INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 985305 G/A 1 56 72 128 27.3327387130254 36.8579073689673 -9.52516865594188 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0937490601923208 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985283_985417:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985283_985417:AGRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 73 34 107 35.6301772509081 17.4051229242346 18.2250543266736 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000450099988845144 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 48 98 146 23.4280617540218 50.1677072522055 -26.7396454981837 A:T:G G T 10 0.511915380124546 9.4783200582639e-06 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 27 28 55 13.1782847366373 14.3336306434873 -1.15534590685003 T:C C T 10 0.511915380124546 0.78847119481376 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 32 27 59 15.6187078360145 13.8217152633627 1.79699257265179 T:C T C 10 0.511915380124546 0.696835382013571 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 2489167 G/T 1 144 152 296 70.2841852620654 77.811137778931 -7.52695251686561 T:G G T 10 0.511915380124546 0.383875234616084 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2489165_2489272:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2489165_2489272:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2489165_2489273:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489165_2489273:TNFRSF14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3410644 A/G 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000162591:ENST00000485002:exon_3410560_3410688:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000356575:exon_3410560_3410688:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000452816:exon_3410560_3410688:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000491842:exon_3410560_3410688:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000475790:exon_3410560_3410688:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000461795:exon_3410560_3410808:MEGF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3638722 C/T 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3644715 C/T 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3644693_3644781:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3644754 T/C 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3644693_3644781:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3649403 G/A 1 5 20 25 2.44042309937727 10.2383076024909 -7.79788450311365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00208268844221083 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 14 26 40 6.83318467825636 13.3097998832382 -6.47661520498184 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0563414942735046 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 3 9 12 1.46425385962636 4.60723842112091 -3.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0856105496561893 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3699273 G/A 1 51 50 101 24.8923156136482 25.5957690062273 -0.703453392579142 A:G G A 10 0.511915380124546 0.920907003700845 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3699225_3699327:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3699225_3699327:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000479239:exon_3699225_3699327:LRRC47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 32 37 69 15.6187078360145 18.9408690646082 -3.32216122859367 T:C T C 10 0.511915380124546 0.470601544176724 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 3809528 C/T 1 13 14 27 6.3451000583809 7.16681532174364 -0.821715263362741 T:C C T 10 0.511915380124546 0.848118384669247 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3809447_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3809447_3809560:C1orf174 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 111 79 190 54.1773928061754 40.4413150298391 13.7360777763363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0499504370255613 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 3 8 11 1.46425385962636 4.09532304099637 -2.63106918137001 A:G A G 10 0.511915380124546 0.137545352473278 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 6 14 20 2.92850771925272 7.16681532174364 -4.23830760249092 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0728986200139047 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6313938 C/T 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6313778_6314207:GPR153 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6314822 T/C 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C T C 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6314610_6315074:GPR153 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 6653457 G/A 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 A:G G A 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6650784_6653718:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6650784_6655617:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6653253_6653718:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6653441_6653718:KLHL21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 9307033 G/A 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 9 3 12 4.39276157887909 1.53574614037364 2.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.147368325849718 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 9416151 G/A 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 A:G G A 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 22 16 38 10.73786163726 8.19064608199274 2.54721555526725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.422726468313301 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 10708142 A/G 1 14 14 28 6.83318467825636 7.16681532174364 -0.333630643487286 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 10709441 C/T 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10709340_10709494:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10709340_10709494:CASZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 20 17 37 9.76169239750908 8.70256146211728 1.0591309353918 T:C T C 10 0.511915380124546 0.745445580497077 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 10725498 G/A 1 1 8 9 0.488084619875454 4.09532304099637 -3.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0188251691270287 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000478728:exon_10725140_10725628:CASZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 307 288 595 149.841978301764 147.431629475869 2.41034882589514 T:G G T 10 0.511915380124546 0.86972912510514 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 81 82 163 39.5348542099118 41.9770611702128 -2.44220696030099 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754098737773241 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 51 49 100 24.8923156136482 25.0838536261028 -0.191538012454597 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 39 44 83 19.0353001751427 22.52427672548 -3.48897655033731 T:C C T 10 0.511915380124546 0.510288687956788 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 20 22 42 9.76169239750908 11.26213836274 -1.50044596523093 T:C T C 10 0.511915380124546 0.647570325012878 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11205058 C/T 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11205025_11205102:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000495435:exon_11204705_11205082:MTOR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11721284 C/A 1 26 37 63 12.6902001167618 18.9408690646082 -6.2506689478464 A:C C A 10 0.511915380124546 0.130552049430746 ENSG00000132879:ENST00000251546:exon_11721187_11722346:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376770:exon_11721187_11723384:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376768:exon_11721187_11721448:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000251547:exon_11721187_11723383:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376762:exon_11721187_11722348:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376760:exon_11721187_11721406:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000475435:exon_11721187_11721365:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000471895:exon_11721187_11721365:FBXO44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 30 33 63 14.6425385962636 16.89320754411 -2.25066894784639 A:G G A 10 0.511915380124546 0.615185788090377 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 23 30 53 11.2259462571354 15.3574614037364 -4.13151514660094 T:C C T 10 0.511915380124546 0.273895215207071 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 29 24 53 14.1544539763882 12.2859691229891 1.86848485339906 A:G G A 10 0.511915380124546 0.680829972632713 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 20 24 44 9.76169239750908 12.2859691229891 -2.52427672548002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.455661101693158 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 61 61 122 29.7731618124027 31.2268381875973 -1.4536763751946 A:G A G 10 0.511915380124546 0.85636867891915 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 44 28 72 21.47572327452 14.3336306434873 7.14209263103269 A:G A G 10 0.511915380124546 0.099404924293358 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 15541607 T/C 1 7 17 24 3.41659233912818 8.70256146211728 -5.2859691229891 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0397042364687207 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000451326:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15541391_15541927:TMEM51 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 249 241 490 121.533070348988 123.371606610016 -1.83853626102751 T:C C T 10 0.511915380124546 0.892193110256183 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 31 23 54 15.1306232161391 11.7740537428646 3.35656947327452 C:G G C 10 0.511915380124546 0.414742154680308 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 12 14 26 5.85701543850545 7.16681532174364 -1.30979988323819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.696332422692757 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 19201956 A/G 1 17 12 29 8.29743853788272 6.14298456149455 2.15445397638817 A:G A G 10 0.511915380124546 0.461979597239853 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 19202917 T/C 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 19202926 T/C 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 20020994 C/T 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:C A C 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 21573722 G/A 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000528294:exon_21573714_21573856:ECE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 22149935 T/C 1 6 15 21 2.92850771925272 7.67873070186819 -4.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0482423624209579 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22149794_22149981:HSPG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 23418153 C/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:G G T 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 16 6 22 7.80935391800726 3.07149228074728 4.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0539349281471928 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 20 18 38 9.76169239750908 9.21447684224183 0.547215555267252 A:G G A 10 0.511915380124546 0.872795071629403 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 26872346 C/T 1 15 15 30 7.32126929813181 7.67873070186819 -0.357461403736378 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26872333_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530607:exon_26872336_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26872343_26872526:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26872343_26872526:RPS6KA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 26897990 C/T 1 125 77 202 61.0105774844318 39.41748426959 21.5930932148417 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00242752534786557 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26897940_26898101:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26897940_26897999:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530305:exon_26897720_26898101:RPS6KA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 26900620 C/G 1 150 202 352 73.2126929813181 103.406906785158 -30.1942138038402 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00135567042228319 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26900570_26900688:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000438977:exon_26900570_26900688:RPS6KA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 22 30 52 10.73786163726 15.3574614037364 -4.61959976647639 T:C T C 10 0.511915380124546 0.213943248938703 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 27876482 C/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 28060574 A/G 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000009780:ENST00000373954:exon_28060542_28060694:FAM76A;ENSG00000009780:ENST00000373948:exon_28060542_28060694:FAM76A;ENSG00000009780:ENST00000530324:exon_28060542_28060694:FAM76A;ENSG00000009780:ENST00000234549:exon_28060542_28060694:FAM76A;ENSG00000009780:ENST00000373949:exon_28060542_28060694:FAM76A;ENSG00000009780:ENST00000010299:exon_28060542_28060694:FAM76A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 232 169 401 113.235631811105 86.5136992410483 26.7219325700571 T:G T G 10 0.511915380124546 0.00805250617162343 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 29 25 54 14.1544539763882 12.7978845031136 1.35656947327452 T:C T C 10 0.511915380124546 0.785926514873607 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 26 20 46 12.6902001167618 10.2383076024909 2.45189251427088 A:G A G 10 0.511915380124546 0.555781106582879 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 1513 1552 3065 738.472029871562 794.492669953295 -56.0206400817334 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.0430249003246362 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 1505 1388 2893 734.567352912558 710.53854761287 24.0288052996885 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.372113492523504 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 22 20 42 10.73786163726 10.2383076024909 0.499554034769069 A:C:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 32672908 T/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:G T G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 32696628 A/C 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 A:C A C 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000084623:ENST00000474371:exon_32696528_32696655:EIF3I HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 90 82 172 43.9276157887909 41.9770611702128 1.9505546185781 A:C A C 10 0.511915380124546 0.81910428441355 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 35864571 A/G 1 8 17 25 3.90467695900363 8.70256146211728 -4.79788450311365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.070577886159909 ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 35921764 G/C 1 46 34 80 22.4518925142709 17.4051229242346 5.04676959003632 C:G G C 10 0.511915380124546 0.265822679553239 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35921614_35921842:KIAA0319L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 36068863 T/C 1 220 172 392 107.3786163726 88.0494453814219 19.329170991178 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0547748986767330 ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 36556867 C/T 1 30 29 59 14.6425385962636 14.8455460236118 -0.203007427348211 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36556845_36556941:ADPRHL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 131 122 253 63.9390852036845 62.4536763751946 1.48540882848987 T:C C T 10 0.511915380124546 0.899943251410693 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 67 66 133 32.7016695316554 33.78641508822 -1.08474555656461 T:C C T 10 0.511915380124546 0.862696227164457 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 52 43 95 25.3804002335236 22.0123613453555 3.36803888816813 T:G G T 10 0.511915380124546 0.538450474032565 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 23 20 43 11.2259462571354 10.2383076024909 0.987638654644522 A:G A G 10 0.511915380124546 0.878997691457703 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 40 45 85 19.5233847950182 23.0361921056046 -3.51280731058641 T:C T C 10 0.511915380124546 0.450186166913304 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 37 49 86 18.0591309353918 25.0838536261028 -7.02472269071095 T:C C T 10 0.511915380124546 0.132549638249441 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 39801815 A/C 0 0 8 8 0 4.09532304099637 -4.09532304099637 C A C 10 0.511915380124546 0.00322077941548718 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 39835817 A/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39835702_39835858:MACF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 17 30 47 8.29743853788272 15.3574614037364 -7.06002286585366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0416549550374928 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 23 40 63 11.2259462571354 20.4766152049818 -9.2506689478464 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0228298901094891 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 22 27 49 10.73786163726 13.8217152633627 -3.08385362610275 A:T A T 10 0.511915380124546 0.394641992151905 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 40737589 T/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C T C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40737566_40737707:ZMPSTE24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 40771432 C/T 1 21 18 39 10.2497770173845 9.21447684224183 1.03530017514271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.751950389677339 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40771387_40771440:COL9A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 40773150 G/A 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 29 16 45 14.1544539763882 8.19064608199274 5.96380789439543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0999028766467087 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 42050366 C/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 20 24 44 9.76169239750908 12.2859691229891 -2.52427672548002 T:C T C 10 0.511915380124546 0.455661101693158 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 26 33 59 12.6902001167618 16.89320754411 -4.20300742734821 T:C C T 10 0.511915380124546 0.298822390520362 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 19 19 38 9.27360777763363 9.72639222236637 -0.452784444732746 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 32 27 59 15.6187078360145 13.8217152633627 1.79699257265179 A:G G A 10 0.511915380124546 0.696835382013571 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45226317 C/T 1 48 45 93 23.4280617540218 23.0361921056046 0.391869648417227 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45226264_45226374:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45226264_45226374:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45226264_45226374:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45226264_45226374:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000423289:exon_45226264_45226374:KIF2C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 43 44 87 20.9876386546445 22.52427672548 -1.5366380708355 T:C C T 10 0.511915380124546 0.749006502677182 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 32 50 82 15.6187078360145 25.5957690062273 -9.97706117021277 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0351919445731186 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 59 41 100 28.7969925726518 20.9885305851064 7.8084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.133394177755201 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 22 18 40 10.73786163726 9.21447684224183 1.52338479501816 C:G C G 10 0.511915380124546 0.639673744429068 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45808113 C/T 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808056_45808315:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000477731:exon_45808056_45808315:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45808056_45808315:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808056_45808315:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000460057:exon_45808056_45808315:TOE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 A:G G A 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 13 16 29 6.3451000583809 8.19064608199274 -1.84554602361183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.57869742206028 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 125 90 215 61.0105774844318 46.0723842112091 14.9381932732226 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.0476438655899296 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 119 87 206 58.082069765179 44.5366380708355 13.5454316943435 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0601209665739385 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46086077 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000159588:ENST00000372044:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000482416:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000491755:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000421127:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000343901:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000446027:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000528266:exon_46085783_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000445048:exon_46085895_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000479529:exon_46086025_46086105:CCDC17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 99 71 170 48.3203773676699 36.3459919888428 11.9743853788272 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.0773379486909956 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 127 112 239 61.9867467241827 57.3345225739491 4.65222415023352 T:C T C 10 0.511915380124546 0.560857909024643 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46159001 G/A 1 94 106 200 45.8799542682927 54.2630302932019 -8.38307602490919 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.257766429544956 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46493460 T/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:G T G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46493403_46493535:MAST2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 13 16 29 6.3451000583809 8.19064608199274 -1.84554602361183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57869742206028 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 24 29 53 11.7140308770109 14.8455460236118 -3.13151514660094 A:G A G 10 0.511915380124546 0.412228942761961 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 28 39 67 13.6663693565127 19.9646998248573 -6.29833046834458 C:G G C 10 0.511915380124546 0.142426408062617 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 A:T A T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 19 14 33 9.27360777763363 7.16681532174364 2.10679245588998 T:C C T 10 0.511915380124546 0.490949258794062 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 70 49 119 34.1659233912818 25.0838536261028 9.08206976517903 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0994266064811342 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 25 35 60 12.2021154968864 17.9170383043591 -5.71492280747276 A:G A G 10 0.511915380124546 0.155975148308068 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 40 51 91 19.5233847950182 26.1076843863518 -6.58429959133369 A:G A G 10 0.511915380124546 0.174095678180076 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 51439777 C/T 1 49 85 134 23.9161463738972 43.5128073105864 -19.5966609366892 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000718264716521082 ENSG00000123080:ENST00000262662:exon_51439565_51440305:CDKN2C;ENSG00000123080:ENST00000396148:exon_51439565_51440305:CDKN2C;ENSG00000123080:ENST00000371761:exon_51439565_51440230:CDKN2C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 54 48 102 26.3565694732745 24.5719382459782 1.78463122729631 A:G A G 10 0.511915380124546 0.766767109365789 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 52991344 T/C 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C T C 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52991235_52991602:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 T:C C T 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 53676401 T/G 1 26 39 65 12.6902001167618 19.9646998248573 -7.27449970809549 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0820766477322011 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 124 111 235 60.5224928645563 56.8226071938246 3.6998856707317 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.64820662402254 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 260 213 473 126.902001167618 109.037975966528 17.8640252010898 C:G C G 10 0.511915380124546 0.107379916361956 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 106 102 208 51.7369697067981 52.2153687727037 -0.478399065905563 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 55188382 C/T 1 22 15 37 10.73786163726 7.67873070186819 3.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.329099236347658 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 55541174 A/G 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55541130_55541196:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55541130_55541196:USP24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 63991267 T/C 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000203965:ENST00000480886:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63991243_63991430:EFCAB7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 88 83 171 42.95144654904 42.4889765503373 0.462469998702645 A:T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 36 34 70 17.5710463155163 17.4051229242346 0.165923391281783 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 67845727 G/C 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 C:G G C 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67845669_67845806:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67845669_67845806:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000465396:exon_67845611_67845806:IL12RB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 67852335 G/A 1 9 18 27 4.39276157887909 9.21447684224183 -4.82171526336274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0819882016777053 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67852262_67852352:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67852262_67852352:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000465396:exon_67852262_67852352:IL12RB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 148 105 253 72.2365237415672 53.7511149130773 18.4854088284899 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0233876228808099 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 97 57 154 47.344208127919 29.1791766670991 18.1650314608199 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00361551483288073 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 69 71 140 33.6778387714063 36.3459919888428 -2.66815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 0.673119265964269 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 76257892 A/T 1 64 50 114 31.2374156720291 25.5957690062273 5.64164666580176 A:T A T 10 0.511915380124546 0.303874440064406 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000319942:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000370824:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000485459:exon_76257866_76257939:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000470201:exon_76257866_76257971:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000471759:exon_76257866_76257991:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000491266:exon_76257866_76257987:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76257866_76257935:RABGGTB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 78098050 C/T 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 78178961 G/T 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 T:G G T 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78178885_78178966:USP33;ENSG00000077254:ENST00000472462:exon_78178885_78178966:USP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 11 24 35 5.36893081862999 12.2859691229891 -6.91703830435911 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0265599492399723 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 78201745 G/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:G G T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000524536:exon_78201741_78201843:USP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 1 335 218 553 163.508347658277 111.597552867151 51.9107947911261 A:G G A 10 0.511915380124546 1.11584782012749e-05 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 152 274 426 74.188862221069 140.264814154126 -66.0759519330566 A:G G A 10 0.511915380124546 1.5621096670717e-10 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 151 157 308 73.7007776011936 80.3707146795537 -6.66993707836015 T:C C T 10 0.511915380124546 0.45907531825967 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 91 65 156 44.4157004086663 33.2744997080955 11.1412007005708 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0782407808270191 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 85725301 T/G 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 T:G T G 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85725041_85725355:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85725041_85725325:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85725041_85725316:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85725041_85725316:C1orf52 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 85741921 G/C 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 C:G G C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 86848019 C/T 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394733:exon_86848009_86848041:ODF2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 89426919 C/T 1 34 29 63 16.5948770757654 14.8455460236118 1.74933105215361 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.706309227585209 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 40 25 65 19.5233847950182 12.7978845031136 6.72550029190451 C:G G C 10 0.511915380124546 0.106870538740414 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 T:G T G 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:G T G 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 97272456 A/G 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117569:ENST00000482253:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000236228:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000370198:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000370197:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000426398:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000476419:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000394184:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000394176:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000459735:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000476783:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000492905:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000462433:exon_97272367_97272514:PTBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 97915624 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000188641:ENST00000370192:exon_97915615_97915779:DPYD;ENSG00000188641:ENST00000394160:exon_97915615_97915779:DPYD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 100361925 G/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100361842_100361944:AGL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 49 27 76 23.9161463738972 13.8217152633627 10.0944311105345 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0216703504874258 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 41 49 90 20.0114694148936 25.0838536261028 -5.07238421120914 A:G G A 10 0.511915380124546 0.293546708995915 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 110882444 A/G 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 A:G A G 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 110950277 G/A 1 75 73 148 36.606346490659 37.3698227490919 -0.763476258432803 A:G G A 10 0.511915380124546 0.934550695355805 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110950208_110950290:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110949655_110950293:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110948940_110950316:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110950208_110950560:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110950208_110950564:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000531779:exon_110950208_110950286:HBXIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 985 718 1703 480.763350577322 367.555242929424 113.208107647898 T:C:G C T 10 0.511915380124546 4.11974534793416e-08 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 669 14 683 326.528610696679 7.16681532174364 319.361795374935 A:C:G C A 10 0.511915380124546 6.84102231332383e-171 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 111957688 T/C 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 112308895 A/C 1 31 24 55 15.1306232161391 12.2859691229891 2.84465409314997 A:C A C 10 0.511915380124546 0.500856148048463 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 25 13 38 12.2021154968864 6.6548999416191 5.54721555526725 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0760296549288303 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 26 11 37 12.6902001167618 5.63106918137001 7.0591309353918 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0213652829938614 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 21 30 51 10.2497770173845 15.3574614037364 -5.10768438635184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.163142513414971 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 32 29 61 15.6187078360145 14.8455460236118 0.773161812402696 A:G A G 10 0.511915380124546 0.898417233805026 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 67 54 121 32.7016695316554 27.6434305267255 5.05823900492994 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.364830804371698 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 86 77 163 41.975277309289 39.41748426959 2.55779303969901 T:C C T 10 0.511915380124546 0.696102760968977 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 96 84 180 46.8561235080436 43.0008919304619 3.85523157758173 A:T:C A T 10 0.511915380124546 0.601962695134214 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 30 26 56 14.6425385962636 13.3097998832382 1.33273871302543 C:G C G 10 0.511915380124546 0.789733716345488 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 11 1 12 5.36893081862999 0.511915380124546 4.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00651276076484706 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 C C 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:T T A 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 0 16 0 16 7.80935391800726 0 7.80935391800726 G G 10 0.511915380124546 3.26152668371144e-05 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 13 0 13 6.3451000583809 0 6.3451000583809 C C 10 0.511915380124546 0.000255011600098263 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 10 1 11 4.88084619875454 0.511915380124546 4.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0119631874808122 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 C C 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 73 73 0 37.3698227490919 -37.3698227490919 A G A 10 0.511915380124546 1.82030415294957e-23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 76 76 0 38.9055688894655 -38.9055688894655 C T C 10 0.511915380124546 2.11655387791869e-24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 62 62 0 31.7387535677219 -31.7387535677219 T G T 10 0.511915380124546 4.86068648355656e-20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 58 58 0 29.6910920472237 -29.6910920472237 A C A 10 0.511915380124546 8.56479788582633e-19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 96 0 96 46.8561235080436 0 46.8561235080436 G G 10 0.511915380124546 1.22312841120698e-28 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 79 79 0 40.4413150298391 -40.4413150298391 C T C 10 0.511915380124546 2.46101746835755e-25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 128 128 0 65.5251686559419 -65.5251686559419 T C T 10 0.511915380124546 1.34083615052229e-40 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 146714427 G/C 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 C:G G C 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000492728:exon_146714396_146714480:CHD1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 37 56 93 18.0591309353918 28.6672612869746 -10.6081303515828 T:C:G C G 10 0.511915380124546 0.0293996826398243 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 147091507 C/T 1 2 12 14 0.976169239750908 6.14298456149455 -5.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00625964766936787 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147090622_147092863:BCL9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 147091972 C/T 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 T:C C T 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147090622_147092863:BCL9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 A:G G A 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 147124310 T/G 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:G T G 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147124252_147124352:ACP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 200 104 304 97.6169239750908 53.2391995329528 44.377724442138 A:T:C:G G T 10 0.511915380124546 3.70488783611554e-07 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151215011 A/G 1 55 35 90 26.84465409315 17.9170383043591 8.92761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0724998095336558 ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151214914_151215043:PIP5K1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151315531 G/T 1 54 41 95 26.3565694732745 20.9885305851064 5.36803888816813 T:G G T 10 0.511915380124546 0.304945142174659 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 197 127 324 96.1526701154644 65.0132532758173 31.1394168396471 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.000554580518333436 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 510 422 932 248.923156136482 216.028290412558 32.8948657239232 T:C T C 10 0.511915380124546 0.033140189156939 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151378487 T/C 1 25 30 55 12.2021154968864 15.3574614037364 -3.15534590685003 T:C T C 10 0.511915380124546 0.420507286079933 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151501841 C/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 C:G C G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000143375:ENST00000271636:exon_151501826_151502035:CGN;ENSG00000143375:ENST00000464886:exon_151501826_151501868:CGN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 84 80 164 40.9991080695381 40.9532304099637 0.0458776595744581 A:T:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 51 69 120 24.8923156136482 35.3221612285937 -10.4298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0673863542450751 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 40 66 106 19.5233847950182 33.78641508822 -14.2630302932019 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00631467223182806 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 59 64 123 28.7969925726518 32.7625843279709 -3.96559175531915 A:G A G 10 0.511915380124546 0.527987657377445 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 43 60 103 20.9876386546445 30.7149228074728 -9.72728415282823 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0609691403231932 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 154316434 C/T 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154316369_154316533:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154316369_154316533:ATP8B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 154401679 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160712:ENST00000368485:exon_154401672_154401920:IL6R;ENSG00000160712:ENST00000344086:exon_154401672_154401920:IL6R;ENSG00000160712:ENST00000512471:exon_154401672_154401920:IL6R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 77 83 160 37.58251573041 42.4889765503373 -4.90646081992735 T:C C T 10 0.511915380124546 0.476794758491393 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 35 45 80 17.0829616956409 23.0361921056046 -5.95323040996368 T:C C T 10 0.511915380124546 0.218404619978542 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 55 58 113 26.84465409315 29.6910920472237 -2.84643795407369 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.638317789413596 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 155106227 A/T 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169242:ENST00000368407:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000368406:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000469878:exon_155105979_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000474413:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000497282:exon_155106206_155106256:EFNA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 155221353 C/G 1 9 17 26 4.39276157887909 8.70256146211728 -4.30979988323819 C:G C G 10 0.511915380124546 0.115854635345725 ENSG00000160767:ENST00000350210:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368370:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000423573:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368366:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368368:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000361361:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000333966:exon_155221304_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000323361:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000491082:exon_155221293_155221392:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000497941:exon_155221293_155221859:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000472550:exon_155221293_155221392:FAM189B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 20 26 46 9.76169239750908 13.3097998832382 -3.54810748572912 T:C T C 10 0.511915380124546 0.305977945926489 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 0 212 0 212 103.473939413596 0 103.473939413596 C C 10 0.511915380124546 2.25920694155565e-62 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156170093 G/A 1 29 15 44 14.1544539763882 7.67873070186819 6.47572327451998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0691444624523556 ENSG00000160785:ENST00000359511:exon_156169626_156170263:SLC25A44;ENSG00000160785:ENST00000469537:exon_156165996_156170263:SLC25A44;ENSG00000160785:ENST00000412949:exon_156170089_156170263:SLC25A44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 61 43 104 29.7731618124027 22.0123613453555 7.76080046704722 A:G A G 10 0.511915380124546 0.141293599415545 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156212567 C/A 1 9 2 11 4.39276157887909 1.02383076024909 3.36893081862999 A:C C A 10 0.511915380124546 0.066253572257908 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156212553_156212622:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156212553_156212622:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156212553_156212622:PMF1;ENSG00000242252:ENST00000368272:exon_156212553_156212622:BGLAP;ENSG00000242252:ENST00000471413:exon_156212553_156213080:BGLAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156222714 C/T 1 25 28 53 12.2021154968864 14.3336306434873 -2.13151514660093 T:C C T 10 0.511915380124546 0.584821430832287 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156222710_156222869:SMG5;ENSG00000198952:ENST00000420555:exon_156222710_156222735:SMG5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156508625 G/A 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156508601_156508825:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156508601_156508825:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000476565:exon_156508601_156508653:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000498755:exon_156508601_156509257:IQGAP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156561651 G/C 1 52 118 170 25.3804002335236 60.4060148546964 -35.0256146211728 C:G G C 10 0.511915380124546 7.96768389889942e-08 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156561555_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368233:exon_156561570_156561778:APOA1BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156563375 G/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000163382:ENST00000368233:exon_156563200_156563668:APOA1BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156563726 A/C 1 146 163 309 71.2603545018163 83.442206960301 -12.1818524584847 A:C A C 10 0.511915380124546 0.172206250840675 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156563813 G/A 1 69 71 140 33.6778387714063 36.3459919888428 -2.66815321743643 A:G G A 10 0.511915380124546 0.673119265964269 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156563852 C/T 1 79 62 141 38.5586849701609 31.7387535677219 6.81993140243902 T:C C T 10 0.511915380124546 0.273652871668937 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156565170 T/G 1 234 123 357 114.211801050856 62.9655917553192 51.2462092955371 A:T:G T G 10 0.511915380124546 5.45317922459161e-08 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156565218 C/T 1 227 136 363 110.795208711728 69.6204916969382 41.1747170147898 T:C C T 10 0.511915380124546 1.55258314663177e-05 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156568252 A/G 1 59 85 144 28.7969925726518 43.5128073105864 -14.7158147379346 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0154673573798838 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156568213_156568286:GPATCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156571243 G/C 1 14 18 32 6.83318467825636 9.21447684224183 -2.38129216398547 C:G G C 10 0.511915380124546 0.480315636502299 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156571201_156571282:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156571201_156571254:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156571201_156571263:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156571201_156571258:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000527691:exon_156571201_156571288:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000334588:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000525375:exon_156571201_156571271:GPATCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 11 11 0 5.63106918137001 -5.63106918137001 C:G A G 10 0.511915380124546 0.000374495281501398 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:C C A 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 157490886 C/T 1 4 14 18 1.95233847950182 7.16681532174364 -5.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0169810396326105 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157490807_157491082:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000461387:exon_157490807_157492584:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157490807_157491082:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157490807_157491082:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157490807_157491082:FCRL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 94 78 172 45.8799542682927 39.9293996497146 5.9505546185781 A:G A G 10 0.511915380124546 0.401567935156397 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 292 271 563 142.520709003633 138.729068013752 3.79164098988065 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.767987712679862 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 250 270 520 122.021154968864 138.217152633627 -16.1959976647639 A:G A G 10 0.511915380124546 0.160490382781237 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 163 194 357 79.557793039699 99.3115837441619 -19.7537907044629 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0388727225650602 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 153 172 325 74.6769468409445 88.0494453814219 -13.3724985404774 A:T T A 10 0.511915380124546 0.149050200488435 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 297 271 568 144.96113210301 138.729068013752 6.2320640892579 A:T:C A T 10 0.511915380124546 0.614641689415664 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 159175428 C/T 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000213088:ENST00000368122:exon_159175251_159176290:DARC;ENSG00000213088:ENST00000359381:exon_159175251_159176288:DARC;ENSG00000213088:ENST00000435307:exon_159175201_159175688:DARC;ENSG00000213088:ENST00000368121:exon_159175049_159176288:DARC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 159888645 C/T 1 1304 1269 2573 636.462344317592 649.620617378049 -13.1582730604567 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.608189119177656 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159887897_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159887897_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159888541_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159888567_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159888628_159888731:TAGLN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 25 23 48 12.2021154968864 11.7740537428646 0.428061754021794 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 20 22 42 9.76169239750908 11.26213836274 -1.50044596523093 A:G A G 10 0.511915380124546 0.647570325012878 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 48 33 81 23.4280617540218 16.89320754411 6.53485420991178 A:G A G 10 0.511915380124546 0.150255900880512 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 43 47 90 20.9876386546445 24.0600228658537 -3.07238421120914 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.528794528822805 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 45 40 85 21.9638078943954 20.4766152049818 1.48719268941359 T:C C T 10 0.511915380124546 0.828377306143763 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 262 222 484 127.878170407369 113.645214387649 14.2329560197198 C:G G C 10 0.511915380124546 0.203076907973715 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161020997 C/T 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.550107784844309 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161068836 A/C 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:C A C 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000444550:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000471613:exon_161068456_161069208:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392191:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000494418:exon_161068456_161068852:KLHDC9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 138 103 241 67.3556775428127 52.7272841528282 14.6283933899844 T:C C T 10 0.511915380124546 0.061751588510224 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 36 25 61 17.5710463155163 12.7978845031136 4.7731618124027 T:C C T 10 0.511915380124546 0.249694569864454 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C C T 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161748106 C/T 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 C:G G C 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 14 27 41 6.83318467825636 13.8217152633627 -6.98853058510638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0409428085739763 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 56 51 107 27.3327387130254 26.1076843863518 1.22505432667358 A:G A G 10 0.511915380124546 0.846990013714389 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 162762484 C/T 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000132196:ENST00000485405:exon_162762449_162762652:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000463037:exon_162762355_162762652:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000367915:exon_162762449_162762842:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000466176:exon_162762449_162762652:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000367917:exon_162762449_162762652:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000254521:exon_162762449_162762652:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000367913:exon_162762449_162762652:HSD17B7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 165623516 C/T 1 40 76 116 19.5233847950182 38.9055688894655 -19.3821840944473 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000373858809756536 ENSG00000143198:ENST00000367889:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000367888:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000495447:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000367885:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000404549:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000367884:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000367883:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000367886:exon_165623516_165623588:MGST3;ENSG00000143198:ENST00000494074:exon_165623070_165623588:MGST3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 53 60 113 25.8684848533991 30.7149228074728 -4.84643795407369 T:C T C 10 0.511915380124546 0.397332615941078 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 191 226 417 93.2241623962117 115.692875908147 -22.4687135119357 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0310162821502992 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 T:G T G 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 33 22 55 16.10679245589 11.26213836274 4.84465409314997 T:C T C 10 0.511915380124546 0.22490313913956 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 20 12 32 9.76169239750908 6.14298456149455 3.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.219498632603626 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 81 73 154 39.5348542099118 37.3698227490919 2.16503146081993 A:C A C 10 0.511915380124546 0.747632396235306 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 171560711 T/C 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 40 47 87 19.5233847950182 24.0600228658537 -4.5366380708355 A:G G A 10 0.511915380124546 0.336787670730825 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 39 39 78 19.0353001751427 19.9646998248573 -0.929399649714583 T:C T C 10 0.511915380124546 0.909928606327392 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 154 150 304 75.1650314608199 76.7873070186819 -1.62227555786198 T:C C T 10 0.511915380124546 0.863505511789077 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 179051508 C/T 1 70 63 133 34.1659233912818 32.2506689478464 1.91525444343539 T:C C T 10 0.511915380124546 0.794850444616197 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000472001:exon_179051316_179051522:TOR3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 179989742 G/C 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 C:G G C 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000439289:exon_179989084_179989970:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_179989650_179990144:CEP350 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 180010874 A/G 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000418229:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490047:exon_180010797_180010937:CEP350 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 180065051 A/G 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 A:G A G 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180064658_180065065:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180064658_180065065:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180064658_180065065:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180064658_180065065:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180064658_180065065:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000496440:exon_180064658_180065065:CEP350 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 A:C A C 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 198201732 A/C 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 A:C A C 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000151414:ENST00000367385:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000442588:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000391974:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000367383:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000417895:exon_198201683_198201767:NEK7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 198671653 A/G 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 A:G A G 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000391970:exon_198671516_198671659:PTPRC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 3 8 11 1.46425385962636 4.09532304099637 -2.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.137545352473278 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C T C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 23 35 58 11.2259462571354 17.9170383043591 -6.69109204722367 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0879069554994606 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 33 34 67 16.10679245589 17.4051229242346 -1.29833046834458 T:C T C 10 0.511915380124546 0.80734200277502 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 50 65 115 24.4042309937727 33.2744997080955 -8.87026871432279 A:G G A 10 0.511915380124546 0.112512218553027 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 88 73 161 42.95144654904 37.3698227490919 5.5816237999481 A:G G A 10 0.511915380124546 0.386988077832475 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 18 21 39 8.78552315775817 10.7502229826155 -1.96469982485729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.631453985165305 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202705455 G/C 1 17 6 23 8.29743853788272 3.07149228074728 5.22594625713544 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0358534318342095 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202705341_202705520:KDM5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202715284 G/A 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000498276:exon_202715270_202715723:KDM5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202733238 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202733177_202733273:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202733177_202733273:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202733177_202733273:KDM5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 11 25 36 5.36893081862999 12.7978845031136 -7.42895368448365 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0183535276441544 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 89 93 182 43.4395311689154 47.6081303515828 -4.16859918266736 A:C C A 10 0.511915380124546 0.553635361934019 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204380483 C/G 1 20 20 40 9.76169239750908 10.2383076024909 -0.47661520498184 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204396830 G/A 1 14 11 25 6.83318467825636 5.63106918137001 1.20211549688635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.692143728741491 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204396776_204396882:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204399061 A/G 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204399049_204399166:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204399064 G/A 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204399049_204399166:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204402500 C/T 1 16 5 21 7.80935391800726 2.55957690062273 5.24977701738453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0274871246986775 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204402444_204402553:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000391949:exon_204402444_204402553:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204408135 G/A 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 A:G G A 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204408063_204408199:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204425028 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204424984_204425179:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000496872:exon_204424984_204425419:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000438854:exon_204424984_204425179:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204424984_204425179:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 204438643 G/T 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:G G T 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000415899:exon_204438538_204439014:PIK3C2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 16 28 44 7.80935391800726 14.3336306434873 -6.52427672548002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0511252870213209 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 206651107 G/A 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206651092_206651202:IKBKE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 9 15 24 4.39276157887909 7.67873070186819 -3.2859691229891 T:C C T 10 0.511915380124546 0.221464885927299 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 209791929 G/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:G G T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000196878:ENST00000391911:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000451182:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000356082:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000367030:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000455193:exon_209791797_209792143:LAMB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 209797198 A/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000196878:ENST00000391911:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000451182:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000356082:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000367030:exon_209797185_209797345:LAMB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 99 68 167 48.3203773676699 34.8102458484691 13.5101315192008 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0368382965377507 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 C:G C G 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 25 34 59 12.2021154968864 17.4051229242346 -5.20300742734821 T:C T C 10 0.511915380124546 0.193684021931843 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 22 11 33 10.73786163726 5.63106918137001 5.10679245588998 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0829590546178677 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 23 15 38 11.2259462571354 7.67873070186819 3.54721555526725 A:G A G 10 0.511915380124546 0.261006704009008 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 134 152 286 65.4033390633108 77.811137778931 -12.4077987156201 T:C T C 10 0.511915380124546 0.155637991016768 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 42 43 85 20.4995540347691 22.0123613453555 -1.51280731058641 T:C C T 10 0.511915380124546 0.74632913982455 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 15 12 27 7.32126929813181 6.14298456149455 1.17828473663726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.703307184687828 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 213124871 G/A 0 24 0 24 11.7140308770109 0 11.7140308770109 G G 10 0.511915380124546 1.38305855228144e-07 ENSG00000143494:ENST00000427709:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366965:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000493155:exon_213124870_213125160:VASH2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 213414543 A/G 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 39 42 81 19.0353001751427 21.5004459652309 -2.46514579008822 T:G T G 10 0.511915380124546 0.656904857747167 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G A G 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 18 6 24 8.78552315775817 3.07149228074728 5.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0235602438707838 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 A:G G A 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 A:G G A 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 19 17 36 9.27360777763363 8.70256146211728 0.571046315516346 T:C C T 10 0.511915380124546 0.86928286566066 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214816142 T/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 9 18 27 4.39276157887909 9.21447684224183 -4.82171526336274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0819882016777053 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 14 16 30 6.83318467825636 8.19064608199274 -1.35746140373638 A:G A G 10 0.511915380124546 0.715918489675599 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 20 17 37 9.76169239750908 8.70256146211728 1.0591309353918 A:G G A 10 0.511915380124546 0.745445580497077 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 20 17 37 9.76169239750908 8.70256146211728 1.0591309353918 A:T T A 10 0.511915380124546 0.745445580497077 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 10 19 29 4.88084619875454 9.72639222236637 -4.84554602361183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0934075833942564 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 23 19 42 11.2259462571354 9.72639222236637 1.49955403476907 A:C A C 10 0.511915380124546 0.757992065227439 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 57 54 111 27.8208233329009 27.6434305267255 0.177392806175398 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 33 50 83 16.10679245589 25.5957690062273 -9.48897655033731 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0474616617650519 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 54 33 87 26.3565694732745 16.89320754411 9.4633619291645 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0529406249136798 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 28 24 52 13.6663693565127 12.2859691229891 1.38040023352361 A:G A G 10 0.511915380124546 0.781913982900238 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 25 33 58 12.2021154968864 16.89320754411 -4.69109204722366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.238390327029988 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 30 41 71 14.6425385962636 20.9885305851064 -6.34599198884276 T:C T C 10 0.511915380124546 0.154056242928942 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 214837147 G/T 1 56 46 102 27.3327387130254 23.5481074857291 3.78463122729631 T:G G T 10 0.511915380124546 0.488741654560227 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 47 45 92 22.9399771341463 23.0361921056046 -0.0962149714582274 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 30 38 68 14.6425385962636 19.4527844447327 -4.81024584846912 T:C T C 10 0.511915380124546 0.275321598040182 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 36 57 93 17.5710463155163 29.1791766670991 -11.6081303515828 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0169668971727573 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 4 12 16 1.95233847950182 6.14298456149455 -4.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0446852968177391 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 222825587 T/C 1 19 11 30 9.27360777763363 5.63106918137001 3.64253859626362 T:C T C 10 0.511915380124546 0.20432458370558 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222825570_222825674:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222825570_222825674:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222825570_222825674:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000495210:exon_222825570_222825625:MIA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 223933094 C/T 0 9 0 9 4.39276157887909 0 4.39276157887909 C C 10 0.511915380124546 0.00398627045804083 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 225607100 G/A 1 28 18 46 13.6663693565127 9.21447684224183 4.45189251427089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.237797035444175 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226027659 C/T 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 T:C C T 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226027530_226027738:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226027530_226027738:EPHX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 8 15 23 3.90467695900363 7.67873070186819 -3.77405374286456 C:G G C 10 0.511915380124546 0.144409879379289 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226034774 C/T 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226041438 C/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226041330_226041492:TMEM63A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226046974 T/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 25 22 47 12.2021154968864 11.26213836274 0.939977134146341 A:T:C A C 10 0.511915380124546 0.884225865636392 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 21 16 37 10.2497770173845 8.19064608199274 2.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.515825881281712 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 227077809 C/T 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227077736_227077834:PSEN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 14 18 32 6.83318467825636 9.21447684224183 -2.38129216398547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.480315636502299 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 23 17 40 11.2259462571354 8.70256146211728 2.52338479501816 T:C T C 10 0.511915380124546 0.434838666804728 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:G A G 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 41 36 77 20.0114694148936 18.4289536844837 1.58251573040996 T:C T C 10 0.511915380124546 0.733834767462433 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 230810756 T/A 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 A:T T A 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230810744_230810870:COG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 20 33 53 9.76169239750908 16.89320754411 -7.13151514660094 A:G A G 10 0.511915380124546 0.054639145292576 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 A:T T A 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 231057247 A/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231057167_231057250:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231057167_231057250:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231057167_231057250:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000471302:exon_231057167_231057252:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000486879:exon_231057167_231057250:TTC13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 49 43 92 23.9161463738972 22.0123613453555 1.90378502854177 T:C C T 10 0.511915380124546 0.754643445286097 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 53 40 93 25.8684848533991 20.4766152049818 5.39186964841722 A:G G A 10 0.511915380124546 0.299732375699827 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236175327 C/A 1 12 8 20 5.85701543850545 4.09532304099637 1.76169239750908 A:C C A 10 0.511915380124546 0.505895428449493 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 24 10 34 11.7140308770109 5.11915380124546 6.59487707576544 A:T T A 10 0.511915380124546 0.0256635112543971 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 15 11 26 7.32126929813181 5.63106918137001 1.69020011676181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.560130398277703 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 18 3 21 8.78552315775817 1.53574614037364 7.24977701738453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00158099344372474 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 18 2 20 8.78552315775817 1.02383076024909 7.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00043045841435021 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 18 3 21 8.78552315775817 1.53574614037364 7.24977701738453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00158099344372474 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 27 10 37 13.1782847366373 5.11915380124546 8.0591309353918 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00825827612031197 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 40 17 57 19.5233847950182 8.70256146211728 10.8208233329009 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00497748194568729 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 34 29 63 16.5948770757654 14.8455460236118 1.74933105215361 T:C T C 10 0.511915380124546 0.706309227585209 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 36 37 73 17.5710463155163 18.9408690646082 -1.36982274909186 T:C C T 10 0.511915380124546 0.815138312709073 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 57 47 104 27.8208233329009 24.0600228658537 3.76080046704722 T:C T C 10 0.511915380124546 0.493036330196061 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 47 46 93 22.9399771341463 23.5481074857291 -0.608130351582776 T:C T C 10 0.511915380124546 0.917715058066653 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 64 52 116 31.2374156720291 26.6195997664764 4.61781590555267 A:G A G 10 0.511915380124546 0.404573142491001 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 49 44 93 23.9161463738972 22.52427672548 1.39186964841723 A:G G A 10 0.511915380124546 0.835849595960669 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 36 36 72 17.5710463155163 18.4289536844837 -0.857907368967311 T:C T C 10 0.511915380124546 0.906311079702919 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 1 12 13 0.488084619875454 6.14298456149455 -5.6548999416191 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00147143006215042 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 1 8 9 0.488084619875454 4.09532304099637 -3.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0188251691270287 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 13 2 15 6.3451000583809 1.02383076024909 5.32126929813181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00762249507560099 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 237058729 C/T 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 14 13 27 6.83318467825636 6.6548999416191 0.178284736637259 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G G A 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 246755124 T/C 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 T:C T C 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP00712_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 18 16 34 8.78552315775817 8.19064608199274 0.594877075765437 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.86547169107651 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 95 85 180 46.3680388881681 43.5128073105864 2.85523157758173 A:G G A 10 0.511915380124546 0.709495613902743 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 1230968 C/T 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000185736:ENST00000381312:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381310:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381307:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000414764:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000474762:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000490172:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381305:exon_1230801_1230979:ADARB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 1421326 C/T 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000185736:ENST00000381312:exon_1421269_1421355:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381307:exon_1421269_1421356:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000414764:exon_1421269_1421357:ADARB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 167 93 260 81.5101315192008 47.6081303515828 33.9020011676181 T:C C T 10 0.511915380124546 2.93409019889929e-05 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3178804 G/A 1 282 226 508 137.639862804878 115.692875908147 21.9469868967307 A:G G A 10 0.511915380124546 0.056240297887705 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 88 102 190 42.95144654904 52.2153687727037 -9.26392222366373 T:C T C 10 0.511915380124546 0.191587202443711 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 77 69 146 37.58251573041 35.3221612285937 2.26035450181629 T:C C T 10 0.511915380124546 0.740884832965281 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 74 67 141 36.1182618707836 34.2983304683446 1.81993140243902 T:C T C 10 0.511915380124546 0.800697020669405 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 31 31 62 15.1306232161391 15.8693767838609 -0.738753567721851 T:C C T 10 0.511915380124546 0.89924655053157 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 43 18 61 20.9876386546445 9.21447684224183 11.7731618124027 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00293956533345804 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 46 43 89 22.4518925142709 22.0123613453555 0.439531168915408 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 22 15 37 10.73786163726 7.67873070186819 3.0591309353918 A:G A G 10 0.511915380124546 0.329099236347658 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5784151 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5784060_5784489:C10orf18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 520 427 947 253.804002335236 218.587867313181 35.216135022055 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0228571245649767 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5926034 T/C 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5929962 G/C 1 12 16 28 5.85701543850545 8.19064608199274 -2.33363064348729 C:G G C 10 0.511915380124546 0.450988108517662 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5929884_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5929810_5930030:ANKRD16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5978442 G/A 1 29 28 57 14.1544539763882 14.3336306434873 -0.179176667099119 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5978419_5978550:FBXO18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 58 87 145 28.3089079527763 44.5366380708355 -16.2277301180592 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00770969241003889 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 21 21 42 10.2497770173845 10.7502229826155 -0.500445965230931 T:G T G 10 0.511915380124546 0.87892642325315 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 6061407 T/C 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6061391_6061462:IL2RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 19 21 40 9.27360777763363 10.7502229826155 -1.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.75222996223045 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 A:G A G 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 11805339 C/T 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000422887:exon_11805223_11805350:ECHDC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 1 12 2 14 5.85701543850545 1.02383076024909 4.83318467825636 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0132808222441933 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 1 12 1 13 5.85701543850545 0.511915380124546 5.3451000583809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00352645269227696 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 56 40 96 27.3327387130254 20.4766152049818 6.85612350804359 A:G G A 10 0.511915380124546 0.184362835810693 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 78 66 144 38.0706003502854 33.78641508822 4.28418526206539 T:C T C 10 0.511915380124546 0.505304223746896 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 12228298 C/T 1 45 63 108 21.9638078943954 32.2506689478464 -10.286861053451 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0539265706106966 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378929:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378940:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12228228_12228331:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000444732:exon_12228228_12228331:NUDT5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 25 21 46 12.2021154968864 10.7502229826155 1.45189251427089 C:G C G 10 0.511915380124546 0.768437629457915 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 13230950 C/T 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13230881_13231080:MCM10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 34 26 60 16.5948770757654 13.3097998832382 3.28507719252724 A:G G A 10 0.511915380124546 0.439480699527162 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 24 47 71 11.7140308770109 24.0600228658537 -12.3459919888428 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00408768802109798 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 15145569 A/G 1 42 29 71 20.4995540347691 14.8455460236118 5.65400801115724 A:G A G 10 0.511915380124546 0.192793456342403 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 15146061 C/G 1 39 54 93 19.0353001751427 27.6434305267255 -8.60813035158277 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0782715999129412 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 15902303 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000148481:ENST00000277632:exon_15902205_15902519:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000477891:exon_15902205_15902497:FAM188A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 16556710 T/C 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.034961178942022 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 66 75 141 32.21358491178 38.393653509341 -6.18006859756098 A:G A G 10 0.511915380124546 0.312742102828669 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 C:G C G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27324405 G/A 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 A:G G A 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27323725_27324681:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27323725_27324681:ANKRD26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27458898 C/A 1 21 13 34 10.2497770173845 6.6548999416191 3.59487707576544 A:C C A 10 0.511915380124546 0.233980124238926 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 23 29 52 11.2259462571354 14.8455460236118 -3.61959976647639 C:G C G 10 0.511915380124546 0.334171385255209 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27499771 G/A 1 31 27 58 15.1306232161391 13.8217152633627 1.30890795277633 A:G G A 10 0.511915380124546 0.793352645663686 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27499804 T/C 1 29 24 53 14.1544539763882 12.2859691229891 1.86848485339906 T:C T C 10 0.511915380124546 0.680829972632713 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27499979 G/T 1 20 16 36 9.76169239750908 8.19064608199274 1.57104631551634 T:G G T 10 0.511915380124546 0.621326824164447 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27506961 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27506912_27507112:ACBD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 27508746 G/A 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27508652_27508786:ACBD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 15 12 27 7.32126929813181 6.14298456149455 1.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.703307184687828 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 163 222 385 79.557793039699 113.645214387649 -34.0874213479502 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.000517980800573689 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 32141460 T/C 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32141445_32141525:ARHGAP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 33200468 G/A 1 14 13 27 6.83318467825636 6.6548999416191 0.178284736637259 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000494395:exon_33200455_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33200376_33200598:ITGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 T:G G T 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 19 16 35 9.27360777763363 8.19064608199274 1.08296169564089 T:G T G 10 0.511915380124546 0.738417177093215 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 33 25 58 16.10679245589 12.7978845031136 3.30890795277634 T:C C T 10 0.511915380124546 0.431561936113505 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 38343959 T/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 31 26 57 15.1306232161391 13.3097998832382 1.82082333290088 T:C T C 10 0.511915380124546 0.691758908540314 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 46 60 106 22.4518925142709 30.7149228074728 -8.26303029320187 A:G A G 10 0.511915380124546 0.120038535776933 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 102 103 205 49.7846312272963 52.7272841528282 -2.94265292553192 A:G G A 10 0.511915380124546 0.726952788660697 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 131 127 258 63.9390852036845 65.0132532758173 -1.07416807213286 A:T T A 10 0.511915380124546 0.901041929945605 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 15 1 16 7.32126929813181 0.511915380124546 6.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000545996770024368 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 50678820 A/G 1 3 11 14 1.46425385962636 5.63106918137001 -4.16681532174364 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0315678139197663 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 63851034 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000150347:ENST00000279873:exon_63850621_63856703:ARID5B;ENSG00000150347:ENST00000309334:exon_63850621_63852823:ARID5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 40 30 70 19.5233847950182 15.3574614037364 4.16592339128178 C:G C G 10 0.511915380124546 0.340513800637055 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 64974548 A/G 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G A G 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 70673289 C/T 1 25 22 47 12.2021154968864 11.26213836274 0.939977134146341 T:C C T 10 0.511915380124546 0.884225865636392 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70673147_70673332:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000460470:exon_70673183_70673332:DDX50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 12 16 28 5.85701543850545 8.19064608199274 -2.33363064348729 A:G G A 10 0.511915380124546 0.450988108517662 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 71880858 A/G 1 31 19 50 15.1306232161391 9.72639222236637 5.4042309937727 A:G A G 10 0.511915380124546 0.15666108931816 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71880848_71880967:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71880848_71880967:AIFM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 71905735 G/A 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 64 67 131 31.2374156720291 34.2983304683446 -3.06091479631552 T:C C T 10 0.511915380124546 0.601206159157653 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 73577267 G/A 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74114700 C/G 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 C:G C G 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000148719:ENST00000394903:exon_74114523_74114907:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000338820:exon_74114523_74114907:DNAJB12;ENSG00000148719:ENST00000444643:exon_74114523_74114988:DNAJB12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 17 25 42 8.29743853788272 12.7978845031136 -4.50044596523093 T:C T C 10 0.511915380124546 0.168974351058953 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 99 82 181 48.3203773676699 41.9770611702128 6.34331619745718 T:C T C 10 0.511915380124546 0.372472883640691 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 52 75 127 25.3804002335236 38.393653509341 -13.0132532758173 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0211444874414861 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 32 53 85 15.6187078360145 27.1315151466009 -11.5128073105864 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0164773128940527 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 43 52 95 20.9876386546445 26.6195997664764 -5.63196111183187 C:G C G 10 0.511915380124546 0.260137292309433 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 33 34 67 16.10679245589 17.4051229242346 -1.29833046834458 A:T T A 10 0.511915380124546 0.80734200277502 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 34 36 70 16.5948770757654 18.4289536844837 -1.83407660871822 T:C C T 10 0.511915380124546 0.720306971897038 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 123 142 265 60.0344082446808 72.6919839776855 -12.6575757330047 A:G A G 10 0.511915380124546 0.124663273718554 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75506674 T/C 1 34 38 72 16.5948770757654 19.4527844447327 -2.85790736896731 T:C T C 10 0.511915380124546 0.556072705521653 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000477008:exon_75506625_75506762:SEC24C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75527708 A/G 1 40 34 74 19.5233847950182 17.4051229242346 2.1182618707836 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.643520148093464 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75527595_75527765:SEC24C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 21 7 28 10.2497770173845 3.58340766087182 6.66636935651271 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0132277180436573 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 26 16 42 12.6902001167618 8.19064608199274 4.49955403476907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.216454730557326 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75559077 G/A 1 24 19 43 11.7140308770109 9.72639222236637 1.98763865464452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.647753721060461 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75566461 C/T 1 16 12 28 7.80935391800726 6.14298456149455 1.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.574667284257565 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75566415_75566569:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75566415_75566569:NDST2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75884157 G/T 1 35 26 61 17.0829616956409 13.3097998832382 3.77316181240269 T:G G T 10 0.511915380124546 0.370988174346448 ENSG00000185009:ENST00000425908:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000355264:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000372745:exon_75884138_75884282:AP3M1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 75888896 C/T 1 30 30 60 14.6425385962636 15.3574614037364 -0.714922807472757 T:C C T 10 0.511915380124546 0.897643286761043 ENSG00000185009:ENST00000425908:exon_75888866_75888999:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000355264:exon_75888866_75888999:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000372745:exon_75888866_75888999:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000480373:exon_75888636_75888999:AP3M1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 76788267 A/G 1 25 23 48 12.2021154968864 11.7740537428646 0.428061754021794 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 81056383 C/A 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 A:C C A 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81056228_81056410:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81056228_81056410:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000478357:exon_81053120_81056692:ZMIZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 153 145 298 74.6769468409445 74.2277301180592 0.449216722885296 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 31 26 57 15.1306232161391 13.3097998832382 1.82082333290088 T:C C T 10 0.511915380124546 0.691758908540314 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91162182 C/T 1 22 43 65 10.73786163726 22.0123613453555 -11.2744997080955 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0059992504359791 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 29 17 46 14.1544539763882 8.70256146211728 5.45189251427089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.139461620694362 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:T A T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 A:T A T 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 7 14 21 3.41659233912818 7.16681532174364 -3.75022298261546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.126764759202054 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 17 14 31 8.29743853788272 7.16681532174364 1.13062321613908 A:T A T 10 0.511915380124546 0.72247502509934 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 95720490 C/T 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 C C 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 95720501 T/C 0 11 0 11 5.36893081862999 0 5.36893081862999 T T 10 0.511915380124546 0.00100716923571172 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 23 20 43 11.2259462571354 10.2383076024909 0.987638654644522 T:G T G 10 0.511915380124546 0.878997691457703 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 12 23 35 5.85701543850545 11.7740537428646 -5.91703830435911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0614495653123259 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 96121503 G/T 1 24 39 63 11.7140308770109 19.9646998248573 -8.25066894784639 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0433303217134539 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000461562:exon_96121422_96121629:NOC3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 15 18 33 7.32126929813181 9.21447684224183 -1.89320754411002 A:T A T 10 0.511915380124546 0.602309440775946 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 97918320 A/G 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 97918915 A/C 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 97920062 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 98469693 C/T 1 24 13 37 11.7140308770109 6.6548999416191 5.