INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 898852 C/T 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_898717_898884:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_898717_898884:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000466300:exon_898717_898884:KLHL17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 34 15 49 15.8446890833717 8.00969599263012 7.83499309074161 T:C C T 10 0.533979732842008 0.030804681485182 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 80 90 170 37.2816213726394 48.0581759557807 -10.7765545831413 A:G G A 10 0.533979732842008 0.106368075333082 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 23 33 56 10.7184661446338 17.6213311837863 -6.90286503915244 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0808084221458688 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 2491306 G/A 1 53 30 83 24.6990741593736 16.0193919852602 8.67968217411334 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0614040597264523 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2490791_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000471768:exon_2491019_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2491210_2491417:TNFRSF14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 12 16 28 5.5922432058959 8.54367572547213 -2.95143251957622 A:G A G 10 0.533979732842008 0.343794544457247 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 6649228 T/G 1 37 53 90 17.2427498848457 28.3009258406264 -11.0581759557807 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0202053316817450 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 A:G A G 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 34 34 0 18.1553109166283 -18.1553109166283 T C T 10 0.533979732842008 5.31818392894258e-12 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 A:C C A 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C T C 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 T:C C T 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 A:G A G 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 10511544 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C T C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 16 12 28 7.45632427452787 6.4077567941041 1.04856748042378 A:G G A 10 0.533979732842008 0.710138043576245 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 12569090 T/C 1 13 19 32 6.0582634730539 10.1456149239982 -4.08735145094425 T:C T C 10 0.533979732842008 0.159445154736600 ENSG00000048707:ENST00000358136:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000356315:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000011700:exon_12568947_12570415:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000496628:exon_12568947_12572099:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000471923:exon_12568947_12572099:VPS13D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C T C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 T:C T C 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 3 10 13 1.39806080147398 5.33979732842008 -3.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0474124643534524 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16261814 C/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 19 19 38 8.85438507600185 10.1456149239982 -1.2912298479963 C:G G C 10 0.533979732842008 0.74591969304963 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 16950346 A/C 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 A A 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 19666060 G/A 1 448 516 964 208.77707968678 275.533542146476 -66.7564624596957 A:G G A 10 0.533979732842008 1.71936980631184e-05 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19665270_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19665273_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19665317_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19665853_19666111:CAPZB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 19670884 A/G 1 430 357 787 200.388714877937 190.630764624597 9.75795025333974 A:G A G 10 0.533979732842008 0.497339500660403 ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19670852_19670928:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19670852_19670928:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19670852_19670928:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19670852_19670928:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19670852_19670928:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000264202:exon_19670852_19670928:CAPZB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 19684006 G/C 1 172 194 366 80.1554859511746 103.59206817135 -23.4365822201749 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0158399781175187 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000264202:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000413711:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000459967:exon_19683916_19684057:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000457768:exon_19683939_19684057:CAPZB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 19775375 G/A 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G G A 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19775328_19775824:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19775328_19775408:CAPZB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 2 9 11 0.932040534315984 4.80581759557807 -3.87377706126209 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0299883171536232 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 54 20 74 25.1650944265316 10.6795946568402 14.4854997696914 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000663130844670649 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 T:G G T 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 35 26 61 16.3107093505297 13.8834730538922 2.42723629663751 T:C T C 10 0.533979732842008 0.608208055450095 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 84 99 183 39.1457024412713 52.8639935513588 -13.7182911100875 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0453489916526089 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 21 25 46 9.78642561031783 13.3494933210502 -3.56306771073237 A:C A C 10 0.533979732842008 0.304463041307313 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 718 759 1477 334.602551819438 405.290617227084 -70.6880654076458 A:C:G A G 10 0.533979732842008 0.000234124970035324 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 726 761 1487 338.330713956702 406.358576692768 -68.0278627360658 A:G A G 10 0.533979732842008 0.000446063888699643 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 17 12 29 7.92234454168586 6.4077567941041 1.51458774758177 T:C T C 10 0.533979732842008 0.710422976957767 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 34 13 47 15.8446890833717 6.9417365269461 8.90295255642563 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0121028268988825 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 30 10 40 13.9806080147398 5.33979732842008 8.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00656695316464904 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 33 11 44 15.3786688162137 5.87377706126209 9.50489175495165 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00388753644745316 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 37 33 70 17.2427498848457 17.6213311837863 -0.378581298940553 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 106 121 227 49.3981483187472 64.611547673883 -15.2133993551358 A:G G A 10 0.533979732842008 0.045887303058506 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 31769551 T/C 1 6 12 18 2.79612160294795 6.4077567941041 -3.61163519115614 T:C T C 10 0.533979732842008 0.101098748879718 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31769458_31769617:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000446633:exon_31769458_31769620:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000463988:exon_31769458_31769629:SNRNP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 31769560 C/G 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 C:G C G 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31769458_31769617:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000446633:exon_31769458_31769620:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000463988:exon_31769458_31769629:SNRNP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 52 37 89 24.2330538922156 19.7572501151543 4.47580377706129 A:G A G 10 0.533979732842008 0.39549297071266 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 12 7 19 5.5922432058959 3.73785812989406 1.85438507600185 A:G G A 10 0.533979732842008 0.492774658327971 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 55 68 123 25.6311146936896 36.3106218332565 -10.679507139567 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0577019014048769 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 43 35 78 20.0388714877937 18.6892906494703 1.34958083832338 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.820770577123472 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 35919979 A/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G A G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000467109:exon_35919963_35920237:KIAA0319L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 36642149 C/T 0 24 0 24 11.1844864117918 0 11.1844864117918 C C 10 0.533979732842008 2.99806432712958e-07 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642019_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642019_36642182:MAP7D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 36752410 C/T 1 21 15 36 9.78642561031783 8.00969599263012 1.77672961768771 T:C C T 10 0.533979732842008 0.618144982656518 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 37948912 C/T 1 17 11 28 7.92234454168586 5.87377706126209 2.04856748042378 T:C C T 10 0.533979732842008 0.456589737565831 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 44 24 68 20.5048917549517 12.8155135882082 7.68937816674346 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0682424326517232 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G A G 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 1 10 11 0.466020267157992 5.33979732842008 -4.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00406923808209847 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 39748921 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000524432:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000404645:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000496804:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000530262:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000485063:exon_39748798_39748973:MACF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 39763242 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 2 10 12 0.932040534315984 5.33979732842008 -4.4077567941041 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0168046456242538 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 39929240 T/C 1 13 3 16 6.0582634730539 1.60193919852602 4.45632427452787 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0414801567890711 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:T A T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 55 63 118 25.6311146936896 33.6407231690465 -8.00960847535694 A:G G A 10 0.533979732842008 0.141081708041176 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 43675467 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000243710:ENST00000372492:exon_43675414_43675587:WDR65;ENSG00000243710:ENST00000528956:exon_43675414_43676549:WDR65;ENSG00000243710:ENST00000296394:exon_43675414_43676549:WDR65;ENSG00000243710:ENST00000533339:exon_43675414_43675587:WDR65 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 43850696 G/A 1 51 56 107 23.7670336250576 29.9028650391524 -6.13583141409485 A:G G A 10 0.533979732842008 0.245843922506173 ENSG00000159479:ENST00000372457:exon_43849640_43850777:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372455:exon_43850397_43850777:MED8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:C C A 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 44451234 C/T 1 23 18 41 10.7184661446338 9.61163519115614 1.10683095347767 T:C C T 10 0.533979732842008 0.756745537238815 ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44451189_44451293:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000481924:exon_44451189_44451878:B4GALT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 45120696 C/T 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000126106:ENST00000372242:exon_45120612_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372237:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000476724:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000468117:exon_45118919_45120788:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372235:exon_45120137_45120791:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000420706:exon_45120568_45120788:TMEM53 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 15 18 33 6.99030400736988 9.61163519115614 -2.62133118378626 T:C C T 10 0.533979732842008 0.386860760235644 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 8 11 19 3.72816213726394 5.87377706126209 -2.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.363516478214209 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 48 44 92 22.3689728235836 23.4951082450483 -1.12613542146473 A:G A G 10 0.533979732842008 0.834999635144317 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 C:G G C 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 51826853 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 31 18 49 14.4466282818978 9.61163519115614 4.83499309074161 T:C C T 10 0.533979732842008 0.197597234821157 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 53675923 C/T 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 110 106 216 51.2622293873791 56.6018516812528 -5.33962229387372 A:G G A 10 0.533979732842008 0.495401016970998 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 62380270 C/T 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 62380298 G/A 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 1 10 11 0.466020267157992 5.33979732842008 -4.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00406923808209847 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 66829262 A/G 1 14 14 28 6.52428374021189 7.47571625978811 -0.951432519576223 A:G A G 10 0.533979732842008 0.850205813298175 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 10 14 24 4.66020267157992 7.47571625978811 -2.81551358820819 C:G G C 10 0.533979732842008 0.307338312334203 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 79 68 147 36.8156011054814 36.3106218332565 0.50497927222483 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 88 88 176 41.0097835099033 46.9902164900967 -5.9804329801934 T:C T C 10 0.533979732842008 0.36597700241465 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 49 40 89 22.8349930907416 21.3591893136803 1.47580377706129 T:C C T 10 0.533979732842008 0.831884389434988 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 37 24 61 17.2427498848457 12.8155135882082 4.42723629663752 T:C T C 10 0.533979732842008 0.304684275618001 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 36 31 67 16.7767296176877 16.5533717181022 0.223357899585466 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 25 20 45 11.6505066789498 10.6795946568402 0.970912022109642 T:C T C 10 0.533979732842008 0.881461959585379 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 34 24 58 15.8446890833717 12.8155135882082 3.02917549516354 T:C C T 10 0.533979732842008 0.433901533957562 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 93602194 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 17 24 41 7.92234454168586 12.8155135882082 -4.89316904652233 A:G G A 10 0.533979732842008 0.158229703534358 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 20 24 44 9.32040534315984 12.8155135882082 -3.49510824504835 T:C T C 10 0.533979732842008 0.295184346205203 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 86 53 139 40.0777429755873 28.3009258406264 11.7768171349609 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0502979537348782 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 42 27 69 19.5728512206357 14.4174527867342 5.15539843390145 C:G C G 10 0.533979732842008 0.229084380156525 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 48 63 111 22.3689728235836 33.6407231690465 -11.2717503454629 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0360710647639704 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 37 33 70 17.2427498848457 17.6213311837863 -0.378581298940553 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 21 16 37 9.78642561031783 8.54367572547213 1.24274988484571 A:G A G 10 0.533979732842008 0.743361954463395 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 98012495 G/A 0 19 0 19 8.85438507600185 0 8.85438507600185 G G 10 0.533979732842008 7.1531138545116e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 21 16 37 9.78642561031783 8.54367572547213 1.24274988484571 A:G G A 10 0.533979732842008 0.743361954463395 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 367 291 658 171.029438046983 155.388102257024 15.6413357899588 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.225949716868467 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 300 149 449 139.806080147398 79.5629801934592 60.2430999539384 A:T:C C T 10 0.533979732842008 8.72307065530206e-09 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 20 12 32 9.32040534315984 6.4077567941041 2.91264854905575 T:C:G T C 10 0.533979732842008 0.376330788398032 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 98 110 208 45.6699861814832 58.7377706126209 -13.0677844311377 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0710269203597324 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 17 31 48 7.92234454168586 16.5533717181022 -8.63102717641638 T:C T C 10 0.533979732842008 0.013718620825034 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G G A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 114445447 T/G 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:G T G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114445260_114445484:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114445260_114445484:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489499:exon_114445260_114445484:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114445260_114445484:AP4B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 1 9 1 10 4.19418240442193 0.533979732842008 3.66020267157992 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0243520340127106 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 21 21 0 11.2135743896822 -11.2135743896822 C T C 10 0.533979732842008 1.08767937833469e-07 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 1 2 24 26 0.932040534315984 12.8155135882082 -11.8834730538922 T:G G T 10 0.533979732842008 1.17607251776179e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 1 1 25 26 0.466020267157992 13.3494933210502 -12.8834730538922 A:C C A 10 0.533979732842008 7.36133664572256e-08 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 38 0 38 17.7087701520037 0 17.7087701520037 G G 10 0.533979732842008 5.542529443373e-11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 22 22 0 11.7475541225242 -11.7475541225242 C T C 10 0.533979732842008 5.06880634473771e-08 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 33 34 0.466020267157992 17.6213311837863 -17.1553109166283 T:C C T 10 0.533979732842008 2.12505058720022e-10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 18 17 35 8.38836480884386 9.07765545831414 -0.689290649470278 A:G G A 10 0.533979732842008 0.86635090990695 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 150123132 C/G 1 44 33 77 20.5048917549517 17.6213311837863 2.88356057116539 C:G C G 10 0.533979732842008 0.568414972726424 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150123102_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150122797_150123248:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000492304:exon_150122827_150123248:PLEKHO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 27 14 41 12.5825472132658 7.47571625978811 5.10683095347767 A:G G A 10 0.533979732842008 0.119299094209677 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 150730279 A/G 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.104626927055117 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 475 433 908 221.359626900046 231.213224320589 -9.8535974205432 T:C T C 10 0.533979732842008 0.52742256537259 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 32 29 61 14.9126485490557 15.4854122524182 -0.572763703362485 A:C A C 10 0.533979732842008 0.898531735005664 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 151732492 G/A 1 138 164 302 64.3107968678029 87.5726761860893 -23.2618793182864 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00790303702898623 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151732119_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151732123_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000468006:exon_151732130_151732507:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151732351_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000495867:exon_151732360_151732657:MRPL9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 151732700 A/G 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:C:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 151955625 C/T 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 17 11 28 7.92234454168586 5.87377706126209 2.04856748042378 T:C C T 10 0.533979732842008 0.456589737565831 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 154988870 C/T 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 155708010 G/A 1 164 154 318 76.4273238139107 82.2328788576692 -5.80555504375852 A:G G A 10 0.533979732842008 0.536525685092269 ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155707948_155708801:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155707948_155708217:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463295:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000476444:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000491777:exon_155707948_155708088:DAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 156235814 G/A 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G G A 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156235572_156236171:SMG5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 23 20 43 10.7184661446338 10.6795946568402 0.0388714877936582 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160302298 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160302238_160302347:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160302238_160302347:COPA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 A:G G A 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160305044 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C:G C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160305032_160305112:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160305032_160305112:COPA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160320938 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160321499 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000459963:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424645:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424754:exon_160321486_160321595:NCSTN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 20 12 32 9.32040534315984 6.4077567941041 2.91264854905575 T:G G T 10 0.533979732842008 0.376330788398032 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 162536106 A/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:T A T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000117143:ENST00000412525:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162535827_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162535827_162536138:UAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 166039898 C/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 C:G C G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000188859:ENST00000435676:exon_166039069_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000456900:exon_166039072_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000441649:exon_166038749_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000354422:exon_166039256_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000338353:exon_166039257_166040000:FAM78B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 108 90 198 50.3301888530631 48.0581759557807 2.27201289728243 A:G A G 10 0.533979732842008 0.77593442830829 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 169773317 G/A 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000472795:exon_169773216_169773521:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000496973:exon_169773253_169773488:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000481744:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000466580:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000456684:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169773216_169773381:C1orf112 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 73 79 152 34.0194795025334 42.1843988945186 -8.16491939198521 A:G G A 10 0.533979732842008 0.193764489266080 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 50 47 97 23.3010133578996 25.0970474435744 -1.79603408567477 C:G C G 10 0.533979732842008 0.760450145061771 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 41 26 67 19.1068309534777 13.8834730538922 5.22335789958547 C:G C G 10 0.533979732842008 0.221659123876264 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 19 22 41 8.85438507600185 11.7475541225242 -2.89316904652233 C:G G C 10 0.533979732842008 0.434331976808259 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 12 16 28 5.5922432058959 8.54367572547213 -2.95143251957622 T:C T C 10 0.533979732842008 0.343794544457247 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 13 10 23 6.0582634730539 5.33979732842008 0.718466144633817 A:G A G 10 0.533979732842008 0.836411835071984 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 173456936 G/A 1 132 105 237 61.514675264855 56.0678719484108 5.44680331644412 A:G G A 10 0.533979732842008 0.515105351314189 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:G G A 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 64 54 118 29.8252970981115 28.8349055734684 0.990391524643062 T:C C T 10 0.533979732842008 0.92653626610021 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 179051508 C/T 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 T:C C T 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000472001:exon_179051316_179051522:TOR3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 179887125 G/A 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179886587_179890583:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179887082_179887374:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179886587_179889211:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179886587_179888412:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179886587_179887533:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000447964:exon_179886587_179887306:TOR1AIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 179989742 G/C 1 2 10 12 0.932040534315984 5.33979732842008 -4.4077567941041 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0168046456242538 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000439289:exon_179989084_179989970:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_179989650_179990144:CEP350 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 A:G G A 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183536358 G/A 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 A:G G A 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183536339_183536645:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000418089:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000419402:exon_183536339_183536480:NCF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183596703 G/A 1 51 65 116 23.7670336250576 34.7086826347305 -10.9416490096729 A:T:C:G G A 10 0.533979732842008 0.0502065624958699 ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183595329_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183595352_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183595593_183596729:ARPC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183599638 C/T 1 39 34 73 18.1747904191617 18.1553109166283 0.019479502533418 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000162704:ENST00000367534:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183599596_183599772:ARPC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183604596 G/A 0 9 0 9 4.19418240442193 0 4.19418240442193 G G 10 0.533979732842008 0.00456625592943765 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 183604597 G/A 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 G G 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 14 20 34 6.52428374021189 10.6795946568402 -4.15531091662827 A:C A C 10 0.533979732842008 0.170925464277231 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 186316436 G/A 1 14 18 32 6.52428374021189 9.61163519115614 -3.08735145094425 A:G G A 10 0.533979732842008 0.29217901070623 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 27 12 39 12.5825472132658 6.4077567941041 6.17479041916169 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.0539440425878941 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 192780657 C/T 1 32 13 45 14.9126485490557 6.9417365269461 7.97091202210964 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0170647288305900 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780532_192781403:RGS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 C:G G C 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 19 16 35 8.85438507600185 8.54367572547213 0.310709350529722 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 201458071 T/A 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000159176:ENST00000367306:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533402:exon_201454411_201461627:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527662:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532313:exon_201454411_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000340006:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000531916:exon_201458001_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532460:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533432:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000530120:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000526723:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000524951:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000458271:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527573:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000529975:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533188:exon_201457755_201458112:CSRP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 30 24 54 13.9806080147398 12.8155135882082 1.16509442653157 A:G G A 10 0.533979732842008 0.786354486653825 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 T:C T C 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 204396830 G/A 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204396776_204396882:PIK3C2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 42 46 88 19.5728512206357 24.5630677107324 -4.9902164900967 T:C C T 10 0.533979732842008 0.2878559480075 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 207643230 T/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207643040_207643447:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207643040_207643447:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207643040_207643447:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207643040_207643447:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207643040_207643447:CR2;ENSG00000117322:ENST00000485707:exon_207643040_207643278:CR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 A:G G A 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 209933660 G/C 1 12 21 33 5.5922432058959 11.2135743896822 -5.62133118378626 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0555024767619246 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 A:G A G 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 22 8 30 10.2524458774758 4.27183786273606 5.98060801473976 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0290477471596604 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 185 170 355 86.2137494242285 90.7765545831413 -4.56280515891282 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.63247425803982 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C T C 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C T C 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 T:C C T 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 226032229 C/T 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032199_226032324:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032199_226032324:EPHX1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 226034909 G/A 1 13 13 26 6.0582634730539 6.9417365269461 -0.883473053892207 A:G G A 10 0.533979732842008 0.844733344957102 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 86 66 152 40.0777429755873 35.2426623675725 4.83508060801479 A:G A G 10 0.533979732842008 0.464689481285371 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G G A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 227182033 G/A 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227177566_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227177566_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227181328_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227181968_227182100:CDC42BPA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 T:G T G 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 233 253 486 108.582722247812 135.096872409028 -26.5141501612159 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0179759141433998 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 19 10 29 8.85438507600185 5.33979732842008 3.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 0.263787165013188 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 229601169 G/A 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G G A 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229601167_229601266:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229601167_229601266:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229601167_229601266:NUP133 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C T C 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 230415212 C/T 1 40 73 113 18.6408106863197 38.9805204974666 -20.3397098111469 T:C C T 10 0.533979732842008 0.000142221196855923 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 84 37 121 39.1457024412713 19.7572501151543 19.388452326117 T:C T C 10 0.533979732842008 0.000359547769850953 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 15 11 26 6.99030400736988 5.87377706126209 1.11652694610779 A:G A G 10 0.533979732842008 0.698803906557757 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 43 28 71 20.0388714877937 14.9514325195762 5.08743896821743 A:G A G 10 0.533979732842008 0.236452778931994 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 13 2 15 6.0582634730539 1.06795946568402 4.99030400736988 A:T T A 10 0.533979732842008 0.0093536109080249 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G A G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 13 3 16 6.0582634730539 1.60193919852602 4.45632427452787 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0414801567890711 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 15 1 16 6.99030400736988 0.533979732842008 6.45632427452787 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000749456351885355 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 16 4 20 7.45632427452787 2.13591893136803 5.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0228161078280953 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 17 9 26 7.92234454168586 4.80581759557807 3.11652694610779 A:G G A 10 0.533979732842008 0.243529768696534 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 234742879 A/G 1 53 59 112 24.6990741593736 31.5048042376785 -6.80573007830489 A:G A G 10 0.533979732842008 0.218314390112956 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 241757722 C/G 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 C:G C G 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000054277:ENST00000366554:exon_241756426_241757993:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000331838:exon_241756452_241757993:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000469376:exon_241756904_241757993:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000490673:exon_241756904_241757993:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000463155:exon_241757514_241757993:OPN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 A:T T A 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 34 28 62 15.8446890833717 14.9514325195762 0.893256563795507 A:G A G 10 0.533979732842008 0.898905220221913 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 C:G G C 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 23 18 41 10.7184661446338 9.61163519115614 1.10683095347767 A:G G A 10 0.533979732842008 0.756745537238815 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 77 80 157 35.8835605711654 42.7183786273606 -6.83481805619525 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298480824317992 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 43 31 74 20.0388714877937 16.5533717181022 3.48549976969141 A:G G A 10 0.533979732842008 0.484761693679201 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 1065457 T/A 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 86 78 164 40.0777429755873 41.6504191616766 -1.57267618608931 A:G G A 10 0.533979732842008 0.814792421496955 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 43 37 80 20.0388714877937 19.7572501151543 0.281621372639364 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 89 75 164 41.4758037770613 40.0484799631506 1.4273238139107 T:C C T 10 0.533979732842008 0.875688423248706 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3171995 G/T 1 15 7 22 6.99030400736988 3.73785812989406 3.25244587747583 T:G G T 10 0.533979732842008 0.201587902311626 ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 125 83 208 58.252533394749 44.3203178258867 13.9322155688623 T:C C T 10 0.533979732842008 0.060339146637428 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 139 102 241 64.7768171349609 54.4659327498848 10.3108843850761 T:C C T 10 0.533979732842008 0.196649533839573 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 556 423 979 259.107268539844 225.873426992169 33.2338415476742 A:T:C T A 10 0.533979732842008 0.0344625352920104 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 48 46 94 22.3689728235836 24.5630677107324 -2.19409488714875 T:C T C 10 0.533979732842008 0.679925225666295 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 39 43 82 18.1747904191617 22.9611285122063 -4.78633809304466 A:G G A 10 0.533979732842008 0.319590272320149 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 T:C C T 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 5926034 T/C 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 T:C T C 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 5929962 G/C 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 C:G G C 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5929884_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5929810_5930030:ANKRD16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 72 82 154 33.5534592353754 43.7863380930446 -10.2328788576692 T:C T C 10 0.533979732842008 0.106234015161229 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 6063567 C/T 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6063441_6063656:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6063468_6063656:IL2RA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 7798033 A/T 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 A:T A T 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000151657:ENST00000379562:exon_7797192_7798105:KIN;ENSG00000151657:ENST00000463666:exon_7797777_7798105:KIN;ENSG00000151657:ENST00000471320:exon_7797798_7798105:KIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 24 18 42 11.1844864117918 9.61163519115614 1.57285122063567 A:G A G 10 0.533979732842008 0.646475162894135 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 43 35 78 20.0388714877937 18.6892906494703 1.34958083832338 A:T A T 10 0.533979732842008 0.820770577123472 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 12123666 C/T 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485527419132807 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 153 153 306 71.3011008751728 81.6988991248272 -10.3977982496544 T:C T C 10 0.533979732842008 0.251784757210429 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 12291584 C/T 1 166 131 297 77.3593643482267 69.951345002303 7.40801934592363 T:C C T 10 0.533979732842008 0.415590996221847 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12291580_12291717:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12291580_12291717:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12291580_12291705:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12291580_12291717:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 207 185 392 96.4661953017044 98.7862505757715 -2.32005527406712 T:G G T 10 0.533979732842008 0.83957601554887 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13251117 G/A 1 8 11 19 3.72816213726394 5.87377706126209 -2.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.363516478214209 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13251091_13251133:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13251091_13251133:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13251091_13251133:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13251091_13251160:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13251091_13253104:MCM10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 9 16 25 4.19418240442193 8.54367572547213 -4.3494933210502 T:C T C 10 0.533979732842008 0.107499092273397 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13658436 G/A 1 17 10 27 7.92234454168586 5.33979732842008 2.58254721326579 A:G G A 10 0.533979732842008 0.34187731653146 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000298451:exon_13658398_13658553:PRPF18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G G A 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13735887 C/A 1 32 25 57 14.9126485490557 13.3494933210502 1.56315522800555 A:C C A 10 0.533979732842008 0.693032130913207 ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 15 13 28 6.99030400736988 6.9417365269461 0.0485674804237775 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 18828464 T/C 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 T:C T C 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 35 38 73 16.3107093505297 20.2912298479963 -3.98052049746658 T:C C T 10 0.533979732842008 0.351288317920141 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 10 16 26 4.66020267157992 8.54367572547213 -3.88347305389221 A:T A T 10 0.533979732842008 0.167959342288254 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 T:C C T 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:G G A 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 T:C T C 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27443083 A/T 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:T A T 10 0.533979732842008 0.188759088593184 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 10 18 28 4.66020267157992 9.61163519115614 -4.95143251957622 T:C C T 10 0.533979732842008 0.086439244923903 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 41 35 76 19.1068309534777 18.6892906494703 0.417540304007396 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 41 50 91 19.1068309534777 26.6989866421004 -7.59215568862272 T:C T C 10 0.533979732842008 0.115807014201152 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 29754609 T/C 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000497265:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29754524_29754679:SVIL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 32141460 T/C 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32141445_32141525:ARHGAP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 32323591 G/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:G G T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 T:G T G 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 51585425 C/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 31 0 31 14.4466282818978 0 14.4466282818978 G G 10 0.533979732842008 5.49399198201433e-09 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 64913646 T/C 1 24 21 45 11.1844864117918 11.2135743896822 -0.0290879778903577 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64913271_64914783:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64913271_64914783:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64913522_64913978:NRBF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 22 19 41 10.2524458774758 10.1456149239982 0.106830953477674 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 5 25 30 2.33010133578996 13.3494933210502 -11.0193919852602 C:G G C 10 0.533979732842008 5.82896626185659e-05 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 66 56 122 30.7573376324275 29.9028650391524 0.85447259327503 A:T A T 10 0.533979732842008 0.927781352658411 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 69651125 A/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G A G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 70666712 A/G 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:G A G 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70666467_70666763:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000483593:exon_70666467_70666763:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000471475:exon_70666467_70666763:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000475535:exon_70666467_70666763:DDX50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 37 20 57 17.2427498848457 10.6795946568402 6.56315522800555 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0855655687917482 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 30 33 63 13.9806080147398 17.6213311837863 -3.6407231690465 T:C C T 10 0.533979732842008 0.37854219242067 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 71880858 A/G 1 12 10 22 5.5922432058959 5.33979732842008 0.252445877475825 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71880848_71880967:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71880848_71880967:AIFM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 72307101 C/T 0 0 12 12 0 6.4077567941041 -6.4077567941041 T C T 10 0.533979732842008 0.000104919848328074 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72307062_72307202:KIAA1274 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 72326400 G/A 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72326337_72326644:KIAA1274 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 73577267 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74886598 C/G 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 C:G C G 10 0.533979732842008 0.816539050312805 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74890449 T/A 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:T T A 10 0.533979732842008 0.485753313180244 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 65 55 120 30.2913173652695 29.3688853063104 0.922432058959046 T:C T C 10 0.533979732842008 0.927161199898705 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 27 14 41 12.5825472132658 7.47571625978811 5.10683095347767 T:C T C 10 0.533979732842008 0.119299094209677 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 18 7 25 8.38836480884386 3.73785812989406 4.6505066789498 T:C C T 10 0.533979732842008 0.07181596673462 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74899111 A/G 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 A:G A G 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 16 11 27 7.45632427452787 5.87377706126209 1.58254721326579 C:G C G 10 0.533979732842008 0.569328009953207 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74912004 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 T:C C T 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 26 17 43 12.1165269461078 9.07765545831414 3.03887148779366 A:G A G 10 0.533979732842008 0.364494136625054 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75527708 A/G 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75527595_75527765:SEC24C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75530013 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75559077 G/A 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 A:C C A 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 81072402 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81072399_81076276:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81072399_81076285:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000446377:exon_81072399_81073442:ZMIZ1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 66 53 119 30.7573376324275 28.3009258406264 2.45641179180106 A:G G A 10 0.533979732842008 0.71341586868988 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 82185750 C/G 1 14 14 28 6.52428374021189 7.47571625978811 -0.951432519576223 C:G C G 10 0.533979732842008 0.850205813298175 ENSG00000122378:ENST00000372188:exon_82185622_82185762:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372187:exon_82185622_82185762:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372185:exon_82185622_82185762:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372181:exon_82185622_82185762:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000394504:exon_82185622_82185762:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000418757:exon_82185622_82185762:C10orf58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 13 3 16 6.0582634730539 1.60193919852602 4.45632427452787 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0414801567890711 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 45 21 66 20.9709120221096 11.2135743896822 9.75733763242748 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0185438888268478 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 25 27 52 11.6505066789498 14.4174527867342 -2.76694610778441 A:G G A 10 0.533979732842008 0.488127733085493 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 45 45 90 20.9709120221096 24.0290879778904 -3.05817595578071 A:G A G 10 0.533979732842008 0.527918288003836 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 26 23 49 12.1165269461078 12.2815338553662 -0.165006909258389 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 15 13 28 6.99030400736988 6.9417365269461 0.0485674804237775 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 37 18 55 17.2427498848457 9.61163519115614 7.63111469368956 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0426071684857193 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 45 24 69 20.9709120221096 12.8155135882082 8.15539843390145 A:G A G 10 0.533979732842008 0.053520045001728 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 C:G G C 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 96106240 G/C 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 C:G G C 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96106233_96106313:NOC3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 96305729 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 44 44 88 20.5048917549517 23.4951082450483 -2.9902164900967 A:C A C 10 0.533979732842008 0.523875438878472 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 11 30 41 5.12622293873791 16.0193919852602 -10.8931690465223 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0008002966220422 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 97983526 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 97987144 C/G 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 C:G C G 10 0.533979732842008 0.400977756319596 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 21 26 47 9.78642561031783 13.8834730538922 -4.09704744357437 A:G A G 10 0.533979732842008 0.244808964628374 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 24 24 48 11.1844864117918 12.8155135882082 -1.63102717641638 T:C C T 10 0.533979732842008 0.66620018596589 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 22 25 47 10.2524458774758 13.3494933210502 -3.09704744357437 T:C C T 10 0.533979732842008 0.383444337920977 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 19 20 39 8.85438507600185 10.6795946568402 -1.82520958083831 A:G G A 10 0.533979732842008 0.631091842210954 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:C A C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 102005620 C/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C C T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466408:exon_102005556_102005873:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102005557_102005670:CWF19L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 102016044 C/T 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000473842:exon_102016019_102016233:CWF19L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 95 52 147 44.2719253800092 27.7669461077844 16.5049792722248 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00631748763192983 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 20 28 48 9.32040534315984 14.9514325195762 -5.63102717641638 A:G A G 10 0.533979732842008 0.112545672875110 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 104163569 G/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G G A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 23 6 29 10.7184661446338 3.20387839705205 7.51458774758177 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00490033533440932 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.541075078613172 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 45 36 81 20.9709120221096 19.2232703823123 1.74764163979736 A:C A C 10 0.533979732842008 0.739034281258313 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 21 19 40 9.78642561031783 10.1456149239982 -0.359189313680318 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 112362387 C/T 1 28 31 59 13.0485674804238 16.5533717181022 -3.50480423767847 T:C C T 10 0.533979732842008 0.364720574142017 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112362232_112362423:SMC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 115885779 G/A 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115885645_115885864:C10orf118 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 4 13 17 1.86408106863197 6.9417365269461 -5.