INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 982225 C/T 1 40 57 97 18.6052885158978 30.4874638648456 -11.8821753489478 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0188148210615292 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982200_982337:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982200_982337:AGRN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 985460 T/C 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1337604 C/T 1 420 446 866 195.355529416927 238.55103304774 -43.1955036308127 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00338136885768002 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1337288_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000493287:exon_1337293_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1337293_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000492508:exon_1337562_1337981:MRPL20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 1 45 1 46 20.930949580385 0.534867787102555 20.3960817932825 T:C C T 10 0.534867787102555 2.54711028531475e-11 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 52 33 85 24.1868750706671 17.6506369743843 6.53623809628282 A:C C A 10 0.534867787102555 0.159324082658749 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 72 62 134 33.489519328616 33.1618028003584 0.327716528257632 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1425816 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 97 97 194 45.1178246510522 51.8821753489478 -6.76435069789567 T:C C T 10 0.534867787102555 0.349711357735188 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1509900 G/C 1 214 206 420 99.5382935600532 110.182764143126 -10.6444705830731 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.304577360683069 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1509858_1510249:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378725:exon_1509858_1509967:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000359060:exon_1509858_1509964:SSU72 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 34 16 50 15.8144952385131 8.55788459364088 7.25661064487225 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0465518228497702 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 36 55 91 16.744759664308 29.4177282906405 -12.6729686263325 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00845140128927103 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 1686081 G/A 1 60 56 116 27.9079327738467 29.9525960777431 -2.04466330389638 A:G G A 10 0.534867787102555 0.710690580435588 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 123 114 237 57.2112621863857 60.9749277296913 -3.76366554330554 A:G G A 10 0.534867787102555 0.648732498086066 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2441392 T/C 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2444414 G/A 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000471361:exon_2444327_2444452:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000487804:exon_2443845_2444478:PANK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 279 351 630 129.771887398387 187.738593272997 -57.9667058746097 A:G A G 10 0.534867787102555 4.13645797139396e-06 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2520500 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 2520527 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 28 18 46 13.0237019611285 9.62762016784599 3.39608179328247 T:C T C 10 0.534867787102555 0.375724060618343 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 17 13 30 7.90724761925657 6.95328123233322 0.95396638692335 A:G G A 10 0.534867787102555 0.855241169984464 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 14 19 33 6.51185098056423 10.1624879549485 -3.65063697438432 T:C T C 10 0.534867787102555 0.22440973942797 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 5937168 G/A 0 0 9 9 0 4.81381008392299 -4.81381008392299 A G A 10 0.534867787102555 0.00101903185420343 ENSG00000131697:ENST00000478423:exon_5937153_5937358:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000489180:exon_5937153_5937358:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000378156:exon_5937153_5937358:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000378169:exon_5937153_5937358:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000506941:exon_5937153_5937526:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000470763:exon_5936939_5937358:NPHP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 6271125 A/G 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 A:G A G 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6271081_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000463453:exon_6271081_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496329:exon_6270998_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6271095_6271178:RNF207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 6272078 G/A 1 29 15 44 13.4888341740259 8.02301680653832 5.46581736748758 A:G G A 10 0.534867787102555 0.129809414676413 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000463453:exon_6271983_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6271927_6272113:RNF207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 6272813 C/T 1 38 44 82 17.6750240901029 23.5341826325124 -5.85915854240951 T:C C T 10 0.534867787102555 0.223272382841728 ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 31 30 61 14.4190985998208 16.0460336130766 -1.62693501325585 A:G A G 10 0.534867787102555 0.701605803608164 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 6279493 G/A 1 31 37 68 14.4190985998208 19.7901081227945 -5.37100952297374 A:G G A 10 0.534867787102555 0.224015024444935 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 55 0 55 25.5822717093595 0 25.5822717093595 C C 10 0.534867787102555 2.18745071520046e-15 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 0 39 39 0 20.8598436969996 -20.8598436969996 A G A 10 0.534867787102555 1.08512630900413e-13 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 45 35 80 20.930949580385 18.7203725485894 2.2105770317956 A:C C A 10 0.534867787102555 0.655037885602451 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 48 44 92 22.3263462190774 23.5341826325124 -1.20783641343506 T:C T C 10 0.534867787102555 0.834805307512606 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 8928125 G/T 1 23 26 49 10.6980408966412 13.9065624646664 -3.2085215680252 T:G G T 10 0.534867787102555 0.391779872989907 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 9323910 G/A 1 16 22 38 7.44211540635912 11.7670913162562 -4.32497590989709 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.193199775436703 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 30 25 55 13.9539663869233 13.3716946775639 0.582271709359475 T:C T C 10 0.534867787102555 0.893424698385427 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 30 22 52 13.9539663869233 11.7670913162562 2.18687507066714 A:G A G 10 0.534867787102555 0.580323809477977 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 67 73 140 31.1638582641288 39.0453484584865 -7.8814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.203688258397938 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 119 117 236 55.350733334796 62.5795310909989 -7.22879775620298 T:C C T 10 0.534867787102555 0.361227559107864 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 10687419 C/T 1 26 37 63 12.0934375353336 19.7901081227945 -7.69667058746097 T:C C T 10 0.534867787102555 0.058067331024054 ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10687329_10687420:PEX14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:G G A 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 374 304 678 173.959447623644 162.599807279177 11.3596403444677 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.397067830800180 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11115061 G/A 1 331 254 585 153.958762469054 135.856417924049 18.1023445450053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.135838808236146 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11115019_11115261:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11134043 C/T 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11133991_11134065:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11133991_11134065:EXOSC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11137629 T/C 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11158105 C/T 1 31 20 51 14.4190985998208 10.6973557420511 3.7217428577697 T:C C T 10 0.534867787102555 0.327574383903317 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11158077_11158213:EXOSC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11205058 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11205025_11205102:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000495435:exon_11204705_11205082:MTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11272468 C/G 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 C:G C G 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11272369_11272531:MTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11301714 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11301610_11301738:MTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11317017 G/A 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11316990_11317222:MTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 21 32 53 9.76777647084634 17.1157691872818 -7.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0530761630853906 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 11856378 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11856263_11856456:MTHFR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 44 36 80 20.4658173674876 19.255240335692 1.2105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.823265987771767 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12049375 C/A 1 32 24 56 14.8842308127182 12.8368268904613 2.04740392225692 A:C C A 10 0.534867787102555 0.595549866241108 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000484391:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000497302:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000412236:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12049222_12049400:MFN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12049390 C/T 1 41 26 67 19.0704207287952 13.9065624646664 5.16385826412881 T:C C T 10 0.534867787102555 0.222139155676814 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000484391:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000497302:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000412236:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12049222_12049400:MFN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12056309 A/T 1 13 26 39 6.04671876766678 13.9065624646664 -7.85984369699965 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0150998634214339 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12056213_12056375:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12056213_12056375:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12056213_12056375:MFN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12058802 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12065841 C/T 1 26 30 56 12.0934375353336 16.0460336130766 -3.95259607774308 T:C C T 10 0.534867787102555 0.348496632513094 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376337:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376320:exon_12065768_12065988:MFN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 49 32 81 22.7914784319748 17.1157691872818 5.67570924469305 A:G A G 10 0.534867787102555 0.221593570078975 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089142 C/G 1 68 33 101 31.6289904770263 17.6506369743843 13.9783535026419 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00516108715660456 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12088778_12089198:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089163 A/G 1 67 44 111 31.1638582641288 23.5341826325124 7.6296756316164 A:G A G 10 0.534867787102555 0.154279122255024 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12088778_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089153_12089198:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089225 G/A 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089359 A/T 1 68 46 114 31.6289904770263 24.6039182067175 7.02507227030873 A:T A T 10 0.534867787102555 0.190335321246152 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12089280_12089664:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089845 C/T 1 133 75 208 61.8625843153602 40.1150840326916 21.7475002826686 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00272191984278614 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089851 C/T 1 108 49 157 50.2342789929241 26.2085215680252 24.0257574248989 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000111728329720750 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12089946 C/G 1 108 88 196 50.2342789929241 47.0683652650248 3.16591372789922 C:G C G 10 0.534867787102555 0.668010512625842 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12090154 C/T 1 120 99 219 55.8158655476934 52.9519109231529 2.86395462454045 T:C C T 10 0.534867787102555 0.73499272046687 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12090085_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12090085_12090181:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12091753 C/T 1 13 28 41 6.04671876766678 14.9762980388715 -8.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00704548809581875 ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12091598_12092082:MIIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 17 23 40 7.90724761925657 12.3019591033588 -4.3947114841022 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.204402284095363 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 67 53 120 31.1638582641288 28.3479927164354 2.8158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.647712233359939 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 12401868 A/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:C A C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000048707:ENST00000358136:exon_12401837_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000356315:exon_12401837_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000011700:exon_12401840_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000460333:exon_12401837_12401942:VPS13D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 14109424 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15541607 T/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000451326:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15541391_15541927:TMEM51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15546077 G/A 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15545822_15546835:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15545822_15546974:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15545822_15546872:TMEM51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G A G 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15850613 G/A 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15850564_15850716:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15850564_15850721:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15850564_15850687:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15850564_15850712:CASP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 17 22 39 7.90724761925657 11.7670913162562 -3.85984369699964 C:G C G 10 0.534867787102555 0.261257462020995 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 10 22 32 4.65132212897445 11.7670913162562 -7.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0128749635874959 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16199344 C/T 1 31 14 45 14.4190985998208 7.48814901943577 6.93094958038503 T:C C T 10 0.534867787102555 0.050859430008587 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16199311_16199631:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 28 23 51 13.0237019611285 12.3019591033588 0.721742857769694 T:C C T 10 0.534867787102555 0.888968917914017 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 24 18 42 11.1631731095387 9.62762016784599 1.53555294169269 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.647000211541768 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 75 63 138 34.8849159673084 33.696670587461 1.18824537984741 A:G A G 10 0.534867787102555 0.864796815090788 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 31 33 64 14.4190985998208 17.6506369743843 -3.23153837456352 T:C C T 10 0.534867787102555 0.453220740694877 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 21 28 49 9.76777647084634 14.9762980388715 -5.2085215680252 T:C C T 10 0.534867787102555 0.152708336996737 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16271180 T/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 18 17 35 8.37237983215401 9.09275238074344 -0.720372548589426 A:G A G 10 0.534867787102555 0.866210037229802 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16274769 C/T 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 16950470 C/T 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 19201956 A/G 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G A G 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 19202896 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 19202917 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 19202926 T/C 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 19203997 C/G 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 C:G C G 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19203910_19204106:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19203910_19204106:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19203910_19204106:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19203910_19204106:ALDH4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 20234258 G/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000169914:ENST00000375120:exon_20234063_20239438:OTUD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 17 17 34 7.90724761925657 9.09275238074344 -1.18550476148687 A:C A C 10 0.534867787102555 0.732719691709591 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 186 159 345 86.5145915989248 85.0439781493062 1.47061344961853 A:G G A 10 0.534867787102555 0.914066128477432 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 22150120 C/T 1 2 11 13 0.93026442579489 5.8835456581281 -4.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00928848391930397 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22150109_22150759:HSPG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 22150160 G/T 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 T:G G T 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22150109_22150759:HSPG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 22852715 G/C 1 21 9 30 9.76777647084634 4.81381008392299 4.95396638692335 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0979330585037194 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 92 73 165 42.7921635865649 39.0453484584865 3.74681512807842 A:T A T 10 0.534867787102555 0.58537418466539 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 64 43 107 29.7684616254365 22.9993148454099 6.76914678002661 A:C A C 10 0.534867787102555 0.208042363823197 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 81 67 148 37.675709244693 35.8361417358712 1.83956750882186 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80495130437636 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 27428621 C/T 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27428507_27428621:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374089:exon_27428507_27428621:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000447808:exon_27428507_27428621:SLC9A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 43 58 101 20.0006851545901 31.0223316519482 -11.0216464973581 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0284882640313424 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 17 29 46 7.90724761925657 15.5111658259741 -7.60391820671753 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0266950708938233 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 150 80 230 69.7698319346167 42.7894229682044 26.9804089664123 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000343996891439734 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 144 64 208 66.9790386572321 34.2315383745635 32.7475002826686 T:C T C 10 0.534867787102555 5.25179547665715e-06 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 153 64 217 71.1652285733091 34.2315383745635 36.9336901987456 A:G A G 10 0.534867787102555 3.75922532426701e-07 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 576 499 1075 267.916154628928 266.899025764175 1.01712886475337 A:G A G 10 0.534867787102555 0.975611028970267 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 A:G A G 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 43 10 53 20.0006851545901 5.34867787102555 14.6520072835646 A:G A G 10 0.534867787102555 4.2450679969869e-05 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 28793149 C/G 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000463428:exon_28792893_28793752:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28792893_28793279:PHACTR4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 29379616 C/T 1 41 36 77 19.0704207287952 19.255240335692 -0.184819606896735 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29379616_29379824:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373797:exon_29379616_29379824:EPB41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 323 330 653 150.237704765875 176.506369743843 -26.2686649779684 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0413165537815388 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 17 13 30 7.90724761925657 6.95328123233322 0.95396638692335 A:G A G 10 0.534867787102555 0.855241169984464 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32672784 G/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32672785 A/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:T A T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32672908 T/G 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32694819 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 32696628 A/C 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:C A C 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000084623:ENST00000474371:exon_32696528_32696655:EIF3I HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 33276464 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 33502376 G/A 0 134 0 134 62.3277165282576 0 62.3277165282576 G G 10 0.534867787102555 4.50395948212346e-37 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33502337_33502471:AK2;ENSG00000004455:ENST00000467905:exon_33502337_33502487:AK2;ENSG00000004455:ENST00000354858:exon_33502337_33502593:AK2;ENSG00000004455:ENST00000480134:exon_33502337_33502478:AK2;ENSG00000004455:ENST00000398192:exon_33502337_33502467:AK2;ENSG00000004455:ENST00000487289:exon_33502337_33502445:AK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 33764578 C/G 1 23 22 45 10.6980408966412 11.7670913162562 -1.06905041961497 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.767002356387335 ENSG00000160094:ENST00000373428:exon_33764531_33766320:ZNF362 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 33957130 C/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000121903:ENST00000373411:exon_33956625_33957302:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000326544:exon_33956625_33957302:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000373413:exon_33956625_33958191:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000361328:exon_33956625_33957302:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000401072:exon_33956625_33957302:ZSCAN20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 48 42 90 22.3263462190774 22.4644470583073 -0.138100839229953 A:C:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 35908451 T/C 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C T C 10 0.534867787102555 0.76449359563304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 24 13 37 11.1631731095387 6.95328123233322 4.20989187720546 T:C T C 10 0.534867787102555 0.188873664543726 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36316571 A/C 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:C:G A C 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000134698:ENST00000373210:exon_36316455_36316654:EIF2C4;ENSG00000134698:ENST00000397882:exon_36316455_36316654:EIF2C4;ENSG00000134698:ENST00000488778:exon_36316455_36316796:EIF2C4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36359669 A/G 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000092847:ENST00000373206:exon_36359638_36359772:EIF2C1;ENSG00000092847:ENST00000373204:exon_36359638_36359772:EIF2C1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 59 50 109 27.4428005609493 26.7433893551277 0.699411205821505 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.92372199627465 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36643685 C/A 1 92 84 176 42.7921635865649 44.9288941166146 -2.13673053004968 A:C C A 10 0.534867787102555 0.762845614555104 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36643783 C/T 1 100 98 198 46.5132212897445 52.4170431360504 -5.90382184630589 T:C C T 10 0.534867787102555 0.433342882698559 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 124 137 261 57.6763943992832 73.27688683305 -15.6004924337669 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.0545115001919462 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 10 19 29 4.65132212897445 10.1624879549485 -5.5111658259741 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0607597508953381 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 38411445 G/A 1 13 16 29 6.04671876766678 8.55788459364088 -2.5111658259741 A:G G A 10 0.534867787102555 0.359273405953985 ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373021:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000440912:exon_38411428_38411522:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000491406:exon_38411428_38411522:INPP5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 16 33 49 7.44211540635912 17.6506369743843 -10.2085215680252 T:C C T 10 0.534867787102555 0.003903661370748 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 39797296 G/A 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 A:G G A 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 38 24 62 17.6750240901029 12.8368268904613 4.83819719964159 C:G G C 10 0.534867787102555 0.252186473216053 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40226135 G/A 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 ENSG00000116985:ENST00000372827:exon_40222854_40226240:BMP8B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40315716 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40424484 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000168389:ENST00000372811:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000450641:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000434861:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000420632:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000372809:exon_40424334_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000525305:exon_40424334_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000483824:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000412699:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000469745:exon_40424373_40424497:MFSD2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 47 34 81 21.8612140061799 18.1855047614869 3.67570924469304 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.437170885404242 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40769783 G/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 30 19 49 13.9539663869233 10.1624879549485 3.7914784319748 T:C T C 10 0.534867787102555 0.317195737226672 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40879808 G/C,T 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 T:C G C 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40879649_40879912:SMAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 24 18 42 11.1631731095387 9.62762016784599 1.53555294169269 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.647000211541768 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 40981218 A/C 1 24 24 48 11.1631731095387 12.8368268904613 -1.67365378092264 A:C A C 10 0.534867787102555 0.665805956068601 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 41013015 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117010:ENST00000372699:exon_41012234_41013841:ZNF684;ENSG00000117010:ENST00000493756:exon_41012234_41013457:ZNF684 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 22 20 42 10.2329086837438 10.6973557420511 -0.464447058307309 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 41474400 C/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171793:ENST00000498694:exon_41474331_41474562:CTPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 41482976 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000171790:ENST00000302946:exon_41482906_41483049:SLFNL1;ENSG00000171790:ENST00000372611:exon_41482906_41483049:SLFNL1;ENSG00000171790:ENST00000359345:exon_41482906_41483049:SLFNL1;ENSG00000171790:ENST00000439569:exon_41482906_41483049:SLFNL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 33 16 49 15.3493630256157 8.55788459364088 6.7914784319748 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0619723923648527 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 43392819 G/T 1 19 35 54 8.83751204505145 18.7203725485894 -9.88286050353797 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00896755924636517 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43391826_43392912:SLC2A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 43393384 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43393276_43393479:SLC2A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 43394612 T/C 1 22 30 52 10.2329086837438 16.0460336130766 -5.81312492933286 T:C T C 10 0.534867787102555 0.125872179355328 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 38 13 51 17.6750240901029 6.95328123233322 10.7217428577697 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.00286370498650432 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 A:G G A 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 26 15 41 12.0934375353336 8.02301680653832 4.07042072879524 A:C C A 10 0.534867787102555 0.214342950952987 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 44442521 A/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:C A C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000117410:ENST00000496131:exon_44442445_44442786:ATP6V0B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 45241809 C/T 1 3593 3443 7036 1671.22004094052 1841.5497909941 -170.329750053577 T:C C T 10 0.534867787102555 4.82624634440986e-05 ENSG00000142937:ENST00000497035:exon_45241706_45241812:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000396651:exon_45241706_45241812:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000372209:exon_45241706_45241812:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000470475:exon_45241706_45241812:RPS8;ENSG00000142937:ENST00000485390:exon_45241308_45241812:RPS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 20 22 42 9.3026442579489 11.7670913162562 -2.46444705830731 A:G A G 10 0.534867787102555 0.536612259953469 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 47746678 G/C 1 3 13 16 1.39539663869233 6.95328123233322 -5.55788459364088 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0096828402624409 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47746618_47746728:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000418131:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000436811:exon_47746618_47746729:STIL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 84 50 134 39.0711058833854 26.7433893551277 12.3277165282576 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0373475805527860 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 47834209 G/T 1 86 122 208 40.0013703091803 65.2538700265117 -25.2524997173314 T:G G T 10 0.534867787102555 0.000488754315901648 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47834141_47834287:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47834141_47834287:CMPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 51753812 G/A 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 ENSG00000085831:ENST00000530004:exon_51752930_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000447632:exon_51752930_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000413473:exon_51752930_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000262675:exon_51753484_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000451380:exon_51753484_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000371750:exon_51753642_51753952:TTC39A;ENSG00000085831:ENST00000534098:exon_51753658_51753952:TTC39A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 51860059 C/T 1 40 46 86 18.6052885158978 24.6039182067175 -5.99862969081973 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.196739357265487 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51860053_51860119:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51860053_51860119:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51860053_51860119:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000486505:exon_51859884_51860119:EPS15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52237786 A/G 1 63 61 124 29.303329412539 32.6269350132559 -3.32360560071682 A:G A G 10 0.534867787102555 0.589407795810945 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000489990:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531819:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000533825:exon_52237748_52237854:OSBPL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52237828 C/T 1 59 63 122 27.4428005609493 33.696670587461 -6.25387002651171 T:C C T 10 0.534867787102555 0.276452614168715 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000489990:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531819:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000533825:exon_52237748_52237854:OSBPL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 41 56 97 19.0704207287952 29.9525960777431 -10.8821753489478 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0320884703231072 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 56 38 94 26.0474039222569 20.3249759098971 5.72242801235983 A:T A T 10 0.534867787102555 0.256170350009269 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52851608 G/A 1 13 3 16 6.04671876766678 1.60460336130767 4.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0414818150900532 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52851524_52851621:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000476332:exon_52851524_52851621:ORC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 87 64 151 40.4665025220777 34.2315383745635 6.2349641475142 A:G A G 10 0.534867787102555 0.328158863895631 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 20 17 37 9.3026442579489 9.09275238074344 0.209891877205465 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53072454 T/C 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000116157:ENST00000361314:exon_53072356_53072617:GPX7;ENSG00000116157:ENST00000459779:exon_53072356_53073080:GPX7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53676401 T/G 1 57 37 94 26.5125361351544 19.7901081227945 6.72242801235983 T:C:G T G 10 0.534867787102555 0.179383700145259 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 67 41 108 31.1638582641288 21.9295792712048 9.23427899292406 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0824341905634454 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53684525 C/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 C:G C G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000162384:ENST00000489755:exon_53684086_53684699:C1orf123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 39 20 59 18.1401563030004 10.6973557420511 7.44280056094926 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0667865674476316 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 43 26 69 20.0006851545901 13.9065624646664 6.0941226899237 T:G G T 10 0.534867787102555 0.149081742886248 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 53792651 A/C 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000496580:exon_53792545_53792664:LRP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 54387295 A/T 1 35 31 66 16.2796274514106 16.5809014001792 -0.301273948768628 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000081870:ENST00000194214:exon_54387234_54387440:HSPB11;ENSG00000081870:ENST00000489675:exon_54387235_54387440:HSPB11;ENSG00000081870:ENST00000371378:exon_54387236_54387440:HSPB11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 54678305 C/G 1 84 101 185 39.0711058833854 54.0216464973581 -14.9505406139727 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0322971764059154 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54678174_54678331:MRPL37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 88 74 162 40.9316347349752 39.5802162455891 1.35141848938609 C:G G C 10 0.534867787102555 0.874949453264229 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 210 178 388 97.6777647084634 95.2064661042548 2.47129860420866 A:T:C:G C G 10 0.534867787102555 0.838729083493131 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 55188382 C/T 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 T:C C T 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 59126891 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59126842_59126899:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59126842_59126899:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59126842_59126899:MYSM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 59127086 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59127078_59127183:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59127078_59127183:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59127078_59127183:MYSM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 59247993 C/T 1 67 82 149 31.1638582641288 43.8591585424095 -12.6953002782807 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0399758504272650 ENSG00000177606:ENST00000371222:exon_59246465_59249785:JUN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 59844471 G/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000172456:ENST00000413489:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000474476:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000371215:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000315089:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000371218:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000495718:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000303721:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000430447:exon_59844421_59844509:FGGY;ENSG00000172456:ENST00000371212:exon_59844421_59844509:FGGY HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 63113968 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_63113777_63113989:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_63113777_63113989:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_63113777_63113989:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_63113777_63113989:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000404627:exon_63113777_63113989:DOCK7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 57 46 103 26.5125361351544 24.6039182067175 1.90861792843683 T:C T C 10 0.534867787102555 0.767220541407151 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 30 20 50 13.9539663869233 10.6973557420511 3.25661064487225 A:G G A 10 0.534867787102555 0.396592939270772 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 67450389 G/C 1 39 27 66 18.1401563030004 14.441430251769 3.69872605123137 C:G G C 10 0.534867787102555 0.389424720403702 ENSG00000198160:ENST00000357692:exon_67450255_67453714:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000401041:exon_67450255_67451367:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000355977:exon_67450255_67454302:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000439314:exon_67450255_67454302:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371018:exon_67450255_67454302:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371017:exon_67450255_67454302:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000355356:exon_67450255_67453713:MIER1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 67795319 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000441640:exon_67795270_67795412:IL12RB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 67833501 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 68151980 T/G 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000116717:ENST00000460575:exon_68151708_68152271:GADD45A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 70639324 A/G 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000066557:ENST00000370952:exon_70639305_70639392:LRRC40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 74671519 A/G 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74670892_74671890:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74670903_74671907:FPGT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 90 79 169 41.8618991607701 42.2545551811018 -0.392656020331792 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 112 58 170 52.0948078445138 31.0223316519482 21.0724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00119555952235498 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 82 59 141 38.1408414575905 31.5571994390507 6.58364201853975 A:G A G 10 0.534867787102555 0.273679922017316 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:G A G 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 78479113 A/G 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000162616:ENST00000487931:exon_78478735_78479303:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000477671:exon_78478735_78479198:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000484662:exon_78478735_78479301:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000370763:exon_78478735_78479303:DNAJB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 78479126 C/T 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000162616:ENST00000487931:exon_78478735_78479303:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000477671:exon_78478735_78479198:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000484662:exon_78478735_78479301:DNAJB4;ENSG00000162616:ENST00000370763:exon_78478735_78479303:DNAJB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 86172187 A/T 1 30 17 47 13.9539663869233 9.09275238074344 4.86121400617991 A:T A T 10 0.534867787102555 0.188047539093212 ENSG00000117174:ENST00000370574:exon_86172125_86172190:ZNHIT6;ENSG00000117174:ENST00000431532:exon_86172125_86172190:ZNHIT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 16 15 31 7.44211540635912 8.02301680653832 -0.580901400179204 T:C C T 10 0.534867787102555 0.85880988898277 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 86838158 C/T 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86838114_86838264:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86838114_86838223:ODF2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 86852621 A/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86852598_86852762:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000465959:exon_86852598_86852762:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000478286:exon_86851411_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486215:exon_86852492_86852769:ODF2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89271574 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000065243:ENST00000370521:exon_89271574_89271700:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000316005:exon_89271180_89271951:PKN2;ENSG00000065243:ENST00000370505:exon_89271574_89271700:PKN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 35 24 59 16.2796274514106 12.8368268904613 3.44280056094926 A:G G A 10 0.534867787102555 0.433970294596475 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89478868 G/A 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89478868_89479007:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000235878:exon_89478868_89479110:GBP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89479063 G/A 1 9 1 10 4.18618991607701 0.534867787102555 3.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0245053429743222 ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000235878:exon_89478868_89479110:GBP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89479074 C/T 1 9 1 10 4.18618991607701 0.534867787102555 3.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0245053429743222 ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000235878:exon_89478868_89479110:GBP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 A:C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 89735135 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89735049_89735257:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89735049_89735278:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89735049_89735257:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89735049_89738487:GBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 90049011 T/C 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000197147:ENST00000330947:exon_90048184_90050348:LRRC8B;ENSG00000197147:ENST00000358200:exon_90048184_90050348:LRRC8B;ENSG00000197147:ENST00000439853:exon_90048184_90050348:LRRC8B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 50 46 96 23.2566106448723 24.6039182067175 -1.34730756184528 A:G A G 10 0.534867787102555 0.8380458741978 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 109 62 171 50.6994112058215 33.1618028003584 17.5376084054631 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.00723410217657488 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 93 57 150 43.2572957994624 30.4874638648456 12.7698319346167 A:G A G 10 0.534867787102555 0.040499453865513 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 51 38 89 23.7217428577697 20.3249759098971 3.3967669478726 T:C C T 10 0.534867787102555 0.524161616608148 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G A G 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 100327217 T/C 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100327059_100327269:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100326766_100327269:AGL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 100336361 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100336314_100336425:AGL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 100818464 T/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000079335:ENST00000370125:exon_100818023_100818559:CDC14A;ENSG00000079335:ENST00000361544:exon_100818047_100818559:CDC14A;ENSG00000079335:ENST00000370124:exon_100818058_100818559:CDC14A;ENSG00000079335:ENST00000336454:exon_100818156_100818559:CDC14A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 37 19 56 17.2098918772055 10.1624879549485 7.04740392225692 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0616192602687749 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 19 24 43 8.83751204505145 12.8368268904613 -3.99931484540987 T:C C T 10 0.534867787102555 0.225920813386530 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 47 61 108 21.8612140061799 32.6269350132559 -10.7657210070759 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0425316460621109 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 39 38 77 18.1401563030004 20.3249759098971 -2.18481960689673 A:G G A 10 0.534867787102555 0.648662324971153 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 43 49 92 20.0006851545901 26.2085215680252 -6.20783641343506 A:T:C C A 10 0.534867787102555 0.210303972762181 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110581780 T/G 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:G T G 10 0.534867787102555 0.156760860097915 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110585850 C/T 1 19 21 40 8.83751204505145 11.2322235291537 -2.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.526724673864191 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110585710_110585892:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110585710_110585892:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110585710_110585892:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000473429:exon_110585710_110585892:FAM40A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 110883917 A/G 1 31 29 60 14.4190985998208 15.5111658259741 -1.0920672261533 A:G A G 10 0.534867787102555 0.79694762683125 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 406 350 756 188.843678436363 187.203725485894 1.63995295046843 T:C C T 10 0.534867787102555 0.912950070045034 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 204 1 205 94.8869714310788 0.534867787102555 94.3521036439762 A:C C A 10 0.534867787102555 5.02181862026099e-54 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 111957688 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 111992516 C/T 1 3 11 14 1.39539663869233 5.8835456581281 -4.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.028188018724604 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 38 33 71 17.6750240901029 17.6506369743843 0.0243871157185929 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114443035 C/G 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 C:G C G 10 0.534867787102555 0.485142004431293 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C C T 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114505000 G/A 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369559:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114504939_114505060:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114504939_114505060:HIPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114508757 G/A 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369559:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114508755_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114508752_114508894:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114508755_114508894:HIPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 114515717 G/A 1 15 22 37 6.97698319346167 11.7670913162562 -4.79010812279453 A:G G A 10 0.534867787102555 0.137804477163093 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114515646_114516193:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114515646_114520426:HIPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 24 27 51 11.1631731095387 14.441430251769 -3.27825714223031 C:G C G 10 0.534867787102555 0.400593151212235 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 A:G G A 10 0.534867787102555 0.467707552599743 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 18 0 18 8.37237983215401 0 8.37237983215401 C C 10 0.534867787102555 1.38746110552337e-05 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 T T 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144922523 C/T 1 13 2 15 6.04671876766678 1.06973557420511 4.97698319346167 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0094603210285478 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 C C 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 11 1 12 5.1164543418719 0.534867787102555 4.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0077867623210267 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 26 1 27 12.0934375353336 0.534867787102555 11.558569748231 T:C C T 10 0.534867787102555 1.65085854480877e-06 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144931392 G/A 1 13 3 16 6.04671876766678 1.60460336130767 4.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0414818150900532 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 144931727 G/A 1 13 1 14 6.04671876766678 0.534867787102555 5.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00244563697787340 ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 159 159 0 85.0439781493062 -85.0439781493062 C T C 10 0.534867787102555 1.39524484246692e-53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 85 85 0 45.4637619037172 -45.4637619037172 T G T 10 0.534867787102555 5.5461997977037e-29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 97 97 0 51.8821753489478 -51.8821753489478 A C A 10 0.534867787102555 5.6873836339864e-33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 139 0 139 64.6533775927449 0 64.6533775927449 G G 10 0.534867787102555 1.84959319815171e-38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 101 101 0 54.0216464973581 -54.0216464973581 C T C 10 0.534867787102555 2.66206217744093e-34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 207 207 0 110.717631930229 -110.717631930229 A:T C T 10 0.534867787102555 1.54283143470026e-69 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 251 1 252 116.748185437259 0.534867787102555 116.213317650156 A:C C A 10 0.534867787102555 7.85974859014253e-67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 146751782 A/C 1 35 26 61 16.2796274514106 13.9065624646664 2.37306498674415 A:C A C 10 0.534867787102555 0.608332984353393 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146751699_146751864:CHD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 146758149 C/T 1 24 40 64 11.1631731095387 21.3947114841022 -10.2315383745635 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0118584385792796 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146757975_146758177:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146757975_146758177:CHD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 146767149 G/T 1 56 52 108 26.0474039222569 27.8131249293329 -1.76572100707594 A:T:G G T 10 0.534867787102555 0.772610344085654 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146767112_146767443:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146767112_146767443:CHD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 147096794 A/G 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G A G 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 150598171 G/A 1 183 161 344 85.1191949602324 86.1137137235114 -0.994518763278919 A:G G A 10 0.534867787102555 0.91405049157064 ENSG00000143420:ENST00000369016:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000369014:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000369009:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000361532:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000361631:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000509582:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000339643:exon_150598118_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000271690:exon_150596096_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000356527:exon_150596098_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000513281:exon_150597098_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000503345:exon_150597941_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000354702:exon_150597982_150598284:ENSA;ENSG00000143420:ENST00000503241:exon_150598031_150598284:ENSA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 49 68 117 22.7914784319748 36.3710095229737 -13.5795310909989 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0123258131826453 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 C:G C G 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151266558 T/C 1 53 60 113 24.6520072835646 32.0920672261533 -7.44005994258871 T:C T C 10 0.534867787102555 0.18652905156585 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000529142:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000455060:exon_151266494_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000446339:exon_151266525_151266614:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000489889:exon_151266095_151266614:PI4KB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 264 279 543 122.794904204925 149.228112601613 -26.4332083966874 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0252013012766497 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 85 61 146 39.5362380962828 32.6269350132559 6.90930308302697 A:C A C 10 0.534867787102555 0.280839137967814 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151732700 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 111 95 206 51.6296756316164 50.8124397747427 0.817235856873666 A:G A G 10 0.534867787102555 0.944366051493985 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151823502 C/G 1 23 10 33 10.6980408966412 5.34867787102555 5.34936302561568 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0797982604402267 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 151825991 G/T 1 17 14 31 7.90724761925657 7.48814901943577 0.419098599820795 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196407:ENST00000368817:exon_151825919_151826173:THEM5;ENSG00000196407:ENST00000368818:exon_151825919_151826173:THEM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 C:G G C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 153906724 C/G 1 49 54 103 22.7914784319748 28.882860503538 -6.09138207156316 C:G C G 10 0.534867787102555 0.237136369561583 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153906611_153906778:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153906611_153906778:DENND4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 154186918 G/C 1 10 1 11 4.65132212897445 0.534867787102555 4.1164543418719 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0138388269412908 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 155491338 C/G 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 C:G C G 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155490891_155491409:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155490891_155491409:ASH1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156108491 C/T 1 79 57 136 36.7454448188982 30.4874638648456 6.25798095405252 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.302782026237109 ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156108279_156108548:LMNA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 77 73 150 35.8151803931033 39.0453484584865 -3.23016806538325 T:C C T 10 0.534867787102555 0.623766340701957 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 59 56 115 27.4428005609493 29.9525960777431 -2.50979551679383 A:G A G 10 0.534867787102555 0.641623967984844 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 90 59 149 41.8618991607701 31.5571994390507 10.3046997217193 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.100347575942469 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156236230 A/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156518379 G/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156518373_156518540:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156518373_156518540:IQGAP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156565834 G/C 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 C:G G C 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 21 21 0 11.2322235291537 -11.2322235291537 C:G A C 10 0.534867787102555 1.04497228760256e-07 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 174 159 333 80.9330050441554 85.0439781493062 -4.1109731051508 C:G G C 10 0.534867787102555 0.66062954047334 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 114 93 207 53.0250722703087 49.7427042005376 3.28236806977111 A:G A G 10 0.534867787102555 0.676198712001333 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 69 83 152 32.0941226899237 44.3940263295121 -12.2999036395884 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0507811460900558 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 64 69 133 29.7684616254365 36.9058773100763 -7.13741568463981 A:T T A 10 0.534867787102555 0.224323220632127 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 159175428 C/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C C T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000213088:ENST00000368122:exon_159175251_159176290:DARC;ENSG00000213088:ENST00000359381:exon_159175251_159176288:DARC;ENSG00000213088:ENST00000435307:exon_159175201_159175688:DARC;ENSG00000213088:ENST00000368121:exon_159175049_159176288:DARC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 44 35 79 20.4658173674876 18.7203725485894 1.74544481889816 A:G G A 10 0.534867787102555 0.735871250112176 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G A G 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 29 30 59 13.4888341740259 16.0460336130766 -2.55719943905074 A:G G A 10 0.534867787102555 0.516814870920027 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1937 1547 3484 900.961096382351 827.440466647653 73.5206297346984 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0125403012199192 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 0 45 0 45 20.930949580385 0 20.930949580385 T T 10 0.534867787102555 6.48284054778509e-13 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 47 0 47 21.8612140061799 0 21.8612140061799 C C 10 0.534867787102555 1.81968231208011e-13 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 49 0 49 22.7914784319748 0 22.7914784319748 C C 10 0.534867787102555 5.12638158671001e-14 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 87 79 166 40.4665025220777 42.2545551811018 -1.78805265902412 T:C C T 10 0.534867787102555 0.815594315583142 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 207 191 398 96.2823680697711 102.159747336588 -5.8773792668169 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.580520798398816 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161020997 C/T 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 T:C C T 10 0.534867787102555 0.49300969037024 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161681661 C/G 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 C:G C G 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 125 88 213 58.1415266121806 47.0683652650248 11.0731613471558 A:G A G 10 0.534867787102555 0.131256426822451 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 129 171 300 60.0020554637704 91.4623915945369 -31.4603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000318464721584662 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 161696782 G/C 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161695691_161696783:FCRLB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 127 119 246 59.0717910379755 63.649266665204 -4.57747562722853 A:G G A 10 0.534867787102555 0.565714727579894 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 39 36 75 18.1401563030004 19.255240335692 -1.11508403269162 T:C C T 10 0.534867787102555 0.817697728651345 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 47 54 101 21.8612140061799 28.882860503538 -7.02164649735806 T:C T C 10 0.534867787102555 0.164060393641324 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 18 28 46 8.37237983215401 14.9762980388715 -6.60391820671753 A:T:G T G 10 0.534867787102555 0.0552189058412865 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 39 41 80 18.1401563030004 21.9295792712048 -3.7894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.433293003468059 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 54 57 111 25.117139496462 30.4874638648456 -5.37032436838361 A:G G A 10 0.534867787102555 0.341490584800421 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 23 33 56 10.6980408966412 17.6506369743843 -6.95259607774308 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0806904855349211 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 139 118 257 64.6533775927449 63.1143988781015 1.53897871464337 T:C C T 10 0.534867787102555 0.851523528354045 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 173907812 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000135870:ENST00000367696:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000258349:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000367694:exon_173907549_173908012:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000479099:exon_173907714_173908009:RC3H1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 173950092 G/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G G C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000135870:ENST00000367696:exon_173949947_173950147:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000258349:exon_173949947_173950147:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000367694:exon_173949947_173950147:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000484867:exon_173950087_173950147:RC3H1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 179012947 C/G 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 C:G C G 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000116199:ENST00000440702:exon_179012850_179013359:FAM20B;ENSG00000116199:ENST00000263733:exon_179012850_179013359:FAM20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 179054692 T/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:G T G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 179055020 C/T 1 87 75 162 40.4665025220777 40.1150840326916 0.351418489386091 T:C:G C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000495145:exon_179054933_179055028:TOR3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 22 21 43 10.2329086837438 11.2322235291537 -0.999314845409865 T:C C T 10 0.534867787102555 0.762536331661582 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 179887125 G/A 1 24 33 57 11.1631731095387 17.6506369743843 -6.48746386484564 A:G G A 10 0.534867787102555 0.110270776425333 ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179886587_179890583:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179887082_179887374:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179886587_179889211:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179886587_179888412:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179886587_179887533:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000447964:exon_179886587_179887306:TOR1AIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 180159686 G/A 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:G G A 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 180905352 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135835:ENST00000367588:exon_180904251_180905806:KIAA1614;ENSG00000135835:ENST00000367587:exon_180904251_180905806:KIAA1614 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 40 30 70 18.6052885158978 16.0460336130766 2.55925490282115 A:G A G 10 0.534867787102555 0.551955007965208 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 182354850 A/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182354834_182355022:GLUL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 32 69 101 14.8842308127182 36.9058773100763 -22.0216464973581 A:G A G 10 0.534867787102555 1.34397778039938e-05 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 182571277 C/T 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.15772121036402 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 184663537 A/C 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:C A C 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 T:C T C 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 184675814 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184675777_184675942:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184675777_184675942:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184675777_184675942:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000466392:exon_184675777_184675942:EDEM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 184677464 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184677287_184677478:EDEM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 21 28 49 9.76777647084634 14.9762980388715 -5.2085215680252 T:C T C 10 0.534867787102555 0.152708336996737 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 186289511 C/T 1 72 71 143 33.489519328616 37.9756128842814 -4.48609355566536 T:C C T 10 0.534867787102555 0.452181347325836 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186289444_186289550:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186289444_186289550:TPR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 186363119 C/G 0 11 0 11 5.1164543418719 0 5.1164543418719 C C 10 0.534867787102555 0.00124543481256921 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186363079_186363147:C1orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 198201732 A/C 1 32 32 64 14.8842308127182 17.1157691872818 -2.23153837456352 A:C A C 10 0.534867787102555 0.617172870341794 ENSG00000151414:ENST00000367385:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000442588:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000391974:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000367383:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000417895:exon_198201683_198201767:NEK7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 200635418 G/A 1 43 51 94 20.0006851545901 27.2782571422303 -7.27757198764017 A:G G A 10 0.534867787102555 0.147741254122426 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 200945910 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200945904_200946021:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200945904_200946021:KIF21B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 200959305 G/A 1 18 15 33 8.37237983215401 8.02301680653832 0.349363025615686 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200959266_200959460:KIF21B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 200971353 A/G 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200971289_200971478:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200971289_200971478:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200971289_200971478:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200971289_200971478:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000534043:exon_200970535_200972909:KIF21B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201355522 T/C 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201355943 C/T 1 5 25 30 2.32566106448723 13.3716946775639 -11.0460336130767 T:C C T 10 0.534867787102555 5.76323407603511e-05 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 30 21 51 13.9539663869233 11.2322235291537 2.72174285776969 A:T A T 10 0.534867787102555 0.484759623037288 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201844057 T/C 1 25 29 54 11.6283053224361 15.5111658259741 -3.88286050353797 T:C T C 10 0.534867787102555 0.339846679833752 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843960_201844064:IPO9;ENSG00000198700:ENST00000456707:exon_201843960_201844064:IPO9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 78 83 161 36.2803126060007 44.3940263295121 -8.11371372351135 A:G G A 10 0.534867787102555 0.206840642131488 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 75 55 130 34.8849159673084 29.4177282906405 5.46718767666785 A:G G A 10 0.534867787102555 0.379385094185831 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 23 35 58 10.6980408966412 18.7203725485894 -8.02233165194819 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0358462407179839 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 202715284 G/A 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 A:G G A 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000498276:exon_202715270_202715723:KDM5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 39 33 72 18.1401563030004 17.6506369743843 0.489519328616041 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 204418364 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204418313_204418424:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000479079:exon_204418304_204418424:PIK3C2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 204438334 C/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 204438643 G/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:G G T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000415899:exon_204438538_204439014:PIK3C2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 205180474 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000133059:ENST00000419742:exon_205180399_205180727:DSTYK;ENSG00000133059:ENST00000367160:exon_205180399_205180727:DSTYK;ENSG00000133059:ENST00000367161:exon_205180399_205180694:DSTYK;ENSG00000133059:ENST00000367162:exon_205180399_205180694:DSTYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 36 36 72 16.744759664308 19.255240335692 -2.51048067138396 T:C C T 10 0.534867787102555 0.557323579245275 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 82 88 170 38.1408414575905 47.0683652650248 -8.92752380743435 A:C C A 10 0.534867787102555 0.191063806878596 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206769047 T/C 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C T C 10 0.534867787102555 0.384697735469175 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206772753 A/G 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.560897834646131 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206858790 G/C 1 40 26 66 18.6052885158978 13.9065624646664 4.69872605123137 C:G G C 10 0.534867787102555 0.268136434325524 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206858289_206858853:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206858382_206858853:MAPKAPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 206904464 C/T 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 T:C C T 10 0.534867787102555 0.782378955473899 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 15 28 43 6.97698319346167 14.9762980388715 -7.99931484540987 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0207298565669656 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 76 74 150 35.3500481802058 39.5802162455891 -4.23016806538325 C:G C G 10 0.534867787102555 0.513057017709996 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 211533352 A/G 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 A:G A G 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000082512:ENST00000462410:exon_211529709_211534121:TRAF5;ENSG00000082512:ENST00000336184:exon_211533254_211533418:TRAF5;ENSG00000082512:ENST00000488428:exon_211533224_211533418:TRAF5;ENSG00000082512:ENST00000427925:exon_211533221_211533418:TRAF5;ENSG00000082512:ENST00000261464:exon_211533254_211533418:TRAF5;ENSG00000082512:ENST00000367004:exon_211533254_211533418:TRAF5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 14 10 24 6.51185098056423 5.34867787102555 1.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 0.686611403599214 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 147 123 270 68.3744352959244 65.7887378136143 2.58569748231015 T:C T C 10 0.534867787102555 0.760751248038987 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 212965293 C/T 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212965170_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212965170_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000530441:exon_212965193_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212965212_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212965226_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366973:exon_212965226_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526997:exon_212965248_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000533650:exon_212965253_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000532433:exon_212965263_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000488246:exon_212965266_212965329:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212965268_212965329:TATDN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 213302951 A/G 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 A:G A G 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213302870_213303232:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213302870_213303232:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213302870_213303232:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000468069:exon_213302870_213303232:RPS6KC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 213414543 A/G 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 8 17 25 3.72105770317956 9.09275238074344 -5.37169467756388 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0430852827113196 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 12 23 35 5.58158655476934 12.3019591033588 -6.72037254858943 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0269677756264726 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214815632 C/T 1 25 19 44 11.6283053224361 10.1624879549485 1.46581736748758 T:C C T 10 0.534867787102555 0.762914460310603 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214816606 G/A 1 12 23 35 5.58158655476934 12.3019591033588 -6.72037254858943 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0269677756264726 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 62 35 97 28.8381971996416 18.7203725485894 10.1178246510522 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0418040215104482 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 23 23 46 10.6980408966412 12.3019591033588 -1.60391820671753 A:G G A 10 0.534867787102555 0.659763248539263 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 31 33 64 14.4190985998208 17.6506369743843 -3.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.453220740694877 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 46 47 93 21.3960817932825 25.1387859938201 -3.74270420053762 C:G C G 10 0.534867787102555 0.46752056761496 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 A:G G A 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 218504382 T/A 1 52 38 90 24.1868750706671 20.3249759098971 3.86189916077005 A:T T A 10 0.534867787102555 0.459966922798015 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218504290_218511325:RRP15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 36 31 67 16.744759664308 16.5809014001792 0.163858264128816 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 72 100 172 33.489519328616 53.4867787102555 -19.9972593816395 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00276730109539404 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 23 29 52 10.6980408966412 15.5111658259741 -4.81312492933286 C:G C G 10 0.534867787102555 0.210981106652534 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 223933079 C/T 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 223980207 G/C 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 C:G G C 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223980091_223980224:TP53BP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 223989966 C/T 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000489310:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000490896:exon_223989818_223990359:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000481128:exon_223989641_223990046:TP53BP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 25 21 46 11.6283053224361 11.2322235291537 0.39608179328247 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226034774 C/T 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226041438 C/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226041330_226041492:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226046974 T/C 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 T:C T C 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226049909 T/C 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000196187:ENST00000474478:exon_226047363_226050051:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226054333 G/A 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226054274_226054382:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226055595 G/A 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226055588_226055730:TMEM63A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 13 24 37 6.04671876766678 12.8368268904613 -6.79010812279454 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0312244811871369 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 115 127 242 53.4902044832062 67.9282089620245 -14.4380044788183 A:G A G 10 0.534867787102555 0.070971203442061 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 188 182 370 87.4448560247197 97.345937252665 -9.90108122794535 T:C T C 10 0.534867787102555 0.322104273682264 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 196 168 364 91.1659137278992 89.8577882332292 1.30812549466998 A:G A G 10 0.534867787102555 0.91635109302817 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 127 130 257 59.0717910379755 69.5328123233322 -10.4610212853566 A:G G A 10 0.534867787102555 0.210991839068234 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 97 88 185 45.1178246510522 47.0683652650248 -1.95054061397267 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.82508575667063 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 31 21 52 14.4190985998208 11.2322235291537 3.18687507066714 A:G G A 10 0.534867787102555 0.406555699258052 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226923342 C/T 1 40 31 71 18.6052885158978 16.5809014001792 2.0243871157186 T:C C T 10 0.534867787102555 0.721438646331854 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 20 30 50 9.3026442579489 16.0460336130766 -6.74338935512775 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0649812387906103 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227071525 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227071406_227071620:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227071406_227071620:PSEN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 23 23 46 10.6980408966412 12.3019591033588 -1.60391820671753 T:C T C 10 0.534867787102555 0.659763248539263 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 3 47 50 1.39539663869233 25.1387859938201 -23.7433893551277 T:C T C 10 0.534867787102555 7.78989351702166e-13 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227216775 C/T 1 2 28 30 0.93026442579489 14.9762980388715 -14.0460336130767 T:C C T 10 0.534867787102555 7.20693317700205e-08 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 71 69 140 33.0243871157186 36.9058773100763 -3.8814901943577 T:G T G 10 0.534867787102555 0.553340783932063 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 45 38 83 20.930949580385 20.3249759098971 0.605973670487934 A:C A C 10 0.534867787102555 0.912854685242112 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 30 43 73 13.9539663869233 22.9993148454099 -9.04534845848652 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0350867699002819 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 25 20 45 11.6283053224361 10.6973557420511 0.930949580385025 A:G G A 10 0.534867787102555 0.881482718229074 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 26 21 47 12.0934375353336 11.2322235291537 0.861214006179914 A:G A G 10 0.534867787102555 0.884096235186603 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 22 10 32 10.2329086837438 5.34867787102555 4.88423081271824 A:T T A 10 0.534867787102555 0.109614610186624 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 26 31 57 12.0934375353336 16.5809014001792 -4.48746386484564 A:G A G 10 0.534867787102555 0.235803914080419 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 55 8 63 25.5822717093595 4.27894229682044 21.303329412539 T:C C T 10 0.534867787102555 1.53939051519642e-08 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 73 4 77 33.9546515415135 2.13947114841022 31.8151803931033 A:G G A 10 0.534867787102555 1.15647021765856e-15 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 82 7 89 38.1408414575905 3.74407450971789 34.3967669478726 T:C C T 10 0.534867787102555 2.36711030672673e-15 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 83 19 102 38.6059736704879 10.1624879549485 28.4434857155394 A:G G A 10 0.534867787102555 6.00339087687785e-09 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 43 57 100 20.0006851545901 30.4874638648456 -10.4867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0444296843802853 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234569192 T/C 1 21 8 29 9.76777647084634 4.27894229682044 5.4888341740259 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0422202715762133 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234569156_234569317:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 12 18 30 5.58158655476934 9.62762016784599 -4.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.147172704883020 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 5 31 36 2.32566106448723 16.5809014001792 -14.255240335692 T:C T C 10 0.534867787102555 1.79861670238866e-06 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 21 14 35 9.76777647084634 7.48814901943577 2.27962745141057 A:G A G 10 0.534867787102555 0.500016160638516 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 236175339 T/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 A:T T A 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 237058729 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:G G A 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 A:G A G 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 13 16 29 6.04671876766678 8.55788459364088 -2.5111658259741 T:C C T 10 0.534867787102555 0.359273405953985 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 16 14 30 7.44211540635912 7.48814901943577 -0.0460336130766503 A:T T A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 245847622 C/T 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245847535_245847697:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245847535_245847697:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245847535_245847697:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245847535_245847697:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245847535_245847697:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245847535_245847697:KIF26B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 245849742 G/A 1 19 12 31 8.83751204505145 6.41841344523066 2.41909859982079 A:G G A 10 0.534867787102555 0.472368301269853 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 51 53 104 23.7217428577697 28.3479927164354 -4.62624985866572 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.377522568828948 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 1041890 G/A 1 130 58 188 60.4671876766678 31.0223316519482 29.4448560247197 A:G G A 10 0.534867787102555 1.41156395470896e-05 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1041869_1041972:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000360059:exon_1041869_1041972:GTPBP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 62 74 136 28.8381971996416 39.5802162455891 -10.7420190459475 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0709424055124738 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 1230968 C/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000185736:ENST00000381312:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381310:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381307:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000414764:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000474762:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000490172:exon_1230801_1230979:ADARB2;ENSG00000185736:ENST00000381305:exon_1230801_1230979:ADARB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 1779349 G/A 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000185736:ENST00000381312:exon_1779245_1779670:ADARB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 78 79 157 36.2803126060007 42.2545551811018 -5.97424257510113 T:C C T 10 0.534867787102555 0.378892449797303 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 71 61 132 33.0243871157186 32.6269350132559 0.397452102462744 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3190265 A/G 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189764_3191591:PITRM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 44 46 90 20.4658173674876 24.6039182067175 -4.13810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.399225377788537 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 49 45 94 22.7914784319748 24.069050419615 -1.27757198764017 T:C T C 10 0.534867787102555 0.836432958535203 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 A:G A G 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5498223 T/C 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000484741:exon_5498050_5498493:NET1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5498693 A/G 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 A:G A G 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5498752 C/T 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5784151 A/G 1 17 33 50 7.90724761925657 17.6506369743843 -9.74338935512775 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00667887167376196 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5784060_5784489:C10orf18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5799613 A/G 1 21 11 32 9.76777647084634 5.8835456581281 3.88423081271824 A:G A G 10 0.534867787102555 0.214684384919347 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5799483_5799636:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5799483_5799636:C10orf18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 319 225 544 148.377175914285 120.345252098075 28.0319238162101 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0160870296785508 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 5978442 G/A 1 39 41 80 18.1401563030004 21.9295792712048 -3.7894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.433293003468059 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5978419_5978550:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5978419_5978550:FBXO18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 T:C C T 10 0.534867787102555 0.560897834646131 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 A:G A G 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 78 55 133 36.2803126060007 29.4177282906405 6.86258431536019 A:G G A 10 0.534867787102555 0.258570351442701 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 19 29 48 8.83751204505145 15.5111658259741 -6.67365378092264 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0600217724249818 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 C:G C G 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 137 155 292 63.72311316695 82.904507000896 -19.1813938339461 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0257494021357871 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 C:G C G 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 66 66 132 30.6987260512314 35.3012739487686 -4.60254789753726 A:T T A 10 0.534867787102555 0.433362675969804 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 13217560 C/G 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13217510_13217681:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13217510_13217681:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13217510_13217681:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13217510_13217681:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13217510_13217681:MCM10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 13239651 A/G 1 13 5 18 6.04671876766678 2.67433893551277 3.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 0.155287650432156 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000481292:exon_13239623_13239767:MCM10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 26 25 51 12.0934375353336 13.3716946775639 -1.27825714223031 A:G A G 10 0.534867787102555 0.779531003528971 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 15326043 G/A 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000148468:ENST00000378116:exon_15325877_15326104:FAM171A1;ENSG00000148468:ENST00000378114:exon_15325877_15326104:FAM171A1;ENSG00000148468:ENST00000396781:exon_15325877_15326104:FAM171A1;ENSG00000148468:ENST00000455654:exon_15325877_15326104:FAM171A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 27 27 54 12.558569748231 14.441430251769 -1.88286050353797 A:C C A 10 0.534867787102555 0.682826750210596 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 47 50 97 21.8612140061799 26.7433893551277 -4.88217534894784 T:C T C 10 0.534867787102555 0.359792977746012 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 23 28 51 10.6980408966412 14.9762980388715 -4.27825714223031 A:G G A 10 0.534867787102555 0.262010186623264 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 31134214 A/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31133710_31134502:ZNF438 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 31138817 G/A 1 9 1 10 4.18618991607701 0.534867787102555 3.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0245053429743222 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 32128611 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32128565_32128639:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32128565_32128639:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32128565_32128639:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32128565_32128639:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32128565_32128639:ARHGAP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 32141460 T/C 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32141445_32141525:ARHGAP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 34630570 C/T 1 23 15 38 10.6980408966412 8.02301680653832 2.67502409010291 T:C C T 10 0.534867787102555 0.419562302737224 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34630555_34630744:PARD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 40 35 75 18.6052885158978 18.7203725485894 -0.115084032691623 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 38241628 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000175395:ENST00000302609:exon_38238500_38242123:ZNF25;ENSG00000175395:ENST00000374633:exon_38239495_38242123:ZNF25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 34 12 46 15.8144952385131 6.41841344523066 9.39608179328247 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0071179015296156 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 36 23 59 16.744759664308 12.3019591033588 4.44280056094926 A:G G A 10 0.534867787102555 0.296502830661604 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 53 47 100 24.6520072835646 25.1387859938201 -0.4867787102555 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.920578319048615 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 32 38 70 14.8842308127182 20.3249759098971 -5.44074509717885 T:C C T 10 0.534867787102555 0.230635574252507 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43882024 C/T 1 692 544 1236 321.871491325032 290.96807618379 30.903415141242 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0819409578379565 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 189 190 379 87.9099882376171 101.624879549485 -13.7148913118684 A:T T A 10 0.534867787102555 0.164521057220046 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 37 20 57 17.2098918772055 10.6973557420511 6.51253613515436 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0860443892936678 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 45924023 G/A 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117636617366408 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 19 12 31 8.83751204505145 6.41841344523066 2.41909859982079 A:G A G 10 0.534867787102555 0.472368301269853 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 19 28 47 8.83751204505145 14.9762980388715 -6.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.079888364178759 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 59956041 C/T 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151151:ENST00000373935:exon_59951278_59956459:IPMK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 23 12 35 10.6980408966412 6.41841344523066 4.27962745141057 T:G G T 10 0.534867787102555 0.175746877249596 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 61665886 C/A 1 32 38 70 14.8842308127182 20.3249759098971 -5.44074509717885 A:C C A 10 0.534867787102555 0.230635574252507 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61665880_61666414:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61665880_61666818:CCDC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 64573312 T/G 1 31 16 47 14.4190985998208 8.55788459364088 5.86121400617992 T:G T G 10 0.534867787102555 0.107045790037668 ENSG00000122877:ENST00000242480:exon_64571756_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000439032:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000437594:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000411732:exon_64571763_64574228:EGR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 14 21 35 6.51185098056423 11.2322235291537 -4.72037254858943 A:G G A 10 0.534867787102555 0.127664441951459 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 16 19 35 7.44211540635912 10.1624879549485 -2.72037254858943 A:T A T 10 0.534867787102555 0.398922124839835 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 65225450 C/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_65225255_65225641:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_65225255_65225722:JMJD1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 A:G G A 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 70105560 G/A 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G G A 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000204130:ENST00000466493:exon_70105459_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000466187:exon_70103183_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000388768:exon_70103266_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000265865:exon_70104902_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000473398:exon_70105490_70105668:RUFY2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 70225504 G/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138346:ENST00000399180:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000399179:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000358410:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000445821:exon_70225424_70225569:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000433594:exon_70225424_70225569:DNA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 70227964 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138346:ENST00000399180:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000399179:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000358410:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000445821:exon_70227880_70228063:DNA2;ENSG00000138346:ENST00000433594:exon_70227880_70228063:DNA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 1003 1021 2024 466.527609536137 546.100010631709 -79.5724010955713 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000427967738251393 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 70940191 C/T 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 T:C C T 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70939988_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000395093:exon_70939993_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000471069:exon_70940006_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000483572:exon_70940037_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000422378:exon_70940044_70940318:SUPV3L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 87 74 161 40.4665025220777 39.5802162455891 0.886286276488647 A:G G A 10 0.534867787102555 0.937079166626282 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 60 45 105 27.9079327738467 24.069050419615 3.83888235423172 A:G G A 10 0.534867787102555 0.493951257687822 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 27 22 49 12.558569748231 11.7670913162562 0.791478431974806 T:C C T 10 0.534867787102555 0.886588645557311 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 73 81 154 33.9546515415135 43.324290755307 -9.36963921379347 T:C C T 10 0.534867787102555 0.145768043924598 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 T:C T C 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 49 62 111 22.7914784319748 33.1618028003584 -10.3703243683836 T:C C T 10 0.534867787102555 0.056634979540779 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 72289701 G/A 1 18 4 22 8.37237983215401 2.13947114841022 6.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00898889974610294 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72289645_72289824:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72289645_72289824:KIAA1274 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 72307101 C/T 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72307062_72307202:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72307062_72307202:KIAA1274 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 72631626 C/T 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166224:ENST00000373202:exon_72631594_72631743:SGPL1;ENSG00000166224:ENST00000496362:exon_72631594_72631743:SGPL1;ENSG00000166224:ENST00000509904:exon_72631594_72631743:SGPL1;ENSG00000166224:ENST00000519206:exon_72631594_72631743:SGPL1;ENSG00000166224:ENST00000532174:exon_72631594_72631743:SGPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 101 64 165 46.9783535026419 34.2315383745635 12.7468151280784 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0508921317723391 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 7 14 21 3.25592549028211 7.48814901943577 -4.23222352915366 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0796989148436305 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 73577267 G/A 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:G G A 10 0.534867787102555 0.615387176330244 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 73972957 C/T 1 25 26 51 11.6283053224361 13.9065624646664 -2.27825714223031 T:C C T 10 0.534867787102555 0.575443123850368 ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000531048:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530461:exon_73972945_73973035:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000527593:exon_73972945_73973109:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000524829:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000532011:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000526751:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000492502:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000533958:exon_73972945_73973089:ASCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75519322 T/C 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.437699564928111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75525999 A/G 1 6 14 20 2.79079327738467 7.48814901943577 -4.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0430157611232849 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 54 44 98 25.117139496462 23.5341826325124 1.58295686394961 A:G G A 10 0.534867787102555 0.762425845442712 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 58 97 155 26.9776683480518 51.8821753489478 -24.904507000896 A:C C A 10 0.534867787102555 7.05677518396526e-05 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75562383 T/A 1 27 36 63 12.558569748231 19.255240335692 -6.69667058746096 A:T T A 10 0.534867787102555 0.100825671164107 ENSG00000166507:ENST00000429742:exon_75562354_75562534:NDST2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75562843 A/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75632760 C/T 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000148660:ENST00000322635:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000351293:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000322680:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000423381:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394762:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394763:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000372765:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000305762:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000472912:exon_75632747_75632841:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000444854:exon_75632747_75632841:CAMK2G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 23 14 37 10.6980408966412 7.48814901943577 3.20989187720546 T:C C T 10 0.534867787102555 0.325376528826404 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 79793652 T/G 1 3673 4300 7973 1708.43061797232 2299.93148454099 -591.500866568671 A:T:G T G 10 0.534867787102555 4.55858102253768e-40 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79793518_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79793518_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79793602_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000478655:exon_79793621_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79793623_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79793623_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000464716:exon_79793632_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000476545:exon_79793636_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79793641_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000466129:exon_79793644_79793662:RPS24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 79795434 C/T 1 4258 3230 7488 1980.53296251732 1727.62295234125 252.910010176068 A:T:C C T 10 0.534867787102555 4.52273835136606e-09 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000478655:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000464716:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000476545:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000466129:exon_79795269_79795844:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000482069:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000465692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000467106:exon_79795269_79795448:RPS24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 81917708 A/G 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122359:ENST00000475974:exon_81917602_81917781:ANXA11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 28 30 58 13.0237019611285 16.0460336130766 -3.02233165194819 T:C C T 10 0.534867787102555 0.433122346217458 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 88930392 C/T 1 26 23 49 12.0934375353336 12.3019591033588 -0.208521568025196 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 18 12 30 8.37237983215401 6.41841344523066 1.95396638692335 C:G C G 10 0.534867787102555 0.583877163454243 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 90681048 C/T 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 T:C C T 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000138134:ENST00000371926:exon_90681040_90681152:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371927:exon_90681040_90681152:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371924:exon_90681040_90681152:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371922:exon_90681040_90681152:STAMBPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 90774035 G/A 1 145 142 287 67.4441708701295 75.9512257685628 -8.50705489843328 A:G G A 10 0.534867787102555 0.315193391253882 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90773876_90775541:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90773876_90775542:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90773857_90774712:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90773876_90774376:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90773876_90774207:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90773876_90774341:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90773876_90774341:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90773876_90774207:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90773876_90774207:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90773876_90774207:FAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91007339 C/T 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 24 25 49 11.1631731095387 13.3716946775639 -2.2085215680252 A:T T A 10 0.534867787102555 0.568276069584453 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91162182 C/T 1 32 8 40 14.8842308127182 4.27894229682044 10.6052885158978 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000697743170318801 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 38 24 62 17.6750240901029 12.8368268904613 4.83819719964159 T:C C T 10 0.534867787102555 0.252186473216053 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91404448 C/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 C:G C G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000152782:ENST00000307534:exon_91404357_91405215:PANK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 A:G A G 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 19 18 37 8.83751204505145 9.62762016784599 -0.790108122794535 A:T T A 10 0.534867787102555 0.869601768514842 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 A:G A G 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 20 17 37 9.3026442579489 9.09275238074344 0.209891877205465 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G A G 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 A:G G A 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 94225548 G/T 0 10 0 10 4.65132212897445 0 4.65132212897445 G G 10 0.534867787102555 0.00239028864245299 ENSG00000119912:ENST00000265986:exon_94225433_94225600:IDE;ENSG00000119912:ENST00000371581:exon_94225433_94225600:IDE;ENSG00000119912:ENST00000496903:exon_94225433_94225600:IDE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 94397295 A/T 1 29 26 55 13.4888341740259 13.9065624646664 -0.417728290640525 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138160:ENST00000260731:exon_94397144_94397302:KIF11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 41 39 80 19.0704207287952 20.8598436969996 -1.7894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 0.737129382138969 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 95441345 T/C 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95441237_95441355:FRA10AC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 135 93 228 62.7928487411551 49.7427042005376 13.0501445406175 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0846580594798217 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 A:C C A 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 98469693 C/T 1 18 22 40 8.37237983215401 11.7670913162562 -3.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.341868431890952 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 98742605 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99006083 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000213390:ENST00000358531:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000492211:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000487035:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000371027:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000479633:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000316676:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000358308:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000355366:exon_99006029_99006094:ARHGAP19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 43 40 83 20.0006851545901 21.3947114841022 -1.39402632951207 T:C C T 10 0.534867787102555 0.826005417472682 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 39 33 72 18.1401563030004 17.6506369743843 0.489519328616041 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 45 42 87 20.930949580385 22.4644470583073 -1.53349747792229 A:G G A 10 0.534867787102555 0.748390116494607 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G A G 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 38 29 67 17.6750240901029 15.5111658259741 2.16385826412881 A:G G A 10 0.534867787102555 0.625950975924369 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 17 16 33 7.90724761925657 8.55788459364088 -0.650636974384315 T:C C T 10 0.534867787102555 0.862618803515972 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99498234 G/A 1 27 21 48 12.558569748231 11.2322235291537 1.32634621907736 A:G G A 10 0.534867787102555 0.773042008197412 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99498234_99498406:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000462887:exon_99498234_99498602:ZFYVE27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 13 17 30 6.04671876766678 9.09275238074344 -3.04603361307665 T:G G T 10 0.534867787102555 0.277867988592941 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99510068 G/T 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:G G T 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000155256:ENST00000481956:exon_99509790_99510227:ZFYVE27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99516955 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 63 87 150 29.303329412539 46.5334974779223 -17.2301680653832 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00527872075595992 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 101639845 G/A 1 44 36 80 20.4658173674876 19.255240335692 1.2105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.823265987771767 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 32 34 66 14.8842308127182 18.1855047614869 -3.30127394876863 T:C C T 10 0.534867787102555 0.459735548935202 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 95 82 177 44.1875602252573 43.8591585424095 0.328401682847762 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 91 96 187 42.3270313736675 51.3473075618453 -9.02027618817779 A:C A C 10 0.534867787102555 0.187876099500555 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102247408 C/A 1 22 10 32 10.2329086837438 5.34867787102555 4.88423081271824 A:C C A 10 0.534867787102555 0.109614610186624 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102247526 G/C 1 17 6 23 7.90724761925657 3.20920672261533 4.69804089664123 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0595173238243252 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 204 113 317 94.8869714310788 60.4400599425887 34.4469114884901 T:C C T 10 0.534867787102555 9.80518922709128e-05 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102746940 G/T 1 140 87 227 65.1185098056423 46.5334974779223 18.58501232772 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.0137681134776403 ENSG00000055950:ENST00000523148:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318325:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370241:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370242:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000476012:exon_102746847_102747027:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000448244:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000299179:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000342071:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746847_102747043:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000370234:exon_102746847_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746847_102746953:MRPL43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102750621 C/T 1 18 7 25 8.37237983215401 3.74407450971789 4.62830532243613 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0721485889991503 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102750623 T/C 1 18 7 25 8.37237983215401 3.74407450971789 4.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0721485889991503 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 18 6 24 8.37237983215401 3.20920672261533 5.16317310953868 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0402244391024662 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 28 34 62 13.0237019611285 18.1855047614869 -5.16180280035841 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204117030105369 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 103558746 G/C 1 163 154 317 75.8165507022835 82.3696392137935 -6.55308851150994 C:G G C 10 0.534867787102555 0.464755563350535 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 103899871 A/G 1 63 57 120 29.303329412539 30.4874638648456 -1.1841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.855067084171865 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104157711 T/G 1 24 18 42 11.1631731095387 9.62762016784599 1.53555294169269 T:G T G 10 0.534867787102555 0.647000211541768 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104210735 C/A 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120055:ENST00000239125:exon_104209594_104210904:C10orf95 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 50 41 91 23.2566106448723 21.9295792712048 1.3270313736675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.833833827468788 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 35 19 54 16.2796274514106 10.1624879549485 6.11713949646203 T:C T C 10 0.534867787102555 0.102652124946657 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 35 22 57 16.2796274514106 11.7670913162562 4.51253613515437 T:G G T 10 0.534867787102555 0.288049673425525 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104678579 G/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:G G T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000148842:ENST00000457502:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000433628:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369875:exon_104678074_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369878:exon_104678114_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000345419:exon_104678114_104679858:CNNM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 57 69 126 26.5125361351544 36.9058773100763 -10.3933411749219 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0737136614552479 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105200591 C/T 1 94 83 177 43.7224280123598 44.3940263295121 -0.671598317152238 T:C C T 10 0.534867787102555 0.940023901828838 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105200491_105200607:PDCD11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105344756 T/C 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 ENSG00000107954:ENST00000369780:exon_105344293_105344982:NEURL;ENSG00000107954:ENST00000369777:exon_105344293_105344982:NEURL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 A:G G A 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105372696 G/A 1 10 2 12 4.65132212897445 1.06973557420511 3.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0440991500426111 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 21 27 48 9.76777647084634 14.441430251769 -4.67365378092264 C:G C G 10 0.534867787102555 0.194104446780439 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105758670 A/G 1 15 25 40 6.97698319346167 13.3716946775639 -6.3947114841022 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0559407918230403 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 49 44 93 22.7914784319748 23.5341826325124 -0.742704200537613 A:G G A 10 0.534867787102555 0.917370614251377 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 36 28 64 16.744759664308 14.9762980388715 1.76846162543648 T:C C T 10 0.534867787102555 0.707903216552952 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 103 62 165 47.9086179284368 33.1618028003584 14.7468151280784 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0234206039321582 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 115457264 T/G 1 11 19 30 5.1164543418719 10.1624879549485 -5.04603361307665 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0692968054620869 ENSG00000165806:ENST00000429617:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369319:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369316:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115457184_115457362:CASP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 115668149 A/G 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 A:G A G 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000196865:ENST00000369301:exon_115668039_115676953:NHLRC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 115805056 G/C 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000043591:ENST00000369295:exon_115803806_115806667:ADRB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 119029744 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 T:C T C 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 119768551 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000107560:ENST00000355624:exon_119764427_119768736:RAB11FIP2;ENSG00000107560:ENST00000369199:exon_119764429_119768736:RAB11FIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 120914646 T/C 1 12 24 36 5.58158655476934 12.8368268904613 -7.25524033569198 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.0185584785892965 ENSG00000183605:ENST00000490417:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120914574_120914689:SFXN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 22 20 42 10.2329086837438 10.6973557420511 -0.464447058307309 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 31 35 66 14.4190985998208 18.7203725485894 -4.30127394876863 A:G G A 10 0.534867787102555 0.324039306866122 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 29 26 55 13.4888341740259 13.9065624646664 -0.417728290640525 T:C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 C:G G C 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 126517989 G/A 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126517962_126518046:FAM175B;ENSG00000165660:ENST00000486933:exon_126517962_126518046:FAM175B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 126655336 A/G 1 19 19 38 8.83751204505145 10.1624879549485 -1.32497590989709 A:G A G 10 0.534867787102555 0.745749296337914 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126655163_126655350:ZRANB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 21 21 42 9.76777647084634 11.2322235291537 -1.