INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 C C 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 A:C C A 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 14 14 28 6.12804522861206 7.87195477138794 -1.74390954277588 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.569582845760759 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 20 13 33 8.75435032658866 7.30967228771737 1.44467803887129 T:C C T 10 0.562282483670567 0.726456894085958 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 48 18 66 21.0104407838128 10.1210847060702 10.8893560777426 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00865544909928314 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 T:C T C 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 46 91 137 20.1350057511539 51.1677060140216 -31.0327002628677 A:G A G 10 0.562282483670567 1.48196550884519e-07 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 2489167 G/T 1 91 48 139 39.8322939859784 26.9895592161872 12.8427347697912 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0322425579280936 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2489165_2489272:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2489165_2489272:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489165_2489273:TNFRSF14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:C T C 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 31 39 70 13.5692430062124 21.9290168631521 -8.35977385693969 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0532897249645164 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 51 51 0 28.6764066671989 -28.6764066671989 T C T 10 0.562282483670567 5.02215649696938e-19 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 33 0 33 14.4446780388713 0 14.4446780388713 G G 10 0.562282483670567 6.92429595861017e-09 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 9107723 C/T 1 24 5 29 10.5052203919064 2.81141241835283 7.69380797355356 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00421290800713067 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000461296:exon_9107669_9107788:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9107669_9107793:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9107670_9107793:SLC2A5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 10511544 C/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 12 7 19 5.2526101959532 3.93597738569397 1.31663281025923 T:C C T 10 0.562282483670567 0.646955815494516 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 10708142 A/G 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G A G 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 T:C T C 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 447 379 826 195.659729799257 213.105061311145 -17.4453315118883 T:C:G G T 10 0.562282483670567 0.233121640653465 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 40 18 58 17.5087006531773 10.1210847060702 7.38761594710711 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0630476381898841 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 22 17 39 9.62978535924753 9.55880222239964 0.0709831368478877 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:C C T 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 T:C T C 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 26 20 46 11.3806554245653 11.2456496734113 0.135005751153919 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11850927 C/T 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11845780_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11845810_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11846660_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11848351_11850955:MTHFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 11907648 C/T 1 3 11 14 1.3131525489883 6.18510732037624 -4.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0126733469552871 ENSG00000175206:ENST00000376480:exon_11907619_11907840:NPPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 12012722 A/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:T A T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12012680_12012748:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12012680_12012792:PLOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 26 29 55 11.3806554245653 16.3061920264464 -4.92553660188118 A:G G A 10 0.562282483670567 0.220938098913845 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 23 26 49 10.067502875577 14.6193445754347 -4.55184169985778 A:G A G 10 0.562282483670567 0.197746510342885 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 15546077 G/A 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:G G A 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15545822_15546835:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15545822_15546974:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15545822_15546872:TMEM51 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 171 164 335 74.849695292333 92.214327321973 -17.3646320296399 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0610443169774791 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 16270110 G/A 1 16 7 23 7.00348026127093 3.93597738569397 3.06750287557696 A:G G A 10 0.562282483670567 0.214927585519853 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444358:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000471805:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000472658:exon_16270094_16270421:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000474511:exon_16270094_16270210:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000487785:exon_16270094_16270390:ZBTB17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 15 10 25 6.5657627449415 5.62282483670567 0.942937908235826 A:G G A 10 0.562282483670567 0.8409335601195 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 16577794 C/T 1 43 36 79 18.8218532021656 20.2421694121404 -1.42031620997479 T:C C T 10 0.562282483670567 0.820761345150637 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 53 44 97 23.1990283654599 24.7404292815049 -1.541400916045 A:G A G 10 0.562282483670567 0.759787732479723 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 19 18 37 8.31663281025923 10.1210847060702 -1.80445189581098 A:T T A 10 0.562282483670567 0.62007199861035 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 41 29 70 17.9464181695068 16.3061920264464 1.64022614306031 T:C C T 10 0.562282483670567 0.719443683827017 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 A:G A G 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 20980231 G/A 1 60 59 119 26.263050979766 33.1746665365634 -6.91161555679747 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.229584438130045 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20979991_20980267:DDOST HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 20982016 G/A 1 63 68 131 27.5762035287543 38.2352088895986 -10.6590053608443 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0645105716190991 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20981933_20982027:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20981933_20982027:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20981933_20982027:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000464364:exon_20981933_20982027:DDOST HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 22 31 53 9.62978535924753 17.4307569937876 -7.80097163454005 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0371762994895439 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 A:G G A 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 26872346 C/T 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26872333_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530607:exon_26872336_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26872343_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26872343_26872526:RPS6KA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 27428621 C/T 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27428507_27428621:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374089:exon_27428507_27428621:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000447808:exon_27428507_27428621:SLC9A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 130 107 237 56.9032771228263 60.1642257527507 -3.26094862992438 T:G T G 10 0.562282483670567 0.694626794321431 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 A:G A G 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 79 109 188 34.5796837900252 61.2887907200918 -26.7091069300666 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000119901827460234 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 116 132 248 50.7752318942142 74.2212878445148 -23.4460559503006 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00316710078399784 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 31769560 C/G 1 21 20 41 9.19206784291809 11.2456496734113 -2.05358183049325 C:G C G 10 0.562282483670567 0.532518728833657 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31769458_31769617:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000446633:exon_31769458_31769620:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000463988:exon_31769458_31769629:SNRNP40 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 114 85 199 49.8997968615554 47.7940111119982 2.10578574955717 A:G A G 10 0.562282483670567 0.775587369615084 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:G A G 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 15 19 34 6.5657627449415 10.6833671897408 -4.11760444479928 A:G G A 10 0.562282483670567 0.169000138365729 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 64 63 127 28.0139210450837 35.4237964712457 -7.40987542616201 A:C A C 10 0.562282483670567 0.210386081054212 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 35658492 C/T 1 69 78 147 30.2025086267309 43.8580337263042 -13.6555250995733 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0247648084243571 ENSG00000116560:ENST00000357214:exon_35657823_35658749:SFPQ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 35864571 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 26 15 41 11.3806554245653 8.43423725505851 2.94641816950675 A:G A G 10 0.562282483670567 0.431852322060608 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 36068863 T/C 1 324 261 585 141.820475290736 146.755728238018 -4.9352529472817 T:C T C 10 0.562282483670567 0.707673504542737 ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 T:C T C 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 12 19 31 5.2526101959532 10.6833671897408 -5.43075699378758 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0685579882840721 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 T:G G T 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41454328 A/G 1 15 8 23 6.5657627449415 4.49825986936454 2.06750287557696 A:G A G 10 0.562282483670567 0.41049601681712 ENSG00000171793:ENST00000372621:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000479480:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000372616:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000480420:exon_41454169_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000484267:exon_41454220_41454382:CTPS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 15 8 23 6.5657627449415 4.49825986936454 2.06750287557696 T:C C T 10 0.562282483670567 0.41049601681712 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 21 19 40 9.19206784291809 10.6833671897408 -1.49129934682268 A:G G A 10 0.562282483670567 0.636568724865594 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41976320 G/A 1 24 17 41 10.5052203919064 9.55880222239964 0.946418169506753 A:G G A 10 0.562282483670567 0.87525047428371 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41976345 T/C 1 18 21 39 7.87891529392979 11.8079321570819 -3.92901686315211 T:C T C 10 0.562282483670567 0.258304062767256 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 1 20 19 39 8.75435032658866 10.6833671897408 -1.92901686315211 T:C C T 10 0.562282483670567 0.628820490474955 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 41978774 G/A 1 13 15 28 5.69032771228263 8.43423725505851 -2.74390954277588 A:G G A 10 0.562282483670567 0.342577207481454 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 29 23 52 12.6938079735536 12.932497124423 -0.238689150869483 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 25 22 47 10.9429379082358 12.3702146407525 -1.42727673251665 A:G G A 10 0.562282483670567 0.769094860710404 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 18 20 38 7.87891529392979 11.2456496734113 -3.36673437948154 C:G C G 10 0.562282483670567 0.326815079236887 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 22 15 37 9.62978535924753 8.43423725505851 1.19554810418902 A:G G A 10 0.562282483670567 0.742640750351494 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 93 54 147 40.7077290186373 30.3632541182106 10.3444749004267 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.096176413106269 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 106 55 161 46.3980567309199 30.9255366018812 15.4725201290387 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0138058968350355 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 83 84 167 36.3305538553429 47.2317286283276 -10.9011747729847 A:G A G 10 0.562282483670567 0.101199135375680 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 91 78 169 39.8322939859784 43.8580337263042 -4.02573974032583 T:C T C 10 0.562282483670567 0.536089737758813 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46159001 G/A 1 86 121 207 37.6437064043312 68.0361805241386 -30.3924741198074 A:G G A 10 0.562282483670567 2.38872332636963e-05 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 A:G A G 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 23 21 44 10.067502875577 11.8079321570819 -1.74042928150495 A:C:G G C 10 0.562282483670567 0.649594525861892 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 38 37 75 16.6332656205185 20.804451895811 -4.17118627529252 T:C C T 10 0.562282483670567 0.352937929618569 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 39 57 96 17.0709831368479 32.0501015692223 -14.9791184323744 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00267152872963819 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 14 10 24 6.12804522861206 5.62282483670567 0.505220391906392 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 80 64 144 35.0174013063546 35.9860789549163 -0.968677648561645 A:G A G 10 0.562282483670567 0.867081438188754 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 6 13 19 2.6263050979766 7.30967228771737 -4.68336718974077 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0369601410754297 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 C:G G C 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 47834209 G/T 1 14 12 26 6.12804522861206 6.7473898040468 -0.619344575434742 T:G G T 10 0.562282483670567 0.844970193666619 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47834141_47834287:CMPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 37 35 72 16.195548104189 19.6798869284698 -3.48433882428082 T:C C T 10 0.562282483670567 0.408741833504348 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 23 29 52 10.067502875577 16.3061920264464 -6.23868915086948 A:T A T 10 0.562282483670567 0.093358080689795 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 52851608 G/A 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000476332:exon_52851524_52851621:ORC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 85 95 180 37.2059888880018 53.4168359487039 -16.2108470607021 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0161252427281567 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 53072454 T/C 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000116157:ENST00000361314:exon_53072356_53072617:GPX7;ENSG00000116157:ENST00000459779:exon_53072356_53073080:GPX7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 18 11 29 7.87891529392979 6.18510732037624 1.69380797355356 T:C T C 10 0.562282483670567 0.578675036997571 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 59002282 A/C 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 59004617 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000453710:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000482274:exon_59004467_59004982:OMA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 37 27 64 16.195548104189 15.1816270591053 1.01392104508371 T:C T C 10 0.562282483670567 0.899876776258687 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 43 33 76 18.8218532021656 18.5553219611287 0.266531241036908 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 C:G G C 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 275 97 372 120.372316990594 54.541400916045 65.8309160745491 T:C T C 10 0.562282483670567 2.11465076283707e-12 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 79115922 C/T 1 165 62 227 72.2233901943564 34.8615139875752 37.3618762067813 T:C C T 10 0.562282483670567 4.13088289558645e-07 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 55 38 93 24.0744633981188 21.3667343794815 2.70772901863727 A:G A G 10 0.562282483670567 0.602473261159277 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 85039955 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:C C T 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 85741921 G/C 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 C:G G C 10 0.562282483670567 0.36749743622047 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 87190040 T/C 1 50 50 100 21.8858758164716 28.1141241835284 -6.2282483670567 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.226837066563636 ENSG00000097033:ENST00000212369:exon_87189996_87190088:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000482504:exon_87189996_87190088:SH3GLB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 89449092 T/C 1 31 8 39 13.5692430062124 4.49825986936454 9.07098313684789 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00327963546578495 ENSG00000213516:ENST00000321792:exon_89445139_89449749:RBMXL1;ENSG00000213516:ENST00000413769:exon_89449034_89449749:RBMXL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 33 31 64 14.4446780388713 17.4307569937876 -2.98607895491629 A:G G A 10 0.562282483670567 0.452999342006024 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 16 7 23 7.00348026127093 3.93597738569397 3.06750287557696 T:C C T 10 0.562282483670567 0.214927585519853 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 19 13 32 8.31663281025923 7.30967228771737 1.00696052254186 C:G C G 10 0.562282483670567 0.858967461171744 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 A:C C A 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 25 13 38 10.9429379082358 7.30967228771737 3.63326562051845 T:C T C 10 0.562282483670567 0.256164562959889 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 13 9 22 5.69032771228263 5.0605423530351 0.629785359247526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.833252046495637 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 17 7 24 7.44119777760036 3.93597738569397 3.50522039190639 A:C C A 10 0.562282483670567 0.216200247541120 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110883917 A/G 1 11 5 16 4.81489267962376 2.81141241835283 2.00348026127093 A:G A G 10 0.562282483670567 0.450921881281376 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 110944122 C/A 1 413 317 730 180.777334244056 178.24354732357 2.53378692048608 A:C C A 10 0.562282483670567 0.88140148256906 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110943871_110944205:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110943871_110944205:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110943871_110944205:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110943871_110944205:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110943875_110944205:HBXIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 860 692 1552 376.437064043312 389.099478700032 -12.66241465672 A:T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.52250597795411 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 73 53 126 31.9533786920486 29.8009716345401 2.15240705750856 A:G G A 10 0.562282483670567 0.72034605539028 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 C:G G C 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 111991768 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000116455:ENST00000235090:exon_111991677_111991998:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000411751:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000421211:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 25 18 43 10.9429379082358 10.1210847060702 0.821853202165618 T:C T C 10 0.562282483670567 0.87839812056761 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 21 17 38 9.19206784291809 9.55880222239964 -0.366734379481546 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 34 21 55 14.8823955552007 11.8079321570819 3.07446339811881 A:G A G 10 0.562282483670567 0.418900853844386 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 24 25 49 10.5052203919064 14.0570620917642 -3.55184169985778 A:G A G 10 0.562282483670567 0.316766851246487 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 18 16 34 7.87891529392979 8.99651973872907 -1.11760444479928 A:G A G 10 0.562282483670567 0.731692958124414 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 T:C C T 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 32 44 76 14.0069605225419 24.7404292815049 -10.7334687589631 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0149196432399821 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 0 0 9 9 0 5.0605423530351 -5.0605423530351 A G A 10 0.562282483670567 0.000589855097312382 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 C C 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 19 28 47 8.31663281025923 15.7439095427759 -7.42727673251665 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0384719663747167 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 60 60 0 33.736949020234 -33.736949020234 C T C 10 0.562282483670567 2.96234460923788e-22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 39 39 0 21.9290168631521 -21.9290168631521 T G T 10 0.562282483670567 1.01522692225665e-14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 30 30 0 16.868474510117 -16.868474510117 A C A 10 0.562282483670567 1.72114630674963e-11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 85 0 85 37.2059888880018 0 37.2059888880018 G G 10 0.562282483670567 5.95586173203791e-22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 1 1 51 52 0.437717516329433 28.6764066671989 -28.2386891508695 T:C T C 10 0.562282483670567 1.49039558550378e-17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 111 111 0 62.4133556874329 -62.4133556874329 T C T 10 0.562282483670567 1.48773582255463e-40 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 146751782 A/C 1 15 15 30 6.5657627449415 8.43423725505851 -1.86847451011701 A:C A C 10 0.562282483670567 0.581784650409097 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146751699_146751864:CHD1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 146767149 G/T 1 88 109 197 38.5191414369901 61.2887907200918 -22.7696492831017 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00119703532751134 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146767112_146767443:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146767112_146767443:CHD1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 13 2 15 5.69032771228263 1.12456496734113 4.5657627449415 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0183526070130827 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 150131701 C/T 1 360 304 664 157.578305878596 170.933875035852 -13.3555691572565 T:C C T 10 0.562282483670567 0.309202825917239 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 150935173 C/T 1 10 23 33 4.37717516329433 12.932497124423 -8.55532196112871 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00421984612007541 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000497314:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000528749:exon_150935063_150935558:SETDB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 151006537 G/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G G A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 426 396 822 186.467661956338 222.663863533545 -36.196201577206 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0113561160172518 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 16 10 26 7.00348026127093 5.62282483670567 1.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.694113498508926 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 34 28 62 14.8823955552007 15.7439095427759 -0.861513987575155 C:G G C 10 0.562282483670567 0.898298735597957 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 153748219 C/T 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000143554:ENST00000271857:exon_153746830_153748640:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000368661:exon_153747768_153748640:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000468403:exon_153747795_153749203:SLC27A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 153906724 C/G 1 5 9 14 2.18858758164717 5.0605423530351 -2.87195477138794 C:G C G 10 0.562282483670567 0.176515303158965 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153906611_153906778:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153906611_153906778:DENND4B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.348175446579672 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 19 26 45 8.31663281025923 14.6193445754347 -6.30271176517551 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0706900410640858 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 24 17 41 10.5052203919064 9.55880222239964 0.946418169506753 A:G A G 10 0.562282483670567 0.87525047428371 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 90 121 211 39.394576469649 68.0361805241386 -28.6416040544896 T:C C T 10 0.562282483670567 9.32469356423424e-05 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 1 9 10 0.437717516329433 5.0605423530351 -4.62282483670567 T:G T G 10 0.562282483670567 0.00673381211537401 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 11 14 25 4.81489267962376 7.87195477138794 -3.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.232042066913704 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 156264648 C/T 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000198715:ENST00000472870:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156264156_156264783:C1orf85 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 156280819 G/A 1 374 382 756 163.706351107208 214.791908762157 -51.0855576549486 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.000209494518248551 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 44 39 83 19.2595707184951 21.9290168631521 -2.66944614465706 T:C T C 10 0.562282483670567 0.581112014478895 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 158263011 T/C 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000158481:ENST00000368170:exon_158263002_158263092:CD1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 230 162 392 100.67502875577 91.0897623546319 9.58526640113773 T:C:G G C 10 0.562282483670567 0.3339790000177 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 161 125 286 70.4725201290387 70.2853104588209 0.18720967021784 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 96 91 187 42.0208815676256 51.1677060140216 -9.14682444639603 A:T:C C A 10 0.562282483670567 0.184980690726873 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 86 84 170 37.6437064043312 47.2317286283276 -9.58802222399639 A:T T A 10 0.562282483670567 0.142420764486636 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 159175428 C/T 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000213088:ENST00000368122:exon_159175251_159176290:DARC;ENSG00000213088:ENST00000359381:exon_159175251_159176288:DARC;ENSG00000213088:ENST00000435307:exon_159175201_159175688:DARC;ENSG00000213088:ENST00000368121:exon_159175049_159176288:DARC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 A:G G A 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161068836 A/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:C A C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000444550:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000471613:exon_161068456_161069208:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392191:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000494418:exon_161068456_161068852:KLHDC9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 172 132 304 75.2874128086625 74.2212878445148 1.06612496414763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.908136436004088 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 167 98 265 73.0988252270153 55.1036833997156 17.9951418272997 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0258801199109438 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 360 450 810 157.578305878596 253.027117651755 -95.4488117731593 A:G G A 10 0.562282483670567 1.80655109806469e-11 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161696782 G/C 1 1 10 11 0.437717516329433 5.62282483670567 -5.18510732037624 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00170994653654638 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161695691_161696783:FCRLB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161697072 G/C 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161697037_161697933:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161697037_161697932:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161697037_161697932:FCRLB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 37 26 63 16.195548104189 14.6193445754347 1.57620352875428 T:C C T 10 0.562282483670567 0.705659679746196 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 161751741 A/G 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 A:G A G 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161751702_161751789:ATF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 114 99 213 49.8997968615554 55.6659658833861 -5.76616902183076 A:G G A 10 0.562282483670567 0.447688812332874 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 167905028 C/T 1 130 123 253 56.9032771228263 69.1607454914797 -12.2574683686535 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.128316117918065 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167904971_167905278:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143164:ENST00000450548:exon_167905021_167905350:DCAF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 32 20 52 14.0069605225419 11.2456496734113 2.76131084913052 T:C T C 10 0.562282483670567 0.486432705484196 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 168034974 G/A 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168034828_168034984:DCAF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 53 47 100 23.1990283654599 26.4272767325166 -3.2282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.545947966145962 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 16 23 39 7.00348026127093 12.932497124423 -5.92901686315211 T:G T G 10 0.562282483670567 0.074520552783291 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 23 22 45 10.067502875577 12.3702146407525 -2.30271176517551 T:C T C 10 0.562282483670567 0.548669484985661 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 15 12 27 6.5657627449415 6.7473898040468 -0.181627059105309 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 14 22 36 6.12804522861206 12.3702146407525 -6.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0432052178490772 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 16 15 31 7.00348026127093 8.43423725505851 -1.43075699378758 A:G A G 10 0.562282483670567 0.717950448309377 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 16 18 34 7.00348026127093 10.1210847060702 -3.11760444479928 A:G G A 10 0.562282483670567 0.302913185765161 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 47 68 115 20.5727232674834 38.2352088895986 -17.6624856221152 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00129148268116782 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 18 18 36 7.87891529392979 10.1210847060702 -2.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.503152902402094 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 161 130 291 70.4725201290387 73.0967228771737 -2.62420274813499 T:C C T 10 0.562282483670567 0.767895031347867 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 174200457 C/T 1 33 36 69 14.4446780388713 20.2421694121404 -5.79749137326912 T:C C T 10 0.562282483670567 0.181946815111737 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000407735:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367692:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367691:exon_174200283_174200493:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000529474:exon_174200357_174200493:RABGAP1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 C:G C G 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 25 20 45 10.9429379082358 11.2456496734113 -0.302711765175514 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 179834319 T/G 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:G T G 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000169905:ENST00000482587:exon_179828165_179834989:TOR1AIP2;ENSG00000169905:ENST00000495650:exon_179834200_179834989:TOR1AIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 7 15 22 3.06402261430603 8.43423725505851 -5.37021464075247 A:G A G 10 0.562282483670567 0.029599076619356 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 181003161 G/A 1 26 12 38 11.3806554245653 6.7473898040468 4.63326562051845 A:G G A 10 0.562282483670567 0.143259910664721 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181003108_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181003139_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181003139_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181003139_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181003139_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181003146_181003210:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181003158_181003210:MR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 28 20 48 12.2560904572241 11.2456496734113 1.01044078381278 A:G G A 10 0.562282483670567 0.88454107504406 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 14 10 24 6.12804522861206 5.62282483670567 0.505220391906392 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 75 72 147 32.8288137247075 40.4843388242808 -7.65552509957335 A:G A G 10 0.562282483670567 0.212898885514156 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 15 13 28 6.5657627449415 7.30967228771737 -0.743909542775875 T:C C T 10 0.562282483670567 0.849760457614327 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 C:G G C 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 22 16 38 9.62978535924753 8.99651973872907 0.633265620518454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.8716338739917 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 36 19 55 15.7578305878596 10.6833671897408 5.07446339811882 T:C T C 10 0.562282483670567 0.176784598032415 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 33 33 66 14.4446780388713 18.5553219611287 -4.11064392225742 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.322734680462863 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 74 92 166 32.391096208378 51.7299884976922 -19.3388922893141 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00286672887152775 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 205628368 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000158715:ENST00000460934:exon_205626979_205628799:SLC45A3;ENSG00000158715:ENST00000367145:exon_205626979_205628799:SLC45A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 206651107 G/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206651092_206651202:IKBKE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 16 14 30 7.00348026127093 7.87195477138794 -0.86847451011701 A:C C A 10 0.562282483670567 0.854434079224977 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 206821586 G/A 1 22 5 27 9.62978535924753 2.81141241835283 6.81837294089469 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.0102941458398147 ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 21 26 47 9.19206784291809 14.6193445754347 -5.42727673251665 A:G G A 10 0.562282483670567 0.140710723863612 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 45 33 78 19.6972882348245 18.5553219611287 1.14196627369577 T:C T C 10 0.562282483670567 0.820440707826106 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 12 17 29 5.2526101959532 9.55880222239964 -4.30619202644644 T:C T C 10 0.562282483670567 0.133721238743553 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 35 42 77 15.3201130715302 23.6158643141638 -8.29575124263366 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0657021439204413 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 214832194 G/T 1 87 77 164 38.0814239206607 43.2957512426337 -5.21432732197299 T:G G T 10 0.562282483670567 0.431674763035973 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214832193_214832371:CENPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 219347282 C/T 1 19 28 47 8.31663281025923 15.7439095427759 -7.42727673251665 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0384719663747167 ENSG00000143353:ENST00000366928:exon_219347186_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000460522:exon_219347211_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000366927:exon_219347217_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000496776:exon_219347218_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000477938:exon_219347226_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000463964:exon_219347237_219347323:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000483635:exon_219347238_219347646:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000474379:exon_219347269_219347323:LYPLAL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 15 19 34 6.5657627449415 10.6833671897408 -4.11760444479928 T:C T C 10 0.562282483670567 0.169000138365729 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 24 8 32 10.5052203919064 4.49825986936454 6.00696052254186 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0332009085403547 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 226019633 T/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000143819:ENST00000445856:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000448202:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000467015:exon_226019480_226019864:EPHX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 226026406 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000143819:ENST00000445856:exon_226026355_226026474:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226026355_226026582:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226026355_226026582:EPHX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 226032229 C/T 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.127683379833145 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032199_226032324:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032199_226032324:EPHX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 55 53 108 24.0744633981188 29.8009716345401 -5.72650823642124 T:G T G 10 0.562282483670567 0.286491892950065 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 16 17 33 7.00348026127093 9.55880222239964 -2.55532196112871 A:C A C 10 0.562282483670567 0.385181118369198 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 25 18 43 10.9429379082358 10.1210847060702 0.821853202165618 A:G A G 10 0.562282483670567 0.87839812056761 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 29 39 68 12.6938079735536 21.9290168631521 -9.23520888959856 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.0274783284400768 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 21 17 38 9.19206784291809 9.55880222239964 -0.366734379481546 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 19 33 52 8.31663281025923 18.5553219611287 -10.2386891508695 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00491183255844775 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 22 22 44 9.62978535924753 12.3702146407525 -2.74042928150495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.448670998808091 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 21 24 45 9.19206784291809 13.4947796080936 -4.30271176517552 A:G G A 10 0.562282483670567 0.229525133790525 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 1 246714520 G/A 1 2 8 10 0.875435032658866 4.49825986936454 -3.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0259060599003915 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246714515_246714604:TFB2M HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 38 44 82 16.6332656205185 24.7404292815049 -8.10716366098649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0754142406159629 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 58 56 114 25.3876159471071 31.4878190855518 -6.10020313844464 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.258329289241834 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 30 25 55 13.131525489883 14.0570620917642 -0.925536601881184 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.892055953850589 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 64 68 132 28.0139210450837 38.2352088895986 -10.2212878445148 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0793059870720226 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3178804 G/A 1 269 285 554 117.746011892617 160.250507846112 -42.5044959534941 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000314681336951626 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 124 167 291 54.2769720248497 93.9011747729847 -39.624202748135 A:T:C T C 10 0.562282483670567 3.58883948987409e-06 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 92 38 130 40.2700115023078 21.3667343794815 18.9032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000744515801453919 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 88 35 123 38.5191414369901 19.6798869284698 18.8392545085203 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000526103691952448 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 19 17 36 8.31663281025923 9.55880222239964 -1.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.737958181938326 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 8 15 23 3.50174013063546 8.43423725505851 -4.93249712442304 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0562099328114218 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 11 14 25 4.81489267962376 7.87195477138794 -3.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.232042066913704 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 5926034 T/C 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 5929962 G/C 1 10 18 28 4.37717516329433 10.1210847060702 -5.74390954277588 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0352963746302327 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5929884_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5929810_5930030:ANKRD16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 5978442 G/A 1 27 25 52 11.8183729408947 14.0570620917642 -2.23868915086948 A:G G A 10 0.562282483670567 0.577139757286031 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5978419_5978550:FBXO18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 52 66 118 22.7613108491305 37.1106439222574 -14.3493330731269 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00914894770529205 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 55 41 96 24.0744633981188 23.0535818304932 1.02088156762557 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.918141221258077 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 77 84 161 33.7042487573663 47.2317286283276 -13.5274798709613 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0385641839976892 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 12257777 A/C 1 43 27 70 18.8218532021656 15.1816270591053 3.64022614306031 A:C A C 10 0.562282483670567 0.401496864842643 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12257739_12257834:CDC123 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 184 163 347 80.5400230046157 91.6520448383024 -11.1120218336867 A:G A G 10 0.562282483670567 0.234221219285178 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 161 180 341 70.4725201290387 101.210847060702 -30.7383269316634 T:G G T 10 0.562282483670567 0.000856104878337888 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 44 38 82 19.2595707184951 21.3667343794815 -2.10716366098649 A:T T A 10 0.562282483670567 0.657309332496857 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 17 9 26 7.44119777760036 5.0605423530351 2.38065542456526 T:C T C 10 0.562282483670567 0.43072895736667 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 15 23 38 6.5657627449415 12.932497124423 -6.36673437948154 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0485483496428518 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 17 14 31 7.44119777760036 7.87195477138794 -0.430756993787577 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 13 25 38 5.69032771228263 14.0570620917642 -8.36673437948155 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00815910067193575 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 24832885 C/T 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24831812_24833101:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 9 17 26 3.9394576469649 9.55880222239964 -5.61934457543474 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0298971709153062 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27420863 G/A 1 13 5 18 5.69032771228263 2.81141241835283 2.87891529392979 A:G G A 10 0.562282483670567 0.235291245672474 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000463270:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27420788_27420870:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27420788_27420870:YME1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 19 22 41 8.31663281025923 12.3702146407525 -4.05358183049325 A:G G A 10 0.562282483670567 0.211266919291815 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 20 34 54 8.75435032658866 19.1176044447993 -10.3632541182106 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00566288822486258 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 31 14 45 13.5692430062124 7.87195477138794 5.69728823482448 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0987242236796141 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 20 26 46 8.75435032658866 14.6193445754347 -5.86499424884608 T:C T C 10 0.562282483670567 0.101284317889982 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 23 24 47 10.067502875577 13.4947796080936 -3.42727673251665 T:C T C 10 0.562282483670567 0.377910630989545 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 30 19 49 13.131525489883 10.6833671897408 2.44815830014222 T:C C T 10 0.562282483670567 0.565278444282851 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 34636928 G/A 1 18 6 24 7.87891529392979 3.3736949020234 4.50522039190639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0671916792549588 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34636884_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34636884_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34636893_34637043:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374768:exon_34636893_34637043:PARD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 40 33 73 17.5087006531773 18.5553219611287 -1.04662130795139 T:C C T 10 0.562282483670567 0.814456305526318 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 35360259 T/G 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:G T G 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000421317:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000468804:exon_35360127_35360267:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000478044:exon_35360127_35360267:CUL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 A:G G A 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 19 10 29 8.31663281025923 5.62282483670567 2.69380797355356 T:G T G 10 0.562282483670567 0.353660782057481 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 46 39 85 20.1350057511539 21.9290168631521 -1.79401111199819 A:G G A 10 0.562282483670567 0.743279499388529 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 9 1 10 3.9394576469649 0.562282483670567 3.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.050497554051754 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 12 1 13 5.2526101959532 0.562282483670567 4.69032771228263 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0094150135690741 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 46122447 A/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 13 9 22 5.69032771228263 5.0605423530351 0.629785359247526 T:G G T 10 0.562282483670567 0.833252046495637 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 27 23 50 11.8183729408947 12.932497124423 -1.11412418352835 A:G A G 10 0.562282483670567 0.776838016948793 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 55 31 86 24.0744633981188 17.4307569937876 6.64370640433124 C:G C G 10 0.562282483670567 0.158675932500418 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 6 11 17 2.6263050979766 6.18510732037624 -3.55880222239964 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0913332562302012 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 A:G G A 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 90 91 181 39.394576469649 51.1677060140216 -11.7731295443726 A:G A G 10 0.562282483670567 0.084772031116526 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 460 465 925 201.350057511539 261.461354906814 -60.1112973952745 A:G G A 10 0.562282483670567 7.86444183941746e-05 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 39 38 77 17.0709831368479 21.3667343794815 -4.29575124263366 A:G G A 10 0.562282483670567 0.358550859429761 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 82 62 144 35.8928363390135 34.8615139875752 1.03132235143836 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.933103625374447 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 49 41 90 21.4481583001422 23.0535818304932 -1.60542353035103 A:G G A 10 0.562282483670567 0.750740240729868 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 22 25 47 9.62978535924753 14.0570620917642 -4.42727673251665 T:C C T 10 0.562282483670567 0.239227461728098 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71874802 C/T 1 27 22 49 11.8183729408947 12.3702146407525 -0.551841699857782 T:C C T 10 0.562282483670567 0.886389070599222 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 45 64 109 19.6972882348245 35.9860789549163 -16.2887907200918 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00191561456761289 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 72307101 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72307062_72307202:KIAA1274 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 69 106 175 30.2025086267309 59.6019432690801 -29.3994346423492 T:C C T 10 0.562282483670567 8.62771400480162e-06 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 17 17 34 7.44119777760036 9.55880222239964 -2.11760444479928 T:C C T 10 0.562282483670567 0.492620571179929 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 75526198 C/T 1 22 28 50 9.62978535924753 15.7439095427759 -6.11412418352835 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0880364121690871 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75526108_75526299:SEC24C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 23 20 43 10.067502875577 11.2456496734113 -1.17814679783438 A:G A G 10 0.562282483670567 0.759680684735222 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 20 10 30 8.75435032658866 5.62282483670567 3.13152548988299 A:G G A 10 0.562282483670567 0.274572278180172 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 25 23 48 10.9429379082358 12.932497124423 -1.98955921618722 A:C C A 10 0.562282483670567 0.564449111885511 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 76788860 C/T 1 16 9 25 7.00348026127093 5.0605423530351 1.94293790823582 T:C C T 10 0.562282483670567 0.546623434100514 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 76789077 G/A 1 13 16 29 5.69032771228263 8.99651973872907 -3.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.26187889880372 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 T:C T C 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 C:G C G 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 90762858 T/C 1 8 9 17 3.50174013063546 5.0605423530351 -1.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.472203671514815 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 9 21 30 3.9394576469649 11.8079321570819 -7.86847451011701 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00502153367975231 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 90768743 C/A 1 29 33 62 12.6938079735536 18.5553219611287 -5.86151398757515 A:C C A 10 0.562282483670567 0.158734748399344 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90768646_90768754:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90768646_90768754:FAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 478 523 1001 209.228972805469 294.073738959707 -84.8447661542376 A:T:C T C 10 0.562282483670567 8.14629553577566e-08 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 94 61 155 41.1454465349667 34.2992315039046 6.84621503106212 T:C C T 10 0.562282483670567 0.292815544974202 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:T A T 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 97920062 G/A 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 A:G G A 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 30 38 68 13.131525489883 21.3667343794815 -8.23520888959855 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.0502398778849197 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 99118348 C/T 1 21 13 34 9.19206784291809 7.30967228771737 1.88239555520072 T:C C T 10 0.562282483670567 0.605368107941141 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99118294_99118376:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99118294_99118376:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99118294_99118376:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99118294_99118376:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99118294_99118376:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99118294_99118767:RRP12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 22 22 44 9.62978535924753 12.3702146407525 -2.74042928150495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.448670998808091 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 16 32 48 7.00348026127093 17.9930394774581 -10.9895592161872 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00193356886386481 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 6 16 22 2.6263050979766 8.99651973872907 -6.37021464075247 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0085507846478614 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 100183515 G/C 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 100195130 G/A 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 A:G G A 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195089_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100194843_100195171:HPS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 101716484 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 3 8 11 1.3131525489883 4.49825986936454 -3.