INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 105 97 202 49.5491166828154 51.2260541120657 -1.6769374292503 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.832771565966405 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 57 40 97 26.8980919135284 21.1241460255941 5.77394588793426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.263766164838598 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 2337194 C/T 1 18 27 45 8.49413428848265 14.258798567276 -5.76466427879338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.100253414901734 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C T C 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 89 153 242 41.9987750930531 80.7998585478975 -38.8010834548444 A:G A G 10 0.528103650639853 5.96363723876121e-07 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 3807258 G/C 1 55 38 93 25.9542992148081 20.0679387243144 5.88636049049367 C:G G C 10 0.528103650639853 0.253306825987155 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 3807450 C/A 1 30 39 69 14.1568904808044 20.5960423749543 -6.43915189414986 A:C C A 10 0.528103650639853 0.147411679377211 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 17 7 24 8.0222379391225 3.69672555447897 4.32551238464353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.100828950492662 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6271125 A/G 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6271081_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000463453:exon_6271081_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496329:exon_6270998_6271178:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6271095_6271178:RNF207 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6272078 G/A 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000463453:exon_6271983_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6271927_6272113:RNF207 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6272813 C/T 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 16 10 26 7.55034158976235 5.28103650639853 2.26930508336382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.434914527433077 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 15 12 27 7.07844524040221 6.33724380767824 0.741201432723969 A:G G A 10 0.528103650639853 0.848515385288294 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 28 21 49 13.2130977820841 11.0901766634369 2.1229211186472 A:G A G 10 0.528103650639853 0.570084944046039 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 36 43 79 16.9882685769653 22.7084569775137 -5.72018840054838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.215702120989916 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 8418920 A/G 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:G A G 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9188876 T/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000180758:ENST00000377411:exon_9188704_9189229:GPR157;ENSG00000180758:ENST00000414642:exon_9188704_9189183:GPR157 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9416151 G/A 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9777669 C/T 1 61 42 103 28.785677310969 22.1803533268738 6.60532398409514 T:C C T 10 0.528103650639853 0.200724528495514 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9777595_9777684:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9777595_9777684:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9777595_9777684:PIK3CD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9780196 A/G 1 25 11 36 11.7974087340037 5.80914015703838 5.98826857696529 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0648016056223966 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9780170_9780300:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9780170_9780300:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9780170_9780300:PIK3CD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 51 44 95 24.0667138173675 23.2365606281535 0.830153189213966 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.918291176185441 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 9833335 A/T 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:T A T 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9833330_9833452:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9833330_9833452:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9833330_9833452:CLSTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 97 101 198 45.7739458879343 53.3384687146252 -7.56452282669089 T:C T C 10 0.528103650639853 0.286481465628229 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 118 102 220 55.6837692244973 53.866572365265 1.81719685923234 T:C C T 10 0.528103650639853 0.839584133068912 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 9 24 33 4.24706714424132 12.6744876153565 -8.42742047111515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00452079834285991 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 24 24 48 11.3255123846435 12.6744876153565 -1.34897523071295 A:G A G 10 0.528103650639853 0.772977371861394 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 37 30 67 17.4601649263254 15.8431095191956 1.61705540712985 T:C T C 10 0.528103650639853 0.715211870334881 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 15541607 T/C 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000451326:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15541391_15541927:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15541391_15541927:TMEM51 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 15546077 G/A 1 17 21 38 8.0222379391225 11.0901766634369 -3.06793872431441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.334006204812849 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15545822_15546835:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15545822_15546974:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15545822_15546872:TMEM51 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 17740019 C/G 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 C:G C G 10 0.528103650639853 0.594489574550988 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19202896 G/A 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19203997 C/G 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 C:G C G 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19203910_19204106:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19203910_19204106:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19203910_19204106:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19203910_19204106:ALDH4A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 16 34 50 7.55034158976235 17.955524121755 -10.4051825319926 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0041609314181152 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 35 43 78 16.5163722276051 22.7084569775137 -6.19208474990853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.174132928663277 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19447843 C/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 C:G C G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000425413:exon_19447694_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000417040:exon_19447707_19447928:UBR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19566957 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 48 45 93 22.6510247692871 23.7646642787934 -1.11363950950633 A:G G A 10 0.528103650639853 0.836033718820688 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 103 106 209 48.6053239840951 55.9789869678244 -7.37366298372928 A:G G A 10 0.528103650639853 0.332142450634064 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 19634964 C/G 1 11 18 29 5.19085984296162 9.50586571151735 -4.31500586855574 C:G C G 10 0.528103650639853 0.136259219011012 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:C A C 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 19 8 27 8.96603063784279 4.22482920511882 4.74120143272397 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0823937518569907 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 450 451 901 212.353357212066 238.174746438574 -25.8213892265075 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0887687804563269 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 23418325 C/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 23688933 A/G 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000125945:ENST00000314011:exon_23685941_23689714:ZNF436;ENSG00000125945:ENST00000374608:exon_23686468_23689714:ZNF436 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 23836364 A/G 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000007968:ENST00000361729:exon_23832922_23836640:E2F2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24134721 T/C 1 20 21 41 9.43792698720294 11.0901766634369 -1.65224967623397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.6410938660349 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000436439:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000235958:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24134625_24134813:HMGCL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 68 19 87 32.08895175649 10.0339693621572 22.0549823943328 T:C T C 10 0.528103650639853 1.40613795508314e-06 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 82 24 106 38.6955006475321 12.6744876153565 26.0210130321756 T:C C T 10 0.528103650639853 2.47406417028876e-07 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 51 31 82 24.0667138173675 16.3712131698354 7.69550064753205 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0972684576933554 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 55 26 81 25.9542992148081 13.7306949166362 12.2236042981719 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00726370430728629 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201162 G/A 1 45 68 113 21.2353357212066 35.91104824351 -14.6757125223034 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00616052784145525 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 50 40 90 23.5948174680073 21.1241460255941 2.47067144241323 A:G A G 10 0.528103650639853 0.67305944713504 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 36 34 70 16.9882685769653 17.955524121755 -0.967255544789708 A:G A G 10 0.528103650639853 0.904823411472605 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 37 44 81 17.4601649263254 23.2365606281535 -5.77639570182809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.221155597182910 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 44 32 76 20.7634393718465 16.8993168204753 3.86412255137117 A:G G A 10 0.528103650639853 0.421753726288302 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 25 21 46 11.7974087340037 11.0901766634369 0.707232070566763 T:C T C 10 0.528103650639853 0.883323581529177 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 26 21 47 12.2693050833638 11.0901766634369 1.17912841992691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.771647354948445 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 83 113 196 39.1673969968922 59.6757125223034 -20.5083155254112 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.00409780722516773 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27480757 A/G 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 A:G A G 10 0.528103650639853 0.368322400865039 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27480474_27481401:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374086:exon_27480474_27481089:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374084:exon_27480473_27480852:SLC9A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 25 15 40 11.7974087340037 7.92155475959779 3.87585397440588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.267888536179292 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 14 3 17 6.60654889104206 1.58431095191956 5.0222379391225 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0150530210679749 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 27874034 A/C 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 A:C A C 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.223549342746253 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 139 74 213 65.5935925610604 39.0796701473491 26.5139224137113 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000262442349593791 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 116 38 154 54.7399765257771 20.0679387243144 34.6720378014626 T:C T C 10 0.528103650639853 1.45421507396291e-08 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 136 59 195 64.17790351298 31.1581153877513 33.0197881252287 A:G A G 10 0.528103650639853 1.79898403193345e-06 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28316322 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000158161:ENST00000373871:exon_28316208_28316322:EYA3;ENSG00000158161:ENST00000373864:exon_28316208_28316322:EYA3;ENSG00000158161:ENST00000373863:exon_28316208_28316322:EYA3;ENSG00000158161:ENST00000495923:exon_28316208_28316322:EYA3;ENSG00000158161:ENST00000471498:exon_28316208_28316322:EYA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28527719 G/A 1 237 247 484 111.839434798355 130.441601708044 -18.6021669096888 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0921966736218776 ENSG00000126698:ENST00000263697:exon_28527068_28527881:DNAJC8;ENSG00000126698:ENST00000489277:exon_28527070_28527881:DNAJC8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28800380 C/A 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 A:C C A 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28800066_28800663:PHACTR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 A:G G A 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 29442291 C/T 1 28 39 67 13.2130977820841 20.5960423749543 -7.38294459287015 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0860575869045575 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000460378:exon_29442211_29442315:EPB41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 37 39 76 17.4601649263254 20.5960423749543 -3.13587744862883 A:G A G 10 0.528103650639853 0.492179354635741 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C T C 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 32829281 G/A 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000162526:ENST00000373534:exon_32829196_32829913:TSSK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 107 71 178 50.4929093815357 37.4953591954296 12.9975501861062 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0512879900845423 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 36556867 C/T 1 17 12 29 8.0222379391225 6.33724380767824 1.68499413144426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.58065189071065 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36556845_36556941:ADPRHL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 71 47 118 33.5046408045704 24.8208715800731 8.68376922449735 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.117272396165690 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 119 136 255 56.1556655738575 71.82209648702 -15.6664309131625 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0518506974800463 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 37948378 C/T 1 39 65 104 18.4039576250457 34.3267372915904 -15.9227796665447 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00218123284066437 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 13 10 23 6.13465254168191 5.28103650639853 0.853616035283381 A:G A G 10 0.528103650639853 0.835583811578279 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 30 34 64 14.1568904808044 17.955524121755 -3.79863364095059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.381451301856020 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 25 27 52 11.7974087340037 14.258798567276 -2.46138983327236 A:G G A 10 0.528103650639853 0.578931495519633 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 21 17 38 9.90982333656309 8.9777620608775 0.932061275685587 C:G G C 10 0.528103650639853 0.871270719218986 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 40226046 G/A 1 11 6 17 5.19085984296162 3.16862190383912 2.0222379391225 A:G G A 10 0.528103650639853 0.345327913480538 ENSG00000116985:ENST00000372827:exon_40222854_40226240:BMP8B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:T A T 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 40703440 C/T 1 27 21 48 12.741201432724 11.0901766634369 1.65102476928706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.666789151538884 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 40705269 G/A 1 30 18 48 14.1568904808044 9.50586571151735 4.65102476928706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.195128950047660 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 5 14 19 2.35948174680074 7.39345110895794 -5.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0224070602662607 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43392819 G/T 1 38 53 91 17.9320612756856 27.9894934839122 -10.0574322082266 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.0360059975158283 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43391826_43392912:SLC2A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43393384 G/A 1 1 19 20 0.471896349360147 10.0339693621572 -9.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 9.85857936282556e-06 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43393276_43393479:SLC2A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43394612 T/C 1 26 42 68 12.2693050833638 22.1803533268738 -9.91104824351 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0203683479612847 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 37 23 60 17.4601649263254 12.1463839647166 5.31378096160882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.196172150014984 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 16 13 29 7.55034158976235 6.86534745831809 0.684994131444263 A:G G A 10 0.528103650639853 0.854027499191445 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 43850696 G/A 1 60 48 108 28.3137809616088 25.3489752307129 2.96480573089588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.630112895146599 ENSG00000159479:ENST00000372457:exon_43849640_43850777:MED8;ENSG00000159479:ENST00000372455:exon_43850397_43850777:MED8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 44071221 G/A 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000142949:ENST00000359947:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000438120:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372413:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372414:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372412:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000422171:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000412568:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000429895:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000414879:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372407:exon_44071200_44071293:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000496447:exon_44071200_44071293:PTPRF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 44083519 G/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000142949:ENST00000359947:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000438120:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372413:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372414:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372412:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000422171:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000412568:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000429895:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000414879:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372407:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000496447:exon_44083407_44083582:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000477970:exon_44083407_44083582:PTPRF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 20 10 30 9.43792698720294 5.28103650639853 4.15689048080441 A:C C A 10 0.528103650639853 0.145562685011199 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 44442301 C/T 1 158 142 300 74.5596231989032 74.9907183908591 -0.431095191955905 T:C:G C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000117410:ENST00000472505:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000472174:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000532642:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000236067:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000471859:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000431876:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000468183:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000473485:exon_44442262_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000496131:exon_44441974_44442331:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000498664:exon_44442262_44442331:ATP6V0B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 14 16 30 6.60654889104206 8.44965841023765 -1.84310951919559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.584479133652254 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 45796881 G/A 1 13 14 27 6.13465254168191 7.39345110895794 -1.25879856727603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.701591240329278 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45796854_45796942:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45796854_45797006:MUTYH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 22 11 33 10.3817196859232 5.80914015703838 4.57257952888485 C:G C G 10 0.528103650639853 0.119452299415424 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 12 16 28 5.66275619232176 8.44965841023765 -2.78690221791588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.345411965030106 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 101 57 158 47.6615312853748 30.1019080864716 17.5596231989032 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00521540037472325 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 104 59 163 49.0772203334553 31.1581153877513 17.919104945704 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00586785567099534 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 119 86 205 56.1556655738575 45.4169139550274 10.7387516188301 A:G A G 10 0.528103650639853 0.141918682435567 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 89 94 183 41.9987750930531 49.6417431601462 -7.64296806709309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.267300234030014 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46493460 T/G 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 T:G T G 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46493403_46493535:MAST2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 9 19 28 4.24706714424132 10.0339693621572 -5.78690221791588 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0360967037502458 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 15 21 36 7.07844524040221 11.0901766634369 -4.01173142303471 A:G A G 10 0.528103650639853 0.186479579485317 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46500863 A/T 1 23 34 57 10.8536160352834 17.955524121755 -7.10190808647162 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0638286462608132 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000456625:exon_46500755_46501265:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46500751_46501259:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 20 13 33 9.43792698720294 6.86534745831809 2.57257952888485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.389406238573835 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 30 21 51 14.1568904808044 11.0901766634369 3.0667138173675 A:G A G 10 0.528103650639853 0.40410666509233 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 60 73 133 28.3137809616088 38.5515664967093 -10.2377855351004 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0823205731739708 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 47024442 G/A 1 11 21 32 5.19085984296162 11.0901766634369 -5.89931682047529 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0498937252623783 ENSG00000079277:ENST00000342571:exon_47023090_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371946:exon_47023090_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371945:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371949:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000396306:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000371944:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000341183:exon_47023091_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000524749:exon_47023905_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000528077:exon_47024065_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000428112:exon_47024371_47024472:MKNK1;ENSG00000079277:ENST00000532897:exon_47024428_47024472:MKNK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 49 38 87 23.1229211186472 20.0679387243144 3.05498239433279 A:G A G 10 0.528103650639853 0.521731212916256 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 33 46 79 15.5725795288849 24.2927679294332 -8.72018840054838 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0552197985047828 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 29 23 52 13.6849941314443 12.1463839647166 1.53861016672765 T:G T G 10 0.528103650639853 0.680076227683372 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52344245 T/G 1 43 39 82 20.2915430224863 20.5960423749543 -0.304499352467943 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52343947_52344386:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000491410:exon_52343947_52344443:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000468722:exon_52343947_52344395:NRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 51 65 116 24.0667138173675 34.3267372915904 -10.260023474223 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0627027605193312 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52823546 C/G 1 16 15 31 7.55034158976235 7.92155475959779 -0.371213169835443 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52823453_52823588:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52823453_52824133:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438021:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460261:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52823453_52823570:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52823453_52823588:CC2D1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52839012 C/T 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52838501_52839047:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52838503_52839047:ORC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 113 89 202 53.3242874776966 47.0012249069469 6.3230625707497 A:G A G 10 0.528103650639853 0.397984132220743 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52940771 C/T 1 46 29 75 21.7072320705668 15.3150058685557 6.39222620201103 T:C C T 10 0.528103650639853 0.164906479783475 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000484723:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52940504_52941207:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52940504_52941207:ZCCHC11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 29 26 55 13.6849941314443 13.7306949166362 -0.0457007851919151 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 93 100 193 43.8863604904937 52.8103650639853 -8.92400457349163 A:G G A 10 0.528103650639853 0.220256245835256 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 54678305 C/G 1 106 115 221 50.0210130321756 60.7319198235831 -10.7109067914075 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.157248523534356 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54678174_54678331:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54678174_54678331:MRPL37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 66 53 119 31.1451590577697 27.9894934839122 3.15566557385749 C:G G C 10 0.528103650639853 0.582758493618942 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 194 158 352 91.5478917758685 83.4403768010968 8.10751497477175 A:T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.393510542733916 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 57 63 120 26.8980919135284 33.2705299903107 -6.37243807678236 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.272591218469793 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 55224131 T/C 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 55224751 C/A 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:C C A 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 74 77 151 34.9203298526509 40.6639810992687 -5.7436512466178 A:G A G 10 0.528103650639853 0.370343413068576 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 59142713 T/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000481973:exon_59142444_59142728:MYSM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 59147926 T/C 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 42 71 113 19.8196466731262 37.4953591954296 -17.6757125223034 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000923104514029628 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 14 16 30 6.60654889104206 8.44965841023765 -1.84310951919559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.584479133652254 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 13 19 32 6.13465254168191 10.0339693621572 -3.8993168204753 A:G G A 10 0.528103650639853 0.214791287737836 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 49 30 79 23.1229211186472 15.8431095191956 7.27981159945161 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.114546348365915 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 74648408 C/T 1 4 10 14 1.88758539744059 5.28103650639853 -3.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.105430532897226 ENSG00000162620:ENST00000395089:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000354431:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000415760:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000388972:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000370911:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000463724:exon_74645907_74649368:LRRIQ3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 74665493 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000524915:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000529485:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000116783:ENST00000370899:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370895:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000534632:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000533006:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370891:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370893:exon_74665348_74665515:TNNI3K HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 74671519 A/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G A G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74670075_74672918:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74670892_74671890:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74670903_74671907:FPGT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 77629563 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000359130:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000478391:exon_77629531_77629627:PIGK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 78098403 T/C 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 78201745 G/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:G G T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000524536:exon_78201741_78201843:USP33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 78280901 C/G 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 C:G C G 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000180488:ENST00000370791:exon_78280793_78280916:FAM73A;ENSG00000180488:ENST00000443751:exon_78280793_78280916:FAM73A;ENSG00000180488:ENST00000476203:exon_78280793_78280916:FAM73A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 1 471 299 770 222.263180548629 157.902991541316 64.3601890073132 A:G G A 10 0.528103650639853 3.09939347453484e-06 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 137 228 365 64.6497998623401 120.407632345886 -55.7578324835463 A:C:G G A 10 0.528103650639853 6.21760012100744e-09 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 61 83 144 28.785677310969 43.8326030031078 -15.0469256921388 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0122978902117846 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 419 286 705 197.724570381902 151.037644082998 46.6869262989036 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000444160254679771 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 80 81 161 37.7517079488118 42.7763957018281 -5.02468775301633 A:G A G 10 0.528103650639853 0.431166744042637 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 12 1 13 5.66275619232176 0.528103650639853 5.13465254168191 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00403006579681969 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 86852621 A/G 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86852598_86852762:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86852598_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000465959:exon_86852598_86852762:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000478286:exon_86851411_86852769:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486215:exon_86852492_86852769:ODF2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 13 2 15 6.13465254168191 1.05620730127971 5.07844524040221 C:G G C 10 0.528103650639853 0.00872208904450117 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 90179532 A/G 1 16 8 24 7.55034158976235 4.22482920511882 3.32551238464353 A:G A G 10 0.528103650639853 0.220559168441265 ENSG00000171488:ENST00000370454:exon_90178268_90185092:LRRC8C;ENSG00000171488:ENST00000529501:exon_90178268_90185092:LRRC8C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.284614626264566 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 17 7 24 8.0222379391225 3.69672555447897 4.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.100828950492662 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 A:C A C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 C:G C G 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 100340787 G/A 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000477753:exon_100340710_100340812:AGL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 20 26 46 9.43792698720294 13.7306949166362 -4.29276792943324 T:G G T 10 0.528103650639853 0.237865484014599 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 14 5 19 6.60654889104206 2.64051825319926 3.96603063784279 C:G G C 10 0.528103650639853 0.105309108512039 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 24 28 52 11.3255123846435 14.7869022179159 -3.46138983327236 A:G A G 10 0.528103650639853 0.404882378834723 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 40 30 70 18.8758539744059 15.8431095191956 3.03274445521029 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.475876831111655 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 44 46 90 20.7634393718465 24.2927679294332 -3.52932855758677 T:G G T 10 0.528103650639853 0.462067127779734 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 67 52 119 31.6170554071299 27.4613898332724 4.15566557385749 A:C C A 10 0.528103650639853 0.463790279882471 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 49 31 80 23.1229211186472 16.3712131698354 6.75170794881176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.145656387562062 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 34 30 64 16.044475878245 15.8431095191956 0.201366359049409 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 110883917 A/G 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 21 4 25 9.90982333656309 2.11241460255941 7.79740873400368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00198492822989544 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 73 112 185 34.4484335032907 59.1476088716635 -24.6991753683728 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000292292021153959 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 111737183 C/T 1 9 1 10 4.24706714424132 0.528103650639853 3.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0234403290361439 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 208 39 247 98.1544406669106 20.5960423749543 77.5583982919563 A:C C A 10 0.528103650639853 2.84427131308024e-25 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 112233975 A/G 1 125 132 257 58.9870436700184 69.7096818844606 -10.7226382144422 A:G A G 10 0.528103650639853 0.189651948598539 ENSG00000116473:ENST00000356415:exon_112233956_112234039:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000433097:exon_112233956_112234039:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000369709:exon_112233956_112234039:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000494982:exon_112233956_112234039:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000436150:exon_112233954_112234039:RAP1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 28 15 43 13.2130977820841 7.92155475959779 5.29154302248632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.126496952023221 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 69 41 110 32.5608481058501 21.652249676234 10.9085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0444453885005546 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 48 31 79 22.6510247692871 16.3712131698354 6.27981159945161 T:C T C 10 0.528103650639853 0.176505323921713 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 81 85 166 38.2236042981719 44.8888103043875 -6.6652060062156 T:C C T 10 0.528103650639853 0.312788000520647 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 7 13 20 3.30327444552103 6.86534745831809 -3.56207301279706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.121674574449562 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114515717 G/A 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114515646_114516193:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114515646_114520426:HIPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 17 19 36 8.0222379391225 10.0339693621572 -2.01173142303471 A:G A G 10 0.528103650639853 0.509905663570198 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 116206423 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000173218:ENST00000355485:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369510:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000310260:exon_116206282_116206889:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369509:exon_116206282_116206889:VANGL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 117078729 A/G 1 118 130 248 55.6837692244973 68.6534745831809 -12.9697053586835 A:G A G 10 0.528103650639853 0.111647086769764 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 117131407 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000143061:ENST00000369486:exon_117131316_117131726:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000369483:exon_117131316_117131726:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000342231:exon_117131316_117131726:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000318837:exon_117131316_117131726:IGSF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 117618351 A/G 1 36 29 65 16.9882685769653 15.3150058685557 1.67326270840956 A:G A G 10 0.528103650639853 0.710745106900206 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 120458924 G/A 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000134250:ENST00000256646:exon_120454176_120459317:NOTCH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 T T 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 12 1 13 5.66275619232176 0.528103650639853 5.13465254168191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00403006579681969 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 144931392 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 144931461 A/T 0 12 0 12 5.66275619232176 0 5.66275619232176 A A 10 0.528103650639853 0.000592519996121889 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 44 43 87 20.7634393718465 22.7084569775137 -1.94501760566721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.74755898457992 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 93 93 0 49.1136395095063 -49.1136395095063 A:C T C 10 0.528103650639853 4.65302555300244e-31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 64 64 0 33.7986336409506 -33.7986336409506 T G T 10 0.528103650639853 1.33716046292306e-21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 61 61 0 32.214322689031 -32.214322689031 A C A 10 0.528103650639853 1.27245863755384e-20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 147 0 147 69.3687633559416 0 69.3687633559416 G G 10 0.528103650639853 1.82081404322237e-41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 108 108 0 57.0351942691041 -57.0351942691041 C T C 10 0.528103650639853 5.9625866265231e-36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 191 192 0.471896349360147 100.867797272212 -100.395900922852 T:C C T 10 0.528103650639853 5.16108341688505e-61 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 150444026 G/A 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 59 45 104 27.8418846122487 23.7646642787934 4.07722033345529 A:G G A 10 0.528103650639853 0.433932401028888 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 150935173 C/T 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000497314:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000528749:exon_150935063_150935558:SETDB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 21 11 32 9.90982333656309 5.80914015703838 4.10068317952471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.159934326105865 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151215011 A/G 1 29 25 54 13.6849941314443 13.2025912659963 0.482402865447938 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151214914_151215043:PIP5K1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 261 289 550 123.164947182998 152.621955034918 -29.4570078519191 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.0131773089536410 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151259828 A/G 1 25 25 50 11.7974087340037 13.2025912659963 -1.40518253199265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.7773314321124 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 44 40 84 20.7634393718465 21.1241460255941 -0.360706653747648 A:C:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 37 35 72 17.4601649263254 18.4836277723949 -1.02346284606941 A:G A G 10 0.528103650639853 0.814591042277998 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 45 46 91 21.2353357212066 24.2927679294332 -3.05743220822662 C:G G C 10 0.528103650639853 0.530521569914123 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155106227 A/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:T A T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000169242:ENST00000368407:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000368406:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000469878:exon_155105979_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000474413:exon_155106206_155106256:EFNA1;ENSG00000169242:ENST00000497282:exon_155106206_155106256:EFNA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 85 88 173 40.1111896956125 46.4731212563071 -6.36193156069456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.360942085584317 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 0 0 9 9 0 4.75293285575868 -4.75293285575868 G T G 10 0.528103650639853 0.00116043163153151 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155408558 C/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155408118_155408859:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155408118_155408859:ASH1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155491322 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155490891_155491409:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155490891_155491409:ASH1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 19 23 42 8.96603063784279 12.1463839647166 -3.18035332687382 T:C T C 10 0.528103650639853 0.355971943604694 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156011444 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000160803:ENST00000368309:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368307:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368308:exon_156011276_156011462:UBQLN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 49 43 92 23.1229211186472 22.7084569775137 0.414464141133525 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 24 18 42 11.3255123846435 9.50586571151735 1.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.644103924037243 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 9 4 13 4.24706714424132 2.11241460255941 2.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.276725408885617 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 26 22 48 12.2693050833638 11.6182803140768 0.651024769287057 A:G G A 10 0.528103650639853 0.885917211675883 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 411 181 592 193.94939958702 95.5867607658134 98.362638821207 A:G G A 10 0.528103650639853 2.68473206236488e-16 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 410 183 593 193.47750323766 96.6429680670931 96.8345351705672 A:T:C:G G A 10 0.528103650639853 8.11922867657713e-16 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.253776528805514 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 11 11 0 5.80914015703838 -5.80914015703838 C:G A C 10 0.528103650639853 0.000258412069235989 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 30 30 60 14.1568904808044 15.8431095191956 -1.68621903839118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.699204772095856 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:C C A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156907081 T/C 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 T:C T C 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 156907115 T/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000132694:ENST00000368194:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000413909:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000487682:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000361409:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000315174:exon_156907041_156907288:ARHGEF11;ENSG00000132694:ENST00000492592:exon_156907041_156907288:ARHGEF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 269 264 533 126.94011797788 139.419363768921 -12.4792457910416 C:G G C 10 0.528103650639853 0.297774789516346 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 11 16 27 5.19085984296162 8.44965841023765 -3.25879856727603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.248785447351970 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 264 237 501 124.580636231079 125.160565201645 -0.579928970566343 T:G G T 10 0.528103650639853 0.964336383082005 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 27 19 46 12.741201432724 10.0339693621572 2.70723207056676 A:G A G 10 0.528103650639853 0.462603643873888 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161068836 A/C 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000444550:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000471613:exon_161068456_161069208:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392191:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000494418:exon_161068456_161068852:KLHDC9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 122 111 233 57.5713546219379 58.6195052210237 -1.04815059908574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.895788132830014 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161335955 A/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:C A C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161337604 G/A 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:G G A 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 125 106 231 58.9870436700184 55.9789869678244 3.00805670219396 A:G A G 10 0.528103650639853 0.741860528169674 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 308 294 602 145.344075602925 155.262473288117 -9.91839768519151 A:G G A 10 0.528103650639853 0.438010141627473 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 16 14 30 7.55034158976235 7.39345110895794 0.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 43 42 85 20.2915430224863 22.1803533268738 -1.8888103043875 T:C C T 10 0.528103650639853 0.744749447892038 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 26 20 46 12.2693050833638 10.5620730127971 1.70723207056676 A:G A G 10 0.528103650639853 0.659627499768371 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 25 17 42 11.7974087340037 8.9777620608775 2.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.440955668410824 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 87 116 203 41.0549823943328 61.2600234742229 -20.2050410798902 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00485163648830912 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 43 57 100 20.2915430224863 30.1019080864716 -9.8103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0566812743326808 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 31 35 66 14.6287868301646 18.4836277723949 -3.8548409422303 A:G G A 10 0.528103650639853 0.388511814818745 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 31 43 74 14.6287868301646 22.7084569775137 -8.07967014734912 T:C T C 10 0.528103650639853 0.063027055048945 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 15 31 46 7.07844524040221 16.3712131698354 -9.29276792943324 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00732706607665844 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 26 26 52 12.2693050833638 13.7306949166362 -1.46138983327236 A:G G A 10 0.528103650639853 0.781495574127885 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 53 58 111 25.0105065160878 30.6300117371115 -5.61950522102368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.296796661271091 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 35 36 71 16.5163722276051 19.0117314230347 -2.49535919542956 T:C T C 10 0.528103650639853 0.555153774558224 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 71 74 145 33.5046408045704 39.0796701473491 -5.57502934277868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.361348434757906 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179012947 C/G 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 C:G C G 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000116199:ENST00000440702:exon_179012850_179013359:FAM20B;ENSG00000116199:ENST00000263733:exon_179012850_179013359:FAM20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179055020 C/T 1 63 72 135 29.7294700096893 38.0234628460694 -8.29399283638015 T:C C T 10 0.528103650639853 0.167822572582843 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000495145:exon_179054933_179055028:TOR3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 14 18 32 6.60654889104206 9.50586571151735 -2.8993168204753 T:C C T 10 0.528103650639853 0.376496178274613 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 C:G C G 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 35 22 57 16.5163722276051 11.6182803140768 4.89809191352838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.232427380868215 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179887125 G/A 1 61 56 117 28.785677310969 29.5738044358318 -0.7881271248628 A:G G A 10 0.528103650639853 0.926318402230186 ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179886587_179890583:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179887082_179887374:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179886587_179889211:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179886587_179888412:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179886587_179887533:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000447964:exon_179886587_179887306:TOR1AIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 179989742 G/C 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_179989084_179990144:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000439289:exon_179989084_179989970:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_179989650_179990144:CEP350 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 180010874 A/G 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000418229:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490047:exon_180010797_180010937:CEP350 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 180010911 A/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000367606:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000418229:exon_180010797_180010937:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490047:exon_180010797_180010937:CEP350 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 38 56 94 17.9320612756856 29.5738044358318 -11.6417431601462 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0173851092668193 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 186316436 G/A 1 29 30 59 13.6849941314443 15.8431095191956 -2.15811538775133 A:G G A 10 0.528103650639853 0.603562008103405 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 197094030 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197094000_197094085:ASPM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 197128726 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000177888:ENST00000467322:exon_197127572_197129144:ZBTB41;ENSG00000177888:ENST00000367405:exon_197128455_197129144:ZBTB41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 198671653 A/G 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 A:G A G 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000391970:exon_198671516_198671659:PTPRC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 201352291 C/T 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000159166:ENST00000503578:exon_201352202_201352339:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201352202_201352339:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201352202_201352339:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000475136:exon_201352202_201352336:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000488842:exon_201352202_201352339:LAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 50 49 99 23.5948174680073 25.8770788813528 -2.28226141334545 A:T A T 10 0.528103650639853 0.687631334400607 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 70 62 132 33.0327444552103 32.7424263396709 0.290318115539407 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 59 43 102 27.8418846122487 22.7084569775137 5.133427634735 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322753886375285 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 62 84 146 29.2575736603291 44.3607066537476 -15.1031329934185 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0128485950949274 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 202104616 T/A 1 28 19 47 13.2130977820841 10.0339693621572 3.17912841992691 A:T T A 10 0.528103650639853 0.383286877131814 ENSG00000143862:ENST00000272217:exon_202104587_202104654:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000491358:exon_202104587_202104736:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000486225:exon_202104587_202104928:ARL8A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 202119546 C/G 1 41 60 101 19.347750323766 31.6862190383912 -12.3384687146252 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0164081676354379 ENSG00000143851:ENST00000309017:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000367279:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000308986:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000495688:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000462815:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000496197:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000480836:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477554:exon_202119439_202119552:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000492977:exon_202118979_202119552:PTPN7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C T C 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 205744138 G/T 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 T:G G T 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 206650065 A/G 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206650021_206650181:IKBKE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 234 248 482 110.423745750274 130.969705358684 -20.5459596084091 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0615349921816965 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207269919 C/T 1 11 1 12 5.19085984296162 0.528103650639853 4.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00727604133363875 ENSG00000123843:ENST00000367078:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391924:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000452902:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000243611:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000367076:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391923:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000469326:exon_207268279_207269960:C4BPB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207782769 G/A 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.130559033023297 ENSG00000203710:ENST00000367052:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367051:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367053:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000400960:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000534202:exon_207782635_207782891:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367049:exon_207782635_207783033:CR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207782931 A/G 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000203710:ENST00000367052:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367051:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367053:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000400960:exon_207782635_207783033:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367049:exon_207782635_207783033:CR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207795320 A/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000203710:ENST00000367052:exon_207795318_207795341:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367051:exon_207795318_207795341:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367053:exon_207795318_207795341:CR1;ENSG00000203710:ENST00000400960:exon_207795318_207795341:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367049:exon_207795318_207795341:CR1;ENSG00000203710:ENST00000529814:exon_207795318_207795341:CR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 207812791 A/G 1 20 26 46 9.43792698720294 13.7306949166362 -4.29276792943324 A:G A G 10 0.528103650639853 0.237865484014599 ENSG00000203710:ENST00000367052:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367051:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367053:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000400960:exon_207812742_207813553:CR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 34 20 54 16.044475878245 10.5620730127971 5.48240286544794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.172330036789244 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 209933660 G/C 1 20 22 42 9.43792698720294 11.6182803140768 -2.18035332687382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.5386334947568 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 81 66 147 38.2236042981719 34.8548409422303 3.36876335594161 A:T:C A C 10 0.528103650639853 0.620404036655051 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 209950848 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 50 44 94 23.5948174680073 23.2365606281535 0.358256839853819 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 26 18 44 12.2693050833638 9.50586571151735 2.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.452030257404925 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 84 108 192 39.6392933462524 57.0351942691041 -17.3959009228518 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0137923818046508 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 31 22 53 14.6287868301646 11.6182803140768 3.01050651608779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.491893222169063 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 213031948 G/C 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 C:G G C 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213031597_213032532:FLVCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 14 20 34 6.60654889104206 10.5620730127971 -3.955524121755 T:C C T 10 0.528103650639853 0.228744499275871 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 214819818 G/A 1 41 40 81 19.347750323766 21.1241460255941 -1.77639570182809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.73895438055875 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 59 53 112 27.8418846122487 27.9894934839122 -0.147608871663536 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 218478411 G/C 1 66 55 121 31.1451590577697 29.0457007851919 2.09945827257779 C:G G C 10 0.528103650639853 0.71668032637918 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218478370_218478467:RRP15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 22 25 47 10.3817196859232 13.2025912659963 -2.82087158007309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.465936799923338 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 220344453 T/C 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220344234_220344462:RAB3GAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 220363460 T/C 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220363406_220363488:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000478976:exon_220363406_220363488:RAB3GAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 42 57 99 19.8196466731262 30.1019080864716 -10.2822614133454 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0437597608515631 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 43 62 105 20.2915430224863 32.7424263396709 -12.4508833171846 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.0185624434241656 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 223954080 A/C 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:C A C 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223954069_223954133:CAPN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 224492746 C/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000488718:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224492736_224492868:NVL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 224495852 C/T 1 10 15 25 4.71896349360147 7.92155475959779 -3.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.231726348019023 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224495693_224495919:NVL;ENSG00000143748:ENST00000470903:exon_224495688_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000461466:exon_224495695_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000498767:exon_224495710_224495965:NVL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 21 23 44 9.90982333656309 12.1463839647166 -2.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.547383567807044 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 225609884 A/G 1 9 20 29 4.24706714424132 10.5620730127971 -6.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0243134393186138 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225609813_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000488632:exon_225609779_225610129:LBR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226032928 G/A 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226065291 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226065095_226065294:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000436966:exon_226065095_226065379:TMEM63A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 115 116 231 54.2680801764169 61.2600234742229 -6.99194329780604 A:G A G 10 0.528103650639853 0.357237272248919 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 212 216 428 100.042026064351 114.070388538208 -14.0283624738571 T:C T C 10 0.528103650639853 0.175592586318367 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 171 161 332 80.6942757405851 85.0246877530163 -4.3304120124312 A:G A G 10 0.528103650639853 0.66021978403042 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 117 105 222 55.2118728751372 55.4508833171846 -0.239010442047359 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 38 30 68 17.9320612756856 15.8431095191956 2.08895175649 C:G C G 10 0.528103650639853 0.629327372215205 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 227216775 C/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 53 59 112 25.0105065160878 31.1581153877513 -6.14760887166354 A:T:G T G 10 0.528103650639853 0.256944424804935 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 41 28 69 19.347750323766 14.7869022179159 4.56084810585014 A:G G A 10 0.528103650639853 0.280639208980292 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 228294567 C/T 1 23 39 62 10.8536160352834 20.5960423749543 -9.74242633967088 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0152426395756227 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228294381_228294619:MRPL55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:C A C 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 18 19 37 8.49413428848265 10.0339693621572 -1.53983507367456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.625425947028641 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 23 19 42 10.8536160352834 10.0339693621572 0.819646673126176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.877667714203748 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 14 20 34 6.60654889104206 10.5620730127971 -3.955524121755 T:C T C 10 0.528103650639853 0.228744499275871 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 230384970 G/A 1 16 14 30 7.55034158976235 7.39345110895794 0.15689048080441 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 26 29 55 12.2693050833638 15.3150058685557 -3.04570078519192 A:G A G 10 0.528103650639853 0.421148445744323 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 234603386 G/T 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:G G T 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234603248_234603396:TARBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 234606998 A/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G A G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234606934_234607003:TARBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236175339 T/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 7 21 28 3.30327444552103 11.0901766634369 -7.78690221791588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00385495606769688 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:T T A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:T T A 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 12 2 14 5.66275619232176 1.05620730127971 4.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0148564761173621 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 15 1 16 7.07844524040221 0.528103650639853 6.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000674230900694594 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 0 13 0 13 6.13465254168191 0 6.13465254168191 G G 10 0.528103650639853 0.000306057846063738 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236706283 G/A 0 14 0 14 6.60654889104206 0 6.60654889104206 G G 10 0.528103650639853 0.000158395828320234 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 0 14 0 14 6.60654889104206 0 6.60654889104206 T T 10 0.528103650639853 0.000158395828320234 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 25 23 48 11.7974087340037 12.1463839647166 -0.348975230712943 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 14 21 35 6.60654889104206 11.0901766634369 -4.48362777239485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.17475961583573 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 26 31 57 12.2693050833638 16.3712131698354 -4.10190808647162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.290912631487119 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 44 49 93 20.7634393718465 25.8770788813528 -5.11363950950633 T:C T C 10 0.528103650639853 0.300368944227016 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 39 68 107 18.4039576250457 35.91104824351 -17.5070906184643 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000906356226746287 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 15 12 27 7.07844524040221 6.33724380767824 0.741201432723969 C:G G C 10 0.528103650639853 0.848515385288294 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 39 40 79 18.4039576250457 21.1241460255941 -2.72018840054838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.574043163091916 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236749626 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 13 14 27 6.13465254168191 7.39345110895794 -1.25879856727603 T:C C T 10 0.528103650639853 0.701591240329278 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 236751269 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236751248_236751343:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236751248_236751343:HEATR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 237058729 C/T 1 11 2 13 5.19085984296162 1.05620730127971 4.13465254168191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0251289067861436 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 237058748 C/T 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 241667523 C/T 1 113 82 195 53.3242874776966 43.3044993524679 10.0197881252287 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.152250853896850 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241667342_241667545:FH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 18 19 37 8.49413428848265 10.0339693621572 -1.53983507367456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.625425947028641 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 A:T T A 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 18 17 35 8.49413428848265 8.9777620608775 -0.483627772394854 C:G G C 10 0.528103650639853 0.867648600286817 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 77 70 147 36.3360189007313 36.9672555447897 -0.63123664405839 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.934302570628097 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 91 76 167 42.9425677917734 40.1358774486288 2.80669034314455 T:C C T 10 0.528103650639853 0.698655426985069 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 23 14 37 10.8536160352834 7.39345110895794 3.46016492632544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.323315400762097 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:C C A 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 8007428 C/A 1 16 13 29 7.55034158976235 6.86534745831809 0.684994131444263 A:C C A 10 0.528103650639853 0.854027499191445 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 A:T A T 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 21 21 42 9.90982333656309 11.0901766634369 -1.18035332687382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75862144149592 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 28 29 57 13.2130977820841 15.3150058685557 -2.10190808647162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.597826186588612 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 18 15 33 8.49413428848265 7.92155475959779 0.572579528884852 A:G A G 10 0.528103650639853 0.8636141408051 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11805339 C/T 0 13 0 13 6.13465254168191 0 6.13465254168191 C C 10 0.528103650639853 0.000306057846063738 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000422887:exon_11805223_11805350:ECHDC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11805354 A/G 0 11 0 11 5.19085984296162 0 5.19085984296162 A A 10 0.528103650639853 0.00114948010758163 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 0 12 0 12 5.66275619232176 0 5.66275619232176 G G 10 0.528103650639853 0.000592519996121889 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 51 56 107 24.0667138173675 29.5738044358318 -5.50709061846427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.288818274462596 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 T:G T G 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 117 105 222 55.2118728751372 55.4508833171846 -0.239010442047359 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 T:C T C 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 13658436 G/A 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000298451:exon_13658398_13658553:PRPF18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 25 42 67 11.7974087340037 22.1803533268738 -10.3829445928701 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0138404172458634 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 12 3 15 5.66275619232176 1.58431095191956 4.07844524040221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0393940244088059 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 16556710 T/C 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.160006891527948 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 24762465 A/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24762157_24762989:KIAA1217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 24832885 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24831812_24833101:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 24833137 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 24908998 C/T 1 13 22 35 6.13465254168191 11.6182803140768 -5.48362777239485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0890065243419107 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 25312689 A/G 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 24 27 51 11.3255123846435 14.258798567276 -2.9332861826325 T:C C T 10 0.528103650639853 0.483553268543661 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 A:T A T 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 C:G C G 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 36 41 77 16.9882685769653 21.652249676234 -4.66398109926868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.305532987879876 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 62 65 127 29.2575736603291 34.3267372915904 -5.06916363126133 T:C T C 10 0.528103650639853 0.375460797613071 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 51 49 100 24.0667138173675 25.8770788813528 -1.8103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.764108981597724 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 22 14 36 10.3817196859232 7.39345110895794 2.98826857696529 T:C T C 10 0.528103650639853 0.404300870104369 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 T:C T C 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27508754 C/T 1 3 9 12 1.41568904808044 4.75293285575868 -3.33724380767824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0797554887978025 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27508652_27508786:ACBD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 27508758 T/C 1 10 3 13 4.71896349360147 1.58431095191956 3.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.098906296354315 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27508652_27508786:ACBD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 240 312 552 113.255123846435 164.768338999634 -51.5132151531988 T:C T C 10 0.528103650639853 1.30111188831096e-05 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 31134214 A/G 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G A G 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31133563_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31133567_31134502:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31133710_31134502:ZNF438 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 32141460 T/C 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32141445_32141525:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000454919:exon_32141445_32141525:ARHGAP12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 33200468 G/A 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 A:G G A 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000494395:exon_33200455_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33200376_33200598:ITGB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 38343858 C/T 1 15 3 18 7.07844524040221 1.58431095191956 5.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00919122956052275 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 38344414 G/A 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 18 15 33 8.49413428848265 7.92155475959779 0.572579528884852 T:G T G 10 0.528103650639853 0.8636141408051 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 19 17 36 8.96603063784279 8.9777620608775 -0.011731423034707 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 43315693 G/A 1 73 70 143 34.4484335032907 36.9672555447897 -2.51882204149898 A:G G A 10 0.528103650639853 0.676403772645737 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43315684_43315872:BMS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 34 14 48 16.044475878245 7.39345110895794 8.65102476928706 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0135420725179401 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 45878050 G/A 1 27 13 40 12.741201432724 6.86534745831809 5.87585397440588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0804307388500419 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45877931_45878129:ALOX5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 46121549 G/A 1 21 20 41 9.90982333656309 10.5620730127971 -0.652249676233971 A:G G A 10 0.528103650639853 0.876554524090356 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 50732280 C/T 1 13 15 28 6.13465254168191 7.92155475959779 -1.78690221791588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.5719128206726 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50732079_50732823:ERCC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 50740600 C/T 1 8 13 21 3.77517079488118 6.86534745831809 -3.09017666343691 T:C C T 10 0.528103650639853 0.195195777078582 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 50740876 G/C 1 11 2 13 5.19085984296162 1.05620730127971 4.13465254168191 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0251289067861436 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 50953533 G/A 1 1 9 10 0.471896349360147 4.75293285575868 -4.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00836318289032847 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50953390_50953542:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50953390_50953542:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50953390_50953542:OGDHL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 65 0 65 30.6732627084096 0 30.6732627084096 G G 10 0.528103650639853 9.9439535475857e-19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 13 6 19 6.13465254168191 3.16862190383912 2.96603063784279 A:G A G 10 0.528103650639853 0.250158578602722 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 58 60 118 27.3699882628885 31.6862190383912 -4.31623077550265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.461081668060308 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 54 54 108 25.4824028654479 28.5175971345521 -3.03519426910412 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.564679018775587 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 46 37 83 21.7072320705668 19.5398350736746 2.1673969968922 A:C C A 10 0.528103650639853 0.661359872628711 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 60127732 C/G 1 34 54 88 16.044475878245 28.5175971345521 -12.4731212563071 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00999025823825863 ENSG00000072401:ENST00000373910:exon_60127683_60127776:UBE2D1;ENSG00000072401:ENST00000185885:exon_60127683_60127776:UBE2D1;ENSG00000072401:ENST00000473824:exon_60127683_60127776:UBE2D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 24 11 35 11.3255123846435 5.80914015703838 5.51637222760515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0645068375392556 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 32 20 52 15.1006831795247 10.5620730127971 4.53861016672765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.214847126212588 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 69793943 G/C 1 21 23 44 9.90982333656309 12.1463839647166 -2.23656062815353 C:G G C 10 0.528103650639853 0.547383567807044 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000463478:exon_69793722_69793943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000513996:exon_69793757_69793943:HERC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 995 690 1685 469.536867613346 364.391518941499 105.145348671848 A:C:G G A 10 0.528103650639853 2.89267341249999e-07 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 54 57 111 25.4824028654479 30.1019080864716 -4.61950522102368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.393416052815264 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 71880858 A/G 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:C:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71880848_71880967:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71880848_71880967:AIFM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 71905735 G/A 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 28 23 51 13.2130977820841 12.1463839647166 1.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.781189943617634 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 17 7 24 8.0222379391225 3.69672555447897 4.32551238464353 A:C A C 10 0.528103650639853 0.100828950492662 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 21 17 38 9.90982333656309 8.9777620608775 0.932061275685587 T:C C T 10 0.528103650639853 0.871270719218986 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 30 16 46 14.1568904808044 8.44965841023765 5.70723207056676 T:C T C 10 0.528103650639853 0.104582061936465 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 105 99 204 49.5491166828154 52.2822614133454 -2.73314473053001 T:C T C 10 0.528103650639853 0.726112126632985 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 55 60 115 25.9542992148081 31.6862190383912 -5.73191982358309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.3047462527429 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 49 61 110 23.1229211186472 32.214322689031 -9.09140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0861091742222359 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 39 62 101 18.4039576250457 32.7424263396709 -14.3384687146252 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00504448826788432 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 28 30 58 13.2130977820841 15.8431095191956 -2.63001173711147 A:T:C T A 10 0.528103650639853 0.512894467717673 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 19 19 38 8.96603063784279 10.0339693621572 -1.06793872431441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.74778887552863 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 15 16 31 7.07844524040221 8.44965841023765 -1.37121316983544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.719840958697151 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 67 69 136 31.6170554071299 36.4391518941499 -4.82209648702001 A:G A G 10 0.528103650639853 0.439816837845969 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75407290 G/A 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000166317:ENST00000372873:exon_75404639_75408637:SYNPO2L;ENSG00000166317:ENST00000394810:exon_75404639_75408637:SYNPO2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75506674 T/C 1 57 35 92 26.8980919135284 18.4836277723949 8.41446414113353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0942828260836448 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000477008:exon_75506625_75506762:SEC24C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75526198 C/T 1 54 65 119 25.4824028654479 34.3267372915904 -8.84433442614251 T:C C T 10 0.528103650639853 0.118323724155946 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75526108_75526299:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75526108_75526299:SEC24C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75527708 A/G 1 28 43 71 13.2130977820841 22.7084569775137 -9.49535919542956 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0316509288647853 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75527595_75527765:SEC24C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 9 17 26 4.24706714424132 8.9777620608775 -4.73069491663618 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0767273473177002 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75559077 G/A 1 23 16 39 10.8536160352834 8.44965841023765 2.40395762504573 A:G G A 10 0.528103650639853 0.522034501209129 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 75576857 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000148660:ENST00000322635:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000351293:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000322680:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000423381:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394762:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000394763:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000433289:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000372765:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000305762:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000441192:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000472912:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000474131:exon_75576781_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000487167:exon_75576365_75576875:CAMK2G;ENSG00000148660:ENST00000477205:exon_75576680_75576875:CAMK2G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 79795434 C/T 1 4385 3332 7717 2069.26549194424 1759.64136393199 309.624128012255 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 1.52330307809803e-12 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000478655:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000464716:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000476545:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000466129:exon_79795269_79795844:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000482069:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000465692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000467106:exon_79795269_79795448:RPS24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 87 60 147 41.0549823943328 31.6862190383912 9.36876335594161 A:G G A 10 0.528103650639853 0.136854219019050 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 15 12 27 7.07844524040221 6.33724380767824 0.741201432723969 T:C T C 10 0.528103650639853 0.848515385288294 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 24 16 40 11.3255123846435 8.44965841023765 2.87585397440588 A:T A T 10 0.528103650639853 0.429339711058927 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 88939898 C/T 1 15 16 31 7.07844524040221 8.44965841023765 -1.37121316983544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.719840958697151 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88939832_88940060:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88939832_88940060:FAM35A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 17 15 32 8.0222379391225 7.92155475959779 0.100683179524705 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 48 48 96 22.6510247692871 25.3489752307129 -2.69795046142589 A:T T A 10 0.528103650639853 0.610065090016167 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 A:C C A 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 C:G C G 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 14 5 19 6.60654889104206 2.64051825319926 3.96603063784279 T:G G T 10 0.528103650639853 0.105309108512039 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:T A T 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:T A T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 26 13 39 12.2693050833638 6.86534745831809 5.40395762504573 A:G A G 10 0.528103650639853 0.107736367085916 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 94397295 A/T 1 44 32 76 20.7634393718465 16.8993168204753 3.86412255137117 A:T:G A T 10 0.528103650639853 0.421753726288302 ENSG00000138160:ENST00000260731:exon_94397144_94397302:KIF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 19 25 44 8.96603063784279 13.2025912659963 -4.23656062815353 C:G C G 10 0.528103650639853 0.227976883056393 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 24 24 48 11.3255123846435 12.6744876153565 -1.34897523071295 A:T A T 10 0.528103650639853 0.772977371861394 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 12 16 28 5.66275619232176 8.44965841023765 -2.78690221791588 T:G T G 10 0.528103650639853 0.345411965030106 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 13 16 29 6.13465254168191 8.44965841023765 -2.31500586855574 A:G G A 10 0.528103650639853 0.458325929651428 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 97388162 G/A 1 24 20 44 11.3255123846435 10.5620730127971 0.763439371846468 A:G G A 10 0.528103650639853 0.880578951681275 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97388125_97388249:ALDH18A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 27 31 58 12.741201432724 16.3712131698354 -3.63001173711147 A:T A T 10 0.528103650639853 0.359390897163681 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 97604260 G/C 1 80 103 183 37.7517079488118 54.3946760159049 -16.6429680670931 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0144893678980086 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97604233_97604392:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97604233_97604604:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97604233_97604310:ENTPD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 51 76 127 24.0667138173675 40.1358774486288 -16.0691636312613 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.00441193068519698 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 22 18 40 10.3817196859232 9.50586571151735 0.875853974405882 A:C C A 10 0.528103650639853 0.874571903122238 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 98742605 C/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 98742750 A/C 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 A A 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 99019177 A/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G A G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000213390:ENST00000358531:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000492211:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000371027:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000479633:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000316676:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000358308:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000355366:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000393817:exon_99019159_99019385:ARHGAP19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 24 18 42 11.3255123846435 9.50586571151735 1.81964667312617 A:G G A 10 0.528103650639853 0.644103924037243 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 5 23 28 2.35948174680074 12.1463839647166 -9.78690221791588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000200560071877062 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 99508111 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99508026_99508121:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99508026_99508121:ZFYVE27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 7 15 22 3.30327444552103 7.92155475959779 -4.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0554919458936411 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 101716484 G/A 1 9 13 22 4.24706714424132 6.86534745831809 -2.61828031407677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.291233724549757 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 18 6 24 8.49413428848265 3.16862190383912 5.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0390594566667783 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 T:C C T 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 120 81 201 56.6275619232176 42.7763957018281 13.8511662213895 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0562401497760731 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 4 10 14 1.88758539744059 5.28103650639853 -3.39345110895794 A:C C A 10 0.528103650639853 0.105430532897226 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 7 15 22 3.30327444552103 7.92155475959779 -4.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0554919458936411 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 104414984 C/T 1 24 33 57 11.3255123846435 17.4274204711151 -6.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.112544977012801 ENSG00000171206:ENST00000302424:exon_104414837_104415070:TRIM8;ENSG00000171206:ENST00000369896:exon_104414837_104415070:TRIM8;ENSG00000171206:ENST00000462202:exon_104414841_104415070:TRIM8;ENSG00000171206:ENST00000487927:exon_104414837_104415070:TRIM8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 35 30 65 16.5163722276051 15.8431095191956 0.673262708409556 T:C C T 10 0.528103650639853 0.90163495487036 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 T:G G T 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 105363289 T/C 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C T C 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 105372696 G/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105372610_105372947:SH3PXD2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 A:G A G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 225 199 424 106.176678606033 105.092626477331 1.08405212870234 A:C:G C A 10 0.528103650639853 0.922588950490552 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 106075159 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000148841:ENST00000337478:exon_106071894_106075822:ITPRIP;ENSG00000148841:ENST00000278071:exon_106071901_106075822:ITPRIP;ENSG00000148841:ENST00000358187:exon_106071902_106075822:ITPRIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 29 11 40 13.6849941314443 5.80914015703838 7.87585397440588 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0164627294453041 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 25 13 38 11.7974087340037 6.86534745831809 4.