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.757476853822526 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 169 145 314 78.6073439796682 77.5558291298705 1.05151484979773 T:C C T 10 0.534867787102555 0.910074799359226 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 93 103 196 43.2572957994624 55.0913820715632 -11.8340862721008 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0994266299382703 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129901570 C/T 1 131 126 257 60.9323198895653 67.3933411749219 -6.46102128535664 T:C C T 10 0.534867787102555 0.453096288706483 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129903094 G/T 1 130 174 304 60.4671876766678 93.0669949558446 -32.5998072791767 T:G G T 10 0.534867787102555 0.000222044867324325 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129904474 G/A 1 105 76 181 48.8388823542317 40.6499518197942 8.18893053443754 A:G G A 10 0.534867787102555 0.233662298075526 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 103 71 174 47.9086179284368 37.9756128842814 9.93300504415543 T:C C T 10 0.534867787102555 0.148579402659128 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 99 89 188 46.0480890768471 47.6032330521274 -1.55514397528034 A:G G A 10 0.534867787102555 0.826769304990167 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 40 24 64 18.6052885158978 12.8368268904613 5.76846162543648 T:G T G 10 0.534867787102555 0.168388306214825 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 T:C T C 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 129921195 A/T 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:T A T 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129921145_129921260:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129921145_129921260:MKI67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 42 79 121 19.5355529416927 42.2545551811018 -22.7190022394092 T:C T C 10 0.534867787102555 3.569036238497e-05 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 0 18 0 18 8.37237983215401 0 8.37237983215401 A A 10 0.534867787102555 1.38746110552337e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 17 2 19 7.90724761925657 1.06973557420511 6.83751204505146 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0018400874483353 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 20 6 26 9.3026442579489 3.20920672261533 6.09343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0178401481494886 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 32 19 51 14.8842308127182 10.1624879549485 4.72174285776969 T:G G T 10 0.534867787102555 0.207582774882467 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 134459388 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368595:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000451873:exon_134459372_134459472:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134459372_134459472:INPP5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 0 0 146 146 0 78.090696916973 -78.090696916973 T C T 10 0.534867787102555 2.92520963197946e-49 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 46 139 185 21.3960817932825 74.3466224072551 -52.9505406139727 A:G A G 10 0.534867787102555 3.12791322852816e-15 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 40 109 149 18.6052885158978 58.3005887941785 -39.6953002782807 T:C T C 10 0.534867787102555 5.44725731017635e-11 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 40 92 132 18.6052885158978 49.2078364134351 -30.6025478975373 A:G G A 10 0.534867787102555 1.00092639133918e-07 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 294119 C/T 1 134 379 513 62.3277165282576 202.714891311868 -140.387174783611 T:C C T 10 0.534867787102555 2.63370727719211e-36 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 294375 C/T 1 97 247 344 45.1178246510522 132.112343414331 -86.9945187632789 T:C C T 10 0.534867787102555 3.34208955322964e-21 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294267_294478:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294321_294478:ATHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 56 61 117 26.0474039222569 32.6269350132559 -6.57953109099893 A:G A G 10 0.534867787102555 0.229424939804121 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 267 479 746 124.190300843618 256.201670022124 -132.011369178506 A:G A G 10 0.534867787102555 3.62370960928572e-22 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.317451841975924 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 490484 A/G 1 16 24 40 7.44211540635912 12.8368268904613 -5.3947114841022 A:G A G 10 0.534867787102555 0.111991189784813 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_490420_491387:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_490420_490642:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_490420_490546:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_490420_490720:PTDSS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 35 20 55 16.2796274514106 10.6973557420511 5.58227170935948 C:G C G 10 0.534867787102555 0.138952312627828 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 972118 C/A 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:C C A 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000183020:ENST00000529818:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_972062_972124:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000531548:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534485:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527024:exon_972062_972216:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000526753:exon_972062_972197:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000530801:exon_972062_972191:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000524559:exon_972062_972255:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_972102_972255:AP2A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 17 23 40 7.90724761925657 12.3019591033588 -4.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.204402284095363 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 A:G G A 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 42 27 69 19.5355529416927 14.441430251769 5.0941226899237 C:G G C 10 0.534867787102555 0.229683092833979 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 3381843 A/G 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5663706 G/C 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 C:G G C 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5663636_5663736:TRIM34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 25 27 52 11.6283053224361 14.441430251769 -2.81312492933286 A:C C A 10 0.534867787102555 0.487790903152005 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 31 23 54 14.4190985998208 12.3019591033588 2.11713949646203 T:C T C 10 0.534867787102555 0.588078831678685 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 41 41 82 19.0704207287952 21.9295792712048 -2.85915854240951 A:G G A 10 0.534867787102555 0.580293758214768 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 227 195 422 105.58501232772 104.299218484998 1.28579384272179 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.922290796732506 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 211 193 404 98.1428969213609 103.229482910793 -5.08658598943221 A:G G A 10 0.534867787102555 0.61827473160744 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 5719719 A/G 1 171 181 352 79.5376084054631 96.8110694655625 -17.2734610600994 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0692044434597363 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 23 15 38 10.6980408966412 8.02301680653832 2.67502409010291 A:G G A 10 0.534867787102555 0.419562302737224 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6524134 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000132286:ENST00000464330:exon_6523983_6524156:FXC1;ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6523983_6525430:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6523983_6524156:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6523983_6524156:DNHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 26 29 55 12.0934375353336 15.5111658259741 -3.41772829064053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.417652545684435 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 A:G G A 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 122 105 227 56.7461299734883 56.1611176457683 0.585012327720008 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.947066060680556 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 134 154 288 62.3277165282576 82.3696392137935 -20.0419226855358 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0181763666702698 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 18 25 43 8.37237983215401 13.3716946775639 -4.99931484540986 A:T A T 10 0.534867787102555 0.129665602297089 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6976988 A/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000149054:ENST00000527171:exon_6976921_6977336:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000278319:exon_6976921_6979068:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000299468:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529755:exon_6976921_6977341:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000414517:exon_6976921_6979079:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529903:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000532533:exon_6976921_6977013:ZNF215 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 6977175 G/C 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 C:G G C 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000149054:ENST00000527171:exon_6976921_6977336:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000278319:exon_6976921_6979068:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529755:exon_6976921_6977341:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000414517:exon_6976921_6979079:ZNF215 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 29 26 55 13.4888341740259 13.9065624646664 -0.417728290640525 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 69 45 114 32.0941226899237 24.069050419615 8.02507227030873 A:G G A 10 0.534867787102555 0.134287693560921 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 47 33 80 21.8612140061799 17.6506369743843 4.2105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.371212086549749 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 45 27 72 20.930949580385 14.441430251769 6.48951932861604 T:C T C 10 0.534867787102555 0.155801394036483 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8159857 C/T 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000166405:ENST00000343202:exon_8159819_8159894:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000309737:exon_8159819_8159894:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000524799:exon_8159819_8160106:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000530060:exon_8159819_8160325:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000528463:exon_8159819_8159894:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000425599:exon_8159819_8159894:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000531450:exon_8159819_8159894:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000529271:exon_8159819_8159972:RIC3;ENSG00000166405:ENST00000529035:exon_8159819_8159894:RIC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8435077 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8435078 A/C 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 39 37 76 18.1401563030004 19.7901081227945 -1.64995181979418 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731051442964933 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 2300 2670 4970 1069.80408966412 1428.09699156382 -358.292901899698 A:T:C C T 10 0.534867787102555 2.70987864630313e-24 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 36 32 68 16.744759664308 17.1157691872818 -0.37100952297374 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 C:G G C 10 0.534867787102555 0.177119301244689 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 22 20 42 10.2329086837438 10.6973557420511 -0.464447058307309 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 42 25 67 19.5355529416927 13.3716946775639 6.16385826412881 T:C C T 10 0.534867787102555 0.142519874977979 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 17 27 44 7.90724761925657 14.441430251769 -6.53418263251242 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0505829292256954 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 11913585 G/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:G G T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525267:exon_11913537_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11913515_11913653:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11913515_11913653:USP47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 14300946 A/G 1 18 15 33 8.37237983215401 8.02301680653832 0.349363025615686 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000133818:ENST00000414023:exon_14299510_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000529237:exon_14300228_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000256196:exon_14300296_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000534746:exon_14300485_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000526063:exon_14300649_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000532814:exon_14300656_14300970:RRAS2;ENSG00000133818:ENST00000531807:exon_14300943_14300970:RRAS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 17132074 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000011405:ENST00000531428:exon_17131979_17132108:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17131979_17132108:PIK3C2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 C:G C G 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 18424590 T/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:T T A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 66 113 179 30.6987260512314 60.4400599425887 -29.7413338913573 T:G T G 10 0.534867787102555 8.5973930627638e-06 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 88 142 230 40.9316347349752 75.9512257685628 -35.0195910335876 T:C T C 10 0.534867787102555 4.36350029007719e-06 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 20486026 G/A 1 25 11 36 11.6283053224361 5.8835456581281 5.74475966430802 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0655292691119456 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20486006_20486092:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20486006_20486092:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20486006_20486092:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20486006_20486092:PRMT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 28110151 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28110071_28110268:KIF18A;ENSG00000121621:ENST00000533466:exon_28110071_28110268:KIF18A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 32624405 C/T 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C C T 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000149100:ENST00000531120:exon_32623825_32627808:EIF3M;ENSG00000186714:ENST00000335185:exon_32623792_32624566:CCDC73;ENSG00000186714:ENST00000528333:exon_32624271_32624566:CCDC73 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:G G A 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 33053107 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33052924_33053135:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33052924_33053135:DEPDC7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.117636617366408 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 34981972 G/A 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34981967_34982058:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34981967_34982065:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34981967_34982065:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34981967_34982051:PDHX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 29 30 59 13.4888341740259 16.0460336130766 -2.55719943905074 T:C C T 10 0.534867787102555 0.516814870920027 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 77 60 137 35.8151803931033 32.0920672261533 3.72311316694996 T:C C T 10 0.534867787102555 0.549539015448928 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 709 701 1410 329.778738944288 374.942318758891 -45.1635798146026 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0162668086190675 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47259668 T/C 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C T C 10 0.534867787102555 0.76449359563304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47260319 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47270255 C/T 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47270227_47270457:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529444:exon_47270227_47270353:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47270227_47270367:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47270227_47270370:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531004:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531547:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529663:exon_47270227_47270391:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000530453:exon_47270227_47270356:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000444355:exon_47270227_47270367:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529788:exon_47270227_47270365:ACP2;ENSG00000025434:ENST00000495866:exon_47270190_47270415:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527464:exon_47270190_47270415:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47270231_47270415:NR1H3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47298360 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000428807:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47298283_47298414:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47298256_47298414:MADD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 77 87 164 35.8151803931033 46.5334974779223 -10.718317084819 C:G G C 10 0.534867787102555 0.100235982704702 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 47869855 C/T 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000030066:ENST00000378460:exon_47869771_47870019:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000426372:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000530326:exon_47869771_47869865:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000263764:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000532747:exon_47869771_47869882:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000526870:exon_47869771_47870107:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000529863:exon_47869771_47869886:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000458312:exon_47869771_47870057:NUP160 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 48145375 A/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:C A C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48145165_48145422:PTPRJ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.18250118711251 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57176628 C/T 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:C C T 10 0.534867787102555 0.3628970889895 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 128 99 227 59.536923250873 52.9519109231529 6.58501232772002 A:G A G 10 0.534867787102555 0.38792636796013 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57310307 A/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000214872:ENST00000457912:exon_57310114_57310847:SMTNL1;ENSG00000214872:ENST00000527972:exon_57310114_57310847:SMTNL1;ENSG00000214872:ENST00000399154:exon_57310116_57310653:SMTNL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 57569279 G/A 1 31 27 58 14.4190985998208 14.441430251769 -0.0223316519481891 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533189:exon_57569205_57569596:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533667:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527467:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000531014:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526772:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000525902:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57569205_57569668:CTNND1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 32 34 66 14.8842308127182 18.1855047614869 -3.30127394876863 T:C C T 10 0.534867787102555 0.459735548935202 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 51 65 116 23.7217428577697 34.7664061616661 -11.0446633038964 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0408980932946273 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 46 57 103 21.3960817932825 30.4874638648456 -9.09138207156317 T:G G T 10 0.534867787102555 0.075861875153087 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 58959632 C/T 1 16 19 35 7.44211540635912 10.1624879549485 -2.72037254858943 T:C C T 10 0.534867787102555 0.398922124839835 ENSG00000110042:ENST00000532982:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000531902:exon_58959571_58959724:DTX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60609729 G/A 1 49 48 97 22.7914784319748 25.6736537809226 -2.88217534894784 A:G G A 10 0.534867787102555 0.61109338604682 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60609598_60609910:CCDC86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 52 62 114 24.1868750706671 33.1618028003584 -8.97492772969127 A:G G A 10 0.534867787102555 0.110062545254702 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60617715 A/C 1 66 52 118 30.6987260512314 27.8131249293329 2.88560112189851 A:C A C 10 0.534867787102555 0.64480734855648 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 55 60 115 25.5822717093595 32.0920672261533 -6.50979551679382 A:C C A 10 0.534867787102555 0.225924382000634 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 104 96 200 48.3737501413343 51.3473075618453 -2.97355742051101 A:G G A 10 0.534867787102555 0.671478279218645 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 74 64 138 34.4197837544109 34.2315383745635 0.188245379847409 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 C:G C G 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 20 18 38 9.3026442579489 9.62762016784599 -0.324975909897089 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 60784934 A/G 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 61105568 G/A 1 15 28 43 6.97698319346167 14.9762980388715 -7.99931484540987 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0207298565669656 ENSG00000149476:ENST00000530456:exon_61105413_61105602:DAK;ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61105413_61105602:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61105413_61105602:DAK;ENSG00000149476:ENST00000530057:exon_61105413_61105574:DAK;ENSG00000149476:ENST00000533393:exon_61105413_61105602:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524968:exon_61105413_61105580:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61105413_61105602:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61105413_61105602:DAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 61722645 C/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:C C A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000167995:ENST00000378043:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000435278:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000378042:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000301774:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000534553:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000529265:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000533521:exon_61722579_61723423:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000524877:exon_61722579_61723423:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000524926:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000449131:exon_61722579_61722673:BEST1;ENSG00000167995:ENST00000526988:exon_61722629_61722673:BEST1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 61724292 C/T 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.346212916398142 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 20 23 43 9.3026442579489 12.3019591033588 -2.99931484540986 T:C T C 10 0.534867787102555 0.364203480464472 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62342994 C/T 1 44 33 77 20.4658173674876 17.6506369743843 2.81518039310327 T:C C T 10 0.534867787102555 0.568618903659844 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 91 127 218 42.3270313736675 67.9282089620245 -25.601177588357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000652750970530934 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62519565 G/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185670:ENST00000530112:exon_62519452_62519571:ZBTB3;ENSG00000185670:ENST00000394807:exon_62518435_62521187:ZBTB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62559385 T/C 1 37 33 70 17.2098918772055 17.6506369743843 -0.440745097178851 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000168569:ENST00000528367:exon_62559151_62559464:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000525631:exon_62559151_62559469:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62559151_62559493:TMEM223 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62575025 A/T 1 91 74 165 42.3270313736675 39.5802162455891 2.74681512807842 A:T A T 10 0.534867787102555 0.696797999570636 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62574369_62575138:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62574369_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62574397_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62574408_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62574409_62575100:STX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62592961 T/C 1 66 63 129 30.6987260512314 33.696670587461 -2.9979445362296 T:C T C 10 0.534867787102555 0.5978438985239 ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62602983 A/G 1 113 94 207 52.5599400574113 50.2775719876402 2.28236806977111 A:G A G 10 0.534867787102555 0.780686229644356 ENSG00000133316:ENST00000311713:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62602903_62603004:WDR74 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62607068 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62606979_62607131:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62606979_62607339:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62606979_62607133:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62607013_62607339:WDR74 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62623017 C/A 1 54 23 77 25.117139496462 12.3019591033588 12.8151803931033 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00400298722691876 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62623019 A/G 1 53 24 77 24.6520072835646 12.8368268904613 11.8151803931033 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00820338298874454 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62623051 T/C 1 46 37 83 21.3960817932825 19.7901081227945 1.60597367048793 T:C T C 10 0.534867787102555 0.742643690552814 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 213 202 415 99.0731613471558 108.043292994716 -8.97013164756032 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.402881359899221 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 61 67 128 28.3730649867441 35.8361417358712 -7.46307674912704 A:C C A 10 0.534867787102555 0.214643361819343 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63713317 G/A 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000110583:ENST00000377793:exon_63713312_63713407:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000338447:exon_63713312_63713407:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000456907:exon_63713306_63713347:NAA40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 18 6 24 8.37237983215401 3.20920672261533 5.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0402244391024662 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63986713 C/A 1 8 15 23 3.72105770317956 8.02301680653832 -4.30195910335876 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0934089262926932 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 252 230 482 117.213317650156 123.019591033588 -5.8062733834315 A:G G A 10 0.534867787102555 0.615568431409576 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 327 348 675 152.098233617465 186.133989911689 -34.0357562942246 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00968275486689494 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 99 83 182 46.0480890768471 44.3940263295121 1.65406274733499 T:C T C 10 0.534867787102555 0.823950103981467 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 19 9 28 8.83751204505145 4.81381008392299 4.02370196112846 A:G G A 10 0.534867787102555 0.1346812069964 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64026219 C/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64034911 G/A 1 27 26 53 12.558569748231 13.9065624646664 -1.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.783434760645152 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64107735 G/A 1 46 37 83 21.3960817932825 19.7901081227945 1.60597367048793 A:G G A 10 0.534867787102555 0.742643690552814 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64107695_64107798:CCDC88B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 66 74 140 30.6987260512314 39.5802162455891 -8.8814901943577 T:G T G 10 0.534867787102555 0.149593201275119 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 155 158 313 72.095492999104 84.5091103622037 -12.4136173630997 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.173785525080042 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 373 304 677 173.494315410747 162.599807279177 10.8945081315703 T:C T C 10 0.534867787102555 0.418520640711797 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 T:C T C 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 22 16 38 10.2329086837438 8.55788459364088 1.67502409010291 T:G T G 10 0.534867787102555 0.628539049587477 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64496357 G/T 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:G G T 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64569000 C/T 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 T C T 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 25 31 56 11.6283053224361 16.5809014001792 -4.95259607774308 A:G G A 10 0.534867787102555 0.227663752153118 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 167 145 312 77.6770795538733 77.5558291298705 0.121250424002838 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 26 19 45 12.0934375353336 10.1624879549485 1.93094958038502 T:C C T 10 0.534867787102555 0.654567694556077 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 21 11 32 9.76777647084634 5.8835456581281 3.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.214684384919347 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 A:G G A 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64897453 C/T 1 12 20 32 5.58158655476934 10.6973557420511 -5.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0774907266020895 ENSG00000162298:ENST00000530451:exon_64897201_64897458:SYVN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 69 59 128 32.0941226899237 31.5571994390507 0.536923250872963 T:C C T 10 0.534867787102555 0.929713725706607 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65147294 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65144289_65147409:SLC25A45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 25 18 43 11.6283053224361 9.62762016784599 2.00068515459014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.647041464439815 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65272177 C/T 1 1925 1450 3375 895.379509827582 775.558291298705 119.821218528877 A:T:C C T 10 0.534867787102555 3.69690966587341e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65339027 C/T 1 95 97 192 44.1875602252573 51.8821753489478 -7.69461512369056 T:C C T 10 0.534867787102555 0.278209839766130 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 39 24 63 18.1401563030004 12.8368268904613 5.30332941253904 T:C C T 10 0.534867787102555 0.206901419868061 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65408708 G/T 1 60 79 139 27.9079327738467 42.2545551811018 -14.3466224072551 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0170170414610602 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 20 22 42 9.3026442579489 11.7670913162562 -2.46444705830731 A:C A C 10 0.534867787102555 0.536612259953469 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65547133 G/A 1 32 26 58 14.8842308127182 13.9065624646664 0.977668348051809 A:G G A 10 0.534867787102555 0.895438925505447 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 18 14 32 8.37237983215401 7.48814901943577 0.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.859899586609749 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65547455 C/A 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:C C A 10 0.534867787102555 0.699211137422613 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65655393 G/C 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 C:G G C 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000172500:ENST00000442885:exon_65654801_65655603:FIBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 65 39 104 30.2335938383339 20.8598436969996 9.37375014133428 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0764116236066542 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 80 94 174 37.2105770317956 50.2775719876402 -13.0669949558446 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0483645481723915 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 80 92 172 37.2105770317956 49.2078364134351 -11.9972593816395 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0784373600159836 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66134085 C/T 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 51 54 105 23.7217428577697 28.882860503538 -5.16111764576828 T:C C T 10 0.534867787102555 0.328863654169167 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 33 31 64 15.3493630256157 16.5809014001792 -1.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.802681973476528 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66299515 A/G 1 9 11 20 4.18618991607701 5.8835456581281 -1.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.505457236744248 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66299422_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66299127_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66299422_66301098:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66299422_66299551:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66299127_66299676:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66299127_66299690:BBS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 T:C T C 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 53 33 86 24.6520072835646 17.6506369743843 7.00137030918027 C:G G C 10 0.534867787102555 0.159546501845075 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 25 7 32 11.6283053224361 3.74407450971789 7.88423081271824 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00686616368673225 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67050292 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67120530 C/G 1 398 384 782 185.122620733183 205.389230247381 -20.266609514198 C:G C G 10 0.534867787102555 0.151609129806174 ENSG00000175482:ENST00000529704:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000533429:exon_67120162_67120549:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000530584:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000312419:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000532830:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000534515:exon_67119024_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000528087:exon_67119036_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000531239:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000524743:exon_67120459_67120631:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000525255:exon_67119995_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000529000:exon_67120364_67120582:POLD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 20 13 33 9.3026442579489 6.95328123233322 2.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.486615987304497 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67165015 T/C 1 31 25 56 14.4190985998208 13.3716946775639 1.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.790777918729491 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164935_67165880:RAD9A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 74 57 131 34.4197837544109 30.4874638648456 3.93231988956529 T:C C T 10 0.534867787102555 0.540038300036362 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 114 100 214 53.0250722703087 53.4867787102555 -0.461706439946774 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 93 100 193 43.2572957994624 53.4867787102555 -10.2294829107931 T:C C T 10 0.534867787102555 0.149071415950591 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 17 19 36 7.90724761925657 10.1624879549485 -2.25524033569198 A:G G A 10 0.534867787102555 0.505591504798501 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67209515 C/T 1 38 45 83 17.6750240901029 24.069050419615 -6.39402632951207 T:C C T 10 0.534867787102555 0.186459160234987 ENSG00000172725:ENST00000393893:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000341356:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000393886:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000453768:exon_67209437_67209559:CORO1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67209869 T/G 1 19 33 52 8.83751204505145 17.6506369743843 -8.81312492933286 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0174608194288521 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67264679 C/T 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67263649_67264907:PITPNM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 C:G C G 10 0.534867787102555 0.317451841975924 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 2216 1174 3390 1030.73298378074 627.9347820584 402.798201722338 A:C:G A G 10 0.534867787102555 1.31395522031206e-44 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 2348 1350 3698 1092.1304358832 722.071512588449 370.058923294751 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 1.0308877901551e-34 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 28 27 55 13.0237019611285 14.441430251769 -1.41772829064053 T:C C T 10 0.534867787102555 0.787211450625085 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 36 56 92 16.744759664308 29.9525960777431 -13.2078364134351 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00640442275827276 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68177510 C/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68177382_68177608:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68177382_68177608:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000528714:exon_68177497_68177608:LRP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 10 15 25 4.65132212897445 8.02301680653832 -3.37169467756387 A:G G A 10 0.534867787102555 0.228786156481097 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68549340 A/G 1 17 10 27 7.90724761925657 5.34867787102555 2.55856974823102 A:G A G 10 0.534867787102555 0.342606221663184 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68549239_68549427:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68549239_68549427:CPT1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68560787 C/T 1 23 10 33 10.6980408966412 5.34867787102555 5.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0797982604402267 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68560783_68560870:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68560783_68560870:CPT1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 9 19 28 4.18618991607701 10.1624879549485 -5.97629803887154 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0352385485799502 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 18 26 44 8.37237983215401 13.9065624646664 -5.53418263251242 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0985950840044302 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 A:C C A 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68705820 G/A 1 23 10 33 10.6980408966412 5.34867787102555 5.34936302561568 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0797982604402267 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68840160 A/G 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68840095_68840176:TPCN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68851414 T/C 1 1 10 11 0.465132212897445 5.34867787102555 -4.8835456581281 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0040341445028996 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68851413_68851484:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68851413_68851484:TPCN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 68852660 C/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 69462910 G/A 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 A:G G A 10 0.534867787102555 0.177119301244689 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 70185325 C/T 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 T:C C T 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70185277_70185417:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70185277_70185412:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526369:exon_70185277_70185412:PPFIA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 70200529 C/T 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70200428_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526347:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530294:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526074:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000528750:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000533894:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530390:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000527612:exon_70200309_70200558:PPFIA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 54 53 107 25.117139496462 28.3479927164354 -3.23085321997338 A:G A G 10 0.534867787102555 0.561546627395983 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71146841 G/A 1 52 49 101 24.1868750706671 26.2085215680252 -2.02164649735806 A:G G A 10 0.534867787102555 0.691255837300446 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71726774 C/T 1 77 80 157 35.8151803931033 42.7894229682044 -6.97424257510114 T:C C T 10 0.534867787102555 0.298294281163034 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 69 52 121 32.0941226899237 27.8131249293329 4.28099776059085 A:G A G 10 0.534867787102555 0.466566961504452 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71941381 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 10 25 35 4.65132212897445 13.3716946775639 -8.72037254858942 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00357071149644778 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 73071552 C/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:C C A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000110237:ENST00000263674:exon_73071365_73071578:ARHGEF17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 A:G A G 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 73611349 G/C 1 17 8 25 7.90724761925657 4.27894229682044 3.62830532243613 C:G G C 10 0.534867787102555 0.164147290224472 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73611315_73611465:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73611315_73611465:PAAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 C:G C G 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.317451841975924 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 74546905 G/A 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000166439:ENST00000299563:exon_74546591_74553458:RNF169 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 74705696 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000162139:ENST00000294064:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000531509:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000531619:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000534628:exon_74705554_74706088:NEU3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 74883577 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000137491:ENST00000526660:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000289575:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000341411:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000532236:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000531756:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000525650:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000454962:exon_74883424_74883614:SLCO2B1;ENSG00000137491:ENST00000428359:exon_74883424_74883614:SLCO2B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 1006 804 1810 467.92300617483 430.033700830454 37.8893053443754 A:T:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0771728451054804 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75133765 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000149243:ENST00000376292:exon_75133438_75133812:KLHL35;ENSG00000149243:ENST00000441792:exon_75133445_75135941:KLHL35;ENSG00000149243:ENST00000460787:exon_75133465_75133812:KLHL35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75152243 C/T 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000534322:exon_75152208_75152355:GDPD5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75160575 G/A 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527322:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533911:exon_75160562_75160655:GDPD5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 31 21 52 14.4190985998208 11.2322235291537 3.18687507066714 T:C C T 10 0.534867787102555 0.406555699258052 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 13 22 35 6.04671876766678 11.7670913162562 -5.72037254858942 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0619967772189013 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 90 96 186 41.8618991607701 51.3473075618453 -9.48540840107523 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.18566832825554 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 51 49 100 23.7217428577697 26.2085215680252 -2.4867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.61806238173745 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 30 35 65 13.9539663869233 18.7203725485894 -4.76640616166607 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.263634949225480 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 17 14 31 7.90724761925657 7.48814901943577 0.419098599820795 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G G A 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 77702260 G/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G G A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000149262:ENST00000433818:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000534064:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000354849:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000529807:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000534408:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000524766:exon_77702154_77702345:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000527522:exon_77702154_77702345:INTS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 82879696 C/T 1 21 30 51 9.76777647084634 16.0460336130766 -6.2782571422303 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0917249958493813 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82879470_82881037:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82879470_82879980:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82879470_82879729:PCF11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 56 31 87 26.0474039222569 16.5809014001792 9.46650252207771 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0524179514105171 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 85725937 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000534412:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531771:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531558:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531930:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532041:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000525162:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528256:exon_85725913_85726006:PICALM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 43 36 79 20.0006851545901 19.255240335692 0.745444818898154 T:G G T 10 0.534867787102555 0.91048399196757 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 31 33 64 14.4190985998208 17.6506369743843 -3.23153837456352 A:C A C 10 0.534867787102555 0.453220740694877 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 19 6 25 8.83751204505145 3.20920672261533 5.62830532243612 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0269109159915461 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 41 35 76 19.0704207287952 18.7203725485894 0.350048180205821 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 102398593 C/T 1 1 9 10 0.465132212897445 4.81381008392299 -4.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.007840761770901 ENSG00000137673:ENST00000260227:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000533366:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000531200:exon_102398488_102398714:MMP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 7 15 22 3.25592549028211 8.02301680653832 -4.76709131625621 C:G G C 10 0.534867787102555 0.053173004707963 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 A:C A C 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 A:G A G 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 110035262 A/G 1 31 30 61 14.4190985998208 16.0460336130766 -1.62693501325585 A:G A G 10 0.534867787102555 0.701605803608164 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 110035301 A/G 1 25 26 51 11.6283053224361 13.9065624646664 -2.27825714223031 A:G A G 10 0.534867787102555 0.575443123850368 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 25 13 38 11.6283053224361 6.95328123233322 4.67502409010291 T:C C T 10 0.534867787102555 0.144697896748167 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 47 72 119 21.8612140061799 38.510480671384 -16.649266665204 A:C A C 10 0.534867787102555 0.00235781780741482 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 40 20 60 18.6052885158978 10.6973557420511 7.9079327738467 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0513623937389103 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 33 20 53 15.3493630256157 10.6973557420511 4.65200728356458 T:C T C 10 0.534867787102555 0.217181125063433 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 A:G G A 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 17 29 46 7.90724761925657 15.5111658259741 -7.60391820671753 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0266950708938233 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117074109 G/A 1 15 6 21 6.97698319346167 3.20920672261533 3.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.125795308975927 ENSG00000149591:ENST00000392951:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000436563:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000525531:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000278968:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000529792:exon_117074023_117074117:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000533863:exon_117071882_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000530649:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000532870:exon_117074023_117074200:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000529622:exon_117074023_117074200:TAGLN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 C:G C G 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 11 16 27 5.1164543418719 8.55788459364088 -3.44143025176898 C:G C G 10 0.534867787102555 0.246642971185003 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 A:G A G 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 25 21 46 11.6283053224361 11.2322235291537 0.39608179328247 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117859209 G/A 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 6 15 21 2.79079327738467 8.02301680653832 -5.23222352915365 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0275138695227108 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118074337 A/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G A G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118071189_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118074143_118076105:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118074143_118074380:AMICA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118081345 A/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:T A T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531536:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000524477:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000527877:exon_118081202_118081427:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000525565:exon_118081202_118081427:AMICA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118629615 G/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G G C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000110367:ENST00000529162:exon_118629483_118630078:DDX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 21 26 47 9.76777647084634 13.9065624646664 -4.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.244135128570163 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 30 39 69 13.9539663869233 20.8598436969996 -6.90587731007629 A:G A G 10 0.534867787102555 0.116111267813880 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 41 49 90 19.0704207287952 26.2085215680252 -7.13810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.139706973181843 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.158813183030461 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 63 66 129 29.303329412539 35.3012739487686 -5.9979445362296 T:C C T 10 0.534867787102555 0.291231464769066 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 47 52 99 21.8612140061799 27.8131249293329 -5.95191092315295 T:C C T 10 0.534867787102555 0.267668950631995 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118922200 G/A 1 113 119 232 52.5599400574113 63.649266665204 -11.0893266077928 A:G G A 10 0.534867787102555 0.148045317473266 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118922150_118922337:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529114:exon_118922150_118922337:HYOU1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 29 28 57 13.4888341740259 14.9762980388715 -1.48746386484564 T:C T C 10 0.534867787102555 0.693092700761284 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 26 24 50 12.0934375353336 12.8368268904613 -0.743389355127752 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.88766651817951 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 49 21 70 22.7914784319748 11.2322235291537 11.5592549028212 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0056730054197437 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 A:T:G T G 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1591 1676 3267 740.025350719835 896.438411183882 -156.413060464047 A:T:C:G A G 10 0.534867787102555 4.36445470556581e-08 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 895 882 1777 416.293330543213 471.753388224453 -55.4600576812402 T:C:G T G 10 0.534867787102555 0.00888312405816631 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 14 16 30 6.51185098056423 8.55788459364088 -2.04603361307665 A:C A C 10 0.534867787102555 0.470026628362640 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 123600475 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123600323_123600533:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123600323_123600533:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123600323_123600533:ZNF202 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 33 23 56 15.3493630256157 12.3019591033588 3.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.425600976645615 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 14 26 40 6.51185098056423 13.9065624646664 -7.3947114841022 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0253437296467524 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126142952 C/T 1 31 35 66 14.4190985998208 18.7203725485894 -4.30127394876863 T:C C T 10 0.534867787102555 0.324039306866122 ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126142864_126143204:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532125:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534315:exon_126142864_126142974:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000531257:exon_126142929_126142974:FOXRED1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126162468 G/A 1 5 14 19 2.32566106448723 7.48814901943577 -5.16248795494855 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0207817371783947 ENSG00000150455:ENST00000488598:exon_126162372_126162582:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 59 49 108 27.4428005609493 26.2085215680252 1.23427899292406 T:C C T 10 0.534867787102555 0.847385029881191 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 84 91 175 39.0711058833854 48.6729686263325 -9.60186274294713 T:C C T 10 0.534867787102555 0.150422333148354 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 28 35 63 13.0237019611285 18.7203725485894 -5.69667058746096 T:C T C 10 0.534867787102555 0.165368594487974 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 126278075 C/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000110080:ENST00000227495:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000531217:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000444328:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000356132:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530591:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534083:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528605:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528858:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000392669:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526756:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526727:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000449406:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000532243:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534457:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530531:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524860:exon_126277994_126278089:ST3GAL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 72 66 138 33.489519328616 35.3012739487686 -1.81175462015259 T:C T C 10 0.534867787102555 0.798129027541948 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 128651893 A/G 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 A:G A G 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 129746707 G/T 1 8 19 27 3.72105770317956 10.1624879549485 -6.44143025176899 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0189124562113899 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129746616_129746790:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129746616_129746790:NFRKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130750642 A/C 1 4 14 18 1.86052885158978 7.48814901943577 -5.62762016784599 A:C A C 10 0.534867787102555 0.00877625850336129 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000527116:exon_130750517_130751036:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000426933:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530330:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130750517_130750701:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 T:C T C 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130776602 A/C 1 12 16 28 5.58158655476934 8.55788459364088 -2.97629803887154 A:C A C 10 0.534867787102555 0.343713788088321 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130776613 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130780015 C/T 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130779913_130780032:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130784754 C/G 1 22 19 41 10.2329086837438 10.1624879549485 0.070420728795245 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 130784971 C/G 1 20 12 32 9.3026442579489 6.41841344523066 2.88423081271824 C:G C G 10 0.534867787102555 0.376491222425149 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 11 134115524 C/T 1 38 29 67 17.6750240901029 15.5111658259741 2.16385826412881 T:C C T 10 0.534867787102555 0.625950975924369 ENSG00000151502:ENST00000281187:exon_134115338_134117686:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525095:exon_134115338_134115623:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000531741:exon_134115338_134116181:VPS26B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 A:G G A 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 23 31 54 10.6980408966412 16.5809014001792 -5.88286050353797 A:G A G 10 0.534867787102555 0.132875221747927 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 863152 G/A 1 67 52 119 31.1638582641288 27.8131249293329 3.35073333479595 A:G G A 10 0.534867787102555 0.581775586137679 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_862089_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_862225_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000447667:exon_862225_863490:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 28 24 52 13.0237019611285 12.8368268904613 0.186875070667138 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 63 60 123 29.303329412539 32.0920672261533 -2.78873781361426 A:C A C 10 0.534867787102555 0.65165826325469 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 80 68 148 37.2105770317956 36.3710095229737 0.839567508821858 T:C C T 10 0.534867787102555 0.934398621114709 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 85 86 171 39.5362380962828 45.9986296908197 -6.46239159453691 T:C C T 10 0.534867787102555 0.357657300746471 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 999638 C/T 1 18 27 45 8.37237983215401 14.441430251769 -6.06905041961497 T:C C T 10 0.534867787102555 0.074166479695257 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_999619_999679:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_999619_999679:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_999619_999679:WNK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 1023218 G/T 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 T:G G T 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000002016:ENST00000358495:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000228345:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000430095:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000468231:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000481052:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000488642:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000461568:exon_1023060_1023287:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000463750:exon_1023060_1023287:RAD52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 1702912 C/T 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 2937013 G/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 C:G G C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 2937150 C/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C C T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000053702:ENST00000337508:exon_2937092_2937213:NRIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3046802 A/G 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000078246:ENST00000228245:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000448120:exon_3046797_3046895:TULP3;ENSG00000078246:ENST00000397132:exon_3046797_3046895:TULP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3782647 A/T 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:T A T 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3782701 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3788145 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3788222 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3789452 C/T 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C C T 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3789404_3789515:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 3806147 T/C 1 16 2 18 7.44211540635912 1.06973557420511 6.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00322006903537436 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3805938_3806201:EFCAB4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 65 65 130 30.2335938383339 34.7664061616661 -4.53281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.430261754132247 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 4919267 A/G 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000151079:ENST00000433855:exon_4918342_4923944:KCNA6;ENSG00000151079:ENST00000280684:exon_4919111_4920871:KCNA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 5021984 T/A 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 A:T T A 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000111262:ENST00000382545:exon_5020006_5027422:KCNA1;ENSG00000111262:ENST00000228858:exon_5020507_5022080:KCNA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 141 144 285 65.5836420185397 77.0209613427679 -11.4373193242282 A:G G A 10 0.534867787102555 0.191346760054377 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 111 111 222 51.6296756316164 59.3703243683836 -7.74064873676721 T:C T C 10 0.534867787102555 0.313120842176152 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4273 3646 7919 1987.50994571078 1950.12795177592 37.3819939348668 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.404513123318091 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4140 3795 7935 1925.64736139542 2029.8232520542 -104.175890658774 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.0192449626822074 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 24 17 41 11.1631731095387 9.09275238074344 2.07042072879524 T:G T G 10 0.534867787102555 0.535884982847249 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 43 48 91 20.0006851545901 25.6736537809226 -5.67296862633251 A:G G A 10 0.534867787102555 0.248546644767869 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 39 59 98 18.1401563030004 31.5571994390507 -13.4170431360504 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00815503593332745 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6859308 T/C 1 11 1 12 5.1164543418719 0.534867787102555 4.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0077867623210267 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 74 70 144 34.4197837544109 37.4407450971788 -3.02096134276792 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.617345169489679 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7053362 A/G 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:G A G 10 0.534867787102555 0.384697735469175 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7055860 T/C 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7055740_7055902:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7055754_7055902:PTPN6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7090742 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7254669 A/C 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:C A C 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7254494_7254683:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7254494_7254683:C1RL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7277236 T/A 1 11 2 13 5.1164543418719 1.06973557420511 4.04671876766679 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0265849870648711 ENSG00000139194:ENST00000266560:exon_7277225_7277326:RBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7280880 C/G 1 26 12 38 12.0934375353336 6.41841344523066 5.67502409010291 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0738373067149549 ENSG00000139194:ENST00000266560:exon_7280836_7281014:RBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7287956 C/T 1 35 23 58 16.2796274514106 12.3019591033588 3.97766834805181 T:C C T 10 0.534867787102555 0.356990979806976 ENSG00000139182:ENST00000266546:exon_7287923_7288131:CLSTN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 56 0 56 26.0474039222569 0 26.0474039222569 G G 10 0.534867787102555 1.11423900661395e-15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 57 56 113 26.5125361351544 29.9525960777431 -3.44005994258872 A:G A G 10 0.534867787102555 0.571719255648954 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 79 61 140 36.7454448188982 32.6269350132559 4.1185098056423 C:G C G 10 0.534867787102555 0.499089517455321 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 153 125 278 71.1652285733091 66.8584733878194 4.30675518548971 T:C C T 10 0.534867787102555 0.630733996562038 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 90 77 167 41.8618991607701 41.1848196068967 0.677079553873313 T:C T C 10 0.534867787102555 0.938294032371118 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 74 64 138 34.4197837544109 34.2315383745635 0.188245379847409 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 44 26 70 20.4658173674876 13.9065624646664 6.55925490282115 A:T A T 10 0.534867787102555 0.120828511820964 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 31 38 69 14.4190985998208 20.3249759098971 -5.9058773100763 A:G A G 10 0.534867787102555 0.184020573275785 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 14613700 A/G 1 27 15 42 12.558569748231 8.02301680653832 4.53555294169269 A:G A G 10 0.534867787102555 0.167703808170223 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14613429_14614067:ATF7IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 950 1049 1999 441.875602252573 561.07630867058 -119.200706418007 A:T:C:G C G 10 0.534867787102555 1.03890163362161e-07 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 45 42 87 20.930949580385 22.4644470583073 -1.53349747792229 A:T:C T A 10 0.534867787102555 0.748390116494607 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 48 28 76 22.3263462190774 14.9762980388715 7.35004818020582 A:G G A 10 0.534867787102555 0.107034446605763 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 17 18 35 7.90724761925657 9.62762016784599 -1.72037254858942 T:G T G 10 0.534867787102555 0.613096775748172 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 58 71 129 26.9776683480518 37.9756128842814 -10.9979445362296 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0633923182169584 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 26732987 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 26733062 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26732960_26733088:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26732960_26733088:ITPR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 27143508 G/A 1 13 5 18 6.04671876766678 2.67433893551277 3.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 0.155287650432156 ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 27844824 G/A 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27844682_27844861:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27844682_27844861:PPFIBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 54 44 98 25.117139496462 23.5341826325124 1.58295686394961 A:G G A 10 0.534867787102555 0.762425845442712 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 20 16 36 9.3026442579489 8.55788459364088 0.74475966430802 A:G A G 10 0.534867787102555 0.868218778112725 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 30868002 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30867893_30868015:CAPRIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 T:C T C 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 30888001 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30887902_30888140:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30887902_30888140:CAPRIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 17 21 38 7.90724761925657 11.2322235291537 -3.32497590989709 C:G C G 10 0.534867787102555 0.329852297176118 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 36 13 49 16.744759664308 6.95328123233322 9.79147843197481 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0059674004029293 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 31254752 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 31 0 31 14.4190985998208 0 14.4190985998208 T T 10 0.534867787102555 5.57907834745611e-09 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 32134240 C/T 1 42 36 78 19.5355529416927 19.255240335692 0.28031260600071 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 32134926 G/A 1 44 38 82 20.4658173674876 20.3249759098971 0.14084145759049 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 32137901 A/G 1 55 62 117 25.5822717093595 33.1618028003584 -7.57953109099893 A:G A G 10 0.534867787102555 0.165409283017695 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 39713776 C/A 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 A:C C A 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39713708_39713815:KIF21A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 45751102 A/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G A G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000177119:ENST00000425752:exon_45751073_45751207:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000320560:exon_45751073_45751207:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000426898:exon_45751073_45751207:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000423947:exon_45751073_45751207:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000435642:exon_45751073_45751207:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000441606:exon_45751073_45751207:ANO6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 46758945 C/T 1 17 13 30 7.90724761925657 6.95328123233322 0.95396638692335 T:C C T 10 0.534867787102555 0.855241169984464 ENSG00000134294:ENST00000256689:exon_46758890_46758972:SLC38A2;ENSG00000134294:ENST00000395444:exon_46758890_46758972:SLC38A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 17 20 37 7.90724761925657 10.6973557420511 -2.79010812279453 T:C C T 10 0.534867787102555 0.411131958237923 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 48477422 A/G 1 26 8 34 12.0934375353336 4.27894229682044 7.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0089461942520272 ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48477374_48477545:SENP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 48736985 T/G 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 T:G T G 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000167528:ENST00000301042:exon_48733911_48737510:ZNF641;ENSG00000167528:ENST00000448928:exon_48733911_48737510:ZNF641 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 48737245 A/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:C A C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000167528:ENST00000301042:exon_48733911_48737510:ZNF641;ENSG00000167528:ENST00000448928:exon_48733911_48737510:ZNF641 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49221622 G/A 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000167535:ENST00000301050:exon_49221368_49222724:CACNB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 54 76 130 25.117139496462 40.6499518197942 -15.5328123233322 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00809875721507233 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49310724 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49310725 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49390677 T/C 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49425978 T/C 1 21 17 38 9.76777647084634 9.09275238074344 0.675024090102909 T:C T C 10 0.534867787102555 0.871956006510723 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424958_49427747:MLL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49434074 C/A 1 17 12 29 7.90724761925657 6.41841344523066 1.4888341740259 A:C C A 10 0.534867787102555 0.710420076918619 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49433507_49435318:MLL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 49444545 G/A 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49443465_49444573:MLL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 50483982 G/A 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.283655371776667 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 20 18 38 9.3026442579489 9.62762016784599 -0.324975909897089 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 A:G A G 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51089734 T/A 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:T T A 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000066084:ENST00000301180:exon_51089631_51089750:DIP2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 36 41 77 16.744759664308 21.9295792712048 -5.18481960689673 T:C C T 10 0.534867787102555 0.254210303947423 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51386066 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000110911:ENST00000262051:exon_51385973_51386122:SLC11A2;ENSG00000110911:ENST00000394904:exon_51385973_51386122:SLC11A2;ENSG00000110911:ENST00000262052:exon_51385973_51386122:SLC11A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51639899 A/G 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 21 14 35 9.76777647084634 7.48814901943577 2.27962745141057 T:C T C 10 0.534867787102555 0.500016160638516 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 41 40 81 19.0704207287952 21.3947114841022 -2.32429075530695 T:C T C 10 0.534867787102555 0.656363928531873 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51696500 G/A 1 18 15 33 8.37237983215401 8.02301680653832 0.349363025615686 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51696470_51696564:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51696470_51696564:BIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 25 18 43 11.6283053224361 9.62762016784599 2.00068515459014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.647041464439815 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 21 17 38 9.76777647084634 9.09275238074344 0.675024090102909 C:G G C 10 0.534867787102555 0.871956006510723 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 52642518 G/A 1 18 23 41 8.37237983215401 12.3019591033588 -3.92957927120476 A:G G A 10 0.534867787102555 0.272995522397383 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52642375_52642709:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52642375_52642709:KRT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53563865 G/A 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000139631:ENST00000453446:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000379843:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000308926:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000475890:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000267085:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000379850:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000379846:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000444623:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000490923:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000490589:exon_53563856_53564160:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000485004:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000483632:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000472908:exon_53563856_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000454442:exon_53563855_53563910:CSAD;ENSG00000139631:ENST00000424845:exon_53563855_53563910:CSAD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53585825 C/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 21 17 38 9.76777647084634 9.09275238074344 0.675024090102909 T:G T G 10 0.534867787102555 0.871956006510723 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53589511 A/G 1 22 37 59 10.2329086837438 19.7901081227945 -9.55719943905074 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0131964152246957 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53671005 G/A 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670867_53671011:ESPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 13 26 39 6.04671876766678 13.9065624646664 -7.85984369699965 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0150998634214339 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 A:G G A 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 A:G A G 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 53876289 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 54118992 C/T 1 25 26 51 11.6283053224361 13.9065624646664 -2.27825714223031 T:C C T 10 0.534867787102555 0.575443123850368 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54118871_54119050:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54118871_54119050:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54118871_54119050:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54118871_54119050:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54118871_54119050:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54118871_54119050:CALCOCO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 48 58 106 22.3263462190774 31.0223316519482 -8.69598543287083 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0979918747775902 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 52 42 94 24.1868750706671 22.4644470583073 1.72242801235983 A:G G A 10 0.534867787102555 0.757096358546642 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 54911768 C/T 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.307011758512706 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 54963034 G/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54962968_54963150:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54962968_54963150:PDE1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56115585 C/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000135437:ENST00000257895:exon_56115473_56115731:RDH5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56332316 C/T 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56332295_56332344:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56332295_56332344:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56332295_56332344:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56332295_56332344:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000415755:exon_56332295_56332344:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56332295_56332344:DGKA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56365381 C/G 1 82 67 149 38.1408414575905 35.8361417358712 2.3046997217193 C:G C G 10 0.534867787102555 0.742836715106092 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56365305_56366565:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56365305_56366565:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56365305_56366565:CDK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 50 42 92 23.2566106448723 22.4644470583073 0.792163586564939 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.91694321099281 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56992630 C/G 1 26 24 50 12.0934375353336 12.8368268904613 -0.743389355127752 C:G C G 10 0.534867787102555 0.88766651817951 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 56993714 C/T 1 7 19 26 3.25592549028211 10.1624879549485 -6.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0092786596387571 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 3610 3431 7041 1679.12728855978 1835.13137754887 -156.00408898909 A:T:C:G A T 10 0.534867787102555 0.000202467086120952 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 3826 3687 7513 1779.59584654562 1972.05753104712 -192.461684501496 A:C:G A G 10 0.534867787102555 8.9173541332514e-06 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57109792 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57109931 A/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57112637 G/A 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57114100 A/G 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 A:G A G 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57114307 A/T 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:T A T 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 11 18 29 5.1164543418719 9.62762016784599 -4.51116582597409 T:G T G 10 0.534867787102555 0.097583539926297 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57619362 G/A 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000182379:ENST00000349394:exon_57618661_57620229:NXPH4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 50 8 58 23.2566106448723 4.27894229682044 18.9776683480518 A:G G A 10 0.534867787102555 2.00420730379938e-07 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57870121 A/C 1 9 10 19 4.18618991607701 5.34867787102555 -1.16248795494854 A:C A C 10 0.534867787102555 0.649883599673449 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57870648 A/G 1 9 18 27 4.18618991607701 9.62762016784599 -5.44143025176898 A:G A G 10 0.534867787102555 0.051709482565568 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 79 54 133 36.7454448188982 28.882860503538 7.86258431536019 A:G G A 10 0.534867787102555 0.192244923700118 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 57985204 C/T 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 T:C C T 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000436866:exon_57985073_57985246:PIP4K2C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 6 16 22 2.79079327738467 8.55788459364088 -5.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0173741464387216 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 182 226 408 84.654062747335 120.880119885177 -36.2260571378424 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000344552528193284 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 23 7 30 10.6980408966412 3.74407450971789 6.95396638692335 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0158465485506418 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 55 36 91 25.5822717093595 19.255240335692 6.3270313736675 A:G A G 10 0.534867787102555 0.207413982344828 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58174306 T/C 1 2 11 13 0.93026442579489 5.8835456581281 -4.95328123233321 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00928848391930397 ENSG00000123427:ENST00000300209:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000333012:exon_58174038_58176321:FAM119B;ENSG00000123427:ENST00000414072:exon_58174039_58174429:FAM119B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 62 51 113 28.8381971996416 27.2782571422303 1.55994005741129 T:C T C 10 0.534867787102555 0.778255742135716 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 24 10 34 11.1631731095387 5.34867787102555 5.81449523851313 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0574595009300012 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 9 10 19 4.18618991607701 5.34867787102555 -1.16248795494854 T:C T C 10 0.534867787102555 0.649883599673449 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 59266456 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000139263:ENST00000379141:exon_59265937_59266598:LRIG3;ENSG00000139263:ENST00000320743:exon_59265938_59266598:LRIG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 66725116 G/A 1 14 11 25 6.51185098056423 5.8835456581281 0.628305322436125 A:G G A 10 0.534867787102555 0.843631536270771 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 18 17 35 8.37237983215401 9.09275238074344 -0.720372548589426 T:C C T 10 0.534867787102555 0.866210037229802 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 68708856 G/A 1 16 9 25 7.44211540635912 4.81381008392299 2.62830532243613 A:G G A 10 0.534867787102555 0.32219626972529 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 68709892 C/T 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68709858_68710033:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68709858_68710033:MDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 97 101 198 45.1178246510522 54.0216464973581 -8.90382184630589 A:G A G 10 0.534867787102555 0.225796451366712 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 19 26 45 8.83751204505145 13.9065624646664 -5.06905041961498 A:C C A 10 0.534867787102555 0.137295976208271 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 72008421 T/C 1 38 30 68 17.6750240901029 16.0460336130766 1.62899047702626 T:C T C 10 0.534867787102555 0.716932952645827 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72008315_72008480:ZFC3H1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 15 22 37 6.97698319346167 11.7670913162562 -4.79010812279453 A:G A G 10 0.534867787102555 0.137804477163093 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 72307637 C/G 1 9 14 23 4.18618991607701 7.48814901943577 -3.30195910335877 C:G C G 10 0.534867787102555 0.210174710637985 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 16 5 21 7.44211540635912 2.67433893551277 4.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0473916663399017 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 75892624 C/T 1 25 44 69 11.6283053224361 23.5341826325124 -11.9058773100763 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00515383289869921 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75891419_75893731:KRR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 618 583 1201 287.451707570621 311.82791988079 -24.3762123101686 A:G G A 10 0.534867787102555 0.164982763451148 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 88444154 C/A 1 23 15 38 10.6980408966412 8.02301680653832 2.67502409010291 A:C C A 10 0.534867787102555 0.419562302737224 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88444131_88444210:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88444131_88444210:CEP290 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 89864162 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000139323:ENST00000393179:exon_89864138_89864271:POC1B;ENSG00000139323:ENST00000313546:exon_89864138_89864271:POC1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 93181768 C/A 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:C C A 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93181643_93181825:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93181643_93181825:EEA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 10 16 26 4.65132212897445 8.55788459364088 -3.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.167762406474111 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 94243853 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000169372:ENST00000332896:exon_94243746_94244527:CRADD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 96641016 C/T 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000111145:ENST00000228741:exon_96640718_96641512:ELK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 37 42 79 17.2098918772055 22.4644470583073 -5.25455518110185 T:C T C 10 0.534867787102555 0.259862331924626 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 59 81 140 27.4428005609493 43.324290755307 -15.8814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00841924724677289 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 101755809 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101755740_101755838:UTP20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 5 18 23 2.32566106448723 9.62762016784599 -7.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00272248076234531 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 102120086 T/G 1 3 31 34 1.39539663869233 16.5809014001792 -15.1855047614869 T:G T G 10 0.534867787102555 6.68545477906323e-08 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102120072_102120182:CHPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 25 29 54 11.6283053224361 15.5111658259741 -3.88286050353797 A:G G A 10 0.534867787102555 0.339846679833752 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 24 26 50 11.1631731095387 13.9065624646664 -2.74338935512775 T:C C T 10 0.534867787102555 0.479702630205434 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 23 18 41 10.6980408966412 9.62762016784599 1.07042072879524 A:C A C 10 0.534867787102555 0.75709320191078 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 105428124 C/T 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105428078_105428176:ALDH1L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 108912791 G/A 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G G A 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000198855:ENST00000361549:exon_108912177_108913380:FICD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 108941679 G/A 1 37 24 61 17.2098918772055 12.8368268904613 4.37306498674414 A:G G A 10 0.534867787102555 0.304837219439568 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 45 37 82 20.930949580385 19.7901081227945 1.14084145759049 C:G G C 10 0.534867787102555 0.825593406610557 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 50 46 96 23.2566106448723 24.6039182067175 -1.34730756184528 T:C C T 10 0.534867787102555 0.8380458741978 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 39 28 67 18.1401563030004 14.9762980388715 3.16385826412882 T:C T C 10 0.534867787102555 0.464489323865927 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 109921723 A/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109921666_109921786:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109921666_109921786:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000280774:exon_109921666_109921786:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000340074:exon_109921666_109921786:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109921666_109921786:UBE3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 109927806 G/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109927724_109927809:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109927724_109927809:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000280774:exon_109927724_109927809:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000340074:exon_109927724_109927809:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109927724_109927809:UBE3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 114 112 226 53.0250722703087 59.9051921554862 -6.88011988517744 A:T A T 10 0.534867787102555 0.386097857793152 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 110029108 C/T 1 37 22 59 17.2098918772055 11.7670913162562 5.44280056094926 T:C C T 10 0.534867787102555 0.191501962614262 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110029046_110029162:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110029046_110029162:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110029046_110029162:MVK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 110353172 T/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 38 36 74 17.6750240901029 19.255240335692 -1.58021624558907 T:C C T 10 0.534867787102555 0.727953498512968 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 112669496 T/C 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 ENSG00000173064:ENST00000430131:exon_112669317_112669519:C12orf51;ENSG00000173064:ENST00000377560:exon_112669317_112669519:C12orf51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 113357202 C/T 1 23 4 27 10.6980408966412 2.13947114841022 8.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000772856874885089 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 113612562 G/A 1 47 41 88 21.8612140061799 21.9295792712048 -0.0683652650248412 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113612445_113612576:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113612445_113612576:DDX54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 20 16 36 9.3026442579489 8.55788459364088 0.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.868218778112725 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 116408538 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116408399_116408575:MED13L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 117465264 C/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465199_117465309:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465199_117465309:FBXW8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120148363 C/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120148345_120148425:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120148345_120148425:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120148345_120148425:CIT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120750517 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000089163:ENST00000202967:exon_120750259_120750553:SIRT4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 27 28 55 12.558569748231 14.9762980388715 -2.41772829064053 T:C C T 10 0.534867787102555 0.589168233191657 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 43 46 89 20.0006851545901 24.6039182067175 -4.6032330521274 A:G A G 10 0.534867787102555 0.340449172188213 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121018862 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121131891 C/T 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.219211710381975 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121151093 C/T 1 24 31 55 11.1631731095387 16.5809014001792 -5.41772829064053 T:C C T 10 0.534867787102555 0.175997931369557 ENSG00000175970:ENST00000344651:exon_121151077_121151190:UNC119B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 22 19 41 10.2329086837438 10.1624879549485 0.070420728795245 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 43 43 86 20.0006851545901 22.9993148454099 -2.99862969081973 T:C C T 10 0.534867787102555 0.519005306006178 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121221518 C/T 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121221477_121221555:AC069214.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121442214 G/A 1 20 18 38 9.3026442579489 9.62762016784599 -0.324975909897089 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121622239 C/T 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000089041:ENST00000261826:exon_121622108_121623856:P2RX7;ENSG00000089041:ENST00000328963:exon_121622108_121623856:P2RX7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121659684 C/T 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.127818607776150 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 28 30 58 13.0237019611285 16.0460336130766 -3.02233165194819 T:C T C 10 0.534867787102555 0.433122346217458 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 46 39 85 21.3960817932825 20.8598436969996 0.536238096282826 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.91400115664794 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 43 34 77 20.0006851545901 18.1855047614869 1.81518039310326 A:G G A 10 0.534867787102555 0.732376695459168 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 20 24 44 9.3026442579489 12.8368268904613 -3.53418263251242 A:T T A 10 0.534867787102555 0.294322558039473 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 95 63 158 44.1875602252573 33.696670587461 10.4908896377963 T:C C T 10 0.534867787102555 0.110417937490103 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 112 121 233 52.0948078445138 64.7190022394091 -12.6241943948953 A:G G A 10 0.534867787102555 0.100828642684009 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 117 94 211 54.4204689090011 50.2775719876402 4.14289692136089 A:G G A 10 0.534867787102555 0.581532773634761 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 121882098 T/G 1 21 7 28 9.76777647084634 3.74407450971789 6.02370196112846 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0232862043608718 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 121 144 265 56.2809977605908 77.0209613427679 -20.7399635821771 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0114924518376415 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 122186268 C/T 1 13 2 15 6.04671876766678 1.06973557420511 4.97698319346167 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0094603210285478 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 122186317 G/A 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G A G 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123344021 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123343973_123344083:HIP1R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123461462 C/T 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 T:C C T 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000111325:ENST00000406539:exon_123461418_123461517:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000397389:exon_123461418_123461517:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000420319:exon_123461418_123461708:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000228922:exon_123461418_123461517:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000454694:exon_123461418_123461517:OGFOD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 50 50 100 23.2566106448723 26.7433893551277 -3.4867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485090653079281 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123649894 A/G 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G A G 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123649849_123650024:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123649849_123650024:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123649849_123650024:MPHOSPH9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 14 28 42 6.51185098056423 14.9762980388715 -8.46444705830731 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0123876194020050 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 35 37 72 16.2796274514106 19.7901081227945 -3.51048067138396 T:C C T 10 0.534867787102555 0.411201241860440 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 31 23 54 14.4190985998208 12.3019591033588 2.11713949646203 A:G G A 10 0.534867787102555 0.588078831678685 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 123825559 C/T 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123825535_123825635:SBNO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124209332 T/C 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124209201_124209338:ATP6V0A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124210782 T/C 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 T:C T C 10 0.534867787102555 0.467707552599743 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124210744_124210832:ATP6V0A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124241506 C/T 1 26 30 56 12.0934375353336 16.0460336130766 -3.95259607774308 T:C C T 10 0.534867787102555 0.348496632513094 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124241362_124241533:ATP6V0A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 56 47 103 26.0474039222569 25.1387859938201 0.908617928436833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.921404923950429 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 21 32 53 9.76777647084634 17.1157691872818 -7.34799271643542 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0530761630853906 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125263061 C/T 1 143 186 329 66.5139064443346 99.4854084010752 -32.9715019567406 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000314702341940454 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 104 68 172 48.3737501413343 36.3710095229737 12.0027406183605 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0670464167892857 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125437142 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125441182 A/G 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G A G 10 0.534867787102555 0.782378955473899 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125441347 T/C 1 36 31 67 16.744759664308 16.5809014001792 0.163858264128816 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 34 30 64 15.8144952385131 16.0460336130766 -0.231538374563518 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 125621375 G/A 1 69 49 118 32.0941226899237 26.2085215680252 5.88560112189851 A:G G A 10 0.534867787102555 0.31019763767666 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125621208_125621410:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125621208_125621410:AACS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132490820 G/A 1 8 15 23 3.72105770317956 8.02301680653832 -4.30195910335876 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0934089262926932 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132490657_132490847:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132490657_132490847:EP400 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132491322 A/G 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132491245_132491422:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132491245_132491422:EP400 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132508389 A/G 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 A:G A G 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132508322_132508486:EP400 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132527986 G/A 1 35 35 70 16.2796274514106 18.7203725485894 -2.44074509717885 A:G G A 10 0.534867787102555 0.632074809096646 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132527849_132528007:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132527849_132528007:EP400 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132552040 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 54 29 83 25.117139496462 15.5111658259741 9.60597367048794 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0365705055178988 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132625105 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 20 30 50 9.3026442579489 16.0460336130766 -6.74338935512775 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0649812387906103 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 31 24 55 14.4190985998208 12.8368268904613 1.58227170935947 T:C T C 10 0.534867787102555 0.687666146215246 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132627365 G/A 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132627273_132627423:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132627273_132627423:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132628281 C/T 1 28 8 36 13.0237019611285 4.27894229682044 8.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00391873368553786 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132628240_132628454:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132628240_132628454:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132628285 G/A 1 29 8 37 13.4888341740259 4.27894229682044 9.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00256750084894314 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132628240_132628454:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132628240_132628454:DDX51 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132635521 T/C 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 70 60 130 32.5592549028212 32.0920672261533 0.467187676667855 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 25 26 51 11.6283053224361 13.9065624646664 -2.27825714223031 T:C T C 10 0.534867787102555 0.575443123850368 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 15 23 38 6.97698319346167 12.3019591033588 -5.32497590989709 T:C T C 10 0.534867787102555 0.103178696618192 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133238076 T/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 165 195 360 76.7468151280784 104.299218484998 -27.5524033569198 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00426617992697143 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 58 57 115 26.9776683480518 30.4874638648456 -3.50979551679383 A:G G A 10 0.534867787102555 0.514611607730349 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 34 41 75 15.8144952385131 21.9295792712048 -6.11508403269162 A:G G A 10 0.534867787102555 0.165953069838820 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 24 19 43 11.1631731095387 10.1624879549485 1.00068515459013 T:C C T 10 0.534867787102555 0.87873815611304 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 34 27 61 15.8144952385131 14.441430251769 1.37306498674415 A:G G A 10 0.534867787102555 0.797833397796188 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 28 35 63 13.0237019611285 18.7203725485894 -5.69667058746096 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.165368594487974 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 12 133732636 G/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G G A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000090612:ENST00000248211:exon_133732089_133736047:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000426665:exon_133732089_133733554:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000402932:exon_133732533_133733497:ZNF268 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 460 7 467 213.960817932825 3.74407450971789 210.216743423107 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 7.92644048086612e-113 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 21562371 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21562020_21563443:LATS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 239 231 470 111.166598882489 123.55445882069 -12.3878599382008 T:C C T 10 0.534867787102555 0.267107182592884 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 43 0 43 20.0006851545901 0 20.0006851545901 C C 10 0.534867787102555 2.31968874314460e-12 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 A:G A G 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 23929095 T/C 1 25 24 49 11.6283053224361 12.8368268904613 -1.2085215680252 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.775494637865315 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 23930055 A/T 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 A:T A T 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 24243200 T/C 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 T:C T C 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/C 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 T:C T C 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 25889592 C/T 1 14 21 35 6.51185098056423 11.2322235291537 -4.72037254858943 T:C C T 10 0.534867787102555 0.127664441951459 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25889495_25889605:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000394327:exon_25889495_25889605:NUPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 330 252 582 153.493630256157 134.786682349844 18.706947906313 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 0.12422750268252 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 346 294 640 160.935745662516 157.251129408151 3.68461625436478 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.781599154682817 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 28851332 G/A 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.633644945334357 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 28862066 A/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 29005437 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000102755:ENST00000282397:exon_29005273_29005447:FLT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 29012442 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000102755:ENST00000282397:exon_29012358_29012482:FLT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 31205563 A/G 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000132952:ENST00000465952:exon_31204972_31205611:USPL1;ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31204972_31205611:USPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 32937526 G/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32937316_32937670:BRCA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 10 16 26 4.65132212897445 8.55788459364088 -3.90656246466643 T:C T C 10 0.534867787102555 0.167762406474111 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 7 21 28 3.25592549028211 11.2322235291537 -7.97629803887154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00364685597819974 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 33704290 G/A 1 19 1 20 8.83751204505145 0.534867787102555 8.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000129377122287014 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 34409603 T/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:T:G T G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 35 25 60 16.2796274514106 13.3716946775639 2.9079327738467 C:G G C 10 0.534867787102555 0.518133848928286 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 51 62 113 23.7217428577697 33.1618028003584 -9.44005994258871 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0891822114290118 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 60 55 115 27.9079327738467 29.4177282906405 -1.50979551679383 A:G A G 10 0.534867787102555 0.780063037609595 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 60 50 110 27.9079327738467 26.7433893551277 1.16454341871895 A:C A C 10 0.534867787102555 0.848882240566003 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 59 58 117 27.4428005609493 31.0223316519482 -3.57953109099893 T:C T C 10 0.534867787102555 0.517775535560819 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 39621994 A/G 1 18 13 31 8.37237983215401 6.95328123233322 1.41909859982079 A:G A G 10 0.534867787102555 0.719657099436856 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 41331026 C/G 1 32 20 52 14.8842308127182 10.6973557420511 4.18687507066714 C:G C G 10 0.534867787102555 0.267966894460082 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 19 33 52 8.83751204505145 17.6506369743843 -8.81312492933286 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0174608194288521 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 42793479 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000102780:ENST00000337343:exon_42793366_42793485:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000261491:exon_42793366_42793485:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000379274:exon_42793366_42793485:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000498255:exon_42793366_42793485:DGKH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 42803263 T/C 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000102780:ENST00000337343:exon_42803235_42803886:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000261491:exon_42803235_42803888:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000379274:exon_42803235_42803888:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000498255:exon_42803235_42803420:DGKH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 42803341 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000102780:ENST00000337343:exon_42803235_42803886:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000261491:exon_42803235_42803888:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000379274:exon_42803235_42803888:DGKH;ENSG00000102780:ENST00000498255:exon_42803235_42803420:DGKH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 36 49 85 16.744759664308 26.2085215680252 -9.46376190371717 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0496925390653421 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 34 42 76 15.8144952385131 22.4644470583073 -6.64995181979418 A:C A C 10 0.534867787102555 0.135621612520926 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 46708291 T/C 1 675 734 1409 313.964243705775 392.592955733275 -78.6287120275 T:C:G T C 10 0.534867787102555 3.0441413009358e-05 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46708262_46708385:LCP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 24 37 61 11.1631731095387 19.7901081227945 -8.62693501325586 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0290997703971459 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 74 79 153 34.4197837544109 42.2545551811018 -7.83477142669091 T:C C T 10 0.534867787102555 0.224130185557513 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 48664518 T/C 1 75 41 116 34.8849159673084 21.9295792712048 12.9553366961036 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0195745619772276 ENSG00000136146:ENST00000258648:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378594:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378586:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000487937:exon_48664488_48664554:MED4;ENSG00000136146:ENST00000417167:exon_48664488_48664554:MED4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 49070345 C/T 1 22 29 51 10.2329086837438 15.5111658259741 -5.2782571422303 T:C C T 10 0.534867787102555 0.160461526154757 ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49070327_49070457:RCBTB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50095127 A/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50095030_50095169:PHF11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 117 107 224 54.4204689090011 57.2308532199734 -2.81038431097232 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.737843817698206 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50123649 G/A 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50123688 G/T 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:G G T 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50134099 T/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C T C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50134054_50134220:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50134054_50134220:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50134150 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50134054_50134220:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50134054_50134220:RCBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 T:C T C 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 52313195 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 53 41 94 24.6520072835646 21.9295792712048 2.72242801235983 C:G G C 10 0.534867787102555 0.606144725711761 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 40 56 96 18.6052885158978 29.9525960777431 -11.3473075618453 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0239774220776075 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 73409497 G/A 1 3 11 14 1.39539663869233 5.8835456581281 -4.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.028188018724604 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73409381_73409506:PIBF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 74339104 G/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000118922:ENST00000377669:exon_74339075_74339137:KLF12;ENSG00000118922:ENST00000377666:exon_74339075_74339137:KLF12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 8 52 60 3.72105770317956 27.8131249293329 -24.0920672261533 A:G G A 10 0.534867787102555 1.16790450432608e-10 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 80 2 82 37.2105770317956 1.06973557420511 36.1408414575905 A:G G A 10 0.534867787102555 1.66419945657902e-19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 76395464 C/T 1 1 15 16 0.465132212897445 8.02301680653832 -7.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000137979024454918 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 76409436 A/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000485987:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000524651:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525107:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525914:exon_76409369_76409475:LMO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 76416034 G/A 1 8 20 28 3.72105770317956 10.6973557420511 -6.97629803887154 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0123321069248147 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525914:exon_76415764_76416119:LMO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 79929326 G/A 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.286983398886570 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.317451841975924 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 80911525 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000136158:ENST00000377104:exon_80910111_80911891:SPRY2;ENSG00000136158:ENST00000377102:exon_80910111_80911891:SPRY2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 95264604 C/T 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95264444_95264644:GPR180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 95273447 G/A 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95273332_95273489:GPR180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 95278288 A/G 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G A G 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95278220_95278297:GPR180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 95673863 G/A 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95672083_95673936:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95672085_95673936:ABCC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 96412459 C/A 1 18 19 37 8.37237983215401 10.1624879549485 -1.79010812279454 A:T:C C A 10 0.534867787102555 0.62221830024311 ENSG00000102580:ENST00000376795:exon_96412294_96412475:DNAJC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 173 93 266 80.467872831258 49.7427042005376 30.7251686307204 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.000166957023562728 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 33 23 56 15.3493630256157 12.3019591033588 3.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.425600976645615 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 103307360 G/A 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.286983398886570 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 72 51 123 33.489519328616 27.2782571422303 6.21126218638573 A:G A G 10 0.534867787102555 0.278771774056334 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 82 102 184 38.1408414575905 54.5565142844606 -16.4156728268701 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0178124463459561 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 21 45 66 9.76777647084634 24.069050419615 -14.3012739487686 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000473214976691911 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 71 92 163 33.0243871157186 49.2078364134351 -16.1834492977165 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0118846853237660 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 114 122 236 53.0250722703087 65.2538700265117 -12.228797756203 T:G T G 10 0.534867787102555 0.117357618693161 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 54 42 96 25.117139496462 22.4644470583073 2.65269243815472 A:G A G 10 0.534867787102555 0.610260646451036 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 43 44 87 20.0006851545901 23.5341826325124 -3.53349747792229 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.454042228201068 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 113889474 C/T 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.127818607776150 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114112389 T/C 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000150401:ENST00000375403:exon_114110134_114112423:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000332592:exon_114110134_114112423:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000478244:exon_114111362_114112423:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000482038:exon_114112112_114112423:DCUN1D2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.117636617366408 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 16 14 30 7.44211540635912 7.48814901943577 -0.0460336130766503 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114277541 C/T 1 40 42 82 18.6052885158978 22.4644470583073 -3.85915854240951 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438720405182939 ENSG00000198176:ENST00000475254:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000465174:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000408980:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000453989:exon_114277495_114277601:TFDP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114290957 C/T 1 102 110 212 47.4434857155394 58.8354565812811 -11.3919708657417 T:C C T 10 0.534867787102555 0.129697241697499 ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114290849_114291015:TFDP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114530114 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000183087:ENST00000480426:exon_114529969_114530137:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000357389:exon_114529969_114530137:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000355761:exon_114529969_114530137:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000450766:exon_114529969_114530137:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000327773:exon_114529969_114530137:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000418959:exon_114529969_114530137:GAS6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114531565 C/G 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 C:G C G 10 0.534867787102555 0.283655371776667 ENSG00000183087:ENST00000480426:exon_114531520_114531684:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000357389:exon_114531520_114531684:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000355761:exon_114531520_114531684:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000450766:exon_114531520_114531684:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000327773:exon_114531520_114531684:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000418959:exon_114531520_114531684:GAS6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114538581 G/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000183087:ENST00000357389:exon_114538486_114538608:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000355761:exon_114538486_114538608:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000450766:exon_114538486_114539017:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000327773:exon_114538486_114538608:GAS6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 20 43 63 9.3026442579489 22.9993148454099 -13.696670587461 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00057731222194407 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 189 198 387 87.9099882376171 105.903821846306 -17.9938336086888 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0743681433304491 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 46 43 89 21.3960817932825 22.9993148454099 -1.6032330521274 T:C T C 10 0.534867787102555 0.750811706156684 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 24 23 47 11.1631731095387 12.3019591033588 -1.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.771320179538871 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20850093 C/T 1 12 18 30 5.58158655476934 9.62762016784599 -4.