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0684806772479422 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 5 10 15 2.18858758164717 5.62282483670567 -3.4342372550585 T:C C T 10 0.562282483670567 0.115461382488288 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 126 72 198 55.1524070575086 40.4843388242808 14.6680682332277 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0376965214043064 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 28 27 55 12.2560904572241 15.1816270591053 -2.92553660188118 T:C T C 10 0.562282483670567 0.497157392372205 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 103825747 G/A 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 64 52 116 28.0139210450837 29.2386891508695 -1.22476810578577 T:C C T 10 0.562282483670567 0.851753259323882 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105174796 T/C 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C T C 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 24 7 31 10.5052203919064 3.93597738569397 6.56924300621242 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0182084832517992 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 53 55 108 23.1990283654599 30.9255366018812 -7.72650823642124 A:C A C 10 0.562282483670567 0.145871654901484 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 46 43 89 20.1350057511539 24.1781467978344 -4.04314104668046 T:C T C 10 0.562282483670567 0.394638836384715 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105344756 T/C 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:C T C 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000107954:ENST00000369780:exon_105344293_105344982:NEURL;ENSG00000107954:ENST00000369777:exon_105344293_105344982:NEURL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 27 21 48 11.8183729408947 11.8079321570819 0.0104407838127845 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G A G 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 190 191 381 83.1663281025923 107.395954381078 -24.229626278486 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0131459449244420 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 111667495 G/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 C:G G C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000108039:ENST00000502895:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000488118:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502935:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369683:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369680:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000322238:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369661:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369659:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000460523:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000403138:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000430337:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000423625:exon_111667449_111667577:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000506777:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000490740:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000451592:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000508275:exon_111667449_111667573:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000475123:exon_111667449_111667576:XPNPEP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 112361606 A/G 1 82 81 163 35.8928363390135 45.5448811773159 -9.65204483830242 A:G A G 10 0.562282483670567 0.133916506653736 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112361395_112361642:SMC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 18 6 24 7.87891529392979 3.3736949020234 4.50522039190639 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0671916792549588 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 17 8 25 7.44119777760036 4.49825986936454 2.94293790823582 A:G G A 10 0.562282483670567 0.313857545875071 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 116719543 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165832:ENST00000298746:exon_116719485_116719566:TRUB1;ENSG00000165832:ENST00000485065:exon_116719485_116719759:TRUB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 121086097 A/T 1 8 13 21 3.50174013063546 7.30967228771737 -3.80793215708191 A:T A T 10 0.562282483670567 0.122676963602703 ENSG00000198873:ENST00000369106:exon_121086028_121086123:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121086028_121086123:GRK5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 121436068 T/G 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:G T G 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 121436286 C/T 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 127524761 C/T 1 91 57 148 39.8322939859784 32.0501015692223 7.78219241675608 T:C C T 10 0.562282483670567 0.214217693100552 ENSG00000107949:ENST00000278100:exon_127524673_127525122:BCCIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 22 22 44 9.62978535924753 12.3702146407525 -2.74042928150495 T:C T C 10 0.562282483670567 0.448670998808091 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 61 71 132 26.7007684960954 39.9220563406103 -13.2212878445148 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0224115214644470 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134036193 A/G 1 15 7 22 6.5657627449415 3.93597738569397 2.62978535924753 A:G A G 10 0.562282483670567 0.289756257599733 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134036145_134036276:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 32 2 34 14.0069605225419 1.12456496734113 12.8823955552007 A:G A G 10 0.562282483670567 1.86118213920894e-06 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 30 3 33 13.131525489883 1.6868474510117 11.4446780388713 C:G C G 10 0.562282483670567 2.49275485068531e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 25 6 31 10.9429379082358 3.3736949020234 7.56924300621242 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00604509412757526 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 39 10 49 17.0709831368479 5.62282483670567 11.4481583001422 T:G G T 10 0.562282483670567 0.000800872777528379 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 7 27 34 3.06402261430603 15.1816270591053 -12.1176044447993 A:G A G 10 0.562282483670567 3.41933263247337e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 10 134145336 G/T 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 T:G G T 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 60 29 89 26.263050979766 16.3061920264464 9.95685895331954 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0417495814559829 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 674454 G/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:G G T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 1780205 A/G 1 29 26 55 12.6938079735536 14.6193445754347 -1.92553660188118 A:G A G 10 0.562282483670567 0.683860920127607 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1780199_1780281:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780199_1780317:CTSD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 1780867 G/A 1 14 17 31 6.12804522861206 9.55880222239964 -3.43075699378758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.277188100761333 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780746_1780869:CTSD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 1782594 G/A 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 414 321 735 181.215051760385 180.492677258252 0.722374502133277 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.970358001979822 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 242 296 538 105.927638951723 166.435615166488 -60.507976214765 A:C:G G A 10 0.562282483670567 2.08037832834095e-07 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 2924591 G/A 1 15 5 20 6.5657627449415 2.81141241835283 3.75435032658866 A:G G A 10 0.562282483670567 0.1147842219571 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 5 11 16 2.18858758164717 6.18510732037624 -3.99651973872907 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0742764766183886 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 27 16 43 11.8183729408947 8.99651973872907 2.82185320216562 C:G G C 10 0.562282483670567 0.443654983107673 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 3381843 A/G 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 A:G A G 10 0.562282483670567 0.528790095088181 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 A:C C A 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 151 146 297 66.0953449657444 82.0932426159028 -15.9978976501584 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0696565096091206 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 45 40 85 19.6972882348245 22.4912993468227 -2.79401111199819 T:C C T 10 0.562282483670567 0.585104497683365 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5653738 T/G 1 23 16 39 10.067502875577 8.99651973872907 1.07098313684789 T:G T G 10 0.562282483670567 0.75030716073852 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5653485_5653900:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5653467_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5653511_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5653485_5653984:TRIM34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 79 72 151 34.5796837900252 40.4843388242808 -5.90465503425562 A:C C A 10 0.562282483670567 0.36700233425541 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5701074 C/A 1 5 16 21 2.18858758164717 8.99651973872907 -6.80793215708191 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0034570514025099 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 79 69 148 34.5796837900252 38.7974913732691 -4.21780758324392 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.507909799308370 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 127 89 216 55.590124573838 50.0431410466805 5.54698352715753 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 0.49294603941496 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 52 104 156 22.7613108491305 58.477378301739 -35.7160674526084 T:C T C 10 0.562282483670567 9.66268846693839e-09 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 159 101 260 69.5970850963798 56.7905308507273 12.8065542456526 C:G G C 10 0.562282483670567 0.118086315103804 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6238662 A/G 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6239109 G/A 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 73 64 137 31.9533786920486 35.9860789549163 -4.03270026286768 T:C C T 10 0.562282483670567 0.492140773395931 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 123 114 237 53.8392545085203 64.1002031384446 -10.2609486299244 A:G G A 10 0.562282483670567 0.190467790552743 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:T A T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 26 18 44 11.3806554245653 10.1210847060702 1.25957071849505 A:T T A 10 0.562282483670567 0.762560692234694 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 114 123 237 49.8997968615554 69.1607454914797 -19.2609486299244 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0127591709214965 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 8016842 G/C 1 189 475 664 82.7286105862628 267.084179743519 -184.355569157256 C:G G C 10 0.562282483670567 3.07615730219858e-47 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8016801_8016914:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8016801_8016914:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8016801_8016914:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8016801_8016914:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000530219:exon_8016529_8017716:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528763:exon_8016801_8016914:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531572:exon_8016801_8017180:EIF3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 8933142 T/C 1 30 17 47 13.131525489883 9.55880222239964 3.57272326748335 T:C T C 10 0.562282483670567 0.307914112902383 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 C:G C G 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 A:G A G 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 9 20 29 3.9394576469649 11.2456496734113 -7.30619202644644 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0079636801956289 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 22 4 26 9.62978535924753 2.24912993468227 7.38065542456526 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00280195719817555 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 11977573 T/C 1 76 87 163 33.2665312410369 48.9185760793393 -15.6520448383024 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0143473325271323 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11977548_11977968:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11977548_11980701:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11977548_11978492:USP47 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 36 28 64 15.7578305878596 15.7439095427759 0.0139210450837126 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 40 34 74 17.5087006531773 19.1176044447993 -1.60890379162196 T:C T C 10 0.562282483670567 0.72625941417231 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 10 22 32 4.37717516329433 12.3702146407525 -7.99303947745814 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0065632242603355 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 22646571 T/C 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 22647008 G/T 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:G G T 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 20 19 39 8.75435032658866 10.6833671897408 -1.92901686315211 T:G T G 10 0.562282483670567 0.628820490474955 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 12 15 27 5.2526101959532 8.43423725505851 -3.18162705910531 T:C T C 10 0.562282483670567 0.246781702556477 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 8 36 44 3.50174013063546 20.2421694121404 -16.7404292815049 T:C T C 10 0.562282483670567 3.24559502399849e-07 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 28 37 65 12.2560904572241 20.804451895811 -8.54836143858685 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0340482725846920 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 18 24 42 7.87891529392979 13.4947796080936 -5.61586431416381 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0881245816088174 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 34110996 C/T 1 17 12 29 7.44119777760036 6.7473898040468 0.693807973553557 T:C C T 10 0.562282483670567 0.853299084532438 ENSG00000135387:ENST00000341394:exon_34110942_34111003:CAPRIN1;ENSG00000135387:ENST00000389645:exon_34110942_34111003:CAPRIN1;ENSG00000135387:ENST00000532820:exon_34110942_34111003:CAPRIN1;ENSG00000135387:ENST00000530820:exon_34110942_34111003:CAPRIN1;ENSG00000135387:ENST00000529307:exon_34110942_34111003:CAPRIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 34152461 C/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34152360_34152484:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34152360_34152484:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34152360_34152484:NAT10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G A G 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 43515495 A/T 1 27 30 57 11.8183729408947 16.868474510117 -5.05010156922232 A:T A T 10 0.562282483670567 0.184159586261038 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43515323_43516483:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43515323_43516477:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43515323_43515511:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000529140:exon_43515323_43515633:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533072:exon_43515323_43516483:TTC17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 65 28 93 28.4516385614131 15.7439095427759 12.7077290186373 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00867932896244592 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 161 150 311 70.4725201290387 84.3423725505851 -13.8698524215463 A:G G A 10 0.562282483670567 0.122705496262418 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 47434986 G/A 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000529740:exon_47434951_47435058:SLC39A13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 47605974 C/T 1 126 117 243 55.1524070575086 65.7870505894563 -10.6346435319478 T:C C T 10 0.562282483670567 0.174834120188437 ENSG00000213619:ENST00000533507:exon_47605866_47606113:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000263774:exon_47605866_47606114:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000526871:exon_47605866_47606017:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000525378:exon_47605866_47606079:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000525212:exon_47605866_47606113:NDUFS3;ENSG00000110536:ENST00000527079:exon_47605866_47606113:PTPMT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 47 49 96 20.5727232674834 27.5518416998578 -6.97911843237443 C:G C G 10 0.562282483670567 0.180823529243588 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 11 5 16 4.81489267962376 2.81141241835283 2.00348026127093 A:G A G 10 0.562282483670567 0.450921881281376 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 58892521 A/G 1 13 16 29 5.69032771228263 8.99651973872907 -3.30619202644644 A:G A G 10 0.562282483670567 0.26187889880372 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 58920990 C/T 1 13 19 32 5.69032771228263 10.6833671897408 -4.99303947745814 T:C C T 10 0.562282483670567 0.107293429068483 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 85 80 165 37.2059888880018 44.9825986936454 -7.77660980564355 A:G G A 10 0.562282483670567 0.239329158531634 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 32 39 71 14.0069605225419 21.9290168631521 -7.92205634061026 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0720626221739177 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60699477 G/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60699456_60699599:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60699456_60699599:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60699456_60699599:TMEM132A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 9 12 21 3.9394576469649 6.7473898040468 -2.80793215708191 C:G C G 10 0.562282483670567 0.272128834938488 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 26 5 31 11.3806554245653 2.81141241835283 8.56924300621242 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00169399307826888 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 19 35 54 8.31663281025923 19.6798869284698 -11.3632541182106 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00229295388068241 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 16 8 24 7.00348026127093 4.49825986936454 2.50522039190639 C:G G C 10 0.562282483670567 0.411148652552095 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61108974 G/A 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61108908_61108986:DAK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 23 15 38 10.067502875577 8.43423725505851 1.63326562051845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.627630593591346 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61557979 G/A 1 626 586 1212 274.011165222225 329.497535430952 -55.4863702087272 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.00144068434956198 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61557965_61558074:C11orf10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 T:C C T 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 15 15 30 6.5657627449415 8.43423725505851 -1.86847451011701 T:G G T 10 0.562282483670567 0.581784650409097 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 132 130 262 57.7787121554852 73.0967228771737 -15.3180107216885 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0616281971493355 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 118 82 200 51.6506669268731 46.1071636609865 5.5435032658866 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.476137371078665 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 160 180 340 70.0348026127093 101.210847060702 -31.1760444479928 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000829751520264107 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 63990505 C/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 C:G C G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 42 23 65 18.3841356858362 12.932497124423 5.45163856141314 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.210989899181046 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64621774 G/A 1 105 111 216 45.9603392145905 62.4133556874329 -16.4530164728425 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0279764560176052 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64619114_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64620203_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64620203_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000488711:exon_64621764_64622329:EHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 76 70 146 33.2665312410369 39.3597738569397 -6.09324261590278 C:G G C 10 0.562282483670567 0.317741375954634 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 49 44 93 21.4481583001422 24.7404292815049 -3.29227098136273 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.531037368768284 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 64893046 C/A 1 22 40 62 9.62978535924753 22.4912993468227 -12.8615139875752 A:T:C C A 10 0.562282483670567 0.00122450900142343 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526171:exon_64892960_64893205:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64892960_64893084:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64892197_64893084:MRPL49 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65211940 C/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:C C A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65269349 C/G 1 307 371 678 134.379277513136 208.60680144178 -74.2275239286444 T:C:G C G 10 0.562282483670567 1.13119804025150e-08 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65338944 T/G 1 77 78 155 33.7042487573663 43.8580337263042 -10.1537849689379 T:G T G 10 0.562282483670567 0.105639408553468 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65366985 T/C 1 33 38 71 14.4446780388713 21.3667343794815 -6.92205634061026 T:C T C 10 0.562282483670567 0.119354328607909 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000532507:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000530153:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524848:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000534432:exon_65366922_65367239:MAP3K11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 21 17 38 9.19206784291809 9.55880222239964 -0.366734379481546 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 24 27 51 10.5052203919064 15.1816270591053 -4.67640666719892 A:G G A 10 0.562282483670567 0.205093322875720 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65408708 G/T 1 31 44 75 13.5692430062124 24.7404292815049 -11.1711862752925 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0103087041218189 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 39 26 65 17.0709831368479 14.6193445754347 2.45163856141314 T:C C T 10 0.562282483670567 0.617493559786922 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65651489 T/C 1 116 137 253 50.7752318942142 77.0327002628677 -26.2574683686534 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000961799644686497 ENSG00000172500:ENST00000534032:exon_65651212_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000338369:exon_65651392_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000357519:exon_65651392_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000525765:exon_65651394_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000531115:exon_65651396_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533045:exon_65651419_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533037:exon_65651480_65651514:FIBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 35 36 71 15.3201130715302 20.2421694121404 -4.92205634061026 A:G G A 10 0.562282483670567 0.281607579465479 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 48 69 117 21.0104407838128 38.7974913732691 -17.7870505894563 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00105126576545081 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 19 24 43 8.31663281025923 13.4947796080936 -5.17814679783438 T:C C T 10 0.562282483670567 0.124946815999759 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66056457 G/A 1 33 25 58 14.4446780388713 14.0570620917642 0.387615947107115 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000174851:ENST00000471387:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66056426_66056616:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66056426_66056641:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66056426_66056620:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000484814:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66056426_66056478:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66056426_66056508:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66056426_66056614:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66056426_66056608:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66056426_66056606:YIF1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66240882 T/C 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:C T C 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000174516:ENST00000349459:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000320740:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000532970:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000524466:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000526296:exon_66240712_66240906:PELI3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:G G T 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 75 66 141 32.8288137247075 37.1106439222574 -4.28183019754995 A:G G A 10 0.562282483670567 0.497422470494646 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 C:G G C 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 29 30 59 12.6938079735536 16.868474510117 -4.17466653656345 T:C T C 10 0.562282483670567 0.295104812887871 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 67052550 G/A 1 56 32 88 24.5121809144482 17.9930394774581 6.5191414369901 A:G G A 10 0.562282483670567 0.197002292625698 ENSG00000173020:ENST00000308595:exon_67052546_67052659:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000416281:exon_67052546_67052659:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000527176:exon_67052318_67052608:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000524899:exon_67052318_67052659:ADRBK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 86 68 154 37.6437064043312 38.2352088895986 -0.591502485267313 T:C C T 10 0.562282483670567 0.935405460304386 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 87 69 156 38.0814239206607 38.7974913732691 -0.716067452608456 T:C C T 10 0.562282483670567 0.935759487021382 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 33 30 63 14.4446780388713 16.868474510117 -2.42379647124572 A:C C A 10 0.562282483670567 0.611851302402827 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 68204451 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68204357_68204467:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68204357_68204467:LRP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 68671259 G/C 1 17 25 42 7.44119777760036 14.0570620917642 -6.61586431416381 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0435611222512426 ENSG00000197345:ENST00000362034:exon_68671191_68671303:MRPL21;ENSG00000197345:ENST00000450904:exon_68671191_68671303:MRPL21;ENSG00000197345:ENST00000447977:exon_68671191_68671296:MRPL21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 68705820 G/A 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 69063572 A/G 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G A G 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000172927:ENST00000308946:exon_69063059_69064753:MYEOV HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 62 57 119 27.1384860124248 32.0501015692223 -4.91161555679748 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.405783621305006 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71146841 G/A 1 45 48 93 19.6972882348245 26.9895592161872 -7.29227098136273 A:G G A 10 0.562282483670567 0.143308849036413 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71726212 C/T 1 27 20 47 11.8183729408947 11.2456496734113 0.572723267483353 T:C C T 10 0.562282483670567 0.884496410302964 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71943960 C/A 1 20 15 35 8.75435032658866 8.43423725505851 0.320113071530155 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71943961 C/A 1 20 15 35 8.75435032658866 8.43423725505851 0.320113071530155 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 37 27 64 16.195548104189 15.1816270591053 1.01392104508371 A:G A G 10 0.562282483670567 0.899876776258687 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 86 64 150 37.6437064043312 35.9860789549163 1.65762744941495 A:T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.805520512032378 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 45 42 87 19.6972882348245 23.6158643141638 -3.91857607933933 C:G G C 10 0.562282483670567 0.449600454441407 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 52 40 92 22.7613108491305 22.4912993468227 0.270011502307838 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 73570995 G/A 1 45 44 89 19.6972882348245 24.7404292815049 -5.04314104668046 A:G G A 10 0.562282483670567 0.287200936903281 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000398483:exon_73570952_73571054:MRPL48 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 11 2 13 4.81489267962376 1.12456496734113 3.69032771228263 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0490871078985576 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 293 256 549 128.251232284524 143.944315819665 -15.6930835351413 A:G A G 10 0.562282483670567 0.182460925976706 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 20 14 34 8.75435032658866 7.87195477138794 0.882395555200723 A:G A G 10 0.562282483670567 0.863348059954762 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 22 24 46 9.62978535924753 13.4947796080936 -3.86499424884608 C:G C G 10 0.562282483670567 0.298325184833791 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 25 18 43 10.9429379082358 10.1210847060702 0.821853202165618 T:C C T 10 0.562282483670567 0.87839812056761 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 48 46 94 21.0104407838128 25.8649942488461 -4.8545534650333 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349631068702275 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 23 29 52 10.067502875577 16.3061920264464 -6.23868915086948 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.093358080689795 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 25 17 42 10.9429379082358 9.55880222239964 1.38413568583619 T:C T C 10 0.562282483670567 0.756541266317635 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 38 22 60 16.6332656205185 12.3702146407525 4.26305097976598 A:G A G 10 0.562282483670567 0.299084317413457 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:C T C 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 16 13 29 7.00348026127093 7.30967228771737 -0.306192026446443 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 17 6 23 7.44119777760036 3.3736949020234 4.06750287557696 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0960650785141877 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 82535943 G/C 1 46 76 122 20.1350057511539 42.7334687589631 -22.5984630078092 C:G G C 10 0.562282483670567 4.97722562948862e-05 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 40 56 96 17.5087006531773 31.4878190855518 -13.9791184323744 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00521505072839555 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 687 536 1223 300.71193371832 301.383411247424 -0.671477529103413 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.977012927630533 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 501 370 871 219.296475681046 208.04451895811 11.2519567229361 A:C A C 10 0.562282483670567 0.452586234158037 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 13 20 33 5.69032771228263 11.2456496734113 -5.55532196112871 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0550493446680247 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 93465483 T/C 1 22 25 47 9.62978535924753 14.0570620917642 -4.42727673251665 T:C T C 10 0.562282483670567 0.239227461728098 ENSG00000166012:ENST00000534079:exon_93465410_93465667:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93465410_93469014:TAF1D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 93529655 G/A 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:G A G 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 94862577 G/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:G G T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 16 9 25 7.00348026127093 5.0605423530351 1.94293790823582 T:C T C 10 0.562282483670567 0.546623434100514 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 100863096 A/G 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000170647:ENST00000303130:exon_100862811_100864663:TMEM133 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 159 140 299 69.5970850963798 78.7195477138794 -9.12246261749954 A:G G A 10 0.562282483670567 0.294465979711176 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 60 59 119 26.263050979766 33.1746665365634 -6.91161555679747 A:C A C 10 0.562282483670567 0.229584438130045 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 111953419 A/C 1 60 27 87 26.263050979766 15.1816270591053 11.0814239206607 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0172748678902814 ENSG00000150776:ENST00000420986:exon_111953192_111954858:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393048:exon_111953189_111955872:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000532163:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000280352:exon_111953192_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000524989:exon_111953189_111953669:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393047:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000525785:exon_111953189_111953546:C11orf57 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 C:G G C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 5 9 14 2.18858758164717 5.0605423530351 -2.87195477138794 A:G G A 10 0.562282483670567 0.176515303158965 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117099025 A/G 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 A:G A G 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117098932_117099066:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117098932_117099066:PCSK7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 A:C C A 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 7 13 20 3.06402261430603 7.30967228771737 -4.24564967341134 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0705527177728787 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117242173 C/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117241796_117242182:CEP164 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 20 12 32 8.75435032658866 6.7473898040468 2.00696052254186 T:G G T 10 0.562282483670567 0.593728963826907 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118765267 G/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 A:G A G 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 19 16 35 8.31663281025923 8.99651973872907 -0.679886928469845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.865535263567683 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 0.250860933602197 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 42 60 102 18.3841356858362 33.736949020234 -15.3528133343978 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00261578012646311 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 36 31 67 15.7578305878596 17.4307569937876 -1.67292640592799 T:C C T 10 0.562282483670567 0.712710726360233 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 C:G C G 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C C T 10 0.562282483670567 0.77386036096334 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.348175446579672 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 61 54 115 26.7007684960954 30.3632541182106 -3.6624856221152 A:G A G 10 0.562282483670567 0.511373055990103 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 15 8 23 6.5657627449415 4.49825986936454 2.06750287557696 T:C C T 10 0.562282483670567 0.41049601681712 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 23 18 41 10.067502875577 10.1210847060702 -0.0535818304932469 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 119207100 G/A 1 34 37 71 14.8823955552007 20.804451895811 -5.92205634061026 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.187889556328411 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26;ENSG00000245385:ENST00000501918:exon_119206959_119207203:RP11-334E6.10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 120198303 C/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000181264:ENST00000375095:exon_120198150_120198349:TMEM136;ENSG00000181264:ENST00000314475:exon_120197831_120198349:TMEM136;ENSG00000181264:ENST00000529187:exon_120197831_120198349:TMEM136;ENSG00000181264:ENST00000524680:exon_120198150_120198350:TMEM136 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1427 1298 2725 624.622895802101 729.842663804396 -105.219768002295 A:T:C:G T G 10 0.562282483670567 5.4127280996578e-05 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 124495764 A/G 1 14 15 29 6.12804522861206 8.43423725505851 -2.30619202644644 A:G A G 10 0.562282483670567 0.455263076280101 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000452080:exon_124495567_124495799:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124495662_124495799:TBRG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 124506967 C/T 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 34 105 139 14.8823955552007 59.0396607854095 -44.1572652302088 T:C T C 10 0.562282483670567 4.88259717218972e-14 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 11 17 28 4.81489267962376 9.55880222239964 -4.74390954277588 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0860688622603035 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 41 15 56 17.9464181695068 8.43423725505851 9.51218091444825 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0103163040398437 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 36 32 68 15.7578305878596 17.9930394774581 -2.23520888959855 A:G G A 10 0.562282483670567 0.62567026427712 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 12 15 27 5.2526101959532 8.43423725505851 -3.18162705910531 A:G A G 10 0.562282483670567 0.246781702556477 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 126135973 C/T 1 31 47 78 13.5692430062124 26.4272767325166 -12.8580337263042 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00409101878232918 ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135858_126135976:SRPR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 46 37 83 20.1350057511539 20.804451895811 -0.669446144657059 T:C C T 10 0.562282483670567 0.912148861357422 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G G A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G A G 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 41 37 78 17.9464181695068 20.804451895811 -2.85803372630422 A:G G A 10 0.562282483670567 0.568615708468336 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 30 16 46 13.131525489883 8.99651973872907 4.13500575115392 A:G G A 10 0.562282483670567 0.237406311795925 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 5022041 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000111262:ENST00000382545:exon_5020006_5027422:KCNA1;ENSG00000111262:ENST00000228858:exon_5020507_5022080:KCNA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 282 237 519 123.4363396049 133.260948629924 -9.82460902502426 T:G G T 10 0.562282483670567 0.400644886572975 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 16 7 23 7.00348026127093 3.93597738569397 3.06750287557696 A:G A G 10 0.562282483670567 0.214927585519853 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 0 24 0 24 10.5052203919064 0 10.5052203919064 A A 10 0.562282483670567 1.07538309613496e-06 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 30 14 44 13.131525489883 7.87195477138794 5.25957071849505 T:C C T 10 0.562282483670567 0.128817364545302 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 30 20 50 13.131525489883 11.2456496734113 1.88587581647165 A:G G A 10 0.562282483670567 0.669727792447411 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 40 28 68 17.5087006531773 15.7439095427759 1.76479111040145 A:G A G 10 0.562282483670567 0.71485368599653 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 23 13 36 10.067502875577 7.30967228771737 2.75783058785959 A:C C A 10 0.562282483670567 0.403491782492216 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 84 77 161 36.7682713716724 43.2957512426337 -6.52747987096129 T:C T C 10 0.562282483670567 0.302901948598259 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 42 33 75 18.3841356858362 18.5553219611287 -0.171186275292527 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 81 84 165 35.4551188226841 47.2317286283276 -11.7766098056436 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0709824795044302 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 7862 3 7865 3441.335113382 1.6868474510117 3439.64826593099 A:T:C T C 10 0.562282483670567 4.94065645841247e-324 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6665001 G/T 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:G G T 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000010295:ENST00000336604:exon_6664423_6665237:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000494107:exon_6664423_6665237:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000487279:exon_6664423_6665237:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000396840:exon_6664423_6665237:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000356896:exon_6664423_6665229:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000436152:exon_6664423_6665229:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000396830:exon_6664423_6665229:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6664423_6665237:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000358846:exon_6664423_6665229:IFFO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6670900 G/A 1 28 31 59 12.2560904572241 17.4307569937876 -5.17466653656345 A:G G A 10 0.562282483670567 0.190347255926114 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6670830_6670970:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6670830_6670970:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6670830_6670970:NOP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 59 62 121 25.8253334634365 34.8615139875752 -9.0361805241386 A:G G A 10 0.562282483670567 0.099875281206441 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 7090742 G/A 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 46 0 46 20.1350057511539 0 20.1350057511539 G G 10 0.562282483670567 4.20806454568527e-12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 0 11 0 11 4.81489267962376 0 4.81489267962376 C C 10 0.562282483670567 0.00348618021164521 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 21 5 26 9.19206784291809 2.81141241835283 6.38065542456526 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.0159439260250896 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 13 8 21 5.69032771228263 4.49825986936454 1.19206784291809 T:C T C 10 0.562282483670567 0.665083927815355 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 129 132 261 56.4655596064969 74.2212878445148 -17.755728238018 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0289019720887516 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 17 18 35 7.44119777760036 10.1210847060702 -2.67988692846985 T:G T G 10 0.562282483670567 0.396612095952673 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 5 13 18 2.18858758164717 7.30967228771737 -5.12108470607021 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0174247903253991 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1927 1525 3452 843.481653966817 857.480787597615 -13.9991336307972 T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.631054817024989 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 618 125 743 270.50942509159 70.2853104588209 200.224114632769 A:G G A 10 0.562282483670567 6.6205141898492e-55 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 58 45 103 25.3876159471071 25.3027117651755 0.0849041819315985 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 A:G A G 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 22 15 37 9.62978535924753 8.43423725505851 1.19554810418902 C:G G C 10 0.562282483670567 0.742640750351494 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 6 11 17 2.6263050979766 6.18510732037624 -3.55880222239964 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0913332562302012 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 34 23 57 14.8823955552007 12.932497124423 1.94989843077768 C:G G C 10 0.562282483670567 0.689274489013371 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 26 30 56 11.3806554245653 16.868474510117 -5.48781908555175 T:G G T 10 0.562282483670567 0.141250235654015 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 31944691 A/C 0 9 0 9 3.9394576469649 0 3.9394576469649 A A 10 0.562282483670567 0.00620797482840731 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 32481021 C/A 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 5 14 19 2.18858758164717 7.87195477138794 -5.68336718974077 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0102806922238463 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 42792751 C/T 1 89 69 158 38.9568589533195 38.7974913732691 0.159367580050414 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134283:ENST00000395580:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000395568:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000432191:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000449194:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000317560:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000337898:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000256678:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000358314:exon_42792656_42792796:PPHLN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 3 10 13 1.3131525489883 5.62282483670567 -4.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0225421185889244 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 49225891 G/A 1 16 21 37 7.00348026127093 11.8079321570819 -4.80445189581098 A:G G A 10 0.562282483670567 0.135449621034062 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49225861_49225969:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49225861_49225969:DDX23 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 76 59 135 33.2665312410369 33.1746665365634 0.0918647044734584 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 15 18 33 6.5657627449415 10.1210847060702 -3.55532196112871 A:C C A 10 0.562282483670567 0.22358287986148 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50036078 C/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000110844:ENST00000261897:exon_50036018_50036155:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000419405:exon_50036018_50036155:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000380281:exon_50036018_50036155:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000341308:exon_50036018_50036155:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000395012:exon_50036018_50036155:PRPF40B;ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50031724_50039686:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50031724_50039686:FMNL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50037745 G/A 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000110844:ENST00000261897:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000419405:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000380281:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000341308:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000395012:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50031724_50039686:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50031724_50039686:FMNL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 79 99 178 34.5796837900252 55.6659658833861 -21.0862820933609 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.00187051778807751 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 A:C C A 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:G T G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 10 12 22 4.37717516329433 6.7473898040468 -2.37021464075247 A:T A T 10 0.562282483670567 0.390806941275438 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 9 12 21 3.9394576469649 6.7473898040468 -2.80793215708191 A:G G A 10 0.562282483670567 0.272128834938488 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 51639899 A/G 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G A G 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 52448731 C/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 2 10 12 0.875435032658866 5.62282483670567 -4.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00719832689368664 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 6 10 16 2.6263050979766 5.62282483670567 -2.99651973872907 A:G A G 10 0.562282483670567 0.139618210498778 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 36 38 74 15.7578305878596 21.3667343794815 -5.60890379162196 A:G A G 10 0.562282483670567 0.198733236224636 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54767812 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 20 29 49 8.75435032658866 16.3061920264464 -7.55184169985778 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0313465826604481 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 67 32 99 29.327073594072 17.9930394774581 11.3340341166139 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0253844911944222 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 11 5 16 4.81489267962376 2.81141241835283 2.00348026127093 C:G C G 10 0.562282483670567 0.450921881281376 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 181 137 318 79.2268704556274 77.0327002628677 2.1941701927597 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.82133929727414 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56575860 G/A 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000139613:ENST00000394023:exon_56575788_56575863:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000347471:exon_56575788_56575863:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000267064:exon_56575788_56575863:SMARCC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56733531 G/A 1 11 30 41 4.81489267962376 16.868474510117 -12.0535818304932 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000201858865651975 ENSG00000110944:ENST00000228534:exon_56733475_56733621:IL23A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56740682 C/G 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 C:G C G 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740603_56740739:STAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 20 14 34 8.75435032658866 7.87195477138794 0.882395555200723 A:G G A 10 0.562282483670567 0.863348059954762 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 12 16 28 5.2526101959532 8.99651973872907 -3.74390954277588 T:C C T 10 0.562282483670567 0.183040118889069 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:T T A 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 56865338 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56864738_56865427:GLS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 1475 1448 2923 645.633336585914 814.185036354981 -168.551699769067 A:C:G A G 10 0.562282483670567 4.06214412205949e-10 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:G T G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57623519 G/A 1 55 43 98 24.0744633981188 24.1781467978344 -0.103683399715564 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57623519_57623594:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57623519_57623594:SHMT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57626018 C/T 1 231 198 429 101.112746272099 111.331931766772 -10.2191854946732 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.330587620557476 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57625994_57626075:SHMT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57640620 C/T 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57640587_57640684:STAC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 53 27 80 23.1990283654599 15.1816270591053 8.01740130635464 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0723613751280049 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57870420 C/G 1 18 37 55 7.87891529392979 20.804451895811 -12.9255366018812 C:G C G 10 0.562282483670567 0.000565272647075377 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870373_57870434:ARHGAP9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57905612 A/G 1 57 41 98 24.9498984307777 23.0535818304932 1.89631660028444 A:G A G 10 0.562282483670567 0.760341912128326 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57905481_57905651:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57905481_57905651:MARS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 89 79 168 38.9568589533195 44.4203162099748 -5.46345725665525 T:G T G 10 0.562282483670567 0.393783062135036 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 57994679 C/G 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57994594_57994861:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57994594_57994861:PIP4K2C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 58001003 C/T 1 19 14 33 8.31663281025923 7.87195477138794 0.444678038871289 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000178498:ENST00000413885:exon_58000667_58001396:DTX3;ENSG00000178498:ENST00000337737:exon_58000648_58001396:DTX3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 26 28 54 11.3806554245653 15.7439095427759 -4.36325411821062 A:G A G 10 0.562282483670567 0.272535244007014 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 26 12 38 11.3806554245653 6.7473898040468 4.63326562051845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.143259910664721 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 67700210 C/T 1 28 34 62 12.2560904572241 19.1176044447993 -6.86151398757515 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0954803318500396 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67698884_67700377:CAND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 107 110 217 46.8357742472493 61.8510732037624 -15.015298956513 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0469854959104844 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 22 17 39 9.62978535924753 9.55880222239964 0.0709831368478877 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 91 95 186 39.8322939859784 53.4168359487039 -13.5845419627255 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0461637159838518 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:C C A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 13 11 24 5.69032771228263 6.18510732037624 -0.494779608093608 T:C T C 10 0.562282483670567 0.840104106104026 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 88589256 G/A 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000139324:ENST00000266712:exon_88588615_88593655:TMTC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 4 12 16 1.75087006531773 6.7473898040468 -4.99651973872907 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0201570469174554 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 95906603 C/A 1 16 29 45 7.00348026127093 16.3061920264464 -9.30271176517551 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0063800390029019 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95906577_95906692:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95906577_95906692:METAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 20 13 33 8.75435032658866 7.30967228771737 1.44467803887129 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.726456894085958 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 14 15 29 6.12804522861206 8.43423725505851 -2.30619202644644 T:C T C 10 0.562282483670567 0.455263076280101 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 7 13 20 3.06402261430603 7.30967228771737 -4.24564967341134 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0705527177728787 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 4 22 26 1.75087006531773 12.3702146407525 -10.6193445754347 T:C C T 10 0.562282483670567 2.86365428024451e-05 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:C T C 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 113596869 C/T 1 130 104 234 56.9032771228263 58.477378301739 -1.57410117891268 T:C C T 10 0.562282483670567 0.843541862499563 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113594986_113596917:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113594986_113596914:DDX54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 113612562 G/A 1 31 28 59 13.5692430062124 15.7439095427759 -2.17466653656345 A:G G A 10 0.562282483670567 0.600938089244845 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113612445_113612576:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113612445_113612576:DDX54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 13 10 23 5.69032771228263 5.62282483670567 0.0675028755769596 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 23 18 41 10.067502875577 10.1210847060702 -0.0535818304932469 T:C:G T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 120608031 A/G 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120607973_120608125:GCN1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 38 5 43 16.6332656205185 2.81141241835283 13.8218532021656 A:C C A 10 0.562282483670567 8.27081070285592e-06 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121094087 G/T 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 T:G G T 10 0.562282483670567 0.167013412381977 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 40 23 63 17.5087006531773 12.932497124423 4.57620352875428 A:G G A 10 0.562282483670567 0.256120575011252 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121476597 G/A 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 A:G G A 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121476577_121477045:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121476577_121476959:OASL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 20 18 38 8.75435032658866 10.1210847060702 -1.36673437948155 T:C C T 10 0.562282483670567 0.744213961211337 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 24 32 56 10.5052203919064 17.9930394774581 -7.48781908555175 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0583503144677854 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 16 16 32 7.00348026127093 8.99651973872907 -1.99303947745814 A:G G A 10 0.562282483670567 0.482266568510133 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 85 81 166 37.2059888880018 45.5448811773159 -8.33889228931412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.210668992048458 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 122734569 C/T 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122734418_122734592:VPS33A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 123200768 T/G 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000255398:ENST00000528880:exon_123199303_123201344:GPR109B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 27 15 42 11.8183729408947 8.43423725505851 3.38413568583619 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.351461705978831 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 57 60 117 24.9498984307777 33.736949020234 -8.78705058945634 A:G A G 10 0.562282483670567 0.113043520430756 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 12 17 29 5.2526101959532 9.55880222239964 -4.30619202644644 T:C T C 10 0.562282483670567 0.133721238743553 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124829255 A/G 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 A:G A G 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124838720 C/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124838639_124838742:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124838639_124838742:NCOR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 A:T T A 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 15 13 28 6.5657627449415 7.30967228771737 -0.743909542775875 A:G G A 10 0.562282483670567 0.849760457614327 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 12 4 16 5.2526101959532 2.24912993468227 3.00348026127093 A:G G A 10 0.562282483670567 0.206345233157792 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 37 10 47 16.195548104189 5.62282483670567 10.5727232674834 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00176649124573156 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 132561984 G/A 1 32 27 59 14.0069605225419 15.1816270591053 -1.17466653656345 A:G G A 10 0.562282483670567 0.793730005269135 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 31 25 56 13.5692430062124 14.0570620917642 -0.487819085551752 T:C C T 10 0.562282483670567 0.893783668858902 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133208974 A/G 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G A G 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133294333 C/T 1 29 28 57 12.6938079735536 15.7439095427759 -3.05010156922232 T:C C T 10 0.562282483670567 0.425995131241528 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 78 74 152 34.1419662736958 41.608903791622 -7.46693751792618 T:C C T 10 0.562282483670567 0.252332749782548 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133306710 C/T 1 54 45 99 23.6367458817894 25.3027117651755 -1.66596588338613 T:C C T 10 0.562282483670567 0.76174024558063 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133331364 G/A 1 4 13 17 1.75087006531773 7.30967228771737 -5.55880222239964 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0119190033802474 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 A:G G A 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133384864 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 5 21 26 2.18858758164717 11.8079321570819 -9.61934457543474 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000198628801046944 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133423695 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133435716 T/G 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:G T G 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133435793 C/T 1 7 16 23 3.06402261430603 8.99651973872907 -5.93249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0188197573727004 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 21 27 48 9.19206784291809 15.1816270591053 -5.98955921618722 T:C T C 10 0.562282483670567 0.108540188269986 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 16 5 21 7.00348026127093 2.81141241835283 4.19206784291809 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0786518434632153 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 49 0 49 21.4481583001422 0 21.4481583001422 C C 10 0.562282483670567 6.67088509037673e-13 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 21742369 G/A 1 15 20 35 6.5657627449415 11.2456496734113 -4.67988692846984 A:G G A 10 0.562282483670567 0.125999856469266 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 22095396 C/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22095384_22095466:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22095384_22095466:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000476895:exon_22095384_22095466:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22095384_22095466:EFHA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 23929842 T/C 1 5 12 17 2.18858758164717 6.7473898040468 -4.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0291238257536717 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 28009851 G/A 1 68 62 130 29.7647911104014 34.8615139875752 -5.09672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 0.377722850160443 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 48 67 115 21.0104407838128 37.672926405928 -16.6624856221152 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00187774729259333 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 16 16 32 7.00348026127093 8.99651973872907 -1.99303947745814 A:G A G 10 0.562282483670567 0.482266568510133 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 32972884 A/G 1 17 16 33 7.44119777760036 8.99651973872907 -1.55532196112871 A:G A G 10 0.562282483670567 0.602607785332713 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 33704065 T/C 0 8 0 8 3.50174013063546 0 3.50174013063546 T T 10 0.562282483670567 0.0113392023691977 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 18 21 39 7.87891529392979 11.8079321570819 -3.92901686315211 A:G G A 10 0.562282483670567 0.258304062767256 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 54 52 106 23.6367458817894 29.2386891508695 -5.6019432690801 A:G G A 10 0.562282483670567 0.282674424022626 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 42 30 72 18.3841356858362 16.868474510117 1.51566117571917 T:C C T 10 0.562282483670567 0.812431189902106 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:T A T 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 A:T T A 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 3 8 11 1.3131525489883 4.49825986936454 -3.