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.142776864266523 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 31 39 70 14.6287868301646 20.5960423749543 -5.96725554478971 C:G C G 10 0.528103650639853 0.187511519051272 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 115922563 G/A 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 120810098 C/T 1 145 145 290 68.4249706572213 76.5750293427787 -8.15005868555735 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.347061936978133 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120810033_120810186:EIF3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 113 101 214 53.3242874776966 53.3384687146252 -0.0141812369285361 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 63 40 103 29.7294700096893 21.1241460255941 8.60532398409514 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0939244581509806 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 121086097 A/T 1 21 15 36 9.90982333656309 7.92155475959779 1.98826857696529 A:T A T 10 0.528103650639853 0.617179411281929 ENSG00000198873:ENST00000369106:exon_121086028_121086123:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121086028_121086123:GRK5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 121685689 G/A 1 30 35 65 14.1568904808044 18.4836277723949 -4.32673729159044 A:G G A 10 0.528103650639853 0.320661104215808 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G G A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 19 8 27 8.96603063784279 4.22482920511882 4.74120143272397 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0823937518569907 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 27 44 71 12.741201432724 23.2365606281535 -10.4953591954296 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0168178369931143 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 C:G C G 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 T:G T G 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 0 0 11 11 0 5.80914015703838 -5.80914015703838 A G A 10 0.528103650639853 0.000258412069235989 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 124896963 C/T 1 84 33 117 39.6392933462524 17.4274204711151 22.2118728751372 T:C C T 10 0.528103650639853 3.78294396537373e-05 ENSG00000188620:ENST00000357878:exon_124896574_124897247:HMX3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 126655336 A/G 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 A:G A G 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126655163_126655350:ZRANB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 127452054 G/A 1 27 29 56 12.741201432724 15.3150058685557 -2.57380443583177 A:G G A 10 0.528103650639853 0.506164201203609 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127451870_127452148:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127451870_127452093:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127451870_127452220:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127451870_127452220:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127451870_127452708:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127451870_127452703:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127451870_127452703:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000527655:exon_127451870_127452275:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127451870_127452712:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000525358:exon_127451870_127452151:C10orf137 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 147 164 311 69.3687633559416 86.6089987049359 -17.2402353489943 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0534145500903369 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 149 151 300 70.3125560546619 79.7436512466178 -9.43109519195589 C:G G C 10 0.528103650639853 0.297928829611230 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129901066 C/A 1 100 135 235 47.1896349360147 71.2939928363802 -24.1043579003655 A:T:C C A 10 0.528103650639853 0.00168723693667506 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 156 136 292 73.6158305001829 71.82209648702 1.79373401316293 T:C T C 10 0.528103650639853 0.860509673407588 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 79 68 147 37.2798115994516 35.91104824351 1.36876335594161 A:G G A 10 0.528103650639853 0.868888317478035 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 170 168 338 80.222379391225 88.7214133074953 -8.49903391627031 T:C T C 10 0.528103650639853 0.355047422633597 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 165 152 317 77.8628976444243 80.2717548972577 -2.4088572528334 T:G T G 10 0.528103650639853 0.822012946253653 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 164 150 314 77.3910012950641 79.215547595978 -1.82454630091384 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.865402598308227 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 141 155 296 66.5373852597807 81.8560658491772 -15.3186805893965 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0806195252940466 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 160 163 323 75.5034158976235 86.080895054296 -10.5774791566725 A:T T A 10 0.528103650639853 0.242310023365787 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 156 159 315 73.6158305001829 83.9684804517366 -10.3526499515537 T:C T C 10 0.528103650639853 0.259058881453696 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 121 99 220 57.0994582725778 52.2822614133454 4.81719685923235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.543612720656532 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 102 102 204 48.133427634735 53.866572365265 -5.73314473053001 T:C C T 10 0.528103650639853 0.440827511464554 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 93 86 179 43.8863604904937 45.4169139550274 -1.53055346453368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.822758799810262 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 55 70 125 25.9542992148081 36.9672555447897 -11.0129563299816 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0491940352478885 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 68 54 122 32.08895175649 28.5175971345521 3.57135462193794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.527147691260855 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 50 47 97 23.5948174680073 24.8208715800731 -1.22605411206574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.839158273808122 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 40 30 70 18.8758539744059 15.8431095191956 3.03274445521029 C:G G C 10 0.528103650639853 0.475876831111655 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 A:T A T 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 18 29 47 8.49413428848265 15.3150058685557 -6.82087158007309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0567243206581705 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 66 85 151 31.1451590577697 44.8888103043875 -13.7436512466178 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0275782260676794 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 90 70 160 42.4706714424132 36.9672555447897 5.50341589762353 C:G G C 10 0.528103650639853 0.428555523446668 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 A A 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 0 11 0 11 5.19085984296162 0 5.19085984296162 C C 10 0.528103650639853 0.00114948010758163 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 10 135197680 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135197628_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135197649_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135197464_135197716:PAOX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 432006 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_431694_433459:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_431999_432054:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_431999_432054:ANO9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 433867 G/A 1 12 5 17 5.66275619232176 2.64051825319926 3.0222379391225 A:G G A 10 0.528103650639853 0.154173525467798 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_433815_433937:ANO9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 135 112 247 63.7060071636198 59.1476088716635 4.55839829195631 C:G G C 10 0.528103650639853 0.567035219234217 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 104 79 183 49.0772203334553 41.7201884005484 7.3570319329069 T:C C T 10 0.528103650639853 0.300065629442317 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:G A G 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 24 14 38 11.3255123846435 7.39345110895794 3.93206127568559 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.255281163532083 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 31 25 56 14.6287868301646 13.2025912659963 1.42619556416823 C:G C G 10 0.528103650639853 0.789306061307979 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 828916 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000177685:ENST00000533803:exon_828852_828929:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000534191:exon_828852_829352:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000527089:exon_828852_828950:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000534606:exon_828852_829070:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000528542:exon_828852_828963:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000450448:exon_828852_828963:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000321883:exon_828852_828963:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000450828:exon_828852_829187:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000327417:exon_828852_828963:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000530737:exon_828852_829183:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000525077:exon_828852_828963:EFCAB4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 85 89 174 40.1111896956125 47.0012249069469 -6.89003521133442 T:C C T 10 0.528103650639853 0.323649846056965 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 20 34 54 9.43792698720294 17.955524121755 -8.51759713455206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0282459249658424 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 14 20 34 6.60654889104206 10.5620730127971 -3.955524121755 T:C C T 10 0.528103650639853 0.228744499275871 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 141 124 265 66.5373852597807 65.4848526793418 1.05253258043896 A:G G A 10 0.528103650639853 0.902260819030205 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 2356823 C/T 0 223 0 223 105.232885907313 0 105.232885907313 C C 10 0.528103650639853 1.61263017383512e-62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 32 20 52 15.1006831795247 10.5620730127971 4.53861016672765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.214847126212588 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 47 30 77 22.1791284199269 15.8431095191956 6.33601890073132 C:G G C 10 0.528103650639853 0.170714851458690 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 3723703 C/T 1 40 54 94 18.8758539744059 28.5175971345521 -9.64174316014618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0497416201358692 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000529063:exon_3723693_3723881:NUP98 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 4112773 C/G 1 55 59 114 25.9542992148081 31.1581153877513 -5.20381617294324 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.348895845871497 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4112512_4114439:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4112512_4113028:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4112512_4113356:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4112512_4112899:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526156:exon_4112512_4113196:STIM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 17 23 40 8.0222379391225 12.1463839647166 -4.12414602559412 A:C C A 10 0.528103650639853 0.207607836596394 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 126 129 255 59.4589400193785 68.125370932541 -8.66643091316251 A:G A G 10 0.528103650639853 0.286658267298242 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 50 47 97 23.5948174680073 24.8208715800731 -1.22605411206574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.839158273808122 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 15 16 31 7.07844524040221 8.44965841023765 -1.37121316983544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.719840958697151 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:T A T 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 178 152 330 83.9975501861062 80.2717548972577 3.72579528884852 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.699753456687815 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 281 254 535 132.602874170201 134.138327262523 -1.53545309232135 T:C C T 10 0.528103650639853 0.89672917841159 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 6976988 A/T 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 A A 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000149054:ENST00000527171:exon_6976921_6977336:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000278319:exon_6976921_6979068:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000299468:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529755:exon_6976921_6977341:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000414517:exon_6976921_6979079:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529903:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000532533:exon_6976921_6977013:ZNF215 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 57 60 117 26.8980919135284 31.6862190383912 -4.7881271248628 C:G C G 10 0.528103650639853 0.405029252820164 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 28 50 78 13.2130977820841 26.4051825319927 -13.1920847499085 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00304182708784912 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 80 41 121 37.7517079488118 21.652249676234 16.0994582725778 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.00346511069668340 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 15 27 42 7.07844524040221 14.258798567276 -7.18035332687383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0301546351986861 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 29 19 48 13.6849941314443 10.0339693621572 3.65102476928706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.314268542891197 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 C:G G C 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 T:C C T 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 19167850 A/G 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000177054:ENST00000532026:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000446113:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000527094:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000319776:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000399351:exon_19167728_19167850:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000525490:exon_19167728_19167850:ZDHHC13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 88 97 185 41.5268787436929 51.2260541120657 -9.6991753683728 T:G T G 10 0.528103650639853 0.161979192456358 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 114 125 239 53.7961838270568 66.0129563299816 -12.2167725029249 T:C T C 10 0.528103650639853 0.120027329295569 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 22647008 G/T 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 T:G G T 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 32955122 A/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 121 98 219 57.0994582725778 51.7541577627056 5.3453005098722 T:C T C 10 0.528103650639853 0.498740857777415 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 34 27 61 16.044475878245 14.258798567276 1.78567731096897 A:G A G 10 0.528103650639853 0.70132143859748 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34152410 G/A 1 40 36 76 18.8758539744059 19.0117314230347 -0.135877448628825 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34152360_34152484:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34152360_34152484:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34152360_34152484:NAT10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 43 33 76 20.2915430224863 17.4274204711151 2.86412255137117 T:G T G 10 0.528103650639853 0.566217517691331 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 18 30 48 8.49413428848265 15.8431095191956 -7.34897523071294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0420647327317077 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 4 12 16 1.88758539744059 6.33724380767824 -4.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0417233745614009 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34938199 C/G 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 C:G C G 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34938269 C/T 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 C C 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34938310 T/C 1 13 2 15 6.13465254168191 1.05620730127971 5.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00872208904450117 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 19 22 41 8.96603063784279 11.6182803140768 -2.65224967623397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.436883368571926 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 43357486 G/A 1 16 34 50 7.55034158976235 17.955524121755 -10.4051825319926 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0041609314181152 ENSG00000166181:ENST00000424223:exon_43357408_43357544:API5;ENSG00000166181:ENST00000455725:exon_43357408_43357544:API5;ENSG00000166181:ENST00000531273:exon_43357408_43357544:API5;ENSG00000166181:ENST00000420461:exon_43357408_43357544:API5;ENSG00000166181:ENST00000378852:exon_43357408_43357544:API5;ENSG00000166181:ENST00000534600:exon_43357408_43357780:API5;ENSG00000166181:ENST00000526394:exon_43357408_43357490:API5;ENSG00000166181:ENST00000532267:exon_43357408_43357614:API5;ENSG00000166181:ENST00000529932:exon_43357408_43357771:API5;ENSG00000166181:ENST00000529334:exon_43357408_43357544:API5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 44104885 T/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:G T G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 32 29 61 15.1006831795247 15.3150058685557 -0.214322689031032 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 44129290 C/A 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 A:C C A 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44129178_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000532479:exon_44129233_44129409:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000527014:exon_44129233_44129599:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44129233_44129798:EXT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 32 27 59 15.1006831795247 14.258798567276 0.841884612248673 A:G A G 10 0.528103650639853 0.896519013453437 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 34 32 66 16.044475878245 16.8993168204753 -0.854840942230297 T:C C T 10 0.528103650639853 0.902042914220886 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 46782179 G/A 1 46 57 103 21.7072320705668 30.1019080864716 -8.39467601590486 A:G G A 10 0.528103650639853 0.113959402776786 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46782162_46782334:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000527333:exon_46782162_46782200:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526876:exon_46782162_46782334:CKAP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 74 95 169 34.9203298526509 50.169846810786 -15.2495169581352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0206506730772682 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 47189728 C/A 1 62 50 112 29.2575736603291 26.4051825319927 2.85239112833646 A:C C A 10 0.528103650639853 0.636444384152433 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527927:exon_47189674_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000532478:exon_47189675_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000525635:exon_47189674_47190054:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000532438:exon_47189675_47189802:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000529455:exon_47189679_47189802:ARFGAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 A:G G A 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 46 55 101 21.7072320705668 29.0457007851919 -7.33846871462515 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.162797982745019 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 25 28 53 11.7974087340037 14.7869022179159 -2.98949348391221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.413540200884492 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 57467510 G/A 1 62 43 105 29.2575736603291 22.7084569775137 6.54911668281544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.205480459821958 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57467338_57467835:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57467338_57468659:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57467338_57468654:ZDHHC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 295 250 545 139.209423061243 132.025912659963 7.18351040128013 A:G G A 10 0.528103650639853 0.548287146710785 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 44 50 94 20.7634393718465 26.4051825319927 -5.64174316014618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.256867828768097 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 43 54 97 20.2915430224863 28.5175971345521 -8.22605411206574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.103740575956918 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 41 72 113 19.347750323766 38.0234628460694 -18.6757125223034 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000456402062653057 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 58979393 G/A 1 62 29 91 29.2575736603291 15.3150058685557 13.9425677917734 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00432014471490508 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 60184191 G/A 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000166928:ENST00000531787:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000300187:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000395005:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000530662:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000527841:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000525397:exon_60182910_60185036:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000531783:exon_60182910_60185161:MS4A14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 54 45 99 25.4824028654479 23.7646642787934 1.71773858665455 A:G G A 10 0.528103650639853 0.763280950079396 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 61906374 T/C 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 62288649 G/C 1 38 48 86 17.9320612756856 25.3489752307129 -7.41691395502736 C:G G C 10 0.528103650639853 0.130088807445299 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 62293822 C/T 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.253776528805514 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 52 47 99 24.5386101667276 24.8208715800731 -0.282261413345445 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 110 127 237 51.9085984296162 67.0691636312613 -15.1605652016452 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0509682136597597 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 145 128 273 68.4249706572213 67.5972672819012 0.827703375320141 T:C C T 10 0.528103650639853 0.95169175811645 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 A:G G A 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64026685 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64026530_64026716:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64026530_64026716:PLCB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64033476 G/A 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64033358_64033511:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64033358_64033511:PLCB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64034866 G/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 10 15 25 4.71896349360147 7.92155475959779 -3.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.231726348019023 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 58 47 105 27.3699882628885 24.8208715800731 2.54911668281544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.626739474777639 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 100 82 182 47.1896349360147 43.3044993524679 3.88513558354676 T:C T C 10 0.528103650639853 0.603474254406049 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:C T C 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 1 7 8 0.471896349360147 3.69672555447897 -3.22482920511882 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0305249046315294 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 13 6 19 6.13465254168191 3.16862190383912 2.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.250158578602722 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 110 67 177 51.9085984296162 35.3829445928702 16.525653836746 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0129591272729935 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 89 62 151 41.9987750930531 32.7424263396709 9.2563487533822 A:G A G 10 0.528103650639853 0.142417811548255 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64694207 G/A 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000068971:ENST00000526559:exon_64694184_64694380:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000164133:exon_64694184_64694380:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000532850:exon_64694184_64694380:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000527441:exon_64694184_64694380:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000359279:exon_64694184_64694380:PPP2R5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 101 131 232 47.6615312853748 69.1815782338207 -21.5200469484459 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.00563204656397602 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 38 26 64 17.9320612756856 13.7306949166362 4.20136635904941 T:C C T 10 0.528103650639853 0.318071291339751 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 47 38 85 22.1791284199269 20.0679387243144 2.1111896956125 T:C C T 10 0.528103650639853 0.66541528441886 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 77 59 136 36.3360189007313 31.1581153877513 5.17790351297999 T:C C T 10 0.528103650639853 0.391320103687124 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 171 165 336 80.6942757405851 87.1371023555757 -6.44282661499061 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.512084894212190 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65307852 G/A 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000322147:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529582:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000301873:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530785:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529189:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532932:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000528516:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000526927:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532661:exon_65307716_65307853:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529371:exon_65307716_65307923:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530866:exon_65307716_65307853:LTBP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65349502 G/T 1 19 12 31 8.96603063784279 6.33724380767824 2.62878683016456 T:G G T 10 0.528103650639853 0.373409226723547 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 30 25 55 14.1568904808044 13.2025912659963 0.954299214808085 A:G G A 10 0.528103650639853 0.892751594995530 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 A:G G A 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65546415 C/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 38 40 78 17.9320612756856 21.1241460255941 -3.19208474990853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.497361215326385 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 40 40 80 18.8758539744059 21.1241460255941 -2.24829205118824 C:G G C 10 0.528103650639853 0.654888620511177 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 24 8 32 11.3255123846435 4.22482920511882 7.1006831795247 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0127077595777180 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66043253 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 8 16 24 3.77517079488118 8.44965841023765 -4.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0659664265085599 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 12 26 38 5.66275619232176 13.7306949166362 -8.06793872431441 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00924218832107943 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 C:G G C 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 67258438 C/T 0 180 0 180 84.9413428848265 0 84.9413428848265 C C 10 0.528103650639853 1.36145338704067e-50 ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67258259_67258574:AIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 2057 1793 3850 970.690790633822 946.889845597256 23.800945036566 A:T:C:G A G 10 0.528103650639853 0.448063888809637 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 107 123 230 50.4929093815357 64.9567490287019 -14.4638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0641979131512763 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 68675700 C/T 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68675613_68675805:IGHMBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 70200529 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70200428_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526347:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530294:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526074:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000528750:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000533894:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530390:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000527612:exon_70200309_70200558:PPFIA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 19 14 33 8.96603063784279 7.39345110895794 1.57257952888485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.606072412847404 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 70281284 C/G 1 23 25 48 10.8536160352834 13.2025912659963 -2.34897523071294 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.563803045831336 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 49 68 117 23.1229211186472 35.91104824351 -12.7881271248628 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0203393106127390 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 32 46 78 15.1006831795247 24.2927679294332 -9.19208474990853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0410565199326458 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 81 37 118 38.2236042981719 19.5398350736746 18.6837692244973 C:G G C 10 0.528103650639853 0.000592778876078413 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 80 40 120 37.7517079488118 21.1241460255941 16.6275619232176 T:G T G 10 0.528103650639853 0.00244856850667270 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 58 59 117 27.3699882628885 31.1581153877513 -3.7881271248628 T:C C T 10 0.528103650639853 0.517296372291575 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 73105534 G/A 1 6 13 19 2.83137809616088 6.86534745831809 -4.03396936215721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0695977405691466 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73105522_73105779:RELT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 73620553 T/C 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 T:C T C 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 73687940 G/A 1 139 153 292 65.5935925610604 80.7998585478975 -15.2062659868371 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0786781957566091 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73687868_73688062:UCP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 118 128 246 55.6837692244973 67.5972672819012 -11.9134980574038 A:G G A 10 0.528103650639853 0.141762783586346 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 15 27 42 7.07844524040221 14.258798567276 -7.18035332687383 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0301546351986861 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 74559446 G/C 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 444 371 815 209.521979115905 195.926454387385 13.5955247285198 A:G A G 10 0.528103650639853 0.343721222103562 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 67 89 156 31.6170554071299 47.0012249069469 -15.3841694998171 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0158935022516957 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77884782 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000188997:ENST00000340067:exon_77882295_77885629:KCTD21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77920563 G/T 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 T:G G T 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530521:exon_77920494_77920597:USP35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:C C A 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77920930 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77930345 T/C 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77926342_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77926343_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77926343_77930461:GAB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77936166 A/G 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77936154_77936248:GAB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 77937800 G/A 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G G A 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000528329:exon_77937666_77938097:GAB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 T:G T G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 76 67 143 35.8641225513712 35.3829445928702 0.481177958501021 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 49 68 117 23.1229211186472 35.91104824351 -12.7881271248628 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0203393106127390 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 17 22 39 8.0222379391225 11.6182803140768 -3.59604237495427 A:C A C 10 0.528103650639853 0.264992380822541 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93464290 T/C 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93529655 G/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G G A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 94731759 G/A 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186280:ENST00000335080:exon_94730188_94732678:KDM4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 94862288 G/A 1 8 18 26 3.77517079488118 9.50586571151735 -5.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0297607143692655 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 207 192 399 97.6825443175504 101.395900922852 -3.71335660530134 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.725730265628308 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 27 16 43 12.741201432724 8.44965841023765 4.29154302248632 C:G G C 10 0.528103650639853 0.222375999999956 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 16 27 43 7.55034158976235 14.258798567276 -6.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0467323963928738 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 107286943 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107286935_107287024:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107286935_107287024:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107286935_107287024:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107286935_107287024:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107286935_107287024:CWF19L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 32 20 52 15.1006831795247 10.5620730127971 4.53861016672765 A:C A C 10 0.528103650639853 0.214847126212588 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 A:G A G 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 108044091 T/A 1 26 33 59 12.2693050833638 17.4274204711151 -5.15811538775133 A:T T A 10 0.528103650639853 0.193452541419213 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G A G 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 T:C C T 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 116633947 G/A 1 17 20 37 8.0222379391225 10.5620730127971 -2.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.415509256308292 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 30 39 69 14.1568904808044 20.5960423749543 -6.43915189414986 A:G A G 10 0.528103650639853 0.147411679377211 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 C:G C G 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118430519 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531939:exon_118430500_118431137:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534156:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534114:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000528378:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000533918:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530185:exon_118430500_118430579:IFT46 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 61 68 129 28.785677310969 35.91104824351 -7.12537093254103 T:C T C 10 0.528103650639853 0.217757689039144 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118920540 C/T 1 44 57 101 20.7634393718465 30.1019080864716 -9.33846871462515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0724507883178174 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118920489_118920549:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118920489_118920549:HYOU1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 38 32 70 17.9320612756856 16.8993168204753 1.03274445521029 A:G G A 10 0.528103650639853 0.81227256630959 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118942344 G/A 1 23 23 46 10.8536160352834 12.1463839647166 -1.29276792943324 A:G G A 10 0.528103650639853 0.76841874383127 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.7110881983466 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 78 86 164 36.8079152500915 45.4169139550274 -8.60899870493589 A:G A G 10 0.528103650639853 0.184255616151267 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 12 3 15 5.66275619232176 1.58431095191956 4.07844524040221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0393940244088059 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 26 12 38 12.2693050833638 6.33724380767824 5.93206127568559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0725469052669104 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 119206912 G/T 1 46 47 93 21.7072320705668 24.8208715800731 -3.11363950950632 T:G G T 10 0.528103650639853 0.534555327368865 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 120330019 T/G 1 10 2 12 4.71896349360147 1.05620730127971 3.66275619232176 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0421544582249524 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000529970:exon_120329883_120330029:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000530747:exon_120328427_120330029:ARHGEF12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:G T G 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:T T A 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2482 2698 5180 1171.24673911188 1424.82364942632 -253.576910314438 A:T:C:G A G 10 0.528103650639853 1.83075768795582e-12 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 34 15 49 16.044475878245 7.92155475959779 8.1229211186472 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0217766672113891 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 51 61 112 24.0667138173675 32.214322689031 -8.14760887166353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.130412119242323 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:C C A 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 28 21 49 13.2130977820841 11.0901766634369 2.1229211186472 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.570084944046039 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 126162468 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000150455:ENST00000488598:exon_126162372_126162582:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 41 39 80 19.347750323766 20.5960423749543 -1.24829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.82317806454237 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 58 75 133 27.3699882628885 39.607773797989 -12.2377855351004 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0369427454106329 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 27 32 59 12.741201432724 16.8993168204753 -4.15811538775133 T:C T C 10 0.528103650639853 0.298533427323511 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 52 46 98 24.5386101667276 24.2927679294332 0.245842237294408 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 128675292 T/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:T T A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128673771_128677134:FLI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 129754644 A/G 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000530278:exon_129754639_129754777:NFRKB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 16 19 35 7.55034158976235 10.0339693621572 -2.48362777239485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.404148524616113 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.51359416898744 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 27 26 53 12.741201432724 13.7306949166362 -0.989493483912209 A:G A G 10 0.528103650639853 0.785341970361852 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 95 112 207 44.830153189214 59.1476088716635 -14.3174556824496 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0510864010400936 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 11 19 30 5.19085984296162 10.0339693621572 -4.84310951919559 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0987221340867943 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 69 55 124 32.5608481058501 29.0457007851919 3.51514732065823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.589602881118906 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 38 34 72 17.9320612756856 17.955524121755 -0.023462846069414 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 4714247 A/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 A:T A T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4714080_4714252:DYRK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 17 15 32 8.0222379391225 7.92155475959779 0.100683179524705 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 T:C T C 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 16 19 35 7.55034158976235 10.0339693621572 -2.48362777239485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.404148524616113 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 31 27 58 14.6287868301646 14.258798567276 0.369988262888526 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 45 25 70 21.2353357212066 13.2025912659963 8.03274445521029 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0561557072442273 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 49 47 96 23.1229211186472 24.8208715800731 -1.69795046142589 T:C C T 10 0.528103650639853 0.759642957834797 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 80 80 160 37.7517079488118 42.2482920511882 -4.49658410237647 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.477450447647992 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 4240 3742 7982 2000.84052128702 1976.16386069433 24.6766605926935 A:T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.58279840938209 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4268 3696 7964 2014.05361906911 1951.8710927649 62.1825263042108 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.164022829082984 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4120 3660 7780 1944.21295936381 1932.85936134186 11.353598021944 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.802733181324622 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:G T G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7015075 A/C 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:C A C 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000415834:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015009_7015118:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015009_7015118:LRRC23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7015707 G/T 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 A:T:G G T 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:T T A 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7053257 C/T 1 41 68 109 19.347750323766 35.91104824351 -16.563297919744 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00199895981808544 ENSG00000111678:ENST00000229281:exon_7053203_7053336:C12orf57 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 26 14 40 12.2693050833638 7.39345110895794 4.87585397440588 A:G A G 10 0.528103650639853 0.153559763683756 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7092665 A/G 1 13 4 17 6.13465254168191 2.11241460255941 4.0222379391225 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0550357587836995 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7092593_7092700:LPCAT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 7125672 C/G 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 C:G C G 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7125578_7125842:LPCAT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 38 41 79 17.9320612756856 21.652249676234 -3.72018840054838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.43118089357917 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 20 18 38 9.43792698720294 9.50586571151735 -0.0679387243144127 A:G A G 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 166 180 346 78.3347939937844 95.0586571151735 -16.7238631213891 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0755620755245752 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 11992168 G/A 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_11992074_11992238:ETV6;ENSG00000139083:ENST00000396373:exon_11992074_11992238:ETV6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 75 51 126 35.392226202011 26.9332861826325 8.45894001937852 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.15312324055227 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 32 29 61 15.1006831795247 15.3150058685557 -0.214322689031032 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1369 1206 2575 646.026102274041 636.893002671663 9.13309960237859 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.722419261308298 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 56 39 95 26.4261955641682 20.5960423749543 5.83015318921397 T:G T G 10 0.528103650639853 0.258554189857677 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 78 75 153 36.8079152500915 39.607773797989 -2.79985854789751 A:G A G 10 0.528103650639853 0.68582782269875 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 75 60 135 35.392226202011 31.6862190383912 3.70600716361984 T:C C T 10 0.528103650639853 0.546991029511211 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 T:G T G 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 33 20 53 15.5725795288849 10.5620730127971 5.01050651608779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.215258178690519 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 27 31 58 12.741201432724 16.3712131698354 -3.63001173711147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.359390897163681 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 C:G G C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 12 14 26 5.66275619232176 7.39345110895794 -1.73069491663618 T:G G T 10 0.528103650639853 0.558326244007148 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 12 0 12 5.66275619232176 0 5.66275619232176 T T 10 0.528103650639853 0.000592519996121889 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 33 28 61 15.5725795288849 14.7869022179159 0.785677310968968 A:G A G 10 0.528103650639853 0.898290983012201 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 52 31 83 24.5386101667276 16.3712131698354 8.1673969968922 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.078739664893161 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 52 24 76 24.5386101667276 12.6744876153565 11.8641225513712 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00781962522475317 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 32137884 G/A 1 58 63 121 27.3699882628885 33.2705299903107 -5.90054172742221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.316594493685023 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 6 22 28 2.83137809616088 11.6182803140768 -8.78690221791588 C:G G C 10 0.528103650639853 0.000971134122110267 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 38710819 C/T 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38710557_38710866:ALG10B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 49 76 125 23.1229211186472 40.1358774486288 -17.0129563299816 A:T A T 10 0.528103650639853 0.00295957133612642 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 47629368 G/T 1 10 15 25 4.71896349360147 7.92155475959779 -3.20259126599632 T:G G T 10 0.528103650639853 0.231726348019023 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629207_47629770:FAM113B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 19 23 42 8.96603063784279 12.1463839647166 -3.18035332687382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.355971943604694 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 0 0 41 41 0 21.652249676234 -21.652249676234 T G T 10 0.528103650639853 4.24337410637441e-14 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 51 68 119 24.0667138173675 35.91104824351 -11.8443344261425 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0343519897235507 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51112586 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000066084:ENST00000301180:exon_51112492_51112601:DIP2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 45 57 102 21.2353357212066 30.1019080864716 -8.866572365265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.091428675067782 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51639892 C/T 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51639899 A/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 A:G G A 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 52467406 A/G 1 47 42 89 22.1791284199269 22.1803533268738 -0.0012249069469128 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 52470979 C/T 1 63 50 113 29.7294700096893 26.4051825319927 3.32428747769661 T:C C T 10 0.528103650639853 0.572319021063773 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52470570_52471278:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52470570_52471278:C12orf44 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 14 25 39 6.60654889104206 13.2025912659963 -6.59604237495427 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0374050035299014 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:G T G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 53589511 A/G 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 A:G A G 10 0.528103650639853 0.618058937675178 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 36 40 76 16.9882685769653 21.1241460255941 -4.13587744862883 T:C T C 10 0.528103650639853 0.359611121907052 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 19 24 43 8.96603063784279 12.6744876153565 -3.70845697751368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.286545613814440 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 54115875 C/T 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54115809_54115967:CALCOCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G G A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 54767812 G/A 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 53 41 94 25.0105065160878 21.652249676234 3.35825683985382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.535831546328531 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 55368188 T/C 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 56296075 C/G 1 63 71 134 29.7294700096893 37.4953591954296 -7.7658891857403 C:G C G 10 0.528103650639853 0.194473156513743 ENSG00000170473:ENST00000408946:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000398213:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000302533:exon_56295198_56296139:WIBG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 25 28 53 11.7974087340037 14.7869022179159 -2.98949348391221 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.413540200884492 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 34 24 58 16.044475878245 12.6744876153565 3.36998826288853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.430688003554096 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 15 8 23 7.07844524040221 4.22482920511882 2.85361603528338 A:T T A 10 0.528103650639853 0.297436847461985 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 C:G C G 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57039080 C/T 1 223 197 420 105.232885907313 104.036419176051 1.19646673126175 T:C C T 10 0.528103650639853 0.92219094863209 ENSG00000110955:ENST00000262030:exon_57038955_57039137:ATP5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 2379 2275 4654 1122.64141512779 1201.43580520567 -78.7943900778757 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0211586362508275 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2458 2453 4911 1159.92122672724 1295.43825501956 -135.517028292318 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.000113470300973619 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 21 14 35 9.90982333656309 7.39345110895794 2.51637222760515 T:G T G 10 0.528103650639853 0.49886719523201 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57627816 G/A 1 260 375 635 122.693050833638 198.038868989945 -75.3458181563066 A:G G A 10 0.528103650639853 2.15713255501085e-09 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57627786_57627893:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57627786_57627893:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57627786_57627893:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57627786_57627893:SHMT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 11 37 48 5.19085984296162 19.5398350736746 -14.3489752307129 A:G G A 10 0.528103650639853 3.24776840416584e-05 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 33 28 61 15.5725795288849 14.7869022179159 0.785677310968968 A:C A C 10 0.528103650639853 0.898290983012201 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57924465 A/G 1 160 190 350 75.5034158976235 100.339693621572 -24.8362777239485 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.00862895884990667 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57924094_57924558:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57924094_57924558:DCTN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 90 99 189 42.4706714424132 52.2822614133454 -9.81158997093221 T:G T G 10 0.528103650639853 0.166255806778671 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 58087938 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58087886_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000389146:exon_58087886_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58087886_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58087933_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58087933_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58087933_58088106:OS9;ENSG00000135506:ENST00000389142:exon_58087933_58088106:OS9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 13 5 18 6.13465254168191 2.64051825319926 3.49413428848265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.154755866488138 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 8 16 24 3.77517079488118 8.44965841023765 -4.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0659664265085599 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 41 35 76 19.347750323766 18.4836277723949 0.864122551371175 A:T T A 10 0.528103650639853 0.908695933744017 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 42 51 93 19.8196466731262 26.9332861826325 -7.11363950950633 A:G A G 10 0.528103650639853 0.146775805290192 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 66725160 C/T 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 T:G G T 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 74 128 202 34.9203298526509 67.5972672819012 -32.6769374292503 A:G G A 10 0.528103650639853 4.05904757342461e-06 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 113 113 226 53.3242874776966 59.6757125223034 -6.35142504460677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.424131099764216 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 A:C C A 10 0.528103650639853 0.185897448916533 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 72018028 A/G 1 10 21 31 4.71896349360147 11.0901766634369 -6.37121316983544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.029407537625691 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72017884_72018072:ZFC3H1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 23 39 62 10.8536160352834 20.5960423749543 -9.74242633967088 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0152426395756227 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 72287089 A/G 1 23 24 47 10.8536160352834 12.6744876153565 -1.82087158007309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.661953577239643 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000491063:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000472611:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000468049:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72287002_72287104:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72287002_72287104:TBC1D15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 72307637 C/G 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 C:G C G 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 C:G G C 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 16 7 23 7.55034158976235 3.69672555447897 3.85361603528338 T:C T C 10 0.528103650639853 0.142969530065131 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94543506 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94542748_94543809:PLXNC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94620432 G/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:G G T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94620381_94620483:PLXNC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94631496 C/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94631440_94631579:PLXNC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 21 19 40 9.90982333656309 10.0339693621572 -0.124146025594118 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 25 11 36 11.7974087340037 5.80914015703838 5.98826857696529 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0648016056223966 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 24 24 48 11.3255123846435 12.6744876153565 -1.34897523071295 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.772977371861394 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 15 29 44 7.07844524040221 15.3150058685557 -8.23656062815353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0151250754971833 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 95681554 C/T 1 27 15 42 12.741201432724 7.92155475959779 4.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.164199775373496 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 59 60 119 27.8418846122487 31.6862190383912 -3.84433442614251 T:C T C 10 0.528103650639853 0.520707308475992 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 110 108 218 51.9085984296162 57.0351942691041 -5.12659583948795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.498114675963296 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 15 7 22 7.07844524040221 3.69672555447897 3.38171968592323 T:C C T 10 0.528103650639853 0.199779915400287 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 527 622 1149 248.689376112797 328.480470697989 -79.7910945851911 A:T:C C T 10 0.528103650639853 2.54958929787794e-06 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 7 26 33 3.30327444552103 13.7306949166362 -10.4274204711151 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000325239664142392 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 7 12 19 3.30327444552103 6.33724380767824 -3.03396936215721 C:G G C 10 0.528103650639853 0.175700689513822 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108686008 C/G 1 33 65 98 15.5725795288849 34.3267372915904 -18.7541577627056 C:G C G 10 0.528103650639853 0.000158640816207701 ENSG00000174600:ENST00000312143:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000412676:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000436420:exon_108681821_108686736:CMKLR1;ENSG00000174600:ENST00000397688:exon_108681821_108686736:CMKLR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108918146 C/T 1 38 41 79 17.9320612756856 21.652249676234 -3.72018840054838 T:C C T 10 0.528103650639853 0.43118089357917 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108923950 A/G 1 47 49 96 22.1791284199269 25.8770788813528 -3.69795046142589 A:G A G 10 0.528103650639853 0.475160353937345 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 1 33 11 44 15.5725795288849 5.80914015703838 9.76343937184647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00365709187119177 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 108956418 T/G 0 36 0 36 16.9882685769653 0 16.9882685769653 T T 10 0.528103650639853 1.79074269782713e-10 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000431221:exon_108956382_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108956382_108956512:ISCU HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 109520769 A/G 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000135093:ENST00000392784:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000377883:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000257548:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000479219:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000491362:exon_109520500_109520867:USP30 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:G A G 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110385079 G/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000139436:ENST00000343646:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000354574:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000361006:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110385061_110385309:GIT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 30 41 71 14.1568904808044 21.652249676234 -7.49535919542956 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0953879522646317 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 34 27 61 16.044475878245 14.258798567276 1.78567731096897 T:C T C 10 0.528103650639853 0.70132143859748 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110924406 T/G 1 32 31 63 15.1006831795247 16.3712131698354 -1.27052999031074 T:G T G 10 0.528103650639853 0.80124485093039 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110924339_110924522:C12orf24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 35 22 57 16.5163722276051 11.6182803140768 4.89809191352838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.232427380868215 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 112110489 T/C 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112110465_112110578:BRAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 112241766 G/A 1 45 40 85 21.2353357212066 21.1241460255941 0.111189695612499 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112241663_112241777:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112241663_112241777:ALDH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 108 118 226 50.9648057308959 62.3162307755027 -11.3514250446068 A:G G A 10 0.528103650639853 0.142619077648218 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 3 36 39 1.41568904808044 19.0117314230347 -17.5960423749543 A:G G A 10 0.528103650639853 3.17636750658047e-09 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 128 38 166 60.4027327180988 20.0679387243144 40.3347939937844 A:G G A 10 0.528103650639853 1.32969938410385e-10 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 145 51 196 68.4249706572213 26.9332861826325 41.4916844745888 C:G G C 10 0.528103650639853 1.65496121115595e-09 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113376320 C/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113376331 C/A 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 113376452 C/T 1 3 10 13 1.41568904808044 5.28103650639853 -3.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.048195832563503 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/C 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114377877 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114383651 C/T 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C C T 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 26 19 45 12.2693050833638 10.0339693621572 2.23533572120662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.552316704024384 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 39 33 72 18.4039576250457 17.4274204711151 0.976537153930586 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.906152166167224 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 117465264 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465199_117465309:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465199_117465309:FBXW8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C T C 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 35 26 61 16.5163722276051 13.7306949166362 2.78567731096897 T:C T C 10 0.528103650639853 0.522509886424512 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 118673394 G/T 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 T:G G T 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118673363_118673476:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118673363_118673476:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118673363_118673476:TAOK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120536629 C/T 1 149 134 283 70.3125560546619 70.7658891857403 -0.453333131078395 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000111737:ENST00000432953:exon_120536615_120536739:RAB35;ENSG00000111737:ENST00000229340:exon_120536615_120536739:RAB35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 22 30 52 10.3817196859232 15.8431095191956 -5.46138983327235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.164229962108735 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120591143 A/G 1 8 18 26 3.77517079488118 9.50586571151735 -5.73069491663618 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0297607143692655 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120608031 A/G 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120607973_120608125:GCN1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 60 24 84 28.3137809616088 12.6744876153565 15.6392933462523 A:C C A 10 0.528103650639853 0.000630254621024182 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120942768 G/A 1 67 48 115 31.6170554071299 25.3489752307129 6.26808017641691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.262805559101281 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120942698_120942786:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120942698_120942786:COQ5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 120966809 C/T 1 19 14 33 8.96603063784279 7.39345110895794 1.57257952888485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.606072412847404 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121151093 C/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 T:C C T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000175970:ENST00000344651:exon_121151077_121151190:UNC119B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C T C 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121175221 G/A 1 26 18 44 12.2693050833638 9.50586571151735 2.76343937184647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.452030257404925 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121175159_121175270:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121175159_121175270:ACADS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 28 24 52 13.2130977820841 12.6744876153565 0.538610166727644 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.890704333337229 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121221518 C/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121221477_121221555:AC069214.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 12 14 26 5.66275619232176 7.39345110895794 -1.73069491663618 A:T T A 10 0.528103650639853 0.558326244007148 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121442214 G/A 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121659917 G/A 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121659897_121659969:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121659897_121659969:P2RX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 18 17 35 8.49413428848265 8.9777620608775 -0.483627772394854 A:G A G 10 0.528103650639853 0.867648600286817 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121691088 G/T 1 10 19 29 4.71896349360147 10.0339693621572 -5.31500586855574 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0616587085729111 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 20 6 26 9.43792698720294 3.16862190383912 6.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.017033013572733 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 121878767 C/T 1 25 25 50 11.7974087340037 13.2025912659963 -1.40518253199265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.7773314321124 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 122623000 T/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122622971_122623098:MLXIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 123200768 T/G 1 2 9 11 0.943792698720294 4.75293285575868 -3.80914015703838 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0308891347915433 ENSG00000255398:ENST00000528880:exon_123199303_123201344:GPR109B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 123253333 T/C 1 100 109 209 47.1896349360147 57.563297919744 -10.3736629837293 T:C T C 10 0.528103650639853 0.165760409664407 ENSG00000139726:ENST00000280557:exon_123253329_123253468:DENR;ENSG00000139726:ENST00000455982:exon_123253323_123253468:DENR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 17 7 24 8.0222379391225 3.69672555447897 4.32551238464353 C:G C G 10 0.528103650639853 0.100828950492662 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 55 39 94 25.9542992148081 20.5960423749543 5.35825683985382 A:G A G 10 0.528103650639853 0.301812938175859 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124819043 T/C 1 12 20 32 5.66275619232176 10.5620730127971 -4.8993168204753 T:C T C 10 0.528103650639853 0.109805506996986 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124818970_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000474079:exon_124818890_124819163:NCOR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 46 19 65 21.7072320705668 10.0339693621572 11.6732627084096 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00400494099575256 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 44 22 66 20.7634393718465 11.6182803140768 9.14515905776971 T:C C T 10 0.528103650639853 0.026239506133151 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 24 42 66 11.3255123846435 22.1803533268738 -10.8548409422303 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00916775598385569 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 24 18 42 11.3255123846435 9.50586571151735 1.81964667312617 A:G A G 10 0.528103650639853 0.644103924037243 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 64 51 115 30.2013663590494 26.9332861826325 3.26808017641691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.575842918667002 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 2751 3126 5877 1298.18685708976 1650.85201190018 -352.665154810416 A:T:C:G G C 10 0.528103650639853 3.72914054202523e-20 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 16 15 31 7.55034158976235 7.92155475959779 -0.371213169835443 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125441347 T/C 1 19 14 33 8.96603063784279 7.39345110895794 1.57257952888485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.606072412847404 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 8 14 22 3.77517079488118 7.39345110895794 -3.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.138184227038771 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 9 15 24 4.24706714424132 7.92155475959779 -3.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.154361116643106 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 131590404 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000111452:ENST00000261654:exon_131590299_131590410:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000376682:exon_131590299_131590410:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000446583:exon_131590299_131590410:GPR133 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 131620588 A/G 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000111452:ENST00000261654:exon_131620582_131620708:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000376682:exon_131620582_131620708:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000335486:exon_131620582_131620708:GPR133;ENSG00000111452:ENST00000446583:exon_131620582_131620708:GPR133 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 19 11 30 8.96603063784279 5.80914015703838 3.15689048080441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.276471972187682 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 14 17 31 6.60654889104206 8.9777620608775 -2.37121316983544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.472722152420775 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 15 8 23 7.07844524040221 4.22482920511882 2.85361603528338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.297436847461985 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 7 30 37 3.30327444552103 15.8431095191956 -12.5398350736746 A:T:G A G 10 0.528103650639853 4.03481406225086e-05 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 363 4 367 171.298374817733 2.11241460255941 169.185960215174 T:C T C 10 0.528103650639853 9.02113606782105e-94 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 21620085 T/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21619824_21620369:LATS2;ENSG00000150457:ENST00000496544:exon_21619838_21620367:LATS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 29 42 71 13.6849941314443 22.1803533268738 -8.49535919542956 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0564148075477006 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 24 23 47 11.3255123846435 12.1463839647166 -0.82087158007309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.884159584028512 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 10 21 31 4.71896349360147 11.0901766634369 -6.37121316983544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.029407537625691 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 26 18 44 12.2693050833638 9.50586571151735 2.76343937184647 A:G A G 10 0.528103650639853 0.452030257404925 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23911748 C/T 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 T:C C T 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23911820 A/G 1 6 15 21 2.83137809616088 7.92155475959779 -5.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0292172121457386 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 23913827 G/A 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 A:G G A 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 24243200 T/C 1 15 7 22 7.07844524040221 3.69672555447897 3.38171968592323 T:C T C 10 0.528103650639853 0.199779915400287 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 115 87 202 54.2680801764169 45.9450176056672 8.3230625707497 C:G C G 10 0.528103650639853 0.259636226825765 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 117 110 227 55.2118728751372 58.0914015703838 -2.87952869524663 T:G G T 10 0.528103650639853 0.739697571380183 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 73 53 126 34.4484335032907 27.9894934839122 6.45894001937852 C:G C G 10 0.528103650639853 0.284265320456938 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 35 40 75 16.5163722276051 21.1241460255941 -4.60777379798897 C:G C G 10 0.528103650639853 0.299692275003487 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 19 24 43 8.96603063784279 12.6744876153565 -3.70845697751368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.286545613814440 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 26 19 45 12.2693050833638 10.0339693621572 2.23533572120662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.552316704024384 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25480145 G/A 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/A 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25831888 T/C 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25831874_25831983:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25831874_25831983:MTMR6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 A:G G A 10 0.528103650639853 0.7110881983466 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 26788304 C/T 1 125 80 205 58.9870436700184 42.2482920511882 16.7387516188301 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0208172620851713 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 207 179 386 97.6825443175504 94.5305534645337 3.15199085301676 A:C:G G C 10 0.528103650639853 0.759914669196356 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 180 132 312 84.9413428848265 69.7096818844606 15.2316610003659 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.0889092753196748 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 146 119 265 68.8968670065815 62.8443344261425 6.05253258043896 C:G G C 10 0.528103650639853 0.461132355372745 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 217 202 419 102.401507811152 106.67693742925 -4.2754296180984 A:G G A 10 0.528103650639853 0.695571092140587 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 30091714 G/A 1 19 20 39 8.96603063784279 10.5620730127971 -1.59604237495427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.633454311444662 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30091710_30091927:SLC7A1;ENSG00000139514:ENST00000473577:exon_30091710_30091927:SLC7A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 30091819 G/C 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 C:G G C 10 0.528103650639853 0.130559033023297 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30091710_30091927:SLC7A1;ENSG00000139514:ENST00000473577:exon_30091710_30091927:SLC7A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 30107067 G/C 1 14 16 30 6.60654889104206 8.44965841023765 -1.84310951919559 C:G G C 10 0.528103650639853 0.584479133652254 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30106961_30107119:SLC7A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 31231806 T/C 1 16 18 34 7.55034158976235 9.50586571151735 -1.955524121755 T:C T C 10 0.528103650639853 0.607017625505778 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 39 35 74 18.4039576250457 18.4836277723949 -0.0796701473491197 A:T:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 32972884 A/G 1 12 16 28 5.66275619232176 8.44965841023765 -2.78690221791588 A:G A G 10 0.528103650639853 0.345411965030106 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 T T 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 33704065 T/C 1 20 3 23 9.43792698720294 1.58431095191956 7.85361603528338 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00115029986326737 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 25 22 47 11.7974087340037 11.6182803140768 0.17912841992691 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 37401827 A/G 1 11 16 27 5.19085984296162 8.44965841023765 -3.25879856727603 A:G A G 10 0.528103650639853 0.248785447351970 ENSG00000133111:ENST00000255476:exon_37401780_37403241:RFXAP;ENSG00000133111:ENST00000472888:exon_37401780_37401886:RFXAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 15 16 31 7.07844524040221 8.44965841023765 -1.37121316983544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.719840958697151 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 53 47 100 25.0105065160878 24.8208715800731 0.189634936014702 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 49 37 86 23.1229211186472 19.5398350736746 3.58308604497264 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.451856525478606 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 80 84 164 37.7517079488118 44.3607066537476 -6.60899870493589 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.310088580359364 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 46 47 93 21.7072320705668 24.8208715800731 -3.11363950950632 A:G A G 10 0.528103650639853 0.534555327368865 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 76 67 143 35.8641225513712 35.3829445928702 0.481177958501021 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 80 57 137 37.7517079488118 30.1019080864716 7.64979986234014 T:C T C 10 0.528103650639853 0.199981837297996 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 40229957 T/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:T A T 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 42301395 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42301330_42301449:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42301330_42301449:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000281496:exon_42301330_42301449:KIAA0564 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 42874234 G/A 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 A:G G A 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 42877265 G/C 1 19 20 39 8.96603063784279 10.5620730127971 -1.59604237495427 C:G G C 10 0.528103650639853 0.633454311444662 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 42882620 C/T 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 T:C C T 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42882590_42882745:AKAP11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 62 88 150 29.2575736603291 46.4731212563071 -17.2155475959779 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00531985717464466 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 39 58 97 18.4039576250457 30.6300117371115 -12.2260541120657 A:G G A 10 0.528103650639853 0.014419477366309 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 30 25 55 14.1568904808044 13.2025912659963 0.954299214808085 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.892751594995530 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 13 24 37 6.13465254168191 12.6744876153565 -6.53983507367456 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0330322046006546 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 1 76 1 77 35.8641225513712 0.528103650639853 35.3360189007313 A:G G A 10 0.528103650639853 3.93135289313185e-20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 23 26 49 10.8536160352834 13.7306949166362 -2.8770788813528 A:T T A 10 0.528103650639853 0.474907101864699 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 44 36 80 20.7634393718465 19.0117314230347 1.75170794881176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.73762850781267 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 26 47 73 12.2693050833638 24.8208715800731 -12.5515664967093 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00455910257120324 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 9 16 25 4.24706714424132 8.44965841023765 -4.20259126599632 A:G A G 10 0.528103650639853 0.109639086474819 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 18 10 28 8.49413428848265 5.28103650639853 3.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.258843407287316 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 27 30 57 12.741201432724 15.8431095191956 -3.10190808647162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.428579027335235 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 C:G G C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 18 19 37 8.49413428848265 10.0339693621572 -1.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.625425947028641 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 8 15 23 3.77517079488118 7.92155475959779 -4.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0962092249770063 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 51941943 T/C 1 31 49 80 14.6287868301646 25.8770788813528 -11.2482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0134375025350657 ENSG00000102786:ENST00000476666:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000425000:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51941941_51942034:INTS6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 51956225 T/G 1 24 17 41 11.3255123846435 8.9777620608775 2.34775032376603 T:G T G 10 0.528103650639853 0.532670531600526 ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000493153:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483746:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000460868:exon_51956165_51956259:INTS6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 52709938 A/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:C:G A C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000136098:ENST00000400357:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000378101:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000339406:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000258597:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000452082:exon_52709865_52709999:NEK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 36 20 56 16.9882685769653 10.5620730127971 6.42619556416823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.107488100461090 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 50 36 86 23.5948174680073 19.0117314230347 4.58308604497264 T:C C T 10 0.528103650639853 0.333200951135469 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 52 35 87 24.5386101667276 18.4836277723949 6.05498239433279 T:C T C 10 0.528103650639853 0.199427549380680 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 76395620 C/T 0 23 0 23 10.8536160352834 0 10.8536160352834 C C 10 0.528103650639853 4.50827213267504e-07 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 76397731 G/A 1 43 6 49 20.2915430224863 3.16862190383912 17.1229211186472 A:G G A 10 0.528103650639853 3.55075504480862e-07 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76397701_76398009:LMO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 23 7 30 10.8536160352834 3.69672555447897 7.15689048080441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0097301916362543 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 26 20 46 12.2693050833638 10.5620730127971 1.70723207056676 A:G A G 10 0.528103650639853 0.659627499768371 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 77575137 A/G 1 42 37 79 19.8196466731262 19.5398350736746 0.279811599451616 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 95858978 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 95858996 T/C 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 99 101 200 46.7177385866546 53.3384687146252 -6.6207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.357859703662507 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 99457431 T/G 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:G T G 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000088387:ENST00000376460:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400228:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000376455:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000357329:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000428223:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400220:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000400235:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000339416:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000448493:exon_99457253_99457463:DOCK9;ENSG00000088387:ENST00000419908:exon_99457253_99457463:DOCK9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 334 434 768 157.613380686289 229.196984377696 -71.5836036914071 T:C:G C T 10 0.528103650639853 2.65862458312469e-07 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 60 50 110 28.3137809616088 26.4051825319927 1.90859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 0.774710392307915 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 T:G G T 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 111955465 T/C 1 55 57 112 25.9542992148081 30.1019080864716 -4.14760887166354 T:C T C 10 0.528103650639853 0.449996486689106 ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111955338_111958084:ARHGEF7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 113508839 G/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 C:G G C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000431624:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000459908:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000418678:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000432166:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000489577:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113508593_113508844:ATP11A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 113527967 G/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113527887_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000495930:exon_113527746_113527990:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000493489:exon_113527817_113527990:ATP11A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 113536132 T/C 1 10 3 13 4.71896349360147 1.58431095191956 3.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.098906296354315 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113536127_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113536130_113541482:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000419631:exon_113536130_113538272:ATP11A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 113960845 G/A 1 29 45 74 13.6849941314443 23.7646642787934 -10.0796701473491 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0199165728071064 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113960800_113960921:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113960800_113960921:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113959247_113960921:LAMP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C T C 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 14 14 28 6.60654889104206 7.39345110895794 -0.786902217915884 T:C C T 10 0.528103650639853 0.850667454315956 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 7 15 22 3.30327444552103 7.92155475959779 -4.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0554919458936411 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 9 13 22 4.24706714424132 6.86534745831809 -2.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.291233724549757 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 40 31 71 18.8758539744059 16.3712131698354 2.50464080457044 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.634771264147746 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20823052 G/A 1 31 29 60 14.6287868301646 15.3150058685557 -0.686219038391179 A:G G A 10 0.528103650639853 0.897533712311774 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20824130 A/G 1 37 33 70 17.4601649263254 17.4274204711151 0.0327444552102918 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20825652 C/T 1 17 17 34 8.0222379391225 8.9777620608775 -0.955524121755001 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.86395113418665 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825555_20825679:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825555_20825679:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20825210_20825668:PARP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 32 35 67 15.1006831795247 18.4836277723949 -3.38294459287015 A:C A C 10 0.528103650639853 0.463218522378622 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20837033 T/C 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20836957_20837061:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20836957_20837061:TEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 36 41 77 16.9882685769653 21.652249676234 -4.66398109926868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.305532987879876 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 170 140 310 80.222379391225 73.9345110895794 6.28786830164557 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.495054628700952 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 770 581 1351 363.360189007313 306.828221021755 56.5319679855586 A:T T A 10 0.528103650639853 0.00206958351527552 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 C:G C G 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23793305 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 34 15 49 16.044475878245 7.92155475959779 8.1229211186472 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0217766672113891 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 47 40 87 22.1791284199269 21.1241460255941 1.05498239433279 A:C C A 10 0.528103650639853 0.830960446106245 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 A:G A G 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 26 21 47 12.2693050833638 11.0901766634369 1.17912841992691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.771647354948445 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.7110881983466 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 404 415 819 190.646125141499 219.163015015539 -28.5168898740396 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0461171503692973 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24627119 C/T 1 62 61 123 29.2575736603291 32.214322689031 -2.95674902870191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.651770901414535 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24627107_24627220:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24627107_24627220:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24627107_24627220:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24627107_24627220:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24627107_24627220:RNF31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24633268 C/A 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:C C A 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 11 28 39 5.19085984296162 14.7869022179159 -9.59604237495427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00214510332572386 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 119 110 229 56.1556655738575 58.0914015703838 -1.93573599652633 T:C C T 10 0.528103650639853 0.84266308846952 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 36 39 75 16.9882685769653 20.5960423749543 -3.60777379798897 A:G G A 10 0.528103650639853 0.420062590184094 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 23 23 46 10.8536160352834 12.1463839647166 -1.