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0150653116930916 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 303 268 571 141.204140948872 143.106568401658 -1.90242745278655 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.899876434593319 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 264 255 519 123.02935052971 136.164831874712 -13.1354813450021 C:G G C 10 0.533979732842008 0.252851584643901 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 164 126 290 76.4273238139107 67.281446338093 9.1458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 0.289848131081367 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 72 71 143 33.5534592353754 37.9125610317826 -4.35910179640714 T:C:G G C 10 0.533979732842008 0.502720660331653 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 30 45 75 13.9806080147398 24.0290879778904 -10.0484799631506 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0207850635531982 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 33 31 64 15.3786688162137 16.5533717181022 -1.17470290188851 A:G G A 10 0.533979732842008 0.802888084904212 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 22 15 37 10.2524458774758 8.00969599263012 2.24274988484571 T:C T C 10 0.533979732842008 0.512240128551892 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 16 19 35 7.45632427452787 10.1456149239982 -2.68929064947028 A:G A G 10 0.533979732842008 0.399437688722377 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129903592 G/A 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 A:G G A 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:T T A 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129906903 C/T 1 59 46 105 27.4951957623215 24.5630677107324 2.93212805158916 T:C C T 10 0.533979732842008 0.625057184192135 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 58 56 114 27.0291754951635 29.9028650391524 -2.87368954398891 T:C C T 10 0.533979732842008 0.639041708793435 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 13 16 29 6.0582634730539 8.54367572547213 -2.48541225241823 T:C C T 10 0.533979732842008 0.360156273349282 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 31 40 71 14.4466282818978 21.3591893136803 -6.91256103178256 C:G G C 10 0.533979732842008 0.121458405326311 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 29 3 32 13.5145877475818 1.60193919852602 11.9126485490557 A:G A G 10 0.533979732842008 8.787737061955e-06 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 27 3 30 12.5825472132658 1.60193919852602 10.9806080147398 C:G C G 10 0.533979732842008 2.65518397919251e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 24 4 28 11.1844864117918 2.13591893136803 9.04856748042378 T:C T C 10 0.533979732842008 0.000459324756848078 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 26 11 37 12.1165269461078 5.87377706126209 6.24274988484571 T:G G T 10 0.533979732842008 0.047248252232637 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G A G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 127 116 243 59.184573929065 61.9416490096729 -2.75707508060793 A:C C A 10 0.533979732842008 0.747998915366135 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 98 75 173 45.6699861814832 40.0484799631506 5.62150621833263 T:C T C 10 0.533979732842008 0.402846219727078 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135076758 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 7 14 21 3.26214187010594 7.47571625978811 -4.21357438968217 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0800441681151879 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:G A G 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 16 18 34 7.45632427452787 9.61163519115614 -2.15531091662827 A:G A G 10 0.533979732842008 0.494805495350407 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 14 17 31 6.52428374021189 9.07765545831414 -2.55337171810225 A:G G A 10 0.533979732842008 0.373773724713525 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 A:G G A 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 10 135197680 G/A 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135197628_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135197649_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135197464_135197716:PAOX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 224204 C/T 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_224078_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529937:exon_224066_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_224078_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_224078_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_224078_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_224078_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000324945:exon_224066_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_224090_224239:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_224167_224239:SIRT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G A G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 294119 C/T 1 49 62 111 22.8349930907416 33.1067434362045 -10.2717503454629 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.0568313138333119 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 294375 C/T 1 41 40 81 19.1068309534777 21.3591893136803 -2.25235836020264 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.656610314576045 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294321_294478:ATHL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 36 26 62 16.7767296176877 13.8834730538922 2.89325656379551 A:G A G 10 0.533979732842008 0.525050949008133 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 374 359 733 174.291579917089 191.698724090281 -17.4071441731918 A:G A G 10 0.533979732842008 0.208104317214120 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 0 0 13 13 0 6.9417365269461 -6.9417365269461 G A G 10 0.533979732842008 4.88947757480249e-05 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 488601 C/T 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_488529_488647:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527325:exon_488529_488647:PTDSS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 760139 A/T 1 147 151 298 68.5049792722248 80.6309396591432 -12.1259603869184 A:T A T 10 0.533979732842008 0.163726035326619 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_760122_760253:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528070:exon_760122_760253:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_760122_760253:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530440:exon_760122_760253:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530119:exon_760122_760965:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000533796:exon_760122_760257:TALDO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:G A G 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 16 9 25 7.45632427452787 4.80581759557807 2.6505066789498 T:C C T 10 0.533979732842008 0.321584955566111 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 822588 C/T 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000531923:exon_822016_822606:PNPLA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 A:C:G C G 10 0.533979732842008 0.541075078613172 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 2356823 C/T 0 163 0 163 75.9613035467527 0 75.9613035467527 C C 10 0.533979732842008 5.49059617063754e-45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 24 15 39 11.1844864117918 8.00969599263012 3.17479041916169 T:C C T 10 0.533979732842008 0.338652293818719 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 16 15 31 7.45632427452787 8.00969599263012 -0.553371718102246 A:C C A 10 0.533979732842008 0.859027851711374 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 41 54 95 19.1068309534777 28.8349055734684 -9.72807461999075 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0505238436600071 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 107 76 183 49.8641685859051 40.5824596959926 9.28170888991254 C:G G C 10 0.533979732842008 0.182408322870003 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G G A 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 1 21 22 0.466020267157992 11.2135743896822 -10.7475541225242 A:G G A 10 0.533979732842008 2.34129504248696e-06 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 1 10 11 0.466020267157992 5.33979732842008 -4.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00406923808209847 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 15 15 30 6.99030400736988 8.00969599263012 -1.01939198526024 A:G G A 10 0.533979732842008 0.718610377950308 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 13408159 A/C 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:C A C 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000133794:ENST00000389707:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000401424:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403290:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000361003:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000389708:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403510:exon_13408143_13408810:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000339640:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403482:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000524392:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000472842:exon_13408143_13408810:ARNTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 15 19 34 6.99030400736988 10.1456149239982 -3.15531091662827 A:G A G 10 0.533979732842008 0.305253935969650 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 T:C C T 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 11 17 28 5.12622293873791 9.07765545831414 -3.95143251957622 A:G G A 10 0.533979732842008 0.183910224836621 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 20529886 G/A 1 13 21 34 6.0582634730539 11.2135743896822 -5.15531091662827 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0863065025878997 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 20 21 41 9.32040534315984 11.2135743896822 -1.89316904652233 T:G T G 10 0.533979732842008 0.639269374263766 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 28057820 C/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C C T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G G A 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 43515495 A/T 1 16 11 27 7.45632427452787 5.87377706126209 1.58254721326579 A:T A T 10 0.533979732842008 0.569328009953207 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43515323_43516483:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43515323_43516477:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43515323_43515511:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000529140:exon_43515323_43515633:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533072:exon_43515323_43516483:TTC17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 30 22 52 13.9806080147398 11.7475541225242 2.23305389221559 C:G C G 10 0.533979732842008 0.579933642266362 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 28 25 53 13.0485674804238 13.3494933210502 -0.300925840626421 T:C:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 26 29 55 12.1165269461078 15.4854122524182 -3.36888530631044 T:C C T 10 0.533979732842008 0.417843579647916 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 87 108 195 40.5437632427453 57.6698111469369 -17.1260479041916 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0146274383891995 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 47772545 T/C 1 51 49 100 23.7670336250576 26.1650069092584 -2.39797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 0.688707881423362 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47772468_47772588:FNBP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 57569563 C/T 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533189:exon_57569205_57569596:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533667:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527467:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000531014:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526772:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000525902:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527599:exon_57569467_57569668:CTNND1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 25 33 58 11.6505066789498 17.6213311837863 -5.97082450483646 C:G C G 10 0.533979732842008 0.147052955257356 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 26 13 39 12.1165269461078 6.9417365269461 5.17479041916169 A:G A G 10 0.533979732842008 0.109292104830820 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 65 61 126 30.2913173652695 32.5727637033625 -2.281446338093 A:G G A 10 0.533979732842008 0.721260913231095 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 25 33 58 11.6505066789498 17.6213311837863 -5.97082450483646 T:C T C 10 0.533979732842008 0.147052955257356 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 17 17 34 7.92234454168586 9.07765545831414 -1.15531091662827 T:C C T 10 0.533979732842008 0.733025840444282 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61133649 G/A 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000149483:ENST00000278826:exon_61133517_61133688:TMEM138;ENSG00000149483:ENST00000451389:exon_61133517_61133688:TMEM138 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 2 12 14 0.932040534315984 6.4077567941041 -5.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00513613100245990 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 61615803 C/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 C:G C G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 62554718 C/T 1 16 1 17 7.45632427452787 0.533979732842008 6.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.000416696240500499 ENSG00000162227:ENST00000294168:exon_62553989_62554814:TAF6L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 63967459 C/T 1 87 90 177 40.5437632427453 48.0581759557807 -7.51441271303541 T:C C T 10 0.533979732842008 0.259548549289075 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63967412_63967508:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63967412_63967508:STIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 63987031 G/C 1 61 37 98 28.4272362966375 19.7572501151543 8.66998618148322 C:G G C 10 0.533979732842008 0.085380559401933 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63986996_63987130:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63986996_63987130:FERMT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 63990541 C/T 1 151 128 279 70.3690603408568 68.349405803777 2.01965453707979 T:C C T 10 0.533979732842008 0.857176167619446 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63990520_63990661:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63990520_63990661:FERMT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64088924 T/C 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.565105757986092 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64109148 G/A 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 16 35 51 7.45632427452787 18.6892906494703 -11.2329663749424 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00181770712231555 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 22 8 30 10.2524458774758 4.27183786273606 5.98060801473976 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0290477471596604 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 13 10 23 6.0582634730539 5.33979732842008 0.718466144633817 T:G T G 10 0.533979732842008 0.836411835071984 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 A:G G A 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 27 21 48 12.5825472132658 11.2135743896822 1.36897282358362 C:G G C 10 0.533979732842008 0.77292167371695 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 67 52 119 31.2233578995855 27.7669461077844 3.45641179180105 T:C T C 10 0.533979732842008 0.581649780394915 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64846569 C/T 1 15 12 27 6.99030400736988 6.4077567941041 0.582547213265785 T:C C T 10 0.533979732842008 0.849719229405915 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64844924_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000524733:exon_64846105_64846659:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65306073 C/T 0 243 0 243 113.242924919392 0 113.242924919392 C C 10 0.533979732842008 6.78536752633674e-67 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65305741_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65305913_65306146:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000528545:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000534462:exon_65305918_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000532290:exon_65305320_65306175:SCYL1;ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65306031_65306702:LTBP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65339027 C/T 1 35 35 70 16.3107093505297 18.6892906494703 -2.37858129894056 T:C C T 10 0.533979732842008 0.632188231847217 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65348725 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348682_65348844:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348682_65348844:EHBP1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 A:G G A 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 15 15 30 6.99030400736988 8.00969599263012 -1.01939198526024 T:G T G 10 0.533979732842008 0.718610377950308 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 28 36 64 13.0485674804238 19.2232703823123 -6.17470290188851 A:G G A 10 0.533979732842008 0.133295034044851 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 A:G G A 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 51 57 108 23.7670336250576 30.4368447719945 -6.66981114693686 A:G G A 10 0.533979732842008 0.210534949619205 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1451 1723 3174 676.195407646247 920.04707968678 -243.851672040533 A:T:G G A 10 0.533979732842008 4.62753872454662e-18 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 12 12 24 5.5922432058959 6.4077567941041 -0.815513588208191 T:C C T 10 0.533979732842008 0.83873335765346 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 19 9 28 8.85438507600185 4.80581759557807 4.04856748042378 A:G G A 10 0.533979732842008 0.134071057634168 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 24 14 38 11.1844864117918 7.47571625978811 3.7087701520037 T:G G T 10 0.533979732842008 0.257171291639676 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 18 18 36 8.38836480884386 9.61163519115614 -1.22327038231229 A:G G A 10 0.533979732842008 0.739647567407739 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 34 31 65 15.8446890833717 16.5533717181022 -0.708682634730518 T:C C T 10 0.533979732842008 0.901383690385633 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 49 39 88 22.8349930907416 20.8252095808383 2.0097835099033 C:G G C 10 0.533979732842008 0.748766266196907 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65824472 C/T 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.339998041946333 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 101 91 192 47.0680469829572 48.5921556886227 -1.52410870566553 A:G G A 10 0.533979732842008 0.828615893962401 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 63 64 127 29.3592768309535 34.1747029018885 -4.81542607093501 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.423725951692973 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 29 42 71 13.5145877475818 22.4271487793643 -8.91256103178256 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0424427672741526 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 24 37 61 11.1844864117918 19.7572501151543 -8.57276370336248 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0293621092557242 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C C T 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 12 10 22 5.5922432058959 5.33979732842008 0.252445877475825 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G A G 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71155129 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71191817 C/T 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 T:C C T 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71192439 C/A 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:C C A 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 111 66 177 51.7282496545371 35.2426623675725 16.4855872869646 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0129243828593911 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 110 69 179 51.2622293873791 36.8446015660985 14.4176278212806 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0356462049675733 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71727422 A/C 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 A A 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 C:G C G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 24 27 51 11.1844864117918 14.4174527867342 -3.23296637494241 C:G G C 10 0.533979732842008 0.401020673484695 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 72420932 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72420915_72421021:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72420915_72421021:ARAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 72535885 C/T 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000435507:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000439504:exon_72533893_72535887:ATG16L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 C:G C G 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 45 31 76 20.9709120221096 16.5533717181022 4.4175403040074 A:G G A 10 0.533979732842008 0.357907837723473 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C T C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 36 51 87 16.7767296176877 27.2329663749424 -10.4562367572547 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0310336040133623 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 34 20 54 15.8446890833717 10.6795946568402 5.16509442653157 T:C T C 10 0.533979732842008 0.173938046893708 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 21 14 35 9.78642561031783 7.47571625978811 2.31070935052972 A:G G A 10 0.533979732842008 0.499706968646814 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 82878197 T/A 1 10 3 13 4.66020267157992 1.60193919852602 3.0582634730539 A:T T A 10 0.533979732842008 0.101966663401288 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82878167_82878350:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82878167_82878350:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82878167_82878350:PCF11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 56 55 111 26.0971349608476 29.3688853063104 -3.27175034546288 T:C C T 10 0.533979732842008 0.568591985472021 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 12 6 18 5.5922432058959 3.20387839705205 2.38836480884386 T:C C T 10 0.533979732842008 0.346018795935265 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 138 251 389 64.3107968678029 134.028912943344 -69.7181160755411 T:C T C 10 0.533979732842008 1.38807142938716e-12 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 65 171 236 30.2913173652695 91.3105343159834 -61.0192169507139 A:C A C 10 0.533979732842008 1.12855780084278e-15 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:C A C 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G A G 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 95555133 A/G 1 23 28 51 10.7184661446338 14.9514325195762 -4.23296637494241 A:G A G 10 0.533979732842008 0.262454688248152 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95555035_95555142:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95555035_95555142:CEP57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 22 16 38 10.2524458774758 8.54367572547213 1.7087701520037 A:G G A 10 0.533979732842008 0.628160935762513 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 104825649 C/T 1 25 21 46 11.6505066789498 11.2135743896822 0.436932289267634 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 10 18 28 4.66020267157992 9.61163519115614 -4.95143251957622 T:C T C 10 0.533979732842008 0.086439244923903 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 107682509 G/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 C:G G C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000110660:ENST00000525815:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000525071:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000265836:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000533664:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000375682:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000429869:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000532513:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000524991:exon_107682393_107682520:SLC35F2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 110118364 A/C 1 20 34 54 9.32040534315984 18.1553109166283 -8.83490557346843 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0197137695891273 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 111953419 A/C 1 64 76 140 29.8252970981115 40.5824596959926 -10.7571625978811 A:C A C 10 0.533979732842008 0.075119853289903 ENSG00000150776:ENST00000420986:exon_111953192_111954858:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393048:exon_111953189_111955872:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000532163:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000280352:exon_111953192_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000524989:exon_111953189_111953669:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393047:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000525785:exon_111953189_111953546:C11orf57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 117152058 C/T 1 22 22 44 10.2524458774758 11.7475541225242 -1.49510824504835 T:C C T 10 0.533979732842008 0.65409277657013 ENSG00000167257:ENST00000531287:exon_117152030_117152120:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000531452:exon_117152030_117152120:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000530849:exon_117152030_117152120:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000300650:exon_117152030_117152120:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000397945:exon_117152030_117152120:RNF214 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 117691405 G/A 1 396 415 811 184.544025794565 221.601589129433 -37.0575633348685 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00919944385097437 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118374647 C/T 1 11 5 16 5.12622293873791 2.66989866421004 2.45632427452787 T:C C T 10 0.533979732842008 0.316611783612569 ENSG00000118058:ENST00000534358:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000359313:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000354520:exon_118373113_118377361:MLL;ENSG00000118058:ENST00000328469:exon_118373113_118377361:MLL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G A G 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118895635 G/A 1 25 21 46 11.6505066789498 11.2135743896822 0.436932289267634 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 24 16 40 11.1844864117918 8.54367572547213 2.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.431924380948287 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 38 38 76 17.7087701520037 20.2912298479963 -2.5824596959926 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.567192146925633 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 8 9 17 3.72816213726394 4.80581759557807 -1.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.634159114777915 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 16 22 38 7.45632427452787 11.7475541225242 -4.2912298479963 A:T T A 10 0.533979732842008 0.193540360253445 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 24 12 36 11.1844864117918 6.4077567941041 4.77672961768771 A:G A G 10 0.533979732842008 0.132745779521213 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 C:G C G 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 125484044 A/G 1 65 54 119 30.2913173652695 28.8349055734684 1.45641179180106 A:G A G 10 0.533979732842008 0.854309541478938 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125483579_125484098:STT3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 126 87 213 58.718553661907 46.4562367572547 12.2623169046523 T:C C T 10 0.533979732842008 0.099253323095885 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 37 25 62 17.2427498848457 13.3494933210502 3.89325656379551 T:C C T 10 0.533979732842008 0.373298886010494 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 44 59 103 20.5048917549517 31.5048042376785 -10.9999124827268 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0375584014712991 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 43 37 80 20.0388714877937 19.7572501151543 0.281621372639364 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 12 7 19 5.5922432058959 3.73785812989406 1.85438507600185 T:C T C 10 0.533979732842008 0.492774658327971 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 20 15 35 9.32040534315984 8.00969599263012 1.31070935052972 A:G G A 10 0.533979732842008 0.735988999370099 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 A:G A G 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 19 10 29 8.85438507600185 5.33979732842008 3.51458774758177 T:C T C 10 0.533979732842008 0.263787165013188 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 2062075 C/T 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 T:C C T 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 31 22 53 14.4466282818978 11.7475541225242 2.69907415937358 A:G A G 10 0.533979732842008 0.493338159132656 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 20 30 50 9.32040534315984 16.0193919852602 -6.6989866421004 A:G G A 10 0.533979732842008 0.06528948352845 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G G A 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 314 117 431 146.33036388761 62.4756287425149 83.8547351450946 T:C:G G T 10 0.533979732842008 1.41946789514950e-16 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6562768 G/C 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 C:G G C 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 83 60 143 38.6796821741133 32.0387839705205 6.64089820359286 A:G A G 10 0.533979732842008 0.276790270393678 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 A:C C A 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 56 48 104 26.0971349608476 25.6310271764164 0.466107784431173 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4603 2850 7453 2145.09128972824 1521.84223859972 623.249051128515 A:T:C:G T C 10 0.533979732842008 5.16874598153654e-48 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4538 3234 7772 2114.79997236297 1726.89045601105 387.909516351914 A:T:C T C 10 0.533979732842008 9.4638245538570e-19 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6702391 C/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 C:G C G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6702257_6702394:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6702257_6702394:CHD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 A:G A G 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 9 13 22 4.19418240442193 6.9417365269461 -2.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.287431649196634 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 8075630 C/G 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 C:G C G 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8075417_8075885:SLC2A3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 15 14 29 6.99030400736988 7.47571625978811 -0.48541225241823 C:G C G 10 0.533979732842008 0.855023454119158 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 34 33 67 15.8446890833717 17.6213311837863 -1.77664210041453 T:C C T 10 0.533979732842008 0.713943360706934 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 12022390 G/A 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_12022358_12022903:ETV6;ENSG00000139083:ENST00000396373:exon_12022358_12022903:ETV6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 17 17 34 7.92234454168586 9.07765545831414 -1.15531091662827 A:T T A 10 0.533979732842008 0.733025840444282 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 20 8 28 9.32040534315984 4.27183786273606 5.04856748042378 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0598582649886792 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 35 47 82 16.3107093505297 25.0970474435744 -8.78633809304466 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0595113110183607 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 22814023 A/G 1 13 14 27 6.0582634730539 7.47571625978811 -1.41745278673421 A:G A G 10 0.533979732842008 0.700482584843573 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 91 62 153 42.4078443113773 33.1067434362045 9.30110087517278 C:G G C 10 0.533979732842008 0.144658139561818 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 A:G A G 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 9 3 12 4.19418240442193 1.60193919852602 2.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157132946742864 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 27143579 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 27788021 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27787843_27788048:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27787843_27788048:PPFIBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 27867706 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 A:G G A 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 31255405 C/T 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31255361_31255461:DDX11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 31944944 G/C 0 31 0 31 14.4466282818978 0 14.4466282818978 G G 10 0.533979732842008 5.49399198201433e-09 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 T:C C T 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 18 11 29 8.38836480884386 5.87377706126209 2.51458774758177 C:G C G 10 0.533979732842008 0.457194054759145 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 48 39 87 22.3689728235836 20.8252095808383 1.54376324274531 A:G A G 10 0.533979732842008 0.748710154777092 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 42792751 C/T 1 40 57 97 18.6408106863197 30.4368447719945 -11.7960340856748 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0189111120652594 ENSG00000134283:ENST00000395580:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000395568:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000432191:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000449194:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000317560:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000337898:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000256678:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000358314:exon_42792656_42792796:PPHLN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 15 14 29 6.99030400736988 7.47571625978811 -0.48541225241823 A:T A T 10 0.533979732842008 0.855023454119158 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 50151977 G/A 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.319762448482123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:T A T 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 11 15 26 5.12622293873791 8.00969599263012 -2.88347305389221 T:C T C 10 0.533979732842008 0.326097105419317 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 53586633 G/A 1 76 97 173 35.4175403040074 51.7960340856748 -16.3784937816674 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0145341695532593 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586475_53586694:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586475_53586694:ITGB7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 27 57 84 12.5825472132658 30.4368447719945 -17.8542975587287 A:G A G 10 0.533979732842008 0.000106514024205181 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56182846 G/C 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 C:G G C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 179 139 318 83.4176278212806 74.2231828650391 9.19444495624147 A:G A G 10 0.533979732842008 0.311991166614156 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56737256 C/A 1 30 13 43 13.9806080147398 6.9417365269461 7.03887148779366 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0327414158839268 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56735384_56737315:STAT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56737257 A/G 1 30 15 45 13.9806080147398 8.00969599263012 5.97091202210964 A:G A G 10 0.533979732842008 0.099187896347851 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56735384_56737315:STAT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 28 20 48 13.0485674804238 10.6795946568402 2.36897282358362 A:G G A 10 0.533979732842008 0.563680486241117 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 T:C C T 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:T T A 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 104 95 199 48.4661077844312 50.7280746199908 -2.26196683555958 T:G G T 10 0.533979732842008 0.776424530858113 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 T:C C T 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 16 12 28 7.45632427452787 6.4077567941041 1.04856748042378 A:G G A 10 0.533979732842008 0.710138043576245 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 25 20 45 11.6505066789498 10.6795946568402 0.970912022109642 A:G A G 10 0.533979732842008 0.881461959585379 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 11 14 25 5.12622293873791 7.47571625978811 -2.3494933210502 T:C T C 10 0.533979732842008 0.423801544226412 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:T A T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 17 14 31 7.92234454168586 7.47571625978811 0.446628281897754 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 93 92 185 43.3398848456933 49.1261354214647 -5.78625057577147 A:G G A 10 0.533979732842008 0.417835482819514 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:G G T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 24 22 46 11.1844864117918 11.7475541225242 -0.563067710732366 A:G G A 10 0.533979732842008 0.883533683479925 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 69980141 G/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 C:G G C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 89 72 161 41.4758037770613 38.4465407646246 3.02926301243672 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.69299213124714 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 14 14 28 6.52428374021189 7.47571625978811 -0.951432519576223 A:C C A 10 0.533979732842008 0.850205813298175 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 A:G A G 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 12 11 23 5.5922432058959 5.87377706126209 -0.281533855366183 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 T:C T C 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 C:G G C 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 20 20 40 9.32040534315984 10.6795946568402 -1.35918931368032 T:C T C 10 0.533979732842008 0.751869891215725 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 90024380 G/C 1 29 30 59 13.5145877475818 16.0193919852602 -2.50480423767847 C:G G C 10 0.533979732842008 0.517526728714328 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90024282_90024422:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90024282_90024422:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90024282_90024422:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90024282_90024422:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90024282_90024422:ATP2B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 95681554 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 95681597 G/A 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 95906603 C/A 1 21 32 53 9.78642561031783 17.0873514509443 -7.30092584062642 A:C C A 10 0.533979732842008 0.053264701682035 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95906577_95906692:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95906577_95906692:METAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 96676330 C/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:C C A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000059758:ENST00000261211:exon_96676287_96676377:CDK17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 52 54 106 24.2330538922156 28.8349055734684 -4.60185168125284 T:C T C 10 0.533979732842008 0.382263802726299 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 55 59 114 25.6311146936896 31.5048042376785 -5.87368954398891 T:C C T 10 0.533979732842008 0.301841438367582 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 19 10 29 8.85438507600185 5.33979732842008 3.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 0.263787165013188 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 15 12 27 6.99030400736988 6.4077567941041 0.582547213265785 A:T T A 10 0.533979732842008 0.849719229405915 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.541075078613172 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 9 23 32 4.19418240442193 12.2815338553662 -8.08735145094425 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00438519577501868 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:C A C 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 C:G G C 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 C:G G C 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 112110489 T/C 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 T:C T C 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112110465_112110578:BRAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 112241766 G/A 1 188 99 287 87.6118102257025 52.8639935513588 34.7478166743437 A:G G A 10 0.533979732842008 4.11059982242370e-05 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112241663_112241777:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112241663_112241777:ALDH2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 139 106 245 64.7768171349609 56.6018516812528 8.17496545370805 A:G G A 10 0.533979732842008 0.306032393672464 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 7 13 20 3.26214187010594 6.9417365269461 -3.67959465684016 A:G G A 10 0.533979732842008 0.118092054429731 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 106 15 121 49.3981483187472 8.00969599263012 41.388452326117 A:G G A 10 0.533979732842008 1.16498099819090e-15 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 113 22 135 52.6602901888531 11.7475541225242 40.9127360663289 C:G G C 10 0.533979732842008 1.43642869728894e-13 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 113612562 G/A 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 A:G G A 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113612445_113612576:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113612445_113612576:DDX54 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 117217141 T/C 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C T C 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000135119:ENST00000257575:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000407967:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117217000_117217153:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000403793:exon_117217000_117217153:RNFT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120565821 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120575528 T/G 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C:G T G 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575349_120575618:GCN1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120575840 C/T 0 21 0 21 9.78642561031783 0 9.78642561031783 C C 10 0.533979732842008 2.00556229209642e-06 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575705_120575848:GCN1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120637199 G/A 1 514 561 1075 239.534417319208 299.562630124366 -60.0282128051586 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.000271258757756435 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120637113_120637288:RPLP0 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 A:G A G 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121174938 C/T 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 11 25 36 5.12622293873791 13.3494933210502 -8.22327038231229 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0070017963297412 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:T T A 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121840634 T/C 1 26 17 43 12.1165269461078 9.07765545831414 3.03887148779366 T:C T C 10 0.533979732842008 0.364494136625054 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 45 43 88 20.9709120221096 22.9611285122063 -1.9902164900967 A:G A G 10 0.533979732842008 0.67094207470673 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 122693081 C/T 1 32 29 61 14.9126485490557 15.4854122524182 -0.572763703362485 T:C C T 10 0.533979732842008 0.898531735005664 ENSG00000184047:ENST00000413918:exon_122692210_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000353548:exon_122692216_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000443649:exon_122692216_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000464942:exon_122692314_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000342392:exon_122692321_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000267169:exon_122692323_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000439489:exon_122692863_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000474004:exon_122692959_122693124:DIABLO HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 24 23 47 11.1844864117918 12.2815338553662 -1.09704744357437 C:G G C 10 0.533979732842008 0.771625880939856 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 122991478 C/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 C:G C G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000111011:ENST00000531389:exon_122991425_122991800:RSRC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 17 12 29 7.92234454168586 6.4077567941041 1.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 0.710422976957767 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 123664514 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 2 17 19 0.932040534315984 9.07765545831414 -8.14561492399815 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00024080558903045 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 30 21 51 13.9806080147398 11.2135743896822 2.76703362505759 A:G G A 10 0.533979732842008 0.484366751571366 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:T T A 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 10 13 23 4.66020267157992 6.9417365269461 -2.28153385536618 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.40522543664051 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 29 48 77 13.5145877475818 25.6310271764164 -12.1164394288346 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00600537568829497 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 132416813 G/A 1 13 6 19 6.0582634730539 3.20387839705205 2.85438507600185 A:G G A 10 0.533979732842008 0.251038003296366 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132416720_132416857:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132416720_132416857:PUS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 34 25 59 15.8446890833717 13.3494933210502 2.49519576232153 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.602088824051317 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133277835 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 38 25 63 17.7087701520037 13.3494933210502 4.3592768309535 T:C C T 10 0.533979732842008 0.312777480488053 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 10 1 11 4.66020267157992 0.533979732842008 4.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0137307529593215 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133435793 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 20412992 A/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:T A T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 20426036 A/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G A G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 78 0 78 36.3495808383234 0 36.3495808383234 C C 10 0.533979732842008 6.13490939606656e-22 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 22178258 C/T 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22178078_22178353:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22178078_22178304:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22178078_22178320:EFHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 23929095 T/C 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 23 16 39 10.7184661446338 8.54367572547213 2.17479041916169 T:C T C 10 0.533979732842008 0.524079805525241 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 28009851 G/A 1 87 100 187 40.5437632427453 53.3979732842008 -12.8542100414555 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.0666643791027195 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 123 161 284 57.320492860433 85.9707369875633 -28.6502441271303 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000683909530849853 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 129 157 286 60.116614463381 83.8348180561952 -23.7182035928143 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.00528795532042436 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 21 12 33 9.78642561031783 6.4077567941041 3.37866881621374 C:G C G 10 0.533979732842008 0.295659016343474 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 37569684 C/T 1 11 5 16 5.12622293873791 2.66989866421004 2.45632427452787 T:C C T 10 0.533979732842008 0.316611783612569 ENSG00000120697:ENST00000443765:exon_37569562_37569733:ALG5;ENSG00000120697:ENST00000239891:exon_37569562_37569733:ALG5;ENSG00000120697:ENST00000413537:exon_37569562_37569733:ALG5;ENSG00000120697:ENST00000496689:exon_37569562_37569733:ALG5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 18 11 29 8.38836480884386 5.87377706126209 2.51458774758177 A:G A G 10 0.533979732842008 0.457194054759145 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 35 28 63 16.3107093505297 14.9514325195762 1.3592768309535 A:C A C 10 0.533979732842008 0.80103783109484 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 13 0 13 6.0582634730539 0 6.0582634730539 G G 10 0.533979732842008 0.000335855234844135 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 11 3 14 5.12622293873791 1.60193919852602 3.52428374021189 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0653098505589489 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G A G 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 22 15 37 10.2524458774758 8.00969599263012 2.24274988484571 A:G A G 10 0.533979732842008 0.512240128551892 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 244 188 432 113.70894518655 100.388189774298 13.3207554122526 A:G G A 10 0.533979732842008 0.20993470989772 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 51943338 G/C 1 12 7 19 5.5922432058959 3.73785812989406 1.85438507600185 C:G G C 10 0.533979732842008 0.492774658327971 ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000425000:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000463928:exon_51943075_51943446:INTS6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 15 7 22 6.99030400736988 3.73785812989406 3.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.201587902311626 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 32 24 56 14.9126485490557 12.8155135882082 2.09713496084755 A:G G A 10 0.533979732842008 0.594988964303431 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 C:G G C 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 77581712 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000005812:ENST00000355619:exon_77579389_77581923:FBXL3;ENSG00000005812:ENST00000417323:exon_77581700_77581923:FBXL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 22 26 48 10.2524458774758 13.8834730538922 -3.63102717641638 T:C C T 10 0.533979732842008 0.313599385414578 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 96443206 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000102580:ENST00000376795:exon_96443127_96443301:DNAJC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 98645253 A/G 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 132 191 323 61.514675264855 101.990128972824 -40.4754537079686 T:C C T 10 0.533979732842008 7.37341883272738e-06 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 99947309 C/A 1 160 223 383 74.5632427452787 119.077480423768 -44.514237678489 A:C C A 10 0.533979732842008 6.0231658252736e-06 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 201 158 359 93.6700736987564 84.3687977890373 9.30127590971914 C:G G C 10 0.533979732842008 0.341135149968185 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 111371892 G/A 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000153487:ENST00000338450:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000333219:exon_111371576_111373421:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375775:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375777:exon_111371576_111373420:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375774:exon_111371576_111373418:ING1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 111532212 G/C 1 34 17 51 15.8446890833717 9.07765545831414 6.76703362505759 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0675703672326389 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 113889474 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 27 29 56 12.5825472132658 15.4854122524182 -2.90286503915245 T:C T C 10 0.533979732842008 0.503472467249471 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 16 10 26 7.45632427452787 5.33979732842008 2.11652694610779 T:C T C 10 0.533979732842008 0.438216520885157 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 111 106 217 51.7282496545371 56.6018516812528 -4.87360202671572 T:G T G 10 0.533979732842008 0.54041939817967 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 68 49 117 31.6893781667435 26.1650069092584 5.52437125748507 C:G G C 10 0.533979732842008 0.310095142724455 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21464336 T/C 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.656538220866779 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 17 18 35 7.92234454168586 9.61163519115614 -1.68929064947028 C:G C G 10 0.533979732842008 0.613477751766752 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21829404 T/C 1 37 31 68 17.2427498848457 16.5533717181022 0.68937816674346 T:C T C 10 0.533979732842008 0.90370658095824 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 17 18 35 7.92234454168586 9.61163519115614 -1.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.613477751766752 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 16 21 37 7.45632427452787 11.2135743896822 -3.75725011515429 A:G G A 10 0.533979732842008 0.249656816699115 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 70 67 137 32.6214187010594 35.7766421004145 -3.15522339935509 A:G A G 10 0.533979732842008 0.608064860789642 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 7 16 23 3.26214187010594 8.54367572547213 -5.28153385536618 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0351604382197583 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23012178 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 103 58 161 48.0000875172732 30.9708245048365 17.0292630124367 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00717649566183041 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 107 85 192 49.8641685859051 45.3882772915707 4.47589129433447 T:C C T 10 0.533979732842008 0.562922407699575 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 125 95 220 58.252533394749 50.7280746199908 7.52445877475825 C:G G C 10 0.533979732842008 0.311839327977984 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 135 84 219 62.9127360663289 44.8542975587287 18.0584385076003 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0147198169634948 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 95 82 177 44.2719253800092 43.7863380930446 0.485587286964595 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 264 239 503 123.02935052971 127.62115614924 -4.59180561952999 A:T:G T A 10 0.533979732842008 0.687729297885098 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23370908 G/T 1 11 11 22 5.12622293873791 5.87377706126209 -0.747554122524175 T:G G T 10 0.533979732842008 0.832114988289712 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23369855_23370942:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23369855_23370942:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23369855_23370942:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23369855_23370942:RBM23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 T:C:G G C 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23467664 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397377:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397376:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23467636_23468365:C14orf93 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:C C A 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24033070 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 A:G A G 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 22 8 30 10.2524458774758 4.27183786273606 5.98060801473976 A:T A T 10 0.533979732842008 0.0290477471596604 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24567508 T/C 1 12 12 24 5.5922432058959 6.4077567941041 -0.815513588208191 T:C T C 10 0.533979732842008 0.83873335765346 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24569418 A/G 1 37 21 58 17.2427498848457 11.2135743896822 6.02917549516354 A:G A G 10 0.533979732842008 0.116340247055692 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 953 955 1908 444.117314601566 509.950644864118 -65.8333302625512 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.0026394730045685 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 14 29 43 6.52428374021189 15.4854122524182 -8.96112851220634 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00857748648801904 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 14 21 35 6.52428374021189 11.2135743896822 -4.68929064947028 C:G G C 10 0.533979732842008 0.128108137753276 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 62 18 80 28.8932565637955 9.61163519115614 19.2816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 1.41375535740207e-05 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24761467 G/T 1 48 8 56 22.3689728235836 4.27183786273606 18.0971349608476 T:G G T 10 0.533979732842008 5.47108870228697e-07 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24761390_24761536:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24761390_24761536:DHRS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 T:G G T 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 31380191 T/G 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:G T G 10 0.533979732842008 0.35504598383173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 14 5 19 6.52428374021189 2.66989866421004 3.85438507600185 A:G G A 10 0.533979732842008 0.105845390407870 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 24 39 63 11.1844864117918 20.8252095808383 -9.6407231690465 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0162634394214924 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 19 20 39 8.85438507600185 10.6795946568402 -1.82520958083831 A:G A G 10 0.533979732842008 0.631091842210954 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 82 102 184 38.2136619069554 54.4659327498848 -16.2522708429295 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0179070497939867 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 9 13 22 4.19418240442193 6.9417365269461 -2.