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0684806772479422 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 22 24 46 9.62978535924753 13.4947796080936 -3.86499424884608 A:C A C 10 0.562282483670567 0.298325184833791 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 46705068 C/T 1 276 224 500 120.810034506924 125.951276342207 -5.14124183528349 T:C C T 10 0.562282483670567 0.652347335896602 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 48664518 T/C 1 31 27 58 13.5692430062124 15.1816270591053 -1.61238405289289 T:C T C 10 0.562282483670567 0.69278613113623 ENSG00000136146:ENST00000258648:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378594:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378586:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000487937:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000417167:exon_48664488_48664554:MED4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 51941943 T/C 1 27 40 67 11.8183729408947 22.4912993468227 -10.672926405928 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0095488562437422 ENSG00000102786:ENST00000476666:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000425000:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51941941_51942034:INTS6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 60240829 C/T 1 17 9 26 7.44119777760036 5.0605423530351 2.38065542456526 T:C C T 10 0.562282483670567 0.43072895736667 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 26 20 46 11.3806554245653 11.2456496734113 0.135005751153919 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 17 11 28 7.44119777760036 6.18510732037624 1.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.705814241129564 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 21 16 37 9.19206784291809 8.99651973872907 0.195548104189021 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 76427253 T/G 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:G T G 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 4 12 16 1.75087006531773 6.7473898040468 -4.99651973872907 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0201570469174554 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 60 76 136 26.263050979766 42.7334687589631 -16.4704177791971 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00549353829856963 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 45 67 112 19.6972882348245 37.672926405928 -17.9756381711035 A:C C A 10 0.562282483670567 0.000787476510665468 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 15 2 17 6.5657627449415 1.12456496734113 5.44119777760036 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00676771080394499 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 A:G G A 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 30 23 53 13.131525489883 12.932497124423 0.199028365459951 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 11 20 31 4.81489267962376 11.2456496734113 -6.43075699378758 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0282343068604987 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 13 114277541 C/T 1 13 11 24 5.69032771228263 6.18510732037624 -0.494779608093608 T:C C T 10 0.562282483670567 0.840104106104026 ENSG00000198176:ENST00000475254:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000465174:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000408980:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000453989:exon_114277495_114277601:TFDP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 15 21 36 6.5657627449415 11.8079321570819 -5.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0927481657086045 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 50 52 102 21.8858758164716 29.2386891508695 -7.35281333439783 A:C A C 10 0.562282483670567 0.162164747843879 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 52 34 86 22.7613108491305 19.1176044447993 3.64370640433124 T:C T C 10 0.562282483670567 0.44873366576993 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 19 10 29 8.31663281025923 5.62282483670567 2.69380797355356 T:C T C 10 0.562282483670567 0.353660782057481 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 19 7 26 8.31663281025923 3.93597738569397 4.38065542456526 A:C C A 10 0.562282483670567 0.112467924457939 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 110 98 208 48.1489267962376 55.1036833997156 -6.95475660347793 A:G G A 10 0.562282483670567 0.363654489819415 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 40 36 76 17.5087006531773 20.2421694121404 -2.73346875896309 T:C T C 10 0.562282483670567 0.56396044821042 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 62 44 106 27.1384860124248 24.7404292815049 2.3980567309199 A:G G A 10 0.562282483670567 0.695705069145773 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 15 15 30 6.5657627449415 8.43423725505851 -1.86847451011701 A:G G A 10 0.562282483670567 0.581784650409097 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 51 46 97 22.3235933328011 25.8649942488461 -3.541400916045 A:G A G 10 0.562282483670567 0.47548004027115 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 1 12 13 0.437717516329433 6.7473898040468 -6.30967228771737 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000383250317598570 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 23240227 G/A 1 476 384 860 208.35353777281 215.916473729498 -7.56293595668762 A:G G A 10 0.562282483670567 0.60634240096274 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 1 15 16 0.437717516329433 8.43423725505851 -7.99651973872907 A:G A G 10 0.562282483670567 3.91395374124534e-05 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 32 32 64 14.0069605225419 17.9930394774581 -3.98607895491629 C:G G C 10 0.562282483670567 0.31689117454189 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G G A 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 17 8 25 7.44119777760036 4.49825986936454 2.94293790823582 A:G A G 10 0.562282483670567 0.313857545875071 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 29 18 47 12.6938079735536 10.1210847060702 2.57272326748335 A:G A G 10 0.562282483670567 0.467027611718781 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 37 10 47 16.195548104189 5.62282483670567 10.5727232674834 A:T A T 10 0.562282483670567 0.00176649124573156 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24459407 G/A 1 63 18 81 27.5762035287543 10.1210847060702 17.4551188226841 A:G G A 10 0.562282483670567 7.04630054033971e-05 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 61 62 123 26.7007684960954 34.8615139875752 -8.16074549147974 T:C T C 10 0.562282483670567 0.146306394184272 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 18 19 37 7.87891529392979 10.6833671897408 -2.80445189581098 C:G G C 10 0.562282483670567 0.408261702249612 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 A:G G A 10 0.562282483670567 0.348175446579672 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 T:C T C 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 92 102 194 40.2700115023078 57.3528133343978 -17.08280183209 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0139036628944414 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 34 26 60 14.8823955552007 14.6193445754347 0.26305097976598 A:T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:C A C 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G A G 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 27 42 69 11.8183729408947 23.6158643141638 -11.7974913732691 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00500141327052753 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 46 33 79 20.1350057511539 18.5553219611287 1.57968379002521 T:C C T 10 0.562282483670567 0.735454652225273 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 14 13 27 6.12804522861206 7.30967228771737 -1.18162705910531 A:G G A 10 0.562282483670567 0.700216367058198 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 2 12 14 0.875435032658866 6.7473898040468 -5.87195477138794 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00191893368034807 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35592445 C/G 1 18 12 30 7.87891529392979 6.7473898040468 1.13152548988299 C:G C G 10 0.562282483670567 0.716833592735589 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 10 20 30 4.37717516329433 11.2456496734113 -6.86847451011701 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0155142792554727 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35593137 C/T 1 68 48 116 29.7647911104014 26.9895592161872 2.77523189421423 T:C C T 10 0.562282483670567 0.640509837175563 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 97 63 160 42.458599083955 35.4237964712457 7.03480261270928 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.300256960320799 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 795 947 1742 347.985425481899 532.481512036027 -184.496086554128 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 8.98856038885856e-19 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 39685330 C/T 0 17 0 17 7.44119777760036 0 7.44119777760036 C C 10 0.562282483670567 7.42873211038224e-05 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 20 7 27 8.75435032658866 3.93597738569397 4.81837294089469 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0796027683683236 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 19 24 43 8.31663281025923 13.4947796080936 -5.17814679783438 A:G G A 10 0.562282483670567 0.124946815999759 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 61997226 C/T 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61997125_61997313:PRKCH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 46 33 79 20.1350057511539 18.5553219611287 1.57968379002521 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.735454652225273 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 62249073 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000023608:ENST00000216294:exon_62248965_62249115:SNAPC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 14 20 34 6.12804522861206 11.2456496734113 -5.11760444479928 T:G G T 10 0.562282483670567 0.085044169403022 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 18 14 32 7.87891529392979 7.87195477138794 0.00696052254185631 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 26 18 44 11.3806554245653 10.1210847060702 1.25957071849505 T:C T C 10 0.562282483670567 0.762560692234694 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:C C T 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 73711394 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000100767:ENST00000340738:exon_73711352_73711467:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000216658:exon_73711352_73711467:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000427855:exon_73711352_73711467:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000381166:exon_73711352_73711467:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000394134:exon_73711352_73711467:PAPLN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 4 13 17 1.75087006531773 7.30967228771737 -5.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0119190033802474 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 A:T A T 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:G G T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 3 8 11 1.3131525489883 4.49825986936454 -3.18510732037624 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0684806772479422 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 25 16 41 10.9429379082358 8.99651973872907 1.94641816950675 A:T T A 10 0.562282483670567 0.637504474126585 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 21 16 37 9.19206784291809 8.99651973872907 0.195548104189021 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 12 27 39 5.2526101959532 15.1816270591053 -9.92901686315211 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00181008202312190 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 19 14 33 8.31663281025923 7.87195477138794 0.444678038871289 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 51 55 106 22.3235933328011 30.9255366018812 -8.6019432690801 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0965837874499693 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 81 79 160 35.4551188226841 44.4203162099748 -8.96519738729072 A:G A G 10 0.562282483670567 0.175366476009414 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 203 181 384 88.8566558148749 101.773129544373 -12.9164737294977 A:G G A 10 0.562282483670567 0.198452285003324 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 67 69 136 29.327073594072 38.7974913732691 -9.47041777919711 A:C:G A C 10 0.562282483670567 0.119462011901698 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 108 89 197 47.2734917635788 50.0431410466805 -2.76964928310169 A:C C A 10 0.562282483670567 0.719744249281077 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 43 39 82 18.8218532021656 21.9290168631521 -3.10716366098649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.505694131426191 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 91666162 G/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 8 9 17 3.50174013063546 5.0605423530351 -1.55880222239964 A:G G A 10 0.562282483670567 0.472203671514815 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 T:C C T 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 A:G G A 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G G A 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 93650465 A/C 1 15 10 25 6.5657627449415 5.62282483670567 0.942937908235826 A:C A C 10 0.562282483670567 0.8409335601195 ENSG00000165943:ENST00000298894:exon_93648542_93650707:MOAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 94527260 T/C 1 139 135 274 60.8427347697912 75.9081352955265 -15.0654005257354 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.0679552172580488 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94527259_94527412:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94527259_94527412:DDX24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 94563265 C/T 0 16 0 16 7.00348026127093 0 7.00348026127093 C C 10 0.562282483670567 0.000138972250073360 ENSG00000165948:ENST00000298901:exon_94563233_94563311:IFI27L1;ENSG00000165948:ENST00000393115:exon_94563187_94563311:IFI27L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 95918625 T/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95918584_95918720:C14orf49 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 14 4 18 6.12804522861206 2.24912993468227 3.87891529392979 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0940670681342025 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 T:C T C 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 C:G G C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 420 349 769 183.841356858362 196.236586801028 -12.395229942666 A:G G A 10 0.562282483670567 0.383081898519589 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 27 36 63 11.8183729408947 20.2421694121404 -8.42379647124572 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0413671669567674 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 13 15 28 5.69032771228263 8.43423725505851 -2.74390954277588 C:G C G 10 0.562282483670567 0.342577207481454 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 24 45 69 10.5052203919064 25.3027117651755 -14.7974913732691 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000381190929474450 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 22 22 0 12.3702146407525 -12.3702146407525 C:G A C 10 0.562282483670567 1.27722196529743e-08 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 105180785 C/T 1 34 17 51 14.8823955552007 9.55880222239964 5.32359333280108 T:C C T 10 0.562282483670567 0.158092884816536 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 105236684 C/T 1 75 91 166 32.8288137247075 51.1677060140216 -18.3388922893141 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00474601018544757 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105235689_105236757:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105235689_105236757:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105235689_105236757:AKT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 105393556 G/C 1 11 1 12 4.81489267962376 0.562282483670567 4.2526101959532 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0165281900059062 ENSG00000166428:ENST00000392593:exon_105393478_105393567:PLD4;ENSG00000166428:ENST00000472901:exon_105393478_105393567:PLD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 29 33 62 12.6938079735536 18.5553219611287 -5.86151398757515 A:G G A 10 0.562282483670567 0.158734748399344 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106066690 A/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:C A C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106110137 C/T 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 C C 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106204113 C/T 1 1 12 13 0.437717516329433 6.7473898040468 -6.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000383250317598570 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 6202 1177 7379 2714.72403627514 661.806483280257 2052.91755299489 A:T:C:G T C 10 0.562282483670567 4.94065645841247e-324 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 5857 1257 7114 2563.71149314149 706.789081973903 1856.92241116759 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 4.94065645841247e-324 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106330071 T/G 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 T:G T G 10 0.562282483670567 0.127683379833145 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 14 106733593 G/A 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 23931507 G/A 0 21 0 21 9.19206784291809 0 9.19206784291809 G G 10 0.562282483670567 6.42738930371318e-06 ENSG00000182636:ENST00000331837:exon_23930565_23932450:NDN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:G G A 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 448 5 453 196.097447315586 2.81141241835283 193.286034897233 C:G C G 10 0.562282483670567 3.8165965512352e-103 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 478 28 506 209.228972805469 15.7439095427759 193.485063262693 A:G G A 10 0.562282483670567 2.99750333210221e-84 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 460 34 494 201.350057511539 19.1176044447993 182.23245306674 T:C T C 10 0.562282483670567 4.39539027684576e-75 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 72 78 150 31.5156611757192 43.8580337263042 -12.3423725505851 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0479901641229053 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 87 84 171 38.0814239206607 47.2317286283276 -9.15030470766696 A:G G A 10 0.562282483670567 0.165681738824929 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 1283 1225 2508 561.591573450663 688.796042496445 -127.204469045782 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 3.47710898687213e-07 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 13 9 22 5.69032771228263 5.0605423530351 0.629785359247526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.833252046495637 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40685797 A/C 1 52 40 92 22.7613108491305 22.4912993468227 0.270011502307838 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 40758337 A/C 1 2 10 12 0.875435032658866 5.62282483670567 -4.7473898040468 A:C A C 10 0.562282483670567 0.00719832689368664 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40758140_40760441:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40758140_40760426:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40758140_40760426:BAHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 41148250 C/T 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 43531411 G/C 1 11 2 13 4.81489267962376 1.12456496734113 3.69032771228263 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0490871078985576 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43531361_43531464:TGM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 44751350 C/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000137770:ENST00000260327:exon_44751189_44751398:CTDSPL2;ENSG00000137770:ENST00000396780:exon_44751189_44751398:CTDSPL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 12 5 17 5.2526101959532 2.81141241835283 2.44119777760036 A:G A G 10 0.562282483670567 0.328929887375812 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 44944341 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44944327_44944464:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44944327_44944464:SPG11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 33 13 46 14.4446780388713 7.30967228771737 7.13500575115392 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0372541948730149 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 19 5 24 8.31663281025923 2.81141241835283 5.50522039190639 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0239673019020508 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 49574217 C/T 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 T:C C T 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49574184_49574282:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49574184_49574282:GALK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 52350879 T/C 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:C T C 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52350830_52350994:MAPK6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 52404862 A/C 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52404435_52404972:BCL2L10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 20 12 32 8.75435032658866 6.7473898040468 2.00696052254186 A:G A G 10 0.562282483670567 0.593728963826907 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 58919999 T/C 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:C T C 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000137845:ENST00000260408:exon_58919899_58920082:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000396140:exon_58919899_58920082:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000396136:exon_58919899_58920082:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000475898:exon_58919899_58920082:ADAM10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 104 80 184 45.522621698261 44.9825986936454 0.540023004615676 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 C:G G C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 17 25 42 7.44119777760036 14.0570620917642 -6.61586431416381 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0435611222512426 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 11 34 45 4.81489267962376 19.1176044447993 -14.3027117651755 A:T A T 10 0.562282483670567 2.73651627704652e-05 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 66612965 T/C 1 10 1 11 4.37717516329433 0.562282483670567 3.81489267962376 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0289532072068827 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 13 13 26 5.69032771228263 7.30967228771737 -1.61934457543474 A:G A G 10 0.562282483670567 0.557199285252459 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 66782869 T/C 1 39 47 86 17.0709831368479 26.4272767325166 -9.35629359566876 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.049921612644991 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66782840_66783882:MAP2K1;ENSG00000174446:ENST00000307979:exon_66782666_66783055:SNAPC5;ENSG00000174446:ENST00000395589:exon_66782666_66783055:SNAPC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:G T G 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 68492028 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 8 13 21 3.50174013063546 7.30967228771737 -3.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.122676963602703 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 15 8 23 6.5657627449415 4.49825986936454 2.06750287557696 T:C T C 10 0.562282483670567 0.41049601681712 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 71125093 G/A 1 33 37 70 14.4446780388713 20.804451895811 -6.35977385693969 A:G G A 10 0.562282483670567 0.147916170215277 ENSG00000166173:ENST00000299213:exon_71123877_71125455:LARP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 71125204 A/G 1 31 36 67 13.5692430062124 20.2421694121404 -6.67292640592799 A:G A G 10 0.562282483670567 0.109811261502872 ENSG00000166173:ENST00000299213:exon_71123877_71125455:LARP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 88 81 169 38.5191414369901 45.5448811773159 -7.02573974032583 A:G A G 10 0.562282483670567 0.278794386691991 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 104 91 195 45.522621698261 51.1677060140216 -5.64508431576056 T:G G T 10 0.562282483670567 0.427757181916563 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 174 135 309 76.1628478413213 75.9081352955265 0.254712545794789 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 110 71 181 48.1489267962376 39.9220563406103 8.22687045562738 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.231061265813825 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 26 13 39 11.3806554245653 7.30967228771737 4.07098313684789 A:G G A 10 0.562282483670567 0.200871978387531 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 36 30 66 15.7578305878596 16.868474510117 -1.11064392225742 A:C C A 10 0.562282483670567 0.80488987968461 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 28 28 56 12.2560904572241 15.7439095427759 -3.48781908555175 T:C T C 10 0.562282483670567 0.349652594289409 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 19 34 53 8.31663281025923 19.1176044447993 -10.80097163454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00336690872043204 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 51 48 99 22.3235933328011 26.9895592161872 -4.66596588338613 T:G T G 10 0.562282483670567 0.362824040164085 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75501138 T/A 1 70 68 138 30.6402261430603 38.2352088895986 -7.59498274653824 A:T T A 10 0.562282483670567 0.198866729006958 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75500022_75501217:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 75503147 G/A 1 100 121 221 43.7717516329433 68.0361805241386 -24.2644288911953 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00110782121618981 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 77224716 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77224702_77224807:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77224702_77224807:RCN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 77325279 C/T 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77325203_77325293:PSTPIP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 78885574 T/A 1 15 6 21 6.5657627449415 3.3736949020234 3.19206784291809 A:T T A 10 0.562282483670567 0.190440128145316 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78885434_78887611:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78885434_78887611:CHRNA5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 2 8 10 0.875435032658866 4.49825986936454 -3.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0259060599003915 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 43 113 156 18.8218532021656 63.5379206547741 -44.7160674526084 T:C T C 10 0.562282483670567 5.34376818818524e-13 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 871 892 1763 381.251956722936 501.555975434146 -120.30401871121 T:C:G C T 10 0.562282483670567 9.1968909056446e-09 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 433 517 950 189.531684570645 290.700044057683 -101.168359487039 A:C A C 10 0.562282483670567 5.23635994108334e-11 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 577 554 1131 252.563006922083 311.504495953494 -58.9414890314112 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000449985570692336 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 81592012 G/C 1 32 33 65 14.0069605225419 18.5553219611287 -4.54836143858686 C:G G C 10 0.562282483670567 0.262919876396912 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 72 61 133 31.5156611757192 34.2992315039046 -2.78357032818541 A:G A G 10 0.562282483670567 0.662411543801253 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 86 59 145 37.6437064043312 33.1746665365634 4.46903986776779 T:G T G 10 0.562282483670567 0.503289843116412 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 59 39 98 25.8253334634365 21.9290168631521 3.89631660028443 A:G G A 10 0.562282483670567 0.476443518354966 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 51 44 95 22.3235933328011 24.7404292815049 -2.41683594870386 A:G A G 10 0.562282483670567 0.679368654459208 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 C:G C G 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 85149771 G/T 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:G G T 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000176371:ENST00000334141:exon_85149760_85150116:ZSCAN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 85188994 T/C 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 T:C T C 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 15 5 20 6.5657627449415 2.81141241835283 3.75435032658866 T:C C T 10 0.562282483670567 0.1147842219571 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 T:C C T 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 89173292 G/A 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G G A 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89173289_89175513:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89173289_89173455:AEN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 89173480 C/T 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89173289_89175513:AEN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 23 8 31 10.067502875577 4.49825986936454 5.56924300621242 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0470930602226456 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 55 69 124 24.0744633981188 38.7974913732691 -14.7230279751503 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00854088314175461 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 34 21 55 14.8823955552007 11.8079321570819 3.07446339811881 A:C C A 10 0.562282483670567 0.418900853844386 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 51 54 105 22.3235933328011 30.3632541182106 -8.03966078540953 T:C C T 10 0.562282483670567 0.116530699345979 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 22 22 44 9.62978535924753 12.3702146407525 -2.74042928150495 C:G G C 10 0.562282483670567 0.448670998808091 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 91428290 C/T 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000182511:ENST00000416779:exon_91428267_91428402:FES;ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000470152:exon_91428267_91428643:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000481665:exon_91428267_91428759:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000452243:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000443697:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91428276_91428488:FES HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 A:C A C 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 100269683 C/T 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 22 41 63 9.62978535924753 23.0535818304932 -13.4237964712457 A:C C A 10 0.562282483670567 0.000833956101240105 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 40 30 70 17.5087006531773 16.868474510117 0.64022614306031 C:G C G 10 0.562282483670567 0.904712149324213 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 32 23 55 14.0069605225419 12.932497124423 1.07446339811882 A:G G A 10 0.562282483670567 0.787857865820993 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 25 21 46 10.9429379082358 11.8079321570819 -0.864994248846083 A:C C A 10 0.562282483670567 0.882097505901343 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 19 7 26 8.31663281025923 3.93597738569397 4.38065542456526 A:T T A 10 0.562282483670567 0.112467924457939 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 20 18 38 8.75435032658866 10.1210847060702 -1.36673437948155 C:G C G 10 0.562282483670567 0.744213961211337 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:G G A 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 T:C T C 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101606120 G/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 T:C C T 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 16 19 35 7.00348026127093 10.6833671897408 -3.67988692846984 T:G G T 10 0.562282483670567 0.234761160479979 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101718106 G/A 1 7 13 20 3.06402261430603 7.30967228771737 -4.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0705527177728787 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101718190 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 15 101718529 T/C 1 11 5 16 4.81489267962376 2.81141241835283 2.00348026127093 T:C T C 10 0.562282483670567 0.450921881281376 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 180529 G/A 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 A:G G A 10 0.562282483670567 0.204465163412720 ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000457916:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000468260:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000456528:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000419636:exon_180521_180590:NPRL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:C C T 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 314829 C/T 1 21 18 39 9.19206784291809 10.1210847060702 -0.929016863152114 T:C C T 10 0.562282483670567 0.87204804809575 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 184 146 330 80.5400230046157 82.0932426159028 -1.5532196112871 A:G A G 10 0.562282483670567 0.867959389276789 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 421964 C/T 1 69 104 173 30.2025086267309 58.477378301739 -28.2748696750081 T:C C T 10 0.562282483670567 2.13551328794866e-05 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 163 199 362 71.3479551616976 111.894214250443 -40.5462590887452 A:T:G G A 10 0.562282483670567 2.10872699485252e-05 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 319 371 690 139.631887709089 208.60680144178 -68.9749137326912 T:C C T 10 0.562282483670567 1.64937044834478e-07 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 T:G G T 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 C:G C G 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 720960 C/T 1 12 12 24 5.2526101959532 6.7473898040468 -1.49477960809361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.544750822415298 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 13 5 18 5.69032771228263 2.81141241835283 2.87891529392979 A:G G A 10 0.562282483670567 0.235291245672474 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 722288 A/G 1 20 8 28 8.75435032658866 4.49825986936454 4.25609045722412 A:G A G 10 0.562282483670567 0.127865195430798 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 731771 C/T 1 108 102 210 47.2734917635788 57.3528133343978 -10.0793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.164714333213041 ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 13 17 30 5.69032771228263 9.55880222239964 -3.86847451011701 T:C T C 10 0.562282483670567 0.197161260272341 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 11 13 24 4.81489267962376 7.30967228771737 -2.49477960809361 A:G A G 10 0.562282483670567 0.312204567844798 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 11 16 27 4.81489267962376 8.99651973872907 -4.18162705910531 T:C T C 10 0.562282483670567 0.121657067505418 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 27 19 46 11.8183729408947 10.6833671897408 1.13500575115392 T:C T C 10 0.562282483670567 0.768461380525327 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 36 49 85 15.7578305878596 27.5518416998578 -11.7940111119982 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0116243354343523 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2009697 C/T 1 95 59 154 41.5831640512961 33.1746665365634 8.40849751473269 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.193692808002081 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 52 39 91 22.7613108491305 21.9290168631521 0.832293985978403 A:C A C 10 0.562282483670567 0.916029566099764 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 68 99 167 29.7647911104014 55.6659658833861 -25.9011747729847 T:C C T 10 0.562282483670567 6.29561137437662e-05 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 23 28 51 10.067502875577 15.7439095427759 -5.67640666719892 T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.121096138678746 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 21 22 43 9.19206784291809 12.3702146407525 -3.17814679783438 A:G A G 10 0.562282483670567 0.358262414274382 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2578131 C/T 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 T:C C T 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000293971:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000429721:exon_2577991_2578149:AMDHD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 27 18 45 11.8183729408947 10.1210847060702 1.69728823482449 A:G A G 10 0.562282483670567 0.654534312650397 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 21 24 45 9.19206784291809 13.4947796080936 -4.30271176517552 A:C C A 10 0.562282483670567 0.229525133790525 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 44 35 79 19.2595707184951 19.6798869284698 -0.420316209974793 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2814640 A/G 1 66 58 124 28.8893560777426 32.6123840528929 -3.72302797515031 A:G A G 10 0.562282483670567 0.526858198330778 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 70 87 157 30.6402261430603 48.9185760793393 -18.278349936279 A:C A C 10 0.562282483670567 0.00369398952029045 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 470 408 878 205.727232674834 229.411253337591 -23.6840206627578 T:G G T 10 0.562282483670567 0.109926032383398 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 76 60 136 33.2665312410369 33.736949020234 -0.470417779197113 T:G G T 10 0.562282483670567 0.931392719126551 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 5 15 20 2.18858758164717 8.43423725505851 -6.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00599272410494571 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 3339961 T/G 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 T:G T G 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 39 55 94 17.0709831368479 30.9255366018812 -13.8545534650333 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00479027305664836 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 5 14 19 2.18858758164717 7.87195477138794 -5.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0102806922238463 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 20 6 26 8.75435032658866 3.3736949020234 5.38065542456526 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0460562483197912 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 17 4 21 7.44119777760036 2.24912993468227 5.19206784291809 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0264251596207138 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 5135657 C/T 1 18 13 31 7.87891529392979 7.30967228771737 0.569243006212424 T:C C T 10 0.562282483670567 0.858912903398618 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5134305_5135733:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5134305_5135733:FAM86A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 30 31 61 13.131525489883 17.4307569937876 -4.29923150390458 C:G C G 10 0.562282483670567 0.302246972087392 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 A:C C A 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 10837913 C/G 1 26 18 44 11.3806554245653 10.1210847060702 1.25957071849505 C:G C G 10 0.562282483670567 0.762560692234694 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10837818_10837922:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10837818_10837922:NUBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 11035888 C/A 1 41 42 83 17.9464181695068 23.6158643141638 -5.66944614465706 A:C C A 10 0.562282483670567 0.224403785105061 ENSG00000182108:ENST00000331808:exon_11035426_11036317:DEXI;ENSG00000182108:ENST00000469379:exon_11035426_11035988:DEXI HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 11260440 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 26 40 66 11.3806554245653 22.4912993468227 -11.1106439222574 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00628443754385562 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:C C A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 23 10 33 10.067502875577 5.62282483670567 4.44467803887129 A:G G A 10 0.562282483670567 0.159512979795580 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 20 18 38 8.75435032658866 10.1210847060702 -1.36673437948155 T:C C T 10 0.562282483670567 0.744213961211337 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 20 34 54 8.75435032658866 19.1176044447993 -10.3632541182106 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00566288822486258 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 15826384 T/C 1 16 1 17 7.00348026127093 0.562282483670567 6.44119777760036 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000995546697136965 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 A:C C A 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 5 25 30 2.18858758164717 14.0570620917642 -11.868474510117 C:G G C 10 0.562282483670567 1.91026682409376e-05 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 21666714 C/T 1 71 56 127 31.0779436593897 31.4878190855518 -0.40987542616201 T:C:G C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197006:ENST00000358154:exon_21666548_21668794:METTL9;ENSG00000197006:ENST00000396014:exon_21666551_21668791:METTL9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 766 713 1479 335.291617508346 400.907410857114 -65.6157933487686 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.00065219510830216 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 24802878 G/C 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 C:G G C 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24802542_24803138:TNRC6A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 37 50 87 16.195548104189 28.1141241835284 -11.9185760793393 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0125305668166143 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 24 48 72 10.5052203919064 26.9895592161872 -16.4843388242808 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000114629568803333 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 A:G G A 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 28509069 C/T 1 10 19 29 4.37717516329433 10.6833671897408 -6.30619202644644 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0235269379343707 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 28947515 A/G 1 45 47 92 19.6972882348245 26.4272767325166 -6.72998849769217 A:G A G 10 0.562282483670567 0.172153031138044 ENSG00000177455:ENST00000380673:exon_28947474_28947522:CD19;ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28947474_28947522:CD19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:G G T 10 0.562282483670567 0.788964593115497 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 30393201 C/T 1 98 70 168 42.8963166002844 39.3597738569397 3.53654274334475 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.640948416284438 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393081_30393204:SEPT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 30666119 G/C 0 40 0 40 17.5087006531773 0 17.5087006531773 G G 10 0.562282483670567 1.98601819055811e-10 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 30735751 C/T 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000437252:exon_30734905_30736478:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000483083:exon_30734905_30736689:SRCAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 31091188 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 116 122 238 50.7752318942142 68.5984630078092 -17.8232311135949 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0220767188999390 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 15 4 19 6.5657627449415 2.24912993468227 4.31663281025923 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0622227262668639 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 37 33 70 16.195548104189 18.5553219611287 -2.35977385693969 T:C C T 10 0.562282483670567 0.630277970570313 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 60 73 133 26.263050979766 41.0466213079514 -14.7835703281854 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0110838302248365 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 56500132 C/T 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 56500176 T/A 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 27 21 48 11.8183729408947 11.8079321570819 0.0104407838127845 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 11 24 35 4.81489267962376 13.4947796080936 -8.67988692846984 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00352677689713531 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 57496678 C/T 1 10 19 29 4.37717516329433 10.6833671897408 -6.30619202644644 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0235269379343707 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57496299_57496722:POLR2C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 66600479 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000089505:ENST00000332695:exon_66600296_66600515:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000336328:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000528324:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000529386:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000528484:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000531885:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000533915:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000333001:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000529506:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000533078:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000457188:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000533666:exon_66600296_66600497:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000379490:exon_66600296_66600652:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000533953:exon_66600334_66600863:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000379500:exon_66600350_66600848:CMTM1;ENSG00000089505:ENST00000328020:exon_66600417_66600848:CMTM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 72822296 G/A 1 5 14 19 2.18858758164717 7.87195477138794 -5.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0102806922238463 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72816784_72822747:ZFHX3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 16 0 16 7.00348026127093 0 7.00348026127093 C C 10 0.562282483670567 0.000138972250073360 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 74706349 T/C 1 23 13 36 10.067502875577 7.30967228771737 2.75783058785959 T:C T C 10 0.562282483670567 0.403491782492216 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74705755_74706436:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74705755_74706436:MLKL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 75446565 T/C 1 41 49 90 17.9464181695068 27.5518416998578 -9.60542353035103 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0437462642889953 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75446433_75446652:CFDP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 2 9 11 0.875435032658866 5.0605423530351 -4.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0137431041574245 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 10 18 28 4.37717516329433 10.1210847060702 -5.74390954277588 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0352963746302327 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 32 31 63 14.0069605225419 17.4307569937876 -3.42379647124572 T:C C T 10 0.562282483670567 0.446375977615616 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 37 23 60 16.195548104189 12.932497124423 3.26305097976598 T:C C T 10 0.562282483670567 0.436486552696801 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 25 37 62 10.9429379082358 20.804451895811 -9.86151398757515 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0144595490764485 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 13 37 50 5.69032771228263 20.804451895811 -15.1141241835283 A:G G A 10 0.562282483670567 2.09987454760648e-05 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 26 22 48 11.3806554245653 12.3702146407525 -0.989559216187216 T:C C T 10 0.562282483670567 0.773304040888056 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 13 16 29 5.69032771228263 8.99651973872907 -3.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.26187889880372 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 19 22 41 8.31663281025923 12.3702146407525 -4.05358183049325 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.211266919291815 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 35 26 61 15.3201130715302 14.6193445754347 0.700768496095414 C:G C G 10 0.562282483670567 0.897894731268983 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 960 1010 1970 420.208815676256 567.905308507273 -147.696492831017 A:C:G G A 10 0.562282483670567 2.63886078957745e-11 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 9 1 10 3.9394576469649 0.562282483670567 3.37717516329433 A:C C A 10 0.562282483670567 0.050497554051754 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 2 14 16 0.875435032658866 7.87195477138794 -6.99651973872907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000498560360308717 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89220658 G/A 1 93 1 94 40.7077290186373 0.562282483670567 40.1454465349667 A:G G A 10 0.562282483670567 3.98527224921861e-22 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89220498_89222171:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89220498_89220997:ACSF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 60 69 129 26.263050979766 38.7974913732691 -12.5344403935031 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0327820074048072 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 6 17 23 2.6263050979766 9.55880222239964 -6.93249712442304 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00513979724637044 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 1523 1065 2588 666.643777369726 598.830845109154 67.8129322605726 T:C:G T G 10 0.562282483670567 0.00747179898088346 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 3353 2696 6049 1467.66683225259 1515.91357597585 -48.2467437232597 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.213498177147452 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89712374 A/C 1 24 13 37 10.5052203919064 7.30967228771737 3.19554810418902 A:C A C 10 0.562282483670567 0.323310835848676 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89712380 G/A 1 24 8 32 10.5052203919064 4.49825986936454 6.00696052254186 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0332009085403547 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89960253 C/T 1 20 25 45 8.75435032658866 14.0570620917642 -5.30271176517551 T:C C T 10 0.562282483670567 0.132607142328911 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89960136_89960266:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89960136_89960266:TCF25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 32 19 51 14.0069605225419 10.6833671897408 3.32359333280108 A:G G A 10 0.562282483670567 0.398254898723321 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 20 7 27 8.75435032658866 3.93597738569397 4.81837294089469 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0796027683683236 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 16 90103659 G/A 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90103640_90103807:GAS8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 16 8 24 7.00348026127093 4.49825986936454 2.50522039190639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.411148652552095 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G A G 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G A G 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 22 2 24 9.62978535924753 1.12456496734113 8.50522039190639 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000268969430538107 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1686410 T/C 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1686329_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1684986_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000476292:exon_1686404_1686452:SMYD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:G T G 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 25 20 45 10.9429379082358 11.2456496734113 -0.302711765175514 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 23 3 26 10.067502875577 1.6868474510117 8.38065542456526 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00058544965586909 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 218 198 416 95.4224185598164 111.331931766772 -15.9095132069559 C:G C G 10 0.562282483670567 0.125466493722 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 26 21 47 11.3806554245653 11.8079321570819 -0.427276732516649 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 23 24 47 10.067502875577 13.4947796080936 -3.42727673251665 A:G G A 10 0.562282483670567 0.377910630989545 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 18 13 31 7.87891529392979 7.30967228771737 0.569243006212424 T:C C T 10 0.562282483670567 0.858912903398618 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 T:C T C 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 14 15 29 6.12804522861206 8.43423725505851 -2.30619202644644 T:C C T 10 0.562282483670567 0.455263076280101 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:G G A 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 104 85 189 45.522621698261 47.7940111119982 -2.27138941373716 A:G G A 10 0.562282483670567 0.769490303772634 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 C:G C G 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 52 43 95 22.7613108491305 24.1781467978344 -1.41683594870386 A:G G A 10 0.562282483670567 0.836291454171315 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 4 14 18 1.75087006531773 7.87195477138794 -6.12108470607021 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00407093218302519 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:C C A 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 126 116 242 55.1524070575086 65.2247681057858 -10.0723610482772 A:G G A 10 0.562282483670567 0.195548693066226 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 C:G G C 10 0.562282483670567 0.22923565132677 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 49 30 79 21.4481583001422 16.868474510117 4.57968379002521 T:C C T 10 0.562282483670567 0.310067260007778 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 46 43 89 20.1350057511539 24.1781467978344 -4.04314104668046 C:G G C 10 0.562282483670567 0.394638836384715 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 14 16 30 6.12804522861206 8.99651973872907 -2.86847451011701 C:G C G 10 0.562282483670567 0.357959347956104 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 203 199 402 88.8566558148749 111.894214250443 -23.0375584355679 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0235736836650318 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 105 95 200 45.9603392145905 53.4168359487039 -7.45649673411339 A:G A G 10 0.562282483670567 0.318402424178799 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8025180 T/C 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8025712 A/G 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 A:G A G 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8025661_8025748:HES7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 18 4 22 7.87891529392979 2.24912993468227 5.62978535924753 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0170264151773366 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 12 17 29 5.2526101959532 9.55880222239964 -4.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.133721238743553 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8053146 C/T 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 T:G T G 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 17 9 26 7.44119777760036 5.0605423530351 2.38065542456526 T:C T C 10 0.562282483670567 0.43072895736667 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 32 26 58 14.0069605225419 14.6193445754347 -0.612384052892885 T:C C T 10 0.562282483670567 0.895241643181989 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 13 11 24 5.69032771228263 6.18510732037624 -0.494779608093608 A:G A G 10 0.562282483670567 0.840104106104026 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 78 53 131 34.1419662736958 29.8009716345401 4.34099463915572 A:G A G 10 0.562282483670567 0.481579870438031 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16062131 A/T 1 13 10 23 5.69032771228263 5.62282483670567 0.0675028755769596 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395848:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000437142:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000411510:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000436828:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000460276:exon_16062074_16062187:NCOR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 40 39 79 17.5087006531773 21.9290168631521 -4.42031620997479 A:G A G 10 0.562282483670567 0.364411422038541 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 37 37 74 16.195548104189 20.804451895811 -4.60890379162196 A:C A C 10 0.562282483670567 0.293219929320369 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 40 46 86 17.5087006531773 25.8649942488461 -8.35629359566876 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0815781245554414 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 4 13 17 1.75087006531773 7.30967228771737 -5.