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.147172704883020 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20851708 T/C 1 14 20 34 6.51185098056423 10.6973557420511 -4.18550476148687 T:C T C 10 0.534867787102555 0.170383372335278 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20851647_20851803:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20851647_20851803:TEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20852770 G/T 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:G G T 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852759_20852872:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852759_20852872:TEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20863677 C/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:C C A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20863609_20863786:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20863609_20863786:TEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 64 67 131 29.7684616254365 35.8361417358712 -6.06768011043471 T:C T C 10 0.534867787102555 0.294464197499120 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20916987 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 39 32 71 18.1401563030004 17.1157691872818 1.0243871157186 T:C T C 10 0.534867787102555 0.905410300782941 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20920340 A/G 1 12 18 30 5.58158655476934 9.62762016784599 -4.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.147172704883020 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 311 328 639 144.656118211105 175.436634169638 -30.7805159585326 A:T:G T G 10 0.534867787102555 0.0155174520417300 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21109141 C/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000181803:ENST00000320704:exon_21108855_21109850:OR6S1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21109278 A/T 1 1 11 12 0.465132212897445 5.8835456581281 -5.41841344523066 A:T A T 10 0.534867787102555 0.00206580726750062 ENSG00000181803:ENST00000320704:exon_21108855_21109850:OR6S1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21109385 C/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000181803:ENST00000320704:exon_21108855_21109850:OR6S1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21109726 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000181803:ENST00000320704:exon_21108855_21109850:OR6S1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 23 29 52 10.6980408966412 15.5111658259741 -4.81312492933286 A:G G A 10 0.534867787102555 0.210981106652534 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 36 38 74 16.744759664308 20.3249759098971 -3.58021624558907 T:C T C 10 0.534867787102555 0.416774247994278 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 48 63 111 22.3263462190774 33.696670587461 -11.3703243683836 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0359177839687218 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 78 63 141 36.2803126060007 33.696670587461 2.58364201853975 A:G G A 10 0.534867787102555 0.673978485258058 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 83 111 194 38.6059736704879 59.3703243683836 -20.7643506978957 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00309697832249647 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 21991626 C/G 1 2 9 11 0.93026442579489 4.81381008392299 -3.8835456581281 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0298728806961029 ENSG00000165821:ENST00000450879:exon_21990967_21993065:SALL2;ENSG00000165821:ENST00000327430:exon_21989234_21993788:SALL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 22972742 G/A 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.156760860097915 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 312 279 591 145.121250424003 149.228112601613 -4.10686217761 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.741631421990894 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 519 563 1082 241.403618493774 301.130564138738 -59.7269456449645 A:T:C:G T A 10 0.534867787102555 0.000284604350299121 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 26 38 64 12.0934375353336 20.3249759098971 -8.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0446495517878643 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 44 53 97 20.4658173674876 28.3479927164354 -7.88217534894783 T:C C T 10 0.534867787102555 0.126479469892877 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 85 95 180 39.5362380962828 50.8124397747427 -11.2762016784599 T:G G T 10 0.534867787102555 0.100132735082055 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 51 38 89 23.7217428577697 20.3249759098971 3.3967669478726 C:G G C 10 0.534867787102555 0.524161616608148 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 78 86 164 36.2803126060007 45.9986296908197 -9.71831708481902 T:C T C 10 0.534867787102555 0.137054072891614 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 C:G C G 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 31 18 49 14.4190985998208 9.62762016784599 4.79147843197481 A:G G A 10 0.534867787102555 0.197868690107406 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 45 33 78 20.930949580385 17.6506369743843 3.28031260600071 A:C C A 10 0.534867787102555 0.496788400815736 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 23945366 A/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 A:G A G 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24567508 T/C 1 62 56 118 28.8381971996416 29.9525960777431 -1.11439887810149 T:C T C 10 0.534867787102555 0.853970406146064 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24569418 A/G 1 90 59 149 41.8618991607701 31.5571994390507 10.3046997217193 A:G A G 10 0.534867787102555 0.100347575942469 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24612645 C/T 1 406 369 775 188.843678436363 197.366213440843 -8.52253500448012 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.540675642102862 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24612571_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24612575_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24612575_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000471700:exon_24612580_24612698:PSME2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 52 60 112 24.1868750706671 32.0920672261533 -7.90519215548616 T:C T C 10 0.534867787102555 0.155099088642810 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24647957 C/T 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24652473 G/A 1 88 67 155 40.9316347349752 35.8361417358712 5.09549299910397 A:G G A 10 0.534867787102555 0.42192122569819 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24652456_24652561:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24652456_24652561:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24652456_24652561:IPO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.560897834646131 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 31 24 55 14.4190985998208 12.8368268904613 1.58227170935947 T:C T C 10 0.534867787102555 0.687666146215246 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 53 52 105 24.6520072835646 27.8131249293329 -3.16111764576828 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.558138335941663 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24718515 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24761551 A/G 1 16 9 25 7.44211540635912 4.81381008392299 2.62830532243613 A:G A G 10 0.534867787102555 0.32219626972529 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 10 18 28 4.65132212897445 9.62762016784599 -4.97629803887154 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0863582676468199 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24775286 C/T 1 41 29 70 19.0704207287952 15.5111658259741 3.55925490282115 T:C C T 10 0.534867787102555 0.404737950456254 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21;ENSG00000136305:ENST00000258807:exon_24775153_24775343:CIDEB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 18 8 26 8.37237983215401 4.27894229682044 4.09343753533357 T:G G T 10 0.534867787102555 0.118905775759782 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 62 29 91 28.8381971996416 15.5111658259741 13.3270313736675 A:C A C 10 0.534867787102555 0.00599479112674947 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24901276 G/T 1 71 41 112 33.0243871157186 21.9295792712048 11.0948078445138 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0372112894693022 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 236 159 395 109.771202243797 85.0439781493062 24.7272240944908 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0133810011320201 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 239 231 470 111.166598882489 123.55445882069 -12.3878599382008 T:C T C 10 0.534867787102555 0.267107182592884 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 200 191 391 93.026442579489 102.159747336588 -9.13330475709901 C:G C G 10 0.534867787102555 0.361797393493789 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 101 75 176 46.9783535026419 40.1150840326916 6.86326946995032 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.326097196108334 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 39 11 50 18.1401563030004 5.8835456581281 12.2566106448723 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000529151491251909 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 33 10 43 15.3493630256157 5.34867787102555 10.0006851545901 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00204354526168129 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 112 58 170 52.0948078445138 31.0223316519482 21.0724761925656 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00119555952235498 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 111 59 170 51.6296756316164 31.5571994390507 20.0724761925656 A:T T A 10 0.534867787102555 0.00204346146849937 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 25281843 C/T 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000168952:ENST00000396700:exon_25278862_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000323944:exon_25278868_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000419632:exon_25281308_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000445298:exon_25281308_25281938:STXBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 31381351 T/C 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31381213_31381388:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31381213_31381388:STRN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 82 76 158 38.1408414575905 40.6499518197942 -2.50911036220369 A:G G A 10 0.534867787102555 0.690985626874039 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 24 29 53 11.1631731095387 15.5111658259741 -4.34799271643542 T:C C T 10 0.534867787102555 0.270799113477227 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 49 37 86 22.7914784319748 19.7901081227945 3.00137030918027 A:G G A 10 0.534867787102555 0.58912867413012 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35497285 T/C 1 14 10 24 6.51185098056423 5.34867787102555 1.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 0.686611403599214 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 42 70 112 19.5355529416927 37.4407450971788 -17.9051921554862 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000841725655930496 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 21 31 52 9.76777647084634 16.5809014001792 -6.81312492933286 C:G C G 10 0.534867787102555 0.070086525273581 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 170 165 335 79.0724761925656 88.2531848719216 -9.18070867935593 C:G C G 10 0.534867787102555 0.324463807248465 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 854 1064 1918 397.222909814418 569.099325477119 -171.876415662701 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 4.22030145100555e-15 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 567 568 1135 263.729964712851 303.804903074251 -40.0749383613999 A:G G A 10 0.534867787102555 0.017296230849896 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 36789729 T/G 1 13 8 21 6.04671876766678 4.27894229682044 1.76777647084634 T:G T G 10 0.534867787102555 0.515422591350918 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 36789775 A/T 0 12 0 12 5.58158655476934 0 5.58158655476934 A A 10 0.534867787102555 0.000650768675436711 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 36789795 G/A 0 11 0 11 5.1164543418719 0 5.1164543418719 G G 10 0.534867787102555 0.00124543481256921 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 39650234 A/T 1 491 435 926 228.379916532645 232.667487389611 -4.28757085696594 A:T:C A T 10 0.534867787102555 0.79216670625421 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 39650824 C/T 1 578 504 1082 268.846419054723 269.573364699688 -0.72694564496453 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.975692557542257 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 39650924 A/G 1 632 472 1104 293.963558551185 252.457595512406 41.5059630387793 A:T:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0122742869696873 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 39736680 T/C 1 17 12 29 7.90724761925657 6.41841344523066 1.4888341740259 T:C T C 10 0.534867787102555 0.710420076918619 ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39736328_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39736350_39736726:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39736618_39736726:CTAGE5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 17 16 33 7.90724761925657 8.55788459364088 -0.650636974384315 A:G A G 10 0.534867787102555 0.862618803515972 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 45564466 A/T 1 22 30 52 10.2329086837438 16.0460336130766 -5.81312492933286 A:T A T 10 0.534867787102555 0.125872179355328 ENSG00000185246:ENST00000452548:exon_45564424_45564766:PRPF39;ENSG00000185246:ENST00000477626:exon_45564424_45564766:PRPF39;ENSG00000185246:ENST00000355765:exon_45564424_45564766:PRPF39;ENSG00000185246:ENST00000424478:exon_45564424_45564766:PRPF39 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 45665468 C/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 C:G C G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45665375_45665750:FANCM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 50136314 C/G 1 9 11 20 4.18618991607701 5.8835456581281 -1.6973557420511 C:G C G 10 0.534867787102555 0.505457236744248 ENSG00000100479:ENST00000216367:exon_50136242_50136316:POLE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 15 17 32 6.97698319346167 9.09275238074344 -2.11576918728176 T:G G T 10 0.534867787102555 0.482440833418438 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 38 38 76 17.6750240901029 20.3249759098971 -2.64995181979418 T:C C T 10 0.534867787102555 0.566653594293032 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 20 11 31 9.3026442579489 5.8835456581281 3.4190985998208 T:C C T 10 0.534867787102555 0.280160698846182 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 C:G G C 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 51228682 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 37 33 70 17.2098918772055 17.6506369743843 -0.440745097178851 A:C:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 54417522 A/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000125378:ENST00000245451:exon_54416454_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000417573:exon_54416457_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000395600:exon_54416457_54417606:BMP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 87 52 139 40.4665025220777 27.8131249293329 12.6533775927449 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0334316705419284 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 71 75 146 33.0243871157186 40.1150840326916 -7.09069691697303 A:C A C 10 0.534867787102555 0.246337605801567 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55611839 A/T 1 364 296 660 169.30812549467 158.320864982356 10.9872605123137 A:T:G A T 10 0.534867787102555 0.412568027158553 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55611834_55612147:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55611834_55612126:LGALS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 22 32 54 10.2329086837438 17.1157691872818 -6.88286050353797 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0753266202915047 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 57 59 116 26.5125361351544 31.5571994390507 -5.04466330389638 T:C C T 10 0.534867787102555 0.353569740680315 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 16 23 39 7.44211540635912 12.3019591033588 -4.85984369699965 T:C T C 10 0.534867787102555 0.147945765478062 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55818403 T/C 1 4 23 27 1.86052885158978 12.3019591033588 -10.441430251769 T:C T C 10 0.534867787102555 5.10375677756946e-05 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 32 22 54 14.8842308127182 11.7670913162562 3.11713949646203 A:T T A 10 0.534867787102555 0.416220945230801 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 28 30 58 13.0237019611285 16.0460336130766 -3.02233165194819 T:C T C 10 0.534867787102555 0.433122346217458 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 57099859 G/A 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000070269:ENST00000261556:exon_57099713_57099889:C14orf101 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 59105188 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59104774_59105265:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59104897_59105265:DACT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 59112732 C/T 1 18 10 28 8.37237983215401 5.34867787102555 3.02370196112846 T:C C T 10 0.534867787102555 0.263663248503772 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60574539 A/G 1 16 15 31 7.44211540635912 8.02301680653832 -0.580901400179204 A:G A G 10 0.534867787102555 0.85880988898277 ENSG00000126773:ENST00000391611:exon_60574304_60577875:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60574304_60575045:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60574357_60575045:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60581863 G/A 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60581935 C/T 1 18 12 30 8.37237983215401 6.41841344523066 1.95396638692335 T:C C T 10 0.534867787102555 0.583877163454243 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60582053 G/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G G A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 16 19 35 7.44211540635912 10.1624879549485 -2.72037254858943 A:G A G 10 0.534867787102555 0.398922124839835 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 63 36 99 29.303329412539 19.255240335692 10.0480890768471 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0441872771039888 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 61924239 G/A 1 35 14 49 16.2796274514106 7.48814901943577 8.79147843197481 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0141756175739395 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 61924241 A/C 1 35 15 50 16.2796274514106 8.02301680653832 8.25661064487225 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0226010026560296 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 61997226 C/T 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61997125_61997313:PRKCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 107 88 195 49.7691467800266 47.0683652650248 2.70078151500178 T:C C T 10 0.534867787102555 0.720050159312149 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 105 104 209 48.8388823542317 55.6262498586657 -6.787367504434 T:G G T 10 0.534867787102555 0.367557169014371 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 20 18 38 9.3026442579489 9.62762016784599 -0.324975909897089 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 56 55 111 26.0474039222569 29.4177282906405 -3.37032436838361 A:G A G 10 0.534867787102555 0.568339082238408 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 68 100 168 31.6289904770263 53.4867787102555 -21.8577882332292 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00083659807578945 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 65417070 C/A 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 A:C C A 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000139998:ENST00000267512:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000436278:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000533601:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000426039:exon_65417043_65417132:RAB15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 67799568 G/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G G A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000072415:ENST00000261681:exon_67799497_67802535:MPP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 68249499 C/T 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68249497_68250242:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68249497_68250242:ZFYVE26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 68264867 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68264731_68265339:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68264731_68265339:ZFYVE26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 139 164 303 64.6533775927449 87.718317084819 -23.0649394920742 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00806296219774648 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 69347632 C/T 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.130339312190040 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69347527_69347706:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69347527_69347706:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69347527_69347706:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69347527_69347706:ACTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 3 11 14 1.39539663869233 5.8835456581281 -4.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.028188018724604 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 69356932 G/T 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 T:G G T 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69356856_69357003:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69356856_69357003:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69356856_69357003:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69356856_69357003:ACTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 69704553 G/T 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 T:G G T 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000081177:ENST00000409018:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000193422:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000492815:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409014:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000312994:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409675:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409949:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409242:exon_69704292_69704648:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000449989:exon_69704292_69704648:EXD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 40 44 84 18.6052885158978 23.5341826325124 -4.92889411661462 A:C A C 10 0.534867787102555 0.324967471349038 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 73418490 T/C 1 2 13 15 0.93026442579489 6.95328123233322 -6.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00279922196728933 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 73735366 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000100767:ENST00000340738:exon_73735265_73735431:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000216658:exon_73735265_73735431:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000427855:exon_73735265_73735431:PAPLN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 36 30 66 16.744759664308 16.0460336130766 0.698726051231372 A:G G A 10 0.534867787102555 0.90225057193937 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 29 23 52 13.4888341740259 12.3019591033588 1.18687507066714 T:C C T 10 0.534867787102555 0.782290155077286 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 37 35 72 17.2098918772055 18.7203725485894 -1.51048067138396 A:G G A 10 0.534867787102555 0.724818172761761 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:T A T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G G A 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 77492192 A/C 1 61 42 103 28.3730649867441 22.4644470583073 5.90861792843683 A:C A C 10 0.534867787102555 0.277298994434033 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 9 19 28 4.18618991607701 10.1624879549485 -5.97629803887154 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0352385485799502 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 78021754 T/A 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78021643_78021862:SPTLC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 99 137 236 46.0480890768471 73.27688683305 -27.228797756203 A:C C A 10 0.534867787102555 0.000409700588602226 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 57 64 121 26.5125361351544 34.2315383745635 -7.71900223940916 T:C C T 10 0.534867787102555 0.171884937440745 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 49 92 141 22.7914784319748 49.2078364134351 -26.4163579814603 A:C A C 10 0.534867787102555 9.21751898173254e-06 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 A:G G A 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 21 22 43 9.76777647084634 11.7670913162562 -1.99931484540986 T:C T C 10 0.534867787102555 0.545487574291049 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 91792386 A/G 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91792254_91792400:CCDC88C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 A:G A G 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 92601731 A/G 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000165934:ENST00000298875:exon_92601711_92601840:CPSF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 71 120 191 33.0243871157186 64.1841344523066 -31.159747336588 T:C C T 10 0.534867787102555 8.1219357184827e-06 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 93180727 A/G 1 63 51 114 29.303329412539 27.2782571422303 2.02507227030873 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.778347682591566 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93180721_93180796:LGMN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 C:G C G 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 24 35 59 11.1631731095387 18.7203725485894 -7.55719943905074 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0509575654467338 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 27 11 38 12.558569748231 5.8835456581281 6.67502409010291 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0340178667108358 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 19 8 27 8.83751204505145 4.27894229682044 4.55856974823101 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0851029413105759 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 94595564 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 A:G A G 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 95786115 C/T 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95786048_95786245:CLMN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 95884323 G/A 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 A:G G A 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 95906023 G/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95905949_95906121:C14orf49 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 95906321 G/A 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95906251_95906412:C14orf49 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 216 129 345 100.468557985848 68.9979445362296 31.4706134496185 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000661114019019907 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102549336 A/T 1 41 45 86 19.0704207287952 24.069050419615 -4.99862969081973 A:T A T 10 0.534867787102555 0.282212943051902 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102549873 G/A 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223630477495032 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 332 424 756 154.423894681952 226.783941731483 -72.3600470495316 A:G G A 10 0.534867787102555 1.41682246373994e-07 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 A:G G A 10 0.534867787102555 0.582705672158879 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102805598 C/A 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:C C A 10 0.534867787102555 0.156760860097915 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 102901201 A/G 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G A G 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 104128498 T/C 1 134 96 230 62.3277165282576 51.3473075618453 10.9804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.164971564717905 ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000452929:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000334553:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000380038:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000443396:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000348520:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000246489:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000347839:exon_104128453_104128531:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000389744:exon_104128453_104128531:C14orf153 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 104167075 C/T 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 C:G C G 10 0.534867787102555 0.117636617366408 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 35 31 66 16.2796274514106 16.5809014001792 -0.301273948768628 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 118 74 192 54.8856011218985 39.5802162455891 15.3053848763094 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0297650209941222 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 142 146 288 66.0487742314372 78.090696916973 -12.0419226855358 A:G G A 10 0.534867787102555 0.156741194852317 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 106053975 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 106066690 A/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:C A C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 1278 287 1565 594.438968082935 153.507054898433 440.931913184501 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 6.4411962426389e-121 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 106330067 C/T 1 190 184 374 88.3751204505145 98.4156728268701 -10.0405523763556 T:C C T 10 0.534867787102555 0.300361559846463 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 7086 5 7091 3295.9268605913 2.67433893551277 3293.25252165578 A:G A G 10 0.534867787102555 0 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 22840279 G/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22840244_22840340:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22840244_22840340:TUBGCP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 23006707 C/A 1 141 141 282 65.5836420185397 75.4163579814603 -9.8327159629205 A:C C A 10 0.534867787102555 0.256743376267922 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23004684_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23005349_23006855:NIPA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 74 74 148 34.4197837544109 39.5802162455891 -5.16043249117814 T:C C T 10 0.534867787102555 0.410639389730571 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 23052632 T/C 1 10 17 27 4.65132212897445 9.09275238074344 -4.44143025176899 T:C T C 10 0.534867787102555 0.121195259221721 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23052595_23052755:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23052595_23052755:NIPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.49300969037024 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 31234064 C/T 1 49 45 94 22.7914784319748 24.069050419615 -1.27757198764017 T:C C T 10 0.534867787102555 0.836432958535203 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31233769_31235308:FAN1;ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31231144_31234275:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31231144_31234275:MTMR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 31267147 C/T 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000340566:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000314404:exon_31267134_31267206:MTMR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 22 31 53 10.2329086837438 16.5809014001792 -6.34799271643541 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0978139501966362 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34542872 C/G 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34544468 C/T 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34544371_34544585:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34544371_34544585:SLC12A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34551082 G/A 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34551014_34551145:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34551014_34551145:SLC12A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 652 13 665 303.266202809134 6.95328123233322 296.312921576801 C:G C G 10 0.534867787102555 2.68425447787004e-155 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 704 56 760 327.453077879801 29.9525960777431 297.500481802058 A:G G A 10 0.534867787102555 6.68211362210199e-125 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 678 61 739 315.359640344468 32.6269350132559 282.732705331212 T:C:G T C 10 0.534867787102555 7.76736788967144e-115 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 35274561 T/C 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 45 43 88 20.930949580385 22.9993148454099 -2.06836526502484 A:C A C 10 0.534867787102555 0.670417319619812 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 A:G A G 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40764549 G/A 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 A:G G A 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000169105:ENST00000306243:exon_40763213_40765351:CHST14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 111 61 172 51.6296756316164 32.6269350132559 19.0027406183605 A:T T A 10 0.534867787102555 0.00362844928022211 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 29 24 53 13.4888341740259 12.8368268904613 0.652007283564584 T:C C T 10 0.534867787102555 0.891245156874754 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40913840 G/T 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 T:G G T 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40914177 T/C 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40914772 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40915045 T/G 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 T:G T G 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40915190 A/G 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 40915894 T/C 1 4 14 18 1.86052885158978 7.48814901943577 -5.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00877625850336129 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 41104874 G/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 41188211 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41188136_41188277:VPS18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 41191514 A/G 1 18 18 36 8.37237983215401 9.62762016784599 -1.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.739410883730553 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41191342_41193212:VPS18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 9 16 25 4.18618991607701 8.55788459364088 -4.37169467756387 A:C C A 10 0.534867787102555 0.107280657645491 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 43481401 C/T 1 44 18 62 20.4658173674876 9.62762016784599 10.8381971996416 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00702703914042077 ENSG00000166946:ENST00000300213:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000407066:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000356633:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000444658:exon_43481397_43481478:CCNDBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 43531411 G/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 C:G G C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43531361_43531464:TGM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 44053617 C/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 44158549 A/G 1 23 28 51 10.6980408966412 14.9762980388715 -4.27825714223031 A:G A G 10 0.534867787102555 0.262010186623264 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44158326_44160617:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44158326_44159216:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000478130:exon_44158326_44159216:WDR76 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 45695169 G/A 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 49170727 T/C 1 498 507 1005 231.635842022928 271.177968060995 -39.5421260380678 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0124922324532248 ENSG00000255302:ENST00000530028:exon_49170298_49172190:EID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 51791559 A/G 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000104093:ENST00000251076:exon_51790749_51792428:DMXL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 51829812 G/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000104093:ENST00000251076:exon_51829685_51829956:DMXL2;ENSG00000104093:ENST00000449909:exon_51829685_51829956:DMXL2;ENSG00000104093:ENST00000436119:exon_51829685_51829956:DMXL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 51914716 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000104093:ENST00000251076:exon_51914656_51914949:DMXL2;ENSG00000104093:ENST00000449909:exon_51914656_51914967:DMXL2;ENSG00000104093:ENST00000436119:exon_51914656_51914832:DMXL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52350879 T/C 1 58 48 106 26.9776683480518 25.6736537809226 1.30401456712917 T:C T C 10 0.534867787102555 0.845870534581483 ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52350830_52350994:MAPK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52643564 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52643451_52643678:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52643451_52643678:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52643451_52643678:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52643451_52643678:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52643451_52643678:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399228:exon_52643451_52643678:MYO5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 17 10 27 7.90724761925657 5.34867787102555 2.55856974823102 T:C T C 10 0.534867787102555 0.342606221663184 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 58471368 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103569:ENST00000219919:exon_58471327_58471544:AQP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59323048 C/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59323003_59323901:RNF111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59350746 G/A 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59350555_59350749:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59350555_59350749:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59350555_59350749:RNF111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59415761 T/C 1 79 82 161 36.7454448188982 43.8591585424095 -7.11371372351135 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.269444330281493 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59415716_59415826:CCNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59499179 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000171989:ENST00000307144:exon_59499042_59500705:LDHAL6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59499228 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171989:ENST00000307144:exon_59499042_59500705:LDHAL6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59499274 C/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:C C A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000171989:ENST00000307144:exon_59499042_59500705:LDHAL6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 22 33 55 10.2329086837438 17.6506369743843 -7.41772829064053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0575088695074937 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59784493 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000157470:ENST00000288228:exon_59784470_59784588:FAM81A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 59911456 G/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000140297:ENST00000396065:exon_59910378_59913023:GCNT3;ENSG00000140297:ENST00000267857:exon_59910378_59912202:GCNT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 42 31 73 19.5355529416927 16.5809014001792 2.95465154151348 T:G T G 10 0.534867787102555 0.55780756296182 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 60742063 G/T 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:G G T 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 174 141 315 80.9330050441554 75.4163579814603 5.51664706269518 A:G G A 10 0.534867787102555 0.572270314174415 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 66793795 G/A 1 349 552 901 162.331142301208 295.24701848061 -132.915876179402 A:G G A 10 0.534867787102555 6.87832181532859e-19 ENSG00000174444:ENST00000307961:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000432669:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000436058:exon_66793713_66793842:RPL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 66794352 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 68468098 A/G 1 27 19 46 12.558569748231 10.1624879549485 2.39608179328247 A:G A G 10 0.534867787102555 0.555169282411363 ENSG00000033800:ENST00000249636:exon_68467975_68468105:PIAS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 68489810 G/T 1 33 32 65 15.3493630256157 17.1157691872818 -1.76640616166608 T:G G T 10 0.534867787102555 0.709786262786337 ENSG00000129007:ENST00000478113:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000448060:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395463:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467188:exon_68489778_68490088:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467889:exon_68489778_68489966:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68489778_68489966:CALML4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 68497597 G/A 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 A:G G A 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000129007:ENST00000478113:exon_68497583_68497636:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395465:exon_68497583_68498417:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000448060:exon_68497583_68497826:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395463:exon_68497583_68498387:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467889:exon_68497583_68497899:CALML4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 68503962 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 68504207 G/A 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 A:G G A 10 0.534867787102555 0.710213463318711 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 69728530 A/C 1 17 18 35 7.90724761925657 9.62762016784599 -1.72037254858942 A:C A C 10 0.534867787102555 0.613096775748172 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728477_69728600:KIF23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 70351755 G/A 1 41 51 92 19.0704207287952 27.2782571422303 -8.20783641343506 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0945486746351709 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 38 28 66 17.6750240901029 14.9762980388715 2.69872605123137 T:C T C 10 0.534867787102555 0.538934134488819 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 71184495 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000129028:ENST00000249861:exon_71184183_71185098:THAP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 20 7 27 9.3026442579489 3.74407450971789 5.55856974823102 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0342724634414899 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 26 19 45 12.0934375353336 10.1624879549485 1.93094958038502 A:G A G 10 0.534867787102555 0.654567694556077 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 55 39 94 25.5822717093595 20.8598436969996 4.72242801235983 T:G G T 10 0.534867787102555 0.353082962105184 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 40 72 112 18.6052885158978 38.510480671384 -19.9051921554862 C:G G C 10 0.534867787102555 0.000193606829724855 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 310 248 558 144.190985998208 132.647211201434 11.5437747967743 A:G G A 10 0.534867787102555 0.329445919990933 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 236 229 465 109.771202243797 122.484723246485 -12.7135210026881 A:G G A 10 0.534867787102555 0.245277969226591 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 142 106 248 66.0487742314372 56.6959854328708 9.35278879856637 A:G G A 10 0.534867787102555 0.251935943348952 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 457 401 858 212.565421294132 214.481982628125 -1.91656133399221 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.918234409521469 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 75091664 G/A 1 425 374 799 197.681190481414 200.040552376356 -2.35936189494146 A:G G A 10 0.534867787102555 0.88720880923418 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 411 467 878 191.16933950085 249.783256576893 -58.6139170760433 T:C C T 10 0.534867787102555 8.50236165051711e-05 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 48 1 49 22.3263462190774 0.534867787102555 21.7914784319748 T:C T C 10 0.534867787102555 3.63090230652061e-12 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 116 95 211 53.9553366961036 50.8124397747427 3.14289692136089 T:G T G 10 0.534867787102555 0.679361934453528 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 76630303 T/C 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000159556:ENST00000290759:exon_76630119_76630308:ISL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 77450964 C/T 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000173517:ENST00000312493:exon_77450845_77451038:AC087465.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 77472951 A/G 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:G A G 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000173517:ENST00000312493:exon_77471132_77474382:AC087465.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 44 50 94 20.4658173674876 26.7433893551277 -6.27757198764017 T:C T C 10 0.534867787102555 0.214894950849925 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78458638 C/T 1 102 79 181 47.4434857155394 42.2545551811018 5.18893053443755 T:C C T 10 0.534867787102555 0.456871042123947 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78567853 G/T 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:G G T 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000140403:ENST00000394855:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000343789:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000394852:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000446172:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000493321:exon_78567339_78568070:DNAJA4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 70 64 134 32.5592549028212 34.2315383745635 -1.67228347174237 T:C C T 10 0.534867787102555 0.795395941671939 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78764285 A/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 26 29 55 12.0934375353336 15.5111658259741 -3.41772829064053 T:C C T 10 0.534867787102555 0.417652545684435 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 78882925 G/A 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78882147_78882978:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78882147_78882978:CHRNA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 79186584 T/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 A:C A C 10 0.534867787102555 0.718154822973439 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 81600995 A/G 1 167 164 331 77.6770795538733 87.718317084819 -10.0412375309457 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.270998783610249 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81600946_81605102:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81600946_81605102:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81600946_81605102:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81600946_81606399:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81600946_81601139:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81600946_81605102:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81600946_81601432:IL16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 6 17 23 2.79079327738467 9.09275238074344 -6.30195910335877 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0108449056970403 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 22 33 55 10.2329086837438 17.6506369743843 -7.41772829064053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0575088695074937 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 17 26 43 7.90724761925657 13.9065624646664 -5.99931484540987 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0914706133810334 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 T:C T C 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 13 6 19 6.04671876766678 3.20920672261533 2.83751204505145 T:C T C 10 0.534867787102555 0.251280044543956 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 13 17 30 6.04671876766678 9.09275238074344 -3.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.277867988592941 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 A:G G A 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 T:C C T 10 0.534867787102555 0.582705672158879 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 21 14 35 9.76777647084634 7.48814901943577 2.27962745141057 C:G C G 10 0.534867787102555 0.500016160638516 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 20 15 35 9.3026442579489 8.02301680653832 1.27962745141058 A:G G A 10 0.534867787102555 0.736175658421399 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86124968 G/A 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 19 11 30 8.83751204505145 5.8835456581281 2.95396638692335 A:G G A 10 0.534867787102555 0.360554133907767 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 58 61 119 26.9776683480518 32.6269350132559 -5.64926666520404 A:G G A 10 0.534867787102555 0.312961874120518 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 46 43 89 21.3960817932825 22.9993148454099 -1.6032330521274 A:G A G 10 0.534867787102555 0.750811706156684 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 22 35 57 10.2329086837438 18.7203725485894 -8.48746386484563 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0327081211074883 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89421327 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89421405 G/A 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89422286 C/T 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89422198_89422500:HAPLN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89430506 C/T 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89430406_89430576:HAPLN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 89450587 G/T 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89450426_89450607:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89450426_89450607:MFGE8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:T T A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:C C A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90293776 A/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166823:ENST00000300057:exon_90293740_90294541:MESP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 29 23 52 13.4888341740259 12.3019591033588 1.18687507066714 T:C T C 10 0.534867787102555 0.782290155077286 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90768271 C/T 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 13 17 30 6.04671876766678 9.09275238074344 -3.04603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.277867988592941 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 A:C C A 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 22 13 35 10.2329086837438 6.95328123233322 3.27962745141058 T:C C T 10 0.534867787102555 0.310936148514570 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91428290 C/T 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000182511:ENST00000416779:exon_91428267_91428402:FES;ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000470152:exon_91428267_91428643:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000481665:exon_91428267_91428759:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000452243:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000443697:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91428276_91428488:FES HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91430436 T/C 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 T:C T C 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000497945:exon_91430417_91430605:FES HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 91454424 C/T 1 60 50 110 27.9079327738467 26.7433893551277 1.16454341871895 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.848882240566003 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454401_91454468:MAN2A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 99670989 T/C 1 14 3 17 6.51185098056423 1.60460336130767 4.90724761925656 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0256258939466012 ENSG00000182253:ENST00000336292:exon_99669572_99675770:SYNM;ENSG00000182253:ENST00000328642:exon_99669572_99672018:SYNM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 32 20 52 14.8842308127182 10.6973557420511 4.18687507066714 C:G G C 10 0.534867787102555 0.267966894460082 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 100332215 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 T:C T C 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 29 19 48 13.4888341740259 10.1624879549485 3.32634621907736 T:C T C 10 0.534867787102555 0.386320023455734 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 19 13 32 8.83751204505145 6.95328123233322 1.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.59619639942853 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 18 10 28 8.37237983215401 5.34867787102555 3.02370196112846 A:G G A 10 0.534867787102555 0.263663248503772 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101605632 G/A 1 29 32 61 13.4888341740259 17.1157691872818 -3.62693501325585 A:G G A 10 0.534867787102555 0.370965362889193 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101605350_101605685:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 53 32 85 24.6520072835646 17.1157691872818 7.53623809628283 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104121276466825 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101718106 G/A 1 26 33 59 12.0934375353336 17.6506369743843 -5.55719943905075 A:G G A 10 0.534867787102555 0.153102980532014 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101718190 C/T 1 21 23 44 9.76777647084634 12.3019591033588 -2.53418263251242 T:C C T 10 0.534867787102555 0.454162488009604 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101718529 T/C 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 T:C T C 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101718950 T/C 1 16 21 37 7.44211540635912 11.2322235291537 -3.79010812279454 T:C T C 10 0.534867787102555 0.249243671719291 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 101827855 C/T 1 8 16 24 3.72105770317956 8.55788459364088 -4.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.063870553184595 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 19 13 32 8.83751204505145 6.95328123233322 1.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.59619639942853 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 314829 C/T 1 34 44 78 15.8144952385131 23.5341826325124 -7.71968739399929 T:C C T 10 0.534867787102555 0.088634873633442 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 38 29 67 17.6750240901029 15.5111658259741 2.16385826412881 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.625950975924369 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 47 73 120 21.8612140061799 39.0453484584865 -17.1841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00179403783292940 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 426769 G/A 1 34 23 57 15.8144952385131 12.3019591033588 3.51253613515436 A:G G A 10 0.534867787102555 0.425902691218509 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426544_426812:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426544_426812:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426544_426812:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 37 40 77 17.2098918772055 21.3947114841022 -4.18481960689673 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.361895692453231 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 35 34 69 16.2796274514106 18.1855047614869 -1.9058773100763 T:C T C 10 0.534867787102555 0.717635739719066 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 53 31 84 24.6520072835646 16.5809014001792 8.07110588338538 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0808223587567276 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 427866 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 449162 T/C 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 19 23 42 8.83751204505145 12.3019591033588 -3.46444705830731 C:G G C 10 0.534867787102555 0.353511036769694 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 219 253 472 101.86395462454 135.321550136946 -33.457595512406 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00229114541830505 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 511421 G/C 1 29 19 48 13.4888341740259 10.1624879549485 3.32634621907736 C:G G C 10 0.534867787102555 0.386320023455734 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_511404_511497:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000413925:exon_511404_511497:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_511404_511497:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_511404_511497:RAB11FIP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 39 46 85 18.1401563030004 24.6039182067175 -6.46376190371717 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.191666659531499 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 723017 G/A 1 104 83 187 48.3737501413343 44.3940263295121 3.97972381182221 A:G G A 10 0.534867787102555 0.607979755232681 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722928_723130:RHOT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 19 8 27 8.83751204505145 4.27894229682044 4.55856974823101 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0851029413105759 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 774120 G/A 1 33 36 69 15.3493630256157 19.255240335692 -3.9058773100763 A:G G A 10 0.534867787102555 0.398470411907974 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774106_774205:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774106_774205:CCDC78 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 53 39 92 24.6520072835646 20.8598436969996 3.79216358656494 T:C C T 10 0.534867787102555 0.465153988041292 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 127 114 241 59.0717910379755 60.9749277296913 -1.90313669171576 T:C T C 10 0.534867787102555 0.846450899800522 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 71 68 139 33.0243871157186 36.3710095229737 -3.34662240725515 A:G G A 10 0.534867787102555 0.61017483372157 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 61 64 125 28.3730649867441 34.2315383745635 -5.85847338781938 A:G A G 10 0.534867787102555 0.324112760594222 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 24 25 49 11.1631731095387 13.3716946775639 -2.2085215680252 T:C C T 10 0.534867787102555 0.568276069584453 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 840599 C/T 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840531_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840525_840805:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840525_840671:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840525_840666:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 841175 C/T 1 34 35 69 15.8144952385131 18.7203725485894 -2.90587731007629 T:C C T 10 0.534867787102555 0.546598572635806 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_841161_841370:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 26 26 52 12.0934375353336 13.9065624646664 -1.81312492933286 A:G A G 10 0.534867787102555 0.677331176291186 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 43 70 113 20.0006851545901 37.4407450971788 -17.4400599425887 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00124749574553230 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 847936 C/T 1 40 41 81 18.6052885158978 21.9295792712048 -3.32429075530695 T:C C T 10 0.534867787102555 0.504411177777365 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 66 55 121 30.6987260512314 29.4177282906405 1.28099776059084 A:G G A 10 0.534867787102555 0.855623523458813 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 904551 G/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_903638_904706:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_903638_904706:LMF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 T:C C T 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1412005 C/T 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.404857079120053 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 19 44 63 8.83751204505145 23.5341826325124 -14.696670587461 A:T T A 10 0.534867787102555 0.000211887302978912 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 36 21 57 16.744759664308 11.2322235291537 5.51253613515436 C:G G C 10 0.534867787102555 0.146985583530713 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 36 20 56 16.744759664308 10.6973557420511 6.04740392225692 A:G A G 10 0.534867787102555 0.109771481230035 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 23 20 43 10.6980408966412 10.6973557420511 0.000685154590135184 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1551674 G/A 1 30 31 61 13.9539663869233 16.5809014001792 -2.62693501325585 A:G G A 10 0.534867787102555 0.522970828867368 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1551664_1551774:TELO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1812972 G/C 1 47 50 97 21.8612140061799 26.7433893551277 -4.88217534894784 C:G G C 10 0.534867787102555 0.359792977746012 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1814391 T/C 1 57 66 123 26.5125361351544 35.3012739487686 -8.78873781361427 T:C T C 10 0.534867787102555 0.124298545737885 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 61 72 133 28.3730649867441 38.510480671384 -10.1374156846398 A:G A G 10 0.534867787102555 0.082347692837199 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1817754 A/G 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1817768 T/G 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 T:G T G 10 0.534867787102555 0.462678051587108 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1818152 C/T 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.130339312190040 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 100 101 201 46.5132212897445 54.0216464973581 -7.50842520761356 C:G G C 10 0.534867787102555 0.289905460567637 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1818680 G/C 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 337 336 673 156.749555746439 179.715576466458 -22.9660207200195 A:T:C T A 10 0.534867787102555 0.0819834000528573 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1822159 T/C 1 346 273 619 160.935745662516 146.018905878998 14.9168397835184 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.242615484351641 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1821891_1822514:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1823024 G/T 1 201 154 355 93.4915747923864 82.3696392137935 11.121935578593 T:G G T 10 0.534867787102555 0.242181422282628 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1822800_1823156:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1822800_1823151:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1822800_1823151:MRPS34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1825774 T/C 1 13 5 18 6.04671876766678 2.67433893551277 3.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.155287650432156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1826023 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 101 72 173 46.9783535026419 38.510480671384 8.46787283125798 T:C T C 10 0.534867787102555 0.222583158990407 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1836709 G/C 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 C:G G C 10 0.534867787102555 0.33925294722777 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 117 94 211 54.4204689090011 50.2775719876402 4.14289692136089 C:G C G 10 0.534867787102555 0.581532773634761 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 121 123 244 56.2809977605908 65.7887378136143 -9.50774005302342 T:C T C 10 0.534867787102555 0.223501131020307 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1877698 C/G 1 39 37 76 18.1401563030004 19.7901081227945 -1.64995181979418 C:G C G 10 0.534867787102555 0.731051442964933 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 1877913 C/G 1 50 47 97 23.2566106448723 25.1387859938201 -1.88217534894784 C:G C G 10 0.534867787102555 0.760315490578168 ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2011126 A/G 1 5 16 21 2.32566106448723 8.55788459364088 -6.23222352915366 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00767990017471512 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2014283 A/G 1 281 41 322 130.702151824182 21.9295792712048 108.772572552977 A:G A G 10 0.534867787102555 2.67671400015968e-38 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 39 83 122 18.1401563030004 44.3940263295121 -26.2538700265117 C:G C G 10 0.534867787102555 1.80783505645721e-06 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2025651 C/T 1 41 37 78 19.0704207287952 19.7901081227945 -0.71968739399929 T:C C T 10 0.534867787102555 0.90986386711268 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2028319 C/T 1 96 68 164 44.6526924381547 36.3710095229737 8.28168291518097 T:C C T 10 0.534867787102555 0.210582736815740 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2131788 G/A 1 29 38 67 13.4888341740259 20.3249759098971 -6.83614173587119 A:G G A 10 0.534867787102555 0.110941764167790 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2131596_2131799:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2131596_2131799:TSC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2152619 C/T 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000487932:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000415938:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000483731:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000496574:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000486339:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000471603:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000480227:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000474088:exon_2152382_2152634:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000475889:exon_2152381_2152634:PKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2160494 C/T 1 28 17 45 13.0237019611285 9.09275238074344 3.93094958038502 T:C C T 10 0.534867787102555 0.295641477437011 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2158253_2161872:PKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2223142 G/A 0 14 0 14 6.51185098056423 0 6.51185098056423 G G 10 0.534867787102555 0.000179023136675139 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2378609 G/A 0 22 0 22 10.2329086837438 0 10.2329086837438 G G 10 0.534867787102555 1.09916716282950e-06 ENSG00000167972:ENST00000301732:exon_2378454_2378758:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000382381:exon_2378454_2378758:ABCA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2579575 G/A 1 21 16 37 9.76777647084634 8.55788459364088 1.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.743605069618952 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000293971:exon_2579476_2579731:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000429721:exon_2579476_2579731:AMDHD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 219 211 430 101.86395462454 112.857103078639 -10.9931484540986 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.288060363410056 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 313 260 573 145.5863826369 139.065624646664 6.52075799023598 A:G A G 10 0.534867787102555 0.615331993388151 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 322 301 623 149.772572552977 160.995203917869 -11.2226313648918 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.377042548688463 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 370 338 708 172.098918772055 180.785312040664 -8.68639326860895 A:G G A 10 0.534867787102555 0.521997537091160 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 581 515 1096 270.241815693416 275.456910357816 -5.21509466440028 A:T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.76208592419283 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 T:C C T 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 35 61 96 16.2796274514106 32.6269350132559 -16.3473075618453 C:G C G 10 0.534867787102555 0.000971835560245154 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 92 64 156 42.7921635865649 34.2315383745635 8.56062521200142 T:G G T 10 0.534867787102555 0.173370136972644 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3075999 C/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 C:G C G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 0 0 9 9 0 4.81381008392299 -4.81381008392299 T C T 10 0.534867787102555 0.00101903185420343 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 35 64 99 16.2796274514106 34.2315383745635 -17.9519109231529 C:G C G 10 0.534867787102555 0.000370877362123616 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 109 108 217 50.6994112058215 57.7657210070759 -7.06630980125443 C:G G C 10 0.534867787102555 0.341503486502165 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4513722 G/A 1 85 69 154 39.5362380962828 36.9058773100763 2.63036078620653 A:G G A 10 0.534867787102555 0.687048347704859 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4513661_4513851:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4513661_4513851:NMRAL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4723451 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 11 20 31 5.1164543418719 10.6973557420511 -5.5809014001792 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0485659015153771 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 T:C C T 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 4815602 T/C 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 T:C T C 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4815566_4816077:ZNF500 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 C:G G C 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 10574796 C/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 10574813 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 76 88 164 35.3500481802058 47.0683652650248 -11.718317084819 A:G A G 10 0.534867787102555 0.071754332065009 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 10995850 G/T 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 0.156760860097915 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 56 60 116 26.0474039222569 32.0920672261533 -6.04466330389638 A:G G A 10 0.534867787102555 0.265513422629193 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 A:G G A 10 0.534867787102555 0.728215546943111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11114006 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11114074 G/A 1 11 21 32 5.1164543418719 11.2322235291537 -6.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0336201434294546 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11114050_11114182:CLEC16A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 8 29 37 3.72105770317956 15.5111658259741 -11.7901081227945 A:C A C 10 0.534867787102555 9.90672879677734e-05 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 103 75 178 47.9086179284368 40.1150840326916 7.79353389574521 T:C C T 10 0.534867787102555 0.259937278310281 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 112 80 192 52.0948078445138 42.7894229682044 9.30538487630944 T:C C T 10 0.534867787102555 0.19291211333124 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 42 31 73 19.5355529416927 16.5809014001792 2.95465154151348 A:C A C 10 0.534867787102555 0.55780756296182 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 398 395 793 185.122620733183 211.272775905509 -26.1501551723261 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.06417417166997 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 76 51 127 35.3500481802058 27.2782571422303 8.07179103797551 A:G G A 10 0.534867787102555 0.155648295635476 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 163 131 294 75.8165507022835 70.0676801104347 5.74887059184883 A:G G A 10 0.534867787102555 0.520452800414967 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 12061674 G/A 1 103 79 182 47.9086179284368 42.2545551811018 5.65406274733499 A:G G A 10 0.534867787102555 0.41450463303455 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 26 23 49 12.0934375353336 12.3019591033588 -0.208521568025196 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:C C A 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 C:G C G 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15128416 A/G 1 3 15 18 1.39539663869233 8.02301680653832 -6.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00173486078588228 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 70 70 140 32.5592549028212 37.4407450971788 -4.8814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.445927917589164 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 63 44 107 29.303329412539 23.5341826325124 5.76914678002662 A:G A G 10 0.534867787102555 0.286943012972726 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 62 55 117 28.8381971996416 29.4177282906405 -0.579531090998934 T:G G T 10 0.534867787102555 0.926399434679348 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 21 35 56 9.76777647084634 18.7203725485894 -8.95259607774308 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0219307963570735 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15711335 G/A 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000166783:ENST00000396368:exon_15711156_15711392:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000321370:exon_15711156_15711392:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000344181:exon_15711156_15711392:KIAA0430 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15718591 G/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15793639 C/T 1 164 102 266 76.281682915181 54.5565142844606 21.7251686307204 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00812288991574806 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15809117 C/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15809021_15809129:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15809021_15809129:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15809021_15809129:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15809021_15809129:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15809021_15809129:MYH11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 56 29 85 26.0474039222569 15.5111658259741 10.5362380962828 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0224593548289875 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 61 71 132 28.3730649867441 37.9756128842814 -9.60254789753726 A:G G A 10 0.534867787102555 0.097782649014834 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 62 57 119 28.8381971996416 30.4874638648456 -1.64926666520405 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78328528313014 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 16162019 T/C 1 19 33 52 8.83751204505145 17.6506369743843 -8.81312492933286 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0174608194288521 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16162013_16162159:ABCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 17228368 G/A 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 18827693 T/C 1 31 23 54 14.4190985998208 12.3019591033588 2.11713949646203 T:C T C 10 0.534867787102555 0.588078831678685 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18827624_18827851:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18827624_18827851:SMG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 29 15 44 13.4888341740259 8.02301680653832 5.46581736748758 T:C T C 10 0.534867787102555 0.129809414676413 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 18839496 G/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 18847416 G/A 1 24 25 49 11.1631731095387 13.3716946775639 -2.2085215680252 A:G G A 10 0.534867787102555 0.568276069584453 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18847255_18847534:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18847255_18847534:SMG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 18908268 C/T 1 25 29 54 11.6283053224361 15.5111658259741 -3.88286050353797 T:C C T 10 0.534867787102555 0.339846679833752 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000532700:exon_18908115_18908278:SMG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 19548740 A/G 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 A:G A G 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 19590444 T/C 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19590307_19590450:C16orf62 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 39 34 73 18.1401563030004 18.1855047614869 -0.0453484584865151 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 20796387 G/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20796306_20796429:ACSM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 20873767 T/G 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 T:G T G 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000188215:ENST00000324344:exon_20873430_20873965:DCUN1D3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 21531457 T/C 1 30 14 44 13.9539663869233 7.48814901943577 6.46581736748758 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0685300198694608 ENSG00000233959:ENST00000435197:exon_21531021_21531686:SLC7A5P2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 21531473 G/A 1 32 6 38 14.8842308127182 3.20920672261533 11.6750240901029 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000114794372754540 ENSG00000233959:ENST00000435197:exon_21531021_21531686:SLC7A5P2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 21666714 C/T 1 75 67 142 34.8849159673084 35.8361417358712 -0.951225768562814 T:C C T 10 0.534867787102555 0.932997474373803 ENSG00000197006:ENST00000358154:exon_21666548_21668794:METTL9;ENSG00000197006:ENST00000396014:exon_21666551_21668791:METTL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 421 466 887 195.820661629824 249.248388789791 -53.4277271599663 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000354930244907246 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 22237273 C/G 1 29 24 53 13.4888341740259 12.8368268904613 0.652007283564584 C:G C G 10 0.534867787102555 0.891245156874754 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 23647492 T/C 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.677574073699258 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23646183_23647655:PALB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 48 87 135 22.3263462190774 46.5334974779223 -24.2071512588449 A:G A G 10 0.534867787102555 3.03435686729586e-05 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 71 54 125 33.0243871157186 28.882860503538 4.14152661218063 A:G A G 10 0.534867787102555 0.474400518842085 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 24104188 C/T 1 57 55 112 26.5125361351544 29.4177282906405 -2.90519215548616 T:C C T 10 0.534867787102555 0.635995646321318 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498739:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000482000:exon_24104111_24104268:PRKCB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 60 51 111 27.9079327738467 27.2782571422303 0.629675631616394 T:C C T 10 0.534867787102555 0.924476433991263 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 24582703 A/G 1 87 81 168 40.4665025220777 43.324290755307 -2.85778823322924 A:G A G 10 0.534867787102555 0.699138140863185 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 133 114 247 61.8625843153602 60.9749277296913 0.887656585668914 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.94916817510027 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 45 69 114 20.930949580385 36.9058773100763 -15.9749277296913 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00342795650508917 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 48 54 102 22.3263462190774 28.882860503538 -6.55651428446061 T:C T C 10 0.534867787102555 0.198300886920347 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 20 17 37 9.3026442579489 9.09275238074344 0.209891877205465 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 27356224 G/A 1 14 18 32 6.51185098056423 9.62762016784599 -3.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.291464382713898 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 28844683 G/A 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 130 121 251 60.4671876766678 64.7190022394091 -4.2518145627413 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.612943487765399 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 28997997 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000213658:ENST00000395461:exon_28997978_28998035:LAT;ENSG00000213658:ENST00000354453:exon_28997978_28998035:LAT;ENSG00000213658:ENST00000454369:exon_28997978_28998035:LAT;ENSG00000213658:ENST00000395456:exon_28997978_28998035:LAT;ENSG00000213658:ENST00000360872:exon_28997861_28998035:LAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 29 22 51 13.4888341740259 11.7670913162562 1.7217428577697 T:G G T 10 0.534867787102555 0.675251656578433 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30097630 C/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000149922:ENST00000395224:exon_30097082_30097759:TBX6;ENSG00000149922:ENST00000279386:exon_30097117_30097759:TBX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 19 13 32 8.83751204505145 6.95328123233322 1.88423081271824 T:C C T 10 0.534867787102555 0.59619639942853 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30455945 A/C 1 178 169 347 82.7935338957452 90.3926560203318 -7.59912212458659 A:C A C 10 0.534867787102555 0.419959237870688 ENSG00000179918:ENST00000478753:exon_30454952_30457186:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000418751:exon_30454960_30456787:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000500504:exon_30455702_30457048:SEPHS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30492819 T/C 1 19 12 31 8.83751204505145 6.41841344523066 2.41909859982079 T:C T C 10 0.534867787102555 0.472368301269853 ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30492760_30492905:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30492760_30492905:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30492760_30492905:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30492760_30492905:ITGAL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 30982789 G/A 1 28 32 60 13.0237019611285 17.1157691872818 -4.0920672261533 A:G G A 10 0.534867787102555 0.302864422401248 ENSG00000099381:ENST00000262519:exon_30982699_30983040:SETD1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 31105528 C/T 1 13 1 14 6.04671876766678 0.534867787102555 5.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00244563697787340 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 50733859 C/G 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 C:G C G 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000527070:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000532206:exon_50733399_50733865:NOD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 50744988 C/T 1 26 20 46 12.0934375353336 10.6973557420511 1.39608179328247 T:C C T 10 0.534867787102555 0.768096535425017 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 50745583 T/G 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 T:G T G 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53283966 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53283783_53283978:CHD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53326860 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53326745_53326964:CHD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 20 28 48 9.3026442579489 14.9762980388715 -5.67365378092264 A:G A G 10 0.534867787102555 0.112059282315814 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53476621 A/G 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 A:G A G 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53476570_53476770:RBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53498223 A/T 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53498138_53498275:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53498138_53498275:RBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53503934 G/A 1 25 12 37 11.6283053224361 6.41841344523066 5.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0996233711949082 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 44 32 76 20.4658173674876 17.1157691872818 3.35004818020582 T:C T C 10 0.534867787102555 0.490856408316813 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 56500132 C/T 1 16 22 38 7.44211540635912 11.7670913162562 -4.32497590989709 T:C C T 10 0.534867787102555 0.193199775436703 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 56500176 T/A 1 25 31 56 11.6283053224361 16.5809014001792 -4.95259607774308 A:T T A 10 0.534867787102555 0.227663752153118 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 T:C T C 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 429 371 800 199.541719333004 198.435949015048 1.105770317956 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.943522483103952 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 31 17 48 14.4190985998208 9.09275238074344 5.32634621907736 A:G G A 10 0.534867787102555 0.147725523030221 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57071113 T/C 1 17 7 24 7.90724761925657 3.74407450971789 4.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 0.102993456137107 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57071107_57071196:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57071107_57071196:NLRC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 A:C C A 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 23 25 48 10.6980408966412 13.3716946775639 -2.67365378092264 T:C C T 10 0.534867787102555 0.471403908453889 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57108465 G/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57180158 C/A 1 5 17 22 2.32566106448723 9.09275238074344 -6.76709131625621 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00459392915020051 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57179997_57180233:CPNE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 519 470 989 241.403618493774 251.387859938201 -9.98424144442689 A:C:G A C 10 0.534867787102555 0.524008293000615 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 14 24 38 6.51185098056423 12.8368268904613 -6.32497590989709 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0499652956178817 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 C:G C G 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 13 18 31 6.04671876766678 9.62762016784599 -3.58090140017921 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.211610157714882 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 23 34 57 10.6980408966412 18.1855047614869 -7.48746386484564 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0620820702285725 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 1 12 13 0.465132212897445 6.41841344523066 -5.95328123233322 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00105395249296596 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58030741 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58035429 C/A 1 26 18 44 12.0934375353336 9.62762016784599 2.46581736748758 A:C C A 10 0.534867787102555 0.546085095617419 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58035305_58035485:C16orf57;ENSG00000103005:ENST00000423271:exon_58035305_58035485:C16orf57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 74 89 163 34.4197837544109 47.6032330521274 -13.1834492977165 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0411468288502492 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 89 89 178 41.3967669478726 47.6032330521274 -6.20646610425479 T:C C T 10 0.534867787102555 0.367678370325002 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 39 32 71 18.1401563030004 17.1157691872818 1.0243871157186 T:C C T 10 0.534867787102555 0.905410300782941 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 67037054 A/C 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:C A C 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000172824:ENST00000398354:exon_67036973_67037077:CES4A;ENSG00000172824:ENST00000326686:exon_67036973_67037077:CES4A;ENSG00000172824:ENST00000338718:exon_67036973_67037077:CES4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 67683546 A/T 1 57 59 116 26.5125361351544 31.5571994390507 -5.04466330389638 A:T A T 10 0.534867787102555 0.353569740680315 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 10 19 29 4.65132212897445 10.1624879549485 -5.5111658259741 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0607597508953381 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69008037 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_69007931_69008071:TMCO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69177189 T/C 1 33 33 66 15.3493630256157 17.6506369743843 -2.30127394876863 T:C T C 10 0.534867787102555 0.622236477713734 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69177081_69177292:CIRH1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 220 195 415 102.329086837438 104.299218484998 -1.97013164756032 A:G A G 10 0.534867787102555 0.844171329116964 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 23 36 59 10.6980408966412 19.255240335692 -8.55719943905074 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0267843456518256 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69400801 C/T 1 45 44 89 20.930949580385 23.5341826325124 -2.60323305212739 T:C C T 10 0.534867787102555 0.596560919537665 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69400710_69401102:TERF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69458591 C/T 1 149 115 264 69.3046997217193 61.5097955167938 7.79490420492548 T:C C T 10 0.534867787102555 0.354950462728073 ENSG00000103018:ENST00000512062:exon_69458428_69458760:CYB5B;ENSG00000103018:ENST00000307892:exon_69458428_69458760:CYB5B;ENSG00000103018:ENST00000514123:exon_69458522_69458760:CYB5B;ENSG00000103018:ENST00000515314:exon_69458581_69458760:CYB5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69458779 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.560897834646131 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69788534 C/T 1 86 87 173 40.0013703091803 46.5334974779223 -6.53212716874202 T:C C T 10 0.534867787102555 0.322899634018621 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69788497_69788629:NOB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 43 40 83 20.0006851545901 21.3947114841022 -1.39402632951207 T:C C T 10 0.534867787102555 0.826005417472682 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 70548219 A/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:T A T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 71318001 G/T 1 27 27 54 12.558569748231 14.441430251769 -1.88286050353797 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.682826750210596 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 29 32 61 13.4888341740259 17.1157691872818 -3.62693501325585 A:G G A 10 0.534867787102555 0.370965362889193 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 36 57 93 16.744759664308 30.4874638648456 -13.7427042005376 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00482782205374807 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 61 38 99 28.3730649867441 20.3249759098971 8.04808907684705 C:G C G 10 0.534867787102555 0.107976352340879 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 44 56 100 20.4658173674876 29.9525960777431 -9.4867787102555 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.070630453682387 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 37 27 64 17.2098918772055 14.441430251769 2.76846162543648 T:C T C 10 0.534867787102555 0.532175606636136 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 50 48 98 23.2566106448723 25.6736537809226 -2.41704313605039 A:G G A 10 0.534867787102555 0.685668244937308 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 55 55 110 25.5822717093595 29.4177282906405 -3.83545658128105 A:C C A 10 0.534867787102555 0.503778812298234 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72828403 A/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72829630 A/G 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72831652 G/A 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 72991660 C/G 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 C:G C G 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72991326_72994093:ZFHX3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:T A T 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 25 10 35 11.6283053224361 5.34867787102555 6.27962745141058 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0409555683117259 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 74706349 T/C 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74705755_74706436:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74705755_74706436:MLKL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 40 37 77 18.6052885158978 19.7901081227945 -1.18481960689673 A:G G A 10 0.534867787102555 0.819818532682382 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 75276775 G/A 1 31 17 48 14.4190985998208 9.09275238074344 5.32634621907736 A:G G A 10 0.534867787102555 0.147725523030221 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 84 73 157 39.0711058833854 39.0453484584865 0.0257574248988632 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 75481561 T/C 1 17 22 39 7.90724761925657 11.7670913162562 -3.85984369699964 T:C T C 10 0.534867787102555 0.261257462020995 ENSG00000166822:ENST00000357613:exon_75476952_75481586:TMEM170A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 4 18 22 1.86052885158978 9.62762016784599 -7.76709131625621 T:G G T 10 0.534867787102555 0.000956309709783151 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 20 33 53 9.3026442579489 17.6506369743843 -8.34799271643542 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0268024138655322 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 77775672 A/G 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77775479_77776151:NUDT7;ENSG00000140876:ENST00000437314:exon_77775479_77776151:NUDT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 84520292 C/T 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 67 89 156 31.1638582641288 47.6032330521274 -16.4393747879986 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0100010037290141 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 85015541 G/A 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 A:G G A 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85015476_85015600:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85015476_85015600:ZDHHC7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 47 61 108 21.8612140061799 32.6269350132559 -10.7657210070759 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0425316460621109 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 60 77 137 27.9079327738467 41.1848196068967 -13.27688683305 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0257329182541246 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 87367681 C/T 1 30 25 55 13.9539663869233 13.3716946775639 0.582271709359475 T:C C T 10 0.534867787102555 0.893424698385427 ENSG00000103264:ENST00000311635:exon_87367492_87367892:FBXO31;ENSG00000103264:ENST00000219546:exon_87367492_87367892:FBXO31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 87445270 T/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 87782258 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 14 17 31 6.51185098056423 9.09275238074344 -2.58090140017921 A:G G A 10 0.534867787102555 0.373013327758721 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 87873247 A/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:C A C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:C C A 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88061150 C/T 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88061089_88061256:BANP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 66 81 147 30.6987260512314 43.324290755307 -12.6255647040756 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0387729202582679 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88776297 T/C 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C T C 10 0.534867787102555 0.366253001737291 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88779323 C/T 1 1 8 9 0.465132212897445 4.27894229682044 -3.81381008392299 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0151480982867498 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 29 35 64 13.4888341740259 18.7203725485894 -5.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.210749373638412 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88780023 G/A 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 53 58 111 24.6520072835646 31.0223316519482 -6.3703243683836 A:G A G 10 0.534867787102555 0.253540377702553 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88781225 T/C 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.78091676997055 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 40 38 78 18.6052885158978 20.3249759098971 -1.71968739399929 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.734110460310212 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88870967 T/C 1 81 59 140 37.675709244693 31.5571994390507 6.1185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.310435810888682 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 51 42 93 23.7217428577697 22.4644470583073 1.25729579946238 A:G A G 10 0.534867787102555 0.835715794018704 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 88926089 C/T 1 126 131 257 58.6066588250781 70.0676801104347 -11.4610212853566 T:C C T 10 0.534867787102555 0.168799140586314 ENSG00000167515:ENST00000301021:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L;ENSG00000167515:ENST00000452287:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L;ENSG00000167515:ENST00000427604:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 42 9 51 19.5355529416927 4.81381008392299 14.7217428577697 T:C C T 10 0.534867787102555 2.81941929597939e-05 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 39 6 45 18.1401563030004 3.20920672261533 14.930949580385 T:C T C 10 0.534867787102555 3.37497626605468e-06 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 37 0 37 17.2098918772055 0 17.2098918772055 G G 10 0.534867787102555 1.09970708437433e-10 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 40 3 43 18.6052885158978 1.60460336130767 17.0006851545901 T:C T C 10 0.534867787102555 2.92636157733414e-08 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 41 8 49 19.0704207287952 4.27894229682044 14.7914784319748 A:C C A 10 0.534867787102555 1.81636998160098e-05 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 27 18 45 12.558569748231 9.62762016784599 2.93094958038503 A:G G A 10 0.534867787102555 0.455527557949342 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 105 97 202 48.8388823542317 51.8821753489478 -3.04329299471611 A:G G A 10 0.534867787102555 0.672810073333148 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 113 113 226 52.5599400574113 60.4400599425887 -7.88011988517744 A:G G A 10 0.534867787102555 0.317240915045019 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89603268 C/T 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197912:ENST00000341316:exon_89603173_89604129:SPG7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89655221 G/A 1 1 10 11 0.465132212897445 5.34867787102555 -4.8835456581281 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0040341445028996 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89656251 T/C 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89661927 C/T 1 86 70 156 40.0013703091803 37.4407450971788 2.56062521200142 T:C C T 10 0.534867787102555 0.689176856588303 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 50 55 105 23.2566106448723 29.4177282906405 -6.16111764576828 C:G G C 10 0.534867787102555 0.241193826683097 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 154 106 260 71.6303607862065 56.6959854328708 14.9343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0712063438023887 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89782989 A/G 1 24 32 56 11.1631731095387 17.1157691872818 -5.95259607774308 A:G A G 10 0.534867787102555 0.139925924821152 ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89782870_89783032:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89782870_89783032:C16orf7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89800259 A/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:C A C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89807233 C/G 1 61 65 126 28.3730649867441 34.7664061616661 -6.39334117492193 C:G C G 10 0.534867787102555 0.283879295158215 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89807212_89807274:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89807212_89807274:FANCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89809319 T/C 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 T:C T C 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 25 17 42 11.6283053224361 9.09275238074344 2.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.444906406905715 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89849480 C/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89849415_89849510:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89849415_89849510:FANCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 T:C T C 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89954138 G/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89962394 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89964952 A/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 22 42 64 10.2329086837438 22.4644470583073 -12.2315383745635 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00245350248234806 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89971536 G/A 1 28 25 53 13.0237019611285 13.3716946775639 -0.347992716435416 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 89977604 G/A 1 151 148 299 70.2349641475142 79.1604324911781 -8.92546834366395 A:G G A 10 0.534867787102555 0.324371329912837 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89977488_89977792:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89977488_89977786:TCF25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 90099244 G/C 1 11 17 28 5.1164543418719 9.09275238074344 -3.97629803887154 C:G G C 10 0.534867787102555 0.183820235173765 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90099126_90099332:GAS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 21 9 30 9.76777647084634 4.81381008392299 4.95396638692335 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0979330585037194 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 22 10 32 10.2329086837438 5.34867787102555 4.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.109614610186624 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 673155 C/T 1 181 151 332 84.1889305344375 80.7650358524858 3.42389468195174 T:C C T 10 0.534867787102555 0.741400095535396 ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_673109_673195:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_673109_673195:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_673109_673195:GLOD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1359363 T/G 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 T:C:G T G 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000167193:ENST00000300574:exon_1359171_1359552:CRK;ENSG00000167193:ENST00000398970:exon_1359171_1359517:CRK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 140 88 228 65.1185098056423 47.0683652650248 18.0501445406175 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.0168278208514002 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 215 148 363 100.003425772951 79.1604324911781 20.8429932817725 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0308657088520869 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1377878 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1377884 C/T 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.405445014430087 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1456318 G/A 1 69 52 121 32.0941226899237 27.8131249293329 4.28099776059085 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.466566961504452 ENSG00000174238:ENST00000313486:exon_1456298_1456443:PITPNA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 34 33 67 15.8144952385131 17.6506369743843 -1.83614173587119 A:G G A 10 0.534867787102555 0.713751992946081 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1542153 G/A 1 14 1 15 6.51185098056423 0.534867787102555 5.97698319346167 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00136645481623119 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1542190 G/A 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:G G A 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1554770 A/G 1 167 188 355 77.6770795538733 100.55514397528 -22.878064421407 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0165500897752023 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1554708_1554847:PRPF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1559647 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1635614 T/C 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C T C 10 0.534867787102555 0.319398149927548 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 31 20 51 14.4190985998208 10.6973557420511 3.7217428577697 A:G A G 10 0.534867787102555 0.327574383903317 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 15 19 34 6.97698319346167 10.1624879549485 -3.18550476148687 A:G A G 10 0.534867787102555 0.304658030947817 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 40 30 70 18.6052885158978 16.0460336130766 2.55925490282115 T:C C T 10 0.534867787102555 0.551955007965208 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1678338 A/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:T A T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 12 19 31 5.58158655476934 10.1624879549485 -4.58090140017921 T:C T C 10 0.534867787102555 0.107516360440066 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 11 22 33 5.1164543418719 11.7670913162562 -6.65063697438431 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0230071913905036 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1684772 T/C 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.33925294722777 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1686410 T/C 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1686329_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1684986_1686452:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000476292:exon_1686404_1686452:SMYD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1690752 G/A 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1690716_1690898:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1690716_1690898:SMYD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 32 32 64 14.8842308127182 17.1157691872818 -2.23153837456352 C:G G C 10 0.534867787102555 0.617172870341794 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1731268 T/C 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1731155_1731300:SMYD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1733399 A/G 1 45 46 91 20.930949580385 24.6039182067175 -3.6729686263325 A:G A G 10 0.534867787102555 0.463040958782133 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1733266_1733420:RPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 68 78 146 31.6289904770263 41.7196873939993 -10.090696916973 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0974867445353539 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 49 36 85 22.7914784319748 19.255240335692 3.53623809628283 T:C T C 10 0.534867787102555 0.449362020498648 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:C C T 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 45 32 77 20.930949580385 17.1157691872818 3.81518039310327 T:G T G 10 0.534867787102555 0.424624601235448 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 37 44 81 17.2098918772055 23.5341826325124 -6.32429075530695 C:G C G 10 0.534867787102555 0.181279448876573 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 82 65 147 38.1408414575905 34.7664061616661 3.37443529592441 T:C T C 10 0.534867787102555 0.620104503017238 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 77 50 127 35.8151803931033 26.7433893551277 9.07179103797551 T:C T C 10 0.534867787102555 0.110032841134698 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2265113 C/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:C C A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 30 22 52 13.9539663869233 11.7670913162562 2.18687507066714 C:G C G 10 0.534867787102555 0.580323809477977 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2298615 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000070444:ENST00000174618:exon_2298169_2298748:MNT;ENSG00000070444:ENST00000404961:exon_2298169_2298748:MNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 103 77 180 47.9086179284368 41.1848196068967 6.72379832154009 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.331880428960448 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 26 44 70 12.0934375353336 23.5341826325124 -11.4407450971788 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00794264323621345 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3480447 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196689:ENST00000174621:exon_3480420_3480486:TRPV1;ENSG00000196689:ENST00000399759:exon_3480420_3480486:TRPV1;ENSG00000196689:ENST00000399756:exon_3480420_3480486:TRPV1;ENSG00000196689:ENST00000425167:exon_3480420_3480486:TRPV1;ENSG00000196689:ENST00000310522:exon_3480420_3480486:TRPV1;ENSG00000196689:ENST00000399752:exon_3480420_3480486:TRPV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3563963 C/G 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 C:G C G 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3627473 C/T 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 37 37 74 17.2098918772055 19.7901081227945 -2.58021624558907 A:G A G 10 0.534867787102555 0.562010524946188 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3947644 T/C 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 3968064 A/C 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3967655_3968123:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3967655_3968123:ZZEF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4058041 C/T 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000167740:ENST00000301391:exon_4057968_4058154:CYB5D2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4084608 C/T 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000185722:ENST00000341657:exon_4084549_4084667:ANKFY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4443756 C/T 1 59 55 114 27.4428005609493 29.4177282906405 -1.97492772969127 T:C C T 10 0.534867787102555 0.708607484190333 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4443643_4443779:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4443643_4443779:MYBBP1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 46 31 77 21.3960817932825 16.5809014001792 4.81518039310327 T:C C T 10 0.534867787102555 0.304390217001576 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 44 52 96 20.4658173674876 27.8131249293329 -7.34730756184528 A:G G A 10 0.534867787102555 0.151832499174984 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4712395 A/T 1 24 15 39 11.1631731095387 8.02301680653832 3.14015630300035 A:T A T 10 0.534867787102555 0.339229824273563 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712395_4712500:PLD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 25 22 47 11.6283053224361 11.7670913162562 -0.138785993820084 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4720469 C/T 1 14 18 32 6.51185098056423 9.62762016784599 -3.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.291464382713898 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4720441_4720554:PLD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 69 55 124 32.0941226899237 29.4177282906405 2.67639439928318 A:G G A 10 0.534867787102555 0.653467610182885 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4799897 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4835895 T/C 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185245:ENST00000438881:exon_4835894_4837179:GP1BA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4836973 A/G 1 13 15 28 6.04671876766678 8.02301680653832 -1.97629803887154 A:G A G 10 0.534867787102555 0.457008833838827 ENSG00000185245:ENST00000438881:exon_4835894_4837179:GP1BA;ENSG00000185245:ENST00000329125:exon_4835900_4837150:GP1BA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4849284 G/A 1 3699 4179 7878 1720.52405550765 2235.21248230158 -514.688426793928 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 3.93905400883809e-31 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4848947_4849292:PFN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 27 19 46 12.558569748231 10.1624879549485 2.39608179328247 A:G A G 10 0.534867787102555 0.555169282411363 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4863410 A/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G A G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 43 25 68 20.0006851545901 13.3716946775639 6.62899047702626 T:C T C 10 0.534867787102555 0.114884350245031 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4883045 C/T 1 45 38 83 20.930949580385 20.3249759098971 0.605973670487934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.912854685242112 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4883818 C/G 1 21 13 34 9.76777647084634 6.95328123233322 2.81449523851313 C:G C G 10 0.534867787102555 0.391595923439878 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4885982 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4886037 A/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 86 93 179 40.0013703091803 49.7427042005376 -9.74133389135735 A:G A G 10 0.534867787102555 0.154646328711504 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5085857 C/T 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000180626:ENST00000399604:exon_5082830_5087571:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000381752:exon_5083373_5086253:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000315777:exon_5085505_5086312:ZNF594;ENSG00000180626:ENST00000389222:exon_5085505_5086312:ZNF594 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 71 47 118 33.0243871157186 25.1387859938201 7.88560112189851 T:C T C 10 0.534867787102555 0.166124098195402 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 44 28 72 20.4658173674876 14.9762980388715 5.48951932861604 T:C C T 10 0.534867787102555 0.237240343640878 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5317492 C/A 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:C C A 10 0.534867787102555 0.243153570620483 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5356913 C/T 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5356900_5356988:DHX33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 48 37 85 22.3263462190774 19.7901081227945 2.53623809628282 T:C C T 10 0.534867787102555 0.589091000365816 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 67 63 130 31.1638582641288 33.696670587461 -2.53281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.661313762992138 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 100 91 191 46.5132212897445 48.6729686263325 -2.159747336588 A:G G A 10 0.534867787102555 0.772017728012543 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 73 62 135 33.9546515415135 33.1618028003584 0.792848741155076 A:G G A 10 0.534867787102555 0.931347873290351 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 45 44 89 20.930949580385 23.5341826325124 -2.60323305212739 T:C T C 10 0.534867787102555 0.596560919537665 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5440197 T/C 1 23 20 43 10.6980408966412 10.6973557420511 0.000685154590135184 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5440171_5440260:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 37 39 76 17.2098918772055 20.8598436969996 -3.64995181979418 C:G C G 10 0.534867787102555 0.422316569557216 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 1 32 4 36 14.8842308127182 2.13947114841022 12.744759664308 A:C A C 10 0.534867787102555 1.22056611312205e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6493198 T/C 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6493099_6493323:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6513329 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6513314_6513480:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6515387 A/G 1 10 1 11 4.65132212897445 0.534867787102555 4.1164543418719 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0138388269412908 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6515454 C/T 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 A:T T A 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 A:G A G 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:C:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6904934 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000108839:ENST00000251535:exon_6904921_6905130:ALOX12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 T:C C T 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6942111 G/T 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:G G T 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7254315 G/A 1 137 171 308 63.72311316695 91.4623915945369 -27.7392784275869 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00165059118195617 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7254269_7254318:ACAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7306727 A/G 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 A:G A G 10 0.534867787102555 0.603495869880734 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 39 27 66 18.1401563030004 14.441430251769 3.69872605123137 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.389424720403702 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 36 10 46 16.744759664308 5.34867787102555 11.3960817932825 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000601042065046888 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7474277 C/T 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 355 310 665 165.121935578593 165.809014001792 -0.687078423199097 C:G G C 10 0.534867787102555 0.96900270762536 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7490231 G/C 1 34 46 80 15.8144952385131 24.6039182067175 -8.7894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0563480270547025 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000423172:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490217_7490287:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000396501:exon_7490217_7490335:MPDU1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 5 18 23 2.32566106448723 9.62762016784599 -7.30195910335877 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00272248076234531 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 C:G G C 10 0.534867787102555 0.582705672158879 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 86 54 140 40.0013703091803 28.882860503538 11.1185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0624809311765514 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 7592373 C/G 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 C:G C G 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7589619_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7591795_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7591966_7592397:WRAP53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 T:C T C 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 30 43 73 13.9539663869233 22.9993148454099 -9.04534845848652 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0350867699002819 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 65 83 148 30.2335938383339 44.3940263295121 -14.1604324911781 T:G T G 10 0.534867787102555 0.020961925012208 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:T T A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 18 18 36 8.37237983215401 9.62762016784599 -1.25524033569198 T:G T G 10 0.534867787102555 0.739410883730553 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 143 84 227 66.5139064443346 44.9288941166146 21.58501232772 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.00416422449288022 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 142 88 230 66.0487742314372 47.0683652650248 18.9804089664124 A:G G A 10 0.534867787102555 0.012019919910638 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 58 58 116 26.9776683480518 31.0223316519482 -4.04466330389638 T:C T C 10 0.534867787102555 0.458072359978568 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 28 17 45 13.0237019611285 9.09275238074344 3.93094958038502 T:C C T 10 0.534867787102555 0.295641477437011 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 44 40 84 20.4658173674876 21.3947114841022 -0.928894116614618 T:C C T 10 0.534867787102555 0.912992386232974 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 24 16 40 11.1631731095387 8.55788459364088 2.6052885158978 T:C T C 10 0.534867787102555 0.432537075389397 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 25 15 40 11.6283053224361 8.02301680653832 3.6052885158978 T:C T C 10 0.534867787102555 0.271130131860466 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8700778 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8700982 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 8701799 G/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 37 37 74 17.2098918772055 19.7901081227945 -2.58021624558907 A:G G A 10 0.534867787102555 0.562010524946188 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 10536018 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000109063:ENST00000226209:exon_10535793_10536101:MYH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 10541515 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000109063:ENST00000226209:exon_10541360_10541749:MYH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 10543463 T/C 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C T C 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000109063:ENST00000226209:exon_10543313_10543568:MYH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 52 31 83 24.1868750706671 16.5809014001792 7.60597367048793 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0995467037640894 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 25 24 49 11.6283053224361 12.8368268904613 -1.2085215680252 A:G G A 10 0.534867787102555 0.775494637865315 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 A:G G A 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 15532277 G/A 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 36 43 79 16.744759664308 22.9993148454099 -6.25455518110185 C:G G C 10 0.534867787102555 0.176132029245724 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 231 213 444 107.44554117931 113.926838652844 -6.48129747353441 A:G A G 10 0.534867787102555 0.536758230407909 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 16 15 31 7.44211540635912 8.02301680653832 -0.580901400179204 T:G T G 10 0.534867787102555 0.85880988898277 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 41 53 94 19.0704207287952 28.3479927164354 -9.27757198764017 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0624406985669412 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 17179481 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17179349_17179497:COPS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 17250159 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000205309:ENST00000446264:exon_17250127_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000478373:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000379552:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000389022:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000470418:exon_17250119_17250172:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000483704:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000480529:exon_17250119_17250466:NT5M HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 A:C C A 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 17698254 G/A 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17697562_17700505:RAI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18167397 G/T 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18167684 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 A:G G A 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18574998 A/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:T A T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18575127 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18684642 G/T 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 T:G G T 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000171928:ENST00000476139:exon_18684627_18685862:FAM18B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 C:G C G 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 19284071 G/C 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 C:G G C 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000443215:exon_19283921_19284246:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000482850:exon_19283921_19284526:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 19284650 C/T 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 19286463 C/T 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19286391_19286856:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19286391_19286856:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19286391_19286857:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19286391_19286857:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19286391_19286857:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19286391_19286851:MAPK7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 20908325 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000124422:ENST00000463692:exon_20908241_20908463:USP22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 20911204 G/T 1 47 26 73 21.8612140061799 13.9065624646664 7.95465154151348 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0777124999794348 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000478443:exon_20911183_20911309:USP22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 38 27 65 17.6750240901029 14.441430251769 3.23359383833392 A:G G A 10 0.534867787102555 0.457114219017479 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 52 0 52 24.1868750706671 0 24.1868750706671 T T 10 0.534867787102555 7.70756948299588e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 52 1 53 24.1868750706671 0.534867787102555 23.6520072835646 T:G T G 10 0.534867787102555 2.76494762497800e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 55 0 55 25.5822717093595 0 25.5822717093595 G G 10 0.534867787102555 2.18745071520046e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 59 0 59 27.4428005609493 0 27.4428005609493 G G 10 0.534867787102555 1.49420008818412e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 58 0 58 26.9776683480518 0 26.9776683480518 C C 10 0.534867787102555 2.91209933436095e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 42 0 42 19.5355529416927 0 19.5355529416927 C C 10 0.534867787102555 4.39620275736202e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 62 0 62 28.8381971996416 0 28.8381971996416 C C 10 0.534867787102555 2.04787713967628e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21215446 C/T 0 16 0 16 7.44211540635912 0 7.44211540635912 C C 10 0.534867787102555 4.96684535967002e-05 ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 62 0 62 28.8381971996416 0 28.8381971996416 C C 10 0.534867787102555 2.04787713967628e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 56 0 56 26.0474039222569 0 26.0474039222569 C C 10 0.534867787102555 1.11423900661395e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 60 0 60 27.9079327738467 0 27.9079327738467 C C 10 0.534867787102555 7.68542208896138e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 67 0 67 31.1638582641288 0 31.1638582641288 G G 10 0.534867787102555 7.80492119918674e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 112 1 113 52.0948078445138 0.534867787102555 51.5599400574113 T:G G T 10 0.534867787102555 2.74598509730329e-29 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 190 190 380 88.3751204505145 101.624879549485 -13.2497590989709 T:C C T 10 0.534867787102555 0.181264962428561 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 26684849 A/G 1 36 22 58 16.744759664308 11.7670913162562 4.97766834805181 A:G A G 10 0.534867787102555 0.235911277647035 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26684646_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26684670_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26684694_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26684731_26684904:TMEM199 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 19 18 37 8.83751204505145 9.62762016784599 -0.790108122794535 A:G G A 10 0.534867787102555 0.869601768514842 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 27421108 C/T 1 97 1 98 45.1178246510522 0.534867787102555 44.5829568639496 T:C C T 10 0.534867787102555 2.18605294157175e-25 ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27420998_27421108:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27420999_27421108:MYO18A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 27438873 C/T 1 19 21 40 8.83751204505145 11.2322235291537 -2.