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.102403599896536 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 98742750 A/C 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 52 62 114 25.3804002335236 31.7387535677219 -6.35835333419824 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.26098111755238 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 74 51 125 36.1182618707836 26.1076843863518 10.0105774844318 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0742375182168307 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 50 65 115 24.4042309937727 33.2744997080955 -8.87026871432279 A:G G A 10 0.511915380124546 0.112512218553027 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 13 17 30 6.3451000583809 8.70256146211728 -2.35746140373638 A:G A G 10 0.511915380124546 0.466232196027525 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 9 18 27 4.39276157887909 9.21447684224183 -4.82171526336274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0819882016777053 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 40 33 73 19.5233847950182 16.89320754411 2.63017725090814 A:G G A 10 0.511915380124546 0.560148238501715 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 22 43 65 10.73786163726 22.0123613453555 -11.2744997080955 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0059992504359791 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 35 33 68 17.0829616956409 16.89320754411 0.189754151530874 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 67 58 125 32.7016695316554 29.6910920472237 3.01057748443175 T:C C T 10 0.511915380124546 0.654803354394109 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 102295836 C/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 C:G C G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000166135:ENST00000299163:exon_102295616_102295892:HIF1AN;ENSG00000166135:ENST00000442724:exon_102295659_102295892:HIF1AN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 159 88 247 77.6054545601972 45.04855345096 32.5569011092371 T:C C T 10 0.511915380124546 3.25336919777043e-05 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 A:C C A 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 102762598 C/T 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102762462_102762703:LZTS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 33 22 55 16.10679245589 11.26213836274 4.84465409314997 A:G A G 10 0.511915380124546 0.22490313913956 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 104140350 G/A 1 46 49 95 22.4518925142709 25.0838536261028 -2.63196111183187 A:G G A 10 0.511915380124546 0.609050042994398 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 T:C T C 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 105372696 G/A 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 114200355 G/A 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000023041:ENST00000369405:exon_114200292_114200453:ZDHHC6;ENSG00000023041:ENST00000369404:exon_114200292_114200453:ZDHHC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 116602805 A/G 1 5 12 17 2.44042309937727 6.14298456149455 -3.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0898784303233661 ENSG00000151553:ENST00000369248:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000369250:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000392942:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000455766:exon_116602692_116602985:FAM160B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 C:G G C 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 121286832 C/T 1 195 194 389 95.1765008757135 99.3115837441619 -4.13508286844838 T:C C T 10 0.511915380124546 0.685184908152477 ENSG00000148908:ENST00000392865:exon_121286818_121286936:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369103:exon_121286818_121286936:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369101:exon_121286818_121286989:RGS10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 T:G T G 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 123596254 T/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C T C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123596233_123596332:ATE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 123673339 T/C 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C T C 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123673305_123673408:ATE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 A:G G A 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 124896963 C/T 1 47 35 82 22.9399771341463 17.9170383043591 5.02293882978723 T:C C T 10 0.511915380124546 0.271952053225747 ENSG00000188620:ENST00000357878:exon_124896574_124897247:HMX3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 27 23 50 13.1782847366373 11.7740537428646 1.4042309937727 T:C T C 10 0.511915380124546 0.777676813700698 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129871690 A/G 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000439034:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129871601_129871735:PTPRE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 219 233 452 106.890531752724 119.276283569019 -12.3857518162948 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.258819633738139 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 279 307 586 136.175608945252 157.158021698236 -20.9824127529839 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0901464708650139 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 163 135 298 79.557793039699 69.1085763168137 10.4492167228853 T:C C T 10 0.511915380124546 0.246463008220082 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 166 161 327 81.0220468993254 82.4183762000519 -1.39632930072652 A:T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.91193507482384 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 108 163 271 52.713138946549 83.442206960301 -30.729068013752 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000200352103320257 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 171 164 335 83.4624699987026 83.9541223404255 -0.491652341722897 A:G G A 10 0.511915380124546 0.956490950843786 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 121 104 225 59.0582390049299 53.2391995329528 5.81903947197716 T:C T C 10 0.511915380124546 0.4634497769204 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 101 98 199 49.2965466074209 50.1677072522055 -0.871160644784645 A:G A G 10 0.511915380124546 0.943502126526565 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 88 72 160 42.95144654904 36.8579073689673 6.09353918007265 T:C C T 10 0.511915380124546 0.343707774454471 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 88 58 146 42.95144654904 29.6910920472237 13.2603545018163 A:T:C T A 10 0.511915380124546 0.0311402215465910 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 57 56 113 27.8208233329009 28.6672612869746 -0.846437954073693 T:C C T 10 0.511915380124546 0.925112237522817 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134013861 G/C 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 C:G G C 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134013860_134014016:DPYSL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 23 4 27 11.2259462571354 2.04766152049818 9.17828473663726 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00034185342535233 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 21 3 24 10.2497770173845 1.53574614037364 8.7140308770109 C:G C G 10 0.511915380124546 0.000301877988273474 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 16 4 20 7.80935391800726 2.04766152049818 5.76169239750908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0122812042506155 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 T:G G T 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G A G 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134219045 C/T 0 11 0 11 5.36893081862999 0 5.36893081862999 C C 10 0.511915380124546 0.00100716923571172 ENSG00000171813:ENST00000305233:exon_134218130_134219793:PWWP2B;ENSG00000171813:ENST00000368609:exon_134218130_134219490:PWWP2B;ENSG00000171813:ENST00000412183:exon_134218130_134219777:PWWP2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 134459388 A/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368595:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000451873:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134459372_134459472:INPP5A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 168 186 354 81.9982161390763 95.2162607031655 -13.2180445640893 A:C C A 10 0.511915380124546 0.166980531784889 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 125 119 244 61.0105774844318 60.917930234821 0.0926472496107849 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135085302 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 52 68 120 25.3804002335236 34.8102458484691 -9.42984561494551 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0998761087100884 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 45 37 82 21.9638078943954 18.9408690646082 3.02293882978723 A:G G A 10 0.511915380124546 0.510161636144452 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135113056 C/T 1 48 36 84 23.4280617540218 18.4289536844837 4.99910806953814 T:C C T 10 0.511915380124546 0.325996173456812 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135184126 G/A 1 93 64 157 45.3918696484172 32.7625843279709 12.6292853204463 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0459857281815236 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 13 20 33 6.3451000583809 10.2383076024909 -3.89320754411002 C:G C G 10 0.511915380124546 0.222635773015784 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 20 20 40 9.76169239750908 10.2383076024909 -0.47661520498184 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 10 15 25 4.88084619875454 7.67873070186819 -2.79788450311365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.318697161637912 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 124 69 193 60.5224928645563 35.3221612285937 25.2003316359626 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000298525933317064 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 556521 C/G 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 C:G C G 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_556492_556588:C11orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 556857 G/C 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_556835_557097:C11orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 14 16 30 6.83318467825636 8.19064608199274 -1.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.715918489675599 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 20 16 36 9.76169239750908 8.19064608199274 1.57104631551634 A:G G A 10 0.511915380124546 0.621326824164447 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 24 18 42 11.7140308770109 9.21447684224183 2.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.537506839413637 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 273 255 528 133.247101225999 130.538421931759 2.70867929423974 T:C C T 10 0.511915380124546 0.827779360431149 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 31 16 47 15.1306232161391 8.19064608199274 6.93997713414634 A:G A G 10 0.511915380124546 0.056724205943952 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.754604246278714 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 822588 C/T 1 64 34 98 31.2374156720291 17.4051229242346 13.8322927477945 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00610175778813985 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000531923:exon_822016_822606:PNPLA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 63 75 138 30.7493310521536 38.393653509341 -7.64432245718735 C:G C G 10 0.511915380124546 0.202145924223263 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 26 58 84 12.6902001167618 29.6910920472237 -17.0008919304619 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000265477970942489 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 375 356 731 183.031732453295 182.241875324338 0.789857128956896 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.97049485798569 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 864473 G/A 1 17 21 38 8.29743853788272 10.7502229826155 -2.45278444473275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.516888244759979 ENSG00000214063:ENST00000397397:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397411:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000399778:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397396:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000421676:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397408:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525334:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397406:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409543:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525201:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397404:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000524895:exon_864437_864653:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000532375:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000346501:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000464987:exon_864437_865825:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409531:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000527644:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000468468:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000529566:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000494815:exon_863272_864511:TSPAN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 993817 G/A 1 46 64 110 22.4518925142709 32.7625843279709 -10.3106918137001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0561298914122631 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 545 475 1020 266.006117832122 243.159805559159 22.8463122729631 T:C C T 10 0.511915380124546 0.158702151892911 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 24 18 42 11.7140308770109 9.21447684224183 2.49955403476907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.537506839413637 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 2929552 A/G 1 22 10 32 10.73786163726 5.11915380124546 5.61870783601453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0521696794811529 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2929463_2929560:SLC22A18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 20 13 33 9.76169239750908 6.6548999416191 3.10679245588998 C:G G C 10 0.511915380124546 0.300741145060542 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 22 16 38 10.73786163726 8.19064608199274 2.54721555526725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.422726468313301 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5663706 G/C 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 C:G G C 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5663636_5663736:TRIM34 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 24 22 46 11.7140308770109 11.26213836274 0.451892514270886 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 42 30 72 20.4995540347691 15.3574614037364 5.14209263103269 T:C T C 10 0.511915380124546 0.239985711533014 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 43 43 86 20.9876386546445 22.0123613453555 -1.02472269071095 A:G G A 10 0.511915380124546 0.830189962777921 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 42 27 69 20.4995540347691 13.8217152633627 6.67783877140633 C:G G C 10 0.511915380124546 0.117956972868955 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 288 254 542 140.568370524131 130.026506551635 10.5418639724961 T:C T C 10 0.511915380124546 0.367305255151813 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 245 273 518 119.580731869486 139.752898774001 -20.1721669045148 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0787715417703175 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 273 314 587 133.247101225999 160.741429359107 -27.4943281331085 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0257002346671402 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 436 349 785 212.804894265698 178.658467663467 34.1464266022314 A:T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.0151717545314695 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 6422860 G/A 1 8 18 26 3.90467695900363 9.21447684224183 -5.3097998832382 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0483330317267402 ENSG00000166313:ENST00000414793:exon_6422804_6422923:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000299402:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389907:exon_6422804_6422923:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000311051:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389906:exon_6422804_6422924:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000524626:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000529519:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000534416:exon_6422804_6422923:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000530885:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000533407:exon_6422282_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000529778:exon_6422804_6423212:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000526925:exon_6422407_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000533139:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000529890:exon_6422804_6422918:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000534188:exon_6422817_6422918:APBB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 185 141 326 90.295654676959 72.180068597561 18.115586079398 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.0461336150937465 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 172 170 342 83.9505546185781 87.0256146211728 -3.07506000259471 A:G G A 10 0.511915380124546 0.745831769599891 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:T A T 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 45 35 80 21.9638078943954 17.9170383043591 4.04676959003632 A:T T A 10 0.511915380124546 0.373605364297920 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 19 24 43 9.27360777763363 12.2859691229891 -3.01236134535548 T:C C T 10 0.511915380124546 0.365314872753145 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 49 50 99 23.9161463738972 25.5957690062273 -1.67962263233005 A:G G A 10 0.511915380124546 0.763577201343884 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 81 40 121 39.5348542099118 20.4766152049818 19.0582390049299 A:T A T 10 0.511915380124546 0.000515113187153778 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 63 26 89 30.7493310521536 13.3097998832382 17.4395311689154 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000264491697524519 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 57 20 77 27.8208233329009 10.2383076024909 17.58251573041 T:C T C 10 0.511915380124546 5.24369156672678e-05 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 70 20 90 34.1659233912818 10.2383076024909 23.9276157887909 T:C T C 10 0.511915380124546 2.44859523604479e-07 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 A:C C A 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 2201 2156 4357 1074.27424834587 1103.68955954852 -29.4153112026468 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.379438944475471 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 9305051 T/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 42 137 179 20.4995540347691 70.1324070770628 -49.6328530422937 T:C C T 10 0.511915380124546 5.10968528945722e-14 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 30 33 63 14.6425385962636 16.89320754411 -2.25066894784639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.615185788090377 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 37 19 56 18.0591309353918 9.72639222236637 8.33273871302543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0316872396859584 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 10822202 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 5 17 22 2.44042309937727 8.70256146211728 -6.26213836274001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00926378092410556 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 11913585 G/T 1 15 8 23 7.32126929813181 4.09532304099637 3.22594625713544 T:G G T 10 0.511915380124546 0.213023121779288 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525267:exon_11913537_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11913515_11913653:USP47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 16 26 42 7.80935391800726 13.3097998832382 -5.50044596523093 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0921803996721186 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 11 20 31 5.36893081862999 10.2383076024909 -4.86937678386093 T:C C T 10 0.511915380124546 0.104757272014477 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 17191019 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17190224_17191288:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000533645:exon_17190224_17191353:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000532035:exon_17190899_17191353:PIK3C2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 18568542 A/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:T A T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18568427_18568597:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18568427_18568597:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000320750:exon_18568427_18568597:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000396196:exon_18568427_18568597:UEVLD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 19167850 A/G 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G A G 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000177054:ENST00000532026:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000446113:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000527094:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000319776:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000399351:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000525490:exon_19167728_19167850:ZDHHC13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 35 46 81 17.0829616956409 23.5481074857291 -6.46514579008823 T:C T C 10 0.511915380124546 0.181960500235975 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 32624405 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000149100:ENST00000531120:exon_32623825_32627808:EIF3M;ENSG00000186714:ENST00000335185:exon_32623792_32624566:CCDC73;ENSG00000186714:ENST00000528333:exon_32624271_32624566:CCDC73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 7 15 22 3.41659233912818 7.67873070186819 -4.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0873275508586045 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 33689652 G/A 1 1 9 10 0.488084619875454 4.60723842112091 -4.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0100505466901609 ENSG00000110427:ENST00000321505:exon_33689419_33695648:C11orf41;ENSG00000110427:ENST00000389726:exon_33689419_33695648:C11orf41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 29 27 56 14.1544539763882 13.8217152633627 0.332738713025426 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 37 51 88 18.0591309353918 26.1076843863518 -8.04855345096005 T:C:G G T 10 0.511915380124546 0.0888911508931887 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 631 706 1337 307.981395141411 361.412258367929 -53.4308632265179 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00371882519169969 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 44639921 C/T 0 13 0 13 6.3451000583809 0 6.3451000583809 C C 10 0.511915380124546 0.000255011600098263 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.101795622387764 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 929 780 1709 453.430611864297 399.293996497146 54.136615367151 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.00895955515971598 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 46339011 G/A 1 40 74 114 19.5233847950182 37.8817381292164 -18.3583533341982 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000680552114802081 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 46387868 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000149091:ENST00000525434:exon_46387794_46388076:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000454345:exon_46387794_46388534:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000318201:exon_46387807_46388534:DGKZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 46780569 G/A 1 76 57 133 37.0944311105345 29.1791766670991 7.91525444343539 A:G G A 10 0.511915380124546 0.193108649894991 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000527333:exon_46780473_46780593:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526876:exon_46780473_46780593:CKAP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 46784238 A/G 1 26 25 51 12.6902001167618 12.7978845031136 -0.107684386351844 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784177_46784312:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526876:exon_46784177_46784312:CKAP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 47298360 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000428807:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47298256_47298414:MADD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 T:C T C 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 20 16 36 9.76169239750908 8.19064608199274 1.57104631551634 A:G G A 10 0.511915380124546 0.621326824164447 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 57077444 T/C 1 47 28 75 22.9399771341463 14.3336306434873 8.60634649065905 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0497867241933595 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 45 31 76 21.9638078943954 15.8693767838609 6.09443111053451 T:C T C 10 0.511915380124546 0.170020806356699 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 19 9 28 9.27360777763363 4.60723842112091 4.66636935651271 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0896574868913052 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 57156097 C/T 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57156050_57156181:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57156050_57156181:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57156050_57156181:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57156050_57156790:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57156050_57156181:RP11-872D17.8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 64 40 104 31.2374156720291 20.4766152049818 10.7608004670472 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0391105982686363 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 16 16 32 7.80935391800726 8.19064608199274 -0.381292163985471 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 23 17 40 11.2259462571354 8.70256146211728 2.52338479501816 A:G A G 10 0.511915380124546 0.434838666804728 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 58978684 G/A 1 58 8 66 28.3089079527763 4.09532304099637 24.21358491178 A:G G A 10 0.511915380124546 4.75578825618666e-10 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 5 60 65 2.44042309937727 30.7149228074728 -28.2744997080955 T:C C T 10 0.511915380124546 6.91640703675758e-14 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 60152563 T/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166927:ENST00000300184:exon_60152561_60152695:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000435979:exon_60152561_60152695:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000530234:exon_60152561_60152695:MS4A7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 60184191 G/A 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000166928:ENST00000531787:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000300187:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000395005:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000530662:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000527841:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000525397:exon_60182910_60185036:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000531783:exon_60182910_60185161:MS4A14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 61557390 G/A 1 453 423 876 221.102332803581 216.540205792683 4.56212701089774 A:G G A 10 0.511915380124546 0.761126549409505 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61557257_61557393:C11orf10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 62417249 A/G 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000185085:ENST00000330574:exon_62414320_62417471:INTS5;ENSG00000255432:ENST00000528405:exon_62417166_62417471:RP11-831H9.11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 62519787 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185670:ENST00000394807:exon_62518435_62521187:ZBTB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 42 52 94 20.4995540347691 26.6195997664764 -6.12004573170732 T:C T C 10 0.511915380124546 0.216848399574410 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 202 224 426 98.5930932148417 114.669045147898 -16.0759519330566 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.121147062500159 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 63986713 C/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:C C A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 284 305 589 138.616032044629 156.134190937987 -17.5181588933576 A:G G A 10 0.511915380124546 0.149398264687810 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 466 430 896 227.447432861962 220.123613453555 7.32381940840682 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.639949450720343 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 103 95 198 50.2727158471718 48.6319611118319 1.6407547353399 A:T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.831420738465235 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 63996995 G/T 1 59 56 115 28.7969925726518 28.6672612869746 0.129731285677217 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63996950_63997043:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63996950_63997043:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63996950_63997043:NUDT22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64034866 G/A 1 15 21 36 7.32126929813181 10.7502229826155 -3.42895368448365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.317316396592093 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64034911 G/A 1 16 18 34 7.80935391800726 9.21447684224183 -1.40512292423456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.732213732981262 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 44 53 97 21.47572327452 27.1315151466009 -5.65579187208096 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.264930380892513 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 213 162 375 103.962024033472 82.9302915801764 21.0317324532953 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.0300971237446902 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 215 174 389 104.938193273223 89.073276141671 15.8649171315516 A:G A G 10 0.511915380124546 0.115822270893628 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64665769 G/A 1 16 11 27 7.80935391800726 5.63106918137001 2.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445588969149603 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665733_64665834:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665733_64665834:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665733_64665834:ATG2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64880743 C/T 1 19 8 27 9.27360777763363 4.09532304099637 5.17828473663726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0540257950190272 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524986:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64880283_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530892:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527851:exon_64880211_64881066:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534667:exon_64880686_64880886:TM7SF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 30 31 61 14.6425385962636 15.8693767838609 -1.2268381875973 T:C C T 10 0.511915380124546 0.79853359250105 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 61 45 106 29.7731618124027 23.0361921056046 6.73696970679813 A:T:G T A 10 0.511915380124546 0.206986907332664 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 28 18 46 13.6663693565127 9.21447684224183 4.45189251427089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.237797035444175 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65211979 G/A 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.508929611162428 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65266541 G/T 1 1094 748 1842 533.964574143747 382.91270433316 151.051869810586 A:T:G G T 10 0.511915380124546 1.74258179007875e-12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 101 125 226 49.2965466074209 63.9894225155682 -14.6928759081474 T:C C T 10 0.511915380124546 0.053619448962695 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65307852 G/A 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000322147:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529582:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000301873:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530785:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529189:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532932:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000528516:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000526927:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532661:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529371:exon_65307716_65307923:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530866:exon_65307716_65307853:LTBP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 66 47 113 32.21358491178 24.0600228658537 8.15356204592631 A:G G A 10 0.511915380124546 0.132651675278885 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 10 13 23 4.88084619875454 6.6548999416191 -1.77405374286456 T:C C T 10 0.511915380124546 0.534108805620596 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 C:G C G 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65392695 C/T 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65392642_65392751:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000530174:exon_65392598_65392751:PCNXL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 124 132 256 60.5224928645563 67.5728301764401 -7.05033731188377 T:C C T 10 0.511915380124546 0.382197210262859 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 11 12 23 5.36893081862999 6.14298456149455 -0.774053742864557 A:C A C 10 0.511915380124546 0.836006652806153 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181299286165187 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65685317 G/A 1 35 38 73 17.0829616956409 19.4527844447327 -2.36982274909186 A:G G A 10 0.511915380124546 0.640005885600238 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65687242 C/A 1 40 39 79 19.5233847950182 19.9646998248573 -0.441315029839132 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000175550:ENST00000532933:exon_65687195_65687323:DRAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 83 66 149 40.5110234496627 33.78641508822 6.72460836144266 A:G G A 10 0.511915380124546 0.287220818522216 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 110 110 220 53.6893081862999 56.3106918137001 -2.62138362740011 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.736365599152818 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65746136 G/T 1 203 209 412 99.0811778347172 106.99031444603 -7.90913661131295 T:G G T 10 0.511915380124546 0.459836969478582 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529580:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000528137:exon_65745958_65746160:SART1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 65766092 C/T 1 31 25 56 15.1306232161391 12.7978845031136 2.33273871302543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.593696163298870 ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 31 36 67 15.1306232161391 18.4289536844837 -3.29833046834458 T:C C T 10 0.511915380124546 0.464176940591911 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 66263165 C/T 1 91 65 156 44.4157004086663 33.2744997080955 11.1412007005708 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0782407808270191 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526667:exon_66263101_66263221:DPP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 C:G G C 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 23 7 30 11.2259462571354 3.58340766087182 7.64253859626362 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00559681639165783 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 66834252 C/T 1 3 14 17 1.46425385962636 7.16681532174364 -5.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00642864916210632 ENSG00000173156:ENST00000308831:exon_66834209_66834318:RHOD;ENSG00000173156:ENST00000533360:exon_66834209_66834318:RHOD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 67068572 C/T 1 40 48 88 19.5233847950182 24.5719382459782 -5.04855345096005 T:C C T 10 0.511915380124546 0.288382049770949 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000506119:exon_67068461_67068599:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068247_67068618:ANKRD13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 109 116 225 53.2012235664245 59.3821840944473 -6.18096052802284 T:C C T 10 0.511915380124546 0.42403605143014 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 68 64 132 33.1897541515309 32.7625843279709 0.427169823559936 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 67378838 C/G 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 C:G C G 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68177510 C/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68177382_68177608:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68177382_68177608:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000528714:exon_68177497_68177608:LRP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 16 11 27 7.80935391800726 5.63106918137001 2.17828473663726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445588969149603 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68206099 G/A 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68205914_68206150:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68205914_68206150:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000533695:exon_68206061_68206150:LRP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68380553 C/T 1 38 66 104 18.5472155552673 33.78641508822 -15.2391995329528 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00311183609504938 ENSG00000110075:ENST00000393800:exon_68380534_68382802:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534534:exon_68380534_68381350:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524845:exon_68380534_68380585:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265637:exon_68380534_68382802:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393799:exon_68380534_68382797:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524904:exon_68380534_68382043:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393801:exon_68380534_68382799:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265636:exon_68380534_68382720:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000527403:exon_68380534_68381521:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534190:exon_68380534_68380822:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526307:exon_68380534_68382060:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526593:exon_68380534_68380592:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000525152:exon_68380534_68380866:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000530734:exon_68380504_68381006:PPP6R3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G A G 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 15 17 32 7.32126929813181 8.70256146211728 -1.38129216398547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.72441756587225 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:C C A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 69462910 G/A 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:G G A 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 24 29 53 11.7140308770109 14.8455460236118 -3.13151514660094 A:G A G 10 0.511915380124546 0.412228942761961 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 70118489 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530746:exon_70118279_70118542:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532024:exon_70118013_70118542:PPFIA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 16 28 44 7.80935391800726 14.3336306434873 -6.52427672548002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0511252870213209 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 110 108 218 53.6893081862999 55.286861053451 -1.59755286715102 A:G G A 10 0.511915380124546 0.839224958736594 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 79 74 153 38.5586849701609 37.8817381292164 0.676946840944467 T:C C T 10 0.511915380124546 0.935675697881156 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 24 24 48 11.7140308770109 12.2859691229891 -0.571938245978206 C:G G C 10 0.511915380124546 0.886208204797435 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 71701763 G/A 1 26 15 41 12.6902001167618 7.67873070186819 5.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.121530770428778 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000490867:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000528683:exon_71701643_71701842:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71701643_71701763:RNF121 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 71706544 A/G 1 33 28 61 16.10679245589 14.3336306434873 1.7731618124027 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.7016797222147 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000533380:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71706486_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000532379:exon_71706292_71706597:RNF121 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 72533536 C/T 1 15 26 41 7.32126929813181 13.3097998832382 -5.98853058510638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0844721070702734 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72533523_72533588:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000439504:exon_72533523_72533588:ATG16L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 73105534 G/A 1 14 24 38 6.83318467825636 12.2859691229891 -5.45278444473275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.103449429666651 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73105522_73105779:RELT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 C:G C G 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 228 164 392 111.283293331604 83.9541223404255 27.329170991178 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00630233915460233 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 T:C T C 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 74559446 G/C 1 3 12 15 1.46425385962636 6.14298456149455 -4.67873070186819 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0187794943013981 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 74559481 C/T 1 2 13 15 0.976169239750908 6.6548999416191 -5.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00347528670860961 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 427 341 768 208.412132686819 174.56314462247 33.8489880643487 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.0155421009741706 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75277582 C/T 1 29 22 51 14.1544539763882 11.26213836274 2.89231561364816 T:C C T 10 0.511915380124546 0.484334403347585 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 38 29 67 18.5472155552673 14.8455460236118 3.70166953165542 C:G C G 10 0.511915380124546 0.393811403819168 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 50 26 76 24.4042309937727 13.3097998832382 11.0944311105345 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0114355619936358 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 63 61 124 30.7493310521536 31.2268381875973 -0.477507135443698 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 45 44 89 21.9638078943954 22.52427672548 -0.560468831084588 T:C T C 10 0.511915380124546 0.915979865229122 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 47 45 92 22.9399771341463 23.0361921056046 -0.0962149714582274 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 23 17 40 11.2259462571354 8.70256146211728 2.52338479501816 T:C T C 10 0.511915380124546 0.434838666804728 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 22 10 32 10.73786163726 5.11915380124546 5.61870783601453 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0521696794811529 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 12 14 26 5.85701543850545 7.16681532174364 -1.30979988323819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.696332422692757 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 110 67 177 53.6893081862999 34.2983304683446 19.3909777179554 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00414892248790052 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 35 36 71 17.0829616956409 18.4289536844837 -1.34599198884277 T:C C T 10 0.511915380124546 0.812639794260727 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 12 15 27 5.85701543850545 7.67873070186819 -1.82171526336274 A:C A C 10 0.511915380124546 0.565249573112803 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 87032287 G/C 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 C:G G C 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000166575:ENST00000340353:exon_87032243_87034756:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000532959:exon_87032243_87032401:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000305494:exon_87032243_87033392:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000531643:exon_87032243_87033392:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000528861:exon_87032243_87033077:TMEM135 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 150 174 324 73.2126929813181 89.073276141671 -15.8605831603529 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0848199609500346 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 150 185 335 73.2126929813181 94.704345323041 -21.4916523417229 A:T:C A C 10 0.511915380124546 0.0215728820650731 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 93464290 T/C 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 C:G C G 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 94231323 A/T 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 A:T A T 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 95825797 A/G 1 15 21 36 7.32126929813181 10.7502229826155 -3.42895368448365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.317316396592093 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 25 25 50 12.2021154968864 12.7978845031136 -0.595769006227297 A:G G A 10 0.511915380124546 0.888368761205228 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 111680496 A/C 1 32 32 64 15.6187078360145 16.3812921639855 -0.762584327970941 A:C A C 10 0.511915380124546 0.900780253259295 ENSG00000086848:ENST00000532425:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527212:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000526272:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111680367_111680497:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111680367_111680497:FDXACB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 19 20 39 9.27360777763363 10.2383076024909 -0.964699824857293 T:C C T 10 0.511915380124546 0.873019589441929 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 33 32 65 16.10679245589 16.3812921639855 -0.274499708095487 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 9 19 28 4.39276157887909 9.72639222236637 -5.33363064348729 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0572604976845011 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 113236975 G/A 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113236947_113237114:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113236947_113237108:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113236947_113237109:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000480233:exon_113236947_113237109:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000496311:exon_113236947_113237108:TTC12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 16 14 30 7.80935391800726 7.16681532174364 0.642538596263622 T:C C T 10 0.511915380124546 0.856761303277079 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 116633947 G/A 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117094795 T/A 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 A:T T A 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117094794_117094932:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117093924_117094932:PCSK7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117099025 A/G 1 31 28 59 15.1306232161391 14.3336306434873 0.796992572651789 A:G A G 10 0.511915380124546 0.896693274135929 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117098932_117099066:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117098932_117099066:PCSK7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 C:G C G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G A G 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117279712 C/T 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117279606_117279744:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117279606_117279720:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117279606_117279720:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117279606_117279744:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117279606_117279720:CEP164 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 13 14 27 6.3451000583809 7.16681532174364 -0.821715263362741 A:G G A 10 0.511915380124546 0.848118384669247 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 A:G A G 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118245820 C/G 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 C:G C G 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000110344:ENST00000252108:exon_118245611_118245944:UBE4A;ENSG00000110344:ENST00000431736:exon_118245611_118245944:UBE4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118374791 G/A 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000118058:ENST00000534358:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000359313:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000354520:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000328469:exon_118373113_118377361:MLL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118765267 G/C 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 A:G A G 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118771747 A/G 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118771328_118772335:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118772516 T/C 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118772825 T/C 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118773180 G/A 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 23 34 57 11.2259462571354 17.4051229242346 -6.17917666709912 A:G A G 10 0.511915380124546 0.112345157648559 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 23 25 48 11.2259462571354 12.7978845031136 -1.57193824597821 T:C C T 10 0.511915380124546 0.66761625666195 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 76 76 152 37.0944311105345 38.9055688894655 -1.81113777893098 T:C C T 10 0.511915380124546 0.807870052587948 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 35 28 63 17.0829616956409 14.3336306434873 2.7493310521536 T:C C T 10 0.511915380124546 0.529841286579674 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118920540 C/T 1 134 137 271 65.4033390633108 70.1324070770628 -4.72906801375196 T:C C T 10 0.511915380124546 0.584739261064921 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118920489_118920549:HYOU1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 39 35 74 19.0353001751427 17.9170383043591 1.1182618707836 A:G G A 10 0.511915380124546 0.817045385944873 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118942344 G/A 1 23 16 39 11.2259462571354 8.19064608199274 3.03530017514271 A:G G A 10 0.511915380124546 0.342140299305098 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 13 17 30 6.3451000583809 8.70256146211728 -2.35746140373638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.466232196027525 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118949549 G/A 1 51 38 89 24.8923156136482 19.4527844447327 5.43953116891541 A:G G A 10 0.511915380124546 0.289007687794745 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 61 64 125 29.7731618124027 32.7625843279709 -2.98942251556824 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.593051456450416 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 118986798 G/A 1 21 13 34 10.2497770173845 6.6548999416191 3.59487707576544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.233980124238926 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 119050896 C/T 1 6 12 18 2.92850771925272 6.14298456149455 -3.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.159007913775557 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 120099658 A/G 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 120099679 G/A 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 120099791 C/T 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 120330019 T/G 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:G T G 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000529970:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000530747:exon_120328427_120330029:ARHGEF12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 120347940 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000529970:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000526067:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000528681:exon_120347709_120348014:ARHGEF12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 121384924 C/T 1 12 18 30 5.85701543850545 9.21447684224183 -3.35746140373638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.273551093070692 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121384861_121385030:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121384861_121385030:SORL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 121393684 G/A 1 26 20 46 12.6902001167618 10.2383076024909 2.45189251427088 A:G G A 10 0.511915380124546 0.555781106582879 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121393625_121393698:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121393625_121393698:SORL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 16 27 43 7.80935391800726 13.8217152633627 -6.01236134535548 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0689977450798601 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 121466409 A/G 1 15 35 50 7.32126929813181 17.9170383043591 -10.5957690062273 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00280104170364950 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121466332_121466481:SORL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 42 45 87 20.4995540347691 23.0361921056046 -2.5366380708355 A:T T A 10 0.511915380124546 0.593802728690036 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1210 1132 2342 590.582390049299 579.488210300986 11.0941797483134 A:T:C:G T G 10 0.511915380124546 0.649362053923413 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 124496774 C/T 0 10 0 10 4.88084619875454 0 4.88084619875454 C C 10 0.511915380124546 0.00200317089435722 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124496709_124496946:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124496695_124496946:TBRG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 124506967 C/T 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 T:C C T 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 102 70 172 49.7846312272963 35.8340766087182 13.9505546185781 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0391574382053583 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 35 30 65 17.0829616956409 15.3574614037364 1.72550029190451 A:G A G 10 0.511915380124546 0.710739442786762 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 69 55 124 33.6778387714063 28.15534590685 5.5224928645563 A:G G A 10 0.511915380124546 0.324945496280541 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 50 39 89 24.4042309937727 19.9646998248573 4.43953116891541 C:G C G 10 0.511915380124546 0.396486004498103 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 17 14 31 8.29743853788272 7.16681532174364 1.13062321613908 A:C C A 10 0.511915380124546 0.72247502509934 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125766173 A/C 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:C A C 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125766204 G/C 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 12 20 32 5.85701543850545 10.2383076024909 -4.38129216398547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.156458779115569 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 126135973 C/T 1 133 153 286 64.9152544434354 78.3230531590555 -13.4077987156201 T:C C T 10 0.511915380124546 0.123956858469738 ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135858_126135976:SRPR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 54 39 93 26.3565694732745 19.9646998248573 6.39186964841723 T:C T C 10 0.511915380124546 0.213149511191491 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 128360445 A/G 1 30 30 60 14.6425385962636 15.3574614037364 -0.714922807472757 A:G A G 10 0.511915380124546 0.897643286761043 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128360352_128360471:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128360352_128360471:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000531611:exon_128360352_128360471:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128360352_128360471:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128360352_128360471:ETS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 128651893 A/G 1 14 11 25 6.83318467825636 5.63106918137001 1.20211549688635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.692143728741491 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 128675292 T/A 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 A:T T A 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128673771_128677134:FLI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 18 17 35 8.78552315775817 8.70256146211728 0.0829616956408916 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:C A C 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 30 31 61 14.6425385962636 15.8693767838609 -1.2268381875973 T:C C T 10 0.511915380124546 0.79853359250105 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 12 27 39 5.85701543850545 13.8217152633627 -7.96469982485729 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0151767762362834 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 1702549 C/G 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 C:G C G 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 2930027 G/A 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000111203:ENST00000228799:exon_2929890_2930038:ITFG2;ENSG00000111203:ENST00000419778:exon_2929890_2930038:ITFG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 42 32 74 20.4995540347691 16.3812921639855 4.1182618707836 A:G A G 10 0.511915380124546 0.354300180704382 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 30 38 68 14.6425385962636 19.4527844447327 -4.81024584846912 A:G G A 10 0.511915380124546 0.275321598040182 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 44 23 67 21.47572327452 11.7740537428646 9.70166953165542 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0198612558310288 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 184 153 337 89.8075700570835 78.3230531590555 11.484516898028 A:G G A 10 0.511915380124546 0.230573471887425 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 20 21 41 9.76169239750908 10.7502229826155 -0.988530585106385 A:G A G 10 0.511915380124546 0.757990196027559 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 31 26 57 15.1306232161391 13.3097998832382 1.82082333290088 A:G A G 10 0.511915380124546 0.691758908540314 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 54 41 95 26.3565694732745 20.9885305851064 5.36803888816813 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.304945142174659 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 96 92 188 46.8561235080436 47.0962149714582 -0.240091463414643 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 142 110 252 69.3080160223145 56.3106918137001 12.9973242086144 C:G C G 10 0.511915380124546 0.115008991475634 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4078 3492 7570 1990.4090798521 1787.60850739491 202.800572457187 A:T:C T C 10 0.511915380124546 3.20492993985618e-06 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4243 3711 7954 2070.94304213155 1899.71797564219 171.225066489361 A:T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.000124897910357461 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6701085 T/C 1 101 111 212 49.2965466074209 56.8226071938246 -7.52606058640374 T:C T C 10 0.511915380124546 0.303756334932881 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6701082_6701223:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6701082_6701223:CHD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 39 28 67 19.0353001751427 14.3336306434873 4.70166953165542 A:G G A 10 0.511915380124546 0.272621075298993 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 6958526 C/T 1 55 41 96 26.84465409315 20.9885305851064 5.85612350804359 T:C C T 10 0.511915380124546 0.261558672711164 ENSG00000111665:ENST00000229265:exon_6958487_6958593:CDCA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 7055860 T/C 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 T:C T C 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7055740_7055902:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7055754_7055902:PTPN6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 7188562 G/T 1 11 7 18 5.36893081862999 3.58340766087182 1.78552315775817 T:G G T 10 0.511915380124546 0.48295319218206 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7187836_7188605:C1R;ENSG00000159403:ENST00000458061:exon_7187845_7188605:C1R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 7242299 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7242183_7242329:C1R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 46 0 46 22.4518925142709 0 22.4518925142709 G G 10 0.511915380124546 4.66728415570617e-14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 36 38 74 17.5710463155163 19.4527844447327 -1.8817381292164 A:G G A 10 0.511915380124546 0.727551994621286 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 8278181 A/T 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000111729:ENST00000352620:exon_8278157_8278273:CLEC4A;ENSG00000111729:ENST00000229332:exon_8278157_8278273:CLEC4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 12977604 A/G 1 108 117 225 52.713138946549 59.8940994745719 -7.18096052802284 A:G A G 10 0.511915380124546 0.350947257381638 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12977474_12977611:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12977474_12977611:DDX47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 14613700 A/G 1 48 37 85 23.4280617540218 18.9408690646082 4.48719268941359 A:G A G 10 0.511915380124546 0.385538388648085 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14613429_14614067:ATF7IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 30 34 64 14.6425385962636 17.4051229242346 -2.76258432797094 T:C:G C G 10 0.511915380124546 0.532845847590832 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 14947558 C/T 1 65 63 128 31.7255002919045 32.2506689478464 -0.525168655941879 T:C C T 10 0.511915380124546 0.929827511954786 ENSG00000084463:ENST00000261167:exon_14947471_14947670:WBP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 19626205 T/C 1 18 33 51 8.78552315775817 16.89320754411 -8.10768438635184 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0249756553657266 ENSG00000139154:ENST00000398864:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000266508:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000435841:exon_19626182_19626289:AEBP2;ENSG00000139154:ENST00000360995:exon_19626182_19626289:AEBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 9 14 23 4.39276157887909 7.16681532174364 -2.77405374286456 T:G T G 10 0.511915380124546 0.29893206210594 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 61 55 116 29.7731618124027 28.15534590685 1.61781590555267 T:C C T 10 0.511915380124546 0.781246099838207 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 21 11 32 10.2497770173845 5.63106918137001 4.61870783601453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.113407034577418 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 27844824 G/A 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27844682_27844861:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27844682_27844861:PPFIBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 35 28 63 17.0829616956409 14.3336306434873 2.7493310521536 A:G G A 10 0.511915380124546 0.529841286579674 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 18 40 58 8.78552315775817 20.4766152049818 -11.6910920472237 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00232026693812463 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 28637061 G/C 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28636985_28637098:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28636985_28637098:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28636985_28637098:CCDC91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 30868002 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30867893_30868015:CAPRIN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 20 6 26 9.76169239750908 3.07149228074728 6.6902001167618 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00986416738905573 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 16 7 23 7.80935391800726 3.58340766087182 4.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.095264062576869 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32134207 C/A 1 9 4 13 4.39276157887909 2.04766152049818 2.3451000583809 A:C C A 10 0.511915380124546 0.268628592400232 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32134240 C/T 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32134638 T/C 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32135186 T/A 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 A:T T A 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32136750 T/C 1 34 28 62 16.5948770757654 14.3336306434873 2.26124643227815 T:C T C 10 0.511915380124546 0.612427235637947 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 45 51 96 21.9638078943954 26.1076843863518 -4.14387649195641 C:G C G 10 0.511915380124546 0.415388436672609 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G G A 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 46318636 C/G 1 40 50 90 19.5233847950182 25.5957690062273 -6.07238421120914 C:G C G 10 0.511915380124546 0.20732067594653 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46318511_46318857:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46318511_46318857:SRSF2IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 34 27 61 16.5948770757654 13.8217152633627 2.7731618124027 A:T A T 10 0.511915380124546 0.523043949579928 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 5 13 18 2.44042309937727 6.6548999416191 -4.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.058592754437712 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 41 40 81 20.0114694148936 20.4766152049818 -0.465145790088226 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 18 25 43 8.78552315775817 12.7978845031136 -4.01236134535548 T:G G T 10 0.511915380124546 0.22689866850651 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 49424534 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424384_49424551:MLL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 18 13 31 8.78552315775817 6.6548999416191 2.13062321613907 A:G A G 10 0.511915380124546 0.477043468133186 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 16 16 32 7.80935391800726 8.19064608199274 -0.381292163985471 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 50190653 C/T 1 11 12 23 5.36893081862999 6.14298456149455 -0.774053742864557 T:C C T 10 0.511915380124546 0.836006652806153 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 50190667 A/T 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:T A T 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 51112586 T/C 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000066084:ENST00000301180:exon_51112492_51112601:DIP2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 27 28 55 13.1782847366373 14.3336306434873 -1.15534590685003 T:C C T 10 0.511915380124546 0.78847119481376 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 12 18 30 5.85701543850545 9.21447684224183 -3.35746140373638 T:C T C 10 0.511915380124546 0.273551093070692 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 46 34 80 22.4518925142709 17.4051229242346 5.04676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.265822679553239 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 16 6 22 7.80935391800726 3.07149228074728 4.73786163725999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0539349281471928 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 7 21 28 3.41659233912818 10.7502229826155 -7.33363064348729 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00711838265769538 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 53586154 G/A 1 249 231 480 121.533070348988 118.25245280877 3.28061754021795 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.784212040241069 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586114_53586322:ITGB7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 36 28 64 17.5710463155163 14.3336306434873 3.23741567202906 T:C T C 10 0.511915380124546 0.454435798502245 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 9 16 25 4.39276157887909 8.19064608199274 -3.79788450311365 T:C C T 10 0.511915380124546 0.161405471327681 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 53715187 G/C 1 18 20 38 8.78552315775817 10.2383076024909 -1.45278444473275 C:G G C 10 0.511915380124546 0.746050140979249 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53715127_53715374:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53715127_53715412:AAAS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 29 41 70 14.1544539763882 20.9885305851064 -6.83407660871822 T:C C T 10 0.511915380124546 0.119787055344146 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 21 33 54 10.2497770173845 16.89320754411 -6.64343052672548 T:C T C 10 0.511915380124546 0.077226279361455 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 54765421 G/A 1 5 17 22 2.44042309937727 8.70256146211728 -6.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00926378092410556 ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54765257_54765499:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54765257_54765499:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54765257_54765499:ZNF385A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 68 82 150 33.1897541515309 41.9770611702128 -8.78730701868189 T:C C T 10 0.511915380124546 0.165031173353448 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 54970454 T/C 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 71 34 105 34.6540080111572 17.4051229242346 17.2488850869227 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000827961747347758 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 27 15 42 13.1782847366373 7.67873070186819 5.49955403476907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.121690688156681 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 39 24 63 19.0353001751427 12.2859691229891 6.74933105215361 A:G G A 10 0.511915380124546 0.101286735465923 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 74 59 133 36.1182618707836 30.2030074273482 5.91525444343539 T:C T C 10 0.511915380124546 0.340129411079172 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56345408 T/G 1 34 24 58 16.5948770757654 12.2859691229891 4.30890795277634 T:G T G 10 0.511915380124546 0.293970808476385 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56345407_56345567:DGKA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 70 71 141 34.1659233912818 36.3459919888428 -2.18006859756098 A:G G A 10 0.511915380124546 0.7366250576953 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 314 196 510 153.258570640893 100.335414504411 52.9231561364816 A:G A G 10 0.511915380124546 3.06030917609293e-06 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56704987 T/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 31 24 55 15.1306232161391 12.2859691229891 2.84465409314997 A:G G A 10 0.511915380124546 0.500856148048463 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 21 26 47 10.2497770173845 13.3097998832382 -3.06002286585366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.385286135028226 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 A:T T A 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 3 11 14 1.46425385962636 5.63106918137001 -4.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0315678139197663 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 C:G C G 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57039080 C/T 1 618 495 1113 301.636295083031 253.39811316165 48.2381819213803 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.00398120878993642 ENSG00000110955:ENST00000262030:exon_57038955_57039137:ATP5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57499258 C/T 1 136 115 251 66.3795083030618 58.8702687143228 7.50923958873897 T:C C T 10 0.511915380124546 0.34458188749296 ENSG00000166888:ENST00000300134:exon_57499251_57499382:STAT6;ENSG00000166888:ENST00000454075:exon_57499251_57499382:STAT6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57499432 C/T 1 19 5 24 9.27360777763363 2.55957690062273 6.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00696783810745496 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57500108 T/C 1 91 96 187 44.4157004086663 49.1438764919564 -4.72817608329009 T:C T C 10 0.511915380124546 0.510741351291443 ENSG00000166888:ENST00000300134:exon_57499974_57500122:STAT6;ENSG00000166888:ENST00000454075:exon_57499974_57500122:STAT6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 23 5 28 11.2259462571354 2.55957690062273 8.66636935651271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.000994341288243795 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 83 87 170 40.5110234496627 44.5366380708355 -4.02561462117281 A:C:G A C 10 0.511915380124546 0.540531652828494 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57870420 C/G 1 74 72 146 36.1182618707836 36.8579073689673 -0.739645498183712 C:G C G 10 0.511915380124546 0.934116179567753 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870373_57870434:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870373_57870434:ARHGAP9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57905612 A/G 1 114 123 237 55.6416466658018 62.9655917553192 -7.32394508951739 A:G A G 10 0.511915380124546 0.363146981053069 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57905481_57905651:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57905481_57905651:MARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 161 132 293 78.5816237999481 67.5728301764401 11.008793623508 T:G T G 10 0.511915380124546 0.199248847374915 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 57994679 C/G 1 29 23 52 14.1544539763882 11.7740537428646 2.38040023352361 C:G C G 10 0.511915380124546 0.579674438793655 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57994594_57994861:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57994594_57994861:PIP4K2C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 58001003 C/T 1 21 24 45 10.2497770173845 12.2859691229891 -2.03619210560457 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.554950280927398 ENSG00000178498:ENST00000413885:exon_58000667_58001396:DTX3;ENSG00000178498:ENST00000337737:exon_58000648_58001396:DTX3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 A:C C A 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 20 19 39 9.76169239750908 9.72639222236637 0.0353001751427069 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 18 10 28 8.78552315775817 5.11915380124546 3.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.188426563384957 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 17 27 44 8.29743853788272 13.8217152633627 -5.52427672548002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.099503316752956 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 62979216 G/A 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 A:G G A 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000261188:exon_62979074_62979281:MON2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 65564324 C/T 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 T:C C T 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000174106:ENST00000308330:exon_65563371_65564898:LEMD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 21 31 52 10.2497770173845 15.8693767838609 -5.61959976647639 A:G A G 10 0.511915380124546 0.128334913651689 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 69082805 G/A 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:G G A 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69082742_69082833:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69082742_69082833:NUP107 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 8 14 22 3.90467695900363 7.16681532174364 -3.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.201891896863631 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 131 143 274 63.9390852036845 73.2038993578101 -9.2648141541256 A:G A G 10 0.511915380124546 0.276870588423923 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 63 56 119 30.7493310521536 28.6672612869746 2.08206976517903 C:G C G 10 0.511915380124546 0.714790432886125 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 C:G G C 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94620432 G/T 1 18 12 30 8.78552315775817 6.14298456149455 2.64253859626362 T:C:G G T 10 0.511915380124546 0.365700122215464 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94620381_94620483:PLXNC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94631496 C/T 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 T:C C T 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94631440_94631579:PLXNC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94694743 T/C 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94694686_94694833:PLXNC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 30 28 58 14.6425385962636 14.3336306434873 0.308907952776336 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 19 13 32 9.27360777763363 6.6548999416191 2.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.381435496341429 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 26 19 45 12.6902001167618 9.72639222236637 2.96380789439543 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.456366162082646 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 24 15 39 11.7140308770109 7.67873070186819 4.03530017514271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.204565942063902 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 74 62 136 36.1182618707836 31.7387535677219 4.37950830306175 A:G G A 10 0.511915380124546 0.492844480092456 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 95906603 C/A 1 44 58 102 21.47572327452 29.6910920472237 -8.21536877270369 A:C C A 10 0.511915380124546 0.113158650943914 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95906577_95906692:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95906577_95906692:METAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 101732670 C/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 101755809 T/C 1 3 8 11 1.46425385962636 4.09532304099637 -2.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.137545352473278 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101755740_101755838:UTP20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 105388484 T/G 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:G T G 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105388256_105388505:C12orf45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 105600935 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105600839_105600985:APPL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 106633198 C/T 1 65 63 128 31.7255002919045 32.2506689478464 -0.525168655941879 T:C C T 10 0.511915380124546 0.929827511954786 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 108941679 G/A 1 32 18 50 15.6187078360145 9.21447684224183 6.4042309937727 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0887030437041339 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 40 40 80 19.5233847950182 20.4766152049818 -0.95323040996368 C:G G C 10 0.511915380124546 0.911049417240887 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 108956433 C/T 1 15 5 20 7.32126929813181 2.55957690062273 4.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0425244406238397 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000431221:exon_108956382_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108956382_108956512:ISCU HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 46 38 84 22.4518925142709 19.4527844447327 2.99910806953814 T:C C T 10 0.511915380124546 0.585540571968894 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 18 9 27 8.78552315775817 4.60723842112091 4.17828473663726 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.124932157067609 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 109962278 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109962243_109962308:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109962243_109962308:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109962243_109962308:UBE3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 110385154 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000139436:ENST00000343646:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000354574:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000361006:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110385061_110385309:GIT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 14 23 37 6.83318467825636 11.7740537428646 -4.9408690646082 T:C T C 10 0.511915380124546 0.137884645110399 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 111926403 G/A 1 26 29 55 12.6902001167618 14.8455460236118 -2.15534590685003 A:G G A 10 0.511915380124546 0.591436508908909 ENSG00000204842:ENST00000377617:exon_111926280_111926584:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000389153:exon_111926280_111926584:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000389154:exon_111926280_111926416:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000483311:exon_111926280_111926584:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000492467:exon_111926279_111926584:ATXN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 112110489 T/C 1 15 11 26 7.32126929813181 5.63106918137001 1.69020011676181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.560130398277703 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112110465_112110578:BRAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 112241766 G/A 1 105 97 202 51.2488850869227 49.655791872081 1.59309321484172 A:G G A 10 0.511915380124546 0.833128721265763 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112241663_112241777:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112241663_112241777:ALDH2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 112486197 G/A 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112486096_112486247:NAA25;ENSG00000111300:ENST00000412551:exon_112486096_112486247:NAA25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 113357202 C/T 1 14 2 16 6.83318467825636 1.02383076024909 5.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00434163882715972 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 26 29 55 12.6902001167618 14.8455460236118 -2.15534590685003 A:G G A 10 0.511915380124546 0.591436508908909 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 28 15 43 13.6663693565127 7.67873070186819 5.98763865464452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0921974284201415 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 34 15 49 16.5948770757654 7.67873070186819 8.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0142915476316735 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 T:C T C 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 T:C T C 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 51 45 96 24.8923156136482 23.0361921056046 1.85612350804359 A:G G A 10 0.511915380124546 0.759699295403071 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 61 46 107 29.7731618124027 23.5481074857291 6.22505432667358 T:C C T 10 0.511915380124546 0.246455815103510 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 52 63 115 25.3804002335236 32.2506689478464 -6.87026871432278 C:G G C 10 0.511915380124546 0.225249788534137 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 87 65 152 42.4633619291645 33.2744997080955 9.18886222106901 T:C C T 10 0.511915380124546 0.144452575641863 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 126 155 281 61.4986621043072 79.3468839193046 -17.8482218149974 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0365960054425812 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 112 118 230 54.6654774260509 60.4060148546964 -5.74053742864557 A:G G A 10 0.511915380124546 0.468447933492566 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 99 127 226 48.3203773676699 65.0132532758173 -16.6928759081474 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0280252149222873 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 122332727 C/T 1 66 52 118 32.21358491178 26.6195997664764 5.59398514530358 T:C C T 10 0.511915380124546 0.312495095825643 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122332645_122332747:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122332645_122332747:PSMD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 122626381 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122626238_122628963:MLXIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 43 30 73 20.9876386546445 15.3574614037364 5.63017725090815 C:G G C 10 0.511915380124546 0.199209061700716 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 22 26 48 10.73786163726 13.3097998832382 -2.57193824597821 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.473946625517885 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 34 9 43 16.5948770757654 4.60723842112091 11.9876386546445 A:C:G C G 10 0.511915380124546 0.000200503530674104 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 56 48 104 27.3327387130254 24.5719382459782 2.76080046704722 A:G A G 10 0.511915380124546 0.624459734656528 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124819043 T/C 1 51 39 90 24.8923156136482 19.9646998248573 4.92761578879086 T:C T C 10 0.511915380124546 0.342764545538167 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124818970_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000474079:exon_124818890_124819163:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 100 64 164 48.8084619875454 32.7625843279709 16.0458776595745 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0124108009523719 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 101 69 170 49.2965466074209 35.3221612285937 13.9743853788272 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.0380093475091754 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 84 66 150 40.9991080695381 33.78641508822 7.21269298131811 T:C C T 10 0.511915380124546 0.253331708534098 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 54 53 107 26.3565694732745 27.1315151466009 -0.774945673326418 T:C T C 10 0.511915380124546 0.923088414406557 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 42 68 110 20.4995540347691 34.8102458484691 -14.3106918137001 A:T T A 10 0.511915380124546 0.00733956306167214 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 2238 3021 5259 1092.33337928127 1546.49636335625 -454.162984074987 A:T:C:G G C 10 0.511915380124546 4.46357449137514e-36 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 29 35 64 14.1544539763882 17.9170383043591 -3.76258432797094 A:G G A 10 0.511915380124546 0.382368413518617 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 125587278 G/A 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 124 124 248 60.5224928645563 63.4775071354437 -2.9550142708874 A:G A G 10 0.511915380124546 0.750870820676342 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 118 101 219 57.5939851453036 51.7034533925791 5.89053175272443 T:C C T 10 0.511915380124546 0.457301153590573 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 130912757 C/T 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130912724_130912882:RIMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 130935796 C/G 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130935740_130935885:RIMBP2;ENSG00000060709:ENST00000392375:exon_130935740_130935885:RIMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 130941150 G/C 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 C:G G C 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130941041_130941245:RIMBP2;ENSG00000060709:ENST00000392375:exon_130941041_130941245:RIMBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 132326298 G/A 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132326169_132326345:MMP17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 132396603 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132396487_132396634:ULK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 132402020 T/C 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132401956_132402099:ULK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 132549269 G/A 1 28 27 55 13.6663693565127 13.8217152633627 -0.155345906850027 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 12 132562080 G/A 1 50 47 97 24.4042309937727 24.0600228658537 0.344208127919043 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 20763380 T/C 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000165474:ENST00000382848:exon_20761609_20763742:GJB2;ENSG00000165474:ENST00000382844:exon_20761611_20763919:GJB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 275 2 277 134.22327046575 1.02383076024909 133.199439705501 T:C T C 10 0.511915380124546 1.85654608152486e-76 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 21562371 C/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21562020_21563443:LATS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 252 262 514 122.997324208614 134.121829592631 -11.1245053840166 T:C C T 10 0.511915380124546 0.331978935538060 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:G A G 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G A G 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 23911748 C/T 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 24234517 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24234504_24234629:TNFRSF19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 112 93 205 54.6654774260509 47.6081303515828 7.05734707446808 C:G C G 10 0.511915380124546 0.329001984326141 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 54 50 104 26.3565694732745 25.5957690062273 0.760800467047222 T:G G T 10 0.511915380124546 0.922020375898774 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 61 55 116 29.7731618124027 28.15534590685 1.61781590555267 C:G C G 10 0.511915380124546 0.781246099838207 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 39 48 87 19.0353001751427 24.5719382459782 -5.5366380708355 A:C:G C G 10 0.511915380124546 0.2402152692544 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 30 19 49 14.6425385962636 9.72639222236637 4.