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0119190033802474 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 11 17 28 4.81489267962376 9.55880222239964 -4.74390954277588 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0860688622603035 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 11 18 29 4.81489267962376 10.1210847060702 -5.30619202644644 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0600681823301601 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 137 161 298 59.9672997371323 90.5274798709613 -30.560180133829 A:C A C 10 0.562282483670567 0.000441495023905861 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 10 16 26 4.37717516329433 8.99651973872907 -4.61934457543474 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0765271121281993 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 33 42 75 14.4446780388713 23.6158643141638 -9.17118627529253 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0361115213302480 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17717983 G/A 1 33 30 63 14.4446780388713 16.868474510117 -2.42379647124572 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.611851302402827 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17717929_17718061:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000490796:exon_17717930_17718061:SREBF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17948475 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000141034:ENST00000268719:exon_17948461_17948520:C17orf39;ENSG00000141034:ENST00000376345:exon_17948461_17948520:C17orf39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 18155401 G/A 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 A:G G A 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18155313_18155460:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18155313_18155460:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488221:exon_18155313_18155460:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488932:exon_18155370_18155460:FLII HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 18167397 G/T 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:G G T 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 40 30 70 17.5087006531773 16.868474510117 0.64022614306031 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.904712149324213 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 20108027 C/T 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 T:C C T 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 26 0 26 11.3806554245653 0 11.3806554245653 T T 10 0.562282483670567 5.82944009315009e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 31 0 31 13.5692430062124 0 13.5692430062124 G G 10 0.562282483670567 2.38135175552208e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 31 0 31 13.5692430062124 0 13.5692430062124 C C 10 0.562282483670567 2.38135175552208e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 14 0 14 6.12804522861206 0 6.12804522861206 C C 10 0.562282483670567 0.000495695397625499 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 38 0 38 16.6332656205185 0 16.6332656205185 C C 10 0.562282483670567 3.43033974626867e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 31 0 31 13.5692430062124 0 13.5692430062124 C C 10 0.562282483670567 2.38135175552208e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 19 0 19 8.31663281025923 0 8.31663281025923 C C 10 0.562282483670567 2.16168217411461e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 22 0 22 9.62978535924753 0 9.62978535924753 C C 10 0.562282483670567 3.5287304837497e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 22 0 22 9.62978535924753 0 9.62978535924753 G G 10 0.562282483670567 3.5287304837497e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 61 0 61 26.7007684960954 0 26.7007684960954 G G 10 0.562282483670567 7.5331339457282e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 150 164 314 65.6576274494149 92.214327321973 -26.556699872558 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00303912305318374 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 30 77 107 13.131525489883 43.2957512426337 -30.1642257527507 A:G G A 10 0.562282483670567 6.35323916235201e-09 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 105 98 203 45.9603392145905 55.1036833997156 -9.14334418512509 T:C C T 10 0.562282483670567 0.203279239940103 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 22 23 45 9.62978535924753 12.932497124423 -3.30271176517551 A:C A C 10 0.562282483670567 0.367969823165498 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 19 15 34 8.31663281025923 8.43423725505851 -0.117604444799278 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 A:C C A 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 95 79 174 41.5831640512961 44.4203162099748 -2.83715215867866 T:C C T 10 0.562282483670567 0.70258675156879 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27085342 G/A 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 67 66 133 29.327073594072 37.1106439222574 -7.78357032818541 T:C C T 10 0.562282483670567 0.189923075294404 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 26 35 61 11.3806554245653 19.6798869284698 -8.29923150390459 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0383830191062201 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 145 147 292 63.4690398677678 82.6555250995734 -19.1864852318056 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0249667619341942 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 13 18 31 5.69032771228263 10.1210847060702 -4.43075699378758 A:G A G 10 0.562282483670567 0.146375376416344 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 A:T T A 10 0.562282483670567 0.62681594206191 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 207 185 392 90.6075258801926 104.022259479055 -13.4147335988623 A:G A G 10 0.562282483670567 0.185597271574226 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 9 12 21 3.9394576469649 6.7473898040468 -2.80793215708191 C:G G C 10 0.562282483670567 0.272128834938488 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 33460484 G/A 1 11 19 30 4.81489267962376 10.6833671897408 -5.86847451011701 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0414100863325727 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 12 7 19 5.2526101959532 3.93597738569397 1.31663281025923 C:G G C 10 0.562282483670567 0.646955815494516 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 498 340 838 217.983323132058 191.176044447993 26.8072786840649 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.0649599034312727 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 218 103 321 95.4224185598164 57.9150958180684 37.507322741748 A:G A G 10 0.562282483670567 2.26399735871839e-05 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 217 104 321 94.984701043487 58.477378301739 36.507322741748 A:T T A 10 0.562282483670567 3.74159406323328e-05 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 51 55 106 22.3235933328011 30.9255366018812 -8.6019432690801 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0965837874499693 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 25 23 48 10.9429379082358 12.932497124423 -1.98955921618722 T:C T C 10 0.562282483670567 0.564449111885511 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 38031674 C/T 1 2 12 14 0.875435032658866 6.7473898040468 -5.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00191893368034807 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38031507_38031687:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38031507_38031687:ZPBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 18 8 26 7.87891529392979 4.49825986936454 3.38065542456526 T:C C T 10 0.562282483670567 0.235851425893108 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 89 83 172 38.9568589533195 46.6694461446571 -7.71258719133752 A:G G A 10 0.562282483670567 0.249291118354647 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 A:G A G 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 87 4 91 38.0814239206607 2.24912993468227 35.8322939859784 C:G G C 10 0.562282483670567 3.44130365644064e-17 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 99 6 105 43.3340341166139 3.3736949020234 39.9603392145905 A:G G A 10 0.562282483670567 2.73303972801355e-18 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 140 26 166 61.2804522861206 14.6193445754347 46.6611077106859 C:G G C 10 0.562282483670567 1.79201387926196e-14 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 22 13 35 9.62978535924753 7.30967228771737 2.32011307153016 T:G T G 10 0.562282483670567 0.49746931299468 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 22 11 33 9.62978535924753 6.18510732037624 3.44467803887129 T:C C T 10 0.562282483670567 0.292590454658416 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 16 18 34 7.00348026127093 10.1210847060702 -3.11760444479928 T:C T C 10 0.562282483670567 0.302913185765161 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 44 28 72 19.2595707184951 15.7439095427759 3.51566117571918 A:G G A 10 0.562282483670567 0.476301274229342 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 26 12 38 11.3806554245653 6.7473898040468 4.63326562051845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.143259910664721 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 30 26 56 13.131525489883 14.6193445754347 -1.48781908555175 T:C C T 10 0.562282483670567 0.688714484755638 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40475056 G/A 1 32 41 73 14.0069605225419 23.0535818304932 -9.04662130795139 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0341622996945971 ENSG00000168610:ENST00000264657:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000389272:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000404395:exon_40475022_40475161:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000471989:exon_40475053_40475643:STAT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 39 37 76 17.0709831368479 20.804451895811 -3.73346875896309 A:G A G 10 0.562282483670567 0.4191013024789 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 10 11 21 4.37717516329433 6.18510732037624 -1.80793215708191 A:G G A 10 0.562282483670567 0.511089966544315 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:C A C 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 2 9 11 0.875435032658866 5.0605423530351 -4.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0137431041574245 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42254527 T/G 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:G T G 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 47 56 103 20.5727232674834 31.4878190855518 -10.9150958180684 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0365450508024910 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 42980189 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000167131:ENST00000417826:exon_42979733_42982758:CCDC103;ENSG00000167131:ENST00000410006:exon_42979733_42980250:CCDC103;ENSG00000214447:ENST00000331733:exon_42979733_42982758:FAM187A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 63 82 145 27.5762035287543 46.1071636609865 -18.5309601322322 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.00246756770054422 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 130 161 291 56.9032771228263 90.5274798709613 -33.624202748135 A:G G A 10 0.562282483670567 9.0294266796515e-05 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 43216472 A/G 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:G A G 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43216388_43216527:ACBD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 43227224 G/T 1 50 60 110 21.8858758164716 33.736949020234 -11.8510732037624 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0267259838235605 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 43311463 C/T 1 9 12 21 3.9394576469649 6.7473898040468 -2.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.272128834938488 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43311439_43311567:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43311439_43311567:FMNL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 18 11 29 7.87891529392979 6.18510732037624 1.69380797355356 A:G G A 10 0.562282483670567 0.578675036997571 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 17 14 31 7.44119777760036 7.87195477138794 -0.430756993787577 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 45916018 C/G 1 50 55 105 21.8858758164716 30.9255366018812 -9.03966078540953 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0773633376036426 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 70 54 124 30.6402261430603 30.3632541182106 0.276972024849695 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 24 30 54 10.5052203919064 16.868474510117 -6.36325411821062 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0990756034106437 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 47297537 C/A 1 47 49 96 20.5727232674834 27.5518416998578 -6.97911843237443 A:C:G C A 10 0.562282483670567 0.180823529243588 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47297531_47297688:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47297531_47297688:ABI3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 26 27 53 11.3806554245653 15.1816270591053 -3.80097163454005 T:C C T 10 0.562282483670567 0.332965365644755 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48452776 A/C 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:C A C 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48823409 G/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 C:G G C 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 21 21 42 9.19206784291809 11.8079321570819 -2.61586431416382 T:C T C 10 0.562282483670567 0.439588605079845 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 8 15 23 3.50174013063546 8.43423725505851 -4.93249712442304 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0562099328114218 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 30 26 56 13.131525489883 14.6193445754347 -1.48781908555175 A:G G A 10 0.562282483670567 0.688714484755638 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 A:G G A 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 37 44 81 16.195548104189 24.7404292815049 -8.54488117731593 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0576192041126385 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61901529 T/C 1 14 43 57 6.12804522861206 24.1781467978344 -18.0501015692223 T:C T C 10 0.562282483670567 1.50147481205244e-06 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901444_61901599:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901444_61901599:FTSJ3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 11 16 27 4.81489267962376 8.99651973872907 -4.18162705910531 C:G G C 10 0.562282483670567 0.121657067505418 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 240 244 484 105.052203919064 137.196926015618 -32.1447220965544 A:T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.00335588452006153 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 350 359 709 153.201130715302 201.859411637734 -48.658280922432 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000273741256583407 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 37 37 74 16.195548104189 20.804451895811 -4.60890379162196 A:G A G 10 0.562282483670567 0.293219929320369 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 63 51 114 27.5762035287543 28.6764066671989 -1.10020313844463 A:G A G 10 0.562282483670567 0.850657182909245 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 100 116 216 43.7717516329433 65.2247681057858 -21.4530164728425 A:T:C T A 10 0.562282483670567 0.00387859422935497 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 7 12 19 3.06402261430603 6.7473898040468 -3.68336718974077 T:G G T 10 0.562282483670567 0.106515830446589 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 72469675 G/A 1 116 75 191 50.7752318942142 42.1711862752925 8.6040456189217 A:G G A 10 0.562282483670567 0.215839625912710 ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72469675_72470013:CD300A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 9 14 23 3.9394576469649 7.87195477138794 -3.93249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.139579078003703 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 72859078 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 17 12 29 7.44119777760036 6.7473898040468 0.693807973553557 T:C C T 10 0.562282483670567 0.853299084532438 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 59 67 126 25.8253334634365 37.672926405928 -11.8475929424914 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0385777508548348 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 54 67 121 23.6367458817894 37.672926405928 -14.0361805241386 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0130325699110757 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 A:G A G 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 11 1 12 4.81489267962376 0.562282483670567 4.2526101959532 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0165281900059062 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 34 47 81 14.8823955552007 26.4272767325166 -11.5448811773159 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0132441456325819 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 27 33 60 11.8183729408947 18.5553219611287 -6.73694902023402 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0906110992644153 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 20 22 42 8.75435032658866 12.3702146407525 -3.61586431416381 C:G G C 10 0.562282483670567 0.278871558416982 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 14 9 23 6.12804522861206 5.0605423530351 1.06750287557696 T:C C T 10 0.562282483670567 0.681505571752396 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 73897344 G/A 0 107 0 107 46.8357742472493 0 46.8357742472493 G G 10 0.562282483670567 2.40293475230388e-27 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477371:exon_73897282_73897505:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000471434:exon_73897282_73897598:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73897264_73898001:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000494179:exon_73897318_73898001:MRPL38 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 13 20 33 5.69032771228263 11.2456496734113 -5.55532196112871 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0550493446680247 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 82 78 160 35.8928363390135 43.8580337263042 -7.96519738729072 C:G G C 10 0.562282483670567 0.231901849893348 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 46 46 92 20.1350057511539 25.8649942488461 -5.72998849769216 T:C C T 10 0.562282483670567 0.248154743684867 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 27 25 52 11.8183729408947 14.0570620917642 -2.23868915086948 T:C T C 10 0.562282483670567 0.577139757286031 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 156 148 304 68.2839325473915 83.2178075832439 -14.9338750358524 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0935126598734265 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 9 15 24 3.9394576469649 8.43423725505851 -4.49477960809361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0976666229063362 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 56 42 98 24.5121809144482 23.6158643141638 0.896316600284432 A:G G A 10 0.562282483670567 0.91901950879067 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 14 25 39 6.12804522861206 14.0570620917642 -7.92901686315211 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0144607346723310 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 24 21 45 10.5052203919064 11.8079321570819 -1.30271176517552 T:C T C 10 0.562282483670567 0.764370143544778 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 13 10 23 5.69032771228263 5.62282483670567 0.0675028755769596 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 27 18 45 11.8183729408947 10.1210847060702 1.69728823482449 A:G G A 10 0.562282483670567 0.654534312650397 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76803659 T/C 1 20 14 34 8.75435032658866 7.87195477138794 0.882395555200723 T:C T C 10 0.562282483670567 0.863348059954762 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 76970879 A/G 1 2 22 24 0.875435032658866 12.3702146407525 -11.4947796080936 A:G A G 10 0.562282483670567 2.18989463665537e-06 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76970770_76970901:LGALS3BP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 25 35 60 10.9429379082358 19.6798869284698 -8.73694902023402 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0265900891596255 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78175483 T/C 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:C T C 10 0.562282483670567 0.740032520907838 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78350110 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78350101_78350343:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78350101_78350343:RNF213 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 89 70 159 38.9568589533195 39.3597738569397 -0.40291490362015 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 C:G G C 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:G T G 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 29 20 49 12.6938079735536 11.2456496734113 1.44815830014222 A:G A G 10 0.562282483670567 0.773826284252894 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80895933 A/G 1 11 18 29 4.81489267962376 10.1210847060702 -5.30619202644644 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0600681823301601 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80895925_80896012:TBCD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 25 29 54 10.9429379082358 16.3061920264464 -5.36325411821062 A:G G A 10 0.562282483670567 0.169793428192282 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 216 169 385 94.5469835271575 95.0257397403258 -0.478756213168282 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.959088542280338 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 34 32 66 14.8823955552007 17.9930394774581 -3.11064392225742 A:G A G 10 0.562282483670567 0.458465290984957 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 172 145 317 75.2874128086625 81.5309601322322 -6.24354732356973 C:G C G 10 0.562282483670567 0.497129839914651 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 22 24 46 9.62978535924753 13.4947796080936 -3.86499424884608 T:C T C 10 0.562282483670567 0.298325184833791 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 24 29 53 10.5052203919064 16.3061920264464 -5.80097163454005 T:C C T 10 0.562282483670567 0.127460210668479 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 12971179 C/T 1 19 17 36 8.31663281025923 9.55880222239964 -1.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.737958181938326 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12971152_12971250:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12971152_12971250:SEH1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 12984128 C/G 1 28 27 55 12.2560904572241 15.1816270591053 -2.92553660188118 C:G C G 10 0.562282483670567 0.497157392372205 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 13124609 T/C 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:C T C 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13124486_13125029:CEP192 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 18 18 36 7.87891529392979 10.1210847060702 -2.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.503152902402094 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.348175446579672 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 34205551 C/T 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34205474_34205712:FHOD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 34398883 G/A 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 A:G G A 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 A:G A G 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 43577787 T/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43577715_43577794:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43577715_43577794:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43577715_43577794:PSTPIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 25 9 34 10.9429379082358 5.0605423530351 5.88239555520072 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0557437441064895 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 18 10 28 7.87891529392979 5.62282483670567 2.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.44952159885089 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 28 34 62 12.2560904572241 19.1176044447993 -6.86151398757515 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0954803318500396 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 19 26 45 8.31663281025923 14.6193445754347 -6.30271176517551 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0706900410640858 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 51686146 C/G 1 266 208 474 116.432859343629 116.954756603478 -0.521897259848757 A:T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.963110832177767 ENSG00000134046:ENST00000256429:exon_51686135_51686273:MBD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 21 9 30 9.19206784291809 5.0605423530351 4.13152548988299 A:G G A 10 0.562282483670567 0.143702707288486 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 24 29 53 10.5052203919064 16.3061920264464 -5.80097163454005 T:C T C 10 0.562282483670567 0.127460210668479 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 129 123 252 56.4655596064969 69.1607454914797 -12.6951858849829 T:C T C 10 0.562282483670567 0.11252496360604 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 32 42 74 14.0069605225419 23.6158643141638 -9.60890379162196 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0260912218105838 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 30 42 72 13.131525489883 23.6158643141638 -10.4843388242808 A:G A G 10 0.562282483670567 0.016911050178539 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 41 42 83 17.9464181695068 23.6158643141638 -5.66944614465706 A:G G A 10 0.562282483670567 0.224403785105061 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 34 27 61 14.8823955552007 15.1816270591053 -0.299231503904586 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 72173173 G/T 1 19 34 53 8.31663281025923 19.1176044447993 -10.80097163454 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00336690872043204 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72173084_72173246:CNDP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 60 29 89 26.263050979766 16.3061920264464 9.95685895331954 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0417495814559829 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 19 11 30 8.31663281025923 6.18510732037624 2.13152548988299 T:C T C 10 0.562282483670567 0.467526269724852 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 20 6 26 8.75435032658866 3.3736949020234 5.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0460562483197912 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 18 74728823 C/T 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000197971:ENST00000382582:exon_74728788_74729051:MBP;ENSG00000197971:ENST00000355994:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397875:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397866:exon_74728788_74729018:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397865:exon_74728788_74729042:MBP;ENSG00000197971:ENST00000527041:exon_74728788_74729021:MBP;ENSG00000197971:ENST00000359645:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397869:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000354542:exon_74728788_74729217:MBP;ENSG00000197971:ENST00000526111:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000529144:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397868:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000473302:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000483025:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000493623:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000484548:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000467108:exon_74728788_74729014:MBP;ENSG00000197971:ENST00000459948:exon_74728788_74729017:MBP;ENSG00000197971:ENST00000482445:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000498683:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397863:exon_74724735_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397860:exon_74724735_74729224:MBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 579519 C/T 1 135 75 210 59.0918647044735 42.1711862752925 16.9206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0214993851663145 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 171 217 388 74.849695292333 122.015298956513 -47.16560366418 A:T:C C T 10 0.562282483670567 1.75511240044961e-06 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 223 310 533 97.6110061414636 174.307569937876 -76.6965637964122 A:T:C:G C G 10 0.562282483670567 3.20444791451366e-11 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 40 45 85 17.5087006531773 25.3027117651755 -7.79401111199819 T:C C T 10 0.562282483670567 0.100785973800083 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 24 30 54 10.5052203919064 16.868474510117 -6.36325411821062 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0990756034106437 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 890165 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_890137_890244:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_890137_890244:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_890137_890244:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_890137_890244:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_890137_890244:MED16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 964330 C/T 1 18 11 29 7.87891529392979 6.18510732037624 1.69380797355356 T:C C T 10 0.562282483670567 0.578675036997571 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964248_964431:ARID3A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 27 21 48 11.8183729408947 11.8079321570819 0.0104407838127845 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 43 25 68 18.8218532021656 14.0570620917642 4.76479111040145 A:G G A 10 0.562282483670567 0.272249613327268 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 38 23 61 16.6332656205185 12.932497124423 3.70076849609541 A:G A G 10 0.562282483670567 0.368350275333653 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 46 29 75 20.1350057511539 16.3061920264464 3.82881372470748 A:G A G 10 0.562282483670567 0.416038978884073 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 152 79 231 66.5330624820738 44.4203162099748 22.112746272099 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00345601929115185 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 40 38 78 17.5087006531773 21.3667343794815 -3.85803372630422 A:G A G 10 0.562282483670567 0.424653619073966 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 35 43 78 15.3201130715302 24.1781467978344 -8.85803372630422 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0518085448009338 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 C:G C G 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 T:C C T 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 58 50 108 25.3876159471071 28.1141241835284 -2.72650823642124 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.628234580260866 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 47 43 90 20.5727232674834 24.1781467978344 -3.60542353035103 T:C T C 10 0.562282483670567 0.45843944312853 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 49 37 86 21.4481583001422 20.804451895811 0.64370640433124 A:G G A 10 0.562282483670567 0.913888747360394 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1816807 G/A 1 28 22 50 12.2560904572241 12.3702146407525 -0.11412418352835 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1816697_1816812:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1816697_1816812:REXO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 16 13 29 7.00348026127093 7.30967228771737 -0.306192026446443 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 T:C C T 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 10 15 25 4.37717516329433 8.43423725505851 -4.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.110291001388382 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 1913058 C/T 1 15 13 28 6.5657627449415 7.30967228771737 -0.743909542775875 T:C C T 10 0.562282483670567 0.849760457614327 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 55 49 104 24.0744633981188 27.5518416998578 -3.47737830173897 A:G A G 10 0.562282483670567 0.491092555743343 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 52 49 101 22.7613108491305 27.5518416998578 -4.79053085072727 T:C T C 10 0.562282483670567 0.367065716085036 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 13 15 28 5.69032771228263 8.43423725505851 -2.74390954277588 A:G G A 10 0.562282483670567 0.342577207481454 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 84 70 154 36.7682713716724 39.3597738569397 -2.59150248526732 A:G G A 10 0.562282483670567 0.685292219137039 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 35 22 57 15.3201130715302 12.3702146407525 2.94989843077768 A:G A G 10 0.562282483670567 0.504957494753078 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:G T G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 24 29 53 10.5052203919064 16.3061920264464 -5.80097163454005 A:G G A 10 0.562282483670567 0.127460210668479 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2248152 T/C 1 141 133 274 61.7181698024501 74.7835703281854 -13.0654005257353 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.113717705648398 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 10 22 32 4.37717516329433 12.3702146407525 -7.99303947745814 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0065632242603355 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 81 54 135 35.4551188226841 30.3632541182106 5.09186470447345 A:G G A 10 0.562282483670567 0.387243048347731 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 79 69 148 34.5796837900252 38.7974913732691 -4.21780758324392 T:C T C 10 0.562282483670567 0.507909799308370 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 23 24 47 10.067502875577 13.4947796080936 -3.42727673251665 T:G G T 10 0.562282483670567 0.377910630989545 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 34 37 71 14.8823955552007 20.804451895811 -5.92205634061026 T:C T C 10 0.562282483670567 0.187889556328411 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 59 72 131 25.8253334634365 40.4843388242808 -14.6590053608443 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0105869697204078 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:C C T 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 118 173 291 51.6506669268731 97.2748696750081 -45.624202748135 T:C C T 10 0.562282483670567 8.58914380141007e-08 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4054628 G/A 0 39 0 39 17.0709831368479 0 17.0709831368479 G G 10 0.562282483670567 1.90036201072447e-10 ENSG00000178951:ENST00000322357:exon_4053969_4055245:ZBTB7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 13 16 29 5.69032771228263 8.99651973872907 -3.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.26187889880372 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4357345 C/T 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 T:C C T 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4357250_4357418:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4357250_4357418:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4357250_4357418:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4357250_4357418:MPND HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4359199 G/A 1 7 13 20 3.06402261430603 7.30967228771737 -4.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0705527177728787 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4359160_4359252:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4359160_4359252:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4359160_4359252:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4359160_4359252:MPND HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 A:G G A 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 5696157 C/T 1 66 68 134 28.8893560777426 38.2352088895986 -9.34585281185597 T:C C T 10 0.562282483670567 0.116836533395641 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 17 16 33 7.44119777760036 8.99651973872907 -1.55532196112871 A:G G A 10 0.562282483670567 0.602607785332713 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 16 16 32 7.00348026127093 8.99651973872907 -1.99303947745814 T:G G T 10 0.562282483670567 0.482266568510133 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 11 19 30 4.81489267962376 10.6833671897408 -5.86847451011701 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0414100863325727 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 69 100 169 30.2025086267309 56.2282483670567 -26.0257397403258 T:C T C 10 0.562282483670567 6.86483614130158e-05 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 1895 1562 3457 829.474693444276 878.285239493426 -48.81054604915 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.0963612646982025 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 14 4 18 6.12804522861206 2.24912993468227 3.87891529392979 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0940670681342025 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 6850762 G/C 1 23 22 45 10.067502875577 12.3702146407525 -2.30271176517551 C:G G C 10 0.562282483670567 0.548669484985661 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6850681_6850768:VAV1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 4 13 17 1.75087006531773 7.30967228771737 -5.55880222239964 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0119190033802474 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 49 41 90 21.4481583001422 23.0535818304932 -1.60542353035103 A:G G A 10 0.562282483670567 0.750740240729868 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 93 71 164 40.7077290186373 39.9220563406103 0.785672678027012 T:C T C 10 0.562282483670567 0.937360338640625 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7762440 C/T 1 653 653 1306 285.82953816312 367.17046183688 -81.3409236737605 A:T:C C T 10 0.562282483670567 6.9362086472578e-06 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7762413_7762475:FCER2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 A:G A G 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 17 26 43 7.44119777760036 14.6193445754347 -7.17814679783438 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0311979507732786 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 130 136 266 56.9032771228263 76.4704177791971 -19.5671406563708 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0159832845703615 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 95 148 243 41.5831640512961 83.2178075832439 -41.6346435319478 T:C C T 10 0.562282483670567 8.98370599193903e-08 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 83 113 196 36.3305538553429 63.5379206547741 -27.2073667994311 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000123861567006730 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 25 20 45 10.9429379082358 11.2456496734113 -0.302711765175514 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 20 19 39 8.75435032658866 10.6833671897408 -1.92901686315211 A:G G A 10 0.562282483670567 0.628820490474955 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 21 11 32 9.19206784291809 6.18510732037624 3.00696052254186 A:G A G 10 0.562282483670567 0.373296241940896 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 22 17 39 9.62978535924753 9.55880222239964 0.0709831368478877 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 9271707 C/T 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 A:C C A 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 14 29 43 6.12804522861206 16.3061920264464 -10.1781467978344 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00196189442333501 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 9524997 G/A 1 18 18 36 7.87891529392979 10.1210847060702 -2.24216941214041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.503152902402094 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 71 82 153 31.0779436593897 46.1071636609865 -15.0292200015968 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0178349183825934 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 14 8 22 6.12804522861206 4.49825986936454 1.62978535924753 C:G C G 10 0.562282483670567 0.526873966582757 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 34 33 67 14.8823955552007 18.5553219611287 -3.67292640592799 T:C C T 10 0.562282483670567 0.389983897489063 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 465 451 916 203.538645093186 253.589400135426 -50.0507550422394 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.000968017852260135 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 278 310 588 121.685469539582 174.307569937876 -52.6221003982934 A:G A G 10 0.562282483670567 1.47070831269880e-05 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10226393 G/A 1 548 429 977 239.869198948529 241.219185494673 -1.34998654614395 A:G G A 10 0.562282483670567 0.948586626439709 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226360_10226496:EIF3G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 353 322 675 154.51428326429 181.054959741923 -26.5406764776327 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0398427039327101 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 C:G C G 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 105 86 191 45.9603392145905 48.3562935956688 -2.39595438107829 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.770602657817225 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 A:C A C 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10488969 G/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10488890_10489184:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531836:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530829:exon_10488890_10489102:TYK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 10 20 30 4.37717516329433 11.2456496734113 -6.86847451011701 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0155142792554727 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 25 17 42 10.9429379082358 9.55880222239964 1.38413568583619 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756541266317635 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10659659 C/T 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 24 40 64 10.5052203919064 22.4912993468227 -11.9860789549163 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00343551112669910 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 20 17 37 8.75435032658866 9.55880222239964 -0.804451895810978 A:G A G 10 0.562282483670567 0.868803625702392 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 8 16 24 3.50174013063546 8.99651973872907 -5.49477960809361 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0373118788378874 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11018788 G/A 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 A:G G A 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11018715_11018821:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11018715_11018821:CARM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11031582 G/A 1 62 57 119 27.1384860124248 32.0501015692223 -4.91161555679748 A:G G A 10 0.562282483670567 0.405783621305006 ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11031510_11031622:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11031510_11031622:CARM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 17 7 24 7.44119777760036 3.93597738569397 3.50522039190639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.216200247541120 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11123738 C/T 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11123625_11123788:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11123625_11123788:SMARCA4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11226800 C/T 1 3 9 12 1.3131525489883 5.0605423530351 -3.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0395973446901177 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11226770_11226888:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11226770_11226888:LDLR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11687195 C/T 1 16 18 34 7.00348026127093 10.1210847060702 -3.11760444479928 T:C C T 10 0.562282483670567 0.302913185765161 ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687058_11687403:ACP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 11687351 C/T 1 27 26 53 11.8183729408947 14.6193445754347 -2.80097163454005 T:C C T 10 0.562282483670567 0.489495525668245 ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687058_11687403:ACP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 43 39 82 18.8218532021656 21.9290168631521 -3.10716366098649 A:G G A 10 0.562282483670567 0.505694131426191 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 16 17 33 7.00348026127093 9.55880222239964 -2.55532196112871 T:G G T 10 0.562282483670567 0.385181118369198 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 111 120 231 48.5866443125671 67.473898040468 -18.887253727901 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0139926522949778 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 858 853 1711 375.561629010654 479.626958570994 -104.06532956034 T:C:G G T 10 0.562282483670567 4.44716632210785e-07 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 12 5 17 5.2526101959532 2.81141241835283 2.44119777760036 T:C T C 10 0.562282483670567 0.328929887375812 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 58 34 92 25.3876159471071 19.1176044447993 6.27001150230784 A:G G A 10 0.562282483670567 0.207747824301243 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 26 35 61 11.3806554245653 19.6798869284698 -8.29923150390459 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0383830191062201 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 25 32 57 10.9429379082358 17.9930394774581 -7.05010156922232 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.0626220416001665 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 17 22 39 7.44119777760036 12.3702146407525 -4.92901686315211 A:C C A 10 0.562282483670567 0.145406189723146 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 15483080 G/A 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G G A 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15483029_15483158:AKAP8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 33 23 56 14.4446780388713 12.932497124423 1.51218091444825 T:C C T 10 0.562282483670567 0.787945909344827 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 13 29 42 5.69032771228263 16.3061920264464 -10.6158643141638 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00152495097296975 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17412218 C/T 1 14 3 17 6.12804522861206 1.6868474510117 4.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0471313685088097 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 10 15 25 4.37717516329433 8.43423725505851 -4.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.110291001388382 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17648350 T/C 1 17 14 31 7.44119777760036 7.87195477138794 -0.430756993787577 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17648185_17648352:FAM129C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 21 13 34 9.19206784291809 7.30967228771737 1.88239555520072 A:G A G 10 0.562282483670567 0.605368107941141 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 21 9 30 9.19206784291809 5.0605423530351 4.13152548988299 T:C C T 10 0.562282483670567 0.143702707288486 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 37 14 51 16.195548104189 7.87195477138794 8.32359333280109 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0230558870748556 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17885270 A/G 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885203_17885287:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885203_17885287:FCHO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 A:G G A 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G A G 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 17937516 C/T 1 43 36 79 18.8218532021656 20.2421694121404 -1.42031620997479 T:C C T 10 0.562282483670567 0.820761345150637 ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17935595_17937719:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17936961_17937719:JAK3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18497137 G/A 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:G G A 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:T T A 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18499151 C/T 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 55 53 108 24.0744633981188 29.8009716345401 -5.72650823642124 C:G C G 10 0.562282483670567 0.286491892950065 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 88 0 88 38.5191414369901 0 38.5191414369901 C C 10 0.562282483670567 1.67705062438352e-22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 3663 3640 7303 1603.35926231471 2046.70824056086 -443.348978246151 A:T:C:G G T 10 0.562282483670567 2.12876003628539e-25 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 12 10 22 5.2526101959532 5.62282483670567 -0.370214640752474 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 16 10 26 7.00348026127093 5.62282483670567 1.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.694113498508926 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 21720644 G/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 21948570 T/C 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21948496_21948588:ZNF100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 C:G G C 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 3 10 13 1.3131525489883 5.62282483670567 -4.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0225421185889244 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 30313033 C/T 1 13 9 22 5.69032771228263 5.0605423530351 0.629785359247526 T:C C T 10 0.562282483670567 0.833252046495637 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30312903_30313037:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30312903_30313037:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30312903_30313037:CCNE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 11 16 27 4.81489267962376 8.99651973872907 -4.18162705910531 C:G C G 10 0.562282483670567 0.121657067505418 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 21 12 33 9.19206784291809 6.7473898040468 2.44467803887129 T:C C T 10 0.562282483670567 0.483667815114976 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 22 42 64 9.62978535924753 23.6158643141638 -13.9860789549163 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000565230936195763 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 67 14 81 29.327073594072 7.87195477138794 21.4551188226841 A:G G A 10 0.562282483670567 7.82532279636872e-07 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 83 67 150 36.3305538553429 37.672926405928 -1.34237255058505 C:G G C 10 0.562282483670567 0.869355799509361 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 87 85 172 38.0814239206607 47.7940111119982 -9.71258719133753 T:G T G 10 0.562282483670567 0.144367942222965 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 5 17 22 2.18858758164717 9.55880222239964 -7.37021464075247 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00197667560254115 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 26 12 38 11.3806554245653 6.7473898040468 4.63326562051845 A:G G A 10 0.562282483670567 0.143259910664721 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 16 14 30 7.00348026127093 7.87195477138794 -0.86847451011701 T:C C T 10 0.562282483670567 0.854434079224977 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 286 221 507 125.187209670218 124.264428891195 0.922780779022531 A:G A G 10 0.562282483670567 0.964306747428335 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 262 266 528 114.681989278311 149.567140656371 -34.8851513780594 A:T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.00244785113739344 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 16 6 22 7.00348026127093 3.3736949020234 3.62978535924753 A:T A T 10 0.562282483670567 0.136024450167174 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 36637149 A/G 1 310 310 620 135.692430062124 174.307569937876 -38.6151398757515 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00207156992641361 ENSG00000126247:ENST00000457326:exon_36637098_36637214:CAPNS1;ENSG00000126247:ENST00000246533:exon_36637098_36637214:CAPNS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 13 6 19 5.69032771228263 3.3736949020234 2.31663281025923 T:G G T 10 0.562282483670567 0.358026329995524 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 142 128 270 62.1558873187795 71.9721579098326 -9.81627059105309 T:C T C 10 0.562282483670567 0.243881776702207 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 38798263 C/T 1 35 43 78 15.3201130715302 24.1781467978344 -8.85803372630422 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0518085448009338 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798237_38798392:YIF1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 47 43 90 20.5727232674834 24.1781467978344 -3.60542353035103 T:C C T 10 0.562282483670567 0.45843944312853 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 A:C C A 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 78 62 140 34.1419662736958 34.8615139875752 -0.719547713879379 T:C T C 10 0.562282483670567 0.932203561669373 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 29 35 64 12.6938079735536 19.6798869284698 -6.98607895491629 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.100681530506670 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 26 23 49 11.3806554245653 12.932497124423 -1.55184169985778 T:C C T 10 0.562282483670567 0.668144037486415 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G A G 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 157 155 312 68.721650063721 87.1537849689379 -18.4321349052169 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0398005489110623 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39369910 A/G 1 24 39 63 10.5052203919064 21.9290168631521 -11.4237964712457 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00484288805336334 ENSG00000068903:ENST00000249396:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000392081:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000462654:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000479290:exon_39369197_39371376:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000402684:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000358931:exon_39369221_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000456703:exon_39369900_39369950:SIRT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39406709 T/A 1 22 32 54 9.62978535924753 17.9930394774581 -8.36325411821062 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0274196454145715 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39406677_39406769:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39406677_39406769:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39406677_39406769:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39406677_39406769:FBXO17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 39915822 G/A 1 33 39 72 14.4446780388713 21.9290168631521 -7.48433882428082 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.0956219660714247 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 32 11 43 14.0069605225419 6.18510732037624 7.82185320216562 T:C T C 10 0.562282483670567 0.020113130923147 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 71 17 88 31.0779436593897 9.55880222239964 21.5191414369901 C:G C G 10 0.562282483670567 2.37248991628219e-06 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 77 73 150 33.7042487573663 41.0466213079514 -7.34237255058505 A:G A G 10 0.562282483670567 0.249285041386238 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 29 16 45 12.6938079735536 8.99651973872907 3.69728823482449 T:C T C 10 0.562282483670567 0.295357330724318 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 25 21 46 10.9429379082358 11.8079321570819 -0.864994248846083 T:C T C 10 0.562282483670567 0.882097505901343 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 16 6 22 7.00348026127093 3.3736949020234 3.62978535924753 T:C T C 10 0.562282483670567 0.136024450167174 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G A G 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 210 157 367 91.9206784291809 88.278349936279 3.64232849290192 A:G A G 10 0.562282483670567 0.712989542542913 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 145 128 273 63.4690398677678 71.9721579098326 -8.50311804206479 A:T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.300481291024395 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41307170 G/A 1 36 48 84 15.7578305878596 26.9895592161872 -11.2317286283276 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0153085001292039 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 23 20 43 10.067502875577 11.2456496734113 -1.17814679783438 A:G G A 10 0.562282483670567 0.759680684735222 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 83 51 134 36.3305538553429 28.6764066671989 7.65414718814403 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.192283231707328 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 100 86 186 43.7717516329433 48.3562935956688 -4.58454196272546 A:G A G 10 0.562282483670567 0.506693976242275 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41930408 C/T 1 101 86 187 44.2094691492727 48.3562935956688 -4.14682444639602 T:C C T 10 0.562282483670567 0.555936637667818 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 14 19 33 6.12804522861206 10.6833671897408 -4.55532196112871 C:G C G 10 0.562282483670567 0.117117237642541 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 21 11 32 9.19206784291809 6.18510732037624 3.00696052254186 T:C T C 10 0.562282483670567 0.373296241940896 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 42083673 T/C 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 42083820 C/G 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 C:G C G 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 42083849 C/A 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 A:C C A 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 74 88 162 32.391096208378 49.4808585630099 -17.0897623546319 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00708702798212121 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 6 13 19 2.6263050979766 7.30967228771737 -4.68336718974077 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0369601410754297 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44103010 G/A 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 A:G G A 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000124444:ENST00000391965:exon_44102983_44104156:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000525771:exon_44102983_44104522:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000533118:exon_44102983_44103646:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000528387:exon_44102983_44103677:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000529930:exon_44102983_44103566:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000336564:exon_44102983_44105309:ZNF576 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:G A G 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:C C T 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 A:T A T 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.348175446579672 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 14 12 26 6.12804522861206 6.7473898040468 -0.619344575434742 A:G A G 10 0.562282483670567 0.844970193666619 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 13 17 30 5.69032771228263 9.55880222239964 -3.86847451011701 A:G A G 10 0.562282483670567 0.197161260272341 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:C T C 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 C:G C G 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 26 21 47 11.3806554245653 11.8079321570819 -0.427276732516649 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 36 18 54 15.7578305878596 10.1210847060702 5.63674588178938 A:G A G 10 0.562282483670567 0.132672293070334 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 25 17 42 10.9429379082358 9.55880222239964 1.38413568583619 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756541266317635 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 15 23 38 6.5657627449415 12.932497124423 -6.36673437948154 A:T:C C A 10 0.562282483670567 0.0485483496428518 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 37 31 68 16.195548104189 17.4307569937876 -1.23520888959855 T:C C T 10 0.562282483670567 0.807329783658913 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 42 35 77 18.3841356858362 19.6798869284698 -1.29575124263366 C:G G C 10 0.562282483670567 0.818586122418758 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 C:G G C 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 22 10 32 9.62978535924753 5.62282483670567 4.00696052254186 A:C A C 10 0.562282483670567 0.211638186576028 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 24 23 47 10.5052203919064 12.932497124423 -2.42727673251665 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.556943629630022 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 2 8 10 0.875435032658866 4.49825986936454 -3.