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.287431649196634 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 18 10 28 8.38836480884386 5.33979732842008 3.04856748042378 A:G G A 10 0.533979732842008 0.262892700324969 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 50269401 T/C 1 23 25 48 10.7184661446338 13.3494933210502 -2.63102717641638 T:C T C 10 0.533979732842008 0.471967020861146 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50269387_50269445:SDCCAG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 16 10 26 7.45632427452787 5.33979732842008 2.11652694610779 T:C C T 10 0.533979732842008 0.438216520885157 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 50750577 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51190355 C/T 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51186481_51190390:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51186481_51190390:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51186538_51190390:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51188215_51190390:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51188215_51190390:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 39 53 92 18.1747904191617 28.3009258406264 -10.1261354214647 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0366635101826272 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 43 44 87 20.0388714877937 23.4951082450483 -3.45623675725469 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.519318582048287 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 T:C C T 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:G T G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 13 10 23 6.0582634730539 5.33979732842008 0.718466144633817 A:G A G 10 0.533979732842008 0.836411835071984 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 55243209 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000020577:ENST00000305831:exon_55243132_55243258:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000357634:exon_55243132_55243258:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000251091:exon_55243132_55243258:SAMD4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 19 18 37 8.85438507600185 9.61163519115614 -0.757250115154294 T:C C T 10 0.533979732842008 0.869707057440637 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 55864130 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000126775:ENST00000247178:exon_55864090_55864152:ATG14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 73 78 151 34.0194795025334 41.6504191616766 -7.6309396591432 A:G A G 10 0.533979732842008 0.221766676383319 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 56103882 A/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 28 39 67 13.0485674804238 20.8252095808383 -7.77664210041453 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0658495179123919 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 48 52 100 22.3689728235836 27.7669461077844 -5.39797328420079 A:G A G 10 0.533979732842008 0.316245897151913 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C C T 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 17 24 41 7.92234454168586 12.8155135882082 -4.89316904652233 A:G A G 10 0.533979732842008 0.158229703534358 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 30 31 61 13.9806080147398 16.5533717181022 -2.57276370336249 T:C T C 10 0.533979732842008 0.523574028194959 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64494278 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64494202_64494511:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64496749 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 A:G G A 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64498037 G/A 1 13 2 15 6.0582634730539 1.06795946568402 4.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0093536109080249 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64519035 A/G 1 11 19 30 5.12622293873791 10.1456149239982 -5.01939198526024 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0697985086582103 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 8 21 29 3.72816213726394 11.2135743896822 -7.48541225241823 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00798617579921449 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 C:G G C 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 68156965 T/C 1 14 18 32 6.52428374021189 9.61163519115614 -3.08735145094425 T:C T C 10 0.533979732842008 0.29217901070623 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68156929_68157138:RDH11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 73412739 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 73422350 T/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:G T G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73422231_73422404:DCAF4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 73425462 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 74036216 A/G 1 15 18 33 6.99030400736988 9.61163519115614 -2.62133118378626 A:G A G 10 0.533979732842008 0.386860760235644 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 76249524 A/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:C A C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76249490_76249873:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76249490_76249873:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000418433:exon_76249490_76249873:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76249490_76249873:TTLL5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 9 15 24 4.19418240442193 8.00969599263012 -3.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.151629104615028 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G G A 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 77795520 A/C 1 17 11 28 7.92234454168586 5.87377706126209 2.04856748042378 A:T:C A C 10 0.533979732842008 0.456589737565831 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77795466_77795544:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77795466_77795544:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77795466_77795544:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77795466_77795544:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77795466_77795544:GSTZ1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 79 74 153 36.8156011054814 39.5145002303086 -2.69889912482721 A:C C A 10 0.533979732842008 0.685773288410272 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 26 54 80 12.1165269461078 28.8349055734684 -16.7183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.000188640483745796 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 91639724 T/C 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91639633_91639747:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91639633_91639747:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91639633_91639780:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519994:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91639633_91639783:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91639633_91639783:C14orf159 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 18 26 44 8.38836480884386 13.8834730538922 -5.49510824504835 T:C T C 10 0.533979732842008 0.129825636560099 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 91779520 C/T 1 16 14 30 7.45632427452787 7.47571625978811 -0.0193919852602384 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91779424_91780494:CCDC88C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 91792386 A/G 1 12 21 33 5.5922432058959 11.2135743896822 -5.62133118378626 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0555024767619246 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91792254_91792400:CCDC88C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 A:G A G 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 T:C C T 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 11 3 14 5.12622293873791 1.60193919852602 3.52428374021189 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0653098505589489 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 92559678 G/C 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 C:G G C 10 0.533979732842008 0.243831320121880 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 6 14 20 2.79612160294795 7.47571625978811 -4.67959465684016 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0432899652170152 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 93118674 G/A 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 93650465 A/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000165943:ENST00000298894:exon_93648542_93650707:MOAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 65 60 125 30.2913173652695 32.0387839705205 -1.74746660525099 T:C T C 10 0.533979732842008 0.788254114002398 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 37 38 75 17.2427498848457 20.2912298479963 -3.04847996315059 T:C C T 10 0.533979732842008 0.48973340867015 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 100609972 G/A 1 11 15 26 5.12622293873791 8.00969599263012 -2.88347305389221 A:G G A 10 0.533979732842008 0.326097105419317 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 19 27 46 8.85438507600185 14.4174527867342 -5.56306771073237 T:C T C 10 0.533979732842008 0.105834158591866 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102551777 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G G A 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 23 17 40 10.7184661446338 9.07765545831414 1.64081068631968 T:C C T 10 0.533979732842008 0.637585373695093 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 92 54 146 42.8738645785353 28.8349055734684 14.0389590050668 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0202042504589605 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 10 18 28 4.66020267157992 9.61163519115614 -4.95143251957622 T:C T C 10 0.533979732842008 0.086439244923903 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 103931879 A/G 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 7 12 19 3.26214187010594 6.4077567941041 -3.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.171287635630369 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 54 43 97 25.1650944265316 22.9611285122063 2.20396591432523 T:C C T 10 0.533979732842008 0.684825306670747 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 24 15 39 11.1844864117918 8.00969599263012 3.17479041916169 A:G G A 10 0.533979732842008 0.338652293818719 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 105518456 A/C 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 11 12 23 5.12622293873791 6.4077567941041 -1.28153385536618 A:G G A 10 0.533979732842008 0.677805261600565 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 106091355 T/C 0 10 0 10 4.66020267157992 0 4.66020267157992 T T 10 0.533979732842008 0.00236783614240732 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 106204113 C/T 0 62 0 62 28.8932565637955 0 28.8932565637955 C C 10 0.533979732842008 1.98344168661744e-17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 106329478 G/A 1 28 10 38 13.0485674804238 5.33979732842008 7.7087701520037 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0139682148060463 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 C C 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 107170139 A/G 1 14 1 15 6.52428374021189 0.533979732842008 5.99030400736988 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00134608134474668 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 14 107170331 C/T 0 0 9 9 0 4.80581759557807 -4.80581759557807 T C T 10 0.533979732842008 0.00103667646843486 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 14 0 14 6.52428374021189 0 6.52428374021189 A A 10 0.533979732842008 0.000176017025741086 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 22939192 G/A 1 1 9 10 0.466020267157992 4.80581759557807 -4.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00790347837899177 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 C:G G C 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 23006707 C/A 1 38 25 63 17.7087701520037 13.3494933210502 4.3592768309535 A:C C A 10 0.533979732842008 0.312777480488053 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23004684_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23005349_23006855:NIPA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 T:C C T 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 38 56 94 17.7087701520037 29.9028650391524 -12.1940948871487 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0129018075919544 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 44 59 103 20.5048917549517 31.5048042376785 -10.9999124827268 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0375584014712991 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 669 642 1311 311.767558728697 342.814988484569 -31.0474297558724 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.0861643746485592 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 11 18 29 5.12622293873791 9.61163519115614 -4.48541225241823 A:G G A 10 0.533979732842008 0.13509972956433 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 40681773 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40681707_40681812:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40681707_40681812:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40681707_40681812:C15orf23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41377713 G/A 1 11 11 22 5.12622293873791 5.87377706126209 -0.747554122524175 A:G G A 10 0.533979732842008 0.832114988289712 ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41377567_41377781:INO80;ENSG00000128908:ENST00000401393:exon_41377567_41377781:INO80;ENSG00000128908:ENST00000263793:exon_41377567_41377781:INO80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 27 4 31 12.5825472132658 2.13591893136803 10.4466282818978 A:G A G 10 0.533979732842008 9.8177576847822e-05 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 29 3 32 13.5145877475818 1.60193919852602 11.9126485490557 A:C C A 10 0.533979732842008 8.787737061955e-06 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41756912 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C C T 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 41817367 A/G 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G A G 10 0.533979732842008 0.807255222461569 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42139642 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139535_42139721:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139535_42139721:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139535_42139721:PLA2G4B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42193320 C/T 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42190570_42193379:EHD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G A G 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42455579 T/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42455548_42455593:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42455548_42455593:VPS39 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42570718 A/G 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 A:G A G 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000214013:ENST00000440615:exon_42570680_42570788:GANC;ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42570680_42570788:GANC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C C T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 T:G T G 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 43027835 G/T 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:G G T 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43027708_43027879:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43027708_43027877:CDAN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:G T G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 13 21 34 6.0582634730539 11.2135743896822 -5.15531091662827 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0863065025878997 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 44087216 G/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:G G T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44086428_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 144 98 242 67.1069184707509 52.3300138185168 14.7769046522341 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0615671052713964 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 15 25 40 6.99030400736988 13.3494933210502 -6.35918931368032 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0560888582676907 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:C C A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 49170670 C/T 1 133 93 226 61.9806955320129 49.6601151543067 12.3205803777062 T:C C T 10 0.533979732842008 0.109463872005414 ENSG00000255302:ENST00000530028:exon_49170298_49172190:EID1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 50773787 A/G 1 78 71 149 36.3495808383234 37.9125610317826 -1.56298019345919 A:G A G 10 0.533979732842008 0.805935413640247 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50773678_50774262:USP8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 50789423 G/A 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 A:G G A 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000419830:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000396440:exon_50789286_50789428:USP8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C T C 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C T C 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 59186818 C/T 1 5 12 17 2.33010133578996 6.4077567941041 -4.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0537967789851417 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 59516875 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 29 28 57 13.5145877475818 14.9514325195762 -1.43684477199445 T:G T G 10 0.533979732842008 0.790894768278725 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 62165553 T/C 1 9 15 24 4.19418240442193 8.00969599263012 -3.81551358820819 T:C T C 10 0.533979732842008 0.151629104615028 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 62165577 G/A 1 14 17 31 6.52428374021189 9.07765545831414 -2.55337171810225 A:G G A 10 0.533979732842008 0.373773724713525 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 65273399 T/C 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C T C 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 66610984 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 A:G A G 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 43 44 87 20.0388714877937 23.4951082450483 -3.45623675725469 T:G G T 10 0.533979732842008 0.519318582048287 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 57 61 118 26.5631552280055 32.5727637033625 -6.00960847535693 C:G G C 10 0.533979732842008 0.269903773289947 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 29 19 48 13.5145877475818 10.1456149239982 3.36897282358362 A:G G A 10 0.533979732842008 0.386073859155553 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 A:G G A 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 61 52 113 28.4272362966375 27.7669461077844 0.660290188853104 T:C C T 10 0.533979732842008 0.925117723090135 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75091664 G/A 1 71 69 140 33.0874389682174 36.8446015660985 -3.75716259788111 A:G G A 10 0.533979732842008 0.553602879189243 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 A:G A G 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 12 15 27 5.5922432058959 8.00969599263012 -2.41745278673421 T:G T G 10 0.533979732842008 0.441078206442053 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 50 33 83 23.3010133578996 17.6213311837863 5.67968217411334 A:G G A 10 0.533979732842008 0.227262304401427 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 1 36 4 40 16.7767296176877 2.13591893136803 14.6408106863197 A:G G A 10 0.533979732842008 1.31325699174148e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 65 57 122 30.2913173652695 30.4368447719945 -0.145527406724966 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 77322867 C/T 0 10 0 10 4.66020267157992 0 4.66020267157992 C C 10 0.533979732842008 0.00236783614240732 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77322843_77322922:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77322843_77322922:PSTPIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 25 18 43 11.6505066789498 9.61163519115614 2.03887148779366 A:T T A 10 0.533979732842008 0.545918304552552 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 78337303 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78337242_78337410:TBC1D2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 T:C C T 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 78885574 T/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78885434_78887611:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78885434_78887611:CHRNA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 79177460 C/G 1 12 14 26 5.5922432058959 7.47571625978811 -1.88347305389221 C:G C G 10 0.533979732842008 0.556476625412329 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:C A C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 A:G G A 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 28 67 95 13.0485674804238 35.7766421004145 -22.7280746199908 T:C T C 10 0.533979732842008 2.70139383931104e-06 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 110 98 208 51.2622293873791 52.3300138185168 -1.06778443113765 T:C C T 10 0.533979732842008 0.889663305795357 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 72 71 143 33.5534592353754 37.9125610317826 -4.35910179640714 A:C A C 10 0.533979732842008 0.502720660331653 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 53 50 103 24.6990741593736 26.6989866421004 -1.99991248272682 T:C C T 10 0.533979732842008 0.694241538625388 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 73 54 127 34.0194795025334 28.8349055734684 5.18457392906499 A:C C A 10 0.533979732842008 0.374718227347151 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 6 17 23 2.79612160294795 9.07765545831414 -6.28153385536618 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0109291731633137 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 82444663 T/C 1 3 11 14 1.39806080147398 5.87377706126209 -4.47571625978811 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0282342402988014 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G C G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 9 13 22 4.19418240442193 6.9417365269461 -2.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.287431649196634 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 17 20 37 7.92234454168586 10.6795946568402 -2.75725011515429 T:C T C 10 0.533979732842008 0.411526612215418 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 63 52 115 29.3592768309535 27.7669461077844 1.59233072316908 T:C C T 10 0.533979732842008 0.780038432815948 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 56 40 96 26.0971349608476 21.3591893136803 4.73794564716724 T:C C T 10 0.533979732842008 0.358098828303799 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 504 486 990 234.874214647628 259.514150161216 -24.6399355135879 A:G A G 10 0.533979732842008 0.118588230917477 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 89856250 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 143 129 272 66.6408982035929 68.883385536619 -2.24248733302616 T:C T C 10 0.533979732842008 0.808052950237527 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 C:G G C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:G G A 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 19 12 31 8.85438507600185 6.4077567941041 2.44662828189775 A:G G A 10 0.533979732842008 0.472269712150071 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C T C 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 1 1 8 9 0.466020267157992 4.27183786273606 -3.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0152569455067580 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 17 21 38 7.92234454168586 11.2135743896822 -3.2912298479963 A:G G A 10 0.533979732842008 0.330206133141336 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 418342 G/C 1 171 189 360 79.6894656840166 100.92216950714 -21.2327038231229 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0264374783613334 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_418328_418414:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_418335_418414:MRPL28 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 602430 C/T 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 15 6 21 6.99030400736988 3.20387839705205 3.78642561031783 A:G G A 10 0.533979732842008 0.125523307419823 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 27 28 55 12.5825472132658 14.9514325195762 -2.36888530631044 T:G G T 10 0.533979732842008 0.589315220729587 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 C:G C G 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 12 19 31 5.5922432058959 10.1456149239982 -4.55337171810225 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.108100320181541 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 49 33 82 22.8349930907416 17.6213311837863 5.21366190695535 C:G C G 10 0.533979732842008 0.269336621779635 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 T:C T C 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 14 35 49 6.52428374021189 18.6892906494703 -12.1650069092584 A:G A G 10 0.533979732842008 0.000509054745864163 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 137 108 245 63.8447766006449 57.6698111469369 6.17496545370805 T:C C T 10 0.533979732842008 0.442757933884744 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 104 55 159 48.4661077844312 29.3688853063104 19.0972224781207 A:T T A 10 0.533979732842008 0.00244985402348583 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1822159 T/C 1 343 275 618 159.844951635191 146.844426531552 13.0005251036391 T:C T C 10 0.533979732842008 0.313463533338180 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1821891_1822514:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1822526 A/G 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 A:G A G 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 24 24 48 11.1844864117918 12.8155135882082 -1.63102717641638 A:C C A 10 0.533979732842008 0.66620018596589 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 69 47 116 32.1553984339015 25.0970474435744 7.05835099032708 C:G C G 10 0.533979732842008 0.193994824483593 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1877698 C/G 1 22 14 36 10.2524458774758 7.47571625978811 2.77672961768771 A:C:G C G 10 0.533979732842008 0.40554096031008 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 1877913 C/G 1 39 27 66 18.1747904191617 14.4174527867342 3.75733763242747 C:G C G 10 0.533979732842008 0.388976058886676 ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 446 188 634 207.845039152464 100.388189774298 107.456849378167 T:C C T 10 0.533979732842008 3.83968910027869e-18 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 C:G G C 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:C C A 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 46 44 90 21.4369322892676 23.4951082450483 -2.05817595578072 A:C A C 10 0.533979732842008 0.673956045991082 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 58 54 112 27.0291754951635 28.8349055734684 -1.80573007830489 T:C T C 10 0.533979732842008 0.77655916613736 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 C:G C G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 15 13 28 6.99030400736988 6.9417365269461 0.0485674804237775 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 T:C T C 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 41 32 73 19.1068309534777 17.0873514509443 2.01947950253342 T:C C T 10 0.533979732842008 0.725151034602435 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 25 21 46 11.6505066789498 11.2135743896822 0.436932289267634 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 24 20 44 11.1844864117918 10.6795946568402 0.50489175495165 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 8 16 24 3.72816213726394 8.54367572547213 -4.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0640799581168582 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 17 32 49 7.92234454168586 17.0873514509443 -9.16500690925839 A:C A C 10 0.533979732842008 0.00966239808108863 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 3452340 G/A 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G C G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 94 95 189 43.8059051128512 50.7280746199908 -6.92216950713951 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.343263711017947 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 53 41 94 24.6990741593736 21.8931690465223 2.80590511285126 C:G G C 10 0.533979732842008 0.605844116295194 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 T:C T C 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 34 26 60 15.8446890833717 13.8834730538922 1.96121602947952 A:G A G 10 0.533979732842008 0.698260657861279 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 8904954 C/T 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000140650:ENST00000268261:exon_8904936_8905035:PMM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 56 62 118 26.0971349608476 33.1067434362045 -7.00960847535694 A:G A G 10 0.533979732842008 0.197933531597059 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 11940390 T/C 1 161 151 312 75.0292630124367 80.6309396591432 -5.60167664670648 T:C T C 10 0.533979732842008 0.53292251470105 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940358_11940459:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940358_11940459:RSL1D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 12662328 C/G 1 6 25 31 2.79612160294795 13.3494933210502 -10.5533717181022 C:G C G 10 0.533979732842008 0.000185738906643265 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 2 23 25 0.932040534315984 12.2815338553662 -11.3494933210502 T:C C T 10 0.533979732842008 2.3269004557081e-06 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 15133882 G/C 1 21 24 45 9.78642561031783 12.8155135882082 -3.02908797789036 C:G G C 10 0.533979732842008 0.374372346129768 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 15718591 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 15771847 C/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 C:G C G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 6 12 18 2.79612160294795 6.4077567941041 -3.61163519115614 A:C A C 10 0.533979732842008 0.101098748879718 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 18878120 T/C 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485527419132807 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 A:G A G 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 24741686 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 A:T T A 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 11 12 23 5.12622293873791 6.4077567941041 -1.28153385536618 A:G G A 10 0.533979732842008 0.677805261600565 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 50 49 99 23.3010133578996 26.1650069092584 -2.86399355135879 T:C C T 10 0.533979732842008 0.614783186235185 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28181225 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28181071_28181230:XPO6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28510999 C/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:C C A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000197272:ENST00000356897:exon_28510683_28511241:IL27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:C C A 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28847568 G/C 1 52 35 87 24.2330538922156 18.6892906494703 5.54376324274531 C:G G C 10 0.533979732842008 0.239437253925541 ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28847254_28848558:ATXN2L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28909622 G/A 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196296:ENST00000357084:exon_28909554_28909772:ATP2A1;ENSG00000196296:ENST00000395503:exon_28909554_28909772:ATP2A1;ENSG00000196296:ENST00000395498:exon_28909554_28909772:ATP2A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 28944282 C/T 1 69 42 111 32.1553984339015 22.4271487793643 9.72824965453712 T:C C T 10 0.533979732842008 0.070554867639082 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 29675326 A/G 1 117 79 196 54.5243712574851 42.1843988945186 12.3399723629664 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0855684515627944 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 T:G G T 10 0.533979732842008 0.650296058723341 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 30093779 C/G 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 C:G C G 10 0.533979732842008 0.650296058723341 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 30094660 G/A 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 A:G G A 10 0.533979732842008 0.243831320121880 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 30104097 C/T 1 42 34 76 19.5728512206357 18.1553109166283 1.4175403040074 T:C C T 10 0.533979732842008 0.818381402867017 ENSG00000090238:ENST00000398841:exon_30103635_30104120:YPEL3;ENSG00000090238:ENST00000398838:exon_30103637_30104120:YPEL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 30505512 C/T 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 105 106 211 48.9321280515892 56.6018516812528 -7.66972362966367 A:C C A 10 0.533979732842008 0.301072859473551 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 24 13 37 11.1844864117918 6.9417365269461 4.24274988484571 A:G G A 10 0.533979732842008 0.188468199014080 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 48594950 G/A 1 13 5 18 6.0582634730539 2.66989866421004 3.38836480884386 A:G G A 10 0.533979732842008 0.155140017910685 ENSG00000102921:ENST00000262384:exon_48594665_48596355:N4BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 56504579 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56504399_56504703:OGFOD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 56782199 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56782146_56782338:NUP93 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 T:C C T 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 29 26 55 13.5145877475818 13.8834730538922 -0.368885306310437 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C T C 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 57108465 G/C 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 66955953 C/T 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000166592:ENST00000420652:exon_66955582_66956256:RRAD;ENSG00000166592:ENST00000299759:exon_66955588_66956256:RRAD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 67116169 C/T 1 11 5 16 5.12622293873791 2.66989866421004 2.45632427452787 T:C C T 10 0.533979732842008 0.316611783612569 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67116116_67116242:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67116116_67116211:CBFB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 67682157 C/T 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67681955_67682217:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67681955_67682217:RLTPR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 67702375 G/C 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 C:G G C 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000159761:ENST00000403458:exon_67702103_67702660:C16orf86;ENSG00000159761:ENST00000459925:exon_67701199_67702660:C16orf86;ENSG00000159761:ENST00000445068:exon_67702103_67702660:C16orf86 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 68387373 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 35 30 65 16.3107093505297 16.0193919852602 0.291317365269482 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 49 45 94 22.8349930907416 24.0290879778904 -1.19409488714874 A:G G A 10 0.533979732842008 0.836585685773281 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 27 21 48 12.5825472132658 11.2135743896822 1.36897282358362 T:C C T 10 0.533979732842008 0.77292167371695 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:T A T 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 125 144 269 58.252533394749 76.8930815292491 -18.6405481345001 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0237232316630142 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 11 15 26 5.12622293873791 8.00969599263012 -2.88347305389221 A:C C A 10 0.533979732842008 0.326097105419317 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C T C 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 56 0 56 26.0971349608476 0 26.0971349608476 C C 10 0.533979732842008 1.11390765192187e-15 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 8 12 20 3.72816213726394 6.4077567941041 -2.67959465684016 T:C C T 10 0.533979732842008 0.266289964581446 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 T:G G T 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 77775672 A/G 1 4 12 16 1.86408106863197 6.4077567941041 -4.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.025216264141459 ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77775479_77776151:NUDT7;ENSG00000140876:ENST00000437314:exon_77775479_77776151:NUDT7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 137 158 295 63.8447766006449 84.3687977890373 -20.5240211883923 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0194255788451166 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 18 6 24 8.38836480884386 3.20387839705205 5.18448641179181 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0400230053827357 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 81743328 A/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G A G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 0 13 0 13 6.0582634730539 0 6.0582634730539 T T 10 0.533979732842008 0.000335855234844135 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 11 0 11 5.12622293873791 0 5.12622293873791 G G 10 0.533979732842008 0.00123154446071590 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 14 33 47 6.52428374021189 17.6213311837863 -11.0970474435744 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00119972327150347 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 32 19 51 14.9126485490557 10.1456149239982 4.76703362505759 T:C C T 10 0.533979732842008 0.207194276082761 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 1 9 10 0.466020267157992 4.80581759557807 -4.33979732842008 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00790347837899177 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 0 9 0 9 4.19418240442193 0 4.19418240442193 G G 10 0.533979732842008 0.00456625592943765 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 C:G C G 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 827 898 1725 385.398760939659 479.513800092123 -94.1150391524637 A:C:G G A 10 0.533979732842008 6.26962862471166e-06 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 85954801 G/A 1 33 27 60 15.3786688162137 14.4174527867342 0.961216029479523 A:G G A 10 0.533979732842008 0.897200840085073 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 0 12 0 12 5.5922432058959 0 5.5922432058959 G G 10 0.533979732842008 0.000642319381394275 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 4 13 17 1.86408106863197 6.9417365269461 -5.07765545831414 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0150653116930916 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 15 9 24 6.99030400736988 4.80581759557807 2.18448641179181 T:G G T 10 0.533979732842008 0.418245035192846 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 12 12 24 5.5922432058959 6.4077567941041 -0.815513588208191 A:G A G 10 0.533979732842008 0.83873335765346 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 64 44 108 29.8252970981115 23.4951082450483 6.33018885306314 C:G C G 10 0.533979732842008 0.247303722343227 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89180765 A/T 1 15 4 19 6.99030400736988 2.13591893136803 4.85438507600185 A:T A T 10 0.533979732842008 0.0359290132702551 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 9 23 32 4.19418240442193 12.2815338553662 -8.08735145094425 C:G G C 10 0.533979732842008 0.00438519577501868 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 18 73 91 8.38836480884386 38.9805204974666 -30.5921556886227 T:C T C 10 0.533979732842008 5.81004227216882e-11 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C C T 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89882359 T/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:G T G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89882285_89882394:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89882285_89882394:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89882285_89882394:FANCA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89954138 G/C 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 C:G G C 10 0.533979732842008 0.816539050312805 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 42 32 74 19.5728512206357 17.0873514509443 2.48549976969141 A:G G A 10 0.533979732842008 0.641480376696342 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 27 6 33 12.5825472132658 3.20387839705205 9.37866881621374 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00128175614665333 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 71 73 144 33.0874389682174 38.9805204974666 -5.89308152924914 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.358290478507075 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 27 27 54 12.5825472132658 14.4174527867342 -1.83490557346843 T:C C T 10 0.533979732842008 0.682980611562211 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 C:G G C 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:G G T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 10 15 25 4.66020267157992 8.00969599263012 -3.3494933210502 A:G A G 10 0.533979732842008 0.229050670812297 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 1424948 A/G 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 17 5 22 7.92234454168586 2.66989866421004 5.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0310066867364352 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 A:G A G 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 4057981 A/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G A G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000167740:ENST00000301391:exon_4057968_4058154:CYB5D2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 158 177 335 73.6312022109627 94.5144127130354 -20.8832105020727 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.0246220217041343 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 6 14 20 2.79612160294795 7.47571625978811 -4.67959465684016 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0432899652170152 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 22 23 45 10.2524458774758 12.2815338553662 -2.02908797789036 T:C C T 10 0.533979732842008 0.55395111452332 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 117 95 212 54.5243712574851 50.7280746199908 3.79629663749432 T:C C T 10 0.533979732842008 0.630174541920377 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 114 78 192 53.1263104560111 41.6504191616766 11.4758912943345 C:G C G 10 0.533979732842008 0.111282322177177 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 5326178 C/T 1 14 1 15 6.52428374021189 0.533979732842008 5.99030400736988 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00134608134474668 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 1 16 1 17 7.45632427452787 0.533979732842008 6.92234454168586 A:C A C 10 0.533979732842008 0.000416696240500499 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 7416202 G/A 1 28 28 56 13.0485674804238 14.9514325195762 -1.90286503915245 A:G G A 10 0.533979732842008 0.688231759503127 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7416093_7416242:POLR2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 7490231 G/C 1 12 15 27 5.5922432058959 8.00969599263012 -2.41745278673421 C:G G C 10 0.533979732842008 0.441078206442053 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000423172:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490217_7490287:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000396501:exon_7490217_7490335:MPDU1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 8736394 T/C 1 10 39 49 4.66020267157992 20.8252095808383 -16.1650069092584 T:C T C 10 0.533979732842008 4.09526832253150e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 8738575 A/G 1 19 13 32 8.85438507600185 6.9417365269461 1.91264854905575 A:G A G 10 0.533979732842008 0.596065477470417 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 8809075 G/A 1 21 22 43 9.78642561031783 11.7475541225242 -1.96112851220634 A:G G A 10 0.533979732842008 0.647067425847131 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 49 25 74 22.8349930907416 13.3494933210502 9.48549976969141 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0271731435537424 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 9821372 C/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000007237:ENST00000323816:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000396115:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000437099:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000432992:exon_9821318_9821416:GAS7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 11 1 12 5.12622293873791 0.533979732842008 4.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00771302033325379 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 15532208 G/A 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 A:G G A 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 7 23 30 3.26214187010594 12.2815338553662 -9.01939198526024 A:C A C 10 0.533979732842008 0.00139456191719301 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G G A 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 60 49 109 27.9612160294795 26.1650069092584 1.79620912022114 C:G C G 10 0.533979732842008 0.773716600333066 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C T C 10 0.533979732842008 0.824764691466817 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 C:G G C 10 0.533979732842008 0.816539050312805 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 303 342 645 141.204140948872 182.621068631967 -41.4169276830951 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00119551850553940 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 176 228 404 82.0195670198066 121.747379087978 -39.7278120681712 A:G G A 10 0.533979732842008 7.8777215002971e-05 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:G T G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 21 13 34 9.78642561031783 6.9417365269461 2.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.391318244319092 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 T:C T C 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 A:G G A 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 90 104 194 41.9418240442193 55.5338922155688 -13.5920681713495 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0521584688586638 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 20911204 G/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:G G T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000478443:exon_20911183_20911309:USP22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 T T 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 9 0 9 4.19418240442193 0 4.19418240442193 G G 10 0.533979732842008 0.00456625592943765 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 C C 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 17 0 17 7.92234454168586 0 7.92234454168586 C C 10 0.533979732842008 2.56364633924739e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 30 0 30 13.9806080147398 0 13.9806080147398 C C 10 0.533979732842008 1.06836577540344e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 22 0 22 10.2524458774758 0 10.2524458774758 C C 10 0.533979732842008 1.06353780599294e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 17 0 17 7.92234454168586 0 7.92234454168586 C C 10 0.533979732842008 2.56364633924739e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 21 0 21 9.78642561031783 0 9.78642561031783 C C 10 0.533979732842008 2.00556229209642e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 24 0 24 11.1844864117918 0 11.1844864117918 G G 10 0.533979732842008 2.99806432712958e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 42 0 42 19.5728512206357 0 19.5728512206357 G G 10 0.533979732842008 4.17899843711666e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 18 9 27 8.38836480884386 4.80581759557807 3.58254721326579 T:C T C 10 0.533979732842008 0.181858757423827 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 25630388 T/C 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 T:C T C 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000109046:ENST00000487603:exon_25629461_25630661:WSB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 71 55 126 33.0874389682174 29.3688853063104 3.71855366190699 T:C C T 10 0.533979732842008 0.532728762473768 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 26684849 A/G 1 17 12 29 7.92234454168586 6.4077567941041 1.51458774758177 A:G A G 10 0.533979732842008 0.710422976957767 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26684646_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26684670_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26684694_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26684731_26684904:TMEM199 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 30692396 G/T 1 16 14 30 7.45632427452787 7.47571625978811 -0.0193919852602384 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000010244:ENST00000394670:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000394673:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000394679:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000341711:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000321233:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000342555:exon_30692349_30692506:ZNF207 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 53 41 94 24.6990741593736 21.8931690465223 2.80590511285126 T:C C T 10 0.533979732842008 0.605844116295194 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 30696296 G/A 1 49 40 89 22.8349930907416 21.3591893136803 1.47580377706129 A:G G A 10 0.533979732842008 0.831884389434988 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 3 12 15 1.39806080147398 6.4077567941041 -5.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0166220870951606 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 9 1 10 4.19418240442193 0.533979732842008 3.66020267157992 A:T T A 10 0.533979732842008 0.0243520340127106 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 33772550 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 10 3 13 4.66020267157992 1.60193919852602 3.0582634730539 C:G G C 10 0.533979732842008 0.101966663401288 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 34249596 A/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34249581_34249679:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34249581_34249679:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34249581_34249680:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34249482_34249679:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34249485_34249679:RDM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 229 169 398 106.71864117918 90.2425748502993 16.4760663288808 A:G G A 10 0.533979732842008 0.107776473985543 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 8 16 24 3.72816213726394 8.54367572547213 -4.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0640799581168582 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 83 105 188 38.6796821741133 56.0678719484108 -17.3881897742975 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.012750237608342 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 34943719 C/T 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.314411136954313 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 28 12 40 13.0485674804238 6.4077567941041 6.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.039204230264038 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 35378217 C/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:C C A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 4 15 19 1.86408106863197 8.00969599263012 -6.