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.198074404336929 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 T:C C T 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 25480295 C/T 1 14 11 25 6.83318467825636 5.63106918137001 1.20211549688635 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.692143728741491 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 134 147 281 65.4033390633108 75.2515608783083 -9.84822181499742 C:G G C 10 0.511915380124546 0.256923388738585 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 35 41 76 17.0829616956409 20.9885305851064 -3.9055688894655 C:G G C 10 0.511915380124546 0.422145638934546 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 124 87 211 60.5224928645563 44.5366380708355 15.9858547937208 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0325366038136966 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 31231806 T/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 12 19 31 5.85701543850545 9.72639222236637 -3.86937678386092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.208319816983143 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 33002219 T/G 1 23 29 52 11.2259462571354 14.8455460236118 -3.61959976647639 T:G T G 10 0.511915380124546 0.334171385255209 ENSG00000139597:ENST00000380130:exon_33002041_33002315:N4BP2L1;ENSG00000139597:ENST00000380139:exon_33002041_33002270:N4BP2L1;ENSG00000139597:ENST00000530622:exon_33002041_33002270:N4BP2L1;ENSG00000139597:ENST00000380133:exon_33002041_33002270:N4BP2L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 A:G G A 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 40229891 G/A 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G G A 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 40229957 T/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 36 23 59 17.5710463155163 11.7740537428646 5.79699257265179 A:T T A 10 0.511915380124546 0.151996897899088 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 49 52 101 23.9161463738972 26.6195997664764 -2.70345339257914 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.619508057468903 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 10 22 32 4.88084619875454 11.26213836274 -6.38129216398547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0323565416418112 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 41834931 C/G 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 C:G C G 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 42264380 C/T 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42264302_42264411:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42264302_42264411:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000478987:exon_42264302_42264411:KIAA0564 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 54 61 115 26.3565694732745 31.2268381875973 -4.87026871432278 T:C T C 10 0.511915380124546 0.40141566994776 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 46 42 88 22.4518925142709 21.5004459652309 0.951446549039954 A:C A C 10 0.511915380124546 0.915169305790299 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 45781569 A/G 1 36 33 69 17.5710463155163 16.89320754411 0.677838771406329 A:G A G 10 0.511915380124546 0.904571051240302 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45781559_45781640:GTF2F2;ENSG00000188342:ENST00000494087:exon_45780490_45781640:GTF2F2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 46077381 G/A 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46077379_46077484:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46077379_46077484:COG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 46108854 G/A 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46108837_46110765:COG3;ENSG00000165837:ENST00000504261:exon_46108657_46109001:FAM194B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 46 39 85 22.4518925142709 19.9646998248573 2.48719268941359 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.664559561631052 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 135 165 300 65.8914236831863 84.4660377205501 -18.5746140373638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0326577297576897 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 20 39 59 9.76169239750908 19.9646998248573 -10.2030074273482 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0088535660683376 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 13 17 30 6.3451000583809 8.70256146211728 -2.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.466232196027525 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C T C 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 52313195 C/T 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:G G T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 52605134 A/C 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 A:C A C 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 52709938 A/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136098:ENST00000400357:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000378101:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000339406:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000258597:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000452082:exon_52709865_52709999:NEK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 51 50 101 24.8923156136482 25.5957690062273 -0.703453392579142 C:G G C 10 0.511915380124546 0.920907003700845 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 37 43 80 18.0591309353918 22.0123613453555 -3.95323040996368 T:C T C 10 0.511915380124546 0.433926156297544 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 73357819 C/G 1 12 2 14 5.85701543850545 1.02383076024909 4.83318467825636 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0132808222441933 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73357561_73357859:PIBF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 73369642 A/G 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:G A G 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73369497_73369695:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000489797:exon_73369497_73369695:PIBF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 3 18 21 1.46425385962636 9.21447684224183 -7.75022298261547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000679621139477514 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 0 12 0 12 5.85701543850545 0 5.85701543850545 G G 10 0.511915380124546 0.00050666091488124 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 28 9 37 13.6663693565127 4.60723842112091 9.0591309353918 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00282496115213607 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G A G 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77575137 A/G 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:G A G 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77633748 C/T 1 27 29 56 13.1782847366373 14.8455460236118 -1.66726128697457 T:C C T 10 0.511915380124546 0.689869899308309 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77633658_77633761:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77633658_77633761:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77633658_77633761:MYCBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77738592 T/C 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C T C 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77738589_77738676:MYCBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77738664 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77738589_77738676:MYCBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 100518580 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000444838:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000419700:exon_100518571_100518661:CLYBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 101287365 T/C 1 3 9 12 1.46425385962636 4.60723842112091 -3.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0856105496561893 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:G A G 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 103518162 C/A 1 58 73 131 28.3089079527763 37.3698227490919 -9.06091479631552 A:C C A 10 0.511915380124546 0.116415141315927 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103517068_103518731:ERCC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 100 103 203 48.8084619875454 52.7272841528282 -3.91882216528283 C:G G C 10 0.511915380124546 0.623238699188394 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 5 13 18 2.44042309937727 6.6548999416191 -4.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.058592754437712 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 39 44 83 19.0353001751427 22.52427672548 -3.48897655033731 A:G G A 10 0.511915380124546 0.510288687956788 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 125 87 212 61.0105774844318 44.5366380708355 16.4739394135963 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0276846853755198 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 52 40 92 25.3804002335236 20.4766152049818 4.90378502854177 A:G A G 10 0.511915380124546 0.348117703222407 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 113527967 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000495930:exon_113527746_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000493489:exon_113527817_113527990:ATP11A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 113536132 T/C 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C T C 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113536127_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113536130_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113536130_113538272:ATP11A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 38 36 74 18.5472155552673 18.4289536844837 0.118261870783599 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 52 61 113 25.3804002335236 31.2268381875973 -5.84643795407369 A:G A G 10 0.511915380124546 0.300787723607881 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:C C A 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 49 46 95 23.9161463738972 23.5481074857291 0.368038888168133 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 21 31 52 10.2497770173845 15.8693767838609 -5.61959976647639 T:C T C 10 0.511915380124546 0.128334913651689 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 21 9 30 10.2497770173845 4.60723842112091 5.64253859626362 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0445249110642641 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 19 46 65 9.27360777763363 23.5481074857291 -14.2744997080955 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000433580879392366 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 22 51 73 10.73786163726 26.1076843863518 -15.3698227490919 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000374100774508473 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 33 46 79 16.10679245589 23.5481074857291 -7.44131502983913 A:G G A 10 0.511915380124546 0.114585163251259 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 32 40 72 15.6187078360145 20.4766152049818 -4.85790736896731 C:G G C 10 0.511915380124546 0.288887603848309 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 21699167 C/T 1 93 263 356 45.3918696484172 134.633744972756 -89.2418753243384 T:C C T 10 0.511915380124546 8.50552126456005e-22 ENSG00000092199:ENST00000449098:exon_21699156_21699231:HNRNPC;ENSG00000092199:ENST00000320084:exon_21699117_21699231:HNRNPC;ENSG00000092199:ENST00000336053:exon_21699117_21699231:HNRNPC;ENSG00000092199:ENST00000420743:exon_21699156_21699231:HNRNPC;ENSG00000092199:ENST00000452166:exon_21699156_21699231:HNRNPC;ENSG00000092199:ENST00000445284:exon_21699117_21699231:HNRNPC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 21961333 A/G 1 57 63 120 27.8208233329009 32.2506689478464 -4.42984561494551 A:G A G 10 0.511915380124546 0.465256555591783 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 6 11 17 2.92850771925272 5.63106918137001 -2.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.228802164450189 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 302 311 613 147.401555202387 159.205683218734 -11.8041280163467 T:G G T 10 0.511915380124546 0.352836489260939 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 15 5 20 7.32126929813181 2.55957690062273 4.76169239750908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0425244406238397 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 16 6 22 7.80935391800726 3.07149228074728 4.73786163725999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0539349281471928 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 40 27 67 19.5233847950182 13.8217152633627 5.70166953165542 C:G G C 10 0.511915380124546 0.17963271455776 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23531389 G/A 1 131 114 245 63.9390852036845 58.3583533341982 5.58073186948624 A:G G A 10 0.511915380124546 0.482811882744216 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23531377_23531484:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000473758:exon_23531377_23531484:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000338631:exon_23531377_23531484:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000357481:exon_23531377_23531484:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23531377_23531484:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000397341:exon_23531377_23531484:ACIN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 52 64 116 25.3804002335236 32.7625843279709 -7.38218409444733 A:G A G 10 0.511915380124546 0.193397704407913 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 131 131 262 63.9390852036845 67.0609147963155 -3.12182959263104 T:C T C 10 0.511915380124546 0.711155513796337 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 21 18 39 10.2497770173845 9.21447684224183 1.03530017514271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.751950389677339 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24030666 G/A 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 A:G G A 10 0.511915380124546 0.414352368963774 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24033070 C/T 1 14 6 20 6.83318467825636 3.07149228074728 3.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.117374955156906 ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24422995 T/G 1 17 10 27 8.29743853788272 5.11915380124546 3.17828473663726 T:G T G 10 0.511915380124546 0.251422647805329 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24423007 G/A 1 17 10 27 8.29743853788272 5.11915380124546 3.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.251422647805329 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 41 9 50 20.0114694148936 4.60723842112091 15.4042309937727 A:G A G 10 0.511915380124546 1.16830844867568e-05 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 29 8 37 14.1544539763882 4.09532304099637 10.0591309353918 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.000846715548456973 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 18 16 34 8.78552315775817 8.19064608199274 0.594877075765437 A:T A T 10 0.511915380124546 0.86547169107651 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 34 45 79 16.5948770757654 23.0361921056046 -6.44131502983913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.176517779579360 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 24 27 51 11.7140308770109 13.8217152633627 -2.10768438635184 A:G G A 10 0.511915380124546 0.577892454939528 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 26 22 48 12.6902001167618 11.26213836274 1.42806175402179 T:C C T 10 0.511915380124546 0.773193056072892 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 65 65 130 31.7255002919045 33.2744997080955 -1.54899941619098 A:G G A 10 0.511915380124546 0.793123167377274 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 67 58 125 32.7016695316554 29.6910920472237 3.01057748443175 T:C T C 10 0.511915380124546 0.654803354394109 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 A:C A C 10 0.511915380124546 0.684928800484095 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24785092 G/T 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 26 11 37 12.6902001167618 5.63106918137001 7.0591309353918 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0213652829938614 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 31 26 57 15.1306232161391 13.3097998832382 1.82082333290088 T:C C T 10 0.511915380124546 0.691758908540314 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 26 26 52 12.6902001167618 13.3097998832382 -0.619599766476391 A:G G A 10 0.511915380124546 0.890415585476036 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 91 121 212 44.4157004086663 61.9417609950701 -17.5260605864037 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0162309500955472 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 115 154 269 56.1297312856772 78.8349685391801 -22.7052372535029 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00599474033569932 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 110 112 222 53.6893081862999 57.3345225739491 -3.6452143876492 C:G C G 10 0.511915380124546 0.638851104747989 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 112 114 226 54.6654774260509 58.3583533341982 -3.69287590814739 A:C C A 10 0.511915380124546 0.641738202799735 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 46 29 75 22.4518925142709 14.8455460236118 7.60634649065905 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0837708512087738 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 46 29 75 22.4518925142709 14.8455460236118 7.60634649065905 A:T T A 10 0.511915380124546 0.0837708512087738 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 40 22 62 19.5233847950182 11.26213836274 8.26124643227815 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0415872520286374 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 31570401 G/A 1 37 19 56 18.0591309353918 9.72639222236637 8.33273871302543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0316872396859584 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399323:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31570386_31570530:HECTD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 41 30 71 20.0114694148936 15.3574614037364 4.65400801115724 T:C C T 10 0.511915380124546 0.286957510698704 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 A:G A G 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 9 6 15 4.39276157887909 3.07149228074728 1.32126929813181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.608797469772918 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 25 29 54 12.2021154968864 14.8455460236118 -2.64343052672548 A:G G A 10 0.511915380124546 0.498388414618411 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 35497285 T/C 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57307152977622 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 35783659 C/T 1 162 272 434 79.0697084198236 139.240983393876 -60.1712749740529 T:C C T 10 0.511915380124546 6.9183566174346e-09 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35783567_35783661:PSMA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 35 33 68 17.0829616956409 16.89320754411 0.189754151530874 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 596 603 1199 290.898433445771 308.684974215101 -17.7865407693306 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.312015608967156 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 26 23 49 12.6902001167618 11.7740537428646 0.916146373897247 A:G G A 10 0.511915380124546 0.886605782074456 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 181 163 344 88.3433161974572 83.442206960301 4.90110923715619 T:C C T 10 0.511915380124546 0.627491085020247 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 A:G A G 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 C:G G C 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C T C 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 34 31 65 16.5948770757654 15.8693767838609 0.725500291904513 T:C T C 10 0.511915380124546 0.901631371744221 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 20 13 33 9.76169239750908 6.6548999416191 3.10679245588998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.300741145060542 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 57 51 108 27.8208233329009 26.1076843863518 1.71313894654903 C:G G C 10 0.511915380124546 0.773287632848305 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 103 87 190 50.2727158471718 44.5366380708355 5.73607777633627 T:C C T 10 0.511915380124546 0.425163479665559 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 A:T T A 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 T:G G T 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 34 28 62 16.5948770757654 14.3336306434873 2.26124643227815 T:G T G 10 0.511915380124546 0.612427235637947 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 45 30 75 21.9638078943954 15.3574614037364 6.60634649065905 A:G G A 10 0.511915380124546 0.134311827543288 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 31 28 59 15.1306232161391 14.3336306434873 0.796992572651789 T:C C T 10 0.511915380124546 0.896693274135929 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 53345378 G/A 1 18 11 29 8.78552315775817 5.63106918137001 3.15445397638817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.268874799109534 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53345300_53345407:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53345300_53345407:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53345300_53345407:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000399304:exon_53345300_53345407:FERMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 15 17 32 7.32126929813181 8.70256146211728 -1.38129216398547 T:G G T 10 0.511915380124546 0.72441756587225 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 13 32 45 6.3451000583809 16.3812921639855 -10.0361921056046 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00274042285270403 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 59789727 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59789610_59789943:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59789610_59789943:DAAM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 61857969 A/G 1 32 21 53 15.6187078360145 10.7502229826155 4.86848485339906 A:G A G 10 0.511915380124546 0.216194455646066 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 61924239 G/A 1 50 21 71 24.4042309937727 10.7502229826155 13.6540080111572 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.00122738790698885 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 61924241 A/C 1 51 20 71 24.8923156136482 10.2383076024909 14.6540080111572 A:C A C 10 0.511915380124546 0.000502638366612 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 61997226 C/T 1 24 27 51 11.7140308770109 13.8217152633627 -2.10768438635184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.577892454939528 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61997125_61997313:PRKCH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:C C A 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 5 20 25 2.44042309937727 10.2383076024909 -7.79788450311365 A:C C A 10 0.511915380124546 0.00208268844221083 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 17 22 39 8.29743853788272 11.26213836274 -2.96469982485729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.423612921109062 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 A:G A G 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 65511154 C/T 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:C C T 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000125954:ENST00000448390:exon_65511029_65511161:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000246166:exon_65511029_65511161:FNTB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 68156965 T/C 1 94 81 175 45.8799542682927 41.4651457900882 4.41480847820446 T:C T C 10 0.511915380124546 0.545399991085619 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68156929_68157138:RDH11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 68249499 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68249497_68250242:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68249497_68250242:ZFYVE26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 68264867 A/G 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G A G 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68264731_68265339:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68264731_68265339:ZFYVE26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 73404680 A/C 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:C A C 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73404679_73404778:DCAF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 52 31 83 25.3804002335236 15.8693767838609 9.51102344966268 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0374006853417745 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 74036370 G/T 1 43 27 70 20.9876386546445 13.8217152633627 7.16592339128178 T:G G T 10 0.511915380124546 0.094524081100605 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 4 14 18 1.95233847950182 7.16681532174364 -5.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0169810396326105 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 A:G G A 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 75470075 G/C 1 71 72 143 34.6540080111572 36.8579073689673 -2.20389935781007 C:G G C 10 0.511915380124546 0.738349376097573 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75469978_75470098:EIF2B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 28 52 80 13.6663693565127 26.6195997664764 -12.9532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00486049954516709 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 76549752 G/A 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 25 20 45 12.2021154968864 10.2383076024909 1.96380789439543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.655157374364705 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 78021766 G/A 1 29 16 45 14.1544539763882 8.19064608199274 5.96380789439543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0999028766467087 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78021643_78021862:SPTLC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 26 28 54 12.6902001167618 14.3336306434873 -1.64343052672548 A:C A C 10 0.511915380124546 0.68470828279398 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 90756760 A/T 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 A:T A T 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90756565_90756951:C14orf102 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 26 13 39 12.6902001167618 6.6548999416191 6.03530017514271 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0558737113558714 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 51 41 92 24.8923156136482 20.9885305851064 3.90378502854177 A:G A G 10 0.511915380124546 0.465688373937773 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 91755603 G/A 1 18 16 34 8.78552315775817 8.19064608199274 0.594877075765437 A:G G A 10 0.511915380124546 0.86547169107651 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91755449_91755687:CCDC88C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 91773494 G/A 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 17 25 42 8.29743853788272 12.7978845031136 -4.50044596523093 A:G A G 10 0.511915380124546 0.168974351058953 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92436176 C/T 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92435462_92436237:TRIP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 6 12 18 2.92850771925272 6.14298456149455 -3.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.159007913775557 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92460227 C/T 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92460153_92460256:TRIP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92472416 G/C 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 C:G G C 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 16 18 34 7.80935391800726 9.21447684224183 -1.40512292423456 T:C C T 10 0.511915380124546 0.732213732981262 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 195 148 343 95.1765008757135 75.7634762584328 19.4130246172807 T:C:G T G 10 0.511915380124546 0.0399836003131343 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 19 21 40 9.27360777763363 10.7502229826155 -1.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.75222996223045 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 93 93 186 45.3918696484172 47.6081303515828 -2.21626070316555 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769503854052375 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 95 88 183 46.3680388881681 45.04855345096 1.31948543720809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.882531854142697 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93118741 G/T 1 91 103 194 44.4157004086663 52.7272841528282 -8.31158374416191 T:G G T 10 0.511915380124546 0.25062823889866 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 70 57 127 34.1659233912818 29.1791766670991 4.98674672418266 T:C C T 10 0.511915380124546 0.424495125968765 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C T C 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 93708759 A/C 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 A:C A C 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000011114:ENST00000355125:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000334746:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000442779:exon_93703896_93709434:BTBD7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 136 125 261 66.3795083030618 63.9894225155682 2.39008578749351 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.804473598934901 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 94546047 G/C 1 139 117 256 67.8437621626881 59.8940994745719 7.94966268811623 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.348396870717208 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94545625_94546088:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94545371_94546093:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94545706_94546088:DDX24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 94935901 G/C 1 1 12 13 0.488084619875454 6.14298456149455 -5.6548999416191 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00147143006215042 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94935550_94936004:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94935550_94936194:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94935550_94936196:SERPINA9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 100847707 A/G 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 100847930 A/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 8 23 31 3.90467695900363 11.7740537428646 -7.86937678386093 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00614276230470446 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 14 14 28 6.83318467825636 7.16681532174364 -0.333630643487286 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 67 76 143 32.7016695316554 38.9055688894655 -6.20389935781007 T:C T C 10 0.511915380124546 0.316047891260594 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102549873 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 331 336 667 161.556009178775 172.003567721847 -10.4475585430721 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.438587801208688 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 12 17 29 5.85701543850545 8.70256146211728 -2.84554602361183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.353974603380494 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 168 143 311 81.9982161390763 73.2038993578101 8.7943167812662 A:G G A 10 0.511915380124546 0.335069425013477 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 23 17 40 11.2259462571354 8.70256146211728 2.52338479501816 C:G G C 10 0.511915380124546 0.434838666804728 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 40 43 83 19.5233847950182 22.0123613453555 -2.48897655033732 T:C C T 10 0.511915380124546 0.660792560519437 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 94 72 166 45.8799542682927 36.8579073689673 9.02204689932537 A:G G A 10 0.511915380124546 0.163250185560926 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105707609 G/A 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000185024:ENST00000327359:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000379937:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000446501:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000392557:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000379932:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000332890:exon_105707602_105707751:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000440513:exon_105707602_105707751:BRF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105833679 A/G 1 17 14 31 8.29743853788272 7.16681532174364 1.13062321613908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72247502509934 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105833550_105833712:PACS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105843179 C/G 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 C:G C G 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105843105_105843262:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105843105_105843262:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105843105_105843262:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105843105_105843262:PACS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105848891 T/C 1 4 9 13 1.95233847950182 4.60723842112091 -2.6548999416191 T:C T C 10 0.511915380124546 0.170663775067474 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105848814_105848918:PACS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 47 84 131 22.9399771341463 43.0008919304619 -20.0609147963155 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000449617734619614 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 106066690 A/C 1 5 36 41 2.44042309937727 18.4289536844837 -15.9885305851064 A:C A C 10 0.511915380124546 2.95785528355608e-07 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 106067298 T/C 1 3 36 39 1.46425385962636 18.4289536844837 -16.9646998248573 T:C T C 10 0.511915380124546 1.13397772037513e-08 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 106067958 C/T 1 5 24 29 2.44042309937727 12.2859691229891 -9.84554602361183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000255952010410365 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 106204113 C/T 0 0 104 104 0 53.2391995329528 -53.2391995329528 T C T 10 0.511915380124546 4.01321812329539e-33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 507 4852 5359 247.458902276855 2483.8134243643 -2236.35452208744 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 40 53 93 19.5233847950182 27.1315151466009 -7.60813035158278 C:G G C 10 0.511915380124546 0.120479862397634 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 43 47 90 20.9876386546445 24.0600228658537 -3.07238421120914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.528794528822805 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 32928471 C/G 1 22 13 35 10.73786163726 6.6548999416191 4.08296169564089 C:G C G 10 0.511915380124546 0.179752545610438 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 32 28 60 15.6187078360145 14.3336306434873 1.28507719252724 A:G G A 10 0.511915380124546 0.796798438713155 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34542872 C/G 1 6 14 20 2.92850771925272 7.16681532174364 -4.23830760249092 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0728986200139047 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34544468 C/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34544371_34544585:SLC12A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34551082 G/A 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G G A 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34551014_34551145:SLC12A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 391 4 395 190.841086371303 2.04766152049818 188.793424850804 C:G C G 10 0.511915380124546 1.31873065008722e-106 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 426 26 452 207.924048066943 13.3097998832382 194.614248183705 A:G G A 10 0.511915380124546 2.63311964729651e-90 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 423 34 457 206.459794207317 17.4051229242346 189.054671283082 A:T:C T C 10 0.511915380124546 9.04185808735884e-83 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 48626647 A/G 1 140 166 306 68.3318467825636 84.9779531006746 -16.6461063181111 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0591909375031873 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000450740:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000249783:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000455976:exon_48626614_48626705:DUT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 48720652 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000166147:ENST00000316623:exon_48720543_48720668:FBN1;ENSG00000166147:ENST00000389087:exon_48720543_48720668:FBN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 49030822 C/G 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 C:G C G 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49030136_49031485:CEP152 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 49285001 G/C 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 C:G G C 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49280967_49285123:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49284327_49285123:SECISBP2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 49325289 A/C 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49325162_49325297:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49325162_49325297:SECISBP2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 50773787 A/G 1 29 17 46 14.1544539763882 8.70256146211728 5.45189251427089 A:G A G 10 0.511915380124546 0.139461620694362 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50773678_50774262:USP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 52664408 G/A 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52664321_52664560:MYO5A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 56959028 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000137871:ENST00000267807:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000455329:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396250:exon_56958877_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000260435:exon_56958998_56959184:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396245:exon_56958877_56959184:ZNF280D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 57213283 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140262:ENST00000267811:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000438423:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000452095:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000333725:exon_57213224_57213296:TCF12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 3 15 18 1.46425385962636 7.67873070186819 -6.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0037081362869019 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 59453422 G/A 1 125 134 259 61.0105774844318 68.5966609366892 -7.58608345225741 A:G G A 10 0.511915380124546 0.351803047059368 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 14 21 35 6.83318467825636 10.7502229826155 -3.91703830435911 A:G A G 10 0.511915380124546 0.236331178773885 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 35 27 62 17.0829616956409 13.8217152633627 3.26124643227815 T:G T G 10 0.511915380124546 0.447099226142731 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 132 100 232 64.4271698235599 51.1915380124546 13.2356318111053 A:G G A 10 0.511915380124546 0.087708274572443 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 19 21 40 9.27360777763363 10.7502229826155 -1.47661520498184 A:G G A 10 0.511915380124546 0.75222996223045 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 T:G T G 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 66612965 T/C 1 1 8 9 0.488084619875454 4.09532304099637 -3.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0188251691270287 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 A:G A G 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 66793677 G/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 C:G G C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 67457335 A/G 1 16 24 40 7.80935391800726 12.2859691229891 -4.47661520498184 A:G A G 10 0.511915380124546 0.205233259279333 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67457233_67457426:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67457233_67457426:SMAD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 68489810 G/T 1 17 15 32 8.29743853788272 7.67873070186819 0.61870783601453 T:G G T 10 0.511915380124546 0.861316316478707 ENSG00000129007:ENST00000478113:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000448060:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395463:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467188:exon_68489778_68490088:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467889:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68489778_68489966:CALML4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 68570749 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68570141_68571003:FEM1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 32 13 45 15.6187078360145 6.6548999416191 8.96380789439543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0104163180463861 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 48 48 96 23.4280617540218 24.5719382459782 -1.14387649195641 T:C C T 10 0.511915380124546 0.838736486990261 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 34 45 79 16.5948770757654 23.0361921056046 -6.44131502983913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.176517779579360 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 70350607 C/T 1 49 31 80 23.9161463738972 15.8693767838609 8.04676959003632 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.0743767880619111 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70350489_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70350489_70350630:TLE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 71125093 G/A 1 10 31 41 4.88084619875454 15.8693767838609 -10.9885305851064 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000801134866629578 ENSG00000166173:ENST00000299213:exon_71123877_71125455:LARP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 71125204 A/G 1 4 22 26 1.95233847950182 11.26213836274 -9.3097998832382 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000241711116005363 ENSG00000166173:ENST00000299213:exon_71123877_71125455:LARP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 5 11 16 2.44042309937727 5.63106918137001 -3.19064608199274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.135644795559592 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 74002006 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000103855:ENST00000318424:exon_74001989_74002030:CD276;ENSG00000103855:ENST00000318443:exon_74001989_74002030:CD276 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 656 616 1272 320.183510638298 315.33987415672 4.84363648157751 T:C C T 10 0.511915380124546 0.800737708382633 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 23 2 25 11.2259462571354 1.02383076024909 10.2021154968863 T:C T C 10 0.511915380124546 2.18033923333469e-05 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75182410 C/T 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75182363_75182430:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75182397_75182430:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75182397_75182430:MPI HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 62 67 129 30.2612464322781 34.2983304683446 -4.03708403606643 A:G A G 10 0.511915380124546 0.482617897887905 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 20 13 33 9.76169239750908 6.6548999416191 3.10679245588998 A:G A G 10 0.511915380124546 0.300741145060542 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 59 67 126 28.7969925726518 34.2983304683446 -5.50133789569279 T:G T G 10 0.511915380124546 0.328827879560302 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 75631598 C/T 1 11 1 12 5.36893081862999 0.511915380124546 4.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00651276076484706 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 76496232 G/A 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000169758:ENST00000388942:exon_76496082_76497304:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000484722:exon_76496082_76497303:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000305457:exon_76496082_76497301:C15orf27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 76496340 C/T 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000169758:ENST00000388942:exon_76496082_76497304:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000484722:exon_76496082_76497303:C15orf27;ENSG00000169758:ENST00000305457:exon_76496082_76497301:C15orf27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 77325279 C/T 1 21 7 28 10.2497770173845 3.58340766087182 6.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0132277180436573 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77325203_77325293:PSTPIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 38 89 127 18.5472155552673 45.5604688310846 -27.0132532758173 A:T T A 10 0.511915380124546 1.80836478848706e-06 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 17 8 25 8.29743853788272 4.09532304099637 4.20211549688635 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.110240985243576 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 79054773 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79054745_79054907:ADAMTS7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 79054900 C/G 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79054745_79054907:ADAMTS7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 105 72 177 51.2488850869227 36.8579073689673 14.3909777179554 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0349979968630120 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 82443830 T/C 1 34 44 78 16.5948770757654 22.52427672548 -5.92939964971458 T:C T C 10 0.511915380124546 0.212600328035611 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 83481859 T/A 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 A:T T A 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83481855_83482028:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83481855_83482028:WHAMM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 A:G A G 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 85159553 C/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000176371:ENST00000379358:exon_85159540_85159839:ZSCAN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 85188775 G/A 1 19 20 39 9.27360777763363 10.2383076024909 -0.964699824857293 A:G G A 10 0.511915380124546 0.873019589441929 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 85326955 G/A 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85325885_85328126:ZNF592 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 26 30 56 12.6902001167618 15.3574614037364 -2.66726128697457 A:G G A 10 0.511915380124546 0.50584998529588 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 39 36 75 19.0353001751427 18.4289536844837 0.606346490659053 T:C C T 10 0.511915380124546 0.908545584361376 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 35 28 63 17.0829616956409 14.3336306434873 2.7493310521536 T:C C T 10 0.511915380124546 0.529841286579674 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 39 33 72 19.0353001751427 16.89320754411 2.14209263103269 A:G A G 10 0.511915380124546 0.638827488083954 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 17 15 32 8.29743853788272 7.67873070186819 0.61870783601453 C:G G C 10 0.511915380124546 0.861316316478707 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89195372 T/C 1 280 379 659 136.663693565127 194.015929067203 -57.3522355020758 T:C:G T C 10 0.511915380124546 8.50415677856831e-06 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 347 249 596 169.365363096783 127.466929651012 41.8984334457706 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000659733229426907 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89442606 C/T 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89441914_89442763:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89441916_89442763:MFGE8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89450587 G/T 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89450426_89450607:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89450426_89450607:MFGE8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 54 49 103 26.3565694732745 25.0838536261028 1.27271584717177 T:C T C 10 0.511915380124546 0.844023645629967 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:T T A 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 33 26 59 16.10679245589 13.3097998832382 2.79699257265179 T:C T C 10 0.511915380124546 0.51596135333126 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 A:C C A 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 40 36 76 19.5233847950182 18.4289536844837 1.0944311105345 C:G G C 10 0.511915380124546 0.81949203651484 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C T C 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:T A T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91459475 G/A 1 11 15 26 5.36893081862999 7.67873070186819 -2.30979988323819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.434416667545016 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91459353_91459486:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91459353_91459486:MAN2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91461545 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91461424_91461618:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91461424_91461618:MAN2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 C:G G C 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:C A C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91486305 C/T 1 35 68 103 17.0829616956409 34.8102458484691 -17.7272841528282 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00051152891371343 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91486142_91486312:UNC45A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91489919 A/G 1 32 39 71 15.6187078360145 19.9646998248573 -4.34599198884276 A:G A G 10 0.511915380124546 0.342619412030228 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91489844_91490144:UNC45A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91513674 T/C 1 39 28 67 19.0353001751427 14.3336306434873 4.70166953165542 T:C T C 10 0.511915380124546 0.272621075298993 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91513634_91513744:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91513634_91513744:PRC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 63 62 125 30.7493310521536 31.7387535677219 -0.989422515568247 T:C C T 10 0.511915380124546 0.858634468346355 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 93536170 C/G 1 25 24 49 12.2021154968864 12.2859691229891 -0.0838536261027514 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 14 14 28 6.83318467825636 7.16681532174364 -0.333630643487286 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101113862 C/T 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 11 17 28 5.36893081862999 8.70256146211728 -3.33363064348729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.257214713691272 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 10 20 30 4.88084619875454 10.2383076024909 -5.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0663852382613355 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101567547 G/C 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 C:G G C 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101567466_101567586:LRRK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 29 17 46 14.1544539763882 8.70256146211728 5.45189251427089 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.139461620694362 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 17 20 37 8.29743853788272 10.2383076024909 -1.9408690646082 T:C C T 10 0.511915380124546 0.62244012208179 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 23 7 30 11.2259462571354 3.58340766087182 7.64253859626362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00559681639165783 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 312539 A/G 1 29 23 52 14.1544539763882 11.7740537428646 2.38040023352361 A:G A G 10 0.511915380124546 0.579674438793655 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_312423_312552:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_312507_312552:ITFG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 25 22 47 12.2021154968864 11.26213836274 0.939977134146341 T:C T C 10 0.511915380124546 0.884225865636392 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 35 32 67 17.0829616956409 16.3812921639855 0.701669531655419 A:C C A 10 0.511915380124546 0.903133011737456 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 723650 C/T 1 47 27 74 22.9399771341463 13.8217152633627 9.1182618707836 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0363470446494601 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 11 7 18 5.36893081862999 3.58340766087182 1.78552315775817 T:C C T 10 0.511915380124546 0.48295319218206 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 C:G G C 10 0.511915380124546 0.389340745110578 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 4 9 13 1.95233847950182 4.60723842112091 -2.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.170663775067474 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 38 32 70 18.5472155552673 16.3812921639855 2.16592339128178 T:C T C 10 0.511915380124546 0.633955897283213 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 36 39 75 17.5710463155163 19.9646998248573 -2.39365350934095 A:G G A 10 0.511915380124546 0.644448386955135 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 33 36 69 16.10679245589 18.4289536844837 -2.32216122859367 A:G A G 10 0.511915380124546 0.630631749768949 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 A:G G A 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 929711 C/T 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_929570_929737:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_929570_929737:LMF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 300 288 588 146.425385962636 147.431629475869 -1.00624351323304 A:G A G 10 0.511915380124546 0.934308486397848 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 239 242 481 116.652224150234 123.88352199014 -7.2312978399066 A:G A G 10 0.511915380124546 0.523289047460878 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1400822 G/A 1 108 134 242 52.713138946549 68.5966609366892 -15.8835219901401 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0460282399886078 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400808_1401001:C16orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 16 12 28 7.80935391800726 6.14298456149455 1.66636935651271 A:T T A 10 0.511915380124546 0.574667284257565 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1552761 C/T 1 21 18 39 10.2497770173845 9.21447684224183 1.03530017514271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.751950389677339 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552646_1552762:TELO2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 34 56 90 16.5948770757654 28.6672612869746 -12.0723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0113309438228648 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1573890 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1573829_1573957:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1573829_1573957:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1573829_1573957:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1573829_1573957:IFT140 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1614097 A/G 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1613998_1614163:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1613998_1614163:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1613998_1614163:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1613998_1614163:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000439987:exon_1613998_1614163:IFT140 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 111 106 217 54.1773928061754 54.2630302932019 -0.0856374870264744 T:C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1877698 C/G 1 30 25 55 14.6425385962636 12.7978845031136 1.84465409314997 C:G C G 10 0.511915380124546 0.68643098678497 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 1877913 C/G 1 39 29 68 19.0353001751427 14.8455460236118 4.18975415153088 C:G C G 10 0.511915380124546 0.333320731072729 ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2011507 C/T 1 308 275 583 150.33006292164 140.77672953425 9.5533333873897 T:C C T 10 0.511915380124546 0.431563567466377 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2011498_2011637:NDUFB10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2048323 C/G 1 117 112 229 57.1059005254281 57.3345225739491 -0.228622048521018 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2047768_2048586:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2047768_2048586:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2047768_2048586:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2047768_2048586:ZNF598 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2305539 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2578131 C/T 1 36 25 61 17.5710463155163 12.7978845031136 4.7731618124027 T:C C T 10 0.511915380124546 0.249694569864454 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000293971:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000429721:exon_2577991_2578149:AMDHD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 96 97 193 46.8561235080436 49.655791872081 -2.79966836403737 T:C C T 10 0.511915380124546 0.719040590239827 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 160 158 318 78.0935391800726 80.8826300596783 -2.78909087960562 A:G A G 10 0.511915380124546 0.779225932133914 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 171 143 314 83.4624699987026 73.2038993578101 10.2585706408926 A:C C A 10 0.511915380124546 0.259056277632459 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 169 128 297 82.4863007589517 65.5251686559419 16.9611321030098 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0552605433214183 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 580 511 1091 283.089079527763 261.588759243643 21.5003202841203 T:G G T 10 0.511915380124546 0.203379676454909 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2821525 G/A 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 2979984 G/A 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2979614_2980011:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2979614_2980011:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2979614_2980011:FLYWCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 89 71 160 43.4395311689154 36.3459919888428 7.09353918007265 T:G G T 10 0.511915380124546 0.269213307218893 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 13 19 32 6.3451000583809 9.72639222236637 -3.38129216398547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.288965937980986 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3452193 T/G 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 T:G T G 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3586230 C/T 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000445795:exon_3586122_3587669:CLUAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 172 168 340 83.9505546185781 86.0017838609237 -2.05122924234563 C:G G C 10 0.511915380124546 0.828443682003783 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 32 23 55 15.6187078360145 11.7740537428646 3.84465409314997 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345658788939129 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 15 14 29 7.32126929813181 7.16681532174364 0.154453976388168 T:C:G C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 6 17 23 2.92850771925272 8.70256146211728 -5.77405374286456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.020314070119371 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 10 3 13 4.88084619875454 1.53574614037364 3.3451000583809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0934748740494892 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 5135657 C/T 1 20 21 41 9.76169239750908 10.7502229826155 -0.988530585106385 T:C C T 10 0.511915380124546 0.757990196027559 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5134305_5135733:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5134305_5135733:FAM86A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 C:G G C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 12 18 30 5.85701543850545 9.21447684224183 -3.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.273551093070692 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 62 52 114 30.2612464322781 26.6195997664764 3.64164666580176 C:G C G 10 0.511915380124546 0.513135533781846 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:C C A 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 95 91 186 46.3680388881681 46.5842995913337 -0.216260703165545 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 15 18 33 7.32126929813181 9.21447684224183 -1.89320754411002 A:G G A 10 0.511915380124546 0.602309440775946 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 1 8 9 0.488084619875454 4.09532304099637 -3.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0188251691270287 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 56 66 122 27.3327387130254 33.78641508822 -6.4536763751946 C:G G C 10 0.511915380124546 0.277107765792446 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 12 14 26 5.85701543850545 7.16681532174364 -1.30979988323819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.696332422692757 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 21 15 36 10.2497770173845 7.67873070186819 2.57104631551635 A:C C A 10 0.511915380124546 0.409845893616438 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 17 10 27 8.29743853788272 5.11915380124546 3.17828473663726 C:G C G 10 0.511915380124546 0.251422647805329 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 48 66 114 23.4280617540218 33.78641508822 -10.3583533341982 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0605883537227743 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 15820863 C/T 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15820705_15820911:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15820705_15820911:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15820705_15820911:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15820705_15820911:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15820705_15820911:MYH11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 25 3 28 12.2021154968864 1.53574614037364 10.6663693565127 T:C T C 10 0.511915380124546 3.1141771375053e-05 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 16162019 T/C 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16162013_16162159:ABCC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 18861335 A/G 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18861271_18861448:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18861271_18861448:SMG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 12 20 32 5.85701543850545 10.2383076024909 -4.38129216398547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.156458779115569 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 9 3 12 4.39276157887909 1.53574614037364 2.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.147368325849718 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 19547747 C/G 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 717 667 1384 349.956672450701 341.447558543072 8.50911390762838 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.667061973744855 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 A:G A G 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 55 55 110 26.84465409315 28.15534590685 -1.31069181370005 T:C:G C G 10 0.511915380124546 0.848919411880045 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 9 26 35 4.39276157887909 13.3097998832382 -8.91703830435911 A:C A C 10 0.511915380124546 0.00342606256932532 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 C:G G C 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 86 82 168 41.975277309289 41.9770611702128 -0.00178386092372307 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 64 46 110 31.2374156720291 23.5481074857291 7.68930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 0.152959984076096 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 24581031 G/A 1 76 51 127 37.0944311105345 26.1076843863518 10.9867467241827 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0618980498901085 ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24580066_24581820:RBBP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 177 143 320 86.3909777179554 73.2038993578101 13.1870783601453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.146121523803071 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 75 71 146 36.606346490659 36.3459919888428 0.260354501816288 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 28 21 49 13.6663693565127 10.7502229826155 2.91614637389725 A:G A G 10 0.511915380124546 0.47547089621082 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 49 50 99 23.9161463738972 25.5957690062273 -1.67962263233005 A:C A C 10 0.511915380124546 0.763577201343884 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27373964 T/C 1 43 37 80 20.9876386546445 18.9408690646082 2.04676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.656627993469593 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 56 36 92 27.3327387130254 18.4289536844837 8.90378502854177 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0757345093180361 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 86 56 142 41.975277309289 28.6672612869746 13.3080160223145 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.0287935274743093 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 38 34 72 18.5472155552673 17.4051229242346 1.14209263103269 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.814502260395669 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28118970 G/A 1 76 57 133 37.0944311105345 29.1791766670991 7.91525444343539 A:G G A 10 0.511915380124546 0.193108649894991 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28118843_28118998:XPO6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 54 46 100 26.3565694732745 23.5481074857291 2.8084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.617485969122393 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 13 15 28 6.3451000583809 7.67873070186819 -1.33363064348729 A:G A G 10 0.511915380124546 0.706603507317959 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28846840 T/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:G T G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.815475235631285 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 19 16 35 9.27360777763363 8.19064608199274 1.08296169564089 A:G A G 10 0.511915380124546 0.738417177093215 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28925978 T/C 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.110373270443025 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 170 161 331 82.9743853788272 82.4183762000519 0.556009178775298 C:G C G 10 0.511915380124546 0.956219831552423 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 29675914 G/A 1 221 210 431 107.866700992475 107.502229826155 0.364471166320698 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 20 16 36 9.76169239750908 8.19064608199274 1.57104631551634 T:C C T 10 0.511915380124546 0.621326824164447 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 30094660 G/A 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G G A 10 0.511915380124546 0.79973740803312 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 5 12 17 2.44042309937727 6.14298456149455 -3.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0898784303233661 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 57 61 118 27.8208233329009 31.2268381875973 -3.40601485469642 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.580837273162627 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 30666119 G/C 0 71 0 71 34.6540080111572 0 34.6540080111572 G G 10 0.511915380124546 2.33101644142308e-21 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 31123632 C/T 1 142 135 277 69.3080160223145 69.1085763168137 0.199439705500765 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31123442_31123888:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31123442_31123888:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31123190_31123888:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31123190_31123888:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31123442_31124110:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31123442_31124110:BCKDK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 31336719 G/A 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000169896:ENST00000287497:exon_31336584_31336725:ITGAM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 C:G C G 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 16 11 27 7.80935391800726 5.63106918137001 2.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445588969149603 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 47271876 T/C 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:C T C 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000129636:ENST00000320640:exon_47271876_47271919:ITFG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 47697618 A/G 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000323584:exon_47697588_47697645:PHKB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 50106594 T/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C T C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000456734:exon_50106516_50106625:HEATR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 54 21 75 26.3565694732745 10.7502229826155 15.6063464906591 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000296951675383307 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 50745583 T/G 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:G T G 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 50830362 G/A 1 164 140 304 80.0458776595745 71.6681532174364 8.37772444213802 A:G G A 10 0.511915380124546 0.358733983735759 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50830235_50835846:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50830235_50835846:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50830235_50835846:CYLD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 53503934 G/A 1 21 12 33 10.2497770173845 6.14298456149455 4.10679245588998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.166690999506631 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 53503943 C/G 1 21 9 30 10.2497770173845 4.60723842112091 5.64253859626362 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0445249110642641 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 22 17 39 10.73786163726 8.70256146211728 2.03530017514271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.527014451735681 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 102 109 211 49.7846312272963 55.7987764335755 -6.0141452062792 T:C C T 10 0.511915380124546 0.409672961253793 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56500132 C/T 1 26 20 46 12.6902001167618 10.2383076024909 2.45189251427088 T:C C T 10 0.511915380124546 0.555781106582879 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56536660 T/C 1 14 8 22 6.83318467825636 4.09532304099637 2.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.289304325792258 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56536585_56536720:BBS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56553814 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56553658_56554195:BBS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 56553816 A/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56553658_56554195:BBS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 20 14 34 9.76169239750908 7.16681532174364 2.59487707576544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.396114031948566 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 22 7 29 10.73786163726 3.58340766087182 7.15445397638817 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00864130974150853 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 16 20 36 7.80935391800726 10.2383076024909 -2.42895368448366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.505535383228504 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58030401 T/C 1 9 2 11 4.39276157887909 1.02383076024909 3.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.066253572257908 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58201628 T/C 1 43 35 78 20.9876386546445 17.9170383043591 3.07060035028541 T:C T C 10 0.511915380124546 0.499155047383028 ENSG00000070770:ENST00000262506:exon_58201589_58201699:CSNK2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 83 87 170 40.5110234496627 44.5366380708355 -4.02561462117281 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540531652828494 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 74 58 132 36.1182618707836 29.6910920472237 6.42716982355993 A:C A C 10 0.511915380124546 0.296154236890383 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 73 54 127 35.6301772509081 27.6434305267255 7.98674672418267 A:G A G 10 0.511915380124546 0.182834376764696 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 66638804 G/A 1 10 17 27 4.88084619875454 8.70256146211728 -3.82171526336274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.177721968120350 ENSG00000140931:ENST00000424011:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000360086:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000361909:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000394108:exon_66638567_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000332807:exon_66638635_66638832:CMTM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 66759803 G/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000135720:ENST00000258198:exon_66759731_66759847:DYNC1LI2;ENSG00000135720:ENST00000443351:exon_66759731_66759847:DYNC1LI2;ENSG00000135720:ENST00000440564:exon_66759731_66759847:DYNC1LI2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 67237090 G/A 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000102890:ENST00000360833:exon_67237022_67237126:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000393997:exon_67237022_67237126:ELMO3;ENSG00000102890:ENST00000477898:exon_67237022_67237126:ELMO3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 347 330 677 169.365363096783 168.9320754411 0.433287655682392 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 31 28 59 15.1306232161391 14.3336306434873 0.796992572651789 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.896693274135929 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 15 7 22 7.32126929813181 3.58340766087182 3.73786163725999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.136223735342928 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 12 4 16 5.85701543850545 2.04766152049818 3.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0781379072177097 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 38 37 75 18.5472155552673 18.9408690646082 -0.393653509340947 T:C:G C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 68893953 T/C 1 2 9 11 0.976169239750908 4.60723842112091 -3.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0346208523981388 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68893787_68894427:TMCO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 69008037 C/T 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_69007931_69008071:TMCO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 40 24 64 19.5233847950182 12.2859691229891 7.23741567202906 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0798708209108779 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 237 233 470 115.676054910483 119.276283569019 -3.60022865853661 T:C C T 10 0.511915380124546 0.74690776691882 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 21 23 44 10.2497770173845 11.7740537428646 -1.52427672548002 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.654632097161359 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:G A G 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 11 3 14 5.36893081862999 1.53574614037364 3.83318467825636 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0583451092032102 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 56 87 143 27.3327387130254 44.5366380708355 -17.2038993578101 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0043453051676307 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 30 25 55 14.6425385962636 12.7978845031136 1.84465409314997 T:C C T 10 0.511915380124546 0.68643098678497 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70506907 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70506886_70507256:FUK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 35 28 63 17.0829616956409 14.3336306434873 2.7493310521536 T:C C T 10 0.511915380124546 0.529841286579674 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 19 13 32 9.27360777763363 6.6548999416191 2.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.381435496341429 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 30 29 59 14.6425385962636 14.8455460236118 -0.203007427348211 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 89 89 178 43.4395311689154 45.5604688310846 -2.12093766216918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.764698848065484 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 71319715 C/T 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 T:C C T 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 71683718 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000040199:ENST00000393524:exon_71678852_71683947:PHLPP2;ENSG00000040199:ENST00000356272:exon_71678852_71683947:PHLPP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 16 18 34 7.80935391800726 9.21447684224183 -1.40512292423456 T:G G T 10 0.511915380124546 0.732213732981262 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 24 34 58 11.7140308770109 17.4051229242346 -5.69109204722366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.149198054581234 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 72828403 A/G 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 72829630 A/G 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 41 0 41 20.0114694148936 0 20.0114694148936 C C 10 0.511915380124546 1.36349352673661e-12 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 75573884 T/C 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75572017_75574072:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75572017_75574072:TMEM231 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 75574030 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75572017_75574072:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75572017_75574072:TMEM231 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 T:G G T 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 30 30 60 14.6425385962636 15.3574614037364 -0.714922807472757 T:C T C 10 0.511915380124546 0.897643286761043 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 77775672 A/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G A G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77775479_77776151:NUDT7;ENSG00000140876:ENST00000437314:exon_77775479_77776151:NUDT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 84 91 175 40.9991080695381 46.5842995913337 -5.58519152179554 T:C C T 10 0.511915380124546 0.406496756722794 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 A:G G A 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 22 24 46 10.73786163726 12.2859691229891 -1.54810748572911 T:C T C 10 0.511915380124546 0.661302444171157 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 17 21 38 8.29743853788272 10.7502229826155 -2.45278444473275 T:C T C 10 0.511915380124546 0.516888244759979 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 97 102 199 47.344208127919 52.2153687727037 -4.87116064478465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.523522679609856 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 83948815 G/A 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 A:G G A 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83948561_83949785:MLYCD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 24 29 53 11.7140308770109 14.8455460236118 -3.13151514660094 T:C T C 10 0.511915380124546 0.412228942761961 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 84115459 G/A 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 84684525 G/A 1 17 19 36 8.29743853788272 9.72639222236637 -1.42895368448365 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.739399217771317 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84684458_84684536:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84684458_84684536:KLHL36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 25 26 51 12.2021154968864 13.3097998832382 -1.10768438635184 A:G A G 10 0.511915380124546 0.780907630340476 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 85697120 C/T 1 13 14 27 6.3451000583809 7.16681532174364 -0.821715263362741 T:C C T 10 0.511915380124546 0.848118384669247 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85695897_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85696972_85697220:KIAA0182 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 85711769 G/A 1 103 83 186 50.2727158471718 42.4889765503373 7.78373929683445 A:G G A 10 0.511915380124546 0.271472732095525 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 709 863 1572 346.051995491697 441.782973047483 -95.7309775557862 A:C:G G A 10 0.511915380124546 1.40947304155603e-06 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 C:G G C 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88061150 C/T 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88061089_88061256:BANP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88594567 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88594440_88594646:ZFPM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 3 11 14 1.46425385962636 5.63106918137001 -4.16681532174364 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0315678139197663 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 117 107 224 57.1059005254281 54.7749456733264 2.3309548521017 T:G G T 10 0.511915380124546 0.789340835684526 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 C:G G C 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 74 84 158 36.1182618707836 43.0008919304619 -6.88263005967826 T:C T C 10 0.511915380124546 0.300950949691324 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 T:C C T 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C T C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 12 0 12 5.85701543850545 0 5.85701543850545 G G 10 0.511915380124546 0.00050666091488124 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 A:C C A 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 19 24 43 9.27360777763363 12.2859691229891 -3.01236134535548 A:G G A 10 0.511915380124546 0.365314872753145 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 18 42 60 8.78552315775817 21.5004459652309 -12.7149228074728 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.00110673386859754 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89294044 A/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89294184 G/A 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 71 63 134 34.6540080111572 32.2506689478464 2.40333906331085 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72979791381681 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89355034 C/T 1 50 40 90 24.4042309937727 20.4766152049818 3.92761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 0.460731075057693 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89354936_89355078:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378332:exon_89354936_89355078:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378330:exon_89354936_89355078:ANKRD11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 42 36 78 20.4995540347691 18.4289536844837 2.07060035028541 A:G G A 10 0.511915380124546 0.652410906728269 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 2392 2000 4392 1167.49841074209 1023.83076024909 143.667650492994 T:G T G 10 0.511915380124546 1.46973462471122e-05 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 4029 3626 7655 1966.4929334782 1856.2051683316 110.287765146601 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.0118922619073271 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89799804 A/C 1 12 21 33 5.85701543850545 10.7502229826155 -4.89320754411002 A:C A C 10 0.511915380124546 0.115979317195962 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799710_89799820:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799710_89799820:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799710_89799820:ZNF276 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89799950 C/T 1 29 13 42 14.1544539763882 6.6548999416191 7.49955403476907 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.0209608996119076 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799890_89799965:ZNF276 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89805498 T/C 1 15 15 30 7.32126929813181 7.67873070186819 -0.357461403736378 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89849480 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89849415_89849510:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89849415_89849510:FANCA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89940232 A/C 1 102 94 196 49.7846312272963 48.1200457317073 1.66458549558899 A:C A C 10 0.511915380124546 0.830549753915451 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89939970_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000310554:exon_89940019_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89940019_89940267:TCF25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 88 92 180 42.95144654904 47.0962149714582 -4.14476842241827 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.551516062492535 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 89967223 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 11 25 36 5.36893081862999 12.7978845031136 -7.42895368448365 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0183535276441544 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 90103659 G/A 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90103640_90103807:GAS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 90106746 C/T 1 1 9 10 0.488084619875454 4.60723842112091 -4.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0100505466901609 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90106708_90106917:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000409873:exon_90106169_90106825:AC133919.6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 90109651 C/T 1 16 4 20 7.80935391800726 2.04766152049818 5.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0122812042506155 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 3 9 12 1.46425385962636 4.60723842112091 -3.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0856105496561893 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 18 29 47 8.78552315775817 14.8455460236118 -6.06002286585366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0813683347606948 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 75 48 123 36.606346490659 24.5719382459782 12.0344082446808 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0305709198697901 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 47 45 92 22.9399771341463 23.0361921056046 -0.0962149714582274 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 58 51 109 28.3089079527763 26.1076843863518 2.20122356642449 T:C C T 10 0.511915380124546 0.702228420108879 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 46 34 80 22.4518925142709 17.4051229242346 5.04676959003632 C:G G C 10 0.511915380124546 0.265822679553239 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 31 25 56 15.1306232161391 12.7978845031136 2.33273871302543 C:G G C 10 0.511915380124546 0.593696163298870 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 32 32 64 15.6187078360145 16.3812921639855 -0.762584327970941 T:C C T 10 0.511915380124546 0.900780253259295 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 28 29 57 13.6663693565127 14.8455460236118 -1.17917666709912 T:G G T 10 0.511915380124546 0.79198285260297 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 1561640 G/A 1 176 184 360 85.9028930980799 94.1924299429165 -8.28953684483655 A:G G A 10 0.511915380124546 0.399079073882699 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1561547_1561675:PRPF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 1686410 T/C 1 3 9 12 1.46425385962636 4.60723842112091 -3.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0856105496561893 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1686329_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1684986_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000476292:exon_1686404_1686452:SMYD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 C:G G C 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 1704296 C/A 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:C C A 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 2266799 G/A 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G G A 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2266759_2266893:SGSM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 2266812 T/C 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2266759_2266893:SGSM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 2266885 G/T 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 T:G G T 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2266759_2266893:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2266759_2266893:SGSM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 2268311 G/A 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2268191_2268351:SGSM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 2594958 C/T 1 104 78 182 50.7608004670472 39.9293996497146 10.8314008173326 T:C C T 10 0.511915380124546 0.119332296983935 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2594903_2594976:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2594903_2594976:KIAA0664 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3564084 T/C 1 13 1 14 6.3451000583809 0.511915380124546 5.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00190072443362425 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 10 15 25 4.88084619875454 7.67873070186819 -2.79788450311365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.318697161637912 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 175 90 265 85.4148084782045 46.0723842112091 39.3424242669953 T:C C T 10 0.511915380124546 1.38701822500900e-06 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3627473 C/T 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3627840 G/A 1 1 9 10 0.488084619875454 4.60723842112091 -4.