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0259060599003915 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 A:G G A 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:C T C 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 283 298 581 123.87405712123 167.560180133829 -43.6861230125994 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.000315547526045344 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 A:T A T 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 12 1 13 5.2526101959532 0.562282483670567 4.69032771228263 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0094150135690741 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 48954395 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 37 32 69 16.195548104189 17.9930394774581 -1.79749137326912 A:G G A 10 0.562282483670567 0.716294947932365 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 49518359 C/T 1 101 79 180 44.2094691492727 44.4203162099748 -0.210847060702058 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49518278_49518407:RUVBL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50312801 C/T 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 T:C C T 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000527973:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529004:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528043:exon_50312652_50312832:FUZ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50321858 G/A 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321828_50321873:MED25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 22 33 55 9.62978535924753 18.5553219611287 -8.92553660188119 A:T:G T G 10 0.562282483670567 0.0200702774698903 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50361353 C/T 1 46 41 87 20.1350057511539 23.0535818304932 -2.91857607933933 T:C C T 10 0.562282483670567 0.589255396302443 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361314_50361371:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361314_50361371:PTOV1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 25 25 50 10.9429379082358 14.0570620917642 -3.11412418352835 T:C T C 10 0.562282483670567 0.394805263532455 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50383679 C/G 1 8 16 24 3.50174013063546 8.99651973872907 -5.49477960809361 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0373118788378874 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 571 258 829 249.936701824106 145.068880787006 104.8678210371 A:G A G 10 0.562282483670567 1.11032317221204e-13 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 114 68 182 49.8997968615554 38.2352088895986 11.6645879719568 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0858529390779683 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 73 59 132 31.9533786920486 33.1746665365634 -1.22128784451484 T:C C T 10 0.562282483670567 0.860909603981474 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 107 185 292 46.8357742472493 104.022259479055 -57.1864852318056 A:T:C T C 10 0.562282483670567 2.23054988791177e-11 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 961 349 1310 420.646533192585 196.236586801028 224.409946391557 A:G G A 10 0.562282483670567 1.53302700367681e-37 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 29 21 50 12.6938079735536 11.8079321570819 0.88587581647165 A:G G A 10 0.562282483670567 0.88697842307912 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50912418 C/G 1 13 11 24 5.69032771228263 6.18510732037624 -0.494779608093608 C:G C G 10 0.562282483670567 0.840104106104026 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50912379_50912492:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50912379_50912492:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50912379_50912492:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50912379_50912492:POLD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 45 45 90 19.6972882348245 25.3027117651755 -5.60542353035103 T:C C T 10 0.562282483670567 0.243753986535758 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 51301538 T/C 1 316 303 619 138.318735160101 170.371592552182 -32.052857392081 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.0106492112171018 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52468203 T/A 1 13 2 15 5.69032771228263 1.12456496734113 4.5657627449415 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0183526070130827 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G A G 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:G T G 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52729030 C/T 1 505 373 878 221.047345746364 209.731366409121 11.3159793372422 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.454357425846549 ENSG00000105568:ENST00000391791:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000423369:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000436460:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52728970_52729061:PPP2R1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:C A C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 10 11 0.437717516329433 5.62282483670567 -5.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00170994653654638 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 4 15 19 1.75087006531773 8.43423725505851 -6.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00224725908254518 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 6 10 16 2.6263050979766 5.62282483670567 -2.99651973872907 A:C C A 10 0.562282483670567 0.139618210498778 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 53269486 C/T 1 26 19 45 11.3806554245653 10.6833671897408 0.697288234824486 T:C C T 10 0.562282483670567 0.881482098272579 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 47 41 88 20.5727232674834 23.0535818304932 -2.4808585630099 T:C C T 10 0.562282483670567 0.593188826142439 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 26 31 57 11.3806554245653 17.4307569937876 -6.05010156922232 T:G T G 10 0.562282483670567 0.110779893005504 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 54966543 C/T 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 54973198 G/A 1 39 22 61 17.0709831368479 12.3702146407525 4.70076849609541 A:G G A 10 0.562282483670567 0.246979297578552 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54971946_54973217:LENG8;ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 51 25 76 22.3235933328011 14.0570620917642 8.26653124103691 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0639728793148282 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 60 24 84 26.263050979766 13.4947796080936 12.7682713716724 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00566137798150381 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 63 88 151 27.5762035287543 49.4808585630099 -21.9046550342556 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000391436821860471 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55756992 A/G 1 27 24 51 11.8183729408947 13.4947796080936 -1.67640666719892 A:G A G 10 0.562282483670567 0.67326079911163 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55758390 G/A 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55758245_55758657:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55758245_55758477:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55758245_55758477:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55758245_55758477:PPP6R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 55758427 C/T 1 13 14 27 5.69032771228263 7.87195477138794 -2.18162705910531 T:C C T 10 0.562282483670567 0.440802256425473 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55758245_55758657:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55758245_55758477:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55758245_55758477:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55758245_55758477:PPP6R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 34 45 79 14.8823955552007 25.3027117651755 -10.4203162099748 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0227669992836958 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 29 50 79 12.6938079735536 28.1141241835284 -15.4203162099748 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000590443771704713 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 111 98 209 48.5866443125671 55.1036833997156 -6.5170390871485 T:C C T 10 0.562282483670567 0.365696249816677 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 59 48 107 25.8253334634365 26.9895592161872 -1.16422575275067 A:G G A 10 0.562282483670567 0.845822787955806 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 11 3 14 4.81489267962376 1.6868474510117 3.12804522861206 C:G C G 10 0.562282483670567 0.110143719169354 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 26 31 57 11.3806554245653 17.4307569937876 -6.05010156922232 A:G A G 10 0.562282483670567 0.110779893005504 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 142 175 317 62.1558873187795 98.3994346423492 -36.2435473235697 A:G A G 10 0.562282483670567 5.44627835497009e-05 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 0 38 0 38 16.6332656205185 0 16.6332656205185 C C 10 0.562282483670567 3.43033974626867e-10 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 17 24 41 7.44119777760036 13.4947796080936 -6.05358183049325 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0601962799078577 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 45 44 89 19.6972882348245 24.7404292815049 -5.04314104668046 T:C C T 10 0.562282483670567 0.287200936903281 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 40 48 88 17.5087006531773 26.9895592161872 -9.4808585630099 A:G A G 10 0.562282483670567 0.052491218695772 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 14 13 27 6.12804522861206 7.30967228771737 -1.18162705910531 A:G A G 10 0.562282483670567 0.700216367058198 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 17 11 28 7.44119777760036 6.18510732037624 1.25609045722412 T:C T C 10 0.562282483670567 0.705814241129564 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 6990033 T/C 1 19 18 37 8.31663281025923 10.1210847060702 -1.80445189581098 T:C T C 10 0.562282483670567 0.62007199861035 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:C T C 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 315 240 555 137.881017643771 134.947796080936 2.93322156283531 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 0.830654174783991 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 40 43 83 17.5087006531773 24.1781467978344 -6.66944614465706 T:C C T 10 0.562282483670567 0.150892482622098 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 83 73 156 36.3305538553429 41.0466213079514 -4.71606745260845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.468106252964882 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 24 22 46 10.5052203919064 12.3702146407525 -1.86499424884608 T:C C T 10 0.562282483670567 0.656272490321413 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 20101487 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 32 25 57 14.0069605225419 14.0570620917642 -0.0501015692223188 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C C T 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 25053651 C/T 1 9 12 21 3.9394576469649 6.7473898040468 -2.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.272128834938488 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25053578_25053694:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25053578_25053694:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25053578_25053694:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25053578_25053694:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25053578_25053694:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25053578_25053694:ADCY3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 22 17 39 9.62978535924753 9.55880222239964 0.0709831368478877 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 5 9 14 2.18858758164717 5.0605423530351 -2.87195477138794 T:G G T 10 0.562282483670567 0.176515303158965 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27324724 G/C 1 12 1 13 5.2526101959532 0.562282483670567 4.69032771228263 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0094150135690741 ENSG00000138028:ENST00000452318:exon_27324656_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402394:exon_27323466_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000389521:exon_27324381_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000405600:exon_27323895_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000312734:exon_27323981_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000404694:exon_27324094_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000260595:exon_27324364_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000437850:exon_27324142_27324756:CGREF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27324751 G/T 1 14 1 15 6.12804522861206 0.562282483670567 5.56576274494149 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00305369291254029 ENSG00000138028:ENST00000452318:exon_27324656_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402394:exon_27323466_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000389521:exon_27324381_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000405600:exon_27323895_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000312734:exon_27323981_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000404694:exon_27324094_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000260595:exon_27324364_27324756:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000437850:exon_27324142_27324756:CGREF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27423913 G/A 1 17 20 37 7.44119777760036 11.2456496734113 -3.80445189581098 A:G G A 10 0.562282483670567 0.246365688336022 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27423866_27423981:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27423866_27423981:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27423866_27423981:SLC5A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 20 34 54 8.75435032658866 19.1176044447993 -10.3632541182106 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00566288822486258 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27430237 T/C 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:C T C 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000445802:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000401463:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000432106:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000426119:exon_27430172_27430658:SLC5A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27439751 G/T 1 149 144 293 65.2199099330855 80.9686776485617 -15.7487677154761 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0678993194149576 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27462651 T/C 1 18 15 33 7.87891529392979 8.43423725505851 -0.555321961128711 T:C T C 10 0.562282483670567 0.862268201844544 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 10 15 25 4.37717516329433 8.43423725505851 -4.05706209176418 A:G A G 10 0.562282483670567 0.110291001388382 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 8 18 26 3.50174013063546 10.1210847060702 -6.61934457543474 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0100131824761379 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 18 18 36 7.87891529392979 10.1210847060702 -2.24216941214041 A:G A G 10 0.562282483670567 0.503152902402094 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 77 71 148 33.7042487573663 39.9220563406103 -6.21780758324391 T:C T C 10 0.562282483670567 0.320524395984491 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 69 46 115 30.2025086267309 25.8649942488461 4.3375143778848 T:C T C 10 0.562282483670567 0.452621831783775 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 A:G G A 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 37232879 A/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:C A C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37232775_37232902:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37232775_37232902:HEATR5B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:G A G 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 14 6 20 6.12804522861206 3.3736949020234 2.75435032658866 T:C C T 10 0.562282483670567 0.263129063879924 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 6 11 17 2.6263050979766 6.18510732037624 -3.55880222239964 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0913332562302012 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 43520160 G/C 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 C:G G C 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA;ENSG00000115970:ENST00000486735:exon_43520131_43520352:THADA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 14 13 27 6.12804522861206 7.30967228771737 -1.18162705910531 T:C T C 10 0.562282483670567 0.700216367058198 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 21 20 41 9.19206784291809 11.2456496734113 -2.05358183049325 T:C T C 10 0.562282483670567 0.532518728833657 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 A:C C A 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 T:C C T 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 C:G G C 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 48018081 A/G 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G A G 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48018066_48018262:MSH6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 54035508 G/C 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 C:G G C 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 13 16 29 5.69032771228263 8.99651973872907 -3.30619202644644 A:G A G 10 0.562282483670567 0.26187889880372 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:T A T 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 29 17 46 12.6938079735536 9.55880222239964 3.13500575115392 T:C C T 10 0.562282483670567 0.376297635649850 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 55473595 G/A 1 18 11 29 7.87891529392979 6.18510732037624 1.69380797355356 A:G G A 10 0.562282483670567 0.578675036997571 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55473473_55473597:MTIF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 T:G G T 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 4 7 11 1.75087006531773 3.93597738569397 -2.18510732037624 A:C C A 10 0.562282483670567 0.22923565132677 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 26 31 57 11.3806554245653 17.4307569937876 -6.05010156922232 A:G G A 10 0.562282483670567 0.110779893005504 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 11 19 30 4.81489267962376 10.6833671897408 -5.86847451011701 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0414100863325727 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 17 29 46 7.44119777760036 16.3061920264464 -8.86499424884608 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0108473026173638 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C T C 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 24 22 46 10.5052203919064 12.3702146407525 -1.86499424884608 A:G A G 10 0.562282483670567 0.656272490321413 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 68592496 C/T 1 78 108 186 34.1419662736958 60.7265082364212 -26.5845419627255 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000110468110133466 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68592305_68592525:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68592322_68592525:PLEK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 80 52 132 35.0174013063546 29.2386891508695 5.77871215548516 T:G G T 10 0.562282483670567 0.335095110313046 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 69746296 C/T 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000115977:ENST00000409068:exon_69746086_69746372:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69746086_69746372:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69746086_69746372:AAK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 35 30 65 15.3201130715302 16.868474510117 -1.54836143858686 A:C A C 10 0.562282483670567 0.709255952090879 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 77 63 140 33.7042487573663 35.4237964712457 -1.71954771387938 T:G G T 10 0.562282483670567 0.798549203440305 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 33 31 64 14.4446780388713 17.4307569937876 -2.98607895491629 A:G G A 10 0.562282483670567 0.452999342006024 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 30 24 54 13.131525489883 13.4947796080936 -0.363254118210618 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 55 55 110 24.0744633981188 30.9255366018812 -6.85107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 0.211480826404847 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 92 73 165 40.2700115023078 41.0466213079514 -0.776609805643552 A:G G A 10 0.562282483670567 0.937510801932298 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 54 149 203 23.6367458817894 83.7800900669145 -60.1433441851251 A:C C A 10 0.562282483670567 1.4651958283353e-17 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 288 254 542 126.062644702877 142.819750852324 -16.7571061494473 A:T A T 10 0.562282483670567 0.153125308212096 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 133 154 287 58.2164296718146 86.5915024852673 -28.3750728134527 A:T A T 10 0.562282483670567 0.00083922700048968 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 74755980 G/A 1 43 45 88 18.8218532021656 25.3027117651755 -6.4808585630099 A:G G A 10 0.562282483670567 0.164499290036749 ENSG00000115307:ENST00000425118:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000377526:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74755544_74756626:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000456927:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74755878_74756110:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74755878_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74755878_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000412627:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000464887:exon_74755878_74756063:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000472800:exon_74755949_74756062:AUP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 14 21 35 6.12804522861206 11.8079321570819 -5.67988692846985 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0609735071526333 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 42 41 83 18.3841356858362 23.0535818304932 -4.66944614465706 T:G G T 10 0.562282483670567 0.320387013376731 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 2 9 11 0.875435032658866 5.0605423530351 -4.18510732037624 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0137431041574245 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 85133216 G/A 1 2886 2475 5361 1263.25275212674 1391.64914708465 -128.39639495791 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.000424555782917855 ENSG00000034510:ENST00000233143:exon_85133127_85133241:TMSB10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 410 359 769 179.464181695068 201.859411637734 -22.395229942666 T:C C T 10 0.562282483670567 0.109735646129656 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 85811592 C/T 1 17 49 66 7.44119777760036 27.5518416998578 -20.1106439222574 T:C C T 10 0.562282483670567 6.5016935263666e-07 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85811531_85811616:VAMP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 39 20 59 17.0709831368479 11.2456496734113 5.82533346343655 T:C C T 10 0.562282483670567 0.148794460157858 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 177 165 342 77.4760003903096 92.7766098056436 -15.3006094153339 T:C T C 10 0.562282483670567 0.101988081250968 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 9 1 10 3.9394576469649 0.562282483670567 3.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 0.050497554051754 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 29 29 58 12.6938079735536 16.3061920264464 -3.61238405289289 A:G G A 10 0.562282483670567 0.356289680816945 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 94 78 172 41.1454465349667 43.8580337263042 -2.71258719133753 T:C C T 10 0.562282483670567 0.701085222108962 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 89160086 T/C 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.204465163412720 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 89160395 T/C 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 89160404 T/G 1 133 10 143 58.2164296718146 5.62282483670567 52.5936048351089 T:G T G 10 0.562282483670567 1.53629021763397e-22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 96690340 G/A 0 29 1 30 12.6938079735536 0.562282483670567 12.131525489883 T:G G T 10 0.562282483670567 9.28885294014008e-07 ENSG00000186281:ENST00000486463:exon_96690175_96690433:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000359548:exon_96690175_96690415:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000434632:exon_96690175_96690415:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000453542:exon_96690175_96690415:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000398024:exon_96690175_96690415:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96690175_96690433:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000377137:exon_96690175_96690415:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96690175_96690433:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000471757:exon_96690175_96690433:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96690175_96690433:GPAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 97526438 G/A 1 22 29 51 9.62978535924753 16.3061920264464 -6.67640666719892 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0666511281116738 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97525453_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97525473_97527386:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97525479_97527192:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97525485_97527192:SEMA4C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 27 20 47 11.8183729408947 11.2456496734113 0.572723267483353 C:G G C 10 0.562282483670567 0.884496410302964 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 99985046 G/T 1 108 93 201 47.2734917635788 52.2922709813627 -5.01877921778397 T:G G T 10 0.562282483670567 0.478054474553724 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99984956_99985054:EIF5B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 C:G G C 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 67 13 80 29.327073594072 7.30967228771737 22.0174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 2.10609633215595e-07 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 86 49 135 37.6437064043312 27.5518416998578 10.0918647044735 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0831426527015973 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 113940207 T/A 1 13 21 34 5.69032771228263 11.8079321570819 -6.11760444479928 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0383911227041192 ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 32 30 62 14.0069605225419 16.868474510117 -2.86151398757515 C:G G C 10 0.562282483670567 0.522583655039634 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 12 5 17 5.2526101959532 2.81141241835283 2.44119777760036 T:C T C 10 0.562282483670567 0.328929887375812 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 118865875 G/A 1 19 27 46 8.31663281025923 15.1816270591053 -6.86499424884608 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0523850971508126 ENSG00000125629:ENST00000411929:exon_118865857_118865948:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000471186:exon_118865857_118867596:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000245787:exon_118865857_118867604:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000485520:exon_118865857_118868573:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000467223:exon_118865857_118865966:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000340599:exon_118865857_118865877:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000479999:exon_118865857_118866043:INSIG2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 35 21 56 15.3201130715302 11.8079321570819 3.51218091444825 T:C T C 10 0.562282483670567 0.419279009886804 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 20 21 41 8.75435032658866 11.8079321570819 -3.05358183049325 T:C T C 10 0.562282483670567 0.348860060668149 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 C:G G C 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 A:G A G 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 23 49 72 10.067502875577 27.5518416998578 -17.4843388242808 C:G C G 10 0.562282483670567 4.03438197361557e-05 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 420 349 769 183.841356858362 196.236586801028 -12.395229942666 A:C A C 10 0.562282483670567 0.383081898519589 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 17 17 34 7.44119777760036 9.55880222239964 -2.11760444479928 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.492620571179929 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 13 17 30 5.69032771228263 9.55880222239964 -3.86847451011701 A:G G A 10 0.562282483670567 0.197161260272341 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 11 19 30 4.81489267962376 10.6833671897408 -5.86847451011701 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0414100863325727 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 128471182 G/A 1 8 23 31 3.50174013063546 12.932497124423 -9.43075699378758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000832980404047688 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128471157_128471595:WDR33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:C A C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 131100496 G/A 1 12 4 16 5.2526101959532 2.24912993468227 3.00348026127093 A:G G A 10 0.562282483670567 0.206345233157792 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131099798_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131100450_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131100467_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131100467_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131100467_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131100469_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000470672:exon_131100470_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131100470_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131100483_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131100485_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000495606:exon_131100491_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131100495_131100767:IMP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 131100734 G/A 1 28 19 47 12.2560904572241 10.6833671897408 1.57272326748335 A:G G A 10 0.562282483670567 0.662831017049048 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131100467_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000470672:exon_131100470_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000495606:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131100495_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131100659_131100767:IMP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 18 13 31 7.87891529392979 7.30967228771737 0.569243006212424 A:G A G 10 0.562282483670567 0.858912903398618 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 136107777 G/A 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000121988:ENST00000283060:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000401392:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000264159:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000403017:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000452187:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000397448:exon_136107554_136107785:ZRANB3;ENSG00000121988:ENST00000472452:exon_136107554_136107785:ZRANB3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 A:C A C 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 136467005 C/G 1 12 20 32 5.2526101959532 11.2456496734113 -5.99303947745814 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0482338285391348 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136467003_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136467001_136467106:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000445855:exon_136467003_136467106:R3HDM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 152321090 C/G 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 C:G C G 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 152321272 C/T 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 152362730 T/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:G T G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152362724_152362889:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000467762:exon_152362462_152362889:RIF1;ENSG00000183091:ENST00000409198:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000397337:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000413693:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000172853:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000397345:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000427231:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000434685:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000498015:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000421461:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000424585:exon_152362680_152362772:NEB;ENSG00000183091:ENST00000509223:exon_152362680_152362772:NEB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 158300469 G/C 1 22 15 37 9.62978535924753 8.43423725505851 1.19554810418902 C:G G C 10 0.562282483670567 0.742640750351494 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158300359_158300654:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158300359_158300610:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158300359_158300518:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158300359_158300604:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000483929:exon_158300359_158300598:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000435117:exon_158300359_158300518:CYTIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160294842 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160294814_160295206:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160294814_160295206:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160294814_160295206:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160294814_160295206:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000467184:exon_160293906_160295723:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000482503:exon_160294814_160295206:BAZ2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160604379 C/T 1 3 10 13 1.3131525489883 5.62282483670567 -4.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0225421185889244 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 11 13 24 4.81489267962376 7.30967228771737 -2.49477960809361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.312204567844798 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C T C 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 10 22 32 4.37717516329433 12.3702146407525 -7.99303947745814 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0065632242603355 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 C:G G C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 99 95 194 43.3340341166139 53.4168359487039 -10.08280183209 T:C T C 10 0.562282483670567 0.148313082383212 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 25 36 61 10.9429379082358 20.2421694121404 -9.29923150390459 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0196770886524069 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 27 36 63 11.8183729408947 20.2421694121404 -8.42379647124572 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0413671669567674 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 24 17 41 10.5052203919064 9.55880222239964 0.946418169506753 T:C T C 10 0.562282483670567 0.87525047428371 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 T:C T C 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 170411698 C/G 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 C:G C G 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 170417031 T/C 1 13 2 15 5.69032771228263 1.12456496734113 4.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0183526070130827 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000487293:exon_170416781_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170416902_170417295:FASTKD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 170666813 T/C 1 107 78 185 46.8357742472493 43.8580337263042 2.9777405209451 T:C T C 10 0.562282483670567 0.71113577188077 ENSG00000138385:ENST00000260956:exon_170666793_170666933:SSB;ENSG00000138385:ENST00000409005:exon_170666793_170666933:SSB;ENSG00000138385:ENST00000409333:exon_170666793_170666933:SSB;ENSG00000138385:ENST00000474273:exon_170666793_170666921:SSB;ENSG00000138385:ENST00000490914:exon_170666793_170666933:SSB;ENSG00000138385:ENST00000470621:exon_170666793_170667112:SSB;ENSG00000138385:ENST00000494051:exon_170666573_170666933:SSB;ENSG00000138382:ENST00000409837:exon_170666591_170666854:METTL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 60 67 127 26.263050979766 37.672926405928 -11.409875426162 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0487227450215233 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 53 36 89 23.1990283654599 20.2421694121404 2.95685895331954 A:T:C A C 10 0.562282483670567 0.593545388867937 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 190617700 T/C 1 16 2 18 7.00348026127093 1.12456496734113 5.87891529392979 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00699745662329772 ENSG00000151687:ENST00000476208:exon_190617661_190617866:ANKAR;ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190617575_190617705:OSGEPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 191224927 C/T 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 191231503 G/A 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 A:G G A 10 0.562282483670567 0.127683379833145 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 191874667 A/G 1 24 40 64 10.5052203919064 22.4912993468227 -11.9860789549163 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00343551112669910 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000424722:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000454414:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000432058:exon_191874602_191874730:STAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 A:G A G 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 A:T T A 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 94 92 186 41.1454465349667 51.7299884976922 -10.5845419627255 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.121101553318068 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 36 41 77 15.7578305878596 23.0535818304932 -7.29575124263366 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.107557980592651 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 264 213 477 115.55742431097 119.766169021831 -4.20874471086044 T:C T C 10 0.562282483670567 0.71210231409801 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 A:G A G 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 24 15 39 10.5052203919064 8.43423725505851 2.07098313684789 A:C C A 10 0.562282483670567 0.524073506123491 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 12 89 101 5.2526101959532 50.0431410466805 -44.7905308507273 A:G G A 10 0.562282483670567 2.00043624157254e-20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 64 47 111 28.0139210450837 26.4272767325166 1.58664431256706 A:G A G 10 0.562282483670567 0.775165489061004 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 A:G A G 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 13 5 18 5.69032771228263 2.81141241835283 2.87891529392979 T:C C T 10 0.562282483670567 0.235291245672474 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 5 11 16 2.18858758164717 6.18510732037624 -3.99651973872907 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0742764766183886 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 22 16 38 9.62978535924753 8.99651973872907 0.633265620518454 C:G G C 10 0.562282483670567 0.8716338739917 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220100201 C/G 1 36 37 73 15.7578305878596 20.804451895811 -5.04662130795139 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.240211992149456 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220099873_220100307:ANKZF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220100229 G/A 1 34 36 70 14.8823955552007 20.2421694121404 -5.35977385693969 A:G G A 10 0.562282483670567 0.228224315384335 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100196_220100307:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220099873_220100307:ANKZF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 19 33 52 8.31663281025923 18.5553219611287 -10.2386891508695 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00491183255844775 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 22 21 43 9.62978535924753 11.8079321570819 -2.17814679783438 A:G G A 10 0.562282483670567 0.540507033257775 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 T:C T C 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 77 75 152 33.7042487573663 42.1711862752925 -8.46693751792618 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.190696224752976 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 38 29 67 16.6332656205185 16.3061920264464 0.327073594072012 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 0 9 0 9 3.9394576469649 0 3.9394576469649 A A 10 0.562282483670567 0.00620797482840731 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 228194481 G/T 0 9 0 9 3.9394576469649 0 3.9394576469649 G G 10 0.562282483670567 0.00620797482840731 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 243 219 462 106.365356468052 123.139863923854 -16.7745074558019 A:G G A 10 0.562282483670567 0.1217533731081 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231067305 C/G 1 74 67 141 32.391096208378 37.672926405928 -5.28183019754994 C:G C G 10 0.562282483670567 0.396272075108549 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 84 83 167 36.7682713716724 46.6694461446571 -9.90117477298469 T:C C T 10 0.562282483670567 0.138172405757691 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 12 2 14 5.2526101959532 1.12456496734113 4.12804522861206 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0300867598929878 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 112 121 233 49.0243618288965 68.0361805241386 -19.0118186952421 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0143885292049241 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 5 9 14 2.18858758164717 5.0605423530351 -2.87195477138794 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.176515303158965 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 2 13 15 0.875435032658866 7.30967228771737 -6.4342372550585 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00098045592469404 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 33 37 70 14.4446780388713 20.804451895811 -6.35977385693969 A:G G A 10 0.562282483670567 0.147916170215277 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 125 28 153 54.7146895411791 15.7439095427759 38.9707799984033 T:C C T 10 0.562282483670567 4.26340369218695e-11 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 0 118 0 118 51.6506669268731 0 51.6506669268731 G G 10 0.562282483670567 5.75417566475065e-30 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234367022 A/G 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 A:G A G 10 0.562282483670567 0.127683379833145 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000471764:exon_234366885_234367043:DGKD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 93 35 128 40.7077290186373 19.6798869284698 21.0278420901674 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000162270300325496 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234749269 G/A 1 84 37 121 36.7682713716724 20.804451895811 15.9638194758614 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00329102378043382 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 69 56 125 30.2025086267309 31.4878190855518 -1.28531045882087 A:G G A 10 0.562282483670567 0.857064974014538 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 47 42 89 20.5727232674834 23.6158643141638 -3.04314104668046 A:T:G T G 10 0.562282483670567 0.523269458294362 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 34 60 94 14.8823955552007 33.736949020234 -18.8545534650333 C:G G C 10 0.562282483670567 0.000103327729572922 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 T:C T C 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 238903399 G/A 1 15 6 21 6.5657627449415 3.3736949020234 3.19206784291809 A:G G A 10 0.562282483670567 0.190440128145316 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434137:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238903386_238903451:UBE2F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241517314 G/A 1 125 51 176 54.7146895411791 28.6764066671989 26.0382828739802 A:G G A 10 0.562282483670567 6.96919871485079e-05 ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241517016_241518149:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241517016_241518144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241517016_241518141:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241517016_241518141:RNPEPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241531479 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 A:G A G 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241538061 T/C 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241569692 C/T 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C C T 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 27 32 59 11.8183729408947 17.9930394774581 -6.17466653656345 A:C A C 10 0.562282483670567 0.115801593116364 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 242435042 C/T 1 75 96 171 32.8288137247075 53.9791184323744 -21.150304707667 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00150163490338301 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242434432_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242434434_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242434437_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000494699:exon_242434461_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000487962:exon_242434465_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242434664_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000478403:exon_242434863_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000470438:exon_242434905_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000465009:exon_242434953_242435116:STK25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 242439595 G/A 1 68 53 121 29.7647911104014 29.8009716345401 -0.036180524138608 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000423004:exon_242439588_242439659:STK25;ENSG00000115694:ENST00000461760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000450497:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000442307:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000424537:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000413760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000429279:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000436402:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000492127:exon_242438822_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000479442:exon_242439318_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000496159:exon_242439462_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000440109:exon_242439558_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000435225:exon_242439587_242439696:STK25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 104 73 177 45.522621698261 41.0466213079514 4.47600039030964 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.54462767978255 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 66 56 122 28.8893560777426 31.4878190855518 -2.59846300780917 T:C T C 10 0.562282483670567 0.649028614183658 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 38 44 82 16.6332656205185 24.7404292815049 -8.10716366098649 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0754142406159629 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 17 22 39 7.44119777760036 12.3702146407525 -4.92901686315211 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.145406189723146 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 45 32 77 19.6972882348245 17.9930394774581 1.70424875736634 A:G A G 10 0.562282483670567 0.731513046278545 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 68 93 161 29.7647911104014 52.2922709813627 -22.5274798709613 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000440017435288926 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 37 46 83 16.195548104189 25.8649942488461 -9.66944614465706 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0354940175780158 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 36 38 74 15.7578305878596 21.3667343794815 -5.60890379162196 A:G A G 10 0.562282483670567 0.198733236224636 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 1918251 C/T 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C C T 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000198053:ENST00000400074:exon_1917966_1920540:SIRPA;ENSG00000198053:ENST00000400068:exon_1917966_1920543:SIRPA;ENSG00000198053:ENST00000356025:exon_1917966_1920543:SIRPA;ENSG00000198053:ENST00000358771:exon_1917966_1920543:SIRPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:C C T 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 74 73 147 32.391096208378 41.0466213079514 -8.65552509957335 A:G A G 10 0.562282483670567 0.157961344931540 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17594886 C/T 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 C C 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 50 27 77 21.8858758164716 15.1816270591053 6.70424875736634 A:C C A 10 0.562282483670567 0.135860305563841 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17596587 G/A 1 24 37 61 10.5052203919064 20.804451895811 -10.2992315039046 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00945690547472882 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596571_17596654:RRBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17600367 C/T 1 24 56 80 10.5052203919064 31.4878190855518 -20.9825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 2.52565361828811e-06 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17608233 C/T 1 39 21 60 17.0709831368479 11.8079321570819 5.26305097976598 T:C C T 10 0.562282483670567 0.193802878951494 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 102 109 211 44.6471866656022 61.2887907200918 -16.6416040544896 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.0220226779708648 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:T A T 10 0.562282483670567 0.82684146397486 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:C T C 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 22 8 30 9.62978535924753 4.49825986936454 5.13152548988299 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0662943370558183 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 A:G A G 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 18491553 C/A 1 16 7 23 7.00348026127093 3.93597738569397 3.06750287557696 A:C C A 10 0.562282483670567 0.214927585519853 ENSG00000101310:ENST00000450074:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000474619:exon_18491466_18491575:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18491466_18491700:SEC23B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 37 35 72 16.195548104189 19.6798869284698 -3.48433882428082 C:G C G 10 0.562282483670567 0.408741833504348 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 18529318 A/G 1 36 54 90 15.7578305878596 30.3632541182106 -14.605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00272221077249558 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18529253_18529414:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18529253_18529414:SEC23B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 32 12 44 14.0069605225419 6.7473898040468 7.25957071849505 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0325275708096421 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 T:C T C 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C T C 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25259006 G/T 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:G G T 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25258955_25259098:PYGB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25262769 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25262669_25262783:PYGB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 9 9 18 3.9394576469649 5.0605423530351 -1.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.63969978219454 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 13 8 21 5.69032771228263 4.49825986936454 1.19206784291809 A:G G A 10 0.562282483670567 0.665083927815355 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 25 25 50 10.9429379082358 14.0570620917642 -3.11412418352835 A:G A G 10 0.562282483670567 0.394805263532455 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 31 14 45 13.5692430062124 7.87195477138794 5.69728823482448 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0987242236796141 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 28 31 59 12.2560904572241 17.4307569937876 -5.17466653656345 T:C T C 10 0.562282483670567 0.190347255926114 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 30825596 C/T 1 52 51 103 22.7613108491305 28.6764066671989 -5.9150958180684 T:C C T 10 0.562282483670567 0.274591330967561 ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30822276_30826470:POFUT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 62 77 139 27.1384860124248 43.2957512426337 -16.1572652302088 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00616614196630703 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 31424592 C/T 1 42 38 80 18.3841356858362 21.3667343794815 -2.98259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.50153684388299 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31424440_31424647:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31424440_31424647:MAPRE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 46 45 91 20.1350057511539 25.3027117651755 -5.1677060140216 T:C C T 10 0.562282483670567 0.291576590609074 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C T C 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 33764554 A/G 1 3 15 18 1.3131525489883 8.43423725505851 -7.12108470607021 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00117188947852978 ENSG00000101000:ENST00000374477:exon_33764501_33765165:PROCR;ENSG00000101000:ENST00000216968:exon_33764501_33765164:PROCR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 16 15 31 7.00348026127093 8.43423725505851 -1.43075699378758 C:G G C 10 0.562282483670567 0.717950448309377 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34092676 G/C 1 20 14 34 8.75435032658866 7.87195477138794 0.882395555200723 C:G G C 10 0.562282483670567 0.863348059954762 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 257 251 508 112.493401696664 141.132903401312 -28.639501704648 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.0107951828113601 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 54 172 226 23.6367458817894 96.7125871913375 -73.0758413095481 A:G G A 10 0.562282483670567 5.47359895247630e-23 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 109 20 129 47.7112092799082 11.2456496734113 36.4655596064969 C:G G C 10 0.562282483670567 1.25945563499314e-11 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 5 48 53 2.18858758164717 26.9895592161872 -24.8009716345401 T:C C T 10 0.562282483670567 1.10351311330241e-12 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C C T 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 73 57 130 31.9533786920486 32.0501015692223 -0.0967228771737112 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 83 37 120 36.3305538553429 20.804451895811 15.526101959532 A:C A C 10 0.562282483670567 0.00423268307265623 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 71 36 107 31.0779436593897 20.2421694121404 10.8357742472493 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0403031129772908 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 168 115 283 73.5365427433447 64.6624856221152 8.87405712122954 A:C A C 10 0.562282483670567 0.308532462314116 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 10 23 33 4.37717516329433 12.932497124423 -8.55532196112871 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00421984612007541 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 22 18 40 9.62978535924753 10.1210847060702 -0.491299346822681 A:G A G 10 0.562282483670567 0.87487801511788 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 46268748 C/T 0 0 10 10 0 5.62282483670567 -5.62282483670567 T C T 10 0.562282483670567 0.000258189908189832 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268669_46268795:NCOA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 20 15 35 8.75435032658866 8.43423725505851 0.320113071530155 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 26 22 48 11.3806554245653 12.3702146407525 -0.989559216187216 T:C T C 10 0.562282483670567 0.773304040888056 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G A G 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 12 7 19 5.2526101959532 3.93597738569397 1.31663281025923 A:G G A 10 0.562282483670567 0.646955815494516 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47711338 A/G 1 106 127 233 46.3980567309199 71.409875426162 -25.0118186952421 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00117027027890061 ENSG00000124207:ENST00000449004:exon_47711269_47711500:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47711269_47711500:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47711269_47711500:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47711269_47711500:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000469700:exon_47711269_47711500:CSE1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 42 30 72 18.3841356858362 16.868474510117 1.51566117571917 T:C C T 10 0.562282483670567 0.812431189902106 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 21 14 35 9.19206784291809 7.87195477138794 1.32011307153015 A:G G A 10 0.562282483670567 0.73469006525912 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 14 9 23 6.12804522861206 5.0605423530351 1.06750287557696 C:G C G 10 0.562282483670567 0.681505571752396 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 23 21 44 10.067502875577 11.8079321570819 -1.74042928150495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.649594525861892 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 T:C C T 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 54961463 T/C 1 14 19 33 6.12804522861206 10.6833671897408 -4.55532196112871 T:C T C 10 0.562282483670567 0.117117237642541 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 19 18 37 8.31663281025923 10.1210847060702 -1.80445189581098 A:T A T 10 0.562282483670567 0.62007199861035 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 A:G G A 10 0.562282483670567 0.127683379833145 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57287597 G/A 1 7 19 26 3.06402261430603 10.6833671897408 -7.61934457543474 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00458212257701768 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57287535_57287635:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57287535_57287636:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57287535_57287816:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57287535_57287635:NPEPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 258 283 541 112.931119212994 159.12594287877 -46.1948236657767 A:T:C C T 10 0.562282483670567 7.74657693000353e-05 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 233 236 469 101.988181304758 132.698666146254 -30.7104848414959 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00450350349362189 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 2 8 10 0.875435032658866 4.49825986936454 -3.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0259060599003915 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 57605451 T/G 1 739 964 1703 323.473244567451 542.040314258427 -218.567069690976 T:C:G T G 10 0.562282483670567 2.71072368704042e-26 ENSG00000124172:ENST00000243997:exon_57605358_57605484:ATP5E;ENSG00000124172:ENST00000395663:exon_57605358_57605484:ATP5E;ENSG00000124172:ENST00000395659:exon_57603733_57605484:ATP5E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 60704940 C/A 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:C C A 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000149657:ENST00000279068:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000440110:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000444156:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000400318:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000479741:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000279069:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000370906:exon_60704841_60705008:LSM14B;ENSG00000149657:ENST00000361670:exon_60704841_60705008:LSM14B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 17 8 25 7.44119777760036 4.49825986936454 2.94293790823582 T:C C T 10 0.562282483670567 0.313857545875071 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 3 8 11 1.3131525489883 4.49825986936454 -3.