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00518353339436301 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 18 9 27 8.38836480884386 4.80581759557807 3.58254721326579 A:G G A 10 0.533979732842008 0.181858757423827 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 22 6 28 10.2524458774758 3.20387839705205 7.04856748042378 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00757306480938749 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C T C 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40258005 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257754_40258007:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257754_40258007:DHX58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 25 34 59 11.6505066789498 18.1553109166283 -6.50480423767847 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0916309813765031 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 25 23 48 11.6505066789498 12.2815338553662 -0.631027176416382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.885692958356073 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:T A T 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 53 49 102 24.6990741593736 26.1650069092584 -1.46593274988481 A:T A T 10 0.533979732842008 0.842784253376713 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 A:G G A 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 16 5 21 7.45632427452787 2.66989866421004 4.78642561031783 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0472462934188454 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 42427630 T/C 1 80 51 131 37.2816213726394 27.2329663749424 10.048654997697 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0804071957634932 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42427596_42427708:GRN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 9 5 14 4.19418240442193 2.66989866421004 1.52428374021189 C:G G C 10 0.533979732842008 0.593885309282772 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 A:G G A 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 53 60 113 24.6990741593736 32.0387839705205 -7.3397098111469 T:C C T 10 0.533979732842008 0.186734690597491 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 112 78 190 52.1942699216951 41.6504191616766 10.5438507600185 A:G G A 10 0.533979732842008 0.127392739027706 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 17 15 32 7.92234454168586 8.00969599263012 -0.0873514509442543 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 45198343 C/T 1 27 28 55 12.5825472132658 14.9514325195762 -2.36888530631044 T:C C T 10 0.533979732842008 0.589315220729587 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45195069_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45195310_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45196583_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45197352_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45197621_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45198137_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45198246_45198383:CDC27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 45214685 T/C 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C T C 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45214518_45214726:CDC27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 45885687 A/G 1 20 19 39 9.32040534315984 10.1456149239982 -0.82520958083831 A:G A G 10 0.533979732842008 0.87288205177777 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 58 42 100 27.0291754951635 22.4271487793643 4.60202671579921 A:G G A 10 0.533979732842008 0.368798292704209 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 48434610 G/A 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 A:G G A 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48434418_48434613:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48434418_48434613:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48434479_48434613:XYLT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 49365558 C/T 1 86 67 153 40.0777429755873 35.7766421004145 4.30110087517278 T:C C T 10 0.533979732842008 0.517232447961964 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000515179:exon_49365485_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000504660:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000506849:exon_49365390_49365564:UTP18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G A G 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 61771128 C/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 C:G C G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000198909:ENST00000361357:exon_61770909_61773667:MAP3K3;ENSG00000198909:ENST00000361733:exon_61770909_61773667:MAP3K3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 36 31 67 16.7767296176877 16.5533717181022 0.223357899585466 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G A G 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 159 175 334 74.0972224781207 93.4464532473514 -19.3492307692306 A:T T A 10 0.533979732842008 0.0370238984606416 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 67513003 C/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 71027797 C/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 71027833 A/G 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 8 17 25 3.72816213726394 9.07765545831414 -5.3494933210502 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0432299475516737 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 72473553 T/C 1 17 13 30 7.92234454168586 6.9417365269461 0.980608014739762 T:C T C 10 0.533979732842008 0.8552242671935 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 72480288 G/A 1 280 305 585 130.485674804238 162.863818516812 -32.3781437125747 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00794841938594651 ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72480140_72480927:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72480140_72480933:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72480140_72480929:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72480140_72480306:CD300A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 24 35 59 11.1844864117918 18.6892906494703 -7.50480423767847 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0667941600707444 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 114 106 220 53.1263104560111 56.6018516812528 -3.47554122524174 T:C T C 10 0.533979732842008 0.637033047482283 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73205976 T/C 1 17 23 40 7.92234454168586 12.2815338553662 -4.35918931368032 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204634029900131 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73205918_73206080:NUP85 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 54 50 104 25.1650944265316 26.6989866421004 -1.53389221556883 T:C C T 10 0.533979732842008 0.769076878551884 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 30 21 51 13.9806080147398 11.2135743896822 2.76703362505759 C:G G C 10 0.533979732842008 0.484366751571366 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 C:G G C 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73570718 C/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000073350:ENST00000167462:exon_73570691_73570749:LLGL2;ENSG00000073350:ENST00000392550:exon_73570691_73570749:LLGL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 43 47 90 20.0388714877937 25.0970474435744 -5.05817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.292565675606669 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 14 10 24 6.52428374021189 5.33979732842008 1.18448641179181 T:C C T 10 0.533979732842008 0.68626255700618 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 71 83 154 33.0874389682174 44.3203178258867 -11.2328788576692 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0755116317798696 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 40 45 85 18.6408106863197 24.0290879778904 -5.38827729157067 T:C C T 10 0.533979732842008 0.276967759051597 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 84 73 157 39.1457024412713 38.9805204974666 0.165181943804754 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 10 16 26 4.66020267157992 8.54367572547213 -3.88347305389221 T:C T C 10 0.533979732842008 0.167959342288254 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 T:C C T 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74475975 C/A 1 7 16 23 3.26214187010594 8.54367572547213 -5.28153385536618 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0351604382197583 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74477620 C/T 1 23 13 36 10.7184661446338 6.9417365269461 3.77672961768771 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.243405353454825 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 54 47 101 25.1650944265316 25.0970474435744 0.0680469829571955 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 75202387 C/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75202311_75202482:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75202311_75202482:SEC14L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 75483528 C/T 1 49 39 88 22.8349930907416 20.8252095808383 2.0097835099033 T:C C T 10 0.533979732842008 0.748766266196907 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 152 120 272 70.8350806080148 64.077567941041 6.75751266697384 T:C T C 10 0.533979732842008 0.429786524542468 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 53 71 124 24.6990741593736 37.9125610317826 -13.213486872409 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0190955134227461 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 52 48 100 24.2330538922156 25.6310271764164 -1.39797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 0.8412575462625 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76120065 A/G 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 22 31 53 10.2524458774758 16.5533717181022 -6.30092584062642 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0980652600828895 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 110 122 232 51.2622293873791 65.145527406725 -13.8832980193458 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0754159677952904 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 39 19 58 18.1747904191617 10.1456149239982 8.02917549516354 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0356269042759245 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 40 20 60 18.6408106863197 10.6795946568402 7.96121602947952 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0513440988143793 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 24 18 42 11.1844864117918 9.61163519115614 1.57285122063567 A:G A G 10 0.533979732842008 0.646475162894135 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76187108 G/C 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 C:G G C 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000409431:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000475701:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000409722:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000424020:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000392388:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000498191:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000484578:exon_76186792_76187141:AFMID HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76482432 A/G 1 20 8 28 9.32040534315984 4.27183786273606 5.04856748042378 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0598582649886792 ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76482306_76482588:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76482306_76482588:DNAH17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76490083 G/A 1 23 3 26 10.7184661446338 1.60193919852602 9.11652694610779 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000236706019871896 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 26 20 46 12.1165269461078 10.6795946568402 1.43693228926763 A:G G A 10 0.533979732842008 0.768029504113072 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76803197 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 1 9 10 0.466020267157992 4.80581759557807 -4.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00790347837899177 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 A:G G A 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 670888 T/C 1 8 15 23 3.72816213726394 8.00969599263012 -4.28153385536618 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0936988538780524 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 43 34 77 20.0388714877937 18.1553109166283 1.88356057116539 A:G A G 10 0.533979732842008 0.732238783864868 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 44 19 63 20.5048917549517 10.1456149239982 10.3592768309535 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0109749928426056 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 706558 C/T 1 6 21 27 2.79612160294795 11.2135743896822 -8.41745278673421 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00150918630920695 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 48 41 89 22.3689728235836 21.8931690465223 0.475803777061294 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 3597003 G/C 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 C:G G C 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000177337:ENST00000317114:exon_3596577_3598350:AP002478.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 48 26 74 22.3689728235836 13.8834730538922 8.48549976969141 T:C T C 10 0.533979732842008 0.061540912319747 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 310 288 598 144.466282818978 153.786163058498 -9.31988023952076 A:G G A 10 0.533979732842008 0.460710157896401 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 351 375 726 163.573113772455 200.242399815753 -36.6692860432978 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00659806438006157 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 92 72 164 42.8738645785353 38.4465407646246 4.4273238139107 A:C:G C G 10 0.533979732842008 0.53139854661504 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 21 20 41 9.78642561031783 10.6795946568402 -0.893169046522326 T:C C T 10 0.533979732842008 0.875890787785455 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 12 20 32 5.5922432058959 10.6795946568402 -5.08735145094425 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0779539286254575 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C T C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 39 31 70 18.1747904191617 16.5533717181022 1.62141870105944 T:C C T 10 0.533979732842008 0.72086570414473 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 9 5 14 4.19418240442193 2.66989866421004 1.52428374021189 A:C A C 10 0.533979732842008 0.593885309282772 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 41 37 78 19.1068309534777 19.7572501151543 -0.650419161676616 T:C C T 10 0.533979732842008 0.909965130637892 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 34398883 G/A 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 A:G G A 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 21 7 28 9.78642561031783 3.73785812989406 6.04856748042378 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0230887084021205 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 13 16 29 6.0582634730539 8.54367572547213 -2.48541225241823 T:C C T 10 0.533979732842008 0.360156273349282 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 13 20 33 6.0582634730539 10.6795946568402 -4.62133118378626 A:C C A 10 0.533979732842008 0.118075777321921 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.129337985263742 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 3 16 19 1.39806080147398 8.54367572547213 -7.14561492399815 T:G T G 10 0.533979732842008 0.00097089318574299 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 A:T A T 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 13 1 14 6.0582634730539 0.533979732842008 5.52428374021189 T:G T G 10 0.533979732842008 0.00241375195318378 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 13 1 14 6.0582634730539 0.533979732842008 5.52428374021189 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00241375195318378 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 22 5 27 10.2524458774758 2.66989866421004 7.58254721326579 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00330641770665177 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 21 4 25 9.78642561031783 2.13591893136803 7.6505066789498 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00207635285168431 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 A:C A C 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.656538220866779 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56414592 T/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 56825944 T/C 1 462 402 864 215.301363426992 214.659852602487 0.641510824505133 T:C T C 10 0.533979732842008 0.972810092050864 ENSG00000166562:ENST00000299714:exon_56825864_56826068:SEC11C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 60985773 C/T 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C C T 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 23 16 39 10.7184661446338 8.54367572547213 2.17479041916169 A:G A G 10 0.533979732842008 0.524079805525241 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 71822419 T/C 1 31 24 55 14.4466282818978 12.8155135882082 1.63111469368956 T:C T C 10 0.533979732842008 0.687249913672632 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71822380_71822442:C18orf55 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 A:G G A 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 26 16 42 12.1165269461078 8.54367572547213 3.57285122063567 T:C T C 10 0.533979732842008 0.28341661624273 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 74611127 A/G 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 A:G A G 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000130856:ENST00000253159:exon_74610975_74611178:ZNF236;ENSG00000130856:ENST00000320610:exon_74610975_74611178:ZNF236 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 40 33 73 18.6408106863197 17.6213311837863 1.01947950253342 A:C A C 10 0.533979732842008 0.906717841076027 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 63 154 217 29.3592768309535 82.2328788576692 -52.8736020267157 T:C C T 10 0.533979732842008 5.19951576966104e-13 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 75 181 256 34.9515200368494 96.6503316444034 -61.698811607554 C:G C G 10 0.533979732842008 6.99271853617621e-15 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 134 69 203 62.4467157991709 36.8446015660985 25.6021142330724 T:C T C 10 0.533979732842008 0.000314772963813397 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 799342 G/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 C:G G C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 24 22 46 11.1844864117918 11.7475541225242 -0.563067710732366 T:C C T 10 0.533979732842008 0.883533683479925 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 810573 C/A 1 41 49 90 19.1068309534777 26.1650069092584 -7.05817595578071 A:C C A 10 0.533979732842008 0.140312385569628 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_810543_810620:PTBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 A:G A G 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 900951 A/G 1 12 12 24 5.5922432058959 6.4077567941041 -0.815513588208191 A:G A G 10 0.533979732842008 0.83873335765346 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_900829_900952:C19orf22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 17 7 24 7.92234454168586 3.73785812989406 4.18448641179181 A:G A G 10 0.533979732842008 0.102624368224294 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 37 27 64 17.2427498848457 14.4174527867342 2.82529709811149 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.531882883719391 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 16 11 27 7.45632427452787 5.87377706126209 1.58254721326579 A:G G A 10 0.533979732842008 0.569328009953207 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 12 17 29 5.5922432058959 9.07765545831414 -3.48541225241823 A:G A G 10 0.533979732842008 0.199414733768263 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 23 21 44 10.7184661446338 11.2135743896822 -0.49510824504835 C:G G C 10 0.533979732842008 0.881297539845545 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1223125 C/G 1 20 37 57 9.32040534315984 19.7572501151543 -10.4368447719945 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00739065233004038 ENSG00000118046:ENST00000326873:exon_1222984_1223171:STK11;ENSG00000118046:ENST00000405031:exon_1222984_1223171:STK11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1357082 T/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1357063_1357093:MUM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1581225 G/A 1 22 15 37 10.2524458774758 8.00969599263012 2.24274988484571 A:G G A 10 0.533979732842008 0.512240128551892 ENSG00000071655:ENST00000355664:exon_1581091_1581268:MBD3;ENSG00000071655:ENST00000156825:exon_1581091_1581268:MBD3;ENSG00000071655:ENST00000434436:exon_1581091_1581268:MBD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 29 31 60 13.5145877475818 16.5533717181022 -3.03878397052048 T:C T C 10 0.533979732842008 0.440634800959378 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G A G 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 34 32 66 15.8446890833717 17.0873514509443 -1.24266236757252 A:G A G 10 0.533979732842008 0.805613938059715 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2037842 A/C 1 398 586 984 185.476066328881 312.912123445417 -127.436057116536 A:C A C 10 0.533979732842008 4.36534829404214e-16 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 63 50 113 29.3592768309535 26.6989866421004 2.6602901888531 A:T:C:G G A 10 0.533979732842008 0.638330581311095 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2109834 G/A 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 68 66 134 31.6893781667435 35.2426623675725 -3.55328420082906 A:G G A 10 0.533979732842008 0.545641388247549 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 18 26 44 8.38836480884386 13.8834730538922 -5.49510824504835 A:G A G 10 0.533979732842008 0.129825636560099 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2136992 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 24 24 48 11.1844864117918 12.8155135882082 -1.63102717641638 C:G G C 10 0.533979732842008 0.66620018596589 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2226855 C/T 1 21 24 45 9.78642561031783 12.8155135882082 -3.02908797789036 T:C C T 10 0.533979732842008 0.374372346129768 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 17 12 29 7.92234454168586 6.4077567941041 1.51458774758177 A:C C A 10 0.533979732842008 0.710422976957767 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 14 12 26 6.52428374021189 6.4077567941041 0.116526946107793 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 23 10 33 10.7184661446338 5.33979732842008 5.37866881621374 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.0796874753563811 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 24 10 34 11.1844864117918 5.33979732842008 5.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0573421831077769 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 3544971 C/T 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.559150993150818 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4054973 G/A 1 10 14 24 4.66020267157992 7.47571625978811 -2.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.307338312334203 ENSG00000178951:ENST00000322357:exon_4053969_4055245:ZBTB7A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 29 11 40 13.5145877475818 5.87377706126209 7.64081068631968 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0169396760786915 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 4 11 15 1.86408106863197 5.87377706126209 -4.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0663544192530847 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4355054 A/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 18 19 37 8.38836480884386 10.1456149239982 -1.75725011515429 A:G G A 10 0.533979732842008 0.622505322195448 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 T:C T C 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 13 21 34 6.0582634730539 11.2135743896822 -5.15531091662827 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0863065025878997 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4852337 A/C 1 10 14 24 4.66020267157992 7.47571625978811 -2.81551358820819 A:C A C 10 0.533979732842008 0.307338312334203 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 17 17 34 7.92234454168586 9.07765545831414 -1.15531091662827 T:C T C 10 0.533979732842008 0.733025840444282 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 4950770 C/T 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4950623_4950785:UHRF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 5653369 A/G 1 58 69 127 27.0291754951635 36.8446015660985 -9.81542607093501 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0908214851783023 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5653349_5653431:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5653349_5653431:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5653349_5653431:SAFB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 96 64 160 44.7379456471672 34.1747029018885 10.5632427452787 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0966012003329504 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 5692192 C/T 1 163 178 341 75.9613035467527 95.0483924458774 -19.0870888991247 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0392056036422841 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 5696101 C/T 1 41 35 76 19.1068309534777 18.6892906494703 0.417540304007396 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 5917890 C/T 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5917805_5917991:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5917805_5917991:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5917805_5917991:RANBP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 T:G G T 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 6731213 G/A 1 34 16 50 15.8446890833717 8.54367572547213 7.3010133578996 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0464126219804141 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6731210_6731293:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6731210_6731293:GPR108 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 6731267 G/A 1 37 19 56 17.2427498848457 10.1456149239982 7.09713496084756 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0612597633134548 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6731210_6731293:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6731210_6731293:GPR108 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 6732125 C/T 1 20 20 40 9.32040534315984 10.6795946568402 -1.35918931368032 T:C C T 10 0.533979732842008 0.751869891215725 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6732036_6732166:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6732036_6732166:GPR108 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 6847974 A/G 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7141727 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7142843 C/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7584223 A/G 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 A:G A G 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7703605 C/T 1 20 7 27 9.32040534315984 3.73785812989406 5.58254721326579 T:C C T 10 0.533979732842008 0.034030349106077 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 45 65 110 20.9709120221096 34.7086826347305 -13.7377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00967545888864806 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 85 77 162 39.6117227084293 41.1164394288346 -1.50471672040528 A:G A G 10 0.533979732842008 0.813810223316428 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 22 18 40 10.2524458774758 9.61163519115614 0.640810686319682 A:G A G 10 0.533979732842008 0.875285178545053 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 33 19 52 15.3786688162137 10.1456149239982 5.23305389221559 T:G T G 10 0.533979732842008 0.165179161596286 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 399 459 858 185.942086596039 245.096697374482 -59.1546107784428 A:G G A 10 0.533979732842008 5.31082279632604e-05 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 516 457 973 240.466457853524 244.028737908798 -3.56228005527373 A:G G A 10 0.533979732842008 0.822106933622923 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 16 10 26 7.45632427452787 5.33979732842008 2.11652694610779 A:G A G 10 0.533979732842008 0.438216520885157 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 258 244 502 120.233228926762 130.29105481345 -10.057825886688 A:T:C:G A G 10 0.533979732842008 0.371288414973278 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 C:G C G 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 14 17 31 6.52428374021189 9.07765545831414 -2.55337171810225 T:C T C 10 0.533979732842008 0.373773724713525 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 36 34 70 16.7767296176877 18.1553109166283 -1.37858129894056 C:G C G 10 0.533979732842008 0.810890156912543 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 30 31 61 13.9806080147398 16.5533717181022 -2.57276370336249 C:G C G 10 0.533979732842008 0.523574028194959 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 T:C C T 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 18 17 35 8.38836480884386 9.07765545831414 -0.689290649470278 A:G G A 10 0.533979732842008 0.86635090990695 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 351 310 661 163.573113772455 165.533717181022 -1.96060340856727 A:T:C:G A G 10 0.533979732842008 0.906905572463482 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 264 220 484 123.02935052971 117.475541225242 5.55380930446815 A:G A G 10 0.533979732842008 0.616637041061851 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10271034 C/G 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 C:G C G 10 0.533979732842008 0.246657616969625 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 43 34 77 20.0388714877937 18.1553109166283 1.88356057116539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.732238783864868 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10370444 A/C 1 237 187 424 110.446803316444 99.8542100414555 10.5925932749886 A:C A C 10 0.533979732842008 0.307096621669671 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 18 10 28 8.38836480884386 5.33979732842008 3.04856748042378 A:G A G 10 0.533979732842008 0.262892700324969 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10415781 T/C 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 T:C T C 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000220201:ENST00000403903:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000480726:exon_10415479_10415884:ZGLP1;ENSG00000220201:ENST00000403352:exon_10415751_10415884:ZGLP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10444826 G/A 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:G G A 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 44 29 73 20.5048917549517 15.4854122524182 5.01947950253342 T:C T C 10 0.533979732842008 0.243760689099718 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10450285 G/A 1 27 24 51 12.5825472132658 12.8155135882082 -0.232966374942405 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 T:C C T 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 87 108 195 40.5437632427453 57.6698111469369 -17.1260479041916 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0146274383891995 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 26 15 41 12.1165269461078 8.00969599263012 4.10683095347767 T:C T C 10 0.533979732842008 0.213695655540794 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11221457 G/C 1 13 33 46 6.0582634730539 17.6213311837863 -11.5630677107324 C:G G C 10 0.533979732842008 0.000922693834691063 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11241915 A/G 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:G A G 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 21 23 44 9.78642561031783 12.2815338553662 -2.49510824504835 C:G G C 10 0.533979732842008 0.454958806982227 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11687195 C/T 1 13 8 21 6.0582634730539 4.27183786273606 1.78642561031783 T:C C T 10 0.533979732842008 0.515089193647705 ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687058_11687403:ACP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11687351 C/T 1 17 8 25 7.92234454168586 4.27183786273606 3.6505066789498 T:C C T 10 0.533979732842008 0.163631830697504 ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687058_11687403:ACP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 11687908 G/A 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687872_11688132:ACP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 12256912 C/T 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 12 15 27 5.5922432058959 8.00969599263012 -2.41745278673421 C:G G C 10 0.533979732842008 0.441078206442053 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 12384580 T/C 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 T:C T C 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 12876964 G/C 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 C:G G C 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000095066:ENST00000397668:exon_12876917_12877054:HOOK2;ENSG00000095066:ENST00000264827:exon_12876917_12877054:HOOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 13879493 C/T 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13879375_13879551:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13879429_13879551:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13879375_13879551:MRI1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 37 33 70 17.2427498848457 17.6213311837863 -0.378581298940553 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 71 65 136 33.0874389682174 34.7086826347305 -1.62124366651308 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796988796350404 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 291 307 598 135.611897742976 163.931777982496 -28.3198802395208 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0216547757583362 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 31 29 60 14.4466282818978 15.4854122524182 -1.03878397052048 A:G G A 10 0.533979732842008 0.797257553646866 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 14065488 A/G 1 9 14 23 4.19418240442193 7.47571625978811 -3.28153385536618 A:G A G 10 0.533979732842008 0.210551057444704 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 14578443 G/A 1 41 51 92 19.1068309534777 27.2329663749424 -8.12613542146473 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.0949806721891391 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14578377_14578453:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14578377_14578453:PKN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 16664679 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000141979:ENST00000409035:exon_16664581_16664720:CALR3;ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16660650_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16661661_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16662584_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16664628_16664720:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16664660_16664720:SLC35E1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 T:C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 A:C A C 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 12 18 30 5.5922432058959 9.61163519115614 -4.01939198526024 T:C T C 10 0.533979732842008 0.147885038186436 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17450445 G/C 1 3 11 14 1.39806080147398 5.87377706126209 -4.47571625978811 A:C:G G C 10 0.533979732842008 0.0282342402988014 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17531450 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000141971:ENST00000528997:exon_17531347_17531855:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528732:exon_17531122_17531529:FAM125A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 67 68 135 31.2233578995855 36.3106218332565 -5.08726393367107 A:G A G 10 0.533979732842008 0.38945228170194 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 A:G G A 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 17946012 G/T 1 13 13 26 6.0582634730539 6.9417365269461 -0.883473053892207 T:G G T 10 0.533979732842008 0.844733344957102 ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17945892_17946024:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17945892_17946024:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000534444:exon_17945892_17946024:JAK3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18174731 C/T 1 11 2 13 5.12622293873791 1.06795946568402 4.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0263752418961719 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18174686_18174820:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18174686_18174820:IL12RB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18180451 A/G 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18180356_18180523:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18180356_18180523:IL12RB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:G G A 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 16 3 19 7.45632427452787 1.60193919852602 5.85438507600185 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00946837300611784 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18499422 C/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 26 22 48 12.1165269461078 11.7475541225242 0.368972823583618 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 23 12 35 10.7184661446338 6.4077567941041 4.31070935052972 T:C T C 10 0.533979732842008 0.175459088737952 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 18684557 A/G 1 394 827 1221 183.611985260249 441.601239060341 -257.989253800092 A:G A G 10 0.533979732842008 6.23696032322464e-50 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18684472_18684558:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18684472_18684558:UBA52 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 19449686 G/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000129933:ENST00000392313:exon_19449654_19449748:MAU2;ENSG00000129933:ENST00000262815:exon_19449654_19449748:MAU2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:G G A 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 14 23 37 6.52428374021189 12.2815338553662 -5.75725011515429 C:G G C 10 0.533979732842008 0.069353298516309 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 21132414 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 15 9 24 6.99030400736988 4.80581759557807 2.18448641179181 T:C T C 10 0.533979732842008 0.418245035192846 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 A:G G A 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G G A 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C T C 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 184 198 382 85.7477291570705 105.727987102718 -19.980257945647 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0453542789094172 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 68 66 134 31.6893781667435 35.2426623675725 -3.55328420082906 A:G A G 10 0.533979732842008 0.545641388247549 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35505077 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 33 31 64 15.3786688162137 16.5533717181022 -1.17470290188851 C:G G C 10 0.533979732842008 0.802888084904212 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35660450 T/C 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C T C 10 0.533979732842008 0.82850726887389 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 295 233 528 137.475978811608 124.417277752188 13.0587010594198 A:G G A 10 0.533979732842008 0.257102516001620 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 309 263 572 144.00026255182 140.436669737448 3.56359281437145 T:C T C 10 0.533979732842008 0.769447363088791 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35769561 T/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:G T G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.238414549935108 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36206050 A/C 1 26 25 51 12.1165269461078 13.3494933210502 -1.23296637494241 A:C A C 10 0.533979732842008 0.779720032696518 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36207336 G/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 C:G G C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36255965 C/G 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36255935_36256077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36255935_36256077:C19orf55 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36387693 C/A 0 16 0 16 7.45632427452787 0 7.45632427452787 C C 10 0.533979732842008 4.8639979692946e-05 ENSG00000167604:ENST00000352614:exon_36387628_36387733:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000396901:exon_36387628_36387733:NFKBID HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36585017 T/G 1 9 3 12 4.19418240442193 1.60193919852602 2.5922432058959 T:G T G 10 0.533979732842008 0.157132946742864 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36584933_36585066:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36584933_36585066:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36590329 T/C 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36590301_36590519:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36590301_36590519:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36590384 C/T 1 7 12 19 3.26214187010594 6.4077567941041 -3.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.171287635630369 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36590301_36590519:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36590301_36590519:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36593915 T/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:G T G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36593850_36593976:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36593850_36593976:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 18 20 38 8.38836480884386 10.6795946568402 -2.2912298479963 A:C A C 10 0.533979732842008 0.516691403762345 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 T:C T C 10 0.533979732842008 0.782419722323192 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:G G A 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 10 21 31 4.66020267157992 11.2135743896822 -6.55337171810225 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0195702772843796 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 72 69 141 33.5534592353754 36.8446015660985 -3.29114233072312 T:C T C 10 0.533979732842008 0.612845773165136 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 26 17 43 12.1165269461078 9.07765545831414 3.03887148779366 A:G G A 10 0.533979732842008 0.364494136625054 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 9 17 26 4.19418240442193 9.07765545831414 -4.88347305389221 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0751233621346127 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 26 30 56 12.1165269461078 16.0193919852602 -3.90286503915245 A:G G A 10 0.533979732842008 0.34863923424549 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 19 16 35 8.85438507600185 8.54367572547213 0.310709350529722 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 39215172 T/C 1 32 34 66 14.9126485490557 18.1553109166283 -3.24266236757252 T:C T C 10 0.533979732842008 0.460112797621251 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39215099_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39215071_39215205:ACTN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 191 191 382 89.0098710271765 101.990128972824 -12.980257945647 T:C T C 10 0.533979732842008 0.199751016549955 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 39898667 C/T 1 23 21 44 10.7184661446338 11.2135743896822 -0.49510824504835 T:C C T 10 0.533979732842008 0.881297539845545 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G A G 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 11 2 13 5.12622293873791 1.06795946568402 4.0582634730539 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0263752418961719 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41798111 A/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41838174 C/T 1 100 84 184 46.6020267157992 44.8542975587287 1.74772915707054 T:C C T 10 0.533979732842008 0.824793298228504 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41838033_41838186:TGFB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 54 39 93 25.1650944265316 20.8252095808383 4.33988484569326 T:C T C 10 0.533979732842008 0.406179566938424 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 28 20 48 13.0485674804238 10.6795946568402 2.36897282358362 A:G G A 10 0.533979732842008 0.563680486241117 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 30 23 53 13.9806080147398 12.2815338553662 1.69907415937358 T:C C T 10 0.533979732842008 0.681235244111532 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 63 49 112 29.3592768309535 26.1650069092584 3.19426992169511 A:G A G 10 0.533979732842008 0.570828590597464 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 C:G C G 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 T:C T C 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42092815 T/A 0 12 0 12 5.5922432058959 0 5.5922432058959 T T 10 0.533979732842008 0.000642319381394275 ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42092788_42093163:CEACAM21 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 43 65 108 20.0388714877937 34.7086826347305 -14.6698111469369 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00504353686091395 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 20 18 38 9.32040534315984 9.61163519115614 -0.291229847996302 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42795554 T/C 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42794385_42795618:CIC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 42853782 T/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C T C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000105429:ENST00000334370:exon_42853651_42853851:MEGF8;ENSG00000105429:ENST00000251268:exon_42853651_42853851:MEGF8;ENSG00000105429:ENST00000378073:exon_42853651_42853851:MEGF8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 12 28 40 5.5922432058959 14.9514325195762 -9.35918931368032 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00382529555442082 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 C:G G C 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 20 8 28 9.32040534315984 4.27183786273606 5.04856748042378 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0598582649886792 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45397229 G/A 1 16 33 49 7.45632427452787 17.6213311837863 -10.1650069092584 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00395656541198560 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45397218_45397323:TOMM40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45575605 G/A 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45854852 T/G 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 T:G T G 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 24 15 39 11.1844864117918 8.00969599263012 3.17479041916169 A:C A C 10 0.533979732842008 0.338652293818719 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 30 42 72 13.9806080147398 22.4271487793643 -8.44654076462457 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0580183436739805 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 24 31 55 11.1844864117918 16.5533717181022 -5.36888530631044 A:G G A 10 0.533979732842008 0.176197057807382 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 25 25 50 11.6505066789498 13.3494933210502 -1.6989866421004 A:G A G 10 0.533979732842008 0.671971489653627 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46202028 G/A 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G G A 10 0.533979732842008 0.689656732788913 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 48 35 83 22.3689728235836 18.6892906494703 3.67968217411334 A:G G A 10 0.533979732842008 0.442737943635481 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 C:G G C 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46289084 C/T 1 14 15 29 6.52428374021189 8.00969599263012 -1.48541225241823 T:C C T 10 0.533979732842008 0.583391265726818 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46294136 G/A 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.188759088593184 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46318799 C/G 1 118 132 250 54.9903915246431 70.485324735145 -15.494933210502 C:G C G 10 0.533979732842008 0.056982490528519 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46318693_46318955:SYMPK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 30 15 45 13.9806080147398 8.00969599263012 5.97091202210964 T:C C T 10 0.533979732842008 0.099187896347851 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 22 26 48 10.2524458774758 13.8834730538922 -3.63102717641638 A:G G A 10 0.533979732842008 0.313599385414578 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46387792 G/C 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 C:G C G 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 18 10 28 8.38836480884386 5.33979732842008 3.04856748042378 A:G G A 10 0.533979732842008 0.262892700324969 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 C:G G C 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 25 21 46 11.6505066789498 11.2135743896822 0.436932289267634 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 26 15 41 12.1165269461078 8.00969599263012 4.10683095347767 T:C T C 10 0.533979732842008 0.213695655540794 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 79 100 179 36.8156011054814 53.3979732842008 -16.5823721787194 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0134174298259309 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48255828 C/T 1 247 1 248 115.107005988024 0.533979732842008 114.573026255182 T:C C T 10 0.533979732842008 7.5280591915059e-66 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 21 38 59 9.78642561031783 20.2912298479963 -10.5048042376785 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00848477575547182 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48664798 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 T:C T C 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 23 19 42 10.7184661446338 10.1456149239982 0.572851220635666 T:C C T 10 0.533979732842008 0.878541442710722 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:G G T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 49300605 T/C 1 14 19 33 6.52428374021189 10.1456149239982 -3.62133118378626 T:C T C 10 0.533979732842008 0.225046333276255 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G A G 10 0.533979732842008 0.74200360843589 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 23 19 42 10.7184661446338 10.1456149239982 0.572851220635666 A:G A G 10 0.533979732842008 0.878541442710722 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 303 264 567 141.204140948872 140.97064947029 0.233491478581499 T:C:G T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50119060 C/G 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 C:G C G 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50119004_50119476:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50119004_50119476:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50119004_50119476:PRR12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 246 300 546 114.640985720866 160.193919852602 -45.5529341317364 C:G C G 10 0.533979732842008 0.000109379546472927 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 22 14 36 10.2524458774758 7.47571625978811 2.77672961768771 T:G T G 10 0.533979732842008 0.40554096031008 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50360989 A/G 1 31 28 59 14.4466282818978 14.9514325195762 -0.504804237678469 A:G A G 10 0.533979732842008 0.897058251165353 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50360950_50361039:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50360950_50361039:PTOV1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50368361 T/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:T T A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 18 19 37 8.38836480884386 10.1456149239982 -1.75725011515429 T:C T C 10 0.533979732842008 0.622505322195448 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 21 14 35 9.78642561031783 7.47571625978811 2.31070935052972 A:G G A 10 0.533979732842008 0.499706968646814 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 124 48 172 57.786513127591 25.6310271764164 32.1554859511746 A:G G A 10 0.533979732842008 7.49037850545975e-07 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 26 21 47 12.1165269461078 11.2135743896822 0.902952556425626 A:G G A 10 0.533979732842008 0.88404744521996 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 19 25 44 8.85438507600185 13.3494933210502 -4.49510824504835 T:C T C 10 0.533979732842008 0.177904020452585 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 68 65 133 31.6893781667435 34.7086826347305 -3.01930446798706 A:G G A 10 0.533979732842008 0.603305229510027 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 9 10 0.466020267157992 4.80581759557807 -4.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00790347837899177 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 T:C C T 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 10 3 13 4.66020267157992 1.60193919852602 3.0582634730539 A:C C A 10 0.533979732842008 0.101966663401288 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 16 12 28 7.45632427452787 6.4077567941041 1.04856748042378 T:C T C 10 0.533979732842008 0.710138043576245 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 24 40 64 11.1844864117918 21.3591893136803 -10.1747029018885 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0119715058763862 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 54973198 G/A 1 61 26 87 28.4272362966375 13.8834730538922 14.5437632427453 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00173136130909346 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54971946_54973217:LENG8;ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 A:C A C 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 34 36 70 15.8446890833717 19.2232703823123 -3.37858129894056 T:C T C 10 0.533979732842008 0.472629221232499 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 14 21 35 6.52428374021189 11.2135743896822 -4.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.128108137753276 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 16 22 38 7.45632427452787 11.7475541225242 -4.2912298479963 T:G G T 10 0.533979732842008 0.193540360253445 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:G G T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 26 31 57 12.1165269461078 16.5533717181022 -4.43684477199445 A:G G A 10 0.533979732842008 0.288137632058744 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 56185250 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58213969 T/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 T:G T G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 24 28 52 11.1844864117918 14.9514325195762 -3.76694610778441 A:G G A 10 0.533979732842008 0.331425802568915 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 A:G A G 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:G A G 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G G A 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 14 13 27 6.52428374021189 6.9417365269461 -0.417452786734215 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 95 105 200 44.2719253800092 56.0678719484108 -11.7959465684016 A:G A G 10 0.533979732842008 0.102974358002183 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 672828 C/T 1 10 13 23 4.66020267157992 6.9417365269461 -2.28153385536618 T:C C T 10 0.533979732842008 0.40522543664051 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_672808_672862:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_672808_672862:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000355654:exon_672808_672862:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000477202:exon_672808_672862:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000405941:exon_672808_672862:TMEM18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3391826 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 T:C T C 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 25 20 45 11.6505066789498 10.6795946568402 0.970912022109642 C:G G C 10 0.533979732842008 0.881461959585379 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 71 49 120 33.0874389682174 26.1650069092584 6.92243205895905 T:C C T 10 0.533979732842008 0.234182336006372 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 A:G A G 10 0.533979732842008 0.541075078613172 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3596217 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C T C 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 76 47 123 35.4175403040074 25.0970474435744 10.320492860433 T:C T C 10 0.533979732842008 0.070386008723478 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 69 45 114 32.1553984339015 24.0290879778904 8.1263104560111 T:C C T 10 0.533979732842008 0.133733593607955 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 21 10 31 9.78642561031783 5.33979732842008 4.44662828189775 T:C C T 10 0.533979732842008 0.148743073161439 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 15743344 T/C 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15743316_15743399:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15743316_15743399:DDX1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 18736927 T/C 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000240857:ENST00000381249:exon_18735989_18737074:RDH14;ENSG00000240857:ENST00000468071:exon_18736388_18737074:RDH14;ENSG00000185013:ENST00000403770:exon_18736811_18737074:NT5C1B;ENSG00000250741:ENST00000532967:exon_18736811_18737074:RP11-111J6.1;ENSG00000250741:ENST00000444297:exon_18736811_18737074:RP11-111J6.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 24080274 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 24426534 A/G 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000198399:ENST00000478720:exon_24425733_24427287:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24426151_24426652:ITSN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 24521493 C/T 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C C T 10 0.533979732842008 0.82850726887389 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 12 11 23 5.5922432058959 5.87377706126209 -0.281533855366183 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 26420574 T/C 1 39 43 82 18.1747904191617 22.9611285122063 -4.78633809304466 T:C:G T C 10 0.533979732842008 0.319590272320149 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26420560_26420646:HADHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 26457214 G/A 1 16 24 40 7.45632427452787 12.8155135882082 -5.35918931368032 A:G G A 10 0.533979732842008 0.112189400636932 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26457085_26457223:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26457085_26457223:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26457085_26457223:HADHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27262658 C/T 1 10 19 29 4.66020267157992 10.1456149239982 -5.48541225241823 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0608000501778 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 4 11 15 1.86408106863197 5.87377706126209 -4.