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0100505466901609 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 50 43 93 24.4042309937727 22.0123613453555 2.39186964841723 T:C T C 10 0.511915380124546 0.678537740637735 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 4443756 C/T 1 81 82 163 39.5348542099118 41.9770611702128 -2.44220696030099 T:C C T 10 0.511915380124546 0.754098737773241 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4443643_4443779:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4443643_4443779:MYBBP1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 38 60 98 18.5472155552673 30.7149228074728 -12.1677072522055 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0151258836593495 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 4634758 C/G 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 C:G C G 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000161920:ENST00000293777:exon_4634708_4634869:MED11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 4720469 C/T 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 T:C C T 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4720441_4720554:PLD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 5085857 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 47 41 88 22.9399771341463 20.9885305851064 1.95144654903995 T:C T C 10 0.511915380124546 0.749279443680296 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 5283673 A/G 1 9 19 28 4.39276157887909 9.72639222236637 -5.33363064348729 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0572604976845011 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5283659_5283757:RABEP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 30 32 62 14.6425385962636 16.3812921639855 -1.73875356772185 T:C C T 10 0.511915380124546 0.704018449283421 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7099811 G/A 1 11 26 37 5.36893081862999 13.3097998832382 -7.9408690646082 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0125636936569039 ENSG00000132535:ENST00000399510:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000399506:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000302955:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000293813:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000380912:exon_7099792_7099894:DLG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 18 16 34 8.78552315775817 8.19064608199274 0.594877075765437 T:C T C 10 0.511915380124546 0.86547169107651 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 18 28 46 8.78552315775817 14.3336306434873 -5.54810748572911 T:C C T 10 0.511915380124546 0.106793315786089 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 35 36 71 17.0829616956409 18.4289536844837 -1.34599198884277 A:G G A 10 0.511915380124546 0.812639794260727 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 24 21 45 11.7140308770109 10.7502229826155 0.963807894395432 A:G G A 10 0.511915380124546 0.881695400392349 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 197 185 382 96.1526701154644 94.704345323041 1.44832479242345 A:G G A 10 0.511915380124546 0.918491822635932 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.361898824533055 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 59 42 101 28.7969925726518 21.5004459652309 7.29654660742086 T:C T C 10 0.511915380124546 0.163519062523091 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 30 11 41 14.6425385962636 5.63106918137001 9.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00476891044524456 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 C:G C G 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7246851 C/T 1 201 156 357 98.1050085949663 79.8587992994292 18.2462092955371 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0566032137497936 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7246698_7246881:ACAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 C:G G C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 62 77 139 30.2612464322781 39.41748426959 -9.15623783731189 T:C T C 10 0.511915380124546 0.127051465113192 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7751138 C/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7751388 C/A 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7751751 C/T 1 15 11 26 7.32126929813181 5.63106918137001 1.69020011676181 T:C C T 10 0.511915380124546 0.560130398277703 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 26 27 53 12.6902001167618 13.8217152633627 -1.13151514660094 A:C C A 10 0.511915380124546 0.784784493477215 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 30 38 68 14.6425385962636 19.4527844447327 -4.81024584846912 T:C C T 10 0.511915380124546 0.275321598040182 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 47 43 90 22.9399771341463 22.0123613453555 0.927615788790863 A:C C A 10 0.511915380124546 0.916118086392329 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 40 37 77 19.5233847950182 18.9408690646082 0.582515730409959 C:G C G 10 0.511915380124546 0.909769348437222 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 8026364 C/T 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 T:C C T 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8026349_8026444:HES7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 7 22 29 3.41659233912818 11.26213836274 -7.84554602361183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0045187452121459 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 8701116 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 8701799 G/T 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 23 12 35 11.2259462571354 6.14298456149455 5.08296169564089 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0927032206331829 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 13980058 A/T 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 15532208 G/A 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 69 89 158 33.6778387714063 45.5604688310846 -11.8826300596783 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0669133815774339 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 117 125 242 57.1059005254281 63.9894225155682 -6.88352199014012 A:G A G 10 0.511915380124546 0.403300115574495 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 104 109 213 50.7608004670472 55.7987764335755 -5.03797596652829 A:C A C 10 0.511915380124546 0.494019777503597 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 110 117 227 53.6893081862999 59.8940994745719 -6.20479128827193 C:G C G 10 0.511915380124546 0.426023930079936 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.277507406797940 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 C:G G C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 370 347 717 180.591309353918 177.634636903217 2.95667245070055 A:G G A 10 0.511915380124546 0.851849642097801 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:G T G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 167 141 308 81.5101315192008 72.180068597561 9.33006292163985 A:G G A 10 0.511915380124546 0.305013978010639 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18167461 T/C 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 4 11 15 1.95233847950182 5.63106918137001 -3.67873070186819 T:C T C 10 0.511915380124546 0.07101935202457 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18630995 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000108448:ENST00000395902:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000414850:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395672:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000424146:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395671:exon_18630838_18631071:TRIM16L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 18907029 A/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18906833_18907381:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18906833_18907482:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18906833_18907482:FAM83G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 T:C C T 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 19861599 G/C 1 2 10 12 0.976169239750908 5.11915380124546 -4.14298456149455 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0197833900869736 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 19871740 C/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 C:G C G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19871727_19871774:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19871727_19871774:AKAP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 13 16 29 6.3451000583809 8.19064608199274 -1.84554602361183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57869742206028 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 23 19 42 11.2259462571354 9.72639222236637 1.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.757992065227439 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 97 0 97 47.344208127919 0 47.344208127919 T T 10 0.511915380124546 1.24457204724245e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 94 0 94 45.8799542682927 0 45.8799542682927 T T 10 0.511915380124546 4.67216372443699e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 96 0 96 46.8561235080436 0 46.8561235080436 G G 10 0.511915380124546 1.22312841120698e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 97 0 97 47.344208127919 0 47.344208127919 C C 10 0.511915380124546 1.24457204724245e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 64 0 64 31.2374156720291 0 31.2374156720291 C C 10 0.511915380124546 2.56307289425295e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 107 0 107 52.2250543266736 0 52.2250543266736 C C 10 0.511915380124546 1.29430324781576e-31 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 94 0 94 45.8799542682927 0 45.8799542682927 C C 10 0.511915380124546 4.67216372443699e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 68 0 68 33.1897541515309 0 33.1897541515309 C C 10 0.511915380124546 1.74636097920653e-20 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 91 0 91 44.4157004086663 0 44.4157004086663 C C 10 0.511915380124546 3.48875413669442e-27 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 1 97 1 98 47.344208127919 0.511915380124546 46.8322927477945 A:G G A 10 0.511915380124546 4.57900120947057e-27 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 129 0 129 62.9629159639336 0 62.9629159639336 G G 10 0.511915380124546 3.95794258666233e-38 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 35 26 61 17.0829616956409 13.3097998832382 3.77316181240269 T:C C T 10 0.511915380124546 0.370988174346448 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 25 27 52 12.2021154968864 13.8217152633627 -1.61959976647639 T:G G T 10 0.511915380124546 0.679293554326009 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25932609 C/T 1 18 18 36 8.78552315775817 9.21447684224183 -0.428953684483655 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 134 119 253 65.4033390633108 60.917930234821 4.48540882848987 A:G G A 10 0.511915380124546 0.614984207050162 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 24 50 74 11.7140308770109 25.5957690062273 -13.8817381292164 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00152150376793739 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 21 20 41 10.2497770173845 10.2383076024909 0.0114694148936145 A:C:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 27889963 C/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 C:G C G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 12 15 27 5.85701543850545 7.67873070186819 -1.82171526336274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.565249573112803 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 27959903 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27952956_27959949:SSH2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 248 231 479 121.044985729113 118.25245280877 2.79253292034248 A:G G A 10 0.511915380124546 0.819306351703642 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 29855661 G/A 1 11 20 31 5.36893081862999 10.2383076024909 -4.86937678386093 A:G G A 10 0.511915380124546 0.104757272014477 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 A A 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:C A C 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 33772658 G/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 408 275 683 199.138524909185 140.77672953425 58.3617953749351 A:G G A 10 0.511915380124546 8.58463431655844e-06 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.72718311731246 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 231 89 320 112.74754719123 45.5604688310846 67.1870783601453 A:G A G 10 0.511915380124546 2.79074697833211e-14 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 231 87 318 112.74754719123 44.5366380708355 68.2109091203944 A:T T A 10 0.511915380124546 9.10087165855752e-15 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 14 18 32 6.83318467825636 9.21447684224183 -2.38129216398547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.480315636502299 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 48 43 91 23.4280617540218 22.0123613453555 1.41570040866632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.83406724155441 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 34943637 G/A 1 75 83 158 36.606346490659 42.4889765503373 -5.88263005967826 A:G G A 10 0.511915380124546 0.381508248157701 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34943427_34943675:GGNBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 76 57 133 37.0944311105345 29.1791766670991 7.91525444343539 T:C T C 10 0.511915380124546 0.193108649894991 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 18 10 28 8.78552315775817 5.11915380124546 3.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.188426563384957 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35872772 G/A 1 29 14 43 14.1544539763882 7.16681532174364 6.98763865464452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0460846664758142 ENSG00000161326:ENST00000394389:exon_35872283_35873603:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000292964:exon_35872283_35873588:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000394386:exon_35872283_35873589:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000487847:exon_35872283_35873603:DUSP14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 6 14 20 2.92850771925272 7.16681532174364 -4.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0728986200139047 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 T:C T C 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 20 17 37 9.76169239750908 8.70256146211728 1.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.745445580497077 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 36104769 G/A 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000108753:ENST00000225893:exon_36104532_36105237:HNF1B;ENSG00000108753:ENST00000427275:exon_36104532_36105096:HNF1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:G G T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 37070646 G/A 1 87 86 173 42.4633619291645 44.024722690711 -1.56136076154645 A:G G A 10 0.511915380124546 0.819982645959097 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 83 82 165 40.5110234496627 41.9770611702128 -1.46603772055008 A:G A G 10 0.511915380124546 0.876296417505464 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 37561496 G/C 1 40 46 86 19.5233847950182 23.5481074857291 -4.02472269071096 C:G G C 10 0.511915380124546 0.390699237603388 ENSG00000125686:ENST00000394287:exon_37560538_37561561:MED1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 9 18 27 4.39276157887909 9.21447684224183 -4.82171526336274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0819882016777053 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 38600092 G/A 1 2 12 14 0.976169239750908 6.14298456149455 -5.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00625964766936787 ENSG00000141753:ENST00000269593:exon_38599713_38600336:IGFBP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 14 6 20 6.83318467825636 3.07149228074728 3.76169239750908 C:G G C 10 0.511915380124546 0.117374955156906 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 40265698 T/C 1 49 31 80 23.9161463738972 15.8693767838609 8.04676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0743767880619111 ENSG00000108773:ENST00000225916:exon_40265126_40265860:KAT2A;ENSG00000108773:ENST00000465682:exon_40265136_40265860:KAT2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 148 114 262 72.2365237415672 58.3583533341982 13.878170407369 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0950585481810988 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 40716163 G/C 1 81 61 142 39.5348542099118 31.2268381875973 8.30801602231448 C:G G C 10 0.511915380124546 0.179281806972007 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40715979_40716193:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40715979_40716193:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40715979_40716193:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40715979_40716193:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40715979_40716193:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40715979_40716193:COASY HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 7 19 26 3.41659233912818 9.72639222236637 -6.30979988323819 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0171736804395362 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 130 112 242 63.451000583809 57.3345225739491 6.11647800985988 A:T:C A T 10 0.511915380124546 0.440993590233513 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 20 10 30 9.76169239750908 5.11915380124546 4.64253859626362 A:C A C 10 0.511915380124546 0.101596955745793 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 9 1 10 4.39276157887909 0.511915380124546 3.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0218341665311933 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 0 0 9 9 0 4.60723842112091 -4.60723842112091 A G A 10 0.511915380124546 0.00157201289671075 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 C:G C G 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 T:C C T 10 0.511915380124546 0.180805245635589 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 27 11 38 13.1782847366373 5.63106918137001 7.54721555526725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0148653531531933 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 C:G C G 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42254527 T/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 158 146 304 77.1173699403217 74.7396454981837 2.37772444213803 T:C C T 10 0.511915380124546 0.81856262354346 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 42427630 T/C 1 461 378 839 225.007009762584 193.504013687078 31.5029960755059 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.0296165992089239 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42427596_42427708:GRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 30 17 47 14.6425385962636 8.70256146211728 5.93997713414634 T:C T C 10 0.511915380124546 0.107568340196753 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 43010064 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43010041_43010141:KIF18B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 218 217 435 106.402447132849 111.085637487026 -4.6831903541775 A:G G A 10 0.511915380124546 0.666186973200725 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 46 50 96 22.4518925142709 25.5957690062273 -3.14387649195641 A:G G A 10 0.511915380124546 0.541402912172989 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 134 96 230 65.4033390633108 49.1438764919564 16.2594625713544 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.0346642990927668 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 62 55 117 30.2612464322781 28.15534590685 2.10590052542812 A:G G A 10 0.511915380124546 0.712394395770035 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 45369777 A/G 1 9 4 13 4.39276157887909 2.04766152049818 2.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.268628592400232 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45369505_45369934:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45369505_45369934:ITGB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 45369789 G/A 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45369505_45369934:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45369505_45369934:ITGB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 45385012 C/T 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45384837_45385045:ITGB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48539881 G/C 1 23 11 34 11.2259462571354 5.63106918137001 5.59487707576544 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0600080878349012 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506052:exon_48539781_48540402:ACSF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48559559 A/G 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48628478 G/A 1 13 22 35 6.3451000583809 11.26213836274 -4.91703830435911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.127031714636438 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 23 13 36 11.2259462571354 6.6548999416191 4.57104631551634 T:C T C 10 0.511915380124546 0.136447034808195 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 56083128 T/C 1 8 16 24 3.90467695900363 8.19064608199274 -4.2859691229891 T:C T C 10 0.511915380124546 0.101689292856960 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 56435885 G/T 1 1 9 10 0.488084619875454 4.60723842112091 -4.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0100505466901609 ENSG00000108375:ENST00000407977:exon_56434829_56436184:RNF43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:C A C 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 11 12 23 5.36893081862999 6.14298456149455 -0.774053742864557 T:C T C 10 0.511915380124546 0.836006652806153 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 C:G G C 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 61771128 C/G 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 C:G C G 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000198909:ENST00000361357:exon_61770909_61773667:MAP3K3;ENSG00000198909:ENST00000361733:exon_61770909_61773667:MAP3K3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 61864403 T/A 1 42 33 75 20.4995540347691 16.89320754411 3.60634649065905 A:T T A 10 0.511915380124546 0.420982664023499 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61864380_61864630:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61864394_61864630:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61864377_61864630:DDX42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 261 258 519 127.390085787494 132.074168072133 -4.68408228463936 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.692862344134126 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 282 300 582 137.639862804878 153.574614037364 -15.9347512324858 A:G A G 10 0.511915380124546 0.198631302220623 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 62500215 A/T 1 278 302 580 135.687524325376 154.598444797613 -18.9109204722367 A:T A T 10 0.511915380124546 0.124283652511059 ENSG00000108654:ENST00000225792:exon_62500101_62500234:DDX5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 A:G A G 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 134 189 323 65.4033390633108 96.7520068435392 -31.3486677802284 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000540500429774693 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 92 59 151 44.9037850285418 30.2030074273482 14.7007776011936 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0180766062931115 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 71 76 147 34.6540080111572 38.9055688894655 -4.25156087830825 A:T:G T A 10 0.511915380124546 0.509706657336762 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 66267650 T/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 70118935 C/T 1 33 53 86 16.10679245589 27.1315151466009 -11.024722690711 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0177574387018264 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70118860_70119113:SOX9;ENSG00000125398:ENST00000455872:exon_70118860_70119113:SOX9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 70645032 G/A 1 10 15 25 4.88084619875454 7.67873070186819 -2.79788450311365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.318697161637912 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70644942_70645100:SLC39A11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 10 25 35 4.88084619875454 12.7978845031136 -7.91703830435911 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0101770299178607 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 44 36 80 21.47572327452 18.4289536844837 3.04676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.504743147041992 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 C:G G C 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 47 40 87 22.9399771341463 20.4766152049818 2.4633619291645 A:G G A 10 0.511915380124546 0.668212033901837 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 113 125 238 55.1535620459263 63.9894225155682 -8.83586046964194 T:C T C 10 0.511915380124546 0.270412522341192 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73096386 A/G 1 15 5 20 7.32126929813181 2.55957690062273 4.76169239750908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0425244406238397 ENSG00000170190:ENST00000329783:exon_73096102_73096911:SLC16A5;ENSG00000170190:ENST00000450736:exon_73096102_73096911:SLC16A5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73125079 G/A 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 A:G G A 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 A:G A G 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 C:G G C 10 0.511915380124546 0.277507406797940 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 20 12 32 9.76169239750908 6.14298456149455 3.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.219498632603626 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 28 26 54 13.6663693565127 13.3097998832382 0.356569473274519 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C C T 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73567846 C/T 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C C T 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000073350:ENST00000167462:exon_73567748_73567864:LLGL2;ENSG00000073350:ENST00000392550:exon_73567748_73567864:LLGL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73570718 C/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000073350:ENST00000167462:exon_73570691_73570749:LLGL2;ENSG00000073350:ENST00000392550:exon_73570691_73570749:LLGL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 19 35 54 9.27360777763363 17.9170383043591 -8.64343052672548 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.0204347793999763 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 17 13 30 8.29743853788272 6.6548999416191 1.64253859626362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.587883526117901 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 28 15 43 13.6663693565127 7.67873070186819 5.98763865464452 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0921974284201415 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73812909 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73812851_73812993:UNK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 9 6 15 4.39276157887909 3.07149228074728 1.32126929813181 A:G A G 10 0.511915380124546 0.608797469772918 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73819525 C/T 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73819346_73819603:UNK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 63 86 149 30.7493310521536 44.024722690711 -13.2753916385573 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0328977484235828 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 67 78 145 32.7016695316554 39.9293996497146 -7.22773011805916 T:C T C 10 0.511915380124546 0.245208113721608 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73831016 G/A 1 52 41 93 25.3804002335236 20.9885305851064 4.39186964841722 A:G G A 10 0.511915380124546 0.406928521952773 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831001_73831144:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73832723 T/G 1 61 34 95 29.7731618124027 17.4051229242346 12.3680388881681 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0133802982020121 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73832653_73832777:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73832653_73832777:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73832653_73832777:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 49 75 124 23.9161463738972 38.393653509341 -14.4775071354437 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0115927063481163 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 37 41 78 18.0591309353918 20.9885305851064 -2.92939964971459 A:G G A 10 0.511915380124546 0.57151153174524 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 73 50 123 35.6301772509081 25.5957690062273 10.0344082446809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0718185098433053 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 64 66 130 31.2374156720291 33.78641508822 -2.54899941619097 C:G G C 10 0.511915380124546 0.662019613710111 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 41 79 120 20.0114694148936 40.4413150298391 -20.4298456149455 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.000229286743980234 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 30 42 72 14.6425385962636 21.5004459652309 -6.85790736896731 T:C T C 10 0.511915380124546 0.125014246239422 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 75202387 C/A 1 27 23 50 13.1782847366373 11.7740537428646 1.4042309937727 A:C C A 10 0.511915380124546 0.777676813700698 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75202311_75202482:SEC14L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.181089356124526 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 98 64 162 47.8322927477945 32.7625843279709 15.0697084198236 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0183688896241152 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 1 59 88 147 28.7969925726518 45.04855345096 -16.2515608783083 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0081307126371441 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 22 23 45 10.73786163726 11.7740537428646 -1.03619210560457 A:T A T 10 0.511915380124546 0.767954640809347 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 37 37 74 18.0591309353918 18.9408690646082 -0.881738129216401 A:G G A 10 0.511915380124546 0.907562111408946 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 A:C C A 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 279 277 556 136.175608945252 141.800560294499 -5.62495134924757 T:C:G C G 10 0.511915380124546 0.640958193956874 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 34 22 56 16.5948770757654 11.26213836274 5.33273871302543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.181285058083278 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76462770 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76462737_76462898:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76462737_76462898:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76462737_76462898:DNAH17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76795805 G/C 1 40 38 78 19.5233847950182 19.4527844447327 0.0706003502854138 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76795749_76795850:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76795749_76795850:USP36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 36 36 72 17.5710463155163 18.4289536844837 -0.857907368967311 A:G G A 10 0.511915380124546 0.906311079702919 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76799835 C/A 1 20 15 35 9.76169239750908 7.67873070186819 2.08296169564089 A:C C A 10 0.511915380124546 0.503837418304441 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 76970879 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76970770_76970901:LGALS3BP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 9 4 13 4.39276157887909 2.04766152049818 2.3451000583809 A:C C A 10 0.511915380124546 0.268628592400232 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 18 20 38 8.78552315775817 10.2383076024909 -1.45278444473275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.746050140979249 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 22 7 29 10.73786163726 3.58340766087182 7.15445397638817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00864130974150853 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 28 14 42 13.6663693565127 7.16681532174364 6.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0460486767235543 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78201687 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000181045:ENST00000361193:exon_78201617_78201759:SLC26A11;ENSG00000181045:ENST00000411502:exon_78201617_78201759:SLC26A11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 18 15 33 8.78552315775817 7.67873070186819 1.10679245588998 T:C C T 10 0.511915380124546 0.730790496693958 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 19 10 29 9.27360777763363 5.11915380124546 4.15445397638817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.139263752664382 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79214797 C/T 1 80 91 171 39.0467695900363 46.5842995913337 -7.53753000129736 T:C C T 10 0.511915380124546 0.252293414637768 ENSG00000224877:ENST00000431388:exon_79214787_79215098:C17orf89 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 35 29 64 17.0829616956409 14.8455460236118 2.23741567202906 C:G G C 10 0.511915380124546 0.618144115325239 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 29 17 46 14.1544539763882 8.70256146211728 5.45189251427089 A:C:G C A 10 0.511915380124546 0.139461620694362 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 45 35 80 21.9638078943954 17.9170383043591 4.04676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.373605364297920 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 79682558 T/C 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183048:ENST00000331531:exon_79682508_79682622:SLC25A10;ENSG00000183048:ENST00000350690:exon_79682508_79682622:SLC25A10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 26 30 56 12.6902001167618 15.3574614037364 -2.66726128697457 A:C A C 10 0.511915380124546 0.50584998529588 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80007887 A/G 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80007897 G/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 39 38 77 19.0353001751427 19.4527844447327 -0.417484269590037 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 181 153 334 88.3433161974572 78.3230531590555 10.0202630384017 A:G G A 10 0.511915380124546 0.274322069061004 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 206 127 333 100.545431694344 65.0132532758173 35.5321784185262 T:C T C 10 0.511915380124546 9.5513567774541e-05 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80085703 G/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:G G T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392346:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000419322:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000324808:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000412801:exon_80085368_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000483145:exon_80085581_80085784:CCDC57 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 88 65 153 42.95144654904 33.2744997080955 9.67694684094447 A:G A G 10 0.511915380124546 0.124660810545651 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80615718 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000141542:ENST00000269347:exon_80614977_80616010:RAB40B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80674648 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80674582_80674772:FN3KRP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80863817 C/T 1 32 11 43 15.6187078360145 5.63106918137001 9.98763865464452 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00215474656210600 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 15 8 23 7.32126929813181 4.09532304099637 3.22594625713544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.213023121779288 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 72 58 130 35.1420926310327 29.6910920472237 5.45100058380902 T:C T C 10 0.511915380124546 0.380417206389991 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 17 80923536 C/T 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C C T 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80923527_80923622:B3GNTL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 224131 G/A 1 35 18 53 17.0829616956409 9.21447684224183 7.86848485339906 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0384054808560604 ENSG00000079134:ENST00000261600:exon_224084_224179:THOC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 658035 A/G 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:G A G 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 6 13 19 2.92850771925272 6.6548999416191 -3.72639222236637 C:G G C 10 0.511915380124546 0.108541560895472 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 670888 T/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 193 177 370 94.2003316359626 90.6090222820446 3.59130935391799 T:C C T 10 0.511915380124546 0.71615810079416 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 685988 G/A 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:G G A 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_685921_686008:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_685921_686008:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_685921_686008:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_685921_686008:ENOSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 706558 C/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 19 8 27 9.27360777763363 4.09532304099637 5.17828473663726 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0540257950190272 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:T A T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 3457607 C/T 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9221883 C/G 1 20 25 45 9.76169239750908 12.7978845031136 -3.03619210560457 C:G C G 10 0.511915380124546 0.375520230803155 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9221850_9221997:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9221850_9221997:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9254785 C/T 1 61 67 128 29.7731618124027 34.2983304683446 -4.52516865594188 T:C C T 10 0.511915380124546 0.427867086767411 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9255784 C/A 1 68 62 130 33.1897541515309 31.7387535677219 1.45100058380903 A:C C A 10 0.511915380124546 0.860811307022084 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 96 107 203 46.8561235080436 54.7749456733264 -7.91882216528283 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.29230338073592 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9258531 C/T 1 18 28 46 8.78552315775817 14.3336306434873 -5.54810748572911 T:C C T 10 0.511915380124546 0.106793315786089 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9258537 T/C 1 16 29 45 7.80935391800726 14.8455460236118 -7.03619210560457 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0375166859426032 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9275542 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9275522_9275665:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9275522_9275665:ANKRD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 10691357 G/A 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10691223_10691381:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10691223_10691381:FAM38B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 10696227 C/T 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10696072_10696286:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10696072_10696286:FAM38B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 22 17 39 10.73786163726 8.70256146211728 2.03530017514271 C:G C G 10 0.511915380124546 0.527014451735681 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 97 104 201 47.344208127919 53.2391995329528 -5.89499140503374 C:G C G 10 0.511915380124546 0.437807507809017 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 65 45 110 31.7255002919045 23.0361921056046 8.68930818629995 T:C T C 10 0.511915380124546 0.105131871479844 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 38 45 83 18.5472155552673 23.0361921056046 -4.48897655033731 T:C C T 10 0.511915380124546 0.379862672690101 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 66 54 120 32.21358491178 27.6434305267255 4.57015438505449 A:G A G 10 0.511915380124546 0.412787626810940 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 46 30 76 22.4518925142709 15.3574614037364 7.09443111053451 A:C C A 10 0.511915380124546 0.109129442703299 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 13056682 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 13068109 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 T:G G T 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 18 29 47 8.78552315775817 14.8455460236118 -6.06002286585366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0813683347606948 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 28649042 T/C 1 2 21 23 0.976169239750908 10.7502229826155 -9.77405374286456 T:C T C 10 0.511915380124546 2.54689670846569e-05 ENSG00000134755:ENST00000251081:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000438199:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000280904:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000399347:exon_28648860_28649117:DSC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 20 18 38 9.76169239750908 9.21447684224183 0.547215555267252 T:C T C 10 0.511915380124546 0.872795071629403 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 20 14 34 9.76169239750908 7.16681532174364 2.59487707576544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396114031948566 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 33702162 G/A 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33702015_33702233:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33702015_33702233:SLC39A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 11 19 30 5.36893081862999 9.72639222236637 -4.35746140373638 A:C A C 10 0.511915380124546 0.143283608395161 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 35 56 91 17.0829616956409 28.6672612869746 -11.5842995913337 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0158323497548000 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 98 117 215 47.8322927477945 59.8940994745719 -12.0618067267774 T:C C T 10 0.511915380124546 0.101963352289213 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 43420177 G/A 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000197046:ENST00000389474:exon_43420176_43420206:SIGLEC15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 A:C C A 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 43700025 G/A 1 44 49 93 21.47572327452 25.0838536261028 -3.60813035158277 A:G G A 10 0.511915380124546 0.469377391401515 ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43699892_43700026:HAUS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 44641567 G/A 1 26 25 51 12.6902001167618 12.7978845031136 -0.107684386351844 A:C:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167220:ENST00000300605:exon_44641503_44641719:HDHD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 34 40 74 16.5948770757654 20.4766152049818 -3.8817381292164 T:C T C 10 0.511915380124546 0.41599997889345 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 174 147 321 84.926723858329 75.2515608783083 9.67516298002074 T:C T C 10 0.511915380124546 0.289107107729159 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 56191239 G/C 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 C:G G C 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56191167_56191294:ALPK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 59713066 T/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:G T G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59711460_59713212:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59711460_59713212:PIGN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 6 11 17 2.92850771925272 5.63106918137001 -2.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.228802164450189 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 17 21 38 8.29743853788272 10.7502229826155 -2.45278444473275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.516888244759979 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 61654210 G/A 1 17 16 33 8.29743853788272 8.19064608199274 0.106792455889984 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 17 18 35 8.29743853788272 9.21447684224183 -0.917038304359108 A:G A G 10 0.511915380124546 0.86609172977762 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 67531505 G/C 1 15 18 33 7.32126929813181 9.21447684224183 -1.89320754411002 C:G G C 10 0.511915380124546 0.602309440775946 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 165 120 285 80.5339622794499 61.4298456149455 19.1041166645044 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0243302430314353 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 24 8 32 11.7140308770109 4.09532304099637 7.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00750422536413303 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C T C 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 74091718 G/A 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:G T G 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 18 11 29 8.78552315775817 5.63106918137001 3.15445397638817 T:G T G 10 0.511915380124546 0.268874799109534 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77473086 G/A 1 11 19 30 5.36893081862999 9.72639222236637 -4.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.143283608395161 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 28 24 52 13.6663693565127 12.2859691229891 1.38040023352361 T:C C T 10 0.511915380124546 0.781913982900238 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 63 55 118 30.7493310521536 28.15534590685 2.59398514530358 A:G G A 10 0.511915380124546 0.646371013768671 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77894844 G/A 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 12 18 30 5.85701543850545 9.21447684224183 -3.35746140373638 T:C C T 10 0.511915380124546 0.273551093070692 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 518957 C/A 1 33 25 58 16.10679245589 12.7978845031136 3.30890795277634 A:C:G C A 10 0.511915380124546 0.431561936113505 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_518889_519291:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_518889_519653:C19orf20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 454 590 1044 221.590417423456 302.030074273482 -80.439656850026 A:T:C C T 10 0.511915380124546 6.96037672192495e-07 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 553 719 1272 269.910794791126 368.067158309549 -98.1563635184224 A:C:G C G 10 0.511915380124546 3.67163193411081e-08 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 677 426 1103 330.433287655682 218.075951933057 112.357335722626 T:C T C 10 0.511915380124546 1.06602321841314e-11 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 22 12 34 10.73786163726 6.14298456149455 4.59487707576544 C:G G C 10 0.511915380124546 0.125035827053306 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 A:G G A 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 24 13 37 11.7140308770109 6.6548999416191 5.0591309353918 T:G T G 10 0.511915380124546 0.102403599896536 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 632915 G/A 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_632834_632938:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_632834_632938:POLRMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 27 18 45 13.1782847366373 9.21447684224183 3.96380789439543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.296564585019024 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 75 53 128 36.606346490659 27.1315151466009 9.47483134405811 A:G A G 10 0.511915380124546 0.111156261362471 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 886001 G/C 1 46 53 99 22.4518925142709 27.1315151466009 -4.67962263233005 C:G G C 10 0.511915380124546 0.366591876189365 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 900951 A/G 1 84 106 190 40.9991080695381 54.2630302932019 -13.2639222236637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0590567983687562 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_900829_900952:C19orf22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 60 78 138 29.2850771925272 39.9293996497146 -10.6443224571873 A:G A G 10 0.511915380124546 0.07390140021491 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 63 48 111 30.7493310521536 24.5719382459782 6.1773928061754 T:C C T 10 0.511915380124546 0.255397619732360 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 56 50 106 27.3327387130254 25.5957690062273 1.73696970679813 A:G G A 10 0.511915380124546 0.771170483119647 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 143 137 280 69.7961006421899 70.1324070770628 -0.336306434872867 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 102 139 241 49.7846312272963 71.1562378373119 -21.3716066100156 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00669334918342026 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 101 72 173 49.2965466074209 36.8579073689673 12.4386392384535 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0676712327005883 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 456 392 848 222.566586663207 200.670829008822 21.895757654385 A:G G A 10 0.511915380124546 0.139628154767010 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1052005 C/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051941_1052125:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1054060 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1054005_1054109:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1055191 G/A 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530092:exon_1055096_1055350:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1056065 A/G 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 A:G A G 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1061873 G/A 1 18 11 29 8.78552315775817 5.63106918137001 3.15445397638817 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.268874799109534 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1061781_1061887:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1065044 C/T 1 6 16 22 2.92850771925272 8.19064608199274 -5.26213836274001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0314983778373771 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 80 36 116 39.0467695900363 18.4289536844837 20.6178159055527 T:C T C 10 0.511915380124546 0.000123662827566556 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 89 37 126 43.4395311689154 18.9408690646082 24.4986621043072 A:G G A 10 0.511915380124546 1.04426591148283e-05 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 161 141 302 78.5816237999481 72.180068597561 6.40155520238713 A:G A G 10 0.511915380124546 0.489839160355875 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1080681 G/A 1 194 156 350 94.6884162558381 79.8587992994292 14.8296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.120947179719840 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080681_1080785:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080681_1080785:HMHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 190 168 358 92.7360777763363 86.0017838609237 6.73429391541255 A:G A G 10 0.511915380124546 0.492151937556902 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 17 13 30 8.29743853788272 6.6548999416191 1.64253859626362 T:C C T 10 0.511915380124546 0.587883526117901 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1119963 A/G 1 17 20 37 8.29743853788272 10.2383076024909 -1.9408690646082 A:G A G 10 0.511915380124546 0.62244012208179 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119905_1120022:SBNO2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1242048 C/T 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.228025798936671 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 44 54 98 21.47572327452 27.6434305267255 -6.1677072522055 T:C C T 10 0.511915380124546 0.226135461717207 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1271529 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 504 585 1089 245.994648417229 299.470497372859 -53.4758489556305 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00130299844152075 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1278861 C/T 1 93 127 220 45.3918696484172 65.0132532758173 -19.6213836274001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00848012442688797 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1370675 C/G 1 31 38 69 15.1306232161391 19.4527844447327 -4.32216122859367 C:G C G 10 0.511915380124546 0.335819815928413 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1438865 C/T 1 898 3220 4118 438.299988648158 1648.36752400104 -1210.06753535288 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0 ENSG00000115268:ENST00000233609:exon_1438806_1438891:RPS15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 216 245 461 105.426277893098 125.419268130514 -19.9929902374157 A:G G A 10 0.511915380124546 0.069112330450054 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 213 27 240 103.962024033472 13.8217152633627 90.140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 2.76649465830777e-35 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1619348 G/A 1 204 18 222 99.5692624545926 9.21447684224183 90.3547856123508 A:G G A 10 0.511915380124546 1.99720388295132e-39 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 204 23 227 99.5692624545926 11.7740537428646 87.7952087117281 T:C C T 10 0.511915380124546 1.30013292578824e-35 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 40 27 67 19.5233847950182 13.8217152633627 5.70166953165542 T:C T C 10 0.511915380124546 0.17963271455776 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 36 35 71 17.5710463155163 17.9170383043591 -0.345991988842766 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 49 34 83 23.9161463738972 17.4051229242346 6.51102344966269 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.155468687817816 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 4 15 19 1.95233847950182 7.67873070186819 -5.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0102846757592954 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 237 178 415 115.676054910483 91.1209376621692 24.5551172483134 A:G G A 10 0.511915380124546 0.016122385100485 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 69 103 172 33.6778387714063 52.7272841528282 -19.0494453814219 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00371691478817456 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2248020 G/A 1 152 110 262 74.188862221069 56.3106918137001 17.878170407369 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0303686810708839 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2248152 T/C 1 179 148 327 87.3671469577063 75.7634762584328 11.6036706992735 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.203654585777203 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2252460 G/A 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252252_2252795:JSRP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 A:G G A 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 29 23 52 14.1544539763882 11.7740537428646 2.38040023352361 A:C C A 10 0.511915380124546 0.579674438793655 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 241 330 571 117.628393389984 168.9320754411 -51.3036820511157 A:G G A 10 0.511915380124546 1.87194395517346e-05 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 54 34 88 26.3565694732745 17.4051229242346 8.95144654903996 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0692799047449745 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 68 87 155 33.1897541515309 44.5366380708355 -11.3468839193046 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0768816902109425 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C C T 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 13 5 18 6.3451000583809 2.55957690062273 3.78552315775817 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.0979415445230112 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 T:G G T 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 44 45 89 21.47572327452 23.0361921056046 -1.56046883108459 T:C T C 10 0.511915380124546 0.751607096166813 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 73 68 141 35.6301772509081 34.8102458484691 0.819931402439025 A:G A G 10 0.511915380124546 0.932940780257302 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 38 24 62 18.5472155552673 12.2859691229891 6.26124643227815 A:G G A 10 0.511915380124546 0.127443719124370 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3633115 C/A 1 24 23 47 11.7140308770109 11.7740537428646 -0.0600228658536608 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3630182_3633167:PIP5K1C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 23 20 43 11.2259462571354 10.2383076024909 0.987638654644522 A:G A G 10 0.511915380124546 0.878997691457703 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 19 30 49 9.27360777763363 15.3574614037364 -6.08385362610275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0875845076584759 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4207940 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000089847:ENST00000318934:exon_4207778_4207965:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262969:exon_4207778_4207965:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262970:exon_4207778_4207965:ANKRD24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4233232 G/A 1 819 748 1567 399.741303677997 382.91270433316 16.8285993448365 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.404376567330572 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4233126_4233304:EBI3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 19 29 48 9.27360777763363 14.8455460236118 -5.57193824597821 A:G A G 10 0.511915380124546 0.114036075690169 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4366934 C/T 1 58 67 125 28.3089079527763 34.2983304683446 -5.98942251556825 T:C C T 10 0.511915380124546 0.325054806916133 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4366923_4366991:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4366923_4366991:SH3GL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 59 76 135 28.7969925726518 38.9055688894655 -10.1085763168137 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.0854337715559169 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 74 58 132 36.1182618707836 29.6910920472237 6.42716982355993 T:C C T 10 0.511915380124546 0.296154236890383 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 96 78 174 46.8561235080436 39.9293996497146 6.92672385832901 A:G G A 10 0.511915380124546 0.324272109782215 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 74 43 117 36.1182618707836 22.0123613453555 14.1059005254281 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00949831368696555 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 80 80 160 39.0467695900363 40.9532304099637 -1.90646081992736 T:C C T 10 0.511915380124546 0.812578433902414 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 109 104 213 53.2012235664245 53.2391995329528 -0.0379759665282933 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 5 14 19 2.44042309937727 7.16681532174364 -4.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0376423259948182 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 3 12 15 1.46425385962636 6.14298456149455 -4.67873070186819 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0187794943013981 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5616266 C/T 1 47 51 98 22.9399771341463 26.1076843863518 -3.16770725220551 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.545406118349828 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5616143_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5616123_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5616109_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5616143_5616346:SAFB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 156 139 295 76.1412007005708 71.1562378373119 4.98496286325894 A:G G A 10 0.511915380124546 0.600251437795525 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5692192 C/T 1 183 186 369 89.3194854372081 95.2162607031655 -5.89677526595746 T:C C T 10 0.511915380124546 0.566857257966707 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5696101 C/T 1 94 87 181 45.8799542682927 44.5366380708355 1.34331619745718 T:C C T 10 0.511915380124546 0.881879360419034 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 5786495 G/A 1 14 16 30 6.83318467825636 8.19064608199274 -1.35746140373638 A:G G A 10 0.511915380124546 0.715918489675599 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786478_5786553:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786478_5786553:DUS3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 44 56 100 21.47572327452 28.6672612869746 -7.19153801245459 T:G G T 10 0.511915380124546 0.161837627353788 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 28 41 69 13.6663693565127 20.9885305851064 -7.32216122859367 A:G A G 10 0.511915380124546 0.09139026310008 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 186 226 412 90.7837392968345 115.692875908147 -24.9091366113129 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.0156493484692680 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 6665099 G/A 1 18 19 37 8.78552315775817 9.72639222236637 -0.940869064608201 A:G G A 10 0.511915380124546 0.869689677577778 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000366236:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000326176:exon_6664568_6665361:TNFSF14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7083010 G/A 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 50 37 87 24.4042309937727 18.9408690646082 5.4633619291645 A:G G A 10 0.511915380124546 0.283490290306568 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 53 52 105 25.8684848533991 26.6195997664764 -0.751114913077327 T:C C T 10 0.511915380124546 0.922379782667711 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 35 33 68 17.0829616956409 16.89320754411 0.189754151530874 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 27 24 51 13.1782847366373 12.2859691229891 0.892315613648156 T:G T G 10 0.511915380124546 0.888849598863121 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 28 27 55 13.6663693565127 13.8217152633627 -0.155345906850027 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 77 78 155 37.58251573041 39.9293996497146 -2.34688391930462 A:G G A 10 0.511915380124546 0.748104232481522 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 138 98 236 67.3556775428127 50.1677072522055 17.1879702906072 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0267490494336951 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.256854402155839 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 3579 2931 6510 1746.85485453425 1500.42397914504 246.430875389206 A:T:C:G G A 10 0.511915380124546 9.6891048821109e-10 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:G A G 10 0.511915380124546 0.839914738945576 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7762143 G/C 1 3469 3251 6720 1693.16554634795 1664.2369007849 28.9286455630513 A:T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.486729154440027 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7762122_7762184:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7762122_7762184:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7762122_7762184:FCER2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 37 42 79 18.0591309353918 21.5004459652309 -3.44131502983913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.499799254672532 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 41 56 97 20.0114694148936 28.6672612869746 -8.65579187208096 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0844745650640538 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8320563 C/T 1 58 40 98 28.3089079527763 20.4766152049818 7.83229274779449 T:C C T 10 0.511915380124546 0.129410889719190 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 123 110 233 60.0344082446808 56.3106918137001 3.72371643098079 A:G G A 10 0.511915380124546 0.646764977684873 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8381435 G/C 1 185 178 363 90.295654676959 91.1209376621692 -0.82528298521018 C:G G C 10 0.511915380124546 0.958144952252562 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 213 213 426 103.962024033472 109.037975966528 -5.07595193305659 T:C C T 10 0.511915380124546 0.62825890734562 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 184 167 351 89.8075700570835 85.4898684807992 4.31770157628436 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.669411658955259 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 34 32 66 16.5948770757654 16.3812921639855 0.213584911779968 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 9492141 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000188629:ENST00000446085:exon_9491344_9492453:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000343499:exon_9491824_9492864:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000434737:exon_9491824_9492864:ZNF177 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 26 41 67 12.6902001167618 20.9885305851064 -8.29833046834458 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0500255127113842 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 9921575 C/T 1 52 51 103 25.3804002335236 26.1076843863518 -0.727284152828236 T:C C T 10 0.511915380124546 0.921652913418017 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 43 36 79 20.9876386546445 18.4289536844837 2.55868497016087 T:G G T 10 0.511915380124546 0.575884768844757 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 16 16 32 7.80935391800726 8.19064608199274 -0.381292163985471 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 25 31 56 12.2021154968864 15.8693767838609 -3.66726128697457 T:C T C 10 0.511915380124546 0.351342325551452 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 C:G C G 10 0.511915380124546 0.815475235631285 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 183 210 393 89.3194854372081 107.502229826155 -18.1827443889466 A:G A G 10 0.511915380124546 0.069305284809114 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 13 16 29 6.3451000583809 8.19064608199274 -1.84554602361183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57869742206028 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10431799 G/T 1 55 66 121 26.84465409315 33.78641508822 -6.94176099507006 T:C:G G T 10 0.511915380124546 0.237039024923002 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10444826 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10446568 T/C 1 332 344 676 162.044093798651 176.098890762844 -14.0547969641931 T:C T C 10 0.511915380124546 0.281641416160427 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 462 354 816 225.49509438246 181.218044564089 44.2770498183705 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00204318127600121 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 41 38 79 20.0114694148936 19.4527844447327 0.558684970160868 A:G A G 10 0.511915380124546 0.910947833501399 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 43 37 80 20.9876386546445 18.9408690646082 2.04676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.656627993469593 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 23 30 53 11.2259462571354 15.3574614037364 -4.13151514660094 C:G G C 10 0.511915380124546 0.273895215207071 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 41 75 116 20.0114694148936 38.393653509341 -18.3821840944473 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000758722283096358 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 17 20 37 8.29743853788272 10.2383076024909 -1.9408690646082 A:G G A 10 0.511915380124546 0.62244012208179 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 91 108 199 44.4157004086663 55.286861053451 -10.8711606447846 T:C T C 10 0.511915380124546 0.136330317859332 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 43 40 83 20.9876386546445 20.4766152049818 0.511023449662684 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11216276 G/A 1 19 18 37 9.27360777763363 9.21447684224183 0.0591309353917993 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11215896_11216276:LDLR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 31 27 58 15.1306232161391 13.8217152633627 1.30890795277633 A:G A G 10 0.511915380124546 0.793352645663686 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 20 36 56 9.76169239750908 18.4289536844837 -8.66726128697458 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0227793023219364 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11258720 C/T 1 22 19 41 10.73786163726 9.72639222236637 1.01146941489362 T:C C T 10 0.511915380124546 0.876113328405461 ENSG00000161888:ENST00000293743:exon_11258689_11258789:SPC24;ENSG00000161888:ENST00000429831:exon_11258689_11258744:SPC24;ENSG00000161888:ENST00000423327:exon_11258689_11258793:SPC24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 13 16 29 6.3451000583809 8.19064608199274 -1.84554602361183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.57869742206028 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11326119 A/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11326125 C/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11348911 A/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11348863_11348980:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11348863_11348980:DOCK6;ENSG00000130173:ENST00000456824:exon_11348733_11348957:AC011472.1;ENSG00000130173:ENST00000252453:exon_11348817_11348955:AC011472.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 11348960 G/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11348863_11348980:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11348863_11348980:DOCK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 12384580 T/C 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 12759982 T/C 1 463 457 920 225.983179002335 233.945328716918 -7.9621497145823 T:C T C 10 0.511915380124546 0.620853376654857 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12759950_12760030:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12759950_12760030:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12759950_12760030:MAN2B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 12876964 G/C 0 0 8 8 0 4.09532304099637 -4.09532304099637 C G C 10 0.511915380124546 0.00322077941548718 ENSG00000095066:ENST00000397668:exon_12876917_12877054:HOOK2;ENSG00000095066:ENST00000264827:exon_12876917_12877054:HOOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 13008171 A/G 1 19 31 50 9.27360777763363 15.8693767838609 -6.5957690062273 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0666323489543619 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008117_13008242:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008117_13008242:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008117_13008242:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008117_13008242:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008117_13008242:GCDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 13049490 C/T 1 109 100 209 53.2012235664245 51.1915380124546 2.0096855539699 T:C C T 10 0.511915380124546 0.835624309712092 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13049414_13049584:CALR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 70 86 156 34.1659233912818 44.024722690711 -9.85879929942917 A:G A G 10 0.511915380124546 0.127922487478552 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 33 29 62 16.10679245589 14.8455460236118 1.26124643227815 T:C T C 10 0.511915380124546 0.800084578883229 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 135 139 274 65.8914236831863 71.1562378373119 -5.2648141541256 A:G G A 10 0.511915380124546 0.545874115380408 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14581651 G/A 1 381 391 772 185.960240172548 200.158913628697 -14.1986734561495 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.313547948811221 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14581583_14581663:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14581583_14581663:PKN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 52 32 84 25.3804002335236 16.3812921639855 8.99910806953814 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0501715559519862 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 39 28 67 19.0353001751427 14.3336306434873 4.70166953165542 T:C C T 10 0.511915380124546 0.272621075298993 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 97 82 179 47.344208127919 41.9770611702128 5.36714695770627 C:G G C 10 0.511915380124546 0.454868944657146 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 44 34 78 21.47572327452 17.4051229242346 4.07060035028542 A:G G A 10 0.511915380124546 0.367343169594949 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 37 46 83 18.0591309353918 23.5481074857291 -5.48897655033732 A:G G A 10 0.511915380124546 0.272131278814351 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 31 43 74 15.1306232161391 22.0123613453555 -6.8817381292164 A:G A G 10 0.511915380124546 0.130205681437719 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 22 31 53 10.73786163726 15.8693767838609 -5.13151514660094 A:C C A 10 0.511915380124546 0.170993473602524 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 105 79 184 51.2488850869227 40.4413150298391 10.8075700570835 T:C C T 10 0.511915380124546 0.121400460261412 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 16611978 T/C 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16611603_16612362:C19orf44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 16633950 T/C 1 45 43 88 21.9638078943954 22.0123613453555 -0.0485534509600427 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16633863_16634101:CHERP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 16989504 G/A 1 41 26 67 20.0114694148936 13.3097998832382 6.70166953165542 A:G G A 10 0.511915380124546 0.112429129333607 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16989308_16991164:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16989308_16991164:SIN3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17173563 G/C 1 25 23 48 12.2021154968864 11.7740537428646 0.428061754021794 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 25 10 35 12.2021154968864 5.11915380124546 7.08296169564089 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0177406483096610 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 17 10 27 8.29743853788272 5.11915380124546 3.17828473663726 C:G C G 10 0.511915380124546 0.251422647805329 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 36 22 58 17.5710463155163 11.26213836274 6.30890795277633 A:G G A 10 0.511915380124546 0.11469228215689 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17351535 G/A 1 9 13 22 4.39276157887909 6.6548999416191 -2.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396442302139566 ENSG00000160113:ENST00000291442:exon_17351480_17351574:NR2F6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 119 115 234 58.082069765179 58.8702687143228 -0.788198949143755 A:G A G 10 0.511915380124546 0.947899254761264 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 9 13 22 4.39276157887909 6.6548999416191 -2.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396442302139566 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 12 2 14 5.85701543850545 1.02383076024909 4.83318467825636 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0132808222441933 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18233507 C/T 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18233483_18233561:MAST3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 15 7 22 7.32126929813181 3.58340766087182 3.73786163725999 A:T T A 10 0.511915380124546 0.136223735342928 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 15 21 36 7.32126929813181 10.7502229826155 -3.42895368448365 A:C A C 10 0.511915380124546 0.317316396592093 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 38 34 72 18.5472155552673 17.4051229242346 1.14209263103269 T:G G T 10 0.511915380124546 0.814502260395669 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 55 48 103 26.84465409315 24.5719382459782 2.27271584717177 T:C T C 10 0.511915380124546 0.693922642805003 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 18779792 G/A 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167487:ENST00000300976:exon_18778474_18781302:KLHL26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 19749013 C/T 1 104 103 207 50.7608004670472 52.7272841528282 -1.96648368578101 T:C C T 10 0.511915380124546 0.834844832300071 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19748968_19749138:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19748968_19749138:GMIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 20044886 T/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C T C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 21909733 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 23837195 T/C 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C T C 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 23926916 T/C 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 23927345 T/C 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 30193653 T/G 1 20 27 47 9.76169239750908 13.8217152633627 -4.06002286585366 T:G T G 10 0.511915380124546 0.246581966365211 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 98 102 200 47.8322927477945 52.2153687727037 -4.38307602490919 T:C T C 10 0.511915380124546 0.57165147442134 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 488 477 965 238.185294499222 244.183636319408 -5.99834182018685 A:G G A 10 0.511915380124546 0.69936145390648 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 47 46 93 22.9399771341463 23.5481074857291 -0.608130351582776 T:C T C 10 0.511915380124546 0.917715058066653 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 28 47 75 13.6663693565127 24.0600228658537 -10.3936535093409 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0203078132746138 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36206050 A/C 1 260 261 521 126.902001167618 133.609914212506 -6.70791304488843 A:T:C:G A C 10 0.511915380124546 0.569038966044794 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36206271 C/T 1 136 112 248 66.3795083030618 57.3345225739491 9.04498572911261 T:C C T 10 0.511915380124546 0.253670610361180 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36207336 G/C 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 C:G G C 10 0.511915380124546 0.599968003294015 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36222857 C/T 1 17 14 31 8.29743853788272 7.16681532174364 1.13062321613908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.72247502509934 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36222809_36223036:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36222809_36223036:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36222809_36223036:AD000671.3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36223747 A/G 1 22 26 48 10.73786163726 13.3097998832382 -2.57193824597821 A:G A G 10 0.511915380124546 0.473946625517885 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36223116_36224409:AD000671.3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36224161 C/A 1 22 12 34 10.73786163726 6.14298456149455 4.59487707576544 A:C C A 10 0.511915380124546 0.125035827053306 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36223116_36224409:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36223116_36224409:AD000671.3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36230247 C/G 1 159 105 264 77.6054545601972 53.7511149130773 23.8543396471199 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00373229979783603 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36230767 A/G 1 96 72 168 46.8561235080436 36.8579073689673 9.99821613907628 A:G A G 10 0.511915380124546 0.142339258607258 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230611_36230989:TMEM149 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36258697 G/C 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 C:G G C 10 0.511915380124546 0.414352368963774 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36258721 C/T 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36258705_36258967:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36258705_36258938:C19orf55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36258842 G/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 C:G G C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36258705_36258967:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36258705_36258938:C19orf55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36259116 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259057_36259138:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259057_36259138:C19orf55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36268771 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000221905:exon_36268726_36268810:ARHGAP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36273308 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273275_36273419:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273275_36273419:ARHGAP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36278470 C/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 70 70 140 34.1659233912818 35.8340766087182 -1.66815321743644 A:G G A 10 0.511915380124546 0.800185933903545 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38573139 G/T 0 22 0 22 10.73786163726 0 10.73786163726 G G 10 0.511915380124546 5.40523048202942e-07 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38571896_38573739:SIPA1L3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 T:C C T 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 72 50 122 35.1420926310327 25.5957690062273 9.54632362480539 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0859509661998872 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 53 58 111 25.8684848533991 29.6910920472237 -3.8226071938246 A:G G A 10 0.511915380124546 0.506701676993915 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 25 21 46 12.2021154968864 10.7502229826155 1.45189251427089 C:G G C 10 0.511915380124546 0.768437629457915 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 24 11 35 11.7140308770109 5.63106918137001 6.08296169564089 A:C C A 10 0.511915380124546 0.042949757679276 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 18 12 30 8.78552315775817 6.14298456149455 2.64253859626362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.365700122215464 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39086580 A/G 1 231 221 452 112.74754719123 113.133299007525 -0.385751816294771 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 251 208 459 122.509239588739 106.478399065906 16.0308405228334 T:C T C 10 0.511915380124546 0.135453195772317 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 154 186 340 75.1650314608199 95.2162607031655 -20.0512292423456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0300641348867615 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39306529 C/T 1 565 535 1100 275.767810229632 273.874728366632 1.89308186299945 T:C C T 10 0.511915380124546 0.927913744352402 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 472 302 774 230.375940581214 154.598444797613 75.7774957836014 T:C:G C T 10 0.511915380124546 5.15679944629101e-08 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 257 269 526 125.437747307992 137.705237253503 -12.2674899455112 T:C:G T G 10 0.511915380124546 0.295301861360394 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39329516 C/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39329517 C/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39820242 G/A 1 223 157 380 108.842870232226 80.3707146795537 28.4721555526725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00399993503450846 ENSG00000130755:ENST00000253054:exon_39820184_39820266:GMFG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39871354 C/A 1 24 10 34 11.7140308770109 5.11915380124546 6.59487707576544 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0256635112543971 ENSG00000179134:ENST00000314471:exon_39871227_39871425:SAMD4B;ENSG00000179134:ENST00000429637:exon_39871227_39871425:SAMD4B;ENSG00000179134:ENST00000392067:exon_39871227_39871395:SAMD4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39915390 C/A 1 52 51 103 25.3804002335236 26.1076843863518 -0.727284152828236 A:C C A 10 0.511915380124546 0.921652913418017 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.515878739571297 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 3108 3082 6190 1516.96699857291 1577.72320154385 -60.7562029709395 A:T:C:G A C 10 0.511915380124546 0.123956067709857 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2955 2992 5947 1442.29005173197 1531.65081733264 -89.3607656006748 A:G G A 10 0.511915380124546 0.020945463837315 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 124 104 228 60.5224928645563 53.2391995329528 7.28329333160352 T:C C T 10 0.511915380124546 0.35393945964921 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 40023088 T/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:G T G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 23 11 34 11.2259462571354 5.63106918137001 5.59487707576544 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0600080878349012 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 T:C C T 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.57307152977622 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 112 112 224 54.6654774260509 57.3345225739491 -2.66904514789829 A:G A G 10 0.511915380124546 0.738562990237633 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 59 77 136 28.7969925726518 39.41748426959 -10.6204916969383 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0718787897085687 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 T:C C T 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 32 19 51 15.6187078360145 9.72639222236637 5.89231561364816 T:C C T 10 0.511915380124546 0.122716913071814 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 9 13 22 4.39276157887909 6.6548999416191 -2.26213836274001 A:G A G 10 0.511915380124546 0.396442302139566 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 260 218 478 126.902001167618 111.597552867151 15.304448300467 A:G A G 10 0.511915380124546 0.169895452496629 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 199 188 387 97.1288393552153 96.2400914634146 0.888747891800705 T:C T C 10 0.511915380124546 0.959459089119097 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41281700 C/T 1 4 9 13 1.95233847950182 4.60723842112091 -2.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170663775067474 ENSG00000213054:ENST00000263369:exon_41281657_41281790:MIA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41307170 G/A 1 110 78 188 53.6893081862999 39.9293996497146 13.7599085365854 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0487139281746236 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C T C 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 20 19 39 9.76169239750908 9.72639222236637 0.0353001751427069 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 35 35 70 17.0829616956409 17.9170383043591 -0.83407660871822 A:G G A 10 0.511915380124546 0.905010881651544 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 160 113 273 78.0935391800726 57.8464379540737 20.2471012259989 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0153430506686341 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 139 145 284 67.8437621626881 74.2277301180592 -6.38396795537106 A:G A G 10 0.511915380124546 0.476395828943186 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 23 30 53 11.2259462571354 15.3574614037364 -4.13151514660094 C:G C G 10 0.511915380124546 0.273895215207071 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 31 29 60 15.1306232161391 14.8455460236118 0.285077192527242 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42083673 T/C 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42083820 C/G 1 11 1 12 5.36893081862999 0.511915380124546 4.85701543850545 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00651276076484706 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42083849 C/A 1 2 9 11 0.976169239750908 4.60723842112091 -3.63106918137001 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0346208523981388 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 5 13 18 2.44042309937727 6.6548999416191 -4.21447684224183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.058592754437712 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 112 91 203 54.6654774260509 46.5842995913337 8.08117783471717 T:C C T 10 0.511915380124546 0.262111515040655 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 42795554 T/C 1 19 18 37 9.27360777763363 9.21447684224183 0.0591309353917993 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42794385_42795618:CIC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 C:G C G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 9 16 25 4.39276157887909 8.19064608199274 -3.79788450311365 C:G G C 10 0.511915380124546 0.161405471327681 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44471252 T/C 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44496070 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44495994_44496086:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44495994_44496086:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44495994_44496086:ZNF155 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44564981 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44564902_44564994:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44564902_44564994:ZNF223 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 3 11 14 1.46425385962636 5.63106918137001 -4.16681532174364 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0315678139197663 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:T A T 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 7 16 23 3.41659233912818 8.19064608199274 -4.77405374286456 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0592824185806538 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 6 12 18 2.92850771925272 6.14298456149455 -3.21447684224183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.159007913775557 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 18 11 29 8.78552315775817 5.63106918137001 3.15445397638817 A:G A G 10 0.511915380124546 0.268874799109534 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 19 9 28 9.27360777763363 4.60723842112091 4.66636935651271 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0896574868913052 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 18 19 37 8.78552315775817 9.72639222236637 -0.940869064608201 A:G A G 10 0.511915380124546 0.869689677577778 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 2 10 12 0.976169239750908 5.11915380124546 -4.14298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0197833900869736 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 C:G C G 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 37 51 88 18.0591309353918 26.1076843863518 -8.04855345096005 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0888911508931887 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 46 45 91 22.4518925142709 23.0361921056046 -0.584299591333682 T:C T C 10 0.511915380124546 0.91685999587672 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 27 34 61 13.1782847366373 17.4051229242346 -4.2268381875973 A:C A C 10 0.511915380124546 0.306650934713769 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 39 49 88 19.0353001751427 25.0838536261028 -6.04855345096004 A:G A G 10 0.511915380124546 0.202465350562864 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 32 41 73 15.6187078360145 20.9885305851064 -5.36982274909186 A:G G A 10 0.511915380124546 0.241706210264101 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 42 12 54 20.4995540347691 6.14298456149455 14.3565694732745 A:C C A 10 0.511915380124546 9.67754837629012e-05 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46025388 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46181392 G/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 C:G G C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 22 22 44 10.73786163726 11.26213836274 -0.524276725480021 T:G G T 10 0.511915380124546 0.881500457303104 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 20 15 35 9.76169239750908 7.67873070186819 2.08296169564089 C:G G C 10 0.511915380124546 0.503837418304441 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 122 101 223 59.5463236248054 51.7034533925791 7.84287023222625 C:G G C 10 0.511915380124546 0.315129684797698 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 68 75 143 33.1897541515309 38.393653509341 -5.20389935781007 T:C C T 10 0.511915380124546 0.403509899501953 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 81 66 147 39.5348542099118 33.78641508822 5.74843912169175 A:G G A 10 0.511915380124546 0.364621784031132 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 78 78 156 38.0706003502854 39.9293996497146 -1.85879929942917 T:C C T 10 0.511915380124546 0.810262636568878 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 45 54 99 21.9638078943954 27.6434305267255 -5.67962263233005 A:G A G 10 0.511915380124546 0.269651212318255 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 A:G A G 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 23 19 42 11.2259462571354 9.72639222236637 1.49955403476907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.757992065227439 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 24 18 42 11.7140308770109 9.21447684224183 2.