INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 T:C T C 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 26 17 43 12.134441310814 9.06594221985237 3.06849909096166 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.363910342526798 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 T:C C T 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 20 12 32 9.3341856237031 6.39948862577814 2.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.376239865171977 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 217 263 480 101.275914017179 140.255459048304 -38.9795450311256 T:C:G G C 10 0.533290718814845 0.000416803936523644 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 C C 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 26 31 57 12.134441310814 16.5320122832602 -4.39757097244616 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.288265995023521 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 91 119 210 42.4705445878491 63.4615955389666 -20.9910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00446180359883509 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3649403 G/A 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 7 13 20 3.26696496829608 6.93277934459299 -3.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.118460995463565 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 6 12 18 2.80025568711093 6.39948862577814 -3.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101505920919438 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 A:G G A 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3753136 A/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:T A T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000443466:exon_3753059_3753256:KIAA0562 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:C C T 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 6027365 C/T 0 8 0 8 3.73367424948124 0 3.73367424948124 C C 10 0.533290718814845 0.00879300435881159 ENSG00000131697:ENST00000478423:exon_6027359_6027423:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000489180:exon_6027359_6027423:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000378156:exon_6027359_6027423:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000378169:exon_6027359_6027423:NPHP4;ENSG00000131697:ENST00000378162:exon_6027359_6027423:NPHP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 77 85 162 35.9366146512569 45.3297110992618 -9.3930964480049 A:G A G 10 0.533290718814845 0.156205947265025 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 6614535 G/A 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6614167_6614595:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6614167_6614560:NOL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 T:C T C 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 6659445 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 7887605 G/A 1 14 2 16 6.53392993659217 1.06658143762969 5.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00546708680034959 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7887178_7887875:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7887178_7887875:PER3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 7889941 C/T 1 1 7 8 0.466709281185155 3.73303503170392 -3.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0293698630550817 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7889894_7890221:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7889897_7890221:PER3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 1 11 21 32 5.1338020930367 11.1991050951117 -6.06530300207504 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0341414277824285 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 1 14 7 21 6.53392993659217 3.73303503170392 2.80089490488825 A:G G A 10 0.533290718814845 0.276079092338444 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 9323910 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 10218439 T/C 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10218412_10218540:UBE4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 50 40 90 23.3354640592577 21.3316287525938 2.00383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 0.751500160202503 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 46 36 82 21.4686269345171 19.1984658773344 2.27016105718271 A:G G A 10 0.533290718814845 0.658768945609741 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 10479791 G/A 1 133 161 294 62.0723343976256 85.85980572919 -23.7874713315644 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00594043077510186 ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10479687_10480200:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10479687_10480201:PGD;ENSG00000142657:ENST00000498356:exon_10479687_10479887:PGD;ENSG00000142657:ENST00000496718:exon_10479474_10479865:PGD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C C T 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 11850927 C/T 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11845780_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11845810_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11846660_11850955:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11848351_11850955:MTHFR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:G T G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 11897082 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000011021:ENST00000312413:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376487:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376493:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000346436:exon_11897056_11897213:CLCN6;ENSG00000011021:ENST00000376496:exon_11897056_11897213:CLCN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 A:G G A 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 A:G A G 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 20 27 47 9.3341856237031 14.3988494080008 -5.06466378429772 T:C T C 10 0.533290718814845 0.146065486507638 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 12198362 C/A 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:C C A 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 A:C A C 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C C T 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 19 9 28 8.86747634251794 4.79961646933361 4.06785987318434 T:C T C 10 0.533290718814845 0.133620819103613 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 29 13 42 13.5345691543695 6.93277934459299 6.60178980977651 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0446168703942869 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 14 17 31 6.53392993659217 9.06594221985237 -2.5320122832602 C:G G C 10 0.533290718814845 0.374395278994912 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 10 17 27 4.66709281185155 9.06594221985237 -4.