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0663544192530847 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 T:C C T 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 15 11 26 6.99030400736988 5.87377706126209 1.11652694610779 A:G A G 10 0.533979732842008 0.698803906557757 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27589810 T/C 1 8 9 17 3.72816213726394 4.80581759557807 -1.07765545831414 T:C T C 10 0.533979732842008 0.634159114777915 ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 37230734 C/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 72 52 124 33.5534592353754 27.7669461077844 5.78651312759101 A:G G A 10 0.533979732842008 0.322557123361539 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 13 15 28 6.0582634730539 8.00969599263012 -1.95143251957622 A:G G A 10 0.533979732842008 0.57068169228738 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 38978408 C/T 1 42 66 108 19.5728512206357 35.2426623675725 -15.6698111469369 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00270212683387204 ENSG00000115875:ENST00000313117:exon_38978371_38978636:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000425778:exon_38978371_38978557:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000425941:exon_38978371_38978505:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000409276:exon_38978371_38978500:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000431066:exon_38978371_38978424:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000446327:exon_38978371_38978501:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000378857:exon_38978371_38978501:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000443213:exon_38978371_38978494:SRSF7;ENSG00000115875:ENST00000378869:exon_38978371_38978501:SRSF7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G G A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:C A C 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 12 6 18 5.5922432058959 3.20387839705205 2.38836480884386 A:G A G 10 0.533979732842008 0.346018795935265 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 42488198 A/G 1 12 2 14 5.5922432058959 1.06795946568402 4.52428374021189 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0157567122608690 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 9 23 32 4.19418240442193 12.2815338553662 -8.08735145094425 A:C C A 10 0.533979732842008 0.00438519577501868 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 8 16 24 3.72816213726394 8.54367572547213 -4.81551358820819 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0640799581168582 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 16 19 35 7.45632427452787 10.1456149239982 -2.68929064947028 A:G A G 10 0.533979732842008 0.399437688722377 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 48030692 T/A 1 46 51 97 21.4369322892676 27.2329663749424 -5.79603408567477 A:T T A 10 0.533979732842008 0.263166353941040 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G A G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:G A G 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:T A T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 T:C C T 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 24 22 46 11.1844864117918 11.7475541225242 -0.563067710732366 A:G G A 10 0.533979732842008 0.883533683479925 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 30 11 41 13.9806080147398 5.87377706126209 8.10683095347767 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0118443299547605 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 T:G G T 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55771050 C/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 C:G C G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 28 20 48 13.0485674804238 10.6795946568402 2.36897282358362 A:G A G 10 0.533979732842008 0.563680486241117 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C T C 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 55873592 G/A 1 18 18 36 8.38836480884386 9.61163519115614 -1.22327038231229 A:G G A 10 0.533979732842008 0.739647567407739 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55873550_55873621:PNPT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 61413723 A/G 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G A G 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61413581_61413910:AHSA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 12 14 26 5.5922432058959 7.47571625978811 -1.88347305389221 A:G A G 10 0.533979732842008 0.556476625412329 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 A:G G A 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 22 12 34 10.2524458774758 6.4077567941041 3.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.229197974083717 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 67632214 C/T 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 T:G G T 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 32 31 63 14.9126485490557 16.5533717181022 -1.6407231690465 A:G G A 10 0.533979732842008 0.70607250596614 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 15 12 27 6.99030400736988 6.4077567941041 0.582547213265785 A:T A T 10 0.533979732842008 0.849719229405915 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 75 77 152 34.9515200368494 41.1164394288346 -6.16491939198521 A:G G A 10 0.533979732842008 0.329900313646946 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71337203 C/T 1 18 15 33 8.38836480884386 8.00969599263012 0.378668816213738 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000462609:exon_71336944_71337252:MCEE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71360060 C/A 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 A:C C A 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71360100 G/A 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 A:G G A 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 A:C A C 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71360399 A/G 1 39 33 72 18.1747904191617 17.6213311837863 0.553459235375428 A:G A G 10 0.533979732842008 0.906671225740266 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 29 22 51 13.5145877475818 11.7475541225242 1.76703362505759 T:G G T 10 0.533979732842008 0.674972314151646 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71365805 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 28 14 42 13.0485674804238 7.47571625978811 5.57285122063567 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0905079516235932 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71592589 A/G 1 7 12 19 3.26214187010594 6.4077567941041 -3.14561492399815 A:G A G 10 0.533979732842008 0.171287635630369 ENSG00000075292:ENST00000494621:exon_71592559_71592835:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000466975:exon_71592559_71592618:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000410075:exon_71592559_71592836:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000466330:exon_71592559_71592743:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71592559_71592836:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71592559_71592836:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000377802:exon_71592559_71592836:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000464375:exon_71592559_71592668:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000475743:exon_71592559_71592644:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71592559_71592836:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71592559_71592836:ZNF638 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71653907 A/G 1 62 32 94 28.8932565637955 17.0873514509443 11.8059051128513 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0170113872814018 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 47 44 91 21.9029525564256 23.4951082450483 -1.59215568862273 A:G G A 10 0.533979732842008 0.753531394806232 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 16 71 87 7.45632427452787 37.9125610317826 -30.4562367572547 A:C C A 10 0.533979732842008 3.30114394106483e-11 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 246 220 466 114.640985720866 117.475541225242 -2.83455550437571 A:T:G A T 10 0.533979732842008 0.816459409622252 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 21 18 39 9.78642561031783 9.61163519115614 0.17479041916169 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 16 19 35 7.45632427452787 10.1456149239982 -2.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.399437688722377 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 280 302 582 130.485674804238 161.261879318286 -30.7762045140486 A:T A T 10 0.533979732842008 0.0112199239500392 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 74590160 T/C 1 34 30 64 15.8446890833717 16.0193919852602 -0.174702901888509 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000491465:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74590121_74590304:DCTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 12 18 30 5.5922432058959 9.61163519115614 -4.01939198526024 A:T T A 10 0.533979732842008 0.147885038186436 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 C:G C G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 A:G G A 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 15 29 44 6.99030400736988 15.4854122524182 -8.49510824504835 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0146495795437882 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 17 12 29 7.92234454168586 6.4077567941041 1.51458774758177 C:G C G 10 0.533979732842008 0.710422976957767 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 494 353 847 230.214011976048 188.494845693229 41.7191662828193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00423343780706322 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 454 399 853 211.573201289728 213.057913403961 -1.48471211423279 A:G A G 10 0.533979732842008 0.918050158215056 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 416 350 766 193.864431137725 186.892906494703 6.97152464302192 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.6378163309107 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 508 346 854 236.73829571626 184.756987563335 51.9813081529252 T:C:G T C 10 0.533979732842008 0.000357294361033612 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 81 71 152 37.7476416397974 37.9125610317826 -0.164919391985208 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 86385728 C/T 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86385715_86385793:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 86400791 T/C 1 16 10 26 7.45632427452787 5.33979732842008 2.11652694610779 T:C T C 10 0.533979732842008 0.438216520885157 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 12 17 29 5.5922432058959 9.07765545831414 -3.48541225241823 A:G G A 10 0.533979732842008 0.199414733768263 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 89160102 T/G 0 0 588 588 0 313.980082911101 -313.980082911101 A:G T G 10 0.533979732842008 1.05202255507610e-195 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 89160394 T/C 0 0 269 269 0 143.6405481345 -143.6405481345 C T C 10 0.533979732842008 6.32255204255006e-90 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 96078522 C/T 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000115042:ENST00000470100:exon_96078425_96078530:FAHD2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 16 20 36 7.45632427452787 10.6795946568402 -3.22327038231229 T:C C T 10 0.533979732842008 0.317927165808843 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 37 25 62 17.2427498848457 13.3494933210502 3.89325656379551 A:G G A 10 0.533979732842008 0.373298886010494 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G A G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 T:C T C 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 98206050 C/T 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 ENSG00000196912:ENST00000438709:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000377003:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000359901:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000258459:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000443455:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000419390:exon_98205988_98206278:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000486846:exon_98205988_98206428:ANKRD36B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 98206060 C/T 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 ENSG00000196912:ENST00000438709:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000377003:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000359901:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000258459:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000443455:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000419390:exon_98205988_98206278:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000486846:exon_98205988_98206428:ANKRD36B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 17 22 39 7.92234454168586 11.7475541225242 -3.82520958083831 C:G G C 10 0.533979732842008 0.261553704343998 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 13 13 26 6.0582634730539 6.9417365269461 -0.883473053892207 T:C T C 10 0.533979732842008 0.844733344957102 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 238 227 465 110.912823583602 121.213399355136 -10.3005757715337 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.352638189265509 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 16 20 36 7.45632427452787 10.6795946568402 -3.22327038231229 T:C T C 10 0.533979732842008 0.317927165808843 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 25 28 53 11.6505066789498 14.9514325195762 -3.30092584062642 T:C T C 10 0.533979732842008 0.409525506633978 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 109104231 A/G 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109104155_109104276:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109104155_109104276:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109104155_109104276:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109104155_109104276:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109104155_109104276:GCC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 82 51 133 38.2136619069554 27.2329663749424 10.9806955320129 A:C:G A C 10 0.533979732842008 0.0675707647643808 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 118575022 G/T 1 79 84 163 36.8156011054814 44.8542975587287 -8.0386964532473 T:G G T 10 0.533979732842008 0.210045380203220 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 122486065 A/G 1 78 68 146 36.3495808383234 36.3106218332565 0.038959005066836 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000155438:ENST00000285814:exon_122486053_122486112:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000417799:exon_122486053_122486112:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000481978:exon_122486053_122486112:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000498570:exon_122486053_122486175:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000447132:exon_122486053_122486112:MKI67IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 35 20 55 16.3107093505297 10.6795946568402 5.63111469368956 A:G A G 10 0.533979732842008 0.138431423673120 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128038139 C/T 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000163161:ENST00000426778:exon_128038023_128038207:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000285398:exon_128038023_128038207:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000445889:exon_128038023_128038207:ERCC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 C:G G C 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 68 49 117 31.6893781667435 26.1650069092584 5.52437125748507 T:C T C 10 0.533979732842008 0.310095142724455 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 10 23 33 4.66020267157992 12.2815338553662 -7.62133118378626 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00858034203521592 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128900721 T/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:G T G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000136731:ENST00000438277:exon_128900668_128900799:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128900668_128900799:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128900668_128900799:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128900668_128900799:UGGT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 9 8 17 4.19418240442193 4.27183786273606 -0.0776554583141351 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128939695 A/G 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G A G 10 0.533979732842008 0.780593524714529 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 17 17 34 7.92234454168586 9.07765545831414 -1.15531091662827 A:G G A 10 0.533979732842008 0.733025840444282 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 33 48 81 15.3786688162137 25.6310271764164 -10.2523583602026 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0255764044913385 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 144194565 C/T 1 32 23 55 14.9126485490557 12.2815338553662 2.63111469368956 T:C C T 10 0.533979732842008 0.502005919023108 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144194482_144194611:ARHGAP15;ENSG00000075884:ENST00000469117:exon_144194482_144194611:ARHGAP15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 148730367 G/C 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 C:G G C 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148730308_148730398:ORC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 152321457 A/G 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 158290914 G/C 1 64 59 123 29.8252970981115 31.5048042376785 -1.67950713956698 C:G G C 10 0.533979732842008 0.786701872643995 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000418920:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000497432:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158290673_158290936:CYTIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 170417031 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000487293:exon_170416781_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170416902_170417295:FASTKD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 403 349 752 187.806167664671 186.358926761861 1.44724090281002 A:T:C T A 10 0.533979732842008 0.941732819534974 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 33 25 58 15.3786688162137 13.3494933210502 2.02917549516354 T:C C T 10 0.533979732842008 0.693322909235444 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 48 48 96 22.3689728235836 25.6310271764164 -3.26205435283276 T:G T G 10 0.533979732842008 0.539936298509905 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 1 2 224 226 0.932040534315984 119.61146015661 -118.679419622294 A:C:G G A 10 0.533979732842008 3.85794215682207e-71 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 22 25 47 10.2524458774758 13.3494933210502 -3.09704744357437 A:G G A 10 0.533979732842008 0.383444337920977 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 175300997 G/A 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 A:G G A 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000163328:ENST00000392552:exon_175296966_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000392551:exon_175298880_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000295500:exon_175299872_175301144:GPR155 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 179325816 G/A 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000204311:ENST00000409117:exon_179325709_179326117:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000437056:exon_179325709_179326014:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000375129:exon_179325709_179326001:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000442710:exon_179325709_179325931:DFNB59 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 179589058 G/A 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G G A 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179588987_179589265:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179588987_179589265:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179588987_179589265:TTN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 190339483 T/C 1 105 93 198 48.9321280515892 49.6601151543067 -0.72798710271757 T:C T C 10 0.533979732842008 0.943269363039294 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190339443_190339534:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190339443_190339534:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190339443_190339534:WDR75 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 190611084 T/C 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204707877453861 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 190617700 T/C 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000151687:ENST00000476208:exon_190617661_190617866:ANKAR;ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190617575_190617705:OSGEPL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 T:G G T 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 191818323 A/C 1 10 17 27 4.66020267157992 9.07765545831414 -4.41745278673421 A:C A C 10 0.533979732842008 0.121329143267452 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000457316:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409428:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000412247:exon_191818291_191818352:GLS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 191874667 A/G 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 A:G A G 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000424722:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000454414:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000432058:exon_191874602_191874730:STAT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 197662526 T/C 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000119041:ENST00000263956:exon_197662521_197662632:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000409364:exon_197662521_197662632:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000455546:exon_197662521_197662623:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000448539:exon_197662521_197662632:GTF3C3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:C C A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 35 15 50 16.3107093505297 8.00969599263012 8.3010133578996 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0225219462152307 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 36 12 48 16.7767296176877 6.4077567941041 10.3689728235836 A:C A C 10 0.533979732842008 0.00336096856733776 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 41 38 79 19.1068309534777 20.2912298479963 -1.18439889451863 T:C C T 10 0.533979732842008 0.82208670637237 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 23 75 98 10.7184661446338 40.0484799631506 -29.3300138185168 A:G G A 10 0.533979732842008 2.61669944694331e-09 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 202025131 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 45 53 98 20.9709120221096 28.3009258406264 -7.33001381851678 A:G A G 10 0.533979732842008 0.156191282147306 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 24 25 49 11.1844864117918 13.3494933210502 -2.16500690925839 T:C T C 10 0.533979732842008 0.568716410457453 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 203152355 G/A 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.541075078613172 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 44 52 96 20.5048917549517 27.7669461077844 -7.26205435283276 A:C A C 10 0.533979732842008 0.152154417387268 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 12 4 16 5.5922432058959 2.13591893136803 3.45632427452787 A:C C A 10 0.533979732842008 0.130303890914635 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 A:C C A 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 209108317 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000441842:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000454793:exon_209108211_209108328:IDH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 209113192 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000454793:exon_209113090_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000432663:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415282:exon_209113093_209113384:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000462386:exon_209112106_209113384:IDH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 46 28 74 21.4369322892676 14.9514325195762 6.48549976969141 C:G C G 10 0.533979732842008 0.161600495847789 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 14 12 26 6.52428374021189 6.4077567941041 0.116526946107793 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 89 89 178 41.4758037770613 47.5241962229387 -6.04839244587741 A:G A G 10 0.533979732842008 0.368332315575211 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 17 24 41 7.92234454168586 12.8155135882082 -4.89316904652233 A:G G A 10 0.533979732842008 0.158229703534358 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 18 15 33 8.38836480884386 8.00969599263012 0.378668816213738 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 89 103 192 41.4758037770613 54.9999124827268 -13.5241087056655 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0510961063131181 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 220404997 C/T 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 223423491 C/G 1 36 30 66 16.7767296176877 16.0193919852602 0.757337632427475 C:G C G 10 0.533979732842008 0.902155640939578 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 228102752 C/A 1 1 12 13 0.466020267157992 6.4077567941041 -5.9417365269461 A:C C A 10 0.533979732842008 0.00106418117838477 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:T A T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 36 47 83 16.7767296176877 25.0970474435744 -8.32031782588666 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.0779548849455183 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 A:G A G 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 76 79 155 35.4175403040074 42.1843988945186 -6.76685859051123 T:C C T 10 0.533979732842008 0.295533074981512 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 55 57 112 25.6311146936896 30.4368447719945 -4.80573007830489 T:C C T 10 0.533979732842008 0.394330251183987 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 231077676 G/A 1 37 37 74 17.2427498848457 19.7572501151543 -2.51450023030858 A:G G A 10 0.533979732842008 0.562649793554737 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 166 197 363 77.3593643482267 105.194007369876 -27.8346430216489 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00376057795287887 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 19 30 49 8.85438507600185 16.0193919852602 -7.16500690925839 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0449451893636869 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234368821 T/C 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.565105757986092 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234394489 T/C 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 203 111 314 94.6021142330724 59.2717503454629 35.3303638876095 T:C T C 10 0.533979732842008 7.0305300253084e-05 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234749269 G/A 1 188 112 300 87.6118102257025 59.8057300783049 27.8060801473976 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00141914987948622 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 65 37 102 30.2913173652695 19.7572501151543 10.5340672501152 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0373856825573819 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 40 49 89 18.6408106863197 26.1650069092584 -7.52419622293871 T:G T G 10 0.533979732842008 0.112274838519446 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 29 44 73 13.5145877475818 23.4951082450483 -9.98052049746658 T:C:G G C 10 0.533979732842008 0.0251406188127726 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 T:C T C 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 238662154 A/G 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.129337985263742 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 50 55 105 23.3010133578996 29.3688853063104 -6.06787194841084 A:G A G 10 0.533979732842008 0.241869772203044 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 204 179 383 95.0681345002304 95.5823721787194 -0.514237678489053 A:C:G A G 10 0.533979732842008 0.959205701331954 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 125 109 234 58.252533394749 58.2037908797789 0.0487425149701437 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.129337985263742 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 27 37 64 12.5825472132658 19.7572501151543 -7.17470290188851 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0796038264083312 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 A:G A G 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 20 12 32 9.32040534315984 6.4077567941041 2.91264854905575 T:C T C 10 0.533979732842008 0.376330788398032 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 44 43 87 20.5048917549517 22.9611285122063 -2.45623675725469 A:G A G 10 0.533979732842008 0.667557402824516 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 2 242707101 A/G 1 2 22 24 0.932040534315984 11.7475541225242 -10.8155135882082 A:G A G 10 0.533979732842008 4.59153288555285e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:T T A 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 C:G G C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 9 16 25 4.19418240442193 8.54367572547213 -4.3494933210502 T:C T C 10 0.533979732842008 0.107499092273397 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 93 110 203 43.3398848456933 58.7377706126209 -15.3978857669276 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0345827466539614 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 826208 T/C 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 32 32 64 14.9126485490557 17.0873514509443 -2.17470290188851 T:C C T 10 0.533979732842008 0.617551135968687 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 150 161 311 69.9030400736988 85.9707369875633 -16.0676969138645 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0691154158793421 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 3870124 G/C 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 C:G G C 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000125779:ENST00000316562:exon_3869742_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000336066:exon_3870036_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000361370:exon_3870062_3870375:PANK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 42 35 77 19.5728512206357 18.6892906494703 0.883560571165386 A:C C A 10 0.533979732842008 0.909209448804589 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 44 35 79 20.5048917549517 18.6892906494703 1.81560110548137 A:G G A 10 0.533979732842008 0.735672203662675 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 A:G G A 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 13763442 T/C 1 119 134 253 55.4564117918011 71.5532842008291 -16.096872409028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0438229974292215 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 15967719 T/C 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C T C 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 25 23 48 11.6505066789498 12.2815338553662 -0.631027176416382 A:G G A 10 0.533979732842008 0.885692958356073 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 17608302 G/A 1 19 16 35 8.85438507600185 8.54367572547213 0.310709350529722 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 34 48 82 15.8446890833717 25.6310271764164 -9.78633809304465 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0350492644304290 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 A:T A T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G A G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 32 15 47 14.9126485490557 8.00969599263012 6.90295255642563 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0562560687413606 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204707877453861 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 25657518 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000130684:ENST00000376436:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000252979:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000376412:exon_25656306_25657673:ZNF337 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 30825596 C/T 1 35 25 60 16.3107093505297 13.3494933210502 2.96121602947952 T:C C T 10 0.533979732842008 0.518042421090703 ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30822276_30826470:POFUT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C T C 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 T:C C T 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 33867924 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 7 14 21 3.26214187010594 7.47571625978811 -4.21357438968217 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0800441681151879 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 14 9 23 6.52428374021189 4.80581759557807 1.71846614463382 T:C C T 10 0.533979732842008 0.535036921090915 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 34081351 A/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:T A T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34081256_34081399:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34081256_34081399:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34081256_34081399:CEP250 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 222 251 473 103.456499309074 134.028912943344 -30.5724136342698 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00492437898177684 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 34309643 T/C 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.091979109069095 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 36500313 C/A 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 A:C C A 10 0.533979732842008 0.281257084261409 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 42088708 G/A 1 58 31 89 27.0291754951635 16.5533717181022 10.4758037770613 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0330004521981047 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42088673_42088881:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42088673_42088881:SRSF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 129 95 224 60.116614463381 50.7280746199908 9.38853984339022 A:T:C:G T C 10 0.533979732842008 0.228012706210446 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 42302371 C/T 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 31 16 47 14.4466282818978 8.54367572547213 5.90295255642563 T:C T C 10 0.533979732842008 0.106933779402055 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 13 32 45 6.0582634730539 17.0873514509443 -11.0290879778904 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00140539156665774 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 43251240 A/G 1 74 58 132 34.4854997696914 30.9708245048365 3.51467526485495 A:G A G 10 0.533979732842008 0.600832426850682 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43251229_43251293:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43251229_43251293:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43251229_43251293:ADA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 27 21 48 12.5825472132658 11.2135743896822 1.36897282358362 T:C T C 10 0.533979732842008 0.77292167371695 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 15 20 35 6.99030400736988 10.6795946568402 -3.68929064947028 A:G A G 10 0.533979732842008 0.237485423172772 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 8 15 23 3.72816213726394 8.00969599263012 -4.28153385536618 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0936988538780524 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 44469290 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124104:ENST00000462307:exon_44469278_44469773:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000472219:exon_44469278_44470369:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000491381:exon_44469278_44470369:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000342644:exon_44469278_44469419:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000372545:exon_44469278_44470369:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000372542:exon_44469278_44470369:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000372541:exon_44469278_44469546:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000344780:exon_44469278_44471914:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000478230:exon_44469278_44469810:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000372547:exon_44469278_44471520:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000486336:exon_44469278_44469610:SNX21;ENSG00000124104:ENST00000465997:exon_44469278_44469729:SNX21 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 44511533 G/A 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 28 30 58 13.0485674804238 16.0193919852602 -2.97082450483646 A:G A G 10 0.533979732842008 0.51085151015067 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 48301146 G/A 1 3 12 15 1.39806080147398 6.4077567941041 -5.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0166220870951606 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 49191228 A/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:C A C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 52674615 A/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 56227514 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 44 58 102 20.5048917549517 30.9708245048365 -10.4659327498848 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0466267676895246 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 42 27 69 19.5728512206357 14.4174527867342 5.15539843390145 A:G A G 10 0.533979732842008 0.229084380156525 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:G G T 10 0.533979732842008 0.796960576034734 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 31 26 57 14.4466282818978 13.8834730538922 0.563155228005547 A:C C A 10 0.533979732842008 0.895341703507052 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G G A 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 92 70 162 42.8738645785353 37.3785812989406 5.49528327959471 A:C:G G C 10 0.533979732842008 0.431085326269163 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 61538601 C/T 1 21 13 34 9.78642561031783 6.9417365269461 2.84468908337173 T:C C T 10 0.533979732842008 0.391318244319092 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 62562302 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000101152:ENST00000369911:exon_62562204_62562375:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000360864:exon_62562204_62562375:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000470551:exon_62562204_62562375:DNAJC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 20 62703490 C/T 1 31 6 37 14.4466282818978 3.20387839705205 11.2427498848457 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.000186547394152334 ENSG00000171703:ENST00000461072:exon_62703223_62703699:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000475236:exon_62703223_62703699:TCEA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 15399864 T/C 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 18 11 29 8.38836480884386 5.87377706126209 2.51458774758177 C:G G C 10 0.533979732842008 0.457194054759145 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 6 12 18 2.79612160294795 6.4077567941041 -3.61163519115614 C:G G C 10 0.533979732842008 0.101098748879718 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 30408670 A/T 1 156 112 268 72.6991616766468 59.8057300783049 12.8934315983419 A:T A T 10 0.533979732842008 0.125730185943560 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30408592_30408695:USP16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 29 24 53 13.5145877475818 12.8155135882082 0.699074159373579 A:T:G T G 10 0.533979732842008 0.89111914118041 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 C:G G C 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 5 13 18 2.33010133578996 6.9417365269461 -4.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0338316318948813 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 39 29 68 18.1747904191617 15.4854122524182 2.68937816674346 T:C T C 10 0.533979732842008 0.545039966327549 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 10 15 25 4.66020267157992 8.00969599263012 -3.3494933210502 T:C T C 10 0.533979732842008 0.229050670812297 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 2 12 14 0.932040534315984 6.4077567941041 -5.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00513613100245990 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 A:T:C:G G A 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 21 12 33 9.78642561031783 6.4077567941041 3.37866881621374 C:G G C 10 0.533979732842008 0.295659016343474 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 72 61 133 33.5534592353754 32.5727637033625 0.980695532012945 T:C C T 10 0.533979732842008 0.930787094653726 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 16 18 34 7.45632427452787 9.61163519115614 -2.15531091662827 T:C T C 10 0.533979732842008 0.494805495350407 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 21 67 88 9.78642561031783 35.7766421004145 -25.9902164900967 T:C T C 10 0.533979732842008 2.11720904980622e-08 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 34 15 49 15.8446890833717 8.00969599263012 7.83499309074161 T:C C T 10 0.533979732842008 0.030804681485182 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 43896143 C/T 1 26 1 27 12.1165269461078 0.533979732842008 11.5825472132658 T:C C T 10 0.533979732842008 1.62910415713916e-06 ENSG00000160188:ENST00000291536:exon_43896008_43896157:RSPH1;ENSG00000160188:ENST00000493019:exon_43896008_43896157:RSPH1;ENSG00000160188:ENST00000398352:exon_43896008_43896157:RSPH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 T:C T C 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 14 18 32 6.52428374021189 9.61163519115614 -3.08735145094425 T:C T C 10 0.533979732842008 0.29217901070623 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 17 18 35 7.92234454168586 9.61163519115614 -1.68929064947028 A:G A G 10 0.533979732842008 0.613477751766752 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 T:C T C 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45750112 C/T 1 33 39 72 15.3786688162137 20.8252095808383 -5.44654076462457 T:C C T 10 0.533979732842008 0.237303484132455 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 34 39 73 15.8446890833717 20.8252095808383 -4.98052049746658 T:C T C 10 0.533979732842008 0.29098860081729 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 12 11 23 5.5922432058959 5.87377706126209 -0.281533855366183 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 13 12 25 6.0582634730539 6.4077567941041 -0.349493321050199 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 5 12 17 2.33010133578996 6.4077567941041 -4.07765545831414 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0537967789851417 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 A:C A C 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 6 12 18 2.79612160294795 6.4077567941041 -3.61163519115614 A:C A C 10 0.533979732842008 0.101098748879718 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 21 47961711 G/A 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.117493276348092 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000457905:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000427143:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000473752:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000494435:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47961669_47961808:DIP2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 3 11 14 1.39806080147398 5.87377706126209 -4.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0282342402988014 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 18900669 A/G 1 16 44 60 7.45632427452787 23.4951082450483 -16.0387839705205 A:G A G 10 0.533979732842008 4.07783787121675e-05 ENSG00000183628:ENST00000483718:exon_18899053_18901751:DGCR6;ENSG00000100033:ENST00000491604:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000420436:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000357068:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000334029:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000482858:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000429300:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000313755:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000414267:exon_18900295_18900875:PRODH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 18905977 C/T 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000100033:ENST00000491604:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000420436:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000357068:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000334029:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000482858:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000429300:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000313755:exon_18905829_18906004:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000414267:exon_18905829_18906004:PRODH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 19121872 G/A 1 10 19 29 4.66020267157992 10.1456149239982 -5.48541225241823 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0608000501778 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 T:C C T 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 19349374 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19349250_19349454:HIRA;ENSG00000242259:ENST00000509549:exon_19349250_19349454:C22orf39 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 C:G C G 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 5 14 19 2.33010133578996 7.47571625978811 -5.14561492399815 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0209709766423747 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 23 17 40 10.7184661446338 9.07765545831414 1.64081068631968 A:G G A 10 0.533979732842008 0.637585373695093 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 21067659 G/A 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000492581:exon_21066981_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000466772:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000399213:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000466394:exon_21067569_21067678:PI4KA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 18 23 41 8.38836480884386 12.2815338553662 -3.89316904652233 C:G C G 10 0.533979732842008 0.27317277225747 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 26 27 53 12.1165269461078 14.4174527867342 -2.30092584062642 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.582647376323401 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 0 34 0 34 15.8446890833717 0 15.8446890833717 C C 10 0.533979732842008 7.56810037430229e-10 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 17 24 41 7.92234454168586 12.8155135882082 -4.89316904652233 C:G C G 10 0.533979732842008 0.158229703534358 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 24472173 C/T 1 2 9 11 0.932040534315984 4.80581759557807 -3.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0299883171536232 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24472118_24472233:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24472118_24472233:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24472118_24472233:CABIN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 26838430 A/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:C A C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26838425_26838538:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26838425_26838538:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26838425_26838538:ASPHD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 21 26 47 9.78642561031783 13.8834730538922 -4.09704744357437 T:C C T 10 0.533979732842008 0.244808964628374 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 T:C C T 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 16 9 25 7.45632427452787 4.80581759557807 2.6505066789498 A:G A G 10 0.533979732842008 0.321584955566111 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 A:G A G 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 A:G A G 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 24 21 45 11.1844864117918 11.2135743896822 -0.0290879778903577 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 32894315 A/C 1 154 163 317 71.7671211423308 87.0386964532473 -15.2715753109165 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0911894279743097 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32894131_32894818:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32894131_32894816:FBXO7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 29 26 55 13.5145877475818 13.8834730538922 -0.368885306310437 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 80 102 182 37.2816213726394 54.4659327498848 -17.1843113772455 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0114425118584185 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 73 48 121 34.0194795025334 25.6310271764164 8.38845232611704 T:C T C 10 0.533979732842008 0.144645017238835 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 74 46 120 34.4854997696914 24.5630677107324 9.92243205895905 A:C C A 10 0.533979732842008 0.081721176989928 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 11 16 27 5.12622293873791 8.54367572547213 -3.41745278673421 A:G A G 10 0.533979732842008 0.246790470710579 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 37266458 G/A 1 12 28 40 5.5922432058959 14.9514325195762 -9.35918931368032 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00382529555442082 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37266457_37266584:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37266457_37266584:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37266457_37266584:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37266457_37266584:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37266457_37266584:NCF4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 21 22 43 9.78642561031783 11.7475541225242 -1.96112851220634 T:C T C 10 0.533979732842008 0.647067425847131 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 144 162 306 67.1069184707509 86.5047167204053 -19.3977982496544 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0293031553679985 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 37695256 T/C 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C T C 10 0.533979732842008 0.238414549935108 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 38021992 C/A 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 A:C C A 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000100083:ENST00000475445:exon_38021804_38023169:GGA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 11 17 28 5.12622293873791 9.07765545831414 -3.95143251957622 A:C C A 10 0.533979732842008 0.183910224836621 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 38164120 G/T 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39414240 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 8 4 12 3.72816213726394 2.13591893136803 1.