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.537506839413637 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 65 58 123 31.7255002919045 29.6910920472237 2.03440824468085 A:G G A 10 0.511915380124546 0.719423238125667 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 162 134 296 79.0697084198236 68.5966609366892 10.4730474831344 A:G G A 10 0.511915380124546 0.244864899406156 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 363 505 868 177.17471701479 258.517266962896 -81.3425499481059 A:C:G A G 10 0.511915380124546 3.48911313082184e-08 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 48259220 C/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 48284163 C/T 1 87 89 176 42.4633619291645 45.5604688310846 -3.09710690192009 T:C C T 10 0.511915380124546 0.651673871840064 ENSG00000178980:ENST00000509570:exon_48284121_48284174:SEPW1;ENSG00000178980:ENST00000396715:exon_48284121_48284174:SEPW1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 2 30 32 0.976169239750908 15.3574614037364 -14.3812921639855 T:G G T 10 0.511915380124546 7.80199927609407e-08 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 3 18 21 1.46425385962636 9.21447684224183 -7.75022298261547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000679621139477514 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49339098 T/C 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49339062_49339100:HSD17B14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 16 7 23 7.80935391800726 3.58340766087182 4.22594625713544 A:G A G 10 0.511915380124546 0.095264062576869 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:C C A 10 0.511915380124546 0.748613515230306 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 747 958 1705 364.599211046964 490.414934159315 -125.815723112351 T:C T C 10 0.511915380124546 1.12573093017042e-09 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 A:T A T 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 121 92 213 59.0582390049299 47.0962149714582 11.9620240334717 T:C C T 10 0.511915380124546 0.114731959608341 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 111 103 214 54.1773928061754 52.7272841528282 1.45010865334716 C:G C G 10 0.511915380124546 0.891268981667833 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 149 97 246 72.7246083614426 49.655791872081 23.0688164893617 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00331075961540748 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 147 96 243 71.7484391216917 49.1438764919564 22.6045626297353 T:G T G 10 0.511915380124546 0.00383333220954466 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 C:G C G 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:T A T 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 29 27 56 14.1544539763882 13.8217152633627 0.332738713025426 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50017191 G/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017139_50017390:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017139_50017390:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017139_50017390:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017139_50017390:FCGRT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 138 129 267 67.3556775428127 66.0370840360664 1.31859350674623 C:G C G 10 0.511915380124546 0.90261324882048 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50399354 G/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 C:G G C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 104 85 189 50.7608004670472 43.5128073105864 7.24799315646082 C:G C G 10 0.511915380124546 0.308712516122908 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 120 89 209 58.5701543850545 45.5604688310846 13.0096855539699 T:C C T 10 0.511915380124546 0.072423402792729 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 41 41 82 20.0114694148936 20.9885305851064 -0.977061170212771 A:G G A 10 0.511915380124546 0.912131808514284 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50902164 G/A 1 19 29 48 9.27360777763363 14.8455460236118 -5.57193824597821 A:G G A 10 0.511915380124546 0.114036075690169 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50902108_50902310:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50902105_50902310:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50902105_50902310:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50902105_50902310:POLD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 280 99 379 136.663693565127 50.6796226323301 85.9840709327971 T:C T C 10 0.511915380124546 2.30235670991054e-19 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 187 178 365 91.2718239167099 91.1209376621692 0.150886254540723 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 187 177 364 91.2718239167099 90.6090222820446 0.662801634665271 A:G G A 10 0.511915380124546 0.958224241318188 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 111 172 283 54.1773928061754 88.0494453814219 -33.8720525752465 T:C:G C G 10 0.511915380124546 6.31425951136781e-05 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 123 200 323 60.0344082446808 102.383076024909 -42.3486677802283 A:G A G 10 0.511915380124546 2.60843273219889e-06 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51728641 A/G 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51728474_51728854:CD33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 110 102 212 53.6893081862999 52.2153687727037 1.47393941359626 A:G G A 10 0.511915380124546 0.89075850255619 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52115645 G/C 1 1 8 9 0.488084619875454 4.09532304099637 -3.60723842112091 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0188251691270287 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52114781_52115675:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52115184_52115675:SIGLEC14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52130488 G/A 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130402_52130501:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130402_52130501:SIGLEC14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52132325 A/T 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 A:T A T 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52132291_52132329:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52132291_52132329:SIGLEC14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52447624 C/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52448901 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52468203 T/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:T T A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52468278 G/A 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:G G T 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52520518 T/C 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52520370_52520612:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52538278 A/C 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52619065 T/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 8 8 0 4.09532304099637 -4.09532304099637 C T C 10 0.511915380124546 0.00322077941548718 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53116387 C/T 1 23 30 53 11.2259462571354 15.3574614037364 -4.13151514660094 T:C C T 10 0.511915380124546 0.273895215207071 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53115620_53116929:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53115620_53116929:ZNF83 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 12 15 27 5.85701543850545 7.67873070186819 -1.82171526336274 A:C C A 10 0.511915380124546 0.565249573112803 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53209553 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53209554 G/T 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:G G T 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 53612989 A/G 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000170954:ENST00000243643:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000448501:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000421033:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000440291:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000455735:exon_53611354_53613161:ZNF415 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 11 0 11 5.36893081862999 0 5.36893081862999 A A 10 0.511915380124546 0.00100716923571172 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 43 39 82 20.9876386546445 19.9646998248573 1.02293882978723 A:T A T 10 0.511915380124546 0.82631071055819 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 46 43 89 22.4518925142709 22.0123613453555 0.439531168915408 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 46 37 83 22.4518925142709 18.9408690646082 3.51102344966268 T:G T G 10 0.511915380124546 0.445060607689017 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 54849463 C/T 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55086775 C/T 1 14 2 16 6.83318467825636 1.02383076024909 5.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00434163882715972 ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55086723_55087019:LILRA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 T:C T C 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 69 54 123 33.6778387714063 27.6434305267255 6.03440824468085 T:C C T 10 0.511915380124546 0.280807017012308 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 51 33 84 24.8923156136482 16.89320754411 7.99910806953814 A:G A G 10 0.511915380124546 0.101037827048882 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 74 72 146 36.1182618707836 36.8579073689673 -0.739645498183712 A:G A G 10 0.511915380124546 0.934116179567753 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 65 62 127 31.7255002919045 31.7387535677219 -0.0132532758173376 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 1 22 24 46 10.73786163726 12.2859691229891 -1.54810748572911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.661302444171157 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55493651 C/T 1 19 14 33 9.27360777763363 7.16681532174364 2.10679245588998 T:C C T 10 0.511915380124546 0.490949258794062 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55494632 A/G 1 65 27 92 31.7255002919045 13.8217152633627 17.9037850285418 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000221749747973767 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 1 56 33 89 27.3327387130254 16.89320754411 10.4395311689154 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0333774127886063 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 64 29 93 31.2374156720291 14.8455460236118 16.3918696484172 A:C C A 10 0.511915380124546 0.000808360901309136 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 55686705 G/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:G G T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000129990:ENST00000354308:exon_55686540_55686707:SYT5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 71 58 129 34.6540080111572 29.6910920472237 4.96291596393357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.428121890486446 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 56160776 C/T 1 140 131 271 68.3318467825636 67.0609147963155 1.27093198624804 T:C C T 10 0.511915380124546 0.903344923564132 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56160774_56160950:CCDC106 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 290 252 542 141.544539763882 129.002675791386 12.5418639724961 T:C C T 10 0.511915380124546 0.283130300994525 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57703258 C/T 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57702869_57703314:ZNF264 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57839567 T/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C C T 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57932027 C/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 16 6 22 7.80935391800726 3.07149228074728 4.73786163725999 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0539349281471928 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 58805783 C/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 2509 2505 5014 1224.60431126751 1282.34802721199 -57.7437159444733 A:T:C:G G A 10 0.511915380124546 0.104261235272604 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 351 331 682 171.317701576284 169.443990821225 1.87371075505968 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.908533667915234 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 29 32 61 14.1544539763882 16.3812921639855 -2.2268381875973 A:G A G 10 0.511915380124546 0.609617494552364 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 24 24 48 11.7140308770109 12.2859691229891 -0.571938245978206 A:G A G 10 0.511915380124546 0.886208204797435 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 3628379 C/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:C C A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 17 20 37 8.29743853788272 10.2383076024909 -1.9408690646082 T:C T C 10 0.511915380124546 0.62244012208179 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 29 24 53 14.1544539763882 12.2859691229891 1.86848485339906 A:C C A 10 0.511915380124546 0.680829972632713 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 68 67 135 33.1897541515309 34.2983304683446 -1.1085763168137 T:G T G 10 0.511915380124546 0.863663852039082 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 49 46 95 23.9161463738972 23.5481074857291 0.368038888168133 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 A:G A G 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 195 156 351 95.1765008757135 79.8587992994292 15.3177015762844 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.109150414041717 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 166 156 322 81.0220468993254 79.8587992994292 1.16324759989621 T:C C T 10 0.511915380124546 0.911319175616203 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 28 34 62 13.6663693565127 17.4051229242346 -3.73875356772185 T:C C T 10 0.511915380124546 0.374990890465063 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 15743344 T/C 1 30 13 43 14.6425385962636 6.6548999416191 7.98763865464452 T:C T C 10 0.511915380124546 0.021015265791021 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15743316_15743399:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15743316_15743399:DDX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 26 35 61 12.6902001167618 17.9170383043591 -5.22683818759731 T:C C T 10 0.511915380124546 0.200960091042057 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 20132062 T/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000118965:ENST00000345530:exon_20132044_20132208:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000281405:exon_20132044_20132208:WDR35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 T:C C T 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 27 15 42 13.1782847366373 7.67873070186819 5.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.121690688156681 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 22 30 52 10.73786163726 15.3574614037364 -4.61959976647639 A:G A G 10 0.511915380124546 0.213943248938703 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 24929851 A/T 1 18 5 23 8.78552315775817 2.55957690062273 6.22594625713544 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0111159395482872 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24929437_24930757:NCOA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 26 28 54 12.6902001167618 14.3336306434873 -1.64343052672548 T:C C T 10 0.511915380124546 0.68470828279398 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 146 126 272 71.2603545018163 64.5013378956928 6.75901660612351 A:G G A 10 0.511915380124546 0.430691207521197 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 117 139 256 57.1059005254281 71.1562378373119 -14.0503373118838 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0803076405183532 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 27246285 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000084764:ENST00000233121:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000405074:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000475633:exon_27246200_27247089:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000481222:exon_27246200_27246813:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000474367:exon_27246200_27246402:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000458529:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000402218:exon_27246200_27246345:MAPRE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 27315252 G/A 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000429697:exon_27315200_27315316:KHK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 70 56 126 34.1659233912818 28.6672612869746 5.49866210430721 T:G G T 10 0.511915380124546 0.372931267152051 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 13 15 28 6.3451000583809 7.67873070186819 -1.33363064348729 A:C C A 10 0.511915380124546 0.706603507317959 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 22 10 32 10.73786163726 5.11915380124546 5.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0521696794811529 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 33783370 G/A 1 36 28 64 17.5710463155163 14.3336306434873 3.23741567202906 A:G G A 10 0.511915380124546 0.454435798502245 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33783278_33783403:RASGRP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 33810348 C/T 1 75 75 150 36.606346490659 38.393653509341 -1.7873070186819 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.806643609221813 ENSG00000119812:ENST00000238823:exon_33808725_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000395190:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000441530:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000474985:exon_33808729_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000403368:exon_33808737_33810764:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000475122:exon_33809956_33810511:FAM98A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 A:G G A 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 66 51 117 32.21358491178 26.1076843863518 6.10590052542812 A:G G A 10 0.511915380124546 0.268360360114556 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 38 32 70 18.5472155552673 16.3812921639855 2.16592339128178 A:G G A 10 0.511915380124546 0.633955897283213 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 38302177 C/A 1 3 12 15 1.46425385962636 6.14298456149455 -4.67873070186819 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0187794943013981 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 38977314 G/A 1 145 151 296 70.7722698819408 77.2992223988064 -6.52695251686561 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.450466203422695 ENSG00000115875:ENST00000313117:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000425778:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000425941:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000409276:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000431066:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000446327:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000378857:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000443213:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000415527:exon_38977156_38977336:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000378869:exon_38977156_38977336:SRSF7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 24 14 38 11.7140308770109 7.16681532174364 4.54721555526725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.147616076984032 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 42990893 T/G 1 15 13 28 7.32126929813181 6.6548999416191 0.666369356512713 T:G T G 10 0.511915380124546 0.85173783903044 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 A:T T A 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 53 73 126 25.8684848533991 37.3698227490919 -11.5013378956928 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0495074748524952 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 16 19 35 7.80935391800726 9.72639222236637 -1.91703830435911 C:G G C 10 0.511915380124546 0.612754653958834 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54036357 G/A 1 37 27 64 18.0591309353918 13.8217152633627 4.23741567202906 A:G G A 10 0.511915380124546 0.318288505298784 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54036351_54036410:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54036351_54036410:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000378239:exon_54036351_54036410:ERLEC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 36 39 75 17.5710463155163 19.9646998248573 -2.39365350934095 A:G A G 10 0.511915380124546 0.644448386955135 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 19 26 45 9.27360777763363 13.3097998832382 -4.03619210560457 A:G G A 10 0.511915380124546 0.236895268949332 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 24 34 58 11.7140308770109 17.4051229242346 -5.69109204722366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.149198054581234 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 54135936 T/C 1 22 15 37 10.73786163726 7.67873070186819 3.0591309353918 T:C T C 10 0.511915380124546 0.329099236347658 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000461810:exon_54135921_54135980:PSME4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 135 105 240 65.8914236831863 53.7511149130773 12.140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.121455525506867 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 35 28 63 17.0829616956409 14.3336306434873 2.7493310521536 T:C C T 10 0.511915380124546 0.529841286579674 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 38 58 96 18.5472155552673 29.6910920472237 -11.1438764919564 A:T T A 10 0.511915380124546 0.0245946185745189 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 27 31 58 13.1782847366373 15.8693767838609 -2.69109204722367 T:G G T 10 0.511915380124546 0.513007349758345 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 78 73 151 38.0706003502854 37.3698227490919 0.700777601193565 A:G A G 10 0.511915380124546 0.935240627808835 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55771169 A/T 1 96 82 178 46.8561235080436 41.9770611702128 4.87906233783082 A:T A T 10 0.511915380124546 0.500014918751479 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 55872538 T/C 1 16 20 36 7.80935391800726 10.2383076024909 -2.42895368448366 T:C T C 10 0.511915380124546 0.505535383228504 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 60689441 T/C 1 21 16 37 10.2497770173845 8.19064608199274 2.0591309353918 T:C T C 10 0.511915380124546 0.515825881281712 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 80 87 167 39.0467695900363 44.5366380708355 -5.48986848079918 A:G A G 10 0.511915380124546 0.438998291646395 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 36 42 78 17.5710463155163 21.5004459652309 -3.92939964971459 A:G G A 10 0.511915380124546 0.428118431058592 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 253 206 459 123.48540882849 105.454568305656 18.0308405228334 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0930053499402931 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 41 56 97 20.0114694148936 28.6672612869746 -8.65579187208096 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0844745650640538 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 25 33 58 12.2021154968864 16.89320754411 -4.69109204722366 A:G A G 10 0.511915380124546 0.238390327029988 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 394 388 782 192.305340230929 198.623167488324 -6.31782725739495 T:G G T 10 0.511915380124546 0.667798312981135 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 200 151 351 97.6169239750908 77.2992223988064 20.3177015762844 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.0325911640646274 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 734 740 1474 358.254110988583 378.817381292164 -20.5632703035807 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.285540413722599 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 69040500 G/A 1 3 15 18 1.46425385962636 7.67873070186819 -6.21447684224183 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0037081362869019 ENSG00000163219:ENST00000463483:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000456116:exon_69040419_69040526:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000488795:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000473986:exon_69040421_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497079:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69040419_69040551:ARHGAP25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 69741801 C/T 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000115977:ENST00000409068:exon_69741603_69741881:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69741603_69741881:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69741603_69741881:AAK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 31 37 68 15.1306232161391 18.9408690646082 -3.81024584846913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.39644005178159 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 70162534 T/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:G T G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000059728:ENST00000435990:exon_70162483_70162597:MXD1;ENSG00000059728:ENST00000264444:exon_70162483_70162597:MXD1;ENSG00000059728:ENST00000409442:exon_70162483_70162597:MXD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 70408938 A/G 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70408295_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70408295_70409127:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000447804:exon_70408612_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000417865:exon_70408641_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000419381:exon_70408735_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000470096:exon_70408762_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000457952:exon_70408782_70409129:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000428010:exon_70408938_70409129:C2orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 115 88 203 56.1297312856772 45.04855345096 11.0811778347172 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.122900716582387 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 52 35 87 25.3804002335236 17.9170383043591 7.4633619291645 A:C A C 10 0.511915380124546 0.132804233460651 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 56 46 102 27.3327387130254 23.5481074857291 3.78463122729631 T:G G T 10 0.511915380124546 0.488741654560227 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 47 46 93 22.9399771341463 23.5481074857291 -0.608130351582776 A:G G A 10 0.511915380124546 0.917715058066653 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71365805 A/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 57 34 91 27.8208233329009 17.4051229242346 10.4157004086663 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0354217243671039 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 40 46 86 19.5233847950182 23.5481074857291 -4.02472269071096 A:G G A 10 0.511915380124546 0.390699237603388 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 71417134 C/T 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 46 161 207 22.4518925142709 82.4183762000519 -59.966483685781 A:C C A 10 0.511915380124546 1.58696991093089e-17 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 409 364 773 199.626609529061 186.337198365335 13.289411163726 A:T:C:G A T 10 0.511915380124546 0.349637837448201 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 74690080 C/G 1 44 44 88 21.47572327452 22.52427672548 -1.04855345096004 C:G C G 10 0.511915380124546 0.831999306070479 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 37 34 71 18.0591309353918 17.4051229242346 0.654008011157238 A:T T A 10 0.511915380124546 0.905949895193709 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75099477 A/T 1 12 8 20 5.85701543850545 4.09532304099637 1.76169239750908 A:T A T 10 0.511915380124546 0.505895428449493 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75099427_75099546:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75099427_75099546:HK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75101454 T/C 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 T:C T C 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75101393_75101576:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75101393_75101576:HK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 38 56 94 18.5472155552673 28.6672612869746 -10.1200457317073 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0391237025541048 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 33 26 59 16.10679245589 13.3097998832382 2.79699257265179 A:G A G 10 0.511915380124546 0.51596135333126 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 74 36 110 36.1182618707836 18.4289536844837 17.6893081862999 A:T:C:G G A 10 0.511915380124546 0.000779961358394299 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 T:C C T 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 80801346 T/C 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000066032:ENST00000466387:exon_80801288_80801439:CTNNA2;ENSG00000066032:ENST00000496558:exon_80801288_80801439:CTNNA2;ENSG00000066032:ENST00000402739:exon_80801288_80801439:CTNNA2;ENSG00000066032:ENST00000361291:exon_80801288_80801439:CTNNA2;ENSG00000066032:ENST00000343114:exon_80801288_80801439:CTNNA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 26 39 65 12.6902001167618 19.9646998248573 -7.27449970809549 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0820766477322011 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 40 46 86 19.5233847950182 23.5481074857291 -4.02472269071096 A:G G A 10 0.511915380124546 0.390699237603388 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85570388 G/T 1 35 6 41 17.0829616956409 3.07149228074728 14.0114694148936 T:G G T 10 0.511915380124546 6.04779579237872e-06 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85571433 G/A 1 15 6 21 7.32126929813181 3.07149228074728 4.24977701738453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.080117730436745 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 69 127 196 33.6778387714063 65.0132532758173 -31.335414504411 T:G T G 10 0.511915380124546 8.05625683448705e-06 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 117 231 348 57.1059005254281 118.25245280877 -61.146552283342 T:C C T 10 0.511915380124546 5.56536061294622e-11 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86259443 C/T 1 24 11 35 11.7140308770109 5.63106918137001 6.08296169564089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.042949757679276 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86259395_86259505:POLR1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86260785 C/T 1 9 32 41 4.39276157887909 16.3812921639855 -11.9885305851064 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000223207330497231 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86260784_86260910:POLR1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86272758 G/A 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86272740_86272892:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86272740_86272892:POLR1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86317037 G/C 1 1 11 12 0.488084619875454 5.63106918137001 -5.14298456149455 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00280717964749689 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86316945_86317052:POLR1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 24 24 48 11.7140308770109 12.2859691229891 -0.571938245978206 A:G A G 10 0.511915380124546 0.886208204797435 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86364653 A/G 1 70 114 184 34.1659233912818 58.3583533341982 -24.1924299429165 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000379679650513464 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86364592_86369280:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86364592_86365316:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000455260:exon_86364592_86369280:PTCD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86400791 T/C 1 93 82 175 45.3918696484172 41.9770611702128 3.41480847820446 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.650213668943659 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 86406556 C/T 1 75 88 163 36.606346490659 45.04855345096 -8.44220696030099 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.209880015545236 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86406556_86406745:IMMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 18 21 39 8.78552315775817 10.7502229826155 -1.96469982485729 A:C C A 10 0.511915380124546 0.631453985165305 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 9 3 12 4.39276157887909 1.53574614037364 2.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.147368325849718 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 0 0 9 9 0 4.60723842112091 -4.60723842112091 C T C 10 0.511915380124546 0.00157201289671075 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 C:G G C 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 1599 6067 7666 780.447307180851 3105.79061121562 -2325.34330403477 A:T:C:G C G 10 0.511915380124546 4.94065645841247e-324 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 89160129 C/G 1 15 3 18 7.32126929813181 1.53574614037364 5.78552315775817 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00783051791605677 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 89160377 G/C 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.201032617783037 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 89161003 C/G 0 18 0 18 8.78552315775817 0 8.78552315775817 C C 10 0.511915380124546 8.29986411986438e-06 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 89161030 T/G 0 12 0 12 5.85701543850545 0 5.85701543850545 T T 10 0.511915380124546 0.00050666091488124 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 98421626 A/G 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98421551_98421668:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98421551_98421668:TMEM131 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 99778735 A/G 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000449211:exon_99778420_99778826:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000415142:exon_99778420_99778738:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 7 16 23 3.41659233912818 8.19064608199274 -4.77405374286456 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0592824185806538 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 334 281 615 163.020263038402 143.848221814997 19.1720412234042 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.125404318586455 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 100 94 194 48.8084619875454 48.1200457317073 0.688416255838085 T:C T C 10 0.511915380124546 0.942834150699708 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 15 21 36 7.32126929813181 10.7502229826155 -3.42895368448365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.317316396592093 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 6 24 30 2.92850771925272 12.2859691229891 -9.35746140373638 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000718206029877274 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 103001402 C/T 1 2 12 14 0.976169239750908 6.14298456149455 -5.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00625964766936787 ENSG00000115604:ENST00000410040:exon_103001338_103001458:IL18R1;ENSG00000115604:ENST00000409599:exon_103001338_103001458:IL18R1;ENSG00000115604:ENST00000233957:exon_103001338_103001458:IL18R1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 51 34 85 24.8923156136482 17.4051229242346 7.48719268941359 T:C C T 10 0.511915380124546 0.128288468965783 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 17 32 49 8.29743853788272 16.3812921639855 -8.08385362610275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0222545630432725 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 66 61 127 32.21358491178 31.2268381875973 0.986746724182666 A:G A G 10 0.511915380124546 0.92931900358315 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 22 18 40 10.73786163726 9.21447684224183 1.52338479501816 T:C T C 10 0.511915380124546 0.639673744429068 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105959592 G/A 1 45 36 81 21.9638078943954 18.4289536844837 3.53485420991178 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.439299321867863 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 105977761 G/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113067494 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113067462_113067738:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113067462_113067738:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000476511:exon_113067462_113067738:ZC3H6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:T T A 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 11 3 14 5.36893081862999 1.53574614037364 3.83318467825636 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0583451092032102 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113513993 G/C 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 C:G G C 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113513554_113514791:CKAP2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 83 91 174 40.5110234496627 46.5842995913337 -6.07327614167099 T:C T C 10 0.511915380124546 0.363838366299358 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 68 66 134 33.1897541515309 33.78641508822 -0.596660936689155 C:G G C 10 0.511915380124546 0.931338257713563 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 64 50 114 31.2374156720291 25.5957690062273 5.64164666580176 A:G A G 10 0.511915380124546 0.303874440064406 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 116 88 204 56.6178159055527 45.04855345096 11.5692624545926 C:G G C 10 0.511915380124546 0.107643790664704 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 39 35 74 19.0353001751427 17.9170383043591 1.1182618707836 T:C C T 10 0.511915380124546 0.817045385944873 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 35 19 54 17.0829616956409 9.72639222236637 7.35656947327452 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0558570329307411 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 83 50 133 40.5110234496627 25.5957690062273 14.9152544434354 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0116134277002865 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 15 17 32 7.32126929813181 8.70256146211728 -1.38129216398547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.72441756587225 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 13 18 31 6.3451000583809 9.21447684224183 -2.86937678386093 T:C C T 10 0.511915380124546 0.369791757385296 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 21 7 28 10.2497770173845 3.58340766087182 6.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0132277180436573 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 47 38 85 22.9399771341463 19.4527844447327 3.48719268941359 A:G A G 10 0.511915380124546 0.515310591398782 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 136537941 C/G 1 66 68 134 32.21358491178 34.8102458484691 -2.59666093668915 C:G C G 10 0.511915380124546 0.666577421798027 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136537753_136537955:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136537753_136537955:UBXN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 144245006 G/A 1 50 45 95 24.4042309937727 23.0361921056046 1.36803888816814 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.837579536005818 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144244942_144245064:ARHGAP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 18 10 28 8.78552315775817 5.11915380124546 3.66636935651271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.188426563384957 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 44 31 75 21.47572327452 15.8693767838609 5.60634649065905 T:C T C 10 0.511915380124546 0.205515777075822 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 65 52 117 31.7255002919045 26.6195997664764 5.10590052542812 A:G G A 10 0.511915380124546 0.356472244765515 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 157406249 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000115159:ENST00000310454:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000438166:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409674:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409125:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409861:exon_157406120_157406284:GPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 158290914 G/C 1 139 160 299 67.8437621626881 81.9064608199274 -14.0626986572393 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.105572897507708 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000418920:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000497432:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158290673_158290936:CYTIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 30 32 62 14.6425385962636 16.3812921639855 -1.73875356772185 T:C T C 10 0.511915380124546 0.704018449283421 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 37 28 65 18.0591309353918 14.3336306434873 3.72550029190451 C:G G C 10 0.511915380124546 0.386457325722391 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 23 18 41 11.2259462571354 9.21447684224183 2.01146941489361 T:C C T 10 0.511915380124546 0.537488200943764 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 24 26 50 11.7140308770109 13.3097998832382 -1.5957690062273 T:C C T 10 0.511915380124546 0.673604244288028 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 26 14 40 12.6902001167618 7.16681532174364 5.52338479501816 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0841195618832647 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 152 143 295 74.188862221069 73.2038993578101 0.984962863258943 T:C C T 10 0.511915380124546 0.953571744468324 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 128 135 263 62.4748313440581 69.1085763168137 -6.63374497275559 T:C T C 10 0.511915380124546 0.423145973133474 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 312 276 588 152.282401401142 141.288644914375 10.993756486767 A:T T A 10 0.511915380124546 0.386358496181551 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 170592709 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000213160:ENST00000272797:exon_170591523_170592737:KLHL23;ENSG00000213160:ENST00000392647:exon_170591523_170592737:KLHL23;ENSG00000213160:ENST00000437875:exon_170592062_170592737:KLHL23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 171055772 A/G 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 A:G A G 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000071909:ENST00000409044:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000409940:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000317935:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000408978:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000438642:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000317915:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000334231:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000484338:exon_171055718_171055901:MYO3B;ENSG00000071909:ENST00000442690:exon_171055718_171055901:MYO3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 124 101 225 60.5224928645563 51.7034533925791 8.81903947197716 T:C C T 10 0.511915380124546 0.257038533475765 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 76 62 138 37.0944311105345 31.7387535677219 5.35567754281266 T:G T G 10 0.511915380124546 0.394734258055532 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 1 3 651 654 1.46425385962636 333.256912461079 -331.792658601453 A:C:G G A 10 0.511915380124546 1.01487686979093e-196 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 47 73 120 22.9399771341463 37.3698227490919 -14.4298456149455 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0102736424762760 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 75 83 158 36.606346490659 42.4889765503373 -5.88263005967826 T:C C T 10 0.511915380124546 0.381508248157701 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 78 77 155 38.0706003502854 39.41748426959 -1.34688391930462 T:C C T 10 0.511915380124546 0.872437166533278 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 T:G T G 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 34 31 65 16.5948770757654 15.8693767838609 0.725500291904513 A:G A G 10 0.511915380124546 0.901631371744221 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 18 19 37 8.78552315775817 9.72639222236637 -0.940869064608201 A:G A G 10 0.511915380124546 0.869689677577778 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 A:G A G 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 191524394 C/T 1 31 21 52 15.1306232161391 10.7502229826155 4.38040023352361 T:C C T 10 0.511915380124546 0.267255104822084 ENSG00000138386:ENST00000409581:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000357215:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000337386:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000409641:exon_191523785_191524721:NAB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 191818323 A/C 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000457316:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409428:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000412247:exon_191818291_191818352:GLS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 15 6 21 7.32126929813181 3.07149228074728 4.24977701738453 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.080117730436745 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 119 124 243 58.082069765179 63.4775071354437 -5.39543737026467 A:G A G 10 0.511915380124546 0.521194335781786 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 198570343 C/T 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:G G T 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C T C 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 203417506 C/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203417439_203417611:BMPR2;ENSG00000204217:ENST00000374574:exon_203417439_203417611:BMPR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 39 59 98 19.0353001751427 30.2030074273482 -11.1677072522055 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0260673115185942 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 44 31 75 21.47572327452 15.8693767838609 5.60634649065905 A:C C A 10 0.511915380124546 0.205515777075822 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 A:G G A 10 0.511915380124546 0.414352368963774 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 1 12 13 0.488084619875454 6.14298456149455 -5.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00147143006215042 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 59 48 107 28.7969925726518 24.5719382459782 4.22505432667358 C:G G C 10 0.511915380124546 0.439999222473745 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 5 21 26 2.44042309937727 10.7502229826155 -8.3097998832382 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00124580264175036 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 22 17 39 10.73786163726 8.70256146211728 2.03530017514271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.527014451735681 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 14 11 25 6.83318467825636 5.63106918137001 1.20211549688635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.692143728741491 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 21 20 41 10.2497770173845 10.2383076024909 0.0114694148936145 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 16 22 38 7.80935391800726 11.26213836274 -3.45278444473275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.330380878567993 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:G G A 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225670901 G/C 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 C:G G C 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225670843_225670954:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 15 20 35 7.32126929813181 10.2383076024909 -2.91703830435911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.398399015735378 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225684166 A/G 1 12 20 32 5.85701543850545 10.2383076024909 -4.38129216398547 A:G A G 10 0.511915380124546 0.156458779115569 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225684163_225684246:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225709926 A/G 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 A:G A G 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225709920_225710041:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225719693 G/A 1 18 15 33 8.78552315775817 7.67873070186819 1.10679245588998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.730790496693958 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225719680_225719759:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225719680_225719759:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225719680_225719759:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225727431 T/C 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:C T C 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225725297_225727463:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 225750861 C/T 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000471810:exon_225750798_225750902:DOCK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 32 35 67 15.6187078360145 17.9170383043591 -2.29833046834458 C:G G C 10 0.511915380124546 0.62567948251645 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 105 84 189 51.2488850869227 43.0008919304619 8.24799315646082 A:G A G 10 0.511915380124546 0.244620044632396 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 106 83 189 51.7369697067981 42.4889765503373 9.24799315646082 T:C C T 10 0.511915380124546 0.190475363770772 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231077676 G/A 1 101 76 177 49.2965466074209 38.9055688894655 10.3909777179554 A:G G A 10 0.511915380124546 0.132478449836626 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 27 15 42 13.1782847366373 7.67873070186819 5.49955403476907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.121690688156681 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 233659553 C/A 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233659458_233659654:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233659458_233659654:GIGYF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 42 30 72 20.4995540347691 15.3574614037364 5.14209263103269 A:G G A 10 0.511915380124546 0.239985711533014 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 234201922 C/T 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C C T 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000085978:ENST00000392017:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000373525:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392021:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000479942:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000347464:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000474148:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392020:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392018:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000334050:exon_234201902_234201992:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000473865:exon_234201902_234202003:ATG16L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 47 27 74 22.9399771341463 13.8217152633627 9.1182618707836 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0363470446494601 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C T C 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 239155053 C/T 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239152679_239155165:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239152679_239155165:PER2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 84 98 182 40.9991080695381 50.1677072522055 -9.16859918266736 T:C T C 10 0.511915380124546 0.182354782810784 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 241570107 C/T 1 28 15 43 13.6663693565127 7.67873070186819 5.98763865464452 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0921974284201415 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 53 48 101 25.8684848533991 24.5719382459782 1.29654660742086 A:T T A 10 0.511915380124546 0.842479514327395 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 34 49 83 16.5948770757654 25.0838536261028 -8.48897655033731 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0783342225043689 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 13 5 18 6.3451000583809 2.55957690062273 3.78552315775817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0979415445230112 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 A:T T A 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 4 9 13 1.95233847950182 4.60723842112091 -2.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.170663775067474 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 C:G G C 10 0.511915380124546 0.550465718738869 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 43 34 77 20.9876386546445 17.4051229242346 3.58251573040996 T:C T C 10 0.511915380124546 0.427268695031442 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 49 30 79 23.9161463738972 15.3574614037364 8.55868497016087 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0562338468564208 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 140 136 276 68.3318467825636 69.6204916969382 -1.28864491437469 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.904206314602386 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 826208 T/C 1 26 15 41 12.6902001167618 7.67873070186819 5.01146941489362 T:C T C 10 0.511915380124546 0.121530770428778 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 99 95 194 48.3203773676699 48.6319611118319 -0.311583744161915 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 90 97 187 43.9276157887909 49.655791872081 -5.72817608329009 A:G A G 10 0.511915380124546 0.421449892785086 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 2636218 C/A 1 11 14 25 5.36893081862999 7.16681532174364 -1.79788450311365 A:C C A 10 0.511915380124546 0.550465718738869 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 206 198 404 100.545431694344 101.35924526466 -0.813813570316569 T:C T C 10 0.511915380124546 0.960322991228004 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 2638557 C/T 1 43 31 74 20.9876386546445 15.8693767838609 5.1182618707836 T:C C T 10 0.511915380124546 0.246649910489570 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 592 522 1114 288.946094966269 267.219828425013 21.7262665412558 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.197545579264731 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 34 55 89 16.5948770757654 28.15534590685 -11.5604688310846 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0147335977913846 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 80 95 175 39.0467695900363 48.6319611118319 -9.58519152179554 A:G G A 10 0.511915380124546 0.151394008718410 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3735141 C/T 1 49 63 112 23.9161463738972 32.2506689478464 -8.33452257394914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.130274451682730 ENSG00000101220:ENST00000379772:exon_3735044_3735166:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000217195:exon_3735044_3735166:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000487464:exon_3734913_3735166:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399672:exon_3735044_3735166:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000405186:exon_3734156_3736254:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399673:exon_3735044_3735166:C20orf27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 33 22 55 16.10679245589 11.26213836274 4.84465409314997 T:C C T 10 0.511915380124546 0.22490313913956 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 C:G C G 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 3842984 C/T 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 32 34 66 15.6187078360145 17.4051229242346 -1.78641508822003 A:G G A 10 0.511915380124546 0.712489234335892 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 47 67 114 22.9399771341463 34.2983304683446 -11.3583533341982 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0389004437728062 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 7967980 G/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 C:G G C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7967935_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7967935_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7967957_7968036:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7967971_7968036:TMX4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 9496716 C/G 1 39 88 127 19.0353001751427 45.04855345096 -26.0132532758173 C:G C G 10 0.511915380124546 4.47213156713048e-06 ENSG00000125869:ENST00000246070:exon_9496647_9496778:C20orf103 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 11903654 G/A 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000132640:ENST00000449734:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000254977:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000407832:exon_11903282_11907243:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000399006:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000405977:exon_11903282_11907257:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000449299:exon_11903282_11903658:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000378226:exon_11903282_11907243:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000453685:exon_11903282_11905859:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000471120:exon_11903282_11903683:BTBD3;ENSG00000132640:ENST00000473180:exon_11903282_11903778:BTBD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 28 32 60 13.6663693565127 16.3812921639855 -2.71492280747276 A:G G A 10 0.511915380124546 0.519880539854187 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 31 32 63 15.1306232161391 16.3812921639855 -1.2506689478464 T:G T G 10 0.511915380124546 0.801595611772682 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 51 48 99 24.8923156136482 24.5719382459782 0.320377367669948 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 44 38 82 21.47572327452 19.4527844447327 2.02293882978723 A:C C A 10 0.511915380124546 0.660704297711749 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 79 78 157 38.5586849701609 39.9293996497146 -1.37071467955371 A:G G A 10 0.511915380124546 0.873234283804922 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 18296390 A/G 1 22 14 36 10.73786163726 7.16681532174364 3.57104631551635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.247804062585390 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 C:G C G 10 0.511915380124546 0.416316526978764 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 23345069 C/T 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000424216:exon_23345000_23345166:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 23345589 A/G 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:G A G 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25255338 C/T 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C C T 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25255228_25255359:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25259006 G/T 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25258955_25259098:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 10 3 13 4.88084619875454 1.53574614037364 3.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0934748740494892 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25262769 G/A 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25262669_25262783:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 17 7 24 8.29743853788272 3.58340766087182 4.7140308770109 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0657083168882434 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25275621 T/C 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25275379_25275666:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000465694:exon_25275379_25275666:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25275379_25275666:ABHD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 32 22 54 15.6187078360145 11.26213836274 4.35656947327452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.276447351326516 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 36 54 90 17.5710463155163 27.6434305267255 -10.0723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0351428862641825 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 25666737 C/T 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130684:ENST00000376436:exon_25666632_25666758:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000252979:exon_25666632_25666758:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000376412:exon_25666632_25666758:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000481610:exon_25666632_25666885:ZNF337 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 30789799 C/T 1 14 8 22 6.83318467825636 4.09532304099637 2.73786163725999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.289304325792258 ENSG00000126003:ENST00000246229:exon_30789722_30790095:PLAGL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 32248163 C/T 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000125967:ENST00000375238:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000246190:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000488489:exon_32247691_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000483813:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485399:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485976:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000478237:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000494174:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000463246:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000480994:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000439478:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000498353:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000493590:exon_32248065_32248201:NECAB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 34242660 C/T 1 69 58 127 33.6778387714063 29.6910920472237 3.98674672418266 T:C C T 10 0.511915380124546 0.534555856979325 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 35128751 G/A 1 131 173 304 63.9390852036845 88.5613607615465 -24.622275557862 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00489956170087597 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482872:exon_35128602_35128763:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000495241:exon_35128602_35129000:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479951:exon_35128602_35128930:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000478910:exon_35128602_35129014:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000483381:exon_35128742_35128821:DLGAP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 35857025 G/T 1 164 144 308 80.0458776595745 73.7158147379346 6.33006292163984 T:G G T 10 0.511915380124546 0.494155135977691 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35856953_35857147:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35856953_35857147:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35856953_35857147:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35856953_35857147:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373623:exon_35856953_35857147:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35856953_35857147:RPN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 187 174 361 91.2718239167099 89.073276141671 2.1985477750389 T:C C T 10 0.511915380124546 0.833335726399063 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 37647484 C/T 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C C T 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37647447_37647542:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37647447_37647542:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37647447_37647542:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37647447_37647542:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37647447_37647542:DHX35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 A:G A G 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 85 105 190 41.4871926894136 53.7511149130773 -12.2639222236637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0814786696047234 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 75 78 153 36.606346490659 39.9293996497146 -3.32305315905553 A:C A C 10 0.511915380124546 0.627796137227734 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 82 88 170 40.0229388297872 45.04855345096 -5.02561462117281 T:C C T 10 0.511915380124546 0.444221973658038 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 43955910 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124145:ENST00000372733:exon_43953928_43956055:SDC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 30 52 82 14.6425385962636 26.6195997664764 -11.9770611702128 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0106173209121639 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 44 35 79 21.47572327452 17.9170383043591 3.55868497016087 T:C T C 10 0.511915380124546 0.433371376432747 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 41 41 82 20.0114694148936 20.9885305851064 -0.977061170212771 A:G A G 10 0.511915380124546 0.912131808514284 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 46268394 C/T 1 49 33 82 23.9161463738972 16.89320754411 7.02293882978723 T:C C T 10 0.511915380124546 0.123563036478573 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 47 36 83 22.9399771341463 18.4289536844837 4.51102344966268 A:G A G 10 0.511915380124546 0.325963309372878 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 62 56 118 30.2612464322781 28.6672612869746 1.59398514530358 T:C C T 10 0.511915380124546 0.783118355763959 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 29 26 55 14.1544539763882 13.3097998832382 0.844654093149972 A:G G A 10 0.511915380124546 0.892977672817521 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 29 27 56 14.1544539763882 13.8217152633627 0.332738713025426 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 11 19 30 5.36893081862999 9.72639222236637 -4.35746140373638 C:G C G 10 0.511915380124546 0.143283608395161 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 14 6 20 6.83318467825636 3.07149228074728 3.76169239750908 A:G G A 10 0.511915380124546 0.117374955156906 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 48808011 C/T 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C C T 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000172216:ENST00000303004:exon_48807376_48809212:CEBPB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 98 97 195 47.8322927477945 49.655791872081 -1.82349912428646 T:C C T 10 0.511915380124546 0.829963938139 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 50092027 T/G 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:G T G 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 12 13 25 5.85701543850545 6.6548999416191 -0.797884503113649 T:C T C 10 0.511915380124546 0.842403639874975 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 25 31 56 12.2021154968864 15.8693767838609 -3.66726128697457 T:C C T 10 0.511915380124546 0.351342325551452 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 52583523 T/A 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:T T A 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52583445_52583612:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52583445_52583612:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52583445_52583612:BCAS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 36 37 73 17.5710463155163 18.9408690646082 -1.36982274909186 A:G G A 10 0.511915380124546 0.815138312709073 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 29 33 62 14.1544539763882 16.89320754411 -2.73875356772185 C:G C G 10 0.511915380124546 0.526487813382936 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 892 915 1807 435.371480928905 468.40257281396 -33.0310918850546 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.120474061250686 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 190 150 340 92.7360777763363 76.7873070186819 15.9487707576544 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0924878699706836 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 5 8 13 2.44042309937727 4.09532304099637 -1.6548999416191 T:G G T 10 0.511915380124546 0.414352368963774 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 299 250 549 145.937301342761 127.978845031136 17.9584563116243 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.135056136283807 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 60886310 T/C 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000130702:ENST00000370691:exon_60886218_60886363:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60886218_60886363:LAMA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 60887468 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000130702:ENST00000370691:exon_60887456_60887588:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60887456_60887588:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000491036:exon_60887456_60887588:LAMA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 24 25 49 11.7140308770109 12.7978845031136 -1.08385362610275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.776823599970121 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 61444234 A/T 1 246 242 488 120.068816489362 123.88352199014 -3.81470550077843 A:T A T 10 0.511915380124546 0.75133677031665 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 115 115 230 56.1297312856772 58.8702687143228 -2.74053742864557 C:G G C 10 0.511915380124546 0.741776959878374 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 61468571 T/C 1 22 28 50 10.73786163726 14.3336306434873 -3.5957690062273 T:C T C 10 0.511915380124546 0.325116599615744 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61468435_61468617:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61468274_61468617:COL9A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 15 23 38 7.32126929813181 11.7740537428646 -4.45278444473275 A:G A G 10 0.511915380124546 0.193629751945305 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 8 238 246 3.90467695900363 121.835860469642 -117.931183510638 A:G A G 10 0.511915380124546 1.08701420823031e-62 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62126299 C/T 1 3 230 233 1.46425385962636 117.740537428646 -116.276283569019 T:C C T 10 0.511915380124546 6.56012795284909e-67 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 40 35 75 19.5233847950182 17.9170383043591 1.60634649065905 A:G A G 10 0.511915380124546 0.730347843401478 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 38 36 74 18.5472155552673 18.4289536844837 0.118261870783599 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 14 18 32 6.83318467825636 9.21447684224183 -2.38129216398547 A:G A G 10 0.511915380124546 0.480315636502299 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 21 18 39 10.2497770173845 9.21447684224183 1.03530017514271 A:G A G 10 0.511915380124546 0.751950389677339 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 A:C C A 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62236148 T/C 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62236096_62236255:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62236096_62236193:GMEB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62320968 T/C 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C T C 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62320855_62321001:RTEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62321655 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62321647_62321794:RTEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62322288 T/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62322158_62322300:RTEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 3 10 13 1.46425385962636 5.11915380124546 -3.6548999416191 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0523756919310054 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 16 7 23 7.80935391800726 3.58340766087182 4.22594625713544 A:C A C 10 0.511915380124546 0.095264062576869 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 59 41 100 28.7969925726518 20.9885305851064 7.8084619875454 T:G T G 10 0.511915380124546 0.133394177755201 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 45 59 104 21.9638078943954 30.2030074273482 -8.23919953295278 T:C:G G T 10 0.511915380124546 0.116603460523322 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 15858229 G/A 1 192 73 265 93.7122470160872 37.3698227490919 56.3424242669953 A:G G A 10 0.511915380124546 1.90016508953701e-12 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15857549_15858435:SAMSN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 71 42 113 34.6540080111572 21.5004459652309 13.1535620459263 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.0142541280959709 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 18966406 C/T 1 38 35 73 18.5472155552673 17.9170383043591 0.630177250908144 T:C C T 10 0.511915380124546 0.9072735323158 ENSG00000154640:ENST00000339775:exon_18965971_18966650:BTG3;ENSG00000154640:ENST00000348354:exon_18965971_18966650:BTG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 19165879 A/T 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:T A T 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19161284_19165898:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19165121_19165895:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19165564_19165898:C21orf91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 19 28 47 9.27360777763363 14.3336306434873 -5.06002286585366 T:G T G 10 0.511915380124546 0.147019604185203 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 96 87 183 46.8561235080436 44.5366380708355 2.31948543720809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.767589076870529 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 439 424 863 214.269148125324 217.052121172807 -2.78297304748315 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.864838880912116 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 37661405 G/A 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000142197:ENST00000399151:exon_37661343_37661504:DOPEY2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 38308911 G/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000159267:ENST00000336648:exon_38308749_38309692:HLCS;ENSG00000159267:ENST00000399120:exon_38308749_38309692:HLCS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 21 10 31 10.2497770173845 5.11915380124546 5.13062321613907 T:C T C 10 0.511915380124546 0.073220020295494 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 46 31 77 22.4518925142709 15.8693767838609 6.58251573040996 A:G G A 10 0.511915380124546 0.139675611869346 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 19 43 62 9.27360777763363 22.0123613453555 -12.7387535677218 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00133751364706823 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 41 42 83 20.0114694148936 21.5004459652309 -1.48897655033732 A:G A G 10 0.511915380124546 0.74357114413313 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 976 859 1835 476.370588998443 439.735311526985 36.6352774714582 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.0882835507798892 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 850 671 1521 414.871926894136 343.49522006357 71.3767068305656 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.000267929053270649 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 670 684 1354 327.016695316554 350.150120005189 -23.1334246886352 A:G A G 10 0.511915380124546 0.211201371596093 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 43221555 G/A 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 43239972 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43239938_43240057:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000495217:exon_43239938_43240139:PRDM15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 1 28 9 37 13.6663693565127 4.60723842112091 9.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00282496115213607 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 43795837 G/A 1 10 26 36 4.88084619875454 13.3097998832382 -8.42895368448366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00679381641526006 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43795825_43795977:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43795825_43795977:TMPRSS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 23 11 34 11.2259462571354 5.63106918137001 5.59487707576544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0600080878349012 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 C:G C G 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 23 15 38 11.2259462571354 7.67873070186819 3.54721555526725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.261006704009008 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 35 31 66 17.0829616956409 15.8693767838609 1.21358491177996 T:G T G 10 0.511915380124546 0.806224885472318 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 41 35 76 20.0114694148936 17.9170383043591 2.0944311105345 A:G G A 10 0.511915380124546 0.64804465696457 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 44838397 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000142178:ENST00000270162:exon_44838140_44838421:SIK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 47 29 76 22.9399771341463 14.8455460236118 8.09443111053451 T:C T C 10 0.511915380124546 0.066846042889281 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 47 48 95 22.9399771341463 24.5719382459782 -1.63196111183187 T:C T C 10 0.511915380124546 0.758983236825276 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 29 16 45 14.1544539763882 8.19064608199274 5.96380789439543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0999028766467087 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 22 14 36 10.73786163726 7.16681532174364 3.57104631551635 T:C T C 10 0.511915380124546 0.247804062585390 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 54 48 102 26.3565694732745 24.5719382459782 1.78463122729631 T:C C T 10 0.511915380124546 0.766767109365789 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G G A 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 23 17 40 11.2259462571354 8.70256146211728 2.52338479501816 T:C T C 10 0.511915380124546 0.434838666804728 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 60 63 123 29.2850771925272 32.2506689478464 -2.96559175531915 A:G A G 10 0.511915380124546 0.652196661754 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 46 54 100 22.4518925142709 27.6434305267255 -5.1915380124546 A:C C A 10 0.511915380124546 0.318049174954150 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 157 120 277 76.6292853204463 61.4298456149455 15.1994397055008 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0713739633317008 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 45751822 G/A 1 48 35 83 23.4280617540218 17.9170383043591 5.51102344966268 A:G G A 10 0.511915380124546 0.229678478293458 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45751726_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45751731_45751851:C21orf2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 14 10 24 6.83318467825636 5.11915380124546 1.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.544036848133445 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 91 81 172 44.4157004086663 41.4651457900882 2.9505546185781 A:G A G 10 0.511915380124546 0.703070169181682 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 43 41 84 20.9876386546445 20.9885305851064 -0.000891930461861534 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 54 65 119 26.3565694732745 33.2744997080955 -6.91793023482097 A:G G A 10 0.511915380124546 0.233152259013868 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 19 28 47 9.27360777763363 14.3336306434873 -5.06002286585366 A:G A G 10 0.511915380124546 0.147019604185203 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47703649 G/A 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47704896 G/A 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 A:G G A 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703982_47705236:MCM3AP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 5 11 16 2.44042309937727 5.63106918137001 -3.19064608199274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.135644795559592 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 21 47773103 C/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:C C A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000466474:exon_47773018_47773217:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000483844:exon_47773018_47773240:PCNT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:C C A 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 17590599 C/T 1 6 12 18 2.92850771925272 6.14298456149455 -3.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.159007913775557 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 18300348 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 40 66 106 19.5233847950182 33.78641508822 -14.2630302932019 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00631467223182806 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 A:G A G 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 19165216 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 19423356 G/T 1 278 258 536 135.687524325376 132.074168072133 3.61335625324335 T:G G T 10 0.511915380124546 0.762485621920686 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 19868218 A/G 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19868145_19868870:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19868145_19868240:TXNRD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 127 120 247 61.9867467241827 61.4298456149455 0.556901109237153 T:C C T 10 0.511915380124546 0.949353435239796 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 20100674 C/T 1 49 67 116 23.9161463738972 34.2983304683446 -10.3821840944473 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0628408757481968 ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000480339:exon_20100434_20100701:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000444845:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000487668:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000487378:exon_20100641_20100901:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494820:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000492988:exon_20100641_20100757:TRMT2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 20130475 G/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000472497:exon_20130279_20130510:ZDHHC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 21348914 C/T 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 T:C C T 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000495142:exon_21348616_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000491432:exon_21348766_21349016:LZTR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 67 77 144 32.7016695316554 39.41748426959 -6.71581473793462 T:C C T 10 0.511915380124546 0.278988682877082 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 55 51 106 26.84465409315 26.1076843863518 0.736969706798128 A:G A G 10 0.511915380124546 0.92277240706239 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 A:G G A 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 23223439 G/A 0 18 0 18 8.78552315775817 0 8.78552315775817 G G 10 0.511915380124546 8.29986411986438e-06 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 23523630 C/A 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 A:C C A 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23522397_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23523071_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23523071_23524426:BCR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 199 147 346 97.1288393552153 75.2515608783083 21.8772784769071 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0206340862039165 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 6 18 24 2.92850771925272 9.21447684224183 -6.2859691229891 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0129537928585913 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 72 66 138 35.1420926310327 33.78641508822 1.35567754281266 T:C T C 10 0.511915380124546 0.86490075916056 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 13 18 31 6.3451000583809 9.21447684224183 -2.86937678386093 A:C C A 10 0.511915380124546 0.369791757385296 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 19 16 35 9.27360777763363 8.19064608199274 1.08296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.738417177093215 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 27 22 49 13.1782847366373 11.26213836274 1.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.668708126395563 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 47 48 95 22.9399771341463 24.5719382459782 -1.63196111183187 A:G G A 10 0.511915380124546 0.758983236825276 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29121288 C/T 1 8 14 22 3.90467695900363 7.16681532174364 -3.26213836274001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.201891896863631 ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000425190:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000454252:exon_29121231_29121355:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29121231_29121355:CHEK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29130458 T/C 1 6 12 18 2.92850771925272 6.14298456149455 -3.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.159007913775557 ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382565:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29130391_29130715:CHEK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 18 36 54 8.78552315775817 18.4289536844837 -9.64343052672548 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00942650127810146 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29656158 C/T 1 23 20 43 11.2259462571354 10.2383076024909 0.987638654644522 T:C C T 10 0.511915380124546 0.878997691457703 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29655841_29656226:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29655893_29656226:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656045_29656226:RHBDD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 61 37 98 29.7731618124027 18.9408690646082 10.8322927477945 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0334045948551503 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 35 24 59 17.0829616956409 12.2859691229891 4.79699257265179 T:C C T 10 0.511915380124546 0.241646813187304 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 22 22 44 10.73786163726 11.26213836274 -0.524276725480021 T:C C T 10 0.511915380124546 0.881500457303104 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 133 107 240 64.9152544434354 54.7749456733264 10.140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.19697218244156 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 30691806 G/T 1 19 14 33 9.27360777763363 7.16681532174364 2.10679245588998 T:G G T 10 0.511915380124546 0.490949258794062 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30691726_30691832:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30691726_30691832:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30691726_30691832:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30691726_30691832:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30691726_30691832:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30691726_30691832:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30691726_30693469:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30691726_30695785:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30691726_30691832:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30691726_30691832:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30691726_30691832:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30691726_30691832:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30691726_30691832:TBC1D10A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 59 86 145 28.7969925726518 44.024722690711 -15.2277301180592 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0125317362371002 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 30974906 C/T 1 152 164 316 74.188862221069 83.9541223404255 -9.76526011935653 T:C C T 10 0.511915380124546 0.285147447321697 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30974824_30974982:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30974824_30974985:PES1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 30977006 G/A 1 107 85 192 52.2250543266736 43.5128073105864 8.71224701608718 A:G G A 10 0.511915380124546 0.220054593858765 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30976999_30977088:PES1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 31662010 C/T 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000333611:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31661932_31662118:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000465937:exon_31661932_31662118:LIMK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 21 30 51 10.2497770173845 15.3574614037364 -5.10768438635184 A:G A G 10 0.511915380124546 0.163142513414971 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 24 29 53 11.7140308770109 14.8455460236118 -3.13151514660094 T:C T C 10 0.511915380124546 0.412228942761961 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 32200859 G/C 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 C:G G C 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000100150:ENST00000400242:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382109:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400249:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000266091:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400246:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382105:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382112:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382111:exon_32200828_32200901:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400248:exon_32200828_32200901:DEPDC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 24 17 41 11.7140308770109 8.70256146211728 3.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.354504248782874 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 93 103 196 45.3918696484172 52.7272841528282 -7.33541450441101 A:G G A 10 0.511915380124546 0.317294818869119 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 103 103 206 50.2727158471718 52.7272841528282 -2.45456830565647 T:C C T 10 0.511915380124546 0.780502110728452 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 34046551 G/A 1 17 8 25 8.29743853788272 4.09532304099637 4.20211549688635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.110240985243576 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000430220:exon_34046353_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000413114:exon_34046354_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000462606:exon_34046361_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000494763:exon_34046426_34046654:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000434071:exon_34046435_34046654:LARGE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36537327 C/T 1 80 106 186 39.0467695900363 54.2630302932019 -15.2162607031656 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0276561774528250 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 50 65 115 24.4042309937727 33.2744997080955 -8.87026871432279 A:T A T 10 0.511915380124546 0.112512218553027 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 43 36 79 20.9876386546445 18.4289536844837 2.55868497016087 A:G A G 10 0.511915380124546 0.575884768844757 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 466 341 807 227.447432861962 174.56314462247 52.8842882394914 T:C T C 10 0.511915380124546 0.000213868452421718 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 491 312 803 239.649548358848 159.717598598858 79.9319497599896 A:C C A 10 0.511915380124546 1.48454227473667e-08 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37325833 C/T 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37325681_37325849:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000421539:exon_37325681_37325849:CSF2RB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37333794 A/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37578214 T/C 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000133466:ENST00000397110:exon_37578192_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000337843:exon_37576207_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000470655:exon_37578192_37578622:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000493023:exon_37576211_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000434784:exon_37578214_37578775:C1QTNF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37603051 C/T 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37603390 C/T 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37603744 C/T 1 9 4 13 4.39276157887909 2.04766152049818 2.3451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.268628592400232 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37603745 G/A 1 5 10 15 2.44042309937727 5.11915380124546 -2.67873070186819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.201032617783037 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 37678565 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000100055:ENST00000457992:exon_37678482_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37678424_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37678495_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37678495_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000402997:exon_37678516_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000405206:exon_37678528_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37678530_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000404204:exon_37678541_37678629:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000469886:exon_37678556_37678629:CYTH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 38699004 C/T 1 72 75 147 35.1420926310327 38.393653509341 -3.25156087830826 T:C C T 10 0.511915380124546 0.621009543536792 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000451964:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38698866_38699014:CSNK1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39064088 C/T 1 17 15 32 8.29743853788272 7.67873070186819 0.