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.121454868321471 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 21546474 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21543740_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21543740_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21545077_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000531334:exon_21546307_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21546352_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21546387_21546624:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21546430_21546624:ECE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 34 53 87 15.8681155602953 28.2644080971868 -12.3962925368915 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00954401264397702 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 22852715 G/C 1 3 9 12 1.40012784355546 4.79961646933361 -3.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 0.078661088597064 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23399824 T/C 1 22 18 40 10.2676041860734 9.59923293866721 0.668371247406199 T:C T C 10 0.533290718814845 0.875165857272662 ENSG00000004487:ENST00000356634:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000400181:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000465864:exon_23399767_23399896:KDM1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23418153 C/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:G G T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 8 16 24 3.73367424948124 8.53265150103752 -4.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0642561142900687 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23688933 A/G 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000125945:ENST00000314011:exon_23685941_23689714:ZNF436;ENSG00000125945:ENST00000374608:exon_23686468_23689714:ZNF436 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 64 42 106 29.8693939958499 22.3982101902235 7.47118380562643 T:C T C 10 0.533290718814845 0.172656763215872 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 18 8 26 8.40076706133279 4.26632575051876 4.13444131081403 A:T A T 10 0.533290718814845 0.118061361205566 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 26162030 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127423:ENST00000374298:exon_26160497_26162337:C1orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 27 24 51 12.6011505919992 12.7989772515563 -0.197826659557096 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 49 40 89 22.8687547780726 21.3316287525938 1.53712602547879 T:C T C 10 0.533290718814845 0.751475902397593 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 71 72 143 33.136358964146 38.3969317546688 -5.26057279052284 C:G C G 10 0.533290718814845 0.402353851313679 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 0 0 12 12 0 6.39948862577814 -6.39948862577814 G A G 10 0.533290718814845 0.000106796556689995 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 27736478 T/C 1 20 19 39 9.3341856237031 10.1325236574821 -0.798338033778956 T:C T C 10 0.533290718814845 0.872948278112427 ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 455 364 819 212.352722939246 194.117821648604 18.2349012906419 A:G A G 10 0.533290718814845 0.207462384903476 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 20 3 23 9.3341856237031 1.59987215644454 7.73431346725856 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00117826689054151 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 39 8 47 18.201661966221 4.26632575051876 13.9353362157023 A:G A G 10 0.533290718814845 2.74266365205679e-05 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 28793149 C/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000463428:exon_28792893_28793752:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28792893_28793279:PHACTR4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 28906454 C/T 1 61 21 82 28.4692661522945 11.1991050951117 17.2701610571827 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.000135598817498154 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 53 45 98 24.7355919028132 23.998082346668 0.737509556145184 T:G T G 10 0.533290718814845 0.919570415394009 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C T C 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 31409502 G/A 1 32 29 61 14.934696997925 15.4654308456305 -0.530733847705546 A:G G A 10 0.533290718814845 0.898657581040117 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31409490_31409682:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000530669:exon_31409490_31409682:PUM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 31897643 G/A 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 89 88 177 41.5371260254788 46.9295832557064 -5.39245723022757 A:G A G 10 0.533290718814845 0.451381953530958 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 25 14 39 11.6677320296289 7.46607006340783 4.20166196622104 A:G G A 10 0.533290718814845 0.200847962376411 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 73 70 143 34.0697775265163 37.3303503170391 -3.26057279052284 A:T:C A C 10 0.533290718814845 0.6154297960549 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 35480637 A/G 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000163867:ENST00000487874:exon_35480589_35480763:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000373340:exon_35480589_35480763:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35480589_35480763:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35480589_35480763:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000415531:exon_35480589_35480763:ZMYM6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 17 19 36 7.93405778014763 10.1325236574821 -2.19846587733442 A:G A G 10 0.533290718814845 0.506348385532759 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 35921789 G/C 1 20 9 29 9.3341856237031 4.79961646933361 4.53456915436949 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0972683129036133 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35921614_35921842:KIAA0319L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 T:C C T 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 38166170 C/T 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000134690:ENST00000373055:exon_38166108_38166193:CDCA8;ENSG00000134690:ENST00000327331:exon_38166108_38166193:CDCA8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 39801815 A/C 1 7 18 25 3.26696496829608 9.59923293866721 -6.33226797037113 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0147410457986700 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 39816546 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000530262:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39816457_39816690:MACF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 39835817 A/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39835702_39835858:MACF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 13 21 34 6.06722065540701 11.1991050951117 -5.13188443970473 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0866492079252036 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 18 25 43 8.40076706133279 13.3322679703711 -4.93150090903834 C:G G C 10 0.533290718814845 0.168282961116614 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 22 22 44 10.2676041860734 11.7323958139266 -1.46479162785318 A:G A G 10 0.533290718814845 0.76291635322776 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 40705427 