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0684806772479422 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 61542195 G/A 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 A:G G A 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 11 16 27 4.81489267962376 8.99651973872907 -4.18162705910531 T:C C T 10 0.562282483670567 0.121657067505418 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62194063 C/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62194510 T/C 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62194528 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 A:C A C 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 47 43 90 20.5727232674834 24.1781467978344 -3.60542353035103 T:G T G 10 0.562282483670567 0.45843944312853 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 29 37 66 12.6938079735536 20.804451895811 -8.11064392225742 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0474429512586227 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 20 62492922 T/A 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:T T A 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000183260:ENST00000369916:exon_62492851_62494341:C20orf135 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 15858229 G/A 1 170 79 249 74.4119777760036 44.4203162099748 29.9916615660288 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.000118978075724165 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15857549_15858435:SAMSN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 19 13 32 8.31663281025923 7.30967228771737 1.00696052254186 C:G G C 10 0.562282483670567 0.858967461171744 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 3 9 12 1.3131525489883 5.0605423530351 -3.7473898040468 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0395973446901177 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 51 42 93 22.3235933328011 23.6158643141638 -1.29227098136273 A:G G A 10 0.562282483670567 0.834642116735612 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 48 56 104 21.0104407838128 31.4878190855518 -10.477378301739 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.0475564911642708 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 18 23 41 7.87891529392979 12.932497124423 -5.05358183049325 T:C T C 10 0.562282483670567 0.117766711241787 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 30408670 A/T 1 88 67 155 38.5191414369901 37.672926405928 0.846215031062115 A:T A T 10 0.562282483670567 0.935551543676161 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30408592_30408695:USP16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 20 15 35 8.75435032658866 8.43423725505851 0.320113071530155 T:G T G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 16 17 33 7.00348026127093 9.55880222239964 -2.55532196112871 A:G A G 10 0.562282483670567 0.385181118369198 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 36 60 96 15.7578305878596 33.736949020234 -17.9791184323744 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000277234337895216 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 19 48 67 8.31663281025923 26.9895592161872 -18.672926405928 A:G G A 10 0.562282483670567 5.53192465272266e-06 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 50 43 93 21.8858758164716 24.1781467978344 -2.29227098136273 T:C C T 10 0.562282483670567 0.676279482456243 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 11 27 38 4.81489267962376 15.1816270591053 -10.3667343794815 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000867898241153032 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 31 32 63 13.5692430062124 17.9930394774581 -4.42379647124572 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.309680534372052 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 C:G G C 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 155 170 325 67.8462150310621 95.5880222239964 -27.7418071929343 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00207933904831889 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 513 514 1027 224.549085876999 289.013196606671 -64.4641107296723 A:G G A 10 0.562282483670567 5.58239929387953e-05 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 312 366 678 136.567865094783 205.795389023428 -69.2275239286444 A:C:G A G 10 0.562282483670567 1.04063045493119e-07 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 11 24 35 4.81489267962376 13.4947796080936 -8.67988692846984 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00352677689713531 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 C:G C G 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 60 69 129 26.263050979766 38.7974913732691 -12.5344403935031 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0327820074048072 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 58 59 117 25.3876159471071 33.1746665365634 -7.78705058945634 A:G G A 10 0.562282483670567 0.162179860113609 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 9 17 26 3.9394576469649 9.55880222239964 -5.61934457543474 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0298971709153062 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 14 28 42 6.12804522861206 15.7439095427759 -9.61586431416382 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00449829317943176 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 29 21 50 12.6938079735536 11.8079321570819 0.88587581647165 A:C C A 10 0.562282483670567 0.88697842307912 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 122 119 241 53.4015369921908 66.9116155567975 -13.5100785646066 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0800111645065287 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 30 19 49 13.131525489883 10.6833671897408 2.44815830014222 A:G A G 10 0.562282483670567 0.565278444282851 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 52 40 92 22.7613108491305 22.4912993468227 0.270011502307838 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 A:G A G 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 A:G A G 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 10 2 12 4.37717516329433 1.12456496734113 3.2526101959532 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0795437158696592 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 21 24 45 9.19206784291809 13.4947796080936 -4.30271176517552 A:G G A 10 0.562282483670567 0.229525133790525 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47734659 G/A 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 A:G G A 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000160298:ENST00000491666:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397683:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000417060:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397685:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397682:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000291691:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397680:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397679:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000423365:exon_47734630_47734963:C21orf58 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 A:G A G 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 A:C A C 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 18900750 G/A 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000183628:ENST00000483718:exon_18899053_18901751:DGCR6;ENSG00000100033:ENST00000491604:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000420436:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000357068:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000334029:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000482858:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000429300:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000313755:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000414267:exon_18900295_18900875:PRODH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G A G 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 37 20 57 16.195548104189 11.2456496734113 4.94989843077768 T:C C T 10 0.562282483670567 0.229353416122101 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19121872 G/A 1 23 16 39 10.067502875577 8.99651973872907 1.07098313684789 A:G G A 10 0.562282483670567 0.75030716073852 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 13 12 25 5.69032771228263 6.7473898040468 -1.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.691089126205243 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 19956269 C/A 1 227 193 420 99.3618762067813 108.520519348419 -9.15864314163814 A:C C A 10 0.562282483670567 0.376261500777169 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19956059_19957498:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19956059_19956481:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19956059_19956521:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19956059_19956539:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19956059_19956539:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19956059_19957498:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19956059_19956533:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19956059_19957498:COMT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 20132942 C/T 1 15 7 22 6.5657627449415 3.93597738569397 2.62978535924753 T:C C T 10 0.562282483670567 0.289756257599733 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20132752_20135530:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20132752_20133973:ZDHHC8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 17 21 38 7.44119777760036 11.8079321570819 -4.36673437948155 A:G A G 10 0.562282483670567 0.190401901812173 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 32 42 74 14.0069605225419 23.6158643141638 -9.60890379162196 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0260912218105838 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 21141300 T/C 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000099937:ENST00000215727:exon_21141163_21142008:SERPIND1;ENSG00000099937:ENST00000406799:exon_21141163_21141520:SERPIND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 22 23 45 9.62978535924753 12.932497124423 -3.30271176517551 T:C C T 10 0.562282483670567 0.367969823165498 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 27 34 61 11.8183729408947 19.1176044447993 -7.29923150390458 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0703127791564225 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 22036792 C/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:C C A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000492445:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000484439:exon_22036726_22036815:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22036726_22036815:PPIL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 18 10 28 7.87891529392979 5.62282483670567 2.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.44952159885089 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 0 0 13 13 0 7.30967228771737 -7.30967228771737 G C G 10 0.562282483670567 2.16531478852512e-05 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 23223439 G/C 1 1 57 58 0.437717516329433 32.0501015692223 -31.6123840528929 A:C:G G C 10 0.562282483670567 1.16741857219507e-19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 514 482 996 224.986803393329 271.020157129213 -46.0333537358848 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 0.00363871284602407 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 19 20 39 8.31663281025923 11.2456496734113 -2.92901686315211 C:G C G 10 0.562282483670567 0.420034067992266 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 15 19 34 6.5657627449415 10.6833671897408 -4.11760444479928 T:C C T 10 0.562282483670567 0.169000138365729 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 47 39 86 20.5727232674834 21.9290168631521 -1.35629359566876 T:C T C 10 0.562282483670567 0.828104399982529 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 26892142 G/A 1 20 6 26 8.75435032658866 3.3736949020234 5.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0460562483197912 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000412662:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26892039_26892282:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26892039_26892282:TFIP11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 29659960 C/T 1 5 11 16 2.18858758164717 6.18510732037624 -3.99651973872907 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0742764766183886 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 35 36 71 15.3201130715302 20.2421694121404 -4.92205634061026 T:C C T 10 0.562282483670567 0.281607579465479 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 4 14 18 1.75087006531773 7.87195477138794 -6.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00407093218302519 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 110 131 241 48.1489267962376 73.6590053608443 -25.5100785646066 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00112784103856148 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 31500991 G/A 1 11 17 28 4.81489267962376 9.55880222239964 -4.74390954277588 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0860688622603035 ENSG00000198832:ENST00000402395:exon_31500758_31501114:RP3-412A9.11;ENSG00000198832:ENST00000490967:exon_31500763_31501114:RP3-412A9.11;ENSG00000198832:ENST00000400299:exon_31500763_31501114:RP3-412A9.11;ENSG00000198832:ENST00000361918:exon_31500765_31501114:RP3-412A9.11;ENSG00000198832:ENST00000465536:exon_31500912_31501114:RP3-412A9.11;ENSG00000198832:ENST00000491958:exon_31500987_31501114:RP3-412A9.11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 13 12 25 5.69032771228263 6.7473898040468 -1.05706209176418 A:G A G 10 0.562282483670567 0.691089126205243 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 175 225 400 76.6005653576508 126.513558825878 -49.9129934682268 A:G G A 10 0.562282483670567 6.92753119002484e-07 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 31 26 57 13.5692430062124 14.6193445754347 -1.05010156922232 T:C T C 10 0.562282483670567 0.79083761786019 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 105 100 205 45.9603392145905 56.2282483670567 -10.2679091524662 A:G G A 10 0.562282483670567 0.159186291209616 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 84 94 178 36.7682713716724 52.8545534650333 -16.0862820933609 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.0156582760745778 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 118 92 210 51.6506669268731 51.7299884976922 -0.0793215708190687 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 109 76 185 47.7112092799082 42.7334687589631 4.9777405209451 A:C:G C A 10 0.562282483670567 0.50496589095437 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 37163388 C/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:C C A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000100360:ENST00000340630:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000415653:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000471809:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000433985:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000453009:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000417951:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000430701:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000440696:exon_37163350_37163409:IFT27;ENSG00000100360:ENST00000465023:exon_37163107_37163409:IFT27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 37407331 T/G 1 39 35 74 17.0709831368479 19.6798869284698 -2.60890379162196 T:G T G 10 0.562282483670567 0.559486049423139 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37406900_37407366:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37406900_37407366:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37407305_37407366:TST HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 288 311 599 126.062644702877 174.869852421546 -48.8072077186696 A:T:C:G A G 10 0.562282483670567 6.33413837365382e-05 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 326 252 578 142.695910323395 141.695185884983 1.00072443841228 C:G G C 10 0.562282483670567 0.966566622502029 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 124 130 254 54.2769720248497 73.0967228771737 -18.819750852324 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0191628179828862 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 38084320 G/A 1 19 14 33 8.31663281025923 7.87195477138794 0.444678038871289 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100101:ENST00000493862:exon_38084319_38084367:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000359114:exon_38084319_38084367:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000438329:exon_38084319_38084367:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000468597:exon_38084319_38084367:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38084319_38084367:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000484650:exon_38084319_38084367:NOL12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 A:G G A 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 619 639 1258 270.947142607919 359.298507065492 -88.3513644575733 A:T:C:G T C 10 0.562282483670567 6.3384209044624e-07 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39069260 T/C 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 27 19 46 11.8183729408947 10.6833671897408 1.13500575115392 A:C:G C A 10 0.562282483670567 0.768461380525327 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 27 22 49 11.8183729408947 12.3702146407525 -0.551841699857782 T:C T C 10 0.562282483670567 0.886389070599222 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 51 17 68 22.3235933328011 9.55880222239964 12.7647911104014 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00201443149309173 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 22 4 26 9.62978535924753 2.24912993468227 7.38065542456526 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00280195719817555 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 19 0 19 8.31663281025923 0 8.31663281025923 A A 10 0.562282483670567 2.16168217411461e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 19 0 19 8.31663281025923 0 8.31663281025923 G G 10 0.562282483670567 2.16168217411461e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 40 14 54 17.5087006531773 7.87195477138794 9.63674588178938 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00872599227548577 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39910151 C/T 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000100335:ENST00000402881:exon_39909522_39910229:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000216171:exon_39909522_39910229:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000433117:exon_39909522_39912385:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000325301:exon_39909522_39914137:SMCR7L;ENSG00000100335:ENST00000404569:exon_39909522_39912183:SMCR7L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 284 351 635 124.311774637559 197.361151768369 -73.04937713081 A:C:G A C 10 0.562282483670567 7.28172071594917e-09 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 22 20 42 9.62978535924753 11.2456496734113 -1.61586431416381 C:G C G 10 0.562282483670567 0.643007608285644 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 14 14 28 6.12804522861206 7.87195477138794 -1.74390954277588 A:C A C 10 0.562282483670567 0.569582845760759 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 33 48 81 14.4446780388713 26.9895592161872 -12.5448811773159 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00681736533232235 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 15 13 28 6.5657627449415 7.30967228771737 -0.743909542775875 A:C A C 10 0.562282483670567 0.849760457614327 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 4 11 15 1.75087006531773 6.18510732037624 -4.43423725505851 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0337725958305674 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43455432 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 35 35 70 15.3201130715302 19.6798869284698 -4.35977385693969 C:G G C 10 0.562282483670567 0.335342663977498 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43557085 G/C 1 106 81 187 46.3980567309199 45.5448811773159 0.853175553603968 C:G G C 10 0.562282483670567 0.941300405383826 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43557058_43557196:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43557058_43557196:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43557058_43557196:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000428336:exon_43557058_43557196:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43557058_43557196:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43557058_43557196:TSPO HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43558972 G/A 1 99 91 190 43.3340341166139 51.1677060140216 -7.83367189740773 A:G G A 10 0.562282483670567 0.272775571920705 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43568512 C/T 1 13 8 21 5.69032771228263 4.49825986936454 1.19206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.665083927815355 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 43570349 C/G 1 11 29 40 4.81489267962376 16.3061920264464 -11.4912993468227 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.000329882757694897 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000484118:exon_43570299_43570409:TTLL12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 44559755 C/T 1 225 202 427 98.4864411741224 113.581061701455 -15.0946205273321 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.143603538227310 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000484345:exon_44559738_44559810:PARVB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 195 145 340 85.3549156842394 81.5309601322322 3.82395555200723 A:C A C 10 0.562282483670567 0.702159170351864 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50617726 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000073150:ENST00000395842:exon_50617363_50618723:PANX2;ENSG00000073150:ENST00000159647:exon_50617650_50618721:PANX2;ENSG00000073150:ENST00000402472:exon_50617650_50618027:PANX2;ENSG00000073150:ENST00000395838:exon_50617363_50618723:PANX2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 0 0 252 252 0 141.695185884983 -141.695185884983 A:C G C 10 0.562282483670567 3.80951273673971e-91 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50684256 T/C 1 37 37 74 16.195548104189 20.804451895811 -4.60890379162196 T:C T C 10 0.562282483670567 0.293219929320369 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50684747 C/T 1 33 32 65 14.4446780388713 17.9930394774581 -3.54836143858685 T:C C T 10 0.562282483670567 0.38407659381321 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684727_50685164:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50684727_50684805:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50684727_50684805:MAPK12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50686830 G/A 1 19 22 41 8.31663281025923 12.3702146407525 -4.05358183049325 A:G G A 10 0.562282483670567 0.211266919291815 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50686654_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000475965:exon_50686654_50686884:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50686795_50686901:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50686795_50686901:MAPK12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50687178 C/T 1 14 11 25 6.12804522861206 6.18510732037624 -0.0570620917641751 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50687091_50687180:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50687091_50687632:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50687124_50687180:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50687091_50687180:MAPK12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50687595 A/G 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G A G 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50687260_50687637:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50687532_50687597:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50687091_50687632:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50687532_50687627:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50687532_50687883:MAPK12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 14 8 22 6.12804522861206 4.49825986936454 1.62978535924753 A:G G A 10 0.562282483670567 0.526873966582757 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50714166 G/C 1 83 80 163 36.3305538553429 44.9825986936454 -8.65204483830242 C:G G C 10 0.562282483670567 0.179967857540179 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50713414_50714237:PLXNB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 16 11 27 7.00348026127093 6.18510732037624 0.818372940894691 T:C C T 10 0.562282483670567 0.847316660983118 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 27 21 48 11.8183729408947 11.8079321570819 0.0104407838127845 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 44 36 80 19.2595707184951 20.2421694121404 -0.982598693645361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.82277728821364 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 24 9 33 10.5052203919064 5.0605423530351 5.44467803887129 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0777412847754722 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 24 8 32 10.5052203919064 4.49825986936454 6.00696052254186 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0332009085403547 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 23 15 38 10.067502875577 8.43423725505851 1.63326562051845 A:G G A 10 0.562282483670567 0.627630593591346 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 A:G G A 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 51007738 C/T 1 18 3 21 7.87891529392979 1.6868474510117 6.19206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00697764099543827 ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51007290_51007850:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51007513_51007850:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51007596_51007850:CTA-384D8.32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 11 13 24 4.81489267962376 7.30967228771737 -2.49477960809361 T:C C T 10 0.562282483670567 0.312204567844798 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 7 16 23 3.06402261430603 8.99651973872907 -5.93249712442304 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0188197573727004 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 T:G T G 10 0.562282483670567 0.654484470731119 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 T:C C T 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 12877577 C/T 1 1420 1037 2457 621.558873187795 583.086935566378 38.4719376214169 A:T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.122260710067197 ENSG00000144713:ENST00000429711:exon_12875984_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12876445_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000273223:exon_12877546_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12877549_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12877559_12877722:RPL32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 33 49 82 14.4446780388713 27.5518416998578 -13.1071636609865 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00506878397863500 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 17 18 35 7.44119777760036 10.1210847060702 -2.67988692846985 T:G G T 10 0.562282483670567 0.396612095952673 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 8 13 21 3.50174013063546 7.30967228771737 -3.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.122676963602703 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 55 43 98 24.0744633981188 24.1781467978344 -0.103683399715564 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 25 21 46 10.9429379082358 11.8079321570819 -0.864994248846083 A:G G A 10 0.562282483670567 0.882097505901343 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:G G T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 21 16 37 9.19206784291809 8.99651973872907 0.195548104189021 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 121 142 263 52.9638194758614 79.8441126812205 -26.8802932053591 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000958959352311506 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 78 104 182 34.1419662736958 58.477378301739 -24.3354120280432 A:C A C 10 0.562282483670567 0.000317601734770232 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 10 25 35 4.37717516329433 14.0570620917642 -9.67988692846984 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00107320357694693 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 A:G G A 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 18 22 40 7.87891529392979 12.3702146407525 -4.49129934682268 T:C C T 10 0.562282483670567 0.155529043562260 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 54 54 108 23.6367458817894 30.3632541182106 -6.72650823642123 A:G A G 10 0.562282483670567 0.207677539659072 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 37132999 C/T 1 12 18 30 5.2526101959532 10.1210847060702 -4.86847451011701 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0963500765676233 ENSG00000093167:ENST00000421307:exon_37132958_37133029:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000336686:exon_37132958_37133029:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000421276:exon_37132958_37133029:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000440230:exon_37132958_37133029:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000416425:exon_37132958_37133029:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000481682:exon_37132958_37133029:LRRFIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 21 15 36 9.19206784291809 8.43423725505851 0.757830587859587 C:G C G 10 0.562282483670567 0.867570466453648 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 22 19 41 9.62978535924753 10.6833671897408 -1.05358183049325 A:G G A 10 0.562282483670567 0.755062561063975 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 9 1 10 3.9394576469649 0.562282483670567 3.37717516329433 C:G G C 10 0.562282483670567 0.050497554051754 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 40573744 A/G 1 8 9 17 3.50174013063546 5.0605423530351 -1.55880222239964 A:G A G 10 0.562282483670567 0.472203671514815 ENSG00000172888:ENST00000403205:exon_40573521_40575017:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000339296:exon_40573521_40579187:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000431278:exon_40573521_40575562:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000462161:exon_40573521_40573748:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000492098:exon_40573521_40574352:ZNF621 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 18 12 30 7.87891529392979 6.7473898040468 1.13152548988299 T:C T C 10 0.562282483670567 0.716833592735589 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:C C A 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 0 8 0 8 3.50174013063546 0 3.50174013063546 G G 10 0.562282483670567 0.0113392023691977 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 46 51 97 20.1350057511539 28.6764066671989 -8.541400916045 T:C C T 10 0.562282483670567 0.082718632389009 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 31 41 72 13.5692430062124 23.0535818304932 -9.48433882428082 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0317831592859631 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 13 7 20 5.69032771228263 3.93597738569397 1.75435032658866 C:G C G 10 0.562282483670567 0.503794843276968 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 48310242 A/C 1 19 7 26 8.31663281025923 3.93597738569397 4.38065542456526 A:C A C 10 0.562282483670567 0.112467924457939 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 T:G T G 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 29 16 45 12.6938079735536 8.99651973872907 3.69728823482449 T:C C T 10 0.562282483670567 0.295357330724318 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 9 2 11 3.9394576469649 1.12456496734113 2.81489267962376 T:C T C 10 0.562282483670567 0.127683379833145 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 41 35 76 17.9464181695068 19.6798869284698 -1.73346875896309 T:C T C 10 0.562282483670567 0.72925496200635 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:T:G T G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 71 62 133 31.0779436593897 34.8615139875752 -3.78357032818541 A:C A C 10 0.562282483670567 0.541014178321502 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 78 64 142 34.1419662736958 35.9860789549163 -1.84411268122052 A:G G A 10 0.562282483670567 0.799830200241271 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 55 62 117 24.0744633981188 34.8615139875752 -10.7870505894563 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0501134629137053 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52256695 C/A 1 14 26 40 6.12804522861206 14.6193445754347 -8.49129934682268 A:C C A 10 0.562282483670567 0.00986715632607972 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 26 14 40 11.3806554245653 7.87195477138794 3.50870065317732 T:C C T 10 0.562282483670567 0.339084745955677 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.204465163412720 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 10 16 26 4.37717516329433 8.99651973872907 -4.61934457543474 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0765271121281993 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 99 76 175 43.3340341166139 42.7334687589631 0.60056535765078 A:G G A 10 0.562282483670567 0.93944721574175 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 177 187 364 77.4760003903096 105.146824446396 -27.6708240560864 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00364562337849947 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53213657 T/C 1 19 20 39 8.31663281025923 11.2456496734113 -2.92901686315211 T:C T C 10 0.562282483670567 0.420034067992266 ENSG00000163932:ENST00000478843:exon_53213593_53213710:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000487897:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000464818:exon_53213593_53213792:PRKCD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 107 75 182 46.8357742472493 42.1711862752925 4.66458797195681 A:G G A 10 0.562282483670567 0.502168169658956 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 427 393 820 186.905379472668 220.977016082533 -34.0716366098649 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0167072112419120 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 357 291 648 156.265153329608 163.624202748135 -7.35904941852741 A:C:G A G 10 0.562282483670567 0.57942029541988 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 186 178 364 81.4154580372745 100.086282093361 -18.6708240560864 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0506361153431844 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 77 63 140 33.7042487573663 35.4237964712457 -1.71954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.798549203440305 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 44 36 80 19.2595707184951 20.2421694121404 -0.982598693645361 T:C T C 10 0.562282483670567 0.82277728821364 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 56667480 C/T 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 12 4 16 5.2526101959532 2.24912993468227 3.00348026127093 T:C C T 10 0.562282483670567 0.206345233157792 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 18 13 31 7.87891529392979 7.30967228771737 0.569243006212424 T:C C T 10 0.562282483670567 0.858912903398618 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 22 6 28 9.62978535924753 3.3736949020234 6.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0208727972864483 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 87294929 A/G 1 16 4 20 7.00348026127093 2.24912993468227 4.75435032658866 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0407252292312323 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87294864_87294968:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 17 1 18 7.44119777760036 0.562282483670567 6.87891529392979 A:C A C 10 0.562282483670567 0.000570074882155398 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 T:G T G 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 100071332 C/T 1 69 60 129 30.2025086267309 33.736949020234 -3.53444039350314 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.535727939622029 ENSG00000114021:ENST00000394140:exon_100071248_100071346:NIT2;ENSG00000114021:ENST00000465368:exon_100071248_100071346:NIT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 47 40 87 20.5727232674834 22.4912993468227 -1.91857607933933 A:G G A 10 0.562282483670567 0.74601982278805 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 101520537 C/T 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C C T 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000144815:ENST00000273347:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000491511:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000477909:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000422132:exon_101520079_101520833:FAM55C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 112709855 G/T 1 10 9 19 4.37717516329433 5.0605423530351 -0.683367189740773 T:G G T 10 0.562282483670567 0.819086952395077 ENSG00000163607:ENST00000383678:exon_112709765_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000383677:exon_112709832_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000471627:exon_112709832_112710259:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000295864:exon_112709834_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000485330:exon_112709838_112710182:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000305485:exon_112709847_112710194:GTPBP8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 113172662 C/A 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 A:C C A 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113172313_113172797:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113172313_113172797:SPICE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 17 10 27 7.44119777760036 5.62282483670567 1.81837294089469 A:G G A 10 0.562282483670567 0.563071699057855 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 13 18 31 5.69032771228263 10.1210847060702 -4.43075699378758 C:G G C 10 0.562282483670567 0.146375376416344 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 119263518 G/C 1 73 54 127 31.9533786920486 30.3632541182106 1.59012457383799 C:G G C 10 0.562282483670567 0.789316821300753 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:T T A 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 28 26 54 12.2560904572241 14.6193445754347 -2.36325411821062 T:C C T 10 0.562282483670567 0.583750740233951 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 1 8 9 0.437717516329433 4.49825986936454 -4.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0130274110875138 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 21 11 32 9.19206784291809 6.18510732037624 3.00696052254186 T:C T C 10 0.562282483670567 0.373296241940896 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 35 37 72 15.3201130715302 20.804451895811 -5.48433882428082 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.193958864877362 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 23 16 39 10.067502875577 8.99651973872907 1.07098313684789 T:C T C 10 0.562282483670567 0.75030716073852 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 17 16 33 7.44119777760036 8.99651973872907 -1.55532196112871 T:C T C 10 0.562282483670567 0.602607785332713 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 366 256 622 160.204610976572 143.944315819665 16.2602951569073 A:G A G 10 0.562282483670567 0.196016857279504 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 231 99 330 101.112746272099 55.6659658833861 45.4467803887129 A:C:G A G 10 0.562282483670567 3.75237195436221e-07 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 221 117 338 96.7355711088047 65.7870505894563 30.9485205193483 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000661479600956691 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 32 17 49 14.0069605225419 9.55880222239964 4.44815830014222 C:G G C 10 0.562282483670567 0.24923463774743 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:G G T 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 70 57 127 30.6402261430603 32.0501015692223 -1.40987542616201 A:G G A 10 0.562282483670567 0.85813039439066 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 18 18 36 7.87891529392979 10.1210847060702 -2.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.503152902402094 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 127379270 C/T 1 36 26 62 15.7578305878596 14.6193445754347 1.13848601242485 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.799335078196116 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 127396375 G/A 1 10 19 29 4.37717516329433 10.6833671897408 -6.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0235269379343707 ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396308_127396406:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396308_127396406:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396308_127396406:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396308_127396406:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396308_127396406:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127396308_127399028:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396308_127396406:ABTB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C C T 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 129152089 G/A 1 42 35 77 18.3841356858362 19.6798869284698 -1.29575124263366 A:G G A 10 0.562282483670567 0.818586122418758 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 129155670 C/T 1 77 65 142 33.7042487573663 36.5483614385869 -2.84411268122051 T:C C T 10 0.562282483670567 0.672559866440971 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 130743812 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000446270:exon_130743068_130744175:ASTE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 133329948 T/C 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 T:C T C 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 A:G G A 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 12 0 12 5.2526101959532 0 5.2526101959532 G G 10 0.562282483670567 0.00181076456401497 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 60 44 104 26.263050979766 24.7404292815049 1.52262169826103 A:G A G 10 0.562282483670567 0.843432144624159 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 28 37 65 12.2560904572241 20.804451895811 -8.54836143858685 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0340482725846920 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 73 64 137 31.9533786920486 35.9860789549163 -4.03270026286768 T:C C T 10 0.562282483670567 0.492140773395931 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.204465163412720 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 54 36 90 23.6367458817894 20.2421694121404 3.39457646964897 T:C C T 10 0.562282483670567 0.524297651103813 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 160122172 C/T 1 20 20 40 8.75435032658866 11.2456496734113 -2.49129934682268 T:C C T 10 0.562282483670567 0.430783925622318 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472991:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472282:exon_160122166_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467468:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485867:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000470240:exon_160122116_160122292:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000497984:exon_160122116_160122292:SMC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 160131347 A/G 1 55 77 132 24.0744633981188 43.2957512426337 -19.2212878445148 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000822738264020709 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000487747:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465563:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000494612:exon_160131261_160131371:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467263:exon_160131261_160131542:SMC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 17 18 35 7.44119777760036 10.1210847060702 -2.67988692846985 A:G G A 10 0.562282483670567 0.396612095952673 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 182769957 A/G 1 8 17 25 3.50174013063546 9.55880222239964 -6.05706209176417 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0245029132727380 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182769947_182770028:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182769947_182770028:MCCC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 26 38 64 11.3806554245653 21.3667343794815 -9.98607895491629 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0160031007928549 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 39 49 88 17.0709831368479 27.5518416998578 -10.4808585630099 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0310588270778339 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 183508590 A/G 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:G A G 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 42 41 83 18.3841356858362 23.0535818304932 -4.66944614465706 A:G A G 10 0.562282483670567 0.320387013376731 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 34 33 67 14.8823955552007 18.5553219611287 -3.67292640592799 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.389983897489063 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 16 18 34 7.00348026127093 10.1210847060702 -3.11760444479928 A:C C A 10 0.562282483670567 0.302913185765161 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2064 6 2070 903.44895370395 3.3736949020234 900.075258801926 T:C:G G T 10 0.562282483670567 0 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 102 92 194 44.6471866656022 51.7299884976922 -7.08280183208999 A:G A G 10 0.562282483670567 0.311741237959924 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 20 28 48 8.75435032658866 15.7439095427759 -6.98955921618722 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0574268025116139 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 189712010 G/A 1 19 14 33 8.31663281025923 7.87195477138794 0.444678038871289 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189711883_189712072:LEPREL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 17 12 29 7.44119777760036 6.7473898040468 0.693807973553557 T:C T C 10 0.562282483670567 0.853299084532438 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 40 23 63 17.5087006531773 12.932497124423 4.57620352875428 T:C C T 10 0.562282483670567 0.256120575011252 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 15 24 39 6.5657627449415 13.4947796080936 -6.92901686315211 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.0345864698431965 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 195591056 C/T 1 17 26 43 7.44119777760036 14.6193445754347 -7.17814679783438 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0311979507732786 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195590236_195591058:TNK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 195789461 G/A 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G G A 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195789453_195789516:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195789453_195789516:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195789453_195789516:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000475593:exon_195789453_195789846:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000465288:exon_195789453_195789516:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000477148:exon_195789453_195789516:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000464368:exon_195789262_195789516:TFRC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 196089400 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000163960:ENST00000296328:exon_196089165_196089558:UBXN7;ENSG00000163960:ENST00000429160:exon_196089165_196089558:UBXN7;ENSG00000163960:ENST00000428095:exon_196089165_196089558:UBXN7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 23 24 47 10.067502875577 13.4947796080936 -3.42727673251665 T:C T C 10 0.562282483670567 0.377910630989545 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 20 33 53 8.75435032658866 18.5553219611287 -9.80097163454005 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00809595165412103 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 12 6 18 5.2526101959532 3.3736949020234 1.87891529392979 T:C C T 10 0.562282483670567 0.478579103813422 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G A G 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 2 12 14 0.875435032658866 6.7473898040468 -5.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.00191893368034807 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 164 154 318 71.785672678027 86.5915024852673 -14.8058298072403 A:G A G 10 0.562282483670567 0.101130015121010 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2746583 C/A 1 50 48 98 21.8858758164716 26.9895592161872 -5.10368339971557 A:C C A 10 0.562282483670567 0.309861002319190 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2746424_2746672:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2746424_2746672:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2746424_2746672:TNIP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 T:G G T 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 T:C T C 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 26 33 59 11.3806554245653 18.5553219611287 -7.17466653656345 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0663066395101656 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 29 29 58 12.6938079735536 16.3061920264464 -3.61238405289289 C:G C G 10 0.562282483670567 0.356289680816945 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 32 33 65 14.0069605225419 18.5553219611287 -4.54836143858686 T:C T C 10 0.562282483670567 0.262919876396912 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 48 44 92 21.0104407838128 24.7404292815049 -3.72998849769217 A:G A G 10 0.562282483670567 0.462651883516562 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 4861974 C/T 1 20 9 29 8.75435032658866 5.0605423530351 3.69380797355356 T:C C T 10 0.562282483670567 0.1926717528841 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4861393_4862095:MSX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 6303052 C/T 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 10509625 G/A 1 2 13 15 0.875435032658866 7.30967228771737 -6.4342372550585 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00098045592469404 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10509583_10509660:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000515667:exon_10509583_10509660:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000429087:exon_10509583_10509660:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000442825:exon_10509583_10509660:CLNK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 11 13 24 4.81489267962376 7.30967228771737 -2.49477960809361 A:C A C 10 0.562282483670567 0.312204567844798 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 11401012 A/G 1 6 9 15 2.6263050979766 5.0605423530351 -2.43423725505851 A:G A G 10 0.562282483670567 0.297764111139792 ENSG00000002587:ENST00000002596:exon_11394774_11401737:HS3ST1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 11401087 A/G 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G A G 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000002587:ENST00000002596:exon_11394774_11401737:HS3ST1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 47 41 88 20.5727232674834 23.0535818304932 -2.4808585630099 A:T A T 10 0.562282483670567 0.593188826142439 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 10 11 21 4.37717516329433 6.18510732037624 -1.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.511089966544315 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 17 6 23 7.44119777760036 3.3736949020234 4.06750287557696 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0960650785141877 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 7 10 17 3.06402261430603 5.62282483670567 -2.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.229624092832583 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 18 12 30 7.87891529392979 6.7473898040468 1.13152548988299 A:C A C 10 0.562282483670567 0.716833592735589 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:G T G 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 171 301 472 74.849695292333 169.247027584841 -94.3973322925076 A:T:C:G A G 10 0.562282483670567 3.32739117059007e-18 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 85 164 249 37.2059888880018 92.214327321973 -55.0083384339712 A:G A G 10 0.562282483670567 2.52772781854676e-12 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 20 46 66 8.75435032658866 25.8649942488461 -17.1106439222574 A:C C A 10 0.562282483670567 2.91732665944175e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 23 45 68 10.067502875577 25.3027117651755 -15.2352088895986 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000216216359811997 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 28 19 47 12.2560904572241 10.6833671897408 1.57272326748335 T:C T C 10 0.562282483670567 0.662831017049048 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 17 28 45 7.44119777760036 15.7439095427759 -8.30271176517552 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0155571701104057 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 72 143 215 31.5156611757192 80.4063951648911 -48.8907339891719 A:C C A 10 0.562282483670567 3.02793834087695e-11 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 33 78 111 14.4446780388713 43.8580337263042 -29.4133556874329 T:C C T 10 0.562282483670567 2.38638610064857e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38798515 G/A 1 11 14 25 4.81489267962376 7.87195477138794 -3.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.232042066913704 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38800323 A/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000515861:exon_38800182_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000506146:exon_38800307_38800519:TLR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 38995374 T/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 A:G A G 10 0.562282483670567 0.78553189085735 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39000569 C/T 1 10 1 11 4.37717516329433 0.562282483670567 3.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0289532072068827 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 10 13 23 4.37717516329433 7.30967228771737 -2.93249712442304 T:C T C 10 0.562282483670567 0.293183589249405 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 11 14 25 4.81489267962376 7.87195477138794 -3.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.232042066913704 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 12 12 24 5.2526101959532 6.7473898040468 -1.49477960809361 A:G A G 10 0.562282483670567 0.544750822415298 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39463903 C/A 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:C C A 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000424936:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39463816_39463909:LIAS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 19 6 25 8.31663281025923 3.3736949020234 4.94293790823582 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0674521838733395 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 41015823 G/A 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 41015899 C/T 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:C C T 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.578906059279765 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 10 15 25 4.37717516329433 8.43423725505851 -4.05706209176418 A:C A C 10 0.562282483670567 0.110291001388382 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 25 29 54 10.9429379082358 16.3061920264464 -5.36325411821062 A:G G A 10 0.562282483670567 0.169793428192282 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 19 27 46 8.31663281025923 15.1816270591053 -6.86499424884608 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0523850971508126 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 90 65 155 39.394576469649 36.5483614385869 2.84621503106212 T:C C T 10 0.562282483670567 0.68595331843566 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 16 18 34 7.00348026127093 10.1210847060702 -3.11760444479928 T:C T C 10 0.562282483670567 0.302913185765161 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 25 21 46 10.9429379082358 11.8079321570819 -0.864994248846083 A:G A G 10 0.562282483670567 0.882097505901343 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 27 50 77 11.8183729408947 28.1141241835284 -16.2957512426337 T:C:G G C 10 0.562282483670567 0.000207323791035624 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 78804474 A/G 1 57 54 111 24.9498984307777 30.3632541182106 -5.41335568743293 A:G A G 10 0.562282483670567 0.338789941043211 ENSG00000169288:ENST00000315567:exon_78804396_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000515625:exon_78804396_78804652:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000511521:exon_78804396_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000502384:exon_78804393_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000506674:exon_78804403_78804654:MRPL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 17 13 30 7.44119777760036 7.30967228771737 0.13152548988299 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 90035549 A/G 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 A:G A G 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 21 16 37 9.19206784291809 8.99651973872907 0.195548104189021 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 2 9 11 0.875435032658866 5.0605423530351 -4.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0137431041574245 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 110384226 T/C 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 16 6 22 7.00348026127093 3.3736949020234 3.62978535924753 A:G A G 10 0.562282483670567 0.136024450167174 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 7 13 20 3.06402261430603 7.30967228771737 -4.