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.76841874383127 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 A:C A C 10 0.528103650639853 0.390773887480627 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 31348049 G/A 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31348017_31348150:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31348017_31348150:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31348017_31348150:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31348017_31348150:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31348017_31348150:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31348017_31348150:COCH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 31 33 64 14.6287868301646 17.4274204711151 -2.79863364095059 C:G C G 10 0.528103650639853 0.532050248884933 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 31570401 G/A 1 79 55 134 37.2798115994516 29.0457007851919 8.2341108142597 A:G G A 10 0.528103650639853 0.166482566477708 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399323:exon_31570386_31570530:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31570386_31570530:HECTD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 25 41 66 11.7974087340037 21.652249676234 -9.8548409422303 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0185698251118230 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 105 95 200 49.5491166828154 50.169846810786 -0.620730127970596 A:G G A 10 0.528103650639853 0.943631569997995 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 1117 1140 2257 527.108222235284 602.038161729432 -74.9299394941482 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.00167643208595611 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 132 154 286 62.2903181155394 81.3279621985374 -19.037644082998 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0244767641172933 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 39685330 C/T 0 20 0 20 9.43792698720294 0 9.43792698720294 C C 10 0.528103650639853 3.14684283276297e-06 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45432870 G/C 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 C:G G C 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000198718:ENST00000361577:exon_45431411_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000361462:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000382233:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000429476:exon_45431442_45433670:FAM179B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45433155 C/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198718:ENST00000361577:exon_45431411_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000361462:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000382233:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000429476:exon_45431442_45433670:FAM179B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45644589 G/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:G G T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45644274_45646179:FANCM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45665468 C/G 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 C:G C G 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45665375_45665750:FANCM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 15 24 39 7.07844524040221 12.6744876153565 -5.59604237495427 T:G T G 10 0.528103650639853 0.078870130036717 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 22 11 33 10.3817196859232 5.80914015703838 4.57257952888485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.119452299415424 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51194458 C/T 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 C C 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51193951_51194469:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51193954_51194469:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51193954_51194469:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51194407_51194469:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 40 30 70 18.8758539744059 15.8431095191956 3.03274445521029 C:G G C 10 0.528103650639853 0.475876831111655 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51214728 T/C 1 30 21 51 14.1568904808044 11.0901766634369 3.0667138173675 T:C T C 10 0.528103650639853 0.40410666509233 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51214710_51214823:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51214710_51214823:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 A:T T A 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 T:G G T 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 44 46 90 20.7634393718465 24.2927679294332 -3.52932855758677 T:G T G 10 0.528103650639853 0.462067127779734 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 70 70 140 33.0327444552103 36.9672555447897 -3.93451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 0.553647714213986 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 52899036 A/C 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:C A C 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000087301:ENST00000281741:exon_52897309_52899305:TXNDC16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 27 43 70 12.741201432724 22.7084569775137 -9.96725554478971 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0222552086713224 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 72 79 151 33.9765371539306 41.7201884005484 -7.7436512466178 A:C A C 10 0.528103650639853 0.221706390840524 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 36 32 68 16.9882685769653 16.8993168204753 0.0889517564899975 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55649132 G/A 1 32 24 56 15.1006831795247 12.6744876153565 2.42619556416823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.592925006147413 ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55649088_55649150:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55649088_55649150:DLGAP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 65 78 143 30.6732627084096 41.1920847499085 -10.518822041499 T:C C T 10 0.528103650639853 0.079204987902585 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 10 15 25 4.71896349360147 7.92155475959779 -3.20259126599632 T:C T C 10 0.528103650639853 0.231726348019023 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 A:T T A 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 22 26 48 10.3817196859232 13.7306949166362 -3.34897523071294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.386272598596215 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 55819219 G/T 1 48 35 83 22.6510247692871 18.4836277723949 4.1673969968922 T:G G T 10 0.528103650639853 0.380672050541568 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 57876265 G/A 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57876097_57879466:NAA30;ENSG00000139977:ENST00000395257:exon_57876097_57879466:NAA30 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 35 27 62 16.5163722276051 14.258798567276 2.25757366032911 A:G A G 10 0.528103650639853 0.612071964349924 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 61857969 A/G 1 14 19 33 6.60654889104206 10.0339693621572 -3.42742047111515 A:G A G 10 0.528103650639853 0.29550524754705 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:C C A 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 49 40 89 23.1229211186472 21.1241460255941 1.99877509305308 A:G A G 10 0.528103650639853 0.750311936969306 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 94 81 175 44.3582568398538 42.7763957018281 1.58186113802573 A:G G A 10 0.528103650639853 0.820796374646044 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 64935720 C/T 1 19 12 31 8.96603063784279 6.33724380767824 2.62878683016456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.373409226723547 ENSG00000179841:ENST00000430028:exon_64934850_64941221:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000320636:exon_64934503_64936423:AKAP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 65417070 C/A 1 1 7 8 0.471896349360147 3.69672555447897 -3.22482920511882 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0305249046315294 ENSG00000139998:ENST00000267512:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000436278:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000533601:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000426039:exon_65417043_65417132:RAB15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 68156965 T/C 1 71 60 131 33.5046408045704 31.6862190383912 1.81842176617926 T:C T C 10 0.528103650639853 0.793170223035223 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68156929_68157138:RDH11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 73749188 C/T 1 49 35 84 23.1229211186472 18.4836277723949 4.63929334625235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.327022841234155 ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73749067_73749213:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73749067_73749213:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73749067_73749213:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73749067_73749213:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73749067_73749213:NUMB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 112 100 212 52.8523911283365 52.8103650639853 0.0420260643511625 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 13 15 28 6.13465254168191 7.92155475959779 -1.78690221791588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.5719128206726 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 18 5 23 8.49413428848265 2.64051825319926 5.85361603528338 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0196656883136863 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 29 37 66 13.6849941314443 19.5398350736746 -5.8548409422303 A:G G A 10 0.528103650639853 0.174827298410030 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 6 12 18 2.83137809616088 6.33724380767824 -3.50586571151735 T:G G T 10 0.528103650639853 0.104929209344249 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 74766352 A/G 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000477803:exon_74766251_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493427:exon_74765764_74766378:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000493752:exon_74765881_74766378:ABCD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75151349 G/C 1 3 10 13 1.41568904808044 5.28103650639853 -3.86534745831809 C:G G C 10 0.528103650639853 0.048195832563503 ENSG00000119682:ENST00000356357:exon_75151157_75151383:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000469797:exon_75151157_75151383:KIAA0317 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 17 17 34 8.0222379391225 8.9777620608775 -0.955524121755001 A:T T A 10 0.528103650639853 0.86395113418665 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 52 28 80 24.5386101667276 14.7869022179159 9.75170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0329531590787242 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 44 24 68 20.7634393718465 12.6744876153565 8.08895175649 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0523013569751392 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 8 22 30 3.77517079488118 11.6182803140768 -7.84310951919559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00528180696553244 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 25 13 38 11.7974087340037 6.86534745831809 4.93206127568559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.142776864266523 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 75590846 A/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:T A T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 36 50 86 16.9882685769653 26.4051825319927 -9.41691395502736 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0512925034370223 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 153 152 305 72.2001414521025 80.2717548972577 -8.07161344515515 A:T:C C A 10 0.528103650639853 0.359369488846211 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 46 51 97 21.7072320705668 26.9332861826325 -5.22605411206574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.309811638567681 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 122 58 180 57.5713546219379 30.6300117371115 26.9413428848265 A:C A C 10 0.528103650639853 5.07515535145041e-05 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 63 47 110 29.7294700096893 24.8208715800731 4.90859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 0.390281405420967 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C T C 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 4 12 16 1.88758539744059 6.33724380767824 -4.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0417233745614009 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 15 14 29 7.07844524040221 7.39345110895794 -0.315005868555737 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 34 56 90 16.044475878245 29.5738044358318 -13.5293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00574202887682494 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 56 34 90 26.4261955641682 17.955524121755 8.47067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0906220090144094 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 63 85 148 29.7294700096893 44.8888103043875 -15.1593402946982 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.0134183275304302 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 45 70 115 21.2353357212066 36.9672555447897 -15.7319198235831 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00366090661720576 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 17 28 45 8.0222379391225 14.7869022179159 -6.76466427879338 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0516534916950353 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 93673655 G/A 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93673401_93673786:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93673401_93673786:UBR7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 203 200 403 95.7949589201098 105.620730127971 -9.82577120786075 T:C T C 10 0.528103650639853 0.343218156245614 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 94935901 G/C 1 13 1 14 6.13465254168191 0.528103650639853 5.60654889104206 C:G G C 10 0.528103650639853 0.00222566407672929 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94935550_94936004:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94935550_94936194:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94935550_94936196:SERPINA9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 95999820 T/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C T C 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 22 27 49 10.3817196859232 14.258798567276 -3.8770788813528 A:G A G 10 0.528103650639853 0.316764899358927 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 48 40 88 22.6510247692871 21.1241460255941 1.52687874369294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.831058207468703 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 A:C C A 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 206 132 338 97.2106479681903 69.7096818844606 27.5009660837297 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00271046891853694 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 17 12 29 8.0222379391225 6.33724380767824 1.68499413144426 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.58065189071065 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 16 25 41 7.55034158976235 13.2025912659963 -5.65224967623397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0859166028984629 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102798055 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102797959_102798183:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102797959_102798183:ZNF839 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 26 19 45 12.2693050833638 10.0339693621572 2.23533572120662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.552316704024384 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 100 122 222 47.1896349360147 64.4286453780621 -17.2390104420474 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0221631861982883 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 C:G G C 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 19 36 55 8.96603063784279 19.0117314230347 -10.0457007851919 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00687082583137596 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 31 38 69 14.6287868301646 20.0679387243144 -5.43915189414986 A:G G A 10 0.528103650639853 0.227681584270359 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 16 9 25 7.55034158976235 4.75293285575868 2.79740873400368 T:G G T 10 0.528103650639853 0.318500289625426 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 28 35 63 13.2130977820841 18.4836277723949 -5.27052999031074 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207312160682015 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106066690 A/C 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:C A C 10 0.528103650639853 0.284614626264566 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106067298 T/C 1 4 27 31 1.88758539744059 14.258798567276 -12.3712131698354 T:C T C 10 0.528103650639853 5.37518882847382e-06 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106067958 C/T 1 4 20 24 1.88758539744059 10.5620730127971 -8.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00034935343418419 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 411 8 419 193.94939958702 4.22482920511882 189.724570381902 A:C:G C G 10 0.528103650639853 9.3931525162903e-101 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106321330 G/A 1 1347 3978 5325 635.644382588118 2100.79632224533 -1465.15193965722 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 882 4316 5198 416.21258013565 2279.29535616161 -1863.08277602596 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 14 106757853 T/C 1 2 1253 1255 0.943792698720294 661.713874251736 -660.770081553016 A:T:C:G T C 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 28422609 C/T 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28422565_28422655:HERC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 38805032 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000172575:ENST00000450598:exon_38804984_38805157:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000310803:exon_38804984_38805157:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000431814:exon_38804984_38805157:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000415523:exon_38804984_38805157:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000414708:exon_38804984_38805157:RASGRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 33 28 61 15.5725795288849 14.7869022179159 0.785677310968968 A:G A G 10 0.528103650639853 0.898290983012201 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 46 44 90 21.7072320705668 23.2365606281535 -1.52932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75269366684854 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 8 18 26 3.77517079488118 9.50586571151735 -5.73069491663618 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0297607143692655 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40589002 A/G 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40588959_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40588947_40589109:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40588947_40589109:PLCB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40750740 A/G 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 A:G A G 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40751555 C/A 1 22 14 36 10.3817196859232 7.39345110895794 2.98826857696529 A:C C A 10 0.528103650639853 0.404300870104369 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 40917613 T/C 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41148163 C/T 1 19 5 24 8.96603063784279 2.64051825319926 6.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0125725185126960 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41148250 C/T 1 16 5 21 7.55034158976235 2.64051825319926 4.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0466466297015263 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 51 10 61 24.0667138173675 5.28103650639853 18.785677310969 A:G A G 10 0.528103650639853 5.58934536827166e-07 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 52 10 62 24.5386101667276 5.28103650639853 19.2575736603291 A:C C A 10 0.528103650639853 5.60907678395342e-07 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41772813 G/A 1 54 68 122 25.4824028654479 35.91104824351 -10.4286453780621 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0693251955021721 ENSG00000137815:ENST00000389629:exon_41772779_41775761:RTF1;ENSG00000137815:ENST00000389628:exon_41772779_41775760:RTF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41772891 C/G 1 42 42 84 19.8196466731262 22.1803533268738 -2.36070665374765 C:G C G 10 0.528103650639853 0.662370666785725 ENSG00000137815:ENST00000389629:exon_41772779_41775761:RTF1;ENSG00000137815:ENST00000389628:exon_41772779_41775760:RTF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 21 5 26 9.90982333656309 2.64051825319926 7.26930508336382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00500624868033568 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41820200 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41820058_41820225:RPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41822163 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41822062_41822177:RPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 41827757 T/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:T T A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41827710_41827830:RPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 42041712 G/A 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:G G A 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42041309_42042813:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42041309_42042813:MGA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 124 121 245 58.5151473206582 63.9005417274222 -5.38539440676398 A:G A G 10 0.528103650639853 0.522355517249087 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43020983 G/A 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43023482 T/C 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023409_43023529:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023409_43023529:CDAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 T:C T C 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43531411 G/C 1 21 16 37 9.90982333656309 8.44965841023765 1.46016492632544 C:G G C 10 0.528103650639853 0.742489529985631 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43531361_43531464:TGM5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 43622265 C/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 72 117 189 33.9765371539306 61.7881271248628 -27.8115899709322 A:T:C C T 10 0.528103650639853 5.57350199594141e-05 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 99 155 254 46.7177385866546 81.8560658491772 -35.1383272625227 T:C C T 10 0.528103650639853 1.28639228803179e-05 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 7 15 22 3.30327444552103 7.92155475959779 -4.61828031407677 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0554919458936411 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 42 52 94 19.8196466731262 27.4613898332724 -7.64174316014618 T:C T C 10 0.528103650639853 0.121764829697218 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 45 50 95 21.2353357212066 26.4051825319927 -5.16984681078603 A:C A C 10 0.528103650639853 0.305102744310374 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44849698 G/A 1 61 55 116 28.785677310969 29.0457007851919 -0.260023474222947 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44849687_44849848:EIF3J HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44864894 C/T 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44864881_44865018:SPG11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44943797 T/C 1 16 22 38 7.55034158976235 11.6182803140768 -4.06793872431441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.197135254307806 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 44943798 G/A 1 17 21 38 8.0222379391225 11.0901766634369 -3.06793872431441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.334006204812849 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 124 117 241 58.5151473206582 61.7881271248628 -3.27297980420457 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.698856723303158 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 45981317 G/A 1 15 22 37 7.07844524040221 11.6182803140768 -4.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.141690847235075 ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45981237_45981415:SQRDL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:C C A 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 49170727 T/C 1 443 388 831 209.050082766545 204.904216448263 4.14586631828217 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.781140294102583 ENSG00000255302:ENST00000530028:exon_49170298_49172190:EID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 50773787 A/G 1 37 32 69 17.4601649263254 16.8993168204753 0.560848105850145 A:G A G 10 0.528103650639853 0.904739106984912 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50773678_50774262:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50773678_50774262:USP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 12 19 31 5.66275619232176 10.0339693621572 -4.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.149322929228651 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 50788090 G/A 1 29 14 43 13.6849941314443 7.39345110895794 6.29154302248632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0660925173017242 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50788045_50788281:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50788045_50788281:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50788045_50788281:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50788045_50788281:USP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 50789423 G/A 1 24 22 46 11.3255123846435 11.6182803140768 -0.292767929433237 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000419830:exon_50789286_50789428:USP8;ENSG00000138592:ENST00000396440:exon_50789286_50789428:USP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 52664408 G/A 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52664321_52664560:MYO5A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 52901914 T/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 56387859 T/C 1 11 16 27 5.19085984296162 8.44965841023765 -3.25879856727603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248785447351970 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 20 12 32 9.43792698720294 6.33724380767824 3.1006831795247 A:G A G 10 0.528103650639853 0.293179899019863 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 62199580 T/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:T T A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62199463_62199589:VPS13C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 62202482 C/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62202376_62202504:VPS13C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 20 9 29 9.43792698720294 4.75293285575868 4.68499413144426 A:G G A 10 0.528103650639853 0.094745459500254 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 22 20 42 10.3817196859232 10.5620730127971 -0.180353326873824 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 27 21 48 12.741201432724 11.0901766634369 1.65102476928706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.666789151538884 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 21 36 57 9.90982333656309 19.0117314230347 -9.10190808647162 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0168745414679443 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 35 43 78 16.5163722276051 22.7084569775137 -6.19208474990853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.174132928663277 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65295505 C/T 1 38 23 61 17.9320612756856 12.1463839647166 5.78567731096897 T:C C T 10 0.528103650639853 0.158474570994917 ENSG00000103707:ENST00000220058:exon_65293851_65295594:MTFMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 65313896 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000103707:ENST00000220058:exon_65313852_65313954:MTFMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 28 26 54 13.2130977820841 13.7306949166362 -0.517597134552062 A:G A G 10 0.528103650639853 0.892562750123292 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 67457335 A/G 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G A G 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67457233_67457426:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67457233_67457426:SMAD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 15 12 27 7.07844524040221 6.33724380767824 0.741201432723969 T:G T G 10 0.528103650639853 0.848515385288294 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 14 8 22 6.60654889104206 4.22482920511882 2.38171968592323 A:G A G 10 0.528103650639853 0.394433566707544 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 16 6 22 7.55034158976235 3.16862190383912 4.38171968592323 T:C C T 10 0.528103650639853 0.085649833785824 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 70350607 C/T 1 24 17 41 11.3255123846435 8.9777620608775 2.34775032376603 T:C C T 10 0.528103650639853 0.532670531600526 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70350489_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70350489_70350630:TLE3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 73866028 C/T 1 35 29 64 16.5163722276051 15.3150058685557 1.20136635904941 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80315838965615 ENSG00000156642:ENST00000345330:exon_73866003_73866136:NPTN;ENSG00000156642:ENST00000351217:exon_73866003_73866136:NPTN;ENSG00000156642:ENST00000287226:exon_73866003_73866136:NPTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 8 1 9 3.77517079488118 0.528103650639853 3.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0417379304922468 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 49 48 97 23.1229211186472 25.3489752307129 -2.22605411206574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.68475817487454 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 51 39 90 24.0667138173675 20.5960423749543 3.47067144241323 T:G G T 10 0.528103650639853 0.526692253956341 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 167 215 382 78.8066903431446 113.542284887568 -34.7355945444238 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.000396228278742783 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74703838 C/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:C C A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 154 176 330 72.6720378014626 92.9462425126141 -20.2742047111515 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0273286937916810 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 292 296 588 137.793734013163 156.318680589396 -18.5249465762336 A:G G A 10 0.528103650639853 0.126657293162936 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74709683 G/A 1 202 211 413 95.3230625707497 111.429870285009 -16.1068077142593 A:G G A 10 0.528103650639853 0.114926025317230 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709676_74709786:SEMA7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 125 135 260 58.9870436700184 71.2939928363802 -12.3069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.135969849561175 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75012985 T/C 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C T C 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000140465:ENST00000379727:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000395049:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000395048:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000268062:exon_75011883_75013115:CYP1A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 280 259 539 132.130977820841 136.778845515722 -4.64786769488074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.697965662566911 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75091664 G/A 1 253 245 498 119.389776388117 129.385394406764 -9.99561801864679 A:G G A 10 0.528103650639853 0.369842890585635 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 17 1 18 8.0222379391225 0.528103650639853 7.49413428848265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000202869964764809 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 63 71 134 29.7294700096893 37.4953591954296 -7.7658891857403 A:G A G 10 0.528103650639853 0.194473156513743 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499429 C/G 1 42 37 79 19.8196466731262 19.5398350736746 0.279811599451616 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499573 G/A 1 64 86 150 30.2013663590494 45.4169139550274 -15.2155475959779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0140074007652208 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 83 46 129 39.1673969968922 24.2927679294332 14.874629067459 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0102769561476747 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 65 47 112 30.6732627084096 24.8208715800731 5.85239112833647 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.298059197838162 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 60 49 109 28.3137809616088 25.8770788813528 2.43670208025602 A:G G A 10 0.528103650639853 0.701401136878553 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499933 A/G 1 127 74 201 59.9308363687387 39.0796701473491 20.8511662213896 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00366948629062359 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 134 70 204 63.2341108142597 36.9672555447897 26.26685526947 A:T:G T G 10 0.528103650639853 0.000247682024200794 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75503147 G/A 1 97 60 157 45.7739458879343 31.6862190383912 14.0877268495431 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0251849926509731 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75645911 C/T 1 6 13 19 2.83137809616088 6.86534745831809 -4.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0695977405691466 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 94 89 183 44.3582568398538 47.0012249069469 -2.64296806709309 T:G G T 10 0.528103650639853 0.711672494904621 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 77325279 C/T 1 11 6 17 5.19085984296162 3.16862190383912 2.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.345327913480538 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77325203_77325293:PSTPIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 49 65 114 23.1229211186472 34.3267372915904 -11.2038161729432 A:T T A 10 0.528103650639853 0.038897694346185 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 25 20 45 11.7974087340037 10.5620730127971 1.23533572120662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.76647967814017 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 41 39 80 19.347750323766 20.5960423749543 -1.24829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.82317806454237 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 70 85 155 33.0327444552103 44.8888103043875 -11.8560658491772 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0639905476580319 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 82512118 G/A 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82511993_82512159:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82511993_82512159:EFTUD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 82533686 T/G 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82533611_82533744:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82533611_82533744:EFTUD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 86124616 A/G 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G A G 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 18 26 44 8.49413428848265 13.7306949166362 -5.23656062815353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.131278426262690 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 30 20 50 14.1568904808044 10.5620730127971 3.59481746800735 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.324932833146096 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 28 26 54 13.2130977820841 13.7306949166362 -0.517597134552062 A:G A G 10 0.528103650639853 0.892562750123292 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 36 28 64 16.9882685769653 14.7869022179159 2.20136635904941 A:G A G 10 0.528103650639853 0.618018150605002 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 C:G G C 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 223 160 383 105.232885907313 84.4965841023765 20.7363018049363 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0357996525891553 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 155 129 284 73.1439341508228 68.125370932541 5.01856321828176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.592797568389446 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 22 29 51 10.3817196859232 15.3150058685557 -4.9332861826325 C:G G C 10 0.528103650639853 0.206471742023699 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 24 35 59 11.3255123846435 18.4836277723949 -7.15811538775133 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0681235853830656 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 1 16 17 0.471896349360147 8.44965841023765 -7.9777620608775 A:C C A 10 0.528103650639853 7.64725967208602e-05 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 7 11 18 3.30327444552103 5.80914015703838 -2.50586571151735 A:C C A 10 0.528103650639853 0.248966895441819 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 14 13 27 6.60654889104206 6.86534745831809 -0.258798567276031 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 28 27 55 13.2130977820841 14.258798567276 -1.04570078519192 C:G G C 10 0.528103650639853 0.78873192122544 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91454424 C/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454401_91454468:MAN2A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91461571 C/A 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 A:C C A 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91461424_91461618:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91461424_91461618:MAN2A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 C:G G C 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:C A C 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 93482910 C/T 1 18 4 22 8.49413428848265 2.11241460255941 6.38171968592324 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0087563221802119 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93482808_93482948:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93482808_93482948:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000420239:exon_93482808_93482948:CHD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 33 11 44 15.5725795288849 5.80914015703838 9.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00365709187119177 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 C:G G C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 C:G G C 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 100269737 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 25 29 54 11.7974087340037 15.3150058685557 -3.51759713455206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.343926205786904 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 36 34 70 16.9882685769653 17.955524121755 -0.967255544789708 T:C T C 10 0.528103650639853 0.904823411472605 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101113862 C/T 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101120515 C/T 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120468_101120557:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120468_101120557:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120468_101120557:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120468_101120557:LINS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101567547 G/C 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 C:G G C 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101567466_101567586:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101567466_101567586:LRRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 17 15 32 8.0222379391225 7.92155475959779 0.100683179524705 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 8 16 24 3.77517079488118 8.44965841023765 -4.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0659664265085599 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 35 28 63 16.5163722276051 14.7869022179159 1.72947000968926 T:C C T 10 0.528103650639853 0.706118249183617 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101718529 T/C 1 14 33 47 6.60654889104206 17.4274204711151 -10.8208715800731 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00187682312723036 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101718927 G/A 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101718950 T/C 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 T:C T C 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 15 101791359 C/G 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 C:G C G 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101791342_101792137:CHSY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 84 83 167 39.6392933462524 43.8326030031078 -4.19330965685545 T:C C T 10 0.528103650639853 0.535745568606055 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 32 36 68 15.1006831795247 19.0117314230347 -3.91104824351 T:C C T 10 0.528103650639853 0.395430723028448 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 168 110 278 79.2785866925047 58.0914015703838 21.1871851221209 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0115488131068462 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 252 128 380 118.917880038757 67.5972672819012 51.3206127568559 T:C C T 10 0.528103650639853 1.04420250702773e-07 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 19 17 36 8.96603063784279 8.9777620608775 -0.011731423034707 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 720698 G/A 1 41 26 67 19.347750323766 13.7306949166362 5.61705540712985 A:G G A 10 0.528103650639853 0.179888949367617 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720675_720773:RHOT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1545589 T/C 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1812972 G/C 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 C:G G C 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1812837_1813007:MAPK8IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1814391 T/C 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 27 18 45 12.741201432724 9.50586571151735 3.23533572120662 A:C:G G C 10 0.528103650639853 0.372254073469817 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 78 79 157 36.8079152500915 41.7201884005484 -4.91227315045692 A:T T A 10 0.528103650639853 0.472020750362052 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1821146 G/A 1 75 81 156 35.392226202011 42.7763957018281 -7.38416949981707 A:G G A 10 0.528103650639853 0.261569109658888 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1821071_1821172:NME3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1822159 T/C 1 216 153 369 101.929611461792 80.7998585478975 21.1297529138943 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0285026571111923 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1821891_1822514:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 2 13 15 0.943792698720294 6.86534745831809 -5.92155475959779 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00291134507882165 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 444 241 685 209.521979115905 127.272979804205 82.2489993117007 T:C C T 10 0.528103650639853 2.27021294478867e-10 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 18 29 47 8.49413428848265 15.3150058685557 -6.82087158007309 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0567243206581705 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 25 30 55 11.7974087340037 15.8431095191956 -4.04570078519192 C:G G C 10 0.528103650639853 0.283169598884180 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 A:C C A 10 0.528103650639853 0.253776528805514 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 14 29 43 6.60654889104206 15.3150058685557 -8.70845697751368 A:C A C 10 0.528103650639853 0.00896454339294906 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 63 63 126 29.7294700096893 33.2705299903107 -3.54105998062147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.533625945451494 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 42 36 78 19.8196466731262 19.0117314230347 0.807915250091469 T:C C T 10 0.528103650639853 0.909914342268573 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 33 35 68 15.5725795288849 18.4836277723949 -2.91104824351 T:C C T 10 0.528103650639853 0.544016509159773 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 38 34 72 17.9320612756856 17.955524121755 -0.023462846069414 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2114407 C/T 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000490108:exon_2114273_2114428:TSC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2125834 T/C 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2125800_2125893:TSC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 13 14 27 6.13465254168191 7.39345110895794 -1.25879856727603 A:G A G 10 0.528103650639853 0.701591240329278 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2140321 G/A 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2140454 T/C 1 13 4 17 6.13465254168191 2.11241460255941 4.0222379391225 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0550357587836995 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2140554 G/A 1 15 5 20 7.07844524040221 2.64051825319926 4.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.070570681987361 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2140680 T/C 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140675_2140809:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140675_2140840:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2144176 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2144093_2144211:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2144093_2144211:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2144093_2144211:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2144093_2144211:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2144050_2144211:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000487932:exon_2144093_2144211:PKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 C:G C G 10 0.528103650639853 0.130559033023297 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 57 44 101 26.8980919135284 23.2365606281535 3.66153128537485 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.486725262597772 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 29 28 57 13.6849941314443 14.7869022179159 -1.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.79201240933562 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 3 12 15 1.41568904808044 6.33724380767824 -4.92155475959779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0168940882725766 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 39 39 78 18.4039576250457 20.5960423749543 -2.19208474990853 T:G G T 10 0.528103650639853 0.651035551864187 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 28 33 61 13.2130977820841 17.4274204711151 -4.21432268903103 T:C C T 10 0.528103650639853 0.306031627766186 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 23 13 36 10.8536160352834 6.86534745831809 3.98826857696529 C:G C G 10 0.528103650639853 0.242237598467389 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 64 63 127 30.2013663590494 33.2705299903107 -3.06916363126133 T:G G T 10 0.528103650639853 0.594980996968688 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3273905 C/T 1 33 26 59 15.5725795288849 13.7306949166362 1.84188461224867 T:C C T 10 0.528103650639853 0.696343967932934 ENSG00000010539:ENST00000396870:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396868:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396871:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000414144:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000438090:exon_3272325_3274610:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000431561:exon_3272325_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000008311:exon_3272350_3274613:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000453093:exon_3273892_3274610:ZNF200 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3613637 G/A 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3639827 G/A 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3640274 G/A 1 17 8 25 8.0222379391225 4.22482920511882 3.79740873400368 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.161050017092251 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3640477 C/T 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 43 28 71 20.2915430224863 14.7869022179159 5.50464080457044 A:G G A 10 0.528103650639853 0.234347425874919 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3721773 G/C 1 155 109 264 73.1439341508228 57.563297919744 15.5806362310788 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0561243733460191 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3721723_3721792:TRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 22 10 32 10.3817196859232 5.28103650639853 5.10068317952471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.077943542144369 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 3820667 C/T 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3820571_3820987:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3820571_3820987:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3820571_3820987:CREBBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 7 12 19 3.30327444552103 6.33724380767824 -3.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.175700689513822 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 33 26 59 15.5725795288849 13.7306949166362 1.84188461224867 T:C T C 10 0.528103650639853 0.696343967932934 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 31 22 53 14.6287868301646 11.6182803140768 3.01050651608779 A:T A T 10 0.528103650639853 0.491893222169063 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 26 11 37 12.2693050833638 5.80914015703838 6.46016492632544 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0466771981036013 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4802370 C/A 1 7 11 18 3.30327444552103 5.80914015703838 -2.50586571151735 A:C C A 10 0.528103650639853 0.248966895441819 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 C:G G C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 10524957 G/T 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:G G T 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10524452_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10524452_10525312:ATF7IP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 22 34 56 10.3817196859232 17.955524121755 -7.57380443583177 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0451715011058709 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 56 34 90 26.4261955641682 17.955524121755 8.47067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0906220090144094 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 51 40 91 24.0667138173675 21.1241460255941 2.94256779177338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.599900791461394 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 23 27 50 10.8536160352834 14.258798567276 -3.40518253199265 A:C A C 10 0.528103650639853 0.395726960156912 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 18 3 21 8.49413428848265 1.58431095191956 6.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00334141336953296 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:G G T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 14041958 T/C 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000175595:ENST00000311895:exon_14041471_14046205:ERCC4;ENSG00000175595:ENST00000389138:exon_14041471_14042339:ERCC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 55 51 106 25.9542992148081 26.9332861826325 -0.978986967824419 T:G T G 10 0.528103650639853 0.846543914755377 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 16 10 26 7.55034158976235 5.28103650639853 2.26930508336382 A:C C A 10 0.528103650639853 0.434914527433077 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 14 8 22 6.60654889104206 4.22482920511882 2.38171968592323 C:G C G 10 0.528103650639853 0.394433566707544 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15165103 G/A 1 20 28 48 9.43792698720294 14.7869022179159 -5.34897523071294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.147844112675630 ENSG00000085721:ENST00000198767:exon_15164978_15165108:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000429751:exon_15164978_15165108:RRN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 1 40 7 47 18.8758539744059 3.69672555447897 15.1791284199269 T:C T C 10 0.528103650639853 5.45338360585615e-06 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 46 6 52 21.7072320705668 3.16862190383912 18.5386101667276 T:C C T 10 0.528103650639853 6.99185127647322e-08 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 1 50 3 53 23.5948174680073 1.58431095191956 22.0105065160878 A:G G A 10 0.528103650639853 6.46014594898193e-11 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 16200674 G/C 1 16 10 26 7.55034158976235 5.28103650639853 2.26930508336382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.434914527433077 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16200595_16200730:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16200595_16200730:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16200595_16200730:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16200595_16200730:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16200595_16200730:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16200595_16200730:ABCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 18826504 G/A 1 35 25 60 16.5163722276051 13.2025912659963 3.31378096160882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.438777693671163 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18826497_18826603:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18826497_18826603:SMG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 36 42 78 16.9882685769653 22.1803533268738 -5.19208474990853 A:C C A 10 0.528103650639853 0.257658932839281 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 20873767 T/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000188215:ENST00000324344:exon_20873430_20873965:DCUN1D3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 5 10 15 2.35948174680074 5.28103650639853 -2.92155475959779 A:G A G 10 0.528103650639853 0.194694511215894 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 22237273 C/G 1 7 15 22 3.30327444552103 7.92155475959779 -4.61828031407677 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0554919458936411 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 16 45 61 7.55034158976235 23.7646642787934 -16.214322689031 T:C:G C G 10 0.528103650639853 2.97576992049686e-05 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 29 16 45 13.6849941314443 8.44965841023765 5.23533572120662 A:C A C 10 0.528103650639853 0.135821071230979 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 41 47 88 19.347750323766 24.8208715800731 -5.47312125630706 C:G G C 10 0.528103650639853 0.285596291109463 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23641185 T/C 1 17 29 46 8.0222379391225 15.3150058685557 -7.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0379254565236344 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 30 51 81 14.1568904808044 26.9332861826325 -12.7763957018281 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00515760234576416 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 81 52 133 38.2236042981719 27.4613898332724 10.7622144648996 A:G A G 10 0.528103650639853 0.068003649862051 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 24104188 C/T 1 57 61 118 26.8980919135284 32.214322689031 -5.31623077550265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.356779698398989 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498739:exon_24104112_24104268:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000482000:exon_24104111_24104268:PRKCB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 71 70 141 33.5046408045704 36.9672555447897 -3.46261474021927 T:C C T 10 0.528103650639853 0.612948888955652 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.7110881983466 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 20 28 48 9.43792698720294 14.7869022179159 -5.34897523071294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.147844112675630 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 42 43 85 19.8196466731262 22.7084569775137 -2.8888103043875 T:C T C 10 0.528103650639853 0.587326741266453 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 15 26 41 7.07844524040221 13.7306949166362 -6.65224967623397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.041977337587542 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.396805472370051 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 54 73 127 25.4824028654479 38.5515664967093 -13.0691636312613 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.0208928436850941 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 T:G G T 10 0.528103650639853 0.566229485908398 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 30900235 G/A 1 68 67 135 32.08895175649 35.3829445928702 -3.29399283638016 A:G G A 10 0.528103650639853 0.605342070776977 ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30900181_30900266:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30900181_30900266:BCL7C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 296 268 564 139.681319410604 141.531778371481 -1.85045896087709 A:C C A 10 0.528103650639853 0.899337764467646 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 C:G C G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 46652209 A/C 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 A:C A C 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46652117_46652284:SHCBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 49 59 108 23.1229211186472 31.1581153877513 -8.03519426910412 T:C C T 10 0.528103650639853 0.124130876826493 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53326860 G/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53326745_53326964:CHD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 A:G A G 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53503934 G/A 1 16 3 19 7.55034158976235 1.58431095191956 5.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00557334447927397 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53503943 C/G 1 14 3 17 6.60654889104206 1.58431095191956 5.0222379391225 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0150530210679749 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 32 28 60 15.1006831795247 14.7869022179159 0.313780961608821 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 56396430 C/A 1 89 89 178 41.9987750930531 47.0012249069469 -5.00244981389383 A:C:G C A 10 0.528103650639853 0.454056978306007 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 93 76 169 43.8863604904937 40.1358774486288 3.75048304186485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.59013217770357 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 223 186 409 105.232885907313 98.2272790190127 7.00560688830014 A:G G A 10 0.528103650639853 0.519737660302785 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57015545 C/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 23 19 42 10.8536160352834 10.0339693621572 0.819646673126176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.877667714203748 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57059427 C/T 1 16 14 30 7.55034158976235 7.39345110895794 0.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 32 23 55 15.1006831795247 12.1463839647166 2.95429921480809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.499943719683589 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 33 26 59 15.5725795288849 13.7306949166362 1.84188461224867 T:C T C 10 0.528103650639853 0.696343967932934 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 0 9 0 9 4.24706714424132 0 4.24706714424132 A A 10 0.528103650639853 0.00435544387654226 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 9 1 10 4.24706714424132 0.528103650639853 3.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0234403290361439 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 15 6 21 7.07844524040221 3.16862190383912 3.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.124351877629196 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57101340 T/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 15 20 35 7.07844524040221 10.5620730127971 -3.48362777239485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.309718330491662 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 48 42 90 22.6510247692871 22.1803533268738 0.470671442413231 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 2 9 11 0.943792698720294 4.75293285575868 -3.80914015703838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0308891347915433 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 45 19 64 21.2353357212066 10.0339693621572 11.2013663590494 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0055501526172683 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 17 19 36 8.0222379391225 10.0339693621572 -2.01173142303471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.509905663570198 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 58752466 C/T 1 46 44 90 21.7072320705668 23.2365606281535 -1.52932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75269366684854 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58752431_58752588:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58752121_58752592:GOT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 66861966 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000159593:ENST00000379463:exon_66861883_66861980:NAE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 36 21 57 16.9882685769653 11.0901766634369 5.89809191352838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.143988674591400 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G A G 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 68893953 T/C 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68893787_68894427:TMCO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69199384 C/T 1 78 91 169 36.8079152500915 48.0574322082266 -11.2495169581352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0900152617952342 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69199244_69199429:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69199244_69199429:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69199244_69199474:CIRH1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 122 103 225 57.5713546219379 54.3946760159049 3.17667860603308 A:G A G 10 0.528103650639853 0.689102239138244 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69356612 C/G 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 C:G C G 10 0.528103650639853 0.667384719304921 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69381769 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000157315:ENST00000288025:exon_69381691_69381839:TMED6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 39 29 68 18.4039576250457 15.3150058685557 3.08895175649 A:G G A 10 0.528103650639853 0.468870869658919 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69963403 G/A 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69963351_69963432:WWP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 26 24 50 12.2693050833638 12.6744876153565 -0.405182531992651 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 37 26 63 17.4601649263254 13.7306949166362 3.72947000968926 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.378495562112750 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 18 20 38 8.49413428848265 10.5620730127971 -2.06793872431441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.519923483669534 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 23 27 50 10.8536160352834 14.258798567276 -3.40518253199265 A:T A T 10 0.528103650639853 0.395726960156912 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 59 73 132 27.8418846122487 38.5515664967093 -10.7096818844606 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0670928935370798 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72057421 C/T 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72057373_72057532:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72057373_72057532:DHODH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72130125 T/C 1 33 23 56 15.5725795288849 12.1463839647166 3.42619556416823 T:C T C 10 0.528103650639853 0.422350191418354 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 14 25 39 6.60654889104206 13.2025912659963 -6.59604237495427 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0374050035299014 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 24 20 44 11.3255123846435 10.5620730127971 0.763439371846468 A:G G A 10 0.528103650639853 0.880578951681275 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 62 45 107 29.2575736603291 23.7646642787934 5.49290938153573 A:C C A 10 0.528103650639853 0.332940029856256 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 72829909 A/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:T A T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 19 1 20 8.96603063784279 0.528103650639853 8.43792698720294 A:C C A 10 0.528103650639853 6.07378452937639e-05 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C T C 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 18 6 24 8.49413428848265 3.16862190383912 5.32551238464353 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0390594566667783 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 T:C C T 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:G G T 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 12 22 34 5.66275619232176 11.6182803140768 -5.955524121755 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0572352645365035 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 111 114 225 52.3804947789763 60.2038161729432 -7.82332139396692 T:C C T 10 0.528103650639853 0.316650152373153 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 126 132 258 59.4589400193785 69.7096818844606 -10.2507418650821 T:C T C 10 0.528103650639853 0.212468212143597 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 55 49 104 25.9542992148081 25.8770788813528 0.077220333455287 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 53 45 98 25.0105065160878 23.7646642787934 1.24584223729441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.84002755925643 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 26 31 57 12.2693050833638 16.3712131698354 -4.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.290912631487119 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84158248 G/C 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 C:G G C 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000103160:ENST00000219439:exon_84155746_84158333:HSDL1;ENSG00000103160:ENST00000434463:exon_84155888_84158333:HSDL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 20 27 47 9.43792698720294 14.258798567276 -4.82087158007309 A:C C A 10 0.528103650639853 0.188512122161681 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:T A T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 18 12 30 8.49413428848265 6.33724380767824 2.15689048080441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.469068351032088 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84520292 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 174 186 360 82.1099647886656 98.2272790190127 -16.1173142303471 A:G A G 10 0.528103650639853 0.091299746223108 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 85711769 G/A 1 53 73 126 25.0105065160878 38.5515664967093 -13.5410599806215 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0160477672537529 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 93 71 164 43.8863604904937 37.4953591954296 6.39100129506411 T:C C T 10 0.528103650639853 0.348099630639227 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 85722434 T/C 1 13 10 23 6.13465254168191 5.28103650639853 0.853616035283381 T:C T C 10 0.528103650639853 0.835583811578279 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85722415_85722605:GINS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 86575737 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86575707_86575819:MTHFSD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 87782322 G/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 C:G G C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87782279_87782415:KLHDC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88599023 A/G 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599022_88599117:ZFPM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88600792 C/T 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 T:C C T 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599556_88601389:ZFPM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88644005 A/G 1 53 58 111 25.0105065160878 30.6300117371115 -5.61950522102368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.296796661271091 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88709828 A/G 1 64 92 156 30.2013663590494 48.5855358588665 -18.3841694998171 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00376281157911275 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88709698_88709979:CYBA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88870967 T/C 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 25 39 64 11.7974087340037 20.5960423749543 -8.79863364095059 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0327420728633912 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 32 34 66 15.1006831795247 17.955524121755 -2.8548409422303 C:G C G 10 0.528103650639853 0.538110000303858 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 88926089 C/T 1 100 104 204 47.1896349360147 54.9227796665447 -7.73314473053001 T:C C T 10 0.528103650639853 0.293129259577099 ENSG00000167515:ENST00000301021:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L;ENSG00000167515:ENST00000452287:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L;ENSG00000167515:ENST00000427604:exon_88926071_88926158:TRAPPC2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 9 13 22 4.24706714424132 6.86534745831809 -2.61828031407677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.291233724549757 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89294439 G/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:G G T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89294827 A/G 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 C:G G C 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 36 25 61 16.9882685769653 13.2025912659963 3.78567731096897 A:G G A 10 0.528103650639853 0.370356569936942 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 16 89790048 G/C 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 C:G G C 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 79 57 136 37.2798115994516 30.1019080864716 7.17790351297999 A:G G A 10 0.528103650639853 0.22986163892819 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 71 73 144 33.5046408045704 38.5515664967093 -5.04692569213884 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.405209437662348 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 78 79 157 36.8079152500915 41.7201884005484 -4.91227315045692 A:T T A 10 0.528103650639853 0.472020750362052 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 61 47 108 28.785677310969 24.8208715800731 3.96480573089588 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.500111376075108 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 53 48 101 25.0105065160878 25.3489752307129 -0.338468714625154 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 27 24 51 12.741201432724 12.6744876153565 0.0667138173674964 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 685752 G/A 1 17 20 37 8.0222379391225 10.5620730127971 -2.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.415509256308292 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685696_685794:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 128 164 292 60.4027327180988 86.6089987049359 -26.2062659868371 A:C C A 10 0.528103650639853 0.00226895370013036 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 1373473 C/T 1 67 41 108 31.6170554071299 21.652249676234 9.96480573089588 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0665778487109874 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 44 51 95 20.7634393718465 26.9332861826325 -6.16984681078603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.218288310324079 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:C T C 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 1964751 C/T 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 T:C C T 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_1963133_1964916:SMG6;ENSG00000070366:ENST00000354901:exon_1963133_1964916:SMG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 18 25 43 8.49413428848265 13.2025912659963 -4.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.170075270240269 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 22 8 30 10.3817196859232 4.22482920511882 6.15689048080441 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0276266387995477 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 16 18 34 7.55034158976235 9.50586571151735 -1.955524121755 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.607017625505778 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 53 65 118 25.0105065160878 34.3267372915904 -9.31623077550266 T:C T C 10 0.528103650639853 0.096751950993789 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 56 76 132 26.4261955641682 40.1358774486288 -13.7096818844606 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0184203880095275 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 8 1 9 3.77517079488118 0.528103650639853 3.24706714424132 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0417379304922468 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3563963 C/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 C:G C G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 0 9 0 9 4.24706714424132 0 4.24706714424132 A A 10 0.528103650639853 0.00435544387654226 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3564084 T/C 1 8 1 9 3.77517079488118 0.528103650639853 3.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0417379304922468 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 42 105 147 19.8196466731262 55.4508833171846 -35.6312366440584 T:C C T 10 0.528103650639853 3.71292612876374e-09 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3629628 C/A 1 13 16 29 6.13465254168191 8.44965841023765 -2.31500586855574 A:C C A 10 0.528103650639853 0.458325929651428 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 44 27 71 20.7634393718465 14.258798567276 6.50464080457044 T:C T C 10 0.528103650639853 0.153250759170052 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 26 21 47 12.2693050833638 11.0901766634369 1.17912841992691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.771647354948445 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3947644 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 3968064 A/C 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:C A C 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3967655_3968123:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3967655_3968123:ZZEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4058111 T/C 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 T:C T C 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000167740:ENST00000301391:exon_4057968_4058154:CYB5D2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4084608 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000185722:ENST00000341657:exon_4084549_4084667:ANKFY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 20 35 55 9.43792698720294 18.4836277723949 -9.04570078519191 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0151569242779983 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 135 140 275 63.7060071636198 73.9345110895794 -10.2285039259596 C:G C G 10 0.528103650639853 0.22722212989614 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 118 130 248 55.6837692244973 68.6534745831809 -12.9697053586835 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.111647086769764 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 269 279 548 126.94011797788 147.340918528519 -20.4008005506394 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0869211171789971 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 24 20 44 11.3255123846435 10.5620730127971 0.763439371846468 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.880578951681275 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 79 76 155 37.2798115994516 40.1358774486288 -2.85606584917721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.687688562515066 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 92 84 176 43.4144641411335 44.3607066537476 -0.94624251261412 C:G C G 10 0.528103650639853 0.939847730774347 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5356913 C/T 1 4 13 17 1.88758539744059 6.86534745831809 -4.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0257057202820419 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5356900_5356988:DHX33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 31 34 65 14.6287868301646 17.955524121755 -3.32673729159044 T:C C T 10 0.528103650639853 0.456610605246761 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 32 22 54 15.1006831795247 11.6182803140768 3.48240286544794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.413752452514042 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 20 30 50 9.43792698720294 15.8431095191956 -6.40518253199265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0882706010075876 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 28 30 58 13.2130977820841 15.8431095191956 -2.63001173711147 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.512894467717673 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 19 19 38 8.96603063784279 10.0339693621572 -1.06793872431441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.74778887552863 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5440197 T/C 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5440171_5440260:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5440171_5440260:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5461677 C/T 1 24 18 42 11.3255123846435 9.50586571151735 1.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.644103924037243 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 9 13 22 4.24706714424132 6.86534745831809 -2.61828031407677 C:G C G 10 0.528103650639853 0.291233724549757 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 7 14 21 3.30327444552103 7.39345110895794 -4.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0828202401380353 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6513329 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6513314_6513480:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6515387 A/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6515454 C/T 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T T A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 15 8 23 7.07844524040221 4.22482920511882 2.85361603528338 A:G A G 10 0.528103650639853 0.297436847461985 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 15 9 24 7.07844524040221 4.75293285575868 2.32551238464353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.415581587245928 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6547959 A/G 1 33 41 74 15.5725795288849 21.652249676234 -6.07967014734912 A:G A G 10 0.528103650639853 0.163826318391060 ENSG00000108590:ENST00000225728:exon_6546635_6547979:MED31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 6940065 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6940046_6940189:SLC16A13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 T:C T C 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 42 40 82 19.8196466731262 21.1241460255941 -1.30449935246794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.825211432795832 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 32 20 52 15.1006831795247 10.5620730127971 4.53861016672765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.214847126212588 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 108 97 205 50.9648057308959 51.2260541120657 -0.261248381169864 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7340088 G/T 1 20 25 45 9.43792698720294 13.2025912659963 -3.76466427879338 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.296893404034065 ENSG00000181284:ENST00000323206:exon_7339513_7340998:TMEM102;ENSG00000181284:ENST00000396568:exon_7339513_7340842:TMEM102 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7490231 G/C 1 45 39 84 21.2353357212066 20.5960423749543 0.639293346252352 C:G G C 10 0.528103650639853 0.913374106709397 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000423172:exon_7490217_7490335:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490217_7490287:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000396501:exon_7490217_7490335:MPDU1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7529902 G/A 1 72 79 151 33.9765371539306 41.7201884005484 -7.7436512466178 A:G G A 10 0.528103650639853 0.221706390840524 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7529552_7529932:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7529556_7529932:SAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7592373 C/G 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 C:G C G 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7589619_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7591795_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7591966_7592397:WRAP53 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 90 135 225 42.4706714424132 71.2939928363802 -28.8233213939669 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000132010077334354 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 40 39 79 18.8758539744059 20.5960423749543 -1.72018840054838 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.73596571762082 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 103 43 146 48.6053239840951 22.7084569775137 25.8968670065815 A:G A G 10 0.528103650639853 1.40476787871721e-05 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 98 40 138 46.2458422372944 21.1241460255941 25.1216962117003 A:G G A 10 0.528103650639853 1.66155736850885e-05 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8161215 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 29 28 57 13.6849941314443 14.7869022179159 -1.10190808647162 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.79201240933562 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8402669 C/T 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8402588_8402794:MYH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8706736 G/T 1 121 167 288 57.0994582725778 88.1933096568554 -31.0938513842777 T:G G T 10 0.528103650639853 0.000302837228311702 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 51 26 77 24.0667138173675 13.7306949166362 10.3360189007313 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0218900226040313 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 15 4 19 7.07844524040221 2.11241460255941 4.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0357287030419509 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 15532208 G/A 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 26 27 53 12.2693050833638 14.258798567276 -1.98949348391221 C:G G C 10 0.528103650639853 0.58583948976565 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 77 57 134 36.3360189007313 30.1019080864716 6.2341108142597 A:G A G 10 0.528103650639853 0.299695894801752 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 51 53 104 24.0667138173675 27.9894934839122 -3.92277966654471 A:C A C 10 0.528103650639853 0.491978740826856 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 20 29 49 9.43792698720294 15.3150058685557 -5.8770788813528 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.114790067649252 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 T:C T C 10 0.528103650639853 0.390773887480627 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 14 23 37 6.60654889104206 12.1463839647166 -5.53983507367456 T:C T C 10 0.528103650639853 0.07193378570055 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 14 24 38 6.60654889104206 12.6744876153565 -6.06793872431441 A:C:G G C 10 0.528103650639853 0.0521566669668127 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 61 48 109 28.785677310969 25.3489752307129 3.43670208025602 A:G G A 10 0.528103650639853 0.565136479939303 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17250159 C/T 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000205309:ENST00000446264:exon_17250127_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000478373:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000379552:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000389022:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000470418:exon_17250119_17250172:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000483704:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000480529:exon_17250119_17250466:NT5M HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17698254 G/A 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17697562_17700505:RAI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 11 4 15 5.19085984296162 2.11241460255941 3.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.127145755019567 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17948475 G/A 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000141034:ENST00000268719:exon_17948461_17948520:C17orf39;ENSG00000141034:ENST00000376345:exon_17948461_17948520:C17orf39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 69 71 140 32.5608481058501 37.4953591954296 -4.93451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 0.446278040323368 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 18167684 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 6 15 21 2.83137809616088 7.92155475959779 -5.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0292172121457386 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G A G 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 C:G C G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 26 29 55 12.2693050833638 15.3150058685557 -3.04570078519192 A:G G A 10 0.528103650639853 0.421148445744323 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 31 0 31 14.6287868301646 0 14.6287868301646 T T 10 0.528103650639853 2.61433681609943e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 39 0 39 18.4039576250457 0 18.4039576250457 G G 10 0.528103650639853 2.38551871271378e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 44 0 44 20.7634393718465 0 20.7634393718465 C C 10 0.528103650639853 8.54470431733953e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 20 0 20 9.43792698720294 0 9.43792698720294 C C 10 0.528103650639853 3.14684283276297e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 45 0 45 21.2353357212066 0 21.2353357212066 C C 10 0.528103650639853 4.41011672773277e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 31 0 31 14.6287868301646 0 14.6287868301646 C C 10 0.528103650639853 2.61433681609943e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 22 0 22 10.3817196859232 0 10.3817196859232 C C 10 0.528103650639853 8.6077904648797e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 29 0 29 13.6849941314443 0 13.6849941314443 C C 10 0.528103650639853 9.4440926329539e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 31 0 31 14.6287868301646 0 14.6287868301646 G G 10 0.528103650639853 2.61433681609943e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 86 0 86 40.5830860449726 0 40.5830860449726 G G 10 0.528103650639853 1.84252844217947e-24 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 T:G G T 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 254 154 408 119.861672737477 81.3279621985374 38.53371053894 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.000130010705573862 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 28 49 77 13.2130977820841 25.8770788813528 -12.6639810992687 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00416968419555033 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27239630 C/T 1 37 23 60 17.4601649263254 12.1463839647166 5.31378096160882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.196172150014984 ENSG00000109118:ENST00000332830:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000378879:exon_27239500_27240295:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000268756:exon_27239162_27240295:PHF12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 18 8 26 8.49413428848265 4.22482920511882 4.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.115944447522606 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 C:G C G 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27835138 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27834914_27835150:TAOK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 63 45 108 29.7294700096893 23.7646642787934 5.96480573089588 T:C T C 10 0.528103650639853 0.289053344862184 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 40 39 79 18.8758539744059 20.5960423749543 -1.72018840054838 C:G G C 10 0.528103650639853 0.73596571762082 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 64 34 98 30.2013663590494 17.955524121755 12.2458422372944 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0148523170419618 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 21 31 52 9.90982333656309 16.3712131698354 -6.46138983327235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0946259985106502 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 A:G A G 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29159404 G/C 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 C:G G C 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29158988_29159431:ATAD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29161202 A/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:T A T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 8 17 25 3.77517079488118 8.9777620608775 -5.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0445969139904772 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 7 11 18 3.30327444552103 5.80914015703838 -2.50586571151735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248966895441819 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 2 8 10 0.943792698720294 4.22482920511882 -3.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0543023096387196 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 23 26 49 10.8536160352834 13.7306949166362 -2.8770788813528 T:C T C 10 0.528103650639853 0.474907101864699 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 A:G A G 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33288649 C/A 1 32 28 60 15.1006831795247 14.7869022179159 0.313780961608821 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 30 34 64 14.1568904808044 17.955524121755 -3.79863364095059 T:G T G 10 0.528103650639853 0.381451301856020 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33460367 G/A 1 11 22 33 5.19085984296162 11.6182803140768 -6.42742047111515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0348614589318123 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33460431 C/T 1 6 16 22 2.83137809616088 8.44965841023765 -5.