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.861316316478707 ENSG00000100211:ENST00000485501:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000475924:exon_39064022_39064472:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000411557:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000492537:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000416285:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000492576:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000467118:exon_39063901_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39063927_39064137:CBY1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 19 15 34 9.27360777763363 7.67873070186819 1.59487707576544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.611073879465023 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 85 81 166 41.4871926894136 41.4651457900882 0.0220468993253746 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 92 96 188 44.9037850285418 49.1438764919564 -4.24009146341464 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.559846910481572 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 T:G G T 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 33 19 52 16.10679245589 9.72639222236637 6.38040023352361 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0952375615100827 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 15 11 26 7.32126929813181 5.63106918137001 1.69020011676181 C:G G C 10 0.511915380124546 0.560130398277703 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 9 1 10 4.39276157887909 0.511915380124546 3.88084619875454 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0218341665311933 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 19 19 38 9.27360777763363 9.72639222236637 -0.452784444732746 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 A:G A G 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 16 12 28 7.80935391800726 6.14298456149455 1.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.574667284257565 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 46 49 95 22.4518925142709 25.0838536261028 -2.63196111183187 C:G C G 10 0.511915380124546 0.609050042994398 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 139 144 283 67.8437621626881 73.7158147379346 -5.87205257524651 C:G G C 10 0.511915380124546 0.513180619853951 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 127 137 264 61.9867467241827 70.1324070770628 -8.14566035288013 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.325062492775152 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42300948 C/A 1 196 223 419 95.664585495589 114.157129767774 -18.4925442721848 A:C:G C A 10 0.511915380124546 0.0784163845468203 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42300867_42300977:SREBF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 50 38 88 24.4042309937727 19.4527844447327 4.95144654903996 A:G A G 10 0.511915380124546 0.337295859077022 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42341934 A/G 1 52 49 101 25.3804002335236 25.0838536261028 0.296546607420858 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42341917_42342009:CENPM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 25 16 41 12.2021154968864 8.19064608199274 4.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.21633401960754 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 62 47 109 30.2612464322781 24.0600228658537 6.20122356642449 T:C C T 10 0.511915380124546 0.250957373956831 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 176 156 332 85.9028930980799 79.8587992994292 6.04409379865075 A:G G A 10 0.511915380124546 0.510655058237795 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 41 39 80 20.0114694148936 19.9646998248573 0.0467695900363232 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 42609148 T/C 1 16 19 35 7.80935391800726 9.72639222236637 -1.91703830435911 T:C T C 10 0.511915380124546 0.612754653958834 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 39 26 65 19.0353001751427 13.3097998832382 5.72550029190451 C:G G C 10 0.511915380124546 0.172887079521733 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C C T 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43455432 G/A 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 A:G G A 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43558972 G/A 1 234 215 449 114.211801050856 110.061806726777 4.14999432407888 A:G G A 10 0.511915380124546 0.705897889768655 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43568512 C/T 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43575643 C/T 1 31 36 67 15.1306232161391 18.4289536844837 -3.29833046834458 T:C C T 10 0.511915380124546 0.464176940591911 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575625_43575758:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575625_43575758:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575625_43575758:TTLL12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 35 36 71 17.0829616956409 18.4289536844837 -1.34599198884277 A:G G A 10 0.511915380124546 0.812639794260727 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 25 30 55 12.2021154968864 15.3574614037364 -3.15534590685003 A:G A G 10 0.511915380124546 0.420507286079933 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 44559755 C/T 1 365 334 699 178.150886254541 170.979736961598 7.17114929294237 T:C C T 10 0.511915380124546 0.596487162724604 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44559738_44559810:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000484345:exon_44559738_44559810:PARVB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 137 115 252 66.8675929229372 58.8702687143228 7.99732420861442 A:C A C 10 0.511915380124546 0.344585109930555 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 35 21 56 17.0829616956409 10.7502229826155 6.33273871302542 C:G G C 10 0.511915380124546 0.108242839406939 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 36 17 53 17.5710463155163 8.70256146211728 8.86848485339906 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0187034102713254 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 100 21 121 48.8084619875454 10.7502229826155 38.0582390049299 A:G G A 10 0.511915380124546 7.74904847158706e-13 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 T:C C T 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 18 13 31 8.78552315775817 6.6548999416191 2.13062321613907 T:C T C 10 0.511915380124546 0.477043468133186 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 221 228 449 107.866700992475 116.716706668396 -8.85000567592114 T:C T C 10 0.511915380124546 0.422331022067208 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 108 70 178 52.713138946549 35.8340766087182 16.8790623378308 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0131444017753483 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 39 44 83 19.0353001751427 22.52427672548 -3.48897655033731 T:C C T 10 0.511915380124546 0.510288687956788 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 119 55 174 58.082069765179 28.15534590685 29.926723858329 T:C C T 10 0.511915380124546 6.28342048929372e-06 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 103 104 207 50.2727158471718 53.2391995329528 -2.96648368578101 A:G A G 10 0.511915380124546 0.728217648181909 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 51 58 109 24.8923156136482 29.6910920472237 -4.79877643357551 T:C T C 10 0.511915380124546 0.388946233620374 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 32 23 55 15.6187078360145 11.7740537428646 3.84465409314997 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345658788939129 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 22 24 46 10.73786163726 12.2859691229891 -1.54810748572911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.661302444171157 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 4354697 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000430981:exon_4354582_4356086:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000462115:exon_4354582_4354785:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4354582_4355445:SETMAR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 24 23 47 11.7140308770109 11.7740537428646 -0.0600228658536608 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 25 13 38 12.2021154968864 6.6548999416191 5.54721555526725 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0760296549288303 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 41 28 69 20.0114694148936 14.3336306434873 5.67783877140633 A:G G A 10 0.511915380124546 0.186268160040947 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 112 107 219 54.6654774260509 54.7749456733264 -0.109468247275565 T:C:G T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 10264480 C/G 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 C:G C G 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10264320_10264515:IRAK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 31 15 46 15.1306232161391 7.67873070186819 7.45189251427089 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0377861032061497 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 103 79 182 50.2727158471718 40.4413150298391 9.83140081733264 T:C C T 10 0.511915380124546 0.158850991653881 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 57 55 112 27.8208233329009 28.15534590685 -0.334522573949148 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13367357 G/A 1 25 40 65 12.2021154968864 20.4766152049818 -8.27449970809549 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0466503753112055 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 50 44 94 24.4042309937727 22.52427672548 1.87995426829268 T:C C T 10 0.511915380124546 0.757208001991923 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 64 54 118 31.2374156720291 27.6434305267255 3.59398514530358 A:G G A 10 0.511915380124546 0.520592970231096 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 41 35 76 20.0114694148936 17.9170383043591 2.0944311105345 T:C C T 10 0.511915380124546 0.64804465696457 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13383511 G/A 1 37 47 84 18.0591309353918 24.0600228658537 -6.00089193046186 A:G G A 10 0.511915380124546 0.192570033429942 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 47 39 86 22.9399771341463 19.9646998248573 2.97527730928905 A:G A G 10 0.511915380124546 0.589939967311748 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 27 23 50 13.1782847366373 11.7740537428646 1.4042309937727 T:C T C 10 0.511915380124546 0.777676813700698 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 22 22 44 10.73786163726 11.26213836274 -0.524276725480021 A:T:C A T 10 0.511915380124546 0.881500457303104 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 101 95 196 49.2965466074209 48.6319611118319 0.664585495588994 T:G G T 10 0.511915380124546 0.94313442821896 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 30 44 74 14.6425385962636 22.52427672548 -7.8817381292164 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0805351268121229 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14523200 G/A 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000131389:ENST00000454876:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000458124:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000360861:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000451687:exon_14523179_14523349:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000452151:exon_14523179_14523349:SLC6A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 56 43 99 27.3327387130254 22.0123613453555 5.32037736766995 A:G G A 10 0.511915380124546 0.315084742284245 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 C:G C G 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 20161096 A/G 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20161090_20161215:KAT2B;ENSG00000114166:ENST00000469085:exon_20161090_20161215:KAT2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:T T A 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 29628639 C/T 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000144642:ENST00000496922:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000434693:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000383767:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000445033:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000273139:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000383766:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000396583:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000452462:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000456853:exon_29628605_29628696:RBMS3;ENSG00000144642:ENST00000497205:exon_29628605_29628696:RBMS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 34 27 61 16.5948770757654 13.8217152633627 2.7731618124027 C:G C G 10 0.511915380124546 0.523043949579928 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 11 21 32 5.36893081862999 10.7502229826155 -5.38129216398547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0756254471263738 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 26 18 44 12.6902001167618 9.21447684224183 3.47572327451998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.365790931907756 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 26 23 49 12.6902001167618 11.7740537428646 0.916146373897247 A:G A G 10 0.511915380124546 0.886605782074456 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 37367628 A/G 1 29 11 40 14.1544539763882 5.63106918137001 8.52338479501816 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00702009428964275 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 38038982 T/C 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000484717:exon_38038974_38039176:VILL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 38043904 T/C 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 T:C T C 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000484717:exon_38043193_38043971:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000412008:exon_38043887_38044036:VILL;ENSG00000136059:ENST00000463080:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38042398_38045890:VILL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 38045785 T/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:T T A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38045746_38045890:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38045746_38045890:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38045746_38045890:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38045746_38045890:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38042398_38045890:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38045555_38045890:VILL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 C:G G C 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 49 43 92 23.9161463738972 22.0123613453555 1.90378502854177 C:G C G 10 0.511915380124546 0.754643445286097 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39111140 C/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:C C A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39111134_39111181:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39111134_39111235:WDR48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C T C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 51 47 98 24.8923156136482 24.0600228658537 0.832292747794494 T:C C T 10 0.511915380124546 0.919636363357207 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 55 45 100 26.84465409315 23.0361921056046 3.80846198754541 A:G G A 10 0.511915380124546 0.484347104053447 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 31 48 79 15.1306232161391 24.5719382459782 -9.44131502983913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0421267649732804 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 23 21 44 11.2259462571354 10.7502229826155 0.475723274519977 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 39433037 A/G 1 28 28 56 13.6663693565127 14.3336306434873 -0.667261286974572 A:G A G 10 0.511915380124546 0.894205620107581 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39432932_39433111:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39432932_39433111:SLC25A38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 40573744 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000172888:ENST00000403205:exon_40573521_40575017:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000339296:exon_40573521_40579187:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000431278:exon_40573521_40575562:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000462161:exon_40573521_40573748:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000492098:exon_40573521_40574352:ZNF621 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 22 30 52 10.73786163726 15.3574614037364 -4.61959976647639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.213943248938703 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 25 27 52 12.2021154968864 13.8217152633627 -1.61959976647639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.679293554326009 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42602626 G/A 1 24 25 49 11.7140308770109 12.7978845031136 -1.08385362610275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.776823599970121 ENSG00000093183:ENST00000451653:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42602609_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42602607_42602788:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42602609_42602788:SEC22C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 26 15 41 12.6902001167618 7.67873070186819 5.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.121530770428778 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 33 17 50 16.10679245589 8.70256146211728 7.4042309937727 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0466303838284057 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 25 24 49 12.2021154968864 12.2859691229891 -0.0838536261027514 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42679848 A/G 1 25 27 52 12.2021154968864 13.8217152633627 -1.61959976647639 A:G A G 10 0.511915380124546 0.679293554326009 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 42680000 C/T 1 30 16 46 14.6425385962636 8.19064608199274 6.45189251427089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0756389806485127 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 44684545 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000186448:ENST00000344387:exon_44683392_44685712:ZNF197;ENSG00000186448:ENST00000396058:exon_44683392_44686754:ZNF197 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 C:G C G 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:C C A 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 45046891 T/A 1 70 64 134 34.1659233912818 32.7625843279709 1.40333906331084 A:T T A 10 0.511915380124546 0.862897167398162 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45046783_45046906:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45046783_45046906:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45046783_45046906:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45046783_45046906:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45045652_45046906:EXOSC7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C T C 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 46008087 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 46009487 G/A 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 46009491 C/T 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 T:C C T 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 46009864 C/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 46010007 T/C 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 24 30 54 11.7140308770109 15.3574614037364 -3.64343052672548 A:G G A 10 0.511915380124546 0.342907640420846 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 24 24 48 11.7140308770109 12.2859691229891 -0.571938245978206 T:C C T 10 0.511915380124546 0.886208204797435 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47545889 T/C 1 36 33 69 17.5710463155163 16.89320754411 0.677838771406329 T:C T C 10 0.511915380124546 0.904571051240302 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000439305:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000327410:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000444949:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000412761:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000444760:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000445044:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000461208:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000425291:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000494161:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000449409:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000414236:exon_47545820_47545938:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000485029:exon_47545684_47545938:C3orf75 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 133 122 255 64.9152544434354 62.4536763751946 2.46157806824078 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.802216994546552 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 99 98 197 48.3203773676699 50.1677072522055 -1.84732988453555 T:G G T 10 0.511915380124546 0.830802724101529 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 25 19 44 12.2021154968864 9.72639222236637 2.47572327451998 A:G A G 10 0.511915380124546 0.546908570182333 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 48488213 G/C 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48488137_48488496:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48488137_48488496:ATRIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 238 190 428 116.164139530358 97.2639222236637 18.9002173066943 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0735090245156687 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 48637964 C/A 1 187 169 356 91.2718239167099 86.5136992410483 4.75812467566163 A:C C A 10 0.511915380124546 0.633449799308982 ENSG00000010256:ENST00000471189:exon_48637915_48638000:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000203407:exon_48637915_48638000:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000480561:exon_48637915_48638000:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000415995:exon_48637915_48638000:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000460105:exon_48637915_48638000:UQCRC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 49463700 C/T 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 T:C C T 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000145029:ENST00000273598:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000421969:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000430622:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000423832:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000497742:exon_49463685_49463855:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000436744:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000422593:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000494057:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000461015:exon_49463685_49463840:NICN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 49724808 T/C 1 11 3 14 5.36893081862999 1.53574614037364 3.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0583451092032102 ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49724582_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484269:exon_49724797_49724895:MST1;ENSG00000173531:ENST00000432076:exon_49724797_49724942:MST1;ENSG00000173531:ENST00000494828:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000490966:exon_49724582_49725101:MST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 10 13 23 4.88084619875454 6.6548999416191 -1.77405374286456 T:G T G 10 0.511915380124546 0.534108805620596 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 55 26 81 26.84465409315 13.3097998832382 13.5348542099118 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00259855729183654 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 86 91 177 41.975277309289 46.5842995913337 -4.60902228204463 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.499425704581586 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:G T G 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 50645158 A/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000114737:ENST00000491847:exon_50643921_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000443053:exon_50643927_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000348721:exon_50643953_50645573:CISH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 51426454 C/T 1 204 198 402 99.5692624545926 101.35924526466 -1.78998281006749 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.881072845397054 ENSG00000145050:ENST00000528157:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000518640:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000438713:exon_51426336_51426828:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000446668:exon_51426336_51426693:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000470900:exon_51426336_51426775:AC092037.1;ENSG00000145050:ENST00000482262:exon_51426336_51426580:AC092037.1;ENSG00000249398:ENST00000273628:exon_51426336_51426520:MANF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 130 120 250 63.451000583809 61.4298456149455 2.02115496886351 A:C A C 10 0.511915380124546 0.8006628597631 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 64 78 142 31.2374156720291 39.9293996497146 -8.69198397768552 A:G G A 10 0.511915380124546 0.153863014850801 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 24 23 47 11.7140308770109 11.7740537428646 -0.0600228658536608 A:C A C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 15 18 33 7.32126929813181 9.21447684224183 -1.89320754411002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.602309440775946 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 C:G C G 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 45 117 162 21.9638078943954 59.8940994745719 -37.9302915801764 T:C C T 10 0.511915380124546 1.94815152370624e-09 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 48 53 101 23.4280617540218 27.1315151466009 -3.70345339257914 T:C T C 10 0.511915380124546 0.486870614267744 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 25 32 57 12.2021154968864 16.3812921639855 -4.17917666709912 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.290760416458357 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 36 41 77 17.5710463155163 20.9885305851064 -3.41748426959004 T:C C T 10 0.511915380124546 0.494316783529837 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 28 26 54 13.6663693565127 13.3097998832382 0.356569473274519 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 56763619 A/G 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 19 16 35 9.27360777763363 8.19064608199274 1.08296169564089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.738417177093215 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 58 40 98 28.3089079527763 20.4766152049818 7.83229274779449 A:G G A 10 0.511915380124546 0.129410889719190 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 145 120 265 70.7722698819408 61.4298456149455 9.34242426699532 T:C C T 10 0.511915380124546 0.268771527808018 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 5 19 24 2.44042309937727 9.72639222236637 -7.2859691229891 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00345489760023995 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 0 23 0 23 11.2259462571354 0 11.2259462571354 C C 10 0.511915380124546 2.73359875825343e-07 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 58413730 A/G 1 39 64 103 19.0353001751427 32.7625843279709 -13.7272841528282 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.00758242492009709 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58413357_58413906:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58413357_58413906:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58413378_58413906:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000485460:exon_58413399_58413906:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58413408_58414341:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58413410_58413906:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58413419_58413906:PDHB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 5 14 19 2.44042309937727 7.16681532174364 -4.72639222236637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0376423259948182 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 57 74 131 27.8208233329009 37.8817381292164 -10.0609147963155 T:C T C 10 0.511915380124546 0.080978930840147 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 76 96 172 37.0944311105345 49.1438764919564 -12.0494453814219 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0675140418224768 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 69230061 G/A 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000114541:ENST00000398540:exon_69230050_69230861:FRMD4B;ENSG00000114541:ENST00000478263:exon_69230050_69230861:FRMD4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 25 17 42 12.2021154968864 8.70256146211728 3.49955403476907 T:C T C 10 0.511915380124546 0.354569483171485 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 88104700 A/C 1 45 43 88 21.9638078943954 22.0123613453555 -0.0485534509600427 A:C:G A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163320:ENST00000309534:exon_88101094_88105149:CGGBP1;ENSG00000163320:ENST00000398392:exon_88101162_88106459:CGGBP1;ENSG00000163320:ENST00000482016:exon_88104564_88105149:CGGBP1;ENSG00000163320:ENST00000462901:exon_88104576_88105149:CGGBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 44 35 79 21.47572327452 17.9170383043591 3.55868497016087 A:C C A 10 0.511915380124546 0.433371376432747 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 46 24 70 22.4518925142709 12.2859691229891 10.1659233912818 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0165029215817832 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 41 42 83 20.0114694148936 21.5004459652309 -1.48897655033732 C:G C G 10 0.511915380124546 0.74357114413313 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 T:C T C 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 108298260 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108298128_108298273:KIAA1524 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 112059768 C/G 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 C:G C G 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112059749_112059830:CD200 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 A:G G A 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 67 67 134 32.7016695316554 34.2983304683446 -1.59666093668916 T:C T C 10 0.511915380124546 0.79602687978725 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 39 33 72 19.0353001751427 16.89320754411 2.14209263103269 A:G G A 10 0.511915380124546 0.638827488083954 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 113528278 C/T 1 16 16 32 7.80935391800726 8.19064608199274 -0.381292163985471 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000114573:ENST00000273398:exon_113528182_113530903:ATP6V1A;ENSG00000114573:ENST00000470455:exon_113528182_113528544:ATP6V1A;ENSG00000114573:ENST00000461496:exon_113528182_113528316:ATP6V1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 113720517 T/A 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:T T A 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113720442_113720543:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000460813:exon_113720442_113720543:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000527855:exon_113720442_113720618:KIAA1407 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 29 22 51 14.1544539763882 11.26213836274 2.89231561364816 A:G G A 10 0.511915380124546 0.484334403347585 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 164 140 304 80.0458776595745 71.6681532174364 8.37772444213802 T:C C T 10 0.511915380124546 0.358733983735759 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 22 16 38 10.73786163726 8.19064608199274 2.54721555526725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.422726468313301 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 12 8 20 5.85701543850545 4.09532304099637 1.76169239750908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.505895428449493 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 C:G C G 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 120495333 A/T 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120495270_120495511:GTF2E1;ENSG00000153767:ENST00000469772:exon_120495270_120495507:GTF2E1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 320 349 669 156.187078360145 178.658467663467 -22.4713893033213 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0887515711507532 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 294 268 562 143.496878243383 137.193321873378 6.30355637000517 A:G G A 10 0.511915380124546 0.612716277986816 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121435621 T/C 1 14 3 17 6.83318467825636 1.53574614037364 5.29743853788272 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0131393637795494 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121435624 C/T 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 42 70 112 20.4995540347691 35.8340766087182 -15.3345225739492 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00438597294928853 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 33 32 65 16.10679245589 16.3812921639855 -0.274499708095487 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 121591519 C/T 1 11 48 59 5.36893081862999 24.5719382459782 -19.2030074273482 T:C C T 10 0.511915380124546 3.19077554102132e-07 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121591384_121591635:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121591384_121591635:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121591384_121591635:EAF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 122290579 C/T 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 45 46 91 21.9638078943954 23.5481074857291 -1.58429959133368 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754134531819732 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 44 46 90 21.47572327452 23.5481074857291 -2.07238421120914 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.674616973117323 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 123665859 T/C 1 13 18 31 6.3451000583809 9.21447684224183 -2.86937678386093 T:C T C 10 0.511915380124546 0.369791757385296 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124385301 T/C 1 11 1 12 5.36893081862999 0.511915380124546 4.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00651276076484706 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124385296_124385481:KALRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124385361 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124385296_124385481:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124385296_124385481:KALRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124385960 C/T 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 T:C C T 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124385859_124386030:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124385859_124386030:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124385859_124386030:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124385859_124386030:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124385859_124386030:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124385859_124386030:KALRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124390722 G/A 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 A:G G A 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124390507_124390745:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124390507_124390745:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124390507_124390745:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124390507_124390745:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124390507_124390745:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124390507_124390745:KALRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124515314 G/A 1 11 7 18 5.36893081862999 3.58340766087182 1.78552315775817 A:G G A 10 0.511915380124546 0.48295319218206 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124515395 G/A 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124515636 C/T 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C C T 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 9 6 15 4.39276157887909 3.07149228074728 1.32126929813181 T:C C T 10 0.511915380124546 0.608797469772918 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 28 9 37 13.6663693565127 4.60723842112091 9.0591309353918 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00282496115213607 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 125648356 T/C 1 4 9 13 1.95233847950182 4.60723842112091 -2.6548999416191 T:C T C 10 0.511915380124546 0.170663775067474 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 17 26 43 8.29743853788272 13.3097998832382 -5.01236134535548 C:G G C 10 0.511915380124546 0.130365598853253 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 T:G G T 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 126741011 G/A 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126740928_126741184:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126740928_126741184:PLXNA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 76 56 132 37.0944311105345 28.6672612869746 8.42716982355994 A:G G A 10 0.511915380124546 0.163403026666392 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 81 68 149 39.5348542099118 34.8102458484691 4.72460836144266 T:C C T 10 0.511915380124546 0.461411647589949 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 127413976 C/T 1 143 99 242 69.7961006421899 50.6796226323301 19.1164780098599 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0144919439110954 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000496306:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000476682:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398101:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127413818_127414033:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000484451:exon_127413818_127414033:MGLL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 129 153 282 62.9629159639336 78.3230531590555 -15.360137195122 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0737933311509098 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 136 151 287 66.3795083030618 77.2992223988064 -10.9197140957447 T:C C T 10 0.511915380124546 0.214942718599302 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 21 17 38 10.2497770173845 8.70256146211728 1.54721555526725 A:C A C 10 0.511915380124546 0.630831038477984 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 12 13 25 5.85701543850545 6.6548999416191 -0.797884503113649 T:C C T 10 0.511915380124546 0.842403639874975 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 107 86 193 52.2250543266736 44.024722690711 8.20033163596263 T:C T C 10 0.511915380124546 0.249702005000713 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 141 120 261 68.819931402439 61.4298456149455 7.39008578749351 T:C C T 10 0.511915380124546 0.386127762567606 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 107 106 213 52.2250543266736 54.2630302932019 -2.03797596652829 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.784443179675743 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 129034578 G/A 1 224 159 383 109.330954852102 81.3945454398028 27.9364094122989 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00487173884655413 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 130409494 T/C 1 18 20 38 8.78552315775817 10.2383076024909 -1.45278444473275 T:C T C 10 0.511915380124546 0.746050140979249 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130409334_130409498:PIK3R4;ENSG00000196455:ENST00000512677:exon_130409334_130409501:PIK3R4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 43 45 88 20.9876386546445 23.0361921056046 -2.04855345096004 A:G G A 10 0.511915380124546 0.671328534032592 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 35 34 69 17.0829616956409 17.4051229242346 -0.322161228593671 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 T:G T G 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 25 20 45 12.2021154968864 10.2383076024909 1.96380789439543 C:G G C 10 0.511915380124546 0.655157374364705 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 134898742 C/T 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134898702_134898824:EPHB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 136664453 T/C 1 21 12 33 10.2497770173845 6.14298456149455 4.10679245588998 T:C T C 10 0.511915380124546 0.166690999506631 ENSG00000158092:ENST00000288986:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000481752:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000491539:exon_136664425_136664585:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000485096:exon_136664425_136664544:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000488930:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000496489:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000469404:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000467911:exon_136664425_136664594:NCK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 141162128 C/G 1 29 24 53 14.1544539763882 12.2859691229891 1.86848485339906 C:G C G 10 0.511915380124546 0.680829972632713 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 26 22 48 12.6902001167618 11.26213836274 1.42806175402179 T:G T G 10 0.511915380124546 0.773193056072892 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 1 21 1 22 10.2497770173845 0.511915380124546 9.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 1.21727343974237e-05 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 146234853 C/T 1 19 18 37 9.27360777763363 9.21447684224183 0.0591309353917993 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 35 29 64 17.0829616956409 14.8455460236118 2.23741567202906 A:G A G 10 0.511915380124546 0.618144115325239 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 38 22 60 18.5472155552673 11.26213836274 7.28507719252724 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0701603555654897 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 149619901 G/C 1 15 3 18 7.32126929813181 1.53574614037364 5.78552315775817 C:G G C 10 0.511915380124546 0.00783051791605677 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000459632:exon_149619859_149619946:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000466795:exon_149619859_149619939:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149619859_149619949:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149619859_149619949:RNF13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 24 25 49 11.7140308770109 12.7978845031136 -1.08385362610275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.776823599970121 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 139 0 139 67.8437621626881 0 67.8437621626881 T T 10 0.511915380124546 4.52626287396005e-41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 78 65 143 38.0706003502854 33.2744997080955 4.79610064218993 C:G C G 10 0.511915380124546 0.451955398322713 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 15 14 29 7.32126929813181 7.16681532174364 0.154453976388168 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 105 105 210 51.2488850869227 53.7511149130773 -2.50222982615465 T:C C T 10 0.511915380124546 0.730669412301805 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158362441 T/C 1 3 17 20 1.46425385962636 8.70256146211728 -7.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00120477127276206 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158362067_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158362317_158362504:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158362386_158362504:GFM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 23 12 35 11.2259462571354 6.14298456149455 5.08296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0927032206331829 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158376836 C/T 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158376711_158376859:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158376711_158376848:GFM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158384498 A/G 1 17 13 30 8.29743853788272 6.6548999416191 1.64253859626362 A:G A G 10 0.511915380124546 0.587883526117901 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158384203_158384533:LXN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 40 51 91 19.5233847950182 26.1076843863518 -6.58429959133369 T:C C T 10 0.511915380124546 0.174095678180076 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 171362785 C/T 1 28 21 49 13.6663693565127 10.7502229826155 2.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.47547089621082 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171362700_171362813:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171362700_171362813:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171362700_171362813:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171362700_171362813:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171362700_171362813:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171362700_171362813:PLD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 171404478 C/A 1 5 13 18 2.44042309937727 6.6548999416191 -4.21447684224183 A:C C A 10 0.511915380124546 0.058592754437712 ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171404475_171404588:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171404475_171404588:PLD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 17 53 70 8.29743853788272 27.1315151466009 -18.8340766087182 T:C T C 10 0.511915380124546 6.05018389130571e-06 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 178968568 A/C 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 A:C A C 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000171121:ENST00000497599:exon_178968531_178968722:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178968531_178968722:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000392685:exon_178968531_178969418:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000349697:exon_178968531_178968722:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000314235:exon_178968531_178968722:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178968531_178968722:KCNMB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 178976777 C/T 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178976736_178977679:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178976736_178976996:KCNMB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:G T G 10 0.511915380124546 0.57307152977622 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 193 146 339 94.2003316359626 74.7396454981837 19.4606861377789 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0388178897467123 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183211906 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183217466 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183217378_183217615:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183217378_183217615:KLHL6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183368216 A/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:T A T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000493074:exon_183368084_183368526:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000437402:exon_183368084_183368326:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454495:exon_183368084_183368495:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000473045:exon_183368084_183368363:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468101:exon_183368084_183368378:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000427201:exon_183368084_183368485:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000482138:exon_183368084_183368546:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468001:exon_183368084_183368521:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000242809:exon_183368145_183368777:KLHL24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183368891 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G G A 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 95 55 150 46.3680388881681 28.15534590685 18.2126929813181 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00317605005232365 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 49 36 85 23.9161463738972 18.4289536844837 5.48719268941359 A:G A G 10 0.511915380124546 0.277865778038171 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183602569 G/A 0 100 0 100 48.8084619875454 0 48.8084619875454 G G 10 0.511915380124546 1.58016425241702e-29 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183602510_183602695:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183602510_183602676:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183602510_183602643:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183602510_183602696:PARL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183906578 C/T 1 33 43 76 16.10679245589 22.0123613453555 -5.90556888946549 T:C C T 10 0.511915380124546 0.206700280769011 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183906549_183906629:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183906549_183906629:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183906549_183906629:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183906549_183906615:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000471226:exon_183906549_183906629:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000472608:exon_183906549_183906629:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000475728:exon_183906578_183906629:ABCF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 23 12 35 11.2259462571354 6.14298456149455 5.08296169564089 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0927032206331829 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 45 63 108 21.9638078943954 32.2506689478464 -10.286861053451 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0539265706106966 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 69 92 161 33.6778387714063 47.0962149714582 -13.4183762000519 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0400819652302084 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 135 147 282 65.8914236831863 75.2515608783083 -9.36013719512196 A:G A G 10 0.511915380124546 0.283674093599374 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184082931 T/C 1 65 69 134 31.7255002919045 35.3221612285937 -3.59666093668916 T:C T C 10 0.511915380124546 0.546341340358391 ENSG00000163882:ENST00000456318:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000438240:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000455712:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000430783:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000443489:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000452961:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000296223:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000429568:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000488213:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000489043:exon_184082743_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000490958:exon_184082921_184083311:POLR2H HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 12 30 42 5.85701543850545 15.3574614037364 -9.50044596523093 A:C C A 10 0.511915380124546 0.00483426603383375 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184700426 C/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000488255:exon_184700206_184700435:VPS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 184766325 G/A 1 21 12 33 10.2497770173845 6.14298456149455 4.10679245588998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.166690999506631 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 1 2854 2 2856 1392.99350512455 1.02383076024909 1391.9696743643 A:T:C:G T C 10 0.511915380124546 0 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2319 18 2337 1131.86823349118 9.21447684224183 1122.65375664894 T:C:G G T 10 0.511915380124546 0 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 185229464 T/C 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185229312_185229485:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185229312_185229485:LIPH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 49 35 84 23.9161463738972 17.9170383043591 5.99910806953814 A:G G A 10 0.511915380124546 0.229730954008663 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 38 21 59 18.5472155552673 10.7502229826155 7.79699257265179 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0501595453142748 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 4 11 15 1.95233847950182 5.63106918137001 -3.67873070186819 T:C T C 10 0.511915380124546 0.07101935202457 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 3 13 16 1.46425385962636 6.6548999416191 -5.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0110438661823276 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 6 13 19 2.92850771925272 6.6548999416191 -3.72639222236637 A:T T A 10 0.511915380124546 0.108541560895472 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 115 123 238 56.1297312856772 62.9655917553192 -6.83586046964194 A:C C A 10 0.511915380124546 0.399425481137129 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 12 13 25 5.85701543850545 6.6548999416191 -0.797884503113649 A:G G A 10 0.511915380124546 0.842403639874975 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 35 51 86 17.0829616956409 26.1076843863518 -9.02472269071096 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.0528179183583767 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 195027339 G/A 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195027240_195027345:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000484296:exon_195027240_195027594:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000439758:exon_195027240_195027345:ACAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 195063347 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000423531:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000480906:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000481463:exon_195063335_195063383:ACAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 41 36 77 20.0114694148936 18.4289536844837 1.58251573040996 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.733834767462433 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 195611844 G/A 1 11 17 28 5.36893081862999 8.70256146211728 -3.33363064348729 A:G G A 10 0.511915380124546 0.257214713691272 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195610028_195613144:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000430929:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195611716_195611904:TNK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 45 44 89 21.9638078943954 22.52427672548 -0.560468831084588 T:G G T 10 0.511915380124546 0.915979865229122 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 196210590 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 196388407 G/A 1 156 145 301 76.1412007005708 74.2277301180592 1.91347058251166 A:G G A 10 0.511915380124546 0.862723288709795 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 197562680 G/A 1 11 15 26 5.36893081862999 7.67873070186819 -2.30979988323819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.434416667545016 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197562545_197562693:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197562545_197562693:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197562545_197562693:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197562668_197562693:LRCH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 13 17 30 6.3451000583809 8.70256146211728 -2.35746140373638 T:C T C 10 0.511915380124546 0.466232196027525 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 3 197597069 A/G 1 22 12 34 10.73786163726 6.14298456149455 4.59487707576544 A:G A G 10 0.511915380124546 0.125035827053306 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 6 11 17 2.92850771925272 5.63106918137001 -2.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.228802164450189 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 14 19 33 6.83318467825636 9.72639222236637 -2.89320754411002 T:C T C 10 0.511915380124546 0.384564402722671 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 520908 C/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 121 100 221 59.0582390049299 51.1915380124546 7.86670099247534 A:T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.312917255170344 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 56 52 108 27.3327387130254 26.6195997664764 0.713138946549037 A:G A G 10 0.511915380124546 0.923504696264405 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:G G T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 4 13 17 1.95233847950182 6.6548999416191 -4.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0277210001524075 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1374774 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1374668_1374776:KIAA1530 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 181 142 323 88.3433161974572 72.6919839776855 15.6513322197717 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0845353473620588 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 26 38 64 12.6902001167618 19.4527844447327 -6.76258432797094 T:C C T 10 0.511915380124546 0.103927999255393 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2701451 G/A 1 35 37 72 17.0829616956409 18.9408690646082 -1.85790736896731 A:G G A 10 0.511915380124546 0.723996601006807 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000506120:exon_2701407_2701665:FAM193A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 308 244 552 150.33006292164 124.907352750389 25.4227101712506 A:T:C:G A G 10 0.511915380124546 0.0331843544009606 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 241 213 454 117.628393389984 109.037975966528 8.59041742345613 A:G G A 10 0.511915380124546 0.425215144661816 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 A:C A C 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2746400 G/A 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 38 20 58 18.5472155552673 10.2383076024909 8.30890795277633 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0349011771951393 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 54 44 98 26.3565694732745 22.52427672548 3.8322927477945 T:C T C 10 0.511915380124546 0.479848755141149 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 70 49 119 34.1659233912818 25.0838536261028 9.08206976517903 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0994266064811342 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 50 47 97 24.4042309937727 24.0600228658537 0.344208127919043 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 3425299 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000159788:ENST00000344733:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000336727:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000382788:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000306648:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000338806:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000508158:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000504194:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000513991:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000515521:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000509746:exon_3425242_3425592:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000511709:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000507041:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000507246:exon_3425242_3425368:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000504559:exon_3425242_3425368:RGS12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 101 123 224 49.2965466074209 62.9655917553192 -13.6690451478983 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0711897833381137 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 4389450 G/A 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000168824:ENST00000421177:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000513555:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000505246:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000506380:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000397958:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000433139:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000513829:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000504171:exon_4389331_4389485:AC110814.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 5624704 A/G 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000173040:ENST00000475313:exon_5624264_5624718:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344938:exon_5624264_5624718:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000310917:exon_5624264_5624718:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344408:exon_5624264_5624718:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000509670:exon_5624264_5624718:EVC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 5733325 G/T 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:G G T 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5733152_5733384:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5733152_5733384:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5733152_5733384:EVC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 6611555 A/C 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 A:C A C 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504960:exon_6611525_6611768:MAN2B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 6621681 G/A 1 17 7 24 8.29743853788272 3.58340766087182 4.7140308770109 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0657083168882434 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6621654_6621771:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6621654_6621771:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 7026923 C/T 1 18 23 41 8.78552315775817 11.7740537428646 -2.98853058510639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.435143873817512 ENSG00000132405:ENST00000448507:exon_7026731_7026989:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000340816:exon_7026731_7026989:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000446947:exon_7026731_7026989:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000409757:exon_7026731_7026989:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000410031:exon_7026731_7026989:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000451522:exon_7026731_7026989:TBC1D14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 242 289 531 118.11647800986 147.943544855994 -29.8270668461339 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0103767470196872 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 10445427 A/T 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 A:T A T 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 10447640 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 43 40 83 20.9876386546445 20.4766152049818 0.511023449662684 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 24 28 52 11.7140308770109 14.3336306434873 -2.61959976647639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.490600609527329 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 17805379 G/A 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000163257:ENST00000382247:exon_17802278_17806394:DCAF16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 C:G G C 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 17841848 A/C 0 12 0 12 5.85701543850545 0 5.85701543850545 A A 10 0.511915380124546 0.00050666091488124 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 C:G C G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 34 18 52 16.5948770757654 9.21447684224183 7.38040023352361 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0512038852496732 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 25821497 A/G 1 11 32 43 5.36893081862999 16.3812921639855 -11.0123613453555 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00108911458125723 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25821430_25821562:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25821430_25821562:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25821430_25821562:SEL1L3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 24 28 52 11.7140308770109 14.3336306434873 -2.61959976647639 T:C T C 10 0.511915380124546 0.490600609527329 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 22 20 42 10.73786163726 10.2383076024909 0.499554034769069 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 25 40 65 12.2021154968864 20.4766152049818 -8.27449970809549 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0466503753112055 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38776070 C/T 1 33 53 86 16.10679245589 27.1315151466009 -11.024722690711 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0177574387018264 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 62 33 95 30.2612464322781 16.89320754411 13.3680388881681 T:G T G 10 0.511915380124546 0.00731288598414013 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 55 41 96 26.84465409315 20.9885305851064 5.85612350804359 T:C T C 10 0.511915380124546 0.261558672711164 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 65 38 103 31.7255002919045 19.4527844447327 12.2727158471718 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0176817074832654 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 68 57 125 33.1897541515309 29.1791766670991 4.01057748443176 A:T A T 10 0.511915380124546 0.476050765606619 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 57 64 121 27.8208233329009 32.7625843279709 -4.94176099507006 T:G T G 10 0.511915380124546 0.413248344000943 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38828826 G/A 1 17 35 52 8.29743853788272 17.9170383043591 -9.61959976647639 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00816440929492575 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38828704_38829000:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38830116 C/T 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 T:C C T 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38830736 A/G 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000508254:exon_38830644_38831158:TLR6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38879949 G/A 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000197712:ENST00000510213:exon_38879692_38880047:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38879692_38880047:FAM114A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 38995374 T/C 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 17 19 36 8.29743853788272 9.72639222236637 -1.42895368448365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.739399217771317 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 T:C T C 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 21 15 36 10.2497770173845 7.67873070186819 2.57104631551635 T:C T C 10 0.511915380124546 0.409845893616438 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 40440854 G/C 1 13 4 17 6.3451000583809 2.04766152049818 4.29743853788272 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0501151076965619 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000515053:exon_40440259_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000513473:exon_40440332_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505414:exon_40440435_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514782:exon_40440499_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000507180:exon_40440540_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511598:exon_40440570_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511902:exon_40440732_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505220:exon_40440733_40440941:RBM47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 47589203 G/A 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G G A 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505476:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47589036_47589223:ATP10D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 47593283 G/C 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 C:G G C 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47593059_47594892:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47593059_47593312:ATP10D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 15 13 28 7.32126929813181 6.6548999416191 0.666369356512713 T:C T C 10 0.511915380124546 0.85173783903044 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 A:G G A 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 53 41 94 25.8684848533991 20.9885305851064 4.87995426829268 T:C T C 10 0.511915380124546 0.353359077707847 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 65 58 123 31.7255002919045 29.6910920472237 2.03440824468085 A:G G A 10 0.511915380124546 0.719423238125667 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 68 62 130 33.1897541515309 31.7387535677219 1.45100058380903 A:G G A 10 0.511915380124546 0.860811307022084 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 192 135 327 93.7122470160872 69.1085763168137 24.6036706992735 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00667786033662338 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 68500171 A/G 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68500147_68500236:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68500147_68500236:UBA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 35 33 68 17.0829616956409 16.89320754411 0.189754151530874 A:T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 69 74 143 33.6778387714063 37.8817381292164 -4.20389935781007 A:G G A 10 0.511915380124546 0.504004037373983 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 3 10 13 1.46425385962636 5.11915380124546 -3.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0523756919310054 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 76878727 G/C 1 72 78 150 35.1420926310327 39.9293996497146 -4.78730701868189 C:G G C 10 0.511915380124546 0.462666752442079 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 23 22 45 11.2259462571354 11.26213836274 -0.0361921056045684 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 20 23 43 9.76169239750908 11.7740537428646 -2.01236134535548 A:G A G 10 0.511915380124546 0.546476919144382 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 14 12 26 6.83318467825636 6.14298456149455 0.690200116761805 T:C T C 10 0.511915380124546 0.846159280949244 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 79832706 C/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 C:G C G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79831764_79833339:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79831764_79837526:BMP2K;ENSG00000163291:ENST00000511594:exon_79831992_79833217:PAQR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 21 12 33 10.2497770173845 6.14298456149455 4.10679245588998 A:G A G 10 0.511915380124546 0.166690999506631 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 86915848 T/C 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000514229:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86915736_86916810:ARHGAP24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 86915923 G/A 0 0 16 16 0 8.19064608199274 -8.19064608199274 A G A 10 0.511915380124546 1.03734200432259e-05 ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000514229:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86915736_86916810:ARHGAP24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 89311962 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000273960:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000502870:exon_89311804_89312030:HERC6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C T C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 95496882 C/T 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 T:C C T 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95496767_95497185:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000510099:exon_95496767_95497089:PDLIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 8 14 22 3.90467695900363 7.16681532174364 -3.26213836274001 A:G A G 10 0.511915380124546 0.201891896863631 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 102117083 C/T 1 15 8 23 7.32126929813181 4.09532304099637 3.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.213023121779288 ENSG00000138814:ENST00000512215:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000394854:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000323055:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000394853:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000523694:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000528620:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000509183:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000492351:exon_102117073_102117085:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000529324:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000525819:exon_102117073_102117273:PPP3CA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 14 22 36 6.83318467825636 11.26213836274 -4.42895368448365 A:G A G 10 0.511915380124546 0.181635479525629 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 11 9 20 5.36893081862999 4.60723842112091 0.761692397509081 A:G G A 10 0.511915380124546 0.824801026782714 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 108641300 T/C 1 14 22 36 6.83318467825636 11.26213836274 -4.42895368448365 T:C T C 10 0.511915380124546 0.181635479525629 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 11 20 31 5.36893081862999 10.2383076024909 -4.86937678386093 A:G G A 10 0.511915380124546 0.104757272014477 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 43 45 88 20.9876386546445 23.0361921056046 -2.04855345096004 T:C T C 10 0.511915380124546 0.671328534032592 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113351825 G/A 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 A:G G A 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 27 18 45 13.1782847366373 9.21447684224183 3.96380789439543 A:G A G 10 0.511915380124546 0.296564585019024 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 A:G G A 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 30 35 65 14.6425385962636 17.9170383043591 -3.27449970809549 T:C T C 10 0.511915380124546 0.457531555300912 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 15 16 31 7.32126929813181 8.19064608199274 -0.869376783860925 A:G A G 10 0.511915380124546 0.857930696979674 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 16 25 41 7.80935391800726 12.7978845031136 -4.98853058510638 A:C A C 10 0.511915380124546 0.158917077235552 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 123268859 A/G 1 13 5 18 6.3451000583809 2.55957690062273 3.78552315775817 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0979415445230112 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123268677_123268934:KIAA1109 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 129867280 T/A 1 20 9 29 9.76169239750908 4.60723842112091 5.15445397638817 A:T T A 10 0.511915380124546 0.063548925958107 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 129913345 G/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000434680:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000503215:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129913322_129913392:SCLT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 T:C C T 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 677 3 680 330.433287655682 1.53574614037364 328.897541515309 A:G G A 10 0.511915380124546 8.35799861964457e-191 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 144130750 T/C 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 T:C T C 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144130717_144130810:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144130717_144130810:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144130717_144130810:USP38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 13 19 32 6.3451000583809 9.72639222236637 -3.38129216398547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.288965937980986 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 60 64 124 29.2850771925272 32.7625843279709 -3.4775071354437 T:C T C 10 0.511915380124546 0.590088772743338 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 51 51 102 24.8923156136482 26.1076843863518 -1.21536877270369 T:C C T 10 0.511915380124546 0.843325612043042 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 152609784 C/T 1 17 15 32 8.29743853788272 7.67873070186819 0.61870783601453 T:C C T 10 0.511915380124546 0.861316316478707 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000510720:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000513504:exon_152609782_152609915:PET112L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 98 94 192 47.8322927477945 48.1200457317073 -0.287752983912824 T:C:G C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 156723683 C/T 1 30 15 45 14.6425385962636 7.67873070186819 6.96380789439543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0513531255030669 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156723365_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156723593_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156723494_156723731:GUCY1B3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 64 70 134 31.2374156720291 35.8340766087182 -4.59666093668916 T:G G T 10 0.511915380124546 0.437917422203472 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 51 55 106 24.8923156136482 28.15534590685 -3.26303029320187 A:C:G A C 10 0.511915380124546 0.560520320409746 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 164436465 G/T 1 84 74 158 40.9991080695381 37.8817381292164 3.11736994032174 A:T:G G T 10 0.511915380124546 0.633831245239419 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164436465_164436613:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164436465_164436613:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164436465_164437254:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164436465_164436613:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164436465_164436613:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164436465_164436613:C4orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 32 50 82 15.6187078360145 25.5957690062273 -9.97706117021277 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0351919445731186 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 14 13 27 6.83318467825636 6.6548999416191 0.178284736637259 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 170038894 A/G 1 18 7 25 8.78552315775817 3.58340766087182 5.20211549688635 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0447517670739692 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170038674_170038933:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170038674_170038933:SH3RF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 10 18 28 4.88084619875454 9.21447684224183 -4.33363064348729 A:G A G 10 0.511915380124546 0.129737767786153 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 10 17 27 4.88084619875454 8.70256146211728 -3.82171526336274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.177721968120350 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 133 128 261 64.9152544434354 65.5251686559419 -0.609914212506496 A:T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.95069931452732 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 185687129 G/A 1 21 28 49 10.2497770173845 14.3336306434873 -4.08385362610275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.25596997044444 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687045_185687140:ACSL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 22 11 33 10.73786163726 5.63106918137001 5.10679245588998 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0829590546178677 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 26 27 53 12.6902001167618 13.8217152633627 -1.13151514660094 T:C C T 10 0.511915380124546 0.784784493477215 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 30 37 67 14.6425385962636 18.9408690646082 -4.29833046834458 T:C T C 10 0.511915380124546 0.328831506862514 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 122 95 217 59.5463236248054 48.6319611118319 10.9143625129735 T:C T C 10 0.511915380124546 0.153741715585659 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 186 186 372 90.7837392968345 95.2162607031655 -4.43252140633109 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.678277797126488 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 C:G C G 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 31 31 62 15.1306232161391 15.8693767838609 -0.738753567721851 C:G G C 10 0.511915380124546 0.89924655053157 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 50 47 97 24.4042309937727 24.0600228658537 0.344208127919043 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:C A C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 640705 A/G 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_640523_640719:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_640523_640719:CEP72 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 1 9 10 0.488084619875454 4.60723842112091 -4.11915380124546 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0100505466901609 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 53 41 94 25.8684848533991 20.9885305851064 4.87995426829268 T:C C T 10 0.511915380124546 0.353359077707847 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 A:G A G 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 5469047 A/G 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 A:G A G 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5468941_5469101:KIAA0947 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 39 38 77 19.0353001751427 19.4527844447327 -0.417484269590037 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 6604329 C/T 1 60 56 116 29.2850771925272 28.6672612869746 0.617815905552671 T:C C T 10 0.511915380124546 0.926252880015815 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6603982_6604389:NSUN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 6632831 G/A 1 127 30 157 61.9867467241827 15.3574614037364 46.6292853204463 A:G G A 10 0.511915380124546 1.73842507778629e-14 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6632712_6632869:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6632712_6632869:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6632712_6632869:NSUN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 11 12 23 5.36893081862999 6.14298456149455 -0.774053742864557 A:G G A 10 0.511915380124546 0.836006652806153 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 9 4 13 4.39276157887909 2.04766152049818 2.3451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.268628592400232 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 10282396 A/G 1 6 11 17 2.92850771925272 5.63106918137001 -2.70256146211728 A:G A G 10 0.511915380124546 0.228802164450189 ENSG00000164237:ENST00000503834:exon_10282309_10282400:CMBL;ENSG00000164237:ENST00000296658:exon_10282309_10282400:CMBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 A:C A C 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 16 14 30 7.80935391800726 7.16681532174364 0.642538596263622 T:C T C 10 0.511915380124546 0.856761303277079 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 31538692 A/C 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 A:C A C 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000082213:ENST00000325366:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000355907:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510659:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000513967:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000517780:exon_31538367_31538793:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000511208:exon_31538588_31538791:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000504464:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510530:exon_31538280_31538796:C5orf22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 33459990 A/G 1 2 11 13 0.976169239750908 5.63106918137001 -4.6548999416191 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0111813136819657 ENSG00000113407:ENST00000504698:exon_33459800_33460074:TARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 36962249 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36962225_36962376:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36962225_36962376:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000505998:exon_36962225_36962376:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36962225_36962376:NIPBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 10 15 25 4.88084619875454 7.67873070186819 -2.79788450311365 T:C C T 10 0.511915380124546 0.318697161637912 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 4 14 18 1.95233847950182 7.16681532174364 -5.21447684224183 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0169810396326105 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 39119723 C/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000082074:ENST00000351578:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000515010:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000512982:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000505428:exon_39119637_39119736:FYB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 39134417 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000082074:ENST00000351578:exon_39134310_39134451:FYB;ENSG00000082074:ENST00000515010:exon_39134310_39134451:FYB;ENSG00000082074:ENST00000512982:exon_39134310_39134451:FYB;ENSG00000082074:ENST00000505428:exon_39134310_39134451:FYB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 42718928 G/T 1 7 19 26 3.41659233912818 9.72639222236637 -6.30979988323819 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0171736804395362 ENSG00000112964:ENST00000230882:exon_42718555_42721979:GHR;ENSG00000112964:ENST00000357703:exon_42718555_42721925:GHR;ENSG00000112964:ENST00000511135:exon_42718555_42719893:GHR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 42719344 C/A 1 3 14 17 1.46425385962636 7.16681532174364 -5.70256146211728 A:C C A 10 0.511915380124546 0.00642864916210632 ENSG00000112964:ENST00000230882:exon_42718555_42721979:GHR;ENSG00000112964:ENST00000357703:exon_42718555_42721925:GHR;ENSG00000112964:ENST00000511135:exon_42718555_42719893:GHR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 43609343 C/T 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C C T 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 50057729 G/T 1 18 4 22 8.78552315775817 2.04766152049818 6.73786163725999 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0045764587297467 ENSG00000151883:ENST00000505697:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000511363:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503888:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000510303:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000281631:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503707:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000514067:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000423185:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503193:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000515166:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505554:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505180:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503561:exon_50057655_50057732:PARP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 18 15 33 8.78552315775817 7.67873070186819 1.10679245588998 C:G G C 10 0.511915380124546 0.730790496693958 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 54572163 T/C 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 T:C T C 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000513447:exon_54572094_54572188:DHX29 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C T C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 54645411 G/A 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54645401_54645480:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54645401_54645480:SKIV2L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 15 15 30 7.32126929813181 7.67873070186819 -0.357461403736378 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 51 37 88 24.8923156136482 18.9408690646082 5.95144654903995 A:G G A 10 0.511915380124546 0.240690391718942 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 A:G A G 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 65317181 C/T 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000416865:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65317150_65317213:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65317150_65317213:ERBB2IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 45 34 79 21.9638078943954 17.4051229242346 4.55868497016087 A:G A G 10 0.511915380124546 0.313582141343552 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 21 13 34 10.2497770173845 6.6548999416191 3.59487707576544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.233980124238926 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 24 20 44 11.7140308770109 10.2383076024909 1.47572327451998 A:T:C A T 10 0.511915380124546 0.763381725765264 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 33 34 67 16.10679245589 17.4051229242346 -1.29833046834458 T:G G T 10 0.511915380124546 0.80734200277502 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 35 31 66 17.0829616956409 15.8693767838609 1.21358491177996 T:C C T 10 0.511915380124546 0.806224885472318 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68687675 C/T 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000514626:exon_68687658_68687746:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000508320:exon_68687658_68687840:RAD17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 34 41 75 16.5948770757654 20.9885305851064 -4.39365350934095 T:G T G 10 0.511915380124546 0.355683091213474 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 13 13 26 6.3451000583809 6.6548999416191 -0.309799883238195 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:T T A 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 991 1021 2012 483.691858296575 522.665603107161 -38.9737448105865 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.0859324994489174 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 72873736 A/T 1 15 11 26 7.32126929813181 5.63106918137001 1.69020011676181 A:T:G A T 10 0.511915380124546 0.560130398277703 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72873681_72873830:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72873681_72873830:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72873681_72873830:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000512550:exon_72873681_72874241:UTP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 4 27 31 1.95233847950182 13.8217152633627 -11.8693767838609 T:C C T 10 0.511915380124546 1.38609368935936e-05 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 73931246 T/C 1 2 10 12 0.976169239750908 5.11915380124546 -4.