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0705527177728787 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 7 18 25 3.06402261430603 10.1210847060702 -7.05706209176418 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00739374553616077 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:G A G 10 0.562282483670567 0.624209044959862 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113565835 G/A 1 148 114 262 64.7821924167561 64.1002031384446 0.681989278311448 A:G G A 10 0.562282483670567 0.950421901232797 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 113568544 G/A 1 210 192 402 91.9206784291809 107.958236864749 -16.0375584355679 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.107960489359731 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113568355_113568605:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000511529:exon_113568367_113568705:LARP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 119652606 G/T 1 23 33 56 10.067502875577 18.5553219611287 -8.48781908555175 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0302293646630897 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511715:exon_119650277_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119652435_119652662:SEC24D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:C C A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 16 7 23 7.00348026127093 3.93597738569397 3.06750287557696 A:T A T 10 0.562282483670567 0.214927585519853 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 15 3 18 6.5657627449415 1.6868474510117 4.87891529392979 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0295751813635947 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 17 4 21 7.44119777760036 2.24912993468227 5.19206784291809 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0264251596207138 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 29 12 41 12.6938079735536 6.7473898040468 5.94641816950675 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0821022422478554 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 140036422 T/C 1 1 64 65 0.437717516329433 35.9860789549163 -35.5483614385869 T:C T C 10 0.562282483670567 4.02206955030385e-22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 14 12 26 6.12804522861206 6.7473898040468 -0.619344575434742 A:G G A 10 0.562282483670567 0.844970193666619 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 146572227 G/A 1 14 6 20 6.12804522861206 3.3736949020234 2.75435032658866 A:G G A 10 0.562282483670567 0.263129063879924 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146572214_146572299:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146572071_146572299:MMAA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 17 11 28 7.44119777760036 6.18510732037624 1.25609045722412 A:G G A 10 0.562282483670567 0.705814241129564 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 12 15 27 5.2526101959532 8.43423725505851 -3.18162705910531 T:C C T 10 0.562282483670567 0.246781702556477 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 152682046 G/T 1 5 11 16 2.18858758164717 6.18510732037624 -3.99651973872907 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0742764766183886 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152681959_152682175:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152681959_152682151:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152681959_152682082:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515884:exon_152681959_152682105:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000511538:exon_152681959_152682122:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152681959_152682137:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000508611:exon_152681959_152682142:PET112L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 9 3 12 3.9394576469649 1.6868474510117 2.2526101959532 A:G A G 10 0.562282483670567 0.249876767695702 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 38 47 85 16.6332656205185 26.4272767325166 -9.79401111199819 A:T:C:G A C 10 0.562282483670567 0.0374029677104763 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 63 57 120 27.5762035287543 32.0501015692223 -4.47389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.409539772970772 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 T:C C T 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 25 19 44 10.9429379082358 10.6833671897408 0.259570718495052 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 50 14 64 21.8858758164716 7.87195477138794 14.0139210450837 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00034939826109568 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 178274694 T/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:G T G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 184367737 G/A 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 A:G G A 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184367241_184369351:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184367241_184369351:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000506835:exon_184367241_184367912:CDKN2AIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 184612553 G/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 184618936 G/C 1 6 10 16 2.6263050979766 5.62282483670567 -2.99651973872907 C:G G C 10 0.562282483670567 0.139618210498778 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184618832_184618988:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184618832_184618988:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184618832_184618988:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184618832_184618988:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184618832_184618988:C4orf41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 185580578 T/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:G T G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000506278:exon_185580494_185580591:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515152:exon_185580494_185580591:CCDC111 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 24 18 42 10.5052203919064 10.1210847060702 0.384135685836185 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 13 20 33 5.69032771228263 11.2456496734113 -5.55532196112871 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0550493446680247 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 38 0 38 16.6332656205185 0 16.6332656205185 A A 10 0.562282483670567 3.43033974626867e-10 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 44 0 44 19.2595707184951 0 19.2595707184951 C C 10 0.562282483670567 1.47977636968361e-11 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 1 44 2 46 19.2595707184951 1.12456496734113 18.1350057511539 T:C T C 10 0.562282483670567 3.57002311394574e-09 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 40 3 43 17.5087006531773 1.6868474510117 15.8218532021656 T:C C T 10 0.562282483670567 1.94280574103901e-07 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 224487 T/C 1 32 47 79 14.0069605225419 26.4272767325166 -12.4203162099748 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00616914068618308 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000502379:exon_224475_224958:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509632:exon_224475_224636:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_224475_224636:SDHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 14 10 24 6.12804522861206 5.62282483670567 0.505220391906392 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 5464163 G/A 1 9 15 24 3.9394576469649 8.43423725505851 -4.49477960809361 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0976666229063362 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 23 42 65 10.067502875577 23.6158643141638 -13.5483614385869 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00099502770966681 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 A:C C A 10 0.562282483670567 0.528790095088181 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 17353999 T/A 0 1237 0 1237 541.456567699509 0 541.456567699509 T T 10 0.562282483670567 5.48681395849879e-310 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 17354033 C/T 0 118 0 118 51.6506669268731 0 51.6506669268731 C C 10 0.562282483670567 5.75417566475065e-30 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 13 8 21 5.69032771228263 4.49825986936454 1.19206784291809 A:G A G 10 0.562282483670567 0.665083927815355 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 13 17 30 5.69032771228263 9.55880222239964 -3.86847451011701 T:C T C 10 0.562282483670567 0.197161260272341 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 103 83 186 45.0849041819316 46.6694461446571 -1.58454196272546 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.824853912096529 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 33881252 G/A 1 40 24 64 17.5087006531773 13.4947796080936 4.01392104508371 A:G G A 10 0.562282483670567 0.377971672688148 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000509762:exon_33880969_33881585:ADAMTS12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 A:G A G 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 43506449 T/C 1 2 6 8 0.875435032658866 3.3736949020234 -2.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.149675901212494 ENSG00000172244:ENST00000306862:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000509489:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000514462:exon_43505652_43506496:C5orf34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 32 48 80 14.0069605225419 26.9895592161872 -12.9825986936454 A:C C A 10 0.562282483670567 0.00454749195318706 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 55246001 A/G 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.192457767275085 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 57 61 118 24.9498984307777 34.2992315039046 -9.3493330731269 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0945931432841267 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 12 16 28 5.2526101959532 8.99651973872907 -3.74390954277588 A:G A G 10 0.562282483670567 0.183040118889069 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 25 17 42 10.9429379082358 9.55880222239964 1.38413568583619 A:G A G 10 0.562282483670567 0.756541266317635 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 32 56 88 14.0069605225419 31.4878190855518 -17.4808585630099 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000221213726225792 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 66479189 G/A 1 9 24 33 3.9394576469649 13.4947796080936 -9.55532196112871 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00120380095883419 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 T:G G T 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 23 17 40 10.067502875577 9.55880222239964 0.508700653177321 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 6 14 20 2.6263050979766 7.87195477138794 -5.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0229693427995087 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 70785245 T/G 1 9 9 18 3.9394576469649 5.0605423530351 -1.12108470607021 T:G T G 10 0.562282483670567 0.63969978219454 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70785231_70785509:BDP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 C:G C G 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 605 601 1206 264.819097379307 337.931772686011 -73.1126753067038 A:T:G A G 10 0.562282483670567 2.52192627529267e-05 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 72868447 T/C 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C T C 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000512550:exon_72868314_72868449:UTP15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 69 69 138 30.2025086267309 38.7974913732691 -8.59498274653825 A:G G A 10 0.562282483670567 0.145296108324920 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 7 19 26 3.06402261430603 10.6833671897408 -7.61934457543474 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.00458212257701768 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 20 28 48 8.75435032658866 15.7439095427759 -6.98955921618722 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0574268025116139 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 22 10 32 9.62978535924753 5.62282483670567 4.00696052254186 T:C C T 10 0.562282483670567 0.211638186576028 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 A:G A G 10 0.562282483670567 0.264490541486293 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 14 20 34 6.12804522861206 11.2456496734113 -5.11760444479928 A:G G A 10 0.562282483670567 0.085044169403022 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 28 39 67 12.2560904572241 21.9290168631521 -9.67292640592799 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0191448555154368 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 A:G A G 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 12 7 19 5.2526101959532 3.93597738569397 1.31663281025923 T:C C T 10 0.562282483670567 0.646955815494516 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 A:C A C 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 12 3 15 5.2526101959532 1.6868474510117 3.56576274494149 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0718833751401134 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 20 4 24 8.75435032658866 2.24912993468227 6.50522039190639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00695776278191023 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 33 3 36 14.4446780388713 1.6868474510117 12.7578305878596 T:C C T 10 0.562282483670567 5.00542239864219e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 40 3 43 17.5087006531773 1.6868474510117 15.8218532021656 T:C C T 10 0.562282483670567 1.94280574103901e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 96358060 G/A 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96358004_96358188:LNPEP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 31 28 59 13.5692430062124 15.7439095427759 -2.17466653656345 A:C:G G C 10 0.562282483670567 0.600938089244845 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 19 12 31 8.31663281025923 6.7473898040468 1.56924300621242 A:T T A 10 0.562282483670567 0.593474819046206 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 114961396 C/A 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 A:C C A 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000251201:ENST00000282382:exon_114961298_114961858:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000408996:exon_114961298_114961870:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000333314:exon_114961298_114961711:TMED7-TICAM2;ENSG00000134970:ENST00000456936:exon_114961298_114961870:TMED7;ENSG00000134970:ENST00000508420:exon_114961298_114961679:TMED7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 19 11 30 8.31663281025923 6.18510732037624 2.13152548988299 A:G A G 10 0.562282483670567 0.467526269724852 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 118872184 C/T 1 72 62 134 31.5156611757192 34.8615139875752 -3.34585281185597 T:C C T 10 0.562282483670567 0.601602952584994 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118872118_118872245:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118871465_118872245:HSD17B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 23 25 48 10.067502875577 14.0570620917642 -3.98955921618722 T:C C T 10 0.562282483670567 0.248686740748081 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 14 14 28 6.12804522861206 7.87195477138794 -1.74390954277588 T:C T C 10 0.562282483670567 0.569582845760759 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 132094205 G/A 1 19 21 40 8.31663281025923 11.8079321570819 -3.49129934682268 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.269718039511596 ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132092025_132094699:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132093835_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132093836_132094248:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132093892_132094248:SEPT8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 40 45 85 17.5087006531773 25.3027117651755 -7.79401111199819 A:G G A 10 0.562282483670567 0.100785973800083 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 39 25 64 17.0709831368479 14.0570620917642 3.01392104508371 A:G A G 10 0.562282483670567 0.529077839120748 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 A:G G A 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 137892221 C/T 1 319 298 617 139.631887709089 167.560180133829 -27.9282924247398 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.0255660139002507 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 0 16 0 16 7.00348026127093 0 7.00348026127093 C C 10 0.562282483670567 0.000138972250073360 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 16 8 24 7.00348026127093 4.49825986936454 2.50522039190639 C:G C G 10 0.562282483670567 0.411148652552095 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 139060486 G/A 1 43 51 94 18.8218532021656 28.6764066671989 -9.85455346503329 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0477890118137221 ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 140857798 T/C 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:C C A 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 24 16 40 10.5052203919064 8.99651973872907 1.50870065317732 C:G G C 10 0.562282483670567 0.750418436013368 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 36 25 61 15.7578305878596 14.0570620917642 1.70076849609541 C:G C G 10 0.562282483670567 0.70019442075796 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3241 2937 6178 1418.64247042369 1651.42365454046 -232.781184116763 A:T:C C T 10 0.562282483670567 2.64679940735853e-09 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 150090781 C/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:C C T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150088002_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150088002_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150088310_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150090420_150090924:DCTN4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 204 242 446 89.2943733312043 136.072361048277 -46.7779877170729 A:G A G 10 0.562282483670567 1.05346603525051e-05 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 82 85 167 35.8928363390135 47.7940111119982 -11.9011747729847 A:C:G G C 10 0.562282483670567 0.0725563968712178 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 11 1 12 4.81489267962376 0.562282483670567 4.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0165281900059062 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 162896687 G/A 1 14 13 27 6.12804522861206 7.30967228771737 -1.18162705910531 A:G G A 10 0.562282483670567 0.700216367058198 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000520345:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000522094:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162896647_162896712:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162896647_162896916:HMMR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 25 14 39 10.9429379082358 7.87195477138794 3.07098313684789 T:C C T 10 0.562282483670567 0.338492154159177 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 27 37 64 11.8183729408947 20.804451895811 -8.98607895491629 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0313909553239993 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 39 39 78 17.0709831368479 21.9290168631521 -4.85803372630423 T:C T C 10 0.562282483670567 0.304467682825358 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 30 25 55 13.131525489883 14.0570620917642 -0.925536601881184 T:G G T 10 0.562282483670567 0.892055953850589 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 A:G A G 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 18 26 44 7.87891529392979 14.6193445754347 -6.74042928150495 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0477633042318867 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 30 30 60 13.131525489883 16.868474510117 -3.73694902023402 T:C C T 10 0.562282483670567 0.363250931570072 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 43 29 72 18.8218532021656 16.3061920264464 2.51566117571918 T:C T C 10 0.562282483670567 0.63501532237896 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 44 27 71 19.2595707184951 15.1816270591053 4.07794365938974 A:G G A 10 0.562282483670567 0.341630573422441 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 9 16 25 3.9394576469649 8.99651973872907 -5.05706209176418 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0453457517811135 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 9 1 10 3.9394576469649 0.562282483670567 3.37717516329433 T:G G T 10 0.562282483670567 0.050497554051754 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 19 14 33 8.31663281025923 7.87195477138794 0.444678038871289 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 54 57 111 23.6367458817894 32.0501015692223 -8.41335568743294 A:G G A 10 0.562282483670567 0.125505272567685 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 T:C T C 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 4310 3 4313 1886.56249537986 1.6868474510117 1884.87564792884 A:T:C:G T A 10 0.562282483670567 0 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 0 19 0 19 8.31663281025923 0 8.31663281025923 A A 10 0.562282483670567 2.16168217411461e-05 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 179149871 A/G 1 86 58 144 37.6437064043312 32.6123840528929 5.03132235143836 A:G A G 10 0.562282483670567 0.44981616962037 ENSG00000127022:ENST00000504734:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000415618:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000247461:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000452673:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000514032:exon_179149805_179150020:CANX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 95 95 190 41.5831640512961 53.4168359487039 -11.8336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0924455790554558 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 146 128 274 63.9067573840972 71.9721579098326 -8.06540052573536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.330513314189989 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 179264590 C/T 1 23 21 44 10.067502875577 11.8079321570819 -1.74042928150495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.649594525861892 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 56 66 122 24.5121809144482 37.1106439222574 -12.5984630078092 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0225903892338741 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 51 68 119 22.3235933328011 38.2352088895986 -15.9116155567975 A:C C A 10 0.562282483670567 0.00401214599616683 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 41 52 93 17.9464181695068 29.2386891508695 -11.2922709813627 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0211615140737508 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 53 52 105 23.1990283654599 29.2386891508695 -6.03966078540953 T:C C T 10 0.562282483670567 0.239371388382194 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 388 220 608 169.83439633582 123.702146407525 46.1322499282953 A:C:G G A 10 0.562282483670567 0.000165160841217800 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 24 31 55 10.5052203919064 17.4307569937876 -6.92553660188118 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0763449939553117 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 T:C T C 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 33 19 52 14.4446780388713 10.6833671897408 3.76131084913052 T:C T C 10 0.562282483670567 0.329394737850463 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 32 25 57 14.0069605225419 14.0570620917642 -0.0501015692223188 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 C:G G C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 21065449 C/T 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 7 2 9 3.06402261430603 1.12456496734113 1.9394576469649 A:G A G 10 0.562282483670567 0.315024394350560 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 11 19 30 4.81489267962376 10.6833671897408 -5.86847451011701 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0414100863325727 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 15 17 32 6.5657627449415 9.55880222239964 -2.99303947745814 A:C A C 10 0.562282483670567 0.291477847805080 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 25967068 C/T 1 16 20 36 7.00348026127093 11.2456496734113 -4.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.179465397865574 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25966563_25967161:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25966744_25967161:TRIM38 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26056072 G/C 1 238 207 445 104.176768886405 116.392474119807 -12.2157052334023 C:G G C 10 0.562282483670567 0.251630392618943 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 264 282 546 115.55742431097 158.5636603951 -43.0062360841296 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.000239965117885932 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26056587 C/T 1 606 562 1168 265.256814895636 316.002755822859 -50.7459409272223 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00288754733821566 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 34 39 73 14.8823955552007 21.9290168631521 -7.04662130795139 T:C T C 10 0.562282483670567 0.099834870809462 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 71 45 116 31.0779436593897 25.3027117651755 5.77523189421423 A:G A G 10 0.562282483670567 0.303872213689793 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 27 21 48 11.8183729408947 11.8079321570819 0.0104407838127845 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:C:G C A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26199454 C/T 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 26216584 C/T 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 28213239 T/C 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 T:C T C 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000187626:ENST00000423974:exon_28213169_28213699:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000377294:exon_28212401_28213753:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000449813:exon_28213169_28213649:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000356796:exon_28213170_28213809:ZKSCAN4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 1 11 12 0.437717516329433 6.18510732037624 -5.7473898040468 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000812019481601098 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 299 400 699 130.8775373825 224.912993468227 -94.0354560857263 A:G G A 10 0.562282483670567 1.01034451641186e-12 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 34 20 54 14.8823955552007 11.2456496734113 3.63674588178938 A:C A C 10 0.562282483670567 0.340044322496036 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 33 21 54 14.4446780388713 11.8079321570819 2.63674588178938 A:T A T 10 0.562282483670567 0.495984441757856 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 24 8 32 10.5052203919064 4.49825986936454 6.00696052254186 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0332009085403547 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 3 8 11 1.3131525489883 4.49825986936454 -3.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0684806772479422 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 307 171 478 134.379277513136 96.150304707667 38.228972805469 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000447387434155308 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 104 27 131 45.522621698261 15.1816270591053 30.3409946391557 C:G G C 10 0.562282483670567 4.34813287717482e-08 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30313029 C/T 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30312936_30313175:RPP21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 63 77 140 27.5762035287543 43.2957512426337 -15.7195477138794 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0081655568473889 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 27 14 41 11.8183729408947 7.87195477138794 3.94641816950675 T:G T G 10 0.562282483670567 0.270494735711089 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 27 14 41 11.8183729408947 7.87195477138794 3.94641816950675 A:C C A 10 0.562282483670567 0.270494735711089 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 480 454 934 210.104407838128 255.276247586437 -45.1718397483096 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00298948706217089 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 90 98 188 39.394576469649 55.1036833997156 -15.7091069300666 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0225940311640497 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 26 12 38 11.3806554245653 6.7473898040468 4.63326562051845 T:C C T 10 0.562282483670567 0.143259910664721 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31111125 G/A 1 13 5 18 5.69032771228263 2.81141241835283 2.87891529392979 A:G G A 10 0.562282483670567 0.235291245672474 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31111148 T/A 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 17 15 32 7.44119777760036 8.43423725505851 -0.993039477458145 T:C T C 10 0.562282483670567 0.725475723315947 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 18 8 26 7.87891529392979 4.49825986936454 3.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 0.235851425893108 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 A:G G A 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31116502 C/T 1 18 6 24 7.87891529392979 3.3736949020234 4.50522039190639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0671916792549588 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116395_31116505:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 11 1 12 4.81489267962376 0.562282483670567 4.2526101959532 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0165281900059062 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 11 1 12 4.81489267962376 0.562282483670567 4.2526101959532 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0165281900059062 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 10 6 16 4.37717516329433 3.3736949020234 1.00348026127093 C:G G C 10 0.562282483670567 0.80213248520352 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 8 1 9 3.50174013063546 0.562282483670567 2.9394576469649 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0874294258227065 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 15 8 23 6.5657627449415 4.49825986936454 2.06750287557696 A:G A G 10 0.562282483670567 0.41049601681712 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 19 10 29 8.31663281025923 5.62282483670567 2.69380797355356 A:C A C 10 0.562282483670567 0.353660782057481 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 37 36 73 16.195548104189 20.2421694121404 -4.04662130795139 T:C T C 10 0.562282483670567 0.34760037322839 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31236900 G/A 1 1940 841 2781 849.1719816791 472.879568766947 376.292412912153 A:T:G G A 10 0.562282483670567 1.59775176518876e-48 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31236526_31236950:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1789 584 2373 783.076636713356 328.372970463611 454.703666249745 T:C T C 10 0.562282483670567 8.01919780619863e-84 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2019 367 2386 883.751665469125 206.357671507098 677.393993962027 C:G C G 10 0.562282483670567 1.13976421551014e-193 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31238868 C/T 1 1 633 634 0.437717516329433 355.924812163469 -355.487094647139 T:C C T 10 0.562282483670567 2.68121779681353e-225 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31238850_31239108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31238850_31239125:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 451 93 544 197.410599864574 52.2922709813627 145.118328883212 T:C:G T G 10 0.562282483670567 8.74407205971619e-40 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 606 148 754 265.256814895636 83.2178075832439 182.039007312392 A:T:C C T 10 0.562282483670567 2.70221005261068e-44 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 100 310 410 43.7717516329433 174.307569937876 -130.535818304932 T:C:G C G 10 0.562282483670567 4.70193268951457e-39 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 384 95 479 168.083526270502 53.4168359487039 114.666690321798 T:C C T 10 0.562282483670567 3.37192782761488e-28 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239543 C/T 1 390 65 455 170.709831368479 36.5483614385869 134.161469929892 T:C C T 10 0.562282483670567 1.43668601108160e-41 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239766 C/T 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 C C 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 317 1 318 138.75645267643 0.562282483670567 138.19417019276 C:G G C 10 0.562282483670567 8.59786000242003e-78 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 39 30 69 17.0709831368479 16.868474510117 0.202508626730875 A:G A G 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 32 35 67 14.0069605225419 19.6798869284698 -5.67292640592799 T:C C T 10 0.562282483670567 0.176317239692272 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 155 118 273 67.8462150310621 66.3493330731269 1.49688195793522 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.902932844497569 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 28 21 49 12.2560904572241 11.8079321570819 0.448158300142216 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31695043 A/G 1 23 20 43 10.067502875577 11.2456496734113 -1.17814679783438 A:G A G 10 0.562282483670567 0.759680684735222 ENSG00000213722:ENST00000437288:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000444662:exon_31694818_31695130:DDAH2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31695437 G/A 1 14 24 38 6.12804522861206 13.4947796080936 -7.36673437948155 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0210215977732831 ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000416410:exon_31695352_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000436437:exon_31695383_31695469:DDAH2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31696493 G/A 1 19 21 40 8.31663281025923 11.8079321570819 -3.49129934682268 A:G G A 10 0.562282483670567 0.269718039511596 ENSG00000213722:ENST00000437288:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31695950_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000444662:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000416410:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000436437:exon_31696423_31696522:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000488119:exon_31695958_31696522:DDAH2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31747555 C/T 1 71 60 131 31.0779436593897 33.736949020234 -2.65900536084428 T:C C T 10 0.562282483670567 0.660278495481866 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31747385_31747591:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31747385_31747591:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31747385_31747591:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31747385_31747591:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747385_31747828:VARS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31777946 C/T 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 T:C C T 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31807466 A/G 1 38 47 85 16.6332656205185 26.4272767325166 -9.79401111199819 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0374029677104763 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 A:G A G 10 0.562282483670567 0.204465163412720 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32149140 C/T 1 26 20 46 11.3806554245653 11.2456496734113 0.135005751153919 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32149128_32149254:AGER HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32159191 C/T 1 344 316 660 150.574825617325 177.681264839899 -27.1064392225742 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0341552311278933 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32158544_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000403803:exon_32158573_32159280:GPSM3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 134 163 297 58.654147188144 91.6520448383024 -32.9978976501584 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.000136427849530836 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 1013 1048 2061 443.407844041716 589.272042886754 -145.864198845039 A:C:G C A 10 0.562282483670567 1.13661678672440e-10 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32605234 G/A 1 600 2 602 262.63050979766 1.12456496734113 261.505944830319 A:G G A 10 0.562282483670567 3.6256158635272e-146 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 2015 5 2020 882.000795403808 2.81141241835283 879.189382985455 A:C C A 10 0.562282483670567 0 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 0 0 101 101 0 56.7905308507273 -56.7905308507273 A C A 10 0.562282483670567 5.76217650405141e-37 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32714143 G/A 0 12 0 12 5.2526101959532 0 5.2526101959532 G G 10 0.562282483670567 0.00181076456401497 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32781256 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 20 46 66 8.75435032658866 25.8649942488461 -17.1106439222574 A:T:C T C 10 0.562282483670567 2.91732665944175e-05 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32800564 G/C 1 24 44 68 10.5052203919064 24.7404292815049 -14.2352088895986 T:C:G G C 10 0.562282483670567 0.000563822562382017 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 195 188 383 85.3549156842394 105.709106930067 -20.3541912458272 A:T:G G T 10 0.562282483670567 0.0392904312861078 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 51 39 90 22.3235933328011 21.9290168631521 0.394576469648971 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32902781 A/T 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 A:T A T 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32902406_32902795:HLA-DMB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32905086 G/T 1 34 19 53 14.8823955552007 10.6833671897408 4.19902836545995 T:G G T 10 0.562282483670567 0.269960096472693 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32940621 C/T 1 17 11 28 7.44119777760036 6.18510732037624 1.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.705814241129564 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32940507_32940704:BRD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32945545 G/A 1 82 95 177 35.8928363390135 53.4168359487039 -17.5239996096904 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00980411169802774 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000481259:exon_32945534_32945678:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945534_32945782:BRD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 144 172 316 63.0313223514384 96.7125871913375 -33.6812648398992 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000173252268588518 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 32977315 A/G 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 1 298 299 0.437717516329433 167.560180133829 -167.1224626175 A:G A G 10 0.562282483670567 2.00698916027071e-105 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 574 188 762 251.249854373095 105.709106930067 145.540747443028 T:C T C 10 0.562282483670567 6.90384068919656e-28 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 701 281 982 306.839978946933 158.001377911429 148.838601035503 A:T:C C T 10 0.562282483670567 1.68007997637638e-22 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 687 280 967 300.71193371832 157.439095427759 143.272838290562 T:C T C 10 0.562282483670567 2.80961508730643e-21 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G G A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 167 157 324 73.0988252270153 88.278349936279 -15.1795247092637 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0930508764959807 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 8 3 11 3.50174013063546 1.6868474510117 1.81489267962376 T:G G T 10 0.562282483670567 0.36749743622047 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 T:C T C 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 76 72 148 33.2665312410369 40.4843388242808 -7.21780758324392 A:G A G 10 0.562282483670567 0.246406399404334 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 34386219 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 11 6 17 4.81489267962376 3.3736949020234 1.44119777760036 T:C C T 10 0.562282483670567 0.62681594206191 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 T:C C T 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 16 9 25 7.00348026127093 5.0605423530351 1.94293790823582 A:C C A 10 0.562282483670567 0.546623434100514 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 13 13 26 5.69032771228263 7.30967228771737 -1.61934457543474 A:G A G 10 0.562282483670567 0.557199285252459 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 125 99 224 54.7146895411791 55.6659658833861 -0.951276342207002 T:C T C 10 0.562282483670567 0.893129674017982 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 35 43 78 15.3201130715302 24.1781467978344 -8.85803372630422 T:G T G 10 0.562282483670567 0.0518085448009338 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 26 19 45 11.3806554245653 10.6833671897408 0.697288234824486 A:G G A 10 0.562282483670567 0.881482098272579 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 132 135 267 57.7787121554852 75.9081352955265 -18.1294231400414 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0263907534587705 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 43 31 74 18.8218532021656 17.4307569937876 1.39109620837804 T:C C T 10 0.562282483670567 0.815064856142058 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 53 57 110 23.1990283654599 32.0501015692223 -8.85107320376237 A:C A C 10 0.562282483670567 0.102010493255698 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 A:T T A 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 42854044 C/T 1 64 80 144 28.0139210450837 44.9825986936454 -16.9686776485616 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00540131805657414 ENSG00000146223:ENST00000483998:exon_42853994_42854208:RPL7L1;ENSG00000146223:ENST00000493763:exon_42853994_42857634:RPL7L1;ENSG00000146223:ENST00000397415:exon_42853994_42854748:RPL7L1;ENSG00000146223:ENST00000304734:exon_42853994_42854208:RPL7L1;ENSG00000146223:ENST00000462348:exon_42853993_42854092:RPL7L1;ENSG00000146223:ENST00000459829:exon_42853994_42854208:RPL7L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43010831 C/T 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43010812_43010918:CUL7;ENSG00000137171:ENST00000467906:exon_43010796_43011246:KLC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43481121 C/T 1 37 24 61 16.195548104189 13.4947796080936 2.70076849609541 T:C C T 10 0.562282483670567 0.520822911915986 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000514627:exon_43480807_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43480204_43481371:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000372417:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000500090:exon_43481097_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000488966:exon_43480952_43481189:YIPF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43488836 C/T 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 T:C C T 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43488894 G/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:G G T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 31 42 73 13.5692430062124 23.6158643141638 -10.0466213079514 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0243173207516955 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 22 18 40 9.62978535924753 10.1210847060702 -0.491299346822681 A:C A C 10 0.562282483670567 0.87487801511788 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43581935 A/G 1 38 25 63 16.6332656205185 14.0570620917642 2.57620352875428 A:G A G 10 0.562282483670567 0.52882623264872 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 6 10 16 2.6263050979766 5.62282483670567 -2.99651973872907 A:G G A 10 0.562282483670567 0.139618210498778 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43608048 C/T 1 36 43 79 15.7578305878596 24.1781467978344 -8.42031620997479 T:C C T 10 0.562282483670567 0.068981086047804 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43607758_43608689:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43607758_43608686:MAD2L1BP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44117607 C/T 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44222718 G/C 1 88 57 145 38.5191414369901 32.0501015692223 6.46903986776778 C:G G C 10 0.562282483670567 0.315216351902706 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222443_44222810:SLC35B2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44232920 A/G 1 70 48 118 30.6402261430603 26.9895592161872 3.65066692687309 A:G A G 10 0.562282483670567 0.517363976112102 ENSG00000146232:ENST00000275015:exon_44232719_44233500:NFKBIE;ENSG00000146232:ENST00000477930:exon_44232719_44233500:NFKBIE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 31 22 53 13.5692430062124 12.3702146407525 1.19902836545995 T:C C T 10 0.562282483670567 0.783223696526692 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 25 32 57 10.9429379082358 17.9930394774581 -7.05010156922232 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0626220416001665 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 49403330 G/A 1 12 13 25 5.2526101959532 7.30967228771737 -2.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.426319103507272 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 8 10 18 3.50174013063546 5.62282483670567 -2.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.348175446579672 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G G A 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 9 9 0 5.0605423530351 -5.0605423530351 A G A 10 0.562282483670567 0.000589855097312382 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 10 10 0 5.62282483670567 -5.62282483670567 A G A 10 0.562282483670567 0.000258189908189832 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 35 31 66 15.3201130715302 17.4307569937876 -2.11064392225742 A:T A T 10 0.562282483670567 0.621218608203896 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 29 13 42 12.6938079735536 7.30967228771737 5.38413568583619 A:G A G 10 0.562282483670567 0.119103211146305 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 T:C C T 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 25 24 49 10.9429379082358 13.4947796080936 -2.55184169985778 T:C C T 10 0.562282483670567 0.47477368725744 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 74310100 C/T 1 8 4 12 3.50174013063546 2.24912993468227 1.2526101959532 T:C C T 10 0.562282483670567 0.568478135207312 ENSG00000119899:ENST00000355773:exon_74310074_74310164:SLC17A5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 76369054 A/G 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G A G 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 32 27 59 14.0069605225419 15.1816270591053 -1.17466653656345 A:G G A 10 0.562282483670567 0.793730005269135 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 83075914 G/A 1 11 18 29 4.81489267962376 10.1210847060702 -5.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0600681823301601 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 116 136 252 50.7752318942142 76.4704177791971 -25.6951858849829 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00118374950227899 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 90359865 T/C 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90359743_90359917:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90359743_90359917:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90359743_90359917:MDN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 90368380 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90368329_90368636:MDN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 47 47 94 20.5727232674834 26.4272767325166 -5.8545534650333 A:G A G 10 0.562282483670567 0.252810779712301 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 108233929 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000429168:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000484803:exon_108233920_108233978:SEC63 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 43 35 78 18.8218532021656 19.6798869284698 -0.858033726304225 A:G G A 10 0.562282483670567 0.909251263872861 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 111912782 A/T 1 45 35 80 19.6972882348245 19.6798869284698 0.017401306354639 A:T A T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 116892734 G/A 1 26 26 52 11.3806554245653 14.6193445754347 -3.23868915086948 A:G G A 10 0.562282483670567 0.40272290663612 ENSG00000111832:ENST00000466444:exon_116892530_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000368590:exon_116892572_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000392526:exon_116892583_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000487832:exon_116892652_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000517800:exon_116892672_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000518117:exon_116892726_116892818:RWDD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 T:C T C 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 122766138 G/A 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 A:G G A 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000111897:ENST00000339697:exon_122764496_122766324:SERINC1;ENSG00000111897:ENST00000368454:exon_122764499_122766324:SERINC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:G T G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 131 0 131 57.3409946391557 0 57.3409946391557 T T 10 0.562282483670567 1.88794707330775e-33 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 141 0 141 61.7181698024501 0 61.7181698024501 A A 10 0.562282483670567 6.74487695456537e-36 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 137 0 137 59.9672997371323 0 59.9672997371323 A A 10 0.562282483670567 8.05910098798036e-35 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 45 0 45 19.6972882348245 0 19.6972882348245 G G 10 0.562282483670567 7.86562981080419e-12 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 56 0 56 24.5121809144482 0 24.5121809144482 T T 10 0.562282483670567 1.85075436382763e-14 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 14 16 30 6.12804522861206 8.99651973872907 -2.86847451011701 T:C T C 10 0.562282483670567 0.357959347956104 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 31 48 79 13.5692430062124 26.9895592161872 -13.4203162099748 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00297446328288821 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 45 62 107 19.6972882348245 34.8615139875752 -15.1642257527507 T:C:G G C 10 0.562282483670567 0.00339719657814649 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 9 10 19 3.9394576469649 5.62282483670567 -1.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 0.492024482019087 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 40 39 79 17.5087006531773 21.9290168631521 -4.42031620997479 T:C C T 10 0.562282483670567 0.364411422038541 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 152443524 G/A 1 9 8 17 3.9394576469649 4.49825986936454 -0.558802222399639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.81086235598227 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 155577823 C/T 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 T:C C T 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 26 17 43 11.3806554245653 9.55880222239964 1.82185320216562 T:C C T 10 0.562282483670567 0.646085242888261 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 157528929 C/T 1 44 40 84 19.2595707184951 22.4912993468227 -3.23172862832763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.510071783290231 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157527301_157530284:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157527301_157529495:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157527301_157529204:ARID1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 16 3 19 7.00348026127093 1.6868474510117 5.31663281025923 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0183936352838449 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 37 10 47 16.195548104189 5.62282483670567 10.5727232674834 A:T T A 10 0.562282483670567 0.00176649124573156 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 159398633 T/C 1 3 10 13 1.3131525489883 5.62282483670567 -4.30967228771737 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0225421185889244 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159397312_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159397866_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159398268_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159398268_159398880:RSPH3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 8 5 13 3.50174013063546 2.81141241835283 0.690327712282629 T:G T G 10 0.562282483670567 0.78553189085735 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 112 151 263 49.0243618288965 84.9046550342556 -35.8802932053591 A:G A G 10 0.562282483670567 9.3515854847451e-06 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 79 65 144 34.5796837900252 36.5483614385869 -1.96867764856164 T:C C T 10 0.562282483670567 0.737819537939497 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 73 115 188 31.9533786920486 64.6624856221152 -32.7091069300666 A:C:G G A 10 0.562282483670567 2.04570864758127e-06 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 13 10 23 5.69032771228263 5.62282483670567 0.0675028755769596 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 22 19 41 9.62978535924753 10.6833671897408 -1.05358183049325 T:C C T 10 0.562282483670567 0.755062561063975 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 166572005 T/C 1 24 16 40 10.5052203919064 8.99651973872907 1.50870065317732 T:C T C 10 0.562282483670567 0.750418436013368 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 39 22 61 17.0709831368479 12.3702146407525 4.70076849609541 T:C C T 10 0.562282483670567 0.246979297578552 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 28 8 36 12.2560904572241 4.49825986936454 7.75783058785959 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0107927250415862 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 249 198 447 108.991661566029 111.331931766772 -2.34027020074343 T:C:G C T 10 0.562282483670567 0.84880908250275 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 30 53 83 13.131525489883 29.8009716345401 -16.6694461446571 T:C T C 10 0.562282483670567 0.000338242987266451 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 167435928 C/T 1 22 10 32 9.62978535924753 5.62282483670567 4.00696052254186 T:C C T 10 0.562282483670567 0.211638186576028 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167435914_167436123:FGFR1OP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 167438276 G/T 1 30 16 46 13.131525489883 8.99651973872907 4.13500575115392 T:G G T 10 0.562282483670567 0.237406311795925 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 167438364 T/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000488525:exon_167438278_167438382:FGFR1OP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 6 6 12 2.6263050979766 3.3736949020234 -0.747389804046804 T:C T C 10 0.562282483670567 0.77386036096334 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 25 4 29 10.9429379082358 2.24912993468227 8.69380797355356 T:G G T 10 0.562282483670567 0.00105814169918302 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 23 10 33 10.067502875577 5.62282483670567 4.44467803887129 T:C T C 10 0.562282483670567 0.159512979795580 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 13 14 27 5.69032771228263 7.87195477138794 -2.18162705910531 A:G G A 10 0.562282483670567 0.440802256425473 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 21 8 29 9.19206784291809 4.49825986936454 4.69380797355356 A:G A G 10 0.562282483670567 0.092522422076799 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 16 17 33 7.00348026127093 9.55880222239964 -2.55532196112871 T:G T G 10 0.562282483670567 0.385181118369198 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 23 39 62 10.067502875577 21.9290168631521 -11.8615139875752 A:T A T 10 0.562282483670567 0.00298245467710561 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 22 22 44 9.62978535924753 12.3702146407525 -2.74042928150495 A:G A G 10 0.562282483670567 0.448670998808091 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 35 35 70 15.3201130715302 19.6798869284698 -4.35977385693969 T:C C T 10 0.562282483670567 0.335342663977498 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 20 24 44 8.75435032658866 13.4947796080936 -4.74042928150495 A:G G A 10 0.562282483670567 0.171821911980153 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 2394991 C/T 1 72 70 142 31.5156611757192 39.3597738569397 -7.84411268122051 T:C C T 10 0.562282483670567 0.204487396628554 ENSG00000106263:ENST00000431643:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2394501_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000413917:exon_2394869_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2394517_2395055:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2394557_2395055:EIF3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 11 16 27 4.81489267962376 8.99651973872907 -4.18162705910531 T:C T C 10 0.562282483670567 0.121657067505418 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 T:G G T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 4802035 A/G 1 8 9 17 3.50174013063546 5.0605423530351 -1.55880222239964 A:G A G 10 0.562282483670567 0.472203671514815 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4801815_4802171:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4801815_4811074:FOXK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 4830095 T/C 1 21 13 34 9.19206784291809 7.30967228771737 1.88239555520072 T:C T C 10 0.562282483670567 0.605368107941141 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4830090_4830222:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4830090_4830222:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4829463_4830222:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4829845_4830222:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000469614:exon_4829463_4830222:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000490487:exon_4830090_4830222:KIAA0415 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 21 23 44 9.19206784291809 12.932497124423 -3.74042928150495 C:G C G 10 0.562282483670567 0.288431577893783 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 5567677 C/T 1 3948 4036 7984 1728.1087544686 2269.37210409441 -541.263349625807 A:T:C C T 10 0.562282483670567 5.37681669411981e-34 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567635_5567729:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 22 41 63 9.62978535924753 23.0535818304932 -13.4237964712457 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000833956101240105 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 201 160 361 87.981220782216 89.9651973872907 -1.98397660507467 T:C T C 10 0.562282483670567 0.832193721921303 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 13 18 31 5.69032771228263 10.1210847060702 -4.43075699378758 T:G G T 10 0.562282483670567 0.146375376416344 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 18 16 34 7.87891529392979 8.99651973872907 -1.11760444479928 A:G G A 10 0.562282483670567 0.731692958124414 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 134 103 237 58.654147188144 57.9150958180684 0.739051370075622 T:C C T 10 0.562282483670567 0.947866017485423 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 72 18 90 31.5156611757192 10.1210847060702 21.394576469649 T:C T C 10 0.562282483670567 3.21261993446999e-06 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 66 12 78 28.8893560777426 6.7473898040468 22.1419662736958 T:C T C 10 0.562282483670567 1.28118614226801e-07 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6456347 G/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:G G T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.756374733637472 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 65 65 130 28.4516385614131 36.5483614385869 -8.09672287717371 A:G A G 10 0.562282483670567 0.157933138252517 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 23 23 46 10.067502875577 12.932497124423 -2.86499424884608 T:C T C 10 0.562282483670567 0.457955100840524 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 6 2 8 2.6263050979766 1.12456496734113 1.