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0185439039172996 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33460516 A/G 1 12 32 44 5.66275619232176 16.8993168204753 -11.2365606281535 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000747483275505286 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33592194 C/G 1 12 58 70 5.66275619232176 30.6300117371115 -24.9672555447897 A:C:G C G 10 0.528103650639853 9.10997451977314e-10 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 9 42 51 4.24706714424132 22.1803533268738 -17.9332861826325 T:C C T 10 0.528103650639853 3.15029636802521e-07 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 36 29 65 16.9882685769653 15.3150058685557 1.67326270840956 A:G G A 10 0.528103650639853 0.710745106900206 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33771996 G/A 1 33 30 63 15.5725795288849 15.8431095191956 -0.270529990310738 A:T:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 15 17 32 7.07844524040221 8.9777620608775 -1.8993168204753 C:G G C 10 0.528103650639853 0.596146570062849 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 34854089 T/C 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.295265926490473 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 23 30 53 10.8536160352834 15.8431095191956 -4.98949348391221 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.172326397331159 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 32 34 66 15.1006831795247 17.955524121755 -2.8548409422303 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.538110000303858 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 21 26 47 9.90982333656309 13.7306949166362 -3.82087158007309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.306964024826106 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 18 11 29 8.49413428848265 5.80914015703838 2.68499413144426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.35634147043118 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 36873149 C/T 0 34 0 34 16.044475878245 0 16.044475878245 C C 10 0.528103650639853 6.91620913396351e-10 ENSG00000108292:ENST00000325718:exon_36872620_36873234:MLLT6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 19 31 50 8.96603063784279 16.3712131698354 -7.40518253199265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0463563334334644 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 36909006 G/C 1 24 30 54 11.3255123846435 15.8431095191956 -4.51759713455206 C:G G C 10 0.528103650639853 0.22333481655334 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 219 273 492 103.345300509872 144.17229662468 -40.8269961148077 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000248108325489782 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 29 20 49 13.6849941314443 10.5620730127971 3.1229211186472 A:G A G 10 0.528103650639853 0.393896031027478 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 11 6 17 5.19085984296162 3.16862190383912 2.0222379391225 A:G G A 10 0.528103650639853 0.345327913480538 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 37819092 C/G 1 13 10 23 6.13465254168191 5.28103650639853 0.853616035283381 C:G C G 10 0.528103650639853 0.835583811578279 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37819057_37819687:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37819057_37819722:STARD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 38068621 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000464556:exon_38068579_38068750:GSDMB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 16 24 40 7.55034158976235 12.6744876153565 -5.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.114640129731523 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 33 36 69 15.5725795288849 19.0117314230347 -3.43915189414986 C:G G C 10 0.528103650639853 0.469675685518312 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 26 24 50 12.2693050833638 12.6744876153565 -0.405182531992651 A:T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 27 26 53 12.741201432724 13.7306949166362 -0.989493483912209 A:T:C T A 10 0.528103650639853 0.785341970361852 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 2 11 13 0.943792698720294 5.80914015703838 -4.86534745831809 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0096514819295199 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 47 49 96 22.1791284199269 25.8770788813528 -3.69795046142589 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.475160353937345 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40447726 G/A 1 39 32 71 18.4039576250457 16.8993168204753 1.50464080457044 A:G G A 10 0.528103650639853 0.812297434712392 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40447637_40447811:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40447637_40447811:STAT5A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 57 50 107 26.8980919135284 26.4051825319927 0.492909381535728 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 72 63 135 33.9765371539306 33.2705299903107 0.706007163619851 A:G A G 10 0.528103650639853 0.931452300855707 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 52 50 102 24.5386101667276 26.4051825319927 -1.86657236526501 A:G A G 10 0.528103650639853 0.766292855853182 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40725379 A/T 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 A:T A T 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40725329_40725382:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40725329_40725382:PSMC3IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 23 23 46 10.8536160352834 12.1463839647166 -1.29276792943324 A:G G A 10 0.528103650639853 0.76841874383127 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 22 16 38 10.3817196859232 8.44965841023765 1.93206127568559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.626706429561788 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40823109 T/A 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40823012_40823148:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40823021_40823148:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40823012_40823148:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40823021_40823148:PLEKHH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:C A C 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 106 105 211 50.0210130321756 55.4508833171846 -5.42987028500898 A:T A T 10 0.528103650639853 0.490594639577846 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 42155892 G/A 1 12 19 31 5.66275619232176 10.0339693621572 -4.37121316983544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.149322929228651 ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42155868_42156033:HDAC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 100 103 203 47.1896349360147 54.3946760159049 -7.20504107989016 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.32540328699575 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 43507008 G/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 C:G G C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000159314:ENST00000531735:exon_43506989_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000532891:exon_43506989_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000442348:exon_43506989_43507645:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000428638:exon_43506989_43507645:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000528273:exon_43506718_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000290470:exon_43506719_43507663:ARHGAP27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 43531194 G/A 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000225190:ENST00000430334:exon_43530721_43531638:PLEKHM1;ENSG00000225190:ENST00000446609:exon_43530721_43531638:PLEKHM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 32 39 71 15.1006831795247 20.5960423749543 -5.49535919542956 A:G G A 10 0.528103650639853 0.193702580127629 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 16 9 25 7.55034158976235 4.75293285575868 2.79740873400368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.318500289625426 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 45916018 C/G 1 41 40 81 19.347750323766 21.1241460255941 -1.77639570182809 C:G C G 10 0.528103650639853 0.73895438055875 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 26 20 46 12.2693050833638 10.5620730127971 1.70723207056676 T:C C T 10 0.528103650639853 0.659627499768371 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 46688135 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000120087:ENST00000239165:exon_46687881_46688379:HOXB7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 36 30 66 16.9882685769653 15.8431095191956 1.1451590577697 T:C T C 10 0.528103650639853 0.806305571211904 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 24 32 56 11.3255123846435 16.8993168204753 -5.57380443583177 T:C T C 10 0.528103650639853 0.142753041024440 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 36 33 69 16.9882685769653 17.4274204711151 -0.439151894149855 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 A:C A C 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C T C 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 19 22 41 8.96603063784279 11.6182803140768 -2.65224967623397 C:G G C 10 0.528103650639853 0.436883368571926 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 56772341 A/G 1 64 58 122 30.2013663590494 30.6300117371115 -0.428645378062065 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56772292_56772694:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000421782:exon_56772292_56772695:RAD51C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 6 12 18 2.83137809616088 6.33724380767824 -3.50586571151735 A:G A G 10 0.528103650639853 0.104929209344249 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 65 58 123 30.6732627084096 30.6300117371115 0.0432509712980824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 A:G A G 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 A:G A G 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 59763465 T/C 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 62568057 T/C 1 1 7 8 0.471896349360147 3.69672555447897 -3.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0305249046315294 ENSG00000108854:ENST00000262435:exon_62567916_62568074:SMURF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 28 28 56 13.2130977820841 14.7869022179159 -1.57380443583177 A:T T A 10 0.528103650639853 0.690071948741665 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 25 38 63 11.7974087340037 20.0679387243144 -8.27052999031074 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0430057396733904 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 85 111 196 40.1111896956125 58.6195052210237 -18.5083155254112 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00982998576476596 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 66267691 A/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:T A T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 14 13 27 6.60654889104206 6.86534745831809 -0.258798567276031 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 70943990 T/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70943891_70944014:SLC39A11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G G A 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 32 31 63 15.1006831795247 16.3712131698354 -1.27052999031074 A:G G A 10 0.528103650639853 0.80124485093039 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 13 18 31 6.13465254168191 9.50586571151735 -3.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.280637889142549 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 15 5 20 7.07844524040221 2.64051825319926 4.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.070570681987361 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 23 18 41 10.8536160352834 9.50586571151735 1.34775032376603 C:G G C 10 0.528103650639853 0.755216948991552 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 19 8 27 8.96603063784279 4.22482920511882 4.74120143272397 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0823937518569907 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 71239087 G/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:G G T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71239035_71239142:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71239035_71239142:C17orf80 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 34 34 68 16.044475878245 17.955524121755 -1.91104824351 A:G G A 10 0.528103650639853 0.715896982827148 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 55 52 107 25.9542992148081 27.4613898332724 -1.50709061846427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.772502652538378 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 6 14 20 2.83137809616088 7.39345110895794 -4.56207301279706 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0454249436140482 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 C:G G C 10 0.528103650639853 0.797125140631411 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 13 18 31 6.13465254168191 9.50586571151735 -3.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.280637889142549 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 12 2 14 5.66275619232176 1.05620730127971 4.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0148564761173621 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 73519798 C/T 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519744_73519860:TSEN54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 26 24 50 12.2693050833638 12.6744876153565 -0.405182531992651 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 51 53 104 24.0667138173675 27.9894934839122 -3.92277966654471 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.491978740826856 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 24 39 63 11.3255123846435 20.5960423749543 -9.27052999031074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0226304789779717 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 182 197 379 85.8851355835468 104.036419176051 -18.1512835925043 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0640400145848761 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 163 151 314 76.919104945704 79.7436512466178 -2.82454630091384 T:C T C 10 0.528103650639853 0.777556143259582 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 47 38 85 22.1791284199269 20.0679387243144 2.1111896956125 T:C T C 10 0.528103650639853 0.66541528441886 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 231 247 478 109.008056702194 130.441601708044 -21.4335450058497 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0542357445771755 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 54 65 119 25.4824028654479 34.3267372915904 -8.84433442614251 T:C C T 10 0.528103650639853 0.118323724155946 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 75483633 C/T 1 293 232 525 138.265630362523 122.520046948446 15.7455834140772 T:C C T 10 0.528103650639853 0.175445725679382 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76120065 A/G 1 1 10 11 0.471896349360147 5.28103650639853 -4.80914015703838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00433058530260509 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 36 53 89 16.9882685769653 27.9894934839122 -11.0012249069469 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0252213888914577 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76129903 C/T 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.594489574550988 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 334 276 610 157.613380686289 145.756607576599 11.8567731096897 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.351015889386386 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 64 80 144 30.2013663590494 42.2482920511882 -12.0469256921388 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0454239795083751 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 24 17 41 11.3255123846435 8.9777620608775 2.34775032376603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.532670531600526 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 23 19 42 10.8536160352834 10.0339693621572 0.819646673126176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.877667714203748 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 18 18 36 8.49413428848265 9.50586571151735 -1.01173142303471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.741928470590991 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 28 34 62 13.2130977820841 17.955524121755 -4.74242633967089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.252985280633188 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 19 20 39 8.96603063784279 10.5620730127971 -1.59604237495427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.633454311444662 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 27 28 55 12.741201432724 14.7869022179159 -2.04570078519192 A:G A G 10 0.528103650639853 0.591920874619508 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76803197 C/T 1 17 30 47 8.0222379391225 15.8431095191956 -7.82087158007309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0275920450329300 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 45 28 73 21.2353357212066 14.7869022179159 6.44843350329073 A:G G A 10 0.528103650639853 0.159083800336426 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 21 18 39 9.90982333656309 9.50586571151735 0.403957625045734 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:G A G 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 77078109 A/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 C C 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 15 5 20 7.07844524040221 2.64051825319926 4.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.070570681987361 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 16 3 19 7.55034158976235 1.58431095191956 5.96603063784279 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00557334447927397 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78092473 G/C 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 C:G G C 10 0.528103650639853 0.130559033023297 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78092452_78092604:GAA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78175483 T/C 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.351492044982908 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 T:C C T 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 78346848 C/T 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78346775_78346965:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78346775_78346965:RNF213 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79170576 C/T 1 9 1 10 4.24706714424132 0.528103650639853 3.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0234403290361439 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79477716 T/C 1 4209 3807 8016 1986.21173445686 2010.49059798592 -24.2788635290615 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.591295038605579 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79477818 A/G 1 4986 2824 7810 2352.87519790969 1491.36470940694 861.510488502748 A:T:C:G A G 10 0.528103650639853 2.73291307801629e-86 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79477830 C/T 1 4836 2611 7447 2282.09074550567 1378.87863182066 903.212113685015 T:C:G C T 10 0.528103650639853 2.20242939489511e-99 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79477891 A/G 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3846 3842 7688 1814.91335963913 2028.97422575832 -214.06086611919 A:T:C:G G A 10 0.528103650639853 1.06727533081705e-06 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478287 G/A 1 3974 3856 7830 1875.31609235722 2036.36767686727 -161.051584510049 A:T:C:G G A 10 0.528103650639853 0.00027921720891075 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478617 G/A 1 3584 3377 6961 1691.27651610677 1783.40602821078 -92.1295121040166 A:T:C:G G A 10 0.528103650639853 0.027183544756125 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 22 6 28 10.3817196859232 3.16862190383912 7.21309778208412 A:C C A 10 0.528103650639853 0.00715821921068277 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 22 6 28 10.3817196859232 3.16862190383912 7.21309778208412 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00715821921068277 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 15 1 16 7.07844524040221 0.528103650639853 6.55034158976235 T:G G T 10 0.528103650639853 0.000674230900694594 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79479267 G/C 1 4106 3571 7677 1937.60641047276 1885.85813643491 51.7482740378487 A:T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.239037679070312 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79479258_79479386:ACTG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 A:G A G 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 16 7 23 7.55034158976235 3.69672555447897 3.85361603528338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.142969530065131 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 14 31 45 6.60654889104206 16.3712131698354 -9.76466427879338 A:C C A 10 0.528103650639853 0.00416448947517608 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 30 19 49 14.1568904808044 10.0339693621572 4.1229211186472 A:G G A 10 0.528103650639853 0.255100303051897 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 T:C C T 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 1 33 34 0.471896349360147 17.4274204711151 -16.955524121755 T:C C T 10 0.528103650639853 3.17982285577626e-10 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 71 64 135 33.5046408045704 33.7986336409506 -0.293992836380156 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 27 14 41 12.741201432724 7.39345110895794 5.34775032376603 C:G C G 10 0.528103650639853 0.117127626292588 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 30 27 57 14.1568904808044 14.258798567276 -0.101908086471621 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 542 622 1164 255.7678213532 328.480470697989 -72.7126493447889 A:G A G 10 0.528103650639853 2.03828997019768e-05 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 60 61 121 28.3137809616088 32.214322689031 -3.90054172742221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.524090946228575 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80044211 G/A 1 21 26 47 9.90982333656309 13.7306949166362 -3.82087158007309 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.306964024826106 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044130_80044434:FASN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 46 43 89 21.7072320705668 22.7084569775137 -1.00122490694691 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.832813709331089 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80051183 A/G 1 25 28 53 11.7974087340037 14.7869022179159 -2.98949348391221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.413540200884492 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80051095_80051295:FASN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 116 98 214 54.7399765257771 51.7541577627056 2.98581876307146 T:C T C 10 0.528103650639853 0.732191479858513 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80895207 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80895147_80895236:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80895147_80895236:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80895147_80895236:TBCD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 80992932 A/C 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 A:C A C 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80992911_80992975:B3GNTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 17 81006629 C/T 1 13 6 19 6.13465254168191 3.16862190383912 2.96603063784279 T:C C T 10 0.528103650639853 0.250158578602722 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 0 31 0 31 14.6287868301646 0 14.6287868301646 T T 10 0.528103650639853 2.61433681609943e-09 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 224131 G/A 1 15 11 26 7.07844524040221 5.80914015703838 1.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.69670328394468 ENSG00000079134:ENST00000261600:exon_224084_224179:THOC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:T A T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 A:G A G 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 24 16 40 11.3255123846435 8.44965841023765 2.87585397440588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.429339711058927 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 3457607 C/T 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 3534610 G/A 1 11 3 14 5.19085984296162 1.58431095191956 3.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0627944859050089 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3534192_3534613:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400147:exon_3534192_3534613:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400150:exon_3534192_3534613:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400149:exon_3534192_3534613:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400155:exon_3534192_3534613:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400145:exon_3534192_3534613:DLGAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 84 70 154 39.6392933462524 36.9672555447897 2.67203780146264 T:C T C 10 0.528103650639853 0.687161878147049 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 105 88 193 49.5491166828154 46.4731212563071 3.07599542650838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.666094469232116 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 75 90 165 35.392226202011 47.5293285575868 -12.1371023555757 A:G A G 10 0.528103650639853 0.061391950042525 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 10691357 G/A 0 20 0 20 9.43792698720294 0 9.43792698720294 G G 10 0.528103650639853 3.14684283276297e-06 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10691223_10691381:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10691223_10691381:FAM38B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 10696227 C/T 0 15 0 15 7.07844524040221 0 7.07844524040221 C C 10 0.528103650639853 8.21230959368607e-05 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10696072_10696286:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10696072_10696286:FAM38B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 C:G C G 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12325958 G/A 1 83 153 236 39.1673969968922 80.7998585478975 -41.6324615510053 A:G G A 10 0.528103650639853 6.65676533776054e-08 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12325066_12326568:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12325172_12326129:TUBB6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 123 126 249 58.0432509712981 66.5410599806215 -8.49780900932338 C:G C G 10 0.528103650639853 0.281453652292001 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 32 43 75 15.1006831795247 22.7084569775137 -7.60777379798897 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0833549034810896 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 52 51 103 24.5386101667276 26.9332861826325 -2.39467601590486 T:C C T 10 0.528103650639853 0.69325715870377 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12703146 G/A 1 65 66 131 30.6732627084096 34.8548409422303 -4.18157823382074 A:G G A 10 0.528103650639853 0.484604214404478 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12702425_12703163:PSMG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 52 59 111 24.5386101667276 31.1581153877513 -6.61950522102368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.217442365379568 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 13100451 A/G 1 6 12 18 2.83137809616088 6.33724380767824 -3.50586571151735 A:G A G 10 0.528103650639853 0.104929209344249 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13100304_13100511:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13100304_13100511:CEP192 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 24 29 53 11.3255123846435 15.3150058685557 -3.98949348391221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.275305239440729 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 21109175 G/A 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 9 1 10 4.24706714424132 0.528103650639853 3.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0234403290361439 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 23865998 G/T 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 28649042 T/C 1 15 2 17 7.07844524040221 1.05620730127971 6.0222379391225 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00295518390877955 ENSG00000134755:ENST00000251081:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000438199:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000280904:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000399347:exon_28648860_28649117:DSC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 28673565 T/C 0 0 18 18 0 9.50586571151735 -9.50586571151735 C T C 10 0.528103650639853 1.34660157145888e-06 ENSG00000134755:ENST00000251081:exon_28673522_28673606:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000438199:exon_28673522_28673606:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000280904:exon_28673522_28673606:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000399347:exon_28673522_28673606:DSC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 14 27 41 6.60654889104206 14.258798567276 -7.65224967623397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0186577651654029 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 29125854 A/G 1 29 44 73 13.6849941314443 23.2365606281535 -9.55156649670927 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0261427900331443 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 39 85 124 18.4039576250457 44.8888103043875 -26.4848526793418 T:C T C 10 0.528103650639853 2.09355829280965e-06 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 19 20 39 8.96603063784279 10.5620730127971 -1.59604237495427 T:G G T 10 0.528103650639853 0.633454311444662 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 31 28 59 14.6287868301646 14.7869022179159 -0.158115387751327 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 40 40 80 18.8758539744059 21.1241460255941 -2.24829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.654888620511177 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33709977 G/C 1 24 23 47 11.3255123846435 12.1463839647166 -0.82087158007309 C:G G C 10 0.528103650639853 0.884159584028512 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33709864_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33709884_33710034:ELP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 7 14 21 3.30327444552103 7.39345110895794 -4.09017666343691 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0828202401380353 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 22 21 43 10.3817196859232 11.0901766634369 -0.708456977513677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.879218371784125 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33726295 A/G 1 30 28 58 14.1568904808044 14.7869022179159 -0.630011737111474 A:G A G 10 0.528103650639853 0.895931340006018 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33726213_33726344:ELP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 42 45 87 19.8196466731262 23.7646642787934 -3.94501760566721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.452451505269941 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 34376897 G/A 1 27 11 38 12.741201432724 5.80914015703838 6.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0332857221166793 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34376035_34377013:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34376035_34377013:C18orf10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 C:G G C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 25 15 40 11.7974087340037 7.92155475959779 3.87585397440588 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.267888536179292 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 38 26 64 17.9320612756856 13.7306949166362 4.20136635904941 T:C C T 10 0.528103650639853 0.318071291339751 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 30 35 65 14.1568904808044 18.4836277723949 -4.32673729159044 A:G A G 10 0.528103650639853 0.320661104215808 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 48458717 T/A 1 27 23 50 12.741201432724 12.1463839647166 0.594817468007351 A:T T A 10 0.528103650639853 0.888373473926872 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 27 21 48 12.741201432724 11.0901766634369 1.65102476928706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.666789151538884 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 52899802 C/T 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52899740_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52899740_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52899752_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52899740_52899902:TCF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 52899822 G/A 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52899740_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52899740_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52899752_52899902:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52899740_52899902:TCF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 54694452 C/T 1 6 12 18 2.83137809616088 6.33724380767824 -3.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.104929209344249 ENSG00000091157:ENST00000254442:exon_54694235_54698828:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000444065:exon_54694235_54697036:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000357574:exon_54694235_54697036:WDR7;ENSG00000091157:ENST00000398311:exon_54694235_54697042:WDR7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56202231 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 9 16 25 4.24706714424132 8.44965841023765 -4.20259126599632 A:T A T 10 0.528103650639853 0.109639086474819 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 32 16 48 15.1006831795247 8.44965841023765 6.65102476928706 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0603321335533087 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 A:G A G 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56203837 G/A 1 26 17 43 12.2693050833638 8.9777620608775 3.29154302248632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.360770585297087 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 17 20 37 8.0222379391225 10.5620730127971 -2.53983507367456 T:G G T 10 0.528103650639853 0.415509256308292 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 T:G T G 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 11 20 31 5.19085984296162 10.5620730127971 -5.37121316983544 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0706075298577317 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 11 21 32 5.19085984296162 11.0901766634369 -5.89931682047529 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0498937252623783 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56204768 G/A 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56247180 T/C 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 56587802 A/C 1 2 9 11 0.943792698720294 4.75293285575868 -3.80914015703838 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0308891347915433 ENSG00000074657:ENST00000336078:exon_56585503_56587865:ZNF532 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 59777153 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59777067_59777206:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59777067_59777206:PIGN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 59780393 T/A 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:T T A 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59780367_59780549:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59780367_59780549:PIGN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 60985600 G/A 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 18 17 35 8.49413428848265 8.9777620608775 -0.483627772394854 T:C C T 10 0.528103650639853 0.867648600286817 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 30 36 66 14.1568904808044 19.0117314230347 -4.8548409422303 A:G A G 10 0.528103650639853 0.267282212369785 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 63 67 130 29.7294700096893 35.3829445928702 -5.65347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.334713742669445 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 72 68 140 33.9765371539306 35.91104824351 -1.93451108957942 T:C T C 10 0.528103650639853 0.79964890264441 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 60 36 96 28.3137809616088 19.0117314230347 9.30204953857411 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0654121129158255 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 21 10 31 9.90982333656309 5.28103650639853 4.62878683016456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.107123560532778 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72997677 C/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72998004 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 8 14 22 3.77517079488118 7.39345110895794 -3.61828031407677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.138184227038771 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 15 4 19 7.07844524040221 2.11241460255941 4.96603063784279 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0357287030419509 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 74091718 G/A 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 76870397 G/A 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_76870355_76870505:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_76870355_76870505:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_76870355_76870505:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_76870355_76870505:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_76870355_76870505:ATP9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 5 17 22 2.35948174680074 8.9777620608775 -6.61828031407676 T:G T G 10 0.528103650639853 0.00505338917430908 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 12 20 32 5.66275619232176 10.5620730127971 -4.8993168204753 T:C C T 10 0.528103650639853 0.109805506996986 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 32 47 79 15.1006831795247 24.8208715800731 -9.72018840054838 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0319909899076896 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77891039 T/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T T A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77890986_77891075:ADNP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77893683 A/G 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 18 77895192 G/A 1 28 16 44 13.2130977820841 8.44965841023765 4.76343937184647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.174681607618319 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 281360 C/T 1 1 8 9 0.471896349360147 4.22482920511882 -3.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0160432936254252 ENSG00000141934:ENST00000269812:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000327790:exon_281048_281537:PPAP2C;ENSG00000141934:ENST00000434325:exon_281048_281537:PPAP2C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 18 2 20 8.49413428848265 1.05620730127971 7.43792698720294 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.000564002575583005 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 T:G T G 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 38 46 84 17.9320612756856 24.2927679294332 -6.36070665374765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.189581263956649 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 808577 C/T 0 226 0 226 106.648574955393 0 106.648574955393 C C 10 0.528103650639853 2.32426355231627e-63 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 900951 A/G 1 39 28 67 18.4039576250457 14.7869022179159 3.61705540712985 A:G A G 10 0.528103650639853 0.394164394893598 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_900829_900952:C19orf22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 30 27 57 14.1568904808044 14.258798567276 -0.101908086471621 A:T:C:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 29 23 52 13.6849941314443 12.1463839647166 1.53861016672765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.680076227683372 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 29 30 59 13.6849941314443 15.8431095191956 -2.15811538775133 A:G G A 10 0.528103650639853 0.603562008103405 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 45 70 115 21.2353357212066 36.9672555447897 -15.7319198235831 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00366090661720576 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 45 23 68 21.2353357212066 12.1463839647166 9.08895175649 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0287820369649328 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 45 25 70 21.2353357212066 13.2025912659963 8.03274445521029 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0561557072442273 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 42 47 89 19.8196466731262 24.8208715800731 -5.00122490694691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.290832738220748 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 60 63 123 28.3137809616088 33.2705299903107 -4.95674902870191 A:G A G 10 0.528103650639853 0.416449646381653 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 32 39 71 15.1006831795247 20.5960423749543 -5.49535919542956 T:C C T 10 0.528103650639853 0.193702580127629 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 C:G C G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1611721 G/A 1 197 198 395 92.963580823949 104.564522826691 -11.6009420027419 A:T:C:G G A 10 0.528103650639853 0.246737646739114 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1611703_1611848:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1609293_1611848:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1609293_1611848:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1609293_1611848:TCF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 70 63 133 33.0327444552103 33.2705299903107 -0.237785535100443 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1819112 A/G 1 15 9 24 7.07844524040221 4.75293285575868 2.32551238464353 A:G A G 10 0.528103650639853 0.415581587245928 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 78 64 142 36.8079152500915 33.7986336409506 3.00928160914088 A:G G A 10 0.528103650639853 0.674448274760044 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 50 44 94 23.5948174680073 23.2365606281535 0.358256839853819 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 34 19 53 16.044475878245 10.0339693621572 6.01050651608779 T:G T G 10 0.528103650639853 0.100943612114930 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 14 27 41 6.60654889104206 14.258798567276 -7.65224967623397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0186577651654029 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2252990 C/G 0 24 0 24 11.3255123846435 0 11.3255123846435 C C 10 0.528103650639853 2.3631230800244e-07 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252911_2253002:JSRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2271386 C/T 1 858 717 1575 404.887067751006 378.650317508775 26.2367502422316 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.189426988080432 ENSG00000104904:ENST00000322297:exon_2271384_2271438:OAZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2273150 T/C 1 1452 1403 2855 685.193499270933 740.929421847714 -55.7359225767802 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.037454040478671 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 142 132 274 67.0092816091409 69.7096818844606 -2.70040027531972 A:G G A 10 0.528103650639853 0.762428986377211 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2444407 G/A 1 49 40 89 23.1229211186472 21.1241460255941 1.99877509305308 A:G G A 10 0.528103650639853 0.750311936969306 ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2444402_2444538:LMNB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2717256 C/G 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 C:G C G 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000176490:ENST00000323469:exon_2714566_2717873:DIRAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 16 29 45 7.55034158976235 15.3150058685557 -7.76466427879338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0244350330703476 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 26 16 42 12.2693050833638 8.44965841023765 3.81964667312617 T:C T C 10 0.528103650639853 0.280074771573914 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 T:C T C 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 38 26 64 17.9320612756856 13.7306949166362 4.20136635904941 A:G G A 10 0.528103650639853 0.318071291339751 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 25 15 40 11.7974087340037 7.92155475959779 3.87585397440588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.267888536179292 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 27 21 48 12.741201432724 11.0901766634369 1.65102476928706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.666789151538884 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3614538 C/T 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3614395_3614587:C19orf29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3752563 G/A 1 17 12 29 8.0222379391225 6.33724380767824 1.68499413144426 A:G G A 10 0.528103650639853 0.58065189071065 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 3977135 C/A 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 A:C C A 10 0.528103650639853 0.368438867131135 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 A:G G A 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 20 17 37 9.43792698720294 8.9777620608775 0.46016492632544 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 6468404 T/G 1 59 50 109 27.8418846122487 26.4051825319927 1.43670208025602 T:G T G 10 0.528103650639853 0.847978746180478 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 18 24 42 8.49413428848265 12.6744876153565 -4.18035332687383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.217890022301436 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 19 12 31 8.96603063784279 6.33724380767824 2.62878683016456 T:C T C 10 0.528103650639853 0.373409226723547 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G G A 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7142843 C/G 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7142921 C/T 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7184518 G/A 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7509332 G/A 1 17 11 28 8.0222379391225 5.80914015703838 2.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.452676280864763 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7509090_7509340:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7509090_7509340:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7509090_7509340:ARHGEF18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7684691 G/A 1 36 20 56 16.9882685769653 10.5620730127971 6.42619556416823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.107488100461090 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7684633_7684742:XAB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 50 26 76 23.5948174680073 13.7306949166362 9.86412255137117 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0284292473631297 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 33 31 64 15.5725795288849 16.3712131698354 -0.798633640950591 A:G A G 10 0.528103650639853 0.900587152139416 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 1299 1882 3181 612.993357818831 993.891070504203 -380.897712685372 A:C:G G A 10 0.528103650639853 1.11092347688784e-41 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 8 35 43 3.77517079488118 18.4836277723949 -14.7084569775137 A:G A G 10 0.528103650639853 4.93169233735289e-06 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 687 1047 1734 324.192792010421 552.924522219926 -228.731730209505 A:T:G A G 10 0.528103650639853 3.56544266767434e-28 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7913974 T/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7913807_7914031:EVI5L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 10 27 37 4.71896349360147 14.258798567276 -9.53983507367456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00251957844423991 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 17 29 46 8.0222379391225 15.3150058685557 -7.29276792943324 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0379254565236344 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 13 22 35 6.13465254168191 11.6182803140768 -5.48362777239485 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0890065243419107 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8122767 T/C 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8122688_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000458625:exon_8122685_8122804:CCL25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 54 41 95 25.4824028654479 21.652249676234 3.83015318921397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.472478706014313 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 66 79 145 31.1451590577697 41.7201884005484 -10.5750293427787 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0810866915729698 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 67 55 122 31.6170554071299 29.0457007851919 2.57135462193794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.651544495629853 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 31 32 63 14.6287868301646 16.8993168204753 -2.27052999031074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.614551101978802 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 15 7 22 7.07844524040221 3.69672555447897 3.38171968592323 A:G A G 10 0.528103650639853 0.199779915400287 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 36 52 88 16.9882685769653 27.4613898332724 -10.4731212563071 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0321405330938200 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10257086 G/A 1 25 28 53 11.7974087340037 14.7869022179159 -2.98949348391221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.413540200884492 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10257027_10257200:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10257027_10257200:DNMT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10334610 G/C 1 1 8 9 0.471896349360147 4.22482920511882 -3.75293285575868 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0160432936254252 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:G T G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10367488 G/A 1 82 93 175 38.6955006475321 49.1136395095063 -10.4181388619743 A:G G A 10 0.528103650639853 0.129747572972247 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10367384_10367501:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10367384_10367501:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10367384_10367501:MRPL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10369434 C/T 1 20 16 36 9.43792698720294 8.44965841023765 0.988268576965293 T:C C T 10 0.528103650639853 0.867739933831479 ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10370369 G/A 1 206 195 401 97.2106479681903 102.980211874771 -5.76956390658104 A:G G A 10 0.528103650639853 0.582326716091041 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10385540 A/T 1 108 92 200 50.9648057308959 48.5855358588665 2.3792698720294 A:T A T 10 0.528103650639853 0.7770844752383 ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10395248 C/T 1 197 164 361 92.963580823949 86.6089987049359 6.35458211901307 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.527131068238825 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395079_10395333:ICAM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 165 167 332 77.8628976444243 88.1933096568554 -10.3304120124312 A:G A G 10 0.528103650639853 0.271643159556743 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10428432 C/T 1 30 29 59 14.1568904808044 15.3150058685557 -1.15811538775133 T:C C T 10 0.528103650639853 0.795188284817778 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10428366_10428449:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10428150_10428449:RAVER1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10439501 C/T 1 34 26 60 16.044475878245 13.7306949166362 2.31378096160882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.605916227509945 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10439540 A/G 1 38 26 64 17.9320612756856 13.7306949166362 4.20136635904941 A:G A G 10 0.528103650639853 0.318071291339751 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10439711 A/G 1 25 25 50 11.7974087340037 13.2025912659963 -1.40518253199265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.7773314321124 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10445806 C/T 1 199 143 342 93.9073735226693 75.518822041499 18.3885514811703 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0510617855541943 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10445742_10446029:ICAM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10446568 T/C 1 136 83 219 64.17790351298 43.8326030031078 20.3453005098722 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00665704956089065 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 297 170 467 140.153215759964 89.777620608775 50.3755951511887 T:C T C 10 0.528103650639853 2.66756440785683e-06 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10449514 T/C 1 147 78 225 69.3687633559416 41.1920847499085 28.1766786060331 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000172611335426958 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 22 18 40 10.3817196859232 9.50586571151735 0.875853974405882 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.874571903122238 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 36 35 71 16.9882685769653 18.4836277723949 -1.49535919542956 A:C C A 10 0.528103650639853 0.723367916243353 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 28 35 63 13.2130977820841 18.4836277723949 -5.27052999031074 A:C C A 10 0.528103650639853 0.207312160682015 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 20 22 42 9.43792698720294 11.6182803140768 -2.18035332687382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.5386334947568 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10659659 C/T 1 16 6 22 7.55034158976235 3.16862190383912 4.38171968592323 T:C C T 10 0.528103650639853 0.085649833785824 ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10668717 C/T 1 24 26 50 11.3255123846435 13.7306949166362 -2.40518253199265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.57151829688635 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 23 25 48 10.8536160352834 13.2025912659963 -2.34897523071294 C:G C G 10 0.528103650639853 0.563803045831336 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 T:C C T 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 60 44 104 28.3137809616088 23.2365606281535 5.07722033345529 T:C T C 10 0.528103650639853 0.327864966547522 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 10943762 G/A 1 26 24 50 12.2693050833638 12.6744876153565 -0.405182531992651 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000099203:ENST00000214869:exon_10943115_10943889:TMED1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 26 22 48 12.2693050833638 11.6182803140768 0.651024769287057 T:C C T 10 0.528103650639853 0.885917211675883 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 11277232 G/A 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11276266_11277287:KANK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:T T A 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 11891248 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197044:ENST00000454339:exon_11890834_11894886:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000409902:exon_11890834_11893301:ZNF441;ENSG00000197044:ENST00000357901:exon_11890834_11894893:ZNF441 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 12692289 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000188033:ENST00000311437:exon_12688775_12692538:ZNF490;ENSG00000188033:ENST00000414906:exon_12692121_12692538:ZNF490 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 12921149 G/A 1 44 41 85 20.7634393718465 21.652249676234 -0.888810304387501 A:G G A 10 0.528103650639853 0.913588149080668 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 60 68 128 28.3137809616088 35.91104824351 -7.59726728190118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.185034281301669 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 33 44 77 15.5725795288849 23.2365606281535 -7.66398109926868 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0871369070882037 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 139 103 242 65.5935925610604 54.3946760159049 11.1989165451556 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.156828735558461 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 614 521 1135 289.74435850713 275.142001983363 14.6023565237668 A:G A G 10 0.528103650639853 0.388755738805136 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 14199911 G/A 1 38 40 78 17.9320612756856 21.1241460255941 -3.19208474990853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.497361215326385 ENSG00000141858:ENST00000533683:exon_14199880_14200174:SAMD1;ENSG00000141858:ENST00000269724:exon_14199880_14200174:SAMD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 129 95 224 60.874629067459 50.169846810786 10.7047822566729 T:C C T 10 0.528103650639853 0.160113624103615 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 89 68 157 41.9987750930531 35.91104824351 6.08772684954308 C:G C G 10 0.528103650639853 0.338615537094751 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 87 65 152 41.0549823943328 34.3267372915904 6.72824510274234 A:G A G 10 0.528103650639853 0.291419427941529 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 21 18 39 9.90982333656309 9.50586571151735 0.403957625045734 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 42 35 77 19.8196466731262 18.4836277723949 1.33601890073132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.819778648732988 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 10 3 13 4.71896349360147 1.58431095191956 3.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.098906296354315 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17173563 G/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 C:G G C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 41 49 90 19.347750323766 25.8770788813528 -6.52932855758677 T:G T G 10 0.528103650639853 0.171575005941495 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 54 58 112 25.4824028654479 30.6300117371115 -5.14760887166354 T:C T C 10 0.528103650639853 0.344930608053862 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 89 75 164 41.9987750930531 39.607773797989 2.39100129506411 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75456289605818 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 78 57 135 36.8079152500915 30.1019080864716 6.70600716361985 T:C C T 10 0.528103650639853 0.263049678168866 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 31 31 62 14.6287868301646 16.3712131698354 -1.74242633967089 A:G A G 10 0.528103650639853 0.703565885750732 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17330060 T/C 1 9 18 27 4.24706714424132 9.50586571151735 -5.25879856727603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.052962765950968 ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 15 24 39 7.07844524040221 12.6744876153565 -5.59604237495427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.078870130036717 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17412218 C/T 1 6 13 19 2.83137809616088 6.86534745831809 -4.03396936215721 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0695977405691466 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 13 10 23 6.13465254168191 5.28103650639853 0.853616035283381 T:C T C 10 0.528103650639853 0.835583811578279 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 66 61 127 31.1451590577697 32.214322689031 -1.06916363126133 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859361635889948 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 9 15 24 4.24706714424132 7.92155475959779 -3.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.154361116643106 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17972889 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 17973573 G/A 1 19 5 24 8.96603063784279 2.64051825319926 6.32551238464353 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0125725185126960 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 C:G C G 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18248146 T/C 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 T:C T C 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18248049_18248171:MAST3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18273047 T/C 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18273012_18273120:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000444315:exon_18273012_18273120:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18273012_18273120:PIK3R2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 18 15 33 8.49413428848265 7.92155475959779 0.572579528884852 C:G G C 10 0.528103650639853 0.8636141408051 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 16 14 30 7.55034158976235 7.39345110895794 0.15689048080441 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18502835 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000175489:ENST00000339007:exon_18501955_18502935:LRRC25;ENSG00000175489:ENST00000392406:exon_18501959_18502935:LRRC25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 107 85 192 50.4929093815357 44.8888103043875 5.60409907714823 C:G C G 10 0.528103650639853 0.427462800614709 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 64 1 65 30.2013663590494 0.528103650639853 29.6732627084096 A:T:C C A 10 0.528103650639853 9.63224056487632e-17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 2402 2252 4654 1133.49503116307 1189.28942124095 -55.7943900778757 A:T:G G T 10 0.528103650639853 0.103169215008575 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 72 64 136 33.9765371539306 33.7986336409506 0.177903512979995 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 22 25 47 10.3817196859232 13.2025912659963 -2.82087158007309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.465936799923338 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 19823270 T/A 1 8 1 9 3.77517079488118 0.528103650639853 3.24706714424132 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0417379304922468 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 C:G C G 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 20044041 G/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:G G T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 20044475 C/A 1 12 24 36 5.66275619232176 12.6744876153565 -7.01173142303471 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0285494031466319 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 20116963 C/T 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 C C 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000397162:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20115227_20118084:ZNF682 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 20133846 C/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20133813_20133908:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000397162:exon_20133813_20133908:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20133813_20133908:ZNF682 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 21477431 T/C 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 23545004 G/A 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 23837195 T/C 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C T C 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:T A T 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33200162 C/T 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33200091_33200298:NUDT19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 12 16 28 5.66275619232176 8.44965841023765 -2.78690221791588 T:C T C 10 0.528103650639853 0.345411965030106 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 36 42 78 16.9882685769653 22.1803533268738 -5.19208474990853 A:G A G 10 0.528103650639853 0.257658932839281 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 73 104 177 34.4484335032907 54.9227796665447 -20.474346163254 T:G T G 10 0.528103650639853 0.00250447476635985 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 171 150 321 80.6942757405851 79.215547595978 1.47872814460719 A:G A G 10 0.528103650639853 0.911001218310582 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 24 8 32 11.3255123846435 4.22482920511882 7.1006831795247 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0127077595777180 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 20 21 41 9.43792698720294 11.0901766634369 -1.65224967623397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.6410938660349 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 35758131 G/A 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35758012_35758637:LSR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36168914 T/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000105668:ENST00000222275:exon_36168877_36169367:UPK1A;ENSG00000105668:ENST00000379013:exon_36168877_36169367:UPK1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36212009 C/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36210686_36212706:AD000671.3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36593915 T/G 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:G T G 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36593850_36593976:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36593850_36593976:WDR62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 139 106 245 65.5935925610604 55.9789869678244 9.61460559323601 A:G G A 10 0.528103650639853 0.224594785789470 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 18 30 48 8.49413428848265 15.8431095191956 -7.34897523071294 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0420647327317077 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 37879589 A/G 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000189164:ENST00000317566:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000356178:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000436120:exon_37879208_37883968:ZNF527 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 37880188 C/A 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000189164:ENST00000317566:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000356178:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000436120:exon_37879208_37883968:ZNF527 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 37975256 A/G 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171827:ENST00000330173:exon_37974781_37976242:ZNF570 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 38631856 C/T 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38631824_38632075:SIPA1L3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 4 11 15 1.88758539744059 5.80914015703838 -3.92155475959779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0668301083998627 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 37 66 103 17.4601649263254 34.8548409422303 -17.3946760159049 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000719171776047639 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 28 41 69 13.2130977820841 21.652249676234 -8.43915189414986 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0529357294169932 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 39876735 G/A 1 51 54 105 24.0667138173675 28.5175971345521 -4.45088331718457 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434388094328694 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39876275_39877043:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39876555_39876859:PAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 39966747 G/A 1 209 175 384 98.6263370162707 92.4181388619743 6.20819815429645 A:G G A 10 0.528103650639853 0.539916017626914 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39966721_39966816:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39966721_39966816:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39966721_39966816:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39966721_39966816:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39966721_39966816:SUPT5H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368322400865039 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 19 37 56 8.96603063784279 19.5398350736746 -10.5738044358318 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00483910373657299 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 27 17 44 12.741201432724 8.9777620608775 3.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.291855884907487 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 30 17 47 14.1568904808044 8.9777620608775 5.17912841992691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.145080883911860 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 23 45 68 10.8536160352834 23.7646642787934 -12.91104824351 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00216475795382105 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 23 11 34 10.8536160352834 5.80914015703838 5.044475878245 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0882357256249168 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 36 33 69 16.9882685769653 17.4274204711151 -0.439151894149855 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 22 27 49 10.3817196859232 14.258798567276 -3.8770788813528 T:C C T 10 0.528103650639853 0.316764899358927 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 18 11 29 8.49413428848265 5.80914015703838 2.68499413144426 T:C T C 10 0.528103650639853 0.35634147043118 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42736787 G/A 1 52 57 109 24.5386101667276 30.1019080864716 -5.56329791974398 A:G G A 10 0.528103650639853 0.292810366200126 ENSG00000105723:ENST00000222330:exon_42736648_42736834:GSK3A;ENSG00000105723:ENST00000398249:exon_42736648_42736834:GSK3A;ENSG00000105723:ENST00000453535:exon_42736648_42736834:GSK3A;ENSG00000105723:ENST00000493059:exon_42736648_42736989:GSK3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 46 40 86 21.7072320705668 21.1241460255941 0.583086044972646 A:G G A 10 0.528103650639853 0.91446683948379 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 30 33 63 14.1568904808044 17.4274204711151 -3.27052999031074 C:G G C 10 0.528103650639853 0.449847312624113 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 15 9 24 7.07844524040221 4.75293285575868 2.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.415581587245928 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 33 52 85 15.5725795288849 27.4613898332724 -11.8888103043875 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0120506330993437 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 55 41 96 25.9542992148081 21.652249676234 4.30204953857411 A:G G A 10 0.528103650639853 0.414082542318728 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44351836 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44351613_44351840:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44377669 G/A 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000176222:ENST00000324394:exon_44376519_44378229:ZNF404 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 18 24 42 8.49413428848265 12.6744876153565 -4.18035332687383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.217890022301436 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 18 12 30 8.49413428848265 6.33724380767824 2.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.469068351032088 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 19 21 40 8.96603063784279 11.0901766634369 -2.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.529489428576162 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 18 21 39 8.49413428848265 11.0901766634369 -2.59604237495427 C:G G C 10 0.528103650639853 0.426412497795246 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 T:C T C 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 22 13 35 10.3817196859232 6.86534745831809 3.51637222760515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.242214515552746 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 19 6 25 8.96603063784279 3.16862190383912 5.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0259244127541826 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44535999 G/T 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:G G T 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44570393 C/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:C C A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44570551 G/A 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 T:C T C 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44590558 C/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000186026:ENST00000328297:exon_44589867_44593765:ZNF284 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44605355 C/T 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44605286_44605378:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 22 16 38 10.3817196859232 8.44965841023765 1.93206127568559 A:T A T 10 0.528103650639853 0.626706429561788 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44610843 C/T 1 21 26 47 9.90982333656309 13.7306949166362 -3.82087158007309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.306964024826106 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 27 27 54 12.741201432724 14.258798567276 -1.51759713455206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.685288058641802 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 16 14 30 7.55034158976235 7.39345110895794 0.15689048080441 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 32 24 56 15.1006831795247 12.6744876153565 2.42619556416823 A:G A G 10 0.528103650639853 0.592925006147413 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 A:T A T 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 A:G A G 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 29 17 46 13.6849941314443 8.9777620608775 4.70723207056676 T:C T C 10 0.528103650639853 0.184994000043587 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 25 12 37 11.7974087340037 6.33724380767824 5.46016492632544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0983513566870617 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44792701 T/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:G T G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44792969 G/A 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 A:G G A 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 14 16 30 6.60654889104206 8.44965841023765 -1.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.584479133652254 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 60 53 113 28.3137809616088 27.9894934839122 0.324287477696611 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 54 45 99 25.4824028654479 23.7646642787934 1.71773858665455 T:C C T 10 0.528103650639853 0.763280950079396 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 22 15 37 10.3817196859232 7.92155475959779 2.46016492632544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.51078704440021 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 28 39 67 13.2130977820841 20.5960423749543 -7.38294459287015 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0860575869045575 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 27 41 68 12.741201432724 21.652249676234 -8.91104824351 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0382047310547494 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 A:C C A 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 46181392 G/C 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 C:G G C 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 46318799 C/G 1 42 32 74 19.8196466731262 16.8993168204753 2.92032985265088 C:G C G 10 0.528103650639853 0.560870716312355 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46318693_46318955:SYMPK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:G T G 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 47127324 C/G 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47126715_47127494:PTGIR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 18 15 33 8.49413428848265 7.92155475959779 0.572579528884852 T:C C T 10 0.528103650639853 0.8636141408051 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 47225265 G/A 1 37 40 77 17.4601649263254 21.1241460255941 -3.66398109926868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.425662455059609 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47225243_47225329:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47225243_47225329:STRN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 64 42 106 30.2013663590494 22.1803533268738 8.02101303217558 C:G G C 10 0.528103650639853 0.120815099455490 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48259220 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48284163 C/T 1 37 33 70 17.4601649263254 17.4274204711151 0.0327444552102918 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000178980:ENST00000509570:exon_48284121_48284174:SEPW1;ENSG00000178980:ENST00000396715:exon_48284121_48284174:SEPW1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 18 10 28 8.49413428848265 5.28103650639853 3.21309778208412 A:T A T 10 0.528103650639853 0.258843407287316 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 21 17 38 9.90982333656309 8.9777620608775 0.932061275685587 C:G C G 10 0.528103650639853 0.871270719218986 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 8 13 21 3.77517079488118 6.86534745831809 -3.09017666343691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.195195777078582 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48737706 A/T 1 1 8 9 0.471896349360147 4.22482920511882 -3.75293285575868 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0160432936254252 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48735710_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519302:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522068:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523750:exon_48737660_48737721:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518596:exon_48737078_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521092:exon_48737535_48737800:CARD8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49299896 A/G 1 71 48 119 33.5046408045704 25.3489752307129 8.15566557385749 A:G A G 10 0.528103650639853 0.142330791999695 ENSG00000105552:ENST00000316273:exon_49299835_49299975:BCAT2;ENSG00000105552:ENST00000402551:exon_49299835_49299975:BCAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 55 34 89 25.9542992148081 17.955524121755 7.99877509305308 A:G A G 10 0.528103650639853 0.110748957778967 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 72 42 114 33.9765371539306 22.1803533268738 11.7961838270568 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0306130040696441 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 72 40 112 33.9765371539306 21.1241460255941 12.8523911283365 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0176137203167645 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 19 6 25 8.96603063784279 3.16862190383912 5.79740873400368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0259244127541826 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 96 85 181 45.3020495385741 44.8888103043875 0.413239234186605 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 16 6 22 7.55034158976235 3.16862190383912 4.38171968592323 A:C C A 10 0.528103650639853 0.085649833785824 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 833 813 1646 393.089659017002 429.3482679702 -36.258608953198 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.0754780977253 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 56 60 116 26.4261955641682 31.6862190383912 -5.26002347422295 T:C C T 10 0.528103650639853 0.352845891226911 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 48 56 104 22.6510247692871 29.5738044358318 -6.92277966654471 A:T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.20148777249862 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 90 83 173 42.4706714424132 43.8326030031078 -1.36193156069456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.87902500981404 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 86 70 156 40.5830860449726 36.9672555447897 3.61583050018294 T:G T G 10 0.528103650639853 0.575528835630243 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50097784 T/C 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097711_50097872:PRR12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 34 34 68 16.044475878245 17.955524121755 -1.91104824351 T:C T C 10 0.528103650639853 0.715896982827148 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 119 123 242 56.1556655738575 64.9567490287019 -8.80108345484442 C:G C G 10 0.528103650639853 0.273819078888261 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 111 117 228 52.3804947789763 61.7881271248628 -9.40763234588648 T:C C T 10 0.528103650639853 0.23244118197615 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 543 433 976 256.23971770256 228.668880727056 27.5708369755035 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0779088389282239 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 35 25 60 16.5163722276051 13.2025912659963 3.31378096160882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.438777693671163 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50881840 G/A 1 52 55 107 24.5386101667276 29.0457007851919 -4.50709061846427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.385578879987718 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881779_50882053:NR1H2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50905985 C/T 1 12 14 26 5.66275619232176 7.39345110895794 -1.73069491663618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.558326244007148 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905869_50905998:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905869_50905998:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905869_50905998:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905869_50905998:POLD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 33 27 60 15.5725795288849 14.258798567276 1.31378096160882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.796501367940377 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 209 198 407 98.6263370162707 104.564522826691 -5.93818581042017 T:C C T 10 0.528103650639853 0.585043845357159 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 220 194 414 103.817196859232 102.452108224131 1.36508863510086 A:G G A 10 0.528103650639853 0.921600234573812 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51301538 T/C 1 205 203 408 96.7387516188301 107.20504107989 -10.46628946106 T:C T C 10 0.528103650639853 0.321337420879133 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 427 429 856 201.499741176783 226.556466124497 -25.0567249477141 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.0870424633844749 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 236 259 495 111.367538448995 136.778845515722 -25.4113070667272 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.0243008493417951 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 267 319 586 125.996325279159 168.465064554113 -42.4687392749538 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000499780267655547 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 51379893 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000423722:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51379728_51380014:KLK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52115645 G/C 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 C:G G C 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52114781_52115675:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52115184_52115675:SIGLEC14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52130488 G/A 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130402_52130501:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130402_52130501:SIGLEC14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52132325 A/T 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:T A T 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52132291_52132329:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52132291_52132329:SIGLEC14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52468203 T/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:T T A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 T:G G T 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 14 8 22 6.60654889104206 4.22482920511882 2.38171968592323 A:G A G 10 0.528103650639853 0.394433566707544 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52496149 C/T 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496133_52496567:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52497250 G/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496736_52498090:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 17 25 42 8.0222379391225 13.2025912659963 -5.18035332687383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.122960344974947 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52520607 C/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52520370_52520612:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52521296 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52521261_52521356:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52521261_52521356:ZNF614 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:G T G 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52825032 C/T 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000198464:ENST00000468240:exon_52824832_52826949:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000490272:exon_52824832_52826933:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000429434:exon_52824832_52829163:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000335090:exon_52824832_52827333:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000391790:exon_52824832_52829163:ZNF480 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 52869312 T/C 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000167554:ENST00000403906:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000321287:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000327920:exon_52868951_52870111:ZNF610 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53086188 T/A 1 16 15 31 7.55034158976235 7.92155475959779 -0.371213169835443 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53209553 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53209554 G/T 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53269486 C/T 1 26 30 56 12.2693050833638 15.8431095191956 -3.57380443583177 T:C C T 10 0.528103650639853 0.35173576651085 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 28 32 60 13.2130977820841 16.8993168204753 -3.68621903839118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.366893583596865 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53454543 G/A 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53454789 A/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:T A T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 28 20 48 13.2130977820841 10.5620730127971 2.65102476928706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.472712139498177 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 9 19 28 4.24706714424132 10.0339693621572 -5.78690221791588 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0360967037502458 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53911510 G/A 0 9 0 9 4.24706714424132 0 4.24706714424132 G G 10 0.528103650639853 0.00435544387654226 ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53958126 T/G 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53958263 G/A 1 4 12 16 1.88758539744059 6.33724380767824 -4.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0417233745614009 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 20 15 35 9.43792698720294 7.92155475959779 1.51637222760515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.735470146821121 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 22 10 32 10.3817196859232 5.28103650639853 5.10068317952471 C:G G C 10 0.528103650639853 0.077943542144369 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 53995004 G/A 1 11 2 13 5.19085984296162 1.05620730127971 4.13465254168191 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0251289067861436 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 0 22 22 0 11.6182803140768 -11.6182803140768 G A G 10 0.528103650639853 6.67767975268258e-08 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54687506 C/G 1 3 10 13 1.41568904808044 5.28103650639853 -3.86534745831809 C:G C G 10 0.528103650639853 0.048195832563503 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54687471_54687509:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000391754:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000495279:exon_54687404_54687517:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000414665:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000453320:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000464098:exon_54687404_54687563:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000474910:exon_54687404_54687563:MBOAT7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54695163 T/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54694194_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695104_54695458:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695125_54695458:TSEN34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 53 46 99 25.0105065160878 24.2927679294332 0.717738586654555 T:C C T 10 0.528103650639853 0.920039488844016 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 14 34 48 6.60654889104206 17.955524121755 -11.3489752307129 T:G T G 10 0.528103650639853 0.00124689929164022 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 27 23 50 12.741201432724 12.1463839647166 0.594817468007351 A:G G A 10 0.528103650639853 0.888373473926872 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 35 32 67 16.5163722276051 16.8993168204753 -0.38294459287015 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 18 22 40 8.49413428848265 11.6182803140768 -3.12414602559412 C:G C G 10 0.528103650639853 0.345175829251647 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54973198 G/A 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54971946_54973217:LENG8;ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 29 19 48 13.6849941314443 10.0339693621572 3.65102476928706 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.314268542891197 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55014124 G/A 0 0 12 12 0 6.33724380767824 -6.33724380767824 A G A 10 0.528103650639853 0.000121943712103065 ENSG00000167618:ENST00000301202:exon_55014013_55014168:LAIR2;ENSG00000167618:ENST00000351841:exon_55014123_55014168:LAIR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55106317 A/G 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000104974:ENST00000473156:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000495417:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000251372:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000477255:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000453777:exon_55106130_55106417:LILRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55106338 A/C 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000104974:ENST00000473156:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000495417:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000251372:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000477255:exon_55106130_55106417:LILRA1;ENSG00000104974:ENST00000453777:exon_55106130_55106417:LILRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:G G T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 T:C T C 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 73 76 149 34.4484335032907 40.1358774486288 -5.6874439453381 A:G A G 10 0.528103650639853 0.367344937889513 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55992992 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 55994823 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 4 12 16 1.88758539744059 6.33724380767824 -4.44965841023765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0417233745614009 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 17 23 40 8.0222379391225 12.1463839647166 -4.12414602559412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207607836596394 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 21 21 42 9.90982333656309 11.0901766634369 -1.18035332687382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75862144149592 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 105 105 210 49.5491166828154 55.4508833171846 -5.90176663436912 T:C C T 10 0.528103650639853 0.447190296200139 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 56733425 C/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:C C A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000131848:ENST00000254165:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A;ENSG00000131848:ENST00000391713:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57088558 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197016:ENST00000391709:exon_57088081_57094261:ZNF470;ENSG00000197016:ENST00000330619:exon_57088081_57089951:ZNF470;ENSG00000197016:ENST00000446235:exon_57088552_57089951:ZNF470 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57133391 G/T 1 1 10 11 0.471896349360147 5.28103650639853 -4.80914015703838 T:G G T 10 0.528103650639853 0.00433058530260509 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57802806 C/T 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57802824 G/A 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57839690 A/T 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:T A T 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57867599 T/C 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000131845:ENST00000282286:exon_57867398_57871266:ZNF304;ENSG00000131845:ENST00000391705:exon_57867398_57871266:ZNF304 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57909872 G/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000188785:ENST00000366197:exon_57909798_57912785:ZNF548;ENSG00000188785:ENST00000336128:exon_57909798_57911257:ZNF548 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57931303 C/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 57932027 C/T 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 T:C C T 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58058561 C/G 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 C:G C G 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 15 17 32 7.07844524040221 8.9777620608775 -1.8993168204753 T:C C T 10 0.528103650639853 0.596146570062849 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 25 20 45 11.7974087340037 10.5620730127971 1.23533572120662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.76647967814017 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1938 2033 3971 914.535125059965 1073.63472175082 -159.099596690856 A:G G A 10 0.528103650639853 4.63095326025837e-07 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 A:G A G 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 14 13 27 6.60654889104206 6.86534745831809 -0.258798567276031 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 13 6 19 6.13465254168191 3.16862190383912 2.