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0197833900869736 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 74046464 C/T 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74046404_74046492:GFM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 115 142 257 56.1297312856772 72.6919839776855 -16.5622526920083 C:G C G 10 0.511915380124546 0.03958143417452 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 199 203 402 97.1288393552153 103.918822165283 -6.78998281006749 A:G A G 10 0.511915380124546 0.51675306765241 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 19 8 27 9.27360777763363 4.09532304099637 5.17828473663726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0540257950190272 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 75470004 C/T 0 165 0 165 80.5339622794499 0 80.5339622794499 C C 10 0.511915380124546 1.11116008993928e-48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 C:G G C 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 75948650 A/G 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75948575_75948658:IQGAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 17 26 43 8.29743853788272 13.3097998832382 -5.01236134535548 A:C C A 10 0.511915380124546 0.130365598853253 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 51 38 89 24.8923156136482 19.4527844447327 5.43953116891541 A:G A G 10 0.511915380124546 0.289007687794745 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 18 21 39 8.78552315775817 10.7502229826155 -1.96469982485729 A:T A T 10 0.511915380124546 0.631453985165305 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 77473165 A/G 1 14 24 38 6.83318467825636 12.2859691229891 -5.45278444473275 A:G A G 10 0.511915380124546 0.103449429666651 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77473163_77473260:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77473163_77473260:AP3B1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 78181477 C/T 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 78610174 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78610080_78610448:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78610080_78610674:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78610080_78610674:JMY HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 0 9 1 10 4.39276157887909 0.511915380124546 3.88084619875454 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0218341665311933 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 A:G G A 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 17 16 33 8.29743853788272 8.19064608199274 0.106792455889984 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 87493525 C/T 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000164180:ENST00000514135:exon_87493486_87493582:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87493486_87493582:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87493486_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87493486_87493582:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87493486_87493582:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87493486_87493582:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000515293:exon_87493486_87494268:TMEM161B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 87498849 G/A 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000164180:ENST00000514135:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87493486_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000506536:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000443393:exon_87498789_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000507872:exon_87498501_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000509387:exon_87498760_87498892:TMEM161B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 32 36 68 15.6187078360145 18.4289536844837 -2.81024584846913 C:G C G 10 0.511915380124546 0.54487399634682 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 16 29 45 7.80935391800726 14.8455460236118 -7.03619210560457 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0375166859426032 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 95067362 C/T 1 25 27 52 12.2021154968864 13.8217152633627 -1.61959976647639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.679293554326009 ENSG00000164292:ENST00000506817:exon_95066850_95067388:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95066879_95067388:RHOBTB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 195 154 349 95.1765008757135 78.8349685391801 16.3415323365335 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0865372368572698 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 26 10 36 12.6902001167618 5.11915380124546 7.57104631551634 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0121549538394753 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 36 28 64 17.5710463155163 14.3336306434873 3.23741567202906 T:C C T 10 0.511915380124546 0.454435798502245 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 15 14 29 7.32126929813181 7.16681532174364 0.154453976388168 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 15 8 23 7.32126929813181 4.09532304099637 3.22594625713544 A:G A G 10 0.511915380124546 0.213023121779288 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:G A G 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96130836 T/C 1 4 13 17 1.95233847950182 6.6548999416191 -4.70256146211728 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0277210001524075 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96130745_96130865:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96130745_96130865:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 24 9 33 11.7140308770109 4.60723842112091 7.10679245588998 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0143918438582559 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 0 38 0 38 18.5472155552673 0 18.5472155552673 G G 10 0.511915380124546 1.03577229524092e-11 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 59 2 61 28.7969925726518 1.02383076024909 27.7731618124027 A:T T A 10 0.511915380124546 3.34969628325478e-15 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 36 4 40 17.5710463155163 2.04766152049818 15.5233847950182 A:G G A 10 0.511915380124546 2.40518683010463e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 70 4 74 34.1659233912818 2.04766152049818 32.1182618707836 T:C C T 10 0.511915380124546 5.00061132406797e-16 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 96 9 105 46.8561235080436 4.60723842112091 42.2488850869227 T:C C T 10 0.511915380124546 7.3364087607507e-19 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 84 8 92 40.9991080695381 4.09532304099637 36.9037850285418 T:C C T 10 0.511915380124546 1.56720942588609e-16 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96350710 G/A 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 A:G G A 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96350643_96350799:LNPEP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 21 21 42 10.2497770173845 10.7502229826155 -0.500445965230931 A:G G A 10 0.511915380124546 0.87892642325315 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 42 34 76 20.4995540347691 17.4051229242346 3.09443111053451 T:C C T 10 0.511915380124546 0.493388300850688 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 A:T T A 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 A:T T A 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 C:G G C 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 106716975 G/A 1 12 16 28 5.85701543850545 8.19064608199274 -2.33363064348729 A:G G A 10 0.511915380124546 0.450988108517662 ENSG00000184349:ENST00000333274:exon_106712590_106717077:EFNA5;ENSG00000184349:ENST00000510359:exon_106716685_106717077:EFNA5;ENSG00000184349:ENST00000509503:exon_106716939_106717077:EFNA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 22 9 31 10.73786163726 4.60723842112091 6.13062321613908 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0308605733351070 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 16 22 38 7.80935391800726 11.26213836274 -3.45278444473275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.330380878567993 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 34 36 70 16.5948770757654 18.4289536844837 -1.83407660871822 A:G G A 10 0.511915380124546 0.720306971897038 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 111066697 T/C 1 26 26 52 12.6902001167618 13.3097998832382 -0.619599766476391 T:C T C 10 0.511915380124546 0.890415585476036 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 24 20 44 11.7140308770109 10.2383076024909 1.47572327451998 T:G T G 10 0.511915380124546 0.763381725765264 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 72 58 130 35.1420926310327 29.6910920472237 5.45100058380902 T:C T C 10 0.511915380124546 0.380417206389991 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 199 146 345 97.1288393552153 74.7396454981837 22.3891938570316 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0176886435147945 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 118811533 G/A 1 15 31 46 7.32126929813181 15.8693767838609 -8.54810748572912 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0121471589156609 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507695:exon_118811519_118811568:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118811519_118811565:HSD17B4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 17 18 35 8.29743853788272 9.21447684224183 -0.917038304359108 A:G A G 10 0.511915380124546 0.86609172977762 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 17 13 30 8.29743853788272 6.6548999416191 1.64253859626362 C:G G C 10 0.511915380124546 0.587883526117901 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:G G A 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 123984706 C/T 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000509799:exon_123983930_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000513986:exon_123983956_123984826:ZNF608 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 126253720 G/A 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000173926:ENST00000308660:exon_126253676_126253919:MARCH3;ENSG00000173926:ENST00000515241:exon_126253676_126253920:MARCH3;ENSG00000173926:ENST00000502289:exon_126253676_126253919:MARCH3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 27 22 49 13.1782847366373 11.26213836274 1.91614637389725 A:G G A 10 0.511915380124546 0.668708126395563 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 130726789 G/A 1 39 40 79 19.0353001751427 20.4766152049818 -1.44131502983913 A:G G A 10 0.511915380124546 0.822103794313823 ENSG00000158985:ENST00000395246:exon_130726686_130726801:CDC42SE2;ENSG00000158985:ENST00000503291:exon_130726686_130726801:CDC42SE2;ENSG00000158985:ENST00000360515:exon_130726686_130726801:CDC42SE2;ENSG00000158985:ENST00000505065:exon_130726686_130730360:CDC42SE2;ENSG00000158985:ENST00000446153:exon_130726686_130726801:CDC42SE2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 59 56 115 28.7969925726518 28.6672612869746 0.129731285677217 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 164 190 354 80.0458776595745 97.2639222236637 -17.2180445640893 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0706468632128176 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 126 120 246 61.4986621043072 61.4298456149455 0.0688164893616943 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 135489435 G/A 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.291939005862036 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137500525 G/A 1 22 23 45 10.73786163726 11.7740537428646 -1.03619210560457 A:G G A 10 0.511915380124546 0.767954640809347 ENSG00000112983:ENST00000254900:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000230901:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000454473:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000418329:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000441656:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000402931:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000411594:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000239899:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000455658:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000512140:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000515014:exon_137500403_137500641:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000506167:exon_137500403_137500855:BRD8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 19 12 31 9.27360777763363 6.14298456149455 3.13062321613908 A:G G A 10 0.511915380124546 0.285285483497109 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 21 27 48 10.2497770173845 13.8217152633627 -3.57193824597821 T:C T C 10 0.511915380124546 0.315725201892205 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 562 550 1112 274.303556370005 281.5534590685 -7.24990269849508 A:G G A 10 0.511915380124546 0.674571380676934 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 126 190 316 61.4986621043072 97.2639222236637 -35.7652601193565 T:C T C 10 0.511915380124546 6.09431947744872e-05 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 A:G A G 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 138775173 T/C 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 T T 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138775095_138775215:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000505568:exon_138775095_138775190:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138775095_138775181:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138775095_138775181:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000512473:exon_138775095_138775181:DNAJC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 15 14 29 7.32126929813181 7.16681532174364 0.154453976388168 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 18 9 27 8.78552315775817 4.60723842112091 4.17828473663726 C:G C G 10 0.511915380124546 0.124932157067609 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 140021482 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000513002:exon_140021455_140021650:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000511410:exon_140021250_140021970:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000514449:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000505086:exon_140021455_140021922:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140021455_140021638:TMCO6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 C:G C G 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 20 12 32 9.76169239750908 6.14298456149455 3.61870783601453 T:C T C 10 0.511915380124546 0.219498632603626 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 18 19 37 8.78552315775817 9.72639222236637 -0.940869064608201 T:C C T 10 0.511915380124546 0.869689677577778 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 50 49 99 24.4042309937727 25.0838536261028 -0.679622632330048 T:C T C 10 0.511915380124546 0.920141200423167 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 17 16 33 8.29743853788272 8.19064608199274 0.106792455889984 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 16 21 37 7.80935391800726 10.7502229826155 -2.9408690646082 C:G G C 10 0.511915380124546 0.411388237397426 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 26 17 43 12.6902001167618 8.70256146211728 3.98763865464452 C:G C G 10 0.511915380124546 0.285516377218113 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 46 44 90 22.4518925142709 22.52427672548 -0.0723842112091369 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 8 13 21 3.90467695900363 6.6548999416191 -2.75022298261547 A:G G A 10 0.511915380124546 0.277507406797940 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 142661490 A/G 1 31 33 64 15.1306232161391 16.89320754411 -1.76258432797094 A:G A G 10 0.511915380124546 0.708341096863079 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 142678361 G/A 1 24 40 64 11.7140308770109 20.4766152049818 -8.76258432797094 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0330463089135560 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000415690:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000416954:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142678233_142678377:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142678233_142678377:NR3C1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149212510 C/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 10 3 13 4.88084619875454 1.53574614037364 3.3451000583809 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0934748740494892 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 12 18 30 5.85701543850545 9.21447684224183 -3.35746140373638 T:G T G 10 0.511915380124546 0.273551093070692 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149907641 C/T 1 10 8 18 4.88084619875454 4.09532304099637 0.785523157758172 T:C C T 10 0.511915380124546 0.815475235631285 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149912527 C/T 1 14 8 22 6.83318467825636 4.09532304099637 2.73786163725999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.289304325792258 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149912507_149912594:NDST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149919739 G/C 1 4 10 14 1.95233847950182 5.11915380124546 -3.16681532174364 C:G G C 10 0.511915380124546 0.111089710779964 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149919644_149919826:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149919644_149919826:NDST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 149932934 G/A 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149932775_149933276:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149932775_149937773:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000521752:exon_149932775_149933273:NDST1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150097883 G/C 1 5 12 17 2.44042309937727 6.14298456149455 -3.70256146211728 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0898784303233661 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000518909:exon_150097838_150097945:DCTN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 47 49 96 22.9399771341463 25.0838536261028 -2.14387649195641 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.683963475409866 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 75 55 130 36.606346490659 28.15534590685 8.45100058380902 A:G G A 10 0.511915380124546 0.160169226517977 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150639409 A/G 1 65 55 120 31.7255002919045 28.15534590685 3.57015438505449 A:G A G 10 0.511915380124546 0.524208236152305 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 98 80 178 47.8322927477945 40.9532304099637 6.87906233783082 A:G A G 10 0.511915380124546 0.32982794290097 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 150647040 C/T 1 88 104 192 42.95144654904 53.2391995329528 -10.2877529839128 T:C C T 10 0.511915380124546 0.148792382280550 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 151055695 G/A 0 23 0 23 11.2259462571354 0 11.2259462571354 G G 10 0.511915380124546 2.73359875825343e-07 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151055693_151055762:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151055693_151055762:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151055693_151055762:SPARC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 A:G G A 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 153413390 C/T 1 12 11 23 5.85701543850545 5.63106918137001 0.225946257135443 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 154291414 T/C 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 T:C T C 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 156536016 A/C 1 2 9 11 0.976169239750908 4.60723842112091 -3.63106918137001 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0346208523981388 ENSG00000135077:ENST00000307851:exon_156535937_156536725:HAVCR2;ENSG00000135077:ENST00000522593:exon_156535937_156536133:HAVCR2;ENSG00000135077:ENST00000522902:exon_156535937_156536103:HAVCR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 118 128 246 57.5939851453036 65.5251686559419 -7.93118351063831 A:G A G 10 0.511915380124546 0.338779351071408 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 56 36 92 27.3327387130254 18.4289536844837 8.90378502854177 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0757345093180361 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 14 14 28 6.83318467825636 7.16681532174364 -0.333630643487286 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 35 44 79 17.0829616956409 22.52427672548 -5.44131502983913 A:G A G 10 0.511915380124546 0.260320635020344 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 162901121 C/G 1 14 18 32 6.83318467825636 9.21447684224183 -2.38129216398547 C:G C G 10 0.511915380124546 0.480315636502299 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162901063_162901211:HMMR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 105 88 193 51.2488850869227 45.04855345096 6.20033163596263 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.388095408480931 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 31 18 49 15.1306232161391 9.21447684224183 5.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.115177436467174 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 25 28 53 12.2021154968864 14.3336306434873 -2.13151514660093 T:C T C 10 0.511915380124546 0.584821430832287 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 16 21 37 7.80935391800726 10.7502229826155 -2.9408690646082 T:C T C 10 0.511915380124546 0.411388237397426 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 18 25 43 8.78552315775817 12.7978845031136 -4.01236134535548 T:G G T 10 0.511915380124546 0.22689866850651 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 34 33 67 16.5948770757654 16.89320754411 -0.298330468344577 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 85 101 186 41.4871926894136 51.7034533925791 -10.2162607031655 C:G C G 10 0.511915380124546 0.142538423925901 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 97 123 220 47.344208127919 62.9655917553192 -15.6213836274001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0365746320252696 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169685163 C/T 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 T:C C T 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000043462:ENST00000046794:exon_169685041_169685170:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000521416:exon_169685041_169685170:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000523369:exon_169685041_169685502:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000520344:exon_169685041_169685170:LCP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 169810796 C/T 1 11 7 18 5.36893081862999 3.58340766087182 1.78552315775817 T:C C T 10 0.511915380124546 0.48295319218206 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169810683_169810854:KCNMB1;ENSG00000145936:ENST00000521859:exon_169809656_169810854:KCNMB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 87 115 202 42.4633619291645 58.8702687143228 -16.4069067851583 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0240870373013179 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 7 16 23 3.41659233912818 8.19064608199274 -4.77405374286456 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0592824185806538 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 9 5 14 4.39276157887909 2.55957690062273 1.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.425821343623314 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 18 21 39 8.78552315775817 10.7502229826155 -1.96469982485729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.631453985165305 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 245 178 423 119.580731869486 91.1209376621692 28.4597942073171 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.00639038184068742 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 225 239 464 109.819039471977 122.347775849766 -12.5287363777893 T:C T C 10 0.511915380124546 0.246082238771466 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176761336 T/C 1 209 204 413 102.00968555397 104.430737545407 -2.42105199143749 T:C T C 10 0.511915380124546 0.843952343829856 ENSG00000169223:ENST00000303127:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000504071:exon_176761285_176761553:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000515209:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000514458:exon_176761285_176761337:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502560:exon_176761310_176761404:LMAN2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 10 19 29 4.88084619875454 9.72639222236637 -4.84554602361183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0934075833942564 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 129 131 260 62.9629159639336 67.0609147963155 -4.09799883238195 C:G G C 10 0.511915380124546 0.620192774603864 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 86 75 161 41.975277309289 38.393653509341 3.5816237999481 A:G A G 10 0.511915380124546 0.582061070682082 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 69 41 110 33.6778387714063 20.9885305851064 12.6893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0168955037025188 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 C:G G C 10 0.511915380124546 0.254209881707502 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 85 97 182 41.4871926894136 49.655791872081 -8.16859918266736 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.235946890217445 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 176963462 G/C 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000146067:ENST00000514747:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176963359_176963487:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000398118:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176963359_176963746:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000515394:exon_176963305_176963746:FAM193B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 19 14 33 9.27360777763363 7.16681532174364 2.10679245588998 T:C T C 10 0.511915380124546 0.490949258794062 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 177483154 T/A 1 12 8 20 5.85701543850545 4.09532304099637 1.76169239750908 A:T T A 10 0.511915380124546 0.505895428449493 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 7 11 18 3.41659233912818 5.63106918137001 -2.21447684224183 T:C C T 10 0.511915380124546 0.350091254850868 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 15 34 49 7.32126929813181 17.4051229242346 -10.0838536261028 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00408786015187064 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 18 10 28 8.78552315775817 5.11915380124546 3.66636935651271 T:C T C 10 0.511915380124546 0.188426563384957 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 70 68 138 34.1659233912818 34.8102458484691 -0.644322457187343 T:G T G 10 0.511915380124546 0.93229844810446 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 5 179498595 C/T 1 56 29 85 27.3327387130254 14.8455460236118 12.4871926894136 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00665193088159078 ENSG00000113269:ENST00000522208:exon_179498456_179498721:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000521389:exon_179498456_179499118:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000393383:exon_179498456_179499118:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000261947:exon_179498456_179499101:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000520911:exon_179498456_179499113:RNF130 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 6 200 206 2.92850771925272 102.383076024909 -99.4545683056565 A:G G A 10 0.511915380124546 1.07061073086596e-53 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 393359 G/C 1 198 196 394 96.6407547353399 100.335414504411 -3.69465976907111 C:G G C 10 0.511915380124546 0.724436923873868 ENSG00000137265:ENST00000380956:exon_393098_393368:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000412334:exon_393098_393368:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000493114:exon_393098_393368:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000443871:exon_393147_393368:IRF4;ENSG00000137265:ENST00000469834:exon_393279_393368:IRF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 29 31 60 14.1544539763882 15.8693767838609 -1.71492280747276 A:G A G 10 0.511915380124546 0.699508617226723 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 26 20 46 12.6902001167618 10.2383076024909 2.45189251427088 A:G G A 10 0.511915380124546 0.555781106582879 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 3015865 C/T 1 1 10 11 0.488084619875454 5.11915380124546 -4.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00532774962763048 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 3723764 G/T 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 T:G G T 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000168994:ENST00000380283:exon_3722854_3723970:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000477592:exon_3722854_3723970:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000380277:exon_3722854_3723970:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000526581:exon_3722854_3723970:C6orf145 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 3727811 C/G 1 22 8 30 10.73786163726 4.09532304099637 6.64253859626362 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0170136664535979 ENSG00000168994:ENST00000380283:exon_3727785_3727896:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000477592:exon_3727785_3727896:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000380277:exon_3727785_3727896:C6orf145;ENSG00000168994:ENST00000526581:exon_3727785_3727896:C6orf145 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 54 36 90 26.3565694732745 18.4289536844837 7.92761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 0.113285036218586 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 5999254 G/A 1 160 158 318 78.0935391800726 80.8826300596783 -2.78909087960562 A:G G A 10 0.511915380124546 0.779225932133914 ENSG00000124785:ENST00000244766:exon_5998232_5999437:NRN1;ENSG00000124785:ENST00000495850:exon_5998948_5999437:NRN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 6152137 C/G 1 22 24 46 10.73786163726 12.2859691229891 -1.54810748572911 C:G C G 10 0.511915380124546 0.661302444171157 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6152046_6152182:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6152046_6152182:F13A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 6152140 C/T 1 22 23 45 10.73786163726 11.7740537428646 -1.03619210560457 T:C C T 10 0.511915380124546 0.767954640809347 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6152046_6152182:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6152046_6152182:F13A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 7231770 A/G 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 45 35 80 21.9638078943954 17.9170383043591 4.04676959003632 A:G A G 10 0.511915380124546 0.373605364297920 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 A:G A G 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 34 30 64 16.5948770757654 15.3574614037364 1.23741567202906 T:C T C 10 0.511915380124546 0.803223122095247 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 194 196 390 94.6884162558381 100.335414504411 -5.64699824857293 A:G G A 10 0.511915380124546 0.577699439311174 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 15496662 C/T 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 T:C C T 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15496363_15497401:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15496363_15497401:JARID2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 24 19 43 11.7140308770109 9.72639222236637 1.98763865464452 A:G A G 10 0.511915380124546 0.647753721060461 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:G G A 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 21065449 C/T 1 14 2 16 6.83318467825636 1.02383076024909 5.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00434163882715972 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 13 2 15 6.3451000583809 1.02383076024909 5.32126929813181 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.00762249507560099 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 27 17 44 13.1782847366373 8.70256146211728 4.47572327451998 T:C C T 10 0.511915380124546 0.227305177190155 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 A:G G A 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 19 17 36 9.27360777763363 8.70256146211728 0.571046315516346 T:C T C 10 0.511915380124546 0.86928286566066 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 0 48 0 48 23.4280617540218 0 23.4280617540218 T T 10 0.511915380124546 1.21192973813105e-14 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26370616 G/C 0 53 0 53 25.8684848533991 0 25.8684848533991 G G 10 0.511915380124546 4.17735247918798e-16 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26370657 A/G 0 36 0 36 17.5710463155163 0 17.5710463155163 A A 10 0.511915380124546 4.00799900292027e-11 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26370659 C/T 0 36 0 36 17.5710463155163 0 17.5710463155163 C C 10 0.511915380124546 4.00799900292027e-11 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 0 41 0 41 20.0114694148936 0 20.0114694148936 T T 10 0.511915380124546 1.36349352673661e-12 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26373150 C/T 1 40 2 42 19.5233847950182 1.02383076024909 18.4995540347691 T:C C T 10 0.511915380124546 5.85556357027544e-10 ENSG00000186470:ENST00000527417:exon_26373125_26373170:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532627:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26373125_26373315:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373116_26373325:BTN3A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 34 26 60 16.5948770757654 13.3097998832382 3.28507719252724 A:G G A 10 0.511915380124546 0.439480699527162 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26468660 G/A 1 32 22 54 15.6187078360145 11.26213836274 4.35656947327452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.276447351326516 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26545418 C/T 1 195 173 368 95.1765008757135 88.5613607615465 6.61514011416709 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.498274507264856 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 255 233 488 124.461578068241 119.276283569019 5.18529449922157 A:G G A 10 0.511915380124546 0.650873536652615 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 74 51 125 36.1182618707836 26.1076843863518 10.0105774844318 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0742375182168307 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 57 54 111 27.8208233329009 27.6434305267255 0.177392806175398 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 29910324 G/C 1 2 26 28 0.976169239750908 13.3097998832382 -12.3336306434873 C:G G C 10 0.511915380124546 1.04552060950507e-06 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 0 200 200 0 102.383076024909 -102.383076024909 A C A 10 0.511915380124546 5.00062799324326e-63 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 0 33 0 33 16.10679245589 0 16.10679245589 C C 10 0.511915380124546 3.05766143294095e-10 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 3 25 28 1.46425385962636 12.7978845031136 -11.3336306434873 A:G G A 10 0.511915380124546 1.06875144646112e-05 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 65 66 131 31.7255002919045 33.78641508822 -2.06091479631552 T:C T C 10 0.511915380124546 0.727529425768164 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 5 9 14 2.44042309937727 4.60723842112091 -2.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.291939005862036 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 27 33 60 13.1782847366373 16.89320754411 -3.71492280747276 A:G G A 10 0.511915380124546 0.367369543936709 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 40 24 64 19.5233847950182 12.2859691229891 7.23741567202906 T:G T G 10 0.511915380124546 0.0798708209108779 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 40 24 64 19.5233847950182 12.2859691229891 7.23741567202906 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0798708209108779 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 52 42 94 25.3804002335236 21.5004459652309 3.87995426829268 A:G G A 10 0.511915380124546 0.47052388028038 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 T:C T C 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 284 289 573 138.616032044629 147.943544855994 -9.32751281136484 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.452016586571904 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30691490 G/A 1 2370 1641 4011 1156.76054910483 840.05313878438 316.707410320446 A:T:C:G G A 10 0.511915380124546 1.08559756665935e-23 ENSG00000196230:ENST00000327892:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000422827:exon_30691488_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000444378:exon_30691434_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000330914:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396389:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396384:exon_30691117_30693203:TUBB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30697931 T/C 1 460 370 830 224.518925142709 189.408690646082 35.1102344966269 A:T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.0150660739797479 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30697799_30697963:FLOT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30709424 A/G 1 129 178 307 62.9629159639336 91.1209376621692 -28.1580216982356 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.00136384960581877 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000438162:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000445853:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000484168:exon_30708967_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000454845:exon_30709391_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000484693:exon_30709131_30709980:FLOT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 25 18 43 12.2021154968864 9.21447684224183 2.98763865464452 A:C A C 10 0.511915380124546 0.446043325021446 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30877821 C/T 1 19 30 49 9.27360777763363 15.3574614037364 -6.08385362610275 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0875845076584759 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 30884719 T/C 1 26 17 43 12.6902001167618 8.70256146211728 3.98763865464452 T:C T C 10 0.511915380124546 0.285516377218113 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30884655_30884761:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30884655_30884736:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30884655_30884736:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000467717:exon_30884655_30884736:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000490699:exon_30884205_30884736:VARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 A:G A G 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 14 9 23 6.83318467825636 4.60723842112091 2.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.407963976479100 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 21 10 31 10.2497770173845 5.11915380124546 5.13062321613907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.073220020295494 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 217 209 426 105.914362512974 106.99031444603 -1.07595193305659 T:C T C 10 0.511915380124546 0.922859922460361 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 211 180 391 102.985854793721 92.1447684224183 10.8410863713025 A:G G A 10 0.511915380124546 0.288146758699391 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 270 251 521 131.782847366373 128.490760411261 3.29208695511153 C:G C G 10 0.511915380124546 0.792664917149593 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 10 11 21 4.88084619875454 5.63106918137001 -0.750222982615465 C:G G C 10 0.511915380124546 0.828779270144445 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 73 59 132 35.6301772509081 30.2030074273482 5.42716982355994 A:G A G 10 0.511915380124546 0.384076381344818 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 24 39 63 11.7140308770109 19.9646998248573 -8.25066894784639 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0433303217134539 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 52 50 102 25.3804002335236 25.5957690062273 -0.215368772703687 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 209 267 476 102.00968555397 136.681406493254 -34.6717209392839 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.00154107526356817 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 T:C C T 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 49 43 92 23.9161463738972 22.0123613453555 1.90378502854177 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754643445286097 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 C:G G C 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 T:G G T 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 22 18 40 10.73786163726 9.21447684224183 1.52338479501816 T:C C T 10 0.511915380124546 0.639673744429068 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31850499 G/A 1 53 49 102 25.8684848533991 25.0838536261028 0.784631227296313 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.921247686931693 ENSG00000204371:ENST00000478491:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31850476_31850562:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31850476_31850562:EHMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 18 17 35 8.78552315775817 8.70256146211728 0.0829616956408916 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 31936674 C/T 1 40 19 59 19.5233847950182 9.72639222236637 9.79699257265179 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0127856099323396 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 108 92 200 52.713138946549 47.0962149714582 5.61692397509081 C:G G C 10 0.511915380124546 0.437328349810673 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32135136 C/A 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:C C A 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000502898:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000509239:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361782:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000448406:exon_32135127_32135206:PPT2;ENSG00000241404:ENST00000333845:exon_32135127_32135206:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000395512:exon_32135127_32135206:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000432129:exon_32135127_32135206:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000466239:exon_32135127_32135433:EGFL8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32147478 G/T 1 43 34 77 20.9876386546445 17.4051229242346 3.58251573040996 T:G G T 10 0.511915380124546 0.427268695031442 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000487940:exon_32147428_32147550:RNF5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32149260 C/T 1 5 7 12 2.44042309937727 3.58340766087182 -1.14298456149455 T:C C T 10 0.511915380124546 0.57307152977622 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32150498 G/A 1 4 14 18 1.95233847950182 7.16681532174364 -5.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0169810396326105 ENSG00000204305:ENST00000488669:exon_32150345_32150708:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32150345_32150708:AGER HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 359 373 732 175.222378535288 190.944436786456 -15.7220582511677 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.251824501019908 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 675 712 1387 329.457118415931 364.483750648677 -35.0266322327453 A:T:C C A 10 0.511915380124546 0.0601376616091611 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 57 85 142 27.8208233329009 43.5128073105864 -15.6919839776855 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00912681052100527 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 127 63 190 61.9867467241827 32.2506689478464 29.7360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 1.60791963248733e-05 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 236 240 476 115.187970290607 122.859691229891 -7.67172093928387 T:C T C 10 0.511915380124546 0.491853858734829 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 472 456 928 230.375940581214 233.433413336793 -3.05747275557866 A:G A G 10 0.511915380124546 0.843890256196287 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 332 272 604 162.044093798651 139.240983393876 22.8031104047743 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0669650503868101 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 40 58 98 19.5233847950182 29.6910920472237 -10.1677072522055 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0432265067874713 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32946034 T/C 1 258 279 537 125.925831927867 142.824391054748 -16.8985591268812 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.154262143697807 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32948031 G/A 1 11 18 29 5.36893081862999 9.21447684224183 -3.84554602361183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.193355903088360 ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32947319_32948241:BRD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32948462 G/A 1 356 313 669 173.758124675662 160.229513978983 13.5286106966788 A:G G A 10 0.511915380124546 0.296729437209302 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 54 43 97 26.3565694732745 22.0123613453555 4.34420812791904 T:G G T 10 0.511915380124546 0.416902614342541 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 44 34 78 21.47572327452 17.4051229242346 4.07060035028542 T:C C T 10 0.511915380124546 0.367343169594949 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33036977 G/A 0 149 0 149 72.7246083614426 0 72.7246083614426 G G 10 0.511915380124546 5.28899118212268e-44 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33037061 G/C 1 323 6 329 157.651332219772 3.07149228074728 154.579839939024 C:G G C 10 0.511915380124546 4.66897717481753e-84 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 30 9 39 14.6425385962636 4.60723842112091 10.0353001751427 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00119816076298519 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 29 0 29 14.1544539763882 0 14.1544539763882 G G 10 0.511915380124546 4.61309037850312e-09 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 587 7 594 286.505671866892 3.58340766087182 282.92226420602 A:T:C:G G A 10 0.511915380124546 6.9345088744101e-158 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 590 8 598 287.969925726518 4.09532304099637 283.874602685521 T:C C T 10 0.511915380124546 6.53022498551166e-157 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 241 191 432 117.628393389984 97.7758376037883 19.8525557861961 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0604285499480471 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33053577 G/A 1 596 355 951 290.898433445771 181.729959944214 109.168473501557 A:G G A 10 0.511915380124546 1.23142008564695e-12 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33172479 G/T 1 22 17 39 10.73786163726 8.70256146211728 2.03530017514271 T:G G T 10 0.511915380124546 0.527014451735681 ENSG00000204228:ENST00000374662:exon_33172419_33172497:HSD17B8;ENSG00000204228:ENST00000469186:exon_33172463_33172896:HSD17B8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 17 17 34 8.29743853788272 8.70256146211728 -0.405122924234561 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33256671 G/C 1 96 67 163 46.8561235080436 34.2983304683446 12.557793039699 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.0503575034010858 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256581_33256790:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256581_33256789:WDR46 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33261586 C/A 1 8 7 15 3.90467695900363 3.58340766087182 0.321269298131811 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33261572_33261707:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000476616:exon_33261572_33261843:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000444031:exon_33261568_33261843:RGL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 217 180 397 105.914362512974 92.1447684224183 13.7695940905553 C:G G C 10 0.511915380124546 0.175310187857522 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 33283065 G/A 1 29 19 48 14.1544539763882 9.72639222236637 4.42806175402179 A:G G A 10 0.511915380124546 0.247943552387851 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 27 46 73 13.1782847366373 23.5481074857291 -10.3698227490919 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0186486029570936 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 34827085 A/T 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:T A T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000065060:ENST00000452449:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000192788:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000399008:exon_34825901_34827348:UHRF1BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 34838731 C/A 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 A:C C A 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000065060:ENST00000452449:exon_34838631_34838893:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000192788:exon_34838631_34838893:UHRF1BP1;ENSG00000065060:ENST00000399008:exon_34838631_34838893:UHRF1BP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 15 22 37 7.32126929813181 11.26213836274 -3.9408690646082 T:C C T 10 0.511915380124546 0.249436095995287 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 18 19 37 8.78552315775817 9.72639222236637 -0.940869064608201 T:C C T 10 0.511915380124546 0.869689677577778 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 35430686 G/A 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35430566_35430691:FANCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 31 36 67 15.1306232161391 18.4289536844837 -3.29833046834458 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.464176940591911 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 35716428 C/T 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C C T 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000157343:ENST00000373869:exon_35716345_35716688:C6orf81;ENSG00000157343:ENST00000288065:exon_35716315_35716685:C6orf81;ENSG00000157343:ENST00000373866:exon_35716315_35716856:C6orf81 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 477 405 882 232.816363680592 207.325728950441 25.4906347301504 A:C C A 10 0.511915380124546 0.0921124491383004 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 318 297 615 155.210909120394 152.03886789699 3.17204122340422 T:C C T 10 0.511915380124546 0.808865023199974 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 A:G A G 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 108 99 207 52.713138946549 50.6796226323301 2.03351631421899 A:G G A 10 0.511915380124546 0.781486328412827 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 43 41 84 20.9876386546445 20.9885305851064 -0.000891930461861534 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 43 28 71 20.9876386546445 14.3336306434873 6.65400801115724 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.123449314279939 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 37252210 C/T 1 14 7 21 6.83318467825636 3.58340766087182 3.24977701738454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.191889404597230 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37252112_37252240:TBC1D22B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 7 13 20 3.41659233912818 6.6548999416191 -3.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181089356124526 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 146 126 272 71.2603545018163 64.5013378956928 6.75901660612351 A:T T A 10 0.511915380124546 0.430691207521197 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 47 51 98 22.9399771341463 26.1076843863518 -3.16770725220551 A:G G A 10 0.511915380124546 0.545406118349828 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 46 37 83 22.4518925142709 18.9408690646082 3.51102344966268 T:C T C 10 0.511915380124546 0.445060607689017 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 245 178 423 119.580731869486 91.1209376621692 28.4597942073171 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00639038184068742 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 268 248 516 130.806678126622 126.955014270887 3.85166385573427 T:C T C 10 0.511915380124546 0.757953158984068 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 135 80 215 65.8914236831863 40.9532304099637 24.9381932732226 A:C A C 10 0.511915380124546 0.000790393492436108 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 42016319 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_42016239_42016706:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_42016239_42016632:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_42016239_42016446:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_42016239_42016442:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000513956:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000508143:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000505672:exon_42016239_42016414:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511161:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000505884:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000514382:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000502771:exon_42016239_42016424:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000514588:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000512381:exon_42016239_42016440:CCND3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 42211085 C/T 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42210986_42211099:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42210986_42211099:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42210986_42211099:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42210986_42211099:TRERF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 42627430 C/T 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 T:C C T 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 9 12 21 4.39276157887909 6.14298456149455 -1.75022298261547 A:T T A 10 0.511915380124546 0.515878739571297 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 43014745 T/C 1 15 15 30 7.32126929813181 7.67873070186819 -0.357461403736378 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43014618_43014845:CUL7;ENSG00000044090:ENST00000478630:exon_43014618_43014845:CUL7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 43320173 G/C 1 29 37 66 14.1544539763882 18.9408690646082 -4.78641508822003 T:C:G G C 10 0.511915380124546 0.268291062818713 ENSG00000171467:ENST00000318149:exon_43320115_43320214:ZNF318;ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43320115_43320214:ZNF318 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 22 30 52 10.73786163726 15.3574614037364 -4.61959976647639 A:G G A 10 0.511915380124546 0.213943248938703 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 441 345 786 215.245317365075 176.610806142968 38.6345112221069 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00598965696107259 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 2 13 15 0.976169239750908 6.6548999416191 -5.67873070186819 A:C A C 10 0.511915380124546 0.00347528670860961 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 48 54 102 23.4280617540218 27.6434305267255 -4.21536877270369 T:G G T 10 0.511915380124546 0.428988564045629 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 44272474 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44272382_44272554:AARS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 25 11 36 12.2021154968864 5.63106918137001 6.57104631551635 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0304354084691738 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 13 22 35 6.3451000583809 11.26213836274 -4.91703830435911 T:C T C 10 0.511915380124546 0.127031714636438 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 26 30 56 12.6902001167618 15.3574614037364 -2.66726128697457 T:C C T 10 0.511915380124546 0.50584998529588 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 8 15 23 3.90467695900363 7.67873070186819 -3.77405374286456 T:C C T 10 0.511915380124546 0.144409879379289 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 20 0 20 9.76169239750908 0 9.76169239750908 G G 10 0.511915380124546 2.1161492900864e-06 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 16 0 16 7.80935391800726 0 7.80935391800726 A A 10 0.511915380124546 3.26152668371144e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 12 12 0 6.14298456149455 -6.14298456149455 G A G 10 0.511915380124546 0.000182785387116761 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 21 21 0 10.7502229826155 -10.7502229826155 A G A 10 0.511915380124546 2.87340985877815e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 12 0 12 5.85701543850545 0 5.85701543850545 C C 10 0.511915380124546 0.00050666091488124 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 13 13 0 6.6548999416191 -6.6548999416191 C T C 10 0.511915380124546 8.92147361896721e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 72006512 T/C 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 38 23 61 18.5472155552673 11.7740537428646 6.7731618124027 A:G A G 10 0.511915380124546 0.09568413636637 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 15 3 18 7.32126929813181 1.53574614037364 5.78552315775817 T:G G T 10 0.511915380124546 0.00783051791605677 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 74497009 A/G 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 75994151 A/G 1 32 35 67 15.6187078360145 17.9170383043591 -2.29833046834458 A:G A G 10 0.511915380124546 0.62567948251645 ENSG00000112697:ENST00000230461:exon_75994118_75994684:TMEM30A;ENSG00000112697:ENST00000475111:exon_75994118_75994664:TMEM30A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 A:T A T 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 13 7 20 6.3451000583809 3.58340766087182 2.76169239750908 A:G G A 10 0.511915380124546 0.265901088588762 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 4 14 18 1.95233847950182 7.16681532174364 -5.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0169810396326105 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 A:G A G 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 A:G A G 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 20 19 39 9.76169239750908 9.72639222236637 0.0353001751427069 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 17 26 43 8.29743853788272 13.3097998832382 -5.01236134535548 T:C T C 10 0.511915380124546 0.130365598853253 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 A:C A C 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 90575924 G/A 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 18 27 45 8.78552315775817 13.8217152633627 -5.03619210560457 T:C C T 10 0.511915380124546 0.138755787745303 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 46 45 91 22.4518925142709 23.0361921056046 -0.584299591333682 A:G A G 10 0.511915380124546 0.91685999587672 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 T:C T C 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 97626374 A/G 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97626319_97626461:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97626319_97626461:MMS22L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 T:C T C 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 56 54 110 27.3327387130254 27.6434305267255 -0.310691813700053 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 106967778 T/C 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106967006_106969328:AIM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 A:T A T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 107100396 A/G 1 27 25 52 13.1782847366373 12.7978845031136 0.380400233523611 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100342_107100457:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100342_107101698:QRSL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 25 23 48 12.2021154968864 11.7740537428646 0.428061754021794 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 26 39 65 12.6902001167618 19.9646998248573 -7.27449970809549 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0820766477322011 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 105 33 138 51.2488850869227 16.89320754411 34.3556775428127 T:G G T 10 0.511915380124546 3.31064740117205e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 102 33 135 49.7846312272963 16.89320754411 32.8914236831863 T:C C T 10 0.511915380124546 7.44026855127742e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 88 56 144 42.95144654904 28.6672612869746 14.2841852620654 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0193516369773017 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109772866 G/A 1 43 40 83 20.9876386546445 20.4766152049818 0.511023449662684 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109772803_109773604:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109772803_109772903:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109772803_109772903:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109772803_109772903:MICAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 31 19 50 15.1306232161391 9.72639222236637 5.4042309937727 T:C T C 10 0.511915380124546 0.15666108931816 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 18 15 33 8.78552315775817 7.67873070186819 1.10679245588998 T:C T C 10 0.511915380124546 0.730790496693958 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 110064928 A/T 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 A:T A T 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110064878_110064975:FIG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 38 17 55 18.5472155552673 8.70256146211728 9.84465409314997 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00978583165594233 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 111912782 A/T 1 68 47 115 33.1897541515309 24.0600228658537 9.12973128567722 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0935090279912476 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 26 25 51 12.6902001167618 12.7978845031136 -0.107684386351844 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 28 25 53 13.6663693565127 12.7978845031136 0.868484853399066 T:C T C 10 0.511915380124546 0.890969893566085 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 42 29 71 20.4995540347691 14.8455460236118 5.65400801115724 C:G C G 10 0.511915380124546 0.192793456342403 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 38 24 62 18.5472155552673 12.2859691229891 6.26124643227815 A:G G A 10 0.511915380124546 0.127443719124370 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 117888109 T/C 1 9 14 23 4.39276157887909 7.16681532174364 -2.77405374286456 T:C T C 10 0.511915380124546 0.29893206210594 ENSG00000047932:ENST00000467125:exon_117888017_117888197:GOPC;ENSG00000047932:ENST00000052569:exon_117888017_117888197:GOPC;ENSG00000047932:ENST00000368498:exon_117888017_117888197:GOPC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 C C 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 11 11 22 5.36893081862999 5.63106918137001 -0.262138362740011 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 9 19 28 4.39276157887909 9.72639222236637 -5.33363064348729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0572604976845011 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 130374102 C/A 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 A:C C A 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000528385:exon_130374004_130374125:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130374004_130374136:L3MBTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 130381246 T/C 1 8 2 10 3.90467695900363 1.02383076024909 2.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.110373270443025 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130381181_130381285:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000531313:exon_130381181_130381285:L3MBTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 135787273 G/C 1 2 17 19 0.976169239750908 8.70256146211728 -7.72639222236637 C:G G C 10 0.511915380124546 0.000309165521997858 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000531788:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000327035:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000417892:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000524469:exon_135786952_135787511:AHI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 243 0 243 118.604562629735 0 118.604562629735 T T 10 0.511915380124546 2.82045500806259e-71 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 278 1 279 135.687524325376 0.511915380124546 135.175608945252 A:G A G 10 0.511915380124546 2.01392813714241e-79 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 277 0 277 135.199439705501 0 135.199439705501 A A 10 0.511915380124546 3.02349015497354e-81 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 98 0 98 47.8322927477945 0 47.8322927477945 G G 10 0.511915380124546 6.25339145980247e-29 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 98 0 98 47.8322927477945 0 47.8322927477945 T T 10 0.511915380124546 6.25339145980247e-29 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 136977568 T/C 1 21 14 35 10.2497770173845 7.16681532174364 3.08296169564089 T:C T C 10 0.511915380124546 0.315321492181660 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136977445_136977598:MAP3K5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 36 28 64 17.5710463155163 14.3336306434873 3.23741567202906 T:C:G T G 10 0.511915380124546 0.454435798502245 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 26 15 41 12.6902001167618 7.67873070186819 5.01146941489362 A:G G A 10 0.511915380124546 0.121530770428778 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 T:C T C 10 0.511915380124546 0.754604246278714 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 A:G A G 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 C:G G C 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 27 23 50 13.1782847366373 11.7740537428646 1.4042309937727 T:C C T 10 0.511915380124546 0.777676813700698 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 144852201 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144852188_144852338:UTRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 144876008 C/T 1 11 6 17 5.36893081862999 3.07149228074728 2.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.334661945890417 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144875824_144876029:UTRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 144878337 G/T 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144878293_144878447:UTRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 145051594 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_145051493_145051622:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367526:exon_145051493_145051622:UTRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 24 18 42 11.7140308770109 9.21447684224183 2.49955403476907 A:G G A 10 0.511915380124546 0.537506839413637 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 28 22 50 13.6663693565127 11.26213836274 2.4042309937727 T:C C T 10 0.511915380124546 0.572124436937464 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 152443761 C/T 1 15 10 25 7.32126929813181 5.11915380124546 2.20211549688635 T:C C T 10 0.511915380124546 0.427667156227124 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G A G 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 158499302 G/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:G G T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158499196_158499313:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158499196_158499313:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158499196_158499313:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158498712_158500388:SYNJ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 158507981 G/A 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:G G A 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158507887_158508021:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158507887_158508021:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158507887_158508021:SYNJ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 158509750 A/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158509692_158509804:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158509692_158509804:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158509692_158509804:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158509692_158509804:SYNJ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 158517308 A/G 1 7 9 16 3.41659233912818 4.60723842112091 -1.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.622256482931006 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158516650_158520208:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158516650_158519568:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158516650_158518886:SYNJ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 22 10 32 10.73786163726 5.11915380124546 5.61870783601453 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.0521696794811529 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 23 23 46 11.2259462571354 11.7740537428646 -0.548107485729115 A:G A G 10 0.511915380124546 0.883922940515953 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 27 30 57 13.1782847366373 15.3574614037364 -2.17917666709912 A:T T A 10 0.511915380124546 0.597760716282939 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 112 91 203 54.6654774260509 46.5842995913337 8.08117783471717 T:C C T 10 0.511915380124546 0.262111515040655 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 20 21 41 9.76169239750908 10.7502229826155 -0.988530585106385 T:C T C 10 0.511915380124546 0.757990196027559 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 161557662 G/A 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000026652:ENST00000320285:exon_161551057_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000457520:exon_161557107_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000366911:exon_161557107_161557666:AGPAT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 166571935 C/T 1 181 116 297 88.3433161974572 59.3821840944473 28.9611321030099 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.000907370519377942 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 166572005 T/C 1 85 128 213 41.4871926894136 65.5251686559419 -24.0379759665283 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00098396694292892 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 163 178 341 79.557793039699 91.1209376621692 -11.5631446224702 T:C C T 10 0.511915380124546 0.213247919362873 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 167040463 A/G 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000071242:ENST00000265678:exon_167040409_167040731:RPS6KA2;ENSG00000071242:ENST00000366863:exon_167040409_167040725:RPS6KA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 A:C C A 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 168343838 T/C 1 12 9 21 5.85701543850545 4.60723842112091 1.24977701738453 T:C T C 10 0.511915380124546 0.665529232948816 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168343809_168343871:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507679:exon_168343809_168343874:MLLT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 18 10 28 8.78552315775817 5.11915380124546 3.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.188426563384957 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 170060808 G/A 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170060759_170060862:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170060759_170060862:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170060759_170060862:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170060759_170061166:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170060759_170060862:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170060759_170060862:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170060759_170060862:WDR27 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 50 39 89 24.4042309937727 19.9646998248573 4.43953116891541 A:T A T 10 0.511915380124546 0.396486004498103 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 15 12 27 7.32126929813181 6.14298456149455 1.17828473663726 A:G A G 10 0.511915380124546 0.703307184687828 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 25 32 57 12.2021154968864 16.3812921639855 -4.17917666709912 T:C T C 10 0.511915380124546 0.290760416458357 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 18 28 46 8.78552315775817 14.3336306434873 -5.54810748572911 A:G G A 10 0.511915380124546 0.106793315786089 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 1538754 T/C 1 15 12 27 7.32126929813181 6.14298456149455 1.17828473663726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.703307184687828 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1538611_1538797:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1538611_1538797:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1538611_1538797:INTS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 38 39 77 18.5472155552673 19.9646998248573 -1.41748426959004 A:G G A 10 0.511915380124546 0.81986498843063 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2274783 C/T 1 81 73 154 39.5348542099118 37.3698227490919 2.16503146081993 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.747632396235306 ENSG00000122687:ENST00000467199:exon_2273866_2275199:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000242257:exon_2273926_2275199:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000486040:exon_2273930_2275199:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000332565:exon_2274010_2275199:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000440306:exon_2274010_2275199:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000407040:exon_2274682_2275199:FTSJ2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 395 370 765 192.793424850804 189.408690646082 3.38473420472235 A:G A G 10 0.511915380124546 0.828239190209246 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 145 110 255 70.7722698819408 56.3106918137001 14.4615780682408 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.079242052404955 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2314844 G/A 1 141 152 293 68.819931402439 77.811137778931 -8.99120637649196 A:G G A 10 0.511915380124546 0.320501171016203 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2314747_2314864:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2314747_2314864:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2314747_2314864:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2314747_2314864:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2314595_2314864:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2314751_2314864:SNX8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2472429 C/A 1 29 24 53 14.1544539763882 12.2859691229891 1.86848485339906 A:C C A 10 0.511915380124546 0.680829972632713 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2472455 A/T 1 34 31 65 16.5948770757654 15.8693767838609 0.725500291904513 A:T A T 10 0.511915380124546 0.901631371744221 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2611878 T/C 1 12 4 16 5.85701543850545 2.04766152049818 3.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0781379072177097 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000415271:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000470731:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000423395:exon_2611826_2611960:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000422276:exon_2611826_2611960:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2629706 C/T 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 T:C C T 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000470731:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2629541_2629740:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000490913:exon_2629539_2629740:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2644519 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000423196:exon_2644515_2644625:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000486730:exon_2644515_2644625:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2645526 G/A 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000423196:exon_2645510_2645631:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000486730:exon_2645510_2645631:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2649704 T/G 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:G T G 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2649678_2649796:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2649678_2649796:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 2649819 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 5096958 T/C 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000146587:ENST00000407184:exon_5096926_5097052:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5096926_5097052:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396904:exon_5096926_5097052:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5096926_5097052:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000476992:exon_5096618_5097052:RBAK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 32 32 64 15.6187078360145 16.3812921639855 -0.762584327970941 A:G G A 10 0.511915380124546 0.900780253259295 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 36 19 55 17.5710463155163 9.72639222236637 7.84465409314997 A:G G A 10 0.511915380124546 0.042239849468453 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 26 31 57 12.6902001167618 15.8693767838609 -3.17917666709912 C:G G C 10 0.511915380124546 0.428470492298107 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 26 22 48 12.6902001167618 11.26213836274 1.42806175402179 T:G G T 10 0.511915380124546 0.773193056072892 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6043386 G/A 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000413462:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000380416:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000415839:exon_6042941_6043689:PMS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 9 16 25 4.39276157887909 8.19064608199274 -3.79788450311365 T:C T C 10 0.511915380124546 0.161405471327681 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 16 14 30 7.80935391800726 7.16681532174364 0.642538596263622 T:C T C 10 0.511915380124546 0.856761303277079 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6456347 G/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6461424 C/T 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6461358_6462434:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6461358_6461435:DAGLB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 26 19 45 12.6902001167618 9.72639222236637 2.96380789439543 T:C T C 10 0.511915380124546 0.456366162082646 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 35 49 84 17.0829616956409 25.0838536261028 -8.00089193046186 T:C C T 10 0.511915380124546 0.08196129813091 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 C:G G C 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 17854532 G/T 1 7 1 8 3.41659233912818 0.511915380124546 2.90467695900363 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0709338224962328 ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17854457_17854567:SNX13 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 C:G C G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 14 22 36 6.83318467825636 11.26213836274 -4.42895368448365 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181635479525629 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 23357321 C/T 1 11 17 28 5.36893081862999 8.70256146211728 -3.33363064348729 T:C C T 10 0.511915380124546 0.257214713691272 ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23357258_23357452:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000467592:exon_23357312_23357332:IGF2BP3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 74 189 263 36.1182618707836 96.7520068435392 -60.6337449727556 A:T:C T C 10 0.511915380124546 4.77280698608571e-14 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 139 52 191 67.8437621626881 26.6195997664764 41.2241623962117 T:C C T 10 0.511915380124546 1.65158155837333e-09 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 110 59 169 53.6893081862999 30.2030074273482 23.4863007589517 T:G G T 10 0.511915380124546 0.000284816278325375 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 24882032 C/T 1 10 7 17 4.88084619875454 3.58340766087182 1.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.630740767048382 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000431825:exon_24881898_24882032:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000461835:exon_24881995_24882032:OSBPL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 T:C T C 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 30491311 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000106100:ENST00000222823:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000434755:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000439183:exon_30490832_30492656:NOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 30492237 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000106100:ENST00000222823:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000434755:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000439183:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000423334:exon_30492147_30492313:NOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 30496382 G/C 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000106100:ENST00000222823:exon_30496337_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000434755:exon_30496337_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000439183:exon_30496337_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000423334:exon_30496337_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000411552:exon_30496359_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000419799:exon_30496359_30496658:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000413433:exon_30496359_30496658:NOD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 22 18 40 10.73786163726 9.21447684224183 1.52338479501816 C:G G C 10 0.511915380124546 0.639673744429068 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 A:T T A 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 8 5 13 3.90467695900363 2.55957690062273 1.3451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 0.582480189447132 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 14 15 29 6.83318467825636 7.67873070186819 -0.845546023611832 C:G C G 10 0.511915380124546 0.853264484384417 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 32908945 T/C 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C T C 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 33573737 C/T 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 T:C C T 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000122507:ENST00000242067:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000350941:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000396127:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000355070:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000396132:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000354265:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000425508:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000422571:exon_33573566_33573814:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000433714:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000434373:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000495426:exon_33573566_33573982:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000489708:exon_33573566_33573788:BBS9;ENSG00000122507:ENST00000498189:exon_33573299_33573788:BBS9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C C T 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 36455477 T/C 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36455367_36455493:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36455367_36455493:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000452877:exon_36455367_36455494:ANLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 38431430 A/G 0 0 10 10 0 5.11915380124546 -5.11915380124546 G A G 10 0.511915380124546 0.000767275317130376 ENSG00000078053:ENST00000325590:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000356264:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000353242:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000428293:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000421537:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000441628:exon_38431349_38431618:AMPH;ENSG00000078053:ENST00000460887:exon_38431349_38431618:AMPH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 39606107 G/A 1 7 15 22 3.41659233912818 7.67873070186819 -4.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0873275508586045 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 14 6 20 6.83318467825636 3.07149228074728 3.76169239750908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.117374955156906 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 304 248 552 148.377724442138 126.955014270887 21.4227101712506 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0736625958328428 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 95 71 166 46.3680388881681 36.3459919888428 10.0220468993254 T:C C T 10 0.511915380124546 0.121255657060308 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 82 69 151 40.0229388297872 35.3221612285937 4.70077760119356 A:G G A 10 0.511915380124546 0.464471595484873 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 90 76 166 43.9276157887909 38.9055688894655 5.02204689932537 T:C C T 10 0.511915380124546 0.438931252975424 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 355 324 679 173.270040055786 165.860583160353 7.40945689543329 T:C T C 10 0.511915380124546 0.591018847025194 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 415 250 665 202.555117248313 127.978845031136 74.5762722171769 A:G G A 10 0.511915380124546 6.55633105238632e-09 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 498 322 820 243.066140697976 164.836752400104 78.2293882978723 A:C:G A G 10 0.511915380124546 4.62771826905609e-08 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 328 310 638 160.091755319149 158.693767838609 1.39798748053965 A:G G A 10 0.511915380124546 0.936881696086322 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 50 42 92 24.4042309937727 21.5004459652309 2.90378502854177 A:G G A 10 0.511915380124546 0.602398453314728 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 67 91 158 32.7016695316554 46.5842995913337 -13.8826300596783 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0313711549264497 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 79 88 167 38.5586849701609 45.04855345096 -6.48986848079917 A:C A C 10 0.511915380124546 0.353000285714782 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 9 6 15 4.39276157887909 3.07149228074728 1.32126929813181 T:C C T 10 0.511915380124546 0.608797469772918 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 48016353 G/T 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 T:G G T 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000442024:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432627:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000433977:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000446009:exon_48016327_48016434:HUS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 50367292 C/A 0 20 0 20 9.76169239750908 0 9.76169239750908 C C 10 0.511915380124546 2.1161492900864e-06 ENSG00000185811:ENST00000484847:exon_50367234_50367581:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000413698:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000440768:exon_50367234_50367556:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000492782:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000462201:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50366975_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000426121:exon_50367245_50367353:IKZF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 50467941 C/T 1 18 17 35 8.78552315775817 8.70256146211728 0.0829616956408916 T:C:G C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 C:G G C 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 A:C A C 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 16 16 0 8.19064608199274 -8.19064608199274 C A C 10 0.511915380124546 1.03734200432259e-05 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 64168692 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395385:exon_64168564_64168743:ZNF107 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 101 84 185 49.2965466074209 43.0008919304619 6.295654676959 A:G G A 10 0.511915380124546 0.377784818186448 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 65617284 G/A 1 19 21 40 9.27360777763363 10.7502229826155 -1.47661520498184 A:G G A 10 0.511915380124546 0.75222996223045 ENSG00000241258:ENST00000422170:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000360415:exon_65617195_65619555:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000395326:exon_65617195_65619548:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000431089:exon_65617195_65617857:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000398684:exon_65617195_65617498:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000338592:exon_65617195_65618276:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000415001:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000492264:exon_65617195_65617639:CRCP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 28 21 49 13.6663693565127 10.7502229826155 2.91614637389725 C:G G C 10 0.511915380124546 0.47547089621082 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 66774670 C/T 1 31 27 58 15.1306232161391 13.8217152633627 1.30890795277633 T:C C T 10 0.511915380124546 0.793352645663686 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 70254788 G/A 1 68 61 129 33.1897541515309 31.2268381875973 1.96291596393358 A:G G A 10 0.511915380124546 0.79174883982743 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70254734_70257489:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70254734_70258054:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000449547:exon_70254734_70254970:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000418686:exon_70254734_70254912:AUTS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.791358650545556 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 72301284 T/C 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.59988390939297 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 39 38 77 19.0353001751427 19.4527844447327 -0.417484269590037 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 17 23 40 8.29743853788272 11.7740537428646 -3.