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.526724673864191 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27438804_27438881:MYO18A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 27889963 C/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G C G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 27959264 G/A 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 A:G G A 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27952956_27959949:SSH2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 34 42 76 15.8144952385131 22.4644470583073 -6.64995181979418 A:G G A 10 0.534867787102555 0.135621612520926 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 29855661 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 30211496 C/T 1 39 28 67 18.1401563030004 14.9762980388715 3.16385826412882 T:C C T 10 0.534867787102555 0.464489323865927 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30211443_30211524:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30211443_30211524:UTP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 T:C T C 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 30477681 C/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:C C A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 23 29 52 10.6980408966412 15.5111658259741 -4.81312492933286 C:G G C 10 0.534867787102555 0.210981106652534 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:C A C 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 39 20 59 18.1401563030004 10.6973557420511 7.44280056094926 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0667865674476316 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 48 36 84 22.3263462190774 19.255240335692 3.07110588338538 A:G G A 10 0.534867787102555 0.514010524874699 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 37 59 96 17.2098918772055 31.5571994390507 -14.3473075618453 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00397122067343697 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 34943719 C/T 1 14 11 25 6.51185098056423 5.8835456581281 0.628305322436125 T:C C T 10 0.534867787102555 0.843631536270771 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35548136 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000132142:ENST00000353139:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000360679:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000394406:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000452074:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000361253:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000394407:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000335166:exon_35548061_35548216:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000427330:exon_35548061_35548216:ACACA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 19 15 34 8.83751204505145 8.02301680653832 0.81449523851313 T:C C T 10 0.534867787102555 0.864211607646382 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 T:C T C 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 30 46 76 13.9539663869233 24.6039182067175 -10.6499518197942 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0155914673568115 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 3 16 19 1.39539663869233 8.55788459364088 -7.16248795494855 C:G G C 10 0.534867787102555 0.000952239745626273 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 T:C T C 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 35990165 T/C 1 9 29 38 4.18618991607701 15.5111658259741 -11.3249759098971 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000248500933623843 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35990060_35990203:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35990060_35990203:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35990060_35990203:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35990060_35990203:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35990060_35990203:DDX52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 143 113 256 66.5139064443346 60.4400599425887 6.07384650174592 A:T:C A T 10 0.534867787102555 0.45294656214228 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 11 12 23 5.1164543418719 6.41841344523066 -1.30195910335877 T:G G T 10 0.534867787102555 0.677574073699258 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 55 58 113 25.5822717093595 31.0223316519482 -5.44005994258871 A:G A G 10 0.534867787102555 0.345718659397865 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 37681117 T/G 1 28 30 58 13.0237019611285 16.0460336130766 -3.02233165194819 T:G T G 10 0.534867787102555 0.433122346217458 ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37680927_37681138:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37680927_37681138:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37680927_37681138:CDK12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 37879588 A/G 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37879572_37879710:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37879572_37879710:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37879572_37879710:ERBB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 C:G C G 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 74 71 145 34.4197837544109 37.9756128842814 -3.55582912987047 A:G G A 10 0.534867787102555 0.561140677338075 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38020419 T/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_38020373_38020441:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_38020373_38020441:IKZF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38031674 C/T 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.127818607776150 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38031507_38031687:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38031507_38031687:ZPBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 43 19 62 20.0006851545901 10.1624879549485 9.83819719964159 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0149336992048296 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 49 26 75 22.7914784319748 13.9065624646664 8.88491596730838 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0484234534754816 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 28 42 70 13.0237019611285 22.4644470583073 -9.44074509717885 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0303163612663161 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38183090 G/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:G G T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000008838:ENST00000495586:exon_38182900_38183402:MED24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 38548889 G/A 1 80 76 156 37.2105770317956 40.6499518197942 -3.43937478799858 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.630262743604273 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548837_38548989:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548837_38548989:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548837_38548989:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548837_38548989:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548837_38548989:TOP2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 43 8 51 20.0006851545901 4.27894229682044 15.7217428577697 T:C T C 10 0.534867787102555 6.78978966525890e-06 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40263400 C/T 1 15 6 21 6.97698319346167 3.20920672261533 3.76777647084634 T:C C T 10 0.534867787102555 0.125795308975927 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40263314_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40263396_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000413196:exon_40263314_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000430773:exon_40263314_40263515:DHX58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40459562 A/G 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 127 102 229 59.0717910379755 54.5565142844606 4.5152767535149 T:C C T 10 0.534867787102555 0.596245202597282 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40706906 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000108786:ENST00000225929:exon_40706687_40707224:HSD17B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 55 66 121 25.5822717093595 35.3012739487686 -9.71900223940916 A:C C A 10 0.534867787102555 0.083338852835909 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 96 110 206 44.6526924381547 58.8354565812811 -14.1827641431263 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0504845000029228 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 57 41 98 26.5125361351544 21.9295792712048 4.58295686394961 A:G A G 10 0.534867787102555 0.364093190339766 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 52 17 69 24.1868750706671 9.09275238074344 15.0941226899237 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000244022265615703 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 40 31 71 18.6052885158978 16.5809014001792 2.0243871157186 A:G A G 10 0.534867787102555 0.721438646331854 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 37 40 77 17.2098918772055 21.3947114841022 -4.18481960689673 T:C C T 10 0.534867787102555 0.361895692453231 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 27 33 60 12.558569748231 17.6506369743843 -5.0920672261533 A:T:C A C 10 0.534867787102555 0.197494457840201 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 40849573 G/A 1 33 46 79 15.3493630256157 24.6039182067175 -9.25455518110185 A:G G A 10 0.534867787102555 0.042007717824296 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41165002 C/G 1 27 15 42 12.558569748231 8.02301680653832 4.53555294169269 C:G C G 10 0.534867787102555 0.167703808170223 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 15 28 43 6.97698319346167 14.9762980388715 -7.99931484540987 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0207298565669656 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 16 9 25 7.44211540635912 4.81381008392299 2.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.32219626972529 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 20 8 28 9.3026442579489 4.27894229682044 5.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0602440681156502 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:C T C 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 A:G A G 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 13 18 31 6.04671876766678 9.62762016784599 -3.58090140017921 A:G G A 10 0.534867787102555 0.211610157714882 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 30 6 36 13.9539663869233 3.20920672261533 10.744759664308 C:G C G 10 0.534867787102555 0.000305599907205472 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C C T 10 0.534867787102555 0.517317017227099 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 45 60 105 20.930949580385 32.0920672261533 -11.1611176457683 C:G G C 10 0.534867787102555 0.031301577438821 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 42980189 G/A 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000167131:ENST00000417826:exon_42979733_42982758:CCDC103;ENSG00000167131:ENST00000410006:exon_42979733_42980250:CCDC103;ENSG00000214447:ENST00000331733:exon_42979733_42982758:FAM187A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 41 37 78 19.0704207287952 19.7901081227945 -0.71968739399929 T:C T C 10 0.534867787102555 0.90986386711268 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 25 41 66 11.6283053224361 21.9295792712048 -10.3012739487686 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0131380122218103 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43171154 C/T 1 49 45 94 22.7914784319748 24.069050419615 -1.27757198764017 T:C C T 10 0.534867787102555 0.836432958535203 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43171053_43171171:NMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 112 90 202 52.0948078445138 48.1381008392299 3.95670700528389 T:C C T 10 0.534867787102555 0.621630383691275 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 174 170 344 80.9330050441554 90.9275238074344 -9.99451876327892 A:G G A 10 0.534867787102555 0.280351314583837 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 43322513 C/T 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.405445014430087 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 19 43 62 8.83751204505145 22.9993148454099 -14.1618028003584 C:G G C 10 0.534867787102555 0.000318860102500339 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 46 62 108 21.3960817932825 33.1618028003584 -11.7657210070759 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0262372968761016 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 45364540 T/C 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45364436_45364597:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45364436_45364597:ITGB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 33 37 70 15.3493630256157 19.7901081227945 -4.44074509717885 T:C C T 10 0.534867787102555 0.337863909775173 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 45893819 C/T 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45893754_45893848:OSBPL7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 45916018 C/G 1 63 61 124 29.303329412539 32.6269350132559 -3.32360560071682 T:C:G C G 10 0.534867787102555 0.589407795810945 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46136133 G/C 1 182 138 320 84.654062747335 73.8117546201526 10.8423081271824 C:G G C 10 0.534867787102555 0.239317436486798 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46136751 G/C 1 277 216 493 128.841622972592 115.531442014152 13.3101809584404 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.24051133225362 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46154202 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 158 169 327 73.4908896377963 90.3926560203318 -16.9017663825355 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.067197532392526 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46629593 G/T 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:G G T 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000120093:ENST00000470495:exon_46629389_46631284:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000472863:exon_46629389_46629722:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000311626:exon_46629389_46629994:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000498678:exon_46629389_46629994:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000489475:exon_46629389_46629722:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000476342:exon_46629389_46629849:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000471459:exon_46629389_46629722:HOXB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 104 108 212 48.3737501413343 57.7657210070759 -9.39197086574166 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.215184180539074 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 41 61 102 19.0704207287952 32.6269350132559 -13.5565142844606 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00734443729924347 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 99 72 171 46.0480890768471 38.510480671384 7.5376084054631 T:C C T 10 0.534867787102555 0.251408112089186 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 179 185 364 83.2586661086427 98.9505406139727 -15.69187450533 T:C C T 10 0.534867787102555 0.103397385203852 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48172779 A/C 0 0 12 12 0 6.41841344523066 -6.41841344523066 C A C 10 0.534867787102555 0.000102545595929325 ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48172639_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48172727_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48172739_48172917:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48172751_48172917:PDK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48263021 C/T 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48265495 T/C 0 0 27 27 0 14.441430251769 -14.441430251769 C T C 10 0.534867787102555 1.05818909058952e-09 ENSG00000108821:ENST00000225964:exon_48265457_48265510:COL1A1;ENSG00000108821:ENST00000486572:exon_48265457_48265915:COL1A1;ENSG00000108821:ENST00000511732:exon_48265253_48265998:COL1A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48268247 G/A 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 A:G G A 10 0.534867787102555 0.582705672158879 ENSG00000108821:ENST00000225964:exon_48268178_48268285:COL1A1;ENSG00000108821:ENST00000494334:exon_48268178_48268285:COL1A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48434610 G/A 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48434418_48434613:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48434418_48434613:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48434479_48434613:XYLT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48437367 C/T 1 20 25 45 9.3026442579489 13.3716946775639 -4.06905041961497 T:C C T 10 0.534867787102555 0.235065277308722 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48625751 C/T 1 33 39 72 15.3493630256157 20.8598436969996 -5.51048067138396 T:C C T 10 0.534867787102555 0.196197362640395 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000510917:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625644_48625814:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625644_48625814:SPATA20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 36 44 80 16.744759664308 23.5341826325124 -6.7894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.145045609304779 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 17 19 36 7.90724761925657 10.1624879549485 -2.25524033569198 A:C A C 10 0.534867787102555 0.505591504798501 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 49371230 G/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G G C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 55197704 A/G 1 39 55 94 18.1401563030004 29.4177282906405 -11.2775719876402 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0225926818822028 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55197611_55198710:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55197611_55198710:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55197611_55198707:AKAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 9 10 19 4.18618991607701 5.34867787102555 -1.16248795494854 A:G A G 10 0.534867787102555 0.649883599673449 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 59763465 T/C 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 59969000 T/C 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000108506:ENST00000251334:exon_59968874_59969050:INTS2;ENSG00000108506:ENST00000444766:exon_59968874_59969050:INTS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 25 36 61 11.6283053224361 19.255240335692 -7.62693501325585 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0544546824811481 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 60766224 A/G 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:G A G 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000011028:ENST00000303375:exon_60766213_60766321:MRC2;ENSG00000011028:ENST00000446119:exon_60766213_60766321:MRC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 60769803 A/G 1 5 15 20 2.32566106448723 8.02301680653832 -5.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0127064683831530 ENSG00000011028:ENST00000303375:exon_60769592_60770953:MRC2;ENSG00000011028:ENST00000446119:exon_60769592_60770953:MRC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 61685341 C/T 1 74 56 130 34.4197837544109 29.9525960777431 4.46718767666785 T:C C T 10 0.534867787102555 0.481997430052646 ENSG00000136463:ENST00000258975:exon_61685162_61685724:TACO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 62121480 T/C 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000178607:ENST00000433197:exon_62120390_62121560:ERN1;ENSG00000178607:ENST00000225768:exon_62120390_62121560:ERN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 65104666 T/G 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:G T G 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000198265:ENST00000358691:exon_65104608_65104842:HELZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 24 27 51 11.1631731095387 14.441430251769 -3.27825714223031 T:C T C 10 0.534867787102555 0.400593151212235 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 29 31 60 13.4888341740259 16.5809014001792 -3.0920672261533 A:G A G 10 0.534867787102555 0.439911209122767 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 11 16 27 5.1164543418719 8.55788459364088 -3.44143025176898 T:C T C 10 0.534867787102555 0.246642971185003 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 127 109 236 59.0717910379755 58.3005887941785 0.771202243797021 A:G A G 10 0.534867787102555 0.948020993669846 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 66267691 A/T 1 10 19 29 4.65132212897445 10.1624879549485 -5.5111658259741 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0607597508953381 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 27 11 38 12.558569748231 5.8835456581281 6.67502409010291 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0340178667108358 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 67273882 C/A 1 12 16 28 5.58158655476934 8.55788459364088 -2.97629803887154 A:C C A 10 0.534867787102555 0.343713788088321 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67273782_67273983:ABCA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 67290840 T/C 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 T:C T C 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67290796_67290854:ABCA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 67304447 C/T 1 5 24 29 2.32566106448723 12.8368268904613 -10.5111658259741 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000101577045794669 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67304421_67304509:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67304421_67304509:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67304421_67304509:ABCA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 67501934 C/T 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67501921_67501987:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67501921_67501987:MAP2K6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 71027833 A/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G A G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 72860099 G/A 1 48 22 70 22.3263462190774 11.7670913162562 10.5592549028211 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0117117644591671 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860018_72860469:FDXR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 72860253 A/G 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860018_72860469:FDXR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 28 14 42 13.0237019611285 7.48814901943577 5.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.090984219274235 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 100 107 207 46.5132212897445 57.2308532199734 -10.7176319302289 T:C T C 10 0.534867787102555 0.143523502151739 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73089706 G/A 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000170190:ENST00000329783:exon_73089684_73089930:SLC16A5;ENSG00000170190:ENST00000450736:exon_73089684_73089930:SLC16A5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73089852 T/C 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000170190:ENST00000329783:exon_73089684_73089930:SLC16A5;ENSG00000170190:ENST00000450736:exon_73089684_73089930:SLC16A5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 38 33 71 17.6750240901029 17.6506369743843 0.0243871157185929 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 19 18 37 8.83751204505145 9.62762016784599 -0.790108122794535 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.869601768514842 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73494963 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 38 23 61 17.6750240901029 12.3019591033588 5.37306498674414 C:G G C 10 0.534867787102555 0.199218662073781 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73568055 C/T 1 10 1 11 4.65132212897445 0.534867787102555 4.1164543418719 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0138388269412908 ENSG00000073350:ENST00000167462:exon_73567979_73568145:LLGL2;ENSG00000073350:ENST00000392550:exon_73567979_73568145:LLGL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 43 35 78 20.0006851545901 18.7203725485894 1.28031260600071 A:G G A 10 0.534867787102555 0.820887132622205 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 20 16 36 9.3026442579489 8.55788459364088 0.74475966430802 A:G G A 10 0.534867787102555 0.868218778112725 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 T:C T C 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 73840272 C/T 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74035821 C/A 1 91 94 185 42.3270313736675 50.2775719876402 -7.95054061397268 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.268889894084762 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74035191_74036014:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74035191_74036014:SRP68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 50 27 77 23.2566106448723 14.441430251769 8.81518039310327 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0516025041813818 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 109 76 185 50.6994112058215 40.6499518197942 10.0494593860273 C:G G C 10 0.534867787102555 0.141177356529670 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 90 84 174 41.8618991607701 44.9288941166146 -3.06699495584457 T:C C T 10 0.534867787102555 0.649139577500937 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74079838 A/G 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.824569743705683 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74152366 A/G 1 19 28 47 8.83751204505145 14.9762980388715 -6.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.079888364178759 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 12 26 38 5.58158655476934 13.9065624646664 -8.32497590989709 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00853955167928266 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 367 393 760 170.703522133362 210.203040331304 -39.4995181979418 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.00453333604751161 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 31 37 68 14.4190985998208 19.7901081227945 -5.37100952297374 T:C T C 10 0.534867787102555 0.224015024444935 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 62 44 106 28.8381971996416 23.5341826325124 5.30401456712917 T:C C T 10 0.534867787102555 0.330686255851365 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 66 95 161 30.6987260512314 50.8124397747427 -20.1137137235114 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00154337221834614 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 36 32 68 16.744759664308 17.1157691872818 -0.37100952297374 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 58 39 97 26.9776683480518 20.8598436969996 6.11782465105217 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223269390025312 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 64 50 114 29.7684616254365 26.7433893551277 3.02507227030873 T:C C T 10 0.534867787102555 0.638947922124486 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76047237 G/T 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 T:G G T 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000078687:ENST00000301624:exon_76044926_76047538:TNRC6C;ENSG00000078687:ENST00000335749:exon_76044926_76047529:TNRC6C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76120065 A/G 1 36 32 68 16.744759664308 17.1157691872818 -0.37100952297374 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 202 223 425 93.9567070052839 119.27551652387 -25.3188095185859 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0149697234495981 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 134 131 265 62.3277165282576 70.0676801104347 -7.73996358217708 T:C C T 10 0.534867787102555 0.355867887201971 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76198754 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76219591 G/A 1 80 85 165 37.2105770317956 45.4637619037172 -8.25318487192158 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.211958418184658 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76449505 G/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76449425_76449547:DNAH17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76481693 C/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 C:G C G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76481632_76481839:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76481632_76481839:DNAH17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76482432 A/G 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76482306_76482588:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76482306_76482588:DNAH17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76970879 A/G 1 1 57 58 0.465132212897445 30.4874638648456 -30.0223316519482 A:G A G 10 0.534867787102555 3.54808074878682e-18 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76970770_76970901:LGALS3BP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 24 23 47 11.1631731095387 12.3019591033588 -1.13878599382009 A:G A G 10 0.534867787102555 0.771320179538871 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 77073566 G/A 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G G A 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073512_77073579:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073512_77073579:ENGASE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 77076440 G/T 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 T:G G T 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77076289_77076446:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77076289_77076446:ENGASE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 23 17 40 10.6980408966412 9.09275238074344 1.6052885158978 A:G G A 10 0.534867787102555 0.638038577575428 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 44 66 110 20.4658173674876 35.3012739487686 -14.8354565812811 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0053735703015802 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 25 31 56 11.6283053224361 16.5809014001792 -4.95259607774308 T:C C T 10 0.534867787102555 0.227663752153118 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78185979 G/A 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78185870_78186073:SGSH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78187954 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78261730 G/A 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 A:G G A 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78261805 A/G 1 20 17 37 9.3026442579489 9.09275238074344 0.209891877205465 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78262161 T/C 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78263486 T/C 1 19 13 32 8.83751204505145 6.95328123233322 1.88423081271824 T:C T C 10 0.534867787102555 0.59619639942853 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78263514 G/A 1 25 20 45 11.6283053224361 10.6973557420511 0.930949580385025 A:G G A 10 0.534867787102555 0.881482718229074 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78292945 G/A 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223810845764614 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 25 19 44 11.6283053224361 10.1624879549485 1.46581736748758 A:G G A 10 0.534867787102555 0.762914460310603 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 48 29 77 22.3263462190774 15.5111658259741 6.81518039310326 C:G G C 10 0.534867787102555 0.137382826304835 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 17 25 42 7.90724761925657 13.3716946775639 -5.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.120876840211428 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 25 24 49 11.6283053224361 12.8368268904613 -1.2085215680252 T:C C T 10 0.534867787102555 0.775494637865315 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78854223 A/G 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78854215_78854289:RPTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78857700 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78857581_78857772:RPTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 78919558 C/T 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78919467_78919581:RPTOR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 79182778 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 30 8 38 13.9539663869233 4.27894229682044 9.67502409010291 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00167207673032649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 37 28 65 17.2098918772055 14.9762980388715 2.23359383833392 A:G G A 10 0.534867787102555 0.620239311494787 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 54 72 126 25.117139496462 38.510480671384 -13.3933411749219 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0199052147949664 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 35 37 72 16.2796274514106 19.7901081227945 -3.51048067138396 C:G C G 10 0.534867787102555 0.411201241860440 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80007646 C/T 1 19 28 47 8.83751204505145 14.9762980388715 -6.13878599382009 T:C C T 10 0.534867787102555 0.079888364178759 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80007553_80007718:RFNG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80014861 T/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:G T G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80014505_80015346:GPS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80016209 G/A 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80039028 A/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80041950 G/A 1 157 132 289 73.0257574248989 70.6025478975373 2.42320952736161 A:G G A 10 0.534867787102555 0.813599573564694 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80320561 G/A 1 14 3 17 6.51185098056423 1.60460336130767 4.90724761925656 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0256258939466012 ENSG00000182459:ENST00000333437:exon_80319756_80321652:TEX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 33 18 51 15.3493630256157 9.62762016784599 5.72174285776969 A:G G A 10 0.534867787102555 0.122922975975223 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 21 25 46 9.76777647084634 13.3716946775639 -3.60391820671753 T:G G T 10 0.534867787102555 0.303718875469948 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 T:G T G 10 0.534867787102555 0.177119301244689 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 16 31 47 7.44211540635912 16.5809014001792 -9.13878599382008 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.00825243704642697 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80397484 A/G 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.313544354924083 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 94 58 152 43.7224280123598 31.0223316519482 12.7000963604116 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0419473066830408 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80402045 T/C 1 20 13 33 9.3026442579489 6.95328123233322 2.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.486615987304497 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80402296 G/A 1 13 8 21 6.04671876766678 4.27894229682044 1.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.515422591350918 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80442683 T/G 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 T:G T G 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 65 46 111 30.2335938383339 24.6039182067175 5.62967563161639 T:C T C 10 0.534867787102555 0.296580617582000 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80583230 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 15 7 22 6.97698319346167 3.74407450971789 3.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.201980319253584 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 16 7 23 7.44211540635912 3.74407450971789 3.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.145219966191261 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 58 51 109 26.9776683480518 27.2782571422303 -0.300588794178495 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 45 32 77 20.930949580385 17.1157691872818 3.81518039310327 A:G G A 10 0.534867787102555 0.424624601235448 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 80992932 A/C 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 A:C A C 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80992911_80992975:B3GNTL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 17 81006629 C/T 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 T:C C T 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 346821 C/T 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000158270:ENST00000400256:exon_346295_347341:COLEC12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 C:G G C 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 292 237 529 135.818606166054 126.763665543306 9.0549406227484 T:C C T 10 0.534867787102555 0.433152782363701 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 54 45 99 25.117139496462 24.069050419615 1.04808907684706 A:G A G 10 0.534867787102555 0.841185139921773 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 677661 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 691173 G/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 745711 T/C 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000176105:ENST00000359834:exon_745708_745857:YES1;ENSG00000176105:ENST00000314574:exon_745708_745857:YES1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2554807 T/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:G T G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2554836 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:C:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 16 18 34 7.44211540635912 9.62762016784599 -2.18550476148687 C:G G C 10 0.534867787102555 0.494284609355426 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2656248 G/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2655886_2656260:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2655886_2656260:SMCHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2705700 A/G 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 A:G A G 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2705692_2705805:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2705692_2705805:SMCHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G G A 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 10 16 26 4.65132212897445 8.55788459364088 -3.90656246466643 A:G A G 10 0.534867787102555 0.167762406474111 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2885118 C/T 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2884962_2885137:EMILIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 2909700 C/T 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2909689_2909817:EMILIN2;ENSG00000132205:ENST00000308080:exon_2909689_2909817:EMILIN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 3067278 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000101605:ENST00000356443:exon_3066805_3067553:MYOM1;ENSG00000101605:ENST00000261606:exon_3066805_3067553:MYOM1;ENSG00000101605:ENST00000400569:exon_3066805_3067553:MYOM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 3596818 T/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:T T A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000177337:ENST00000317114:exon_3596577_3598350:AP002478.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 3729175 C/T 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400147:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400150:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400149:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400155:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400145:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000485480:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000498188:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000478161:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000486430:exon_3729135_3729378:DLGAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9221883 C/G 1 42 28 70 19.5355529416927 14.9762980388715 4.55925490282115 C:G C G 10 0.534867787102555 0.283733346173946 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9221850_9221997:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9221850_9221997:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9254785 C/T 1 58 58 116 26.9776683480518 31.0223316519482 -4.04466330389638 T:C C T 10 0.534867787102555 0.458072359978568 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9255784 C/A 1 89 82 171 41.3967669478726 43.8591585424095 -2.4623915945369 A:C C A 10 0.534867787102555 0.75922366983558 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 93 121 214 43.2572957994624 64.7190022394091 -21.4617064399468 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00390023827642279 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9258531 C/T 1 64 50 114 29.7684616254365 26.7433893551277 3.02507227030873 T:C C T 10 0.534867787102555 0.638947922124486 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9258537 T/C 1 66 46 112 30.6987260512314 24.6039182067175 6.09480784451384 T:C T C 10 0.534867787102555 0.257112768814846 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9275542 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9275522_9275665:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9275522_9275665:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 9275563 T/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9275522_9275665:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9275522_9275665:ANKRD12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 10681711 C/T 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10681658_10681750:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10681658_10681750:FAM38B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 11999115 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000141401:ENST00000269159:exon_11999053_11999186:IMPA2;ENSG00000141401:ENST00000383376:exon_11999053_11999186:IMPA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 12698983 C/T 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000101624:ENST00000262127:exon_12698978_12699202:CEP76;ENSG00000101624:ENST00000438851:exon_12698978_12699202:CEP76 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 53 58 111 24.6520072835646 31.0223316519482 -6.3703243683836 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.253540377702553 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C T C 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 16 7 23 7.44211540635912 3.74407450971789 3.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.145219966191261 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 21 13 34 9.76777647084634 6.95328123233322 2.81449523851313 T:G G T 10 0.534867787102555 0.391595923439878 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 14105016 C/A 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 A:C C A 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 19 24 43 8.83751204505145 12.8368268904613 -3.99931484540987 A:G G A 10 0.534867787102555 0.225920813386530 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 19154233 T/C 1 28 17 45 13.0237019611285 9.09275238074344 3.93094958038502 T:C T C 10 0.534867787102555 0.295641477437011 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 27 18 45 12.558569748231 9.62762016784599 2.93094958038503 T:C C T 10 0.534867787102555 0.455527557949342 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 21141343 G/A 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:G G A 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21141324_21141491:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21141324_21141491:NPC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 T:C T C 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 27 19 46 12.558569748231 10.1624879549485 2.39608179328247 A:T:G G T 10 0.534867787102555 0.555169282411363 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 20 21 41 9.3026442579489 11.2322235291537 -1.92957927120476 T:C T C 10 0.534867787102555 0.639159703203119 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 28 20 48 13.0237019611285 10.6973557420511 2.32634621907736 A:G A G 10 0.534867787102555 0.563889079835253 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 28 26 54 13.0237019611285 13.9065624646664 -0.882860503537971 A:G G A 10 0.534867787102555 0.89168444954929 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 A:C A C 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 22 31 53 10.2329086837438 16.5809014001792 -6.34799271643541 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0978139501966362 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 50 47 97 23.2566106448723 25.1387859938201 -1.88217534894784 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.760315490578168 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 34205551 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34205474_34205712:FHOD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 34310668 C/T 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34310609_34310767:FHOD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 34398883 G/A 1 36 50 86 16.744759664308 26.7433893551277 -9.99862969081973 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0393624380706051 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 46284587 T/C 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000134030:ENST00000256413:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000382998:exon_46284290_46284782:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000435190:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000420275:exon_46284290_46284776:KIAA0427 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 A:G A G 10 0.534867787102555 0.344673769927785 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47809843 G/C 1 40 10 50 18.6052885158978 5.34867787102555 13.2566106448723 C:G G C 10 0.534867787102555 0.000162912731482682 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 11 31 42 5.1164543418719 16.5809014001792 -11.4644470583073 T:G G T 10 0.534867787102555 0.000503006423309086 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 102 131 233 47.4434857155394 70.0676801104347 -22.6241943948953 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00309130913882012 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47811669 A/G 1 26 24 50 12.0934375353336 12.8368268904613 -0.743389355127752 A:G A G 10 0.534867787102555 0.88766651817951 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47813078 G/C 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 C:G G C 10 0.534867787102555 0.149954178119034 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47813916 C/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:C C A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47813990 C/A 1 81 40 121 37.675709244693 21.3947114841022 16.2809977605908 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00338344748354347 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47813957_47814674:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47813957_47814692:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47813957_47814692:CXXC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 26 30 56 12.0934375353336 16.0460336130766 -3.95259607774308 A:C A C 10 0.534867787102555 0.348496632513094 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 44 20 64 20.4658173674876 10.6973557420511 9.76846162543648 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0167232361812965 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 C:G G C 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56202231 T/C 1 18 18 36 8.37237983215401 9.62762016784599 -1.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.739410883730553 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56203837 G/A 1 76 48 124 35.3500481802058 25.6736537809226 9.67639439928318 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0873149892408324 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 24 36 60 11.1631731095387 19.255240335692 -8.0920672261533 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0386627588305170 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 30 13 43 13.9539663869233 6.95328123233322 7.00068515459013 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0330068775381324 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56204768 G/A 1 46 12 58 21.3960817932825 6.41841344523066 14.9776683480518 A:G G A 10 0.534867787102555 5.80126611077442e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56246442 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56247180 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56247567 A/G 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56247600 C/A 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 A:C C A 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56367823 A/G 1 31 52 83 14.4190985998208 27.8131249293329 -13.3940263295121 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00397279052188258 ENSG00000172175:ENST00000348428:exon_56367673_56367823:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000345724:exon_56367673_56367823:MALT1;ENSG00000172175:ENST00000446453:exon_56367673_56367823:MALT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 56587735 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000074657:ENST00000336078:exon_56585503_56587865:ZNF532 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 20 57 77 9.3026442579489 30.4874638648456 -21.1848196068967 T:G T G 10 0.534867787102555 1.56342821212765e-06 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 12 48 60 5.58158655476934 25.6736537809226 -20.0920672261533 A:G A G 10 0.534867787102555 1.56900880598327e-07 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 5 34 39 2.32566106448723 18.1855047614869 -15.8598436969996 T:C T C 10 0.534867787102555 1.57857331858131e-07 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 5 18 23 2.32566106448723 9.62762016784599 -7.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00272248076234531 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 11 34 45 5.1164543418719 18.1855047614869 -13.069050419615 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000124521198297450 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 14 24 38 6.51185098056423 12.8368268904613 -6.32497590989709 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0499652956178817 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 48 39 87 22.3263462190774 20.8598436969996 1.46650252207771 A:G A G 10 0.534867787102555 0.829979995547735 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 67531505 G/C 1 191 18 209 88.840252663412 9.62762016784599 79.212632495566 T:C:G G C 10 0.534867787102555 1.24782841956372e-32 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 14 130 144 6.51185098056423 69.5328123233322 -63.0209613427679 T:C T C 10 0.534867787102555 1.68292563151265e-28 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 28 31 59 13.0237019611285 16.5809014001792 -3.55719943905074 T:C T C 10 0.534867787102555 0.363898246946618 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 72775365 C/T 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 1 14 10 24 6.51185098056423 5.34867787102555 1.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.686611403599214 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 74083434 G/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 C:G G C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74083422_74083526:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74083422_74083526:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74083422_74083526:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000529449:exon_74083422_74083526:ZNF516 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 74611127 A/G 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000130856:ENST00000253159:exon_74610975_74611178:ZNF236;ENSG00000130856:ENST00000320610:exon_74610975_74611178:ZNF236 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 T:G T G 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 21 18 39 9.76777647084634 9.62762016784599 0.140156303000355 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 579450 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 259 352 611 120.469243140438 188.273461060099 -67.8042179196611 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 4.87244106219356e-08 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 580333 G/A 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.104563589848143 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 305 438 743 141.865324933721 234.272090750919 -92.4067658171984 C:G C G 10 0.534867787102555 1.34080159684577e-11 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 580575 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 313 209 522 145.5863826369 111.787367504434 33.7990151324663 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00324955215498749 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 630075 C/T 1 27 29 56 12.558569748231 15.5111658259741 -2.95259607774308 T:C C T 10 0.534867787102555 0.503353984888101 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 100 101 201 46.5132212897445 54.0216464973581 -7.50842520761356 T:C C T 10 0.534867787102555 0.289905460567637 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 651885 G/A 1 11 27 38 5.1164543418719 14.441430251769 -9.32497590989709 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.00297721376252940 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 815238 G/A 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000129951:ENST00000520876:exon_815186_815327:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000359894:exon_815186_815327:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000300947:exon_815186_815327:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000451667:exon_815186_815327:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000521445:exon_815186_815327:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000521181:exon_814886_815274:MIR3187;ENSG00000129951:ENST00000519502:exon_815186_815327:MIR3187 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 43 34 77 20.0006851545901 18.1855047614869 1.81518039310326 A:G G A 10 0.534867787102555 0.732376695459168 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 49 41 90 22.7914784319748 21.9295792712048 0.861899160770051 T:C C T 10 0.534867787102555 0.915979049075325 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 990185 G/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 64 36 100 29.7684616254365 19.255240335692 10.5132212897445 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0355669803162898 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 10 15 25 4.65132212897445 8.02301680653832 -3.37169467756387 A:G G A 10 0.534867787102555 0.228786156481097 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1011823 A/G 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.317451841975924 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 110 70 180 51.1645434187189 37.4407450971788 13.7237983215401 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0435173149450993 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1041352 A/G 1 14 16 30 6.51185098056423 8.55788459364088 -2.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.470026628362640 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1041224_1041426:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530703:exon_1041224_1041681:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000526885:exon_1041224_1041426:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000525238:exon_1041224_1041426:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531467:exon_1041201_1041426:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000527496:exon_1041204_1041426:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1042809 A/G 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000534541:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1042661_1042825:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1049269 G/A 1 9 10 19 4.18618991607701 5.34867787102555 -1.16248795494854 A:G G A 10 0.534867787102555 0.649883599673449 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1049265_1049436:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1049305 C/A 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:C C A 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1049265_1049436:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1049265_1049436:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1052005 C/T 1 9 11 20 4.18618991607701 5.8835456581281 -1.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.505457236744248 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051941_1052125:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1054060 A/G 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1054005_1054109:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1055191 G/A 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 A:G G A 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530092:exon_1055096_1055350:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1056065 A/G 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1056492 G/C 1 21 23 44 9.76777647084634 12.3019591033588 -2.53418263251242 C:G G C 10 0.534867787102555 0.454162488009604 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056329_1056498:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056329_1056498:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056329_1056498:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 27 16 43 12.558569748231 8.55788459364088 4.00068515459014 A:G G A 10 0.534867787102555 0.284456528567027 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1242048 C/T 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 T:C C T 10 0.534867787102555 0.467707552599743 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 53 54 107 24.6520072835646 28.882860503538 -4.23085321997338 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438813579775648 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1357082 T/C 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1357063_1357093:MUM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 53 41 94 24.6520072835646 21.9295792712048 2.72242801235983 A:G G A 10 0.534867787102555 0.606144725711761 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 99 109 208 46.0480890768471 58.3005887941785 -12.2524997173314 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0952354402553008 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1438865 C/T 1 889 2364 3253 413.502537265829 1264.42744871044 -850.924911444612 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 6.265685333796e-201 ENSG00000115268:ENST00000233609:exon_1438806_1438891:RPS15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 182 185 367 84.654062747335 98.9505406139727 -14.2964778666377 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.142854312925058 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1819112 A/G 1 24 42 66 11.1631731095387 22.4644470583073 -11.3012739487686 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00629460893897566 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 49 26 75 22.7914784319748 13.9065624646664 8.88491596730838 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0484234534754816 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 54 73 127 25.117139496462 39.0453484584865 -13.9282089620245 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0159971874828506 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 9 18 27 4.18618991607701 9.62762016784599 -5.44143025176898 T:C T C 10 0.534867787102555 0.051709482565568 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 127 108 235 59.0717910379755 57.7657210070759 1.30607003089958 A:G A G 10 0.534867787102555 0.896027861988588 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 106 95 201 49.3040145671292 50.8124397747427 -1.50842520761356 A:G G A 10 0.534867787102555 0.83242223593268 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 65 64 129 30.2335938383339 34.2315383745635 -3.9979445362296 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.481800097347408 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2073466 T/C 1 2 13 15 0.93026442579489 6.95328123233322 -6.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00279922196728933 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 270 219 489 125.58569748231 117.13604537546 8.44965210685061 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.468307387336998 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 225 223 448 104.654747901925 119.27551652387 -14.6207686219446 A:G A G 10 0.534867787102555 0.169792441105418 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 237 223 460 110.236334456694 119.27551652387 -9.0391820671753 T:C T C 10 0.534867787102555 0.400589461365904 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2097986 T/C 1 8 34 42 3.72105770317956 18.1855047614869 -14.4644470583073 T:C T C 10 0.534867787102555 6.78823423600293e-06 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 12 29 41 5.58158655476934 15.5111658259741 -9.92957927120476 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00250237645545863 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 61 56 117 28.3730649867441 29.9525960777431 -1.57953109099894 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.781674110537932 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 148 107 255 68.8395675088219 57.2308532199734 11.6087142888485 A:G G A 10 0.534867787102555 0.149157199633877 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2111649 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2115493 A/G 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2137000 G/C 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 C:G G C 10 0.534867787102555 0.633644945334357 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 63 32 95 29.303329412539 17.1157691872818 12.1875602252573 T:C:G T G 10 0.534867787102555 0.0132997720110616 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 86 66 152 40.0013703091803 35.3012739487686 4.70009636041164 A:G G A 10 0.534867787102555 0.465051048055586 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 83 92 175 38.6059736704879 49.2078364134351 -10.6018627429471 A:G G A 10 0.534867787102555 0.11190550498654 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 134 94 228 62.3277165282576 50.2775719876402 12.0501445406175 C:G G C 10 0.534867787102555 0.111538252892718 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2233925 C/G 1 32 16 48 14.8842308127182 8.55788459364088 6.32634621907736 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0818102208338162 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2248152 T/C 1 107 101 208 49.7691467800266 54.0216464973581 -4.25249971733144 T:C T C 10 0.534867787102555 0.578448219353367 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2252990 C/G 1 51 24 75 23.7217428577697 12.8368268904613 10.8849159673084 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0145220236801884 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252911_2253002:JSRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 53 41 94 24.6520072835646 21.9295792712048 2.72242801235983 A:C C A 10 0.534867787102555 0.606144725711761 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2418031 C/T 1 26 15 41 12.0934375353336 8.02301680653832 4.07042072879524 T:C C T 10 0.534867787102555 0.214342950952987 ENSG00000178297:ENST00000332578:exon_2418000_2418136:TMPRSS9;ENSG00000178297:ENST00000425079:exon_2418000_2418136:TMPRSS9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2432441 G/A 1 134 104 238 62.3277165282576 55.6262498586657 6.70146666959191 A:G G A 10 0.534867787102555 0.398731732935342 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2432414_2432521:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2432414_2432521:LMNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2438119 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2444565 C/T 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 2934240 C/T 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 14 31 45 6.51185098056423 16.5809014001792 -10.069050419615 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00398641813606149 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3542983 C/T 1 34 30 64 15.8144952385131 16.0460336130766 -0.231538374563518 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3613596 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3633192 A/G 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.796302648602911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 28 16 44 13.0237019611285 8.55788459364088 4.46581736748758 T:C C T 10 0.534867787102555 0.226318951658351 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 46 33 79 21.3960817932825 17.6506369743843 3.74544481889815 A:G A G 10 0.534867787102555 0.430942245131862 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 46 33 79 21.3960817932825 17.6506369743843 3.74544481889815 T:C C T 10 0.534867787102555 0.430942245131862 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 3961176 G/A 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 16 24 40 7.44211540635912 12.8368268904613 -5.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.111991189784813 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 17 8 25 7.90724761925657 4.27894229682044 3.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.164147290224472 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4033614 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4037322 G/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4037525 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 37 50 87 17.2098918772055 26.7433893551277 -9.53349747792229 T:G G T 10 0.534867787102555 0.041613571457355 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4174950 A/G 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 A:G A G 10 0.534867787102555 0.300286638189599 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 18 22 40 8.37237983215401 11.7670913162562 -3.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.341868431890952 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4216910 G/A 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G G A 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000089847:ENST00000318934:exon_4216547_4218160:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262969:exon_4216547_4217257:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262970:exon_4216547_4218160:ANKRD24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 6 18 24 2.79079327738467 9.62762016784599 -6.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00669892307548342 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 42 63 105 19.5355529416927 33.696670587461 -14.1611176457683 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0060416561365015 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4510560 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167676:ENST00000301286:exon_4510458_4513716:PLIN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4694639 G/A 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4704230 G/A 1 43 46 89 20.0006851545901 24.6039182067175 -4.6032330521274 A:G G A 10 0.534867787102555 0.340449172188213 ENSG00000142002:ENST00000357909:exon_4704143_4704316:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000381797:exon_4704143_4704239:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262960:exon_4704143_4704316:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262959:exon_4704143_4704316:DPP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 63 60 123 29.303329412539 32.0920672261533 -2.78873781361426 A:G G A 10 0.534867787102555 0.65165826325469 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 64 58 122 29.7684616254365 31.0223316519482 -1.25387002651171 T:C T C 10 0.534867787102555 0.856162257178137 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4839455 G/A 1 88 80 168 40.9316347349752 42.7894229682044 -1.85778823322924 A:G G A 10 0.534867787102555 0.816631122626133 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4838346_4839548:PLIN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 55 53 108 25.5822717093595 28.3479927164354 -2.76572100707594 T:C C T 10 0.534867787102555 0.630052721343148 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 12 28 40 5.58158655476934 14.9762980388715 -9.3947114841022 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00379652772746966 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5210782 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5210690_5210816:PTPRS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5590267 C/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:C C A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5590291 G/T 1 65 53 118 30.2335938383339 28.3479927164354 1.88560112189851 T:G G T 10 0.534867787102555 0.78211501082749 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5590289_5590419:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5590289_5590419:SAFB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5616266 C/T 1 41 41 82 19.0704207287952 21.9295792712048 -2.85915854240951 T:C C T 10 0.534867787102555 0.580293758214768 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5616143_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5616123_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5616109_5616346:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5616143_5616346:SAFB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 128 89 217 59.536923250873 47.6032330521274 11.9336901987456 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117357157895682 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5692192 C/T 1 301 267 568 140.004796082131 142.809699156382 -2.80490307425123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.833465395590597 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5696101 C/T 1 126 136 262 58.6066588250781 72.7420190459475 -14.1353602208694 T:C C T 10 0.534867787102555 0.083021073177367 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5696245 A/G 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 A:G A G 10 0.534867787102555 0.849949393834714 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5783634 T/C 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5783712 C/T 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C C T 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5783905 G/A 1 8 15 23 3.72105770317956 8.02301680653832 -4.30195910335876 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0934089262926932 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5784025 C/T 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 45 23 68 20.930949580385 12.3019591033588 8.62899047702626 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0387137591959072 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 33 14 47 15.3493630256157 7.48814901943577 7.86121400617991 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0272837735428603 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6042059 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000087903:ENST00000303657:exon_6042055_6042134:RFX2;ENSG00000087903:ENST00000359161:exon_6042055_6042134:RFX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6374295 G/A 1 180 159 339 83.7237983215401 85.0439781493062 -1.32017982776614 A:G G A 10 0.534867787102555 0.913320993471974 ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374214_6374387:ALKBH7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6419275 A/G 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.718154822973439 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 13 20 33 6.04671876766678 10.6973557420511 -4.65063697438432 A:G A G 10 0.534867787102555 0.117556598186340 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 149 183 332 69.3046997217193 97.8808050397676 -28.5761053180483 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00201797192480230 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 26 20 46 12.0934375353336 10.6973557420511 1.39608179328247 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.768096535425017 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7083629 A/G 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G A G 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 18 32 50 8.37237983215401 17.1157691872818 -8.74338935512775 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0154459245127603 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 19 26 45 8.83751204505145 13.9065624646664 -5.06905041961498 T:G T G 10 0.534867787102555 0.137295976208271 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 21 31 52 9.76777647084634 16.5809014001792 -6.81312492933286 A:G G A 10 0.534867787102555 0.070086525273581 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 48 22 70 22.3263462190774 11.7670913162562 10.5592549028211 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0117117644591671 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 25 45 70 11.6283053224361 24.069050419615 -12.4407450971788 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00372703277277784 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7172378 G/A 1 17 10 27 7.90724761925657 5.34867787102555 2.55856974823102 A:G G A 10 0.534867787102555 0.342606221663184 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7172301_7172445:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7172301_7172445:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7184518 G/A 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7547074 A/C 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000104883:ENST00000221480:exon_7546919_7547097:PEX11G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7621648 C/T 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.615387176330244 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7621981 A/G 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 9 23 32 4.18618991607701 12.3019591033588 -8.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00431762324981531 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7685981 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7687666 C/T 1 58 41 99 26.9776683480518 21.9295792712048 5.04808907684706 T:C C T 10 0.534867787102555 0.315900360771878 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687648_7687779:XAB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7688614 T/C 1 1 9 10 0.465132212897445 4.81381008392299 -4.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.007840761770901 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7691001 G/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G G C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 21 18 39 9.76777647084634 9.62762016784599 0.140156303000355 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7696622 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000174788:ENST00000311069:exon_7696509_7696694:PCP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7698320 C/T 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000174788:ENST00000311069:exon_7698293_7698636:PCP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7703605 C/T 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.134594577567062 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7703982 C/T 1 103 71 174 47.9086179284368 37.9756128842814 9.93300504415543 T:C C T 10 0.534867787102555 0.148579402659128 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7703905_7703986:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7703905_7703986:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7703905_7703986:STXBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7703998 C/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7707369 G/A 1 123 95 218 57.2112621863857 50.8124397747427 6.398822411643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.415357247998771 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7707315_7707422:STXBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 72 75 147 33.489519328616 40.1150840326916 -6.62556470407559 T:C T C 10 0.534867787102555 0.283218834003752 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7712364 A/G 1 124 88 212 57.6763943992832 47.0683652650248 10.6080291342583 A:G A G 10 0.534867787102555 0.148678084676742 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G A G 10 0.534867787102555 0.850186493410356 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 16 21 37 7.44211540635912 11.2322235291537 -3.79010812279454 C:G G C 10 0.534867787102555 0.249243671719291 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7747293 T/G 1 266 415 681 123.72516863072 221.97013164756 -98.2449630168399 T:G T G 10 0.534867787102555 4.71789849991582e-14 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 651 821 1472 302.801070596237 439.126453211198 -136.325382614961 A:T:G G A 10 0.534867787102555 1.24602293405077e-12 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 748 462 1210 347.918895247289 247.10891764138 100.809977605908 A:C:G G A 10 0.534867787102555 5.42503218131945e-09 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 23 11 34 10.6980408966412 5.8835456581281 4.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.121336627273295 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 967 665 1632 449.782849871829 355.687078423199 94.0957714486302 A:T:G G A 10 0.534867787102555 3.01429436761628e-06 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 65 57 122 30.2335938383339 30.4874638648456 -0.253870026511713 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 23 28 51 10.6980408966412 14.9762980388715 -4.27825714223031 C:G C G 10 0.534867787102555 0.262010186623264 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 8321969 C/T 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.15772121036402 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 8381435 G/C 1 213 155 368 99.0731613471558 82.904507000896 16.1686543462598 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0945520916913743 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 9492141 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000188629:ENST00000446085:exon_9491344_9492453:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000343499:exon_9491824_9492864:ZNF177;ENSG00000188629:ENST00000434737:exon_9491824_9492864:ZNF177 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 49 65 114 22.7914784319748 34.7664061616661 -11.9749277296913 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0303692712976227 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10218408 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10218434 C/T 1 4 13 17 1.86052885158978 6.95328123233322 -5.09275238074344 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0148937036014684 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 154 126 280 71.6303607862065 67.3933411749219 4.23701961128459 C:G C G 10 0.534867787102555 0.632044382965 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 75 76 151 34.8849159673084 40.6499518197942 -5.76503585248581 C:G C G 10 0.534867787102555 0.369857733906126 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 95 99 194 44.1875602252573 52.9519109231529 -8.76435069789567 T:C C T 10 0.534867787102555 0.221263202322759 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 457 482 939 212.565421294132 257.806273383432 -45.2408520892992 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00322370125246941 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 307 341 648 142.795589359516 182.389915401971 -39.5943260424556 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00185679345790604 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10229297 C/A 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000130811:ENST00000453552:exon_10229275_10229403:EIF3G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10251747 A/G 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 A:G A G 10 0.534867787102555 0.128640050678942 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 T:C T C 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 24 19 43 11.1631731095387 10.1624879549485 1.00068515459013 T:G T G 10 0.534867787102555 0.87873815611304 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 42 45 87 19.5355529416927 24.069050419615 -4.53349747792229 C:G C G 10 0.534867787102555 0.335618480101067 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 251 178 429 116.748185437259 95.2064661042548 21.5417193330039 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0374729038041485 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10404519 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105376:ENST00000221980:exon_10404374_10404619:ICAM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10441117 G/A 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 A:G G A 10 0.534867787102555 0.467707552599743 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10444826 G/A 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796972428964265 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 234 213 447 108.840937818002 113.926838652844 -5.08590083484208 A:G A G 10 0.534867787102555 0.635670477345463 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10472933 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 100 114 214 46.5132212897445 60.9749277296913 -14.4617064399468 A:C C A 10 0.534867787102555 0.054768364446191 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10477067 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 30 32 62 13.9539663869233 17.1157691872818 -3.16180280035841 C:G G C 10 0.534867787102555 0.446611798616851 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 73 78 151 33.9546515415135 41.7196873939993 -7.7650358524858 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.221239004397902 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 51 38 89 23.7217428577697 20.3249759098971 3.3967669478726 T:C C T 10 0.534867787102555 0.524161616608148 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 105 83 188 48.8388823542317 44.3940263295121 4.44485602471966 A:G A G 10 0.534867787102555 0.558769403862514 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10742443 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10742463 G/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:G G T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10793749 A/G 1 16 19 35 7.44211540635912 10.1624879549485 -2.72037254858943 A:G A G 10 0.534867787102555 0.398922124839835 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 574 541 1115 266.985890203133 289.363472822482 -22.3775826193489 T:G G T 10 0.534867787102555 0.186514679270880 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 89 76 165 41.3967669478726 40.6499518197942 0.746815128078424 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.937889595667205 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11031090 T/C 1 22 19 41 10.2329086837438 10.1624879549485 0.070420728795245 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 38 27 65 17.6750240901029 14.441430251769 3.23359383833392 T:C C T 10 0.534867787102555 0.457114219017479 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11213419 T/C 1 50 32 82 23.2566106448723 17.1157691872818 6.14084145759049 T:C T C 10 0.534867787102555 0.185197902118349 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11213340_11213462:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11213340_11213462:LDLR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11218226 G/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 34 20 54 15.8144952385131 10.6973557420511 5.11713949646203 A:G A G 10 0.534867787102555 0.174460174743270 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11241915 A/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11326119 A/G 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11326125 C/T 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11327608 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11327590_11327772:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11327590_11327772:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11327626 A/G 1 13 3 16 6.04671876766678 1.60460336130767 4.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0414818150900532 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11327590_11327772:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11327590_11327772:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:T T A 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11347493 T/C 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11347469_11347555:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11347469_11347555:DOCK6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11473358 C/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105520:ENST00000427915:exon_11473189_11473365:AC024575.1;ENSG00000105520:ENST00000251473:exon_11473189_11473365:AC024575.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11548955 T/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11553281 T/C 1 235 200 435 109.3060700309 106.973557420511 2.33251261038858 T:C T C 10 0.534867787102555 0.847599393481212 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11553201_11553330:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11553201_11553330:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11553201_11553330:PRKCSH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11559801 T/C 1 254 207 461 118.143582075951 110.717631930229 7.42595014572214 T:C T C 10 0.534867787102555 0.513408268918743 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11559729_11559803:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11559729_11559803:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11559729_11559803:PRKCSH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11559907 A/G 1 228 219 447 106.050144540617 117.13604537546 -11.0859008348421 A:G A G 10 0.534867787102555 0.297223787187623 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11559891_11559990:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11559891_11559990:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11559891_11559990:PRKCSH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11942362 A/G 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000457526:exon_11942183_11942516:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000414255:exon_11942183_11942493:ZNF440 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11942615 A/C 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11943552 G/A 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 A:G G A 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11979254 G/A 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000171291:ENST00000455282:exon_11978121_11980297:ZNF439;ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11978121_11980306:ZNF439 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 11979305 C/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 C:G C G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000171291:ENST00000455282:exon_11978121_11980297:ZNF439;ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11978121_11980306:ZNF439 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12128726 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197647:ENST00000344980:exon_12128691_12128751:ZNF433;ENSG00000197647:ENST00000419886:exon_12128691_12128751:ZNF433;ENSG00000197647:ENST00000455504:exon_12128691_12128751:ZNF433;ENSG00000197647:ENST00000478765:exon_12128691_12128751:ZNF433 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12759982 T/C 1 387 374 761 180.006166391311 200.040552376356 -20.0343859850444 T:C T C 10 0.534867787102555 0.146245108931663 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12759950_12760030:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12759950_12760030:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12759950_12760030:MAN2B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 164 197 361 76.281682915181 105.368954059203 -29.0872711440224 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00219860537072812 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 120 123 243 55.8158655476934 65.7887378136143 -9.97287226592086 A:G G A 10 0.534867787102555 0.221692783781383 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12783947 G/A 1 1 11 12 0.465132212897445 5.8835456581281 -5.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00206580726750062 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12812199 C/T 1 91 79 170 42.3270313736675 42.2545551811018 0.0724761925656523 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12876964 G/C 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 C:G G C 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000095066:ENST00000397668:exon_12876917_12877054:HOOK2;ENSG00000095066:ENST00000264827:exon_12876917_12877054:HOOK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 68 74 142 31.6289904770263 39.5802162455891 -7.95122576856281 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.206848881492142 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 73 86 159 33.9546515415135 45.9986296908197 -12.0439781493062 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0567207576230979 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13226900 C/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:C C A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 100 85 185 46.5132212897445 45.4637619037172 1.04945938602732 A:G A G 10 0.534867787102555 0.883161566863314 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 64 51 115 29.7684616254365 27.2782571422303 2.49020448320617 A:G A G 10 0.534867787102555 0.708650613968602 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 234 227 461 108.840937818002 121.41498767228 -12.5740498542779 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.243433853766318 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13885437 C/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:C C A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 883 772 1655 410.711743988444 412.917931643172 -2.20618765472852 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.921494433117677 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 73 84 157 33.9546515415135 44.9288941166146 -10.9742425751011 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0926238852542803 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 34 24 58 15.8144952385131 12.8368268904613 2.97766834805181 T:C T C 10 0.534867787102555 0.510839054649768 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 110 88 198 51.1645434187189 47.0683652650248 4.09617815369411 A:G G A 10 0.534867787102555 0.569577660044726 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14705499 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14705509 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 14705574 T/C 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 T:C T C 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000187912:ENST00000397439:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000417570:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000339847:exon_14705571_14705612:CLEC17A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 15535470 C/T 1 66 65 131 30.6987260512314 34.7664061616661 -4.06768011043471 T:C C T 10 0.534867787102555 0.484733479775229 ENSG00000011451:ENST00000263381:exon_15535424_15535843:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000389282:exon_15535424_15535843:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000416927:exon_15535424_15535843:WIZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 15565046 G/A 1 78 71 149 36.2803126060007 37.9756128842814 -1.69530027828069 A:G G A 10 0.534867787102555 0.805682525611433 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 15566888 C/A 1 22 24 46 10.2329086837438 12.8368268904613 -2.60391820671753 A:C C A 10 0.534867787102555 0.462891281671205 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 44 61 105 20.4658173674876 32.6269350132559 -12.1611176457683 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0187584594734160 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 16535957 G/A 1 32 27 59 14.8842308127182 14.441430251769 0.442800560949255 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000127527:ENST00000455140:exon_16535894_16536127:EPS15L1;ENSG00000127527:ENST00000248070:exon_16535894_16536127:EPS15L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 16633950 T/C 1 29 22 51 13.4888341740259 11.7670913162562 1.7217428577697 T:C T C 10 0.534867787102555 0.675251656578433 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16633863_16634101:CHERP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 31 29 60 14.4190985998208 15.5111658259741 -1.0920672261533 C:G G C 10 0.534867787102555 0.79694762683125 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17000632 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000127533:ENST00000248076:exon_17000384_17002830:F2RL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17160720 G/A 1 26 35 61 12.0934375353336 18.7203725485894 -6.62693501325585 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0958923813104294 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17160573_17160986:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17160573_17160986:HAUS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 20 21 41 9.3026442579489 11.2322235291537 -1.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.639159703203119 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17302056 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 137 133 270 63.72311316695 71.1374156846398 -7.41430251768985 T:C T C 10 0.534867787102555 0.393103343910841 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 215 206 421 100.003425772951 110.182764143126 -10.1793383701757 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.328715967647427 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17311442 C/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G C G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 144 87 231 66.9790386572321 46.5334974779223 20.4455411793098 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00819322164427821 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 130 109 239 60.4671876766678 58.3005887941785 2.16659888248935 T:C T C 10 0.534867787102555 0.795640491850183 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 68 91 159 31.6289904770263 48.6729686263325 -17.0439781493062 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00849517324059617 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 22 30 52 10.2329086837438 16.0460336130766 -5.81312492933286 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.125872179355328 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17321669 A/G 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485142004431293 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17351535 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160113:ENST00000291442:exon_17351480_17351574:NR2F6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17397298 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17397189_17397361:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17397189_17398455:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17397189_17398455:ANKLE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17531450 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000141971:ENST00000528997:exon_17531347_17531855:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528732:exon_17531122_17531529:FAM125A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17650608 G/C 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 C:G G C 10 0.534867787102555 0.149954178119034 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 22 26 48 10.2329086837438 13.9065624646664 -3.67365378092264 A:G A G 10 0.534867787102555 0.312974412829421 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 25 21 46 11.6283053224361 11.2322235291537 0.39608179328247 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 17952609 T/G 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 T:G T G 10 0.534867787102555 0.243153570620483 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 T:C T C 10 0.534867787102555 0.582705672158879 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18170852 G/A 0 15 0 15 6.97698319346167 0 6.97698319346167 G G 10 0.534867787102555 9.42065881354215e-05 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18170717_18170895:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18170701_18170895:IL12RB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18188280 C/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:C C A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 C:G C G 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18191780 C/T 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 T:C C T 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18234789 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234749_18234958:MAST3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 T:C C T 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 9 17 26 4.18618991607701 9.09275238074344 -4.90656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.074971365864513 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18257750 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18257691_18257827:MAST3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18279638 T/C 1 28 51 79 13.0237019611285 27.2782571422303 -14.2545551811018 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00147160769953452 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 1207 1045 2252 561.414580967216 558.93683752217 2.47774344504614 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.932664974133584 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18288642 A/G 1 9 29 38 4.18618991607701 15.5111658259741 -11.3249759098971 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000248500933623843 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 1 12 13 0.465132212897445 6.41841344523066 -5.95328123233322 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00105395249296596 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 0 0 10 10 0 5.34867787102555 -5.34867787102555 A T A 10 0.534867787102555 0.000473984541358627 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 0 0 10 10 0 5.34867787102555 -5.34867787102555 T G T 10 0.534867787102555 0.000473984541358627 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 18543431 G/T 1 1 9 10 0.465132212897445 4.81381008392299 -4.34867787102555 T:G G T 10 0.534867787102555 0.007840761770901 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 19032647 C/A 1 4 20 24 1.86052885158978 10.6973557420511 -8.83682689046132 A:C C A 10 0.534867787102555 0.000301188171612911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 19121086 C/T 1 76 82 158 35.3500481802058 43.8591585424095 -8.50911036220369 T:C C T 10 0.534867787102555 0.176234830039923 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19120664_19121151:SUGP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 25 20 45 11.6283053224361 10.6973557420511 0.930949580385025 T:C C T 10 0.534867787102555 0.881482718229074 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 19257638 T/C 1 39 42 81 18.1401563030004 22.4644470583073 -4.32429075530695 T:C T C 10 0.534867787102555 0.373261946430715 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000475290:exon_19257593_19257992:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257551_19257684:AC002126.6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 19640309 C/A 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:C C A 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000186010:ENST00000512771:exon_19640173_19640326:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000450144:exon_19640173_19640326:NDUFA13;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19640173_19640322:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19640173_19640322:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000334631:exon_19640173_19640322:YJEFN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 C:G C G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 20044041 G/T 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 T:G G T 10 0.534867787102555 0.130339312190040 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 20150175 G/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20150152_20150277:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20150152_20150277:ZNF682 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21132044 T/C 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21477379 C/T 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21477431 T/C 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C T C 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21580012 T/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:G T G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000196268:ENST00000392288:exon_21579931_21580069:ZNF493;ENSG00000196268:ENST00000355504:exon_21579935_21580069:ZNF493;ENSG00000196268:ENST00000339914:exon_21579958_21580069:ZNF493 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21688495 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21688437_21688576:ZNF429 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 23543834 C/T 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 23545004 G/A 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 23836766 T/C 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 T:C T C 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23836028_23837080:ZNF675 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 23926543 T/G 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 T:G T G 10 0.534867787102555 0.127818607776150 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 37 29 66 17.2098918772055 15.5111658259741 1.69872605123137 T:C C T 10 0.534867787102555 0.712483524471379 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 30193653 T/G 1 26 72 98 12.0934375353336 38.510480671384 -26.4170431360504 T:G T G 10 0.534867787102555 7.41664593641515e-08 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 41 23 64 19.0704207287952 12.3019591033588 6.76846162543648 A:G G A 10 0.534867787102555 0.103169881550915 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 32973077 C/T 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.18250118711251 ENSG00000178904:ENST00000342179:exon_32972985_32975236:DPY19L3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 T:C T C 10 0.534867787102555 0.49300969037024 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 27 8 35 12.558569748231 4.27894229682044 8.27962745141058 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00594205590525025 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33183316 A/G 1 27 11 38 12.558569748231 5.8835456581281 6.67502409010291 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0340178667108358 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33414420 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33414345_33414448:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33414341_33414448:CCDC123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 A:G G A 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 18 24 42 8.37237983215401 12.8368268904613 -4.46444705830731 A:G A G 10 0.534867787102555 0.215445908779324 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 33882222 G/A 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 A:G G A 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33882201_33882385:PEPD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35232171 T/C 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35434238 A/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35434512 T/C 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C T C 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35435006 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35449409 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000379189:exon_35449007_35449987:ZNF792 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35449760 G/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 C:G G C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000379189:exon_35449007_35449987:ZNF792 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35450229 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35450230 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35504627 C/A 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:C C A 10 0.534867787102555 0.190809482498995 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 98 29 127 45.5829568639496 15.5111658259741 30.0717910379755 A:C:G G A 10 0.534867787102555 5.28215992880159e-08 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 108 71 179 50.2342789929241 37.9756128842814 12.2586661086427 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0720236615040017 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 172 171 343 80.0027406183605 91.4623915945369 -11.4596509761764 A:G A G 10 0.534867787102555 0.233688522666144 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 297 328 625 138.144267230541 175.436634169638 -37.2923669390969 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00298170156995831 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35769561 T/G 1 17 7 24 7.90724761925657 3.74407450971789 4.16317310953868 T:G T G 10 0.534867787102555 0.102993456137107 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 45 43 88 20.930949580385 22.9993148454099 -2.06836526502484 T:C C T 10 0.534867787102555 0.670417319619812 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 443 377 820 206.053570313568 201.645155737663 4.40841457590491 A:G A G 10 0.534867787102555 0.77946417274852 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 35843086 G/A 1 21 17 38 9.76777647084634 9.09275238074344 0.675024090102909 A:G G A 10 0.534867787102555 0.871956006510723 ENSG00000126266:ENST00000246553:exon_35842455_35843357:FFAR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 58 92 150 26.9776683480518 49.2078364134351 -22.2301680653832 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.000296136923888786 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 398 397 795 185.122620733183 212.342511479714 -27.2198907465312 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0548578130960766 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36168914 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105668:ENST00000222275:exon_36168877_36169367:UPK1A;ENSG00000105668:ENST00000379013:exon_36168877_36169367:UPK1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36214865 C/T 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36214618_36214908:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36214633_36214908:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36214634_36214908:AD000671.3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 58 58 116 26.9776683480518 31.0223316519482 -4.04466330389638 A:G A G 10 0.534867787102555 0.458072359978568 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36259494 C/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:C C A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36275074 G/A 1 21 26 47 9.76777647084634 13.9065624646664 -4.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.244135128570163 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36275074_36275219:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36275074_36275219:ARHGAP33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36276403 T/G 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36278470 C/G 1 18 14 32 8.37237983215401 7.48814901943577 0.88423081271824 C:G C G 10 0.534867787102555 0.859899586609749 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36515560 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36530562 T/C 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 36940698 A/G 1 9 14 23 4.18618991607701 7.48814901943577 -3.30195910335877 A:G A G 10 0.534867787102555 0.210174710637985 ENSG00000186017:ENST00000434377:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000454319:exon_36936021_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000493391:exon_36937923_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000392170:exon_36938531_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000424129:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000358744:exon_36938584_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000452939:exon_36940435_36940903:ZNF566;ENSG00000186017:ENST00000427002:exon_36940666_36940903:ZNF566 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37310344 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37441365 T/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37677748 T/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:T T A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000245680:ENST00000531805:exon_37675722_37678146:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000532828:exon_37675722_37678146:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000527838:exon_37675724_37677830:ZNF585B;ENSG00000245680:ENST00000501522:exon_37676129_37678146:ZNF585B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37835658 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37835512_37835676:HKR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 41 40 81 19.0704207287952 21.3947114841022 -2.32429075530695 A:G G A 10 0.534867787102555 0.656363928531873 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 A:T A T 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 38189616 T/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198182:ENST00000355202:exon_38187276_38190796:ZNF607 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 38229378 G/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000189144:ENST00000392138:exon_38229203_38231095:ZNF573;ENSG00000189144:ENST00000357309:exon_38229206_38231095:ZNF573;ENSG00000189144:ENST00000339503:exon_38229206_38231095:ZNF573 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 141 127 268 65.5836420185397 67.9282089620245 -2.34456694348474 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.806582038633603 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 81 93 174 37.675709244693 49.7427042005376 -12.0669949558446 A:G G A 10 0.534867787102555 0.068468364211544 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 20 21 41 9.3026442579489 11.2322235291537 -1.92957927120476 A:G G A 10 0.534867787102555 0.639159703203119 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 133 105 238 61.8625843153602 56.1611176457683 5.70146666959191 T:C C T 10 0.534867787102555 0.475227439229426 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39914308 C/T 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 T:C C T 10 0.534867787102555 0.831969512247843 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 62 68 130 28.8381971996416 36.3710095229737 -7.53281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.188418326683301 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 54 36 90 25.117139496462 19.255240335692 5.86189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 0.2452037572176 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 65 73 138 30.2335938383339 39.0453484584865 -8.81175462015259 C:G C G 10 0.534867787102555 0.146783396772798 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 17 21 38 7.90724761925657 11.2322235291537 -3.32497590989709 T:C T C 10 0.534867787102555 0.329852297176118 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 4227 3655 7882 1966.1138639175 1954.94176185984 11.1721020576615 A:T:C:G A C 10 0.534867787102555 0.803828157057763 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 4074 3525 7599 1894.94863534419 1885.40894953651 9.53968580768446 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.827059167063377 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 74 63 137 34.4197837544109 33.696670587461 0.723113166949965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.931886452873629 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 39963621 C/A 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:C C A 10 0.534867787102555 0.194126160849861 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 C:G C G 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 137 131 268 63.72311316695 70.0676801104347 -6.34456694348474 T:C C T 10 0.534867787102555 0.46257358868778 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40486136 G/A 1 26 21 47 12.0934375353336 11.2322235291537 0.861214006179914 A:G G A 10 0.534867787102555 0.884096235186603 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40519935 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000187187:ENST00000347077:exon_40519572_40523514:ZNF546 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40541039 C/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000128000:ENST00000434248:exon_40534167_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000388801:exon_40540414_40541685:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000445410:exon_40540414_40541685:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000221355:exon_40539486_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000412146:exon_40540228_40542533:ZNF780B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 34 50 84 15.8144952385131 26.7433893551277 -10.9288941166146 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0210898875459971 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 152 128 280 70.7000963604116 68.463076749127 2.23701961128459 A:G A G 10 0.534867787102555 0.810786612182222 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40742320 T/C 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40742164_40743998:AKT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40882486 C/G 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 C:G C G 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000105223:ENST00000488311:exon_40882174_40882681:PLD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 50 31 81 23.2566106448723 16.5809014001792 6.67570924469305 T:C T C 10 0.534867787102555 0.148291349798260 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 28 19 47 13.0237019611285 10.1624879549485 2.86121400617991 A:G G A 10 0.534867787102555 0.465624873092918 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41186879 A/G 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000105245:ENST00000252891:exon_41186822_41186962:NUMBL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 T:C T C 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 176 129 305 81.8632694699503 68.9979445362296 12.8653249337207 A:G A G 10 0.534867787102555 0.151226267856959 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41269481 T/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 142 103 245 66.0487742314372 55.0913820715632 10.957392159874 T:C T C 10 0.534867787102555 0.178541265019277 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41847919 G/C 1 248 262 510 115.352788798566 140.135360220869 -24.7825714223031 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0295621128285776 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41847788_41847935:TGFB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 25 29 54 11.6283053224361 15.5111658259741 -3.88286050353797 T:C T C 10 0.534867787102555 0.339846679833752 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41897674 G/A 1 13 6 19 6.04671876766678 3.20920672261533 2.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.251280044543956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41897688 G/A 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 52 48 100 24.1868750706671 25.6736537809226 -1.4867787102555 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.764840702058961 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 89 56 145 41.3967669478726 29.9525960777431 11.4441708701295 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0666666564442454 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 151 113 264 70.2349641475142 60.4400599425887 9.79490420492547 A:G A G 10 0.534867787102555 0.241228876734644 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41932084 G/T 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000177191:ENST00000321702:exon_41931265_41932715:B3GNT8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41932120 C/T 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000177191:ENST00000321702:exon_41931265_41932715:B3GNT8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41932275 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000177191:ENST00000321702:exon_41931265_41932715:B3GNT8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41937095 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41936961_41937250:BCKDHA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 30 33 63 13.9539663869233 17.6506369743843 -3.69667058746097 C:G C G 10 0.534867787102555 0.377960048285944 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 33 43 76 15.3493630256157 22.9993148454099 -7.64995181979418 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0848859290702088 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 42912441 T/C 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 T:C T C 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42912384_42912474:LIPE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44001345 C/T 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C C T 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 12 16 28 5.58158655476934 8.55788459364088 -2.97629803887154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.343713788088321 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 67 41 108 31.1638582641288 21.9295792712048 9.23427899292406 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.0824341905634454 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 18 23 41 8.37237983215401 12.3019591033588 -3.