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.250158578602722 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 13 13 26 6.13465254168191 6.86534745831809 -0.730694916636178 A:G A G 10 0.528103650639853 0.845438438309726 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58946056 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000131849:ENST00000254166:exon_58944182_58946578:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000391695:exon_58945866_58946169:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000418193:exon_58945866_58946169:ZNF132 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58982098 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000083812:ENST00000196482:exon_58982098_58984765:ZNF324 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:C A C 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:G A G 10 0.528103650639853 0.207029491689985 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 258 265 523 121.749258134918 139.947467419561 -18.1982092846431 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.114909080538427 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 A A 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 187 185 372 88.2446173303475 97.6991753683728 -9.45455803802531 A:G A G 10 0.528103650639853 0.349939423182484 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 19 28 47 8.96603063784279 14.7869022179159 -5.82087158007309 C:G G C 10 0.528103650639853 0.107505229769686 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 3504615 C/A 1 23 18 41 10.8536160352834 9.50586571151735 1.34775032376603 A:C C A 10 0.528103650639853 0.755216948991552 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 36 33 69 16.9882685769653 17.4274204711151 -0.439151894149855 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 160 115 275 75.5034158976235 60.7319198235831 14.7714960740404 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0797773961887526 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 108 82 190 50.9648057308959 43.3044993524679 7.66030637842793 T:C C T 10 0.528103650639853 0.276344076710510 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 22 13 35 10.3817196859232 6.86534745831809 3.51637222760515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.242214515552746 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 8 13 21 3.77517079488118 6.86534745831809 -3.09017666343691 T:C C T 10 0.528103650639853 0.195195777078582 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 40 44 84 18.8758539744059 23.2365606281535 -4.36070665374765 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.382250612552397 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 17902510 G/A 1 44 49 93 20.7634393718465 25.8770788813528 -5.11363950950633 A:G G A 10 0.528103650639853 0.300368944227016 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17902409_17902528:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17902409_17902528:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17902409_17902528:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17902409_17902528:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17902409_17902528:SMC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 20101487 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 20823724 T/C 0 0 18 18 0 9.50586571151735 -9.50586571151735 C T C 10 0.528103650639853 1.34660157145888e-06 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20821948_20823791:HS1BP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 9 4 13 4.24706714424132 2.11241460255941 2.13465254168191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.276725408885617 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 83 70 153 39.1673969968922 36.9672555447897 2.20014145210249 T:C T C 10 0.528103650639853 0.746480499098412 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 64 58 122 30.2013663590494 30.6300117371115 -0.428645378062065 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 14 31 45 6.60654889104206 16.3712131698354 -9.76466427879338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00416448947517608 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 58 9 67 27.3699882628885 4.75293285575868 22.6170554071299 A:G G A 10 0.528103650639853 8.92665955950162e-09 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 27262658 C/T 1 40 44 84 18.8758539744059 23.2365606281535 -4.36070665374765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.382250612552397 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262609_27262705:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 27605049 T/G 1 175 124 299 82.5818611380257 65.4848526793418 17.097008458684 T:C:G T G 10 0.528103650639853 0.0489628351587269 ENSG00000115241:ENST00000344034:exon_27604993_27605095:PPM1G;ENSG00000115241:ENST00000472077:exon_27604993_27605095:PPM1G;ENSG00000115241:ENST00000350803:exon_27604993_27605095:PPM1G;ENSG00000115241:ENST00000395543:exon_27604993_27605095:PPM1G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 12 21 33 5.66275619232176 11.0901766634369 -5.42742047111515 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0797424808549282 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 8 15 23 3.77517079488118 7.92155475959779 -4.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0962092249770063 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 73 67 140 34.4484335032907 35.3829445928702 -0.934511089579424 T:C T C 10 0.528103650639853 0.932581256293282 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 23 25 48 10.8536160352834 13.2025912659963 -2.34897523071294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.563803045831336 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 32983480 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 54 46 100 25.4824028654479 24.2927679294332 1.1896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.841715019574503 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:G A G 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 37516652 A/G 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37516499_37516656:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37516499_37516656:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37516499_37516656:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000475912:exon_37516499_37516656:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443187:exon_37516499_37516656:PRKD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 38302177 C/A 1 5 15 20 2.35948174680074 7.92155475959779 -5.56207301279706 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0137985402926307 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 38302390 G/C 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 C:G G C 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 10 16 26 4.71896349360147 8.44965841023765 -3.73069491663618 T:G T G 10 0.528103650639853 0.170141289167191 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 57 58 115 26.8980919135284 30.6300117371115 -3.73191982358309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.51385854860297 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 42578409 T/C 1 271 273 544 127.8839106766 144.17229662468 -16.28838594808 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.169396316720517 ENSG00000115944:ENST00000378669:exon_42576478_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000482463:exon_42577647_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000234301:exon_42577647_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000464443:exon_42577992_42578499:COX7A2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 8 23 31 3.77517079488118 12.1463839647166 -8.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00334788397675838 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 44116923 C/T 1 149 145 294 70.3125560546619 76.5750293427787 -6.26247328811677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.483524946795017 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44116873_44117015:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000419884:exon_44116873_44117015:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000463456:exon_44116873_44117015:LRPPRC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 118 101 219 55.6837692244973 53.3384687146252 2.3453005098722 T:C T C 10 0.528103650639853 0.78674019117491 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 0 0 9 9 0 4.75293285575868 -4.75293285575868 G A G 10 0.528103650639853 0.00116043163153151 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 46987300 T/G 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:G T G 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 C:G G C 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 47278901 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 17 23 40 8.0222379391225 12.1463839647166 -4.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.207607836596394 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 48010488 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 48030692 T/A 1 55 54 109 25.9542992148081 28.5175971345521 -2.56329791974398 A:T T A 10 0.528103650639853 0.632713324534634 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:T A T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 48602252 C/T 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000170802:ENST00000340553:exon_48602059_48606433:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000304367:exon_48602059_48602582:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000495290:exon_48602059_48602289:FOXN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:T A T 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 25 32 57 11.7974087340037 16.8993168204753 -5.10190808647162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.186450354571913 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 20 18 38 9.43792698720294 9.50586571151735 -0.0679387243144127 A:T A T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 36 27 63 16.9882685769653 14.258798567276 2.72947000968926 A:G G A 10 0.528103650639853 0.529549045967733 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 24 13 37 11.3255123846435 6.86534745831809 4.46016492632544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.187086784524428 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 180 156 336 84.9413428848265 82.3841694998171 2.55717338500941 T:C C T 10 0.528103650639853 0.785020510176485 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 63 46 109 29.7294700096893 24.2927679294332 5.43670208025603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.337475685416519 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 24 21 45 11.3255123846435 11.0901766634369 0.235335721206615 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 24 31 55 11.3255123846435 16.3712131698354 -5.04570078519192 T:G G T 10 0.528103650639853 0.179406417717739 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 55873592 G/A 1 19 18 37 8.96603063784279 9.50586571151735 -0.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.87078300601169 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55873550_55873621:PNPT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 60689147 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 64779514 A/G 1 134 114 248 63.2341108142597 60.2038161729432 3.03029464131646 A:G A G 10 0.528103650639853 0.703398505472079 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 21 37 58 9.90982333656309 19.5398350736746 -9.63001173711147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0122801780031477 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 32 42 74 15.1006831795247 22.1803533268738 -7.07967014734912 A:G A G 10 0.528103650639853 0.104073944158379 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G G A 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 192 167 359 90.6040990771482 88.1933096568554 2.41078942029277 T:G G T 10 0.528103650639853 0.832587945136136 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 71 56 127 33.5046408045704 29.5738044358318 3.93083636873867 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.534074997998688 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 527 456 983 248.689376112797 240.815264691773 7.87411142102451 C:G G C 10 0.528103650639853 0.63184624176669 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 69870090 G/A 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:G G A 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000115977:ENST00000409068:exon_69870010_69870406:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69870010_69870406:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69870010_69870406:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000495836:exon_69870010_69870406:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000495239:exon_69870009_69870406:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000471775:exon_69870038_69870406:AAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 70031712 G/A 1 28 23 51 13.2130977820841 12.1463839647166 1.0667138173675 A:G G A 10 0.528103650639853 0.781189943617634 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70031665_70031759:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000484219:exon_70031665_70031721:ANXA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 70037739 C/G 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 70071305 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000087338:ENST00000282570:exon_70071263_70071328:GMCL1;ENSG00000087338:ENST00000471404:exon_70071263_70071328:GMCL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 133 87 220 62.7622144648996 45.9450176056672 16.8171968592323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.025666539196399 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 62 64 126 29.2575736603291 33.7986336409506 -4.54105998062148 A:C A C 10 0.528103650639853 0.423456286897763 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 124 85 209 58.5151473206582 44.8888103043875 13.6263370162707 A:T:G G T 10 0.528103650639853 0.0614813477128024 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 29 35 64 13.6849941314443 18.4836277723949 -4.79863364095059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.260179377689602 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 24 30 54 11.3255123846435 15.8431095191956 -4.51759713455206 A:C C A 10 0.528103650639853 0.22333481655334 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 51 39 90 24.0667138173675 20.5960423749543 3.47067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.526692253956341 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 37 43 80 17.4601649263254 22.7084569775137 -5.24829205118824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.263331599902488 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 25 24 49 11.7974087340037 12.6744876153565 -0.877078881352798 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.886456564905082 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 0 9 0 9 4.24706714424132 0 4.24706714424132 G G 10 0.528103650639853 0.00435544387654226 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 34 58 92 16.044475878245 30.6300117371115 -14.5855358588665 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00239535713467029 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 84 105 189 39.6392933462524 55.4508833171846 -15.8115899709322 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0237233130942766 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 74717206 C/T 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74717152_74717254:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74717152_74717600:TTC31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 74755980 G/A 1 62 33 95 29.2575736603291 17.4274204711151 11.830153189214 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0176845592134342 ENSG00000115307:ENST00000425118:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000377526:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74755544_74756626:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000456927:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74755878_74756110:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74755878_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74755878_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000412627:exon_74755878_74756062:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000464887:exon_74755878_74756063:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000472800:exon_74755949_74756062:AUP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 23 18 41 10.8536160352834 9.50586571151735 1.34775032376603 C:G C G 10 0.528103650639853 0.755216948991552 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 216 117 333 101.929611461792 61.7881271248628 40.141484336929 A:C:G G A 10 0.528103650639853 1.03195380303035e-05 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85622056 T/A 1 47 35 82 22.1791284199269 18.4836277723949 3.69550064753206 A:T T A 10 0.528103650639853 0.440166444532423 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 35 48 83 16.5163722276051 25.3489752307129 -8.8326030031078 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0611573322052653 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 280 249 529 132.130977820841 131.497809009323 0.633168811517777 C:G C G 10 0.528103650639853 0.965291320539836 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 22 21 43 10.3817196859232 11.0901766634369 -0.708456977513677 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.879218371784125 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 375 310 685 176.961131010055 163.712131698354 13.2489993117007 T:C C T 10 0.528103650639853 0.319848094918726 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 491 423 914 231.701107535832 223.387844220658 8.31326331517437 A:G A G 10 0.528103650639853 0.596122759027844 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 218 210 428 102.873404160512 110.901766634369 -8.02836247385707 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.439035017950691 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 21 15 36 9.90982333656309 7.92155475959779 1.98826857696529 T:C C T 10 0.528103650639853 0.617179411281929 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 85826721 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000168890:ENST00000306353:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000431593:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000334462:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000444380:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000409668:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000422458:exon_85826648_85826825:TMEM150A;ENSG00000168890:ENST00000451147:exon_85826715_85826825:TMEM150A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86260785 C/T 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86260784_86260910:POLR1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86315741 C/T 1 12 3 15 5.66275619232176 1.58431095191956 4.07844524040221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0393940244088059 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000424089:exon_86315689_86315792:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409024:exon_86315689_86315792:POLR1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86363074 A/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G A G 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86364653 A/G 1 115 112 227 54.2680801764169 59.1476088716635 -4.87952869524663 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.549767151708053 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86364592_86369280:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86364592_86365316:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000455260:exon_86364592_86369280:PTCD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86400791 T/C 1 77 52 129 36.3360189007313 27.4613898332724 8.87462906745896 T:C T C 10 0.528103650639853 0.133627535699203 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 66 89 155 31.1451590577697 47.0012249069469 -15.8560658491772 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0124174528306458 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86683642 A/G 1 17 8 25 8.0222379391225 4.22482920511882 3.79740873400368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.161050017092251 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000463013:exon_86683565_86683778:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86683556_86683689:KDM3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 86691250 G/A 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86691176_86691339:KDM3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 33 34 67 15.5725795288849 17.955524121755 -2.38294459287015 A:C C A 10 0.528103650639853 0.624938459931376 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C T C 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 C:G G C 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 89160098 T/C 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 T:C T C 10 0.528103650639853 0.253776528805514 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 89160102 T/C 1 15 23 38 7.07844524040221 12.1463839647166 -5.06793872431441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.106336748752300 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 89160363 C/G 1 12 28 40 5.66275619232176 14.7869022179159 -9.12414602559412 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00412601201918889 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 89160366 T/C 1 12 27 39 5.66275619232176 14.258798567276 -8.59604237495427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00620216280373158 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 96685021 A/G 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.153619869440870 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 104 114 218 49.0772203334553 60.2038161729432 -11.126595839488 A:G G A 10 0.528103650639853 0.135894754596116 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 56 51 107 26.4261955641682 26.9332861826325 -0.507090618464272 A:G A G 10 0.528103650639853 0.923232076927853 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 28 20 48 13.2130977820841 10.5620730127971 2.65102476928706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.472712139498177 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 20 26 46 9.43792698720294 13.7306949166362 -4.29276792943324 A:G A G 10 0.528103650639853 0.237865484014599 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 36 20 56 16.9882685769653 10.5620730127971 6.42619556416823 T:C T C 10 0.528103650639853 0.107488100461090 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 98206050 C/T 1 11 1 12 5.19085984296162 0.528103650639853 4.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00727604133363875 ENSG00000196912:ENST00000438709:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000377003:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000359901:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000258459:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000443455:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000419390:exon_98205988_98206278:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000486846:exon_98205988_98206428:ANKRD36B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 98206060 C/T 1 8 1 9 3.77517079488118 0.528103650639853 3.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0417379304922468 ENSG00000196912:ENST00000438709:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000377003:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000359901:exon_98205988_98206329:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000258459:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000443455:exon_98205988_98206327:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000419390:exon_98205988_98206278:ANKRD36B;ENSG00000196912:ENST00000486846:exon_98205988_98206428:ANKRD36B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 59 58 117 27.8418846122487 30.6300117371115 -2.7881271248628 C:G G C 10 0.528103650639853 0.643757780139754 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 5 15 20 2.35948174680074 7.92155475959779 -5.56207301279706 A:T T A 10 0.528103650639853 0.0137985402926307 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 15 9 24 7.07844524040221 4.75293285575868 2.32551238464353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.415581587245928 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 20 13 33 9.43792698720294 6.86534745831809 2.57257952888485 A:G G A 10 0.528103650639853 0.389406238573835 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113089246 A/G 1 5 10 15 2.35948174680074 5.28103650639853 -2.92155475959779 A:G A G 10 0.528103650639853 0.194694511215894 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:T T A 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:G A G 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 75 99 174 35.392226202011 52.2822614133454 -16.8900352113344 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0120203617436865 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 51 61 112 24.0667138173675 32.214322689031 -8.14760887166353 C:G G C 10 0.528103650639853 0.130412119242323 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 46 62 108 21.7072320705668 32.7424263396709 -11.0351942691041 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0342581678782017 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 120128323 C/T 1 1040 1076 2116 490.772203334553 568.239528088482 -77.4673247539289 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.000795233543986424 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120128316_120128378:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120128316_120128378:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120128316_120128378:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120128316_120128378:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120128316_120128378:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120127793_120128378:DBI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 8 15 23 3.77517079488118 7.92155475959779 -4.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0962092249770063 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 21 30 51 9.90982333656309 15.8431095191956 -5.9332861826325 C:G C G 10 0.528103650639853 0.122093194814424 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 127451500 T/A 1 312 265 577 147.231661000366 139.947467419561 7.28419358080484 A:T T A 10 0.528103650639853 0.559504076809651 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127451440_127451523:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127451440_127451523:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127451440_127451523:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127451440_127451523:GYPC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 328 402 730 154.782002590128 212.297667557221 -57.5156649670927 A:C A C 10 0.528103650639853 2.29511200325293e-05 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 128396807 A/G 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000072163:ENST00000426981:exon_128395956_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000469300:exon_128396000_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000494613:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409286:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409754:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000476932:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324938:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000484252:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000466410:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409455:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410109:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409808:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410011:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324864:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000355119:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000342067:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410038:exon_128396045_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000413578:exon_128396558_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409254:exon_128396772_128397003:LIMS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 130897234 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000152076:ENST00000496704:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000409943:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000310463:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000392984:exon_130896862_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000498526:exon_130897000_130897520:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000409488:exon_130897175_130897251:CCDC74B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 20 15 35 9.43792698720294 7.92155475959779 1.51637222760515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.735470146821121 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.189185822477580 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 136511842 C/A 1 38 48 86 17.9320612756856 25.3489752307129 -7.41691395502736 A:C C A 10 0.528103650639853 0.130088807445299 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 136598357 A/G 1 136 110 246 64.17790351298 58.0914015703838 6.08650194259616 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.444263979073579 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136597196_136598521:MCM6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 136623717 C/T 1 58 35 93 27.3699882628885 18.4836277723949 8.88636049049367 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0769732498639945 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136623702_136623847:MCM6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 52 37 89 24.5386101667276 19.5398350736746 4.99877509305308 A:G G A 10 0.528103650639853 0.339364905858460 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 136873084 G/A 1 88 76 164 41.5268787436929 40.1358774486288 1.39100129506411 A:G G A 10 0.528103650639853 0.875790187919535 ENSG00000121966:ENST00000409817:exon_136871919_136873813:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000241393:exon_136871921_136873482:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000466288:exon_136872207_136873482:CXCR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 65 61 126 30.6732627084096 32.214322689031 -1.54105998062147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.78967499417193 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 144899559 C/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000463875:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000476958:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000482601:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144899449_144899622:GTDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 152118271 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000184898:ENST00000331426:exon_152118239_152118393:RBM43;ENSG00000184898:ENST00000409092:exon_152118239_152118292:RBM43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 152118275 A/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000184898:ENST00000331426:exon_152118239_152118393:RBM43;ENSG00000184898:ENST00000409092:exon_152118239_152118292:RBM43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 33 29 62 15.5725795288849 15.3150058685557 0.257573660329115 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 41 43 84 19.347750323766 22.7084569775137 -3.36070665374765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.512396214138434 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 152317669 G/A 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152317652_152317803:RIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 153512846 A/G 1 148 104 252 69.8406597053018 54.9227796665447 14.917880038757 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.0670905625808703 ENSG00000196504:ENST00000410080:exon_153508107_153512912:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000440252:exon_153508116_153512912:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000359961:exon_153508116_153512912:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000356402:exon_153508116_153512912:PRPF40A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 14 26 40 6.60654889104206 13.7306949166362 -7.12414602559412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0265482454370916 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 6 26 32 2.83137809616088 13.7306949166362 -10.8993168204753 T:G G T 10 0.528103650639853 0.000116387470234684 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 2 12 14 0.943792698720294 6.33724380767824 -5.39345110895794 T:G T G 10 0.528103650639853 0.00532051078652733 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160289579 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160289268_160289874:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160289268_160289874:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160289268_160289874:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160289268_160289874:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000472953:exon_160289268_160292064:BAZ2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160604379 C/T 1 91 66 157 42.9425677917734 34.8548409422303 8.08772684954308 T:C C T 10 0.528103650639853 0.201797011702571 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160605268 T/C 1 69 75 144 32.5608481058501 39.607773797989 -7.04692569213884 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.243753880041421 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 39 35 74 18.4039576250457 18.4836277723949 -0.0796701473491197 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 160743040 T/A 1 28 24 52 13.2130977820841 12.6744876153565 0.538610166727644 A:T T A 10 0.528103650639853 0.890704333337229 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 66 82 148 31.1451590577697 43.3044993524679 -12.1593402946982 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0481660295962371 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 55 73 128 25.9542992148081 38.5515664967093 -12.5972672819012 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0269166739864600 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170411698 C/G 1 25 12 37 11.7974087340037 6.33724380767824 5.46016492632544 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0983513566870617 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170413751 G/A 1 56 52 108 26.4261955641682 27.4613898332724 -1.03519426910412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.847794132426795 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170413697_170413807:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170413697_170413807:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170413697_170413807:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170413697_170413807:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170413697_170413807:FASTKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170417031 T/C 1 30 30 60 14.1568904808044 15.8431095191956 -1.68621903839118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.699204772095856 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000487293:exon_170416781_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170416902_170417295:FASTKD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 221 217 438 104.289093208592 114.598492188848 -10.3093989802556 A:T T A 10 0.528103650639853 0.338562835880295 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 170937153 C/T 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170937055_170937194:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000484596:exon_170936534_170937194:UBR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 163 178 341 76.919104945704 94.0024498138938 -17.0833448681899 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.0652865571775528 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 95 86 181 44.830153189214 45.4169139550274 -0.586760765813388 T:G T G 10 0.528103650639853 0.940778522848057 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 81 75 156 38.2236042981719 39.607773797989 -1.38416949981707 A:G G A 10 0.528103650639853 0.872658396744862 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 40 33 73 18.8758539744059 17.4274204711151 1.44843350329073 T:C T C 10 0.528103650639853 0.81486237443545 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 175300997 G/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000163328:ENST00000392552:exon_175296966_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000392551:exon_175298880_175301144:GPR155;ENSG00000163328:ENST00000295500:exon_175299872_175301144:GPR155 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 178416658 T/G 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196659:ENST00000408939:exon_178414973_178417742:TTC30B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 179404628 T/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:T T A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179404109_179404693:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179404109_179404693:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179404109_179404693:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179404109_179404693:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179404109_179404693:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179404109_179404693:TTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 81 83 164 38.2236042981719 43.8326030031078 -5.60899870493589 T:C C T 10 0.528103650639853 0.390467162058924 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 50 60 110 23.5948174680073 31.6862190383912 -8.09140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.127258114264032 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 183790378 G/C 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 C:G G C 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000061676:ENST00000361354:exon_183789605_183790546:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000360982:exon_183789605_183790546:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000456371:exon_183789612_183790546:NCKAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 190617700 T/C 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000151687:ENST00000476208:exon_190617661_190617866:ANKAR;ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190617575_190617705:OSGEPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 190620216 C/T 1 7 16 23 3.30327444552103 8.44965841023765 -5.14638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0366490777229314 ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000520350:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000413448:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000517895:exon_190619899_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000518114:exon_190619041_190620286:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000521630:exon_190619899_190620286:OSGEPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 1251 1 1252 590.342333049544 0.528103650639853 589.814229398904 A:G G A 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 13 18 31 6.13465254168191 9.50586571151735 -3.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.280637889142549 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 98 104 202 46.2458422372944 54.9227796665447 -8.67693742925031 T:C T C 10 0.528103650639853 0.231267755978572 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 97 85 182 45.7739458879343 44.8888103043875 0.885135583546756 A:G A G 10 0.528103650639853 0.940857620992412 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 85 75 160 40.1111896956125 39.607773797989 0.503415897623519 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 314 284 598 148.175453699086 149.981436781718 -1.80598308263208 T:C T C 10 0.528103650639853 0.902229574436476 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 93 85 178 43.8863604904937 44.8888103043875 -1.00244981389383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.880998054981745 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 198365788 C/T 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000115541:ENST00000463841:exon_198365606_198365962:HSPE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 38 33 71 17.9320612756856 17.4274204711151 0.504640804570439 T:C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 9 17 26 4.24706714424132 8.9777620608775 -4.73069491663618 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0767273473177002 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 201437214 A/G 1 29 17 46 13.6849941314443 8.9777620608775 4.70723207056676 A:G A G 10 0.528103650639853 0.184994000043587 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 26 38 64 12.2693050833638 20.0679387243144 -7.79863364095059 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0598723881188528 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 201950184 A/G 1 288 247 535 135.906148615722 130.441601708044 5.46454690767865 A:G A G 10 0.528103650639853 0.665042412065145 ENSG00000119013:ENST00000450023:exon_201950182_201950236:NDUFB3;ENSG00000119013:ENST00000237889:exon_201950182_201950473:NDUFB3;ENSG00000119013:ENST00000433898:exon_201950182_201950467:NDUFB3;ENSG00000119013:ENST00000454214:exon_201950182_201950473:NDUFB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 82 93 175 38.6955006475321 49.1136395095063 -10.4181388619743 T:C T C 10 0.528103650639853 0.129747572972247 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 73 104 177 34.4484335032907 54.9227796665447 -20.474346163254 A:C A C 10 0.528103650639853 0.00250447476635985 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 16 9 25 7.55034158976235 4.75293285575868 2.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.318500289625426 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 42 42 84 19.8196466731262 22.1803533268738 -2.36070665374765 A:C C A 10 0.528103650639853 0.662370666785725 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 25 24 49 11.7974087340037 12.6744876153565 -0.877078881352798 A:G A G 10 0.528103650639853 0.886456564905082 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 1 20 5 25 9.43792698720294 2.64051825319926 6.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00796583510429838 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 213886769 G/C 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 C:G G C 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000030419:ENST00000457361:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374327:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000342002:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000434687:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000451136:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374319:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000453575:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000412444:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000413091:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000439848:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374326:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000431520:exon_213886717_213886854:IKZF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 14 14 28 6.60654889104206 7.39345110895794 -0.786902217915884 C:G C G 10 0.528103650639853 0.850667454315956 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 216176824 C/T 1 42 37 79 19.8196466731262 19.5398350736746 0.279811599451616 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216176540_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216176679_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216176715_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216176795_216177113:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216176814_216177347:ATIC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 107 85 192 50.4929093815357 44.8888103043875 5.60409907714823 A:G A G 10 0.528103650639853 0.427462800614709 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 217288388 G/C 1 32 27 59 15.1006831795247 14.258798567276 0.841884612248673 C:G G C 10 0.528103650639853 0.896519013453437 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217288356_217288406:SMARCAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 1201 845 2046 566.747515581537 446.247584790676 120.499930790861 A:T:C C T 10 0.528103650639853 9.18772535036936e-08 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 217363638 G/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 217364764 G/T 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 G G 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217364672_217366190:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217364672_217366179:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363993_217366183:RPL37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 40 51 91 18.8758539744059 26.9332861826325 -8.05743220822662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0938293663088536 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219503113 C/T 1 13 24 37 6.13465254168191 12.6744876153565 -6.53983507367456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0330322046006546 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219507302 C/T 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219508263 G/T 1 9 19 28 4.24706714424132 10.0339693621572 -5.78690221791588 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0360967037502458 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219509618 C/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:C C A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219527712 C/T 1 39 38 77 18.4039576250457 20.0679387243144 -1.66398109926868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.732914229580579 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000436603:exon_219527606_219527723:BCS1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 34 35 69 16.044475878245 18.4836277723949 -2.43915189414986 T:C T C 10 0.528103650639853 0.629921370591888 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 45 31 76 21.2353357212066 16.3712131698354 4.86412255137117 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.301400812032439 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219529247 A/C 1 64 50 114 30.2013663590494 26.4051825319927 3.79618382705676 A:T:C A C 10 0.528103650639853 0.511967306174722 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219529881 G/A 1 20 11 31 9.43792698720294 5.80914015703838 3.62878683016456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.211615695999613 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219529877_219529970:RNF25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219563807 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163482:ENST00000295709:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392106:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392105:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000440309:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000431040:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000419433:exon_219563325_219564071:STK36 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 219613979 A/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219613976_219614110:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219613976_219614110:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219613976_219614110:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219613976_219614110:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000467841:exon_219613976_219614085:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000480472:exon_219613976_219614005:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000465558:exon_219613976_219614110:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000448224:exon_219613976_219614086:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000436668:exon_219613976_219614110:TTLL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 107 122 229 50.4929093815357 64.4286453780621 -13.9357359965263 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0737098708456571 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 57 73 130 26.8980919135284 38.5515664967093 -11.6534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0433335466376359 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225670901 G/C 1 12 14 26 5.66275619232176 7.39345110895794 -1.73069491663618 C:G G C 10 0.528103650639853 0.558326244007148 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225670843_225670954:DOCK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225684166 A/G 1 7 17 24 3.30327444552103 8.9777620608775 -5.67448761535647 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0238869648119683 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225684163_225684246:DOCK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225709926 A/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225709920_225710041:DOCK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 225727431 T/C 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225725297_225727463:DOCK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 228205039 G/A 1 53 40 93 25.0105065160878 21.1241460255941 3.88636049049367 A:G G A 10 0.528103650639853 0.467584826550466 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228205008_228205070:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228205008_228205277:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228205008_228205096:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228205008_228205096:MFF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 228398422 A/G 1 57 47 104 26.8980919135284 24.8208715800731 2.07722033345529 A:G A G 10 0.528103650639853 0.695746911677309 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228398265_228398474:AGFG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 34 30 64 16.044475878245 15.8431095191956 0.201366359049409 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 73 51 124 34.4484335032907 26.9332861826325 7.51514732065823 C:G G C 10 0.528103650639853 0.178765766971226 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 91 52 143 42.9425677917734 27.4613898332724 15.481177958501 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00941249610500853 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 4 11 15 1.88758539744059 5.80914015703838 -3.92155475959779 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0668301083998627 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 72 100 172 33.9765371539306 52.8103650639853 -18.8338279100547 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00459810018960101 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 9 15 24 4.24706714424132 7.92155475959779 -3.67448761535647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.154361116643106 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231775094 C/A 1 13 25 38 6.13465254168191 13.2025912659963 -7.06793872431441 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0231439853199828 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231775144 G/A 1 20 13 33 9.43792698720294 6.86534745831809 2.57257952888485 A:G G A 10 0.528103650639853 0.389406238573835 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 231775256 A/T 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:T A T 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 21 15 36 9.90982333656309 7.92155475959779 1.98826857696529 A:G G A 10 0.528103650639853 0.617179411281929 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 232952256 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000360410:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409401:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000441279:exon_232952197_232952262:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000464554:exon_232952197_232952554:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000470087:exon_232952197_232952431:DIS3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 233127979 T/C 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_233127917_233128072:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000424049:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000498319:exon_233127917_233128150:DIS3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 233660846 G/A 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233660772_233660931:GIGYF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 23 26 49 10.8536160352834 13.7306949166362 -2.8770788813528 A:G G A 10 0.528103650639853 0.474907101864699 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 234377151 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234377069_234377199:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234377069_234377199:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234377069_234377199:DGKD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 238903399 G/A 1 18 9 27 8.49413428848265 4.75293285575868 3.74120143272397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.178532552079908 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434137:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238903386_238903451:UBE2F HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:C T C 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:G G T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 239307483 G/T 1 4 18 22 1.88758539744059 9.50586571151735 -7.61828031407676 T:G G T 10 0.528103650639853 0.00109419435865532 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239307395_239309541:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239307395_239309463:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239307395_239309537:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000483951:exon_239307395_239307612:TRAF3IP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 239353001 C/T 1 21 24 45 9.90982333656309 12.6744876153565 -2.76466427879338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.456623221741375 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242035544 G/C 1 231 271 502 109.008056702194 143.1160893234 -34.1080326212062 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0023539268655808 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 86 87 173 40.5830860449726 45.9450176056672 -5.36193156069456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.446525319147326 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242039198 T/C 1 68 78 146 32.08895175649 41.1920847499085 -9.10313299341853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.136226069774984 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 419 188 607 197.724570381902 99.2834863202924 98.4410840616092 A:C A C 10 0.528103650639853 4.78368676301769e-16 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 317 125 442 149.591142747167 66.0129563299816 83.578186417185 A:T:G G A 10 0.528103650639853 5.48598969526964e-16 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242054403 G/A 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 45 26 71 21.2353357212066 13.7306949166362 7.50464080457044 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0758508209127552 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242063448 G/A 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242063364_242063548:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 25 27 52 11.7974087340037 14.258798567276 -2.46138983327236 A:G A G 10 0.528103650639853 0.578931495519633 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 39 63 102 18.4039576250457 33.2705299903107 -14.866572365265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00383223823986076 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242066830 G/A 1 67 64 131 31.6170554071299 33.7986336409506 -2.18157823382074 A:G G A 10 0.528103650639853 0.726798312300015 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242380748 T/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242380719_242380971:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000413432:exon_242380719_242381167:FARP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242439595 G/A 1 83 74 157 39.1673969968922 39.0796701473491 0.0877268495430812 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000423004:exon_242439588_242439659:STK25;ENSG00000115694:ENST00000461760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000450497:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000442307:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000424537:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000413760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000429279:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000436402:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000492127:exon_242438822_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000479442:exon_242439318_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000496159:exon_242439462_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000440109:exon_242439558_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000435225:exon_242439587_242439696:STK25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242606175 A/G 1 14 25 39 6.60654889104206 13.2025912659963 -6.59604237495427 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0374050035299014 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000311517:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000400771:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242606060_242606253:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000429899:exon_242606060_242606184:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242606011_242606253:ATG4B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 32 28 60 15.1006831795247 14.7869022179159 0.313780961608821 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 278848 C/T 1 31 32 63 14.6287868301646 16.8993168204753 -2.27052999031074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.614551101978802 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 23 23 46 10.8536160352834 12.1463839647166 -1.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.76841874383127 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 376857 G/A 1 57 65 122 26.8980919135284 34.3267372915904 -7.42864537806207 A:G G A 10 0.528103650639853 0.204093637243573 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_376842_377072:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 57 48 105 26.8980919135284 25.3489752307129 1.54911668281543 T:C C T 10 0.528103650639853 0.770477496220696 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 80 96 176 37.7517079488118 50.6979504614259 -12.9462425126141 T:C C T 10 0.528103650639853 0.058801556212247 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 428553 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000125875:ENST00000461304:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000354200:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000494633:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000246077:exon_428533_428718:TBC1D20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 1291076 G/C 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000125775:ENST00000381812:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000381808:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000360779:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000339987:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000467129:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000245974:exon_1290627_1291139:SDCBP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 61 54 115 28.785677310969 28.5175971345521 0.268080176416905 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 4854682 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000423430:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000496331:exon_4854523_4854738:SLC23A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 4893607 G/A 1 14 5 19 6.60654889104206 2.64051825319926 3.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.105309108512039 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4893526_4893624:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4893526_4893624:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4893526_4893624:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4893526_4893624:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4893526_4893624:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4893526_4893624:SLC23A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 28 36 64 13.2130977820841 19.0117314230347 -5.79863364095059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.168444076952433 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 27 33 60 12.741201432724 17.4274204711151 -4.68621903839118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.245701466353028 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 25 35 60 11.7974087340037 18.4836277723949 -6.68621903839118 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0930041275737026 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 28 56 84 13.2130977820841 29.5738044358318 -16.3607066537477 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000409975946324458 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:C C A 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 10394046 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 60 61 121 28.3137809616088 32.214322689031 -3.90054172742221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.524090946228575 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 13695607 T/G 1 29 31 60 13.6849941314443 16.3712131698354 -2.68621903839118 T:G T G 10 0.528103650639853 0.519448300981425 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 18 9 27 8.49413428848265 4.75293285575868 3.74120143272397 A:C C A 10 0.528103650639853 0.178532552079908 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 17596587 G/A 1 7 18 25 3.30327444552103 9.50586571151735 -6.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0153814544149345 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596571_17596654:RRBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 29 27 56 13.6849941314443 14.258798567276 -0.573804435831768 T:C C T 10 0.528103650639853 0.894275221478099 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 18295730 C/T 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000360010:exon_18295713_18295750:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000434018:exon_18295713_18295923:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000425686:exon_18295713_18296032:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 20373813 C/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000188559:ENST00000417022:exon_20370196_20373897:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20370196_20373897:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20373411_20373897:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20373411_20373897:RALGAPA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 20493222 G/A 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000188559:ENST00000417022:exon_20493157_20493302:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000427175:exon_20493157_20493244:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20493157_20493928:RALGAPA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 C:G C G 10 0.528103650639853 0.189185822477580 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 25 16 41 11.7974087340037 8.44965841023765 3.34775032376603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.34880738086651 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 23345589 A/G 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 T:G G T 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 64 71 135 30.2013663590494 37.4953591954296 -7.29399283638016 T:C C T 10 0.528103650639853 0.227615138921809 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 32248163 C/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C C T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000125967:ENST00000375238:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000246190:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000488489:exon_32247691_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000483813:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485399:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485976:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000478237:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000494174:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000463246:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000480994:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000439478:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000498353:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000493590:exon_32248065_32248201:NECAB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 32678368 T/G 1 19 95 114 8.96603063784279 50.169846810786 -41.2038161729432 T:G T G 10 0.528103650639853 1.65642465467406e-15 ENSG00000125977:ENST00000374980:exon_32678323_32678408:EIF2S2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 32878733 G/A 1 125 103 228 58.9870436700184 54.3946760159049 4.59236765411352 A:G G A 10 0.528103650639853 0.551265243283151 ENSG00000101444:ENST00000217426:exon_32878537_32878744:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000480653:exon_32878537_32878744:AHCY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33147737 C/G 1 12 1 13 5.66275619232176 0.528103650639853 5.13465254168191 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00403006579681969 ENSG00000101460:ENST00000374837:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000397711:exon_33147540_33148086:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000360668:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000476428:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 14 17 31 6.60654889104206 8.9777620608775 -2.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.472722152420775 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33337784 C/T 1 18 21 39 8.49413428848265 11.0901766634369 -2.59604237495427 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426412497795246 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33591006 G/A 1 66 58 124 31.1451590577697 30.6300117371115 0.51514732065823 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 19 21 40 8.96603063784279 11.0901766634369 -2.12414602559412 C:G G C 10 0.528103650639853 0.529489428576162 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 198 197 395 93.4354771733091 104.036419176051 -10.6009420027419 A:G A G 10 0.528103650639853 0.290262516741318 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 124 105 229 58.5151473206582 55.4508833171846 3.06426400347367 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.691915351237861 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 116 135 251 54.7399765257771 71.2939928363802 -16.5540163106031 T:C T C 10 0.528103650639853 0.037063194299505 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 83 60 143 39.1673969968922 31.6862190383912 7.48117795850102 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.24086193987085 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 111 88 199 52.3804947789763 46.4731212563071 5.90737352266926 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434935125132575 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 34832755 C/A 1 21 29 50 9.90982333656309 15.3150058685557 -5.40518253199265 A:C C A 10 0.528103650639853 0.156065012101847 ENSG00000131043:ENST00000397286:exon_34832619_34832848:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34832619_34832848:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34832619_34832848:C20orf4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 89 93 182 41.9987750930531 49.1136395095063 -7.11486441645324 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.299319644477662 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 36640103 G/T 1 34 21 55 16.044475878245 11.0901766634369 4.95429921480809 T:G G T 10 0.528103650639853 0.223910816018479 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36639917_36642305:TTI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 13 13 26 6.13465254168191 6.86534745831809 -0.730694916636178 T:C C T 10 0.528103650639853 0.845438438309726 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 335 269 604 158.085277035649 142.05988202212 16.0253950135288 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.19249767601683 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44578674 T/A 1 23 16 39 10.8536160352834 8.44965841023765 2.40395762504573 A:T T A 10 0.528103650639853 0.522034501209129 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44578961 A/G 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578858_44579012:ZNF335 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 33 32 65 15.5725795288849 16.8993168204753 -1.32673729159044 T:G T G 10 0.528103650639853 0.804134420244095 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 71 74 145 33.5046408045704 39.0796701473491 -5.57502934277868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.361348434757906 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44757524 C/G 1 240 293 533 113.255123846435 154.734369637477 -41.4792457910416 C:G C G 10 0.528103650639853 0.000365483179607383 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44756969_44758153:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44757521_44757765:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44757521_44758502:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44757521_44757643:CD40 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 44979315 C/T 1 10 21 31 4.71896349360147 11.0901766634369 -6.37121316983544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.029407537625691 ENSG00000080189:ENST00000493599:exon_44978167_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000480329:exon_44978994_44979529:SLC35C2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 37 57 94 17.4601649263254 30.1019080864716 -12.6417431601462 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00967400933905638 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 34 25 59 16.044475878245 13.2025912659963 2.84188461224867 A:G A G 10 0.528103650639853 0.515237922033481 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 46256752 A/G 1 21 27 48 9.90982333656309 14.258798567276 -4.34897523071294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.247554539696894 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46256666_46256767:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46256666_46256767:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46256666_46256767:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46256666_46256767:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46256666_46256767:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000497292:exon_46256666_46256767:NCOA3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47244450 G/A 1 17 22 39 8.0222379391225 11.6182803140768 -3.59604237495427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.264992380822541 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47244399_47244501:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47246077 C/G 1 15 17 32 7.07844524040221 8.9777620608775 -1.8993168204753 C:G C G 10 0.528103650639853 0.596146570062849 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47246127 G/A 1 22 15 37 10.3817196859232 7.92155475959779 2.46016492632544 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.51078704440021 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47249116 G/A 1 54 65 119 25.4824028654479 34.3267372915904 -8.84433442614251 A:G G A 10 0.528103650639853 0.118323724155946 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47249170 G/A 1 60 57 117 28.3137809616088 30.1019080864716 -1.7881271248628 A:G G A 10 0.528103650639853 0.781437734713385 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 86 73 159 40.5830860449726 38.5515664967093 2.03151954826338 T:C T C 10 0.528103650639853 0.751551253301461 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47351095 G/A 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47351083_47351187:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47351083_47351187:PREX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 47606201 G/A 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47606093_47606221:ARFGEF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 49 27 76 23.1229211186472 14.258798567276 8.86412255137117 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0501813476319999 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 28 35 63 13.2130977820841 18.4836277723949 -5.27052999031074 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207312160682015 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 48808011 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000172216:ENST00000303004:exon_48807376_48809212:CEBPB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 61 59 120 28.785677310969 31.1581153877513 -2.37243807678236 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.714779052464732 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 49576348 A/G 1 20 13 33 9.43792698720294 6.86534745831809 2.57257952888485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.389406238573835 ENSG00000124217:ENST00000244051:exon_49575363_49577820:MOCS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C C T 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52192637 T/C 1 20 20 40 9.43792698720294 10.5620730127971 -1.12414602559412 T:C T C 10 0.528103650639853 0.753345197017696 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 22 23 45 10.3817196859232 12.1463839647166 -1.76466427879338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.655318495368836 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52198589 C/T 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 T:C C T 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 15 43 58 7.07844524040221 22.7084569775137 -15.6300117371115 A:G A G 10 0.528103650639853 5.3990328298537e-05 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52645166 A/G 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 52675259 G/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:G G T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52675186_52675262:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52675186_52675262:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52675186_52675262:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52675186_52675262:BCAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 17 22 39 8.0222379391225 11.6182803140768 -3.59604237495427 C:G C G 10 0.528103650639853 0.264992380822541 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 57566372 C/T 1 56 40 96 26.4261955641682 21.1241460255941 5.30204953857411 T:C C T 10 0.528103650639853 0.307122132949848 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57566367_57566501:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57566367_57566501:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57566367_57566501:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57566367_57566501:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000497935:exon_57566367_57566501:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000490205:exon_57566367_57566977:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000479207:exon_57566367_57566501:TH1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 60714822 C/T 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60714752_60714961:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370858:exon_60714387_60714961:PSMA7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 60883791 G/A 1 102 93 195 48.133427634735 49.1136395095063 -0.980211874771335 A:G G A 10 0.528103650639853 0.886262687985956 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60883711_60883916:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60883711_60883916:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60883711_60883918:ADRM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 T:G G T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 14 18 32 6.60654889104206 9.50586571151735 -2.8993168204753 A:G G A 10 0.528103650639853 0.376496178274613 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 70 63 133 33.0327444552103 33.2705299903107 -0.237785535100443 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61467800 A/G 1 9 1 10 4.24706714424132 0.528103650639853 3.71896349360147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0234403290361439 ENSG00000092758:ENST00000472880:exon_61467273_61468011:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469802:exon_61467539_61467884:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61467771_61467884:COL9A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61528074 T/C 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61528271 C/T 1 10 1 11 4.71896349360147 0.528103650639853 4.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0130891108155244 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61528306 A/G 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 40 56 96 18.8758539744059 29.5738044358318 -10.6979504614259 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0316362867982802 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 1 140 141 0.471896349360147 73.9345110895794 -73.4626147402193 A:G A G 10 0.528103650639853 1.63383555661749e-44 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62126299 C/T 0 0 90 90 0 47.5293285575868 -47.5293285575868 T C T 10 0.528103650639853 4.42787737137677e-30 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 21 19 40 9.90982333656309 10.0339693621572 -0.124146025594118 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 27 30 57 12.741201432724 15.8431095191956 -3.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.428579027335235 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 A:G G A 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 11 3 14 5.19085984296162 1.58431095191956 3.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0627944859050089 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62194298 G/A 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:T:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62195220 C/T 1 3 11 14 1.41568904808044 5.80914015703838 -4.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0287103645641043 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62195672 C/T 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 6 12 18 2.83137809616088 6.33724380767824 -3.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.104929209344249 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 C:G G C 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62199990 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62199711_62200352:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62199711_62200352:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 7 22 29 3.30327444552103 11.6182803140768 -8.31500586855574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00238620323722915 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 20 62896665 G/A 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 A:G G A 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000203880:ENST00000369758:exon_62896611_62896782:PCMTD2;ENSG00000203880:ENST00000308824:exon_62896611_62896782:PCMTD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 17203785 A/T 1 9 19 28 4.24706714424132 10.0339693621572 -5.78690221791588 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0360967037502458 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000453553:exon_17203720_17203948:USP25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 28 26 54 13.2130977820841 13.7306949166362 -0.517597134552062 C:G G C 10 0.528103650639853 0.892562750123292 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 54 40 94 25.4824028654479 21.1241460255941 4.35825683985382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.408951564796058 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 24 30 54 11.3255123846435 15.8431095191956 -4.51759713455206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.22333481655334 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 39 41 80 18.4039576250457 21.652249676234 -3.24829205118824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.502457204415693 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 T:C T C 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 90 90 180 42.4706714424132 47.5293285575868 -5.05865711517353 A:G A G 10 0.528103650639853 0.456311588543145 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 30339120 C/A 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:C C A 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 30339234 T/C 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000483326:exon_30339217_30339501:LTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 30408670 A/T 1 50 75 125 23.5948174680073 39.607773797989 -16.0129563299816 A:T A T 10 0.528103650639853 0.00527360958463164 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30408592_30408695:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30408592_30408695:USP16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 7 18 25 3.30327444552103 9.50586571151735 -6.20259126599632 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0153814544149345 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 24 19 43 11.3255123846435 10.0339693621572 1.29154302248632 C:G G C 10 0.528103650639853 0.76101309367585 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 97 112 209 45.7739458879343 59.1476088716635 -13.3736629837293 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0714432647054545 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 123 165 288 58.0432509712981 87.1371023555757 -29.0938513842777 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000607749904637931 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 248 203 451 117.030294641316 107.20504107989 9.82525356142631 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.370301432421023 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 8 44 52 3.77517079488118 23.2365606281535 -19.4613898332724 T:C T C 10 0.528103650639853 3.0390251350827e-08 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 193 213 406 91.0759954265084 112.486077586289 -21.4100821597803 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0367014677526257 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 36080290 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36080242_36080367:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36080242_36080367:CLIC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:T:G T G 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 42749081 T/C 1 138 96 234 65.1216962117003 50.6979504614259 14.4237457502744 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.0665366172952189 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 57 71 128 26.8980919135284 37.4953591954296 -10.5972672819012 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0632744654878778 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 563 536 1099 265.677644689763 283.063556742961 -17.3859120531985 A:G G A 10 0.528103650639853 0.30431832766927 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 252 230 482 118.917880038757 121.463839647166 -2.54595960840913 A:G A G 10 0.528103650639853 0.819727824841817 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 43221555 G/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 0 0 27 27 0 14.258798567276 -14.258798567276 T C T 10 0.528103650639853 1.56263905859092e-09 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 C:G C G 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44299532 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44299517_44299641:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44299517_44299665:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44299517_44299625:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44299197_44299620:WDR4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 56 25 81 26.4261955641682 13.2025912659963 13.2236042981719 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00358485049209464 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 74 52 126 34.9203298526509 27.4613898332724 7.45894001937852 A:T:G T G 10 0.528103650639853 0.211443999123350 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 37 35 72 17.4601649263254 18.4836277723949 -1.02346284606941 A:G G A 10 0.528103650639853 0.814591042277998 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 44838330 C/A 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:C C A 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000142178:ENST00000270162:exon_44838140_44838421:SIK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 36 17 53 16.9882685769653 8.9777620608775 8.01050651608779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0280884113696715 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45107562 T/C 1 21 26 47 9.90982333656309 13.7306949166362 -3.82087158007309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.306964024826106 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45110305 C/T 1 24 18 42 11.3255123846435 9.50586571151735 1.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.644103924037243 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45110169_45110321:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45110169_45110321:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45110169_45110321:RRP1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 41 22 63 19.347750323766 11.6182803140768 7.72947000968926 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0580771172276703 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 126 112 238 59.4589400193785 59.1476088716635 0.311331147714988 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45527291 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45527176_45527315:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45527254_45527315:PWP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 82 80 162 38.6955006475321 42.2482920511882 -3.55279140365618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.582704647474372 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 45833839 G/A 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45833774_45833957:TRPM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 71 66 137 33.5046408045704 34.8548409422303 -1.35020013765986 T:C C T 10 0.528103650639853 0.864220410445635 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:C C A 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 17590599 C/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 18300348 A/G 1 24 8 32 11.3255123846435 4.22482920511882 7.1006831795247 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0127077595777180 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 18301600 G/A 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 18348768 G/A 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18348690_18348778:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18348690_18348778:MICAL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 18354766 C/T 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 T:C C T 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000465886:exon_18354696_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000498345:exon_18354700_18354789:MICAL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19028643 C/T 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19028571_19029472:DGCR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 31 20 51 14.6287868301646 10.5620730127971 4.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.265454526986781 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19776103 G/A 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19770747_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19775938_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000405009:exon_19775941_19776149:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19775987_19776483:GNB1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19949952 A/G 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 50 49 99 23.5948174680073 25.8770788813528 -2.28226141334545 T:C C T 10 0.528103650639853 0.687631334400607 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 39 27 66 18.4039576250457 14.258798567276 4.1451590577697 C:G C G 10 0.528103650639853 0.326059915889846 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 81 97 178 38.2236042981719 51.2260541120657 -13.0024498138938 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0602388634610659 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 19956269 C/A 1 115 119 234 54.2680801764169 62.8443344261425 -8.57625424972559 A:C C A 10 0.528103650639853 0.266308793350085 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19956059_19957498:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19956059_19956481:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19956059_19956521:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19956059_19956539:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19956059_19956539:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19956059_19957498:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19956059_19956533:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19956059_19957498:COMT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 54 37 91 25.4824028654479 19.5398350736746 5.94256779177338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.248025238294227 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 21348914 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21348847_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000495142:exon_21348616_21349016:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000491432:exon_21348766_21349016:LZTR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 20 22 42 9.43792698720294 11.6182803140768 -2.18035332687382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.5386334947568 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 23523630 C/A 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:C C A 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23522397_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23523071_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23523071_23524426:BCR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 A:G A G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 24095337 C/T 1 119 83 202 56.1556655738575 43.8326030031078 12.3230625707497 T:C C T 10 0.528103650639853 0.090629590753315 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 274 229 503 129.29959972468 120.935735996526 8.36386372815396 A:G G A 10 0.528103650639853 0.474976628968897 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 64 72 136 30.2013663590494 38.0234628460694 -7.82209648702 C:G G C 10 0.528103650639853 0.197646665551288 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 29726466 G/A 1 40 34 74 18.8758539744059 17.955524121755 0.92032985265088 A:G G A 10 0.528103650639853 0.907442424798333 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29726181_29726521:AP1B1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 76 71 147 35.8641225513712 37.4953591954296 -1.63123664405839 A:G G A 10 0.528103650639853 0.804672365056934 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.253776528805514 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 14 13 27 6.60654889104206 6.86534745831809 -0.258798567276031 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 36 25 61 16.9882685769653 13.2025912659963 3.78567731096897 A:C C A 10 0.528103650639853 0.370356569936942 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 30776095 C/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000463319:exon_30776051_30776194:RNF215 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 11 2 13 5.19085984296162 1.05620730127971 4.13465254168191 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0251289067861436 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 C:G G C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 31679110 G/C 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 C:G G C 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000100100:ENST00000215912:exon_31677579_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000480654:exon_31677580_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000416925:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000441972:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000493034:exon_31677665_31679274:PIK3IP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 17 18 35 8.0222379391225 9.50586571151735 -1.48362777239485 A:G G A 10 0.528103650639853 0.616977588104617 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 19 30 49 8.96603063784279 15.8431095191956 -6.8770788813528 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0619291597443312 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 292 413 705 137.793734013163 218.106807714259 -80.3130737010964 A:G G A 10 0.528103650639853 1.71109966917279e-09 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 26 19 45 12.2693050833638 10.0339693621572 2.23533572120662 A:T:G T G 10 0.528103650639853 0.552316704024384 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 21 11 32 9.90982333656309 5.80914015703838 4.10068317952471 T:G G T 10 0.528103650639853 0.159934326105865 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 70 53 123 33.0327444552103 27.9894934839122 5.04325097129808 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.368308162132128 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 158 230 388 74.5596231989032 121.463839647166 -46.904216448263 A:T:C C T 10 0.528103650639853 2.04338710418662e-06 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 56 48 104 26.4261955641682 25.3489752307129 1.07722033345529 A:G A G 10 0.528103650639853 0.844991703176229 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 A:G A G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 28 22 50 13.2130977820841 11.6182803140768 1.59481746800735 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.673595742943965 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 464 406 870 218.959906103108 214.41008215978 4.54982394332791 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.760042457275089 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 37699377 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37699295_37699443:CYTH4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 38035851 A/G 1 18 24 42 8.49413428848265 12.6744876153565 -4.18035332687383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.217890022301436 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38035057_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38035482_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38035700_38035853:SH3BP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 11 24 35 5.19085984296162 12.6744876153565 -7.48362777239485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0165017203775963 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 683 699 1382 322.30520661298 369.144451797257 -46.8392451842769 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.0122004213419572 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 T:G G T 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 38699004 C/T 1 29 22 51 13.6849941314443 11.6182803140768 2.