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.342781564446145 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 19 13 32 9.27360777763363 6.6548999416191 2.61870783601453 C:G G C 10 0.511915380124546 0.381435496341429 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75051311 T/C 1 39 31 70 19.0353001751427 15.8693767838609 3.16592339128178 T:C T C 10 0.511915380124546 0.474915239667683 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75051324 G/C 1 32 35 67 15.6187078360145 17.9170383043591 -2.29833046834458 C:G G C 10 0.511915380124546 0.62567948251645 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 48 63 111 23.4280617540218 32.2506689478464 -8.8226071938246 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.106294352504345 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 61 55 116 29.7731618124027 28.15534590685 1.61781590555267 T:C C T 10 0.511915380124546 0.781246099838207 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 108 98 206 52.713138946549 50.1677072522055 2.54543169434353 A:G G A 10 0.511915380124546 0.728133812647254 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 27 23 50 13.1782847366373 11.7740537428646 1.4042309937727 T:C T C 10 0.511915380124546 0.777676813700698 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 42 44 86 20.4995540347691 22.52427672548 -2.02472269071095 T:C C T 10 0.511915380124546 0.667946801860287 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 T:C T C 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 54 52 106 26.3565694732745 26.6195997664764 -0.263030293201872 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 84 69 153 40.9991080695381 35.3221612285937 5.67694684094447 T:C C T 10 0.511915380124546 0.374450369278037 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 A:G G A 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 70 80 150 34.1659233912818 40.9532304099637 -6.7873070186819 A:G A G 10 0.511915380124546 0.288588510670256 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 77265144 G/A 1 30 52 82 14.6425385962636 26.6195997664764 -11.9770611702128 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0106173209121639 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77265099_77265166:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77265099_77265166:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77265099_77265166:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77265099_77265166:PTPN12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 46 36 82 22.4518925142709 18.4289536844837 4.02293882978723 A:G G A 10 0.511915380124546 0.379704266011605 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 87082292 G/A 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000473795:exon_87081688_87082451:ABCB4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C T C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 14 11 25 6.83318467825636 5.63106918137001 1.20211549688635 T:C C T 10 0.511915380124546 0.692143728741491 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 T:C C T 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 18 8 26 8.78552315775817 4.09532304099637 4.6902001167618 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0776612490352213 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 12 16 28 5.85701543850545 8.19064608199274 -2.33363064348729 T:C T C 10 0.511915380124546 0.450988108517662 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 15 20 35 7.32126929813181 10.2383076024909 -2.91703830435911 C:G C G 10 0.511915380124546 0.398399015735378 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 50 60 110 24.4042309937727 30.7149228074728 -6.31069181370005 A:C C A 10 0.511915380124546 0.252603318215134 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92123671 A/G 1 9 10 19 4.39276157887909 5.11915380124546 -0.726392222366374 A:G A G 10 0.511915380124546 0.820523976701015 ENSG00000127980:ENST00000438045:exon_92123607_92123710:PEX1;ENSG00000127980:ENST00000248633:exon_92123607_92123710:PEX1;ENSG00000127980:ENST00000496420:exon_92122267_92123710:PEX1;ENSG00000127980:ENST00000484913:exon_92123607_92123710:PEX1;ENSG00000127980:ENST00000428214:exon_92123607_92123710:PEX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92733766 C/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:C C A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92734983 A/G 1 3 7 10 1.46425385962636 3.58340766087182 -2.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 0.216601914653512 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 32 32 64 15.6187078360145 16.3812921639855 -0.762584327970941 A:G G A 10 0.511915380124546 0.900780253259295 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 59 47 106 28.7969925726518 24.0600228658537 4.73696970679813 T:G T G 10 0.511915380124546 0.382652090286937 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 13 10 23 6.3451000583809 5.11915380124546 1.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.679647548089005 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 93518486 C/T 1 12 12 24 5.85701543850545 6.14298456149455 -0.285969122989103 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000105825:ENST00000222543:exon_93518347_93518535:TFPI2;ENSG00000105825:ENST00000451238:exon_93518347_93518535:TFPI2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 30 19 49 14.6425385962636 9.72639222236637 4.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.198074404336929 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 93555564 C/G 1 25 31 56 12.2021154968864 15.8693767838609 -3.66726128697457 C:G C G 10 0.511915380124546 0.351342325551452 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93555403_93555831:GNG11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 2 7 9 0.976169239750908 3.58340766087182 -2.60723842112091 C:G G C 10 0.511915380124546 0.101795622387764 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 95041016 G/C 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 C:G G C 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95040965_95041055:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000469926:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000491069:exon_95040963_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000490778:exon_95040994_95041091:PON2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 97852399 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000474915:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000479975:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000476659:exon_97852343_97852482:TECPR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 17 6 23 8.29743853788272 3.07149228074728 5.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0358534318342095 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99032458 C/T 1 15 18 33 7.32126929813181 9.21447684224183 -1.89320754411002 T:C C T 10 0.511915380124546 0.602309440775946 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 31 24 55 15.1306232161391 12.2859691229891 2.84465409314997 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.500856148048463 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G A G 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99170144 T/C 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000197343:ENST00000252713:exon_99169868_99172029:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000425063:exon_99169868_99174062:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000493277:exon_99169868_99171344:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000422164:exon_99169868_99170173:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000424881:exon_99169868_99174072:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000394163:exon_99169868_99174076:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000494357:exon_99169868_99173159:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000419215:exon_99169868_99174076:ZNF655 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99217424 G/A 1 6 8 14 2.92850771925272 4.09532304099637 -1.16681532174364 A:G G A 10 0.511915380124546 0.59988390939297 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99217184_99219197:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99217184_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99217184_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000431485:exon_99217184_99217439:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99217230_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000466948:exon_99217288_99217616:ZNF498 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99227172 A/G 1 7 16 23 3.41659233912818 8.19064608199274 -4.77405374286456 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0592824185806538 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99226814_99230022:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99226814_99228527:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000485586:exon_99226814_99229994:ZNF498 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 99655002 C/T 1 11 10 21 5.36893081862999 5.11915380124546 0.249777017384535 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654948_99655028:ZSCAN21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100075112 G/A 1 169 122 291 82.4863007589517 62.4536763751946 20.0326243837571 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0190188680365814 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100074900_100075125:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100074900_100075930:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100074900_100075930:TSC22D4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100160488 T/C 1 20 25 45 9.76169239750908 12.7978845031136 -3.03619210560457 T:C T C 10 0.511915380124546 0.375520230803155 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160486_100160497:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160486_100160569:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160486_100160569:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160486_100160543:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160486_100160569:AGFG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100173282 G/A 1 8 15 23 3.90467695900363 7.67873070186819 -3.77405374286456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.144409879379289 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100170920_100173405:LRCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 111 83 194 54.1773928061754 42.4889765503373 11.6884162558381 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0986706072661899 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100281768 T/C 1 18 16 34 8.78552315775817 8.19064608199274 0.594877075765437 T:C T C 10 0.511915380124546 0.86547169107651 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100281643_100281780:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000472105:exon_100281643_100281960:GIGYF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 T:C C T 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100460331 G/A 1 20 22 42 9.76169239750908 11.26213836274 -1.50044596523093 A:G G A 10 0.511915380124546 0.647570325012878 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000482184:exon_100460303_100460449:SLC12A9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 71 57 128 34.6540080111572 29.1791766670991 5.47483134405812 A:G G A 10 0.511915380124546 0.376702615952117 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100731574 G/A 1 15 19 34 7.32126929813181 9.72639222236637 -2.40512292423456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.493377638849841 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 37 35 72 18.0591309353918 17.9170383043591 0.142092631032689 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 15 21 36 7.32126929813181 10.7502229826155 -3.42895368448365 T:C C T 10 0.511915380124546 0.317316396592093 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 11 13 24 5.36893081862999 6.6548999416191 -1.2859691229891 T:G T G 10 0.511915380124546 0.684928800484095 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 19 29 48 9.27360777763363 14.8455460236118 -5.57193824597821 A:G A G 10 0.511915380124546 0.114036075690169 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 32 24 56 15.6187078360145 12.2859691229891 3.33273871302543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.423323007431542 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 62 32 94 30.2612464322781 16.3812921639855 13.8799542682927 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0050753573303937 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 91 39 130 44.4157004086663 19.9646998248573 24.451000583809 T:C C T 10 0.511915380124546 1.46965328558646e-05 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 102114090 T/C 1 37 90 127 18.0591309353918 46.0723842112091 -28.0132532758173 T:C T C 10 0.511915380124546 7.04748883411046e-07 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 107531665 G/A 1 13 18 31 6.3451000583809 9.21447684224183 -2.86937678386093 A:G G A 10 0.511915380124546 0.369791757385296 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107531415_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000485066:exon_107531607_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107531609_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107531609_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107531618_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107531619_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000451081:exon_107531631_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000453354:exon_107531631_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000450038:exon_107531631_107531734:DLD;ENSG00000091140:ENST00000460577:exon_107531662_107531734:DLD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 107834613 G/C 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000091129:ENST00000379028:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000379032:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000351718:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000379024:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000425651:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000379022:exon_107834468_107834615:NRCAM;ENSG00000091129:ENST00000445979:exon_107834468_107834615:NRCAM HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 26 17 43 12.6902001167618 8.70256146211728 3.98763865464452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.285516377218113 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 78 90 168 38.0706003502854 46.0723842112091 -8.00178386092372 C:G G C 10 0.511915380124546 0.218121066197715 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 25 24 49 12.2021154968864 12.2859691229891 -0.0838536261027514 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 58 62 120 28.3089079527763 31.7387535677219 -3.42984561494552 T:C C T 10 0.511915380124546 0.583982991680913 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 9 13 22 4.39276157887909 6.6548999416191 -2.26213836274001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396442302139566 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 16 12 28 7.80935391800726 6.14298456149455 1.66636935651271 A:G A G 10 0.511915380124546 0.574667284257565 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 278 273 551 135.687524325376 139.752898774001 -4.06537444862482 T:C T C 10 0.511915380124546 0.733373605667275 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 27 13 40 13.1782847366373 6.6548999416191 6.52338479501816 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0406644072257365 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 23 12 35 11.2259462571354 6.14298456149455 5.08296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0927032206331829 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 7 17 24 3.41659233912818 8.70256146211728 -5.2859691229891 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0397042364687207 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 22 14 36 10.73786163726 7.16681532174364 3.57104631551635 A:G G A 10 0.511915380124546 0.247804062585390 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 14 3 17 6.83318467825636 1.53574614037364 5.29743853788272 A:T A T 10 0.511915380124546 0.0131393637795494 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 14 2 16 6.83318467825636 1.02383076024909 5.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00434163882715972 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 16 4 20 7.80935391800726 2.04766152049818 5.76169239750908 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0122812042506155 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 57 97 154 27.8208233329009 49.655791872081 -21.8349685391801 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000491421654121823 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 65 86 151 31.7255002919045 44.024722690711 -12.2992223988064 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0505097431803898 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 30 41 71 14.6425385962636 20.9885305851064 -6.34599198884276 A:G G A 10 0.511915380124546 0.154056242928942 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 135048804 C/T 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000080802:ENST00000451834:exon_135048606_135048818:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000262563:exon_135048606_135048818:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000473470:exon_135048606_135048818:CNOT4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 137567238 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137567158_137567374:CREB3L2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 12 6 18 5.85701543850545 3.07149228074728 2.78552315775817 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.240294789159371 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 9 3 12 4.39276157887909 1.53574614037364 2.85701543850545 A:G G A 10 0.511915380124546 0.147368325849718 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 A:C:G G C 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 140051091 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000157800:ENST00000477571:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000326232:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000447932:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000340308:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000429996:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000492027:exon_140051073_140051157:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000460560:exon_140051073_140051769:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000485734:exon_140051073_140051251:SLC37A3;ENSG00000157800:ENST00000487319:exon_140051073_140051205:SLC37A3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 63 277 340 30.7493310521536 141.800560294499 -111.051229242346 T:C T C 10 0.511915380124546 1.83274353736690e-35 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 148712092 G/A 1 85 82 167 41.4871926894136 41.9770611702128 -0.489868480799174 A:G G A 10 0.511915380124546 0.938514709422195 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150163837 A/G 1 8 3 11 3.90467695900363 1.53574614037364 2.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.228025798936671 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 15 7 22 7.32126929813181 3.58340766087182 3.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.136223735342928 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 16 11 27 7.80935391800726 5.63106918137001 2.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445588969149603 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 13 11 24 6.3451000583809 5.63106918137001 0.714030877010897 A:G A G 10 0.511915380124546 0.839914738945576 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 58 84 142 28.3089079527763 43.0008919304619 -14.6919839776855 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0147729405401964 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 45 76 121 21.9638078943954 38.9055688894655 -16.9417609950701 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.00254861046591524 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150439554 G/A 1 42 69 111 20.4995540347691 35.3221612285937 -14.8226071938246 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00568666949177007 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 53 81 134 25.8684848533991 41.4651457900882 -15.5966609366892 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00731718223380265 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150731426 G/A 1 14 17 31 6.83318467825636 8.70256146211728 -1.86937678386092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.590999279432223 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466956:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150731360_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000488551:exon_150731360_150731515:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150731360_150731515:ABCB8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150765065 T/C 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:C T C 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150764961_150765141:SLC4A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 28 35 63 13.6663693565127 17.9170383043591 -4.2506689478464 A:G G A 10 0.511915380124546 0.314255804021216 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 85 76 161 41.4871926894136 38.9055688894655 2.5816237999481 A:T A T 10 0.511915380124546 0.69425030861851 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 44 39 83 21.47572327452 19.9646998248573 1.51102344966269 A:G A G 10 0.511915380124546 0.826355804675321 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 38 36 74 18.5472155552673 18.4289536844837 0.118261870783599 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 156469096 C/T 1 5 6 11 2.44042309937727 3.07149228074728 -0.631069181370006 T:C C T 10 0.511915380124546 0.769693255663501 ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 156469123 G/A 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 A:G G A 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 156469133 C/G 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 C:G C G 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 27 21 48 13.1782847366373 10.7502229826155 2.42806175402179 T:C T C 10 0.511915380124546 0.564172367837418 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 157013410 A/G 1 16 17 33 7.80935391800726 8.70256146211728 -0.893207544110016 A:G A G 10 0.511915380124546 0.862187514781948 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157013383_157013470:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157013362_157016045:UBE3C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 35 32 67 17.0829616956409 16.3812921639855 0.701669531655419 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.903133011737456 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 24 17 41 11.7140308770109 8.70256146211728 3.01146941489362 C:G C G 10 0.511915380124546 0.354504248782874 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 413135 C/T 1 50 27 77 24.4042309937727 13.8217152633627 10.58251573041 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0165794460877426 ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000519376:exon_413007_413150:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000517464:exon_413007_413150:FBXO25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 98 93 191 47.8322927477945 47.6081303515828 0.224162396211725 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 12 5 17 5.85701543850545 2.55957690062273 3.29743853788272 C:G G C 10 0.511915380124546 0.145392626068465 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 G G 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 0 11 0 11 5.36893081862999 0 5.36893081862999 C C 10 0.511915380124546 0.00100716923571172 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 0 10 0 10 4.88084619875454 0 4.88084619875454 G G 10 0.511915380124546 0.00200317089435722 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 15 13 28 7.32126929813181 6.6548999416191 0.666369356512713 T:C C T 10 0.511915380124546 0.85173783903044 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 T:C T C 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 11162496 A/C 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 A:C A C 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11162350_11162523:MTMR9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C T C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17132462 A/G 1 7 19 26 3.41659233912818 9.72639222236637 -6.30979988323819 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0171736804395362 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17132242_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17132242_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17132285_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17132242_17132467:VPS37A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 21 15 36 10.2497770173845 7.67873070186819 2.57104631551635 T:C C T 10 0.511915380124546 0.409845893616438 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 38 22 60 18.5472155552673 11.26213836274 7.28507719252724 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0701603555654897 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 38 23 61 18.5472155552673 11.7740537428646 6.7731618124027 T:C C T 10 0.511915380124546 0.09568413636637 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 22 21 43 10.73786163726 10.7502229826155 -0.0123613453554761 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 35 48 83 17.0829616956409 24.5719382459782 -7.48897655033732 A:G A G 10 0.511915380124546 0.123745260614247 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21955116 C/T 1 10 9 19 4.88084619875454 4.60723842112091 0.273607777633626 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955077_21955350:FAM160B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21955784 A/C 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000474579:exon_21955446_21955821:FAM160B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21956108 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21955985_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21956057_21956130:FAM160B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21959638 A/G 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 A:G A G 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21959639 C/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:C C T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 21965270 C/T 1 20 14 34 9.76169239750908 7.16681532174364 2.59487707576544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.396114031948566 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 T:C T C 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 23 28 51 11.2259462571354 14.3336306434873 -3.10768438635184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.403614712000107 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 46 39 85 22.4518925142709 19.9646998248573 2.48719268941359 A:G G A 10 0.511915380124546 0.664559561631052 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 33 50 83 16.10679245589 25.5957690062273 -9.48897655033731 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0474616617650519 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 28 23 51 13.6663693565127 11.7740537428646 1.89231561364816 A:G G A 10 0.511915380124546 0.674931519064623 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 19 17 36 9.27360777763363 8.70256146211728 0.571046315516346 A:G A G 10 0.511915380124546 0.86928286566066 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 26221331 T/C 1 32 35 67 15.6187078360145 17.9170383043591 -2.29833046834458 T:C T C 10 0.511915380124546 0.62567948251645 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26221237_26221406:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26220200_26221406:PPP2R2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 40 32 72 19.5233847950182 16.3812921639855 3.14209263103269 A:G A G 10 0.511915380124546 0.481279264107318 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 198 116 314 96.6407547353399 59.3821840944473 37.2585706408926 A:G A G 10 0.511915380124546 2.72929821690634e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 214 109 323 104.450108653347 55.7987764335755 48.6513322197716 T:C T C 10 0.511915380124546 5.41048901016442e-08 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 218 110 328 106.402447132849 56.3106918137001 50.0917553191489 A:G G A 10 0.511915380124546 2.65283556864039e-08 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 249 151 400 121.533070348988 77.2992223988064 44.2338479501816 A:G A G 10 0.511915380124546 9.98487713625268e-06 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 113 139 252 55.1535620459263 71.1562378373119 -16.0026757913856 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0505594829970509 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 333 370 703 162.532178418526 189.408690646082 -26.8765122275558 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0454872356864267 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 465 353 818 226.959348242086 180.706129183965 46.2532190581214 C:G C G 10 0.511915380124546 0.00128045033832902 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27308538 G/A 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 A:G G A 10 0.511915380124546 0.333155981387753 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 640 542 1182 312.374156720291 277.458136027504 34.9160206927867 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0446490513301543 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27308961 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 27312040 C/T 1 7 7 14 3.41659233912818 3.58340766087182 -0.166815321743643 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 28196783 C/G 1 56 48 104 27.3327387130254 24.5719382459782 2.76080046704722 C:G C G 10 0.511915380124546 0.624459734656528 ENSG00000168081:ENST00000518479:exon_28196557_28196893:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000301908:exon_28196557_28197008:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000519592:exon_28196557_28197725:PNOC;ENSG00000168081:ENST00000522209:exon_28196557_28197008:PNOC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 30973957 G/T 1 3 6 9 1.46425385962636 3.07149228074728 -1.60723842112091 T:G G T 10 0.511915380124546 0.333155981387753 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30973870_30974044:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30973870_30974044:WRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 16 13 29 7.80935391800726 6.6548999416191 1.15445397638817 T:G G T 10 0.511915380124546 0.713359822125517 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C C T 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 7 6 13 3.41659233912818 3.07149228074728 0.345100058380903 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 C:G G C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 14 1 15 6.83318467825636 0.511915380124546 6.32126929813181 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00102045202716629 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 13 6 19 6.3451000583809 3.07149228074728 3.27360777763363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.169359101858056 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 16 19 35 7.80935391800726 9.72639222236637 -1.91703830435911 T:C T C 10 0.511915380124546 0.612754653958834 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 22 24 46 10.73786163726 12.2859691229891 -1.54810748572911 A:G A G 10 0.511915380124546 0.661302444171157 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 40 30 70 19.5233847950182 15.3574614037364 4.16592339128178 A:G A G 10 0.511915380124546 0.340513800637055 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 37730593 A/G 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 4 13 17 1.95233847950182 6.6548999416191 -4.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0277210001524075 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 63 35 98 30.7493310521536 17.9170383043591 12.8322927477945 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0111911869515909 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 26 25 51 12.6902001167618 12.7978845031136 -0.107684386351844 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 63 53 116 30.7493310521536 27.1315151466009 3.61781590555267 T:C T C 10 0.511915380124546 0.516902944366031 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 C:G C G 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 42218849 C/G 1 43 33 76 20.9876386546445 16.89320754411 4.09443111053451 C:G C G 10 0.511915380124546 0.360910599949463 ENSG00000070501:ENST00000265421:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000520008:exon_42218813_42218879:POLB;ENSG00000070501:ENST00000518925:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000522610:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000519771:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000524208:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000521290:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000519524:exon_42218813_42219230:POLB;ENSG00000070501:ENST00000518579:exon_42218813_42218883:POLB;ENSG00000070501:ENST00000517393:exon_42218816_42218883:POLB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 59510073 C/T 1 26 32 58 12.6902001167618 16.3812921639855 -3.69109204722367 T:C C T 10 0.511915380124546 0.359491332789149 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59509962_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59510032_59510109:NSMAF HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 61655556 G/T 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:G G T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527825:exon_61655379_61655656:CHD7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 41 33 74 20.0114694148936 16.89320754411 3.1182618707836 T:G G T 10 0.511915380124546 0.487433192649826 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 70744167 G/A 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 A:G G A 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 12 10 22 5.85701543850545 5.11915380124546 0.737861637259988 A:G G A 10 0.511915380124546 0.832859590307307 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 72 65 137 35.1420926310327 33.2744997080955 1.8675929229372 T:C T C 10 0.511915380124546 0.797830560876834 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 106 105 211 51.7369697067981 53.7511149130773 -2.0141452062792 A:G A G 10 0.511915380124546 0.783497792286286 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 67 42 109 32.7016695316554 21.5004459652309 11.2012235664245 C:G C G 10 0.511915380124546 0.0348522111944096 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 A:G A G 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 94748392 T/C 1 10 17 27 4.88084619875454 8.70256146211728 -3.82171526336274 T:C T C 10 0.511915380124546 0.177721968120350 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94746777_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94746777_94748638:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000519109:exon_94748191_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000518597:exon_94748209_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000520560:exon_94748272_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000521947:exon_94748391_94748666:RBM12B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 6 6 12 2.92850771925272 3.07149228074728 -0.142984561494552 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 98788033 G/C 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 C:G G C 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98787935_98788336:LAPTM4B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 16 14 30 7.80935391800726 7.16681532174364 0.642538596263622 T:C T C 10 0.511915380124546 0.856761303277079 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 99169923 C/T 1 23 18 41 11.2259462571354 9.21447684224183 2.01146941489361 T:C C T 10 0.511915380124546 0.537488200943764 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 99169956 T/C 1 21 22 43 10.2497770173845 11.26213836274 -1.01236134535548 T:C T C 10 0.511915380124546 0.76312311229569 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 99208190 A/C 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:C A C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000104361:ENST00000430223:exon_99208170_99208233:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000341166:exon_99208170_99208233:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000520545:exon_99208170_99208233:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000521820:exon_99207919_99208233:NIPAL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 18 14 32 8.78552315775817 7.16681532174364 1.61870783601453 T:C T C 10 0.511915380124546 0.599968003294015 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 29 14 43 14.1544539763882 7.16681532174364 6.98763865464452 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0460846664758142 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 103663814 G/A 1 24 24 48 11.7140308770109 12.2859691229891 -0.571938245978206 A:G G A 10 0.511915380124546 0.886208204797435 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 104337367 A/C 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:C A C 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523933:exon_104337263_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104337282_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G G A 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 17 12 29 8.29743853788272 6.14298456149455 2.15445397638817 T:G T G 10 0.511915380124546 0.461979597239853 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 20 21 41 9.76169239750908 10.7502229826155 -0.988530585106385 A:G G A 10 0.511915380124546 0.757990196027559 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 17 11 28 8.29743853788272 5.63106918137001 2.66636935651271 T:C C T 10 0.511915380124546 0.348780232818632 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 124525483 C/T 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 T:C C T 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000156804:ENST00000517956:exon_124525438_124525622:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000287396:exon_124525438_124525622:FBXO32 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 8 11 19 3.90467695900363 5.63106918137001 -1.72639222236637 T:C T C 10 0.511915380124546 0.495389260776191 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 26 21 47 12.6902001167618 10.7502229826155 1.93997713414634 T:C C T 10 0.511915380124546 0.662128597629188 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 126033096 T/C 1 88 72 160 42.95144654904 36.8579073689673 6.09353918007265 T:C T C 10 0.511915380124546 0.343707774454471 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 98 73 171 47.8322927477945 37.3698227490919 10.4624699987026 T:C C T 10 0.511915380124546 0.125807601314169 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 15 22 37 7.32126929813181 11.26213836274 -3.9408690646082 T:C T C 10 0.511915380124546 0.249436095995287 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 131140180 G/A 1 2 9 11 0.976169239750908 4.60723842112091 -3.63106918137001 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0346208523981388 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131140173_131140336:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131140173_131140336:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131140173_131140336:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131140173_131140336:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131140173_131140336:ASAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 205 185 390 100.057347074468 94.704345323041 5.35300175142709 T:G G T 10 0.511915380124546 0.612598185860413 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 13 8 21 6.3451000583809 4.09532304099637 2.24977701738453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.386170075075001 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 7 12 19 3.41659233912818 6.14298456149455 -2.72639222236637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.254209881707502 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 18 9 27 8.78552315775817 4.60723842112091 4.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.124932157067609 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 13 5 18 6.3451000583809 2.55957690062273 3.78552315775817 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0979415445230112 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 16 10 26 7.80935391800726 5.11915380124546 2.6902001167618 T:C C T 10 0.511915380124546 0.330527445390033 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 19 18 37 9.27360777763363 9.21447684224183 0.0591309353917993 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 76 55 131 37.0944311105345 28.15534590685 8.93908520368448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.137076157995801 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 177 149 326 86.3909777179554 76.2753916385574 10.115586079398 C:G C G 10 0.511915380124546 0.268278747158715 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 142225990 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000022567:ENST00000519067:exon_142225858_142226069:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000517878:exon_142225858_142226069:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000024061:exon_142225858_142226069:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000433583:exon_142225858_142226069:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000425766:exon_142225858_142226069:SLC45A4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 143413136 C/T 1 3 8 11 1.46425385962636 4.09532304099637 -2.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.137545352473278 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143413115_143413192:TSNARE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 143808951 C/T 1 23 8 31 11.2259462571354 4.09532304099637 7.13062321613907 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0113490227293442 ENSG00000130193:ENST00000336138:exon_143808621_143809277:C8orf55;ENSG00000130193:ENST00000443814:exon_143808765_143809118:C8orf55 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144102747 C/T 1 682 655 1337 332.87371075506 335.304573981578 -2.43086322651794 T:C:G C T 10 0.511915380124546 0.91287095230426 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520531:exon_144102731_144103057:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000523847:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102731_144102850:LY6E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 10 32 42 4.88084619875454 16.3812921639855 -11.5004459652309 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000511777639567243 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 72 45 117 35.1420926310327 23.0361921056046 12.1059005254281 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0264196681316468 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 34 26 60 16.5948770757654 13.3097998832382 3.28507719252724 T:C T C 10 0.511915380124546 0.439480699527162 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144623574 T/C 1 13 12 25 6.3451000583809 6.14298456149455 0.202115496886351 T:C T C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144623546_144623623:ZC3H3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 20 4 24 9.76169239750908 2.04766152049818 7.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00165259369401979 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 0 48 0 48 23.4280617540218 0 23.4280617540218 G G 10 0.511915380124546 1.21192973813105e-14 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 1 40 41 0.488084619875454 20.4766152049818 -19.9885305851064 A:G G A 10 0.511915380124546 8.637722109859e-12 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 1085 1217 2302 529.571812564868 623.001017611572 -93.4292050467049 A:T:G G A 10 0.511915380124546 0.000104579852219764 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144671931 C/T 1 14 5 19 6.83318467825636 2.55957690062273 4.27360777763363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0649795949837597 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 43 47 90 20.9876386546445 24.0600228658537 -3.07238421120914 A:G A G 10 0.511915380124546 0.528794528822805 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 22 27 49 10.73786163726 13.8217152633627 -3.08385362610275 A:G G A 10 0.511915380124546 0.394641992151905 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144991205 C/T 1 75 62 137 36.606346490659 31.7387535677219 4.8675929229372 T:C C T 10 0.511915380124546 0.442059801649732 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144994566 G/A 1 29 37 66 14.1544539763882 18.9408690646082 -4.78641508822003 A:G G A 10 0.511915380124546 0.268291062818713 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144996831 G/A 1 29 16 45 14.1544539763882 8.19064608199274 5.96380789439543 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0999028766467087 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 13 24 37 6.3451000583809 12.2859691229891 -5.9408690646082 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0690652769228899 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 6 9 15 2.92850771925272 4.60723842112091 -1.67873070186819 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445432694937292 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145011204 A/G 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000526416:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527816:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528131:exon_145011147_145011239:PLEC HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 67 57 124 32.7016695316554 29.1791766670991 3.5224928645563 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.531224386276623 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 19 5 24 9.27360777763363 2.55957690062273 6.7140308770109 A:G A G 10 0.511915380124546 0.00696783810745496 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 53 51 104 25.8684848533991 26.1076843863518 -0.239199532952782 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145059701 C/T 1 44 45 89 21.47572327452 23.0361921056046 -1.56046883108459 T:C C T 10 0.511915380124546 0.751607096166813 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059580_145059816:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 38 35 73 18.5472155552673 17.9170383043591 0.630177250908144 A:G G A 10 0.511915380124546 0.9072735323158 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145065456 C/T 1 174 142 316 84.926723858329 72.6919839776855 12.2347398806435 T:C C T 10 0.511915380124546 0.176964931758051 ENSG00000178719:ENST00000313269:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000529301:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000395068:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000530898:exon_145065368_145065694:GRINA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 145736024 G/A 1 16 12 28 7.80935391800726 6.14298456149455 1.66636935651271 A:G G A 10 0.511915380124546 0.574667284257565 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 14 13 27 6.83318467825636 6.6548999416191 0.178284736637259 A:C C A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 4 6 10 1.95233847950182 3.07149228074728 -1.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 0.540123233096962 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 26 25 51 12.6902001167618 12.7978845031136 -0.107684386351844 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 66 55 121 32.21358491178 28.15534590685 4.05823900492994 A:G G A 10 0.511915380124546 0.46857517593333 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 4 7 11 1.95233847950182 3.58340766087182 -1.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.377571010084769 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 2116037 G/A 1 176 207 383 85.9028930980799 105.966483685781 -20.0635905877011 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0409711004423815 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2115822_2116049:SMARCA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 9 7 16 4.39276157887909 3.58340766087182 0.809353918007265 T:C T C 10 0.511915380124546 0.804509817849144 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 4685008 C/T 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000106993:ENST00000381858:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381854:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381845:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000479095:exon_4684877_4685475:CDC37L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 31 39 70 15.1306232161391 19.9646998248573 -4.83407660871822 A:G A G 10 0.511915380124546 0.282185316891008 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 35 34 69 17.0829616956409 17.4051229242346 -0.322161228593671 T:G T G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 5920649 G/A 1 10 14 24 4.88084619875454 7.16681532174364 -2.2859691229891 A:G G A 10 0.511915380124546 0.416316526978764 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 35 24 59 17.0829616956409 12.2859691229891 4.79699257265179 A:G A G 10 0.511915380124546 0.241646813187304 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 7046901 C/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 15510148 G/C 1 218 179 397 106.402447132849 91.6328530422937 14.7695940905552 C:G G C 10 0.511915380124546 0.145441645331751 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15510115_15510327:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15510115_15510324:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15510115_15510324:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15510115_15510324:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15510115_15510287:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000487363:exon_15510115_15510287:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000463712:exon_15510115_15510327:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000488797:exon_15510115_15510324:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000484265:exon_15510115_15510327:PSIP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 17135115 C/T 1 3 8 11 1.46425385962636 4.09532304099637 -2.63106918137001 T:C C T 10 0.511915380124546 0.137545352473278 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 19058818 G/A 1 16 11 27 7.80935391800726 5.63106918137001 2.17828473663726 A:G G A 10 0.511915380124546 0.445588969149603 ENSG00000147874:ENST00000380502:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000428731:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000380496:exon_19056616_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000415524:exon_19058762_19058999:HAUS6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 19345978 G/A 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 8 10 18 3.90467695900363 5.11915380124546 -1.21447684224183 A:G G A 10 0.511915380124546 0.641294458481462 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.754604246278714 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 32542375 G/A 1 23 24 47 11.2259462571354 12.2859691229891 -1.06002286585366 A:G G A 10 0.511915380124546 0.772513197420904 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 33062128 G/A 1 15 15 30 7.32126929813181 7.67873070186819 -0.357461403736378 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33062047_33062175:SMU1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 11 8 19 5.36893081862999 4.09532304099637 1.27360777763363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.649402947699443 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 33986805 T/C 1 19 31 50 9.27360777763363 15.8693767838609 -6.5957690062273 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.0666323489543619 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_33986758_33986835:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33986758_33986835:UBAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 24 28 52 11.7140308770109 14.3336306434873 -2.61959976647639 T:C C T 10 0.511915380124546 0.490600609527329 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 22 13 35 10.73786163726 6.6548999416191 4.08296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.179752545610438 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 35650859 G/A 1 60 23 83 29.2850771925272 11.7740537428646 17.5110234496627 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000104279976539819 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650751_35650937:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650751_35650907:SIT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 2 12 14 0.976169239750908 6.14298456149455 -5.16681532174364 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00625964766936787 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 35846469 C/T 0 72 0 72 35.1420926310327 0 35.1420926310327 C C 10 0.511915380124546 1.19146224456033e-21 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 36607660 A/G 1 12 7 19 5.85701543850545 3.58340766087182 2.27360777763363 A:G A G 10 0.511915380124546 0.361898824533055 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36607572_36607670:MELK;ENSG00000165304:ENST00000495529:exon_36607572_36607670:MELK;ENSG00000165304:ENST00000487398:exon_36607572_36607670:MELK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 46 34 80 22.4518925142709 17.4051229242346 5.04676959003632 T:G G T 10 0.511915380124546 0.265822679553239 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 26 44 70 12.6902001167618 22.52427672548 -9.83407660871822 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0225441420481946 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 51 43 94 24.8923156136482 22.0123613453555 2.87995426829268 T:C T C 10 0.511915380124546 0.606323631852225 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 72 57 129 35.1420926310327 29.1791766670991 5.96291596393357 A:G G A 10 0.511915380124546 0.332696399797965 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 9 8 17 4.39276157887909 4.09532304099637 0.297438537882718 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 30 14 44 14.6425385962636 7.16681532174364 7.47572327451998 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0335511821831847 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 19 7 26 9.27360777763363 3.58340766087182 5.69020011676181 T:C C T 10 0.511915380124546 0.030125330646746 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37948724 T/C 1 3 10 13 1.46425385962636 5.11915380124546 -3.6548999416191 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0523756919310054 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37948632_37948751:SHB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 37974743 T/C 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 T:C T C 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37974619_37974834:SHB HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 71437571 A/G 1 6 10 16 2.92850771925272 5.11915380124546 -2.19064608199274 A:G A G 10 0.511915380124546 0.322770449308216 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000377284:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000437200:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000440050:exon_71437531_71437599:PIP5K1B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 79 39 118 38.5586849701609 19.9646998248573 18.5939851453036 T:C C T 10 0.511915380124546 0.000614145782748083 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 70 40 110 34.1659233912818 20.4766152049818 13.6893081862999 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00982009542204145 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 15 9 24 7.32126929813181 4.60723842112091 2.7140308770109 T:C T C 10 0.511915380124546 0.310769068154569 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 11 29 40 5.36893081862999 14.8455460236118 -9.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00382749776568963 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 79003516 C/G 1 1 15 16 0.488084619875454 7.67873070186819 -7.19064608199274 C:G C G 10 0.511915380124546 0.000206693713020471 ENSG00000135002:ENST00000376736:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000490113:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000483155:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000476087:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000472900:exon_79003470_79003572:AL391868.1;ENSG00000135002:ENST00000479197:exon_79002500_79003572:AL391868.1;ENSG00000250683:ENST00000257452:exon_79003470_79003572:RFK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 13 18 31 6.3451000583809 9.21447684224183 -2.86937678386093 A:G A G 10 0.511915380124546 0.369791757385296 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 32 40 72 15.6187078360145 20.4766152049818 -4.85790736896731 T:C C T 10 0.511915380124546 0.288887603848309 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 17 5 22 8.29743853788272 2.55957690062273 5.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0175691984054843 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 95772666 A/C 1 31 16 47 15.1306232161391 8.19064608199274 6.93997713414634 A:C A C 10 0.511915380124546 0.056724205943952 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95772528_95772666:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95772528_95772666:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95772528_95772666:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95772528_95772666:FGD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 10 12 22 4.88084619875454 6.14298456149455 -1.26213836274001 T:C T C 10 0.511915380124546 0.672166961123758 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 37 29 66 18.0591309353918 14.8455460236118 3.21358491177997 T:C C T 10 0.511915380124546 0.461507216984254 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 98678513 G/A 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98678509_98678716:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98678509_98678716:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98678509_98678716:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000466840:exon_98678509_98678716:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000437817:exon_98678509_98678716:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000456993:exon_98678509_98678716:C9orf102 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 99521123 T/C 0 8 0 8 3.90467695900363 0 3.90467695900363 T T 10 0.511915380124546 0.00793690566420958 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 99580834 A/C 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 A:C A C 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 11 4 15 5.36893081862999 2.04766152049818 3.32126929813181 A:G A G 10 0.511915380124546 0.120030299485992 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 100194406 T/C 1 19 10 29 9.27360777763363 5.11915380124546 4.15445397638817 T:C T C 10 0.511915380124546 0.139263752664382 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100194307_100194520:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100194307_100194520:TDRD7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 100895443 C/T 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000106789:ENST00000343933:exon_100895320_100895499:CORO2A;ENSG00000106789:ENST00000375077:exon_100895320_100895499:CORO2A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 101984010 G/A 1 26 21 47 12.6902001167618 10.7502229826155 1.93997713414634 A:G G A 10 0.511915380124546 0.662128597629188 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 104152790 G/C 1 68 53 121 33.1897541515309 27.1315151466009 6.05823900492994 C:G G C 10 0.511915380124546 0.276713815850864 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 104152846 G/A 1 63 46 109 30.7493310521536 23.5481074857291 7.20122356642449 A:G G A 10 0.511915380124546 0.180283773980855 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 14 25 39 6.83318467825636 12.7978845031136 -5.96469982485729 A:G G A 10 0.511915380124546 0.07675145707064 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 108366734 G/A 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.034961178942022 ENSG00000106692:ENST00000223528:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000357998:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000374705:exon_108366496_108366773:FKTN HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 51 48 99 24.8923156136482 24.5719382459782 0.320377367669948 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114174384 C/T 1 40 42 82 19.5233847950182 21.5004459652309 -1.97706117021277 T:C C T 10 0.511915380124546 0.740582002559278 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 44 53 97 21.47572327452 27.1315151466009 -5.65579187208096 T:C T C 10 0.511915380124546 0.264930380892513 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 19 21 40 9.27360777763363 10.7502229826155 -1.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.75222996223045 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 14 26 40 6.83318467825636 13.3097998832382 -6.47661520498184 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0563414942735046 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 2 8 10 0.976169239750908 4.09532304099637 -3.11915380124546 T:G G T 10 0.511915380124546 0.059815468795016 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 78 25 103 38.0706003502854 12.7978845031136 25.2727158471718 A:G G A 10 0.511915380124546 4.95833368078446e-07 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 A:C A C 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 17 50 67 8.29743853788272 25.5957690062273 -17.2983304683446 A:G A G 10 0.511915380124546 2.25337496256469e-05 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 116122954 A/G 0 11 0 11 5.36893081862999 0 5.36893081862999 A A 10 0.511915380124546 0.00100716923571172 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116122787_116123017:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116122787_116123017:BSPRY HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 21 34 55 10.2497770173845 17.4051229242346 -7.15534590685003 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0591119091350353 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 59 33 92 28.7969925726518 16.89320754411 11.9037850285418 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0160065298206645 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 40 22 62 19.5233847950182 11.26213836274 8.26124643227815 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0415872520286374 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 117386719 C/T 1 15 8 23 7.32126929813181 4.09532304099637 3.22594625713544 T:C C T 10 0.511915380124546 0.213023121779288 ENSG00000157693:ENST00000374049:exon_117386630_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000288502:exon_117386630_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000471206:exon_117386416_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000448809:exon_117386587_117386739:C9orf91 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 7 8 15 3.41659233912818 4.09532304099637 -0.678730701868189 A:G A G 10 0.511915380124546 0.79973740803312 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 17 9 26 8.29743853788272 4.60723842112091 3.69020011676181 C:G C G 10 0.511915380124546 0.171780486970469 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 15 22 37 7.32126929813181 11.26213836274 -3.9408690646082 T:G T G 10 0.511915380124546 0.249436095995287 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 A:G A G 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 11 5 16 5.36893081862999 2.55957690062273 2.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.212193562476213 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 26 35 61 12.6902001167618 17.9170383043591 -5.22683818759731 A:G A G 10 0.511915380124546 0.200960091042057 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123850770 G/A 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 T:C C T 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123886324 C/T 1 10 10 20 4.88084619875454 5.11915380124546 -0.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123886209_123886362:CEP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 14 4 18 6.83318467825636 2.04766152049818 4.78552315775817 A:T T A 10 0.511915380124546 0.0317203243017737 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 61 49 110 29.7731618124027 25.0838536261028 4.68930818629995 T:C C T 10 0.511915380124546 0.391670035402233 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 125143792 C/A 1 6 2 8 2.92850771925272 1.02383076024909 1.90467695900363 A:C C A 10 0.511915380124546 0.290180034144535 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000426608:exon_125143775_125143831:PTGS1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 125659716 C/T 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125659558_125660389:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125659558_125659855:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125659558_125659855:RC3H2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 125782737 A/G 1 16 15 31 7.80935391800726 7.67873070186819 0.130623216139075 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000011454:ENST00000456584:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000373647:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000447652:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000373643:exon_125782588_125782738:RABGAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 126783433 G/C 1 33 5 38 16.10679245589 2.55957690062273 13.5472155552673 C:G G C 10 0.511915380124546 5.20730861121916e-06 ENSG00000106689:ENST00000373615:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000446480:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000488674:exon_126783378_126783583:LHX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 32 47 79 15.6187078360145 24.0600228658537 -8.44131502983913 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0711072687194683 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 128099361 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128099297_128099374:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000479511:exon_128098988_128099374:GAPVD1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 57 61 118 27.8208233329009 31.2268381875973 -3.40601485469642 A:G G A 10 0.511915380124546 0.580837273162627 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 129854199 G/A 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000136859:ENST00000373425:exon_129853949_129854219:ANGPTL2;ENSG00000136859:ENST00000373417:exon_129853949_129854219:ANGPTL2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 49 45 94 23.9161463738972 23.0361921056046 0.879954268292682 A:G A G 10 0.511915380124546 0.917929796241933 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 34 25 59 16.5948770757654 12.7978845031136 3.79699257265179 A:G A G 10 0.511915380124546 0.362844418976214 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 46 48 94 22.4518925142709 24.5719382459782 -2.12004573170732 A:T:C C T 10 0.511915380124546 0.68093060169784 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 93 169 262 45.3918696484172 86.5136992410483 -41.121829592631 T:C C T 10 0.511915380124546 3.4007210158901e-07 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 54 42 96 26.3565694732745 21.5004459652309 4.85612350804359 A:G G A 10 0.511915380124546 0.358492270747768 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 18 38 56 8.78552315775817 19.4527844447327 -10.6672612869746 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00474157486671266 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 51 47 98 24.8923156136482 24.0600228658537 0.832292747794494 A:G A G 10 0.511915380124546 0.919636363357207 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 10 16 26 4.88084619875454 8.19064608199274 -3.3097998832382 T:G G T 10 0.511915380124546 0.239879394061285 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131584748 C/T 1 115 127 242 56.1297312856772 65.0132532758173 -8.88352199014012 T:C C T 10 0.511915380124546 0.274360235202222 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131670457 T/C 1 4 5 9 1.95233847950182 2.55957690062273 -0.607238421120914 T:C T C 10 0.511915380124546 0.748613515230306 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131670952 C/T 1 8 9 17 3.90467695900363 4.60723842112091 -0.702561462117282 T:C C T 10 0.511915380124546 0.810970519399074 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131804785 T/C 1 8 4 12 3.90467695900363 2.04766152049818 1.85701543850545 T:C T C 10 0.511915380124546 0.389340745110578 ENSG00000148343:ENST00000474534:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000450073:exon_131804583_131804785:FAM73B HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131846957 T/C 1 5 3 8 2.44042309937727 1.53574614037364 0.904676959003632 T:C T C 10 0.511915380124546 0.72718311731246 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000480255:exon_131846878_131847047:DOLPP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 8 12 20 3.90467695900363 6.14298456149455 -2.23830760249092 T:C C T 10 0.511915380124546 0.374492136639995 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 131866523 C/G 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 C:G C G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000415948:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000441796:exon_131866476_131866585:CRAT HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 132580901 C/G 1 47 55 102 22.9399771341463 28.15534590685 -5.21536877270369 C:G C G 10 0.511915380124546 0.322700493314850 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132580799_132580926:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132580632_132580926:TOR1A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 158 136 294 77.1173699403217 69.6204916969382 7.49687824338349 T:C:G T C 10 0.511915380124546 0.414128440735971 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 134350851 T/C 1 19 16 35 9.27360777763363 8.19064608199274 1.08296169564089 T:C T C 10 0.511915380124546 0.738417177093215 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 58 70 128 28.3089079527763 35.8340766087182 -7.52516865594189 T:C C T 10 0.511915380124546 0.186073279076558 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 135977007 G/C 1 17 29 46 8.29743853788272 14.8455460236118 -6.54810748572911 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0562230897865293 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975883_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135976907_135977301:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135976686_135977526:RALGDS HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136037742 G/A 1 5 11 16 2.44042309937727 5.63106918137001 -3.19064608199274 A:G G A 10 0.511915380124546 0.135644795559592 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372038:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372036:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000487864:exon_136037729_136037919:GBGT1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 95 50 145 46.3680388881681 25.5957690062273 20.7722698819408 A:G G A 10 0.511915380124546 0.000613906550937845 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 62 50 112 30.2612464322781 25.5957690062273 4.66547742605085 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396051725613867 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 56 68 124 27.3327387130254 34.8102458484691 -7.47750713544369 A:G A G 10 0.511915380124546 0.208364174394415 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 64 38 102 31.2374156720291 19.4527844447327 11.7846312272963 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0223730095651064 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 136643994 T/C 1 3 14 17 1.46425385962636 7.16681532174364 -5.70256146211728 T:C T C 10 0.511915380124546 0.00642864916210632 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 16 27 43 7.80935391800726 13.8217152633627 -6.01236134535548 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0689977450798601 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 137734163 C/T 1 2 6 8 0.976169239750908 3.07149228074728 -2.09532304099637 T:C C T 10 0.511915380124546 0.170136895026891 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137734003_137736686:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137734003_137734174:COL5A1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 138377657 T/C 1 8 1 9 3.90467695900363 0.511915380124546 3.39276157887909 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0395419873135597 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 138377853 A/G 1 7 2 9 3.41659233912818 1.02383076024909 2.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.180805245635589 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 138378856 A/G 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 138905136 C/T 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C C T 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138905045_138905142:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138905045_138905142:NACC2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139008432 G/A 1 9 11 20 4.39276157887909 5.63106918137001 -1.23830760249092 A:G G A 10 0.511915380124546 0.657752778254819 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 22 9 31 10.73786163726 4.60723842112091 6.13062321613908 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0308605733351070 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139110654 C/T 1 15 2 17 7.32126929813181 1.02383076024909 6.29743853788272 T:C C T 10 0.511915380124546 0.00245641205164764 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000455222:exon_139110525_139110654:QSOX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139266496 C/T 1 10 2 12 4.88084619875454 1.02383076024909 3.85701543850545 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0392153210606380 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 35 53 88 17.0829616956409 27.1315151466009 -10.04855345096 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0332028978942343 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 22 23 45 10.73786163726 11.7740537428646 -1.03619210560457 T:C T C 10 0.511915380124546 0.767954640809347 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 23 20 43 11.2259462571354 10.2383076024909 0.987638654644522 T:C C T 10 0.511915380124546 0.878997691457703 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 16 18 34 7.80935391800726 9.21447684224183 -1.40512292423456 A:C A C 10 0.511915380124546 0.732213732981262 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 17 14 31 8.29743853788272 7.16681532174364 1.13062321613908 C:G G C 10 0.511915380124546 0.72247502509934 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 16 7 23 7.80935391800726 3.58340766087182 4.22594625713544 A:G G A 10 0.511915380124546 0.095264062576869 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 19 19 38 9.27360777763363 9.72639222236637 -0.452784444732746 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 30 33 63 14.6425385962636 16.89320754411 -2.25066894784639 A:C:G A G 10 0.511915380124546 0.615185788090377 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 66 85 151 32.21358491178 43.5128073105864 -11.2992223988064 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0731222158645841 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139327439 A/G 1 3 5 8 1.46425385962636 2.55957690062273 -1.09532304099637 A:G A G 10 0.511915380124546 0.498273370898368 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139327408_139327527:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139327408_139327527:INPP5E HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 7 5 12 3.41659233912818 2.55957690062273 0.857015438505448 A:G G A 10 0.511915380124546 0.775181640471533 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 16 8 24 7.80935391800726 4.09532304099637 3.7140308770109 T:C C T 10 0.511915380124546 0.154375553954120 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 12 22 34 5.85701543850545 11.26213836274 -5.40512292423456 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0849156877664003 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 8 18 26 3.90467695900363 9.21447684224183 -5.3097998832382 C:G G C 10 0.511915380124546 0.0483330317267402 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 7 18 25 3.41659233912818 9.21447684224183 -5.79788450311365 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0262630327507063 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139390834 C/T 1 34 42 76 16.5948770757654 21.5004459652309 -4.90556888946549 T:C C T 10 0.511915380124546 0.30182880859102 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 32 18 50 15.6187078360145 9.21447684224183 6.4042309937727 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0887030437041339 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139397707 G/A 1 4 4 8 1.95233847950182 2.04766152049818 -0.0953230409963677 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139397634_139397782:NOTCH1;ENSG00000148400:ENST00000494783:exon_139397634_139397782:NOTCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139402760 G/A 1 10 5 15 4.88084619875454 2.55957690062273 2.32126929813181 A:G G A 10 0.511915380124546 0.303837259523578 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139402684_139402837:NOTCH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139566778 C/T 1 7 4 11 3.41659233912818 2.04766152049818 1.36893081862999 T:C C T 10 0.511915380124546 0.550107784844309 ENSG00000172889:ENST00000371699:exon_139566716_139567130:EGFL7;ENSG00000172889:ENST00000308874:exon_139566716_139567129:EGFL7;ENSG00000172889:ENST00000406555:exon_139566716_139567130:EGFL7;ENSG00000172889:ENST00000371698:exon_139566716_139567130:EGFL7 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 6 4 10 2.92850771925272 2.04766152049818 0.88084619875454 A:G G A 10 0.511915380124546 0.754604246278714 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 1 7 8 0.488084619875454 3.58340766087182 -3.09532304099637 A:G G A 10 0.511915380124546 0.034961178942022 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 81 56 137 39.5348542099118 28.6672612869746 10.8675929229372 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0723921420082021 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 29 21 50 14.1544539763882 10.7502229826155 3.4042309937727 A:G G A 10 0.511915380124546 0.396457218833623 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139838530 G/A 1 40 49 89 19.5233847950182 25.0838536261028 -5.56046883108459 A:G G A 10 0.511915380124546 0.245310901828098 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139838343_139838607:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000443788:exon_139838343_139838986:FBXW5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 139975195 C/T 1 16 20 36 7.80935391800726 10.2383076024909 -2.42895368448366 T:C C T 10 0.511915380124546 0.505535383228504 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 64 84 148 31.2374156720291 43.0008919304619 -11.7634762584328 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0584350617636797 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 33 16 49 16.10679245589 8.19064608199274 7.91614637389725 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0310500809852828 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 12 20 32 5.85701543850545 10.2383076024909 -4.38129216398547 A:G A G 10 0.511915380124546 0.156458779115569 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 145 106 251 70.7722698819408 54.2630302932019 16.509239588739 C:G C G 10 0.511915380124546 0.037348764870632 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 150 102 252 73.2126929813181 52.2153687727037 20.9973242086144 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0081258623638894 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 180 137 317 87.8552315775817 70.1324070770628 17.7228245005189 A:C:G G A 10 0.511915380124546 0.0491936790175363 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 186 192 378 90.7837392968345 98.2877529839128 -7.50401368707837 A:T:G A G 10 0.511915380124546 0.440883529758717 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 54 51 105 26.3565694732745 26.1076843863518 0.248885086922673 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 1720321 C/T 1 108 112 220 52.713138946549 57.3345225739491 -4.62138362740011 T:C C T 10 0.511915380124546 0.544474743658546 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 30 23 53 14.6425385962636 11.7740537428646 2.86848485339906 T:C T C 10 0.511915380124546 0.492785874358798 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 29 35 64 14.1544539763882 17.9170383043591 -3.76258432797094 A:G G A 10 0.511915380124546 0.382368413518617 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 172 135 307 83.9505546185781 69.1085763168137 14.8419783017644 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0977018399879822 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 186 143 329 90.7837392968345 73.2038993578101 17.5798399390244 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0536750796665048 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 325 215 540 158.627501459523 110.061806726777 48.5656947327452 A:G A G 10 0.511915380124546 2.86553886371216e-05 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 385 250 635 187.91257865205 127.978845031136 59.9337336209133 A:T:C:G A T 10 0.511915380124546 1.81018435126950e-06 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 1 28 23 51 13.6663693565127 11.7740537428646 1.89231561364816 A:G G A 10 0.511915380124546 0.674931519064623 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 14027177 T/A 1 32 34 66 15.6187078360145 17.4051229242346 -1.78641508822003 A:T T A 10 0.511915380124546 0.712489234335892 ENSG00000046647:ENST00000398350:exon_14024845_14027288:GEMIN8;ENSG00000046647:ENST00000380523:exon_14026398_14027288:GEMIN8;ENSG00000046647:ENST00000398355:exon_14026792_14027288:GEMIN8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 14027206 C/T 1 48 44 92 23.4280617540218 22.52427672548 0.903785028541773 T:C C T 10 0.511915380124546 0.917037758390582 ENSG00000046647:ENST00000398350:exon_14024845_14027288:GEMIN8;ENSG00000046647:ENST00000380523:exon_14026398_14027288:GEMIN8;ENSG00000046647:ENST00000398355:exon_14026792_14027288:GEMIN8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 1 25 20 45 12.2021154968864 10.2383076024909 1.96380789439543 T:C C T 10 0.511915380124546 0.655157374364705 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 28 23 51 13.6663693565127 11.7740537428646 1.89231561364816 A:G G A 10 0.511915380124546 0.674931519064623 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 19375782 A/C 1 111 98 209 54.1773928061754 50.1677072522055 4.0096855539699 A:T:C A C 10 0.511915380124546 0.628251773358254 ENSG00000131828:ENST00000422285:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379806:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379815:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000481733:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379804:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000478795:exon_19375500_19375837:PDHA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 30577846 A/C 1 15 19 34 7.32126929813181 9.72639222236637 -2.40512292423456 A:C A C 10 0.511915380124546 0.493377638849841 ENSG00000120280:ENST00000378962:exon_30576941_30578473:CXorf21 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 37701048 G/A 1 27 8 35 13.1782847366373 4.09532304099637 9.08296169564089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.00206928898303279 ENSG00000165169:ENST00000378581:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000378578:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000432389:exon_37701035_37701158:DYNLT3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 39932907 T/C 1 6 7 13 2.92850771925272 3.58340766087182 -0.654899941619097 T:C T C 10 0.511915380124546 0.7862651874713 ENSG00000183337:ENST00000417733:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378455:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000397354:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378444:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000342274:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000406200:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000490976:exon_39931159_39934433:BCOR HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 39934105 G/A 1 6 5 11 2.92850771925272 2.55957690062273 0.368930818629994 A:G G A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000183337:ENST00000417733:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378455:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000397354:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378444:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000342274:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000406200:exon_39931602_39934433:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000490976:exon_39931159_39934433:BCOR HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 40573157 G/A 1 10 4 14 4.88084619875454 2.04766152049818 2.83318467825636 A:G G A 10 0.511915380124546 0.181299286165187 ENSG00000180182:ENST00000324817:exon_40573030_40573159:MED14;ENSG00000180182:ENST00000482034:exon_40573084_40573159:MED14;ENSG00000180182:ENST00000492219:exon_40573130_40573159:MED14 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 157 172 329 76.6292853204463 88.0494453814219 -11.4201600609756 A:G G A 10 0.511915380124546 0.22499655178943 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 117 150 267 57.1059005254281 76.7873070186819 -19.6814064932538 T:C T C 10 0.511915380124546 0.0168936851455065 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 31 31 0 15.8693767838609 -15.8693767838609 G T G 10 0.511915380124546 2.20469646063955e-10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 47663200 G/A 0 0 20 20 0 10.2383076024909 -10.2383076024909 A G A 10 0.511915380124546 5.88711412277519e-07 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 49035640 C/T 1 32 23 55 15.6187078360145 11.7740537428646 3.84465409314997 T:C C T 10 0.511915380124546 0.345658788939129 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000432913:exon_49035600_49035737:PRICKLE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 27 24 51 13.1782847366373 12.2859691229891 0.892315613648156 A:G G A 10 0.511915380124546 0.888849598863121 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 55028850 A/G 1 37 59 96 18.0591309353918 30.2030074273482 -12.1438764919564 A:G A G 10 0.511915380124546 0.0141281892254741 ENSG00000169188:ENST00000374987:exon_55028684_55028864:APEX2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 48 39 87 23.4280617540218 19.9646998248573 3.4633619291645 A:G G A 10 0.511915380124546 0.520193118725968 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 57475132 T/C 1 4 8 12 1.95233847950182 4.09532304099637 -2.14298456149455 T:C T C 10 0.511915380124546 0.256854402155839 ENSG00000165591:ENST00000374900:exon_57474957_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000491179:exon_57475115_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000465623:exon_57474957_57475151:FAAH2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 1 9 9 18 4.39276157887909 4.60723842112091 -0.214476842241828 C:G G C 10 0.511915380124546 1 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 82 79 161 40.0229388297872 40.4413150298391 -0.418376200051902 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 73066439 T/C 1 5 5 10 2.44042309937727 2.55957690062273 -0.11915380124546 T:C T C 10 0.511915380124546 1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 73071630 G/A 1 25 21 46 12.2021154968864 10.7502229826155 1.45189251427089 A:G G A 10 0.511915380124546 0.768437629457915 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 33 36 69 16.10679245589 18.4289536844837 -2.32216122859367 C:G G C 10 0.511915380124546 0.630631749768949 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 37 51 88 18.0591309353918 26.1076843863518 -8.04855345096005 A:C A C 10 0.511915380124546 0.0888911508931887 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 1 148 105 253 72.2365237415672 53.7511149130773 18.4854088284899 A:G G A 10 0.511915380124546 0.0233876228808099 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 117527020 C/T 1 7 10 17 3.41659233912818 5.11915380124546 -1.70256146211728 T:C C T 10 0.511915380124546 0.472133682168288 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117526595_117527234:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000493448:exon_117526595_117527178:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117526592_117527238:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117526711_117527234:WDR44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 117528142 C/T 1 8 8 16 3.90467695900363 4.09532304099637 -0.190646081992735 T:C C T 10 0.511915380124546 1 ENSG00000131725:ENST00000435384:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000254029:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371822:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371825:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000534809:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000446173:exon_117528018_117528148:WDR44;ENSG00000131725:ENST00000371848:exon_117528018_117528148:WDR44 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 117700141 A/G 1 7 3 10 3.41659233912818 1.53574614037364 1.88084619875454 A:G A G 10 0.511915380124546 0.345146521084903 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117699968_117700145:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117699968_117700145:DOCK11 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 32 21 53 15.6187078360145 10.7502229826155 4.86848485339906 T:C C T 10 0.511915380124546 0.216194455646066 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 118604436 T/C 1 692 466 1158 337.754556953814 238.552567138038 99.2019898157758 T:C T C 10 0.511915380124546 5.41909531246986e-09 ENSG00000005022:ENST00000317881:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000460013:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000463551:exon_118604225_118604476:SLC25A5 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 118893137 T/C 1 10 6 16 4.88084619875454 3.07149228074728 1.80935391800726 T:C T C 10 0.511915380124546 0.45657675460252 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 1 13 9 22 6.3451000583809 4.60723842112091 1.73786163725999 T:C T C 10 0.511915380124546 0.526087268483407 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 1 17 23 40 8.29743853788272 11.7740537428646 -3.47661520498184 A:T T A 10 0.511915380124546 0.342781564446145 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 123041043 A/G 1 5 4 9 2.44042309937727 2.04766152049818 0.392761578879086 A:G A G 10 0.511915380124546 1 ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123040838_123041101:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123040838_123047815:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123040838_123047815:XIAP HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 1 93 58 151 45.3918696484172 29.6910920472237 15.7007776011936 A:T:C T C 10 0.511915380124546 0.0114624303231425 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 129201179 C/T 1 23 38 61 11.2259462571354 19.4527844447327 -8.2268381875973 T:C C T 10 0.511915380124546 0.0400721068456097 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 129263595 C/T 1 170 95 265 82.9743853788272 48.6319611118319 34.3424242669953 T:C C T 10 0.511915380124546 2.66627645986799e-05 ENSG00000156709:ENST00000460436:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000346424:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000440263:exon_129263337_129263603:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129263345_129263603:AIFM1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 1 26 24 50 12.6902001167618 12.2859691229891 0.404230993772702 A:T T A 10 0.511915380124546 1 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 134713855 G/A 1 21 11 32 10.2497770173845 5.63106918137001 4.61870783601453 A:G G A 10 0.511915380124546 0.113407034577418 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153176254 A/G 1 107 54 161 52.2250543266736 27.6434305267255 24.5816237999481 A:G A G 10 0.511915380124546 0.000102405687986567 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000467421:exon_153176154_153176325:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442172:exon_153176154_153176288:ARHGAP4 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 77 30 107 37.58251573041 15.3574614037364 22.2250543266736 A:G G A 10 0.511915380124546 1.62196444806744e-05 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 1 6 3 9 2.92850771925272 1.53574614037364 1.39276157887909 A:G A G 10 0.511915380124546 0.508929611162428 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153696247 G/C 1 8 6 14 3.90467695900363 3.07149228074728 0.833184678256357 C:G G C 10 0.511915380124546 0.791358650545556 ENSG00000130827:ENST00000369682:exon_153696110_153696344:PLXNA3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153706264 C/G 1 61 69 130 29.7731618124027 35.3221612285937 -5.54899941619097 C:G C G 10 0.511915380124546 0.336004053081497 ENSG00000196976:ENST00000407062:exon_153706028_153706750:LAGE3;ENSG00000196976:ENST00000357360:exon_153706108_153706397:LAGE3 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 93 92 185 45.3918696484172 47.0962149714582 -1.704345323041 A:G G A 10 0.511915380124546 0.825606021497648 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 154020114 C/A 1 11 17 28 5.36893081862999 8.70256146211728 -3.33363064348729 A:C C A 10 0.511915380124546 0.257214713691272 ENSG00000130830:ENST00000369534:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000413259:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000439370:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393529:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000417435:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000488694:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000369531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000471821:exon_154019906_154020122:MPP1 HGDP00712_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 80 33 113 39.0467695900363 16.89320754411 22.1535620459263 T:G T G 10 0.511915380124546 2.83870871946858e-05 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2