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.272995522397383 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 21 13 34 9.76777647084634 6.95328123233322 2.81449523851313 T:C C T 10 0.534867787102555 0.391595923439878 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 A:G A G 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 40 30 70 18.6052885158978 16.0460336130766 2.55925490282115 C:G G C 10 0.534867787102555 0.551955007965208 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 41 28 69 19.0704207287952 14.9762980388715 4.0941226899237 T:C T C 10 0.534867787102555 0.336957000153830 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44471209 T/A 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:T T A 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44471075_44471229:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44471252 T/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44471323 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44535999 G/T 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:G G T 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44570393 C/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:C C A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44570951 G/A 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 36 29 65 16.744759664308 15.5111658259741 1.23359383833393 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80437607092977 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 31 30 61 14.4190985998208 16.0460336130766 -1.62693501325585 T:G G T 10 0.534867787102555 0.701605803608164 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 32 24 56 14.8842308127182 12.8368268904613 2.04740392225692 A:G A G 10 0.534867787102555 0.595549866241108 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 37 29 66 17.2098918772055 15.5111658259741 1.69872605123137 T:C T C 10 0.534867787102555 0.712483524471379 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 39 40 79 18.1401563030004 21.3947114841022 -3.25455518110184 A:G A G 10 0.534867787102555 0.499345312127459 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 40 35 75 18.6052885158978 18.7203725485894 -0.115084032691623 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 40 36 76 18.6052885158978 19.255240335692 -0.649951819794179 A:G A G 10 0.534867787102555 0.908789985616379 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44652954 G/A 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44652924_44653050:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44652924_44653050:ZNF234 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G G A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 C:G C G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 6 34 40 2.79079327738467 18.1855047614869 -15.3947114841022 T:C T C 10 0.534867787102555 6.19659450587534e-07 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 39 22 61 18.1401563030004 11.7670913162562 6.37306498674415 A:G G A 10 0.534867787102555 0.123022111795832 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44778405 A/C 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000159915:ENST00000334152:exon_44777458_44778826:ZNF233;ENSG00000159915:ENST00000391958:exon_44777052_44779468:ZNF233;ENSG00000159915:ENST00000253426:exon_44777052_44779468:ZNF233;ENSG00000159915:ENST00000280305:exon_44778147_44778796:ZNF233 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44792969 G/A 1 6 18 24 2.79079327738467 9.62762016784599 -6.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00669892307548342 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44890697 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000184280:ENST00000330997:exon_44886479_44892264:ZNF285 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44981375 T/C 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:C T C 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 C:G C G 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45490428 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45540675 C/T 1 133 180 313 61.8625843153602 96.2762016784599 -34.4136173630997 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000110545282044743 ENSG00000104856:ENST00000221452:exon_45540663_45541452:RELB;ENSG00000104856:ENST00000505236:exon_45540663_45541417:RELB;ENSG00000104856:ENST00000509229:exon_45540663_45540826:RELB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45571781 T/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 42 19 61 19.5355529416927 10.1624879549485 9.37306498674414 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0201398484102540 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 43 38 81 20.0006851545901 20.3249759098971 -0.324290755306958 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 A:G G A 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 37 29 66 17.2098918772055 15.5111658259741 1.69872605123137 A:G A G 10 0.534867787102555 0.712483524471379 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 250 207 457 116.283053224361 110.717631930229 5.56542129413236 A:T:C:G T G 10 0.534867787102555 0.60637545759429 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46025400 G/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 68 88 156 31.6289904770263 47.0683652650248 -15.4393747879986 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0157868023112063 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 33 31 64 15.3493630256157 16.5809014001792 -1.23153837456352 A:C C A 10 0.534867787102555 0.802681973476528 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46142053 C/T 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46180150 A/G 1 11 18 29 5.1164543418719 9.62762016784599 -4.51116582597409 A:G A G 10 0.534867787102555 0.097583539926297 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46191845 C/G 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 C:G C G 10 0.534867787102555 0.319398149927548 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 39 43 82 18.1401563030004 22.9993148454099 -4.85915854240951 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319262796091445 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 T:C C T 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46289503 C/T 1 42 47 89 19.5355529416927 25.1387859938201 -5.6032330521274 T:C C T 10 0.534867787102555 0.243814811255743 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46294136 G/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 109 83 192 50.6994112058215 44.3940263295121 6.30538487630944 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.385608270351656 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46324612 G/A 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46324358_46324743:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 53 55 108 24.6520072835646 29.4177282906405 -4.76572100707594 T:C C T 10 0.534867787102555 0.385786582129870 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46329438 G/A 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 A:G G A 10 0.534867787102555 0.127818607776150 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 74 67 141 34.4197837544109 35.8361417358712 -1.41635798146026 A:G G A 10 0.534867787102555 0.866001399714074 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 73 84 157 33.9546515415135 44.9288941166146 -10.9742425751011 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0926238852542803 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 43 47 90 20.0006851545901 25.1387859938201 -5.13810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.291849310478259 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46375779 C/T 1 11 1 12 5.1164543418719 0.534867787102555 4.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0077867623210267 ENSG00000170608:ENST00000302177:exon_46375333_46377054:FOXA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 41 39 80 19.0704207287952 20.8598436969996 -1.7894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.737129382138969 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 26 27 53 12.0934375353336 14.441430251769 -2.34799271643542 C:G C G 10 0.534867787102555 0.582405025185927 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 32 22 54 14.8842308127182 11.7670913162562 3.11713949646203 A:G A G 10 0.534867787102555 0.416220945230801 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 12 30 42 5.58158655476934 16.0460336130766 -10.4644470583073 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00163782956236844 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47184991 C/T 1 58 62 120 26.9776683480518 33.1618028003584 -6.1841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.272776965286934 ENSG00000105287:ENST00000454760:exon_47184907_47185005:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000449438:exon_47184907_47185005:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000433867:exon_47184907_47185005:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000291281:exon_47184907_47185005:PRKD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 136 126 262 63.2579809540525 67.3933411749219 -4.13536022086941 A:G G A 10 0.534867787102555 0.620662162599329 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47424219 C/T 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 T:C C T 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000160007:ENST00000317082:exon_47421933_47425613:GRLF1;ENSG00000160007:ENST00000404338:exon_47421933_47425613:GRLF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 20 24 44 9.3026442579489 12.8368268904613 -3.53418263251242 C:G G C 10 0.534867787102555 0.294322558039473 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 40 32 72 18.6052885158978 17.1157691872818 1.48951932861604 A:G G A 10 0.534867787102555 0.81342805317915 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 55 41 96 25.5822717093595 21.9295792712048 3.65269243815472 T:C C T 10 0.534867787102555 0.47537024500864 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 A:G G A 10 0.534867787102555 0.18250118711251 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 12 1 13 5.58158655476934 0.534867787102555 5.04671876766678 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00436890327669135 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 48250300 C/T 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.816289814725156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 302 417 719 140.469928295028 223.039867221765 -82.5699389267371 A:C:G A G 10 0.534867787102555 7.47481003352877e-10 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 29 35 64 13.4888341740259 18.7203725485894 -5.23153837456352 T:G G T 10 0.534867787102555 0.210749373638412 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 48954395 C/T 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 T:C C T 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49300605 T/C 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49303469 C/T 1 52 30 82 24.1868750706671 16.0460336130766 8.14084145759049 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0768027668437765 ENSG00000105552:ENST00000316273:exon_49303444_49303554:BCAT2;ENSG00000105552:ENST00000402551:exon_49303444_49303554:BCAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49376860 A/G 1 155 145 300 72.095492999104 77.5558291298705 -5.46033613076651 A:G A G 10 0.534867787102555 0.562822269885708 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49421966 T/C 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49421924_49422001:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000460125:exon_49421633_49422041:NUCB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49458262 C/T 1 15 18 33 6.97698319346167 9.62762016784599 -2.65063697438432 T:C C T 10 0.534867787102555 0.38622307733151 ENSG00000087088:ENST00000502487:exon_49458072_49458856:BAX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49481243 T/C 1 35 22 57 16.2796274514106 11.7670913162562 4.51253613515437 T:C T C 10 0.534867787102555 0.288049673425525 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000472004:exon_49481181_49481243:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000496048:exon_49481181_49481259:GYS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49497123 T/C 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.033554406248866 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 6 15 21 2.79079327738467 8.02301680653832 -5.23222352915365 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0275138695227108 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 47 42 89 21.8612140061799 22.4644470583073 -0.603233052127397 A:G A G 10 0.534867787102555 0.915701867101544 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49812123 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 49812403 G/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 156 159 315 72.5606252120014 85.0439781493062 -12.4833529373048 C:G C G 10 0.534867787102555 0.175145123434940 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50166650 C/T 1 120 86 206 55.8158655476934 45.9986296908197 9.81723585687367 T:C C T 10 0.534867787102555 0.184528761425855 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50166600_50166771:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50166600_50166771:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50166600_50166771:IRF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50191506 C/T 1 518 483 1001 240.938486280877 258.341141170534 -17.4026548896576 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.281362473906886 ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000530361:exon_50191419_50191676:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527866:exon_50191419_50192286:PRMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50321858 G/A 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.560897834646131 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321828_50321873:MED25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50360989 A/G 1 102 75 177 47.4434857155394 40.1150840326916 7.32840168284776 A:G A G 10 0.534867787102555 0.291659679515333 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50360950_50361039:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50360950_50361039:PTOV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 537 307 844 249.775998325928 164.204410640484 85.5715876854436 A:G A G 10 0.534867787102555 3.21031562945873e-09 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50399354 G/C 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 100 103 203 46.5132212897445 55.0913820715632 -8.57816078181867 A:G G A 10 0.534867787102555 0.232332055153297 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 619 358 977 287.916839783518 191.482667782715 96.4341720008038 T:C T C 10 0.534867787102555 5.31695611248383e-10 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 662 488 1150 307.917524938109 261.015480106047 46.9020448320618 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00595186375626929 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50905089 T/C 1 23 30 53 10.6980408966412 16.0460336130766 -5.34799271643541 T:C T C 10 0.534867787102555 0.168228619072260 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50905439 G/C 1 15 52 67 6.97698319346167 27.8131249293329 -20.8361417358712 A:C:G G C 10 0.534867787102555 2.44645639058356e-07 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 149 68 217 69.3046997217193 36.3710095229737 32.9336901987456 T:C T C 10 0.534867787102555 6.18336291643675e-06 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 221 226 447 102.794219050335 120.880119885177 -18.0859008348421 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0879698987814578 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 204 256 460 94.8869714310788 136.926153498254 -42.0391820671753 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000100574938800636 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 175 214 389 81.3981372570529 114.461706439947 -33.0635691828939 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00093034017415636 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 119 154 273 55.350733334796 82.3696392137935 -27.0189058789975 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00126072909528905 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 112 185 297 52.0948078445138 98.9505406139727 -46.8557327694588 A:G A G 10 0.534867787102555 5.1436711975114e-08 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51379893 C/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C C T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000423722:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51379728_51380014:KLK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51853628 A/G 1 86 105 191 40.0013703091803 56.1611176457683 -16.159747336588 A:G A G 10 0.534867787102555 0.020218367457668 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51853583_51853645:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51853583_51853645:ETFB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51917735 G/A 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 A:G G A 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51917676_51917769:SIGLEC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51918112 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51918078_51918362:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51918078_51918362:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51918078_51918362:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51918078_51918362:SIGLEC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51920240 G/T 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:G G T 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000142512:ENST00000524527:exon_51920177_51920719:SIGLEC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 51920613 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51920386_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51920336_51920688:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51920336_51920719:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000524527:exon_51920177_51920719:SIGLEC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52132325 A/T 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52132291_52132329:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52132291_52132329:SIGLEC14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52376507 T/C 1 13 8 21 6.04671876766678 4.27894229682044 1.76777647084634 T:C T C 10 0.534867787102555 0.515422591350918 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52376952 T/A 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 A:T T A 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52472289 C/T 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52472258_52472384:ZNF615 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52825032 C/T 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 T:C C T 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000198464:ENST00000468240:exon_52824832_52826949:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000490272:exon_52824832_52826933:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000429434:exon_52824832_52829163:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000335090:exon_52824832_52827333:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000391790:exon_52824832_52829163:ZNF480 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 6 20 26 2.79079327738467 10.6973557420511 -7.90656246466643 A:C A C 10 0.534867787102555 0.00248680706919341 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 9 18 27 4.18618991607701 9.62762016784599 -5.44143025176898 T:C T C 10 0.534867787102555 0.051709482565568 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53056953 G/A 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53057925 C/A 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 A:C C A 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 9 10 19 4.18618991607701 5.34867787102555 -1.16248795494854 T:C C T 10 0.534867787102555 0.649883599673449 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53085813 T/C 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53086124 C/A 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 A:C C A 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 49 40 89 22.7914784319748 21.3947114841022 1.39676694787261 T:C C T 10 0.534867787102555 0.831921959417736 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 42 36 78 19.5355529416927 19.255240335692 0.28031260600071 A:C:G C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53209553 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53209554 G/T 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:G G T 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 28 9 37 13.0237019611285 4.81381008392299 8.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00767952467814298 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 A:G G A 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53303745 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53344701 A/G 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53344919 T/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 12 3 15 5.58158655476934 1.60460336130767 3.97698319346167 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0663309153643763 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53409976 T/C 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.28201462375414 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 15 4 19 6.97698319346167 2.13947114841022 4.83751204505145 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0360007359864548 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53454543 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53454789 A/T 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 A:T A T 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 21 24 45 9.76777647084634 12.8368268904613 -3.06905041961498 T:C T C 10 0.534867787102555 0.373583488422862 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53576589 C/G 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 14 21 35 6.51185098056423 11.2322235291537 -4.72037254858943 C:G G C 10 0.534867787102555 0.127664441951459 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53612989 A/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G A G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000170954:ENST00000243643:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000448501:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000421033:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000440291:exon_53611133_53613161:ZNF415;ENSG00000170954:ENST00000455735:exon_53611354_53613161:ZNF415 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53912127 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53958126 T/G 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:G T G 10 0.534867787102555 0.806945941972106 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53958263 G/A 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.535462440174447 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 22 15 37 10.2329086837438 8.02301680653832 2.20989187720547 C:G G C 10 0.534867787102555 0.512648936021927 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53993923 C/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813;ENSG00000198346:ENST00000468450:exon_53993629_53994020:ZNF813 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 53994525 A/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 A:T:C C A 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55106317 A/G 0 12 0 12 5.58158655476934 0 5.58158655476934 A A 10 0.534867787102555 0.000650768675436711 ENSG00000104974:ENST00000473156:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000495417:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000251372:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000477255:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000453777:exon_55106130_55106417:LILRA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55106338 A/C 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000104974:ENST00000473156:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000495417:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000251372:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000477255:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000453777:exon_55106130_55106417:LILRA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 64 41 105 29.7684616254365 21.9295792712048 7.83888235423172 T:C C T 10 0.534867787102555 0.142112934739910 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 52 51 103 24.1868750706671 27.2782571422303 -3.09138207156317 A:G A G 10 0.534867787102555 0.554725027320386 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 77 59 136 35.8151803931033 31.5571994390507 4.25798095405252 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.492268976225313 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55824332 T/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180061:ENST00000326652:exon_55824169_55824423:TMEM150B;ENSG00000180061:ENST00000438693:exon_55824227_55824423:TMEM150B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 14 23 37 6.51185098056423 12.3019591033588 -5.79010812279454 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.069085953031393 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 62 75 137 28.8381971996416 40.1150840326916 -11.27688683305 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0593375871581038 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 56185250 G/A 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 0.638780682626094 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57065189 T/C 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.283655371776667 ENSG00000196867:ENST00000301318:exon_57065053_57068169:ZFP28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57066013 C/T 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000196867:ENST00000301318:exon_57065053_57068169:ZFP28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57088558 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000197016:ENST00000391709:exon_57088081_57094261:ZNF470;ENSG00000197016:ENST00000330619:exon_57088081_57089951:ZNF470;ENSG00000197016:ENST00000446235:exon_57088552_57089951:ZNF470 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 24 24 48 11.1631731095387 12.8368268904613 -1.67365378092264 A:G G A 10 0.534867787102555 0.665805956068601 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57723007 G/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 C:G G C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57722722_57734212:ZNF264 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57723013 G/A 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57722722_57734212:ZNF264 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57802806 C/T 1 17 5 22 7.90724761925657 2.67433893551277 5.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0311331964571846 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57802824 G/A 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57832214 G/T 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57831877_57832239:ZNF543 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57867599 T/C 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C:G T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000131845:ENST00000282286:exon_57867398_57871266:ZNF304;ENSG00000131845:ENST00000391705:exon_57867398_57871266:ZNF304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57909872 G/A 1 12 18 30 5.58158655476934 9.62762016784599 -4.04603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.147172704883020 ENSG00000188785:ENST00000366197:exon_57909798_57912785:ZNF548;ENSG00000188785:ENST00000336128:exon_57909798_57911257:ZNF548 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:G T G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57967133 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000178201:ENST00000321039:exon_57966542_57967854:VN1R1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57984918 A/G 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 ENSG00000197128:ENST00000427512:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000343280:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000356584:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000450712:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000291809:exon_57984642_57985560:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000425074:exon_57984642_57985560:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000415705:exon_57984642_57985566:ZNF772 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57985460 T/A 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:T T A 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000197128:ENST00000427512:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000343280:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000319969:exon_57985298_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000356584:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000450712:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000291809:exon_57984642_57985560:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000425074:exon_57984642_57985560:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000415705:exon_57984642_57985566:ZNF772 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 57985566 G/C 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 C:G G C 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000197128:ENST00000427512:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000343280:exon_57980955_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000319969:exon_57985298_57985789:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000356584:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000450712:exon_57984642_57985566:ZNF772;ENSG00000197128:ENST00000415705:exon_57984642_57985566:ZNF772 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58213969 T/G 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 T:G T G 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58361334 G/A 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000198466:ENST00000423137:exon_58361228_58361439:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000484707:exon_58361228_58361439:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000339656:exon_58361269_58361439:ZNF587 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58596109 A/T 1 26 27 53 12.0934375353336 14.441430251769 -2.34799271643542 A:T A T 10 0.534867787102555 0.582405025185927 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58600048 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58904715 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 T:C T C 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 20 10 30 9.3026442579489 5.34867787102555 3.95396638692335 A:G G A 10 0.534867787102555 0.199468342313066 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 20 12 32 9.3026442579489 6.41841344523066 2.88423081271824 A:G A G 10 0.534867787102555 0.376491222425149 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58946056 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000131849:ENST00000254166:exon_58944182_58946578:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000391695:exon_58945866_58946169:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000418193:exon_58945866_58946169:ZNF132 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58963018 C/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 C:G C G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000249471:ENST00000336614:exon_58962971_58963071:ZNF324B;ENSG00000249471:ENST00000391696:exon_58963014_58963071:ZNF324B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 20 15 35 9.3026442579489 8.02301680653832 1.27962745141058 A:C A C 10 0.534867787102555 0.736175658421399 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58991743 G/A 1 13 16 29 6.04671876766678 8.55788459364088 -2.5111658259741 A:G G A 10 0.534867787102555 0.359273405953985 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 23 24 47 10.6980408966412 12.8368268904613 -2.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.560897834646131 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59025685 A/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:C A C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 422 346 768 196.285793842722 185.064254337484 11.2215395052378 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.426282505272512 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59067623 C/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 40 29 69 18.6052885158978 15.5111658259741 3.09412268992371 A:G A G 10 0.534867787102555 0.471701744799663 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 34 31 65 15.8144952385131 16.5809014001792 -0.766406161666074 T:C C T 10 0.534867787102555 0.90129126971515 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 18 28 46 8.37237983215401 14.9762980388715 -6.60391820671753 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0552189058412865 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59082368 C/T 1 13 18 31 6.04671876766678 9.62762016784599 -3.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.211610157714882 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59082361_59082796:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59082361_59082796:MZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 19 59082605 C/T 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 T:C C T 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59082361_59082796:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59082361_59082796:MZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 36 29 65 16.744759664308 15.5111658259741 1.23359383833393 T:C C T 10 0.534867787102555 0.80437607092977 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 301 242 543 140.004796082131 129.438004478818 10.5667916033127 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366700924599551 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 1652660 G/A 0 8 0 8 3.72105770317956 0 3.72105770317956 G G 10 0.534867787102555 0.00888925060565865 ENSG00000130508:ENST00000252804:exon_1651944_1653447:PXDN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 31 37 68 14.4190985998208 19.7901081227945 -5.37100952297374 A:G A G 10 0.534867787102555 0.224015024444935 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 44 46 90 20.4658173674876 24.6039182067175 -4.13810083922995 C:G G C 10 0.534867787102555 0.399225377788537 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3481531 T/C 1 34 30 64 15.8144952385131 16.0460336130766 -0.231538374563518 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3481466_3481872:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000452495:exon_3481486_3481566:TTC15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3482912 G/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 74 66 140 34.4197837544109 35.3012739487686 -0.881490194357703 T:C C T 10 0.534867787102555 0.93252880787399 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 49 45 94 22.7914784319748 24.069050419615 -1.27757198764017 A:G A G 10 0.534867787102555 0.836432958535203 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 14 26 40 6.51185098056423 13.9065624646664 -7.3947114841022 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0253437296467524 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 31 25 56 14.4190985998208 13.3716946775639 1.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.790777918729491 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 3628383 C/A 1 20 35 55 9.3026442579489 18.7203725485894 -9.41772829064052 A:C C A 10 0.534867787102555 0.014256432570991 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 8822266 C/T 1 62 76 138 28.8381971996416 40.6499518197942 -11.8117546201526 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.0494166433512705 ENSG00000115738:ENST00000234091:exon_8821984_8822643:ID2;ENSG00000115738:ENST00000396290:exon_8822113_8822643:ID2;ENSG00000115738:ENST00000331129:exon_8822186_8822643:ID2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 26 21 47 12.0934375353336 11.2322235291537 0.861214006179914 T:C T C 10 0.534867787102555 0.884096235186603 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 9554280 A/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 A:T A T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 23 11 34 10.6980408966412 5.8835456581281 4.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.121336627273295 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 10016050 A/G 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10015994_10016147:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10015994_10016147:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10015994_10016147:TAF1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:G G T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 10188649 A/T 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:T A T 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000172059:ENST00000305883:exon_10187777_10188722:KLF11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 200 183 383 93.026442579489 97.8808050397676 -4.85436246027857 T:G T G 10 0.534867787102555 0.644875703745753 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 565 526 1091 262.799700287056 281.340456015944 -18.5407557288875 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 0.261631438658389 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 20101487 G/A 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.49300969037024 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 52 47 99 24.1868750706671 25.1387859938201 -0.951910923152948 A:C C A 10 0.534867787102555 0.919816244784387 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 4 13 17 1.86052885158978 6.95328123233322 -5.09275238074344 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0148937036014684 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 A:G G A 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 24432835 T/G 1 29 21 50 13.4888341740259 11.2322235291537 2.25661064487225 T:G T G 10 0.534867787102555 0.5722669806911 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 24929851 A/T 1 23 9 32 10.6980408966412 4.81381008392299 5.88423081271824 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0496810565368202 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24929437_24930757:NCOA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 27 26 53 12.558569748231 13.9065624646664 -1.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.783434760645152 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 26 26 52 12.0934375353336 13.9065624646664 -1.81312492933286 A:G A G 10 0.534867787102555 0.677331176291186 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 17 2 19 7.90724761925657 1.06973557420511 6.83751204505146 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0018400874483353 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 25 18 43 11.6283053224361 9.62762016784599 2.00068515459014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.647041464439815 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 26420574 T/C 1 76 69 145 35.3500481802058 36.9058773100763 -1.55582912987047 T:C T C 10 0.534867787102555 0.803335136258867 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26420560_26420646:HADHA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 26590084 T/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:G T G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000138018:ENST00000442141:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000407686:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000260585:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000447170:exon_26590014_26590088:EPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27246285 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000084764:ENST00000233121:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000405074:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000475633:exon_27246200_27247089:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000481222:exon_27246200_27246813:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000474367:exon_27246200_27246402:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000458529:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000402218:exon_27246200_27246345:MAPRE3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27279013 A/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000084693:ENST00000489683:exon_27278550_27279332:AGBL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 T:G G T 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 80 104 184 37.2105770317956 55.6262498586657 -18.4156728268701 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00764429415728358 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27559188 G/C 1 64 65 129 29.7684616254365 34.7664061616661 -4.9979445362296 C:G G C 10 0.534867787102555 0.379196007651115 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27559065_27559292:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27559065_27559292:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27559065_27559292:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000470115:exon_27558784_27559292:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000493511:exon_27559065_27559634:GTF3C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 27851918 G/A 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000436280:exon_27851891_27852036:GPN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 35 37 72 16.2796274514106 19.7901081227945 -3.51048067138396 A:G A G 10 0.534867787102555 0.411201241860440 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 36 37 73 16.744759664308 19.7901081227945 -3.04534845848652 T:C T C 10 0.534867787102555 0.483874566234905 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 38 36 74 17.6750240901029 19.255240335692 -1.58021624558907 T:G G T 10 0.534867787102555 0.727953498512968 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 31 25 56 14.4190985998208 13.3716946775639 1.04740392225692 A:G A G 10 0.534867787102555 0.790777918729491 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 67 65 132 31.1638582641288 34.7664061616661 -3.60254789753726 A:G A G 10 0.534867787102555 0.542341296843081 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 79 104 183 36.7454448188982 55.6262498586657 -18.8808050397676 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.00597418631518474 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 51 47 98 23.7217428577697 25.1387859938201 -1.41704313605039 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 0.839643407218525 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37439069 A/G 1 24 42 66 11.1631731095387 22.4644470583073 -11.3012739487686 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00629460893897566 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 20 12 32 9.3026442579489 6.41841344523066 2.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.376491222425149 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37475457 C/T 1 24 41 65 11.1631731095387 21.9295792712048 -10.7664061616661 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00866829747386173 ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37475278_37475563:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000419278:exon_37475278_37475530:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000441905:exon_37475401_37475569:C2orf56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:G A G 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 37518045 G/C 0 0 10 10 0 5.34867787102555 -5.34867787102555 C G C 10 0.534867787102555 0.000473984541358627 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000475912:exon_37518011_37518105:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443187:exon_37518011_37518142:PRKD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 16 14 30 7.44211540635912 7.48814901943577 -0.0460336130766503 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:C A C 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 T:C T C 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 39088574 G/A 1 17 9 26 7.90724761925657 4.81381008392299 3.09343753533357 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.244174969689519 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000479345:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000355320:exon_39088141_39088979:DHX57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 39 34 73 18.1401563030004 18.1855047614869 -0.0453484584865151 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 T:C T C 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 44123759 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138095:ENST00000472420:exon_44123376_44123847:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000483489:exon_44123583_44123847:LRPPRC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 46987300 T/G 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:G T G 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 33 19 52 15.3493630256157 10.1624879549485 5.18687507066714 A:G G A 10 0.534867787102555 0.165587002921691 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 47637337 C/A 1 10 21 31 4.65132212897445 11.2322235291537 -6.58090140017921 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0193568230470193 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000454849:exon_47637233_47637485:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47637233_47637511:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000422810:exon_47637233_47637376:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47637233_47637346:MSH2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 48713777 C/T 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48713770_48713897:KLRAQ1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 11 23 34 5.1164543418719 12.3019591033588 -7.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0155757272744578 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 44 44 88 20.4658173674876 23.5341826325124 -3.06836526502484 A:G A G 10 0.534867787102555 0.523168650710111 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 24 28 52 11.1631731095387 14.9762980388715 -3.81312492933286 A:G A G 10 0.534867787102555 0.331041744557042 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 19 34 53 8.83751204505145 18.1855047614869 -9.34799271643542 A:T A T 10 0.534867787102555 0.012560370169548 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 31 32 63 14.4190985998208 17.1157691872818 -2.69667058746096 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529028456616675 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 T:C C T 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 27 22 49 12.558569748231 11.7670913162562 0.791478431974806 T:C T C 10 0.534867787102555 0.886588645557311 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 55201038 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000115310:ENST00000491592:exon_55200699_55201155:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000485749:exon_55200957_55201327:RTN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 160 104 264 74.4211540635912 55.6262498586657 18.7949042049255 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0222971518523395 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 58 59 117 26.9776683480518 31.5571994390507 -4.57953109099893 A:T T A 10 0.534867787102555 0.405579432920248 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 26 28 54 12.0934375353336 14.9762980388715 -2.88286050353797 T:G G T 10 0.534867787102555 0.495673046163505 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 27 20 47 12.558569748231 10.6973557420511 1.86121400617992 A:G A G 10 0.534867787102555 0.661763290758282 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 155 133 288 72.095492999104 71.1374156846398 0.958077314464148 A:G A G 10 0.534867787102555 0.952912156976243 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 61577435 T/C 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61577395_61577524:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61577395_61577524:USP34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 86 85 171 40.0013703091803 45.4637619037172 -5.46239159453691 A:G G A 10 0.534867787102555 0.443417290529113 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 65296657 A/G 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65296533_65296935:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65296533_65296935:CEP68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 A:G A G 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 65315711 G/A 1 223 172 395 103.72448347613 91.9972593816395 11.7272240944908 A:G G A 10 0.534867787102555 0.246184701319362 ENSG00000138069:ENST00000409784:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409892:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409751:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000398529:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000356214:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000260638:exon_65315014_65315824:RAB1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 282 278 560 131.167284037079 148.69324481451 -17.5259607774308 T:G G T 10 0.534867787102555 0.138406668139208 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 708 341 1049 329.313606731391 182.389915401971 146.92369132942 C:G G C 10 0.534867787102555 3.85789626238892e-20 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 754 403 1157 350.709688524674 215.55171820233 135.157970322344 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 1.02893654830361e-15 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 69581631 G/A 1 21 17 38 9.76777647084634 9.09275238074344 0.675024090102909 A:G G A 10 0.534867787102555 0.871956006510723 ENSG00000198380:ENST00000361060:exon_69581621_69581700:GFPT1;ENSG00000198380:ENST00000357308:exon_69581621_69581700:GFPT1;ENSG00000198380:ENST00000493759:exon_69581621_69581700:GFPT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 32 23 55 14.8842308127182 12.3019591033588 2.58227170935947 A:T A T 10 0.534867787102555 0.502601554770959 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71297695 T/C 1 187 109 296 86.9797238118222 58.3005887941785 28.6791350176437 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000869945230193706 ENSG00000124357:ENST00000497690:exon_71297632_71297749:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71295780_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297643_71297716:NAGK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71297942 G/T 1 212 100 312 98.6080291342583 53.4867787102555 45.1212504240028 T:G G T 10 0.534867787102555 2.70713821912605e-07 ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297871_71298268:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297871_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297871_71297969:NAGK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 26 35 61 12.0934375353336 18.7203725485894 -6.62693501325585 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0958923813104294 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 28 43 71 13.0237019611285 22.9993148454099 -9.97561288428141 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0231172811974184 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 79 67 146 36.7454448188982 35.8361417358712 0.90930308302697 A:G G A 10 0.534867787102555 0.93393259647774 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71631109 A/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71630980_71631128:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71633275 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 7 14 21 3.25592549028211 7.48814901943577 -4.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0796989148436305 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 54 60 114 25.117139496462 32.0920672261533 -6.97492772969127 A:G G A 10 0.534867787102555 0.222092510214137 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 A:G A G 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 31 35 66 14.4190985998208 18.7203725485894 -4.30127394876863 T:C C T 10 0.534867787102555 0.324039306866122 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 91 181 272 42.3270313736675 96.8110694655625 -54.484038091895 A:C C A 10 0.534867787102555 4.35870787048559e-11 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 253 222 475 117.678449863054 118.740648736767 -1.06219887371363 A:T A T 10 0.534867787102555 0.926768421373748 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73491514 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73491406_73491647:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73491406_73491647:FBXO41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73492614 A/T 1 22 15 37 10.2329086837438 8.02301680653832 2.20989187720547 A:T A T 10 0.534867787102555 0.512648936021927 ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73492410_73492768:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73492410_73492768:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000519873:exon_73492611_73492768:FBXO41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73675669 T/G 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:G T G 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000377715:exon_73675090_73681194:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000443750:exon_73675090_73681194:ALMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73716810 G/A 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73716761_73717285:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73717103 G/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 C:G G C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73716761_73717285:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 29 33 62 13.4888341740259 17.6506369743843 -4.16180280035841 A:G A G 10 0.534867787102555 0.309974850223521 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74300717 T/C 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:C T C 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000187605:ENST00000475405:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74300676_74300766:TET3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74590160 T/C 1 45 42 87 20.930949580385 22.4644470583073 -1.53349747792229 T:C T C 10 0.534867787102555 0.748390116494607 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000491465:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74590121_74590304:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74590121_74590304:DCTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74682512 C/T 0 22 0 22 10.2329086837438 0 10.2329086837438 C C 10 0.534867787102555 1.09916716282950e-06 ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 113 109 222 52.5599400574113 58.3005887941785 -5.74064873676721 A:G G A 10 0.534867787102555 0.459545231643212 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 153 123 276 71.1652285733091 65.7887378136143 5.37649075969482 T:C C T 10 0.534867787102555 0.546388364528618 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 492 270 762 228.845048745543 144.41430251769 84.4307462278531 A:C:G C A 10 0.534867787102555 7.18798210262721e-10 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 48 56 104 22.3263462190774 29.9525960777431 -7.62624985866572 T:C C T 10 0.534867787102555 0.140995232809931 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 42 48 90 19.5355529416927 25.6736537809226 -6.13810083922995 C:G C G 10 0.534867787102555 0.205745165981018 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 34 25 59 15.8144952385131 13.3716946775639 2.44280056094926 T:C C T 10 0.534867787102555 0.60212543611048 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 40 38 78 18.6052885158978 20.3249759098971 -1.71968739399929 C:G C G 10 0.534867787102555 0.734110460310212 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 7 18 25 3.25592549028211 9.62762016784599 -6.37169467756387 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0145980406386551 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 T:C T C 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 339 295 634 157.679820172234 157.785997195254 -0.106177023019853 A:T:C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 87 79 166 40.4665025220777 42.2545551811018 -1.78805265902412 A:G A G 10 0.534867787102555 0.815594315583142 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 489 304 793 227.449652106851 162.599807279177 64.8498448276739 T:C C T 10 0.534867787102555 3.56020361412911e-06 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 439 320 759 204.193041461978 171.157691872818 33.0353495891608 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0163247489637948 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 296 215 511 137.679135017644 114.996574227049 22.6825607905944 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0459570682243795 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 25 16 41 11.6283053224361 8.55788459364088 3.07042072879524 T:C C T 10 0.534867787102555 0.352528530597853 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 85826721 G/A 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000168890:ENST00000306353:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000431593:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000334462:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000444380:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000409668:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000422458:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000451147:exon_85826715_85826825:TMEM150A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86067488 C/T 1 25 14 39 11.6283053224361 7.48814901943577 4.14015630300035 T:C C T 10 0.534867787102555 0.201743249759012 ENSG00000115525:ENST00000393808:exon_86066267_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393805:exon_86066267_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000377332:exon_86066267_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000525834:exon_86066267_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393806:exon_86066267_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000461206:exon_86066272_86067515:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393803:exon_86066367_86067965:ST3GAL5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86259443 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86259395_86259505:POLR1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86269163 C/T 1 19 21 40 8.83751204505145 11.2322235291537 -2.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.526724673864191 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86269012_86269226:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86269012_86269226:POLR1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86315741 C/T 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86315689_86315792:POLR1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86317037 G/C 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 C:G G C 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86316945_86317052:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86316945_86317052:POLR1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86363074 A/G 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:G A G 10 0.534867787102555 0.836582088194986 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86385728 C/T 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86385715_86385793:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 74 71 145 34.4197837544109 37.9756128842814 -3.55582912987047 A:G G A 10 0.534867787102555 0.561140677338075 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 86437710 G/A 1 52 40 92 24.1868750706671 21.3947114841022 2.79216358656494 A:G G A 10 0.534867787102555 0.601973476536303 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86437603_86437736:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86437603_86440917:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86437603_86437736:MRPL35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 87303060 C/G 1 15 7 22 6.97698319346167 3.74407450971789 3.23290868374379 C:G C G 10 0.534867787102555 0.201980319253584 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 63 35 98 29.303329412539 18.7203725485894 10.5829568639496 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.0335051543551481 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 13 15 28 6.04671876766678 8.02301680653832 -1.97629803887154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.457008833838827 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 C:G G C 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 89161084 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 95774147 T/C 1 92 58 150 42.7921635865649 31.0223316519482 11.7698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0595702925365654 ENSG00000144029:ENST00000272418:exon_95773920_95774153:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000345084:exon_95773920_95774153:MRPS5;ENSG00000144029:ENST00000475895:exon_95773920_95774153:MRPS5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 96943473 T/C 1 6 13 19 2.79079327738467 6.95328123233322 -4.16248795494855 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0663015221709073 ENSG00000144028:ENST00000480835:exon_96943272_96943688:SNRNP200 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 86 55 141 40.0013703091803 29.4177282906405 10.5836420185397 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0766010994589997 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 23 17 40 10.6980408966412 9.09275238074344 1.6052885158978 T:C C T 10 0.534867787102555 0.638038577575428 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 23 19 42 10.6980408966412 10.1624879549485 0.535552941692689 A:G A G 10 0.534867787102555 0.878734543696345 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 18 8 26 8.37237983215401 4.27894229682044 4.09343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.118905775759782 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 12 20 32 5.58158655476934 10.6973557420511 -5.11576918728176 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0774907266020895 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 99149946 G/A 1 21 10 31 9.76777647084634 5.34867787102555 4.41909859982079 A:G G A 10 0.534867787102555 0.148807256053737 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99149840_99149958:INPP4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 16 38 54 7.44211540635912 20.3249759098971 -12.882860503538 A:T T A 10 0.534867787102555 0.000531445726478908 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 100015848 G/A 1 95 78 173 44.1875602252573 41.7196873939993 2.46787283125798 A:G G A 10 0.534867787102555 0.760587314683457 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_100015770_100016728:EIF5B;ENSG00000158417:ENST00000470023:exon_100015770_100016237:EIF5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 100029254 C/T 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100029193_100029413:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100029193_100029413:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100029193_100029413:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482595:exon_100029193_100029415:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100029193_100029413:REV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 10 20 30 4.65132212897445 10.6973557420511 -6.04603361307665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0287815121131482 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 22 25 47 10.2329086837438 13.3716946775639 -3.13878599382008 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.382776411930619 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 101638888 A/G 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 G A G 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101638743_101638970:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101638743_101638983:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101638743_101638983:TBC1D8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 101881399 G/A 1 77 41 118 35.8151803931033 21.9295792712048 13.8856011218985 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0123924433112248 ENSG00000158435:ENST00000289382:exon_101881307_101881509:C2orf29;ENSG00000158435:ENST00000462489:exon_101881307_101881509:C2orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 105885873 C/T 1 29 13 42 13.4888341740259 6.95328123233322 6.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0451404167329929 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 17 14 31 7.90724761925657 7.48814901943577 0.419098599820795 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 109356978 G/C 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000469184:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000437168:exon_109356945_109357137:RANBP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 109408208 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109408131_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109408011_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109408131_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000470608:exon_109408168_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000447782:exon_109408136_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109408172_109408258:CCDC138 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 109429146 T/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:T T A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109429087_109429164:CCDC138 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 109432452 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109432397_109432561:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109432397_109432561:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109432397_109432561:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109432397_109432561:CCDC138 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 110321960 T/C 1 27 38 65 12.558569748231 20.3249759098971 -7.76640616166608 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0617915183236346 ENSG00000186522:ENST00000334001:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000352314:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397712:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000356688:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397714:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000437928:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000415095:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000468616:exon_110321943_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000483047:exon_110321792_110322111:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000486678:exon_110321943_110322111:SEPT10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 110373197 G/A 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:G G A 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000198142:ENST00000356454:exon_110371911_110376563:ANKRD57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 112813163 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000153214:ENST00000283206:exon_112812800_112813333:TMEM87B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113305150 G/C 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 16 7 23 7.44211540635912 3.74407450971789 3.69804089664123 A:T T A 10 0.534867787102555 0.145219966191261 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.102479693301745 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 18 27 45 8.37237983215401 14.441430251769 -6.06905041961497 A:G G A 10 0.534867787102555 0.074166479695257 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 8 24 32 3.72105770317956 12.8368268904613 -9.11576918728176 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00125670295768018 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113590390 G/A 1 27 1 28 12.558569748231 0.534867787102555 12.0237019611285 A:G G A 10 0.534867787102555 8.85905648082725e-07 ENSG00000125538:ENST00000263341:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000491056:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000487639:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000418817:exon_113590276_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000432018:exon_113590329_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000416750:exon_113590372_113590403:IL1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 65 87 152 30.2335938383339 46.5334974779223 -16.2999036395884 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00910193529848984 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 48 58 106 22.3263462190774 31.0223316519482 -8.69598543287083 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0979918747775902 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113942903 A/C 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:C A C 10 0.534867787102555 0.618076615182016 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 48 66 114 22.3263462190774 35.3012739487686 -12.9749277296913 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0185236084284221 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 14 22 36 6.51185098056423 11.7670913162562 -5.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.094468807287743 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 76 47 123 35.3500481802058 25.1387859938201 10.2112621863857 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0705842166773596 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 120439059 G/A 1 24 13 37 11.1631731095387 6.95328123233322 4.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.188873664543726 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 122216419 A/G 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G A G 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122216416_122216551:CLASP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 40 32 72 18.6052885158978 17.1157691872818 1.48951932861604 T:C C T 10 0.534867787102555 0.81342805317915 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 26 37 63 12.0934375353336 19.7901081227945 -7.69667058746097 A:G G A 10 0.534867787102555 0.058067331024054 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 47 72 119 21.8612140061799 38.510480671384 -16.649266665204 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00235781780741482 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 128744457 G/A 1 14 7 21 6.51185098056423 3.74407450971789 2.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.276708886024608 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128744359_128744533:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000409388:exon_128744359_128744536:SAP130 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 130910847 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 19 9 28 8.83751204505145 4.81381008392299 4.02370196112846 T:C C T 10 0.534867787102555 0.1346812069964 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 131130678 T/C 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.246478148672503 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 14 22 36 6.51185098056423 11.7670913162562 -5.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.094468807287743 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 136437833 C/A 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136437743_136437894:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000445855:exon_136437743_136437894:R3HDM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 45 43 88 20.930949580385 22.9993148454099 -2.06836526502484 A:G A G 10 0.534867787102555 0.670417319619812 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 136537941 C/G 1 98 100 198 45.5829568639496 53.4867787102555 -7.90382184630589 C:G C G 10 0.534867787102555 0.285242513413577 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136537753_136537955:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136537753_136537955:UBXN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 50 86 136 23.2566106448723 45.9986296908197 -22.7420190459475 T:C T C 10 0.534867787102555 9.8954406496893e-05 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 102 151 253 47.4434857155394 80.7650358524858 -33.3215501369464 A:G G A 10 0.534867787102555 2.93568555654890e-05 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152317669 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152317652_152317803:RIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 36 25 61 16.744759664308 13.3716946775639 3.37306498674415 A:G G A 10 0.534867787102555 0.441858834708637 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 40 26 66 18.6052885158978 13.9065624646664 4.69872605123137 A:T A T 10 0.534867787102555 0.268136434325524 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 24 12 36 11.1631731095387 6.41841344523066 4.74475966430802 C:G C G 10 0.534867787102555 0.133045425937367 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 152698480 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000182389:ENST00000360283:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000397327:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152698417_152698602:CACNB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 157406249 G/A 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000115159:ENST00000310454:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000438166:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409674:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409125:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409861:exon_157406120_157406284:GPD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 13 15 28 6.04671876766678 8.02301680653832 -1.97629803887154 A:G A G 10 0.534867787102555 0.457008833838827 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:G T G 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 55 56 111 25.5822717093595 29.9525960777431 -4.37032436838361 T:C C T 10 0.534867787102555 0.446774757903472 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 52 50 102 24.1868750706671 26.7433893551277 -2.55651428446061 T:C C T 10 0.534867787102555 0.621067871170952 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160639970 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000241399:ENST00000429078:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000259053:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000480212:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 14 41 55 6.51185098056423 21.9295792712048 -15.4177282906405 T:C T C 10 0.534867787102555 3.30461573990411e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160664907 T/G 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:G T G 10 0.534867787102555 0.437699564928111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 101 98 199 46.9783535026419 52.4170431360504 -5.43868963340844 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.477418569457133 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160710153 T/G 1 55 47 102 25.5822717093595 25.1387859938201 0.443485715539389 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710141_160710208:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710141_160710208:RP11-357L2.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 73 69 142 33.9546515415135 36.9058773100763 -2.95122576856281 C:G G C 10 0.534867787102555 0.674184186647071 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 160737663 T/A 1 34 34 68 15.8144952385131 18.1855047614869 -2.37100952297374 A:T T A 10 0.534867787102555 0.627203560914087 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 172 143 315 80.0027406183605 76.4860935556654 3.51664706269517 T:C C T 10 0.534867787102555 0.734754290454261 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 68 58 126 31.6289904770263 31.0223316519482 0.606658825078071 T:C T C 10 0.534867787102555 0.929092179794266 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 166773971 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123607:ENST00000243344:exon_166773767_166773991:TTC21B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 33 33 66 15.3493630256157 17.6506369743843 -2.30127394876863 T:C T C 10 0.534867787102555 0.622236477713734 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 170411698 C/G 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 C:G C G 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 170417031 T/C 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000487293:exon_170416781_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170416902_170417295:FASTKD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 161 120 281 74.8862862764886 64.1841344523066 10.7021518241821 T:C C T 10 0.534867787102555 0.209425383507729 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 85 94 179 39.5362380962828 50.2775719876402 -10.7413338913573 T:G T G 10 0.534867787102555 0.115622330146962 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 172336601 T/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172336548_172336703:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172336548_172336703:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000339506:exon_172336548_172336703:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000431110:exon_172336548_172336703:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000498486:exon_172336166_172336703:DCAF17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 43 30 73 20.0006851545901 16.0460336130766 3.95465154151348 T:C T C 10 0.534867787102555 0.411722940564657 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 175436940 G/A 1 286 272 558 133.027812888669 145.484038091895 -12.4562252032257 A:G G A 10 0.534867787102555 0.308446241768701 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175436873_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 179393111 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179393001_179393154:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179393001_179393154:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179393001_179393154:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179393001_179393154:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179393001_179393154:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179393001_179393154:TTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 179395560 G/A 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179394968_179400576:TTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 179395760 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179394968_179400576:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179394968_179400576:TTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593857532575953 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 183595793 C/T 1 14 17 31 6.51185098056423 9.09275238074344 -2.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.373013327758721 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183595757_183595834:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183595757_183595834:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183595757_183595834:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183595757_183595834:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000459930:exon_183595757_183595834:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000444005:exon_183595757_183595834:DNAJC10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 190617700 T/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000151687:ENST00000476208:exon_190617661_190617866:ANKAR;ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190617575_190617705:OSGEPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 190620216 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000520350:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000413448:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000517895:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000518114:exon_190619041_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000521630:exon_190619899_190620286:OSGEPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 33 16 49 15.3493630256157 8.55788459364088 6.7914784319748 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0619723923648527 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C T C 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191224895 A/G 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000451089:exon_191224765_191224919:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 T:G G T 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191231503 G/A 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191818323 A/C 1 28 13 41 13.0237019611285 6.95328123233322 6.07042072879524 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0612310601091194 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000457316:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409428:exon_191818291_191818352:GLS;ENSG00000115419:ENST00000412247:exon_191818291_191818352:GLS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 191841759 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 26 24 50 12.0934375353336 12.8368268904613 -0.743389355127752 T:C T C 10 0.534867787102555 0.88766651817951 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 198359384 T/C 1 51 106 157 23.7217428577697 56.6959854328708 -32.9742425751011 T:C T C 10 0.534867787102555 1.36474388230059e-07 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198359381_198359476:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198359381_198359476:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198359381_198359476:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198359381_198359476:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198359364_198359476:HSPD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 200790050 A/G 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 A:G A G 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000178074:ENST00000319974:exon_200789785_200792996:C2orf69 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 21 24 45 9.76777647084634 12.8368268904613 -3.06905041961498 T:G G T 10 0.534867787102555 0.373583488422862 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 201437214 A/G 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:G A G 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 T:C T C 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 11 22 33 5.1164543418719 11.7670913162562 -6.65063697438431 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0230071913905036 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 202252539 G/A 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202252426_202252724:TRAK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 98 108 206 45.5829568639496 57.7657210070759 -12.1827641431263 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0937651872028118 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 87 72 159 40.4665025220777 38.510480671384 1.95602185069376 A:C A C 10 0.534867787102555 0.811601021131083 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 207172627 A/G 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 A A 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 207174316 T/C 0 21 0 21 9.76777647084634 0 9.76777647084634 T T 10 0.534867787102555 2.06865016693889e-06 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 A:G A G 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 208841964 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000178385:ENST00000408943:exon_208841375_208842310:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000427836:exon_208841375_208842310:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000447645:exon_208841375_208842174:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000389247:exon_208841375_208842310:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000457206:exon_208841375_208842310:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000323852:exon_208841349_208842310:PLEKHM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 215593543 G/A 1 21 11 32 9.76777647084634 5.8835456581281 3.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.214684384919347 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215590370_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000432456:exon_215593148_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471590:exon_215593262_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215593277_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215593428_215593732:BARD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 215617247 G/A 1 13 6 19 6.04671876766678 3.20920672261533 2.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.251280044543956 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215617171_215617279:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215617171_215617279:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215617171_215617279:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000421162:exon_215617171_215617279:BARD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 215645545 C/G 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 C:G C G 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 215674323 C/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 C:G C G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215674136_215674428:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215674136_215674428:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215674136_215674397:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000421162:exon_215674136_215674411:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471787:exon_215674136_215674394:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000479904:exon_215674136_215674384:BARD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 3 24 27 1.39539663869233 12.8368268904613 -11.441430251769 A:G A G 10 0.534867787102555 6.35737114453262e-06 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 27 25 52 12.558569748231 13.3716946775639 -0.81312492933286 C:G G C 10 0.534867787102555 0.88970995153227 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219143229 G/A 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000135926:ENST00000476429:exon_219143132_219143288:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219143202_219143288:TMBIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 4 16 20 1.86052885158978 8.55788459364088 -6.6973557420511 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00294974331581314 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 42 21 63 19.5355529416927 11.2322235291537 8.30332941253903 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0426639521986729 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 43 22 65 20.0006851545901 11.7670913162562 8.23359383833392 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0462538864756987 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 87 90 177 40.4665025220777 48.1381008392299 -7.67159831715223 T:C C T 10 0.534867787102555 0.258830693330955 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 223423491 C/G 1 130 172 302 60.4671876766678 91.9972593816395 -31.5300717049716 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.000333084959514171 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 223520797 T/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:G T G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223520735_223521056:FARSB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 68 83 151 31.6289904770263 44.3940263295121 -12.7650358524858 T:C T C 10 0.534867787102555 0.041214453415067 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 68 59 127 31.6289904770263 31.5571994390507 0.0717910379755153 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 1 14 2 16 6.51185098056423 1.06973557420511 5.44211540635912 A:T A T 10 0.534867787102555 0.00559568828633585 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 228194481 G/T 1 14 1 15 6.51185098056423 0.534867787102555 5.97698319346167 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00136645481623119 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 38 34 72 17.6750240901029 18.1855047614869 -0.510480671383963 A:G A G 10 0.534867787102555 0.90659756965614 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 135 125 260 62.7928487411551 66.8584733878194 -4.0656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.619462874041189 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 24 37 61 11.1631731095387 19.7901081227945 -8.62693501325586 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0290997703971459 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 63 91 154 29.303329412539 48.6729686263325 -19.3696392137935 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00205452936412561 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 57 43 100 26.5125361351544 22.9993148454099 3.5132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.547744335267679 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 170 131 301 79.0724761925656 70.0676801104347 9.00479608213094 A:G A G 10 0.534867787102555 0.325977653509082 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231333834 G/A 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 T:G T G 10 0.534867787102555 0.117923142331755 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 11 20 31 5.1164543418719 10.6973557420511 -5.5809014001792 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0485659015153771 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 17 24 41 7.90724761925657 12.8368268904613 -4.92957927120476 A:G G A 10 0.534867787102555 0.158061657600612 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231775094 C/A 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 231775297 T/G 1 13 26 39 6.04671876766678 13.9065624646664 -7.85984369699965 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0150998634214339 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 90 103 193 41.8618991607701 55.0913820715632 -13.2294829107931 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0605644622461831 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 12 21 33 5.58158655476934 11.2322235291537 -5.65063697438432 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0551457818594442 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 A:C A C 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 233633460 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000115474:ENST00000233826:exon_233631174_233633523:KCNJ13;ENSG00000115474:ENST00000409779:exon_233632786_233633523:KCNJ13;ENSG00000115474:ENST00000410029:exon_233632850_233633523:KCNJ13;ENSG00000115474:ENST00000413607:exon_233632901_233633523:KCNJ13;ENSG00000115474:ENST00000438786:exon_233633191_233633523:KCNJ13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 234354245 G/A 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.283655371776667 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 234368821 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 59 63 122 27.4428005609493 33.696670587461 -6.25387002651171 A:G G A 10 0.534867787102555 0.276452614168715 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 234372985 A/C 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:C A C 10 0.534867787102555 0.194126160849861 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 237489297 C/T 1 36 25 61 16.744759664308 13.3716946775639 3.37306498674415 T:C C T 10 0.534867787102555 0.441858834708637 ENSG00000144476:ENST00000447924:exon_237489083_237489740:CXCR7;ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 237489904 C/T 1 30 21 51 13.9539663869233 11.2322235291537 2.72174285776969 T:C C T 10 0.534867787102555 0.484759623037288 ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 238903399 G/A 1 11 18 29 5.1164543418719 9.62762016784599 -4.51116582597409 A:G G A 10 0.534867787102555 0.097583539926297 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434137:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238903386_238903451:UBE2F HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 19 29 48 8.83751204505145 15.5111658259741 -6.67365378092264 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0600217724249818 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 T:G G T 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 61 67 128 28.3730649867441 35.8361417358712 -7.46307674912704 T:C T C 10 0.534867787102555 0.214643361819343 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 240954110 A/G 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240951034_240954277:NDUFA10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241492255 G/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000144504:ENST00000464991:exon_241492159_241492474:ANKMY1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241531479 A/G 1 35 27 62 16.2796274514106 14.441430251769 1.83819719964159 A:G A G 10 0.534867787102555 0.7031862175381 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241533512 T/A 1 13 8 21 6.04671876766678 4.27894229682044 1.76777647084634 A:T T A 10 0.534867787102555 0.515422591350918 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 18 13 31 8.37237983215401 6.95328123233322 1.41909859982079 T:C C T 10 0.534867787102555 0.719657099436856 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 25 25 50 11.6283053224361 13.3716946775639 -1.74338935512775 A:G A G 10 0.534867787102555 0.67165980504118 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 21 16 37 9.76777647084634 8.55788459364088 1.20989187720546 A:G G A 10 0.534867787102555 0.743605069618952 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241538061 T/C 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 241570107 C/T 1 29 4 33 13.4888341740259 2.13947114841022 11.3493630256157 T:C C T 10 0.534867787102555 3.55020837200603e-05 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242035544 G/C 1 141 163 304 65.5836420185397 87.1834492977165 -21.5998072791767 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0134126829611167 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242039198 T/C 1 44 52 96 20.4658173674876 27.8131249293329 -7.34730756184528 T:C T C 10 0.534867787102555 0.151832499174984 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242047750 A/G 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 A:G A G 10 0.534867787102555 0.177119301244689 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242063448 G/A 1 11 18 29 5.1164543418719 9.62762016784599 -4.51116582597409 A:G G A 10 0.534867787102555 0.097583539926297 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242063364_242063548:PASK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 43 26 69 20.0006851545901 13.9065624646664 6.0941226899237 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149081742886248 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 71 112 183 33.0243871157186 59.9051921554862 -26.8808050397676 T:C T C 10 0.534867787102555 7.78334641493736e-05 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242066830 G/A 1 70 56 126 32.5592549028212 29.9525960777431 2.60665882507807 A:G G A 10 0.534867787102555 0.656316531711941 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242176019 T/C 1 6 17 23 2.79079327738467 9.09275238074344 -6.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0108449056970403 ENSG00000115677:ENST00000479894:exon_242175523_242176186:HDLBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242287487 T/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:G T G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 85 91 176 39.5362380962828 48.6729686263325 -9.13673053004968 A:G A G 10 0.534867787102555 0.174218561612076 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242606175 A/G 1 29 30 59 13.4888341740259 16.0460336130766 -2.55719943905074 A:G A G 10 0.534867787102555 0.516814870920027 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000311517:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000400771:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000429899:exon_242606060_242606184:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242606011_242606253:ATG4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242607924 A/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G A G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242607674_242608100:ATG4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 52 60 112 24.1868750706671 32.0920672261533 -7.90519215548616 T:C T C 10 0.534867787102555 0.155099088642810 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242617851 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 17 12 29 7.90724761925657 6.41841344523066 1.4888341740259 T:C C T 10 0.534867787102555 0.710420076918619 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 256763 G/C 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 C:G G C 10 0.534867787102555 0.179195747683729 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 104 80 184 48.3737501413343 42.7894229682044 5.58432717312988 T:C C T 10 0.534867787102555 0.417334728870832 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 65 62 127 30.2335938383339 33.1618028003584 -2.92820896202448 A:G A G 10 0.534867787102555 0.656667566094045 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 46 53 99 21.3960817932825 28.3479927164354 -6.95191092315294 T:C C T 10 0.534867787102555 0.190021088036237 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 9 16 25 4.18618991607701 8.55788459364088 -4.37169467756387 T:C T C 10 0.534867787102555 0.107280657645491 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 136 136 272 63.2579809540525 72.7420190459475 -9.48403809189497 A:G A G 10 0.534867787102555 0.248959432657766 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 121 117 238 56.2809977605908 62.5795310909989 -6.29853333040809 A:G G A 10 0.534867787102555 0.435719420773823 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 595 602 1197 276.75366667398 321.990407835738 -45.2367411617583 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.00909862633182897 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2778744 G/A 1 7 20 27 3.25592549028211 10.6973557420511 -7.44143025176898 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00584207431082675 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 40 42 82 18.6052885158978 22.4644470583073 -3.85915854240951 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438720405182939 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:G T G 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3147468 G/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000088899:ENST00000329152:exon_3147351_3149207:RP5-1187M17.10;ENSG00000088899:ENST00000360342:exon_3147351_3147827:RP5-1187M17.10;ENSG00000088899:ENST00000337576:exon_3147351_3149207:RP5-1187M17.10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 56 50 106 26.0474039222569 26.7433893551277 -0.695985432870831 A:G G A 10 0.534867787102555 0.922601207906203 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 94 95 189 43.7224280123598 50.8124397747427 -7.0900117623829 A:G G A 10 0.534867787102555 0.308089888634854 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 45 49 94 20.930949580385 26.2085215680252 -5.27757198764017 T:C C T 10 0.534867787102555 0.301542930953825 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3843027 C/A 1 17 25 42 7.90724761925657 13.3716946775639 -5.46444705830731 A:C C A 10 0.534867787102555 0.120876840211428 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 3846397 C/T 1 34 37 71 15.8144952385131 19.7901081227945 -3.97561288428141 T:C C T 10 0.534867787102555 0.344673769927785 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3846330_3849280:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3846330_3848972:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3846330_3847950:MAVS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 42 35 77 19.5355529416927 18.7203725485894 0.815180393103265 T:C T C 10 0.534867787102555 0.909258246699808 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 41 36 77 19.0704207287952 19.255240335692 -0.184819606896735 A:T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 5933108 C/A 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5933070_5933174:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5933070_5933174:MCM8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 22 25 47 10.2329086837438 13.3716946775639 -3.13878599382008 A:G G A 10 0.534867787102555 0.382776411930619 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 53 48 101 24.6520072835646 25.6736537809226 -1.02164649735806 A:G G A 10 0.534867787102555 0.842605989205303 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 63 64 127 29.303329412539 34.2315383745635 -4.92820896202448 T:G T G 10 0.534867787102555 0.423501097865313 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 67 81 148 31.1638582641288 43.324290755307 -12.1604324911781 T:C C T 10 0.534867787102555 0.047975343760517 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 17594801 G/A 1 64 35 99 29.7684616254365 18.7203725485894 11.0480890768471 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0267225074845565 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17594323_17594865:RRBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 23 21 44 10.6980408966412 11.2322235291537 -0.534182632512421 A:C C A 10 0.534867787102555 0.881091734150379 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 17610535 C/T 1 40 36 76 18.6052885158978 19.255240335692 -0.649951819794179 T:C C T 10 0.534867787102555 0.908789985616379 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 18491553 C/A 1 40 61 101 18.6052885158978 32.6269350132559 -14.0216464973581 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00677989192953356 ENSG00000101310:ENST00000450074:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18491466_18491700:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000474619:exon_18491466_18491575:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18491466_18491700:SEC23B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 55 52 107 25.5822717093595 27.8131249293329 -2.23085321997339 T:C T C 10 0.534867787102555 0.69876990389098 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 23345069 C/T 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000424216:exon_23345000_23345166:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 23345589 A/G 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 32 26 58 14.8842308127182 13.9065624646664 0.977668348051809 T:G G T 10 0.534867787102555 0.895438925505447 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 20 13 33 9.3026442579489 6.95328123233322 2.34936302561568 A:G G A 10 0.534867787102555 0.486615987304497 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 33 26 59 15.3493630256157 13.9065624646664 1.44280056094925 T:C T C 10 0.534867787102555 0.794405479999813 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 58 61 119 26.9776683480518 32.6269350132559 -5.64926666520404 T:C T C 10 0.534867787102555 0.312961874120518 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 23 34 57 10.6980408966412 18.1855047614869 -7.48746386484564 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0620820702285725 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 63 71 134 29.303329412539 37.9756128842814 -8.67228347174237 T:C C T 10 0.534867787102555 0.141286820668378 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 33000354 T/C 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:C T C 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000078747:ENST00000374864:exon_33000321_33000445:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000486883:exon_33000321_33000445:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000262650:exon_33000321_33000445:ITCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 33147737 C/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101460:ENST00000374837:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000397711:exon_33147540_33148086:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000360668:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000476428:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 33470694 C/T 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000131069:ENST00000490046:exon_33470597_33470793:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481971:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000488172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000497927:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000475459:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000461051:exon_33470597_33470799:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000484354:exon_33470621_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000374693:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480274:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000493805:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480978:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000467019:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000476922:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000464399:exon_33470630_33470792:ACSS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 33581889 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 33581955 G/A 1 1 13 14 0.465132212897445 6.95328123233322 -6.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000536187327055624 ENSG00000078814:ENST00000262873:exon_33581949_33582204:MYH7B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34092698 T/C 1 27 13 40 12.558569748231 6.95328123233322 5.6052885158978 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0823362588298334 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 269 295 564 125.120565269413 157.785997195254 -32.665431925841 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0060533827220911 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 142 126 268 66.0487742314372 67.3933411749219 -1.34456694348474 A:G G A 10 0.534867787102555 0.902568546103019 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 191 127 318 88.840252663412 67.9282089620245 20.9120437013875 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0210345663456238 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 105 69 174 48.8388823542317 36.9058773100763 11.9330050441554 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0801973153137654 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34242660 C/T 1 99 96 195 46.0480890768471 51.3473075618453 -5.29921848499823 T:C C T 10 0.534867787102555 0.473065481621218 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 93 84 177 43.2572957994624 44.9288941166146 -1.67159831715224 T:C C T 10 0.534867787102555 0.8214164899962 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 36031638 G/A 1 50 57 107 23.2566106448723 30.4874638648456 -7.23085321997339 A:G G A 10 0.534867787102555 0.175106470439442 ENSG00000197122:ENST00000445403:exon_36031574_36033817:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373578:exon_36031574_36034453:SRC;ENSG00000197122:ENST00000358208:exon_36031574_36033817:SRC;ENSG00000197122:ENST00000360723:exon_36031574_36033817:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373567:exon_36031574_36034453:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373558:exon_36031574_36034453:SRC;ENSG00000197122:ENST00000477066:exon_36031574_36033825:SRC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37055875 T/C 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.806945941972106 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37383640 T/C 1 11 20 31 5.1164543418719 10.6973557420511 -5.5809014001792 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0485659015153771 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 30 31 61 13.9539663869233 16.5809014001792 -2.62693501325585 T:C C T 10 0.534867787102555 0.522970828867368 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 C:G G C 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 37601243 A/G 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37601202_37601294:DHX35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 39802851 G/A 1 21 34 55 9.76777647084634 18.1855047614869 -8.41772829064053 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0296789530145319 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39802764_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39802767_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39802764_39802951:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000461641:exon_39802767_39802952:PLCG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 T:C C T 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 40045231 G/C 1 23 23 46 10.6980408966412 12.3019591033588 -1.60391820671753 C:G G C 10 0.534867787102555 0.659763248539263 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 40049349 C/T 1 12 19 31 5.58158655476934 10.1624879549485 -4.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.107516360440066 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 40049586 T/C 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 40049873 T/C 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42089140 T/A 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 A:T T A 10 0.534867787102555 0.313544354924083 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 18 6 24 8.37237983215401 3.20920672261533 5.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0402244391024662 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 133 70 203 61.8625843153602 37.4407450971788 24.4218392181813 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.000549209358054523 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 84 93 177 39.0711058833854 49.7427042005376 -10.6715983171522 T:C C T 10 0.534867787102555 0.113746161142952 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 75 70 145 34.8849159673084 37.4407450971788 -2.55582912987047 A:T:C A C 10 0.534867787102555 0.678086662746679 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 72 75 147 33.489519328616 40.1150840326916 -6.62556470407559 T:C C T 10 0.534867787102555 0.283218834003752 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 23 33 56 10.6980408966412 17.6506369743843 -6.95259607774308 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0806904855349211 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 36 34 70 16.744759664308 18.1855047614869 -1.44074509717885 T:C T C 10 0.534867787102555 0.810829708610313 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44505830 C/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44505973 T/C 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44507307 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 38 20 58 17.6750240901029 10.6973557420511 6.97766834805181 C:G C G 10 0.534867787102555 0.086167215857827 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44523782 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000064601:ENST00000480961:exon_44523633_44523889:CTSA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44594228 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 15 20 35 6.97698319346167 10.6973557420511 -3.72037254858942 C:G C G 10 0.534867787102555 0.236958433239998 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 33 32 65 15.3493630256157 17.1157691872818 -1.76640616166608 T:G T G 10 0.534867787102555 0.709786262786337 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 44983873 G/A 1 50 40 90 23.2566106448723 21.3947114841022 1.86189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 0.751601235474083 ENSG00000080189:ENST00000243896:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372227:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372229:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372230:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372225:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000487729:exon_44983712_44983918:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000484318:exon_44983712_44983880:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000424568:exon_44983743_44983880:SLC35C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 45131155 G/A 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000198185:ENST00000396380:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000331711:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000418827:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000457685:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000347606:exon_45129731_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000399484:exon_45130586_45131263:ZNF334 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 48 35 83 22.3263462190774 18.7203725485894 3.60597367048793 T:C C T 10 0.534867787102555 0.443310685358476 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 45839439 C/A 1 84 69 153 39.0711058833854 36.9058773100763 2.16522857330909 A:C C A 10 0.534867787102555 0.746363065904626 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45837859_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45837859_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45838892_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45839058_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45839058_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45839085_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45839086_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45839105_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45839105_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45839105_45839542:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45839406_45839542:ZMYND8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 46265081 G/C 1 69 71 140 32.0941226899237 37.9756128842814 -5.8814901943577 C:G G C 10 0.534867787102555 0.351462817447852 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46264635_46265506:NCOA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 25 25 50 11.6283053224361 13.3716946775639 -1.74338935512775 A:G G A 10 0.534867787102555 0.67165980504118 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 24 20 44 11.1631731095387 10.6973557420511 0.465817367487579 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 T:C C T 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 48808011 C/T 1 33 22 55 15.3493630256157 11.7670913162562 3.58227170935947 T:C C T 10 0.534867787102555 0.347564089341679 ENSG00000172216:ENST00000303004:exon_48807376_48809212:CEBPB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 72 73 145 33.489519328616 39.0453484584865 -5.55582912987047 T:C C T 10 0.534867787102555 0.361015246899699 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 50140627 G/C 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 C:G G C 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50139620_50140649:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50139620_50140649:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50139620_50140649:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50139620_50140649:NFATC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 52185814 C/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:C C A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 52 31 83 24.1868750706671 16.5809014001792 7.60597367048793 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0995467037640894 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 41 39 80 19.0704207287952 20.8598436969996 -1.7894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.737129382138969 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 56928546 A/G 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.317451841975924 ENSG00000124209:ENST00000244040:exon_56928488_56928594:RAB22A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 42 51 93 19.5355529416927 27.2782571422303 -7.74270420053762 A:G G A 10 0.534867787102555 0.11896382642836 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 60 56 116 27.9079327738467 29.9525960777431 -2.04466330389638 C:G C G 10 0.534867787102555 0.710690580435588 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57561869 C/T 1 43 44 87 20.0006851545901 23.5341826325124 -3.53349747792229 T:C C T 10 0.534867787102555 0.454042228201068 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57561809_57561918:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000471621:exon_57561809_57562476:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000492016:exon_57561809_57561918:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57561809_57561918:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57561809_57561918:TH1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 47 31 78 21.8612140061799 16.5809014001792 5.28031260600071 T:C C T 10 0.534867787102555 0.256911800685787 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 C:G G C 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 118 124 242 54.8856011218985 66.3236056007168 -11.4380044788183 A:G A G 10 0.534867787102555 0.156149975722758 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 12 19 31 5.58158655476934 10.1624879549485 -4.58090140017921 A:C C A 10 0.534867787102555 0.107516360440066 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 335 334 669 155.819291320644 178.645840892253 -22.8265495716093 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0811001660476307 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 18 36 54 8.37237983215401 19.255240335692 -10.882860503538 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00379283344051172 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60768615 G/A 1 43 25 68 20.0006851545901 13.3716946775639 6.62899047702626 A:G G A 10 0.534867787102555 0.114884350245031 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60768587_60768680:GTPBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60884880 C/G 1 10 21 31 4.65132212897445 11.2322235291537 -6.58090140017921 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0193568230470193 ENSG00000130702:ENST00000370691:exon_60884772_60884891:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60884772_60884891:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000495695:exon_60884772_60884891:LAMA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60889920 C/A 1 6 18 24 2.79079327738467 9.62762016784599 -6.83682689046132 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00669892307548342 ENSG00000130702:ENST00000370691:exon_60889360_60889935:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60889855_60890003:LAMA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60905919 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60905799_60906000:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000370692:exon_60905799_60906000:LAMA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 19 8 27 8.83751204505145 4.27894229682044 4.55856974823101 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0851029413105759 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 31 45 76 14.4190985998208 24.069050419615 -9.64995181979418 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0288176077202043 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 129 86 215 60.0020554637704 45.9986296908197 14.0034257729507 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.0558807052961364 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 61512497 G/A 0 22 0 22 10.2329086837438 0 10.2329086837438 G G 10 0.534867787102555 1.09916716282950e-06 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 61912715 T/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62191475 T/G 0 0 14 14 0 7.48814901943577 -7.48814901943577 G T G 10 0.534867787102555 2.21855320731740e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62191558 G/A 1 46 23 69 21.3960817932825 12.3019591033588 9.0941226899237 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0298038280628887 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 24 22 46 11.1631731095387 11.7670913162562 -0.60391820671753 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.883360419729026 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 25 17 42 11.6283053224361 9.09275238074344 2.53555294169269 C:G G C 10 0.534867787102555 0.444906406905715 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 23 8 31 10.6980408966412 4.27894229682044 6.41909859982079 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0290683237476653 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 23 25 48 10.6980408966412 13.3716946775639 -2.67365378092264 A:G A G 10 0.534867787102555 0.471403908453889 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62195220 C/T 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62195672 C/T 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 T:C C T 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 20 11 31 9.3026442579489 5.8835456581281 3.4190985998208 T:C C T 10 0.534867787102555 0.280160698846182 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 35 19 54 16.2796274514106 10.1624879549485 6.11713949646203 C:G G C 10 0.534867787102555 0.102652124946657 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62196884 A/G 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 A:G A G 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62198348 C/T 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 T:C C T 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62198662 A/G 1 14 18 32 6.51185098056423 9.62762016784599 -3.11576918728176 A:G A G 10 0.534867787102555 0.291464382713898 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62200575 T/C 1 25 8 33 11.6283053224361 4.27894229682044 7.