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.578356063973385 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000451964:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38698866_38699014:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38698866_38699014:CSNK1E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39064088 C/T 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000100211:ENST00000485501:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000475924:exon_39064022_39064472:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000411557:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000492537:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000416285:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000492576:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39064022_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000467118:exon_39063901_39064137:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39063927_39064137:CBY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 21 25 46 9.90982333656309 13.2025912659963 -3.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.376505141745722 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 62 64 126 29.2575736603291 33.7986336409506 -4.54105998062148 T:C C T 10 0.528103650639853 0.423456286897763 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 39 47 86 18.4039576250457 24.8208715800731 -6.41691395502735 T:C T C 10 0.528103650639853 0.194715964267388 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 40 37 77 18.8758539744059 19.5398350736746 -0.663981099268678 C:G G C 10 0.528103650639853 0.909444223792204 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 C:G G C 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 17 0 17 8.0222379391225 0 8.0222379391225 A A 10 0.528103650639853 2.21833303698710e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 17 3 20 8.0222379391225 1.58431095191956 6.43792698720294 C:G G C 10 0.528103650639853 0.005637624961023 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 41 35 76 19.347750323766 18.4836277723949 0.864122551371175 C:G G C 10 0.528103650639853 0.908695933744017 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 372 388 760 175.545441961975 204.904216448263 -29.3587744862883 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0350413446753213 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 40803186 G/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:G G T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40803021_40803572:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802442_40804433:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000481408:exon_40803021_40803332:SGSM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 T:C C T 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 41527632 A/T 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 A:T A T 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41527392_41527637:EP300 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 29 26 55 13.6849941314443 13.7306949166362 -0.0457007851919151 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 124 212 336 58.5151473206582 111.957973935649 -53.4428266149906 A:G G A 10 0.528103650639853 5.34359440499304e-09 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 21 37 58 9.90982333656309 19.5398350736746 -9.63001173711147 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0122801780031477 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 19 5 24 8.96603063784279 2.64051825319926 6.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0125725185126960 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 89 168 257 41.9987750930531 88.7214133074953 -46.7226382144422 C:G G C 10 0.528103650639853 6.22820296429067e-09 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 36 48 84 16.9882685769653 25.3489752307129 -8.36070665374765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0798925812591659 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 35 53 88 16.5163722276051 27.9894934839122 -11.4731212563071 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0183194659589973 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 A:G A G 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 33 37 70 15.5725795288849 19.5398350736746 -3.96725554478971 A:G A G 10 0.528103650639853 0.402211150238619 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 37 25 62 17.4601649263254 13.2025912659963 4.25757366032911 T:C C T 10 0.528103650639853 0.309908380115069 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 28 20 48 13.2130977820841 10.5620730127971 2.65102476928706 A:G A G 10 0.528103650639853 0.472712139498177 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44495983 A/G 1 54 47 101 25.4824028654479 24.8208715800731 0.661531285374849 A:G A G 10 0.528103650639853 0.92088740762116 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44495933_44496003:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44495933_44496003:PARVB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 141 146 287 66.5373852597807 77.1031329934185 -10.5657477336378 A:C A C 10 0.528103650639853 0.214894199607435 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 45723854 C/G 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 C:G C G 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 11 4 15 5.19085984296162 2.11241460255941 3.07844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.127145755019567 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50277835 T/C 1 22 8 30 10.3817196859232 4.22482920511882 6.15689048080441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0276266387995477 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50277883 A/G 1 28 12 40 13.2130977820841 6.33724380767824 6.87585397440588 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0382827144798061 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50278438 A/G 1 22 20 42 10.3817196859232 10.5620730127971 -0.180353326873824 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50278568 A/G 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50278642 C/T 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50280136 T/C 1 26 25 51 12.2693050833638 13.2025912659963 -0.933286182632504 T:C T C 10 0.528103650639853 0.88864928991479 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 18 22 40 8.49413428848265 11.6182803140768 -3.12414602559412 T:C T C 10 0.528103650639853 0.345175829251647 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 13 3 16 6.13465254168191 1.58431095191956 4.55034158976235 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0244607240599101 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50319079 T/G 1 41 20 61 19.347750323766 10.5620730127971 8.78567731096897 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0286176755880887 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50319170 A/G 1 63 36 99 29.7294700096893 19.0117314230347 10.7177385866546 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0342527459406828 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C T C 10 0.528103650639853 0.795116119978559 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 120 109 229 56.6275619232176 57.563297919744 -0.935735996526333 T:C T C 10 0.528103650639853 0.947248918641118 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 78 79 157 36.8079152500915 41.7201884005484 -4.91227315045692 C:G G C 10 0.528103650639853 0.472020750362052 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 C:G G C 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 11 6 17 5.19085984296162 3.16862190383912 2.0222379391225 T:C T C 10 0.528103650639853 0.345327913480538 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50682865 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50682148_50682993:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50682148_50683421:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50682148_50683400:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50682148_50683400:TUBGCP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50684312 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 T:C T C 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 64 72 136 30.2013663590494 38.0234628460694 -7.82209648702 A:G G A 10 0.528103650639853 0.197646665551288 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50716564 C/T 1 44 64 108 20.7634393718465 33.7986336409506 -13.0351942691041 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0122570945297829 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716546_50716700:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000411680:exon_50716546_50716700:PLXNB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 71 83 154 33.5046408045704 43.8326030031078 -10.3279621985374 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.106306279553495 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 14 18 32 6.60654889104206 9.50586571151735 -2.8993168204753 T:C T C 10 0.528103650639853 0.376496178274613 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 53 48 101 25.0105065160878 25.3489752307129 -0.338468714625154 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:G T G 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 62 45 107 29.2575736603291 23.7646642787934 5.49290938153573 A:G A G 10 0.528103650639853 0.332940029856256 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 18 28 46 8.49413428848265 14.7869022179159 -6.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0757808345697918 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 15 7 22 7.07844524040221 3.69672555447897 3.38171968592323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.199779915400287 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 10 17 27 4.71896349360147 8.9777620608775 -4.25879856727603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.123013332822349 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 99 97 196 46.7177385866546 51.2260541120657 -4.50831552541118 T:G T G 10 0.528103650639853 0.520689873586023 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 42 37 79 19.8196466731262 19.5398350736746 0.279811599451616 T:C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 38 20 58 17.9320612756856 10.5620730127971 7.36998826288853 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0648011869640783 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 20 12 32 9.43792698720294 6.33724380767824 3.1006831795247 T:C T C 10 0.528103650639853 0.293179899019863 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 4354697 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000430981:exon_4354582_4356086:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000462115:exon_4354582_4354785:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4354582_4355445:SETMAR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G A G 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 8809184 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 20 29 49 9.43792698720294 15.3150058685557 -5.8770788813528 T:C T C 10 0.528103650639853 0.114790067649252 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 7 12 19 3.30327444552103 6.33724380767824 -3.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.175700689513822 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9506176 T/G 1 47 38 85 22.1791284199269 20.0679387243144 2.1111896956125 T:G T G 10 0.528103650639853 0.66541528441886 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000443339:exon_9506109_9506437:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000488236:exon_9506109_9506638:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000421188:exon_9506109_9506356:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000478961:exon_9506109_9506494:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000476740:exon_9506109_9506377:SETD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 38 32 70 17.9320612756856 16.8993168204753 1.03274445521029 C:G G C 10 0.528103650639853 0.81227256630959 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 38 34 72 17.9320612756856 17.955524121755 -0.023462846069414 T:C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 39 35 74 18.4039576250457 18.4836277723949 -0.0796701473491197 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:G T G 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 35 30 65 16.5163722276051 15.8431095191956 0.673262708409556 T:C C T 10 0.528103650639853 0.90163495487036 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 27 28 55 12.741201432724 14.7869022179159 -2.04570078519192 A:G A G 10 0.528103650639853 0.591920874619508 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 44 52 96 20.7634393718465 27.4613898332724 -6.69795046142589 A:G G A 10 0.528103650639853 0.184357029229119 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 22 21 43 10.3817196859232 11.0901766634369 -0.708456977513677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.879218371784125 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 28 20 48 13.2130977820841 10.5620730127971 2.65102476928706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.472712139498177 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 20 18 38 9.43792698720294 9.50586571151735 -0.0679387243144127 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 12627303 A/C 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:C A C 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000132155:ENST00000471449:exon_12627180_12627404:RAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 A:T A T 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 31 42 73 14.6287868301646 22.1803533268738 -7.55156649670927 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0796254707045568 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 14220023 G/C 1 28 16 44 13.2130977820841 8.44965841023765 4.76343937184647 C:G G C 10 0.528103650639853 0.174681607618319 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14219966_14220283:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14219966_14220172:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14219966_14220101:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14219984_14220121:XPC;ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14219858_14220381:LSM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 14526538 G/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000131389:ENST00000454876:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000458124:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000360861:exon_14526375_14530855:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000451687:exon_14526375_14530855:SLC6A6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 15 5 20 7.07844524040221 2.64051825319926 4.43792698720294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.070570681987361 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 C:G C G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 58 32 90 27.3699882628885 16.8993168204753 10.4706714424132 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0341393701352173 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 464 388 852 218.959906103108 204.904216448263 14.0556896548453 T:C T C 10 0.528103650639853 0.336908911032409 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 317 277 594 149.591142747167 146.284711227239 3.30643151992732 A:C A C 10 0.528103650639853 0.805295219364027 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 16419309 C/T 1 343 293 636 161.86044783053 154.734369637477 7.1260781930535 T:C C T 10 0.528103650639853 0.578425217963095 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000451036:exon_16419226_16419609:RFTN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 20113830 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20113825_20113951:KAT2B;ENSG00000114166:ENST00000426228:exon_20113825_20113951:KAT2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:G T G 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 12 12 24 5.66275619232176 6.33724380767824 -0.674487615356473 A:T T A 10 0.528103650639853 0.839700696621906 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 26 23 49 12.2693050833638 12.1463839647166 0.122921118647204 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 23 19 42 10.8536160352834 10.0339693621572 0.819646673126176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.877667714203748 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C:G T G 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 26 19 45 12.2693050833638 10.0339693621572 2.23533572120662 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.552316704024384 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 27 30 57 12.741201432724 15.8431095191956 -3.10190808647162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.428579027335235 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 28 29 57 13.2130977820841 15.3150058685557 -2.10190808647162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.597826186588612 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 86 68 154 40.5830860449726 35.91104824351 4.67203780146264 A:G A G 10 0.528103650639853 0.468426141070604 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 39111140 C/A 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 A:C:G C A 10 0.528103650639853 0.368322400865039 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39111134_39111181:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39111134_39111235:WDR48 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 39139776 G/A 1 24 20 44 11.3255123846435 10.5620730127971 0.763439371846468 A:G G A 10 0.528103650639853 0.880578951681275 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 39139840 C/T 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 60 24 84 28.3137809616088 12.6744876153565 15.6392933462523 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000630254621024182 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 41996136 T/C 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000168038:ENST00000301831:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000420927:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000497684:exon_41996114_41996290:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000453224:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000431379:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000414606:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000460978:exon_41996114_41996299:ULK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 28 18 46 13.2130977820841 9.50586571151735 3.70723207056676 T:C C T 10 0.528103650639853 0.303248314500651 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 43 33 76 20.2915430224863 17.4274204711151 2.86412255137117 T:C T C 10 0.528103650639853 0.566217517691331 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 31 23 54 14.6287868301646 12.1463839647166 2.48240286544794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.58606132487831 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 14 13 27 6.60654889104206 6.86534745831809 -0.258798567276031 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 43743787 A/T 1 10 18 28 4.71896349360147 9.50586571151735 -4.78690221791588 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0876736090199602 ENSG00000011198:ENST00000456453:exon_43743707_43744076:ABHD5;ENSG00000011198:ENST00000458276:exon_43743707_43744079:ABHD5;ENSG00000011198:ENST00000013894:exon_43743707_43744079:ABHD5;ENSG00000011198:ENST00000454293:exon_43743707_43743831:ABHD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 C:G C G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:C C A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 45754685 A/G 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45754629_45754688:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45754629_45754688:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000463237:exon_45754629_45754903:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45754629_45754688:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45754629_45754688:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000445499:exon_45754633_45754688:SACM1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 14 8 22 6.60654889104206 4.22482920511882 2.38171968592323 A:T A T 10 0.528103650639853 0.394433566707544 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 46008790 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 46009491 C/T 1 4 9 13 1.88758539744059 4.75293285575868 -2.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.163442331272679 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 46009864 C/G 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 C:G C G 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47036565 G/A 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47036578 G/A 1 8 20 28 3.77517079488118 10.5620730127971 -6.78690221791588 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0127969504016873 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 24 25 49 11.3255123846435 13.2025912659963 -1.8770788813528 T:C C T 10 0.528103650639853 0.668300217735918 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 129 98 227 60.874629067459 51.7541577627056 9.12047130475337 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.232030170411603 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 45 51 96 21.2353357212066 26.9332861826325 -5.69795046142589 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.261518961216216 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 80 84 164 37.7517079488118 44.3607066537476 -6.60899870493589 A:G G A 10 0.528103650639853 0.310088580359364 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 42 36 78 19.8196466731262 19.0117314230347 0.807915250091469 T:C C T 10 0.528103650639853 0.909914342268573 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A,C 0 0 44 44 0 23.2365606281535 -23.2365606281535 A:C G A 10 0.528103650639853 4.45914068793868e-15 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47702865 C/T 1 25 23 48 11.7974087340037 12.1463839647166 -0.348975230712943 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47702784_47702945:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47702784_47702945:SMARCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 34 40 74 16.044475878245 21.1241460255941 -5.07967014734912 T:C T C 10 0.528103650639853 0.246197995547052 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 15 14 29 7.07844524040221 7.39345110895794 -0.315005868555737 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 25 28 53 11.7974087340037 14.7869022179159 -2.98949348391221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.413540200884492 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 25 5 30 11.7974087340037 2.64051825319926 9.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000730332497860733 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 18 21 39 8.49413428848265 11.0901766634369 -2.59604237495427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.426412497795246 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 61 72 133 28.785677310969 38.0234628460694 -9.23778553510045 T:C T C 10 0.528103650639853 0.118019719273851 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 69 53 122 32.5608481058501 27.9894934839122 4.57135462193793 A:G G A 10 0.528103650639853 0.416094139311961 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 18 29 47 8.49413428848265 15.3150058685557 -6.82087158007309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0567243206581705 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:T T A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:G T G 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50357869 A/C 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50357000_50360213:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000481597:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000458018:exon_50357558_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000424190:exon_50357568_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000426286:exon_50357677_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000428028:exon_50357691_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000415028:exon_50357778_50357966:HYAL2;ENSG00000114383:ENST00000462137:exon_50357458_50357966:TUSC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:G T G 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 91 105 196 42.9425677917734 55.4508833171846 -12.5083155254112 A:T:C A C 10 0.528103650639853 0.0741368383059776 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 45 53 98 21.2353357212066 27.9894934839122 -6.75415776270559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.188634289706489 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52255239 G/A 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 97 71 168 45.7739458879343 37.4953591954296 8.2785866925047 T:C T C 10 0.528103650639853 0.216497887993904 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52265215 G/A 1 92 83 175 43.4144641411335 43.8326030031078 -0.418138861974271 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265143_52265247:TWF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52429665 C/T 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C C T 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52429563_52429694:DNAH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52492707 T/C 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 T:C T C 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000433196:exon_52492678_52492800:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000488380:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000420808:exon_52492678_52492860:NISCH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52558480 G/A 1 75 139 214 35.392226202011 73.4064074389396 -38.0141812369285 A:G G A 10 0.528103650639853 2.14890050424260e-07 ENSG00000010327:ENST00000321725:exon_52558316_52558511:STAB1;ENSG00000010327:ENST00000462741:exon_52558316_52558509:STAB1;ENSG00000010327:ENST00000469989:exon_52558316_52558511:STAB1;ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52558386_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52558401_52558627:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000479024:exon_52558403_52558627:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52558403_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52558405_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000462261:exon_52558417_52558747:NT5DC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52559042 C/T 1 74 101 175 34.9203298526509 53.3384687146252 -18.4181388619743 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00626323411878586 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000479024:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000462261:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52558979_52559119:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000469616:exon_52558833_52559076:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000466112:exon_52558979_52559119:NT5DC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52584787 T/C 1 3 11 14 1.41568904808044 5.80914015703838 -4.39345110895794 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0287103645641043 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52584763_52584833:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52584763_52584833:PBRM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 269 229 498 126.94011797788 120.935735996526 6.00438198135322 A:G G A 10 0.528103650639853 0.621560641884157 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52800284 T/C 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52800194_52800391:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52800194_52800391:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52800194_52800391:NEK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52802402 A/C 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:C A C 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52802354_52802620:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52802354_52802620:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000496822:exon_52802354_52802582:NEK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 18 6 24 8.49413428848265 3.16862190383912 5.32551238464353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0390594566667783 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 36 31 67 16.9882685769653 16.3712131698354 0.61705540712985 T:C T C 10 0.528103650639853 0.903215168481274 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 73 121 194 34.4484335032907 63.9005417274222 -29.4521082241315 A:G G A 10 0.528103650639853 2.67333472586785e-05 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 43 49 92 20.2915430224863 25.8770788813528 -5.58553585886647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.252203118452449 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 6 16 22 2.83137809616088 8.44965841023765 -5.61828031407677 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0185439039172996 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53883797 T/A 1 27 65 92 12.741201432724 34.3267372915904 -21.5855358588665 A:T T A 10 0.528103650639853 8.04659353705796e-06 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56657197 T/C 1 69 59 128 32.5608481058501 31.1581153877513 1.40273271809881 T:C T C 10 0.528103650639853 0.859585481007013 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56654161_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56654573_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56656766_56657871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56656887_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56656974_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56657065_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000485156:exon_56657145_56657871:C3orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 47 39 86 22.1791284199269 20.5960423749543 1.58308604497265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.747261397482476 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 1 42 38 80 19.8196466731262 20.0679387243144 -0.248292051188237 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56763619 A/G 1 47 52 99 22.1791284199269 27.4613898332724 -5.28226141334545 A:G A G 10 0.528103650639853 0.314494283115405 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 45 54 99 21.2353357212066 28.5175971345521 -7.28226141334545 C:G C G 10 0.528103650639853 0.158768796547868 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 57542173 C/T 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000174840:ENST00000487257:exon_57542003_57543414:PDE12;ENSG00000174840:ENST00000311180:exon_57542004_57543414:PDE12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 T:C C T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 30 27 57 14.1568904808044 14.258798567276 -0.101908086471621 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58112440 A/G 1 19 10 29 8.96603063784279 5.28103650639853 3.68499413144426 A:G A G 10 0.528103650639853 0.195389720971694 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 31 29 60 14.6287868301646 15.3150058685557 -0.686219038391179 T:C C T 10 0.528103650639853 0.897533712311774 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 27 23 50 12.741201432724 12.1463839647166 0.594817468007351 A:G G A 10 0.528103650639853 0.888373473926872 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 41 47 88 19.347750323766 24.8208715800731 -5.47312125630706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.285596291109463 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 12 21 33 5.66275619232176 11.0901766634369 -5.42742047111515 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0797424808549282 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 47 15 62 22.1791284199269 7.92155475959779 14.2575736603291 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000294989428197779 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58382846 C/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 T:C C T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58382766_58382927:PXK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58395863 A/G 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000459676:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000495557:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58395817_58395886:PXK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 31 24 55 14.6287868301646 12.6744876153565 1.95429921480808 T:C C T 10 0.528103650639853 0.6857994205545 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.368322400865039 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 40 44 84 18.8758539744059 23.2365606281535 -4.36070665374765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.382250612552397 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 64009117 T/A 1 69 54 123 32.5608481058501 28.5175971345521 4.04325097129808 A:T T A 10 0.528103650639853 0.471804945236246 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64008951_64009236:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64008951_64009148:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64008727_64009154:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64008951_64009132:PSMD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 44 39 83 20.7634393718465 20.5960423749543 0.167396996892204 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 73114232 C/T 1 68 64 132 32.08895175649 33.7986336409506 -1.70968188446059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.794012570779424 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 36 38 74 16.9882685769653 20.0679387243144 -3.07967014734912 T:C T C 10 0.528103650639853 0.486910633707072 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 93768268 C/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 C:G C G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000169379:ENST00000303097:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000394222:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000471138:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000460371:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000335438:exon_93768250_93768366:ARL13B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 93779860 C/T 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000178700:ENST00000314636:exon_93776766_93780450:DHFRL1;ENSG00000178700:ENST00000394221:exon_93776768_93780450:DHFRL1;ENSG00000178700:ENST00000461173:exon_93778823_93780450:DHFRL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 134 118 252 63.2341108142597 62.3162307755027 0.917880038757048 T:C C T 10 0.528103650639853 0.949713073480264 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 64 65 129 30.2013663590494 34.3267372915904 -4.12537093254104 A:G G A 10 0.528103650639853 0.481493511803338 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 138 141 279 65.1216962117003 74.4626147402193 -9.34091852851898 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.280481321034809 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 72 90 162 33.9765371539306 47.5293285575868 -13.5527914036562 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0337589374447427 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 14 4 18 6.60654889104206 2.11241460255941 4.49413428848265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0355692913440577 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 108298260 C/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108298128_108298273:KIAA1524 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 111286375 G/C 1 8 13 21 3.77517079488118 6.86534745831809 -3.09017666343691 C:G G C 10 0.528103650639853 0.195195777078582 ENSG00000153283:ENST00000352690:exon_111286370_111286494:CD96;ENSG00000153283:ENST00000283285:exon_111286370_111286494:CD96;ENSG00000153283:ENST00000438817:exon_111286370_111286494:CD96;ENSG00000153283:ENST00000488054:exon_111286370_111286494:CD96;ENSG00000153283:ENST00000494798:exon_111286370_111286494:CD96 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 57 59 116 26.8980919135284 31.1581153877513 -4.26002347422295 T:C T C 10 0.528103650639853 0.457410993537644 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 27 19 46 12.741201432724 10.0339693621572 2.70723207056676 A:G G A 10 0.528103650639853 0.462603643873888 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 113176122 G/A 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113175983_113176204:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113175983_113176204:SPICE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 113222036 G/A 1 3 13 16 1.41568904808044 6.86534745831809 -5.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00983635678273322 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113222027_113222074:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000495812:exon_113222027_113222074:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000480527:exon_113222027_113222074:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000460832:exon_113222027_113222074:SPICE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 113323793 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113323757_113323823:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113323757_113323823:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000480746:exon_113323757_113323822:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000463226:exon_113323757_113323823:SIDT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 C:G G C 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 33 46 79 15.5725795288849 24.2927679294332 -8.72018840054838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0552197985047828 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119128398 G/A 1 21 16 37 9.90982333656309 8.44965841023765 1.46016492632544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.742489529985631 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119128343_119128623:ARHGAP31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 74 65 139 34.9203298526509 34.3267372915904 0.593592561060433 A:G A G 10 0.528103650639853 0.932521538848719 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 35 28 63 16.5163722276051 14.7869022179159 1.72947000968926 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.706118249183617 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119242443 C/T 1 27 30 57 12.741201432724 15.8431095191956 -3.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.428579027335235 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 30 21 51 14.1568904808044 11.0901766634369 3.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.40410666509233 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 A:T T A 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 26 28 54 12.2693050833638 14.7869022179159 -2.51759713455206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.499251618178376 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 9 17 26 4.24706714424132 8.9777620608775 -4.73069491663618 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.0767273473177002 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 9 16 25 4.24706714424132 8.44965841023765 -4.20259126599632 C:G C G 10 0.528103650639853 0.109639086474819 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 18 11 29 8.49413428848265 5.80914015703838 2.68499413144426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.35634147043118 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 120500186 A/T 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 A:T A T 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121208833 G/C 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 C:G G C 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 138 145 283 65.1216962117003 76.5750293427787 -11.4533331310784 T:C C T 10 0.528103650639853 0.190160276030637 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 155 183 338 73.1439341508228 96.6429680670931 -23.4990339162703 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0120965187503797 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 39 35 74 18.4039576250457 18.4836277723949 -0.0796701473491197 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121435621 T/C 1 15 6 21 7.07844524040221 3.16862190383912 3.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.124351877629196 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121435624 C/T 1 15 6 21 7.07844524040221 3.16862190383912 3.90982333656309 T:C C T 10 0.528103650639853 0.124351877629196 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121435584_121435986:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121435584_121435986:GOLGB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 45 30 75 21.2353357212066 15.8431095191956 5.39222620201103 T:C C T 10 0.528103650639853 0.247480356672606 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 54 70 124 25.4824028654479 36.9672555447897 -11.4848526793418 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.0474000278607465 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 122259640 T/C 1 52 54 106 24.5386101667276 28.5175971345521 -3.97898696782442 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.43870385965239 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 15 30 45 7.07844524040221 15.8431095191956 -8.76466427879338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0105707878168005 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 122335878 C/G 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 C:G C G 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122335862_122336011:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122335862_122336011:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122335862_122336011:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122335862_122336011:PARP15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 32 29 61 15.1006831795247 15.3150058685557 -0.214322689031032 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 86 71 157 40.5830860449726 37.4953591954296 3.08772684954308 C:G G C 10 0.528103650639853 0.632476478729341 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 55 57 112 25.9542992148081 30.1019080864716 -4.14760887166354 T:C C T 10 0.528103650639853 0.449996486689106 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 195 91 286 92.0197881252287 48.0574322082266 43.962355917002 A:G A G 10 0.528103650639853 1.52516151106822e-07 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 125 44 169 58.9870436700184 23.2365606281535 35.7504830418649 A:T:G A G 10 0.528103650639853 1.92401030047986e-08 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 125 50 175 58.9870436700184 26.4051825319927 32.5818611380257 T:C C T 10 0.528103650639853 6.48709044410215e-07 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 126194076 T/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126193802_126194762:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126193802_126194708:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126193802_126194708:ZXDC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 126736618 C/T 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126736592_126736735:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126736592_126736735:PLXNA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 41 36 77 19.347750323766 19.0117314230347 0.336018900731322 A:T:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 44 56 100 20.7634393718465 29.5738044358318 -8.8103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0883435361674672 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 127441239 T/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T T A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 178 202 380 83.9975501861062 106.67693742925 -22.6793872431441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0207285714676671 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 128614214 G/A 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 432 423 855 203.859222923584 223.387844220658 -19.5286212970743 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.181770060574689 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 57 59 116 26.8980919135284 31.1581153877513 -4.26002347422295 T:C T C 10 0.528103650639853 0.457410993537644 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 98 65 163 46.2458422372944 34.3267372915904 11.919104945704 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0708680730240154 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 173 130 303 81.6380684393054 68.6534745831809 12.9845938561245 A:G G A 10 0.528103650639853 0.150175946425593 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 28 26 54 13.2130977820841 13.7306949166362 -0.517597134552062 T:C C T 10 0.528103650639853 0.892562750123292 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 27 23 50 12.741201432724 12.1463839647166 0.594817468007351 T:G T G 10 0.528103650639853 0.888373473926872 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 11 20 31 5.19085984296162 10.5620730127971 -5.37121316983544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0706075298577317 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 C C 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 18 7 25 8.49413428848265 3.69672555447897 4.79740873400368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0701677836939822 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 A:G G A 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 21 17 38 9.90982333656309 8.9777620608775 0.932061275685587 A:T T A 10 0.528103650639853 0.871270719218986 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 59 60 119 27.8418846122487 31.6862190383912 -3.84433442614251 T:G T G 10 0.528103650639853 0.520707308475992 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 141164140 C/G 1 78 81 159 36.8079152500915 42.7763957018281 -5.96848045173662 A:C:G C G 10 0.528103650639853 0.382319239271477 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 42 0 42 19.8196466731262 0 19.8196466731262 G G 10 0.528103650639853 3.22172289516461e-12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 15 17 32 7.07844524040221 8.9777620608775 -1.8993168204753 T:C C T 10 0.528103650639853 0.596146570062849 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 48 52 100 22.6510247692871 27.4613898332724 -4.8103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.367710576906065 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 31 25 56 14.6287868301646 13.2025912659963 1.42619556416823 T:G T G 10 0.528103650639853 0.789306061307979 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 185 0 185 87.3008246316272 0 87.3008246316272 T T 10 0.528103650639853 5.39387718135967e-52 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 155571275 T/C 1 19 22 41 8.96603063784279 11.6182803140768 -2.65224967623397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.436883368571926 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000475842:exon_155571160_155571280:SLC33A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 83 103 186 39.1673969968922 54.3946760159049 -15.2272790190127 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0274520918330957 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 109 81 190 51.436702080256 42.7763957018281 8.66030637842793 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.217231484037067 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 156272886 C/G 1 33 16 49 15.5725795288849 8.44965841023765 7.1229211186472 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0452408280243081 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156272746_156272973:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156272746_156272938:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156272746_156272914:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156272746_156272906:SSR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 156272887 T/G 1 29 6 35 13.6849941314443 3.16862190383912 10.5163722276051 T:G T G 10 0.528103650639853 0.000278744655469914 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156272746_156272973:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156272746_156272938:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156272746_156272914:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156272746_156272906:SSR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 156870816 A/G 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000163660:ENST00000464316:exon_156869966_156872455:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000474539:exon_156868071_156871617:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000467081:exon_156870529_156870945:CCNL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 A:C C A 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 25 27 52 11.7974087340037 14.258798567276 -2.46138983327236 A:G G A 10 0.528103650639853 0.578931495519633 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 12 20 32 5.66275619232176 10.5620730127971 -4.8993168204753 T:C T C 10 0.528103650639853 0.109805506996986 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 69 74 143 32.5608481058501 39.0796701473491 -6.51882204149898 T:C C T 10 0.528103650639853 0.277621341766265 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 160118695 C/T 0 22 0 22 10.3817196859232 0 10.3817196859232 C C 10 0.528103650639853 8.6077904648797e-07 ENSG00000113810:ENST00000497311:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465903:exon_160118388_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485645:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160118610_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160118416_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160117456_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000490207:exon_160118416_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160118270_160118753:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160118615_160118753:SMC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 170078232 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000136603:ENST00000476188:exon_170078109_170078488:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000259119:exon_170077487_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000426052:exon_170078156_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000413427:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000458537:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000431185:exon_170078120_170079217:SKIL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 171969077 C/G 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 C:G C G 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000075420:ENST00000415807:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000469491:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000336824:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000416957:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000443501:exon_171969050_171969246:FNDC3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 25 18 43 11.7974087340037 9.50586571151735 2.29154302248632 A:G A G 10 0.528103650639853 0.542748796814479 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 45 141 186 21.2353357212066 74.4626147402193 -53.2272790190126 T:C T C 10 0.528103650639853 2.20582381623810e-15 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:G T G 10 0.528103650639853 0.75776913662152 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 179092989 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 69 52 121 32.5608481058501 27.4613898332724 5.09945827257778 T:C C T 10 0.528103650639853 0.364004569726765 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 114 83 197 53.7961838270568 43.8326030031078 9.96358082394896 T:C T C 10 0.528103650639853 0.175005401463580 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183211906 A/G 1 22 11 33 10.3817196859232 5.80914015703838 4.57257952888485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.119452299415424 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183212026 C/T 1 32 15 47 15.1006831795247 7.92155475959779 7.17912841992691 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0404955854300038 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183217574 C/T 1 21 9 30 9.90982333656309 4.75293285575868 5.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0677902526741492 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183217378_183217615:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183217378_183217615:KLHL6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183226114 G/T 1 36 13 49 16.9882685769653 6.86534745831809 10.1229211186472 T:G G T 10 0.528103650639853 0.00390609574434313 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183225847_183226296:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183225847_183226296:KLHL6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183368216 A/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T A T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000493074:exon_183368084_183368526:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000437402:exon_183368084_183368326:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454495:exon_183368084_183368495:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000473045:exon_183368084_183368363:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468101:exon_183368084_183368378:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000427201:exon_183368084_183368485:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000482138:exon_183368084_183368546:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468001:exon_183368084_183368521:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000242809:exon_183368145_183368777:KLHL24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183368891 C/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 50 46 96 23.5948174680073 24.2927679294332 -0.697950461425886 A:G A G 10 0.528103650639853 0.918775099960552 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183861379 A/G 1 7 2 9 3.30327444552103 1.05620730127971 2.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.185897448916533 ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 23 24 47 10.8536160352834 12.6744876153565 -1.82087158007309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.661953577239643 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 21 24 45 9.90982333656309 12.6744876153565 -2.76466427879338 T:C T C 10 0.528103650639853 0.456623221741375 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 25 14 39 11.7974087340037 7.39345110895794 4.40395762504573 A:G A G 10 0.528103650639853 0.199135457015214 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 171 153 324 80.6942757405851 80.7998585478975 -0.105582807312359 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 184633247 A/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184633143_184633262:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184633143_184633262:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184633143_184633262:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184633143_184633262:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184633143_184633262:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000452140:exon_184633171_184633262:VPS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 184766325 G/A 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2380 10 2390 1123.11331147715 5.28103650639853 1117.83227497075 T:C:G G T 10 0.528103650639853 4.94065645841247e-324 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 5 18 23 2.35948174680074 9.50586571151735 -7.14638396471662 A:C C A 10 0.528103650639853 0.00301156022022803 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 104 64 168 49.0772203334553 33.7986336409506 15.2785866925047 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0202213220945525 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 189712010 G/A 1 49 29 78 23.1229211186472 15.3150058685557 7.80791525009147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0885771110648363 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189711883_189712072:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189711883_189712072:LEPREL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 44 35 79 20.7634393718465 18.4836277723949 2.27981159945162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.652943856721262 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 48 36 84 22.6510247692871 19.0117314230347 3.63929334625235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.44606791058276 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:G A G 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 192516430 C/T 1 44 33 77 20.7634393718465 17.4274204711151 3.33601890073132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.494087147403178 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 7 12 19 3.30327444552103 6.33724380767824 -3.03396936215721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.175700689513822 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 1 43 44 0.471896349360147 22.7084569775137 -22.2365606281535 A:T:C T C 10 0.528103650639853 2.240308603786e-13 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:C C A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:C C A 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 C:G C G 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 195027339 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195027240_195027345:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000484296:exon_195027240_195027594:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000439758:exon_195027240_195027345:ACAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 195066011 T/C 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195065988_195066046:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000423531:exon_195065988_195066046:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000480906:exon_195065988_195066046:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000481463:exon_195065988_195066046:ACAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 195595297 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 195802106 G/A 1 48 72 120 22.6510247692871 38.0234628460694 -15.3724380767824 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.00588113868137449 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195802030_195802231:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195802030_195802231:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000421258:exon_195802030_195802231:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000464011:exon_195802030_195802231:TFRC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 18 30 48 8.49413428848265 15.8431095191956 -7.34897523071294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0420647327317077 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 11 7 18 5.19085984296162 3.69672555447897 1.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.638176009359053 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 3 197665599 G/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197665419_197665903:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197665531_197665646:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197665537_197665646:IQCG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 2 21 23 0.943792698720294 11.0901766634369 -10.1463839647166 T:C C T 10 0.528103650639853 1.98644839734710e-05 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 0 0 25 25 0 13.2025912659963 -13.2025912659963 C T C 10 0.528103650639853 7.01722561804779e-09 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 12 3 15 5.66275619232176 1.58431095191956 4.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0393940244088059 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 A:G G A 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:C T C 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 T:C T C 10 0.528103650639853 0.7110881983466 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 A:G A G 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 675777 G/C 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 C:G G C 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 860986 T/C 1 43 36 79 20.2915430224863 19.0117314230347 1.27981159945162 T:C T C 10 0.528103650639853 0.822136184271989 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860744_861071:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860744_861006:GAK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 875814 C/T 1 25 15 40 11.7974087340037 7.92155475959779 3.87585397440588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.267888536179292 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_875695_875828:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_875695_875828:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_875695_875828:GAK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 43 32 75 20.2915430224863 16.8993168204753 3.39222620201103 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.488188037205272 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 1657281 G/A 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 G G 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000174137:ENST00000308132:exon_1656705_1657450:FAM53A;ENSG00000174137:ENST00000489363:exon_1656705_1657450:FAM53A;ENSG00000174137:ENST00000416791:exon_1656705_1657450:FAM53A;ENSG00000174137:ENST00000461064:exon_1656705_1657450:FAM53A;ENSG00000174137:ENST00000472884:exon_1656705_1657450:FAM53A;ENSG00000174137:ENST00000463238:exon_1657263_1657450:FAM53A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 1980561 C/T 1 30 37 67 14.1568904808044 19.5398350736746 -5.38294459287015 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.220952073263244 ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1980365_1980641:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1980365_1983934:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1980365_1983934:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000482415:exon_1980365_1981523:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382888:exon_1980365_1980642:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000350915:exon_1980365_1983930:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508299:exon_1980365_1980629:WHSC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2252237 C/T 0 50 0 50 23.5948174680073 0 23.5948174680073 C C 10 0.528103650639853 1.64805511078507e-14 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2249159_2252428:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2251191_2252428:MXD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 96 131 227 45.3020495385741 69.1815782338207 -23.8795286952466 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00172602772680231 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 64 99 163 30.2013663590494 52.2822614133454 -22.080895054296 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000694387809661547 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 A:C A C 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 T:G G T 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 20 18 38 9.43792698720294 9.50586571151735 -0.0679387243144127 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 30 24 54 14.1568904808044 12.6744876153565 1.48240286544794 T:G T G 10 0.528103650639853 0.785483090791565 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 83 69 152 39.1673969968922 36.4391518941499 2.72824510274234 T:G G T 10 0.528103650639853 0.685084005301091 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 71 56 127 33.5046408045704 29.5738044358318 3.93083636873867 C:G C G 10 0.528103650639853 0.534074997998688 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:C:G G A 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 2934808 T/C 1 8 14 22 3.77517079488118 7.39345110895794 -3.61828031407677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.138184227038771 ENSG00000109736:ENST00000509676:exon_2934327_2934936:MFSD10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 36 34 70 16.9882685769653 17.955524121755 -0.967255544789708 A:G G A 10 0.528103650639853 0.904823411472605 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 88 57 145 41.5268787436929 30.1019080864716 11.4249706572213 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.0669117903518038 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 47 21 68 22.1791284199269 11.0901766634369 11.08895175649 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00732320584549604 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 4304337 C/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 5586400 C/T 0 8 0 8 3.77517079488118 0 3.77517079488118 C C 10 0.528103650639853 0.00850905350050942 ENSG00000173040:ENST00000475313:exon_5586350_5586577:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344938:exon_5586350_5586577:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000310917:exon_5586350_5586577:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344408:exon_5586350_5586577:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000509670:exon_5586350_5586577:EVC2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 5749904 T/C 1 2 10 12 0.943792698720294 5.28103650639853 -4.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0173557609330065 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 5749961 G/C 1 3 9 12 1.41568904808044 4.75293285575868 -3.33724380767824 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0797554887978025 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 5750003 A/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 5755529 A/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:C A C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5755512_5755660:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5755512_5755660:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5755512_5755660:EVC;ENSG00000072840:ENST00000514919:exon_5755512_5755656:EVC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6302656 C/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:C C A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6302707 C/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6303534 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6303706 C/T 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6303844 G/A 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:C A C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6596360 G/A 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6596261_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6596348_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6596261_6596459:MAN2B2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6600012 A/G 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6599925_6600081:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6599925_6600081:MAN2B2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 A:G A G 10 0.528103650639853 0.726829864786135 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8228948 T/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 16 7 23 7.55034158976235 3.69672555447897 3.85361603528338 A:G A G 10 0.528103650639853 0.142969530065131 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 8239254 C/T 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8238005_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 153 148 301 72.2001414521025 78.1593402946982 -5.95919884259574 T:C T C 10 0.528103650639853 0.525474824944671 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 11 6 17 5.19085984296162 3.16862190383912 2.0222379391225 C:G C G 10 0.528103650639853 0.345327913480538 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 13601337 G/A 1 34 22 56 16.044475878245 11.6182803140768 4.42619556416823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.284331625911785 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 T:C C T 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 88 93 181 41.5268787436929 49.1136395095063 -7.58676076581339 T:C T C 10 0.528103650639853 0.264896135772962 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 22729018 G/A 0 375 0 375 176.961131010055 0 176.961131010055 G G 10 0.528103650639853 1.55505260038638e-104 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 29 22 51 13.6849941314443 11.6182803140768 2.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.578356063973385 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 25370669 G/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:G G T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000168228:ENST00000450254:exon_25370651_25372003:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000302874:exon_25370651_25372005:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000505412:exon_25370651_25371648:ZCCHC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 25370670 C/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:C C A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000168228:ENST00000450254:exon_25370651_25372003:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000302874:exon_25370651_25372005:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000505412:exon_25370651_25371648:ZCCHC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 25419908 G/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419777_25420120:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419777_25420111:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25419777_25420120:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 27 32 59 12.741201432724 16.8993168204753 -4.15811538775133 T:C T C 10 0.528103650639853 0.298533427323511 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 22 27 49 10.3817196859232 14.258798567276 -3.8770788813528 A:C A C 10 0.528103650639853 0.316764899358927 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 15 23 38 7.07844524040221 12.1463839647166 -5.06793872431441 A:G A G 10 0.528103650639853 0.106336748752300 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 27 28 55 12.741201432724 14.7869022179159 -2.04570078519192 T:C T C 10 0.528103650639853 0.591920874619508 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 20 22 42 9.43792698720294 11.6182803140768 -2.18035332687382 T:G T G 10 0.528103650639853 0.5386334947568 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 63 65 128 29.7294700096893 34.3267372915904 -4.59726728190119 A:G G A 10 0.528103650639853 0.426748824439073 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 195 294 489 92.0197881252287 155.262473288117 -63.2426851628881 A:T:G A G 10 0.528103650639853 1.25269033422488e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 106 176 282 50.0210130321756 92.9462425126141 -42.9252294804385 A:G A G 10 0.528103650639853 3.3107436258613e-07 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 134 150 284 63.2341108142597 79.215547595978 -15.9814367817183 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0652229721309936 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 102 130 232 48.133427634735 68.6534745831809 -20.5200469484459 A:C C A 10 0.528103650639853 0.00839004629789848 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 105 175 280 49.5491166828154 92.4181388619743 -42.8690221791588 A:G A G 10 0.528103650639853 3.02021499248393e-07 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 87 115 202 41.0549823943328 60.7319198235831 -19.6769374292503 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00591916804976109 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 180 241 421 84.9413428848265 127.272979804205 -42.3316369193781 T:G T G 10 0.528103650639853 3.92803865271738e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 172 231 403 81.1661720899453 121.991943297806 -40.8257712078608 A:C C A 10 0.528103650639853 5.06780519898518e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 142 214 356 67.0092816091409 113.014181236929 -46.0048996277877 T:C C T 10 0.528103650639853 1.20043245480939e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 103 166 269 48.6053239840951 87.6652060062156 -39.0598820221205 A:T A T 10 0.528103650639853 2.20740006796011e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 103 184 287 48.6053239840951 97.1710717177329 -48.5657477336378 T:G T G 10 0.528103650639853 1.01929022490306e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38798515 G/A 1 36 41 77 16.9882685769653 21.652249676234 -4.66398109926868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.305532987879876 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 38800323 A/G 1 32 27 59 15.1006831795247 14.258798567276 0.841884612248673 A:G A G 10 0.528103650639853 0.896519013453437 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000515861:exon_38800182_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000506146:exon_38800307_38800519:TLR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 7 19 26 3.30327444552103 10.0339693621572 -6.73069491663618 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00979490634898194 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 15 27 42 7.07844524040221 14.258798567276 -7.18035332687383 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0301546351986861 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 A:G A G 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 47560015 A/G 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:G A G 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 47560163 C/A 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:C C A 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47559681_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47560098_47560290:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47560105_47560290:ATP10D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 47589203 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505476:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47589036_47589223:ATP10D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 14 4 18 6.60654889104206 2.11241460255941 4.49413428848265 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0355692913440577 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 48424058 C/T 1 46 39 85 21.7072320705668 20.5960423749543 1.1111896956125 T:C C T 10 0.528103650639853 0.828840157901856 ENSG00000109171:ENST00000264313:exon_48424028_48428076:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000512093:exon_48424028_48427032:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000388965:exon_48424028_48428215:SLAIN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 27 15 42 12.741201432724 7.92155475959779 4.81964667312617 T:C C T 10 0.528103650639853 0.164199775373496 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 13 5 18 6.13465254168191 2.64051825319926 3.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.154755866488138 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 54324991 A/T 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 A:T A T 10 0.528103650639853 0.23468173708393 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 10 14 24 4.71896349360147 7.39345110895794 -2.67448761535647 A:G A G 10 0.528103650639853 0.310421695696587 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 56291528 T/C 1 15 8 23 7.07844524040221 4.22482920511882 2.85361603528338 T:C T C 10 0.528103650639853 0.297436847461985 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 28 14 42 13.2130977820841 7.39345110895794 5.81964667312617 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0884177193494544 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 12 14 26 5.66275619232176 7.39345110895794 -1.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.558326244007148 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 22 24 46 10.3817196859232 12.6744876153565 -2.29276792943324 C:G C G 10 0.528103650639853 0.555765468390474 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 33 16 49 15.5725795288849 8.44965841023765 7.1229211186472 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0452408280243081 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 51 79 130 24.0667138173675 41.7201884005484 -17.6534745831809 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00204506127035277 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57796906 G/A 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 125 107 232 58.9870436700184 56.5070906184643 2.47995305155411 T:C C T 10 0.528103650639853 0.792599732474227 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 64 75 139 30.2013663590494 39.607773797989 -9.40640743893957 T:C T C 10 0.528103650639853 0.125959397266226 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 71888210 C/T 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156136:ENST00000286648:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000503359:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000504730:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000504952:exon_71888084_71888277:DCK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 51 41 92 24.0667138173675 21.652249676234 2.41446414113353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.676486864567603 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 49 31 80 23.1229211186472 16.3712131698354 6.75170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.145656387562062 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 42 30 72 19.8196466731262 15.8431095191956 3.97653715393059 T:C T C 10 0.528103650639853 0.408856295483344 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 25 33 58 11.7974087340037 17.4274204711151 -5.63001173711147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.149188020264178 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 A:G A G 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 25 13 38 11.7974087340037 6.86534745831809 4.93206127568559 T:C T C 10 0.528103650639853 0.142776864266523 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 77660162 G/C 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138771:ENST00000296043:exon_77659914_77663079:SHROOM3;ENSG00000138771:ENST00000264907:exon_77659914_77663079:SHROOM3;ENSG00000138771:ENST00000486758:exon_77659914_77663283:SHROOM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 79786856 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000505725:exon_79786711_79786927:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79786711_79786874:BMP2K HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 79832509 A/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:C A C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79831764_79833339:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79831764_79837526:BMP2K;ENSG00000163291:ENST00000511594:exon_79831992_79833217:PAQR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 20 10 30 9.43792698720294 5.28103650639853 4.15689048080441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.145562685011199 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 32 31 63 15.1006831795247 16.3712131698354 -1.27052999031074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80124485093039 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 T:C C T 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 87684031 A/G 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 A:G A G 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000163629:ENST00000427191:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000436978:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000357349:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000316707:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000411767:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000511467:exon_87683880_87684343:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000508063:exon_87683880_87684087:PTPN13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 100871381 C/G 1 260 249 509 122.693050833638 131.497809009323 -8.80475817568517 C:G C G 10 0.528103650639853 0.450510237320263 ENSG00000164032:ENST00000511348:exon_100871325_100871512:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000511203:exon_100870430_100871456:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000296417:exon_100871325_100871545:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000511319:exon_100870820_100871425:H2AFZ;ENSG00000164032:ENST00000527366:exon_100871325_100871411:H2AFZ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 102751276 C/T 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 T:C C T 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102750965_102751363:BANK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 102816467 C/G 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102816462_102816567:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102816462_102816567:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000428908:exon_102816462_102816567:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000508653:exon_102816462_102816567:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102816462_102816567:BANK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 21 18 39 9.90982333656309 9.50586571151735 0.403957625045734 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 106155751 G/A 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 106158216 G/A 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 92 90 182 43.4144641411335 47.5293285575868 -4.11486441645324 A:T A T 10 0.528103650639853 0.553236438617655 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 32 26 58 15.1006831795247 13.7306949166362 1.36998826288853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.792975479453411 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 26 29 55 12.2693050833638 15.3150058685557 -3.04570078519192 A:G A G 10 0.528103650639853 0.421148445744323 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 35 25 60 16.5163722276051 13.2025912659963 3.31378096160882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.438777693671163 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 29 31 60 13.6849941314443 16.3712131698354 -2.68621903839118 T:C T C 10 0.528103650639853 0.519448300981425 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G A G 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 10 12 22 4.71896349360147 6.33724380767824 -1.61828031407677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.527484432019207 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 123192383 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000441681:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000455637:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000423315:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000446180:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000419325:exon_123192173_123192879:KIAA1109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 123268859 A/G 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123268677_123268934:KIAA1109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 128807198 T/A 1 24 12 36 11.3255123846435 6.33724380767824 4.98826857696529 A:T T A 10 0.528103650639853 0.131871344335218 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 27 19 46 12.741201432724 10.0339693621572 2.70723207056676 A:T A T 10 0.528103650639853 0.462603643873888 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 130023884 G/T 1 22 15 37 10.3817196859232 7.92155475959779 2.46016492632544 T:G G T 10 0.528103650639853 0.51078704440021 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 29 6 35 13.6849941314443 3.16862190383912 10.5163722276051 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000278744655469914 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 27 8 35 12.741201432724 4.22482920511882 8.51637222760515 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00373948394685271 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 441 2 443 208.106290067825 1.05620730127971 207.050082766545 A:G G A 10 0.528103650639853 1.19705464025253e-118 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 141543997 G/A 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000109436:ENST00000442267:exon_141541919_141544071:TBC1D9;ENSG00000109436:ENST00000262996:exon_141543922_141544071:TBC1D9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 141600320 A/G 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000109436:ENST00000442267:exon_141600096_141600357:TBC1D9;ENSG00000109436:ENST00000262996:exon_141600096_141600357:TBC1D9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 142147940 G/C 1 18 20 38 8.49413428848265 10.5620730127971 -2.06793872431441 C:G G C 10 0.528103650639853 0.519923483669534 ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142147921_142148000:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000507532:exon_142147921_142148000:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000512809:exon_142147921_142148000:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000503649:exon_142147921_142148000:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000512738:exon_142147921_142148000:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142147921_142148000:ZNF330 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 48 30 78 22.6510247692871 15.8431095191956 6.80791525009147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.140310341840138 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 41 53 94 19.347750323766 27.9894934839122 -8.64174316014618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.079323438106695 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 151773593 G/C 1 19 17 36 8.96603063784279 8.9777620608775 -0.011731423034707 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151773037_151774095:LRBA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 151829824 T/C 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151829812_151830009:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151829812_151830009:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151829812_151830009:LRBA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 39 32 71 18.4039576250457 16.8993168204753 1.50464080457044 A:G A G 10 0.528103650639853 0.812297434712392 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 T:C C T 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 168 178 346 79.2785866925047 94.0024498138938 -14.7238631213891 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.118429181684263 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 154553833 A/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 156289917 G/A 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 156617994 G/A 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515602:exon_156617908_156618001:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156617958_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156617908_156618212:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156617908_156618274:GUCY1A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 48 47 95 22.6510247692871 24.8208715800731 -2.16984681078603 T:C C T 10 0.528103650639853 0.681844398194941 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 17 12 29 8.0222379391225 6.33724380767824 1.68499413144426 C:G G C 10 0.528103650639853 0.58065189071065 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 170028045 G/A 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170027998_170028356:SH3RF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 170037572 G/A 1 19 6 25 8.96603063784279 3.16862190383912 5.79740873400368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0259244127541826 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170037420_170037781:SH3RF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 31 11 42 14.6287868301646 5.80914015703838 8.81964667312618 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00787467883872616 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 174090004 G/A 1 1 7 8 0.471896349360147 3.69672555447897 -3.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0305249046315294 ENSG00000109586:ENST00000265000:exon_174089904_174090112:GALNT7;ENSG00000109586:ENST00000512285:exon_174089962_174090112:GALNT7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 18 40 58 8.49413428848265 21.1241460255941 -12.6300117371115 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000921776060716596 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 12 12 24 5.66275619232176 6.33724380767824 -0.674487615356473 T:C C T 10 0.528103650639853 0.839700696621906 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 184600571 C/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:C C A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:C C T 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 A:G A G 10 0.528103650639853 0.390773887480627 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 24 25 49 11.3255123846435 13.2025912659963 -1.8770788813528 T:C C T 10 0.528103650639853 0.668300217735918 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 97 86 183 45.7739458879343 45.4169139550274 0.357031932906906 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 80 49 129 37.7517079488118 25.8770788813528 11.874629067459 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0421568611128749 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 A:G A G 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 4 15 19 1.88758539744059 7.92155475959779 -6.03396936215721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00943665583951543 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 24 9 33 11.3255123846435 4.75293285575868 6.57257952888485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0233455073527892 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 50 70 120 23.5948174680073 36.9672555447897 -13.3724380767824 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.0171200758326341 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5146395 A/G 1 1 12 13 0.471896349360147 6.33724380767824 -5.86534745831809 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00114324380000839 ENSG00000145536:ENST00000274181:exon_5146243_5146568:ADAMTS16;ENSG00000145536:ENST00000511368:exon_5146243_5146568:ADAMTS16;ENSG00000145536:ENST00000433402:exon_5146243_5146568:ADAMTS16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5209210 G/A 0 0 8 8 0 4.22482920511882 -4.22482920511882 A G A 10 0.528103650639853 0.00245908160362961 ENSG00000145536:ENST00000274181:exon_5209206_5209359:ADAMTS16;ENSG00000145536:ENST00000511368:exon_5209206_5209359:ADAMTS16;ENSG00000145536:ENST00000433402:exon_5209206_5209359:ADAMTS16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5460569 C/T 1 19 10 29 8.96603063784279 5.28103650639853 3.68499413144426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.195389720971694 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5460619 G/C 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 C:G G C 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 29 40 69 13.6849941314443 21.1241460255941 -7.43915189414986 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0906975295532974 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 43 34 77 20.2915430224863 17.955524121755 2.33601890073132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.648575009464351 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 5464163 G/A 1 59 52 111 27.8418846122487 27.4613898332724 0.380494778976317 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 185 153 338 87.3008246316272 80.7998585478975 6.50096608372969 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.513334384477102 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 52 52 104 24.5386101667276 27.4613898332724 -2.92277966654471 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.623608210633617 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 11 4 15 5.19085984296162 2.11241460255941 3.07844524040221 A:C C A 10 0.528103650639853 0.127145755019567 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 C:G C G 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 7866821 T/C 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 C:G G C 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 7868030 T/C 1 5 14 19 2.35948174680074 7.39345110895794 -5.