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.400977756319596 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 12 6 18 5.5922432058959 3.20387839705205 2.38836480884386 A:C C A 10 0.533979732842008 0.346018795935265 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 13 6 19 6.0582634730539 3.20387839705205 2.85438507600185 T:C T C 10 0.533979732842008 0.251038003296366 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 17 8 25 7.92234454168586 4.27183786273606 3.6505066789498 C:G G C 10 0.533979732842008 0.163631830697504 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 24 25 49 11.1844864117918 13.3494933210502 -2.16500690925839 A:G G A 10 0.533979732842008 0.568716410457453 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G A G 10 0.533979732842008 0.516842352441035 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 C:G C G 10 0.533979732842008 0.541075078613172 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 53 49 102 24.6990741593736 26.1650069092584 -1.46593274988481 C:G G C 10 0.533979732842008 0.842784253376713 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 0 12 0 12 5.5922432058959 0 5.5922432058959 C C 10 0.533979732842008 0.000642319381394275 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 42 28 70 19.5728512206357 14.9514325195762 4.62141870105944 T:C C T 10 0.533979732842008 0.283049563169607 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 22 25 47 10.2524458774758 13.3494933210502 -3.09704744357437 T:C C T 10 0.533979732842008 0.383444337920977 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:G A G 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:C A C 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43278220 C/T 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43278190_43278256:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43278190_43278310:PACSIN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43289473 G/A 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 C:G G C 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 23 30 53 10.7184661446338 16.0193919852602 -5.30092584062642 T:C C T 10 0.533979732842008 0.168531571020118 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 143 113 256 66.6408982035929 60.3397098111469 6.30118839244597 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.45245223641414 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 44395451 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44395414_44395553:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44395414_44395553:PARVB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 45567580 C/A 1 10 3 13 4.66020267157992 1.60193919852602 3.0582634730539 A:C C A 10 0.533979732842008 0.101966663401288 ENSG00000093000:ENST00000497960:exon_45567481_45568087:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000484186:exon_45567481_45567627:NUP50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 45599054 G/A 1 16 7 23 7.45632427452787 3.73785812989406 3.71846614463382 A:G G A 10 0.533979732842008 0.144828679250741 ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000440039:exon_45599012_45599065:C22orf9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 46096224 A/G 1 29 38 67 13.5145877475818 20.2912298479963 -6.77664210041453 A:G A G 10 0.533979732842008 0.111228518093099 ENSG00000130638:ENST00000252934:exon_46096162_46096258:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000396011:exon_46096162_46096258:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000381061:exon_46096162_46096258:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000457846:exon_46096162_46096258:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000498009:exon_46096162_46096258:ATXN10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 46615880 T/C 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 T:C T C 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000186951:ENST00000396000:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000262735:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000407236:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000402126:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000493286:exon_46615709_46616554:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000434345:exon_46615709_46615911:PPARA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 40 45 85 18.6408106863197 24.0290879778904 -5.38827729157067 T:C T C 10 0.533979732842008 0.276967759051597 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50636357 C/T 1 58 64 122 27.0291754951635 34.1747029018885 -7.14552740672497 T:C C T 10 0.533979732842008 0.204588498652587 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636252_50636424:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636252_50636424:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636252_50636615:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636252_50636424:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50636252_50636424:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 127 109 236 59.184573929065 58.2037908797789 0.980783049286124 C:G G C 10 0.533979732842008 0.947997981921823 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 21 9 30 9.78642561031783 4.80581759557807 4.98060801473976 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0979315457841292 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 A:T T A 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50832506 C/T 1 8 20 28 3.72816213726394 10.6795946568402 -6.95143251957622 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0123680797200350 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50832322_50832564:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50832322_50832564:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50832322_50832564:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50832322_50832564:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50832322_50832564:PPP6R2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 17 20 37 7.92234454168586 10.6795946568402 -2.75725011515429 A:G G A 10 0.533979732842008 0.411526612215418 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 15 17 32 6.99030400736988 9.07765545831414 -2.08735145094425 T:G T G 10 0.533979732842008 0.483078089460155 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 18 23 41 8.38836480884386 12.2815338553662 -3.89316904652233 C:G G C 10 0.533979732842008 0.27317277225747 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 3170791 C/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G C G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000339437:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000465998:exon_3170698_3171180:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000420393:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000402675:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000413000:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000469632:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000397779:exon_3170724_3170872:TRNT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 A:G A G 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C T C 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 8 11 19 3.72816213726394 5.87377706126209 -2.14561492399815 T:C T C 10 0.533979732842008 0.363516478214209 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 22 23 45 10.2524458774758 12.2815338553662 -2.02908797789036 A:G G A 10 0.533979732842008 0.55395111452332 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 9489626 C/A 1 12 7 19 5.5922432058959 3.73785812989406 1.85438507600185 A:C C A 10 0.533979732842008 0.492774658327971 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000443339:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9489370_9489690:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000488236:exon_9489371_9489690:SETD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 10320592 T/C 1 8 12 20 3.72816213726394 6.4077567941041 -2.67959465684016 T:C T C 10 0.533979732842008 0.266289964581446 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10320569_10320747:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000426850:exon_10320569_10320849:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000496355:exon_10320569_10320718:TATDN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 34 27 61 15.8446890833717 14.4174527867342 1.42723629663752 T:C C T 10 0.533979732842008 0.797762907074716 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 11 3 14 5.12622293873791 1.60193919852602 3.52428374021189 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0653098505589489 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 29 39 68 13.5145877475818 20.8252095808383 -7.31062183325654 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0883954380801647 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 17 9 26 7.92234454168586 4.80581759557807 3.11652694610779 A:G G A 10 0.533979732842008 0.243529768696534 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 29 21 50 13.5145877475818 11.2135743896822 2.3010133578996 A:G G A 10 0.533979732842008 0.571966200304298 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 126 124 250 58.718553661907 66.213486872409 -7.494933210502 T:C T C 10 0.533979732842008 0.342574562439303 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 69 61 130 32.1553984339015 32.5727637033625 -0.41736526946103 A:T:C:G A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:C C A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 9 12 21 4.19418240442193 6.4077567941041 -2.21357438968217 T:G T G 10 0.533979732842008 0.385190864065462 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 9 13 22 4.19418240442193 6.9417365269461 -2.74755412252417 A:T T A 10 0.533979732842008 0.287431649196634 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 52 31 83 24.2330538922156 16.5533717181022 7.67968217411334 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0991517531177352 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 37090506 C/A 1 56 37 93 26.0971349608476 19.7572501151543 6.33988484569326 A:C C A 10 0.533979732842008 0.212390450901753 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37090395_37090508:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37090395_37090508:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37090395_37090508:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37090395_37090508:MLH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 34 30 64 15.8446890833717 16.0193919852602 -0.174702901888509 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 39433037 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39432932_39433111:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39432932_39433111:SLC25A38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 6 13 19 2.79612160294795 6.9417365269461 -4.14561492399815 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.0666823971512723 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G G C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 40573744 A/G 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000172888:ENST00000403205:exon_40573521_40575017:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000339296:exon_40573521_40579187:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000431278:exon_40573521_40575562:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000462161:exon_40573521_40573748:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000492098:exon_40573521_40574352:ZNF621 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 T:C C T 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 13 13 26 6.0582634730539 6.9417365269461 -0.883473053892207 T:C C T 10 0.533979732842008 0.844733344957102 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 27 16 43 12.5825472132658 8.54367572547213 4.03887148779366 T:C C T 10 0.533979732842008 0.225895300002125 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 16 4 20 7.45632427452787 2.13591893136803 5.32040534315984 T:G G T 10 0.533979732842008 0.0228161078280953 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 11 14 25 5.12622293873791 7.47571625978811 -2.3494933210502 A:G A G 10 0.533979732842008 0.423801544226412 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 89 54 143 41.4758037770613 28.8349055734684 12.6408982035929 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0360674949853596 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 39 34 73 18.1747904191617 18.1553109166283 0.019479502533418 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 49845460 C/G 1 45 50 95 20.9709120221096 26.6989866421004 -5.72807461999075 C:G C G 10 0.533979732842008 0.258493319647938 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49845453_49845545:UBA7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 49848045 C/T 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C C T 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49847950_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460516:exon_49847893_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460703:exon_49847959_49848105:UBA7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 50334642 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000450489:exon_50334636_50335103:NAT6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 17 10 27 7.92234454168586 5.33979732842008 2.58254721326579 A:C C A 10 0.533979732842008 0.34187731653146 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 T:G T G 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 51472033 A/G 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 A A 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 63 68 131 29.3592768309535 36.3106218332565 -6.95134500230304 A:G G A 10 0.533979732842008 0.254846265849135 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 51737995 T/C 1 103 73 176 48.0000875172732 38.9805204974666 9.0195670198066 T:C T C 10 0.533979732842008 0.174867817460977 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 52562663 T/C 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 T:C T C 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000486792:exon_52562653_52562781:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52562653_52562708:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52562653_52562708:NT5DC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C C T 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 13 18 31 6.0582634730539 9.61163519115614 -3.55337171810225 T:C C T 10 0.533979732842008 0.212350667650115 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 64009102 G/T 1 19 15 34 8.85438507600185 8.00969599263012 0.84468908337173 T:G G T 10 0.533979732842008 0.864128994545874 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64008951_64009236:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64008951_64009148:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64008727_64009154:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64008951_64009132:PSMD6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 73111809 A/G 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:G A G 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 6 14 20 2.79612160294795 7.47571625978811 -4.67959465684016 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0432899652170152 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 13 14 27 6.0582634730539 7.47571625978811 -1.41745278673421 T:C T C 10 0.533979732842008 0.700482584843573 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 12 2 14 5.5922432058959 1.06795946568402 4.52428374021189 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0157567122608690 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 93768268 C/G 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 C:G C G 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000169379:ENST00000303097:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000394222:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000471138:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000460371:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000335438:exon_93768250_93768366:ARL13B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 T:C T C 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:G T G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 27 22 49 12.5825472132658 11.7475541225242 0.834993090741611 A:G G A 10 0.533979732842008 0.886513021471209 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 99897169 A/C 1 93 85 178 43.3398848456933 45.3882772915707 -2.04839244587741 A:C A C 10 0.533979732842008 0.764337655433995 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99897149_99897447:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99897149_99897443:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99897149_99897199:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99897149_99897443:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000494412:exon_99897149_99897447:C3orf26 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 100287764 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 105421034 C/T 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 T:C C T 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105420938_105421045:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105420938_105421303:CBLB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 9 5 14 4.19418240442193 2.66989866421004 1.52428374021189 A:T A T 10 0.533979732842008 0.593885309282772 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 26 17 43 12.1165269461078 9.07765545831414 3.03887148779366 T:C C T 10 0.533979732842008 0.364494136625054 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 105 133 238 48.9321280515892 71.0193044679871 -22.0871764163979 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00422860774553174 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 137 75 212 63.8447766006449 40.0484799631506 23.7962966374943 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00116487514349681 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 20 24 44 9.32040534315984 12.8155135882082 -3.49510824504835 T:C C T 10 0.533979732842008 0.295184346205203 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 A:G G A 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 38 26 64 17.7087701520037 13.8834730538922 3.82529709811149 T:C T C 10 0.533979732842008 0.38121259794845 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 122056432 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000121552:ENST00000264474:exon_122056394_122056495:CSTA;ENSG00000121552:ENST00000479204:exon_122056394_122057117:CSTA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 12 23 35 5.5922432058959 12.2815338553662 -6.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0271631402642049 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 11 11 22 5.12622293873791 5.87377706126209 -0.747554122524175 T:C T C 10 0.533979732842008 0.832114988289712 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 13 10 23 6.0582634730539 5.33979732842008 0.718466144633817 A:G G A 10 0.533979732842008 0.836411835071984 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 31 29 60 14.4466282818978 15.4854122524182 -1.03878397052048 C:G G C 10 0.533979732842008 0.797257553646866 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 67 56 123 31.2233578995855 29.9028650391524 1.32049286043302 T:C C T 10 0.533979732842008 0.856759483330834 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 124826408 T/C 1 13 6 19 6.0582634730539 3.20387839705205 2.85438507600185 T:C T C 10 0.533979732842008 0.251038003296366 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826325_124826615:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124826325_124826475:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000461616:exon_124826325_124826421:SLC12A8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 15 15 30 6.99030400736988 8.00969599263012 -1.01939198526024 T:C C T 10 0.533979732842008 0.718610377950308 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 37 51 88 17.2427498848457 27.2329663749424 -9.9902164900967 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0417281311396726 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 17 17 34 7.92234454168586 9.07765545831414 -1.15531091662827 A:G G A 10 0.533979732842008 0.733025840444282 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 132401600 C/T 1 4 11 15 1.86408106863197 5.87377706126209 -4.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0663544192530847 ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000474871:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000493732:exon_132400126_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000490993:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000465756:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000337331:exon_132401547_132401662:NPHP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 A:G G A 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:G T G 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 136664453 T/C 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 T:C T C 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000158092:ENST00000288986:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000481752:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000491539:exon_136664425_136664585:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000485096:exon_136664425_136664544:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000488930:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000496489:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000469404:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000467911:exon_136664425_136664594:NCK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 A:G G A 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:T T A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 138289163 T/C 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 T:C T C 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 138289221 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 142123914 C/T 1 7 1 8 3.26214187010594 0.533979732842008 2.72816213726394 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0753755727272084 ENSG00000114127:ENST00000264951:exon_142123749_142123918:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000498077:exon_142123749_142123915:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000392981:exon_142123749_142123918:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000472697:exon_142123749_142123918:XRN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 10 18 28 4.66020267157992 9.61163519115614 -4.95143251957622 T:C C T 10 0.533979732842008 0.086439244923903 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:G T G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 37 34 71 17.2427498848457 18.1553109166283 -0.912561031782563 C:G G C 10 0.533979732842008 0.905429174900529 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 T:C T C 10 0.533979732842008 0.782419722323192 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 30 40 70 13.9806080147398 21.3591893136803 -7.37858129894056 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0929178429565389 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 160146671 A/G 1 43 30 73 20.0388714877937 16.0193919852602 4.01947950253342 A:G A G 10 0.533979732842008 0.411713977654293 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000488017:exon_160146584_160146730:SMC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 160146726 G/A 1 58 49 107 27.0291754951635 26.1650069092584 0.864168585905151 A:G G A 10 0.533979732842008 0.922908132197841 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160146541_160146730:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000488017:exon_160146584_160146730:SMC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 28 31 59 13.0485674804238 16.5533717181022 -3.50480423767847 A:G G A 10 0.533979732842008 0.364720574142017 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 21 15 36 9.78642561031783 8.00969599263012 1.77672961768771 A:G A G 10 0.533979732842008 0.618144982656518 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 179085343 T/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179085227_179085380:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179085227_179085380:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179085227_179085380:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179085227_179085380:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000474903:exon_179085227_179085380:MFN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 44 28 72 20.5048917549517 14.9514325195762 5.55345923537543 T:C C T 10 0.533979732842008 0.196109857728677 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 183515682 A/G 1 6 7 13 2.79612160294795 3.73785812989406 -0.941736526946103 A:G A G 10 0.533979732842008 0.782419722323192 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 61 73 134 28.4272362966375 38.9805204974666 -10.5532842008291 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0694567061867182 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 183960671 C/T 1 32 32 64 14.9126485490557 17.0873514509443 -2.17470290188851 T:C C T 10 0.533979732842008 0.617551135968687 ENSG00000214160:ENST00000411922:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000397676:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000445626:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000458439:exon_183960601_183960743:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000418734:exon_183960601_183960743:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000485912:exon_183960601_183961377:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000455059:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000446569:exon_183960601_183960745:ALG3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 26 13 39 12.1165269461078 6.9417365269461 5.17479041916169 T:C T C 10 0.533979732842008 0.109292104830820 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184044684 G/A 1 29 29 58 13.5145877475818 15.4854122524182 -1.97082450483646 A:G G A 10 0.533979732842008 0.602063454970399 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000448284:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000466311:exon_184044669_184044696:EIF4G1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184049143 C/T 1 117 124 241 54.5243712574851 66.213486872409 -11.6891156149239 T:C C T 10 0.533979732842008 0.137677455250451 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184049054_184049152:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184049054_184049394:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000478291:exon_184049102_184049152:EIF4G1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 14 4 18 6.52428374021189 2.13591893136803 4.38836480884386 A:C C A 10 0.533979732842008 0.0559466590370494 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 184766325 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 0 1281 0 1281 596.971962229388 0 596.971962229388 T T 10 0.533979732842008 0 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 770 5 775 358.835605711654 2.66989866421004 356.165707047444 A:T:C:G G T 10 0.533979732842008 9.74792540557396e-200 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 185229464 T/C 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185229312_185229485:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185229312_185229485:LIPH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:C C A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 18 9 27 8.38836480884386 4.80581759557807 3.58254721326579 T:C C T 10 0.533979732842008 0.181858757423827 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 T:C C T 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 26 23 49 12.1165269461078 12.2815338553662 -0.165006909258389 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 66 71 137 30.7573376324275 37.9125610317826 -7.15522339935509 A:C C A 10 0.533979732842008 0.231179859846689 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 4 13 17 1.86408106863197 6.9417365269461 -5.07765545831414 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0150653116930916 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 195063347 G/A 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 A:G G A 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000423531:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000480906:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000481463:exon_195063335_195063383:ACAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 195593777 C/T 1 32 31 63 14.9126485490557 16.5533717181022 -1.6407231690465 T:C C T 10 0.533979732842008 0.70607250596614 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195593760_195593887:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195593760_195593887:TNK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 8 9 17 3.72816213726394 4.80581759557807 -1.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.634159114777915 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 196022961 G/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:G G T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000213123:ENST00000465757:exon_196022877_196023177:TCTEX1D2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 196089400 G/A 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 A:G G A 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000163960:ENST00000296328:exon_196089165_196089558:UBXN7;ENSG00000163960:ENST00000429160:exon_196089165_196089558:UBXN7;ENSG00000163960:ENST00000428095:exon_196089165_196089558:UBXN7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 196730926 G/A 1 9 17 26 4.19418240442193 9.07765545831414 -4.88347305389221 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.0751233621346127 ENSG00000163975:ENST00000469783:exon_196730772_196731050:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196730772_196730970:MFI2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 2 8 10 0.932040534315984 4.27183786273606 -3.33979732842008 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0528950918346824 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 13 22 35 6.0582634730539 11.7475541225242 -5.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0623141824356604 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:C C T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 44 48 92 20.5048917549517 25.6310271764164 -5.12613542146473 T:C T C 10 0.533979732842008 0.297288887718191 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 758789 C/T 1 15 9 24 6.99030400736988 4.80581759557807 2.18448641179181 T:C C T 10 0.533979732842008 0.418245035192846 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_758772_758852:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_758772_758852:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_758772_758852:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_758772_758852:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_758772_758852:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_758772_758852:PCGF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 759872 T/C 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:C T C 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 A:G A G 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 13 5 18 6.0582634730539 2.66989866421004 3.38836480884386 T:C T C 10 0.533979732842008 0.155140017910685 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 20 13 33 9.32040534315984 6.9417365269461 2.37866881621374 T:C T C 10 0.533979732842008 0.486410169421634 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 1165130 G/T 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:G G T 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165051_1165274:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000507466:exon_1165051_1165413:SPON2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 1980561 C/T 1 29 37 66 13.5145877475818 19.7572501151543 -6.24266236757252 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.138872091830715 ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1980365_1980641:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1980365_1983934:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1980365_1983934:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000482415:exon_1980365_1981523:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382888:exon_1980365_1980642:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000350915:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508299:exon_1980365_1980629:WHSC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 145 125 270 67.5729387379088 66.747466605251 0.82547213265785 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.951390352291933 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 23 20 43 10.7184661446338 10.6795946568402 0.0388714877936582 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 24 25 49 11.1844864117918 13.3494933210502 -2.16500690925839 C:G C G 10 0.533979732842008 0.568716410457453 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 19 15 34 8.85438507600185 8.00969599263012 0.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.864128994545874 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 9 1 10 4.19418240442193 0.533979732842008 3.66020267157992 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0243520340127106 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 2955284 T/C 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:C T C 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2955238_2955372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2955238_2955372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2955238_2955372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2955238_2955372:NOP14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G G A 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 4 11 15 1.86408106863197 5.87377706126209 -4.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0663544192530847 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 43 56 99 20.0388714877937 29.9028650391524 -9.86399355135879 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0551658499634105 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 98 90 188 45.6699861814832 48.0581759557807 -2.38818977429749 A:C C A 10 0.533979732842008 0.770080472662968 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5749904 T/C 1 2 10 12 0.932040534315984 5.33979732842008 -4.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0168046456242538 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5749961 G/C 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 C:G G C 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5795412 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5795335_5795444:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5795335_5795444:EVC;ENSG00000072840:ENST00000506240:exon_5795241_5795444:EVC;ENSG00000072840:ENST00000515113:exon_5795335_5795444:EVC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5803633 C/T 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5803669 T/C 1 9 1 10 4.19418240442193 0.533979732842008 3.66020267157992 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0243520340127106 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 5812778 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5812680_5816032:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5812680_5815889:EVC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 8390948 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8390900_8391013:ACOX3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 15628518 T/C 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000118564:ENST00000422585:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000382358:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000341285:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000412094:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000511441:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000513163:exon_15628496_15628578:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000507700:exon_15628496_15628578:FBXL5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 87 63 150 40.5437632427453 33.6407231690465 6.9030400736988 T:C T C 10 0.533979732842008 0.287422860844229 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 17805490 T/C 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000163257:ENST00000382247:exon_17802278_17806394:DCAF16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 27 23 50 12.5825472132658 12.2815338553662 0.301013357899603 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 25777951 A/G 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 A:G A G 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25777899_25777982:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25777899_25777982:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25777899_25777982:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000509290:exon_25777899_25778341:SEL1L3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 49 41 90 22.8349930907416 21.8931690465223 0.941824044219288 A:G G A 10 0.533979732842008 0.915949613473953 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 93 185 278 43.3398848456933 98.7862505757715 -55.4463657300782 A:T:G A G 10 0.533979732842008 3.13240467038727e-11 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 40 86 126 18.6408106863197 45.9222570244127 -27.281446338093 A:G A G 10 0.533979732842008 1.05686255371735e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:C C A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 30 98 128 13.9806080147398 52.3300138185168 -38.349405803777 A:T:G T G 10 0.533979732842008 7.04214710751646e-12 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 50 86 136 23.3010133578996 45.9222570244127 -22.6212436665131 A:C C A 10 0.533979732842008 0.000136777957404879 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 22 39 61 10.2524458774758 20.8252095808383 -10.5727637033625 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00696955055752183 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 10 16 26 4.66020267157992 8.54367572547213 -3.88347305389221 A:T A T 10 0.533979732842008 0.167959342288254 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 13 14 27 6.0582634730539 7.47571625978811 -1.41745278673421 T:G T G 10 0.533979732842008 0.700482584843573 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38798515 G/A 1 8 12 20 3.72816213726394 6.4077567941041 -2.67959465684016 A:G G A 10 0.533979732842008 0.266289964581446 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38995310 A/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 38995374 T/C 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 39739042 G/A 1 81 76 157 37.7476416397974 40.5824596959926 -2.83481805619525 A:G G A 10 0.533979732842008 0.689376103331284 ENSG00000078140:ENST00000261427:exon_39739040_39739133:UBE2K;ENSG00000078140:ENST00000510934:exon_39739040_39739133:UBE2K;ENSG00000078140:ENST00000438068:exon_39739040_39739133:UBE2K;ENSG00000078140:ENST00000295963:exon_39739040_39739133:UBE2K;ENSG00000078140:ENST00000445950:exon_39739040_39739133:UBE2K HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 T:C C T 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 8 2 10 3.72816213726394 1.06795946568402 2.66020267157992 T:C T C 10 0.533979732842008 0.117493276348092 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 1 8 9 0.466020267157992 4.27183786273606 -3.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0152569455067580 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 8 15 23 3.72816213726394 8.00969599263012 -4.28153385536618 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0936988538780524 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 5 13 18 2.33010133578996 6.9417365269461 -4.61163519115614 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0338316318948813 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:G G A 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 37 38 75 17.2427498848457 20.2912298479963 -3.04847996315059 T:C C T 10 0.533979732842008 0.48973340867015 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 14 8 22 6.52428374021189 4.27183786273606 2.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.396430767567554 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 5 9 14 2.33010133578996 4.80581759557807 -2.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.28371002149275 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 7 28 35 3.26214187010594 14.9514325195762 -11.6892906494703 T:C C T 10 0.533979732842008 6.43959517337997e-05 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 A:G A G 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 28 24 52 13.0485674804238 12.8155135882082 0.233053892215587 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 74451073 A/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 74451092 T/G 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:G T G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 T:C T C 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 38 43 81 17.7087701520037 22.9611285122063 -5.25235836020265 A:G G A 10 0.533979732842008 0.26590453260543 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 7 18 25 3.26214187010594 9.61163519115614 -6.3494933210502 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0146756206275409 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 22 23 45 10.2524458774758 12.2815338553662 -2.02908797789036 T:G G T 10 0.533979732842008 0.55395111452332 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 83381295 C/T 1 13 17 30 6.0582634730539 9.07765545831414 -3.01939198526024 T:C C T 10 0.533979732842008 0.278698265019382 ENSG00000145293:ENST00000273920:exon_83381134_83382244:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000509635:exon_83381134_83382208:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000505846:exon_83381134_83382240:ENOPH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 14 17 31 6.52428374021189 9.07765545831414 -2.55337171810225 A:G A G 10 0.533979732842008 0.373773724713525 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 10 20 30 4.66020267157992 10.6795946568402 -6.01939198526024 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0422642408400219 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 86852097 G/T 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:G G T 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86851426_86852195:ARHGAP24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 12 9 21 5.5922432058959 4.80581759557807 0.786425610317833 A:G A G 10 0.533979732842008 0.82850726887389 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 45 43 88 20.9709120221096 22.9611285122063 -1.9902164900967 C:G C G 10 0.533979732842008 0.67094207470673 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 32 29 61 14.9126485490557 15.4854122524182 -0.572763703362485 T:C C T 10 0.533979732842008 0.898531735005664 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 104067200 G/C 1 37 45 82 17.2427498848457 24.0290879778904 -6.78633809304465 C:G G C 10 0.533979732842008 0.150129551360062 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 25 18 43 11.6505066789498 9.61163519115614 2.03887148779366 T:C C T 10 0.533979732842008 0.545918304552552 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 511 542 1053 238.136356517734 289.417015200368 -51.2806586826344 A:T:G A T 10 0.533979732842008 0.00161992853885537 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 83 52 135 38.6796821741133 27.7669461077844 10.9127360663289 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0696798187358584 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 113462395 T/C 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 T:C T C 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000138658:ENST00000505019:exon_113462248_113462424:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000445413:exon_113462248_113462424:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000313239:exon_113462248_113462424:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000506675:exon_113462248_113462424:C4orf21 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 113569135 G/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:G G T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 16 8 24 7.45632427452787 4.27183786273606 3.18448641179181 A:C A C 10 0.533979732842008 0.223111709254795 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 12 10 22 5.5922432058959 5.33979732842008 0.252445877475825 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 4 12 16 1.86408106863197 6.4077567941041 -4.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.025216264141459 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 9 12 21 4.19418240442193 6.4077567941041 -2.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.385190864065462 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 A:C C A 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 9 1 10 4.19418240442193 0.533979732842008 3.66020267157992 A:T A T 10 0.533979732842008 0.0243520340127106 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:G A G 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 140036422 T/C 1 6 36 42 2.79612160294795 19.2232703823123 -16.4271487793643 T:C T C 10 0.533979732842008 1.92781686264368e-07 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C T C 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 7 13 20 3.26214187010594 6.9417365269461 -3.67959465684016 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.118092054429731 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 146073711 A/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000164164:ENST00000455611:exon_146073693_146073787:OTUD4;ENSG00000164164:ENST00000454497:exon_146073693_146073787:OTUD4;ENSG00000164164:ENST00000394097:exon_146073693_146073787:OTUD4;ENSG00000164164:ENST00000296578:exon_146073693_146073787:OTUD4;ENSG00000164164:ENST00000447906:exon_146073693_146073787:OTUD4;ENSG00000164164:ENST00000514973:exon_146073693_146073787:OTUD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 148605099 C/A 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164169:ENST00000322396:exon_148604950_148605381:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000514886:exon_148604950_148605276:PRMT10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 10 6 16 4.66020267157992 3.20387839705205 1.45632427452787 A:G A G 10 0.533979732842008 0.618014249261772 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 26 21 47 12.1165269461078 11.2135743896822 0.902952556425626 T:C C T 10 0.533979732842008 0.88404744521996 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 33 15 48 15.3786688162137 8.00969599263012 7.36897282358362 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0418023848123047 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 A:G A G 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 42 23 65 19.5728512206357 12.2815338553662 7.29131736526948 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0813735696906343 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 24 21 45 11.1844864117918 11.2135743896822 -0.0290879778903577 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 186263218 C/T 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186263130_186263270:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186263130_186263270:SNX25 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 4 186336465 T/C 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:C T C 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000502428:exon_186336438_186336501:UFSP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 37 33 70 17.2427498848457 17.6213311837863 -0.378581298940553 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 94 87 181 43.8059051128512 46.4562367572547 -2.65033164440344 T:C T C 10 0.533979732842008 0.70993135644438 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 344026 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000249915:ENST00000506909:exon_344008_344079:PDCD6;ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000514523:exon_344008_344084:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510400:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000515206:exon_344008_344079:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000504625:exon_344008_344079:AHRR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 C:G G C 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 447737 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_447648_447867:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_447648_447867:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_447648_447867:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_447648_447867:EXOC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 A:C A C 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 15 11 26 6.99030400736988 5.87377706126209 1.11652694610779 A:G G A 10 0.533979732842008 0.698803906557757 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 T:C C T 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 104 99 203 48.4661077844312 52.8639935513588 -4.39788576692762 A:G G A 10 0.533979732842008 0.573702147959833 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 28 20 48 13.0485674804238 10.6795946568402 2.36897282358362 A:G A G 10 0.533979732842008 0.563680486241117 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 9 12 21 4.19418240442193 6.4077567941041 -2.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.385190864065462 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 31526371 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512076:exon_31526186_31526527:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512302:exon_31526186_31526433:DROSHA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 0 0 14 14 0 7.47571625978811 -7.47571625978811 T C T 10 0.533979732842008 2.27859564567246e-05 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 18 16 34 8.38836480884386 8.54367572547213 -0.15531091662827 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G A G 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 54696126 A/G 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54696061_54696249:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54696061_54696249:SKIV2L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 64020114 A/G 1 70 87 157 32.6214187010594 46.4562367572547 -13.8348180561953 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0305290072186806 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 34 16 50 15.8446890833717 8.54367572547213 7.3010133578996 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0464126219804141 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 65339026 G/A 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 A:G G A 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65338905_65339026:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65338905_65339026:ERBB2IP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 A:T A T 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 T:G G T 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 13 18 31 6.0582634730539 9.61163519115614 -3.55337171810225 T:C C T 10 0.533979732842008 0.212350667650115 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 T:G T G 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 72182857 A/G 1 17 24 41 7.92234454168586 12.8155135882082 -4.89316904652233 A:G A G 10 0.533979732842008 0.158229703534358 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 72798724 T/G 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:G T G 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 74652199 A/G 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74652168_74652273:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74652168_74652273:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74652168_74652273:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000508070:exon_74652168_74652274:HMGCR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 4 15 19 1.86408106863197 8.00969599263012 -6.14561492399815 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00518353339436301 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 8 11 19 3.72816213726394 5.87377706126209 -2.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.363516478214209 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 78573831 C/A 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 A:C C A 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78573733_78573906:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78573733_78573906:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78573733_78573906:JMY HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 42 53 95 19.5728512206357 28.3009258406264 -8.72807461999075 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0803510248844965 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G A G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 89820984 T/C 1 2 19 21 0.932040534315984 10.1456149239982 -9.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 3.46116536747268e-05 ENSG00000176018:ENST00000500869:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000315948:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000509384:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000453259:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000254085:ENST00000517526:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000520100:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000426853:exon_89820852_89821117:LYSMD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 T:C C T 10 0.533979732842008 0.816539050312805 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 16 14 30 7.45632427452787 7.47571625978811 -0.0193919852602384 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 95084131 G/A 1 13 2 15 6.0582634730539 1.06795946568402 4.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0093536109080249 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000506959:exon_95084037_95084145:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000510623:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95084037_95084191:RHOBTB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 36 37 73 16.7767296176877 19.7572501151543 -2.98052049746658 C:G G C 10 0.533979732842008 0.484645678133814 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96116940 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96124296 C/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G C G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 22 28 50 10.2524458774758 14.9514325195762 -4.6989866421004 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.203045806058057 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 16 23 39 7.45632427452787 12.2815338553662 -4.82520958083831 T:C C T 10 0.533979732842008 0.148212562448611 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 C:G G C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 102353089 A/C 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:C A C 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102353038_102353137:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102353038_102353137:PAM HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 108680471 T/C 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108680406_108680520:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108680406_108680520:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108680406_108680520:PJA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 110461450 G/A 1 19 13 32 8.85438507600185 6.9417365269461 1.91264854905575 A:G G A 10 0.533979732842008 0.596065477470417 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110461306_110461493:WDR36 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 111497330 C/A 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:C C A 10 0.533979732842008 0.759536905354992 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 111497358 T/G 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:G T G 10 0.533979732842008 0.74200360843589 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 112197082 C/T 1 3 10 13 1.39806080147398 5.33979732842008 -3.9417365269461 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0474124643534524 ENSG00000153037:ENST00000503445:exon_112196885_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000505459:exon_112196919_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000506997:exon_112196992_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000282999:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000512790:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515463:exon_112197007_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515755:exon_112197023_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000445150:exon_112197029_112197114:SRP19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 112238039 A/C 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 A:C A C 10 0.533979732842008 0.485753313180244 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 23 17 40 10.7184661446338 9.07765545831414 1.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.637585373695093 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 112312580 T/C 1 1 8 9 0.466020267157992 4.27183786273606 -3.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0152569455067580 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112312399_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112312407_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112312433_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000510046:exon_112312491_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000504961:exon_112312510_112312683:DCP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:G T G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 115822585 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503402:exon_115822445_115822925:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510024:exon_115822337_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000502996:exon_115822445_115822662:SEMA6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:T T A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 C:G C G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 123983915 G/T 1 22 20 42 10.2524458774758 10.6795946568402 -0.427148779364334 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 123984763 C/T 1 7 12 19 3.26214187010594 6.4077567941041 -3.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.171287635630369 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000509799:exon_123983930_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000513986:exon_123983956_123984826:ZNF608 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 125819209 G/A 1 7 12 19 3.26214187010594 6.4077567941041 -3.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.171287635630369 ENSG00000155324:ENST00000513040:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000506445:exon_125819155_125819241:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000285689:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000515200:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000514099:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000513978:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000502348:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000511134:exon_125819155_125819266:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000504859:exon_125819155_125819338:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000508523:exon_125819155_125819241:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000512579:exon_125819155_125819266:GRAMD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 12 24 36 5.5922432058959 12.8155135882082 -7.22327038231229 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0186978803963462 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 125960350 G/A 1 55 46 101 25.6311146936896 24.5630677107324 1.0680469829572 A:G G A 10 0.533979732842008 0.842685920828483 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125960267_125962944:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125960267_125961080:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000511371:exon_125960267_125960901:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000513813:exon_125960267_125961170:PHAX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 126140522 T/C 1 20 16 36 9.32040534315984 8.54367572547213 0.776729617687714 T:C T C 10 0.533979732842008 0.868106197168173 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000472034:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000492190:exon_126140468_126140606:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000395354:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000463908:exon_126140468_126140624:LMNB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 126171974 C/T 1 97 90 187 45.2039659143252 48.0581759557807 -2.85421004145548 T:C C T 10 0.533979732842008 0.714145968559373 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126171915_126172706:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126171915_126172712:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126171915_126172263:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000484340:exon_126171915_126172366:LMNB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 11 11 22 5.12622293873791 5.87377706126209 -0.747554122524175 A:G G A 10 0.533979732842008 0.832114988289712 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 131819798 T/C 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 131819800 G/A 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 23 15 38 10.7184661446338 8.00969599263012 2.7087701520037 T:C T C 10 0.533979732842008 0.419058355262351 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 69 77 146 32.1553984339015 41.1164394288346 -8.96104099493316 T:C C T 10 0.533979732842008 0.158247907684055 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 A:G G A 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 9 9 18 4.19418240442193 4.80581759557807 -0.611635191156143 T:C T C 10 0.533979732842008 0.816539050312805 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 47 86 133 21.9029525564256 45.9222570244127 -24.0193044679871 T:C T C 10 0.533979732842008 3.6940467132653e-05 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 26 9 35 12.1165269461078 4.80581759557807 7.31070935052972 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.0165703824185678 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 15 5 20 6.99030400736988 2.66989866421004 4.