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.479179960348109 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 90 104 194 39.394576469649 58.477378301739 -19.08280183209 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00726063475069511 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C T C 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 28 54 82 12.2560904572241 30.3632541182106 -18.1071636609865 A:G G A 10 0.562282483670567 7.68544330627383e-05 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 15 14 29 6.5657627449415 7.87195477138794 -1.30619202644644 A:G A G 10 0.562282483670567 0.709191153467367 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 33055315 C/T 1 65 85 150 28.4516385614131 47.7940111119982 -19.3423725505851 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00169519001100526 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33055282_33055482:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33055282_33055482:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33055282_33055482:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33055282_33055482:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33055282_33055482:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000473083:exon_33055282_33055538:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33055282_33055482:NT5C3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G A G 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 36492212 C/T 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 A:G A G 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 A:G G A 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 40134027 C/T 1 18 15 33 7.87891529392979 8.43423725505851 -0.555321961128711 T:C C T 10 0.562282483670567 0.862268201844544 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40133729_40136733:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40133729_40135154:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000465643:exon_40133729_40135131:CDK13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 43906513 A/G 1 199 200 399 87.1057857495572 112.456496734113 -25.3507109845562 A:T:G A G 10 0.562282483670567 0.0115675890233515 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 44 42 86 19.2595707184951 23.6158643141638 -4.35629359566876 T:C C T 10 0.562282483670567 0.384801608281215 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 29 26 55 12.6938079735536 14.6193445754347 -1.92553660188118 A:G G A 10 0.562282483670567 0.683860920127607 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 42 22 64 18.3841356858362 12.3702146407525 6.01392104508371 A:C C A 10 0.562282483670567 0.165262732267796 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 67 61 128 29.327073594072 34.2992315039046 -4.97215790983257 A:G G A 10 0.562282483670567 0.374824994925181 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 21 23 44 9.19206784291809 12.932497124423 -3.74042928150495 T:G G T 10 0.562282483670567 0.288431577893783 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 11 8 19 4.81489267962376 4.49825986936454 0.316632810259227 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 8 9 17 3.50174013063546 5.0605423530351 -1.55880222239964 A:G G A 10 0.562282483670567 0.472203671514815 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 143 148 291 62.5936048351089 83.2178075832439 -20.624202748135 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0154103773898969 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 141 118 259 61.7181698024501 66.3493330731269 -4.63116327067684 A:G G A 10 0.562282483670567 0.573381879742312 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 166 113 279 72.6611077106859 63.5379206547741 9.12318705591181 A:G G A 10 0.562282483670567 0.278004216479873 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 45015107 G/A 1 54 60 114 23.6367458817894 33.736949020234 -10.1002031384446 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0593151342574922 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45015075_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45015083_45015248:MYO1G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 20 26 46 8.75435032658866 14.6193445754347 -5.86499424884608 T:C C T 10 0.562282483670567 0.101284317889982 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 48016353 G/T 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 T:G G T 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000442024:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432627:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000433977:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000446009:exon_48016327_48016434:HUS1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 5 21 26 2.18858758164717 11.8079321570819 -9.61934457543474 A:G G A 10 0.562282483670567 0.000198628801046944 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 1 27 27 54 11.8183729408947 15.1816270591053 -3.36325411821062 A:C:G A C 10 0.562282483670567 0.410897840964835 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 220 227 447 96.2978535924753 127.638123793219 -31.3402702007434 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00308800546406046 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64168692 C/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395385:exon_64168564_64168743:ZNF107 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 3 9 12 1.3131525489883 5.0605423530351 -3.7473898040468 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0395973446901177 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 2 7 9 0.875435032658866 3.93597738569397 -3.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0480678142146998 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 11 9 20 4.81489267962376 5.0605423530351 -0.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 A:G G A 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64451558 G/A 1 5 5 10 2.18858758164717 2.81141241835283 -0.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.756374733637472 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 8 13 21 3.50174013063546 7.30967228771737 -3.80793215708191 A:G G A 10 0.562282483670567 0.122676963602703 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:G A G 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 83 87 170 36.3305538553429 48.9185760793393 -12.5880222239964 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0534913248478013 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 T:C T C 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 66248692 C/G 1 10 14 24 4.37717516329433 7.87195477138794 -3.49477960809361 C:G C G 10 0.562282483670567 0.156387806204107 ENSG00000243335:ENST00000503687:exon_66248662_66248828:KCTD7;ENSG00000243335:ENST00000451741:exon_66248662_66248828:KCTD7;ENSG00000243335:ENST00000380828:exon_66248662_66248828:KCTD7;ENSG00000243335:ENST00000510829:exon_66248662_66248828:KCTD7;ENSG00000154710:ENST00000284957:exon_66248662_66248828:RABGEF1;ENSG00000154710:ENST00000450873:exon_66248662_66248828:RABGEF1;ENSG00000154710:ENST00000439720:exon_66248662_66248828:RABGEF1;ENSG00000154710:ENST00000437078:exon_66248662_66248828:RABGEF1;ENSG00000154710:ENST00000484547:exon_66248662_66248828:RABGEF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 51 25 76 22.3235933328011 14.0570620917642 8.26653124103691 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0639728793148282 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 22 31 53 9.62978535924753 17.4307569937876 -7.80097163454005 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0371762994895439 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 0 8 0 8 3.50174013063546 0 3.50174013063546 T T 10 0.562282483670567 0.0113392023691977 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 73521469 G/A 0 19 0 19 8.31663281025923 0 8.31663281025923 G G 10 0.562282483670567 2.16168217411461e-05 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73521401_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000483414:exon_73521340_73521523:LIMK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 73635968 G/C 1 86 69 155 37.6437064043312 38.7974913732691 -1.15378496893788 C:G G C 10 0.562282483670567 0.871578150235261 ENSG00000086730:ENST00000344995:exon_73635967_73636022:LAT2;ENSG00000086730:ENST00000460943:exon_73635967_73636022:LAT2;ENSG00000086730:ENST00000398479:exon_73635967_73636022:LAT2;ENSG00000086730:ENST00000398475:exon_73635967_73636022:LAT2;ENSG00000086730:ENST00000275635:exon_73635967_73636022:LAT2;ENSG00000086730:ENST00000490586:exon_73635967_73636022:LAT2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 50 35 85 21.8858758164716 19.6798869284698 2.20598888800181 T:C T C 10 0.562282483670567 0.663089398252429 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 35 20 55 15.3201130715302 11.2456496734113 4.07446339811882 T:C C T 10 0.562282483670567 0.280588226850174 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 35 23 58 15.3201130715302 12.932497124423 2.38761594710711 T:C T C 10 0.562282483670567 0.597288141893652 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 28 33 61 12.2560904572241 18.5553219611287 -6.29923150390459 A:G A G 10 0.562282483670567 0.121185294148027 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 54 35 89 23.6367458817894 19.6798869284698 3.95685895331954 A:G G A 10 0.562282483670567 0.454822133162555 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 11 4 15 4.81489267962376 2.24912993468227 2.5657627449415 A:G A G 10 0.562282483670567 0.204465163412720 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 80 66 146 35.0174013063546 37.1106439222574 -2.09324261590278 A:G G A 10 0.562282483670567 0.739189018888798 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 13 19 32 5.69032771228263 10.6833671897408 -4.99303947745814 A:G A G 10 0.562282483670567 0.107293429068483 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 14 10 24 6.12804522861206 5.62282483670567 0.505220391906392 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 25 10 35 10.9429379082358 5.62282483670567 5.32011307153016 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0875579193498101 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 96339061 C/T 1 218 185 403 95.4224185598164 104.022259479055 -8.5998409192385 T:C C T 10 0.562282483670567 0.393711192612156 ENSG00000127922:ENST00000466986:exon_96339000_96339124:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000417009:exon_96339000_96339173:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000444799:exon_96339000_96339170:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000449279:exon_96339000_96339192:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000488005:exon_96339000_96339163:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000413065:exon_96339000_96339163:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000248566:exon_96339000_96339203:SHFM1;ENSG00000127922:ENST00000476463:exon_96339000_96339185:SHFM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 7 20 27 3.06402261430603 11.2456496734113 -8.18162705910531 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00168037002812117 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 97933552 A/T 1 16 4 20 7.00348026127093 2.24912993468227 4.75435032658866 A:T A T 10 0.562282483670567 0.0407252292312323 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 98609987 G/A 1 34 64 98 14.8823955552007 35.9860789549163 -21.1036833997156 A:G G A 10 0.562282483670567 2.30297736286730e-05 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98609694_98610866:TRRAP HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 T:C T C 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G A G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99669327 A/G 1 11 10 21 4.81489267962376 5.62282483670567 -0.807932157081907 A:G A G 10 0.562282483670567 0.82684146397486 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 177 176 353 77.4760003903096 98.9617171260198 -21.4857167357102 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0241220807318119 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 A:G A G 10 0.562282483670567 0.386919319946478 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99752566 G/A 1 16 22 38 7.00348026127093 12.3702146407525 -5.36673437948155 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.101021262377347 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 99758136 T/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:G T G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 128 108 236 56.0278420901674 60.7265082364212 -4.69866614625381 A:G A G 10 0.562282483670567 0.555178224718923 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 62 76 138 27.1384860124248 42.7334687589631 -15.5949827465382 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00780920818227358 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 100853911 G/C 1 13 12 25 5.69032771228263 6.7473898040468 -1.05706209176418 C:G G C 10 0.562282483670567 0.691089126205243 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853813_100853936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853813_100854384:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000421736:exon_100853876_100853954:PLOD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 15 14 29 6.5657627449415 7.87195477138794 -1.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.709191153467367 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 8 17 25 3.50174013063546 9.55880222239964 -6.05706209176417 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0245029132727380 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 102110058 C/T 1 20 42 62 8.75435032658866 23.6158643141638 -14.8615139875752 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000167560101434798 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102110021_102110093:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102110036_102110093:LRWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 25 15 40 10.9429379082358 8.43423725505851 2.50870065317732 A:G G A 10 0.562282483670567 0.524383211497703 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 119 106 225 52.0883844432025 59.6019432690801 -7.51355882587757 A:T A T 10 0.562282483670567 0.314376069675737 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 19 21 40 8.31663281025923 11.8079321570819 -3.49129934682268 A:G G A 10 0.562282483670567 0.269718039511596 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 112096073 T/C 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 T:C T C 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000443101:exon_112096057_112096128:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000429071:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000476927:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000440625:exon_112096057_112096141:IFRD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 115890532 G/A 1 51 45 96 22.3235933328011 25.3027117651755 -2.97911843237443 A:G G A 10 0.562282483670567 0.539175604560179 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000393484:exon_115890489_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000494384:exon_115890503_115890550:TES HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 69 53 122 30.2025086267309 29.8009716345401 0.401536992190827 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 18 10 28 7.87891529392979 5.62282483670567 2.25609045722412 A:G G A 10 0.562282483670567 0.44952159885089 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 58 77 135 25.3876159471071 43.2957512426337 -17.9081352955265 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00229062395149814 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 128505573 G/A 1 394 377 771 172.460701433797 211.980496343804 -39.5197949100072 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00460703690621917 ENSG00000128524:ENST00000249289:exon_128505431_128505897:ATP6V1F;ENSG00000128524:ENST00000492758:exon_128505431_128505898:ATP6V1F HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 14 10 24 6.12804522861206 5.62282483670567 0.505220391906392 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 355 0 355 155.389718296949 0 155.389718296949 T T 10 0.562282483670567 2.90403800979027e-89 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 13 7 20 5.69032771228263 3.93597738569397 1.75435032658866 A:T A T 10 0.562282483670567 0.503794843276968 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 15 6 21 6.5657627449415 3.3736949020234 3.19206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.190440128145316 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 17 6 23 7.44119777760036 3.3736949020234 4.06750287557696 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0960650785141877 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 133979711 G/A 1 9 11 20 3.9394576469649 6.18510732037624 -2.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.369771497146265 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 A:G G A 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 23 17 40 10.067502875577 9.55880222239964 0.508700653177321 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 141352547 T/G 1 10 10 20 4.37717516329433 5.62282483670567 -1.24564967341134 T:G T G 10 0.562282483670567 0.654484470731119 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 138 0 138 60.4050172534618 0 60.4050172534618 T T 10 0.562282483670567 4.29443322736685e-35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 143079495 G/T 0 45 0 45 19.6972882348245 0 19.6972882348245 G G 10 0.562282483670567 7.86562981080419e-12 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449630:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079341_143079778:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000457235:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079341_143079540:ZYX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 143079496 G/C 0 44 0 44 19.2595707184951 0 19.2595707184951 G G 10 0.562282483670567 1.47977636968361e-11 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449630:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079341_143079778:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000457235:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079341_143079540:ZYX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 143079497 A/C 0 42 0 42 18.3841356858362 0 18.3841356858362 A A 10 0.562282483670567 5.34595593232987e-11 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449630:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079341_143079778:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000457235:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079341_143079540:ZYX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 148451092 T/C 1 5 17 22 2.18858758164717 9.55880222239964 -7.37021464075247 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00197667560254115 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148451068_148451242:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148451068_148451242:CUL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 15 7 22 6.5657627449415 3.93597738569397 2.62978535924753 T:C C T 10 0.562282483670567 0.289756257599733 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 22 35 57 9.62978535924753 19.6798869284698 -10.0501015692223 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0105331570158092 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 19 20 39 8.31663281025923 11.2456496734113 -2.92901686315211 A:G A G 10 0.562282483670567 0.420034067992266 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150069867 C/A 1 117 122 239 51.2129494105437 68.5984630078092 -17.3855135972655 A:C C A 10 0.562282483670567 0.0264716390974609 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 17 17 34 7.44119777760036 9.55880222239964 -2.11760444479928 A:C:G A C 10 0.562282483670567 0.492620571179929 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 88 81 169 38.5191414369901 45.5448811773159 -7.02573974032583 A:G A G 10 0.562282483670567 0.278794386691991 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150217335 G/T 1 89 67 156 38.9568589533195 37.672926405928 1.28393254739155 T:G G T 10 0.562282483670567 0.871979863189489 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150269542 G/T 1 1 39 40 0.437717516329433 21.9290168631521 -21.4912993468227 T:G G T 10 0.562282483670567 2.32781552203487e-13 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000478135:exon_150269217_150269621:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000479232:exon_150269217_150269569:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150730998 C/T 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730825_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150773165 C/T 1 57 55 112 24.9498984307777 30.9255366018812 -5.9756381711035 T:C C T 10 0.562282483670567 0.255046880058542 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 98 93 191 42.8963166002844 52.2922709813627 -9.3959543810783 A:T A T 10 0.562282483670567 0.189171868169886 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 99 87 186 43.3340341166139 48.9185760793393 -5.58454196272546 A:G G A 10 0.562282483670567 0.417021662439951 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 38 30 68 16.6332656205185 16.868474510117 -0.235208889598557 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 10 8 18 4.37717516329433 4.49825986936454 -0.121084706070206 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 18 24 42 7.87891529392979 13.4947796080936 -5.61586431416381 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0881245816088174 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 64 69 133 28.0139210450837 38.7974913732691 -10.7835703281854 A:C:G C G 10 0.562282483670567 0.0662599878758335 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 22 44 66 9.62978535924753 24.7404292815049 -15.1106439222574 A:G A G 10 0.562282483670567 0.000256359752173634 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 19 16 35 8.31663281025923 8.99651973872907 -0.679886928469845 T:C T C 10 0.562282483670567 0.865535263567683 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 156742749 G/A 1 8 7 15 3.50174013063546 3.93597738569397 -0.434237255058505 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 156742796 A/C 1 12 6 18 5.2526101959532 3.3736949020234 1.87891529392979 A:C A C 10 0.562282483670567 0.478579103813422 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 11 7 18 4.81489267962376 3.93597738569397 0.878915293929794 C:G G C 10 0.562282483670567 0.813725065486357 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 12 7 19 5.2526101959532 3.93597738569397 1.31663281025923 T:C T C 10 0.562282483670567 0.646955815494516 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 381410 A/G 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 6302154 G/T 1 13 19 32 5.69032771228263 10.6833671897408 -4.99303947745814 T:G G T 10 0.562282483670567 0.107293429068483 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 27 17 44 11.8183729408947 9.55880222239964 2.25957071849505 C:G G C 10 0.562282483670567 0.54541359988331 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 6338306 C/A 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 A:C C A 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6338235_6338397:MCPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 16 20 36 7.00348026127093 11.2456496734113 -4.24216941214041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.179465397865574 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 26 25 51 11.3806554245653 14.0570620917642 -2.67640666719892 C:G C G 10 0.562282483670567 0.482016875397872 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 8185733 G/A 1 8 8 16 3.50174013063546 4.49825986936454 -0.996519738729072 A:G G A 10 0.562282483670567 0.624209044959862 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8185226_8185977:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8185226_8185977:AC068353.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 11643553 G/T 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 T:G G T 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11643472_11643606:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 354 398 752 154.952000780619 223.788428500886 -68.8364277202664 A:T:C:G G C 10 0.562282483670567 5.39345124041354e-07 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 15 11 26 6.5657627449415 6.18510732037624 0.380655424565258 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 12 14 26 5.2526101959532 7.87195477138794 -2.61934457543474 T:C C T 10 0.562282483670567 0.327271871316105 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 61 60 121 26.7007684960954 33.736949020234 -7.03618052413861 T:C T C 10 0.562282483670567 0.200799618465480 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 26 25 51 11.3806554245653 14.0570620917642 -2.67640666719892 T:C C T 10 0.562282483670567 0.482016875397872 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 37 28 65 16.195548104189 15.7439095427759 0.451638561413146 C:G C G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 1 11 13 24 4.81489267962376 7.30967228771737 -2.49477960809361 A:G A G 10 0.562282483670567 0.312204567844798 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 18 17 35 7.87891529392979 9.55880222239964 -1.67988692846984 A:G G A 10 0.562282483670567 0.611311135850672 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 33 36 69 14.4446780388713 20.2421694121404 -5.79749137326912 A:G A G 10 0.562282483670567 0.181946815111737 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 29 23 52 12.6938079735536 12.932497124423 -0.238689150869483 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 6 11 17 2.6263050979766 6.18510732037624 -3.55880222239964 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0913332562302012 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 31 19 50 13.5692430062124 10.6833671897408 2.88587581647165 A:G A G 10 0.562282483670567 0.47688468218447 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 25 26 51 10.9429379082358 14.6193445754347 -3.67640666719892 T:C:G T C 10 0.562282483670567 0.324700436589807 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 20 20 40 8.75435032658866 11.2456496734113 -2.49129934682268 A:G G A 10 0.562282483670567 0.430783925622318 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 39 32 71 17.0709831368479 17.9930394774581 -0.922056340610258 A:G A G 10 0.562282483670567 0.90489782641864 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 77 96 173 33.7042487573663 53.9791184323744 -20.2748696750081 C:G C G 10 0.562282483670567 0.00211820968502559 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 122 121 243 53.4015369921908 68.0361805241386 -14.6346435319478 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0608728142344678 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 66 56 122 28.8893560777426 31.4878190855518 -2.59846300780917 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.649028614183658 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 218 173 391 95.4224185598164 97.2748696750081 -1.8524511151917 A:G A G 10 0.562282483670567 0.878499419209704 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 241 196 437 105.489921435393 110.207366799431 -4.71744536403777 A:G A G 10 0.562282483670567 0.664473846993719 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 5 23 28 2.18858758164717 12.932497124423 -10.7439095427759 A:C A C 10 0.562282483670567 6.16861639336491e-05 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 12 9 21 5.2526101959532 5.0605423530351 0.192067842918092 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 36 23 59 15.7578305878596 12.932497124423 2.82533346343655 T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.512857110056373 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G A G 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 T:C T C 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 7 14 21 3.06402261430603 7.87195477138794 -4.80793215708191 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0460091809249048 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 32 0 32 14.0069605225419 0 14.0069605225419 T T 10 0.562282483670567 1.28044587591705e-08 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 48691637 G/A 1 59 71 130 25.8253334634365 39.9220563406103 -14.0967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0133273966126363 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48691565_48691654:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48691565_48691654:AC103686.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 16 21 37 7.00348026127093 11.8079321570819 -4.80445189581098 A:G A G 10 0.562282483670567 0.135449621034062 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 5 4 9 2.18858758164717 2.24912993468227 -0.0605423530351028 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 13 6 19 5.69032771228263 3.3736949020234 2.31663281025923 T:C C T 10 0.562282483670567 0.358026329995524 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 95411714 A/G 1 8 6 14 3.50174013063546 3.3736949020234 0.128045228612062 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95411642_95411849:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95411642_95411849:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95411642_95411793:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000523192:exon_95411642_95411811:RAD54B HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:C T C 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 41 27 68 17.9464181695068 15.1816270591053 2.76479111040145 T:C C T 10 0.562282483670567 0.542432460566682 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 3 14 17 1.3131525489883 7.87195477138794 -6.55880222239964 T:C T C 10 0.562282483670567 0.00214129057289237 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 18 17 35 7.87891529392979 9.55880222239964 -1.67988692846984 A:G A G 10 0.562282483670567 0.611311135850672 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:G T G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 9 20 29 3.9394576469649 11.2456496734113 -7.30619202644644 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0079636801956289 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 7 15 22 3.06402261430603 8.43423725505851 -5.37021464075247 T:C T C 10 0.562282483670567 0.029599076619356 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 20 15 35 8.75435032658866 8.43423725505851 0.320113071530155 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 125562029 C/T 1 182 165 347 79.6645879719568 92.7766098056436 -13.1120218336868 T:C C T 10 0.562282483670567 0.159735904733873 ENSG00000147684:ENST00000276689:exon_125562002_125562220:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517367:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000518657:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000524241:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517830:exon_125562015_125562074:NDUFB9 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 126033096 T/C 1 82 80 162 35.8928363390135 44.9825986936454 -9.08976235463185 T:C T C 10 0.562282483670567 0.15461662748193 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 148 111 259 64.7821924167561 62.4133556874329 2.36883672932316 T:C C T 10 0.562282483670567 0.802312351620365 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 133844598 C/T 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 T:C C T 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 70 45 115 30.6402261430603 25.3027117651755 5.33751437788479 A:G G A 10 0.562282483670567 0.347690595117818 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 13 3 16 5.69032771228263 1.6868474510117 4.00348026127093 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0465312298648921 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 A:G A G 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 142154262 G/A 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 5 6 11 2.18858758164717 3.3736949020234 -1.18510732037624 T:C C T 10 0.562282483670567 0.550130037911436 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 30 15 45 13.131525489883 8.43423725505851 4.69728823482449 A:G G A 10 0.562282483670567 0.177709340060247 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 58 41 99 25.3876159471071 23.0535818304932 2.33403411661387 T:C:G C G 10 0.562282483670567 0.685856912457022 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144102747 C/T 1 491 392 883 214.919300517752 220.414733598862 -5.49543308111066 T:C C T 10 0.562282483670567 0.709232360830444 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520531:exon_144102731_144103057:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000523847:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102731_144102850:LY6E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144620899 C/T 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 7 1 8 3.06402261430603 0.562282483670567 2.50174013063546 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0874128071850006 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 40 10 50 17.5087006531773 5.62282483670567 11.8858758164717 A:T:G G A 10 0.562282483670567 0.000537009245507653 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 2 17 19 0.875435032658866 9.55880222239964 -8.68336718974077 A:G G A 10 0.562282483670567 6.45904444562747e-05 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 993 1033 2026 434.653493715127 580.837805631696 -146.184311916569 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 7.79383571560101e-11 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A,G 0 0 11 11 0 6.18510732037624 -6.18510732037624 A:G C A 10 0.562282483670567 0.000113014245354178 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 7 8 15 3.06402261430603 4.49825986936454 -1.4342372550585 A:G G A 10 0.562282483670567 0.604286753211991 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 A:G G A 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 33 17 50 14.4446780388713 9.55880222239964 4.88587581647165 A:G A G 10 0.562282483670567 0.199411198408656 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 144998514 C/T 1 9 4 13 3.9394576469649 2.24912993468227 1.69032771228263 T:C C T 10 0.562282483670567 0.411950034875506 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 145621887 C/T 1 6 12 18 2.6263050979766 6.7473898040468 -4.12108470607021 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0585970921293146 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145621813_145621956:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621813_145621945:CPSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:G G A 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 10 4 14 4.37717516329433 2.24912993468227 2.12804522861206 C:G C G 10 0.562282483670567 0.292594749416132 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 A:G G A 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 33 19 52 14.4446780388713 10.6833671897408 3.76131084913052 T:C C T 10 0.562282483670567 0.329394737850463 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 5 8 13 2.18858758164717 4.49825986936454 -2.30967228771737 T:C C T 10 0.562282483670567 0.264490541486293 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 4 9 13 1.75087006531773 5.0605423530351 -3.30967228771737 A:C A C 10 0.562282483670567 0.0912440980726193 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 132 100 232 57.7787121554852 56.2282483670567 1.55046378842846 C:G C G 10 0.562282483670567 0.894752551013589 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 54 48 102 23.6367458817894 26.9895592161872 -3.35281333439783 A:G G A 10 0.562282483670567 0.549597463682041 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 28 27 55 12.2560904572241 15.1816270591053 -2.92553660188118 A:C C A 10 0.562282483670567 0.497157392372205 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2837281 A/C 1 28 24 52 12.2560904572241 13.4947796080936 -1.23868915086948 A:C A C 10 0.562282483670567 0.780475098064649 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2837180_2837401:KIAA0020 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 29 27 56 12.6938079735536 15.1816270591053 -2.48781908555175 T:C C T 10 0.562282483670567 0.504248931522165 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 5335470 C/T 1 1 7 8 0.437717516329433 3.93597738569397 -3.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0251876797388892 ENSG00000107018:ENST00000223862:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000487557:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000223858:exon_5334969_5335597:RLN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 44 41 85 19.2595707184951 23.0535818304932 -3.79401111199819 A:G A G 10 0.562282483670567 0.444566069252654 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 6 8 14 2.6263050979766 4.49825986936454 -1.87195477138794 A:G A G 10 0.562282483670567 0.420484008008452 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 7 11 18 3.06402261430603 6.18510732037624 -3.12108470607021 A:C A C 10 0.562282483670567 0.157977218105118 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 6606634 C/T 0 8 0 8 3.50174013063546 0 3.50174013063546 C C 10 0.562282483670567 0.0113392023691977 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 6984172 G/A 1 3 7 10 1.3131525489883 3.93597738569397 -2.62282483670567 A:G G A 10 0.562282483670567 0.116172903715661 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 211 0 211 92.3583959455104 0 92.3583959455104 G G 10 0.562282483670567 3.50613690654676e-53 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 81 70 151 35.4551188226841 39.3597738569397 -3.90465503425562 A:C C A 10 0.562282483670567 0.566023994465502 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 101 95 196 44.2094691492727 53.4168359487039 -9.20736679943113 T:G G T 10 0.562282483670567 0.195223839148828 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 19126281 C/T 1 23 44 67 10.067502875577 24.7404292815049 -14.672926405928 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000467952671522379 ENSG00000147872:ENST00000411567:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000434144:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000380465:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000380464:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000475923:exon_19125504_19126446:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000472715:exon_19125631_19126307:PLIN2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 26842442 C/T 1 6 13 19 2.6263050979766 7.30967228771737 -4.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0369601410754297 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26840683_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26842264_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26842392_26842645:C9orf82 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 19 20 39 8.31663281025923 11.2456496734113 -2.92901686315211 T:C T C 10 0.562282483670567 0.420034067992266 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 22 14 36 9.62978535924753 7.87195477138794 1.75783058785959 T:G T G 10 0.562282483670567 0.616673683810018 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 116 116 232 50.7752318942142 65.2247681057858 -14.4495362115715 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.0636885638435099 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 33062128 G/A 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33062047_33062175:SMU1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 33113493 A/G 1 15 16 31 6.5657627449415 8.99651973872907 -2.43075699378758 A:G A G 10 0.562282483670567 0.469579803469305 ENSG00000086062:ENST00000379731:exon_33110635_33113584:B4GALT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 34635679 G/A 1 35 27 62 15.3201130715302 15.1816270591053 0.138486012424847 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 15 9 24 6.5657627449415 5.0605423530351 1.50522039190639 A:G G A 10 0.562282483670567 0.681683367560676 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 A:G G A 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 35618092 T/C 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 T:C T C 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000463720:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000477364:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000378431:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000465754:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000470387:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000482121:exon_35618011_35618118:CD72;ENSG00000137101:ENST00000378430:exon_35618011_35618118:CD72 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 7 3 10 3.06402261430603 1.6868474510117 1.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 0.528790095088181 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 25 17 42 10.9429379082358 9.55880222239964 1.38413568583619 T:C C T 10 0.562282483670567 0.756541266317635 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 27 9 36 11.8183729408947 5.0605423530351 6.75783058785959 T:G G T 10 0.562282483670567 0.0278946835630128 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 15 15 30 6.5657627449415 8.43423725505851 -1.86847451011701 T:C C T 10 0.562282483670567 0.581784650409097 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 23 15 38 10.067502875577 8.43423725505851 1.63326562051845 T:C T C 10 0.562282483670567 0.627630593591346 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 93 70 163 40.7077290186373 39.3597738569397 1.34795516169758 A:G G A 10 0.562282483670567 0.874679245793523 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37836358 G/A 0 15 0 15 6.5657627449415 0 6.5657627449415 G G 10 0.562282483670567 0.000261637086703705 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 29 7 36 12.6938079735536 3.93597738569397 8.75783058785959 A:G G A 10 0.562282483670567 0.00366770762956420 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 17 11 28 7.44119777760036 6.18510732037624 1.25609045722412 T:C C T 10 0.562282483670567 0.705814241129564 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 T:C C T 10 0.562282483670567 0.736037290013816 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 8 11 19 3.50174013063546 6.18510732037624 -2.68336718974077 T:C C T 10 0.562282483670567 0.250860933602197 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 20 10 30 8.75435032658866 5.62282483670567 3.13152548988299 T:G G T 10 0.562282483670567 0.274572278180172 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 74587769 T/A 1 18 24 42 7.87891529392979 13.4947796080936 -5.61586431416381 A:T T A 10 0.562282483670567 0.0881245816088174 ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74587608_74588068:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74587608_74588373:C9orf85 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 9 18 27 3.9394576469649 10.1210847060702 -6.18162705910531 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0194555153869376 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 77745496 C/T 1 32 22 54 14.0069605225419 12.3702146407525 1.63674588178938 T:C C T 10 0.562282483670567 0.683106215427421 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77745494_77745557:OSTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 10 0 10 4.37717516329433 0 4.37717516329433 G G 10 0.562282483670567 0.00341716022414850 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 17 13 30 7.44119777760036 7.30967228771737 0.13152548988299 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 9 7 16 3.9394576469649 3.93597738569397 0.00348026127092815 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 10 12 22 4.37717516329433 6.7473898040468 -2.37021464075247 T:C C T 10 0.562282483670567 0.390806941275438 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 11 18 29 4.81489267962376 10.1210847060702 -5.30619202644644 C:G G C 10 0.562282483670567 0.0600681823301601 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 10 18 28 4.37717516329433 10.1210847060702 -5.74390954277588 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0352963746302327 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 10 21 31 4.37717516329433 11.8079321570819 -7.43075699378758 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.0101333006025569 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 16 20 36 7.00348026127093 11.2456496734113 -4.24216941214041 A:T:C T C 10 0.562282483670567 0.179465397865574 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 5 7 12 2.18858758164717 3.93597738569397 -1.7473898040468 A:C C A 10 0.562282483670567 0.386919319946478 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 13 5 18 5.69032771228263 2.81141241835283 2.87891529392979 T:C T C 10 0.562282483670567 0.235291245672474 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 100684737 C/G 1 3 6 9 1.3131525489883 3.3736949020234 -2.0605423530351 C:G C G 10 0.562282483670567 0.192457767275085 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100684700_100684754:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100684700_100684750:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 16 14 30 7.00348026127093 7.87195477138794 -0.86847451011701 T:G T G 10 0.562282483670567 0.854434079224977 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 52 51 103 22.7613108491305 28.6764066671989 -5.9150958180684 T:C T C 10 0.562282483670567 0.274591330967561 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 46 35 81 20.1350057511539 19.6798869284698 0.455118822684074 C:G G C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 104152790 G/C 1 105 120 225 45.9603392145905 67.473898040468 -21.5135588258776 C:G G C 10 0.562282483670567 0.00466507097602509 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 104152846 G/A 1 117 85 202 51.2129494105437 47.7940111119982 3.41893829854547 A:G G A 10 0.562282483670567 0.670650545446772 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 17 19 36 7.44119777760036 10.6833671897408 -3.24216941214041 A:G G A 10 0.562282483670567 0.314727918413896 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 24 13 37 10.5052203919064 7.30967228771737 3.19554810418902 A:G G A 10 0.562282483670567 0.323310835848676 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 11 12 23 4.81489267962376 6.7473898040468 -1.93249712442304 A:G A G 10 0.562282483670567 0.529299441913213 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 403 430 833 176.400159080762 241.781467978344 -65.3813088975823 A:G A G 10 0.562282483670567 5.46598982958543e-06 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 113013606 C/G 1 4 4 8 1.75087006531773 2.24912993468227 -0.498259869364536 C:G C G 10 0.562282483670567 0.736037290013816 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:G G T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 114820741 G/A 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 A:G G A 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114820708_114820751:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114820708_114820966:SUSD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 90 72 162 39.394576469649 40.4843388242808 -1.08976235463186 T:C T C 10 0.562282483670567 0.874414514042884 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 109 71 180 47.7112092799082 39.9220563406103 7.78915293929794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.260075753559792 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 115930746 G/A 1 18 19 37 7.87891529392979 10.6833671897408 -2.80445189581098 A:G G A 10 0.562282483670567 0.408261702249612 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115930740_115930836:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115930740_115930836:FKBP15 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 116132334 C/T 1 10 15 25 4.37717516329433 8.43423725505851 -4.05706209176418 T:C C T 10 0.562282483670567 0.110291001388382 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 46 34 80 20.1350057511539 19.1176044447993 1.01740130635464 A:G A G 10 0.562282483670567 0.910375739305217 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 4 17 21 1.75087006531773 9.55880222239964 -7.80793215708191 T:C C T 10 0.562282483670567 0.000666061918138748 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 8 12 20 3.50174013063546 6.7473898040468 -3.24564967341134 A:G G A 10 0.562282483670567 0.177047313526238 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 3 10 13 1.3131525489883 5.62282483670567 -4.30967228771737 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0225421185889244 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 125023704 T/C 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 T:C T C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000119446:ENST00000417201:exon_125023659_125023787:RBM18;ENSG00000119446:ENST00000431086:exon_125023659_125023787:RBM18;ENSG00000119446:ENST00000483428:exon_125023659_125023787:RBM18 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 126794713 C/T 1 4 10 14 1.75087006531773 5.62282483670567 -3.87195477138794 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0559207541418682 ENSG00000106689:ENST00000373615:exon_126794699_126795442:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000446480:exon_126794699_126795163:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000488674:exon_126794699_126794812:LHX2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 58 42 100 25.3876159471071 23.6158643141638 1.7717516329433 A:G A G 10 0.562282483670567 0.762934627123589 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 127915947 G/A 1 59 59 118 25.8253334634365 33.1746665365634 -7.3493330731269 A:G G A 10 0.562282483670567 0.193847689962123 ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127915812_127916021:PPP6C HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 62 57 119 27.1384860124248 32.0501015692223 -4.91161555679748 A:G A G 10 0.562282483670567 0.405783621305006 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 128692068 C/T 1 7 4 11 3.06402261430603 2.24912993468227 0.814892679623763 T:C C T 10 0.562282483670567 0.765394097683934 ENSG00000167081:ENST00000373492:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373489:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000342287:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373487:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373483:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000373482:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000447726:exon_128691934_128692124:PBX3;ENSG00000167081:ENST00000428092:exon_128691934_128692124:PBX3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 130674799 G/A 1 47 50 97 20.5727232674834 28.1141241835284 -7.541400916045 A:G G A 10 0.562282483670567 0.125890734631532 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130674666_130674959:ST6GALNAC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 88 79 167 38.5191414369901 44.4203162099748 -5.90117477298469 C:G G C 10 0.562282483670567 0.391017699092467 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 96 66 162 42.0208815676256 37.1106439222574 4.91023764536814 A:G A G 10 0.562282483670567 0.476266899292355 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 10 5 15 4.37717516329433 2.81141241835283 1.5657627449415 A:G A G 10 0.562282483670567 0.45019413187754 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 130941259 G/T 1 35 39 74 15.3201130715302 21.9290168631521 -6.60890379162196 T:G G T 10 0.562282483670567 0.128624524551683 ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 14 12 26 6.12804522861206 6.7473898040468 -0.619344575434742 A:G A G 10 0.562282483670567 0.844970193666619 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 9 13 22 3.9394576469649 7.30967228771737 -3.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.196535581912771 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 8 2 10 3.50174013063546 1.12456496734113 2.37717516329433 T:C C T 10 0.562282483670567 0.202319238074563 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 22 38 60 9.62978535924753 21.3667343794815 -11.736949020234 T:C C T 10 0.562282483670567 0.00259736402585405 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 29 18 47 12.6938079735536 10.1210847060702 2.57272326748335 A:G G A 10 0.562282483670567 0.467027611718781 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 17 12 29 7.44119777760036 6.7473898040468 0.693807973553557 T:C C T 10 0.562282483670567 0.853299084532438 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 21 12 33 9.19206784291809 6.7473898040468 2.44467803887129 A:G A G 10 0.562282483670567 0.483667815114976 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 4 6 10 1.75087006531773 3.3736949020234 -1.62282483670567 T:C T C 10 0.562282483670567 0.349958229793673 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 35 38 73 15.3201130715302 21.3667343794815 -6.04662130795139 A:C A C 10 0.562282483670567 0.158566114153362 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 39 51 90 17.0709831368479 28.6764066671989 -11.605423530351 T:C C T 10 0.562282483670567 0.0145456488574212 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 11 11 22 4.81489267962376 6.18510732037624 -1.37021464075247 A:G G A 10 0.562282483670567 0.668482180533371 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 33 34 67 14.4446780388713 19.1176044447993 -4.67292640592799 C:G C G 10 0.562282483670567 0.268839539604393 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 28 14 42 12.2560904572241 7.87195477138794 4.38413568583619 A:G G A 10 0.562282483670567 0.213386159913562 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 92 57 149 40.2700115023078 32.0501015692223 8.21990993308552 C:G C G 10 0.562282483670567 0.186843155082844 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 103 55 158 45.0849041819316 30.9255366018812 14.1593675800504 A:G A G 10 0.562282483670567 0.0246127489964668 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 22 19 41 9.62978535924753 10.6833671897408 -1.05358183049325 T:C C T 10 0.562282483670567 0.755062561063975 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 9 5 14 3.9394576469649 2.81141241835283 1.12804522861206 A:G G A 10 0.562282483670567 0.601211696983916 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 111 94 205 48.5866443125671 52.8545534650333 -4.26790915246623 T:C C T 10 0.562282483670567 0.573561089124895 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 18 13 31 7.87891529392979 7.30967228771737 0.569243006212424 A:G A G 10 0.562282483670567 0.858912903398618 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 T:C C T 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 3 5 8 1.3131525489883 2.81141241835283 -1.49825986936454 C:G C G 10 0.562282483670567 0.309639557427907 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 6 3 9 2.6263050979766 1.6868474510117 0.939457646964897 T:G G T 10 0.562282483670567 0.740032520907838 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 28 20 48 12.2560904572241 11.2456496734113 1.01044078381278 A:T:C C T 10 0.562282483670567 0.88454107504406 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 12 8 20 5.2526101959532 4.49825986936454 0.75435032658866 T:C C T 10 0.562282483670567 0.8240248669573 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 14 7 21 6.12804522861206 3.93597738569397 2.19206784291809 T:C C T 10 0.562282483670567 0.385167304836806 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 42 41 83 18.3841356858362 23.0535818304932 -4.66944614465706 T:C T C 10 0.562282483670567 0.320387013376731 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135202993 G/A 1 4 8 12 1.75087006531773 4.49825986936454 -2.7473898040468 A:G G A 10 0.562282483670567 0.146220527953362 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135203530 A/C 1 7 7 14 3.06402261430603 3.93597738569397 -0.871954771387938 A:C A C 10 0.562282483670567 0.788964593115497 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 4 5 9 1.75087006531773 2.81141241835283 -1.0605423530351 A:G G A 10 0.562282483670567 0.51740010865667 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 14 13 27 6.12804522861206 7.30967228771737 -1.18162705910531 C:G C G 10 0.562282483670567 0.700216367058198 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 39 47 86 17.0709831368479 26.4272767325166 -9.35629359566876 A:C C A 10 0.562282483670567 0.049921612644991 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135277301 A/G 1 39 33 72 17.0709831368479 18.5553219611287 -1.48433882428083 A:G A G 10 0.562282483670567 0.723394979153317 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 35 26 61 15.3201130715302 14.6193445754347 0.700768496095414 A:C C A 10 0.562282483670567 0.897894731268983 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 36 23 59 15.7578305878596 12.932497124423 2.82533346343655 A:G G A 10 0.562282483670567 0.512857110056373 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 28 19 47 12.2560904572241 10.6833671897408 1.57272326748335 A:G G A 10 0.562282483670567 0.662831017049048 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 136219448 C/G 1 74 37 111 32.391096208378 20.804451895811 11.5866443125671 C:G C G 10 0.562282483670567 0.0277297197048467 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219301_136219463:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219301_136219463:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136219301_136219463:SURF1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 31 29 60 13.5692430062124 16.3061920264464 -2.73694902023402 A:G A G 10 0.562282483670567 0.516254664654545 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 18 20 38 7.87891529392979 11.2456496734113 -3.36673437948154 A:G G A 10 0.562282483670567 0.326815079236887 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 10 7 17 4.37717516329433 3.93597738569397 0.441197777600361 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139270876 G/A 1 25 26 51 10.9429379082358 14.6193445754347 -3.67640666719892 A:G G A 10 0.562282483670567 0.324700436589807 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 19 20 39 8.31663281025923 11.2456496734113 -2.92901686315211 A:G A G 10 0.562282483670567 0.420034067992266 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139273225 G/A 1 13 12 25 5.69032771228263 6.7473898040468 -1.05706209176418 A:G G A 10 0.562282483670567 0.691089126205243 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 7 9 16 3.06402261430603 5.0605423530351 -1.99651973872907 T:C C T 10 0.562282483670567 0.326254636704828 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 7 6 13 3.06402261430603 3.3736949020234 -0.309672287717371 A:C A C 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 5 3 8 2.18858758164717 1.6868474510117 0.501740130635464 A:G A G 10 0.562282483670567 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 34 14 48 14.8823955552007 7.87195477138794 7.01044078381278 A:G G A 10 0.562282483670567 0.0424242769457817 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 49 40 89 21.4481583001422 22.4912993468227 -1.04314104668046 T:C C T 10 0.562282483670567 0.831539156084365 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 6 7 13 2.6263050979766 3.93597738569397 -1.30967228771737 A:G A G 10 0.562282483670567 0.578906059279765 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 7 5 12 3.06402261430603 2.81141241835283 0.252610195953196 A:G G A 10 0.562282483670567 1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 24 28 52 10.5052203919064 15.7439095427759 -5.23868915086948 A:G A G 10 0.562282483670567 0.162471675998494 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 27 26 53 11.8183729408947 14.6193445754347 -2.80097163454005 A:G G A 10 0.562282483670567 0.489495525668245 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 210 254 464 91.9206784291809 142.819750852324 -50.8990724231431 A:C:G G A 10 0.562282483670567 2.64081298500343e-06 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 140110801 C/T 1 12 11 23 5.2526101959532 6.18510732037624 -0.932497124423041 T:C C T 10 0.562282483670567 0.834117890061646 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140110724_140111461:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140110724_140111461:NDOR1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 140468710 T/A 1 6 5 11 2.6263050979766 2.81141241835283 -0.185107320376237 A:T T A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000148399:ENST00000479650:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000277540:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000475100:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000472113:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000485189:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000467768:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000477690:exon_140468660_140469821:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000470855:exon_140468659_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000481839:exon_140468667_140468832:WDR85 HGDP00711_parsed_pileup.txt . 9 140611140 G/A 1 9 6 15 3.9394576469649 3.3736949020234 0.565762744941495 A:G G A 10 0.562282483670567 0.802055941087737 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 10 3 13 4.37717516329433 1.6868474510117 2.69032771228263 T:C T C 10 0.562282483670567 0.167013412381977 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 14 5 19 6.12804522861206 2.81141241835283 3.31663281025923 T:C C T 10 0.562282483670567 0.165513983690861 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 15 12 27 6.5657627449415 6.7473898040468 -0.181627059105309 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 24 2 26 10.5052203919064 1.12456496734113 9.38065542456526 A:G G A 10 0.562282483670567 9.07492590151977e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 322257 G/A 1 6 4 10 2.6263050979766 2.24912993468227 0.37717516329433 A:G G A 10 0.562282483670567 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1497618 C/T 1 34 35 69 14.8823955552007 19.6798869284698 -4.79749137326912 T:C C T 10 0.562282483670567 0.275078878254609 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1225 1122 2347 536.203957503555 630.880946678376 -94.6769891748207 A:T:C:G G A 10 0.562282483670567 9.11249956472423e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 751 552 1303 328.725854763404 310.379930986153 18.3459237772512 T:C T C 10 0.562282483670567 0.31485623842752 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 123 107 230 53.8392545085203 60.1642257527507 -6.3249712442304 T:C C T 10 0.562282483670567 0.425294461370487 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 35 28 63 15.3201130715302 15.7439095427759 -0.423796471245721 T:C C T 10 0.562282483670567 1 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 10 18 28 4.37717516329433 10.1210847060702 -5.74390954277588 T:C T C 10 0.562282483670567 0.0352963746302327 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 24 16 40 10.5052203919064 8.99651973872907 1.50870065317732 T:C C T 10 0.562282483670567 0.750418436013368 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 27 24 51 11.8183729408947 13.4947796080936 -1.67640666719892 C:G C G 10 0.562282483670567 0.67326079911163 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00711_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 64 62 126 28.0139210450837 34.8615139875752 -6.84759294249144 T:C C T 10 0.562282483670567 0.243091802537414 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99