C/G 1 10 21 31 4.66709281185155 11.1991050951117 -6.5320122832602 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0197437549469357 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 13 24 37 6.06722065540701 12.7989772515563 -6.73175659614927 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0315445515188551 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 41976665 G/A 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 42047300 A/T 1 16 5 21 7.46734849896248 2.66645359407423 4.80089490488825 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0471434198872913 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 42050366 C/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 44132744 C/T 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000066135:ENST00000439179:exon_44132625_44132762:KDM4A;ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44132625_44132762:KDM4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 45798251 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000470256:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000461495:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000435155:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467940:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000478796:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528013:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525160:exon_45798246_45798359:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000479746:exon_45798239_45798842:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000492494:exon_45798251_45798359:MUTYH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 47078637 T/C 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000142961:ENST00000396291:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000319928:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000271139:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000371940:exon_47078576_47082137:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000477318:exon_47078576_47079043:MOBKL2C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 22 9 31 10.2676041860734 4.79961646933361 5.4679877167398 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0701136796662376 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 47726087 T/C 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C T C 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47725961_47726211:STIL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 52237786 A/G 1 55 43 98 25.6690104651835 22.9315009090383 2.73750955614519 A:G A G 10 0.533290718814845 0.613561905413409 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000489990:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531819:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000533825:exon_52237748_52237854:OSBPL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 52237828 C/T 1 52 51 103 24.2688826216281 27.1978266595571 -2.92894403792904 T:C C T 10 0.533290718814845 0.621698610229973 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000489990:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531819:exon_52237742_52237854:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000533825:exon_52237748_52237854:OSBPL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 52704364 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000157077:ENST00000357206:exon_52703160_52705267:ZFYVE9;ENSG00000157077:ENST00000361625:exon_52703160_52705267:ZFYVE9;ENSG00000157077:ENST00000287727:exon_52703160_52705267:ZFYVE9;ENSG00000157077:ENST00000371591:exon_52703160_52705267:ZFYVE9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 52838922 G/A 1 18 15 33 8.40076706133279 7.99936078222268 0.401406279110114 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52838501_52839047:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52838503_52839047:ORC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 19 22 41 8.86747634251794 11.7323958139266 -2.86491947140865 T:C C T 10 0.533290718814845 0.434495956938024 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 36 42 78 16.8015341226656 22.3982101902235 -5.59667606755791 A:G A G 10 0.533290718814845 0.213416398893807 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 49 49 98 22.8687547780726 26.1312452219274 -3.26249044385482 T:G T G 10 0.533290718814845 0.544129966625614 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 16 13 29 7.46734849896248 6.93277934459299 0.534569154369494 T:G G T 10 0.533290718814845 0.855209067729783 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 36 32 68 16.8015341226656 17.065303002075 -0.263768879409461 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G G A 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 63991267 T/C 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000203965:ENST00000480886:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63991243_63991430:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63991243_63991430:EFCAB7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 25 22 47 11.6677320296289 11.7323958139266 -0.064663784297716 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 20 18 38 9.3341856237031 9.59923293866721 -0.265047314964111 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 65312375 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65312332_65312419:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65312332_65312419:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65312332_65312592:JAK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 66831370 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000184588:ENST00000329654:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000341517:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371049:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000423207:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371045:exon_66831350_66831449:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000480109:exon_66831350_66831449:PDE4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 67795319 T/C 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000441640:exon_67795270_67795412:IL12RB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 70820008 C/T 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118454:ENST00000370944:exon_70819662_70820405:ANKRD13C;ENSG00000118454:ENST00000262346:exon_70819662_70820417:ANKRD13C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 40 36 76 18.6683712474062 19.1984658773344 -0.530094629928222 T:G G T 10 0.533290718814845 0.909026668160728 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:G A G 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 79 57 136 36.8700332136272 30.3975709724462 6.47246224118108 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.30240456346577 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 85039955 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85039922_85040163:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85039922_85040147:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85039599_85040104:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85039599_85040113:CTBS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C