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0133654508723130 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 1 25 8 33 11.6283053224361 4.27894229682044 7.34936302561568 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0133654508723130 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 24 13 37 11.1631731095387 6.95328123233322 4.20989187720546 A:G A G 10 0.534867787102555 0.188873664543726 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62202240 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130589:ENST00000479540:exon_62202038_62204574:RP4-697K14.7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62319464 T/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62321138 G/A 1 26 43 69 12.0934375353336 22.9993148454099 -10.9058773100763 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0107677430257953 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62325663 C/A 1 17 6 23 7.90724761925657 3.20920672261533 4.69804089664123 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0595173238243252 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62328267 C/T 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62328113_62328416:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62328113_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62328113_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62328113_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62328113_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62328113_62328544:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62328021_62328544:TNFRSF6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62328742 C/T 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62328681_62328875:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62328681_62328875:TNFRSF6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62365069 G/A 1 28 31 59 13.0237019611285 16.5809014001792 -3.55719943905074 A:G G A 10 0.534867787102555 0.363898246946618 ENSG00000197114:ENST00000448100:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000355969:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62364939_62366176:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000369967:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000472711:exon_62364939_62365127:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000478385:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000468235:exon_62364939_62365322:ZGPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62366046 G/A 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 A:G G A 10 0.534867787102555 0.177119301244689 ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62364939_62366176:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62365997_62366176:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000472711:exon_62365997_62366176:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000484569:exon_62365506_62366176:ZGPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62373983 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62373881_62374143:SLC2A4RG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62492922 T/A 1 19 11 30 8.83751204505145 5.8835456581281 2.95396638692335 A:T T A 10 0.534867787102555 0.360554133907767 ENSG00000183260:ENST00000369916:exon_62492851_62494341:C20orf135 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62574006 A/G 1 16 21 37 7.44211540635912 11.2322235291537 -3.79010812279454 A:G A G 10 0.534867787102555 0.249243671719291 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62703490 C/T 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171703:ENST00000461072:exon_62703223_62703699:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000475236:exon_62703223_62703699:TCEA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 20 62896665 G/A 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000203880:ENST00000369758:exon_62896611_62896782:PCMTD2;ENSG00000203880:ENST00000308824:exon_62896611_62896782:PCMTD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 49 57 106 22.7914784319748 30.4874638648456 -7.69598543287083 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.144450474977027 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 16 26 42 7.44211540635912 13.9065624646664 -6.46444705830731 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0621373098429561 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 26965100 C/A 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:C C A 10 0.534867787102555 0.593857532575953 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 47 65 112 21.8612140061799 34.7664061616661 -12.9051921554862 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0175165035718929 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 71 85 156 33.0243871157186 45.4637619037172 -12.4393747879986 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0537373288054553 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 27 37 64 12.558569748231 19.7901081227945 -7.23153837456352 T:C T C 10 0.534867787102555 0.079244696153758 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 56 22 78 26.0474039222569 11.7670913162562 14.2803126060007 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00133117703235916 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 34617213 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 28 22 50 13.0237019611285 11.7670913162562 1.25661064487225 C:G G C 10 0.534867787102555 0.77776803013863 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 246 256 502 114.422524372771 136.926153498254 -22.5036291254826 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0488887545644734 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 37692589 A/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000159256:ENST00000400485:exon_37692487_37692601:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000492336:exon_37692487_37692601:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000290384:exon_37692487_37692601:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000487909:exon_37692529_37692601:MORC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 60 69 129 27.9079327738467 36.9058773100763 -8.99794453622959 C:G G C 10 0.534867787102555 0.113154372994172 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 17 8 25 7.90724761925657 4.27894229682044 3.62830532243613 T:G T G 10 0.534867787102555 0.164147290224472 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 58 62 120 26.9776683480518 33.1618028003584 -6.1841344523066 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.272776965286934 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 40752333 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000182093:ENST00000333781:exon_40752170_40752412:WRB;ENSG00000182093:ENST00000487869:exon_40752320_40752412:WRB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 232 291 523 107.910673392207 155.646526046844 -47.7358526546363 T:C T C 10 0.534867787102555 3.01682833349243e-05 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43274814 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43274675_43274927:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43274675_43274927:PRDM15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43327793 C/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000157617:ENST00000299796:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000380486:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000329623:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482084:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482186:exon_43327769_43328911:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000467074:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000494352:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000419715:exon_43327769_43327893:C2CD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43327856 A/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000157617:ENST00000299796:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000380486:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000329623:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482084:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000482186:exon_43327769_43328911:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000467074:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000494352:exon_43327769_43327893:C2CD2;ENSG00000157617:ENST00000419715:exon_43327769_43327893:C2CD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 1 98 12 110 45.5829568639496 6.41841344523066 39.1645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 1.77804867108678e-15 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 118 12 130 54.8856011218985 6.41841344523066 48.4671876766678 T:C T C 10 0.534867787102555 3.3078730533724e-20 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 11 68 79 5.1164543418719 36.3710095229737 -31.2545551811018 T:C C T 10 0.534867787102555 3.11449269815479e-13 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 43985955 G/A 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000496416:exon_43985937_43985985:SLC37A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 45725715 A/G 1 13 1 14 6.04671876766678 0.534867787102555 5.51185098056423 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00244563697787340 ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45725683_45725818:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45725683_45725818:PFKL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 45743594 C/T 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.806945941972106 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 107 89 196 49.7691467800266 47.6032330521274 2.16591372789922 T:C C T 10 0.534867787102555 0.774950829492551 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 46271460 T/C 1 105 87 192 48.8388823542317 46.5334974779223 2.30538487630944 T:C T C 10 0.534867787102555 0.772498439426083 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 58 29 87 26.9776683480518 15.5111658259741 11.4665025220777 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0135112180800380 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 46950863 C/T 1 16 20 36 7.44211540635912 10.6973557420511 -3.25524033569198 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.317451841975924 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46950684_46950885:SLC19A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 76 79 155 35.3500481802058 42.2545551811018 -6.90450700089603 A:G A G 10 0.534867787102555 0.295227347366380 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 68 54 122 31.6289904770263 28.882860503538 2.74612997348829 A:C A C 10 0.534867787102555 0.650599265593822 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47664646 C/T 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.219211710381975 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 36 39 75 16.744759664308 20.8598436969996 -4.11508403269162 A:G A G 10 0.534867787102555 0.356173574656988 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 24 30 54 11.1631731095387 16.0460336130766 -4.88286050353797 T:C T C 10 0.534867787102555 0.219351191226900 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47773103 C/A 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 A:C C A 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47773018_47773240:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000466474:exon_47773018_47773217:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000483844:exon_47773018_47773240:PCNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47811272 C/T 1 25 22 47 11.6283053224361 11.7670913162562 -0.138785993820084 T:C:G C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47811079_47811291:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47811079_47811291:PCNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 51 47 98 23.7217428577697 25.1387859938201 -1.41704313605039 A:G A G 10 0.534867787102555 0.839643407218525 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 18 23 41 8.37237983215401 12.3019591033588 -3.92957927120476 A:C A C 10 0.534867787102555 0.272995522397383 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47961711 G/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000457905:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000427143:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000473752:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000494435:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47961669_47961808:DIP2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47970581 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47970456_47970657:DIP2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47974582 A/G 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47974488_47974609:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47974488_47974609:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47974488_47974609:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47974488_47974609:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000472364:exon_47974488_47974609:DIP2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 21 47985655 C/T 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000478105:exon_47985626_47985800:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000479654:exon_47985626_47985800:DIP2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 14 11 25 6.51185098056423 5.8835456581281 0.628305322436125 A:G G A 10 0.534867787102555 0.843631536270771 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 18 10 28 8.37237983215401 5.34867787102555 3.02370196112846 A:C C A 10 0.534867787102555 0.263663248503772 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 17630647 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 26 30 56 12.0934375353336 16.0460336130766 -3.95259607774308 T:C T C 10 0.534867787102555 0.348496632513094 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 18300348 A/G 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 18354766 C/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C C T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000465886:exon_18354696_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000498345:exon_18354700_18354789:MICAL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 26 13 39 12.0934375353336 6.95328123233322 5.14015630300035 T:C C T 10 0.534867787102555 0.109692215025922 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19165478 A/G 1 141 113 254 65.5836420185397 60.4400599425887 5.14358207595103 A:G A G 10 0.534867787102555 0.529923332097584 ENSG00000100075:ENST00000215882:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000451283:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000470922:exon_19165240_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000461267:exon_19165455_19165554:SLC25A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19318912 C/T 1 54 43 97 25.117139496462 22.9993148454099 2.11782465105216 T:C C T 10 0.534867787102555 0.685185429533995 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19318221_19319079:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19318221_19319079:HIRA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 144 86 230 66.9790386572321 45.9986296908197 20.9804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00547385801550294 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19467652 T/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000093009:ENST00000491520:exon_19467261_19467740:CDC45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 71 52 123 33.0243871157186 27.8131249293329 5.21126218638573 A:C A C 10 0.534867787102555 0.366891728581406 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 19868218 A/G 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19868145_19868870:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19868145_19868240:TXNRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 27 31 58 12.558569748231 16.5809014001792 -4.02233165194819 T:C C T 10 0.534867787102555 0.29570972901548 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 20939123 G/A 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 95 89 184 44.1875602252573 47.6032330521274 -3.41567282687012 T:C C T 10 0.534867787102555 0.657596783098239 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 139 126 265 64.6533775927449 67.3933411749219 -2.73996358217707 A:G A G 10 0.534867787102555 0.75831690164279 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22048862 C/T 1 19 6 25 8.83751204505145 3.20920672261533 5.62830532243612 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0269109159915461 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 44 35 79 20.4658173674876 18.7203725485894 1.74544481889816 T:C C T 10 0.534867787102555 0.735871250112176 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22287862 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000397495:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000445205:exon_22287763_22287951:PPM1F HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 25 15 40 11.6283053224361 8.02301680653832 3.6052885158978 A:G G A 10 0.534867787102555 0.271130131860466 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.130339312190040 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22782150 G/A 0 0 150 150 0 80.2301680653833 -80.2301680653833 A G A 10 0.534867787102555 1.36918668117356e-50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22782173 C/G 0 0 187 187 0 100.020276188178 -100.020276188178 G C G 10 0.534867787102555 6.86736488482658e-63 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22782212 C/G 1 1 25 26 0.465132212897445 13.3716946775639 -12.9065624646664 C:G C G 10 0.534867787102555 7.02940274236478e-08 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22782331 A/G 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 G A G 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 22782332 G/A 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 A G A 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 23237592 G/A 0 67 0 67 31.1638582641288 0 31.1638582641288 G G 10 0.534867787102555 7.80492119918674e-19 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24036563 G/A 1 14 17 31 6.51185098056423 9.09275238074344 -2.58090140017921 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.373013327758721 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24036534_24036637:RGL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24086107 A/G 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 A:G A G 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000187792:ENST00000341976:exon_24083769_24087406:ZNF70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 C:G C G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 246 217 463 114.422524372771 116.066309801254 -1.64378542848297 A:G G A 10 0.534867787102555 0.88891660798456 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24109550 T/C 1 13 16 29 6.04671876766678 8.55788459364088 -2.5111658259741 T:C T C 10 0.534867787102555 0.359273405953985 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24180581 G/C 1 16 18 34 7.44211540635912 9.62762016784599 -2.18550476148687 C:G G C 10 0.534867787102555 0.494284609355426 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24180325_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000430614:exon_24180539_24180632:DERL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 60 65 125 27.9079327738467 34.7664061616661 -6.85847338781938 T:C T C 10 0.534867787102555 0.243774841051818 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 26829719 C/T 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 T:C C T 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 26838430 A/C 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26838425_26838538:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26838425_26838538:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26838425_26838538:ASPHD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 47 42 89 21.8612140061799 22.4644470583073 -0.603233052127397 C:G G C 10 0.534867787102555 0.915701867101544 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 35 30 65 16.2796274514106 16.0460336130766 0.233593838333928 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29725639 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 23 28 51 10.6980408966412 14.9762980388715 -4.27825714223031 T:C T C 10 0.534867787102555 0.262010186623264 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 31 33 64 14.4190985998208 17.6506369743843 -3.23153837456352 T:C C T 10 0.534867787102555 0.453220740694877 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 T:C C T 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 29940556 G/C 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 C:G G C 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000475187:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000440771:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000455450:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000428374:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000418021:exon_29940449_29940592:THOC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 118 111 229 54.8856011218985 59.3703243683836 -4.4847232464851 A:G A G 10 0.534867787102555 0.55195860124917 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30403996 C/T 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C C T 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000100330:ENST00000401950:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000333027:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000323630:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000351488:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000406629:exon_30403890_30404021:MTMR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 21 35 56 9.76777647084634 18.7203725485894 -8.95259607774308 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0219307963570735 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30738161 C/T 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30782731 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30782605_30782748:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30782605_30782748:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000473077:exon_30782605_30782875:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000431544:exon_30782605_30782748:RNF215 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 71 67 138 33.0243871157186 35.8361417358712 -2.81175462015259 T:C T C 10 0.534867787102555 0.669882337905701 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 12 31 43 5.58158655476934 16.5809014001792 -10.9993148454099 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00106496884647509 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 C:G G C 10 0.534867787102555 0.283655371776667 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 57 44 101 26.5125361351544 23.5341826325124 2.97835350264194 T:C T C 10 0.534867787102555 0.618203978670161 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 C:G G C 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31491332 C/T 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 T:C C T 10 0.534867787102555 0.49300969037024 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 40 37 77 18.6052885158978 19.7901081227945 -1.18481960689673 A:G G A 10 0.534867787102555 0.819818532682382 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 18 27 45 8.37237983215401 14.441430251769 -6.06905041961497 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.074166479695257 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 25 14 39 11.6283053224361 7.48814901943577 4.14015630300035 A:G G A 10 0.534867787102555 0.201743249759012 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 42 48 90 19.5355529416927 25.6736537809226 -6.13810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.205745165981018 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 254 317 571 118.143582075951 169.55308851151 -51.4095064355589 A:G G A 10 0.534867787102555 1.79595619781731e-05 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 385 0 385 179.075901965516 0 179.075901965516 G G 10 0.534867787102555 3.43537776417428e-105 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 97 99 196 45.1178246510522 52.9519109231529 -7.83408627210078 T:C C T 10 0.534867787102555 0.282871107073960 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 31 25 56 14.4190985998208 13.3716946775639 1.04740392225692 A:G G A 10 0.534867787102555 0.790777918729491 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 41 15 56 19.0704207287952 8.02301680653832 11.0474039222569 T:G T G 10 0.534867787102555 0.00301317994171071 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 42 24 66 19.5355529416927 12.8368268904613 6.69872605123137 C:G G C 10 0.534867787102555 0.108995315389124 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36649966 C/T 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36649884_36650037:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000475519:exon_36649884_36650037:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000438034:exon_36649884_36650037:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36657596 A/G 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 50 71 121 23.2566106448723 37.9756128842814 -14.7190022394092 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00806919863418785 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 92 137 229 42.7921635865649 73.27688683305 -30.4847232464851 A:C C A 10 0.534867787102555 6.45192524223289e-05 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 99 150 249 46.0480890768471 80.2301680653833 -34.1820789885362 A:G G A 10 0.534867787102555 1.85652944688740e-05 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 86 105 191 40.0013703091803 56.1611176457683 -16.159747336588 A:G G A 10 0.534867787102555 0.020218367457668 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 97 119 216 45.1178246510522 63.649266665204 -18.5314420141519 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0138815137182456 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 37603531 G/A 1 14 16 30 6.51185098056423 8.55788459364088 -2.04603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.470026628362640 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 37708004 T/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37707497_37708215:CYTH4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 48 35 83 22.3263462190774 18.7203725485894 3.60597367048793 A:C C A 10 0.534867787102555 0.443310685358476 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 55 75 130 25.5822717093595 40.1150840326916 -14.5328123233322 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0135138283052658 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38061602 A/G 1 69 76 145 32.0941226899237 40.6499518197942 -8.55582912987047 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.157836585615669 ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38061562_38061878:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38061562_38062939:SH3BP1;ENSG00000241360:ENST00000215904:exon_38061562_38062941:PDXP;ENSG00000241360:ENST00000403251:exon_38061562_38062939:PDXP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38119213 G/A 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38119192_38122510:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38119192_38122510:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000396964:exon_38119192_38122510:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417174:exon_38119192_38122510:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000423472:exon_38119192_38122514:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000492485:exon_38119192_38122577:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38119192_38122510:TRIOBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 38 31 69 17.6750240901029 16.5809014001792 1.0941226899237 T:C C T 10 0.534867787102555 0.81053206575554 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 1 1 11 12 0.465132212897445 5.8835456581281 -5.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00206580726750062 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 523 540 1063 243.264147345364 288.82860503538 -45.564457690016 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00513983168151227 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 17 25 42 7.90724761925657 13.3716946775639 -5.46444705830731 T:G G T 10 0.534867787102555 0.120876840211428 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38341134 T/C 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000128346:ENST00000403305:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000249079:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000396889:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000403026:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000418863:exon_38341049_38341180:C22orf23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 38565347 C/T 1 3 11 14 1.39539663869233 5.8835456581281 -4.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.028188018724604 ENSG00000184381:ENST00000332509:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000335539:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000402064:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000419848:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000425347:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000429782:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000335538:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000396860:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000471636:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000451461:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000430886:exon_38565225_38565474:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000436218:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000447598:exon_38565225_38565474:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000435484:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000417303:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000455341:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000420435:exon_38565225_38565478:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000426674:exon_38565225_38565478:PLA2G6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39414240 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 103 109 212 47.9086179284368 58.3005887941785 -10.3919708657417 A:G A G 10 0.534867787102555 0.168408067300088 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39497481 G/C 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39709605 G/A 1 85 96 181 39.5362380962828 51.3473075618453 -11.8110694655625 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0864135274098939 ENSG00000100316:ENST00000464182:exon_39709196_39709710:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39709196_39710213:RPL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39715140 C/T 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.18250118711251 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 672 655 1327 312.568847067083 350.338400552174 -37.7695534850905 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0390064434430904 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 40757228 A/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000239900:ENST00000480775:exon_40757092_40757346:ADSL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 40801312 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 40803186 G/T 1 29 9 38 13.4888341740259 4.81381008392299 8.67502409010291 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00516272589066279 ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40803021_40803572:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802442_40804433:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000481408:exon_40803021_40803332:SGSM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 8 16 24 3.72105770317956 8.55788459364088 -4.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.063870553184595 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 41551039 T/A 1 17 20 37 7.90724761925657 10.6973557420511 -2.79010812279453 A:T T A 10 0.534867787102555 0.411131958237923 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41550999_41551117:EP300 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 41574129 G/A 1 79 72 151 36.7454448188982 38.510480671384 -1.7650358524858 A:G G A 10 0.534867787102555 0.806861994224998 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41572777_41576081:EP300 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 41609859 T/C 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 19 23 42 8.83751204505145 12.3019591033588 -3.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.353511036769694 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 97 90 187 45.1178246510522 48.1381008392299 -3.02027618817778 A:C A C 10 0.534867787102555 0.660851174211352 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 331 305 636 153.958762469054 163.134675066279 -9.17591259722496 T:G G T 10 0.534867787102555 0.474456105911804 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 75 65 140 34.8849159673084 34.7664061616661 0.118509805642297 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 42294751 G/C 1 114 117 231 53.0250722703087 62.5795310909989 -9.55445882069021 T:C:G G C 10 0.534867787102555 0.2107801596089 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42294653_42295192:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42294680_42294785:SREBF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 42538029 A/G 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.117636617366408 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 37 70 107 17.2098918772055 37.4407450971788 -20.2308532199734 T:C:G C T 10 0.534867787102555 9.30700954426504e-05 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 57 68 125 26.5125361351544 36.3710095229737 -9.85847338781938 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0881537985907057 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 25 39 64 11.6283053224361 20.8598436969996 -9.23153837456352 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0237188770684326 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43193641 G/A 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 37 35 72 17.2098918772055 18.7203725485894 -1.51048067138396 A:C A C 10 0.534867787102555 0.724818172761761 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43218463 C/T 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43278148 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43465814 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43465610_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43465642_43465850:TTLL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 38 23 61 17.6750240901029 12.3019591033588 5.37306498674414 C:G G C 10 0.534867787102555 0.199218662073781 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 59 75 134 27.4428005609493 40.1150840326916 -12.6722834717424 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0303078170384746 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 46238912 G/A 1 72 46 118 33.489519328616 24.6039182067175 8.88560112189851 A:G G A 10 0.534867787102555 0.116402234665043 ENSG00000130638:ENST00000252934:exon_46238871_46239058:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000396011:exon_46238871_46239058:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000493643:exon_46238871_46239058:ATXN10;ENSG00000130638:ENST00000402380:exon_46238871_46239058:ATXN10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 47069609 G/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:G G T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000075240:ENST00000406902:exon_47069567_47069711:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000361034:exon_47069567_47069711:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000418035:exon_47069567_47069711:GRAMD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 30 19 49 13.9539663869233 10.1624879549485 3.7914784319748 T:C T C 10 0.534867787102555 0.317195737226672 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 30 21 51 13.9539663869233 11.2322235291537 2.72174285776969 A:T T A 10 0.534867787102555 0.484759623037288 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 47116905 G/A 1 31 21 52 14.4190985998208 11.2322235291537 3.18687507066714 A:G G A 10 0.534867787102555 0.406555699258052 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50216754 G/A 1 55 49 104 25.5822717093595 26.2085215680252 -0.626249858665719 A:G G A 10 0.534867787102555 0.921929476107245 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50216599_50216861:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000459821:exon_50216599_50216949:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000494833:exon_50216599_50216853:BRD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50278568 A/G 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50278642 C/T 1 23 13 36 10.6980408966412 6.95328123233322 3.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.243786640606121 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50280136 T/C 1 36 39 75 16.744759664308 20.8598436969996 -4.11508403269162 T:C T C 10 0.534867787102555 0.356173574656988 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 11 22 33 5.1164543418719 11.7670913162562 -6.65063697438431 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0230071913905036 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 21 18 39 9.76777647084634 9.62762016784599 0.140156303000355 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50315952 C/T 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315945_50316091:CRELD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50317989 C/T 1 22 8 30 10.2329086837438 4.27894229682044 5.95396638692335 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0422527047053945 ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 85 57 142 39.5362380962828 30.4874638648456 9.04877423143719 T:C C T 10 0.534867787102555 0.130824999130575 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 36 27 63 16.744759664308 14.441430251769 2.30332941253904 T:C C T 10 0.534867787102555 0.614368764956346 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 51 46 97 23.7217428577697 24.6039182067175 -0.882175348947836 T:C T C 10 0.534867787102555 0.919009149078582 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 285 254 539 132.562680675772 135.856417924049 -3.29373724827715 T:C T C 10 0.534867787102555 0.7956323619475 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 C:G C G 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 12 16 28 5.58158655476934 8.55788459364088 -2.97629803887154 C:G G C 10 0.534867787102555 0.343713788088321 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 30 28 58 13.9539663869233 14.9762980388715 -1.02233165194819 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.793988505704594 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50655098 A/G 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 73 44 117 33.9546515415135 23.5341826325124 10.4204689090011 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0633660786714814 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50664612 A/G 1 37 38 75 17.2098918772055 20.3249759098971 -3.11508403269163 A:G A G 10 0.534867787102555 0.489074042023051 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50664479_50664618:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000473946:exon_50664479_50664620:TUBGCP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 65 51 116 30.2335938383339 27.2782571422303 2.95533669610362 A:G G A 10 0.534867787102555 0.641885556117113 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50717129 T/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716864_50717269:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50718397 A/G 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50719165 T/C 1 10 16 26 4.65132212897445 8.55788459364088 -3.90656246466643 T:C T C 10 0.534867787102555 0.167762406474111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 76 74 150 35.3500481802058 39.5802162455891 -4.23016806538325 A:G A G 10 0.534867787102555 0.513057017709996 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50719976 C/T 1 14 17 31 6.51185098056423 9.09275238074344 -2.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.373013327758721 ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719789_50720171:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50720181 C/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196576:ENST00000492578:exon_50719995_50720435:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 35 46 81 16.2796274514106 24.6039182067175 -8.32429075530695 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0742967629676203 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50724190 G/T 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:G G T 10 0.534867787102555 0.28201462375414 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 14 23 37 6.51185098056423 12.3019591033588 -5.79010812279454 T:C T C 10 0.534867787102555 0.069085953031393 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 46 56 102 21.3960817932825 29.9525960777431 -8.55651428446061 T:G T G 10 0.534867787102555 0.092287591146283 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 114 112 226 53.0250722703087 59.9051921554862 -6.88011988517744 A:G A G 10 0.534867787102555 0.386097857793152 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50897868 G/A 1 16 15 31 7.44211540635912 8.02301680653832 -0.580901400179204 A:G G A 10 0.534867787102555 0.85880988898277 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 57 51 108 26.5125361351544 27.2782571422303 -0.765721007075943 A:G G A 10 0.534867787102555 0.923269756049036 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50898619 G/A 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 47 37 84 21.8612140061799 19.7901081227945 2.07110588338538 T:C C T 10 0.534867787102555 0.663603925775226 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 98 113 211 45.5829568639496 60.4400599425887 -14.8571030786391 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0451483386447802 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 39 43 82 18.1401563030004 22.9993148454099 -4.85915854240951 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319262796091445 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 52 52 104 24.1868750706671 27.8131249293329 -3.62624985866572 A:G G A 10 0.534867787102555 0.492568424635132 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G A G 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 4358185 A/G 1 21 21 42 9.76777647084634 11.2322235291537 -1.46444705830731 A:G A G 10 0.534867787102555 0.757476853822526 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4357896_4359251:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425046:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4357896_4358948:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000358950:exon_4357896_4358220:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4357896_4358948:SETMAR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 4716811 A/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:C A C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4716752_4716932:ITPR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 9 20 29 4.18618991607701 10.6973557420511 -6.51116582597409 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0237505210960763 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 27 35 62 12.558569748231 18.7203725485894 -6.16180280035841 A:G G A 10 0.534867787102555 0.127237143900353 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 8809222 C/T 1 22 15 37 10.2329086837438 8.02301680653832 2.20989187720547 T:C C T 10 0.534867787102555 0.512648936021927 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 170 170 340 79.0724761925656 90.9275238074344 -11.8550476148687 T:C T C 10 0.534867787102555 0.211134432913668 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 67 41 108 31.1638582641288 21.9295792712048 9.23427899292406 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0824341905634454 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 10264480 C/G 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 C:G C G 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10264320_10264515:IRAK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 62 48 110 28.8381971996416 25.6736537809226 3.16454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 0.567467162060712 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 55 43 98 25.5822717093595 22.9993148454099 2.58295686394961 A:G A G 10 0.534867787102555 0.614321363025591 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 55 54 109 25.5822717093595 28.882860503538 -3.30058879417849 A:G G A 10 0.534867787102555 0.564947575647933 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 15 13 28 6.97698319346167 6.95328123233322 0.0237019611284595 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 19 26 45 8.83751204505145 13.9065624646664 -5.06905041961498 C:G C G 10 0.534867787102555 0.137295976208271 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 66 76 142 30.6987260512314 40.6499518197942 -9.95122576856281 T:C T C 10 0.534867787102555 0.109647512616115 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 12626516 G/A 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 67 37 104 31.1638582641288 19.7901081227945 11.3737501413343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0301143831593632 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 80 59 139 37.2105770317956 31.5571994390507 5.65337759274486 T:C C T 10 0.534867787102555 0.350633303705216 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 65 80 145 30.2335938383339 42.7894229682044 -12.5558291298705 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0376054426134844 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 13381455 C/T 1 26 28 54 12.0934375353336 14.9762980388715 -2.88286050353797 T:C C T 10 0.534867787102555 0.495673046163505 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13381354_13381533:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000485755:exon_13381354_13381533:NUP210 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 14 28 42 6.51185098056423 14.9762980388715 -8.46444705830731 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0123876194020050 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14154413 T/C 1 25 22 47 11.6283053224361 11.7670913162562 -0.138785993820084 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163528:ENST00000295767:exon_14153580_14154694:CHCHD4;ENSG00000163528:ENST00000396914:exon_14153593_14154694:CHCHD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 16 32 48 7.44211540635912 17.1157691872818 -9.67365378092264 A:T A T 10 0.534867787102555 0.00569785637273724 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 44 44 88 20.4658173674876 23.5341826325124 -3.06836526502484 A:G G A 10 0.534867787102555 0.523168650710111 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14200383 G/A 1 26 31 57 12.0934375353336 16.5809014001792 -4.48746386484564 A:G G A 10 0.534867787102555 0.235803914080419 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000477324:exon_14200307_14200392:XPC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14220023 G/C 1 30 27 57 13.9539663869233 14.441430251769 -0.487463864845635 C:G G C 10 0.534867787102555 0.895352371638272 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14219966_14220283:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14219966_14220172:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14219966_14220101:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14219984_14220121:XPC;ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14219858_14220381:LSM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 14526521 C/T 1 17 7 24 7.90724761925657 3.74407450971789 4.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 0.102993456137107 ENSG00000131389:ENST00000454876:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000458124:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000360861:exon_14526375_14530855:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000451687:exon_14526375_14530855:SLC6A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 14 4 18 6.51185098056423 2.13947114841022 4.37237983215401 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0560178997489729 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 15610070 C/T 1 31 13 44 14.4190985998208 6.95328123233322 7.46581736748758 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0331527902278491 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 17 7 24 7.90724761925657 3.74407450971789 4.16317310953868 T:C T C 10 0.534867787102555 0.102993456137107 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 47 31 78 21.8612140061799 16.5809014001792 5.28031260600071 C:G C G 10 0.534867787102555 0.256911800685787 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:G T G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 439 408 847 204.193041461978 218.226057137842 -14.0330156758641 T:C T C 10 0.534867787102555 0.33505292639037 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 251 244 495 116.748185437259 130.507740053023 -13.7595546157647 A:T:C A C 10 0.534867787102555 0.223840507423546 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 T:C T C 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 35 35 70 16.2796274514106 18.7203725485894 -2.44074509717885 A:C C A 10 0.534867787102555 0.632074809096646 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 17052089 C/T 1 16 28 44 7.44211540635912 14.9762980388715 -7.53418263251242 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0238324788175709 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 30 20 50 13.9539663869233 10.6973557420511 3.25661064487225 T:G G T 10 0.534867787102555 0.396592939270772 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 20141356 C/T 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20141354_20141446:KAT2B;ENSG00000114166:ENST00000426228:exon_20141354_20141446:KAT2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 23959527 G/A 1 27 7 34 12.558569748231 3.74407450971789 8.81449523851313 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00288367961403909 ENSG00000174748:ENST00000490223:exon_23958639_23960067:RPL15;ENSG00000174748:ENST00000465786:exon_23959341_23961043:RPL15;ENSG00000174748:ENST00000436146:exon_23959338_23959538:RPL15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 16 14 30 7.44211540635912 7.48814901943577 -0.0460336130766503 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 T:G T G 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 36 25 61 16.744759664308 13.3716946775639 3.37306498674415 A:G G A 10 0.534867787102555 0.441858834708637 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 T:C T C 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 23 16 39 10.6980408966412 8.55788459364088 2.14015630300035 A:G G A 10 0.534867787102555 0.5245845937422 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 27 29 56 12.558569748231 15.5111658259741 -2.95259607774308 A:G G A 10 0.534867787102555 0.503353984888101 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 84 64 148 39.0711058833854 34.2315383745635 4.83956750882186 A:G A G 10 0.534867787102555 0.458657709043579 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 39226171 G/A 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39224701_39227152:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000421646:exon_39224707_39227152:XIRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 39226720 G/A 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39224701_39227152:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000421646:exon_39224707_39227152:XIRP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 32 15 47 14.8842308127182 8.02301680653832 6.86121400617992 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0563240817122912 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 C:G G C 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 40573744 A/G 1 24 16 40 11.1631731095387 8.55788459364088 2.6052885158978 A:G A G 10 0.534867787102555 0.432537075389397 ENSG00000172888:ENST00000403205:exon_40573521_40575017:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000339296:exon_40573521_40579187:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000431278:exon_40573521_40575562:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000462161:exon_40573521_40573748:ZNF621;ENSG00000172888:ENST00000492098:exon_40573521_40574352:ZNF621 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 41280827 C/T 1 100 74 174 46.5132212897445 39.5802162455891 6.93300504415543 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.323233599182487 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41280625_41280844:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41280625_41281939:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000471014:exon_41280624_41280845:CTNNB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 45527218 T/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45527184_45527288:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45527184_45527288:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45527184_45527288:LARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 1 17 12 29 7.90724761925657 6.41841344523066 1.4888341740259 A:G G A 10 0.534867787102555 0.710420076918619 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 45559519 T/C 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45559455_45559564:LARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 45565554 A/G 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45565489_45565600:LARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 14 16 30 6.51185098056423 8.55788459364088 -2.04603361307665 A:T A T 10 0.534867787102555 0.470026628362640 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 46008790 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 46009864 C/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47036756 C/G 1 63 87 150 29.303329412539 46.5334974779223 -17.2301680653832 C:G C G 10 0.534867787102555 0.00527872075595992 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 502 322 824 233.496370874517 172.227427447023 61.2689434274947 T:C:G C G 10 0.534867787102555 1.97324344121151e-05 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47046842 G/C 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 C:G G C 10 0.534867787102555 0.831969512247843 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 61 59 120 28.3730649867441 31.5571994390507 -3.1841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.583652900758745 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47125498 C/A 1 73 65 138 33.9546515415135 34.7664061616661 -0.811754620152591 A:C C A 10 0.534867787102555 0.932059723962163 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 20 36 56 9.3026442579489 19.255240335692 -9.95259607774308 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0102822161341234 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 16 16 32 7.44211540635912 8.55788459364088 -1.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.725645289293216 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 40 38 78 18.6052885158978 20.3249759098971 -1.71968739399929 A:G G A 10 0.534867787102555 0.734110460310212 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 20 32 52 9.3026442579489 17.1157691872818 -7.81312492933286 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0363158017745871 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 48488192 G/C 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 C:G G C 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48488114_48488203:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48488114_48488203:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48488137_48488496:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48488137_48488496:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48488141_48488203:ATRIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 49463700 C/T 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 T:C C T 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000145029:ENST00000273598:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000421969:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000430622:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000423832:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000497742:exon_49463685_49463855:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000436744:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000422593:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000494057:exon_49463685_49463861:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000461015:exon_49463685_49463840:NICN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 49724808 T/C 1 32 22 54 14.8842308127182 11.7670913162562 3.11713949646203 T:C T C 10 0.534867787102555 0.416220945230801 ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49724582_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484269:exon_49724797_49724895:MST1;ENSG00000173531:ENST00000432076:exon_49724797_49724942:MST1;ENSG00000173531:ENST00000494828:exon_49724797_49724911:MST1;ENSG00000173531:ENST00000490966:exon_49724582_49725101:MST1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:G T G 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 57 40 97 26.5125361351544 21.3947114841022 5.11782465105216 T:C C T 10 0.534867787102555 0.310384250547974 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 19 34 53 8.83751204505145 18.1855047614869 -9.34799271643542 T:C T C 10 0.534867787102555 0.012560370169548 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 126 117 243 58.6066588250781 62.5795310909989 -3.97287226592086 T:C T C 10 0.534867787102555 0.607751596193783 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 117 128 245 54.4204689090011 68.463076749127 -14.042607840126 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0732167515589079 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 49 49 98 22.7914784319748 26.2085215680252 -3.41704313605039 A:G A G 10 0.534867787102555 0.543708893216402 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 28 24 52 13.0237019611285 12.8368268904613 0.186875070667138 A:T T A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 19 16 35 8.83751204505145 8.55788459364088 0.279627451410574 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 19 29 48 8.83751204505145 15.5111658259741 -6.67365378092264 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0600217724249818 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:G T G 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 50645158 A/G 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000114737:ENST00000491847:exon_50643921_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000443053:exon_50643927_50645573:CISH;ENSG00000114737:ENST00000348721:exon_50643953_50645573:CISH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 195 188 383 90.7007815150018 100.55514397528 -9.85436246027857 A:T:C A C 10 0.534867787102555 0.330483125671923 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 60 78 138 27.9079327738467 41.7196873939993 -13.8117546201526 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0209688857151746 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 60 60 120 27.9079327738467 32.0920672261533 -4.1841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.464875599763766 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 17 9 26 7.90724761925657 4.81381008392299 3.09343753533357 T:C C T 10 0.534867787102555 0.244174969689519 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52325759 A/G 1 9 2 11 4.18618991607701 1.06973557420511 3.1164543418719 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0725046651229634 ENSG00000168237:ENST00000489173:exon_52324976_52325938:GLYCTK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52407041 C/T 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52406912_52407069:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52406912_52407069:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52406912_52407069:DNAH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52425234 C/G 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 C:G C G 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52425195_52425344:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52425195_52425344:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52425195_52425344:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52425195_52425344:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52425195_52425344:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000480649:exon_52425195_52425344:DNAH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52437143 C/T 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000163930:ENST00000466093:exon_52436795_52437314:BAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52521920 C/T 1 46 52 98 21.3960817932825 27.8131249293329 -6.41704313605039 T:C C T 10 0.534867787102555 0.224159037972429 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52559042 C/T 1 354 1 355 164.656803365696 0.534867787102555 164.121935578593 T:C C T 10 0.534867787102555 1.08070476513367e-94 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000479024:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000462261:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000469616:exon_52558833_52559076:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000466112:exon_52558979_52559119:NT5DC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 52721199 C/T 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 53267155 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 37 14 51 17.2098918772055 7.48814901943577 9.72174285776969 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0071580368454942 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 53899178 T/C 1 91 82 173 42.3270313736675 43.8591585424095 -1.53212716874202 T:C T C 10 0.534867787102555 0.819613054716629 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 14 15 29 6.51185098056423 8.02301680653832 -1.51116582597409 T:C C T 10 0.534867787102555 0.582705672158879 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 56601044 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000482673:exon_56600978_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56600811_56601081:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484441:exon_56600979_56601081:CCDC66 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 56657197 T/C 1 58 69 127 26.9776683480518 36.9058773100763 -9.92820896202448 T:C T C 10 0.534867787102555 0.090634874763154 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56654161_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56654573_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56656766_56657871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56656887_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56656974_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56657065_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000485156:exon_56657145_56657871:C3orf63 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 37 38 75 17.2098918772055 20.3249759098971 -3.11508403269163 T:C T C 10 0.534867787102555 0.489074042023051 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 58107039 G/A 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58106968_58107230:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58106968_58107230:FLNB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 4 22 26 1.86052885158978 11.7670913162562 -9.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 9.26763087048137e-05 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 27 6 33 12.558569748231 3.20920672261533 9.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0012824468096737 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 66433676 A/G 1 15 31 46 6.97698319346167 16.5809014001792 -9.60391820671753 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00481982653763449 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 29 27 56 13.4888341740259 14.441430251769 -0.952596077743079 T:C C T 10 0.534867787102555 0.893593101295832 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 73111368 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 78700901 G/T 1 2 10 12 0.93026442579489 5.34867787102555 -4.41841344523066 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0167363082066575 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78700882_78701079:ROBO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 32 32 64 14.8842308127182 17.1157691872818 -2.23153837456352 T:C T C 10 0.534867787102555 0.617172870341794 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 53 34 87 24.6520072835646 18.1855047614869 6.46650252207771 T:C C T 10 0.534867787102555 0.196897650756596 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 31 26 57 14.4190985998208 13.9065624646664 0.512536135154365 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 172 171 343 80.0027406183605 91.4623915945369 -11.4596509761764 A:T:C C A 10 0.534867787102555 0.233688522666144 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 26 22 48 12.0934375353336 11.7670913162562 0.32634621907736 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 81 81 162 37.675709244693 43.324290755307 -5.64858151061391 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.386976995849896 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 100463651 T/G 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100461320_100463775:TFG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 104 131 235 48.3737501413343 70.0676801104347 -21.6939299691004 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00486785781584111 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 54 65 119 25.117139496462 34.7664061616661 -9.64926666520405 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0810068211881635 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 29 22 51 13.4888341740259 11.7670913162562 1.7217428577697 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.675251656578433 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105260520 C/T 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 19 24 43 8.83751204505145 12.8368268904613 -3.99931484540987 T:C T C 10 0.534867787102555 0.225920813386530 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105266331 A/G 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 A:G A G 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 32 17 49 14.8842308127182 9.09275238074344 5.7914784319748 A:G A G 10 0.534867787102555 0.114956756984191 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.316682748263081 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 2 17 19 0.93026442579489 9.09275238074344 -8.16248795494855 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000127118118830605 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 108391500 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108391407_108391503:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108391407_108391503:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108391407_108391503:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108391407_108391503:DZIP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 112059768 C/G 1 14 24 38 6.51185098056423 12.8368268904613 -6.32497590989709 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0499652956178817 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112059749_112059830:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112059749_112059830:CD200 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 36 45 81 16.744759664308 24.069050419615 -7.32429075530695 A:C C A 10 0.534867787102555 0.118622056880870 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 33 5 38 15.3493630256157 2.67433893551277 12.6750240901029 A:T A T 10 0.534867787102555 2.36312828988572e-05 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 113720517 T/A 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113720442_113720543:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000460813:exon_113720442_113720543:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000527855:exon_113720442_113720618:KIAA1407 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119128398 G/A 1 27 18 45 12.558569748231 9.62762016784599 2.93094958038503 A:G G A 10 0.534867787102555 0.455527557949342 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119128343_119128623:ARHGAP31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 39 33 72 18.1401563030004 17.6506369743843 0.489519328616041 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119196334 G/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:G G T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119198873 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119198755_119199019:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119198755_119199019:POGLUT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 38 30 68 17.6750240901029 16.0460336130766 1.62899047702626 C:G G C 10 0.534867787102555 0.716932952645827 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 35 35 70 16.2796274514106 18.7203725485894 -2.44074509717885 T:C C T 10 0.534867787102555 0.632074809096646 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 35 32 67 16.2796274514106 17.1157691872818 -0.836141735871184 A:T T A 10 0.534867787102555 0.902695490039415 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 68 70 138 31.6289904770263 37.4407450971788 -5.81175462015259 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.348119730660300 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 37 37 74 17.2098918772055 19.7901081227945 -2.58021624558907 T:C C T 10 0.534867787102555 0.562010524946188 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 37 39 76 17.2098918772055 20.8598436969996 -3.64995181979418 C:G C G 10 0.534867787102555 0.422316569557216 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 19 13 32 8.83751204505145 6.95328123233322 1.88423081271824 T:C C T 10 0.534867787102555 0.59619639942853 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121208833 G/C 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 C:G G C 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 241 223 464 112.096863308284 119.27551652387 -7.17865321558553 A:G G A 10 0.534867787102555 0.514907528068759 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 202 188 390 93.9567070052839 100.55514397528 -6.59843696999646 A:G G A 10 0.534867787102555 0.509676904494362 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 64 79 143 29.7684616254365 42.2545551811018 -12.4860935556654 A:T:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0438522249443577 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 35 30 65 16.2796274514106 16.0460336130766 0.233593838333928 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 37 32 69 17.2098918772055 17.1157691872818 0.0941226899237044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 33 28 61 15.3493630256157 14.9762980388715 0.373064986744144 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 119 114 233 55.350733334796 60.9749277296913 -5.62419439489532 A:G A G 10 0.534867787102555 0.470586568601454 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 131 110 241 60.9323198895653 58.8354565812811 2.09686330828424 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796562042336185 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122849449 T/C 1 9 14 23 4.18618991607701 7.48814901943577 -3.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.210174710637985 ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122849327_122849463:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122849327_122849463:PDIA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 19 16 35 8.83751204505145 8.55788459364088 0.279627451410574 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 T:C T C 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 44 42 86 20.4658173674876 22.4644470583073 -1.99862969081973 T:G T G 10 0.534867787102555 0.667305281737749 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124462824 A/G 1 74 86 160 34.4197837544109 45.9986296908197 -11.5788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0686306684932844 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124462959 A/G 1 35 44 79 16.2796274514106 23.5341826325124 -7.25455518110184 A:G A G 10 0.534867787102555 0.114293013295456 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124515278 G/A 1 2 9 11 0.93026442579489 4.81381008392299 -3.8835456581281 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0298728806961029 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124515498 T/C 0 8 0 8 3.72105770317956 0 3.72105770317956 T T 10 0.534867787102555 0.00888925060565865 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 8 15 23 3.72105770317956 8.02301680653832 -4.30195910335876 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0934089262926932 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124646837 G/A 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 A:G G A 10 0.534867787102555 0.128640050678942 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000497378:exon_124646743_124646837:MUC13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 30 30 60 13.9539663869233 16.0460336130766 -2.0920672261533 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.606755639351541 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 25 33 58 11.6283053224361 17.6506369743843 -6.02233165194819 C:G G C 10 0.534867787102555 0.116229576510907 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 125734340 A/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 A:T A T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125734337_125734416:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125734337_125734416:SLC41A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 126737268 C/A 1 23 6 29 10.6980408966412 3.20920672261533 7.4888341740259 A:C C A 10 0.534867787102555 0.00496179124750955 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126737137_126737371:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126737137_126737371:PLXNA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 126741011 G/A 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126740928_126741184:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126740928_126741184:PLXNA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 93 88 181 43.2572957994624 47.0683652650248 -3.81106946556245 A:G G A 10 0.534867787102555 0.602184702351973 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 84 87 171 39.0711058833854 46.5334974779223 -7.4623915945369 T:C C T 10 0.534867787102555 0.283134679082868 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 99 92 191 46.0480890768471 49.2078364134351 -3.159747336588 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.663837225360258 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128624880 T/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:G T G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128627753 T/C 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 92 70 162 42.7921635865649 37.4407450971788 5.35141848938609 T:C C T 10 0.534867787102555 0.43120008507057 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 128994074 C/T 1 131 120 251 60.9323198895653 64.1841344523066 -3.2518145627413 T:C C T 10 0.534867787102555 0.704394717085056 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128994037_128994135:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128994037_128994135:COPG;ENSG00000181789:ENST00000509889:exon_128994037_128994135:COPG;ENSG00000181789:ENST00000514478:exon_128994037_128994135:COPG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 60 55 115 27.9079327738467 29.4177282906405 -1.50979551679383 A:G G A 10 0.534867787102555 0.780063037609595 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 96 66 162 44.6526924381547 35.3012739487686 9.35141848938608 A:G A G 10 0.534867787102555 0.156200718314289 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129152089 G/A 1 57 53 110 26.5125361351544 28.3479927164354 -1.83545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.774533197039997 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 58 90 148 26.9776683480518 48.1381008392299 -21.1604324911781 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000514070170036224 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129155670 C/T 1 79 67 146 36.7454448188982 35.8361417358712 0.90930308302697 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.93393259647774 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 129214302 G/A 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000163913:ENST00000347300:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000296266:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507564:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000512220:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000504021:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000349441:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000348417:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000431818:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000454840:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000506507:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000509522:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000512814:exon_129214289_129214330:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507221:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000446384:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000513932:exon_129214293_129214450:IFT122 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 130449248 G/A 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 37 35 72 17.2098918772055 18.7203725485894 -1.51048067138396 A:G G A 10 0.534867787102555 0.724818172761761 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 35 36 71 16.2796274514106 19.255240335692 -2.9756128842814 T:G T G 10 0.534867787102555 0.47863745001853 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 136664453 T/C 1 25 25 50 11.6283053224361 13.3716946775639 -1.74338935512775 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.67165980504118 ENSG00000158092:ENST00000288986:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000481752:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000491539:exon_136664425_136664585:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000485096:exon_136664425_136664544:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000488930:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000496489:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000469404:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000467911:exon_136664425_136664594:NCK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 140675469 C/T 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502756:exon_140675369_140675911:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000393015:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000515813:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000507429:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000513887:exon_140675369_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512023:exon_140675367_140675533:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512506:exon_140675469_140675533:SLC25A36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 141162009 C/T 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 142222284 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142222204_142222295:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142222204_142222295:ATR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 142277536 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142277466_142277618:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142277466_142277618:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515863:exon_142277466_142277843:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515149:exon_142277466_142277618:ATR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 56 0 56 26.0474039222569 0 26.0474039222569 G G 10 0.534867787102555 1.11423900661395e-15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 18 24 42 8.37237983215401 12.8368268904613 -4.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.215445908779324 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 T:C T C 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G G A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 55 61 116 25.5822717093595 32.6269350132559 -7.04466330389638 A:G A G 10 0.534867787102555 0.193825380703394 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 21 21 42 9.76777647084634 11.2322235291537 -1.46444705830731 T:G T G 10 0.534867787102555 0.757476853822526 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 60 64 124 27.9079327738467 34.2315383745635 -6.32360560071682 T:C:G C G 10 0.534867787102555 0.280154180952049 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 C:G G C 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 156249214 T/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000169282:ENST00000490337:exon_156249198_156249286:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000389636:exon_156249198_156249286:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000471742:exon_156249198_156249286:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000320719:exon_156249198_156249290:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000302490:exon_156249198_156249286:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000389634:exon_156249198_156249286:KCNAB1;ENSG00000169282:ENST00000497291:exon_156249198_156249286:KCNAB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 128 123 251 59.536923250873 65.7887378136143 -6.2518145627413 T:C C T 10 0.534867787102555 0.447921087669378 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 160130110 G/A 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.401674823937556 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 160156951 C/T 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 T:C C T 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000479460:exon_160156439_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471396:exon_160156507_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000496222:exon_160156519_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471155:exon_160156629_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000494486:exon_160156637_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000468542:exon_160156789_160156974:TRIM59 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 167747022 C/T 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167747011_167747090:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167747011_167747090:GOLIM4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 169504476 G/T 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169504204_169505333:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169504204_169505333:MYNN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 170825920 G/A 1 11 13 24 5.1164543418719 6.95328123233322 -1.83682689046132 A:G G A 10 0.534867787102555 0.540814378150813 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170825854_170825951:TNIK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 31 21 52 14.4190985998208 11.2322235291537 3.18687507066714 A:G G A 10 0.534867787102555 0.406555699258052 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 52 64 116 24.1868750706671 34.2315383745635 -10.0446633038964 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0631732726753961 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 178976777 C/T 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178976736_178977679:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178976736_178976996:KCNMB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 62 59 121 28.8381971996416 31.5571994390507 -2.71900223940915 A:G A G 10 0.534867787102555 0.64914919532793 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 179092989 C/T 1 21 8 29 9.76777647084634 4.27894229682044 5.4888341740259 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0422202715762133 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 182631792 C/A 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182631649_182631891:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000491699:exon_182631649_182632393:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000484691:exon_182631649_182631884:ATP11B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.283655371776667 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 59 24 83 27.4428005609493 12.8368268904613 14.6059736704879 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0013082096606797 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 155 77 232 72.095492999104 41.1848196068967 30.9106733922072 T:C C T 10 0.534867787102555 4.17740816876725e-05 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 49 57 106 22.7914784319748 30.4874638648456 -7.69598543287083 C:G C G 10 0.534867787102555 0.144450474977027 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 103 110 213 47.9086179284368 58.8354565812811 -10.9268386528442 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149026533657173 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183960671 C/T 1 56 76 132 26.0474039222569 40.6499518197942 -14.6025478975373 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0113529121770986 ENSG00000214160:ENST00000411922:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000397676:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000445626:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000458439:exon_183960601_183960743:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000418734:exon_183960601_183960743:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000485912:exon_183960601_183961377:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000455059:exon_183960601_183960745:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000446569:exon_183960601_183960745:ALG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 44 28 72 20.4658173674876 14.9762980388715 5.48951932861604 T:C C T 10 0.534867787102555 0.237240343640878 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 26 43 69 12.0934375353336 22.9993148454099 -10.9058773100763 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0107677430257953 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 184042166 A/T 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:T A T 10 0.534867787102555 0.366253001737291 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 68 63 131 31.6289904770263 33.696670587461 -2.0676801104347 A:G G A 10 0.534867787102555 0.726870178783452 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.243153570620483 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 3 9 12 1.39539663869233 4.81381008392299 -3.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0784035454430902 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G G A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 14 4 18 6.51185098056423 2.13947114841022 4.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0560178997489729 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 67 74 141 31.1638582641288 39.5802162455891 -8.41635798146025 T:C C T 10 0.534867787102555 0.176595439922852 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 7 18 25 3.25592549028211 9.62762016784599 -6.37169467756387 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0145980406386551 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 A:T T A 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 12 13 25 5.58158655476934 6.95328123233322 -1.37169467756388 A:G A G 10 0.534867787102555 0.689506779269227 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 191093384 A/G 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 30 24 54 13.9539663869233 12.8368268904613 1.11713949646203 A:G G A 10 0.534867787102555 0.786622504714958 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 18 31 49 8.37237983215401 16.5809014001792 -8.20852156802519 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.0215215512398045 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 194126697 T/C 1 100 90 190 46.5132212897445 48.1381008392299 -1.62487954948545 T:C T C 10 0.534867787102555 0.82757144500921 ENSG00000133657:ENST00000439040:exon_194123401_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000429136:exon_194123406_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000256031:exon_194123409_194126845:ATP13A3;ENSG00000133657:ENST00000461660:exon_194124194_194126845:ATP13A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 A:C C A 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 A:C C A 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 195610043 C/T 1 29 25 54 13.4888341740259 13.3716946775639 0.11713949646203 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195610028_195613144:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000430929:exon_195610028_195610180:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195610028_195610180:TNK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 195615376 A/G 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 A:G A G 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195615297_195615455:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000433111:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000427576:exon_195615297_195615477:TNK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 195622173 A/G 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.117636617366408 ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195622117_195622432:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195622117_195622432:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195622117_195622432:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195622117_195622432:TNK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 195778972 C/T 1 94 102 196 43.7224280123598 54.5565142844606 -10.8340862721008 T:C C T 10 0.534867787102555 0.132555226933887 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195776347_195779055:TFRC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196435534 T/C 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000174007:ENST00000409690:exon_196435399_196435598:C3orf34;ENSG00000174007:ENST00000311566:exon_196435399_196435598:C3orf34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 21 33 54 9.76777647084634 17.6506369743843 -7.88286050353797 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0398519738879298 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196674749 C/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196673214_196675556:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000413127:exon_196673608_196675444:PIGZ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196735687 C/T 1 38 25 63 17.6750240901029 13.3716946775639 4.30332941253903 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313050851492455 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 39 15 54 18.1401563030004 8.02301680653832 10.117139496462 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.00604443154048966 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 48 30 78 22.3263462190774 16.0460336130766 6.28031260600071 T:C T C 10 0.534867787102555 0.173386138848736 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 79 35 114 36.7454448188982 18.7203725485894 18.0250722703087 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000678552189450076 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196749798 T/G 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:G T G 10 0.534867787102555 0.523929958174943 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 196750016 A/G 1 7 11 18 3.25592549028211 5.8835456581281 -2.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.243153570620483 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 15 22 37 6.97698319346167 11.7670913162562 -4.79010812279453 T:C C T 10 0.534867787102555 0.137804477163093 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 3 197665599 G/T 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:G G T 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197665419_197665903:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197665531_197665646:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197665537_197665646:IQCG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 85919 G/A 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 G G 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 338191 G/A 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000131127:ENST00000512994:exon_338124_338219:ZNF141;ENSG00000131127:ENST00000503699:exon_338124_338219:ZNF141;ENSG00000131127:ENST00000505939:exon_338124_338219:ZNF141;ENSG00000131127:ENST00000240499:exon_338124_338219:ZNF141 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 532975 C/T 1 44 26 70 20.4658173674876 13.9065624646664 6.55925490282115 T:C C T 10 0.534867787102555 0.120828511820964 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 24 28 52 11.1631731095387 14.9762980388715 -3.81312492933286 A:G A G 10 0.534867787102555 0.331041744557042 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 675855 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 780286 C/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 C:G C G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000168993:ENST00000304062:exon_778745_780486:CPLX1;ENSG00000168993:ENST00000505203:exon_778746_780486:CPLX1;ENSG00000168993:ENST00000506404:exon_780178_780486:CPLX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 32 26 58 14.8842308127182 13.9065624646664 0.977668348051809 A:G A G 10 0.534867787102555 0.895438925505447 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 28 28 56 13.0237019611285 14.9762980388715 -1.95259607774308 T:C T C 10 0.534867787102555 0.688153321688502 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 954885 G/T 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:G G T 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000145214:ENST00000273814:exon_954837_954989:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000509465:exon_954837_954989:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000405681:exon_954837_954989:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000515182:exon_954837_954989:DGKQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 1985257 G/A 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:G G A 10 0.534867787102555 0.194126160849861 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 182 166 348 84.654062747335 88.7880526590241 -4.13398991168914 T:G G T 10 0.534867787102555 0.667534501255573 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 111 91 202 51.6296756316164 48.6729686263325 2.95670700528389 C:G C G 10 0.534867787102555 0.724454973295227 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 23 21 44 10.6980408966412 11.2322235291537 -0.534182632512421 A:G G A 10 0.534867787102555 0.881091734150379 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3162056 C/T 1 10 18 28 4.65132212897445 9.62762016784599 -4.97629803887154 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0863582676468199 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3162009_3162119:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3162009_3162119:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 21 25 46 9.76777647084634 13.3716946775639 -3.60391820671753 A:G G A 10 0.534867787102555 0.303718875469948 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 51 34 85 23.7217428577697 18.1855047614869 5.53623809628282 T:C T C 10 0.534867787102555 0.234046570273811 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 50 45 95 23.2566106448723 24.069050419615 -0.812439774742725 A:G A G 10 0.534867787102555 0.91819384300849 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 43 51 94 20.0006851545901 27.2782571422303 -7.27757198764017 A:G G A 10 0.534867787102555 0.147741254122426 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 49 27 76 22.7914784319748 14.441430251769 8.35004818020582 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0652291870199924 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3318413 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000159788:ENST00000511275:exon_3317797_3319778:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000344733:exon_3317797_3319778:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000336727:exon_3317797_3319778:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000502947:exon_3317795_3319778:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000514268:exon_3317795_3319778:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000382788:exon_3317795_3319778:RGS12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 100 90 190 46.5132212897445 48.1381008392299 -1.62487954948545 T:C T C 10 0.534867787102555 0.82757144500921 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 106 85 191 49.3040145671292 45.4637619037172 3.840252663412 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.611887552228022 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 78 80 158 36.2803126060007 42.7894229682044 -6.50911036220369 T:C C T 10 0.534867787102555 0.3011765675504 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 3526786 C/T 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 5448429 A/G 0 10 0 10 4.65132212897445 0 4.65132212897445 A A 10 0.534867787102555 0.00239028864245299 ENSG00000152953:ENST00000282908:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000512018:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000512636:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000510398:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000511959:exon_5448400_5449057:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000508728:exon_5448400_5448503:STK32B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 5749904 T/C 1 16 6 22 7.44211540635912 3.20920672261533 4.23290868374379 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0870742846520174 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 5749961 G/C 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 C:G G C 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 5750003 A/G 1 3 12 15 1.39539663869233 6.41841344523066 -5.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0165998200537799 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 5785442 G/A 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5785279_5785491:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5785279_5785491:EVC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 6619204 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000510427:exon_6619175_6619219:MAN2B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 6864479 C/T 1 28 32 60 13.0237019611285 17.1157691872818 -4.0920672261533 T:C C T 10 0.534867787102555 0.302864422401248 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 10083058 C/T 1 231 247 478 107.44554117931 132.112343414331 -24.6668022350213 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0246353053364990 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382451:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000443592:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000502702:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000515743:exon_10082981_10083068:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000502962:exon_10082981_10083068:WDR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 A:C A C 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 13605624 T/G 1 40 34 74 18.6052885158978 18.1855047614869 0.419783754410929 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 40 29 69 18.6052885158978 15.5111658259741 3.09412268992371 A:T A T 10 0.534867787102555 0.471701744799663 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 13616381 A/G 1 34 18 52 15.8144952385131 9.62762016784599 6.18687507066714 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0956075052377835 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615820_13616434:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615820_13616434:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615820_13616434:BOD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 32 27 59 14.8842308127182 14.441430251769 0.442800560949255 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 188 158 346 87.4448560247197 84.5091103622037 2.93574566251597 T:C T C 10 0.534867787102555 0.787634677995913 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 22439914 A/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:C A C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22439879_22440043:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22439879_22440043:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000508133:exon_22439879_22440043:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000502482:exon_22439879_22440043:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000514129:exon_22439881_22440043:GPR125 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 37 32 69 17.2098918772055 17.1157691872818 0.0941226899237044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 25 12 37 11.6283053224361 6.41841344523066 5.20989187720546 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0996233711949082 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 25 12 37 11.6283053224361 6.41841344523066 5.20989187720546 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0996233711949082 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 T:G T G 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38023302 C/G 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 53 47 100 24.6520072835646 25.1387859938201 -0.4867787102555 T:G T G 10 0.534867787102555 0.920578319048615 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 65 46 111 30.2335938383339 24.6039182067175 5.62967563161639 T:C T C 10 0.534867787102555 0.296580617582000 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 76 56 132 35.3500481802058 29.9525960777431 5.39745210246274 T:G T G 10 0.534867787102555 0.383116986660521 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 65 50 115 30.2335938383339 26.7433893551277 3.49020448320617 A:T A T 10 0.534867787102555 0.575086392643545 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 60 60 120 27.9079327738467 32.0920672261533 -4.1841344523066 T:G T G 10 0.534867787102555 0.464875599763766 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 T:C T C 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 6 13 19 2.79079327738467 6.95328123233322 -4.16248795494855 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0663015221709073 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38830116 C/T 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 38830736 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000508254:exon_38830644_38831158:TLR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 30 31 61 13.9539663869233 16.5809014001792 -2.62693501325585 A:G A G 10 0.534867787102555 0.522970828867368 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 39921942 A/G 1 6 15 21 2.79079327738467 8.02301680653832 -5.23222352915365 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0275138695227108 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39921939_39922019:PDS5A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 40438576 A/G 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40438458_40438902:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40438458_40438664:RBM47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 50 49 99 23.2566106448723 26.2085215680252 -2.95191092315294 T:C T C 10 0.534867787102555 0.614662961752018 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 41015823 G/T 1 2 12 14 0.93026442579489 6.41841344523066 -5.48814901943577 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00511526831383688 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 41258970 A/G 1 53 33 86 24.6520072835646 17.6506369743843 7.00137030918027 A:G A G 10 0.534867787102555 0.159546501845075 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 67 52 119 31.1638582641288 27.8131249293329 3.35073333479595 T:C C T 10 0.534867787102555 0.581775586137679 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 42457545 G/A 1 26 20 46 12.0934375353336 10.6973557420511 1.39608179328247 A:G G A 10 0.534867787102555 0.768096535425017 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000514372:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42457542_42457616:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000506602:exon_42457542_42457616:ATP8A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 42629038 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42629012_42629126:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42629012_42629127:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42629012_42629126:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000510289:exon_42627158_42629126:ATP8A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 47589203 G/A 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:G G A 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505476:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47589036_47589223:ATP10D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 48582909 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507711:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000506685:exon_48582473_48582968:FRYL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 52752812 A/T 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:T A T 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000109184:ENST00000509376:exon_52752734_52753410:DCUN1D4;ENSG00000109184:ENST00000477560:exon_52752734_52753410:DCUN1D4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C T C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C T C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 56309992 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000134852:ENST00000511124:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000309964:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000381322:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000513440:exon_56309854_56310063:CLOCK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57215969 C/T 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 T:C C T 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57220216 G/A 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57220205_57220377:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57220205_57220377:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57220205_57220377:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57220205_57220377:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57220205_57220377:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57220205_57220377:AASDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57221348 T/C 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57221348_57221589:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57221348_57221589:AASDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57248716 G/C 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 C:G G C 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57247925_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57248590_57248763:AASDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57250285 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57250236_57250465:AASDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57266959 G/A 1 18 19 37 8.37237983215401 10.1624879549485 -1.79010812279454 A:G G A 10 0.534867787102555 0.62221830024311 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57266950_57267077:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000425339:exon_57265345_57267082:PPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57301681 G/A 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 A:G G A 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57301516_57301781:PPAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57335853 G/T 1 55 90 145 25.5822717093595 48.1381008392299 -22.5558291298705 T:G G T 10 0.534867787102555 0.000224372853520946 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57335819_57335939:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57335819_57335939:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57335819_57335939:SRP72 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 57357683 T/C 1 39 46 85 18.1401563030004 24.6039182067175 -6.46376190371717 T:C T C 10 0.534867787102555 0.191666659531499 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57357597_57357731:SRP72 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 25 20 45 11.6283053224361 10.6973557420511 0.930949580385025 T:C C T 10 0.534867787102555 0.881482718229074 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 32 17 49 14.8842308127182 9.09275238074344 5.7914784319748 A:G G A 10 0.534867787102555 0.114956756984191 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 10 12 22 4.65132212897445 6.41841344523066 -1.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.523929958174943 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 42 31 73 19.5355529416927 16.5809014001792 2.95465154151348 A:G A G 10 0.534867787102555 0.55780756296182 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:C C A 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68500171 A/G 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68500147_68500236:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68500147_68500236:UBA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 68562365 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68562363_68562425:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68562363_68562425:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68562363_68562425:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000506571:exon_68562363_68562425:UBA6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 61 53 114 28.3730649867441 28.3479927164354 0.0250722703087298 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 71659634 T/C 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593131144231023 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 74451073 A/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:G A G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 35 32 67 16.2796274514106 17.1157691872818 -0.836141735871184 T:G G T 10 0.534867787102555 0.902695490039415 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77039174 G/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 C:G G C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77038817_77039347:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77039099_77039347:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77039193 A/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 A:T A T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77038817_77039347:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77039099_77039347:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77039352 A/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G A G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000138750:ENST00000513248:exon_77039228_77039590:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 23 28 51 10.6980408966412 14.9762980388715 -4.27825714223031 A:G A G 10 0.534867787102555 0.262010186623264 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 30 25 55 13.9539663869233 13.3716946775639 0.582271709359475 A:G A G 10 0.534867787102555 0.893424698385427 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 22 9 31 10.2329086837438 4.81381008392299 5.4190985998208 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0701483964314631 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 78804474 A/G 1 61 45 106 28.3730649867441 24.069050419615 4.30401456712917 A:G A G 10 0.534867787102555 0.436597840916853 ENSG00000169288:ENST00000315567:exon_78804396_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000515625:exon_78804396_78804652:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000511521:exon_78804396_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000502384:exon_78804393_78804654:MRPL1;ENSG00000169288:ENST00000506674:exon_78804403_78804654:MRPL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 79832509 A/C 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:C A C 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79831764_79833339:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79831764_79837526:BMP2K;ENSG00000163291:ENST00000511594:exon_79831992_79833217:PAQR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 79832706 C/G 1 12 13 25 5.58158655476934 6.95328123233322 -1.37169467756388 C:G C G 10 0.534867787102555 0.689506779269227 ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79831764_79833339:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79831764_79837526:BMP2K;ENSG00000163291:ENST00000511594:exon_79831992_79833217:PAQR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 27 14 41 12.558569748231 7.48814901943577 5.07042072879524 T:C T C 10 0.534867787102555 0.11980753059124 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 84370091 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84369936_84370114:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84369936_84370114:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84369936_84370114:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000514939:exon_84370064_84370114:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84370079_84370114:HELQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 24 12 36 11.1631731095387 6.41841344523066 4.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.133045425937367 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 90035549 A/G 1 25 14 39 11.6283053224361 7.48814901943577 4.14015630300035 A:G A G 10 0.534867787102555 0.201743249759012 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 95170839 G/A 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95170805_95170906:SMARCAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 28 17 45 13.0237019611285 9.09275238074344 3.93094958038502 A:G A G 10 0.534867787102555 0.295641477437011 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 18 14 32 8.37237983215401 7.48814901943577 0.88423081271824 A:G G A 10 0.534867787102555 0.859899586609749 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 103611845 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103611753_103611928:MANBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 106157539 C/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 110384652 A/G 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 A:G A G 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 37 20 57 17.2098918772055 10.6973557420511 6.51253613515436 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0860443892936678 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 421 335 756 195.820661629824 179.180708679356 16.6399529504684 A:T:C A T 10 0.534867787102555 0.229079813607171 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 110638810 C/T 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123739:ENST00000243501:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502283:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000507961:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502772:exon_110638704_110638869:PLA2G12A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 302 208 510 140.469928295028 111.252499717331 29.2174285776969 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00998472528261105 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113350384 C/T 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113350305_113350409:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113350305_113350409:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113350305_113350409:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113350305_113350409:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113350305_113350409:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 22 15 37 10.2329086837438 8.02301680653832 2.20989187720547 A:G G A 10 0.534867787102555 0.512648936021927 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 26 19 45 12.0934375353336 10.1624879549485 1.93094958038502 A:G A G 10 0.534867787102555 0.654567694556077 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 A:G G A 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 24 21 45 11.1631731095387 11.2322235291537 -0.0690504196149764 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 123268859 A/G 1 16 9 25 7.44211540635912 4.81381008392299 2.62830532243613 A:G A G 10 0.534867787102555 0.32219626972529 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123268677_123268934:KIAA1109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 19 26 45 8.83751204505145 13.9065624646664 -5.06905041961498 T:C T C 10 0.534867787102555 0.137295976208271 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 T:C C T 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 A:G G A 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 128842761 G/A 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:G G A 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000504126:exon_128842512_128842926:MFSD8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 31 22 53 14.4190985998208 11.7670913162562 2.65200728356459 T:C C T 10 0.534867787102555 0.493833680251161 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 41 31 72 19.0704207287952 16.5809014001792 2.48951932861604 A:G A G 10 0.534867787102555 0.636851256295767 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 26 13 39 12.0934375353336 6.95328123233322 5.14015630300035 A:C C A 10 0.534867787102555 0.109692215025922 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 14 19 33 6.51185098056423 10.1624879549485 -3.65063697438432 A:G A G 10 0.534867787102555 0.22440973942797 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 43 15 58 20.0006851545901 8.02301680653832 11.9776683480518 A:T A T 10 0.534867787102555 0.00147075689749491 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 744 1 745 346.058366395699 0.534867787102555 345.523498608597 A:G G A 10 0.534867787102555 4.31451514199566e-200 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 65 79 144 30.2335938383339 42.2545551811018 -12.0209613427679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0453196650605300 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 79 90 169 36.7454448188982 48.1381008392299 -11.3926560203318 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0895436280176388 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 146576418 G/C 1 11 17 28 5.1164543418719 9.09275238074344 -3.97629803887154 C:G G C 10 0.534867787102555 0.183820235173765 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146576299_146581187:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000511969:exon_146576299_146576720:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146576299_146576646:MMAA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 148605099 C/A 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 A:C C A 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000164169:ENST00000322396:exon_148604950_148605381:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000514886:exon_148604950_148605276:PRMT10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 16 21 37 7.44211540635912 11.2322235291537 -3.79010812279454 A:G A G 10 0.534867787102555 0.249243671719291 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 148984321 A/G 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:G A G 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148984299_148984451:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148984299_148984451:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148984299_148984451:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148984304_148984428:ARHGAP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 27 11 38 12.558569748231 5.8835456581281 6.67502409010291 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0340178667108358 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 151719263 A/G 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151719233_151719294:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151719233_151719294:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151719233_151719294:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151719233_151719294:LRBA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 152049296 G/A 1 10 2 12 4.65132212897445 1.06973557420511 3.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0440991500426111 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 T:C C T 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 T:C T C 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 1 10 11 0.465132212897445 5.34867787102555 -4.8835456581281 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0040341445028996 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 156721098 G/A 1 18 21 39 8.37237983215401 11.2322235291537 -2.85984369699965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.422874998565857 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 156721198 C/T 1 28 25 53 13.0237019611285 13.3716946775639 -0.347992716435416 A:T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 92 95 187 42.7921635865649 50.8124397747427 -8.02027618817779 T:C C T 10 0.534867787102555 0.24182939897034 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 16 15 31 7.44211540635912 8.02301680653832 -0.580901400179204 C:G G C 10 0.534867787102555 0.85880988898277 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 170077789 A/G 1 18 17 35 8.37237983215401 9.09275238074344 -0.720372548589426 A:G A G 10 0.534867787102555 0.866210037229802 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170077555_170077830:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170077555_170077808:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170077555_170077830:SH3RF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 178272700 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178272534_178272703:NEIL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 76 59 135 35.3500481802058 31.5571994390507 3.79284874115507 A:G A G 10 0.534867787102555 0.546379352513818 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 22 39 61 10.2329086837438 20.8598436969996 -10.6269350132559 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0068729798086062 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 184612553 G/C 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 C:G G C 10 0.534867787102555 0.782378955473899 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 184615117 A/C 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:C:G A C 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184615070_184615191:C4orf41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 94 86 180 43.7224280123598 45.9986296908197 -2.27620167845991 T:C C T 10 0.534867787102555 0.765225553004866 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 185622046 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 17 8 25 7.90724761925657 4.27894229682044 3.62830532243613 T:C C T 10 0.534867787102555 0.164147290224472 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 58 20 78 26.9776683480518 10.6973557420511 16.2803126060007 T:G T G 10 0.534867787102555 0.000231449122478402 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 44 28 72 20.4658173674876 14.9762980388715 5.48951932861604 T:C C T 10 0.534867787102555 0.237240343640878 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 84 98 182 39.0711058833854 52.4170431360504 -13.345937252665 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0531325445308918 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 206 161 367 95.8172358568737 86.1137137235114 9.70352213336231 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.320389720122678 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 427842 G/A 1 10 3 13 4.65132212897445 1.60460336130767 3.