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0711729581189506 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 C:G C G 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139661085 A/G 1 94 94 188 43.8059051128512 50.1940948871488 -6.3881897742975 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.380452021863835 ENSG00000120306:ENST00000509789:exon_139661082_139661635:C5orf32;ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139661034_139661118:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139661034_139661118:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000512707:exon_139661034_139661120:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139661030_139661118:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000512925:exon_139661034_139661118:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139660545_139661118:PFDN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139931779 T/A 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:T T A 10 0.533979732842008 0.485527419132807 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 36 33 69 16.7767296176877 17.6213311837863 -0.844601566098547 T:G G T 10 0.533979732842008 0.904111009242406 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G G A 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139941228 A/G 1 13 5 18 6.0582634730539 2.66989866421004 3.38836480884386 A:G A G 10 0.533979732842008 0.155140017910685 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511201:exon_139941172_139941292:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000506289:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000508496:exon_139941172_139941310:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 139941318 A/G 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 A:G A G 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 8 14 22 3.72816213726394 7.47571625978811 -3.74755412252417 T:C T C 10 0.533979732842008 0.134977557415204 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 C:G C G 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 141019881 G/C 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 C:G G C 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 11 3 14 5.12622293873791 1.60193919852602 3.52428374021189 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0653098505589489 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 54 33 87 25.1650944265316 17.6213311837863 7.54376324274531 T:C C T 10 0.533979732842008 0.108168050447897 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 39 36 75 18.1747904191617 19.2232703823123 -1.0484799631506 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.817966344308245 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 13 10 23 6.0582634730539 5.33979732842008 0.718466144633817 A:G A G 10 0.533979732842008 0.836411835071984 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 25 7 32 11.6505066789498 3.73785812989406 7.91264854905575 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00686289455272232 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 9 14 23 4.19418240442193 7.47571625978811 -3.28153385536618 A:G G A 10 0.533979732842008 0.210551057444704 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:G T G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 4065 3922 7987 1894.37238599724 2094.26851220636 -199.896126209118 A:T:C:G C T 10 0.533979732842008 7.6152894930561e-06 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 254 296 550 118.36914785813 158.058000921234 -39.6888530631044 A:G A G 10 0.533979732842008 0.000725630465394746 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 52 31 83 24.2330538922156 16.5533717181022 7.67968217411334 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0991517531177352 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 19 5 24 8.85438507600185 2.66989866421004 6.18448641179181 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0129674950644784 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 153788991 G/C 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 C:G G C 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G A G 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 157158553 C/T 1 24 21 45 11.1844864117918 11.2135743896822 -0.0290879778903577 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157158205_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157158428_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157158428_157158639:THG1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 38 41 79 17.7087701520037 21.8931690465223 -4.18439889451863 A:G G A 10 0.533979732842008 0.368090933493533 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 47 42 89 21.9029525564256 22.4271487793643 -0.524196222938709 T:C T C 10 0.533979732842008 0.915833030285662 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 169702390 C/A 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:C C A 10 0.533979732842008 0.188759088593184 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 171517343 G/T 1 26 16 42 12.1165269461078 8.54367572547213 3.57285122063567 T:G G T 10 0.533979732842008 0.28341661624273 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171517236_171517366:STK10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G A G 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 175843389 T/C 0 21 0 21 9.78642561031783 0 9.78642561031783 T T 10 0.533979732842008 2.00556229209642e-06 ENSG00000175416:ENST00000310418:exon_175843178_175843570:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000345807:exon_175843178_175843570:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000510734:exon_175843178_175843540:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000502877:exon_175843178_175843539:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000428448:exon_175843178_175843540:CLTB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 T:G G T 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 A:G G A 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176795906 G/C 1 25 22 47 11.6505066789498 11.7475541225242 -0.0970474435743736 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000169220:ENST00000408923:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000398128:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000336477:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000514713:exon_176795718_176796076:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000511890:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000425155:exon_176795718_176795921:RGS14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 58 63 121 27.0291754951635 33.6407231690465 -6.61154767388296 C:G G C 10 0.533979732842008 0.237123936380751 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 20 23 43 9.32040534315984 12.2815338553662 -2.96112851220634 A:G A G 10 0.533979732842008 0.44509386974926 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 22 3 25 10.2524458774758 1.60193919852602 8.6505066789498 T:C T C 10 0.533979732842008 0.000406312428756106 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 18 6 24 8.38836480884386 3.20387839705205 5.18448641179181 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0400230053827357 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 13 8 21 6.0582634730539 4.27183786273606 1.78642561031783 C:G G C 10 0.533979732842008 0.515089193647705 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 40 29 69 18.6408106863197 15.4854122524182 3.15539843390145 A:G G A 10 0.533979732842008 0.471114542765985 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 840 0 840 391.457024412713 0 391.457024412713 T T 10 0.533979732842008 1.83298024511033e-229 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 8 16 24 3.72816213726394 8.54367572547213 -4.81551358820819 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0640799581168582 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179043161 G/A 1 148 144 292 68.9709995393828 76.8930815292491 -7.92208198986631 A:G G A 10 0.533979732842008 0.378982118066515 ENSG00000169045:ENST00000511300:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000393432:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502904:exon_179043127_179044111:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000442819:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000356731:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000515481:exon_179041181_179044650:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000329433:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510678:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510411:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523449:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000524179:exon_179043127_179043288:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519033:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000521720:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502632:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519958:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523136:exon_179043142_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504549:exon_179043159_179043219:HNRNPH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 37 30 67 17.2427498848457 16.0193919852602 1.22335789958547 T:C C T 10 0.533979732842008 0.807293035077136 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 47 48 95 21.9029525564256 25.6310271764164 -3.72807461999076 A:G G A 10 0.533979732842008 0.472356867346331 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 44 52 96 20.5048917549517 27.7669461077844 -7.26205435283276 T:C T C 10 0.533979732842008 0.152154417387268 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 27 33 60 12.5825472132658 17.6213311837863 -5.03878397052048 T:G G T 10 0.533979732842008 0.198222995332622 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 2 11 13 0.932040534315984 5.87377706126209 -4.9417365269461 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00932711290464671 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 T:G T G 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 9 13 22 4.19418240442193 6.9417365269461 -2.74755412252417 T:C C T 10 0.533979732842008 0.287431649196634 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 350793 T/C 1 167 11 178 77.8253846153847 5.87377706126209 71.9516075541226 T:C T C 10 0.533979732842008 1.03668684696892e-32 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 134 68 202 62.4467157991709 36.3106218332565 26.1360939659144 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000229286364960864 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 5369270 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5368783_5369415:FARS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 6174866 G/A 1 29 3 32 13.5145877475818 1.60193919852602 11.9126485490557 A:G G A 10 0.533979732842008 8.787737061955e-06 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 7231843 G/A 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 A:G G A 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000397521:exon_7231813_7232140:RREB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 7246998 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7246998_7247099:RREB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 7884652 C/T 1 46 28 74 21.4369322892676 14.9514325195762 6.48549976969141 T:C C T 10 0.533979732842008 0.161600495847789 ENSG00000239264:ENST00000379757:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000473453:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7884592_7884721:TXNDC5;ENSG00000188428:ENST00000439343:exon_7884592_7884721:MUTED HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 18 13 31 8.38836480884386 6.9417365269461 1.44662828189775 A:G G A 10 0.533979732842008 0.719593105305051 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 11723636 C/T 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000111863:ENST00000505099:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000414691:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000514824:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000513651:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000512139:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000229583:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000503285:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000379413:exon_11723582_11723733:C6orf105 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:G G T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 28 34 62 13.0485674804238 18.1553109166283 -5.10674343620449 T:C T C 10 0.533979732842008 0.204740936434028 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 A:T T A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 16295278 A/T 1 11 14 25 5.12622293873791 7.47571625978811 -2.3494933210502 A:T A T 10 0.533979732842008 0.423801544226412 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16295237_16295417:GMPR HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 17764755 T/C 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000137177:ENST00000378814:exon_17764386_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000502297:exon_17764386_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000259711:exon_17763924_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378826:exon_17763926_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378843:exon_17763926_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000399378:exon_17763928_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378816:exon_17763928_17765177:KIF13A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 115 95 210 53.5923307231691 50.7280746199908 2.86425610317833 T:C C T 10 0.533979732842008 0.729628661340634 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 40 31 71 18.6408106863197 16.5533717181022 2.08743896821743 A:G G A 10 0.533979732842008 0.636388321869008 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G G A 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 5 14 19 2.33010133578996 7.47571625978811 -5.14561492399815 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0209709766423747 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 27 11 38 12.5825472132658 5.87377706126209 6.7087701520037 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0338521739125256 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 24869300 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 1 14 15 0.466020267157992 7.47571625978811 -7.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000274949587074644 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 21 21 42 9.78642561031783 11.2135743896822 -1.42714877936433 A:G A G 10 0.533979732842008 0.757523365874838 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 26 33 59 12.1165269461078 17.6213311837863 -5.50480423767847 T:C T C 10 0.533979732842008 0.153826805935841 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370572 C/T 0 41 0 41 19.1068309534777 0 19.1068309534777 C C 10 0.533979732842008 7.9557655302638e-12 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000530653:exon_26370550_26370588:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370616 G/C 0 37 0 37 17.2427498848457 0 17.2427498848457 G G 10 0.533979732842008 1.06231072808251e-10 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370657 A/G 0 20 0 20 9.32040534315984 0 9.32040534315984 A A 10 0.533979732842008 3.78558161135393e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370659 C/T 0 20 0 20 9.32040534315984 0 9.32040534315984 C C 10 0.533979732842008 3.78558161135393e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 0 0 20 20 0 10.6795946568402 -10.6795946568402 A G A 10 0.533979732842008 2.3339744105291e-07 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 0 17 0 17 7.92234454168586 0 7.92234454168586 T T 10 0.533979732842008 2.56364633924739e-05 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26373150 C/T 1 46 3 49 21.4369322892676 1.60193919852602 19.8349930907416 T:C C T 10 0.533979732842008 8.22246199609434e-10 ENSG00000186470:ENST00000527417:exon_26373125_26373170:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532627:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26373125_26373315:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373116_26373325:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26373678 G/A 0 17 0 17 7.92234454168586 0 7.92234454168586 G G 10 0.533979732842008 2.56364633924739e-05 ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373504_26373834:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373615_26373816:BTN3A2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 17 15 32 7.92234454168586 8.00969599263012 -0.0873514509442543 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 20 27 47 9.32040534315984 14.4174527867342 -5.09704744357437 A:G A G 10 0.533979732842008 0.145569172842256 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 27925456 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000124657:ENST00000244623:exon_27925019_27925960:OR2B6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 27925827 A/G 1 41 42 83 19.1068309534777 22.4271487793643 -3.32031782588666 A:G A G 10 0.533979732842008 0.509651645691136 ENSG00000124657:ENST00000244623:exon_27925019_27925960:OR2B6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 37 31 68 17.2427498848457 16.5533717181022 0.68937816674346 T:C C T 10 0.533979732842008 0.90370658095824 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 2 16 18 0.932040534315984 8.54367572547213 -7.61163519115614 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000447284348095701 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.405548418936591 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 313 47 360 145.864343620452 25.0970474435744 120.767296176877 A:G A G 10 0.533979732842008 7.3118087198427e-42 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 289 120 409 134.67985720866 64.077567941041 70.6022892676188 C:G G C 10 0.533979732842008 1.19228158285528e-12 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 30593522 C/T 1 66 68 134 30.7573376324275 36.3106218332565 -5.55328420082907 T:C C T 10 0.533979732842008 0.342180892559873 ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30593279_30594172:MRPS18B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 30652575 G/A 1 25 24 49 11.6505066789498 12.8155135882082 -1.16500690925839 A:G G A 10 0.533979732842008 0.775741001678977 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31111091 T/A 1 13 17 30 6.0582634730539 9.07765545831414 -3.01939198526024 A:T T A 10 0.533979732842008 0.278698265019382 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31111125 G/A 1 12 15 27 5.5922432058959 8.00969599263012 -2.41745278673421 A:G G A 10 0.533979732842008 0.441078206442053 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 T:C T C 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 17 13 30 7.92234454168586 6.9417365269461 0.980608014739762 A:G G A 10 0.533979732842008 0.8552242671935 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 11 4 15 5.12622293873791 2.13591893136803 2.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.194130432008041 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31116502 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116395_31116505:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 15 4 19 6.99030400736988 2.13591893136803 4.85438507600185 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0359290132702551 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 12 4 16 5.5922432058959 2.13591893136803 3.45632427452787 C:G C G 10 0.533979732842008 0.130303890914635 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31118772 G/A 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 6 8 14 2.79612160294795 4.27183786273606 -1.47571625978811 C:G G C 10 0.533979732842008 0.438571146756421 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:C A C 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 20 13 33 9.32040534315984 6.9417365269461 2.37866881621374 T:C T C 10 0.533979732842008 0.486410169421634 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31170608 C/T 0 0 8 8 0 4.27183786273606 -4.27183786273606 T C T 10 0.533979732842008 0.00222453086591490 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1359 938 2297 633.321543067711 500.872989405803 132.448553661908 T:C:G T C 10 0.533979732842008 2.89276971714056e-08 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 1267 530 1797 590.447678489176 283.009258406264 307.438420082912 A:C:G C G 10 0.533979732842008 1.75893471400821e-49 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 T T 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31238868 C/T 1 52 190 242 24.2330538922156 101.456149239982 -77.2230953477659 T:C C T 10 0.533979732842008 3.27267968616952e-24 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31238850_31239108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31238850_31239125:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 290 44 334 135.145877475818 23.4951082450483 111.650769230769 T:C C T 10 0.533979732842008 8.68944524337681e-39 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 36 171 207 16.7767296176877 91.3105343159834 -74.5338046982957 C:G C G 10 0.533979732842008 1.21706810973521e-26 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 200 33 233 93.2040534315984 17.6213311837863 75.5827222478121 T:C C T 10 0.533979732842008 1.08203979524528e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31239601 C/T 0 143 0 143 66.6408982035929 0 66.6408982035929 C C 10 0.533979732842008 1.19925780483062e-39 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 176 0 176 82.0195670198066 0 82.0195670198066 G G 10 0.533979732842008 1.22488012577406e-48 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2041 525 2566 951.147365269462 280.339359742054 670.808005527408 A:T:C C T 10 0.533979732842008 1.23341481617733e-167 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 374 182 556 174.291579917089 97.1843113772455 77.1072685398436 A:C:G G A 10 0.533979732842008 3.4139484972794e-11 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31526080 G/A 1 35 38 73 16.3107093505297 20.2912298479963 -3.98052049746658 A:G G A 10 0.533979732842008 0.351288317920141 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525799_31526606:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525799_31526606:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525799_31526606:NFKBIL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 69 68 137 32.1553984339015 36.3106218332565 -4.15522339935509 C:G C G 10 0.533979732842008 0.494067310979175 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31606977 C/T 1 234 225 459 109.04874251497 120.145439889452 -11.0966973744816 T:C C T 10 0.533979732842008 0.303662120904911 ENSG00000204463:ENST00000464869:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000464126:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000422948:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000441793:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31606805_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31606806_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31606806_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31606806_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31606806_31607003:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31606806_31607003:BAT3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31695043 A/G 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 A:G A G 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000213722:ENST00000437288:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31694815_31695130:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000444662:exon_31694818_31695130:DDAH2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31695437 G/A 1 13 18 31 6.0582634730539 9.61163519115614 -3.55337171810225 A:G G A 10 0.533979732842008 0.212350667650115 ENSG00000213722:ENST00000469963:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375789:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000480913:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000483792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375787:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000375792:exon_31695320_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000416410:exon_31695352_31695469:DDAH2;ENSG00000213722:ENST00000436437:exon_31695383_31695469:DDAH2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31731360 G/C 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 C:G G C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 23 33 56 10.7184661446338 17.6213311837863 -6.90286503915244 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0808084221458688 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31807466 A/G 1 139 135 274 64.7768171349609 72.0872639336711 -7.31044679871017 A:G A G 10 0.533979732842008 0.396718668289849 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31828292 C/T 1 15 11 26 6.99030400736988 5.87377706126209 1.11652694610779 T:C C T 10 0.533979732842008 0.698803906557757 ENSG00000204386:ENST00000495807:exon_31827819_31829968:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000480384:exon_31826829_31828398:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000491768:exon_31828216_31828398:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000375631:exon_31828216_31828398:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000479533:exon_31828216_31828398:NEU1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31864112 G/T 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:G G T 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31864040_31864281:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864040_31864293:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864040_31864293:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864040_31864293:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864040_31864293:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864040_31864293:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31863178_31864293:EHMT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 42 40 82 19.5728512206357 21.3591893136803 -1.78633809304465 T:C T C 10 0.533979732842008 0.740267467557552 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 14 21 35 6.52428374021189 11.2135743896822 -4.68929064947028 A:G A G 10 0.533979732842008 0.128108137753276 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 31940281 T/C 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000204344:ENST00000466132:exon_31939646_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000479644:exon_31940079_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000375331:exon_31940079_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000375338:exon_31940079_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000492583:exon_31939676_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000415730:exon_31939712_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000375333:exon_31940079_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000473983:exon_31940117_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000478486:exon_31940129_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000463823:exon_31940151_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000483801:exon_31940158_31940288:STK19;ENSG00000204344:ENST00000466336:exon_31940174_31940288:STK19;ENSG00000254729:ENST00000519179:exon_31940158_31940288:XXbac-BPG116M5.15 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32149140 C/T 1 59 73 132 27.4951957623215 38.9805204974666 -11.485324735145 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0545316471202638 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32149128_32149254:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32149128_32149254:AGER HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32159191 C/T 1 119 146 265 55.4564117918011 77.9610409949332 -22.5046292031321 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00663539678061427 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32158543_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32158544_32159280:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000403803:exon_32158573_32159280:GPSM3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32905086 G/T 1 18 20 38 8.38836480884386 10.6795946568402 -2.2912298479963 T:G G T 10 0.533979732842008 0.516691403762345 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 121 110 231 56.388452326117 58.7377706126209 -2.34931828650384 T:C C T 10 0.533979732842008 0.792032930392318 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32940621 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32940507_32940704:BRD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32945545 G/A 1 148 110 258 68.9709995393828 58.7377706126209 10.233228926762 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.212219993972048 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32945534_32945782:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000481259:exon_32945534_32945678:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945534_32945782:BRD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 32948462 G/A 1 270 287 557 125.825472132658 153.252183325656 -27.4267111929984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0217473319445309 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33036977 G/A 0 12 0 12 5.5922432058959 0 5.5922432058959 G G 10 0.533979732842008 0.000642319381394275 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33037061 G/C 0 55 0 55 25.6311146936896 0 25.6311146936896 G G 10 0.533979732842008 1.06946720267386e-15 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 57 2 59 26.5631552280055 1.06795946568402 25.4951957623215 A:G G A 10 0.533979732842008 1.36595982793837e-13 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 59 2 61 27.4951957623215 1.06795946568402 26.4272362966375 T:C C T 10 0.533979732842008 4.03232037460001e-14 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 56 7 63 26.0971349608476 3.73785812989406 22.3592768309535 A:T:G A G 10 0.533979732842008 2.44984952646760e-09 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33048649 G/T 1 10 42 52 4.66020267157992 22.4271487793643 -17.7669461077844 T:G G T 10 0.533979732842008 8.60312885051219e-07 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 102 31 133 47.5340672501152 16.5533717181022 30.9806955320129 T:C T C 10 0.533979732842008 4.05969386557369e-08 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 119 36 155 55.4564117918011 19.2232703823123 36.2331414094888 T:C C T 10 0.533979732842008 2.22396767544279e-09 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 115 20 135 53.5923307231691 10.6795946568402 42.9127360663289 T:C T C 10 0.533979732842008 6.6781562503583e-15 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 21 26 47 9.78642561031783 13.8834730538922 -4.09704744357437 A:G A G 10 0.533979732842008 0.244808964628374 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 17 19 36 7.92234454168586 10.1456149239982 -2.22327038231229 A:G G A 10 0.533979732842008 0.505998942773016 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 40 40 80 18.6408106863197 21.3591893136803 -2.71837862736064 A:G A G 10 0.533979732842008 0.576138756207888 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 6 10 16 2.79612160294795 5.33979732842008 -2.54367572547213 C:G G C 10 0.533979732842008 0.219989084919456 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33658780 C/T 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33658694_33658886:ITPR3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 A:G G A 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.091979109069095 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 25 22 47 11.6505066789498 11.7475541225242 -0.0970474435743736 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 34741175 G/A 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 A:G G A 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 35285720 A/C 1 19 33 52 8.85438507600185 17.6213311837863 -8.76694610778441 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0175735465658987 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35285668_35285776:DEF6;ENSG00000023892:ENST00000468102:exon_35285385_35285776:DEF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 35437113 C/G 1 21 9 30 9.78642561031783 4.80581759557807 4.98060801473976 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0979315457841292 ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436724_35437306:RPL10A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36075219 A/C 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 A:C A C 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36566575 C/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C C T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36936640 G/A 1 174 141 315 81.0875264854906 75.2911423307231 5.79638415476749 A:G G A 10 0.533979732842008 0.534663918403494 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 41029109 T/C 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124701:ENST00000426505:exon_41029067_41029127:APOBEC2;ENSG00000124701:ENST00000244669:exon_41029067_41029631:APOBEC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 41029139 C/G 1 7 10 17 3.26214187010594 5.33979732842008 -2.07765545831414 C:G C G 10 0.533979732842008 0.339998041946333 ENSG00000124701:ENST00000244669:exon_41029067_41029631:APOBEC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 41029342 T/C 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124701:ENST00000426505:exon_41029234_41029434:APOBEC2;ENSG00000124701:ENST00000244669:exon_41029067_41029631:APOBEC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42713050 C/A 1 10 18 28 4.66020267157992 9.61163519115614 -4.95143251957622 A:C C A 10 0.533979732842008 0.086439244923903 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42713223 T/G 1 15 8 23 6.99030400736988 4.27183786273606 2.71846614463382 T:G T G 10 0.533979732842008 0.299796148276539 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42713274 G/A 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 A:G G A 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42713307 G/A 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42713779 G/A 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 42932139 T/A 1 11 12 23 5.12622293873791 6.4077567941041 -1.28153385536618 A:T T A 10 0.533979732842008 0.677805261600565 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 43006009 C/G 1 21 12 33 9.78642561031783 6.4077567941041 3.37866881621374 C:G C G 10 0.533979732842008 0.295659016343474 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43006005_43006210:CUL7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 43016336 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 48 42 90 22.3689728235836 22.4271487793643 -0.0581759557807153 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 132 71 203 61.514675264855 37.9125610317826 23.6021142330724 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000909681494596068 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 315 285 600 146.796384154768 152.184223859972 -5.38783970520475 A:G G A 10 0.533979732842008 0.682437529457907 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 49415448 C/T 1 9 5 14 4.19418240442193 2.66989866421004 1.52428374021189 T:C C T 10 0.533979732842008 0.593885309282772 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49415383_49415498:MUT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 54191686 C/T 1 4 13 17 1.86408106863197 6.9417365269461 -5.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0150653116930916 ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54191596_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54191600_54191804:TINAG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 14 14 0 7.47571625978811 -7.47571625978811 A G A 10 0.533979732842008 2.27859564567246e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 11 0 11 5.12622293873791 0 5.12622293873791 C C 10 0.533979732842008 0.00123154446071590 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 11 11 0 5.87377706126209 -5.87377706126209 C T C 10 0.533979732842008 0.000225140097378004 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 8 8 0 4.27183786273606 -4.27183786273606 A G A 10 0.533979732842008 0.00222453086591490 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 17 14 31 7.92234454168586 7.47571625978811 0.446628281897754 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G G A 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G A G 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 22 19 41 10.2524458774758 10.1456149239982 0.106830953477674 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 83075914 G/A 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 121 101 222 56.388452326117 53.9319530170428 2.45649930907424 T:C C T 10 0.533979732842008 0.787946796158378 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 649 558 1207 302.447153385537 297.96069092584 4.48646245969644 C:G C G 10 0.533979732842008 0.817479962774887 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 90368380 G/A 1 17 23 40 7.92234454168586 12.2815338553662 -4.35918931368032 A:G G A 10 0.533979732842008 0.204634029900131 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90368329_90368636:MDN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 20 14 34 9.32040534315984 7.47571625978811 1.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.607471883706505 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 90565242 A/G 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 A:G A G 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000118412:ENST00000419040:exon_90565189_90565263:CASP8AP2;ENSG00000118412:ENST00000444163:exon_90565189_90565263:CASP8AP2;ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90565189_90565263:CASP8AP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 15 11 26 6.99030400736988 5.87377706126209 1.11652694610779 C:G G C 10 0.533979732842008 0.698803906557757 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 105725997 C/G 1 70 73 143 32.6214187010594 38.9805204974666 -6.35910179640714 C:G C G 10 0.533979732842008 0.314592254635726 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 35 31 66 16.3107093505297 16.5533717181022 -0.242662367572528 A:T:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 16 11 27 7.45632427452787 5.87377706126209 1.58254721326579 A:G G A 10 0.533979732842008 0.569328009953207 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 107003810 T/C 1 12 11 23 5.5922432058959 5.87377706126209 -0.281533855366183 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:T A T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 21 20 41 9.78642561031783 10.6795946568402 -0.893169046522326 A:G G A 10 0.533979732842008 0.875890787785455 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 14 29 43 6.52428374021189 15.4854122524182 -8.96112851220634 T:G G T 10 0.533979732842008 0.00857748648801904 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 109764622 C/T 1 21 8 29 9.78642561031783 4.27183786273606 5.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0418931561908898 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 39 17 56 18.1747904191617 9.07765545831414 9.09713496084755 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0156639317925192 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 T:C T C 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 45 54 99 20.9709120221096 28.8349055734684 -7.86399355135879 A:G G A 10 0.533979732842008 0.130480175481799 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111587266 T/C 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:C T C 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C C T 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111695268 C/T 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 26 5 31 12.1165269461078 2.66989866421004 9.44662828189775 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00049327042708661 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 18 12 30 8.38836480884386 6.4077567941041 1.98060801473976 A:G G A 10 0.533979732842008 0.583836871954459 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 111696852 T/C 1 9 12 21 4.19418240442193 6.4077567941041 -2.21357438968217 T:C T C 10 0.533979732842008 0.385190864065462 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:G G A 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 62 54 116 28.8932565637955 28.8349055734684 0.058350990327078 A:C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 16 0 16 7.45632427452787 0 7.45632427452787 C C 10 0.533979732842008 4.8639979692946e-05 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 118887215 T/A 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 A:T T A 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 118887303 T/C 1 2 9 11 0.932040534315984 4.80581759557807 -3.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0299883171536232 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 122766138 G/A 1 4 7 11 1.86408106863197 3.73785812989406 -1.87377706126209 A:G G A 10 0.533979732842008 0.366484330780655 ENSG00000111897:ENST00000339697:exon_122764496_122766324:SERINC1;ENSG00000111897:ENST00000368454:exon_122764499_122766324:SERINC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 11 10 21 5.12622293873791 5.33979732842008 -0.213574389682167 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 424 0 424 197.592593274989 0 197.592593274989 T T 10 0.533979732842008 5.87261173862627e-116 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 466 1 467 217.165444495624 0.533979732842008 216.631464762782 A:C A C 10 0.533979732842008 2.39314211712518e-125 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 457 1 458 212.971262091202 0.533979732842008 212.43728235836 A:G A G 10 0.533979732842008 6.97522745278766e-123 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 30 0 30 13.9806080147398 0 13.9806080147398 G G 10 0.533979732842008 1.06836577540344e-08 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 36 0 36 16.7767296176877 0 16.7767296176877 T T 10 0.533979732842008 2.0399762267708e-10 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 138727288 G/A 1 41 13 54 19.1068309534777 6.9417365269461 12.1650944265316 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00090365105541376 ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138727108_138727288:HEBP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 79 61 140 36.8156011054814 32.5727637033625 4.24283740211889 T:C C T 10 0.533979732842008 0.498607012001721 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 144416308 A/C 1 502 543 1045 233.942174113312 289.95099493321 -56.0088208198983 A:T:C A C 10 0.533979732842008 0.000571853122620733 ENSG00000169976:ENST00000367569:exon_144416018_144416754:SF3B5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 149721690 G/A 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 A:G G A 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000177688:ENST00000326669:exon_149721495_149722177:SUMO4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 8 10 18 3.72816213726394 5.33979732842008 -1.61163519115614 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485753313180244 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 21 28 49 9.78642561031783 14.9514325195762 -5.16500690925839 A:G G A 10 0.533979732842008 0.153206069505334 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 11 9 20 5.12622293873791 4.80581759557807 0.320405343159841 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 C:G C G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 21 14 35 9.78642561031783 7.47571625978811 2.31070935052972 A:G A G 10 0.533979732842008 0.499706968646814 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 54 59 113 25.1650944265316 31.5048042376785 -6.3397098111469 A:T T A 10 0.533979732842008 0.257917258775948 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 160464289 G/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:G G A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160464180_160464320:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160464180_160464320:IGF2R HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 A:G A G 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 T:C C T 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 166571935 C/T 1 79 49 128 36.8156011054814 26.1650069092584 10.650594196223 A:T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.062884312493502 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 166572005 T/C 1 32 49 81 14.9126485490557 26.1650069092584 -11.2523583602026 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0139653960552766 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 68 38 106 31.6893781667435 20.2912298479963 11.3981483187472 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0317399766450836 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 184 150 334 85.7477291570705 80.0969599263012 5.65076923076934 T:C C T 10 0.533979732842008 0.546725620653295 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 28 46 74 13.0485674804238 24.5630677107324 -11.5145002303086 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0098790681548293 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 15 10 25 6.99030400736988 5.33979732842008 1.6505066789498 A:C C A 10 0.533979732842008 0.553013495766918 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 20 14 34 9.32040534315984 7.47571625978811 1.84468908337173 T:C C T 10 0.533979732842008 0.607471883706505 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 20 15 35 9.32040534315984 8.00969599263012 1.31070935052972 A:G A G 10 0.533979732842008 0.735988999370099 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 6 170855221 C/T 1 186 173 359 86.6797696913865 92.3784937816674 -5.69872409028085 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.560851654570316 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170855191_170855272:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000462957:exon_170855191_170855272:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170855191_170855272:PSMB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 590148 G/A 1 13 6 19 6.0582634730539 3.20387839705205 2.85438507600185 A:G G A 10 0.533979732842008 0.251038003296366 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 A:G A G 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 590229 T/C 1 15 7 22 6.99030400736988 3.73785812989406 3.25244587747583 T:C T C 10 0.533979732842008 0.201587902311626 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 57 28 85 26.5631552280055 14.9514325195762 11.6117227084293 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0121998124730830 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 943711 T/C 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 943868 G/A 1 10 10 20 4.66020267157992 5.33979732842008 -0.679594656840159 A:G G A 10 0.533979732842008 0.824764691466817 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000463358:exon_943789_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000477906:exon_943824_943909:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_943763_943909:COX19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 20 16 36 9.32040534315984 8.54367572547213 0.776729617687714 T:C C T 10 0.533979732842008 0.868106197168173 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 1195264 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C C T 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2405952 G/A 1 83 78 161 38.6796821741133 41.6504191616766 -2.97073698756328 A:G G A 10 0.533979732842008 0.636700511953611 ENSG00000106263:ENST00000431643:exon_2405952_2406070:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2405952_2406083:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2405952_2406083:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2405952_2406083:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000463229:exon_2405952_2406083:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000489558:exon_2405952_2407365:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000463026:exon_2405952_2406378:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000468250:exon_2405952_2406226:EIF3B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2473087 C/T 1 55 69 124 25.6311146936896 36.8446015660985 -11.213486872409 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0475529205730692 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2473130 G/C 1 47 46 93 21.9029525564256 24.5630677107324 -2.66011515430674 C:G G C 10 0.533979732842008 0.604265109147902 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2577691 C/G 1 61 60 121 28.4272362966375 32.0387839705205 -3.61154767388296 C:G C G 10 0.533979732842008 0.524630287282149 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 38 26 64 17.7087701520037 13.8834730538922 3.82529709811149 T:C C T 10 0.533979732842008 0.38121259794845 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2578238 C/T 1 16 35 51 7.45632427452787 18.6892906494703 -11.2329663749424 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00181770712231555 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 25 9 34 11.6505066789498 4.80581759557807 6.84468908337173 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0241099036954596 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2583328 C/T 1 10 16 26 4.66020267157992 8.54367572547213 -3.88347305389221 T:C C T 10 0.533979732842008 0.167959342288254 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2649704 T/G 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:G T G 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2649678_2649796:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2649678_2649796:IQCE HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 36 41 77 16.7767296176877 21.8931690465223 -5.11643942883461 T:C T C 10 0.533979732842008 0.254830623694547 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 34 41 75 15.8446890833717 21.8931690465223 -6.04847996315059 A:G A G 10 0.533979732842008 0.166620773965038 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 6441688 T/C 1 20 28 48 9.32040534315984 14.9514325195762 -5.63102717641638 T:C T C 10 0.533979732842008 0.112545672875110 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 6452461 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6452241_6452514:DAGLB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 6456302 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6456258_6456342:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C T C 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G A G 10 0.533979732842008 0.731579084689464 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 60 88 148 27.9612160294795 46.9902164900967 -19.0290004606172 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00219133299145764 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 8153521 G/A 1 24 39 63 11.1844864117918 20.8252095808383 -9.6407231690465 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0162634394214924 ENSG00000003147:ENST00000402384:exon_8152814_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000406470:exon_8152817_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000265577:exon_8152885_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000396675:exon_8152939_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000339809:exon_8153402_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000455539:exon_8153402_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000401396:exon_8153409_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000404556:exon_8153414_8153674:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000422063:exon_8153414_8153674:ICA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 24849439 A/G 1 9 20 29 4.19418240442193 10.6795946568402 -6.48541225241823 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0237825465617289 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000487020:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24849426_24849570:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000459987:exon_24849426_24849978:OSBPL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 18 36 54 8.38836480884386 19.2232703823123 -10.8349055734684 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00382349757402784 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 C:G C G 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 34 32 66 15.8446890833717 17.0873514509443 -1.24266236757252 C:G G C 10 0.533979732842008 0.805613938059715 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 A:G A G 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 9 14 23 4.19418240442193 7.47571625978811 -3.28153385536618 C:G C G 10 0.533979732842008 0.210551057444704 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 38393403 G/A 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 A:G G A 10 0.533979732842008 0.650296058723341 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 38402496 A/G 1 13 4 17 6.0582634730539 2.13591893136803 3.92234454168586 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0860088192709853 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 180 152 332 83.8836480884386 81.1649193919852 2.71872869645337 A:G G A 10 0.533979732842008 0.783454899385669 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 18 17 35 8.38836480884386 9.07765545831414 -0.689290649470278 T:C T C 10 0.533979732842008 0.86635090990695 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 236 200 436 109.980783049286 106.795946568402 3.18483648088453 A:G A G 10 0.533979732842008 0.773497190080528 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 44047066 T/C 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C T C 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000136206:ENST00000258704:exon_44046867_44047185:SPDYE1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 6 13 19 2.79612160294795 6.9417365269461 -4.14561492399815 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0666823971512723 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 20 16 36 9.32040534315984 8.54367572547213 0.776729617687714 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.868106197168173 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 30 24 54 13.9806080147398 12.8155135882082 1.16509442653157 A:G G A 10 0.533979732842008 0.786354486653825 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 66 93 159 30.7573376324275 49.6601151543067 -18.9027775218793 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00315535236263538 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 70 108 178 32.6214187010594 57.6698111469369 -25.0483924458774 A:C A C 10 0.533979732842008 0.000212779656180352 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 45148814 C/T 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 T:C C T 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 17 17 0 9.07765545831414 -9.07765545831414 C A C 10 0.533979732842008 2.30611880200101e-06 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 116 144 260 54.0583509903271 76.8930815292491 -22.8347305389221 T:C T C 10 0.533979732842008 0.00507227830431251 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 64291965 T/G 1 20 10 30 9.32040534315984 5.33979732842008 3.98060801473976 T:G T G 10 0.533979732842008 0.19944539864427 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 65432889 C/T 1 25 18 43 11.6505066789498 9.61163519115614 2.03887148779366 T:C C T 10 0.533979732842008 0.545918304552552 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65432718_65432895:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65432718_65432894:GUSB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.592530831612695 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 21 18 39 9.78642561031783 9.61163519115614 0.17479041916169 A:C C A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 A:G G A 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 4 10 14 1.86408106863197 5.33979732842008 -3.47571625978811 T:C C T 10 0.533979732842008 0.104626927055117 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 73151220 G/C 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151187_73151440:ABHD11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 8 7 15 3.72816213726394 3.73785812989406 -0.00969599263011922 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 75695613 A/G 1 346 307 653 161.243012436665 163.931777982496 -2.68876554583119 A:G A G 10 0.533979732842008 0.844572275307769 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75695597_75696826:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75695597_75696824:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75695597_75696385:MDH2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 16 11 27 7.45632427452787 5.87377706126209 1.58254721326579 T:C C T 10 0.533979732842008 0.569328009953207 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 76885769 A/G 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 A:G A G 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000135205:ENST00000285871:exon_76885650_76885826:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000431197:exon_76885650_76885826:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000461882:exon_76885650_76885826:CCDC146 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:G G A 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 77247821 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77247797_77247882:PTPN12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 13 5 18 6.0582634730539 2.66989866421004 3.38836480884386 A:G A G 10 0.533979732842008 0.155140017910685 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 23 28 51 10.7184661446338 14.9514325195762 -4.23296637494241 A:G G A 10 0.533979732842008 0.262454688248152 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 13 8 21 6.0582634730539 4.27183786273606 1.78642561031783 T:C C T 10 0.533979732842008 0.515089193647705 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91504051 G/C 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 C:G G C 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000456229:exon_91503629_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000442961:exon_91503632_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000425936:exon_91503968_91504078:MTERF HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 174 170 344 81.0875264854906 90.7765545831413 -9.68902809765073 T:G G T 10 0.533979732842008 0.304748715838611 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91641928 A/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G A G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91641743_91641956:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 15 32 47 6.99030400736988 17.0873514509443 -10.0970474435744 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00331429658144907 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 44 45 89 20.5048917549517 24.0290879778904 -3.52419622293871 A:G A G 10 0.533979732842008 0.459258845066822 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 8 13 21 3.72816213726394 6.9417365269461 -3.