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0224070602662607 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000504695:exon_7867463_7868220:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507572:exon_7867603_7868145:FASTKD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 10227548 C/A 1 8 16 24 3.77517079488118 8.44965841023765 -4.67448761535647 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0659664265085599 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10226442_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10226845_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10227068_10227759:FAM173B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C C T 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 14368975 C/T 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14368817_14369008:TRIO HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 16465719 T/C 1 21 13 34 9.90982333656309 6.86534745831809 3.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.309032190201497 ENSG00000173545:ENST00000308683:exon_16465150_16465901:ZNF622 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 17275991 C/G 1 331 271 602 156.197691638209 143.1160893234 13.0816023148085 C:G C G 10 0.528103650639853 0.288822903384585 ENSG00000176788:ENST00000322611:exon_17275317_17276943:BASP1;ENSG00000176788:ENST00000447228:exon_17275751_17276009:BASP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 7 24 31 3.30327444552103 12.6744876153565 -9.37121316983544 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000893108239010868 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 31526371 T/C 1 13 19 32 6.13465254168191 10.0339693621572 -3.8993168204753 T:C T C 10 0.528103650639853 0.214791287737836 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512076:exon_31526186_31526527:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512302:exon_31526186_31526433:DROSHA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 31538692 A/C 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 A:C A C 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000082213:ENST00000325366:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000355907:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510659:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000513967:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000517780:exon_31538367_31538793:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000511208:exon_31538588_31538791:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000504464:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510530:exon_31538280_31538796:C5orf22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 32126374 G/A 1 111 98 209 52.3804947789763 51.7541577627056 0.626337016270725 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.944872813708614 ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 26 23 49 12.2693050833638 12.1463839647166 0.122921118647204 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 25 21 46 11.7974087340037 11.0901766634369 0.707232070566763 T:C C T 10 0.528103650639853 0.883323581529177 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 13 12 25 6.13465254168191 6.33724380767824 -0.202591265996325 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 33998883 A/G 1 6 10 16 2.83137809616088 5.28103650639853 -2.44965841023765 A:G A G 10 0.528103650639853 0.316767099376427 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 37301638 T/C 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 T:C T C 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37301539_37301652:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37301539_37301652:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37301539_37301652:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37301539_37301652:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37301539_37301652:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000515054:exon_37301116_37301652:NUP155 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 43506449 T/C 1 13 2 15 6.13465254168191 1.05620730127971 5.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00872208904450117 ENSG00000172244:ENST00000306862:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000509489:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000514462:exon_43505652_43506496:C5orf34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 54572163 T/C 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C T C 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000513447:exon_54572094_54572188:DHX29 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 54645411 G/A 1 9 7 16 4.24706714424132 3.69672555447897 0.550341589762352 A:G G A 10 0.528103650639853 0.80852818897402 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54645401_54645480:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54645401_54645480:SKIV2L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G A G 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 56177443 G/A 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 56558570 C/T 1 166 147 313 78.3347939937844 77.6312366440584 0.703557349726012 T:C C T 10 0.528103650639853 0.954895846684064 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56558421_56558959:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56558421_56559408:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56558421_56559414:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56558421_56558909:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56558421_56558912:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56558421_56558912:GPBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 0 0 84 84 0 44.3607066537476 -44.3607066537476 A G A 10 0.528103650639853 4.00973691734123e-28 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 26 16 42 12.2693050833638 8.44965841023765 3.81964667312617 T:C T C 10 0.528103650639853 0.280074771573914 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 61772535 G/T 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:G G T 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61772510_61772580:IPO11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 37 25 62 17.4601649263254 13.2025912659963 4.25757366032911 C:G C G 10 0.528103650639853 0.309908380115069 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C T C 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 33 20 53 15.5725795288849 10.5620730127971 5.01050651608779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.215258178690519 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 16 19 35 7.55034158976235 10.0339693621572 -2.48362777239485 A:G A G 10 0.528103650639853 0.404148524616113 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 75 100 175 35.392226202011 52.8103650639853 -17.4181388619743 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00985590332610816 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G G A 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 67589188 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521409:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588929_67589220:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517698:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000519025:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523872:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000520550:exon_67589131_67589311:PIK3R1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 68616331 C/T 1 8 15 23 3.77517079488118 7.92155475959779 -4.14638396471662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0962092249770063 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000460090:exon_68616292_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68616292_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 14 15 29 6.60654889104206 7.92155475959779 -1.31500586855574 A:T T A 10 0.528103650639853 0.7110881983466 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70849021 G/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70848943_70849147:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:C C T 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 73207372 T/A 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000214944:ENST00000296794:exon_73207100_73207522:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000437974:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000426542:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000287898:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000296799:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000512883:exon_73207100_73207400:RP11-428C6.1;ENSG00000214944:ENST00000503341:exon_73207100_73207527:RP11-428C6.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 135 154 289 63.7060071636198 81.3279621985374 -17.6219550349175 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0392215575761834 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 11 15 26 5.19085984296162 7.92155475959779 -2.73069491663618 A:G G A 10 0.528103650639853 0.328448931147581 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 20 17 37 9.43792698720294 8.9777620608775 0.46016492632544 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 27 51 78 12.741201432724 26.9332861826325 -14.1920847499085 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00139531088847188 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 30 30 60 14.1568904808044 15.8431095191956 -1.68621903839118 A:C C A 10 0.528103650639853 0.699204772095856 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 79734201 T/C 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000039319:ENST00000338008:exon_79732575_79734826:ZFYVE16;ENSG00000039319:ENST00000510158:exon_79732575_79734826:ZFYVE16;ENSG00000039319:ENST00000505560:exon_79732575_79734826:ZFYVE16;ENSG00000039319:ENST00000512558:exon_79732575_79734826:ZFYVE16;ENSG00000039319:ENST00000510995:exon_79732575_79734826:ZFYVE16;ENSG00000039319:ENST00000425484:exon_79732575_79734826:ZFYVE16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 16 16 32 7.55034158976235 8.44965841023765 -0.899316820475295 A:G G A 10 0.528103650639853 0.859870759171863 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 89820984 T/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000176018:ENST00000500869:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000315948:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000509384:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000453259:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000254085:ENST00000517526:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000520100:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000426853:exon_89820852_89821117:LYSMD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 6 15 21 2.83137809616088 7.92155475959779 -5.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0292172121457386 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 A:G A G 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 12 7 19 5.66275619232176 3.69672555447897 1.96603063784279 C:G G C 10 0.528103650639853 0.491883988496033 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 15 11 26 7.07844524040221 5.80914015703838 1.26930508336382 A:C A C 10 0.528103650639853 0.69670328394468 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 102433409 G/A 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000145723:ENST00000512248:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000399004:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000274384:exon_102433294_102433485:GIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 10 24 34 4.71896349360147 12.6744876153565 -7.955524121755 A:C A C 10 0.528103650639853 0.00895179121140262 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 102886546 A/C 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:C A C 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000112874:ENST00000230792:exon_102884556_102886672:NUDT12;ENSG00000112874:ENST00000507423:exon_102886209_102886672:NUDT12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 42 33 75 19.8196466731262 17.4274204711151 2.39222620201103 T:C C T 10 0.528103650639853 0.644093097552505 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 44 49 93 20.7634393718465 25.8770788813528 -5.11363950950633 T:C C T 10 0.528103650639853 0.300368944227016 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 114573602 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000164219:ENST00000419445:exon_114573555_114573706:PGGT1B;ENSG00000164219:ENST00000379615:exon_114573555_114573706:PGGT1B;ENSG00000164219:ENST00000296642:exon_114573555_114573706:PGGT1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 16 13 29 7.55034158976235 6.86534745831809 0.684994131444263 T:G T G 10 0.528103650639853 0.854027499191445 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 118811533 G/A 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507695:exon_118811519_118811568:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118811519_118811565:HSD17B4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 121309893 T/C 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 T:C T C 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121309891_121309979:SRFBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 55 43 98 25.9542992148081 22.7084569775137 3.24584223729441 A:T T A 10 0.528103650639853 0.544671895884065 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 100 89 189 47.1896349360147 47.0012249069469 0.188410029067782 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 123983915 G/T 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 T:G G T 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 131607494 C/T 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 T:C C T 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607484_131607601:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131607484_131607526:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 21 27 48 9.90982333656309 14.258798567276 -4.34897523071294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.247554539696894 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 9 16 25 4.24706714424132 8.44965841023765 -4.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.109639086474819 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 51 59 110 24.0667138173675 31.1581153877513 -7.09140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.182228123295150 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 36 40 76 16.9882685769653 21.1241460255941 -4.13587744862883 A:G A G 10 0.528103650639853 0.359611121907052 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134223664 A/G 1 38 38 76 17.9320612756856 20.0679387243144 -2.13587744862883 A:G A G 10 0.528103650639853 0.647105554120996 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 1 28 20 48 13.2130977820841 10.5620730127971 2.65102476928706 C:G C G 10 0.528103650639853 0.472712139498177 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 310 262 572 146.287868301646 138.363156467641 7.92471183400409 A:G A G 10 0.528103650639853 0.52993956012651 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134670741 C/T 1 194 155 349 91.5478917758685 81.8560658491772 9.69182592669131 T:C C T 10 0.528103650639853 0.308656650971844 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 166 145 311 78.3347939937844 76.5750293427787 1.75976465100572 A:G A G 10 0.528103650639853 0.864804899436506 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 137522908 A/C 1 31 28 59 14.6287868301646 14.7869022179159 -0.158115387751327 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000112984:ENST00000394894:exon_137522785_137523404:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000508792:exon_137522785_137523354:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000502338:exon_137522785_137522932:KIF20A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 18 20 38 8.49413428848265 10.5620730127971 -2.06793872431441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.519923483669534 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C C T 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 6 8 14 2.83137809616088 4.22482920511882 -1.39345110895794 C:G C G 10 0.528103650639853 0.594489574550988 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 T:C C T 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 139931779 T/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T T A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 36 31 67 16.9882685769653 16.3712131698354 0.61705540712985 T:G G T 10 0.528103650639853 0.903215168481274 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 139941318 A/G 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 A:G A G 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 32 28 60 15.1006831795247 14.7869022179159 0.313780961608821 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 17 20 37 8.0222379391225 10.5620730127971 -2.53983507367456 T:C T C 10 0.528103650639853 0.415509256308292 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 56 59 115 26.4261955641682 31.1581153877513 -4.73191982358309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.401178528645614 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 5 13 18 2.35948174680074 6.86534745831809 -4.50586571151735 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0558219169828791 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 C:G G C 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 28 16 44 13.2130977820841 8.44965841023765 4.76343937184647 C:G C G 10 0.528103650639853 0.174681607618319 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141021095 C/T 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141019979_141021179:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141020549_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141020554_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141020776_141021130:FCHSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141023817 G/T 1 12 13 25 5.66275619232176 6.86534745831809 -1.20259126599633 T:G G T 10 0.528103650639853 0.691237953470935 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141023785_141024005:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141023785_141024005:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141023785_141024005:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141023785_141024005:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141023785_141024005:FCHSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 45 63 108 21.2353357212066 33.2705299903107 -12.0351942691041 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0208505431347604 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 37 38 75 17.4601649263254 20.0679387243144 -2.60777379798897 A:G A G 10 0.528103650639853 0.564771522598396 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 32 44 76 15.1006831795247 23.2365606281535 -8.13587744862883 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0662847938007803 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 34 36 70 16.044475878245 19.0117314230347 -2.96725554478971 A:G G A 10 0.528103650639853 0.549775273564227 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 15 14 29 7.07844524040221 7.39345110895794 -0.315005868555737 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 148747641 C/G 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 C:G C G 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149212800 G/A 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149212578_149213341:PPARGC1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 21 20 41 9.90982333656309 10.5620730127971 -0.652249676233971 T:C C T 10 0.528103650639853 0.876554524090356 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 24 28 52 11.3255123846435 14.7869022179159 -3.46138983327236 A:G A G 10 0.528103650639853 0.404882378834723 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149755744 G/C 1 21 43 64 9.90982333656309 22.7084569775137 -12.7986336409506 C:G G C 10 0.528103650639853 0.00157507863396862 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755645_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755645_149755893:TCOF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 23 22 45 10.8536160352834 11.6182803140768 -0.764664278793383 T:C T C 10 0.528103650639853 0.881749953286831 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 149919739 G/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149919644_149919826:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149919644_149919826:NDST1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 150097883 G/C 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000518909:exon_150097838_150097945:DCTN4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 235 190 425 110.895642099635 100.339693621572 10.5559484780625 A:G G A 10 0.528103650639853 0.308086999453818 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 150639409 A/G 1 72 33 105 33.9765371539306 17.4274204711151 16.5491166828154 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00118954140849587 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 132 131 263 62.2903181155394 69.1815782338207 -6.89126011828134 A:G A G 10 0.528103650639853 0.422119526646244 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 150647040 C/T 1 141 146 287 66.5373852597807 77.1031329934185 -10.5657477336378 T:C C T 10 0.528103650639853 0.214894199607435 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 151054227 T/C 0 0 9 9 0 4.75293285575868 -4.75293285575868 C T C 10 0.528103650639853 0.00116043163153151 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151054173_151054235:SPARC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 10 3 13 4.71896349360147 1.58431095191956 3.13465254168191 A:G A G 10 0.528103650639853 0.098906296354315 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 29 41 70 13.6849941314443 21.652249676234 -7.96725554478971 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0717873468159782 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 29 27 56 13.6849941314443 14.258798567276 -0.573804435831768 T:C C T 10 0.528103650639853 0.894275221478099 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169025547 A/T 1 18 6 24 8.49413428848265 3.16862190383912 5.32551238464353 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0390594566667783 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169025480_169025583:CCDC99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 24 45 69 11.3255123846435 23.7646642787934 -12.4391518941499 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00350309374680112 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 41 56 97 19.347750323766 29.5738044358318 -10.2260541120657 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0417465346757682 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 36 26 62 16.9882685769653 13.7306949166362 3.25757366032911 T:G G T 10 0.528103650639853 0.446630471884474 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 18 24 42 8.49413428848265 12.6744876153565 -4.18035332687383 A:C C A 10 0.528103650639853 0.217890022301436 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 38 34 72 17.9320612756856 17.955524121755 -0.023462846069414 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 54 37 91 25.4824028654479 19.5398350736746 5.94256779177338 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.248025238294227 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 53 61 114 25.0105065160878 32.214322689031 -7.20381617294324 A:C A C 10 0.528103650639853 0.189474717667077 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 39 35 74 18.4039576250457 18.4836277723949 -0.0796701473491197 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 54 79 133 25.4824028654479 41.7201884005484 -16.2377855351004 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00531825483335471 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 173316729 G/A 1 12 12 24 5.66275619232176 6.33724380767824 -0.674487615356473 A:G G A 10 0.528103650639853 0.839700696621906 ENSG00000113742:ENST00000265085:exon_173315283_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000326629:exon_173315331_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000520867:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000334035:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000519835:exon_173316534_173317861:CPEB4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 175919324 G/A 1 23 14 37 10.8536160352834 7.39345110895794 3.46016492632544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.323315400762097 ENSG00000113194:ENST00000261942:exon_175919195_175919333:FAF2;ENSG00000113194:ENST00000504983:exon_175919240_175919333:FAF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 16 15 31 7.55034158976235 7.92155475959779 -0.371213169835443 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176396334 T/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:T T A 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 21 21 42 9.90982333656309 11.0901766634369 -1.18035332687382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75862144149592 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 15 9 24 7.07844524040221 4.75293285575868 2.32551238464353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.415581587245928 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 T:G G T 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 24 28 52 11.3255123846435 14.7869022179159 -3.46138983327236 T:C T C 10 0.528103650639853 0.404882378834723 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176639105 T/C 1 7 22 29 3.30327444552103 11.6182803140768 -8.31500586855574 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00238620323722915 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176721119 G/A 1 24 23 47 11.3255123846435 12.1463839647166 -0.82087158007309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.884159584028512 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176721151 T/C 1 31 14 45 14.6287868301646 7.39345110895794 7.23533572120662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.035930553730041 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 28 17 45 13.2130977820841 8.9777620608775 4.23533572120662 T:C T C 10 0.528103650639853 0.233566187612482 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176722005 G/A 1 30 29 59 14.1568904808044 15.3150058685557 -1.15811538775133 A:G G A 10 0.528103650639853 0.795188284817778 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 316 201 517 149.119246397806 106.14883377861 42.970412619196 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000148315759190797 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 294 246 540 138.737526711883 129.913498057404 8.82402865447938 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.463825030118382 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 177022428 C/T 1 197 180 377 92.963580823949 95.0586571151735 -2.09507629122457 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.836683465554627 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177022268_177023125:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177022268_177022578:TMED9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 26 15 41 12.2693050833638 7.92155475959779 4.34775032376603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.210899309494033 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 177482657 G/A 1 3122 1 3123 1473.26040270238 0.528103650639853 1472.73229905174 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 0 13 0 13 6.13465254168191 0 6.13465254168191 A A 10 0.528103650639853 0.000306057846063738 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 179193598 C/T 1 7 18 25 3.30327444552103 9.50586571151735 -6.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0153814544149345 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179192327_179193742:MAML1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 179201847 G/A 1 26 22 48 12.2693050833638 11.6182803140768 0.651024769287057 A:G G A 10 0.528103650639853 0.885917211675883 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179200896_179204287:MAML1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 135 112 247 63.7060071636198 59.1476088716635 4.55839829195631 A:G A G 10 0.528103650639853 0.567035219234217 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 133 95 228 62.7622144648996 50.169846810786 12.5923676541135 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0975390767553367 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 109 68 177 51.436702080256 35.91104824351 15.525653836746 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0196313386480087 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180480187 G/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:G G T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000165810:ENST00000509395:exon_180480049_180480316:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000511056:exon_180480120_180480316:BTNL9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180486841 C/T 1 21 11 32 9.90982333656309 5.80914015703838 4.10068317952471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.159934326105865 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 5 180659796 G/A 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000146063:ENST00000515499:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180659659_180659889:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515834:exon_180659659_180660524:TRIM41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 60 362 422 28.3137809616088 191.173521531627 -162.859740570018 A:G G A 10 0.528103650639853 1.31155739038648e-61 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 A:G A G 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 18 22 40 8.49413428848265 11.6182803140768 -3.12414602559412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.345175829251647 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 52 58 110 24.5386101667276 30.6300117371115 -6.09140157038383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.253026536482845 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 31 25 56 14.6287868301646 13.2025912659963 1.42619556416823 T:C C T 10 0.528103650639853 0.789306061307979 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 57 48 105 26.8980919135284 25.3489752307129 1.54911668281543 A:C A C 10 0.528103650639853 0.770477496220696 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 7229619 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7229230_7230666:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7229230_7229883:RREB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 7247344 C/A 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:C C A 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 64 61 125 30.2013663590494 32.214322689031 -2.01295632998162 A:G G A 10 0.528103650639853 0.7211509792726 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 11193860 G/A 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11193824_11193925:NEDD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 20 30 50 9.43792698720294 15.8431095191956 -6.40518253199265 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0882706010075876 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 11723636 C/T 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000111863:ENST00000505099:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000414691:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000514824:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000513651:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000512139:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000229583:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000503285:exon_11723582_11723733:C6orf105;ENSG00000111863:ENST00000379413:exon_11723582_11723733:C6orf105 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12120445 A/G 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 A:G A G 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000095951:ENST00000487103:exon_12120123_12120455:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12122174 A/G 1 18 24 42 8.49413428848265 12.6744876153565 -4.18035332687383 A:T:G A G 10 0.528103650639853 0.217890022301436 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12123049 G/A 1 19 7 26 8.96603063784279 3.69672555447897 5.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0482399675614698 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12123249 A/G 1 19 13 32 8.96603063784279 6.86534745831809 2.1006831795247 A:G A G 10 0.528103650639853 0.484258530347796 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12123538 G/T 1 17 3 20 8.0222379391225 1.58431095191956 6.43792698720294 T:G G T 10 0.528103650639853 0.005637624961023 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 18 22 40 8.49413428848265 11.6182803140768 -3.12414602559412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.345175829251647 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 45 39 84 21.2353357212066 20.5960423749543 0.639293346252352 A:G A G 10 0.528103650639853 0.913374106709397 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12164612 C/G 1 52 50 102 24.5386101667276 26.4051825319927 -1.86657236526501 C:G C G 10 0.528103650639853 0.766292855853182 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:G G T 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 19 24 43 8.96603063784279 12.6744876153565 -3.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.286545613814440 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 15496662 C/T 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 T:C C T 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15496363_15497401:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15496363_15497401:JARID2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 15513482 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15513470_15513653:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15513470_15513653:JARID2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 66 72 138 31.1451590577697 38.0234628460694 -6.87830378829971 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.267703898474334 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 17637958 G/A 1 32 34 66 15.1006831795247 17.955524121755 -2.8548409422303 A:G G A 10 0.528103650639853 0.538110000303858 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 18 15 33 8.49413428848265 7.92155475959779 0.572579528884852 C:G G C 10 0.528103650639853 0.8636141408051 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 94 80 174 44.3582568398538 42.2482920511882 2.10996478866559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.761904289881148 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 24503590 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000112294:ENST00000357578:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000491546:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000348925:exon_24503491_24503661:ALDH5A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 39 29 68 18.4039576250457 15.3150058685557 3.08895175649 C:G G C 10 0.528103650639853 0.468870869658919 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 34 21 55 16.044475878245 11.0901766634369 4.95429921480809 A:C A C 10 0.528103650639853 0.223910816018479 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 25967068 C/T 1 30 34 64 14.1568904808044 17.955524121755 -3.79863364095059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.381451301856020 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25966563_25967161:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25966744_25967161:TRIM38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26056072 G/C 1 102 85 187 48.133427634735 44.8888103043875 3.24461733034749 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.66071347609027 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 375 352 727 176.961131010055 185.892485025228 -8.9313540151731 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.527748084888494 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 58 20 78 27.3699882628885 10.5620730127971 16.8079152500915 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000146100093293233 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 20 10 30 9.43792698720294 5.28103650639853 4.15689048080441 T:C C T 10 0.528103650639853 0.145562685011199 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:G G A 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26216584 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:G A G 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26431654 G/A 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 26 32 58 12.2693050833638 16.8993168204753 -4.63001173711147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.238329966263028 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 57 81 138 26.8980919135284 42.7763957018281 -15.8783037882997 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00800540163323604 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 28269407 G/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 13 9 22 6.13465254168191 4.75293285575868 1.38171968592323 C:G C G 10 0.528103650639853 0.670931609468216 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29795636 G/A 0 16 0 16 7.55034158976235 0 7.55034158976235 G G 10 0.528103650639853 4.26492422863451e-05 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29795613_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29795510_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29795598_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000442051:exon_29795620_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29795622_29795694:HLA-G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29795657 G/A 0 18 0 18 8.49413428848265 0 8.49413428848265 G G 10 0.528103650639853 1.15547048172275e-05 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29795613_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29795510_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29795598_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000442051:exon_29795620_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29795622_29795694:HLA-G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29795993 G/A 0 20 0 20 9.43792698720294 0 9.43792698720294 G G 10 0.528103650639853 3.14684283276297e-06 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000442051:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29795824_29796093:HLA-G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29796376 C/A 1 16 1 17 7.55034158976235 0.528103650639853 7.0222379391225 A:C C A 10 0.528103650639853 0.000370103832949932 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29796320_29796595:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29796320_29796595:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29796320_29796595:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29796320_29796595:HLA-G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29797696 A/G 0 18 0 18 8.49413428848265 0 8.49413428848265 A A 10 0.528103650639853 1.15547048172275e-05 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29797195_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29797593_29797709:HLA-G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29910324 G/C 1 14 182 196 6.60654889104206 96.1148644164532 -89.5083155254112 A:C:G G C 10 0.528103650639853 9.63356124376715e-43 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 916 16 932 432.257056013895 8.44965841023765 423.807397603657 A:C:G G A 10 0.528103650639853 9.55151116239054e-226 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 1 1035 1036 0.471896349360147 546.587278412248 -546.115382062888 A:C C A 10 0.528103650639853 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29911005 G/A 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 10 29 39 4.71896349360147 15.3150058685557 -10.5960423749543 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000660001286558185 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 28 11 39 13.2130977820841 5.80914015703838 7.40395762504573 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0235130007552441 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 1542 264 1806 727.664170713347 139.419363768921 588.244806944426 A:G A G 10 0.528103650639853 2.12824167315523e-189 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 2222 202 2424 1048.55368827825 106.67693742925 941.876750848996 C:G G C 10 0.528103650639853 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 50 46 96 23.5948174680073 24.2927679294332 -0.697950461425886 T:C T C 10 0.528103650639853 0.918775099960552 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 1232 1231 2463 581.376302411701 650.095593937659 -68.7192915259579 A:T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.00568769764877740 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 924 998 1922 436.032226808776 527.047443338573 -91.0152165297975 A:C:G G A 10 0.528103650639853 3.50387077300867e-05 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 31 28 59 14.6287868301646 14.7869022179159 -0.158115387751327 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 17 17 34 8.0222379391225 8.9777620608775 -0.955524121755001 T:C T C 10 0.528103650639853 0.86395113418665 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30671881 C/T 1 54 68 122 25.4824028654479 35.91104824351 -10.4286453780621 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0693251955021721 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30675574 A/C 1 23 25 48 10.8536160352834 13.2025912659963 -2.34897523071294 A:C A C 10 0.528103650639853 0.563803045831336 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30675343_30676134:MDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30680916 C/T 1 27 10 37 12.741201432724 5.28103650639853 7.46016492632544 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0198672636701857 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30680733_30681131:MDC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30862423 C/T 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000465966:exon_30862283_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513514:exon_30862365_30862448:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30862351_30862448:DDR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 12 15 27 5.66275619232176 7.92155475959779 -2.25879856727603 A:C A C 10 0.528103650639853 0.442911339733074 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30865279 C/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 14 10 24 6.60654889104206 5.28103650639853 1.32551238464353 A:C A C 10 0.528103650639853 0.684525898438066 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30882689 C/T 1 25 14 39 11.7974087340037 7.39345110895794 4.40395762504573 T:C C T 10 0.528103650639853 0.199135457015214 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30882803 G/A 1 33 25 58 15.5725795288849 13.2025912659963 2.36998826288853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.599538421213066 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 18 18 36 8.49413428848265 9.50586571151735 -1.01173142303471 T:C T C 10 0.528103650639853 0.741928470590991 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 22 22 44 10.3817196859232 11.6182803140768 -1.23656062815353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.763639383897723 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 A:G G A 10 0.528103650639853 0.390773887480627 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 43 29 72 20.2915430224863 15.3150058685557 4.97653715393059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.288033856523903 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 17 21 38 8.0222379391225 11.0901766634369 -3.06793872431441 T:C T C 10 0.528103650639853 0.334006204812849 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 13 10 23 6.13465254168191 5.28103650639853 0.853616035283381 A:G G A 10 0.528103650639853 0.835583811578279 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 T:G T G 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 10 14 24 4.71896349360147 7.39345110895794 -2.67448761535647 C:G C G 10 0.528103650639853 0.310421695696587 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 10 14 24 4.71896349360147 7.39345110895794 -2.67448761535647 C:G G C 10 0.528103650639853 0.310421695696587 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 T:C C T 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 14 14 28 6.60654889104206 7.39345110895794 -0.786902217915884 A:G A G 10 0.528103650639853 0.850667454315956 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 29 29 58 13.6849941314443 15.3150058685557 -1.63001173711147 A:C A C 10 0.528103650639853 0.694708795596846 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 66 63 129 31.1451590577697 33.2705299903107 -2.12537093254103 T:C T C 10 0.528103650639853 0.7249280814012 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 3071 1235 4306 1449.19368888501 652.208008540218 796.985680344793 T:C:G T C 10 0.528103650639853 9.5894244768081e-136 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 3243 882 4125 1530.35986097496 465.78741986435 1064.57244111061 A:T:C:G C G 10 0.528103650639853 2.97253224411886e-259 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 10 0 10 4.71896349360147 0 4.71896349360147 T T 10 0.528103650639853 0.00223490108103097 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31238068 C/T 1 2390 28 2418 1127.83227497075 14.7869022179159 1113.04537275284 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 4.94065645841247e-324 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237987_31238199:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31237991_31238108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31237998_31238262:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 1 31 2 33 14.6287868301646 1.05620730127971 13.5725795288849 A:G G A 10 0.528103650639853 4.63870255025571e-07 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 1350 133 1483 637.060071636198 70.2377855351004 566.822286101098 T:C:G T G 10 0.528103650639853 3.08232461453917e-225 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 1625 227 1852 766.831567710239 119.879528695247 646.952039014992 A:T:C C T 10 0.528103650639853 2.15594856279272e-227 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 832 3 835 392.617762667642 1.58431095191956 391.033451715723 T:C:G C T 10 0.528103650639853 2.15336940014124e-224 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 948 3 951 447.357739193419 1.58431095191956 445.7734282415 T:G G T 10 0.528103650639853 2.30461488917873e-256 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/A 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 1401 902 2303 661.126785453566 476.349492877147 184.777292576419 A:T:C:G A G 10 0.528103650639853 1.00556603040190e-14 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2214 1227 3441 1044.77851748337 647.9831793351 396.795338148266 T:C:G C T 10 0.528103650639853 1.56574464940016e-42 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31323203 A/G 1 1764 2676 4440 832.425160271299 1413.20536911225 -580.780208840947 A:T:G A G 10 0.528103650639853 2.80640902119884e-68 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31474884 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 16 10 26 7.55034158976235 5.28103650639853 2.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434914527433077 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 132 152 284 62.2903181155394 80.2717548972577 -17.9814367817182 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0373246064559391 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 274 289 563 129.29959972468 152.621955034918 -23.3223553102372 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0521001781896036 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31541216 C/T 1 464 440 904 218.959906103108 232.365606281535 -13.4057001784271 T:C C T 10 0.528103650639853 0.386442380553538 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31541058_31542101:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31541058_31542101:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31541058_31542101:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31541058_31542101:LTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31555657 A/G 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000204482:ENST00000464526:exon_31554977_31556686:LST1;ENSG00000204482:ENST00000488959:exon_31555328_31556686:LST1;ENSG00000204482:ENST00000460834:exon_31555593_31555743:LST1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 12 25 37 5.66275619232176 13.2025912659963 -7.53983507367456 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0136460544601254 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31583312 G/A 1 7 5 12 3.30327444552103 2.64051825319926 0.662756192321764 A:G G A 10 0.528103650639853 0.778656539816616 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 106 94 200 50.0210130321756 49.6417431601462 0.379269872029404 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 148 163 311 69.8406597053018 86.080895054296 -16.2402353489943 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0691024154444437 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 133 131 264 62.7622144648996 69.1815782338207 -6.41936376892119 A:G G A 10 0.528103650639853 0.459545194974094 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31604011 G/A 1 179 177 356 84.4694465354663 93.474346163254 -9.00489962778767 A:G G A 10 0.528103650639853 0.339943952331609 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 8 14 22 3.77517079488118 7.39345110895794 -3.61828031407677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.138184227038771 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31605278 C/T 1 132 125 257 62.2903181155394 66.0129563299816 -3.72263821444221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.662103175333626 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31605223_31605548:BAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 46 24 70 21.7072320705668 12.6744876153565 9.03274445521029 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.0314286080096737 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 33 55 88 15.5725795288849 29.0457007851919 -13.4731212563071 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00520720514227055 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 38 24 62 17.9320612756856 12.6744876153565 5.25757366032911 C:G C G 10 0.528103650639853 0.203949544795536 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 116 138 254 54.7399765257771 72.8783037882997 -18.1383272625227 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0236422579181371 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:G A G 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 12 2 14 5.66275619232176 1.05620730127971 4.60654889104206 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0148564761173621 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31750509 G/A 1 34 19 53 16.044475878245 10.0339693621572 6.01050651608779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.100943612114930 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000474643:exon_31750307_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000461328:exon_31750189_31750622:VARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31753423 T/C 1 15 17 32 7.07844524040221 8.9777620608775 -1.8993168204753 T:C T C 10 0.528103650639853 0.596146570062849 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31753346_31753510:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31753346_31753510:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31753346_31753510:VARS;ENSG00000204394:ENST00000495010:exon_31753346_31753510:VARS;ENSG00000204394:ENST00000489979:exon_31753346_31753510:VARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31778529 C/T 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 T:C C T 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31778831 A/G 1 1 7 8 0.471896349360147 3.69672555447897 -3.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0305249046315294 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000424494:exon_31778787_31779266:HSPA1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31803130 C/T 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31803065_31803228:C6orf48 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 8 10 18 3.77517079488118 5.28103650639853 -1.50586571151735 T:G G T 10 0.528103650639853 0.49040407603384 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31868938 C/T 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 20 11 31 9.43792698720294 5.80914015703838 3.62878683016456 A:C A C 10 0.528103650639853 0.211615695999613 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31930351 A/G 1 16 12 28 7.55034158976235 6.33724380767824 1.21309778208412 A:G A G 10 0.528103650639853 0.707697380982591 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31930216_31930362:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31930216_31930362:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000477400:exon_31930216_31930360:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31930216_31930362:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31930216_31930362:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31930216_31930362:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000466290:exon_31930216_31930362:SKIV2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31935567 G/A 1 25 31 56 11.7974087340037 16.3712131698354 -4.57380443583177 A:G G A 10 0.528103650639853 0.230873356231740 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461915:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000494058:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31935492_31935639:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31935536_31935639:SKIV2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 37 37 74 17.4601649263254 19.5398350736746 -2.07967014734912 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.643097034270657 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 31939345 G/A 1 28 19 47 13.2130977820841 10.0339693621572 3.17912841992691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.383286877131814 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31939097_31939462:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31939097_31939986:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31939097_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31939097_31939502:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31939097_31939872:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31939097_31939761:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31939097_31939460:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31939097_31939502:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31939097_31939358:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31939097_31939766:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000418489:exon_31939097_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000460058:exon_31939097_31939502:DOM3Z HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 2179 2090 4269 1028.26214525576 1103.73662983729 -75.4744845815324 A:C:G C A 10 0.528103650639853 0.0214711612149103 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 10 8 18 4.71896349360147 4.22482920511882 0.494134288482647 T:C T C 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2129 2007 4136 1004.66732778775 1059.90402683418 -55.2366990464318 A:T:C A C 10 0.528103650639853 0.0866873435005396 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C T C 10 0.528103650639853 0.795116119978559 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 4175 3729 7904 1970.16725857861 1969.29851323601 0.868745342602097 A:T:C:G T G 10 0.528103650639853 0.991011500478828 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32605284 G/A 1 40 211 251 18.8758539744059 111.429870285009 -92.5540163106031 A:G G A 10 0.528103650639853 7.92709467528131e-34 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 1 40 304 344 18.8758539744059 160.543509794515 -141.667655820109 T:C C T 10 0.528103650639853 4.22002964813023e-58 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32605309 A/G 1 5 371 376 2.35948174680074 195.926454387385 -193.566972640585 A:G A G 10 0.528103650639853 2.51818077490673e-112 ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 1 164 165 0.471896349360147 86.6089987049359 -86.1371023555757 A:C C A 10 0.528103650639853 2.8404948386872e-52 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 92 43 135 43.4144641411335 22.7084569775137 20.7060071636199 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000373571814050404 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32782149 G/A 1 86 37 123 40.5830860449726 19.5398350736746 21.0432509712981 A:G G A 10 0.528103650639853 0.000132787597297877 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782147_32782369:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32782387 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 49 54 103 23.1229211186472 28.5175971345521 -5.39467601590486 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.323776114979442 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32800103 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 56 90 146 26.4261955641682 47.5293285575868 -21.1031329934185 A:C C A 10 0.528103650639853 0.000478047702627365 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 227 201 428 107.120471304753 106.14883377861 0.971637526142914 T:C T C 10 0.528103650639853 0.961394812598041 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 154 176 330 72.6720378014626 92.9462425126141 -20.2742047111515 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0273286937916810 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 345 314 659 162.804240529251 165.824546300914 -3.02030577166309 A:G A G 10 0.528103650639853 0.815044160783961 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 207 206 413 97.6825443175504 108.78935203181 -11.1068077142593 A:G G A 10 0.528103650639853 0.278559896456111 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 41 46 87 19.347750323766 24.2927679294332 -4.94501760566721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.333874350866154 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 15 26 41 7.07844524040221 13.7306949166362 -6.65224967623397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.041977337587542 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 142 163 305 67.0092816091409 86.080895054296 -19.0716134451552 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0293518436575611 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 123 146 269 58.0432509712981 77.1031329934185 -19.0598820221205 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0203388342039532 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 77 54 131 36.3360189007313 28.5175971345521 7.81842176617926 A:G G A 10 0.528103650639853 0.18935532481335 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32975014 T/C 0 0 10 10 0 5.28103650639853 -5.28103650639853 C T C 10 0.528103650639853 0.000547603450601758 ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 76 62 138 35.8641225513712 32.7424263396709 3.12169621170029 T:C C T 10 0.528103650639853 0.60996177033044 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 91 59 150 42.9425677917734 31.1581153877513 11.7844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.059770748147247 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 32977315 A/G 0 68 0 68 32.08895175649 0 32.08895175649 A A 10 0.528103650639853 1.44718181803899e-19 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 15 12 27 7.07844524040221 6.33724380767824 0.741201432723969 A:G G A 10 0.528103650639853 0.848515385288294 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 33651129 C/T 1 9 6 15 4.24706714424132 3.16862190383912 1.07844524040221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.615842724959798 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33650984_33651174:ITPR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 27 19 46 12.741201432724 10.0339693621572 2.70723207056676 A:G G A 10 0.528103650639853 0.462603643873888 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35258465 C/A 1 7 16 23 3.30327444552103 8.44965841023765 -5.14638396471662 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0366490777229314 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35258418_35259180:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000469195:exon_35258418_35258493:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000486891:exon_35258418_35258493:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35258418_35258493:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35258418_35258493:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000448999:exon_35258418_35258493:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35258418_35258493:ZNF76 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 17 16 33 8.0222379391225 8.44965841023765 -0.427420471115148 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 T:C C T 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35423662 A/C 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:C A C 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35423524_35424130:FANCE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35430686 G/A 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35430566_35430691:FANCE HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35436208 A/T 1 1237 1218 2455 583.735784158502 643.230246479341 -59.4944623208391 A:T:C A T 10 0.528103650639853 0.0170474780031861 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000490335:exon_35436197_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000478340:exon_35436197_35436216:RPL10A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36339136 G/A 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36339107_36339337:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36339107_36339337:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36339107_36339337:ETV7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 16 15 31 7.55034158976235 7.92155475959779 -0.371213169835443 C:G G C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 31 28 59 14.6287868301646 14.7869022179159 -0.158115387751327 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 188 215 403 88.7165136797076 113.542284887568 -24.8257712078607 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0144143126236362 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36652339 C/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 C:G C G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 381 385 766 179.792509106216 203.319905496343 -23.5273963901274 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0890875310374422 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 168 132 300 79.2785866925047 69.7096818844606 9.56890480804411 T:C T C 10 0.528103650639853 0.272511725257873 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36937798 G/A 1 20 1 21 9.43792698720294 0.528103650639853 8.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 3.31836128791711e-05 ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36937242_36937890:MTCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 38 30 68 17.9320612756856 15.8431095191956 2.08895175649 A:G G A 10 0.528103650639853 0.629327372215205 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 19 31 50 8.96603063784279 16.3712131698354 -7.40518253199265 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0463563334334644 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 18 21 39 8.49413428848265 11.0901766634369 -2.59604237495427 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426412497795246 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 21 11 32 9.90982333656309 5.80914015703838 4.10068317952471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.159934326105865 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 98 101 199 46.2458422372944 53.3384687146252 -7.09262647733075 T:G T G 10 0.528103650639853 0.320956299027379 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 32 22 54 15.1006831795247 11.6182803140768 3.48240286544794 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.413752452514042 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41250466 T/A 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41250133_41250489:TREM1;ENSG00000124731:ENST00000334475:exon_41250133_41250489:TREM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 94 117 211 44.3582568398538 61.7881271248628 -17.429870285009 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0188549399893246 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 22 16 38 10.3817196859232 8.44965841023765 1.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.626706429561788 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 68 59 127 32.08895175649 31.1581153877513 0.930836368738671 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.929236760563857 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 51 60 111 24.0667138173675 31.6862190383912 -7.61950522102368 A:T:C A C 10 0.528103650639853 0.154575321962256 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43306998 C/T 1 56 49 105 26.4261955641682 25.8770788813528 0.549116682815434 T:C C T 10 0.528103650639853 0.922533364995187 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 45 27 72 21.2353357212066 14.258798567276 6.97653715393059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.124320156777456 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43492671 C/T 1 34 39 73 16.044475878245 20.5960423749543 -4.55156649670927 T:C C T 10 0.528103650639853 0.293796833468134 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43581585 C/T 1 31 32 63 14.6287868301646 16.8993168204753 -2.27052999031074 T:C C T 10 0.528103650639853 0.614551101978802 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 18 19 37 8.49413428848265 10.0339693621572 -1.53983507367456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.625425947028641 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 A:G A G 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 4 14 18 1.88758539744059 7.39345110895794 -5.50586571151735 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0156544765361726 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 152 138 290 71.7282451027423 72.8783037882997 -1.15005868555737 T:G G T 10 0.528103650639853 0.90645366859764 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 46108083 A/G 1 53 41 94 25.0105065160878 21.652249676234 3.35825683985382 A:G A G 10 0.528103650639853 0.535831546328531 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 7 9 16 3.30327444552103 4.75293285575868 -1.44965841023765 T:C C T 10 0.528103650639853 0.618058937675178 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 13 6 19 6.13465254168191 3.16862190383912 2.96603063784279 A:G G A 10 0.528103650639853 0.250158578602722 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 49459978 A/G 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:G A G 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 56351972 G/C 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 C:G G C 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56351902_56352071:DST;ENSG00000151914:ENST00000487754:exon_56351902_56352071:DST HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 20 18 38 9.43792698720294 9.50586571151735 -0.0679387243144127 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 57012930 C/T 1 27 37 64 12.741201432724 19.5398350736746 -6.79863364095059 T:C C T 10 0.528103650639853 0.103291348610720 ENSG00000112200:ENST00000370706:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000357489:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000444273:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000491832:exon_57011888_57013491:ZNF451 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 9 9 0 4.75293285575868 -4.75293285575868 G A G 10 0.528103650639853 0.00116043163153151 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 10 10 0 5.28103650639853 -5.28103650639853 A G A 10 0.528103650639853 0.000547603450601758 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 9 9 0 4.75293285575868 -4.75293285575868 A G A 10 0.528103650639853 0.00116043163153151 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 74493432 A/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:C A C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74493430_74493547:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74493430_74493547:CD109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 74497009 A/G 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:G A G 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 74497152 G/A 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 A:G G A 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 76344431 C/T 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:C C T 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000493959:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000487548:exon_76344423_76344772:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76344423_76344527:SENP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 83667045 C/T 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:C C T 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000118420:ENST00000369747:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000237186:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000392921:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000509102:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000430071:exon_83667031_83667169:UBE2CBP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 83838673 G/A 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000083097:ENST00000349129:exon_83838606_83839227:DOPEY1;ENSG00000083097:ENST00000237163:exon_83838606_83839227:DOPEY1;ENSG00000083097:ENST00000369739:exon_83838606_83839227:DOPEY1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 21 12 33 9.90982333656309 6.33724380767824 3.57257952888485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.227218437823609 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 17 8 25 8.0222379391225 4.22482920511882 3.79740873400368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.161050017092251 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 413 391 804 194.893192285741 206.488527400183 -11.5953351144418 C:G G C 10 0.528103650639853 0.416729966801755 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 90565242 A/G 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000118412:ENST00000419040:exon_90565189_90565263:CASP8AP2;ENSG00000118412:ENST00000444163:exon_90565189_90565263:CASP8AP2;ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90565189_90565263:CASP8AP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 20 19 39 9.43792698720294 10.0339693621572 -0.596042374954266 T:C C T 10 0.528103650639853 0.873746965625565 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 44 50 94 20.7634393718465 26.4051825319927 -5.64174316014618 A:G A G 10 0.528103650639853 0.256867828768097 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 97345558 C/T 1 38 35 73 17.9320612756856 18.4836277723949 -0.551566496709267 T:C C T 10 0.528103650639853 0.90723125624163 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97345542_97345757:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97345542_97345750:NDUFAF4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 99374397 A/G 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99374353_99374936:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99374353_99374936:FBXL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368322400865039 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 101094554 A/G 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G A G 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101094491_101094645:ASCC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 24 17 41 11.3255123846435 8.9777620608775 2.34775032376603 A:C A C 10 0.528103650639853 0.532670531600526 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:T A T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 33 27 60 15.5725795288849 14.258798567276 1.31378096160882 T:G G T 10 0.528103650639853 0.796501367940377 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 57 12 69 26.8980919135284 6.33724380767824 20.5608481058501 T:G G T 10 0.528103650639853 3.4319581570881e-07 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 57 12 69 26.8980919135284 6.33724380767824 20.5608481058501 T:C C T 10 0.528103650639853 3.4319581570881e-07 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 68 54 122 32.08895175649 28.5175971345521 3.57135462193794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.527147691260855 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 25 24 49 11.7974087340037 12.6744876153565 -0.877078881352798 T:C T C 10 0.528103650639853 0.886456564905082 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 34 21 55 16.044475878245 11.0901766634369 4.95429921480809 T:C T C 10 0.528103650639853 0.223910816018479 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 110064928 A/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:T A T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110064878_110064975:FIG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 25 13 38 11.7974087340037 6.86534745831809 4.93206127568559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.142776864266523 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 111628708 A/G 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 A:G A G 10 0.528103650639853 0.130559033023297 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 54 53 107 25.4824028654479 27.9894934839122 -2.50709061846427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.629889870249028 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 2262 0 2262 1067.42954225265 0 1067.42954225265 C C 10 0.528103650639853 0 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 17 14 31 8.0222379391225 7.39345110895794 0.628786830164557 A:C C A 10 0.528103650639853 0.859035893617188 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 119669877 C/T 1 8 14 22 3.77517079488118 7.39345110895794 -3.61828031407677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.138184227038771 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119669628_119670452:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119669628_119670452:MAN1A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 20 25 45 9.43792698720294 13.2025912659963 -3.76466427879338 T:G T G 10 0.528103650639853 0.296893404034065 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 25 41 66 11.7974087340037 21.652249676234 -9.8548409422303 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0185698251118230 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 15 5 20 7.07844524040221 2.64051825319926 4.43792698720294 T:C T C 10 0.528103650639853 0.070570681987361 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 130761804 C/T 0 23 0 23 10.8536160352834 0 10.8536160352834 C C 10 0.528103650639853 4.50827213267504e-07 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 7 20 27 3.30327444552103 10.5620730127971 -7.25879856727603 A:G A G 10 0.528103650639853 0.006173864224338 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 1 8 9 0.471896349360147 4.22482920511882 -3.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0160432936254252 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136554628 G/A 1 42 21 63 19.8196466731262 11.0901766634369 8.72947000968926 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0314653231118147 ENSG00000146410:ENST00000451457:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000367784:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000420702:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000275229:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532282:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532958:exon_136554282_136554637:FAM54A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 312 0 312 147.231661000366 0 147.231661000366 T T 10 0.528103650639853 3.28696213079077e-87 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 340 0 340 160.44475878245 0 160.44475878245 A A 10 0.528103650639853 6.61668733038717e-95 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 337 0 337 159.02906973437 0 159.02906973437 A A 10 0.528103650639853 4.76444037641591e-94 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 267 0 267 125.996325279159 0 125.996325279159 G G 10 0.528103650639853 1.00351366405431e-74 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 364 0 364 171.770271167094 0 171.770271167094 T T 10 0.528103650639853 1.20814674964462e-101 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136904783 G/A 1 25 20 45 11.7974087340037 10.5620730127971 1.23533572120662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.76647967814017 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000463140:exon_136904693_136904878:MAP3K5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136934321 T/C 1 13 8 21 6.13465254168191 4.22482920511882 1.90982333656309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.51359416898744 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136934258_136934394:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136934258_136934394:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136934258_136934394:MAP3K5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 32 35 67 15.1006831795247 18.4836277723949 -3.38294459287015 T:G T G 10 0.528103650639853 0.463218522378622 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 139229872 C/T 1 29 28 57 13.6849941314443 14.7869022179159 -1.10190808647162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.79201240933562 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000478483:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526022:exon_139229805_139229874:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526244:exon_139229805_139230049:REPS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 9 15 24 4.24706714424132 7.92155475959779 -3.67448761535647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.154361116643106 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 144852201 G/A 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144852188_144852338:UTRN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 144869785 A/G 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144869776_144869990:UTRN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 147680359 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000164506:ENST00000367479:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000179882:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367481:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000321680:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367480:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000367475:exon_147680220_147680459:STXBP5;ENSG00000164506:ENST00000392291:exon_147680220_147680459:STXBP5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 149795380 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 24 15 39 11.3255123846435 7.92155475959779 3.40395762504573 T:C C T 10 0.528103650639853 0.336333370784763 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 149983216 G/A 1 18 10 28 8.49413428848265 5.28103650639853 3.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.258843407287316 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_149982051_149983374:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_149982833_149983374:LATS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 23 29 52 10.8536160352834 15.3150058685557 -4.46138983327235 A:G A G 10 0.528103650639853 0.266335355495242 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 151152059 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000120278:ENST00000367328:exon_151151718_151153341:PLEKHG1;ENSG00000120278:ENST00000358517:exon_151151718_151153341:PLEKHG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 4 11 15 1.88758539744059 5.80914015703838 -3.92155475959779 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0668301083998627 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 47 45 92 22.1791284199269 23.7646642787934 -1.58553585886647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.755043769488086 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 27 32 59 12.741201432724 16.8993168204753 -4.15811538775133 A:C C A 10 0.528103650639853 0.298533427323511 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 51 48 99 24.0667138173675 25.3489752307129 -1.28226141334545 A:G G A 10 0.528103650639853 0.840685255150146 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 41 38 79 19.347750323766 20.0679387243144 -0.720188400548384 C:G G C 10 0.528103650639853 0.910514509220418 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 155618219 A/G 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155618087_155618238:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155618087_155618238:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000487586:exon_155618095_155618238:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155618215_155618238:TFB1M HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 157510853 C/G 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157510776_157510914:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157510776_157510914:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157510776_157510914:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157510776_157510914:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157510776_157510914:ARID1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 158497717 T/C 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 T:C T C 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158497658_158497814:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158497658_158497814:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158497658_158497814:SYNJ2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 15 24 39 7.07844524040221 12.6744876153565 -5.59604237495427 C:G C G 10 0.528103650639853 0.078870130036717 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 12 17 29 5.66275619232176 8.9777620608775 -3.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.265077380070381 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 42 41 83 19.8196466731262 21.652249676234 -1.8326030031078 A:T T A 10 0.528103650639853 0.741881768865223 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.743343147592765 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 92 75 167 43.4144641411335 39.607773797989 3.80669034314455 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.587795514545077 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 41 47 88 19.347750323766 24.8208715800731 -5.47312125630706 T:C T C 10 0.528103650639853 0.285596291109463 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 160201295 C/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:C C A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 33 31 64 15.5725795288849 16.3712131698354 -0.798633640950591 T:C C T 10 0.528103650639853 0.900587152139416 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 166572005 T/C 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 23 37 60 10.8536160352834 19.5398350736746 -8.68621903839118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0276684378569138 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 11 20 31 5.19085984296162 10.5620730127971 -5.37121316983544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0706075298577317 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 210 248 458 99.0982333656309 130.969705358684 -31.8714719930527 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00315521030941819 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 52 61 113 24.5386101667276 32.214322689031 -7.67571252230339 T:C T C 10 0.528103650639853 0.157985729498772 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 13 11 24 6.13465254168191 5.80914015703838 0.325512384643528 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 168347560 C/T 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168347387_168347581:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507679:exon_168347387_168347581:MLLT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170591923 T/G 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000198719:ENST00000366756:exon_170591294_170591967:DLL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 25 30 55 11.7974087340037 15.8431095191956 -4.04570078519192 T:C T C 10 0.528103650639853 0.283169598884180 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 77 41 118 36.3360189007313 21.652249676234 14.6837692244973 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.0073130973343054 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 62 37 99 29.2575736603291 19.5398350736746 9.71773858665455 T:C T C 10 0.528103650639853 0.055625198953801 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 87 39 126 41.0549823943328 20.5960423749543 20.4589400193785 A:G A G 10 0.528103650639853 0.000235245126028543 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 68 58 126 32.08895175649 30.6300117371115 1.45894001937852 T:G T G 10 0.528103650639853 0.858464829347851 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 819679 G/A 1 17 15 32 8.0222379391225 7.92155475959779 0.100683179524705 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_819590_819781:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_819590_819781:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_819590_819781:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_819590_819781:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000461576:exon_819541_819781:HEATR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 891636 G/A 1 22 14 36 10.3817196859232 7.39345110895794 2.98826857696529 A:G G A 10 0.528103650639853 0.404300870104369 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000464442:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000480475:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000488628:exon_891587_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000463848:exon_891187_891680:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_891587_891680:SUN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 17 26 43 8.0222379391225 13.7306949166362 -5.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0930511009166986 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 1131394 G/A 1 16 23 39 7.55034158976235 12.1463839647166 -4.59604237495427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.151232432602676 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 A:G G A 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 22 26 48 10.3817196859232 13.7306949166362 -3.34897523071294 A:G G A 10 0.528103650639853 0.386272598596215 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 38 31 69 17.9320612756856 16.3712131698354 1.56084810585014 T:C T C 10 0.528103650639853 0.719527630389531 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 20 9 29 9.43792698720294 4.75293285575868 4.68499413144426 T:C C T 10 0.528103650639853 0.094745459500254 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 16 13 29 7.55034158976235 6.86534745831809 0.684994131444263 T:C T C 10 0.528103650639853 0.854027499191445 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 16 6 22 7.55034158976235 3.16862190383912 4.38171968592323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.085649833785824 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2579463 G/A 1 9 15 24 4.24706714424132 7.92155475959779 -3.67448761535647 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.154361116643106 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2579420_2579522:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2579420_2580686:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2579420_2580686:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2579178_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2579420_2580686:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2579420_2580686:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2579420_2579522:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 5 10 15 2.35948174680074 5.28103650639853 -2.92155475959779 T:C C T 10 0.528103650639853 0.194694511215894 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 16 10 26 7.55034158976235 5.28103650639853 2.26930508336382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.434914527433077 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 20 8 28 9.43792698720294 4.22482920511882 5.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0578563592887067 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 40 36 76 18.8758539744059 19.0117314230347 -0.135877448628825 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 8 18 26 3.77517079488118 9.50586571151735 -5.73069491663618 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0297607143692655 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 A:G G A 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 80 98 178 37.7517079488118 51.7541577627056 -14.0024498138938 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0423638002101412 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 21 14 35 9.90982333656309 7.39345110895794 2.51637222760515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.49886719523201 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6066450 T/C 1 80 73 153 37.7517079488118 38.5515664967093 -0.799858547897507 T:C T C 10 0.528103650639853 0.93552283033933 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 65 51 116 30.6732627084096 26.9332861826325 3.73997652577705 T:C T C 10 0.528103650639853 0.515828900693913 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6204999 A/C 1 15 18 33 7.07844524040221 9.50586571151735 -2.42742047111515 A:C A C 10 0.528103650639853 0.486205427284594 ENSG00000008256:ENST00000350796:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000396741:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000465320:exon_6204904_6205058:CYTH3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 32 24 56 15.1006831795247 12.6744876153565 2.42619556416823 T:C C T 10 0.528103650639853 0.592925006147413 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 32 34 66 15.1006831795247 17.955524121755 -2.8548409422303 A:G G A 10 0.528103650639853 0.538110000303858 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 25 23 48 11.7974087340037 12.1463839647166 -0.348975230712943 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 177 112 289 83.525653836746 59.1476088716635 24.3780449650825 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00460159465129713 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 25 24 49 11.7974087340037 12.6744876153565 -0.877078881352798 A:G G A 10 0.528103650639853 0.886456564905082 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G A G 10 0.528103650639853 1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 7277950 C/T 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000106392:ENST00000429911:exon_7277886_7278059:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000419721:exon_7277886_7277965:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000436587:exon_7277886_7278553:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000223122:exon_7277886_7278553:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000402468:exon_7277886_7278595:C1GALT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 61 57 118 28.785677310969 30.1019080864716 -1.31623077550265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.853852584561484 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 C:G C G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 10979697 G/A 1 117 111 228 55.2118728751372 58.6195052210237 -3.40763234588648 A:G G A 10 0.528103650639853 0.690739017588225 ENSG00000189043:ENST00000339600:exon_10979643_10979883:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000486007:exon_10979643_10979706:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000492822:exon_10979587_10979762:NDUFA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 34 22 56 16.044475878245 11.6182803140768 4.42619556416823 A:G G A 10 0.528103650639853 0.284331625911785 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 6 11 17 2.83137809616088 5.80914015703838 -2.9777620608775 C:G G C 10 0.528103650639853 0.223549342746253 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 23313171 T/C 1 2 15 17 0.943792698720294 7.92155475959779 -6.9777620608775 T:C T C 10 0.528103650639853 0.000856148868719188 ENSG00000136235:ENST00000258733:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000381990:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000425903:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000453162:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000435486:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000470994:exon_23313140_23313544:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000463011:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000478451:exon_23313140_23313233:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000468723:exon_23312912_23313233:GPNMB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 54 27 81 25.4824028654479 14.258798567276 11.2236042981719 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0139929130268716 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 65 43 108 30.6732627084096 22.7084569775137 7.96480573089588 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.147941574569173 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 24758852 C/T 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 30491311 C/T 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C C T 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000106100:ENST00000222823:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000434755:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000439183:exon_30490832_30492656:NOD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 39 59 98 18.4039576250457 31.1581153877513 -12.7541577627056 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0111744263667031 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 26 22 48 12.2693050833638 11.6182803140768 0.651024769287057 C:G C G 10 0.528103650639853 0.885917211675883 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 27 27 54 12.741201432724 14.258798567276 -1.51759713455206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.685288058641802 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 T:C C T 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 18 18 36 8.49413428848265 9.50586571151735 -1.01173142303471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.741928470590991 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 41 27 68 19.347750323766 14.258798567276 5.08895175649 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.226724289352016 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 165 134 299 77.8628976444243 70.7658891857403 7.09700845868394 A:G G A 10 0.528103650639853 0.418016712241886 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 43916491 G/A 1 31 49 80 14.6287868301646 25.8770788813528 -11.2482920511882 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0134375025350657 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 34 27 61 16.044475878245 14.258798567276 1.78567731096897 T:G T G 10 0.528103650639853 0.70132143859748 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 37 50 87 17.4601649263254 26.4051825319927 -8.94501760566721 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0673272923180093 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 7 8 15 3.30327444552103 4.22482920511882 -0.921554759597795 T:C C T 10 0.528103650639853 0.797125140631411 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 55 71 126 25.9542992148081 37.4953591954296 -11.5410599806215 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0404228469396196 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45143892 A/G 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:G A G 10 0.528103650639853 0.488275399095619 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45144113 C/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 122 140 262 57.5713546219379 73.9345110895794 -16.3631564676415 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0475201470314098 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 44 45 89 20.7634393718465 23.7646642787934 -3.00122490694691 A:T:C C A 10 0.528103650639853 0.526441281973655 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 56087330 T/C 1 9 3 12 4.24706714424132 1.58431095191956 2.