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.102479693301745 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 50 43 93 23.2566106448723 22.9993148454099 0.257295799462383 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 14 7 21 6.51185098056423 3.74407450971789 2.76777647084634 C:G G C 10 0.534867787102555 0.276708886024608 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 30 17 47 13.9539663869233 9.09275238074344 4.86121400617991 A:G G A 10 0.534867787102555 0.188047539093212 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 69 49 118 32.0941226899237 26.2085215680252 5.88560112189851 A:G G A 10 0.534867787102555 0.31019763767666 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 462465 C/A 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_462272_462644:EXOC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 466811 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 33 105 138 15.3493630256157 56.1611176457683 -40.8117546201526 A:G A G 10 0.534867787102555 1.98060303796886e-12 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 53 112 165 24.6520072835646 59.9051921554862 -35.2531848719216 A:C A C 10 0.534867787102555 4.59600835412320e-08 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 1076245 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000113504:ENST00000504576:exon_1076006_1076351:SLC12A7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 1466813 T/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 29 26 55 13.4888341740259 13.9065624646664 -0.417728290640525 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 27 24 51 12.558569748231 12.8368268904613 -0.278257142230306 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 46 31 77 21.3960817932825 16.5809014001792 4.81518039310327 A:G G A 10 0.534867787102555 0.304390217001576 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7866821 T/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 C:G G C 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7868030 T/C 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000504695:exon_7867463_7868220:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507572:exon_7867603_7868145:FASTKD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7878424 T/A 1 18 6 24 8.37237983215401 3.20920672261533 5.16317310953868 A:T:G T A 10 0.534867787102555 0.0402244391024662 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 20 5 25 9.3026442579489 2.67433893551277 6.62830532243613 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00834667728744288 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 14368975 C/T 1 27 25 52 12.558569748231 13.3716946775639 -0.81312492933286 T:C C T 10 0.534867787102555 0.88970995153227 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14368817_14369008:TRIO HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 25 25 50 11.6283053224361 13.3716946775639 -1.74338935512775 T:C T C 10 0.534867787102555 0.67165980504118 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 12 22 34 5.58158655476934 11.7670913162562 -6.18550476148687 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0387795939877815 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 84 76 160 39.0711058833854 40.6499518197942 -1.5788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.812509666012248 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 33998768 C/A 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:C C A 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 36171780 A/G 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000145604:ENST00000274254:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000274255:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000308927:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000509692:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000513151:exon_36171705_36171835:SKP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 37292071 C/T 1 15 18 33 6.97698319346167 9.62762016784599 -2.65063697438432 T:C C T 10 0.534867787102555 0.38622307733151 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37288239_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000508182:exon_37291735_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37291940_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37291941_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37291941_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37292002_37292140:NUP155 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 65 47 112 30.2335938383339 25.1387859938201 5.09480784451384 C:G G C 10 0.534867787102555 0.345156097062683 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 35 34 69 16.2796274514106 18.1855047614869 -1.9058773100763 C:G G C 10 0.534867787102555 0.717635739719066 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54572163 T/C 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000513447:exon_54572094_54572188:DHX29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C T C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54645411 G/A 1 10 11 21 4.65132212897445 5.8835456581281 -1.23222352915365 A:G G A 10 0.534867787102555 0.664437659323176 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54645401_54645480:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54645401_54645480:SKIV2L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54649079 T/C 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54648996_54649097:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54648996_54649097:SKIV2L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54960673 C/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 C:G C G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 54960687 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 56177743 G/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 56178217 A/C 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:C A C 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 56558570 C/T 1 159 120 279 73.9560218506938 64.1841344523066 9.77188739838716 T:C C T 10 0.534867787102555 0.254336121890547 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56558421_56558959:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56558421_56559408:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56558421_56559414:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56558421_56558909:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56558421_56558912:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56558421_56558912:GPBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 0 0 83 83 0 44.3940263295121 -44.3940263295121 A G A 10 0.534867787102555 2.56355521031803e-28 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 31 27 58 14.4190985998208 14.441430251769 -0.0223316519481891 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 18 13 31 8.37237983215401 6.95328123233322 1.41909859982079 T:C T C 10 0.534867787102555 0.719657099436856 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 65350173 C/T 1 86 83 169 40.0013703091803 44.3940263295121 -4.3926560203318 T:C C T 10 0.534867787102555 0.537459944786811 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 65350466 A/G 1 90 56 146 41.8618991607701 29.9525960777431 11.909303083027 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0560193478461256 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511671:exon_65350461_65350779:ERBB2IP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 65465971 G/A 1 82 65 147 38.1408414575905 34.7664061616661 3.37443529592441 A:G G A 10 0.534867787102555 0.620104503017238 ENSG00000153914:ENST00000334121:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000522912:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000520953:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000524111:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000380918:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000284041:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000520580:exon_65465879_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000519259:exon_65459411_65465998:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000523655:exon_65465879_65465998:SREK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 15 4 19 6.97698319346167 2.13947114841022 4.83751204505145 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0360007359864548 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 C:G G C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 35 31 66 16.2796274514106 16.5809014001792 -0.301273948768628 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 68616331 C/T 1 14 18 32 6.51185098056423 9.62762016784599 -3.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.291464382713898 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000460090:exon_68616292_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68616292_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 70751781 A/G 1 16 7 23 7.44211540635912 3.74407450971789 3.69804089664123 A:G A G 10 0.534867787102555 0.145219966191261 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70751442_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70751513_70751916:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70751616_70751916:BDP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 71491801 C/T 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000131711:ENST00000296755:exon_71489693_71496194:MAP1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 51 43 94 23.7217428577697 22.9993148454099 0.722428012359828 T:C C T 10 0.534867787102555 0.91789187795228 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 22 31 53 10.2329086837438 16.5809014001792 -6.34799271643541 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0978139501966362 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 72874801 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 74869661 C/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:C C A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514296:exon_74869563_74869662:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74869563_74869694:POLK;ENSG00000122008:ENST00000507073:exon_74869563_74869694:POLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 74872745 C/T 1 28 14 42 13.0237019611285 7.48814901943577 5.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.090984219274235 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74872605_74872758:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74872605_74872758:POLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 74892352 A/G 1 32 26 58 14.8842308127182 13.9065624646664 0.977668348051809 A:G A G 10 0.534867787102555 0.895438925505447 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74892047_74893003:POLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 74970236 G/A 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74969949_74970403:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74970015_74970403:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74970033_74970403:POC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 75001582 A/G 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 75932913 A/G 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 C:G G C 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 T:C C T 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 16 25 41 7.44211540635912 13.3716946775639 -5.92957927120476 A:G A G 10 0.534867787102555 0.083852340508913 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 77805733 T/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77805607_77806209:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77805607_77806221:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77805607_77806221:LHFPL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 12 7 19 5.58158655476934 3.74407450971789 1.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.49300969037024 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 82373183 G/C 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 C:G G C 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000174695:ENST00000502346:exon_82373140_82373315:TMEM167A;ENSG00000174695:ENST00000511450:exon_82373140_82373186:TMEM167A;ENSG00000174695:ENST00000308489:exon_82373140_82373232:TMEM167A;ENSG00000174695:ENST00000504622:exon_82373140_82373272:TMEM167A;ENSG00000174695:ENST00000509770:exon_82373140_82373243:TMEM167A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 41 29 70 19.0704207287952 15.5111658259741 3.55925490282115 C:G C G 10 0.534867787102555 0.404737950456254 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 22 27 49 10.2329086837438 14.441430251769 -4.20852156802519 T:C T C 10 0.534867787102555 0.253119736626014 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 94860194 G/C 1 10 21 31 4.65132212897445 11.2322235291537 -6.58090140017921 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0193568230470193 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94860169_94860295:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000513232:exon_94860169_94860295:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94860169_94860295:TTC37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 94865856 C/T 1 15 23 38 6.97698319346167 12.3019591033588 -5.32497590989709 T:C C T 10 0.534867787102555 0.103178696618192 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94865793_94865933:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94865793_94865933:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000503279:exon_94865793_94865933:TTC37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 38 11 49 17.6750240901029 5.8835456581281 11.7914784319748 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000801307755087108 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 38 10 48 17.6750240901029 5.34867787102555 12.3263462190774 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000391122871762594 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 30 7 37 13.9539663869233 3.74407450971789 10.2098918772055 A:C A C 10 0.534867787102555 0.000748305129044905 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 28 12 40 13.0237019611285 6.41841344523066 6.6052885158978 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0394361210347616 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 25 8 33 11.6283053224361 4.27894229682044 7.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0133654508723130 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 0 57 0 57 26.5125361351544 0 26.5125361351544 G G 10 0.534867787102555 5.68936651341963e-16 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 96130836 T/C 1 7 25 32 3.25592549028211 13.3716946775639 -10.1157691872818 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000515817409853393 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96130745_96130865:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96130745_96130865:ERAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 96139464 C/T 1 64 45 109 29.7684616254365 24.069050419615 5.69941120582151 T:C C T 10 0.534867787102555 0.291763788501968 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 59 41 100 27.4428005609493 21.9295792712048 5.5132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.316126007585786 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 89 60 149 41.3967669478726 32.0920672261533 9.30469972171931 T:C T C 10 0.534867787102555 0.139306779611086 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 28 29 57 13.0237019611285 15.5111658259741 -2.48746386484564 A:G G A 10 0.534867787102555 0.510563120831932 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 16 8 24 7.44211540635912 4.27894229682044 3.16317310953868 C:G C G 10 0.534867787102555 0.223630477495032 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 110461426 T/C 1 33 28 61 15.3493630256157 14.9762980388715 0.373064986744144 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110461306_110461493:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110461306_110461493:WDR36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112175770 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112176325 G/A 1 11 11 22 5.1164543418719 5.8835456581281 -0.767091316256209 A:G G A 10 0.534867787102555 0.831969512247843 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112176559 T/G 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112176756 T/A 1 8 12 20 3.72105770317956 6.41841344523066 -2.6973557420511 A:T T A 10 0.534867787102555 0.265723552483775 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 17 24 41 7.90724761925657 12.8368268904613 -4.92957927120476 T:C T C 10 0.534867787102555 0.158061657600612 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112321556 C/T 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112321532_112321683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112321532_112321683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000510046:exon_112321532_112321707:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000502635:exon_112321529_112321683:DCP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112917278 T/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 T:G T G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112916963_112920176:YTHDC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 112926755 G/A 1 24 26 50 11.1631731095387 13.9065624646664 -2.74338935512775 A:G G A 10 0.534867787102555 0.479702630205434 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112926738_112926941:YTHDC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 114860161 G/A 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000145780:ENST00000274457:exon_114856608_114861314:FEM1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 T:G G T 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 T:C C T 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 115822585 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503402:exon_115822445_115822925:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510024:exon_115822337_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000502996:exon_115822445_115822662:SEMA6A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 118484804 G/A 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.806945941972106 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118484434_118486116:DMXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 118506603 A/C 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 A:C A C 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 118506685 G/A 1 12 10 22 5.58158655476934 5.34867787102555 0.23290868374379 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 118506805 A/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 A:T A T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 17 13 30 7.90724761925657 6.95328123233322 0.95396638692335 A:G A G 10 0.534867787102555 0.855241169984464 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 122685679 G/A 1 23 11 34 10.6980408966412 5.8835456581281 4.81449523851313 A:G G A 10 0.534867787102555 0.121336627273295 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 123983915 G/T 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 38 29 67 17.6750240901029 15.5111658259741 2.16385826412881 A:G G A 10 0.534867787102555 0.625950975924369 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 16 23 39 7.44211540635912 12.3019591033588 -4.85984369699965 T:C T C 10 0.534867787102555 0.147945765478062 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131602166 T/C 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000463615:exon_131602157_131602454:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000418373:exon_131602157_131602238:PDLIM4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131607080 A/G 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.127818607776150 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131606996_131607159:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131607494 C/T 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607484_131607601:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131607484_131607526:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131819798 T/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131819800 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131819977 C/T 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.15772121036402 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131821866 T/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:G T G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 47 47 94 21.8612140061799 25.1387859938201 -3.27757198764017 T:C T C 10 0.534867787102555 0.535558944164887 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 131822224 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 135489435 G/A 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.796302648602911 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 A:G G A 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 137735695 C/T 1 33 20 53 15.3493630256157 10.6973557420511 4.65200728356458 T:C C T 10 0.534867787102555 0.217181125063433 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137735549_137735701:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137735549_137735701:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137735549_137735701:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137735549_137735701:KDM3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 122 76 198 56.7461299734883 40.6499518197942 16.0961781536941 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0225809725911157 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 25 14 39 11.6283053224361 7.48814901943577 4.14015630300035 T:C C T 10 0.534867787102555 0.201743249759012 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 19 11 30 8.83751204505145 5.8835456581281 2.95396638692335 C:G C G 10 0.534867787102555 0.360554133907767 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 C:G C G 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 133 132 265 61.8625843153602 70.6025478975373 -8.73996358217708 A:G G A 10 0.534867787102555 0.295358307745032 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 29 24 53 13.4888341740259 12.8368268904613 0.652007283564584 A:G G A 10 0.534867787102555 0.891245156874754 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 142779601 G/A 1 83 68 151 38.6059736704879 36.3710095229737 2.23496414751419 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.744602181374049 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000415690:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000416954:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142779221_142780417:NR3C1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 55 64 119 25.5822717093595 34.2315383745635 -8.64926666520405 T:C C T 10 0.534867787102555 0.118602877127479 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 41 42 83 19.0704207287952 22.4644470583073 -3.39402632951207 A:G A G 10 0.534867787102555 0.509427397908752 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 42 62 104 19.5355529416927 33.1618028003584 -13.6262498586657 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00786146663379445 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 48 50 98 22.3263462190774 26.7433893551277 -4.41704313605039 A:G G A 10 0.534867787102555 0.418048594190534 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 26 17 43 12.0934375353336 9.09275238074344 3.00068515459013 T:G T G 10 0.534867787102555 0.445050822509516 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 147778631 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:C:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000503613:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000508326:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000509411:exon_147778562_147779100:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000521160:exon_147778578_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000509699:exon_147778562_147778695:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000502629:exon_147778560_147778695:FBXO38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 49 58 107 22.7914784319748 31.0223316519482 -8.23085321997338 T:C C T 10 0.534867787102555 0.121075743452350 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3977 3806 7783 1849.83081069314 2035.70679771232 -185.875987019185 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 2.48385579601441e-05 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 46 29 75 21.3960817932825 15.5111658259741 5.88491596730838 A:G G A 10 0.534867787102555 0.202813101170452 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 150097883 G/C 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000518909:exon_150097838_150097945:DCTN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 150483095 A/G 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 A:G A G 10 0.534867787102555 0.128640050678942 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 51 73 124 23.7217428577697 39.0453484584865 -15.3236056007168 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00672669756984539 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 148 144 292 68.8395675088219 77.0209613427679 -8.18139383394606 T:C T C 10 0.534867787102555 0.348229099326651 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 35 33 68 16.2796274514106 17.6506369743843 -1.37100952297374 C:G G C 10 0.534867787102555 0.80817328482364 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 153406820 A/G 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153406784_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153406736_153406894:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518735:exon_153406736_153406941:FAM114A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 157164889 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 T:C T C 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 157240229 T/C 1 22 22 44 10.2329086837438 11.7670913162562 -1.53418263251242 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.653525861955733 ENSG00000113282:ENST00000523094:exon_157240071_157240235:CLINT1;ENSG00000113282:ENST00000530742:exon_157240071_157240235:CLINT1;ENSG00000113282:ENST00000411809:exon_157240071_157240235:CLINT1;ENSG00000113282:ENST00000452585:exon_157240071_157240235:CLINT1;ENSG00000113282:ENST00000296951:exon_157240071_157240235:CLINT1;ENSG00000113282:ENST00000523908:exon_157240071_157240235:CLINT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 17 16 33 7.90724761925657 8.55788459364088 -0.650636974384315 T:C T C 10 0.534867787102555 0.862618803515972 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 60 61 121 27.9079327738467 32.6269350132559 -4.71900223940915 A:G G A 10 0.534867787102555 0.412714927148658 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 T:C C T 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 49 67 116 22.7914784319748 35.8361417358712 -13.0446633038964 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0155873119634028 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 26 50 76 12.0934375353336 26.7433893551277 -14.6499518197942 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000792984003625076 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 T:G G T 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 53 57 110 24.6520072835646 30.4874638648456 -5.83545658128105 A:C C A 10 0.534867787102555 0.293224965668763 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 56 53 109 26.0474039222569 28.3479927164354 -2.30058879417849 A:C A C 10 0.534867787102555 0.701257793162757 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 60 58 118 27.9079327738467 31.0223316519482 -3.11439887810149 C:G C G 10 0.534867787102555 0.580777567933041 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 89 96 185 41.3967669478726 51.3473075618453 -9.95054061397268 T:C C T 10 0.534867787102555 0.161239051489875 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 169810796 C/T 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169810683_169810854:KCNMB1;ENSG00000145936:ENST00000521859:exon_169809656_169810854:KCNMB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 82 84 166 38.1408414575905 44.9288941166146 -6.78805265902413 A:G A G 10 0.534867787102555 0.311996633462778 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 124 138 262 57.6763943992832 73.8117546201526 -16.1353602208694 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0475336868672601 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 172396450 G/A 1 19 64 83 8.83751204505145 34.2315383745635 -25.3940263295121 A:G G A 10 0.534867787102555 1.54136847565813e-08 ENSG00000037241:ENST00000519974:exon_172396416_172396719:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000521476:exon_172396416_172396724:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000265100:exon_172396416_172396774:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519239:exon_172396416_172396721:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519156:exon_172396416_172396490:RPL26L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 172750436 G/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 173316729 G/A 1 7 28 35 3.25592549028211 14.9762980388715 -11.7203725485894 A:G G A 10 0.534867787102555 6.26001878144745e-05 ENSG00000113742:ENST00000265085:exon_173315283_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000326629:exon_173315331_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000520867:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000334035:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000519835:exon_173316534_173317861:CPEB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 64 55 119 29.7684616254365 29.4177282906405 0.350733334795954 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 175956516 G/A 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G G A 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000146083:ENST00000508478:exon_175956489_175956645:RNF44 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 175958648 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 T:G G T 10 0.534867787102555 0.18250118711251 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 53 39 92 24.6520072835646 20.8598436969996 3.79216358656494 A:G G A 10 0.534867787102555 0.465153988041292 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 26 16 42 12.0934375353336 8.55788459364088 3.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.284163795398839 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G G A 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 T:G G T 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 17 11 28 7.90724761925657 5.8835456581281 2.02370196112846 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.570626722334187 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 39 33 72 18.1401563030004 17.6506369743843 0.489519328616041 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 244 193 437 113.492259946977 103.229482910793 10.2627770361835 A:G A G 10 0.534867787102555 0.337683601511899 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 399 380 779 185.587752946081 203.249759098971 -17.6620061528904 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.208821897106218 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176737720 A/G 1 13 20 33 6.04671876766678 10.6973557420511 -4.65063697438432 A:G A G 10 0.534867787102555 0.117556598186340 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176737427_176738485:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176737427_176738485:MXD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 92 103 195 42.7921635865649 55.0913820715632 -12.2992184849982 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.0847748767262756 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 177022428 C/T 1 252 252 504 117.213317650156 134.786682349844 -17.5733646996877 T:C C T 10 0.534867787102555 0.118262521361698 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177022268_177023125:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177022268_177022578:TMED9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 19 32 51 8.83751204505145 17.1157691872818 -8.27825714223031 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0240822940237414 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 3028 7 3035 1408.42034065346 3.74407450971789 1404.67626614375 T:C:G T C 10 0.534867787102555 4.94065645841247e-324 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.438858491316679 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 20 28 48 9.3026442579489 14.9762980388715 -5.67365378092264 T:C C T 10 0.534867787102555 0.112059282315814 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 178293253 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178293245_178293371:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000520377:exon_178293245_178293371:ZNF354B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 178294059 T/C 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178293977_178294072:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000520377:exon_178293977_178294072:ZNF354B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 15 17 32 6.97698319346167 9.09275238074344 -2.11576918728176 T:C C T 10 0.534867787102555 0.482440833418438 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179036357 G/A 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:G G A 10 0.534867787102555 0.517317017227099 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 19 27 46 8.83751204505145 14.441430251769 -5.60391820671753 A:G G A 10 0.534867787102555 0.105276451707417 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179250900 A/G 1 302 316 618 140.469928295028 169.018220724407 -28.548292429379 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0215560389411740 ENSG00000161011:ENST00000514093:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000422245:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000481335:exon_179250858_179250968:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000464493:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000508284:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000453046:exon_179250858_179250939:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000504627:exon_179250858_179251057:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179250858_179251040:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179250858_179250907:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179250858_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000485412:exon_179250565_179251087:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179250858_179251087:SQSTM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179260009 G/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 303 232 535 140.935060507926 124.089326607793 16.8457339001331 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.152634459170299 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 335 303 638 155.819291320644 162.064939492074 -6.24564817143008 A:G G A 10 0.534867787102555 0.633986705306964 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 67 101 168 31.1638582641288 54.0216464973581 -22.8577882332292 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000469812574610706 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 34 55 89 15.8144952385131 29.4177282906405 -13.6032330521274 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00403872773104786 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 33 34 67 15.3493630256157 18.1855047614869 -2.83614173587119 T:C T C 10 0.534867787102555 0.540842924375666 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179280379 T/C 1 10 13 23 4.65132212897445 6.95328123233322 -2.30195910335877 T:C T C 10 0.534867787102555 0.404857079120053 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179280197_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523835:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519213:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519318:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000517338:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519398:exon_179280283_179280437:C5orf45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 167 121 288 77.6770795538733 64.7190022394091 12.9580773144642 T:G T G 10 0.534867787102555 0.1396160151874 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 121 121 242 56.2809977605908 64.7190022394091 -8.43800447881831 T:C C T 10 0.534867787102555 0.302520000521164 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180486785 G/C 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 77 71 148 35.8151803931033 37.9756128842814 -2.16043249117814 T:C C T 10 0.534867787102555 0.742140259824801 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180669370 A/G 1 3 13 16 1.39539663869233 6.95328123233322 -5.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0096828402624409 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180686958 C/T 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 19 22 41 8.83751204505145 11.7670913162562 -2.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.434173854704632 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 263 127 390 122.329771992028 67.9282089620245 54.4015630300035 A:G G A 10 0.534867787102555 2.59273608103605e-08 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:G A G 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 21 36 57 9.76777647084634 19.255240335692 -9.48746386484564 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0160850085772117 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 69 72 141 32.0941226899237 38.510480671384 -6.41635798146025 A:C:G A C 10 0.534867787102555 0.311050762451606 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 7229346 T/C 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7229230_7230666:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7229230_7229883:RREB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 7229619 G/A 1 13 5 18 6.04671876766678 2.67433893551277 3.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 0.155287650432156 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7229230_7230666:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7229230_7229883:RREB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 15 6 21 6.97698319346167 3.20920672261533 3.76777647084634 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.125795308975927 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 7247344 C/A 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:C C A 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 12120445 A/G 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000095951:ENST00000487103:exon_12120123_12120455:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 T:C C T 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 12122174 A/G 1 27 10 37 12.558569748231 5.34867787102555 7.20989187720547 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.0202397692894009 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 14 18 32 6.51185098056423 9.62762016784599 -3.11576918728176 A:G G A 10 0.534867787102555 0.291464382713898 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 13305408 G/C 1 52 38 90 24.1868750706671 20.3249759098971 3.86189916077005 C:G G C 10 0.534867787102555 0.459966922798015 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13305183_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13305183_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13305186_13305419:TBC1D7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 A:G A G 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 44 46 90 20.4658173674876 24.6039182067175 -4.13810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.399225377788537 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 15468876 C/G 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15468773_15468949:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15468773_15468949:JARID2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 15663118 T/C 1 14 35 49 6.51185098056423 18.7203725485894 -12.2085215680252 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00049852292954585 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15663045_15663273:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15663045_15663238:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15663045_15663261:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15663045_15663289:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15663045_15663251:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15663045_15663206:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15663045_15663151:DTNBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:G G A 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 16327615 A/G 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 59 56 115 27.4428005609493 29.9525960777431 -2.50979551679383 A:G G A 10 0.534867787102555 0.641623967984844 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 24 13 37 11.1631731095387 6.95328123233322 4.20989187720546 C:G G C 10 0.534867787102555 0.188873664543726 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 46 59 105 21.3960817932825 31.5571994390507 -10.1611176457683 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0504115831204685 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 24503590 C/T 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C C T 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000112294:ENST00000357578:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000491546:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000348925:exon_24503491_24503661:ALDH5A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 54 58 112 25.117139496462 31.0223316519482 -5.90519215548616 A:G G A 10 0.534867787102555 0.297450287996692 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 25600602 A/G 1 16 3 19 7.44211540635912 1.60460336130767 5.83751204505145 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00948879546962881 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26056153 C/A 1 228 159 387 106.050144540617 85.0439781493062 21.0061663913112 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0324078893264343 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26091336 T/C 1 9 1 10 4.18618991607701 0.534867787102555 3.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0245053429743222 ENSG00000010704:ENST00000483782:exon_26091069_26091817:HFE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26184041 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26285503 C/T 1 13 11 24 6.04671876766678 5.8835456581281 0.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370572 C/T 1 57 3 60 26.5125361351544 1.60460336130767 24.9079327738467 T:C C T 10 0.534867787102555 1.31816704201791e-12 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000530653:exon_26370550_26370588:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 0 55 0 55 25.5822717093595 0 25.5822717093595 T T 10 0.534867787102555 2.18745071520046e-15 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370616 G/C 0 55 0 55 25.5822717093595 0 25.5822717093595 G G 10 0.534867787102555 2.18745071520046e-15 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370657 A/G 0 32 0 32 14.8842308127182 0 14.8842308127182 A A 10 0.534867787102555 2.88397982428033e-09 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370659 C/T 0 31 0 31 14.4190985998208 0 14.4190985998208 C C 10 0.534867787102555 5.57907834745611e-09 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 25 1 26 11.6283053224361 0.534867787102555 11.0934375353336 T:C T C 10 0.534867787102555 3.07805176300289e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26373150 C/T 1 42 2 44 19.5355529416927 1.06973557420511 18.4658173674876 T:C C T 10 0.534867787102555 1.44433583897981e-09 ENSG00000186470:ENST00000527417:exon_26373125_26373170:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532627:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26373125_26373315:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373116_26373325:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26373678 G/A 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373504_26373834:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373615_26373816:BTN3A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 109 84 193 50.6994112058215 44.9288941166146 5.77051708920688 A:G G A 10 0.534867787102555 0.427741407659670 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 257 285 542 119.538978714643 152.437319324228 -32.8983406095848 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.00508630026961228 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 70 58 128 32.5592549028212 31.0223316519482 1.53692325087296 A:G A G 10 0.534867787102555 0.79129549142198 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 97 72 169 45.1178246510522 38.510480671384 6.60734397966821 A:G A G 10 0.534867787102555 0.317120321980919 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 27420588 G/A 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000096654:ENST00000211936:exon_27418522_27421039:ZNF184;ENSG00000096654:ENST00000377419:exon_27418599_27421039:ZNF184 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 28264717 C/T 1 6 4 10 2.79079327738467 2.13947114841022 0.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.759832164427984 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 28333396 T/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000189298:ENST00000252211:exon_28333203_28334523:ZKSCAN3;ENSG00000189298:ENST00000454413:exon_28333203_28333706:ZKSCAN3;ENSG00000189298:ENST00000377255:exon_28333203_28334504:ZKSCAN3;ENSG00000189298:ENST00000341464:exon_28333391_28333800:ZKSCAN3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 14 4 18 6.51185098056423 2.13947114841022 4.37237983215401 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0560178997489729 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 46 21 67 21.3960817932825 11.2322235291537 10.1638582641288 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0139591594229539 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 39 19 58 18.1401563030004 10.1624879549485 7.97766834805181 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0473822368097402 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 22 36 58 10.2329086837438 19.255240335692 -9.02233165194819 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0243835303422093 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 23 17 40 10.6980408966412 9.09275238074344 1.6052885158978 A:G A G 10 0.534867787102555 0.638038577575428 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29576393 A/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G A G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377042:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000472823:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376977:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377016:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000485026:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377012:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377034:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000491829:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000457175:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376952:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000494877:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000473774:exon_29576378_29576510:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000489839:exon_29576231_29576510:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29581041 A/G 1 12 1 13 5.58158655476934 0.534867787102555 5.04671876766678 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00436890327669135 ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377042:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000472823:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376977:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377016:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377012:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377034:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000491829:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000457175:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376952:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000494877:exon_29581020_29581262:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29581110 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377042:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000472823:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376977:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377016:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377012:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377034:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000491829:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000457175:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376952:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000494877:exon_29581020_29581262:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29581113 A/G 1 9 7 16 4.18618991607701 3.74407450971789 0.44211540635912 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377042:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000472823:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376977:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377016:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377012:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000377034:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000491829:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000457175:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000376952:exon_29581020_29581262:GABBR1;ENSG00000204681:ENST00000494877:exon_29581020_29581262:GABBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 60 61 121 27.9079327738467 32.6269350132559 -4.71900223940915 T:C C T 10 0.534867787102555 0.412714927148658 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 31 17 48 14.4190985998208 9.09275238074344 5.32634621907736 T:C C T 10 0.534867787102555 0.147725523030221 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 48 19 67 22.3263462190774 10.1624879549485 12.1638582641288 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00305675718466778 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 168 53 221 78.1422117667708 28.3479927164354 49.7942190503353 A:G G A 10 0.534867787102555 6.70105598742845e-12 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 1 69 2 71 32.0941226899237 1.06973557420511 31.0243871157186 T:C C T 10 0.534867787102555 1.68489517218062e-16 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 29 13 42 13.4888341740259 6.95328123233322 6.53555294169269 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0451404167329929 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 62 45 107 28.8381971996416 24.069050419615 4.76914678002662 A:G A G 10 0.534867787102555 0.383780925916032 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 38 131 169 17.6750240901029 70.0676801104347 -52.3926560203318 A:G A G 10 0.534867787102555 2.21603179969527e-16 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 264 0 264 122.794904204925 0 122.794904204925 A A 10 0.534867787102555 2.09464914531022e-72 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 1 204 205 0.465132212897445 109.113028568921 -108.647896356024 C:G G C 10 0.534867787102555 1.68821569420434e-66 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 64 91 155 29.7684616254365 48.6729686263325 -18.904507000896 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00278027391227828 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 63 62 125 29.303329412539 33.1618028003584 -3.85847338781937 A:C C A 10 0.534867787102555 0.530493221462027 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 59 52 111 27.4428005609493 27.8131249293329 -0.370324368383606 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 56 54 110 26.0474039222569 28.882860503538 -2.83545658128105 T:C C T 10 0.534867787102555 0.633030075986924 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30308326 A/G 1 7 10 17 3.25592549028211 5.34867787102555 -2.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.33925294722777 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30308282_30308397:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30308282_30308397:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 1119 1196 2315 520.482946232241 639.701873374656 -119.218927142415 A:G G A 10 0.534867787102555 7.7340241526205e-07 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30632765 G/A 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 A:G G A 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30632578_30632769:DHX16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30640609 G/C 1 24 14 38 11.1631731095387 7.48814901943577 3.67502409010291 C:G G C 10 0.534867787102555 0.257674712380607 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30640412_30640814:DHX16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30671344 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30858833 C/T 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 T C T 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000204580:ENST00000460944:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000512694:exon_30858750_30858842:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000428153:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000515219:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000421124:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000503495:exon_30858750_30858843:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000431373:exon_30858750_30859111:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000424544:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508472:exon_30858750_30858897:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000507533:exon_30858537_30858897:DDR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 26 10 36 12.0934375353336 5.34867787102555 6.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0289176443554653 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:C A C 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 20 21 41 9.3026442579489 11.2322235291537 -1.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.639159703203119 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 41 44 85 19.0704207287952 23.5341826325124 -4.46376190371717 T:C T C 10 0.534867787102555 0.384500127005205 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 12 29 41 5.58158655476934 15.5111658259741 -9.92957927120476 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00250237645545863 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 84 46 130 39.0711058833854 24.6039182067175 14.4671876766678 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0107962228003775 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 46 68 114 21.3960817932825 36.3710095229737 -14.9749277296913 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00622695038971108 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 46 48 94 21.3960817932825 25.6736537809226 -4.27757198764017 T:C C T 10 0.534867787102555 0.408660814058232 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 20 20 40 9.3026442579489 10.6973557420511 -1.3947114841022 A:G G A 10 0.534867787102555 0.75176281881351 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 15 22 37 6.97698319346167 11.7670913162562 -4.79010812279453 A:G G A 10 0.534867787102555 0.137804477163093 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 48 23 71 22.3263462190774 12.3019591033588 10.0243871157186 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0173487897009716 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 44 48 92 20.4658173674876 25.6736537809226 -5.20783641343506 A:T A T 10 0.534867787102555 0.296690945128699 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 41 38 79 19.0704207287952 20.3249759098971 -1.25455518110185 C:G G C 10 0.534867787102555 0.821910452411794 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 56 35 91 26.0474039222569 18.7203725485894 7.3270313736675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.141104741428771 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31125257 C/A 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:C C A 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31125162_31125566:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31125162_31125566:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31125162_31125566:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31125162_31125566:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31125162_31125384:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31125162_31125277:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31125162_31125277:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31125135_31125565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31125135_31125277:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31125162_31125277:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31125162_31125549:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31125135_31125277:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 43 44 87 20.0006851545901 23.5341826325124 -3.53349747792229 T:C C T 10 0.534867787102555 0.454042228201068 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31133870 G/A 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000204531:ENST00000441888:exon_31133704_31134027:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000513407:exon_31133348_31134947:POU5F1;ENSG00000204531:ENST00000471529:exon_31133704_31134615:POU5F1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31170514 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31170528 A/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1158 806 1964 538.623102535241 431.103436404659 107.519666130582 T:C T C 10 0.534867787102555 1.12919367612523e-06 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 1293 45 1338 601.415951276396 24.069050419615 577.346900856781 A:T:C:G C G 10 0.534867787102555 1.53070916458180e-282 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31237275 G/A 1 172 1169 1341 80.0027406183605 625.260443122887 -545.257702504526 A:C:G G A 10 0.534867787102555 2.67527821849973e-214 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237270_31237320:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237270_31237302:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 40 0 40 18.6052885158978 0 18.6052885158978 T T 10 0.534867787102555 1.58572792190599e-11 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31237766 A/T 1 5 1435 1440 2.32566106448723 767.535274492166 -765.209613427679 A:T A T 10 0.534867787102555 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237743_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237743_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237714_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237743_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237743_31237862:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 190 17 207 88.3751204505145 9.09275238074344 79.2823680697711 T:C C T 10 0.534867787102555 2.35485862535382e-33 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 9 108 117 4.18618991607701 57.7657210070759 -53.5795310909989 C:G C G 10 0.534867787102555 4.27694119440228e-26 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 95 1 96 44.1875602252573 0.534867787102555 43.6526924381547 T:G G T 10 0.534867787102555 7.630925502281e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 96 1 97 44.6526924381547 0.534867787102555 44.1178246510522 T:C C T 10 0.534867787102555 4.08266437554227e-25 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 83 0 83 38.6059736704879 0 38.6059736704879 G G 10 0.534867787102555 2.90045508589504e-23 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 47 13 60 21.8612140061799 6.95328123233322 14.9079327738467 T:C C T 10 0.534867787102555 8.20336641833532e-05 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 154 17 171 71.6303607862065 9.09275238074344 62.5376084054631 T:C T C 10 0.534867787102555 6.51204909663224e-25 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 3063 826 3889 1424.69996810487 441.80079214671 982.899175958164 A:T:C:G C T 10 0.534867787102555 9.57988590681676e-236 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31323321 G/A 1 1502 581 2083 698.628583771962 310.758184306584 387.870399465378 A:T:G G A 10 0.534867787102555 9.87715835869345e-68 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 996 105 1101 463.271684045855 56.1611176457683 407.110566400087 A:G G A 10 0.534867787102555 5.0740681693701e-157 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31431508 G/A 1 156 82 238 72.5606252120014 43.8591585424095 28.7014666695919 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000199411751134631 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31431539 T/C 1 149 90 239 69.3046997217193 48.1381008392299 21.1665988824894 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00637686217181392 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31431636 T/A 1 143 95 238 66.5139064443346 50.8124397747427 15.7014666695919 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0438916013912017 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 119 103 222 55.350733334796 55.0913820715632 0.259351263232787 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 102 117 219 47.4434857155394 62.5795310909989 -15.1360453754595 T:C C T 10 0.534867787102555 0.042158435202216 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31503118 G/A 1 94 90 184 43.7224280123598 48.1381008392299 -4.41567282687012 A:G G A 10 0.534867787102555 0.554508368833595 ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 24 19 43 11.1631731095387 10.1624879549485 1.00068515459013 T:C C T 10 0.534867787102555 0.87873815611304 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 12 8 20 5.58158655476934 4.27894229682044 1.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.656756142259415 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 58 70 128 26.9776683480518 37.4407450971788 -10.463076749127 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0759712074696676 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 292 268 560 135.818606166054 143.344566943485 -7.52596077743081 A:G A G 10 0.534867787102555 0.525487546345459 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 216 185 401 100.468557985848 98.9505406139727 1.51801737187544 T:C C T 10 0.534867787102555 0.920266073629362 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 20 14 34 9.3026442579489 7.48814901943577 1.81449523851313 T:C T C 10 0.534867787102555 0.607689123408875 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 42 38 80 19.5355529416927 20.3249759098971 -0.789422968204402 C:G C G 10 0.534867787102555 0.910922364415701 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 43 49 92 20.0006851545901 26.2085215680252 -6.20783641343506 A:C:G C A 10 0.534867787102555 0.210303972762181 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 167 179 346 77.6770795538733 95.7413338913573 -18.064254337484 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.0524802959001712 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 62 67 129 28.8381971996416 35.8361417358712 -6.9979445362296 T:C C T 10 0.534867787102555 0.218112951285454 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 24 29 53 11.1631731095387 15.5111658259741 -4.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.270799113477227 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31660907 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477462:exon_31660804_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000482224:exon_31660529_31660926:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468037:exon_31660671_31660926:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31660804_31660926:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31710968 T/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:T T A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000204410:ENST00000463094:exon_31710885_31711257:MSH5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 76 79 155 35.3500481802058 42.2545551811018 -6.90450700089603 T:C C T 10 0.534867787102555 0.295227347366380 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31805210 A/G 1 446 510 956 207.44896695226 272.782571422303 -65.3336044700426 A:G A G 10 0.534867787102555 2.44340552031449e-05 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31805013_31805212:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31804620_31805212:C6orf48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 111 74 185 51.6296756316164 39.5802162455891 12.0494593860273 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0772849708535047 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31856212 C/T 1 43 35 78 20.0006851545901 18.7203725485894 1.28031260600071 T:C C T 10 0.534867787102555 0.820887132622205 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31856140_31856283:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31856140_31856283:EHMT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31868075 G/C 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 C:G G C 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31928306 A/G 1 26 22 48 12.0934375353336 11.7670913162562 0.32634621907736 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000488648:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31928209_31928323:SKIV2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 72 53 125 33.489519328616 28.3479927164354 5.14152661218063 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.371118376354171 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 34 26 60 15.8144952385131 13.9065624646664 1.9079327738467 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.698326466975926 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 30 38 68 13.9539663869233 20.3249759098971 -6.37100952297374 T:C T C 10 0.534867787102555 0.144232080769782 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 T:C C T 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32122472 C/A 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 A:C C A 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000221988:ENST00000414204:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361568:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000478521:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000395523:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000324816:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000437001:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375137:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375143:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000424499:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000493548:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000436118:exon_32122243_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000453656:exon_32122255_32122554:PPT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32134510 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000421600:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000502898:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000509239:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361782:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000448406:exon_32134478_32134587:PPT2;ENSG00000241404:ENST00000333845:exon_32134478_32134587:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000395512:exon_32134478_32134587:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000432129:exon_32134478_32134587:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000466239:exon_32134478_32134587:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000482938:exon_32134478_32134587:EGFL8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32154998 C/T 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32154750_32155172:PBX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 217 257 474 100.933690198746 137.461021285357 -36.5273310866111 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000897012203735629 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32163541 A/C 1 15 17 32 6.97698319346167 9.09275238074344 -2.11576918728176 A:C A C 10 0.534867787102555 0.482440833418438 ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32605234 G/A 0 744 1 745 346.058366395699 0.534867787102555 345.523498608597 T:C:G G T 10 0.534867787102555 4.31451514199566e-200 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 1983 1 1984 922.357178175633 0.534867787102555 921.822310388531 C:G C G 10 0.534867787102555 0 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32605326 A/G 0 33 0 33 15.3493630256157 0 15.3493630256157 A A 10 0.534867787102555 1.49414563450156e-09 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32605336 G/A 0 38 0 38 17.6750240901029 0 17.6750240901029 G G 10 0.534867787102555 5.75649100594631e-11 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 1 123 124 0.465132212897445 65.7887378136143 -65.3236056007168 A:C:G C A 10 0.534867787102555 8.64176838336604e-40 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32714143 G/A 0 11 0 11 5.1164543418719 0 5.1164543418719 G G 10 0.534867787102555 0.00124543481256921 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 121 111 232 56.2809977605908 59.3703243683836 -3.08932660779276 T:C C T 10 0.534867787102555 0.693376556940733 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32810443 G/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 209 189 398 97.212632495566 101.090011762383 -3.8773792668169 T:C T C 10 0.534867787102555 0.725095387440039 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 259 214 473 120.469243140438 114.461706439947 6.00753670049149 T:C T C 10 0.534867787102555 0.612190771943731 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32819865 T/C 1 20 16 36 9.3026442579489 8.55788459364088 0.74475966430802 T:C T C 10 0.534867787102555 0.868218778112725 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 387 431 818 180.006166391311 230.528016241201 -50.52184984989 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000449864917711853 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 90 101 191 41.8618991607701 54.0216464973581 -12.159747336588 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0818143285872582 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32943151 T/C 1 15 2 17 6.97698319346167 1.06973557420511 5.90724761925657 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00560283838617104 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32943229 T/C 1 86 87 173 40.0013703091803 46.5334974779223 -6.53212716874202 T:C T C 10 0.534867787102555 0.322899634018621 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32943161_32943298:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32943161_32943298:BRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32944094 G/C 1 205 201 406 95.3521036439762 107.508425207614 -12.1563215636373 C:G G C 10 0.534867787102555 0.232677112095610 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944027_32944241:BRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32948287 T/G 1 18 5 23 8.37237983215401 2.67433893551277 5.69804089664123 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0202484207319403 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32948288 T/C 1 18 2 20 8.37237983215401 1.06973557420511 7.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00104646527311964 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32948296 G/C 1 17 1 18 7.90724761925657 0.534867787102555 7.37237983215401 C:G G C 10 0.534867787102555 0.000236295721391475 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 518 516 1034 240.938486280877 275.991778144918 -35.0532918640419 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0291131515866474 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32974907 G/A 1 59 78 137 27.4428005609493 41.7196873939993 -14.27688683305 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0162705116750485 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 68 40 108 31.6289904770263 21.3947114841022 10.2342789929241 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0534916400782111 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32975014 T/C 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 54 59 113 25.117139496462 31.5571994390507 -6.44005994258871 T:C C T 10 0.534867787102555 0.257704349514509 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32975720 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 47 58 105 21.8612140061799 31.0223316519482 -9.16111764576828 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0784110619273491 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 32977315 A/G 1 22 22 44 10.2329086837438 11.7670913162562 -1.53418263251242 A:G A G 10 0.534867787102555 0.653525861955733 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33048735 C/G 1 8 10 18 3.72105770317956 5.34867787102555 -1.62762016784599 C:G C G 10 0.534867787102555 0.485142004431293 ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000478189:exon_33048718_33049008:HLA-DPB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 476 515 991 221.402933339184 275.456910357816 -54.053977018632 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000648875985486917 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33131593 T/G 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 T:G T G 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000204248:ENST00000374708:exon_33130458_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000374714:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000374712:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000341947:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000357486:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000395197:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000361917:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000374713:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000395196:exon_33130469_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000477772:exon_33130472_33131595:COL11A2;ENSG00000204248:ENST00000374697:exon_33131515_33131595:COL11A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 19 14 33 8.83751204505145 7.48814901943577 1.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.728215546943111 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 36 20 56 16.744759664308 10.6973557420511 6.04740392225692 A:G G A 10 0.534867787102555 0.109771481230035 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33247084 C/T 1 95 97 192 44.1875602252573 51.8821753489478 -7.69461512369056 T:C C T 10 0.534867787102555 0.278209839766130 ENSG00000227057:ENST00000467874:exon_33246885_33247124:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000473611:exon_33246885_33247387:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000461951:exon_33246885_33247151:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33246885_33247151:WDR46 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33255103 A/C 1 12 2 14 5.58158655476934 1.06973557420511 4.51185098056423 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0159085010695991 ENSG00000227057:ENST00000488944:exon_33255020_33255495:WDR46 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 12 15 27 5.58158655476934 8.02301680653832 -2.44143025176898 A:G G A 10 0.534867787102555 0.440950658381376 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 58 68 126 26.9776683480518 36.3710095229737 -9.39334117492193 A:C C A 10 0.534867787102555 0.107631386678576 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 145 115 260 67.4441708701295 61.5097955167938 5.9343753533357 C:G G C 10 0.534867787102555 0.494167898240961 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 T:G G T 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:T A T 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 24 15 39 11.1631731095387 8.02301680653832 3.14015630300035 T:C T C 10 0.534867787102555 0.339229824273563 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 86 115 201 40.0013703091803 61.5097955167938 -21.5084252076136 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00288801246204019 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 C:G G C 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33382241 T/C 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C T C 10 0.534867787102555 0.170715478381623 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 33411463 C/G 1 10 18 28 4.65132212897445 9.62762016784599 -4.97629803887154 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0863582676468199 ENSG00000197283:ENST00000293748:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000395072:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000418600:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000449372:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000496374:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000428982:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000440474:exon_33410666_33411737:SYNGAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 34215228 G/A 1 2 7 9 0.93026442579489 3.74407450971789 -2.81381008392299 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0916987952083956 ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000495581:exon_34214807_34215641:C6orf1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 34574305 C/A 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:C C A 10 0.534867787102555 0.838633273489104 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35056443 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000064999:ENST00000360359:exon_35056383_35059179:ANKS1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 33 36 69 15.3493630256157 19.255240335692 -3.9058773100763 T:C C T 10 0.534867787102555 0.398470411907974 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 43 36 79 20.0006851545901 19.255240335692 0.745444818898154 T:C C T 10 0.534867787102555 0.91048399196757 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 23 19 42 10.6980408966412 10.1624879549485 0.535552941692689 T:C C T 10 0.534867787102555 0.878734543696345 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35430686 G/A 1 4 14 18 1.86052885158978 7.48814901943577 -5.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00877625850336129 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35430566_35430691:FANCE HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 78 59 137 36.2803126060007 31.5571994390507 4.72311316694997 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.441557756750572 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36098333 T/C 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 C T C 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000156711:ENST00000373761:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000211287:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373770:exon_36098262_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373766:exon_36098262_36098478:MAPK13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36098410 A/C 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 A:C A C 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000156711:ENST00000476951:exon_36098396_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373761:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000211287:exon_36098098_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373770:exon_36098262_36098478:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373766:exon_36098262_36098478:MAPK13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 18 31 49 8.37237983215401 16.5809014001792 -8.20852156802519 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0215215512398045 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 407 421 828 189.30881064926 225.179338370176 -35.8705277209155 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0133399032050412 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36652339 C/G 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 C:G C G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 301 294 595 140.004796082131 157.251129408151 -17.2463333260202 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.162358929492614 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 17 15 32 7.90724761925657 8.02301680653832 -0.115769187281759 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36887476 C/T 1 27 38 65 12.558569748231 20.3249759098971 -7.76640616166608 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0617915183236346 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36887354_36887477:C6orf89 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 93 74 167 43.2572957994624 39.5802162455891 3.67707955387331 A:G G A 10 0.534867787102555 0.587823510367199 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 50 49 99 23.2566106448723 26.2085215680252 -2.95191092315294 A:C:G G C 10 0.534867787102555 0.614662961752018 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36978745 G/A 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 A:G G A 10 0.534867787102555 0.319398149927548 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36978834 A/G 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36978749_36979339:FGD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 36 26 62 16.744759664308 13.9065624646664 2.83819719964159 T:C C T 10 0.534867787102555 0.525244103251326 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 34 50 84 15.8144952385131 26.7433893551277 -10.9288941166146 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0210898875459971 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 37250112 A/G 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37249961_37250140:TBC1D22B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 37447798 C/T 1 44 39 83 20.4658173674876 20.8598436969996 -0.394026329512062 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37447789_37449282:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37447789_37449282:FTSJD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 41029342 T/C 1 13 2 15 6.04671876766678 1.06973557420511 4.97698319346167 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0094603210285478 ENSG00000124701:ENST00000426505:exon_41029234_41029434:APOBEC2;ENSG00000124701:ENST00000244669:exon_41029067_41029631:APOBEC2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 T:C C T 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 41557860 C/T 1 83 92 175 38.6059736704879 49.2078364134351 -10.6018627429471 T:C C T 10 0.534867787102555 0.11190550498654 ENSG00000137166:ENST00000373063:exon_41557737_41557908:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373060:exon_41557701_41557908:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000409208:exon_41557737_41557908:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373057:exon_41557701_41557908:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000307972:exon_41557701_41557908:FOXP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 70 70 140 32.5592549028212 37.4407450971788 -4.8814901943577 A:T:C A C 10 0.534867787102555 0.445927917589164 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 31 24 55 14.4190985998208 12.8368268904613 1.58227170935947 T:C C T 10 0.534867787102555 0.687666146215246 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42627430 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 17 27 44 7.90724761925657 14.441430251769 -6.53418263251242 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0505829292256954 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42985973 T/C 1 1 8 9 0.465132212897445 4.27894229682044 -3.81381008392299 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0151480982867498 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 68 58 126 31.6289904770263 31.0223316519482 0.606658825078071 T:C T C 10 0.534867787102555 0.929092179794266 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 57 52 109 26.5125361351544 27.8131249293329 -1.3005887941785 C:G C G 10 0.534867787102555 0.847901345415968 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 158 132 290 73.4908896377963 70.6025478975373 2.88834174025905 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.768599338776787 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 44 30 74 20.4658173674876 16.0460336130766 4.41978375441093 T:C C T 10 0.534867787102555 0.351420475544301 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43019477 G/A 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 A:G G A 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019350_43019501:CUL7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43023371 T/C 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000112651:ENST00000485654:exon_43023283_43023455:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000491898:exon_43023354_43023934:MRPL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43152573 A/G 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 A:G A G 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000451399:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43152040_43152643:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43152040_43152643:CUL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 20 23 43 9.3026442579489 12.3019591033588 -2.99931484540986 A:C A C 10 0.534867787102555 0.364203480464472 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43270151 C/T 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 T:C C T 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000137204:ENST00000372589:exon_43269938_43270152:SLC22A7;ENSG00000137204:ENST00000407602:exon_43269938_43270152:SLC22A7;ENSG00000137204:ENST00000372585:exon_43269938_43270152:SLC22A7;ENSG00000137204:ENST00000372574:exon_43269938_43270152:SLC22A7;ENSG00000137204:ENST00000436107:exon_43269938_43270152:SLC22A7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 20 26 46 9.3026442579489 13.9065624646664 -4.60391820671753 A:G A G 10 0.534867787102555 0.185619216912494 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 88 50 138 40.9316347349752 26.7433893551277 14.1882453798474 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0166880474538305 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 43747450 G/A 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:G G A 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000112715:ENST00000480614:exon_43746626_43754221:VEGFA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44115061 G/A 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 200 161 361 93.026442579489 86.1137137235114 6.91272885597765 T:G G T 10 0.534867787102555 0.492872550881455 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 11 9 20 5.1164543418719 4.81381008392299 0.3026442579489 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44270768 G/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:G G T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 30 31 61 13.9539663869233 16.5809014001792 -2.62693501325585 T:C C T 10 0.534867787102555 0.522970828867368 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 30 34 64 13.9539663869233 18.1855047614869 -4.23153837456352 A:T T A 10 0.534867787102555 0.317034898552420 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 14 19 33 6.51185098056423 10.1624879549485 -3.65063697438432 C:G C G 10 0.534867787102555 0.22440973942797 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 12 25 37 5.58158655476934 13.3716946775639 -7.79010812279454 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0126468429718294 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 3 14 17 1.39539663869233 7.48814901943577 -6.09275238074344 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00313459269537849 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 14 11 25 6.51185098056423 5.8835456581281 0.628305322436125 T:C C T 10 0.534867787102555 0.843631536270771 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 14 10 24 6.51185098056423 5.34867787102555 1.16317310953868 A:G G A 10 0.534867787102555 0.686611403599214 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 52268008 T/G 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:G T G 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000170915:ENST00000512121:exon_52267960_52268347:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 T:C C T 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56351972 G/C 1 14 14 28 6.51185098056423 7.48814901943577 -0.976298038871541 C:G G C 10 0.534867787102555 0.710213463318711 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000487754:exon_56351902_56352071:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56401600 G/A 1 5 13 18 2.32566106448723 6.95328123233322 -4.62762016784599 A:G G A 10 0.534867787102555 0.033554406248866 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000340834:exon_56401577_56401738:DST;ENSG00000151914:ENST00000524186:exon_56401577_56401738:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 21 20 41 9.76777647084634 10.6973557420511 -0.929579271204755 T:C C T 10 0.534867787102555 0.87585152397212 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 16 18 34 7.44211540635912 9.62762016784599 -2.18550476148687 T:C T C 10 0.534867787102555 0.494284609355426 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56420538 C/T 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000520144:exon_56420406_56420638:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C T C 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 25 16 41 11.6283053224361 8.55788459364088 3.07042072879524 A:G G A 10 0.534867787102555 0.352528530597853 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 57012930 C/T 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000112200:ENST00000370706:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000357489:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000444273:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000491832:exon_57011888_57013491:ZNF451 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 8 0 8 3.72105770317956 0 3.72105770317956 G G 10 0.534867787102555 0.00888925060565865 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 21 21 0 11.2322235291537 -11.2322235291537 A G A 10 0.534867787102555 1.04497228760256e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 13 0 13 6.04671876766678 0 6.04671876766678 C C 10 0.534867787102555 0.000340924125332158 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 12 12 0 6.41841344523066 -6.41841344523066 C T C 10 0.534867787102555 0.000102545595929325 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 72006512 T/C 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74138471 G/C 1 33 34 67 15.3493630256157 18.1855047614869 -2.83614173587119 C:G G C 10 0.534867787102555 0.540842924375666 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 10 10 20 4.65132212897445 5.34867787102555 -0.6973557420511 T:G G T 10 0.534867787102555 0.824569743705683 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 75 66 141 34.8849159673084 35.3012739487686 -0.416357981460258 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 13 33 46 6.04671876766678 17.6506369743843 -11.6039182067175 T:G G T 10 0.534867787102555 0.00092080581891732 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 27 21 48 12.558569748231 11.2322235291537 1.32634621907736 A:G A G 10 0.534867787102555 0.773042008197412 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 76369054 A/G 1 31 32 63 14.4190985998208 17.1157691872818 -2.69667058746096 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.529028456616675 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 76564953 A/G 1 10 15 25 4.65132212897445 8.02301680653832 -3.37169467756387 A:G A G 10 0.534867787102555 0.228786156481097 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76564856_76565000:MYO6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 82933309 C/T 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C C T 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000369751:exon_82933157_82933337:IBTK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 86199233 A/G 1 3 7 10 1.39539663869233 3.74407450971789 -2.34867787102555 A:G A G 10 0.534867787102555 0.204411071600288 ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000416334:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000437581:exon_86199212_86199317:NT5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 88366708 C/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 287 259 546 133.492945101567 138.530756859562 -5.03781175799503 C:G G C 10 0.534867787102555 0.66816931874099 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 90340734 G/A 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000135299:ENST00000369408:exon_90340152_90343553:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000339746:exon_90340152_90341302:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000447838:exon_90340152_90341216:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000522441:exon_90340152_90341055:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000520793:exon_90340152_90341219:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000518253:exon_90340152_90341196:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000415924:exon_90340152_90343373:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000479572:exon_90340152_90341217:ANKRD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:C A C 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 90577984 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 99883694 T/C 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99880190_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99880255_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99880312_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99880315_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99883420_99883722:USP45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 99893938 T/C 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C T C 10 0.534867787102555 0.816289814725156 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 99894086 C/G 1 11 18 29 5.1164543418719 9.62762016784599 -4.51116582597409 C:G C G 10 0.534867787102555 0.097583539926297 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 31 28 59 14.4190985998208 14.9762980388715 -0.557199439050745 T:C T C 10 0.534867787102555 0.896885791206687 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 21 25 46 9.76777647084634 13.3716946775639 -3.60391820671753 T:C C T 10 0.534867787102555 0.303718875469948 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 106960447 G/A 1 12 12 24 5.58158655476934 6.41841344523066 -0.836826890461321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.838633273489104 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106959730_106960914:AIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 51 32 83 23.7217428577697 17.1157691872818 6.60597367048793 A:C A C 10 0.534867787102555 0.153794662450003 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 107003810 T/C 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 T:C T C 10 0.534867787102555 0.396858492919777 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 107006336 G/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 107006347 T/C 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 T:C T C 10 0.534867787102555 0.741828421132198 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 23 20 43 10.6980408966412 10.6973557420511 0.000685154590135184 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 17 23 40 7.90724761925657 12.3019591033588 -4.3947114841022 A:G G A 10 0.534867787102555 0.204402284095363 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 30 19 49 13.9539663869233 10.1624879549485 3.7914784319748 A:G G A 10 0.534867787102555 0.317195737226672 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 A:G G A 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111587266 T/C 1 19 21 40 8.83751204505145 11.2322235291537 -2.3947114841022 T:C T C 10 0.534867787102555 0.526724673864191 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 15 19 34 6.97698319346167 10.1624879549485 -3.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 0.304658030947817 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111695268 C/T 1 4 10 14 1.86052885158978 5.34867787102555 -3.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.104563589848143 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 8 6 14 3.72105770317956 3.20920672261533 0.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 111696852 T/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 32 30 62 14.8842308127182 16.0460336130766 -1.16180280035841 A:G G A 10 0.534867787102555 0.799845431249356 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 27 32 59 12.558569748231 17.1157691872818 -4.55719943905074 T:C T C 10 0.534867787102555 0.242784368075445 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 57 47 104 26.5125361351544 25.1387859938201 1.37375014133428 C:G C G 10 0.534867787102555 0.844338893022324 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 41 31 72 19.0704207287952 16.5809014001792 2.48951932861604 A:G G A 10 0.534867787102555 0.636851256295767 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 116988211 C/T 1 9 11 20 4.18618991607701 5.8835456581281 -1.6973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 0.505457236744248 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116987797_116988370:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116987797_116988370:ZUFSP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 117896728 A/C 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 A:C A C 10 0.534867787102555 0.806945941972106 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 372 0 372 173.02918319785 0 173.02918319785 C C 10 0.534867787102555 8.50896491152043e-102 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 118886961 G/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 118887215 T/A 1 14 8 22 6.51185098056423 4.27894229682044 2.23290868374379 A:T T A 10 0.534867787102555 0.396858492919777 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 25 11 36 11.6283053224361 5.8835456581281 5.74475966430802 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0655292691119456 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 T:C T C 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 130374102 C/A 0 10 0 10 4.65132212897445 0 4.65132212897445 C C 10 0.534867787102555 0.00239028864245299 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000528385:exon_130374004_130374125:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130374004_130374136:L3MBTL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 131943057 G/A 1 3 8 11 1.39539663869233 4.27894229682044 -2.88354565812811 A:G G A 10 0.534867787102555 0.127818607776150 ENSG00000112282:ENST00000354577:exon_131943021_131943119:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368068:exon_131943021_131943119:MED23;ENSG00000112282:ENST00000403834:exon_131943021_131943119:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368060:exon_131943021_131943119:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368058:exon_131943021_131943119:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368053:exon_131943021_131943119:MED23 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 134493397 G/A 1 4 12 16 1.86052885158978 6.41841344523066 -4.55788459364088 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0249575924410279 ENSG00000118515:ENST00000367858:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000474427:exon_134490386_134495724:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000413996:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000477460:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000237305:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367855:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367857:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000528577:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000475719:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000531782:exon_134493331_134493435:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000525877:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000489458:exon_134493331_134493454:SGK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 36 28 64 16.744759664308 14.9762980388715 1.76846162543648 A:G A G 10 0.534867787102555 0.707903216552952 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 135606755 C/G 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 318 0 318 147.912043701388 0 147.912043701388 T T 10 0.534867787102555 5.86815104016089e-87 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 344 0 344 160.005481236721 0 160.005481236721 A A 10 0.534867787102555 3.38982835487128e-94 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 337 0 337 156.749555746439 0 156.749555746439 A A 10 0.534867787102555 2.80218488050918e-92 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 163 0 163 75.8165507022835 0 75.8165507022835 G G 10 0.534867787102555 6.27681556003928e-45 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 207 1 208 96.2823680697711 0.534867787102555 95.7475002826686 A:T T A 10 0.534867787102555 7.1561181409581e-55 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 36 33 69 16.744759664308 17.6506369743843 -0.905877310076296 T:G T G 10 0.534867787102555 0.904068302007901 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 24 18 42 11.1631731095387 9.62762016784599 1.53555294169269 T:C T C 10 0.534867787102555 0.647000211541768 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G A G 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 17 12 29 7.90724761925657 6.41841344523066 1.4888341740259 T:C T C 10 0.534867787102555 0.710420076918619 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 144178419 T/C 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.78091676997055 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 144262783 G/T 1 22 20 42 10.2329086837438 10.6973557420511 -0.464447058307309 T:G G T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000118495:ENST00000360537:exon_144261437_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000354765:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000429150:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000423789:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000444202:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000416623:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392309:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000451709:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000325773:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000437412:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392307:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367572:exon_144261475_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367571:exon_144262421_144263800:PLAGL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 146125793 A/T 1 11 17 28 5.1164543418719 9.09275238074344 -3.97629803887154 A:T A T 10 0.534867787102555 0.183820235173765 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 146126419 C/T 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 146207563 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000146414:ENST00000367505:exon_146205943_146207923:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000367503:exon_146205943_146207923:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000438092:exon_146205949_146207576:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000275233:exon_146206629_146207923:SHPRH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 147680359 A/G 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000164506:ENST00000367479:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000179882:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367481:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000321680:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367480:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367475:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000392291:exon_147680220_147680459:STXBP5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 151281463 C/T 1 45 39 84 20.930949580385 20.8598436969996 0.0711058833853819 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151281411_151281551:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151281411_151281551:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151281411_151281551:MTHFD1L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 42 42 84 19.5355529416927 22.4644470583073 -2.92889411661462 C:G G C 10 0.534867787102555 0.584737924339223 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 157405930 G/A 1 19 17 36 8.83751204505145 9.09275238074344 -0.255240335691981 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000452544:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000493658:exon_157405900_157406039:ARID1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 A:G G A 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 158502270 G/A 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158502141_158502359:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158502141_158502359:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158502141_158502359:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158502141_158502359:SYNJ2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 13 9 22 6.04671876766678 4.81381008392299 1.23290868374379 A:G A G 10 0.534867787102555 0.672562792945326 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 26 18 44 12.0934375353336 9.62762016784599 2.46581736748758 A:G A G 10 0.534867787102555 0.546085095617419 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 159184507 C/T 1 44 30 74 20.4658173674876 16.0460336130766 4.41978375441093 T:C C T 10 0.534867787102555 0.351420475544301 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 159458149 C/T 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000164691:ENST00000367066:exon_159455500_159458156:TAGAP;ENSG00000164691:ENST00000367061:exon_159456029_159458156:TAGAP;ENSG00000164691:ENST00000326965:exon_159456169_159458156:TAGAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 26 48 74 12.0934375353336 25.6736537809226 -13.5802162455891 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00221913712234888 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 19 25 44 8.83751204505145 13.3716946775639 -4.53418263251242 T:G T G 10 0.534867787102555 0.177119301244689 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 90 124 214 41.8618991607701 66.3236056007168 -24.4617064399468 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00096147698088165 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 100 71 171 46.5132212897445 37.9756128842814 8.5376084054631 T:C C T 10 0.534867787102555 0.193545422047184 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 59 90 149 27.4428005609493 48.1381008392299 -20.6953002782807 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000726048491050877 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160202167 G/A 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:G G A 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160453978 A/G 1 15 10 25 6.97698319346167 5.34867787102555 1.62830532243613 A:G A G 10 0.534867787102555 0.553525493210204 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160453974_160454139:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160453974_160454139:IGF2R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160464289 G/A 1 11 8 19 5.1164543418719 4.27894229682044 0.837512045051455 A:G G A 10 0.534867787102555 0.819606558314992 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160464180_160464320:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160464180_160464320:IGF2R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 52 26 78 24.1868750706671 13.9065624646664 10.2803126060007 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0227147173523392 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 45 40 85 20.930949580385 21.3947114841022 -0.463761903717174 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 167435928 C/T 1 32 27 59 14.8842308127182 14.441430251769 0.442800560949255 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167435914_167436123:FGFR1OP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 167438276 G/T 1 32 21 53 14.8842308127182 11.2322235291537 3.65200728356458 T:G G T 10 0.534867787102555 0.337695020910148 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 167438364 T/C 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000488525:exon_167438278_167438382:FGFR1OP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 168343838 T/C 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C T C 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168343809_168343871:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507679:exon_168343809_168343874:MLLT4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 7 15 22 3.25592549028211 8.02301680653832 -4.76709131625621 T:C C T 10 0.534867787102555 0.053173004707963 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170068086 C/T 1 14 4 18 6.51185098056423 2.13947114841022 4.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0560178997489729 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170068180 A/G 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000474869:exon_170068157_170068281:WDR27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170151766 C/T 1 5 10 15 2.32566106448723 5.34867787102555 -3.02301680653832 T:C C T 10 0.534867787102555 0.128640050678942 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 T:C C T 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 15 12 27 6.97698319346167 6.41841344523066 0.558569748231014 A:G A G 10 0.534867787102555 0.849949393834714 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 26 21 47 12.0934375353336 11.2322235291537 0.861214006179914 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.884096235186603 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 32 21 53 14.8842308127182 11.2322235291537 3.65200728356458 T:G G T 10 0.534867787102555 0.337695020910148 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 33 19 52 15.3493630256157 10.1624879549485 5.18687507066714 T:C T C 10 0.534867787102555 0.165587002921691 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 47 18 65 21.8612140061799 9.62762016784599 12.2335938383339 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00259213176272421 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 34 32 66 15.8144952385131 17.1157691872818 -1.30127394876863 T:G T G 10 0.534867787102555 0.80545768502491 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 11 16 27 5.1164543418719 8.55788459364088 -3.44143025176898 A:G A G 10 0.534867787102555 0.246642971185003 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 590148 G/A 1 28 11 39 13.0237019611285 5.8835456581281 7.14015630300035 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0241891444885677 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 590229 T/C 1 41 26 67 19.0704207287952 13.9065624646664 5.16385826412881 T:C T C 10 0.534867787102555 0.222139155676814 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 13 10 23 6.04671876766678 5.34867787102555 0.698040896641235 A:G A G 10 0.534867787102555 0.836582088194986 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 27 28 55 12.558569748231 14.9762980388715 -2.41772829064053 T:C T C 10 0.534867787102555 0.589168233191657 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 29 26 55 13.4888341740259 13.9065624646664 -0.417728290640525 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 T:C C T 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 883098 C/T 1 45 27 72 20.930949580385 14.441430251769 6.48951932861604 T:C C T 10 0.534867787102555 0.155801394036483 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_882978_883273:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_882978_883455:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_882978_883471:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_882978_883306:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000471349:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_882978_883157:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_883007_883157:SUN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 28 36 64 13.0237019611285 19.255240335692 -6.23153837456352 T:C C T 10 0.534867787102555 0.132844993569762 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 16 18 34 7.44211540635912 9.62762016784599 -2.18550476148687 T:C T C 10 0.534867787102555 0.494284609355426 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1195264 T/C 1 10 6 16 4.65132212897445 3.20920672261533 1.44211540635912 T:C T C 10 0.534867787102555 0.618076615182016 ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1522157 T/C 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000164880:ENST00000468115:exon_1521914_1523489:INTS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1522175 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000164880:ENST00000468115:exon_1521914_1523489:INTS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 15 11 26 6.97698319346167 5.8835456581281 1.09343753533357 A:G A G 10 0.534867787102555 0.699211137422613 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 26 27 53 12.0934375353336 14.441430251769 -2.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.582405025185927 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 42 24 66 19.5355529416927 12.8368268904613 6.69872605123137 T:C T C 10 0.534867787102555 0.108995315389124 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2414142 A/G 1 9 16 25 4.18618991607701 8.55788459364088 -4.37169467756387 A:G A G 10 0.534867787102555 0.107280657645491 ENSG00000106263:ENST00000475415:exon_2412753_2415162:EIF3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 103 95 198 47.9086179284368 50.8124397747427 -2.9038218463059 T:C T C 10 0.534867787102555 0.721796726876775 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 65 42 107 30.2335938383339 22.4644470583073 7.76914678002661 T:C C T 10 0.534867787102555 0.146130752979116 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 54 36 90 25.117139496462 19.255240335692 5.86189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 0.2452037572176 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 38 29 67 17.6750240901029 15.5111658259741 2.16385826412881 A:G G A 10 0.534867787102555 0.625950975924369 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 21 22 43 9.76777647084634 11.7670913162562 -1.99931484540986 T:C C T 10 0.534867787102555 0.545487574291049 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 T:G G T 10 0.534867787102555 0.438858491316679 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5104275 G/A 1 9 13 22 4.18618991607701 6.95328123233322 -2.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.286983398886570 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5104359 G/A 1 6 9 15 2.79079327738467 4.81381008392299 -2.02301680653833 A:G G A 10 0.534867787102555 0.313544354924083 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5105133 C/T 1 12 11 23 5.58158655476934 5.8835456581281 -0.301959103358765 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5105208 C/T 1 13 4 17 6.04671876766678 2.13947114841022 3.90724761925656 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0860690818444164 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 0 59 0 59 27.4428005609493 0 27.4428005609493 G G 10 0.534867787102555 1.49420008818412e-16 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 21 28 49 9.76777647084634 14.9762980388715 -5.2085215680252 C:G G C 10 0.534867787102555 0.152708336996737 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 25 19 44 11.6283053224361 10.1624879549485 1.46581736748758 A:G G A 10 0.534867787102555 0.762914460310603 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5427652 G/A 1 12 17 29 5.58158655476934 9.09275238074344 -3.5111658259741 A:G G A 10 0.534867787102555 0.198577764080982 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 5632828 C/T 0 1297 1 1298 603.276480127986 0.534867787102555 602.741612340884 C:G C G 10 0.534867787102555 0 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5632454_5633399:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5632454_5633399:FSCN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 30 35 65 13.9539663869233 18.7203725485894 -4.76640616166607 T:G G T 10 0.534867787102555 0.263634949225480 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6036980 G/C 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 C:G G C 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6036957_6037054:PMS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6043386 G/A 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 A:G G A 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000413462:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000380416:exon_6043321_6043423:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000415839:exon_6042941_6043689:PMS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 58 74 132 26.9776683480518 39.5802162455891 -12.6025478975373 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0292053053525716 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 48 63 111 22.3263462190774 33.696670587461 -11.3703243683836 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0359177839687218 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 36 25 61 16.744759664308 13.3716946775639 3.37306498674415 T:C C T 10 0.534867787102555 0.441858834708637 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 50 30 80 23.2566106448723 16.0460336130766 7.2105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.116872968861772 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 27 17 44 12.558569748231 9.09275238074344 3.46581736748758 T:C C T 10 0.534867787102555 0.364792043707667 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 109 92 201 50.6994112058215 49.2078364134351 1.49157479238644 T:C T C 10 0.534867787102555 0.887590261316547 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 63 43 106 29.303329412539 22.9993148454099 6.30401456712917 A:G G A 10 0.534867787102555 0.242923747942529 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 30 20 50 13.9539663869233 10.6973557420511 3.25661064487225 T:C T C 10 0.534867787102555 0.396592939270772 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 26 15 41 12.0934375353336 8.02301680653832 4.07042072879524 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.214342950952987 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 C:G G C 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 20418678 C/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C C T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 ENSG00000105855:ENST00000478974:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000222573:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000477859:exon_20418674_20421704:ITGB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 20421490 T/C 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 T:C T C 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000105855:ENST00000478974:exon_20421350_20421508:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000222573:exon_20421350_20421508:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000477859:exon_20418674_20421704:ITGB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 23728916 G/A 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 A:G G A 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000188732:ENST00000409192:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000344962:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000429719:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000462546:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409994:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409653:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000446234:exon_23728888_23729078:C7orf46 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 23728931 T/C 1 12 5 17 5.58158655476934 2.67433893551277 2.90724761925656 T:C T C 10 0.534867787102555 0.223810845764614 ENSG00000188732:ENST00000409192:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000344962:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000429719:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000462546:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409994:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409653:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000446234:exon_23728888_23729078:C7orf46 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C T C 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 25182405 G/T 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:G G T 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25182259_25182433:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25182259_25182433:C7orf31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 25207963 G/A 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25207908_25208084:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25207908_25208084:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000443822:exon_25207908_25208084:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000415598:exon_25207908_25208084:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000444434:exon_25207941_25208084:C7orf31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 25989520 T/G 1 11 5 16 5.1164543418719 2.67433893551277 2.44211540635912 T:G T G 10 0.534867787102555 0.316682748263081 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 120 109 229 55.8158655476934 58.3005887941785 -2.4847232464851 C:G G C 10 0.534867787102555 0.74106870802819 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 30655489 A/T 1 1 13 14 0.465132212897445 6.95328123233322 -6.48814901943577 A:T A T 10 0.534867787102555 0.000536187327055624 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 32908945 T/C 1 14 25 39 6.51185098056423 13.3716946775639 -6.85984369699965 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0357606986087596 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 26 27 53 12.0934375353336 14.441430251769 -2.34799271643542 A:G G A 10 0.534867787102555 0.582405025185927 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 13 13 26 6.04671876766678 6.95328123233322 -0.906562464666431 T:C C T 10 0.534867787102555 0.844675156546112 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 21 19 40 9.76777647084634 10.1624879549485 -0.394711484102201 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 T:C C T 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 38393343 T/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 38393390 T/G 1 11 2 13 5.1164543418719 1.06973557420511 4.04671876766679 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0265849870648711 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 38393448 G/C 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 G G 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 38393524 C/T 1 7 1 8 3.25592549028211 0.534867787102555 2.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0756443189601137 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 18 21 39 8.37237983215401 11.2322235291537 -2.85984369699965 A:G G A 10 0.534867787102555 0.422874998565857 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 42 38 80 19.5355529416927 20.3249759098971 -0.789422968204402 A:G A G 10 0.534867787102555 0.910922364415701 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 27 16 43 12.558569748231 8.55788459364088 4.00068515459014 A:G G A 10 0.534867787102555 0.284456528567027 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44047066 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136206:ENST00000258704:exon_44046867_44047185:SPDYE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44153614 C/G 1 5 12 17 2.32566106448723 6.41841344523066 -4.09275238074344 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0534038017940238 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 2 16 18 0.93026442579489 8.55788459364088 -7.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.000446386505027661 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44608718 C/T 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.189238275360181 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44610490 C/T 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 103 89 192 47.9086179284368 47.6032330521274 0.305384876309439 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 35 32 67 16.2796274514106 17.1157691872818 -0.836141735871184 T:C C T 10 0.534867787102555 0.902695490039415 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 47408974 T/A 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 A:T T A 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000136205:ENST00000311160:exon_47407962_47409218:TNS3;ENSG00000136205:ENST00000398879:exon_47407962_47409218:TNS3;ENSG00000136205:ENST00000457718:exon_47407962_47409218:TNS3;ENSG00000136205:ENST00000450444:exon_47408878_47409218:TNS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:C C T 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 7 8 15 3.25592549028211 4.27894229682044 -1.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.615387176330244 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 12 18 30 5.58158655476934 9.62762016784599 -4.