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.191289654517023 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 26 18 44 12.1165269461078 9.61163519115614 2.50489175495165 A:C A C 10 0.533979732842008 0.546069615037964 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 5 17 22 2.33010133578996 9.07765545831414 -6.74755412252417 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0046452357175887 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 10 26 36 4.66020267157992 13.8834730538922 -9.22327038231229 A:C C A 10 0.533979732842008 0.00231936494784649 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 128 84 212 59.650594196223 44.8542975587287 14.7962966374943 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0457147871839758 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 92764419 A/G 1 12 5 17 5.5922432058959 2.66989866421004 2.92234454168586 A:G A G 10 0.533979732842008 0.2236935718195 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 48 49 97 22.3689728235836 26.1650069092584 -3.79603408567477 T:C C T 10 0.533979732842008 0.476688459403486 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 97922908 G/A 1 10 5 15 4.66020267157992 2.66989866421004 1.99030400736988 A:G G A 10 0.533979732842008 0.438813059472914 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 156 99 255 72.6991616766468 52.8639935513588 19.835168125288 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0142200087271529 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 72 72 144 33.5534592353754 38.4465407646246 -4.89308152924914 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.45235922187588 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 176 138 314 82.0195670198066 73.6892031321971 8.33036388760951 A:G G A 10 0.533979732842008 0.365589114927331 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 19 23 42 8.85438507600185 12.2815338553662 -3.42714877936433 A:G A G 10 0.533979732842008 0.353621992325494 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 12 16 28 5.5922432058959 8.54367572547213 -2.95143251957622 A:G A G 10 0.533979732842008 0.343794544457247 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 26 13 39 12.1165269461078 6.9417365269461 5.17479041916169 T:C C T 10 0.533979732842008 0.109292104830820 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 99950006 C/T 1 9 4 13 4.19418240442193 2.13591893136803 2.0582634730539 T:C C T 10 0.533979732842008 0.281257084261409 ENSG00000121716:ENST00000470714:exon_99949786_99950112:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000310771:exon_99949786_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444874:exon_99949885_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422752:exon_99949786_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000420688:exon_99949782_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000452089:exon_99949799_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000493091:exon_99949891_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000457519:exon_99949905_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000448382:exon_99949911_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000443526:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000419749:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422808:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000438028:exon_99949969_99950101:PILRB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 36 30 66 16.7767296176877 16.0193919852602 0.757337632427475 T:C T C 10 0.533979732842008 0.902155640939578 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100283691 C/G 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100283597_100283702:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000464111:exon_100283597_100284056:GIGYF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100460331 G/A 1 14 20 34 6.52428374021189 10.6795946568402 -4.15531091662827 A:G G A 10 0.533979732842008 0.170925464277231 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000482184:exon_100460303_100460449:SLC12A9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100463822 G/A 1 26 16 42 12.1165269461078 8.54367572547213 3.57285122063567 A:G G A 10 0.533979732842008 0.28341661624273 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 39 47 86 18.1747904191617 25.0970474435744 -6.92225702441269 A:G G A 10 0.533979732842008 0.159639898427817 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 20 19 39 9.32040534315984 10.1456149239982 -0.82520958083831 T:C T C 10 0.533979732842008 0.87288205177777 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 100853911 G/C 1 15 24 39 6.99030400736988 12.8155135882082 -5.82520958083831 C:G G C 10 0.533979732842008 0.0765887497948134 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853813_100853936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853813_100854384:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000421736:exon_100853876_100853954:PLOD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 102952123 G/T 1 165 127 292 76.8933440810687 67.815426070935 9.07791801013369 T:G G T 10 0.533979732842008 0.291688699807392 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000469560:exon_102951025_102952343:PMPCB HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 28 27 55 13.0485674804238 14.4174527867342 -1.36888530631044 A:T:G A T 10 0.533979732842008 0.787291480285534 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 112407371 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 16 7 23 7.45632427452787 3.73785812989406 3.71846614463382 A:G A G 10 0.533979732842008 0.144828679250741 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 A:C C A 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 30 22 52 13.9806080147398 11.7475541225242 2.23305389221559 T:C C T 10 0.533979732842008 0.579933642266362 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 8 5 13 3.72816213726394 2.66989866421004 1.0582634730539 T:C T C 10 0.533979732842008 0.592530831612695 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 43 24 67 20.0388714877937 12.8155135882082 7.22335789958547 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0864262891704103 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 128612552 C/T 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 T:C C T 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128612480_128612636:TNPO3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 128614990 G/A 1 5 11 16 2.33010133578996 5.87377706126209 -3.54367572547213 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0841734197110343 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128614922_128615016:TNPO3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 1 176 1 177 82.0195670198066 0.533979732842008 81.4855872869646 T:C T C 10 0.533979732842008 1.44237318899856e-46 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:C A C 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 135322853 T/C 1 18 22 40 8.38836480884386 11.7475541225242 -3.35918931368032 T:C T C 10 0.533979732842008 0.342100617787002 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 33 37 70 15.3786688162137 19.7572501151543 -4.37858129894055 T:C T C 10 0.533979732842008 0.338038810516930 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 135614740 T/C 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000105887:ENST00000393085:exon_135611509_135614760:MTPN;ENSG00000105887:ENST00000356707:exon_135613420_135614760:MTPN;ENSG00000105887:ENST00000435723:exon_135614207_135614760:MTPN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 30 31 61 13.9806080147398 16.5533717181022 -2.57276370336249 T:G T G 10 0.533979732842008 0.523574028194959 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 17 10 27 7.92234454168586 5.33979732842008 2.58254721326579 A:G A G 10 0.533979732842008 0.34187731653146 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139719829 C/T 1 27 18 45 12.5825472132658 9.61163519115614 2.97091202210964 T:C C T 10 0.533979732842008 0.455457887704137 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139719825_139720089:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139719825_139720123:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139719825_139720093:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139719825_139720093:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139719825_139720123:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139719825_139720123:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139719825_139720123:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139719825_139720091:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139719825_139720079:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139719825_139720125:TBXAS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 47 30 77 21.9029525564256 16.0193919852602 5.88356057116539 A:T:G G A 10 0.533979732842008 0.208864190390390 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 21 26 47 9.78642561031783 13.8834730538922 -4.09704744357437 T:C C T 10 0.533979732842008 0.244808964628374 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 8 3 11 3.72816213726394 1.60193919852602 2.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.238414549935108 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 140158851 C/G 1 9 10 19 4.19418240442193 5.33979732842008 -1.14561492399815 C:G C G 10 0.533979732842008 0.650296058723341 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 70 91 161 32.6214187010594 48.5921556886227 -15.9707369875633 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0140829581143418 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 205 0 205 95.5341547673884 0 95.5341547673884 T T 10 0.533979732842008 1.6231888613989e-56 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 148489820 G/A 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 A:G G A 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148489818_148489910:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148489818_148489910:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148489818_148489910:CUL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 149430438 C/G 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 C:G C G 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 T:C T C 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 9 2 11 4.19418240442193 1.06795946568402 3.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0721477987529612 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150217335 G/T 1 3 17 20 1.39806080147398 9.07765545831414 -7.67959465684016 T:G G T 10 0.533979732842008 0.000529635759236411 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 31 27 58 14.4466282818978 14.4174527867342 0.029175495163539 C:G G C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150730999 G/A 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 A:G G A 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730825_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150739054 G/A 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 A:G G A 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150739048_150739117:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150739048_150739195:ABCB8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150742388 A/C 1 31 28 59 14.4466282818978 14.9514325195762 -0.504804237678469 A:C A C 10 0.533979732842008 0.897058251165353 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150742408 G/T 1 25 21 46 11.6505066789498 11.2135743896822 0.436932289267634 T:G G T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 150778690 C/T 1 81 63 144 37.7476416397974 33.6407231690465 4.10691847075086 T:C C T 10 0.533979732842008 0.505188620460835 ENSG00000164897:ENST00000297533:exon_150778167_150778987:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000392818:exon_150778172_150778987:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000462940:exon_150778173_150778987:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000482202:exon_150778571_150778987:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000476627:exon_150778583_150778987:TMUB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 11 6 17 5.12622293873791 3.20387839705205 1.92234454168586 T:C C T 10 0.533979732842008 0.467577760212056 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 13 18 31 6.0582634730539 9.61163519115614 -3.55337171810225 A:G A G 10 0.533979732842008 0.212350667650115 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 3 6 9 1.39806080147398 3.20387839705205 -1.80581759557807 T:C C T 10 0.533979732842008 0.319762448482123 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 151874498 C/T 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 T:C C T 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 155503920 A/T 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 A:T A T 10 0.533979732842008 0.485527419132807 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000440108:exon_155503867_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155503897_155504149:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000486747:exon_155503897_155504149:RBM33 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 5 12 17 2.33010133578996 6.4077567941041 -4.07765545831414 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0537967789851417 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 157023721 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 7 158540945 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158540885_158540971:ESYT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 6420490 C/G 1 10 2 12 4.66020267157992 1.06795946568402 3.5922432058959 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0438194160896602 ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6420168_6420930:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6420168_6420784:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000338312:exon_6420168_6420565:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000523120:exon_6420168_6420766:ANGPT2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 A:C C A 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 18 14 32 8.38836480884386 7.47571625978811 0.912648549055746 T:C C T 10 0.533979732842008 0.859848793157757 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 8185677 G/A 1 5 7 12 2.33010133578996 3.73785812989406 -1.4077567941041 A:G G A 10 0.533979732842008 0.565105757986092 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8185226_8185977:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8185226_8185977:AC068353.1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 8654898 C/T 1 33 25 58 15.3786688162137 13.3494933210502 2.02917549516354 T:C C T 10 0.533979732842008 0.693322909235444 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 15 16 31 6.99030400736988 8.54367572547213 -1.55337171810225 T:C T C 10 0.533979732842008 0.593958633610706 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 18 16 34 8.38836480884386 8.54367572547213 -0.15531091662827 T:C:G C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 48 39 87 22.3689728235836 20.8252095808383 1.54376324274531 T:C C T 10 0.533979732842008 0.748710154777092 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 186 156 342 86.6797696913865 83.3008383233532 3.37893136803328 C:G G C 10 0.533979732842008 0.745120677560986 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 10 11 21 4.66020267157992 5.87377706126209 -1.21357438968217 A:G A G 10 0.533979732842008 0.664756088212577 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 21996617 T/A 1 12 4 16 5.5922432058959 2.13591893136803 3.45632427452787 A:T T A 10 0.533979732842008 0.130303890914635 ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21996420_21997042:REEP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 22473465 T/C 1 8 1 9 3.72816213726394 0.533979732842008 3.19418240442193 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0429802824797869 ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 3 8 11 1.39806080147398 4.27183786273606 -2.87377706126209 T:C T C 10 0.533979732842008 0.128032984850620 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 29 19 48 13.5145877475818 10.1456149239982 3.36897282358362 T:C T C 10 0.533979732842008 0.386073859155553 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 26265907 A/G 1 1 7 8 0.466020267157992 3.73785812989406 -3.27183786273606 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0292259444124964 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 9 3 12 4.19418240442193 1.60193919852602 2.5922432058959 A:G A G 10 0.533979732842008 0.157132946742864 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 7 5 12 3.26214187010594 2.66989866421004 0.592243205895905 T:C T C 10 0.533979732842008 0.780593524714529 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G G A 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 10 8 18 4.66020267157992 4.27183786273606 0.388364808843857 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 54 32 86 25.1650944265316 17.0873514509443 8.07774297558732 T:C C T 10 0.533979732842008 0.084442212010517 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27294606 G/C 1 8 9 17 3.72816213726394 4.80581759557807 -1.07765545831414 C:G G C 10 0.533979732842008 0.634159114777915 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 47 43 90 21.9029525564256 22.9611285122063 -1.05817595578072 C:G C G 10 0.533979732842008 0.833400408571981 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 63 63 126 29.3592768309535 33.6407231690465 -4.28144633809301 A:C A C 10 0.533979732842008 0.475406214009756 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27308961 C/T 1 8 6 14 3.72816213726394 3.20387839705205 0.524283740211889 T:C C T 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 A:C A C 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 30 16 46 13.9806080147398 8.54367572547213 5.43693228926763 C:G C G 10 0.533979732842008 0.138682247544815 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 T:C T C 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27886903 C/T 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27886783_27886919:C8orf80;ENSG00000189233:ENST00000341513:exon_27886783_27886919:C8orf80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 27925204 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27925031_27925261:C8orf80;ENSG00000189233:ENST00000341513:exon_27925031_27925261:C8orf80 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 62 71 133 28.8932565637955 37.9125610317826 -9.01930446798706 C:G G C 10 0.533979732842008 0.118632241718958 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 14 13 27 6.52428374021189 6.9417365269461 -0.417452786734215 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 29203062 T/C 1 9 7 16 4.19418240442193 3.73785812989406 0.456324274527873 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29202887_29203591:DUSP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 33364766 G/C 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 C:G G C 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000129696:ENST00000519356:exon_33364747_33364839:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33364747_33364839:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33364747_33364839:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33364747_33364839:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33364747_33364839:C8orf41 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 5 8 13 2.33010133578996 4.27183786273606 -1.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.405548418936591 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 18 18 36 8.38836480884386 9.61163519115614 -1.22327038231229 A:G A G 10 0.533979732842008 0.739647567407739 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 54742024 T/C 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:T:C T C 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000521377:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000519588:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520070:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000521275:exon_54742004_54742093:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524234:exon_54742006_54742093:ATP6V1H HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 68139774 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68139682_68139833:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68139682_68139833:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518230:exon_68139682_68139833:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000517631:exon_68139682_68139833:ARFGEF1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 81905397 A/G 1 16 3 19 7.45632427452787 1.60193919852602 5.85438507600185 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00946837300611784 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81905338_81905542:PAG1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 86057707 A/G 1 9 11 20 4.19418240442193 5.87377706126209 -1.67959465684016 A:G A G 10 0.533979732842008 0.505945891794351 ENSG00000133739:ENST00000399341:exon_86057624_86058310:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000426019:exon_86057624_86058310:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000360375:exon_86057624_86058311:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000414626:exon_86057624_86058311:LRRCC1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 25 15 40 11.6505066789498 8.00969599263012 3.64081068631968 A:G G A 10 0.533979732842008 0.270504564636463 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 A:C C A 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 13 11 24 6.0582634730539 5.87377706126209 0.184486411791809 A:C A C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 9 18 27 4.19418240442193 9.61163519115614 -5.41745278673421 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0518085652739397 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 13 9 22 6.0582634730539 4.80581759557807 1.25244587747583 A:G A G 10 0.533979732842008 0.672276811539625 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 6 4 10 2.79612160294795 2.13591893136803 0.660202671579921 C:G C G 10 0.533979732842008 0.759536905354992 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 95547037 C/T 1 7 3 10 3.26214187010594 1.60193919852602 1.66020267157992 T:C C T 10 0.533979732842008 0.35504598383173 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 17 37 54 7.92234454168586 19.7572501151543 -11.8349055734684 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00149577354095420 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 110283353 T/G 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:G T G 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110283234_110283359:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110283234_110283359:NUDCD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 9 3 12 4.19418240442193 1.60193919852602 2.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157132946742864 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 C:G C G 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 125499030 C/T 1 4 8 12 1.86408106863197 4.27183786273606 -2.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.246657616969625 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 12 11 23 5.5922432058959 5.87377706126209 -0.281533855366183 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 125562029 C/T 1 306 344 650 142.602201750346 183.689028097651 -41.0868263473052 A:T:C C T 10 0.533979732842008 0.00125881749997090 ENSG00000147684:ENST00000276689:exon_125562002_125562220:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517367:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000518657:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000524241:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517830:exon_125562015_125562074:NDUFB9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 128098844 T/C 0 24 0 24 11.1844864117918 0 11.1844864117918 T T 10 0.533979732842008 2.99806432712958e-07 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 133844598 C/T 1 35 23 58 16.3107093505297 12.2815338553662 4.02917549516354 T:C C T 10 0.533979732842008 0.296355920470259 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 7 4 11 3.26214187010594 2.13591893136803 1.12622293873791 A:G A G 10 0.533979732842008 0.559150993150818 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 18 21 39 8.38836480884386 11.2135743896822 -2.82520958083831 A:G G A 10 0.533979732842008 0.423150398317351 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 65 63 128 30.2913173652695 33.6407231690465 -3.34940580377702 C:G C G 10 0.533979732842008 0.595283930617013 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 12 13 25 5.5922432058959 6.9417365269461 -1.3494933210502 A:G G A 10 0.533979732842008 0.689656732788913 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 27 23 50 12.5825472132658 12.2815338553662 0.301013357899603 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 18 16 34 8.38836480884386 8.54367572547213 -0.15531091662827 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 5 3 8 2.33010133578996 1.60193919852602 0.728162137263936 T:C C T 10 0.533979732842008 0.731579084689464 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 32 12 44 14.9126485490557 6.4077567941041 8.50489175495165 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0100978981734426 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 A:C:G G A 10 0.533979732842008 0.129337985263742 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 2 6 8 0.932040534315984 3.20387839705205 -2.27183786273606 T:G G T 10 0.533979732842008 0.157153557815206 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:C C A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 14 7 21 6.52428374021189 3.73785812989406 2.78642561031783 A:C A C 10 0.533979732842008 0.276341841808555 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 144991205 C/T 1 8 11 19 3.72816213726394 5.87377706126209 -2.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.363516478214209 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 A:G G A 10 0.533979732842008 0.529928831618983 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 23 22 45 10.7184661446338 11.7475541225242 -1.02908797789036 T:C C T 10 0.533979732842008 0.767369485255639 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 39 48 87 18.1747904191617 25.6310271764164 -7.45623675725469 T:C C T 10 0.533979732842008 0.132003509948804 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 13 7 20 6.0582634730539 3.73785812989406 2.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.372476500711893 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 6 6 12 2.79612160294795 3.20387839705205 -0.407756794104095 A:C A C 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 2060768 T/C 1 14 21 35 6.52428374021189 11.2135743896822 -4.68929064947028 T:C T C 10 0.533979732842008 0.128108137753276 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 133 99 232 61.9806955320129 52.8639935513588 9.11670198065416 C:G C G 10 0.533979732842008 0.23679970024906 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 4 11 15 1.86408106863197 5.87377706126209 -4.00969599263012 T:G T G 10 0.533979732842008 0.0663544192530847 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 5922789 G/A 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:G G A 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 13 18 31 6.0582634730539 9.61163519115614 -3.55337171810225 A:G G A 10 0.533979732842008 0.212350667650115 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 7798518 G/C 1 288 258 546 134.213836941502 137.766771073238 -3.55293413173635 T:C:G G C 10 0.533979732842008 0.764149372573174 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 15486870 A/G 1 67 81 148 31.2233578995855 43.2523583602026 -12.0290004606172 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0483350935677879 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000487363:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000463712:exon_15486825_15486929:PSIP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 19063108 T/C 1 1 8 9 0.466020267157992 4.27183786273606 -3.80581759557807 T:C T C 10 0.533979732842008 0.0152569455067580 ENSG00000147874:ENST00000380502:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000428731:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000380496:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000415524:exon_19063006_19063191:HAUS6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 21333447 T/C 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000198642:ENST00000359039:exon_21331018_21335429:KLHL9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 7 11 18 3.26214187010594 5.87377706126209 -2.61163519115614 T:C T C 10 0.533979732842008 0.243831320121880 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 42 26 68 19.5728512206357 13.8834730538922 5.68937816674346 A:G A G 10 0.533979732842008 0.18214414750155 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 32542278 T/C 1 30 27 57 13.9806080147398 14.4174527867342 -0.436844771994453 T:C T C 10 0.533979732842008 1 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 34648418 C/T 1 11 8 19 5.12622293873791 4.27183786273606 0.854385076001849 T:C C T 10 0.533979732842008 0.81950734500673 ENSG00000213930:ENST00000473506:exon_34648331_34648454:GALT;ENSG00000213930:ENST00000473529:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000472111:exon_34648331_34648483:GALT;ENSG00000213930:ENST00000378846:exon_34648331_34648510:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648331_34648891:GALT;ENSG00000213930:ENST00000487381:exon_34648331_34648823:GALT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 34649442 A/G 1 28 25 53 13.0485674804238 13.3494933210502 -0.300925840626421 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648995_34650279:GALT;ENSG00000213930:ENST00000488412:exon_34649174_34649561:GALT HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35074917 T/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 T:C T C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000221829:ENST00000481254:exon_35074776_35075322:FANCG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35608962 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35608859_35610029:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35608859_35610038:TESK1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35612978 G/A 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35612845_35612990:CD72 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35650859 G/A 1 18 43 61 8.38836480884386 22.9611285122063 -14.5727637033625 A:G G A 10 0.533979732842008 0.000255313594200352 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650751_35650937:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650751_35650907:SIT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 17 19 36 7.92234454168586 10.1456149239982 -2.22327038231229 A:G G A 10 0.533979732842008 0.505998942773016 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 131 136 267 61.048654997697 72.6212436665131 -11.5725886688161 T:C T C 10 0.533979732842008 0.158702560975114 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 21 14 35 9.78642561031783 7.47571625978811 2.31070935052972 T:C C T 10 0.533979732842008 0.499706968646814 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 36966528 G/A 0 8 0 8 3.72816213726394 0 3.72816213726394 G G 10 0.533979732842008 0.00883448110169867 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:G G T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 10 9 19 4.66020267157992 4.80581759557807 -0.145614923998151 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 A:G G A 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 72897434 G/A 1 21 21 42 9.78642561031783 11.2135743896822 -1.42714877936433 A:G G A 10 0.533979732842008 0.757523365874838 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 72897463 C/T 1 27 22 49 12.5825472132658 11.7475541225242 0.834993090741611 T:C C T 10 0.533979732842008 0.886513021471209 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 74315560 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000474495:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000396272:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377055:exon_74315558_74315740:TMEM2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 12 10 22 5.5922432058959 5.33979732842008 0.252445877475825 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 7 8 15 3.26214187010594 4.27183786273606 -1.00969599263012 A:C A C 10 0.533979732842008 0.616011707249859 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 4 12 16 1.86408106863197 6.4077567941041 -4.54367572547213 A:G A G 10 0.533979732842008 0.025216264141459 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 80943948 C/T 1 5 6 11 2.33010133578996 3.20387839705205 -0.873777061262087 T:C C T 10 0.533979732842008 0.76459556509901 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80943897_80945007:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80943897_80945009:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80943897_80944370:PSAT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 16 0 16 7.45632427452787 0 7.45632427452787 G G 10 0.533979732842008 4.8639979692946e-05 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 86421433 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000165113:ENST00000376371:exon_86421217_86421475:GKAP1;ENSG00000165113:ENST00000376365:exon_86421217_86421475:GKAP1;ENSG00000165113:ENST00000388782:exon_86421217_86421475:GKAP1;ENSG00000165113:ENST00000485742:exon_86421270_86421475:GKAP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 20 15 35 9.32040534315984 8.00969599263012 1.31070935052972 A:G G A 10 0.533979732842008 0.735988999370099 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 11 7 18 5.12622293873791 3.73785812989406 1.38836480884386 T:C T C 10 0.533979732842008 0.638636915897731 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 94985637 T/C 1 34 35 69 15.8446890833717 18.6892906494703 -2.84460156609855 T:C T C 10 0.533979732842008 0.546783928399508 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_94985628_94985711:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000421189:exon_94985628_94985771:IARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 95009708 C/G 1 12 15 27 5.5922432058959 8.00969599263012 -2.41745278673421 C:G C G 10 0.533979732842008 0.441078206442053 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95009659_95009833:IARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 12 17 29 5.5922432058959 9.07765545831414 -3.48541225241823 A:G A G 10 0.533979732842008 0.199414733768263 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 70 74 144 32.6214187010594 39.5145002303086 -6.89308152924914 T:C C T 10 0.533979732842008 0.277544211508333 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 3 7 10 1.39806080147398 3.73785812989406 -2.33979732842008 A:C C A 10 0.533979732842008 0.204707877453861 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 T:C C T 10 0.533979732842008 0.129337985263742 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 96212813 C/T 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96212757_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96212757_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96212761_96212881:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96212761_96212869:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96212761_96212881:FAM120AOS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 98766861 G/T 1 4 5 9 1.86408106863197 2.66989866421004 -0.805817595578072 T:G G T 10 0.533979732842008 0.74200360843589 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:C C T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 23 15 38 10.7184661446338 8.00969599263012 2.7087701520037 T:G T G 10 0.533979732842008 0.419058355262351 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 40 24 64 18.6408106863197 12.8155135882082 5.82529709811149 T:C C T 10 0.533979732842008 0.16811051638811 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 51 31 82 23.7670336250576 16.5533717181022 7.21366190695534 T:C T C 10 0.533979732842008 0.121480470688602 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 104152790 G/C 1 25 31 56 11.6505066789498 16.5533717181022 -4.90286503915245 C:G G C 10 0.533979732842008 0.227812712795959 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 104152846 G/A 1 30 22 52 13.9806080147398 11.7475541225242 2.23305389221559 A:G G A 10 0.533979732842008 0.579933642266362 ENSG00000136897:ENST00000374865:exon_104149915_104153132:MRPL50 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 8 9 17 3.72816213726394 4.80581759557807 -1.07765545831414 A:G G A 10 0.533979732842008 0.634159114777915 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 6 12 18 2.79612160294795 6.4077567941041 -3.61163519115614 A:G G A 10 0.533979732842008 0.101098748879718 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 8 8 16 3.72816213726394 4.27183786273606 -0.543675725472127 A:G G A 10 0.533979732842008 0.807255222461569 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:T A T 10 0.533979732842008 0.298120176542467 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 5 14 19 2.33010133578996 7.47571625978811 -5.14561492399815 C:G C G 10 0.533979732842008 0.0209709766423747 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 14 4 18 6.52428374021189 2.13591893136803 4.38836480884386 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0559466590370494 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 572 540 1112 266.563592814371 288.349055734684 -21.7854629203128 A:T:G A G 10 0.533979732842008 0.196202511697584 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 7 7 14 3.26214187010594 3.73785812989406 -0.475716259788111 T:G G T 10 0.533979732842008 0.796678947545285 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 9 6 15 4.19418240442193 3.20387839705205 0.990304007369881 A:G A G 10 0.533979732842008 0.796960576034734 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 25 25 50 11.6505066789498 13.3494933210502 -1.6989866421004 T:C:G T C 10 0.533979732842008 0.671971489653627 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 25 24 49 11.6505066789498 12.8155135882082 -1.16500690925839 T:C C T 10 0.533979732842008 0.775741001678977 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 4 6 10 1.86408106863197 3.20387839705205 -1.33979732842008 T:C C T 10 0.533979732842008 0.529928831618983 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 28 22 50 13.0485674804238 11.7475541225242 1.3010133578996 A:G A G 10 0.533979732842008 0.777596513823316 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 14 6 20 6.52428374021189 3.20387839705205 3.32040534315984 T:C C T 10 0.533979732842008 0.178927883030219 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 11 17 28 5.12622293873791 9.07765545831414 -3.95143251957622 T:C C T 10 0.533979732842008 0.183910224836621 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 21 27 48 9.78642561031783 14.4174527867342 -4.63102717641638 C:G C G 10 0.533979732842008 0.194693092174646 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 27 22 49 12.5825472132658 11.7475541225242 0.834993090741611 T:G T G 10 0.533979732842008 0.886513021471209 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 108 147 255 50.3301888530631 78.4950207277752 -28.164831874712 A:G A G 10 0.533979732842008 0.000427009656162605 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 14 13 27 6.52428374021189 6.9417365269461 -0.417452786734215 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 81 72 153 37.7476416397974 38.4465407646246 -0.698899124827214 A:G A G 10 0.533979732842008 0.935510655183451 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 6 9 15 2.79612160294795 4.80581759557807 -2.00969599263012 T:C T C 10 0.533979732842008 0.314411136954313 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 7 9 16 3.26214187010594 4.80581759557807 -1.54367572547213 T:C C T 10 0.533979732842008 0.463417403482875 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 130259618 A/C 1 6 2 8 2.79612160294795 1.06795946568402 1.72816213726394 A:C A C 10 0.533979732842008 0.298120176542467 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 130586621 C/G 1 2 7 9 0.932040534315984 3.73785812989406 -2.80581759557807 C:G C G 10 0.533979732842008 0.091979109069095 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000486329:exon_130586583_130586684:ENG HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 4 9 13 1.86408106863197 4.80581759557807 -2.9417365269461 A:G A G 10 0.533979732842008 0.162229334464842 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 20 34 54 9.32040534315984 18.1553109166283 -8.83490557346843 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0197137695891273 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131395956 C/T 1 8 16 24 3.72816213726394 8.54367572547213 -4.81551358820819 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0640799581168582 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131395940_131396261:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131395940_131396261:WDR34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 18 23 41 8.38836480884386 12.2815338553662 -3.89316904652233 A:G G A 10 0.533979732842008 0.27317277225747 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 5 14 19 2.33010133578996 7.47571625978811 -5.14561492399815 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0209709766423747 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 12 8 20 5.5922432058959 4.27183786273606 1.32040534315984 A:G A G 10 0.533979732842008 0.656538220866779 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 5 10 15 2.33010133578996 5.33979732842008 -3.00969599263012 A:G G A 10 0.533979732842008 0.129337985263742 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 14 11 25 6.52428374021189 5.87377706126209 0.650506678949801 C:G G C 10 0.533979732842008 0.843430158854152 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 9 16 25 4.19418240442193 8.54367572547213 -4.3494933210502 A:C A C 10 0.533979732842008 0.107499092273397 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 22 17 39 10.2524458774758 9.07765545831414 1.17479041916169 T:C C T 10 0.533979732842008 0.750264511753606 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132569442 G/A 1 9 3 12 4.19418240442193 1.60193919852602 2.5922432058959 A:G G A 10 0.533979732842008 0.157132946742864 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 21 8 29 9.78642561031783 4.27183786273606 5.51458774758177 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0418931561908898 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 92 48 140 42.8738645785353 25.6310271764164 17.2428374021189 C:G C G 10 0.533979732842008 0.00383524895743539 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 58 24 82 27.0291754951635 12.8155135882082 14.2136619069553 A:G A G 10 0.533979732842008 0.00178283190294894 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 19 14 33 8.85438507600185 7.47571625978811 1.37866881621374 T:C C T 10 0.533979732842008 0.728088488884919 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 83 52 135 38.6796821741133 27.7669461077844 10.9127360663289 T:C:G C T 10 0.533979732842008 0.0696798187358584 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132678195 G/A 1 27 15 42 12.5825472132658 8.00969599263012 4.57285122063567 A:G G A 10 0.533979732842008 0.167059241402013 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 59 61 120 27.4951957623215 32.5727637033625 -5.07756794104095 A:G A G 10 0.533979732842008 0.361518564283482 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 134108844 T/C 1 59 57 116 27.4951957623215 30.4368447719945 -2.94164900967292 T:C T C 10 0.533979732842008 0.641896559898349 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134108841_134110057:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134108841_134110050:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134108841_134109088:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134108841_134109088:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134108841_134109090:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000476004:exon_134108841_134109094:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000528406:exon_134108841_134108888:NUP214 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 134334588 A/G 1 16 10 26 7.45632427452787 5.33979732842008 2.11652694610779 A:G A G 10 0.533979732842008 0.438216520885157 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134334551_134334743:BAT2L1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 34 23 57 15.8446890833717 12.2815338553662 3.56315522800555 A:G G A 10 0.533979732842008 0.35640880617461 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 21 15 36 9.78642561031783 8.00969599263012 1.77672961768771 A:G G A 10 0.533979732842008 0.618144982656518 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 14 22 36 6.52428374021189 11.7475541225242 -5.22327038231229 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0948191072862948 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 73 66 139 34.0194795025334 35.2426623675725 -1.2231828650391 A:G A G 10 0.533979732842008 0.865176544713468 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 9 12 21 4.19418240442193 6.4077567941041 -2.21357438968217 A:C C A 10 0.533979732842008 0.385190864065462 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 7 2 9 3.26214187010594 1.06795946568402 2.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.188759088593184 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 136907005 G/A 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 A:G G A 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 4 4 8 1.86408106863197 2.13591893136803 -0.271837862736064 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 138903635 G/A 1 10 7 17 4.66020267157992 3.73785812989406 0.922344541685865 A:G G A 10 0.533979732842008 0.809126182966244 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139256468 C/G 1 39 24 63 18.1747904191617 12.8155135882082 5.3592768309535 C:G C G 10 0.533979732842008 0.206655494395553 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139256541 C/T 1 27 17 44 12.5825472132658 9.07765545831414 3.50489175495165 T:C C T 10 0.533979732842008 0.364782642492931 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139266496 C/T 1 6 3 9 2.79612160294795 1.60193919852602 1.19418240442193 T:C C T 10 0.533979732842008 0.516842352441035 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 3 5 8 1.39806080147398 2.66989866421004 -1.27183786273606 T:C C T 10 0.533979732842008 0.485527419132807 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 34 27 61 15.8446890833717 14.4174527867342 1.42723629663752 A:G A G 10 0.533979732842008 0.797762907074716 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 6 5 11 2.79612160294795 2.66989866421004 0.126222938737913 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 14 14 28 6.52428374021189 7.47571625978811 -0.951432519576223 T:C C T 10 0.533979732842008 0.850205813298175 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 18 12 30 8.38836480884386 6.4077567941041 1.98060801473976 A:G A G 10 0.533979732842008 0.583836871954459 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 16 13 29 7.45632427452787 6.9417365269461 0.51458774758177 T:C C T 10 0.533979732842008 1 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 17 16 33 7.92234454168586 8.54367572547213 -0.621331183786262 T:C C T 10 0.533979732842008 0.86279717602364 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 6 11 17 2.79612160294795 5.87377706126209 -3.07765545831414 T:C C T 10 0.533979732842008 0.150601274470452 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 7 16 23 3.26214187010594 8.54367572547213 -5.28153385536618 A:G A G 10 0.533979732842008 0.0351604382197583 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139744524 C/T 1 188 192 380 87.6118102257025 102.524108705666 -14.912298479963 T:C C T 10 0.533979732842008 0.135836803585077 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139836694 C/T 1 10 12 22 4.66020267157992 6.4077567941041 -1.74755412252417 T:C C T 10 0.533979732842008 0.52430174558224 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836552_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 139929435 A/G 1 5 5 10 2.33010133578996 2.66989866421004 -0.339797328420079 A:G A G 10 0.533979732842008 1 ENSG00000180539:ENST00000314330:exon_139929102_139931234:C9orf139 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 105 155 260 48.9321280515892 82.7668585905112 -33.8347305389221 A:C:G G A 10 0.533979732842008 2.86900938796395e-05 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140079522 G/A 1 7 6 13 3.26214187010594 3.20387839705205 0.0582634730538967 A:G G A 10 0.533979732842008 1 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140079365_140079539:ANAPC2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 10 4 14 4.66020267157992 2.13591893136803 2.52428374021189 A:G A G 10 0.533979732842008 0.193608695507136 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 42 46 88 19.5728512206357 24.5630677107324 -4.9902164900967 A:G G A 10 0.533979732842008 0.2878559480075 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 14 16 30 6.52428374021189 8.54367572547213 -2.01939198526024 T:C T C 10 0.533979732842008 0.47078293991185 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 61 42 103 28.4272362966375 22.4271487793643 6.00008751727318 A:G G A 10 0.533979732842008 0.277243536950773 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 46 36 82 21.4369322892676 19.2232703823123 2.21366190695535 T:C T C 10 0.533979732842008 0.658996395748452 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 44 15 59 20.5048917549517 8.00969599263012 12.4951957623215 T:C C T 10 0.533979732842008 0.00100329367853220 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 28 9 37 13.0485674804238 4.80581759557807 8.24274988484571 A:G G A 10 0.533979732842008 0.00763698360377808 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 1460740 A/G 1 5 4 9 2.33010133578996 2.13591893136803 0.194182404421928 A:G A G 10 0.533979732842008 1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 11 5 16 5.12622293873791 2.66989866421004 2.45632427452787 T:C T C 10 0.533979732842008 0.316611783612569 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 16 6 22 7.45632427452787 3.20387839705205 4.25244587747583 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0868157064028228 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 11 13 24 5.12622293873791 6.9417365269461 -1.81551358820819 C:G C G 10 0.533979732842008 0.541075078613172 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 0 0 20 20 0 10.6795946568402 -10.6795946568402 T C T 10 0.533979732842008 2.3339744105291e-07 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 3 9 12 1.39806080147398 4.80581759557807 -3.4077567941041 T:C C T 10 0.533979732842008 0.0785442552302002 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 13 3 16 6.0582634730539 1.60193919852602 4.45632427452787 A:G G A 10 0.533979732842008 0.0414801567890711 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 0 0 127 127 0 67.815426070935 -67.815426070935 A G A 10 0.533979732842008 7.71631898407668e-43 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 67 3 70 31.2233578995855 1.60193919852602 29.6214187010594 A:G G A 10 0.533979732842008 5.21420999417014e-15 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 47483800 G/A 0 81 0 81 37.7476416397974 0 37.7476416397974 G G 10 0.533979732842008 9.10295727650382e-23 ENSG00000126759:ENST00000478222:exon_47483612_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47483613_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47483625_47483839:CFP HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 13 13 0 6.9417365269461 -6.9417365269461 G T G 10 0.533979732842008 4.88947757480249e-05 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 0 0 27 27 0 14.4174527867342 -14.4174527867342 G A G 10 0.533979732842008 1.11411423115581e-09 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 0 0 17 17 0 9.07765545831414 -9.07765545831414 G A G 10 0.533979732842008 2.30611880200101e-06 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 0 0 28 28 0 14.9514325195762 -14.9514325195762 T C T 10 0.533979732842008 5.19199811647752e-10 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 0 0 25 25 0 13.3494933210502 -13.3494933210502 T C T 10 0.533979732842008 5.13003245551795e-09 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 0 0 61 61 0 32.5727637033625 -32.5727637033625 C G C 10 0.533979732842008 5.92506439913906e-21 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 0 0 18 18 0 9.61163519115614 -9.61163519115614 T C T 10 0.533979732842008 1.07469810020658e-06 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 1 640 2 642 298.252970981115 1.06795946568402 297.185011515431 T:C T C 10 0.533979732842008 1.94881717919918e-170 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 73066439 T/C 0 46 0 46 21.4369322892676 0 21.4369322892676 T T 10 0.533979732842008 3.22477480691496e-13 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 0 455 1 456 212.039221556886 0.533979732842008 211.505241824044 T:G G T 10 0.533979732842008 2.47897937172150e-122 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 0 21 0 21 9.78642561031783 0 9.78642561031783 A A 10 0.533979732842008 2.00556229209642e-06 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 119374120 T/G 0 0 25 25 0 13.3494933210502 -13.3494933210502 G T G 10 0.533979732842008 5.13003245551795e-09 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 0 0 24 24 0 12.8155135882082 -12.8155135882082 C T C 10 0.533979732842008 1.1008174573186e-08 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 129063293 C/A 0 0 9 9 0 4.80581759557807 -4.80581759557807 A C A 10 0.533979732842008 0.00103667646843486 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 1 2 25 27 0.932040534315984 13.3494933210502 -12.4174527867342 A:G A G 10 0.533979732842008 5.92977885573558e-07 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 133632439 C/G 0 78 0 78 36.3495808383234 0 36.3495808383234 C C 10 0.533979732842008 6.13490939606656e-22 ENSG00000165704:ENST00000370796:exon_133632420_133632466:HPRT1;ENSG00000165704:ENST00000298556:exon_133632420_133632466:HPRT1;ENSG00000165704:ENST00000462974:exon_133632420_133632466:HPRT1;ENSG00000165704:ENST00000475720:exon_133632420_133632466:HPRT1 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 134713861 C/T 0 0 22 22 0 11.7475541225242 -11.7475541225242 T C T 10 0.533979732842008 5.06880634473771e-08 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 0 0 34 34 0 18.1553109166283 -18.1553109166283 C T C 10 0.533979732842008 5.31818392894258e-12 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 0 0 17 17 0 9.07765545831414 -9.07765545831414 G T G 10 0.533979732842008 2.30611880200101e-06 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 152018832 T/G 0 0 38 38 0 20.2912298479963 -20.2912298479963 G T G 10 0.533979732842008 2.50831786492639e-13 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000432467:exon_152018809_152018967:NSDHL HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 153296642 G/C 0 0 26 26 0 13.8834730538922 -13.8834730538922 C G C 10 0.533979732842008 2.39069909544965e-09 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000407218:exon_153296464_153296737:MECP2 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 153628294 C/G 0 46 0 46 21.4369322892676 0 21.4369322892676 C C 10 0.533979732842008 3.22477480691496e-13 ENSG00000147403:ENST00000474786:exon_153628144_153628507:RPL10;ENSG00000147403:ENST00000491035:exon_153628144_153628967:RPL10;ENSG00000147403:ENST00000489200:exon_153628144_153629239:RPL10;ENSG00000147403:ENST00000482732:exon_153627679_153629254:RPL10;ENSG00000147403:ENST00000492572:exon_153628144_153629238:RPL10 HGDP00713_parsed_pileup.txt . X 153706264 C/G 0 102 0 102 47.5340672501152 0 47.5340672501152 C C 10 0.533979732842008 2.01147679746535e-28 ENSG00000196976:ENST00000407062:exon_153706028_153706750:LAGE3;ENSG00000196976:ENST00000357360:exon_153706108_153706397:LAGE3