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.153619869440870 ENSG00000146733:ENST00000437355:exon_56087293_56087427:PSPH;ENSG00000146733:ENST00000275605:exon_56087293_56087427:PSPH;ENSG00000146733:ENST00000395471:exon_56087293_56087427:PSPH;ENSG00000146733:ENST00000421626:exon_56087293_56087427:PSPH;ENSG00000146733:ENST00000427797:exon_56087293_56087501:PSPH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 240 253 493 113.255123846435 133.610223611883 -20.3550997654475 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0710907693765129 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 63982799 T/A 1 2 6 8 0.943792698720294 3.16862190383912 -2.22482920511882 A:T T A 10 0.528103650639853 0.160006891527948 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680;ENSG00000173041:ENST00000476563:exon_63982304_63982878:ZNF680 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 13 15 28 6.13465254168191 7.92155475959779 -1.78690221791588 C:G G C 10 0.528103650639853 0.5719128206726 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 34 27 61 16.044475878245 14.258798567276 1.78567731096897 T:C C T 10 0.528103650639853 0.70132143859748 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 47 67 114 22.1791284199269 35.3829445928702 -13.2038161729432 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0145493512589282 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 19 36 55 8.96603063784279 19.0117314230347 -10.0457007851919 A:G A G 10 0.528103650639853 0.00687082583137596 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 104 246 350 49.0772203334553 129.913498057404 -80.8362777239486 A:G G A 10 0.528103650639853 2.80294211169359e-18 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 25 19 44 11.7974087340037 10.0339693621572 1.76343937184647 T:C T C 10 0.528103650639853 0.652078105468931 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 23 28 51 10.8536160352834 14.7869022179159 -3.9332861826325 T:C C T 10 0.528103650639853 0.326303883941055 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 14 11 25 6.60654889104206 5.80914015703838 0.797408734003676 A:G A G 10 0.528103650639853 0.842406966522714 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 62 76 138 29.2575736603291 40.1358774486288 -10.8783037882997 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0730550522344716 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 81 56 137 38.2236042981719 29.5738044358318 8.64979986234014 A:G G A 10 0.528103650639853 0.146233330210490 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 27 24 51 12.741201432724 12.6744876153565 0.0667138173674964 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:C C T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 13 14 27 6.13465254168191 7.39345110895794 -1.25879856727603 A:G A G 10 0.528103650639853 0.701591240329278 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 11 9 20 5.19085984296162 4.75293285575868 0.437926987202941 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 16 18 34 7.55034158976235 9.50586571151735 -1.955524121755 A:C A C 10 0.528103650639853 0.607017625505778 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 111 137 248 52.3804947789763 72.3502001376599 -19.9697053586835 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0129659457974490 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 13 13 26 6.13465254168191 6.86534745831809 -0.730694916636178 T:C T C 10 0.528103650639853 0.845438438309726 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 26 21 47 12.2693050833638 11.0901766634369 1.17912841992691 C:G C G 10 0.528103650639853 0.771647354948445 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92027906 C/A 1 61 72 133 28.785677310969 38.0234628460694 -9.23778553510045 A:C C A 10 0.528103650639853 0.118019719273851 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92404016 G/C 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 C:G G C 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000105810:ENST00000265734:exon_92404010_92404145:CDK6;ENSG00000105810:ENST00000424848:exon_92404010_92404145:CDK6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92731586 A/G 1 36 35 71 16.9882685769653 18.4836277723949 -1.49535919542956 A:G A G 10 0.528103650639853 0.723367916243353 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 58 48 106 27.3699882628885 25.3489752307129 2.02101303217558 A:G G A 10 0.528103650639853 0.77056431555666 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92764419 A/G 1 38 40 78 17.9320612756856 21.1241460255941 -3.19208474990853 A:G A G 10 0.528103650639853 0.497361215326385 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 43 48 91 20.2915430224863 25.3489752307129 -5.05743220822662 T:C C T 10 0.528103650639853 0.29561172739004 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C T C 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 97841618 G/C 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000180535:ENST00000314018:exon_97841566_97842271:BHLHA15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 24 22 46 11.3255123846435 11.6182803140768 -0.292767929433237 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 99097689 G/A 1 21 16 37 9.90982333656309 8.44965841023765 1.46016492632544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.742489529985631 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99097261_99097887:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000481881:exon_99097261_99097898:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000485576:exon_99097261_99097920:ZNF394 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 18 28 46 8.49413428848265 14.7869022179159 -6.29276792943324 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0757808345697918 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 14 22 36 6.60654889104206 11.6182803140768 -5.01173142303471 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0980717102967213 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100281768 T/C 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100281643_100281780:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000472105:exon_100281643_100281960:GIGYF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 40 34 74 18.8758539744059 17.955524121755 0.92032985265088 A:G G A 10 0.528103650639853 0.907442424798333 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 27 40 67 12.741201432724 21.1241460255941 -8.38294459287015 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0495380410132149 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 73 88 161 34.4484335032907 46.4731212563071 -12.0246877530163 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0585500259068466 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 18 14 32 8.49413428848265 7.39345110895794 1.1006831795247 T:C C T 10 0.528103650639853 0.726829864786135 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 T:G T G 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 45 50 95 21.2353357212066 26.4051825319927 -5.16984681078603 T:C T C 10 0.528103650639853 0.305102744310374 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G G A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 16 21 37 7.55034158976235 11.0901766634369 -3.53983507367456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.253776528805514 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 102952631 T/C 1 9 27 36 4.24706714424132 14.258798567276 -10.0117314230347 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00117251398335328 ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102952503_102952862:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000469560:exon_102952503_102952798:PMPCB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 12 3 15 5.66275619232176 1.58431095191956 4.07844524040221 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0393940244088059 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 13 26 39 6.13465254168191 13.7306949166362 -7.59604237495427 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0160530135830872 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 112096073 T/C 1 13 20 33 6.13465254168191 10.5620730127971 -4.42742047111515 T:C T C 10 0.528103650639853 0.162165519301767 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000443101:exon_112096057_112096128:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000429071:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000476927:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000440625:exon_112096057_112096141:IFRD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 115889369 G/T 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000135269:ENST00000461440:exon_115889074_115889631:TES;ENSG00000135269:ENST00000496871:exon_115889074_115889860:TES;ENSG00000135269:ENST00000485009:exon_115889074_115890086:TES HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 127222544 G/A 1 25 24 49 11.7974087340037 12.6744876153565 -0.877078881352798 A:G G A 10 0.528103650639853 0.886456564905082 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 23 14 37 10.8536160352834 7.39345110895794 3.46016492632544 T:C T C 10 0.528103650639853 0.323315400762097 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 34 30 64 16.044475878245 15.8431095191956 0.201366359049409 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 45 41 86 21.2353357212066 21.652249676234 -0.416913955027354 A:T:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 C:G G C 10 0.528103650639853 0.390773887480627 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 8 2 10 3.77517079488118 1.05620730127971 2.71896349360147 T:G T G 10 0.528103650639853 0.114928336316658 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 8 11 19 3.77517079488118 5.80914015703838 -2.03396936215721 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368322400865039 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 12 21 33 5.66275619232176 11.0901766634369 -5.42742047111515 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0797424808549282 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 517 0 517 243.970412619196 0 243.970412619196 T T 10 0.528103650639853 5.05512878708015e-144 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 135069400 C/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 C:G C G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000080802:ENST00000414802:exon_135069042_135069483:CNOT4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 135242688 C/T 1 6 5 11 2.83137809616088 2.64051825319926 0.190859842961617 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135242667_135242720:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000448354:exon_135242679_135242720:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000451477:exon_135242679_135242720:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000440390:exon_135242679_135242720:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000489493:exon_135242680_135242962:NUP205 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 135269655 T/C 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:C T C 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135269580_135269755:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000448354:exon_135269580_135269755:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000451477:exon_135269580_135269755:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000440390:exon_135269580_135269755:NUP205 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 135292098 G/A 1 11 3 14 5.19085984296162 1.58431095191956 3.60654889104206 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0627944859050089 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000472132:exon_135291995_135292119:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000463247:exon_135291995_135292119:NUP205 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 135333172 C/T 1 84 63 147 39.6392933462524 33.2705299903107 6.36876335594162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.321686087757877 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135333152_135333472:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135333152_135333473:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000491089:exon_135333152_135333497:NUP205 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 21 16 37 9.90982333656309 8.44965841023765 1.46016492632544 A:G G A 10 0.528103650639853 0.742489529985631 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 142495156 T/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 T:G T G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 305 1 306 143.928386554845 0.528103650639853 143.400282904205 T:C T C 10 0.528103650639853 6.45893489410593e-83 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 100 129 229 47.1896349360147 68.125370932541 -20.9357359965263 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00653290005095208 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 148851213 G/A 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000197024:ENST00000420008:exon_148851058_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000426851:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000485111:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000475153:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000483892:exon_148851037_148851409:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000491174:exon_148851037_148851432:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000335901:exon_148851037_148851432:ZNF398 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 17 15 32 8.0222379391225 7.92155475959779 0.100683179524705 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 26 14 40 12.2693050833638 7.39345110895794 4.87585397440588 A:G A G 10 0.528103650639853 0.153559763683756 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 42 47 89 19.8196466731262 24.8208715800731 -5.00122490694691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.290832738220748 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 74 46 120 34.9203298526509 24.2927679294332 10.6275619232176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0549377750944304 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 69 43 112 32.5608481058501 22.7084569775137 9.85239112833646 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0717786602806912 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 75 68 143 35.392226202011 35.91104824351 -0.518822041498979 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.933478895948569 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 A:G A G 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 A:G G A 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150217335 G/T 1 22 25 47 10.3817196859232 13.2025912659963 -2.82087158007309 T:C:G G T 10 0.528103650639853 0.465936799923338 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150269542 G/T 0 0 11 11 0 5.80914015703838 -5.80914015703838 T G T 10 0.528103650639853 0.000258412069235989 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000478135:exon_150269217_150269621:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000479232:exon_150269217_150269569:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 50 28 78 23.5948174680073 14.7869022179159 8.80791525009147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0533722092756313 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 44 26 70 20.7634393718465 13.7306949166362 7.03274445521029 T:C C T 10 0.528103650639853 0.095113449570958 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 60 66 126 28.3137809616088 34.8548409422303 -6.54105998062148 T:C T C 10 0.528103650639853 0.247429231027992 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 64 49 113 30.2013663590494 25.8770788813528 4.32428747769661 C:G G C 10 0.528103650639853 0.451448175549752 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150417677 G/A 1 10 6 16 4.71896349360147 3.16862190383912 1.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.465976252948737 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150742350 C/G 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 C:G C G 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150768505 G/A 1 9 13 22 4.24706714424132 6.86534745831809 -2.61828031407677 A:G G A 10 0.528103650639853 0.291233724549757 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768477_150768692:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768477_150768692:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768477_150768692:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768477_150768692:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768477_150768692:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000480107:exon_150768477_150768688:SLC4A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 20 24 44 9.43792698720294 12.6744876153565 -3.23656062815353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.366409941001759 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 35 52 87 16.5163722276051 27.4613898332724 -10.9450176056672 A:T A T 10 0.528103650639853 0.0235895991434269 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 44 29 73 20.7634393718465 15.3150058685557 5.44843350329073 A:G A G 10 0.528103650639853 0.240947572901795 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 151859683 G/A 1 20 22 42 9.43792698720294 11.6182803140768 -2.18035332687382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.5386334947568 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 156754864 C/T 1 20 12 32 9.43792698720294 6.33724380767824 3.1006831795247 T:C C T 10 0.528103650639853 0.293179899019863 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156754845_156754955:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000475176:exon_156754845_156754955:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156754862_156754955:NOM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 156979662 C/T 1 13 23 36 6.13465254168191 12.1463839647166 -6.01173142303471 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0466453709490248 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000389103:exon_156979528_156979715:UBE3C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 45 31 76 21.2353357212066 16.3712131698354 4.86412255137117 T:C T C 10 0.528103650639853 0.301400812032439 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 157024038 A/G 1 20 23 43 9.43792698720294 12.1463839647166 -2.70845697751368 A:G A G 10 0.528103650639853 0.446945968585884 ENSG00000009335:ENST00000497368:exon_157023774_157024509:UBE3C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 46 53 99 21.7072320705668 27.9894934839122 -6.28226141334545 A:C:G G A 10 0.528103650639853 0.227271452721979 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 23 38 61 10.8536160352834 20.0679387243144 -9.21432268903103 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0206125260158456 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 37 32 69 17.4601649263254 16.8993168204753 0.560848105850145 A:G G A 10 0.528103650639853 0.904739106984912 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 32 30 62 15.1006831795247 15.8431095191956 -0.742426339670885 T:C:G G C 10 0.528103650639853 0.899084848581718 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 39 27 66 18.4039576250457 14.258798567276 4.1451590577697 T:C T C 10 0.528103650639853 0.326059915889846 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 34 17 51 16.044475878245 8.9777620608775 7.0667138173675 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0501478376466283 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 37 20 57 17.4601649263254 10.5620730127971 6.89809191352838 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0838007463280105 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 8 7 15 3.77517079488118 3.69672555447897 0.0784452404022051 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 196274 T/G 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:G T G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000172748:ENST00000308811:exon_195154_197342:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000320552:exon_195197_196362:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000398612:exon_195154_197332:ZNF596;ENSG00000172748:ENST00000382859:exon_195154_197332:ZNF596 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6302487 A/G 1 57 50 107 26.8980919135284 26.4051825319927 0.492909381535728 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 12 8 20 5.66275619232176 4.22482920511882 1.43792698720294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.65561640446159 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 9 16 25 4.24706714424132 8.44965841023765 -4.20259126599632 A:C C A 10 0.528103650639853 0.109639086474819 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 T:C C T 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 42 27 69 19.8196466731262 14.258798567276 5.56084810585014 C:G C G 10 0.528103650639853 0.186921930553417 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 23 8 31 10.8536160352834 4.22482920511882 6.62878683016456 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0188177929137802 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 10 9 19 4.71896349360147 4.75293285575868 -0.0339693621572064 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 9 5 14 4.24706714424132 2.64051825319926 1.60654889104206 C:G G C 10 0.528103650639853 0.434296664420084 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 23 3 26 10.8536160352834 1.58431095191956 9.26930508336382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.000223253546639947 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 1 22 3 25 10.3817196859232 1.58431095191956 8.79740873400368 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000387343600132062 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 1 20 3 23 9.43792698720294 1.58431095191956 7.85361603528338 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.00115029986326737 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 21 18 39 9.90982333656309 9.50586571151735 0.403957625045734 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8998262 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000173281:ENST00000310455:exon_8993765_8999178:PPP1R3B;ENSG00000173281:ENST00000519699:exon_8997073_8999178:PPP1R3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 8998263 T/G 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:G T G 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000173281:ENST00000310455:exon_8993765_8999178:PPP1R3B;ENSG00000173281:ENST00000519699:exon_8997073_8999178:PPP1R3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 11162496 A/C 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:C A C 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11162350_11162523:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11162350_11162523:MTMR9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 11407723 A/G 1 63 72 135 29.7294700096893 38.0234628460694 -8.29399283638015 A:G A G 10 0.528103650639853 0.167822572582843 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11407668_11407771:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11407668_11407771:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11407668_11407771:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11407503_11407771:BLK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17132462 A/G 1 23 30 53 10.8536160352834 15.8431095191956 -4.98949348391221 A:G A G 10 0.528103650639853 0.172326397331159 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17132242_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17132242_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17132285_17132467:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17132242_17132467:VPS37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 10 14 24 4.71896349360147 7.39345110895794 -2.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.310421695696587 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 22 16 38 10.3817196859232 8.44965841023765 1.93206127568559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.626706429561788 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 21 16 37 9.90982333656309 8.44965841023765 1.46016492632544 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.742489529985631 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 42 35 77 19.8196466731262 18.4836277723949 1.33601890073132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.819778648732988 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 37 18 55 17.4601649263254 9.50586571151735 7.95429921480809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0417992027794795 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 14 14 28 6.60654889104206 7.39345110895794 -0.786902217915884 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.850667454315956 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 21833965 C/T 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21833867_21834032:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21833867_21834032:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518017:exon_21833867_21834013:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21833867_21834032:XPO7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 T:G G T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 94 78 172 44.3582568398538 41.1920847499085 3.16617208994529 C:G G C 10 0.528103650639853 0.647415232926765 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 18 21 39 8.49413428848265 11.0901766634369 -2.59604237495427 A:G G A 10 0.528103650639853 0.426412497795246 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 23058220 T/G 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 T:G T G 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000104689:ENST00000221132:exon_23058200_23058273:TNFRSF10A;ENSG00000104689:ENST00000524158:exon_23058200_23058273:TNFRSF10A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 7 14 21 3.30327444552103 7.39345110895794 -4.09017666343691 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0828202401380353 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 23 16 39 10.8536160352834 8.44965841023765 2.40395762504573 T:C T C 10 0.528103650639853 0.522034501209129 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 53 40 93 25.0105065160878 21.1241460255941 3.88636049049367 A:G G A 10 0.528103650639853 0.467584826550466 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 26240637 C/G 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 C:G C G 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 23 15 38 10.8536160352834 7.92155475959779 2.93206127568559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.417137892344015 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 45 58 103 21.2353357212066 30.6300117371115 -9.39467601590486 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0752153611611946 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 86 107 193 40.5830860449726 56.5070906184643 -15.9240045734916 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0251779777039930 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 95 95 190 44.830153189214 50.169846810786 -5.33969362157207 T:C T C 10 0.528103650639853 0.467634820656021 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 254 197 451 119.861672737477 104.036419176051 15.8252535614263 A:G A G 10 0.528103650639853 0.143703281371566 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 248 199 447 117.030294641316 105.092626477331 11.9376681639857 A:G A G 10 0.528103650639853 0.275891609418473 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 8 20 28 3.77517079488118 10.5620730127971 -6.78690221791588 A:C A C 10 0.528103650639853 0.0127969504016873 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 A:G A G 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 3 11 14 1.41568904808044 5.80914015703838 -4.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0287103645641043 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 29005093 A/G 1 4 8 12 1.88758539744059 4.22482920511882 -2.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.248299121496119 ENSG00000197892:ENST00000524189:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000357808:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000355514:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000404075:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000522355:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000521515:exon_29004909_29005119:KIF13B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 19 11 30 8.96603063784279 5.80914015703838 3.15689048080441 T:G G T 10 0.528103650639853 0.276471972187682 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 12 10 22 5.66275619232176 5.28103650639853 0.381719685923234 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 9 12 21 4.24706714424132 6.33724380767824 -2.09017666343691 A:G A G 10 0.528103650639853 0.389238605930617 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 5 15 20 2.35948174680074 7.92155475959779 -5.56207301279706 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0137985402926307 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 5 12 17 2.35948174680074 6.33724380767824 -3.9777620608775 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0860317525321938 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 23 20 43 10.8536160352834 10.5620730127971 0.291543022486323 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 20 21 41 9.43792698720294 11.0901766634369 -1.65224967623397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.6410938660349 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 22 21 43 10.3817196859232 11.0901766634369 -0.708456977513677 A:G A G 10 0.528103650639853 0.879218371784125 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 67 66 133 31.6170554071299 34.8548409422303 -3.23778553510045 A:G A G 10 0.528103650639853 0.602774310521642 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 37702472 G/A 1 18 23 41 8.49413428848265 12.1463839647166 -3.65224967623397 A:G G A 10 0.528103650639853 0.275913885562019 ENSG00000104221:ENST00000220659:exon_37700786_37702731:BRF2;ENSG00000104221:ENST00000520601:exon_37702220_37702731:BRF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 37730593 A/G 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G A G 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 13 7 20 6.13465254168191 3.69672555447897 2.43792698720294 T:C C T 10 0.528103650639853 0.371172980461534 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 12 18 30 5.66275619232176 9.50586571151735 -3.84310951919559 A:G A G 10 0.528103650639853 0.200371604884740 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 15 15 30 7.07844524040221 7.92155475959779 -0.84310951919559 T:C C T 10 0.528103650639853 0.8554588551812 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 49 0 49 23.1229211186472 0 23.1229211186472 T T 10 0.528103650639853 3.17228096104882e-14 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 80 89 169 37.7517079488118 47.0012249069469 -9.24951695813515 A:G A G 10 0.528103650639853 0.165595408775269 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 35 30 65 16.5163722276051 15.8431095191956 0.673262708409556 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.90163495487036 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 36 43 79 16.9882685769653 22.7084569775137 -5.72018840054838 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.215702120989916 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 41525914 C/T 1 3 6 9 1.41568904808044 3.16862190383912 -1.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.322518147187976 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41525859_41526082:ANK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 42176890 C/T 1 20 17 37 9.43792698720294 8.9777620608775 0.46016492632544 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000104365:ENST00000520810:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000416505:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000379708:exon_42176788_42177022:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517890:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523105:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520835:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517917:exon_42176788_42177268:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000518679:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000342222:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520201:exon_42176788_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000521661:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520655:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523517:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517502:exon_42176788_42176939:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000522785:exon_42176788_42176939:IKBKB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 48769846 G/A 1 6 6 12 2.83137809616088 3.16862190383912 -0.337243807678236 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48769717_48769860:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48769717_48769860:AC103686.1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 27 16 43 12.741201432724 8.44965841023765 4.29154302248632 A:G A G 10 0.528103650639853 0.222375999999956 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 19 18 37 8.96603063784279 9.50586571151735 -0.53983507367456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.87078300601169 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 53586706 A/G 1 13 13 26 6.13465254168191 6.86534745831809 -0.730694916636178 A:G A G 10 0.528103650639853 0.845438438309726 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53586405_53586834:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53586405_53586834:RB1CC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 63938764 G/A 1 28 24 52 13.2130977820841 12.6744876153565 0.538610166727644 A:G G A 10 0.528103650639853 0.890704333337229 ENSG00000137563:ENST00000518466:exon_63938717_63938792:GGH;ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518113:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63938717_63938855:GGH HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 67380528 T/C 1 5 6 11 2.35948174680074 3.16862190383912 -0.809140157038383 T:C T C 10 0.528103650639853 0.765474494045665 ENSG00000147576:ENST00000396623:exon_67380504_67381142:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000415254:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000424777:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000447940:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000435418:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000276576:exon_67380504_67381042:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000426810:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000496501:exon_67380504_67380769:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000419955:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000466739:exon_67380504_67380899:ADHFE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 68204143 T/A 1 11 13 24 5.19085984296162 6.86534745831809 -1.67448761535647 A:T T A 10 0.528103650639853 0.543574679313419 ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68204082_68204358:ARFGEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 27 25 52 12.741201432724 13.2025912659963 -0.461389833272356 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 24 21 45 11.3255123846435 11.0901766634369 0.235335721206615 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 17 9 26 8.0222379391225 4.75293285575868 3.26930508336382 C:G G C 10 0.528103650639853 0.240227554985515 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 156 137 293 73.6158305001829 72.3502001376599 1.26563036252308 A:G A G 10 0.528103650639853 0.906908661745912 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 62 97 159 29.2575736603291 51.2260541120657 -21.9684804517366 C:G C G 10 0.528103650639853 0.00059338518761697 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 82615074 T/C 1 56 71 127 26.4261955641682 37.4953591954296 -11.0691636312613 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0508223599035859 ENSG00000104231:ENST00000524305:exon_82613569_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000523096:exon_82613957_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000220669:exon_82613958_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000522520:exon_82614000_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000519338:exon_82614394_82615124:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000522032:exon_82614559_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000519464:exon_82614779_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521895:exon_82614783_82615092:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521287:exon_82614917_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000523431:exon_82614964_82615100:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000520635:exon_82615060_82615100:ZFAND1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 94935721 A/G 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 A:G A G 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000164951:ENST00000297598:exon_94934244_94938290:PDP1;ENSG00000164951:ENST00000520728:exon_94934244_94936616:PDP1;ENSG00000164951:ENST00000517764:exon_94934244_94936184:PDP1;ENSG00000164951:ENST00000396200:exon_94934244_94938294:PDP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95272605 G/C 1 7 1 8 3.30327444552103 0.528103650639853 2.77517079488118 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0737733790309771 ENSG00000164949:ENST00000396194:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000297596:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523660:exon_95272044_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000521817:exon_95272231_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523433:exon_95272451_95272740:GEM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 A:G A G 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 34 51 85 16.044475878245 26.9332861826325 -10.8888103043875 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0220177933730741 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 31 39 70 14.6287868301646 20.5960423749543 -5.96725554478971 T:C T C 10 0.528103650639853 0.187511519051272 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 29 24 53 13.6849941314443 12.6744876153565 1.01050651608779 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.890745344647234 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 19 25 44 8.96603063784279 13.2025912659963 -4.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.227976883056393 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 22 20 42 10.3817196859232 10.5620730127971 -0.180353326873824 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 19 13 32 8.96603063784279 6.86534745831809 2.1006831795247 A:G G A 10 0.528103650639853 0.484258530347796 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 27 25 52 12.741201432724 13.2025912659963 -0.461389833272356 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 67 52 119 31.6170554071299 27.4613898332724 4.15566557385749 A:G G A 10 0.528103650639853 0.463790279882471 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 103306033 T/C 1 58 57 115 27.3699882628885 30.1019080864716 -2.73191982358309 T:C T C 10 0.528103650639853 0.641034819524461 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103305833_103306072:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103305833_103306072:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103305833_103306072:UBR5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 55 74 129 25.9542992148081 39.0796701473491 -13.125370932541 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0218156907407646 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 104312341 A/G 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G A G 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104312184_104312512:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104312182_104312512:FZD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 104337096 A/G 1 18 13 31 8.49413428848265 6.86534745831809 1.62878683016456 A:G A G 10 0.528103650639853 0.593879990405665 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 104337367 A/C 1 26 7 33 12.2693050833638 3.69672555447897 8.57257952888485 A:C A C 10 0.528103650639853 0.00268844876078175 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523933:exon_104337263_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104337282_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 104343686 G/A 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104343569_104345045:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104343569_104345094:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104343569_104344222:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104343569_104345087:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104343569_104344120:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104343569_104344014:FZD6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 30 32 62 14.1568904808044 16.8993168204753 -2.74242633967089 A:G A G 10 0.528103650639853 0.525831606856191 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 105263979 C/T 1 1 8 9 0.471896349360147 4.22482920511882 -3.75293285575868 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0160432936254252 ENSG00000176406:ENST00000262231:exon_105263830_105264087:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000507740:exon_105263830_105268322:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000436393:exon_105263830_105264087:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000339750:exon_105263830_105264087:RIMS2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 4 6 10 1.88758539744059 3.16862190383912 -1.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.531866768758195 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 31 38 69 14.6287868301646 20.0679387243144 -5.43915189414986 T:C T C 10 0.528103650639853 0.227681584270359 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 13 30 43 6.13465254168191 15.8431095191956 -9.70845697751368 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00339372462554419 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 110542337 T/C 1 25 9 34 11.7974087340037 4.75293285575868 7.044475878245 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0160697372664876 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110542309_110542559:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110542309_110543500:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110542309_110542489:PKHD1L1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 18 16 34 8.49413428848265 8.44965841023765 0.0444758782449988 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 91 90 181 42.9425677917734 47.5293285575868 -4.58676076581339 T:C T C 10 0.528103650639853 0.503664801053201 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 12 11 23 5.66275619232176 5.80914015703838 -0.146383964716619 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 11 8 19 5.19085984296162 4.22482920511882 0.966030637842794 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.819124472562508 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 10 10 20 4.71896349360147 5.28103650639853 -0.562073012797059 T:C T C 10 0.528103650639853 0.826325406634276 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 15 13 28 7.07844524040221 6.86534745831809 0.213097782084116 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 57 75 132 26.8980919135284 39.607773797989 -12.7096818844606 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0291458348161600 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 135614065 G/A 1 10 13 23 4.71896349360147 6.86534745831809 -2.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.408520155558523 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135613720_135615176:ZFAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 4 4 8 1.88758539744059 2.11241460255941 -0.224829205118824 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 141561521 C/T 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 T:C C T 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141561402_141561535:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141561402_141561535:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141561402_141561535:EIF2C2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 143808951 C/T 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000130193:ENST00000336138:exon_143808621_143809277:C8orf55;ENSG00000130193:ENST00000443814:exon_143808765_143809118:C8orf55 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144332012 T/C 1 4 5 9 1.88758539744059 2.64051825319926 -0.752932855758677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.743343147592765 ENSG00000181638:ENST00000520584:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000330701:exon_144331860_144333510:ZFP41;ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144331860_144333510:ZFP41 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 6 9 15 2.83137809616088 4.75293285575868 -1.92155475959779 A:G G A 10 0.528103650639853 0.439256706533861 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 14 9 23 6.60654889104206 4.75293285575868 1.85361603528338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.53297476241213 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144620893 G/C 1 19 15 34 8.96603063784279 7.92155475959779 1.044475878245 C:G G C 10 0.528103650639853 0.735231156069807 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 29 19 48 13.6849941314443 10.0339693621572 3.65102476928706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.314268542891197 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 12 5 17 5.66275619232176 2.64051825319926 3.0222379391225 T:C C T 10 0.528103650639853 0.154173525467798 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144991205 C/T 1 61 53 114 28.785677310969 27.9894934839122 0.796183827056758 T:C C T 10 0.528103650639853 0.925386639488522 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 144998444 C/T 1 7 10 17 3.30327444552103 5.28103650639853 -1.9777620608775 T:C C T 10 0.528103650639853 0.467332261810144 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 145001038 G/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 29 25 54 13.6849941314443 13.2025912659963 0.482402865447938 A:C:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 13 5 18 6.13465254168191 2.64051825319926 3.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.154755866488138 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 16 11 27 7.55034158976235 5.80914015703838 1.74120143272397 C:G C G 10 0.528103650639853 0.566229485908398 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 17 11 28 8.0222379391225 5.80914015703838 2.21309778208412 A:G G A 10 0.528103650639853 0.452676280864763 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 23 18 41 10.8536160352834 9.50586571151735 1.34775032376603 A:G G A 10 0.528103650639853 0.755216948991552 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 37 30 67 17.4601649263254 15.8431095191956 1.61705540712985 T:C C T 10 0.528103650639853 0.715211870334881 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 29 27 56 13.6849941314443 14.258798567276 -0.573804435831768 T:C C T 10 0.528103650639853 0.894275221478099 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 13 14 27 6.13465254168191 7.39345110895794 -1.25879856727603 A:C C A 10 0.528103650639853 0.701591240329278 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146157202 T/C 1 4 7 11 1.88758539744059 3.69672555447897 -1.80914015703838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.368438867131135 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 8 9 17 3.77517079488118 4.75293285575868 -0.977762060877501 T:C T C 10 0.528103650639853 0.638002531441823 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 8 146171437 A/G 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532351:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527512:exon_146171299_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527427:exon_146169475_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000529378:exon_146171310_146171601:ZNF16 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 8 8 16 3.77517079488118 4.22482920511882 -0.449658410237648 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 14 17 31 6.60654889104206 8.9777620608775 -2.37121316983544 C:G C G 10 0.528103650639853 0.472722152420775 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 712766 G/A 1 5 3 8 2.35948174680074 1.58431095191956 0.775170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.730001600910196 ENSG00000107104:ENST00000382303:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000489369:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000354485:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000223950:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000397976:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000412100:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000382297:exon_710804_713464:KANK1;ENSG00000107104:ENST00000382293:exon_710804_713464:KANK1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 2054672 C/G 1 23 18 41 10.8536160352834 9.50586571151735 1.34775032376603 C:G C G 10 0.528103650639853 0.755216948991552 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2054597_2054723:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2054597_2054723:SMARCA2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 59 31 90 27.8418846122487 16.3712131698354 11.4706714424132 C:G C G 10 0.528103650639853 0.0196812590036735 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 59 74 133 27.8418846122487 39.0796701473491 -11.2377855351004 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0559030820850586 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 5557708 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000197646:ENST00000397745:exon_5557618_5557752:PDCD1LG2;ENSG00000197646:ENST00000397747:exon_5557618_5557752:PDCD1LG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 6012617 T/C 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 T:C T C 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 6015011 T/C 1 9 9 18 4.24706714424132 4.75293285575868 -0.505865711517353 T:C T C 10 0.528103650639853 0.81843919425541 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 T:C C T 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 221 0 221 104.289093208592 0 104.289093208592 G G 10 0.528103650639853 5.88523247462951e-62 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 T:G T G 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 32487521 T/C 1 11 3 14 5.19085984296162 1.58431095191956 3.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0627944859050089 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32487469_32487631:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32487469_32487631:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32487469_32487631:DDX58 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 285 265 550 134.490459567642 139.947467419561 -5.45700785191914 A:T:C T C 10 0.528103650639853 0.669361898270157 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 33442036 C/A 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 A:C C A 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000165272:ENST00000297991:exon_33441152_33442209:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000493581:exon_33441154_33443890:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494313:exon_33441181_33442209:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000343952:exon_33442030_33442209:AQP3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 14 12 26 6.60654889104206 6.33724380767824 0.269305083363822 A:C A C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 34610736 C/T 1 65 41 106 30.6732627084096 21.652249676234 9.02101303217558 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0807490433311825 ENSG00000164967:ENST00000378959:exon_34610483_34611329:C9orf23;ENSG00000164967:ENST00000297613:exon_34610483_34611329:C9orf23 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 11 5 16 5.19085984296162 2.64051825319926 2.55034158976235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.221639780060529 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35609642 G/A 1 30 26 56 14.1568904808044 13.7306949166362 0.426195564168232 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35608859_35610029:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35608859_35610038:TESK1;ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35609530_35610297:CD72 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35704150 C/T 1 157 185 342 74.0877268495431 97.6991753683728 -23.6114485188297 A:T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.0108882865771215 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000464379:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000466916:exon_35703988_35704190:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000465002:exon_35703988_35704412:TLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 117 84 201 55.2118728751372 44.3607066537476 10.8511662213896 A:G G A 10 0.528103650639853 0.137820358620620 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35706249 C/T 1 133 198 331 62.7622144648996 104.564522826691 -41.8023083617913 T:C C T 10 0.528103650639853 4.45529199931785e-06 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35706193_35706363:TLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35707163 C/T 1 189 136 325 89.1884100290678 71.82209648702 17.3663135420478 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0587537836087179 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35707069_35707250:TLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 69 64 133 32.5608481058501 33.7986336409506 -1.23778553510045 A:G G A 10 0.528103650639853 0.862299064192057 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 96 84 180 45.3020495385741 44.3607066537476 0.941342884826462 T:C T C 10 0.528103650639853 0.940522497456365 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 37428495 C/T 1 138 152 290 65.1216962117003 80.2717548972577 -15.1500586855574 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0777275372709204 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37428481_37428569:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000493368:exon_37428481_37429155:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37428481_37428569:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37428481_37428569:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37428481_37428569:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 36 10 46 16.9882685769653 5.28103650639853 11.7072320705668 T:C C T 10 0.528103650639853 0.000537931175907157 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 28 29 57 13.2130977820841 15.3150058685557 -2.10190808647162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.597826186588612 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 54 48 102 25.4824028654479 25.3489752307129 0.133427634734993 A:C C A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 56 30 86 26.4261955641682 15.8431095191956 10.5830860449726 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0232722534578946 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 50 30 80 23.5948174680073 15.8431095191956 7.75170794881176 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0929019588645921 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 72959094 G/C 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 C:G G C 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72959060_72959185:SMC5;ENSG00000198887:ENST00000475540:exon_72959060_72959590:SMC5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 75775235 A/G 1 1 21 22 0.471896349360147 11.0901766634369 -10.6182803140768 A:G A G 10 0.528103650639853 2.50485099829470e-06 ENSG00000135046:ENST00000257497:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000456643:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000415424:exon_75775179_75775254:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376912:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376911:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000495713:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000489109:exon_75775201_75775292:ANXA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 14 7 21 6.60654889104206 3.69672555447897 2.90982333656309 A:C A C 10 0.528103650639853 0.274720052655174 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 17 27 44 8.0222379391225 14.258798567276 -6.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0696782041134933 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 29 16 45 13.6849941314443 8.44965841023765 5.23533572120662 A:C:G A G 10 0.528103650639853 0.135821071230979 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 12 0 12 5.66275619232176 0 5.66275619232176 G G 10 0.528103650639853 0.000592519996121889 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 70 66 136 33.0327444552103 34.8548409422303 -1.82209648702 A:C C A 10 0.528103650639853 0.796852434135751 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 38 56 94 17.9320612756856 29.5738044358318 -11.6417431601462 A:C C A 10 0.528103650639853 0.0173851092668193 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 86586178 G/C 1 2 9 11 0.943792698720294 4.75293285575868 -3.80914015703838 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0308891347915433 ENSG00000165119:ENST00000376256:exon_86586081_86586271:HNRNPK HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 21 21 42 9.90982333656309 11.0901766634369 -1.18035332687382 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75862144149592 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 88651370 T/C 1 5 17 22 2.35948174680074 8.9777620608775 -6.61828031407676 T:C T C 10 0.528103650639853 0.00505338917430908 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 88694179 G/T 1 9 2 11 4.24706714424132 1.05620730127971 3.19085984296162 T:G G T 10 0.528103650639853 0.0700208110289317 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000466178:exon_88694107_88694256:GOLM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 91978397 C/T 1 4 10 14 1.88758539744059 5.28103650639853 -3.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.105430532897226 ENSG00000187764:ENST00000492386:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420101:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000469653:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000475255:exon_91978345_91980569:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000455551:exon_91978345_91978442:SEMA4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 91978783 G/A 1 5 9 14 2.35948174680074 4.75293285575868 -2.39345110895794 A:G G A 10 0.528103650639853 0.284614626264566 ENSG00000187764:ENST00000492386:exon_91978656_91978865:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_91978656_91978865:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_91978656_91978865:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420101:exon_91978656_91979566:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000469653:exon_91978656_91978865:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000475255:exon_91978345_91980569:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_91978656_91978865:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000455551:exon_91978656_91978865:SEMA4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 19 24 43 8.96603063784279 12.6744876153565 -3.70845697751368 T:C:G C T 10 0.528103650639853 0.286545613814440 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 10 7 17 4.71896349360147 3.69672555447897 1.0222379391225 A:G G A 10 0.528103650639853 0.809001293249272 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 48 33 81 22.6510247692871 17.4274204711151 5.22360429817191 T:C C T 10 0.528103650639853 0.26666244891952 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 A:C C A 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 95768448 G/A 1 3 7 10 1.41568904808044 3.69672555447897 -2.28103650639853 A:G G A 10 0.528103650639853 0.207029491689985 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 64 55 119 30.2013663590494 29.0457007851919 1.15566557385749 T:C C T 10 0.528103650639853 0.85473526535465 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 96437979 G/T 1 6 2 8 2.83137809616088 1.05620730127971 1.77517079488118 T:G G T 10 0.528103650639853 0.295265926490473 ENSG00000197724:ENST00000359246:exon_96437962_96438071:PHF2;ENSG00000197724:ENST00000375376:exon_96437962_96438071:PHF2;ENSG00000197724:ENST00000427747:exon_96437962_96438071:PHF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 97522829 G/A 1 4 12 16 1.88758539744059 6.33724380767824 -4.44965841023765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0417233745614009 ENSG00000148120:ENST00000428218:exon_97521931_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000277198:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000297979:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375315:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000395357:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000427193:exon_97522444_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000489318:exon_97522588_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000424143:exon_97522597_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000428313:exon_97522720_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375316:exon_97522720_97522862:C9orf3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 98638288 A/G 1 5 7 12 2.35948174680074 3.69672555447897 -1.33724380767824 A:G A G 10 0.528103650639853 0.566335781194943 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98637900_98638366:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98637983_98638366:C9orf102 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 99150582 G/T 1 3 5 8 1.41568904808044 2.64051825319926 -1.22482920511882 T:G G T 10 0.528103650639853 0.488275399095619 ENSG00000165244:ENST00000375256:exon_99148223_99150741:ZNF367 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 15 11 26 7.07844524040221 5.80914015703838 1.26930508336382 A:G A G 10 0.528103650639853 0.69670328394468 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 100194406 T/C 1 10 5 15 4.71896349360147 2.64051825319926 2.07844524040221 T:C T C 10 0.528103650639853 0.313265957393607 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100194307_100194520:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100194307_100194520:TDRD7 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 101552584 G/A 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000165138:ENST00000375018:exon_101552386_101552888:ANKS6;ENSG00000165138:ENST00000353234:exon_101552386_101552888:ANKS6;ENSG00000165138:ENST00000466120:exon_101552386_101552778:ANKS6;ENSG00000165138:ENST00000471846:exon_101552193_101552888:ANKS6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 101984010 G/A 1 5 11 16 2.35948174680074 5.80914015703838 -3.44965841023765 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.130559033023297 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 102595685 C/T 1 2 8 10 0.943792698720294 4.22482920511882 -3.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0543023096387196 ENSG00000119508:ENST00000395097:exon_102595564_102595736:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000338488:exon_102595564_102596341:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000238459:exon_102595564_102595736:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000395096:exon_102595564_102595806:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000330847:exon_102595564_102595736:NR4A3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 102713544 T/C 1 6 7 13 2.83137809616088 3.69672555447897 -0.865347458318089 T:C T C 10 0.528103650639853 0.782914319744954 ENSG00000136874:ENST00000259400:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000529340:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000525342:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000524405:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000525640:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000534052:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000525579:exon_102713342_102713567:STX17;ENSG00000136874:ENST00000525847:exon_102713342_102713567:STX17 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 40 28 68 18.8758539744059 14.7869022179159 4.08895175649 A:G G A 10 0.528103650639853 0.333878651765854 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 107533159 A/G 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000165028:ENST00000374762:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B;ENSG00000165028:ENST00000461177:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 108366734 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000106692:ENST00000223528:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000357998:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000374705:exon_108366496_108366773:FKTN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 11 12 23 5.19085984296162 6.33724380767824 -1.14638396471662 T:G T G 10 0.528103650639853 0.679891753040608 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111663754 G/A 1 6 3 9 2.83137809616088 1.58431095191956 1.24706714424132 A:G G A 10 0.528103650639853 0.514002881638353 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111663705_111663810:IKBKAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111668652 C/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111668583_111668765:IKBKAP HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 19 28 47 8.96603063784279 14.7869022179159 -5.82087158007309 C:G C G 10 0.528103650639853 0.107505229769686 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 12 12 24 5.66275619232176 6.33724380767824 -0.674487615356473 T:C C T 10 0.528103650639853 0.839700696621906 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 111795674 G/A 1 3 9 12 1.41568904808044 4.75293285575868 -3.33724380767824 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0797554887978025 ENSG00000106771:ENST00000374587:exon_111795587_111795781:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000374586:exon_111795587_111795781:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000472207:exon_111795587_111795781:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000413712:exon_111795587_111795781:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000491854:exon_111795587_111795781:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000223608:exon_111795587_111795781:C9orf5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 70 77 147 33.0327444552103 40.6639810992687 -7.63123664405839 T:C T C 10 0.528103650639853 0.215941575613048 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 58 76 134 27.3699882628885 40.1358774486288 -12.7658891857403 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0303054671216998 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 15 35 50 7.07844524040221 18.4836277723949 -11.4051825319926 T:C C T 10 0.528103650639853 0.00156965846359992 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114174384 C/T 1 38 32 70 17.9320612756856 16.8993168204753 1.03274445521029 T:C C T 10 0.528103650639853 0.81227256630959 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 39 33 72 18.4039576250457 17.4274204711151 0.976537153930586 T:C T C 10 0.528103650639853 0.906152166167224 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 34 37 71 16.044475878245 19.5398350736746 -3.49535919542956 T:C C T 10 0.528103650639853 0.408617861555936 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 33 22 55 15.5725795288849 11.6182803140768 3.95429921480809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.344628758562647 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 9 4 13 4.24706714424132 2.11241460255941 2.13465254168191 A:C C A 10 0.528103650639853 0.276725408885617 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 13 19 32 6.13465254168191 10.0339693621572 -3.8993168204753 T:G G T 10 0.528103650639853 0.214791287737836 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114820741 G/A 1 6 4 10 2.83137809616088 2.11241460255941 0.71896349360147 A:G G A 10 0.528103650639853 0.75776913662152 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114820708_114820751:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114820708_114820966:SUSD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 138 118 256 65.1216962117003 62.3162307755027 2.80546543619763 T:C:G T C 10 0.528103650639853 0.754445285802707 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 173 158 331 81.6380684393054 83.4403768010968 -1.80230836179135 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.868875415217885 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 115933980 C/A 0 38 0 38 17.9320612756856 0 17.9320612756856 C C 10 0.528103650639853 4.66382685334857e-11 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115933861_115933986:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115933861_115933986:FKBP15 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 116132092 G/C 1 12 4 16 5.66275619232176 2.11241460255941 3.55034158976235 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0841939254554931 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 116132334 C/T 1 6 18 24 2.83137809616088 9.50586571151735 -6.67448761535647 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0072105147488389 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 116153891 C/G 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 C:G C G 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 116153900 A/G 1 8 3 11 3.77517079488118 1.58431095191956 2.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.23468173708393 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 45 48 93 21.2353357212066 25.3489752307129 -4.11363950950633 T:C C T 10 0.528103650639853 0.407514592425367 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 51 32 83 24.0667138173675 16.8993168204753 7.1673969968922 A:G A G 10 0.528103650639853 0.124295535140973 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 117139280 T/C 1 76 82 158 35.8641225513712 43.3044993524679 -7.44037680109677 T:C T C 10 0.528103650639853 0.264565135653361 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 T:C C T 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 15 19 34 7.07844524040221 10.0339693621572 -2.955524121755 A:G G A 10 0.528103650639853 0.390773887480627 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 14 6 20 6.60654889104206 3.16862190383912 3.43792698720294 A:G A G 10 0.528103650639853 0.177848121659255 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 15 10 25 7.07844524040221 5.28103650639853 1.79740873400368 C:G C G 10 0.528103650639853 0.550417913517758 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 T:G T G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 25 11 36 11.7974087340037 5.80914015703838 5.98826857696529 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0648016056223966 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 413 383 796 194.893192285741 202.263698195064 -7.37050590932296 A:T:G G A 10 0.528103650639853 0.619223957670208 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 T:C C T 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 7 7 14 3.30327444552103 3.69672555447897 -0.393451108957942 A:T T A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 26 27 53 12.2693050833638 14.258798567276 -1.98949348391221 T:C C T 10 0.528103650639853 0.58583948976565 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 124065224 G/A 1 12 9 21 5.66275619232176 4.75293285575868 0.909823336563087 A:G G A 10 0.528103650639853 0.827891546169625 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000432226:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449773:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477863:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000475428:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477104:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124065189_124065343:GSN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 5 4 9 2.35948174680074 2.11241460255941 0.247067144241323 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 125582466 G/A 1 51 33 84 24.0667138173675 17.4274204711151 6.63929334625235 A:G G A 10 0.528103650639853 0.156348484405082 ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125580623_125582915:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125580623_125582915:PDCL HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 126219706 A/G 1 17 12 29 8.0222379391225 6.33724380767824 1.68499413144426 A:G A G 10 0.528103650639853 0.58065189071065 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000491650:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000497135:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000479305:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126219627_126219714:DENND1A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 126783433 G/C 1 13 3 16 6.13465254168191 1.58431095191956 4.55034158976235 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0244607240599101 ENSG00000106689:ENST00000373615:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000446480:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000488674:exon_126783378_126783583:LHX2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 9 8 17 4.24706714424132 4.22482920511882 0.0222379391224994 T:C T C 10 0.528103650639853 1 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 8 6 14 3.77517079488118 3.16862190383912 0.606548891042058 T:C C T 10 0.528103650639853 0.795116119978559 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 9 10 19 4.24706714424132 5.28103650639853 -1.03396936215721 A:T:C C T 10 0.528103650639853 0.653508512361618 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130241237 A/T 1 17 10 27 8.0222379391225 5.28103650639853 2.74120143272397 A:T A T 10 0.528103650639853 0.338083770397841 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130241213_130241242:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130241213_130241242:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130241213_130241242:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130241213_130241242:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130241213_130241242:LRSAM1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130677112 G/A 1 13 17 30 6.13465254168191 8.9777620608775 -2.84310951919559 A:G G A 10 0.528103650639853 0.361400373359748 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 80 61 141 37.7517079488118 32.214322689031 5.53738525978073 C:G G C 10 0.528103650639853 0.355123732968814 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 74 62 136 34.9203298526509 32.7424263396709 2.17790351298 A:G A G 10 0.528103650639853 0.731793504722953 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:T:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131079489 G/A 1 11 10 21 5.19085984296162 5.28103650639853 -0.0901766634369121 A:G G A 10 0.528103650639853 1 ENSG00000167112:ENST00000372890:exon_131079431_131079505:TRUB2;ENSG00000167112:ENST00000460320:exon_131079431_131079505:TRUB2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131085127 C/A 1 10 11 21 4.71896349360147 5.80914015703838 -1.09017666343691 A:C C A 10 0.528103650639853 0.667384719304921 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131198122 C/T 1 7 3 10 3.30327444552103 1.58431095191956 1.71896349360147 T:C C T 10 0.528103650639853 0.351492044982908 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131197932_131198184:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131197932_131198184:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131197932_131198184:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131197932_131198184:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131197932_131198184:CERCAM HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 10 14 24 4.71896349360147 7.39345110895794 -2.67448761535647 A:G A G 10 0.528103650639853 0.310421695696587 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131343207 G/A 1 17 25 42 8.0222379391225 13.2025912659963 -5.18035332687383 A:G G A 10 0.528103650639853 0.122960344974947 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131343201_131343338:SPTAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 22 22 44 10.3817196859232 11.6182803140768 -1.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 0.763639383897723 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 61 81 142 28.785677310969 42.7763957018281 -13.9907183908591 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0229075134691772 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131379998 C/A 1 57 62 119 26.8980919135284 32.7424263396709 -5.84433442614251 A:C C A 10 0.528103650639853 0.31265674828929 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 16 6 22 7.55034158976235 3.16862190383912 4.38171968592323 A:G G A 10 0.528103650639853 0.085649833785824 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 15 8 23 7.07844524040221 4.22482920511882 2.85361603528338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.297436847461985 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 8 17 25 3.77517079488118 8.9777620608775 -5.20259126599632 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0445969139904772 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 11 11 22 5.19085984296162 5.80914015703838 -0.618280314076765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.833366311581364 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 17 17 34 8.0222379391225 8.9777620608775 -0.955524121755001 C:G G C 10 0.528103650639853 0.86395113418665 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 16 20 36 7.55034158976235 10.5620730127971 -3.01173142303471 T:C T C 10 0.528103650639853 0.322447873445446 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131757628 A/C 1 24 31 55 11.3255123846435 16.3712131698354 -5.04570078519192 A:C A C 10 0.528103650639853 0.179406417717739 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131757598_131757793:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131757598_131757793:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131757598_131757793:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131757598_131757793:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000495726:exon_131757415_131757793:NUP188 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 62 60 122 29.2575736603291 31.6862190383912 -2.42864537806206 A:C A C 10 0.528103650639853 0.71698601899229 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 131857687 C/G 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 C:G C G 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131857089_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000455396:exon_131857485_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131857676_131857891:CRAT HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 21 23 44 9.90982333656309 12.1463839647166 -2.23656062815353 A:G G A 10 0.528103650639853 0.547383567807044 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 102 97 199 48.133427634735 51.2260541120657 -3.09262647733075 T:C T C 10 0.528103650639853 0.670664225846825 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 210 167 377 99.0982333656309 88.1933096568554 10.9049237087754 A:G A G 10 0.528103650639853 0.27870220323744 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 16 13 29 7.55034158976235 6.86534745831809 0.684994131444263 T:C C T 10 0.528103650639853 0.854027499191445 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 10 4 14 4.71896349360147 2.11241460255941 2.60654889104206 A:G A G 10 0.528103650639853 0.189185822477580 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 134473655 C/T 1 16 7 23 7.55034158976235 3.69672555447897 3.85361603528338 T:C C T 10 0.528103650639853 0.142969530065131 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134473586_134473697:RAPGEF1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 56 60 116 26.4261955641682 31.6862190383912 -5.26002347422295 T:C T C 10 0.528103650639853 0.352845891226911 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 49 50 99 23.1229211186472 26.4051825319927 -3.28226141334545 T:C T C 10 0.528103650639853 0.546374813903438 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 10 19 29 4.71896349360147 10.0339693621572 -5.31500586855574 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0616587085729111 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 26 28 54 12.2693050833638 14.7869022179159 -2.51759713455206 T:C T C 10 0.528103650639853 0.499251618178376 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 31 41 72 14.6287868301646 21.652249676234 -7.02346284606941 T:C T C 10 0.528103650639853 0.0998620667692315 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 60 48 108 28.3137809616088 25.3489752307129 2.96480573089588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.630112895146599 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 40 50 90 18.8758539744059 26.4051825319927 -7.52932855758677 A:C A C 10 0.528103650639853 0.114517365623706 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 61 46 107 28.785677310969 24.2927679294332 4.49290938153573 A:G G A 10 0.528103650639853 0.438717966986897 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 18 9 27 8.49413428848265 4.75293285575868 3.74120143272397 A:G A G 10 0.528103650639853 0.178532552079908 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 35 28 63 16.5163722276051 14.7869022179159 1.72947000968926 C:G C G 10 0.528103650639853 0.706118249183617 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 21 22 43 9.90982333656309 11.6182803140768 -1.70845697751368 T:C T C 10 0.528103650639853 0.648373211920892 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135786904 A/G 1 12 6 18 5.66275619232176 3.16862190383912 2.49413428848265 A:G A G 10 0.528103650639853 0.345434457103537 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000493467:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000424271:exon_135786387_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000403810:exon_135786596_135786955:TSC1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 42 33 75 19.8196466731262 17.4274204711151 2.39222620201103 C:G G C 10 0.528103650639853 0.644093097552505 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 52 39 91 24.5386101667276 20.5960423749543 3.94256779177338 A:G G A 10 0.528103650639853 0.462616426130449 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 135976976 C/T 1 23 10 33 10.8536160352834 5.28103650639853 5.57257952888485 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0561151960161705 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135975883_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135976907_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135976907_135977301:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135976686_135977526:RALGDS HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136029301 C/T 1 5 8 13 2.35948174680074 4.22482920511882 -1.86534745831809 T:C C T 10 0.528103650639853 0.40672660137621 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136028340_136029648:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136028340_136029629:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136028340_136030699:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136028340_136030699:GBGT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 9 11 20 4.24706714424132 5.80914015703838 -1.56207301279706 T:G T G 10 0.528103650639853 0.509845749151065 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136633699 G/C 1 24 41 65 11.3255123846435 21.652249676234 -10.3267372915904 C:G G C 10 0.528103650639853 0.0124748284037966 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136640116 G/A 1 10 23 33 4.71896349360147 12.1463839647166 -7.42742047111515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0134349834287607 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136640057_136640173:VAV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136662928 A/G 1 7 6 13 3.30327444552103 3.16862190383912 0.134652541681911 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136662832_136662931:VAV2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136907005 G/A 1 2 7 9 0.943792698720294 3.69672555447897 -2.75293285575868 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0940578615863052 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 136913355 T/C 1 10 3 13 4.71896349360147 1.58431095191956 3.13465254168191 T:C T C 10 0.528103650639853 0.098906296354315 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 11 14 25 5.19085984296162 7.39345110895794 -2.20259126599632 T:C C T 10 0.528103650639853 0.426356491214651 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 138714620 G/A 1 9 14 23 4.24706714424132 7.39345110895794 -3.14638396471662 A:G G A 10 0.528103650639853 0.213869853598877 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138712685_138715106:CAMSAP1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139008606 C/T 1 3 11 14 1.41568904808044 5.80914015703838 -4.39345110895794 T:C C T 10 0.528103650639853 0.0287103645641043 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139256495 G/T 1 5 25 30 2.35948174680074 13.2025912659963 -10.8431095191956 T:G G T 10 0.528103650639853 6.48818108920644e-05 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139270876 G/A 1 25 25 50 11.7974087340037 13.2025912659963 -1.40518253199265 A:G G A 10 0.528103650639853 0.7773314321124 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 3 8 11 1.41568904808044 4.22482920511882 -2.80914015703838 T:C T C 10 0.528103650639853 0.129781334643652 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 11 17 28 5.19085984296162 8.9777620608775 -3.78690221791588 T:C C T 10 0.528103650639853 0.185485320003807 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 6 17 23 2.83137809616088 8.9777620608775 -6.14638396471662 A:G A G 10 0.528103650639853 0.0116276457035969 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 34 13 47 16.044475878245 6.86534745831809 9.17912841992691 A:G G A 10 0.528103650639853 0.00806369383412883 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139312548 G/C 1 51 52 103 24.0667138173675 27.4613898332724 -3.39467601590486 C:G G C 10 0.528103650639853 0.554019243269651 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139312469_139312561:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139312469_139312561:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139312469_139312561:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000444897:exon_139312469_139312561:PMPCA HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 18 22 40 8.49413428848265 11.6182803140768 -3.12414602559412 A:C C A 10 0.528103650639853 0.345175829251647 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139327439 A/G 1 8 5 13 3.77517079488118 2.64051825319926 1.13465254168191 A:G A G 10 0.528103650639853 0.588933573945144 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139327408_139327527:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139327408_139327527:INPP5E HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 24 11 35 11.3255123846435 5.80914015703838 5.51637222760515 A:G G A 10 0.528103650639853 0.0645068375392556 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 30 21 51 14.1568904808044 11.0901766634369 3.0667138173675 T:C C T 10 0.528103650639853 0.40410666509233 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 18 20 38 8.49413428848265 10.5620730127971 -2.06793872431441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.519923483669534 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 12 16 28 5.66275619232176 8.44965841023765 -2.78690221791588 C:G G C 10 0.528103650639853 0.345411965030106 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 29 21 50 13.6849941314443 11.0901766634369 2.59481746800735 A:C A C 10 0.528103650639853 0.482388625529308 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 3 10 13 1.41568904808044 5.28103650639853 -3.86534745831809 A:G G A 10 0.528103650639853 0.048195832563503 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 32 29 61 15.1006831795247 15.3150058685557 -0.214322689031032 A:G A G 10 0.528103650639853 1 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 17 13 30 8.0222379391225 6.86534745831809 1.15689048080441 A:G G A 10 0.528103650639853 0.717691074704143 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 7 4 11 3.30327444552103 2.11241460255941 1.19085984296162 A:G A G 10 0.528103650639853 0.55591008380612 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 140109141 C/T 1 7 11 18 3.30327444552103 5.80914015703838 -2.50586571151735 T:C C T 10 0.528103650639853 0.248966895441819 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140109022_140109143:NDOR1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 140150476 C/T 1 23 21 44 10.8536160352834 11.0901766634369 -0.23656062815353 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140150359_140150522:COBRA1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 140277826 C/T 1 5 5 10 2.35948174680074 2.64051825319926 -0.28103650639853 T:C C T 10 0.528103650639853 1 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140277765_140277829:EXD3 HGDP00716_parsed_pileup.txt . 9 140611140 G/A 1 17 19 36 8.0222379391225 10.0339693621572 -2.01173142303471 A:G G A 10 0.528103650639853 0.509905663570198 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 8 12 20 3.77517079488118 6.33724380767824 -2.56207301279706 A:G G A 10 0.528103650639853 0.270783248912636 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 8 4 12 3.77517079488118 2.11241460255941 1.66275619232176 A:G A G 10 0.528103650639853 0.396805472370051 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 33 20 53 15.5725795288849 10.5620730127971 5.01050651608779 T:C:G C G 10 0.528103650639853 0.215258178690519 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 66 45 111 31.1451590577697 23.7646642787934 7.38049477897632 A:G G A 10 0.528103650639853 0.18309322335496 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 64 52 116 30.2013663590494 27.4613898332724 2.73997652577705 A:G A G 10 0.528103650639853 0.642606982320999 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 1718268 G/A 1 40 44 84 18.8758539744059 23.2365606281535 -4.36070665374765 A:G G A 10 0.528103650639853 0.382250612552397 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1718085_1718325:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1718085_1718325:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1718085_1719196:AKAP17A HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 2407207 G/A 1 63 67 130 29.7294700096893 35.3829445928702 -5.65347458318089 A:G G A 10 0.528103650639853 0.334713742669445 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1 HGDP00716_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 31 75 106 14.6287868301646 39.607773797989 -24.9789869678244 T:C C T 10 0.528103650639853 1.22982747714740e-06 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99