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.147172704883020 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 9 19 28 4.18618991607701 10.1624879549485 -5.97629803887154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0352385485799502 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 4 21 25 1.86052885158978 11.2322235291537 -9.37169467756387 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000167506474638737 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 21 5 26 9.76777647084634 2.67433893551277 7.09343753533357 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00529968741778032 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 66459256 T/C 1 78 91 169 36.2803126060007 48.6729686263325 -12.3926560203318 T:C T C 10 0.534867787102555 0.063935137118787 ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66459199_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000463579:exon_66459207_66459353:SBDS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 66460455 G/T 1 49 52 101 22.7914784319748 27.8131249293329 -5.02164649735806 T:G G T 10 0.534867787102555 0.320522857375615 ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66460277_66460588:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000420420:exon_66460277_66460573:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66460277_66460563:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66460085_66460559:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000496763:exon_66460277_66460635:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66460277_66460553:SBDS;ENSG00000198874:ENST00000491969:exon_66460160_66460484:TYW1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 24 17 41 11.1631731095387 9.09275238074344 2.07042072879524 C:G G C 10 0.534867787102555 0.535884982847249 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 70254788 G/A 1 60 60 120 27.9079327738467 32.0920672261533 -4.1841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.464875599763766 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70254734_70257489:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70254734_70258054:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000449547:exon_70254734_70254970:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000418686:exon_70254734_70254912:AUTS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 27 19 46 12.558569748231 10.1624879549485 2.39608179328247 A:G G A 10 0.534867787102555 0.555169282411363 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 55 40 95 25.5822717093595 21.3947114841022 4.18756022525728 T:C C T 10 0.534867787102555 0.411896788392765 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 60 51 111 27.9079327738467 27.2782571422303 0.629675631616394 T:C C T 10 0.534867787102555 0.924476433991263 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 38 25 63 17.6750240901029 13.3716946775639 4.30332941253903 A:G G A 10 0.534867787102555 0.313050851492455 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 40 42 82 18.6052885158978 22.4644470583073 -3.85915854240951 T:C C T 10 0.534867787102555 0.438720405182939 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73107003 C/A 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 A:C C A 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73106926_73107129:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73106926_73107203:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73106926_73107744:WBSCR22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73108310 T/C 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 T:C T C 10 0.534867787102555 0.405445014430087 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73638035 A/G 1 36 80 116 16.744759664308 42.7894229682044 -26.0446633038964 A:G A G 10 0.534867787102555 1.41558033583254e-06 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 68 62 130 31.6289904770263 33.1618028003584 -1.53281232333215 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.792670501082838 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 75048750 G/A 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 A:G G A 10 0.534867787102555 0.117923142331755 ENSG00000135213:ENST00000476072:exon_75048603_75050568:POM121C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 48 33 81 22.3263462190774 17.6506369743843 4.67570924469304 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.317572837491233 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 52 50 102 24.1868750706671 26.7433893551277 -2.55651428446061 A:G G A 10 0.534867787102555 0.621067871170952 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 87079406 T/A 1 2 9 11 0.93026442579489 4.81381008392299 -3.8835456581281 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0298728806961029 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87079284_87079408:ABCB4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 21 22 43 9.76777647084634 11.7670913162562 -1.99931484540986 T:C C T 10 0.534867787102555 0.545487574291049 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91503329 C/T 1 26 25 51 12.0934375353336 13.3716946775639 -1.27825714223031 T:C C T 10 0.534867787102555 0.779531003528971 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 20 10 30 9.3026442579489 5.34867787102555 3.95396638692335 T:C C T 10 0.534867787102555 0.199468342313066 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 37 46 83 17.2098918772055 24.6039182067175 -7.39402632951207 A:G A G 10 0.534867787102555 0.123012307103768 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 18 18 36 8.37237983215401 9.62762016784599 -1.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.739410883730553 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 91865662 C/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91864717_91865856:KRIT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 34 25 59 15.8144952385131 13.3716946775639 2.44280056094926 C:G C G 10 0.534867787102555 0.60212543611048 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 65 62 127 30.2335938383339 33.1618028003584 -2.92820896202448 A:C C A 10 0.534867787102555 0.656667566094045 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 49 63 112 22.7914784319748 33.696670587461 -10.9051921554862 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0462375294677487 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 32 31 63 14.8842308127182 16.5809014001792 -1.69667058746096 A:G A G 10 0.534867787102555 0.705737693347895 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 48 46 94 22.3263462190774 24.6039182067175 -2.27757198764017 T:C C T 10 0.534867787102555 0.679637020406994 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97822115 T/A 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 A:T T A 10 0.534867787102555 0.529686062624994 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97822210 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97854393 G/A 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 A:G G A 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97854318_97854414:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97854318_97854414:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97854318_97854417:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000479975:exon_97854318_97854414:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000476659:exon_97854318_97854414:TECPR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97863145 G/A 1 14 7 21 6.51185098056423 3.74407450971789 2.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.276708886024608 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97862139_97863154:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97862733_97863223:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000471397:exon_97862739_97863223:TECPR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 98650051 G/C 1 7 18 25 3.25592549028211 9.62762016784599 -6.37169467756387 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0145980406386551 ENSG00000198742:ENST00000361368:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000361125:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000394240:exon_98649828_98650069:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000480055:exon_98649835_98650069:SMURF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99032458 C/T 1 19 16 35 8.83751204505145 8.55788459364088 0.279627451410574 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 35 35 70 16.2796274514106 18.7203725485894 -2.44074509717885 T:C T C 10 0.534867787102555 0.632074809096646 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 21 23 44 9.76777647084634 12.3019591033588 -2.53418263251242 A:G A G 10 0.534867787102555 0.454162488009604 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99158174 A/G 1 58 61 119 26.9776683480518 32.6269350132559 -5.64926666520404 A:G A G 10 0.534867787102555 0.312961874120518 ENSG00000197343:ENST00000320583:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000467680:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000357864:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000489320:exon_99158156_99158582:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000452314:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000416144:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000252713:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000454654:exon_99158130_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000412636:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000486324:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000423973:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000449244:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000493947:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000455905:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000425063:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000493277:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000422422:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000488751:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000422164:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000422647:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000427931:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000424881:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000440391:exon_99158156_99158318:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000394163:exon_99158156_99158318:ZNF655 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99217424 G/A 1 7 12 19 3.25592549028211 6.41841344523066 -3.16248795494855 A:G G A 10 0.534867787102555 0.170715478381623 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99217184_99219197:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99217184_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99217184_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000431485:exon_99217184_99217439:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99217230_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000466948:exon_99217288_99217616:ZNF498 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99227172 A/G 1 22 20 42 10.2329086837438 10.6973557420511 -0.464447058307309 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99226814_99230022:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99226814_99228527:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000485586:exon_99226814_99229994:ZNF498 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:G A G 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 14 5 19 6.51185098056423 2.67433893551277 3.83751204505145 A:G G A 10 0.534867787102555 0.106005801047133 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 28 25 53 13.0237019611285 13.3716946775639 -0.347992716435416 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99691740 G/A 1 15 29 44 6.97698319346167 15.5111658259741 -8.53418263251242 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0146296421261335 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 208 221 429 96.7475002826686 118.205780949665 -21.4582806669961 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0419564139261209 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99696370 C/G 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 C:G C G 10 0.534867787102555 0.564977131081005 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 63 36 99 29.303329412539 19.255240335692 10.0480890768471 A:T A T 10 0.534867787102555 0.0441872771039888 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 79 44 123 36.7454448188982 23.5341826325124 13.2112621863857 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0185321846750961 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99707712 A/G 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99707700_99707897:TAF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 210 162 372 97.6777647084634 86.6485815106139 11.0291831978495 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.253441629702054 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 9 3 12 4.18618991607701 1.60460336130767 2.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.15772121036402 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99758136 T/G 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 T:G T G 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 99818101 G/A 1 17 13 30 7.90724761925657 6.95328123233322 0.95396638692335 A:G G A 10 0.534867787102555 0.855241169984464 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 100160511 C/T 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 T:C C T 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160486_100160569:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160486_100160569:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160486_100160543:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160486_100160569:AGFG2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 110 91 201 51.1645434187189 48.6729686263325 2.49157479238644 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.777395090016902 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 59 76 135 27.4428005609493 40.6499518197942 -13.2071512588449 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0247364809999099 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 53 60 113 24.6520072835646 32.0920672261533 -7.44005994258871 T:C C T 10 0.534867787102555 0.18652905156585 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 100853911 G/C 1 43 47 90 20.0006851545901 25.1387859938201 -5.13810083922995 C:G G C 10 0.534867787102555 0.291849310478259 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853813_100853936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853813_100853954:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853813_100854384:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000421736:exon_100853876_100853954:PLOD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 A:G G A 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 101926407 G/A 1 14 19 33 6.51185098056423 10.1624879549485 -3.65063697438432 A:G G A 10 0.534867787102555 0.22440973942797 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101926313_101927250:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101926313_101927224:CUX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 98 98 196 45.5829568639496 52.4170431360504 -6.83408627210078 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.352059831550748 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 24 23 47 11.1631731095387 12.3019591033588 -1.13878599382009 A:G G A 10 0.534867787102555 0.771320179538871 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 157 33 190 73.0257574248989 17.6506369743843 55.3751204505146 T:C C T 10 0.534867787102555 4.23459459690706e-17 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 8 3 11 3.72105770317956 1.60460336130767 2.11645434187189 A:C A C 10 0.534867787102555 0.239039081555199 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 105111234 A/G 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000091127:ENST00000481939:exon_105111208_105111295:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000356362:exon_105111135_105111295:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000469408:exon_105111135_105111295:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000478208:exon_105110733_105111295:PUS7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 107013080 G/A 1 8 14 22 3.72105770317956 7.48814901943577 -3.76709131625621 A:G G A 10 0.534867787102555 0.134594577567062 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107013040_107013205:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107013040_107013205:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107013040_107013205:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107013040_107013205:COG5;ENSG00000164597:ENST00000475638:exon_107013039_107013205:COG5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 49 43 92 22.7914784319748 22.9993148454099 -0.207836413435061 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 26 27 53 12.0934375353336 14.441430251769 -2.34799271643542 T:G T G 10 0.534867787102555 0.582405025185927 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 46 45 91 21.3960817932825 24.069050419615 -2.6729686263325 A:G G A 10 0.534867787102555 0.600228373191699 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 115889369 G/T 1 14 3 17 6.51185098056423 1.60460336130767 4.90724761925656 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0256258939466012 ENSG00000135269:ENST00000461440:exon_115889074_115889631:TES;ENSG00000135269:ENST00000496871:exon_115889074_115889860:TES;ENSG00000135269:ENST00000485009:exon_115889074_115890086:TES HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 123388732 G/A 1 9 5 14 4.18618991607701 2.67433893551277 1.51185098056423 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593857532575953 ENSG00000106299:ENST00000223023:exon_123388672_123389121:WASL;ENSG00000106299:ENST00000470644:exon_123388672_123389016:WASL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 126079144 A/G 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:G A G 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000179603:ENST00000339582:exon_126078652_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000358373:exon_126078669_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000489939:exon_126078682_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000341617:exon_126078746_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000495315:exon_126078747_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000472701:exon_126079131_126079222:GRM8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 22 26 48 10.2329086837438 13.9065624646664 -3.67365378092264 A:G G A 10 0.534867787102555 0.312974412829421 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 20 13 33 9.3026442579489 6.95328123233322 2.34936302561568 A:G A G 10 0.534867787102555 0.486615987304497 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 134 160 294 62.3277165282576 85.5788459364088 -23.2511294081512 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00709199380291311 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 127724857 G/A 1 88 69 157 40.9316347349752 36.9058773100763 4.02575742489887 A:G G A 10 0.534867787102555 0.575599991539082 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127724776_127724899:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127724776_127724899:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127724776_127724902:SND1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 36 24 60 16.744759664308 12.8368268904613 3.9079327738467 A:G A G 10 0.534867787102555 0.365329890841620 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 52 48 100 24.1868750706671 25.6736537809226 -1.4867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.764840702058961 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128612552 C/T 1 19 35 54 8.83751204505145 18.7203725485894 -9.88286050353797 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00896755924636517 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128612480_128612636:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128612480_128612636:TNPO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128614990 G/A 1 26 35 61 12.0934375353336 18.7203725485894 -6.62693501325585 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0958923813104294 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128614922_128615016:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128614922_128615016:TNPO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 12 14 26 5.58158655476934 7.48814901943577 -1.90656246466643 C:G G C 10 0.534867787102555 0.556321433383045 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 128845088 A/G 1 1 7 8 0.465132212897445 3.74407450971789 -3.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0290437193183312 ENSG00000128602:ENST00000249373:exon_128845044_128845253:SMO HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 22 22 44 10.2329086837438 11.7670913162562 -1.53418263251242 T:C T C 10 0.534867787102555 0.653525861955733 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 17 18 35 7.90724761925657 9.62762016784599 -1.72037254858942 T:C T C 10 0.534867787102555 0.613096775748172 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 1 644 2 646 299.545145105955 1.06973557420511 298.47540953175 T:C T C 10 0.534867787102555 4.94603940208739e-171 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 19 15 34 8.83751204505145 8.02301680653832 0.81449523851313 A:G G A 10 0.534867787102555 0.864211607646382 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 134 140 274 62.3277165282576 74.8814901943577 -12.5537736661001 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.130414890643941 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 78 90 168 36.2803126060007 48.1381008392299 -11.8577882332292 A:G G A 10 0.534867787102555 0.075023884832899 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134880884 G/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 C:G G C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134882884 G/A 1 63 52 115 29.303329412539 27.8131249293329 1.49020448320617 A:G G A 10 0.534867787102555 0.851801835170774 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134881796_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134882745_134882903:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134882697_134882903:WDR91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 51 52 103 23.7217428577697 27.8131249293329 -4.09138207156317 A:G G A 10 0.534867787102555 0.430855369875904 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 134890855 T/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:G T G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 135279315 A/C 1 25 29 54 11.6283053224361 15.5111658259741 -3.88286050353797 A:C A C 10 0.534867787102555 0.339846679833752 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 16 28 44 7.44211540635912 14.9762980388715 -7.53418263251242 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0238324788175709 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 18 22 40 8.37237983215401 11.7670913162562 -3.3947114841022 A:G G A 10 0.534867787102555 0.341868431890952 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 138739999 G/C 1 9 15 24 4.18618991607701 8.02301680653832 -3.83682689046132 C:G G C 10 0.534867787102555 0.151333526573415 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 14 6 20 6.51185098056423 3.20920672261533 3.3026442579489 C:G G C 10 0.534867787102555 0.179195747683729 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 140373326 A/G 1 15 21 36 6.97698319346167 11.2322235291537 -4.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.181853654210587 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 15 22 37 6.97698319346167 11.7670913162562 -4.79010812279453 T:C T C 10 0.534867787102555 0.137804477163093 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 140394587 C/T 1 29 29 58 13.4888341740259 15.5111658259741 -2.02233165194819 T:C C T 10 0.534867787102555 0.601403327934734 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140394463_140394921:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140394463_140394881:ADCK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 142334648 A/T 0 9 0 9 4.18618991607701 0 4.18618991607701 A A 10 0.534867787102555 0.00460179407563991 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 255 0 255 118.608714288848 0 118.608714288848 T T 10 0.534867787102555 7.17438262372132e-70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 143085819 G/A 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.372789766598658 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 149419635 T/G 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:G T G 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149419513_149419644:KRBA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 149430367 C/T 1 17 10 27 7.90724761925657 5.34867787102555 2.55856974823102 T:C C T 10 0.534867787102555 0.342606221663184 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150027763 A/G 1 6 16 22 2.79079327738467 8.55788459364088 -5.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0173741464387216 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150028098 A/G 1 33 31 64 15.3493630256157 16.5809014001792 -1.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.802681973476528 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 38 46 84 17.6750240901029 24.6039182067175 -6.92889411661462 T:C T C 10 0.534867787102555 0.154670107527526 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 36 34 70 16.744759664308 18.1855047614869 -1.44074509717885 A:G A G 10 0.534867787102555 0.810829708610313 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150163837 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 T:C T C 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150730998 C/T 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730825_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150731338 G/C 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 C:G G C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150731643 A/G 1 15 9 24 6.97698319346167 4.81381008392299 2.16317310953868 A:G A G 10 0.534867787102555 0.418782319234137 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466956:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150731360_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150731592_150731686:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150731592_150731684:ABCB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 12 21 33 5.58158655476934 11.2322235291537 -5.65063697438432 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0551457818594442 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 11 19 30 5.1164543418719 10.1624879549485 -5.04603361307665 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0692968054620869 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150761880 C/A 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:C C A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 59 60 119 27.4428005609493 32.0920672261533 -4.64926666520404 A:G G A 10 0.534867787102555 0.409140015399759 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150773072 G/C 1 8 15 23 3.72105770317956 8.02301680653832 -4.30195910335876 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0934089262926932 ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 126 124 250 58.6066588250781 66.3236056007168 -7.71694677563875 A:T A T 10 0.534867787102555 0.34187704567974 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 50 16 66 23.2566106448723 8.55788459364088 14.6987260512314 T:C C T 10 0.534867787102555 0.000280979952118545 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 60 28 88 27.9079327738467 14.9762980388715 12.9316347349752 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00719706279662669 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156469123 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156469190 A/G 1 10 2 12 4.65132212897445 1.06973557420511 3.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0440991500426111 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156518192 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000105983:ENST00000353442:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000316198:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000448926:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000415428:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000354505:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000359422:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000454132:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000461603:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000486837:exon_156518129_156518219:LMBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156518195 G/A 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000105983:ENST00000353442:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000316198:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000448926:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000415428:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000354505:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000359422:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000454132:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000461603:exon_156518129_156518219:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000486837:exon_156518129_156518219:LMBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156554830 T/C 1 10 1 11 4.65132212897445 0.534867787102555 4.1164543418719 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0138388269412908 ENSG00000105983:ENST00000353442:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000316198:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000448926:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000415428:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000354505:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000359422:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000454132:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000434503:exon_156554828_156554892:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000477983:exon_156554828_156554892:LMBR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 156742779 C/A 1 33 36 69 15.3493630256157 19.255240335692 -3.9058773100763 A:C C A 10 0.534867787102555 0.398470411907974 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 40 28 68 18.6052885158978 14.9762980388715 3.62899047702626 A:G G A 10 0.534867787102555 0.397154844237101 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 158590740 A/T 1 25 7 32 11.6283053224361 3.74407450971789 7.88423081271824 A:T A T 10 0.534867787102555 0.00686616368673225 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000483958:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000497111:exon_158590633_158590767:ESYT2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 196274 T/G 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:G T G 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000172748:ENST00000308811:exon_195154_197342:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000320552:exon_195197_196362:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000398612:exon_195154_197332:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000382859:exon_195154_197332:ZNF596 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 381410 A/G 1 15 19 34 6.97698319346167 10.1624879549485 -3.18550476148687 A:G A G 10 0.534867787102555 0.304658030947817 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6272399 G/T 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 T:G G T 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 18 28 46 8.37237983215401 14.9762980388715 -6.60391820671753 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0552189058412865 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 50 24 74 23.2566106448723 12.8368268904613 10.4197837544109 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0191561013516234 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 36 35 71 16.744759664308 18.7203725485894 -1.9756128842814 T:C C T 10 0.534867787102555 0.636769883381484 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 6 10 16 2.79079327738467 5.34867787102555 -2.55788459364088 A:C C A 10 0.534867787102555 0.219211710381975 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 74 80 154 34.4197837544109 42.7894229682044 -8.36963921379347 C:G C G 10 0.534867787102555 0.196106703071943 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 20 10 30 9.3026442579489 5.34867787102555 3.95396638692335 C:G G C 10 0.534867787102555 0.199468342313066 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 26 7 33 12.0934375353336 3.74407450971789 8.34936302561568 C:G G C 10 0.534867787102555 0.00446558743595473 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 25 6 31 11.6283053224361 3.20920672261533 8.4190985998208 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00324218582957753 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 25 6 31 11.6283053224361 3.20920672261533 8.4190985998208 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00324218582957753 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 11 24 35 5.1164543418719 12.8368268904613 -7.72037254858943 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0104389862295 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 11162496 A/C 1 5 7 12 2.32566106448723 3.74407450971789 -1.41841344523066 A:C A C 10 0.534867787102555 0.564977131081005 ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11162350_11162523:MTMR9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 51 85 136 23.7217428577697 45.4637619037172 -21.7420190459475 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000201068212087699 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 242 105 347 112.561995521182 56.1611176457683 56.4008778754134 T:C T C 10 0.534867787102555 8.54310788868581e-10 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 11418766 G/A 1 23 39 62 10.6980408966412 20.8598436969996 -10.1618028003584 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0106658991528949 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 45 25 70 20.930949580385 13.3716946775639 7.55925490282115 T:C C T 10 0.534867787102555 0.073114598537122 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 10 20 30 4.65132212897445 10.6973557420511 -6.04603361307665 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0287815121131482 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 18 13 31 8.37237983215401 6.95328123233322 1.41909859982079 T:C C T 10 0.534867787102555 0.719657099436856 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 93 86 179 43.2572957994624 45.9986296908197 -2.74133389135735 A:G A G 10 0.534867787102555 0.708204159253369 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 17 19 36 7.90724761925657 10.1624879549485 -2.25524033569198 A:G G A 10 0.534867787102555 0.505591504798501 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 17 39 56 7.90724761925657 20.8598436969996 -12.9525960777431 C:G C G 10 0.534867787102555 0.000670780913139387 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21833965 C/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21833867_21834032:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21833867_21834032:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518017:exon_21833867_21834013:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21833867_21834032:XPO7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21955116 C/T 1 23 18 41 10.6980408966412 9.62762016784599 1.07042072879524 T:C C T 10 0.534867787102555 0.75709320191078 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955077_21955350:FAM160B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21956108 A/G 1 18 18 36 8.37237983215401 9.62762016784599 -1.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.739410883730553 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21955985_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21956057_21956130:FAM160B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21959638 A/G 1 21 12 33 9.76777647084634 6.41841344523066 3.34936302561568 A:G A G 10 0.534867787102555 0.295875352800468 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21959639 C/T 1 23 10 33 10.6980408966412 5.34867787102555 5.34936302561568 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0797982604402267 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 13 15 28 6.04671876766678 8.02301680653832 -1.97629803887154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.457008833838827 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21965372 C/T 1 28 35 63 13.0237019611285 18.7203725485894 -5.69667058746096 T:C C T 10 0.534867787102555 0.165368594487974 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 31 32 63 14.4190985998208 17.1157691872818 -2.69667058746096 A:T A T 10 0.534867787102555 0.529028456616675 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22106739 C/T 1 35 32 67 16.2796274514106 17.1157691872818 -0.836141735871184 T:C C T 10 0.534867787102555 0.902695490039415 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22106557_22106822:POLR3D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22262321 T/C 1 21 7 28 9.76777647084634 3.74407450971789 6.02370196112846 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0232862043608718 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22262379 C/T 1 14 5 19 6.51185098056423 2.67433893551277 3.83751204505145 T:C C T 10 0.534867787102555 0.106005801047133 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22262418 A/G 1 18 9 27 8.37237983215401 4.81381008392299 3.55856974823102 A:G A G 10 0.534867787102555 0.18250118711251 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22472344 C/T 1 18 6 24 8.37237983215401 3.20920672261533 5.16317310953868 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0402244391024662 ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22473224 T/C 1 88 84 172 40.9316347349752 44.9288941166146 -3.99725938163946 T:C T C 10 0.534867787102555 0.542050011617555 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22473281 C/G 1 90 100 190 41.8618991607701 53.4867787102555 -11.6248795494854 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0946137818380769 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22473465 T/C 1 11 2 13 5.1164543418719 1.06973557420511 4.04671876766679 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0265849870648711 ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22473520 A/G 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22584718 T/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000134020:ENST00000256404:exon_22584688_22584733:PEBP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 106 82 188 49.3040145671292 43.8591585424095 5.44485602471966 A:G G A 10 0.534867787102555 0.464838132976361 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 24 21 45 11.1631731095387 11.2322235291537 -0.0690504196149764 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 32 15 47 14.8842308127182 8.02301680653832 6.86121400617992 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0563240817122912 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 24 12 36 11.1631731095387 6.41841344523066 4.74475966430802 A:G G A 10 0.534867787102555 0.133045425937367 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 30 23 53 13.9539663869233 12.3019591033588 1.65200728356458 T:C T C 10 0.534867787102555 0.681584237391025 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 36 24 60 16.744759664308 12.8368268904613 3.9079327738467 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.365329890841620 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 25364811 A/G 1 30 24 54 13.9539663869233 12.8368268904613 1.11713949646203 A:G A G 10 0.534867787102555 0.786622504714958 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 130 56 186 60.4671876766678 29.9525960777431 30.5145915989248 A:G A G 10 0.534867787102555 6.19042496019781e-06 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 111 50 161 51.6296756316164 26.7433893551277 24.8862862764886 T:C T C 10 0.534867787102555 7.17892981039528e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 95 47 142 44.1875602252573 25.1387859938201 19.0487742314372 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00133524571631814 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 152 114 266 70.7000963604116 60.9749277296913 9.72516863072036 A:G A G 10 0.534867787102555 0.243135194959057 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 51 54 105 23.7217428577697 28.882860503538 -5.16111764576828 A:G G A 10 0.534867787102555 0.328863654169167 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 153 116 269 71.1652285733091 62.0446633038964 9.1205652694127 A:C:G C G 10 0.534867787102555 0.271802837026479 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27308961 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 20 12 32 9.3026442579489 6.41841344523066 2.88423081271824 A:C A C 10 0.534867787102555 0.376491222425149 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 10 18 28 4.65132212897445 9.62762016784599 -4.97629803887154 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0863582676468199 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 18 28 46 8.37237983215401 14.9762980388715 -6.60391820671753 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0552189058412865 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 28286885 C/T 1 4 6 10 1.86052885158978 3.20920672261533 -1.34867787102555 T:C C T 10 0.534867787102555 0.529686062624994 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 28717051 T/C 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:C T C 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000104299:ENST00000523303:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521022:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000416984:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000397363:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521777:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000520983:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000523436:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000518510:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000524081:exon_28716953_28717063:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000520184:exon_28716953_28717080:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000520831:exon_28716953_28717080:INTS9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 29197763 G/A 1 17 14 31 7.90724761925657 7.48814901943577 0.419098599820795 A:T:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 29203061 G/A 1 29 15 44 13.4888341740259 8.02301680653832 5.46581736748758 A:G G A 10 0.534867787102555 0.129809414676413 ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29202887_29203591:DUSP4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 30541641 C/G 1 46 30 76 21.3960817932825 16.0460336130766 5.35004818020582 C:G C G 10 0.534867787102555 0.250382805714957 ENSG00000104687:ENST00000221130:exon_30541605_30541716:GSR;ENSG00000104687:ENST00000414019:exon_30541605_30541716:GSR;ENSG00000104687:ENST00000523295:exon_30541605_30541716:GSR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 C:G G C 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 11 14 25 5.1164543418719 7.48814901943577 -2.37169467756387 A:G G A 10 0.534867787102555 0.423555272597334 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 41 21 62 19.0704207287952 11.2322235291537 7.83819719964159 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0554760900762017 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 23 13 36 10.6980408966412 6.95328123233322 3.74475966430802 T:C T C 10 0.534867787102555 0.243786640606121 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 23 12 35 10.6980408966412 6.41841344523066 4.27962745141057 A:G A G 10 0.534867787102555 0.175746877249596 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33408901 C/G 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 C:G C G 10 0.534867787102555 0.130339312190040 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33408862_33408907:RNF122 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 33416189 G/A 1 5 8 13 2.32566106448723 4.27894229682044 -1.95328123233321 A:G G A 10 0.534867787102555 0.405445014430087 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 37730456 G/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:G G T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 26 15 41 12.0934375353336 8.02301680653832 4.07042072879524 T:C C T 10 0.534867787102555 0.214342950952987 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 114 1 115 53.0250722703087 0.534867787102555 52.4902044832062 A:T T A 10 0.534867787102555 7.55456124644259e-30 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 59498614 A/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 59510044 T/A 1 29 32 61 13.4888341740259 17.1157691872818 -3.62693501325585 A:T T A 10 0.534867787102555 0.370965362889193 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59509962_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59510032_59510109:NSMAF HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 31 25 56 14.4190985998208 13.3716946775639 1.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.790777918729491 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 46 49 95 21.3960817932825 26.2085215680252 -4.81243977474272 T:C:G G T 10 0.534867787102555 0.354961082629957 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 13 16 29 6.04671876766678 8.55788459364088 -2.5111658259741 A:G G A 10 0.534867787102555 0.359273405953985 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 14 7 21 6.51185098056423 3.74407450971789 2.76777647084634 A:G G A 10 0.534867787102555 0.276708886024608 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 74204653 A/T 1 11 10 21 5.1164543418719 5.34867787102555 -0.232223529153655 A:T A T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 74893419 C/G 1 121 105 226 56.2809977605908 56.1611176457683 0.119880114822564 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 106 86 192 49.3040145671292 45.9986296908197 3.30538487630944 A:G A G 10 0.534867787102555 0.664517360793105 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 44 78 122 20.4658173674876 41.7196873939993 -21.2538700265117 C:G C G 10 0.534867787102555 0.000123528896711726 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 24 27 51 11.1631731095387 14.441430251769 -3.27825714223031 A:G G A 10 0.534867787102555 0.400593151212235 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 63 41 104 29.303329412539 21.9295792712048 7.37375014133428 A:C A C 10 0.534867787102555 0.168619384340095 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 59 38 97 27.4428005609493 20.3249759098971 7.11782465105216 T:C C T 10 0.534867787102555 0.155124040888480 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 94746698 G/T 1 26 14 40 12.0934375353336 7.48814901943577 4.6052885158978 T:G G T 10 0.534867787102555 0.156259714967946 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 95416309 T/A 1 11 3 14 5.1164543418719 1.60460336130767 3.51185098056423 A:T T A 10 0.534867787102555 0.0657321023808686 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95416305_95416467:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95416305_95416467:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95416305_95416467:RAD54B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 16 9 25 7.44211540635912 4.81381008392299 2.62830532243613 A:G A G 10 0.534867787102555 0.32219626972529 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 23 14 37 10.6980408966412 7.48814901943577 3.20989187720546 A:G A G 10 0.534867787102555 0.325376528826404 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 10 14 24 4.65132212897445 7.48814901943577 -2.83682689046132 T:C T C 10 0.534867787102555 0.307011758512706 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 16 21 37 7.44211540635912 11.2322235291537 -3.79010812279454 T:C C T 10 0.534867787102555 0.249243671719291 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 99234772 T/G 1 6 12 18 2.79079327738467 6.41841344523066 -3.62762016784599 T:G T G 10 0.534867787102555 0.100590424051042 ENSG00000104361:ENST00000430223:exon_99234707_99234828:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000341166:exon_99234707_99234828:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000520545:exon_99234707_99234828:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000522188:exon_99234707_99234828:NIPAL2;ENSG00000104361:ENST00000520735:exon_99234707_99234828:NIPAL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 100844758 T/C 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000132549:ENST00000357162:exon_100844597_100844880:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000358544:exon_100844597_100844880:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000395996:exon_100844597_100844880:VPS13B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 101153024 G/A 1 3 11 14 1.39539663869233 5.8835456581281 -4.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.028188018724604 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 102213785 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000120963:ENST00000519916:exon_102213448_102213971:ZNF706 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 103298802 T/C 1 43 36 79 20.0006851545901 19.255240335692 0.745444818898154 T:C T C 10 0.534867787102555 0.91048399196757 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103298588_103298845:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103298588_103298845:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103298588_103298845:UBR5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 104337096 A/G 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 G A G 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 104343686 G/A 1 2 8 10 0.93026442579489 4.27894229682044 -3.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0527097349518558 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104343569_104345045:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104343569_104345094:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104343569_104344222:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104343569_104345087:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104343569_104344120:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104343569_104344014:FZD6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 104427359 A/C 1 12 4 16 5.58158655476934 2.13947114841022 3.44211540635912 A:C A C 10 0.534867787102555 0.130339312190040 ENSG00000164933:ENST00000521645:exon_104427012_104427417:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523256:exon_104427012_104427399:SLC25A32;ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104426942_104427744:DCAF13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 104427541 C/T 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C C T 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104426942_104427744:DCAF13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 44 39 83 20.4658173674876 20.8598436969996 -0.394026329512062 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 A:G G A 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 10 26 36 4.65132212897445 13.9065624646664 -9.25524033569198 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00228799059588818 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 4 11 15 1.86052885158978 5.8835456581281 -4.02301680653832 T:G T G 10 0.534867787102555 0.0412295141843521 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 103 110 213 47.9086179284368 58.8354565812811 -10.9268386528442 A:G A G 10 0.534867787102555 0.149026533657173 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 119964052 G/C 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000164761:ENST00000297350:exon_119964031_119964439:TNFRSF11B;ENSG00000164761:ENST00000517352:exon_119964031_119964122:TNFRSF11B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 32 23 55 14.8842308127182 12.3019591033588 2.58227170935947 A:G G A 10 0.534867787102555 0.502601554770959 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 13 21 34 6.04671876766678 11.2322235291537 -5.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0858942177157192 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 29 14 43 13.4888341740259 7.48814901943577 6.00068515459014 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0684755018498675 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 97 78 175 45.1178246510522 41.7196873939993 3.39813725705288 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.649540233391586 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 76 132 208 35.3500481802058 70.6025478975373 -35.2524997173314 T:G G T 10 0.534867787102555 9.59615931620695e-07 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 19 11 30 8.83751204505145 5.8835456581281 2.95396638692335 A:G A G 10 0.534867787102555 0.360554133907767 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:G A G 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 135614972 A/G 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135613720_135615176:ZFAT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 A:G G A 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 21 13 34 9.76777647084634 6.95328123233322 2.81449523851313 A:G A G 10 0.534867787102555 0.391595923439878 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 9 8 17 4.18618991607701 4.27894229682044 -0.0927523807434349 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 A:G G A 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 12 6 18 5.58158655476934 3.20920672261533 2.37237983215401 T:C C T 10 0.534867787102555 0.346212916398142 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 29 16 45 13.4888341740259 8.55788459364088 4.93094958038503 A:G G A 10 0.534867787102555 0.178130075050817 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141582971 G/C 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141582911_141583031:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141582911_141583031:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141582911_141583031:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000517293:exon_141582911_141583031:EIF2C2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 141727724 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000169398:ENST00000522684:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519654:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519465:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000517887:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521059:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395218:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000354438:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395214:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395221:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000523539:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000340930:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519993:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519419:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000524202:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000430260:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521986:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000522424:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521562:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521250:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000523388:exon_141727697_141728147:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521981:exon_141727697_141727808:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521029:exon_141727697_141727808:PTK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 142202664 G/T 1 77 86 163 35.8151803931033 45.9986296908197 -10.1834492977165 T:G G T 10 0.534867787102555 0.116490653423072 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142202625_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142202625_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142202625_142203017:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142202625_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142202625_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142202625_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523530:exon_142202625_142203000:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142201373_142202762:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520725:exon_142202625_142203169:DENND3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143425354 C/T 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.298597855982487 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143425327_143425833:TSNARE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143425406 C/T 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C C T 10 0.534867787102555 0.35564025242651 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143425327_143425833:TSNARE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143425553 C/T 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 T:C C T 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143425327_143425833:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143425327_143425833:TSNARE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143427178 C/G 1 6 3 9 2.79079327738467 1.60460336130767 1.186189916077 C:G C G 10 0.534867787102555 0.517317017227099 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143427104_143427253:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143427104_143427253:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143427104_143427253:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143427104_143427253:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143427104_143427253:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143427104_143427253:TSNARE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143436034 A/G 1 3 12 15 1.39539663869233 6.41841344523066 -5.02301680653833 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0165998200537799 ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520462:exon_143435998_143436124:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000518720:exon_143435998_143436124:TSNARE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143746050 C/T 1 14 17 31 6.51185098056423 9.09275238074344 -2.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.373013327758721 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143746069 T/C 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593378477042381 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 143747271 C/G 1 5 11 16 2.32566106448723 5.8835456581281 -3.55788459364088 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0836374310792754 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144102747 C/T 1 499 415 914 232.100974235825 221.97013164756 10.1308425882647 T:C C T 10 0.534867787102555 0.507400333484005 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520531:exon_144102731_144103057:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000523847:exon_144102731_144102850:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102731_144102850:LY6E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144332082 T/C 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000181638:ENST00000520584:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000330701:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144331860_144333510:ZFP41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144332449 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000181638:ENST00000520584:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000330701:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144331860_144333510:ZFP41 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 28 14 42 13.0237019611285 7.48814901943577 5.53555294169269 T:C C T 10 0.534867787102555 0.090984219274235 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 30 67 97 13.9539663869233 35.8361417358712 -21.8821753489478 A:G G A 10 0.534867787102555 8.9699038810371e-06 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144378184 C/G 1 8 9 17 3.72105770317956 4.81381008392299 -1.09275238074343 C:G C G 10 0.534867787102555 0.633644945334357 ENSG00000185730:ENST00000518575:exon_144377910_144378457:ZNF696;ENSG00000185730:ENST00000330143:exon_144377910_144380231:ZNF696 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 23 17 40 10.6980408966412 9.09275238074344 1.6052885158978 A:G G A 10 0.534867787102555 0.638038577575428 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 C:G G C 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 T:C C T 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 T:C T C 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 27 14 41 12.558569748231 7.48814901943577 5.07042072879524 A:C C A 10 0.534867787102555 0.11980753059124 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 21 15 36 9.76777647084634 8.02301680653832 1.74475966430802 T:G T G 10 0.534867787102555 0.618444526994758 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144623574 T/C 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C T C 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144623546_144623623:ZC3H3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 36 33 69 16.744759664308 17.6506369743843 -0.905877310076296 A:G G A 10 0.534867787102555 0.904068302007901 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144650925 A/T 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 A:T A T 10 0.534867787102555 0.283655371776667 ENSG00000204839:ENST00000533210:exon_144649956_144650927:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000524906:exon_144650722_144651024:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000534459:exon_144650722_144651057:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000533083:exon_144650722_144651013:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000532862:exon_144650722_144651030:C8orf73 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 55 29 84 25.5822717093595 15.5111658259741 10.0711058833854 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0287358985017815 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 37 43 80 17.2098918772055 22.9993148454099 -5.7894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 0.217812075892500 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 35 22 57 16.2796274514106 11.7670913162562 4.51253613515437 A:G G A 10 0.534867787102555 0.288049673425525 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 768 745 1513 357.221539505238 398.476501391403 -41.2549618861657 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0345601437188925 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144688736 C/G 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 C:G C G 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144688637_144688789:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 65 64 129 30.2335938383339 34.2315383745635 -3.9979445362296 A:G A G 10 0.534867787102555 0.481800097347408 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144732450 G/A 1 16 12 28 7.44211540635912 6.41841344523066 1.02370196112846 A:G G A 10 0.534867787102555 0.850186493410356 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144893077 G/A 1 40 20 60 18.6052885158978 10.6973557420511 7.9079327738467 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0513623937389103 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 39 19 58 18.1401563030004 10.1624879549485 7.97766834805181 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0473822368097402 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 49 53 102 22.7914784319748 28.3479927164354 -5.55651428446061 A:G A G 10 0.534867787102555 0.276515508320754 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 79 81 160 36.7454448188982 43.324290755307 -6.5788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.30383713203101 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144991205 C/T 1 92 84 176 42.7921635865649 44.9288941166146 -2.13673053004968 T:C C T 10 0.534867787102555 0.762845614555104 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 56 53 109 26.0474039222569 28.3479927164354 -2.30058879417849 T:C T C 10 0.534867787102555 0.701257793162757 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 19 24 43 8.83751204505145 12.8368268904613 -3.99931484540987 T:C T C 10 0.534867787102555 0.225920813386530 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 46 41 87 21.3960817932825 21.9295792712048 -0.533497477922285 A:G A G 10 0.534867787102555 0.914857281947162 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 78 60 138 36.2803126060007 32.0920672261533 4.18824537984742 T:C C T 10 0.534867787102555 0.495682852697958 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 67 56 123 31.1638582641288 29.9525960777431 1.21126218638573 A:G A G 10 0.534867787102555 0.856878017155013 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144994566 G/A 1 70 93 163 32.5592549028212 49.7427042005376 -17.1834492977165 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00750247327779207 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 54 47 101 25.117139496462 25.1387859938201 -0.0216464973580557 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 47 39 86 21.8612140061799 20.8598436969996 1.00137030918027 A:G G A 10 0.534867787102555 0.914003718495864 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 36 48 84 16.744759664308 25.6736537809226 -8.92889411661462 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0623565485948617 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 64 62 126 29.7684616254365 33.1618028003584 -3.39334117492193 T:G T G 10 0.534867787102555 0.592283652867482 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 60 31 91 27.9079327738467 16.5809014001792 11.3270313736675 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.0203294873247677 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 48 29 77 22.3263462190774 15.5111658259741 6.81518039310326 T:C C T 10 0.534867787102555 0.137382826304835 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 39 25 64 18.1401563030004 13.3716946775639 4.76846162543648 T:C C T 10 0.534867787102555 0.260204106379335 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 55 17 72 25.5822717093595 9.09275238074344 16.489519328616 A:C A C 10 0.534867787102555 7.72082875853162e-05 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 41 21 62 19.0704207287952 11.2322235291537 7.83819719964159 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0554760900762017 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 42 23 65 19.5355529416927 12.3019591033588 7.23359383833392 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0815961067286517 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145001509 T/C 1 2 9 11 0.93026442579489 4.81381008392299 -3.8835456581281 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0298728806961029 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 40 47 87 18.6052885158978 25.1387859938201 -6.53349747792229 T:C C T 10 0.534867787102555 0.163982836084352 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 48 55 103 22.3263462190774 29.4177282906405 -7.09138207156317 A:G A G 10 0.534867787102555 0.167696241784364 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 22 33 55 10.2329086837438 17.6506369743843 -7.41772829064053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0575088695074937 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 18 11 29 8.37237983215401 5.8835456581281 2.48883417402591 A:G A G 10 0.534867787102555 0.457181512023349 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 88 85 173 40.9316347349752 45.4637619037172 -4.53212716874202 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.493828955956583 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 33 31 64 15.3493630256157 16.5809014001792 -1.23153837456352 A:G A G 10 0.534867787102555 0.802681973476528 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 66 75 141 30.6987260512314 40.1150840326916 -9.41635798146026 A:G A G 10 0.534867787102555 0.128348006415151 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 106 103 209 49.3040145671292 55.0913820715632 -5.78736750443399 A:G G A 10 0.534867787102555 0.445838532485256 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145066853 C/T 1 34 33 67 15.8144952385131 17.6506369743843 -1.83614173587119 T:C C T 10 0.534867787102555 0.713751992946081 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145603114 A/C 1 8 13 21 3.72105770317956 6.95328123233322 -3.23222352915366 A:C A C 10 0.534867787102555 0.190809482498995 ENSG00000173137:ENST00000534714:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000533715:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000532190:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526833:exon_145603076_145603179:ADCK5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145620296 C/G 1 14 13 27 6.51185098056423 6.95328123233322 -0.441430251768986 C:G C G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145622923 T/C 1 10 4 14 4.65132212897445 2.13947114841022 2.51185098056423 T:C T C 10 0.534867787102555 0.283655371776667 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145623098 T/C 1 7 3 10 3.25592549028211 1.60460336130767 1.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.35564025242651 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 58 49 107 26.9776683480518 26.2085215680252 0.769146780026617 A:G G A 10 0.534867787102555 0.92295856311374 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 26 17 43 12.0934375353336 9.09275238074344 3.00068515459013 A:G G A 10 0.534867787102555 0.445050822509516 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145663814 A/G 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 T:C C T 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 17 14 31 7.90724761925657 7.48814901943577 0.419098599820795 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145668042 G/A 1 6 11 17 2.79079327738467 5.8835456581281 -3.09275238074343 A:G G A 10 0.534867787102555 0.149954178119034 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145666101_145668239:NFKBIL2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145737286 G/A 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G G A 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737285_145737450:RECQL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 6 7 13 2.79079327738467 3.74407450971789 -0.953281232333215 A:G G A 10 0.534867787102555 0.782378955473899 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 36 36 72 16.744759664308 19.255240335692 -2.51048067138396 T:C C T 10 0.534867787102555 0.557323579245275 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 29 44 73 13.4888341740259 23.5341826325124 -10.0453484584865 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0190993343113842 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 35 31 66 16.2796274514106 16.5809014001792 -0.301273948768628 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145747920 T/G 1 13 17 30 6.04671876766678 9.09275238074344 -3.04603361307665 T:G T G 10 0.534867787102555 0.277867988592941 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 145947776 G/A 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 8 146032530 A/G 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:G A G 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000204752:ENST00000377296:exon_146032252_146032811:AF235103.1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 286593 C/A 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 A:C C A 10 0.534867787102555 0.117636617366408 ENSG00000107099:ENST00000469197:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000479404:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000487230:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_286461_286636:DOCK8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 C:G C G 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 48 44 92 22.3263462190774 23.5341826325124 -1.20783641343506 A:G G A 10 0.534867787102555 0.834805307512606 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 2837227 T/C 1 48 51 99 22.3263462190774 27.2782571422303 -4.95191092315295 T:C T C 10 0.534867787102555 0.364616894942415 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2837180_2837401:KIAA0020 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 1 10 11 0.465132212897445 5.34867787102555 -4.8835456581281 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0040341445028996 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 43 44 87 20.0006851545901 23.5341826325124 -3.53349747792229 A:G A G 10 0.534867787102555 0.454042228201068 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 5050706 C/T 0 0 11 11 0 5.8835456581281 -5.8835456581281 T C T 10 0.534867787102555 0.000220465478601318 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5050686_5050831:JAK2;ENSG00000096968:ENST00000472549:exon_5050686_5050831:JAK2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 5969307 C/T 1 12 21 33 5.58158655476934 11.2322235291537 -5.65063697438432 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0551457818594442 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6007551 T/C 1 18 21 39 8.37237983215401 11.2322235291537 -2.85984369699965 T:C T C 10 0.534867787102555 0.422874998565857 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 51 48 99 23.7217428577697 25.6736537809226 -1.95191092315295 A:C A C 10 0.534867787102555 0.762639788246265 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6012968 A/G 1 26 16 42 12.0934375353336 8.55788459364088 3.53555294169269 A:G A G 10 0.534867787102555 0.284163795398839 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 20 29 49 9.3026442579489 15.5111658259741 -6.20852156802519 T:C C T 10 0.534867787102555 0.085745524515006 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6984172 G/A 1 20 19 39 9.3026442579489 10.1624879549485 -0.859843696999645 A:G G A 10 0.534867787102555 0.872810586165431 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 22 15 37 10.2329086837438 8.02301680653832 2.20989187720547 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.512648936021927 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 8 4 12 3.72105770317956 2.13947114841022 1.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.401674823937556 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 7798518 G/C 1 184 166 350 85.5843271731299 88.7880526590241 -3.20372548589425 C:G G C 10 0.534867787102555 0.747981723730267 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 123 76 199 57.2112621863857 40.6499518197942 16.5613103665915 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0190011938652894 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 185 86 271 86.0494593860273 45.9986296908197 40.0508296952076 T:G G T 10 0.534867787102555 9.32816513897003e-07 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 17273731 A/G 1 2 6 8 0.93026442579489 3.20920672261533 -2.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 0.156760860097915 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17273731_17273864:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17273731_17273864:CNTLN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 20885204 A/G 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20885108_20885229:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20885108_20885229:KIAA1797 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 A:G A G 10 0.534867787102555 0.467707552599743 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 12 9 21 5.58158655476934 4.81381008392299 0.767776470846345 T:C T C 10 0.534867787102555 0.828643647029382 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 21854740 C/T 1 14 9 23 6.51185098056423 4.81381008392299 1.69804089664123 T:C C T 10 0.534867787102555 0.535462440174447 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21854630_21854869:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21854630_21854869:MTAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 21 18 39 9.76777647084634 9.62762016784599 0.140156303000355 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 A:G A G 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 27009100 T/C 1 4 7 11 1.86052885158978 3.74407450971789 -1.88354565812811 T:C T C 10 0.534867787102555 0.366253001737291 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_27009018_27009156:IFT74 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 27060616 C/T 1 13 14 27 6.04671876766678 7.48814901943577 -1.44143025176899 T:C C T 10 0.534867787102555 0.700408534294297 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27060589_27060649:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27060589_27060649:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27060589_27060649:IFT74 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 3 10 13 1.39539663869233 5.34867787102555 -3.95328123233321 T:G T G 10 0.534867787102555 0.047327890213025 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 32480251 A/T 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:T A T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32480217_32480352:DDX58 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 30 27 57 13.9539663869233 14.441430251769 -0.487463864845635 A:G A G 10 0.534867787102555 0.895352371638272 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 33290532 A/G 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 A:G A G 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33290509_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33290510_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33290510_33290595:NFX1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 35 31 66 16.2796274514106 16.5809014001792 -0.301273948768628 A:C A C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 26 20 46 12.0934375353336 10.6973557420511 1.39608179328247 T:C C T 10 0.534867787102555 0.768096535425017 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 35060746 A/G 1 26 29 55 12.0934375353336 15.5111658259741 -3.41772829064053 A:G A G 10 0.534867787102555 0.417652545684435 ENSG00000165280:ENST00000480327:exon_35060310_35060920:VCP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 35076755 G/A 1 18 24 42 8.37237983215401 12.8368268904613 -4.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.215445908779324 ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35076721_35076867:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35076721_35076867:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000474894:exon_35076721_35076849:FANCG HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 35077441 T/C 1 8 8 16 3.72105770317956 4.27894229682044 -0.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.806945941972106 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 35752124 G/A 1 20 23 43 9.3026442579489 12.3019591033588 -2.99931484540986 A:G G A 10 0.534867787102555 0.364203480464472 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35751953_35752142:RGP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 200 304 504 93.026442579489 162.599807279177 -69.5733646996877 A:T:C:G A G 10 0.534867787102555 5.72140183970306e-10 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 27 22 49 12.558569748231 11.7670913162562 0.791478431974806 T:G G T 10 0.534867787102555 0.886588645557311 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 26 26 52 12.0934375353336 13.9065624646664 -1.81312492933286 T:C C T 10 0.534867787102555 0.677331176291186 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 41 15 56 19.0704207287952 8.02301680653832 11.0474039222569 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00301317994171071 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 56 46 102 26.0474039222569 24.6039182067175 1.44348571553939 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.84279030222765 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37762141 G/A 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G G A 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 49 25 74 22.7914784319748 13.3716946775639 9.41978375441093 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.0352401181018295 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 44 11 55 20.4658173674876 5.8835456581281 14.5822717093595 A:G G A 10 0.534867787102555 6.21606837376277e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 21 15 36 9.76777647084634 8.02301680653832 1.74475966430802 T:C C T 10 0.534867787102555 0.618444526994758 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 29 33 62 13.4888341740259 17.6506369743843 -4.16180280035841 T:C C T 10 0.534867787102555 0.309974850223521 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 46 50 96 21.3960817932825 26.7433893551277 -5.34730756184528 T:C C T 10 0.534867787102555 0.306401643707705 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 15 15 30 6.97698319346167 8.02301680653832 -1.04603361307665 T:C T C 10 0.534867787102555 0.718154822973439 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 74360096 C/T 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 T:C C T 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000434022:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74359934_74360495:TMEM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 74360209 G/C 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G G C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000434022:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74359934_74360495:TMEM2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 46 50 96 21.3960817932825 26.7433893551277 -5.34730756184528 T:C C T 10 0.534867787102555 0.306401643707705 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 79933241 A/G 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79933151_79933507:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000493341:exon_79933151_79933507:VPS13A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 17 23 40 7.90724761925657 12.3019591033588 -4.3947114841022 C:G G C 10 0.534867787102555 0.204402284095363 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 16 0 16 7.44211540635912 0 7.44211540635912 G G 10 0.534867787102555 4.96684535967002e-05 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 36 25 61 16.744759664308 13.3716946775639 3.37306498674415 A:G G A 10 0.534867787102555 0.441858834708637 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 88651370 T/C 1 18 7 25 8.37237983215401 3.74407450971789 4.62830532243613 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0721485889991503 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 88959938 C/T 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C C T 10 0.534867787102555 0.731842787348388 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88959785_88960069:ZCCHC6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 53 36 89 24.6520072835646 19.255240335692 5.39676694787261 T:C C T 10 0.534867787102555 0.288078375659577 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 67 82 149 31.1638582641288 43.8591585424095 -12.6953002782807 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0399758504272650 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 113 186 299 52.5599400574113 99.4854084010752 -46.925468343664 A:G G A 10 0.534867787102555 5.64397892684644e-08 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 40 21 61 18.6052885158978 11.2322235291537 7.37306498674415 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0716131380318037 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 92003689 C/T 1 41 19 60 19.0704207287952 10.1624879549485 8.9079327738467 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0269785395306322 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 21 22 43 9.76777647084634 11.7670913162562 -1.99931484540986 T:C C T 10 0.534867787102555 0.545487574291049 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 22 32 54 10.2329086837438 17.1157691872818 -6.88286050353797 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0753266202915047 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 26 29 55 12.0934375353336 15.5111658259741 -3.41772829064053 A:G G A 10 0.534867787102555 0.417652545684435 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 22 17 39 10.2329086837438 9.09275238074344 1.14015630300035 T:C C T 10 0.534867787102555 0.750561214820388 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 27 29 56 12.558569748231 15.5111658259741 -2.95259607774308 T:C T C 10 0.534867787102555 0.503353984888101 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 94087622 T/G 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:G T G 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000148090:ENST00000375731:exon_94087600_94087686:AUH;ENSG00000148090:ENST00000422391:exon_94087600_94087686:AUH;ENSG00000148090:ENST00000478465:exon_94087600_94087686:AUH HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 94495608 T/C 0 0 9 9 0 4.81381008392299 -4.81381008392299 C T C 10 0.534867787102555 0.00101903185420343 ENSG00000169071:ENST00000375715:exon_94495404_94495718:ROR2;ENSG00000169071:ENST00000375710:exon_94495404_94495718:ROR2;ENSG00000169071:ENST00000375708:exon_94495404_94495718:ROR2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 95400370 G/A 1 15 8 23 6.97698319346167 4.27894229682044 2.69804089664123 A:G G A 10 0.534867787102555 0.300286638189599 ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95400283_95400562:IPPK HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 28 10 38 13.0237019611285 5.34867787102555 7.67502409010291 A:C C A 10 0.534867787102555 0.0140511961253635 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 29 37 66 13.4888341740259 19.7901081227945 -6.30127394876863 T:C T C 10 0.534867787102555 0.138512354987656 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 35 44 79 16.2796274514106 23.5341826325124 -7.25455518110184 T:C C T 10 0.534867787102555 0.114293013295456 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 98209594 G/A 1 6 5 11 2.79079327738467 2.67433893551277 0.116454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000185920:ENST00000375290:exon_98209194_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000430669:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000437951:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000331920:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000418258:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000375275:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000375284:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000421141:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000429896:exon_98209193_98209733:PTCH1;ENSG00000185920:ENST00000375274:exon_98209194_98209733:PTCH1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 98638288 A/G 1 7 15 22 3.25592549028211 8.02301680653832 -4.76709131625621 A:G A G 10 0.534867787102555 0.053173004707963 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98637983_98638366:C9orf102 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100201551 A/G 1 19 4 23 8.83751204505145 2.13947114841022 6.69804089664123 A:G A G 10 0.534867787102555 0.00556809910609563 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100201527_100201600:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100201527_100201600:TDRD7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100367810 G/A 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100367813 A/G 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100380093 T/C 1 10 2 12 4.65132212897445 1.06973557420511 3.58158655476934 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0440991500426111 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375163:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375171:exon_100380039_100380159:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000484708:exon_100380039_100380134:TSTD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 A:G G A 10 0.534867787102555 0.467707552599743 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100745902 A/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 A:G A G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 30 33 63 13.9539663869233 17.6506369743843 -3.69667058746097 T:G T G 10 0.534867787102555 0.377960048285944 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 57 58 115 26.5125361351544 31.0223316519482 -4.50979551679383 T:C T C 10 0.534867787102555 0.402035887418610 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 47 46 93 21.8612140061799 24.6039182067175 -2.74270420053762 C:G G C 10 0.534867787102555 0.603874339790345 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 16 7 23 7.44211540635912 3.74407450971789 3.69804089664123 T:C T C 10 0.534867787102555 0.145219966191261 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 21 18 39 9.76777647084634 9.62762016784599 0.140156303000355 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 103065884 C/T 1 3 6 9 1.39539663869233 3.20920672261533 -1.813810083923 T:C C T 10 0.534867787102555 0.319398149927548 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 20 22 42 9.3026442579489 11.7670913162562 -2.46444705830731 A:G G A 10 0.534867787102555 0.536612259953469 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 107533159 A/G 1 5 15 20 2.32566106448723 8.02301680653832 -5.6973557420511 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0127064683831530 ENSG00000165028:ENST00000374762:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B;ENSG00000165028:ENST00000461177:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 107535139 G/A 1 13 7 20 6.04671876766678 3.74407450971789 2.3026442579489 A:G G A 10 0.534867787102555 0.372789766598658 ENSG00000165028:ENST00000460936:exon_107535103_107535189:NIPSNAP3B;ENSG00000165028:ENST00000374762:exon_107535103_107535189:NIPSNAP3B;ENSG00000165028:ENST00000461177:exon_107535103_107535189:NIPSNAP3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 108366734 G/A 1 4 8 12 1.86052885158978 4.27894229682044 -2.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 0.246478148672503 ENSG00000106692:ENST00000223528:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000357998:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000374705:exon_108366496_108366773:FKTN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 7 7 14 3.25592549028211 3.74407450971789 -0.48814901943577 C:G C G 10 0.534867787102555 0.796302648602911 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 20 22 42 9.3026442579489 11.7670913162562 -2.46444705830731 C:G C G 10 0.534867787102555 0.536612259953469 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 111868885 G/A 1 2 9 11 0.93026442579489 4.81381008392299 -3.8835456581281 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0298728806961029 ENSG00000106771:ENST00000374587:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000374586:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000491854:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000223608:exon_111868788_111868889:C9orf5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 111881856 T/C 1 7 9 16 3.25592549028211 4.81381008392299 -1.55788459364088 T:C T C 10 0.534867787102555 0.462678051587108 ENSG00000106771:ENST00000374587:exon_111881615_111882225:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000374586:exon_111881615_111882225:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000223608:exon_111881615_111882225:C9orf5 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 548 531 1079 254.8924526678 284.014794951457 -29.1223422836568 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0767551302835342 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114125854 T/A 1 20 12 32 9.3026442579489 6.41841344523066 2.88423081271824 A:T T A 10 0.534867787102555 0.376491222425149 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 14 23 37 6.51185098056423 12.3019591033588 -5.79010812279454 T:C C T 10 0.534867787102555 0.069085953031393 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114174384 C/T 1 42 20 62 19.5355529416927 10.6973557420511 8.83819719964159 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0297128249145326 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 31 24 55 14.4190985998208 12.8368268904613 1.58227170935947 T:C:G C T 10 0.534867787102555 0.687666146215246 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114184259 G/C 1 15 14 29 6.97698319346167 7.48814901943577 -0.511165825974095 C:G G C 10 0.534867787102555 0.854763616019835 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184201_114184323:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184201_114184323:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 35 15 50 16.2796274514106 8.02301680653832 8.25661064487225 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0226010026560296 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114190337 G/A 1 10 16 26 4.65132212897445 8.55788459364088 -3.90656246466643 A:G G A 10 0.534867787102555 0.167762406474111 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114190322_114190441:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114190322_114190441:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114195587 G/A 1 24 19 43 11.1631731095387 10.1624879549485 1.00068515459013 A:G G A 10 0.534867787102555 0.87873815611304 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114195513_114195652:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114195513_114195652:KIAA0368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 85 63 148 39.5362380962828 33.696670587461 5.83956750882186 T:C T C 10 0.534867787102555 0.364992977069678 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 97 60 157 45.1178246510522 32.0920672261533 13.0257574248989 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0376918194025624 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 115925104 C/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C C T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000136867:ENST00000259392:exon_115925029_115926417:SLC31A2;ENSG00000136867:ENST00000374220:exon_115925029_115926417:SLC31A2;ENSG00000136867:ENST00000394724:exon_115925029_115926421:SLC31A2;ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115923286_115928435:FKBP15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 26 25 51 12.0934375353336 13.3716946775639 -1.27825714223031 A:G A G 10 0.534867787102555 0.779531003528971 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 37 37 74 17.2098918772055 19.7901081227945 -2.58021624558907 T:C C T 10 0.534867787102555 0.562010524946188 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 117071744 A/G 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196739:ENST00000356083:exon_117071540_117071758:COL27A1;ENSG00000196739:ENST00000357257:exon_117071540_117071758:COL27A1;ENSG00000196739:ENST00000426060:exon_117071540_117071758:COL27A1;ENSG00000196739:ENST00000494090:exon_117071540_117071758:COL27A1;ENSG00000196739:ENST00000468565:exon_117071540_117071758:COL27A1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 18 16 34 8.37237983215401 8.55788459364088 -0.18550476148687 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 15 5 20 6.97698319346167 2.67433893551277 4.3026442579489 A:T:G A G 10 0.534867787102555 0.0713311474979913 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 C:G C G 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 13 19 32 6.04671876766678 10.1624879549485 -4.11576918728176 T:G T G 10 0.534867787102555 0.158813183030461 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123538346 G/T 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 T:G G T 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 447 469 916 207.914099165158 250.852992151098 -42.9388929859404 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.00484689574964055 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 123676482 T/C 1 8 2 10 3.72105770317956 1.06973557420511 2.65132212897445 T:C T C 10 0.534867787102555 0.117923142331755 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 62 84 146 28.8381971996416 44.9288941166146 -16.090696916973 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00789691338365737 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 125143792 C/A 0 0 8 8 0 4.27894229682044 -4.27894229682044 A C A 10 0.534867787102555 0.00219084343321564 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125143650_125143831:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000426608:exon_125143775_125143831:PTGS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 16 13 29 7.44211540635912 6.95328123233322 0.488834174025905 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 T:G T G 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 18 20 38 8.37237983215401 10.6973557420511 -2.32497590989709 A:G G A 10 0.534867787102555 0.516394360344558 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 129595667 C/T 1 13 21 34 6.04671876766678 11.2322235291537 -5.18550476148687 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0858942177157192 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 11 4 15 5.1164543418719 2.13947114841022 2.97698319346168 T:C C T 10 0.534867787102555 0.194126160849861 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 19 10 29 8.83751204505145 5.34867787102555 3.4888341740259 T:C C T 10 0.534867787102555 0.263759775649781 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 A:G A G 10 0.534867787102555 0.816289814725156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 45 23 68 20.930949580385 12.3019591033588 8.62899047702626 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.0387137591959072 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131028226 G/A 1 16 10 26 7.44211540635912 5.34867787102555 2.09343753533357 A:G G A 10 0.534867787102555 0.438858491316679 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131196695 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131247176 C/T 1 9 9 18 4.18618991607701 4.81381008392299 -0.62762016784599 T:C C T 10 0.534867787102555 0.816289814725156 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 25 27 52 11.6283053224361 14.441430251769 -2.81312492933286 A:G A G 10 0.534867787102555 0.487790903152005 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 31 31 62 14.4190985998208 16.5809014001792 -2.16180280035841 T:C C T 10 0.534867787102555 0.612012488897638 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 66 134 200 30.6987260512314 71.6722834717424 -40.973557420511 T:C C T 10 0.534867787102555 6.10841640034234e-09 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131396520 C/T 1 94 78 172 43.7224280123598 41.7196873939993 2.00274061836054 T:C C T 10 0.534867787102555 0.818713919717523 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131396505_131396662:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131396505_131396662:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131397476 G/A 1 57 25 82 26.5125361351544 13.3716946775639 13.1408414575905 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.00380349368140802 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 52 24 76 24.1868750706671 12.8368268904613 11.3500481802058 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.0109452015320426 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131398540 G/A 0 27 0 27 12.558569748231 0 12.558569748231 G G 10 0.534867787102555 7.99018552162035e-08 ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 25 45 70 11.6283053224361 24.069050419615 -12.4407450971788 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00372703277277784 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 50 38 88 23.2566106448723 20.3249759098971 2.93163473497516 A:G A G 10 0.534867787102555 0.593465191138135 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 24 22 46 11.1631731095387 11.7670913162562 -0.60391820671753 T:C T C 10 0.534867787102555 0.883360419729026 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 16 11 27 7.44211540635912 5.8835456581281 1.55856974823102 T:C T C 10 0.534867787102555 0.569921389292835 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 18 13 31 8.37237983215401 6.95328123233322 1.41909859982079 A:G G A 10 0.534867787102555 0.719657099436856 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 29 37 66 13.4888341740259 19.7901081227945 -6.30127394876863 C:G G C 10 0.534867787102555 0.138512354987656 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 10 8 18 4.65132212897445 4.27894229682044 0.37237983215401 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131804785 T/C 1 13 18 31 6.04671876766678 9.62762016784599 -3.58090140017921 T:C T C 10 0.534867787102555 0.211610157714882 ENSG00000148343:ENST00000474534:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000450073:exon_131804583_131804785:FAM73B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 131846957 T/C 1 4 4 8 1.86052885158978 2.13947114841022 -0.27894229682044 T:C T C 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000480255:exon_131846878_131847047:DOLPP1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 129 152 281 60.0020554637704 81.2999036395884 -21.297848175818 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0119171809391312 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 132620379 C/G 1 5 6 11 2.32566106448723 3.20920672261533 -0.883545658128105 C:G C G 10 0.534867787102555 0.76449359563304 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000494971:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132620329_132620391:USP20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 15 16 31 6.97698319346167 8.55788459364088 -1.58090140017921 T:C C T 10 0.534867787102555 0.593378477042381 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 133346226 C/T 1 11 15 26 5.1164543418719 8.02301680653832 -2.90656246466643 T:C C T 10 0.534867787102555 0.32589355434797 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 133760617 C/T 1 43 47 90 20.0006851545901 25.1387859938201 -5.13810083922995 T:C C T 10 0.534867787102555 0.291849310478259 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 36 40 76 16.744759664308 21.3947114841022 -4.64995181979418 A:G A G 10 0.534867787102555 0.302045107796643 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 13 15 28 6.04671876766678 8.02301680653832 -1.97629803887154 T:C C T 10 0.534867787102555 0.457008833838827 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 13 12 25 6.04671876766678 6.41841344523066 -0.371694677563876 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 80 89 169 37.2105770317956 47.6032330521274 -10.3926560203318 A:T:C C T 10 0.534867787102555 0.122806212017684 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 75 58 133 34.8849159673084 31.0223316519482 3.86258431536018 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.54321202213361 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 52 56 108 24.1868750706671 29.9525960777431 -5.76572100707594 T:C T C 10 0.534867787102555 0.289015901239097 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135150616 T/C 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 T:C T C 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000107290:ENST00000464133:exon_135150310_135150807:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135158619 A/T 1 3 5 8 1.39539663869233 2.67433893551277 -1.27894229682044 A:T A T 10 0.534867787102555 0.485153951874109 ENSG00000107290:ENST00000474172:exon_135158157_135158800:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 16 17 33 7.44211540635912 9.09275238074344 -1.65063697438432 A:G A G 10 0.534867787102555 0.603495869880734 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 26 24 50 12.0934375353336 12.8368268904613 -0.743389355127752 T:C T C 10 0.534867787102555 0.88766651817951 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 35 21 56 16.2796274514106 11.2322235291537 5.04740392225692 T:C T C 10 0.534867787102555 0.183279253968275 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 36 37 73 16.744759664308 19.7901081227945 -3.04534845848652 T:C C T 10 0.534867787102555 0.483874566234905 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 31 43 74 14.4190985998208 22.9993148454099 -8.58021624558907 A:C A C 10 0.534867787102555 0.0479695117010734 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 30 33 63 13.9539663869233 17.6506369743843 -3.69667058746097 A:G G A 10 0.534867787102555 0.377960048285944 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 17 19 36 7.90724761925657 10.1624879549485 -2.25524033569198 A:G A G 10 0.534867787102555 0.505591504798501 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 13 17 30 6.04671876766678 9.09275238074344 -3.04603361307665 C:G C G 10 0.534867787102555 0.277867988592941 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135277301 A/G 1 28 30 58 13.0237019611285 16.0460336130766 -3.02233165194819 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.433122346217458 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 26 30 56 12.0934375353336 16.0460336130766 -3.95259607774308 A:C C A 10 0.534867787102555 0.348496632513094 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 31 26 57 14.4190985998208 13.9065624646664 0.512536135154365 C:G C G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 27 21 48 12.558569748231 11.2322235291537 1.32634621907736 T:C T C 10 0.534867787102555 0.773042008197412 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135781239 A/G 1 14 16 30 6.51185098056423 8.55788459364088 -2.04603361307665 A:G A G 10 0.534867787102555 0.470026628362640 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135780968_135781526:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135780968_135781526:TSC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 135976976 C/T 1 37 32 69 17.2098918772055 17.1157691872818 0.0941226899237044 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975883_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135976907_135977301:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135976686_135977526:RALGDS HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136037742 G/A 1 4 5 9 1.86052885158978 2.67433893551277 -0.813810083922995 A:G G A 10 0.534867787102555 0.741828421132198 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372038:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372036:exon_136037729_136037919:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000487864:exon_136037729_136037919:GBGT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 83 49 132 38.6059736704879 26.2085215680252 12.3974521024627 A:T:G G A 10 0.534867787102555 0.0358738038951182 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 64 46 110 29.7684616254365 24.6039182067175 5.16454341871895 A:G G A 10 0.534867787102555 0.340346412653039 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 13 22 35 6.04671876766678 11.7670913162562 -5.72037254858942 T:C T C 10 0.534867787102555 0.0619967772189013 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136219448 C/G 1 84 66 150 39.0711058833854 35.3012739487686 3.76983193461675 C:G C G 10 0.534867787102555 0.567179789010424 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219301_136219463:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219301_136219463:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136219301_136219463:SURF1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 59 48 107 27.4428005609493 25.6736537809226 1.76914678002661 A:G A G 10 0.534867787102555 0.771707341780701 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 7 5 12 3.25592549028211 2.67433893551277 0.58158655476934 A:C C A 10 0.534867787102555 0.78091676997055 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136907005 G/A 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G G A 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136913355 T/C 1 5 9 14 2.32566106448723 4.81381008392299 -2.48814901943577 T:C T C 10 0.534867787102555 0.193870291020876 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 136915508 C/T 1 9 12 21 4.18618991607701 6.41841344523066 -2.23222352915366 T:C C T 10 0.534867787102555 0.384697735469175 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136915496_136915549:BRD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138376649 T/C 1 10 5 15 4.65132212897445 2.67433893551277 1.97698319346168 T:C T C 10 0.534867787102555 0.438830154815433 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649;ENSG00000196422:ENST00000401470:exon_138376295_138376681:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138376972 A/G 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 A:G A G 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138377657 T/C 1 10 7 17 4.65132212897445 3.74407450971789 0.907247619256565 T:C T C 10 0.534867787102555 0.80918421990889 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138377738 C/T 1 7 6 13 3.25592549028211 3.20920672261533 0.0467187676667846 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138377853 A/G 1 11 6 17 5.1164543418719 3.20920672261533 1.90724761925657 A:G A G 10 0.534867787102555 0.467707552599743 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138378856 A/G 1 8 11 19 3.72105770317956 5.8835456581281 -2.16248795494854 A:G A G 10 0.534867787102555 0.3628970889895 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138379059 G/T 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 T:G G T 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 153 180 333 71.1652285733091 96.2762016784599 -25.1109731051508 A:T:C:G A G 10 0.534867787102555 0.00599654700879745 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 25 23 48 11.6283053224361 12.3019591033588 -0.67365378092264 T:C T C 10 0.534867787102555 0.885551033472128 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139110654 C/T 1 14 12 26 6.51185098056423 6.41841344523066 0.0934375353335692 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139110525_139110654:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000455222:exon_139110525_139110654:QSOX2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139256468 C/G 1 25 36 61 11.6283053224361 19.255240335692 -7.62693501325585 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0544546824811481 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139256541 C/T 1 20 21 41 9.3026442579489 11.2322235291537 -1.92957927120476 T:C C T 10 0.534867787102555 0.639159703203119 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139266405 G/A 1 17 18 35 7.90724761925657 9.62762016784599 -1.72037254858942 A:G G A 10 0.534867787102555 0.613096775748172 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139266496 C/T 1 22 7 29 10.2329086837438 3.74407450971789 6.48883417402591 T:C C T 10 0.534867787102555 0.015689361637975 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 16 14 30 7.44211540635912 7.48814901943577 -0.0460336130766503 T:C C T 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 79 63 142 36.7454448188982 33.696670587461 3.04877423143719 A:G A G 10 0.534867787102555 0.61506140383627 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 45 44 89 20.930949580385 23.5341826325124 -2.60323305212739 A:T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.596560919537665 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 40 44 84 18.6052885158978 23.5341826325124 -4.92889411661462 T:C C T 10 0.534867787102555 0.324967471349038 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 69 50 119 32.0941226899237 26.7433893551277 5.35073333479596 T:C C T 10 0.534867787102555 0.358424674341822 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 26 19 45 12.0934375353336 10.1624879549485 1.93094958038502 A:C A C 10 0.534867787102555 0.654567694556077 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 22 18 40 10.2329086837438 9.62762016784599 0.605288515897801 C:G G C 10 0.534867787102555 0.875452855759996 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 51 22 73 23.7217428577697 11.7670913162562 11.9546515415135 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00479998412112061 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139279179 A/G 1 46 25 71 21.3960817932825 13.3716946775639 8.02438711571859 A:G A G 10 0.534867787102555 0.057753915855298 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 35 26 61 16.2796274514106 13.9065624646664 2.37306498674415 A:G A G 10 0.534867787102555 0.608332984353393 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139290230 C/G 1 5 4 9 2.32566106448723 2.13947114841022 0.186189916077005 C:G C G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139290251 C/G 1 5 5 10 2.32566106448723 2.67433893551277 -0.34867787102555 C:G C G 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 32 25 57 14.8842308127182 13.3716946775639 1.51253613515436 T:C C T 10 0.534867787102555 0.790866566196644 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 24 33 57 11.1631731095387 17.6506369743843 -6.48746386484564 A:C:G A G 10 0.534867787102555 0.110270776425333 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 52 50 102 24.1868750706671 26.7433893551277 -2.55651428446061 T:C C T 10 0.534867787102555 0.621067871170952 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 39 22 61 18.1401563030004 11.7670913162562 6.37306498674415 T:C T C 10 0.534867787102555 0.123022111795832 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 81 101 182 37.675709244693 54.0216464973581 -16.345937252665 T:C C T 10 0.534867787102555 0.0172172100182517 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 64 53 117 29.7684616254365 28.3479927164354 1.42046890900107 T:C C T 10 0.534867787102555 0.853085085276428 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 24 19 43 11.1631731095387 10.1624879549485 1.00068515459013 A:G G A 10 0.534867787102555 0.87873815611304 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139327034 A/G 1 27 26 53 12.558569748231 13.9065624646664 -1.34799271643542 A:G A G 10 0.534867787102555 0.783434760645152 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326931_139327038:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326931_139327038:INPP5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139327439 A/G 1 30 29 59 13.9539663869233 15.5111658259741 -1.55719943905074 A:G A G 10 0.534867787102555 0.69739059724736 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139327408_139327527:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139327408_139327527:INPP5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139328551 T/C 1 28 17 45 13.0237019611285 9.09275238074344 3.93094958038502 T:C T C 10 0.534867787102555 0.295641477437011 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139328489_139328586:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139328489_139328586:INPP5E HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 23 22 45 10.6980408966412 11.7670913162562 -1.06905041961497 A:G G A 10 0.534867787102555 0.767002356387335 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 30 36 66 13.9539663869233 19.255240335692 -5.30127394876863 A:C A C 10 0.534867787102555 0.217384257691487 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139617626 G/A 1 30 6 36 13.9539663869233 3.20920672261533 10.744759664308 A:G G A 10 0.534867787102555 0.000305599907205472 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139617662 T/C 1 30 5 35 13.9539663869233 2.67433893551277 11.2796274514106 T:C T C 10 0.534867787102555 0.000112335712437273 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139620695 C/T 1 25 26 51 11.6283053224361 13.9065624646664 -2.27825714223031 T:C C T 10 0.534867787102555 0.575443123850368 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 38 51 89 17.6750240901029 27.2782571422303 -9.6032330521274 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0436807012832622 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 63 48 111 29.303329412539 25.6736537809226 3.62967563161639 A:G G A 10 0.534867787102555 0.5067937735207 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 21 42 63 9.76777647084634 22.4644470583073 -12.696670587461 A:G G A 10 0.534867787102555 0.00146669040791183 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139690840 G/A 1 7 2 9 3.25592549028211 1.06973557420511 2.18618991607701 A:G G A 10 0.534867787102555 0.189238275360181 ENSG00000213213:ENST00000479371:exon_139690802_139690919:KIAA1984;ENSG00000213213:ENST00000423962:exon_139690802_139690919:KIAA1984;ENSG00000213213:ENST00000371682:exon_139690812_139690919:KIAA1984;ENSG00000213213:ENST00000338005:exon_139690815_139690919:KIAA1984 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 73 94 167 33.9546515415135 50.2775719876402 -16.3229204461267 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0128677052539521 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139749067 C/T 1 7 4 11 3.25592549028211 2.13947114841022 1.11645434187189 T:C C T 10 0.534867787102555 0.559692301451304 ENSG00000177943:ENST00000485732:exon_139748991_139749128:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000317446:exon_139748991_139749128:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000445819:exon_139748991_139749128:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000392881:exon_139748991_139749128:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000413647:exon_139748991_139749128:MAMDC4 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 53 58 111 24.6520072835646 31.0223316519482 -6.3703243683836 A:G G A 10 0.534867787102555 0.253540377702553 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139837990 G/C 1 7 13 20 3.25592549028211 6.95328123233322 -3.6973557420511 C:G G C 10 0.534867787102555 0.117636617366408 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139925927 G/C 1 11 7 18 5.1164543418719 3.74407450971789 1.37237983215401 C:G G C 10 0.534867787102555 0.638780682626094 ENSG00000180549:ENST00000314412:exon_139924626_139926177:FUT7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139929435 A/G 1 8 1 9 3.72105770317956 0.534867787102555 3.18618991607701 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0431889028458087 ENSG00000180539:ENST00000314330:exon_139929102_139931234:C9orf139 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139944361 C/T 1 9 6 15 4.18618991607701 3.20920672261533 0.976983193461675 T:C C T 10 0.534867787102555 0.796972428964265 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139944322_139944441:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139944322_139944441:ENTPD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139945363 G/A 1 6 6 12 2.79079327738467 3.20920672261533 -0.41841344523066 A:G G A 10 0.534867787102555 1 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139945354_139945581:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139945354_139945581:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000469106:exon_139945354_139945581:ENTPD2 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 48 43 91 22.3263462190774 22.9993148454099 -0.672968626332509 T:C C T 10 0.534867787102555 0.916539814116095 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 61 48 109 28.3730649867441 25.6736537809226 2.6994112058215 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.632061488154391 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 540 494 1034 251.17139496462 264.224686828662 -13.0532918640419 A:C:G G A 10 0.534867787102555 0.417804164564381 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 365 273 638 169.773257707567 146.018905878998 23.7543518285699 T:C:G C G 10 0.534867787102555 0.0621026721195087 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 141 91 232 65.5836420185397 48.6729686263325 16.9106733922072 C:G G C 10 0.534867787102555 0.0296527353476937 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 102 86 188 47.4434857155394 45.9986296908197 1.44485602471966 A:G A G 10 0.534867787102555 0.883806345614888 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 31 43 74 14.4190985998208 22.9993148454099 -8.58021624558907 A:G A G 10 0.534867787102555 0.0479695117010734 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140100317 C/G 1 20 25 45 9.3026442579489 13.3716946775639 -4.06905041961497 C:G C G 10 0.534867787102555 0.235065277308722 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140262424 C/T 1 4 9 13 1.86052885158978 4.81381008392299 -2.95328123233321 T:C C T 10 0.534867787102555 0.162111720482917 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 9 4 13 4.18618991607701 2.13947114841022 2.04671876766679 T:C C T 10 0.534867787102555 0.28201462375414 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140509480 G/T 1 49 51 100 22.7914784319748 27.2782571422303 -4.4867787102555 T:G G T 10 0.534867787102555 0.369303364375789 ENSG00000197070:ENST00000491911:exon_140509011_140509811:ARRDC1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140611140 G/A 1 43 35 78 20.0006851545901 18.7203725485894 1.28031260600071 A:G G A 10 0.534867787102555 0.820887132622205 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 38 57 95 17.6750240901029 30.4874638648456 -12.8124397747427 T:C T C 10 0.534867787102555 0.00984306939484007 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 74 62 136 34.4197837544109 33.1618028003584 1.25798095405252 A:G G A 10 0.534867787102555 0.86373431823727 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 75 53 128 34.8849159673084 28.3479927164354 6.53692325087296 T:C:G T C 10 0.534867787102555 0.251006174386617 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 223989 A/G 1 6 2 8 2.79079327738467 1.06973557420511 1.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.298597855982487 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 229425 G/A 1 8 5 13 3.72105770317956 2.67433893551277 1.04671876766679 A:G G A 10 0.534867787102555 0.593131144231023 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 22 21 43 10.2329086837438 11.2322235291537 -0.999314845409865 A:G A G 10 0.534867787102555 0.762536331661582 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 20 15 35 9.3026442579489 8.02301680653832 1.27962745141058 T:C T C 10 0.534867787102555 0.736175658421399 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 30 26 56 13.9539663869233 13.9065624646664 0.0474039222569189 A:G A G 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 6 8 14 2.79079327738467 4.27894229682044 -1.48814901943577 A:G A G 10 0.534867787102555 0.437699564928111 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 322193 C/T 1 8 7 15 3.72105770317956 3.74407450971789 -0.0230168065383252 T:C C T 10 0.534867787102555 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1500009 T/C 1 10 9 19 4.65132212897445 4.81381008392299 -0.162487954948545 T:C T C 10 0.534867787102555 1 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 2344 2124 4468 1090.26990703161 1136.05917980583 -45.7892727742155 A:G G A 10 0.534867787102555 0.172341664156187 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1508583 T/C 1 1428 1284 2712 664.208800017551 686.770238639681 -22.5614386221292 A:T:C T C 10 0.534867787102555 0.386434854645158 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1508648 A/G 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 A:G A G 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 62 44 106 28.8381971996416 23.5341826325124 5.30401456712917 C:G C G 10 0.534867787102555 0.330686255851365 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 52 36 88 24.1868750706671 19.255240335692 4.93163473497516 T:C C T 10 0.534867787102555 0.336303632705312 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 134 92 226 62.3277165282576 49.2078364134351 13.1198801148226 A:G G A 10 0.534867787102555 0.0831337261756928 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 131 124 255 60.9323198895653 66.3236056007168 -5.39128571115153 A:G A G 10 0.534867787102555 0.530265328142175 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 30 22 52 13.9539663869233 11.7670913162562 2.18687507066714 T:C T C 10 0.534867787102555 0.580323809477977 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1554655 T/C 1 5 3 8 2.32566106448723 1.60460336130767 0.72105770317956 T:C T C 10 0.534867787102555 0.731842787348388 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 76 76 152 35.3500481802058 40.6499518197942 -5.29990363958836 T:C C T 10 0.534867787102555 0.416435401026615 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1718360 G/A 1 56 35 91 26.0474039222569 18.7203725485894 7.3270313736675 A:G G A 10 0.534867787102555 0.141104741428771 ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1718085_1719196:AKAP17A HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 77 91 168 35.8151803931033 48.6729686263325 -12.8577882332292 C:G C G 10 0.534867787102555 0.0529116325833879 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 193 177 370 89.7705170892069 94.6715983171522 -4.90108122794534 T:C C T 10 0.534867787102555 0.639114219303137 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 97 129 226 45.1178246510522 68.9979445362296 -23.8801198851774 T:C C T 10 0.534867787102555 0.00167054232964098 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 2836181 A/T 0 15 0 15 6.97698319346167 0 6.97698319346167 A A 10 0.534867787102555 9.42065881354215e-05 ENSG00000006756:ENST00000381154:exon_2835845_2836268:ARSD;ENSG00000006756:ENST00000358177:exon_2835845_2836268:ARSD;ENSG00000006756:ENST00000217890:exon_2835845_2836268:ARSD HGDP00715_parsed_pileup.txt . X 2836184 C/T 0 16 0 16 7.44211540635912 0 7.44211540635912 C C 10 0.534867787102555 4.96684535967002e-05 ENSG00000006756:ENST00000381154:exon_2835845_2836268:ARSD;ENSG00000006756:ENST00000358177:exon_2835845_2836268:ARSD;ENSG00000006756:ENST00000217890:exon_2835845_2836268:ARSD