T C 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 85733374 C/T 1 28 33 61 13.0678598731843 17.5985937208899 -4.53073384770555 T:C C T 10 0.533290718814845 0.251069564242170 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85731464_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85731931_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85731931_85733665:BCL10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 89475135 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89475075_89475177:GBP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 C:G G C 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 60 65 125 28.0025568711093 34.6638967229649 -6.66133985185563 A:G G A 10 0.533290718814845 0.244541160990608 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C C T 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 C:G C G 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 38 39 77 17.7349526850359 20.798338033779 -3.06338534874306 A:G A G 10 0.533290718814845 0.495278654947628 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 153 86 239 71.4065200213287 45.8630018180767 25.543518203252 A:C:G C A 10 0.533290718814845 0.000919289924312394 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 89 96 185 41.5371260254788 51.1959090062251 -9.65878298074633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.161818827637045 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 108 99 207 50.4046023679967 52.7957811626697 -2.39117879467292 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780613515311191 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 53 55 108 24.7355919028132 29.3309895348165 -4.59539763200326 T:C C T 10 0.533290718814845 0.386776889242704 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 14 19 33 6.53392993659217 10.1325236574821 -3.59859372088989 T:G T G 10 0.533290718814845 0.225573054676117 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 100340787 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000477753:exon_100340710_100340812:AGL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 52 54 106 24.2688826216281 28.7976988160016 -4.52881619437357 A:G G A 10 0.533290718814845 0.382849205068935 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 230 1 231 107.343134672586 0.533290718814845 106.809843953771 A:C C A 10 0.533290718814845 1.91317508811796e-61 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 112991623 T/C 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL;ENSG00000143079:ENST00000441739:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 3 11 14 1.40012784355546 5.8661979069633 -4.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0282747514932721 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 11 3 14 5.1338020930367 1.59987215644454 3.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0649898735465232 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 117122130 T/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000143061:ENST00000369486:exon_117122014_117122499:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000369483:exon_117122014_117122499:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000342231:exon_117122014_117122499:IGSF3;ENSG00000143061:ENST00000318837:exon_117122014_117122499:IGSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 4 15 19 1.86683712474062 7.99936078222268 -6.13252365748206 C:G C G 10 0.533290718814845 0.00523948537024325 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 1 15 1 16 7.00063921777732 0.533290718814845 6.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000739777050623032 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 49 51 100 22.8687547780726 27.1978266595571 -4.3290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.42301067743777 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 114 114 0 60.7951419448923 -60.7951419448923 C T C 10 0.533290718814845 1.86764306570936e-38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 48 48 0 25.5979545031126 -25.5979545031126 T G T 10 0.533290718814845 1.30085533374887e-16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 37 37 0 19.7317565961493 -19.7317565961493 A C A 10 0.533290718814845 5.68483925471621e-13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 109 0 109 50.8713116491819 0 50.8713116491819 G G 10 0.533290718814845 2.0048848876377e-30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 1 1 75 76 0.466709281185155 39.9968039111134 -39.5300946299282 T:C T C 10 0.533290718814845 6.18347794741219e-24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 142 142 0 75.727282071708 -75.727282071708 T C T 10 0.533290718814845 1.01063452608763e-47 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 176 0 176 82.1408334885873 0 82.1408334885873 C C 10 0.533290718814845 1.03250786500231e-48 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 147096794 A/G 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 138 87 225 64.4058808035514 46.3962925368915 18.0095882666599 T:G G T 10 0.533290718814845 0.016167832995544 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150239484 T/A 1 103 97 200 48.071055962071 51.72919972504 -3.658143762969 A:T T A 10 0.533290718814845 0.620288726302473 ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 17 16 33 7.93405778014763 8.53265150103752 -0.598593720889886 A:G A G 10 0.533290718814845 0.862945254696392 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 C:G C G 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150935173 C/T 1 20 27 47 9.3341856237031 14.3988494080008 -5.06466378429772 T:C C T 10 0.533290718814845 0.146065486507638 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000497314:exon_150935063_150935195:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000528749:exon_150935063_150935558:SETDB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 150999737 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000143363:ENST00000467771:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000462440:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000475722:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000450884:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_150999709_150999803:PRUNE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 151006537 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 151215011 A/G 1 30 22 52 14.0012784355546 11.7323958139266 2.26888262162806 A:G A G 10 0.533290718814845 0.579673990099634 ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151214914_151215043:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151214914_151215043:PIP5K1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 81 73 154 37.8034517759976 38.9302224734837 -1.12677069748614 A:G A G 10 0.533290718814845 0.87193884252513 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 15 21 36 7.00063921777732 11.1991050951117 -4.19846587733442 T:C T C 10 0.533290718814845 0.182676991709835 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 154316434 C/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154316369_154316533:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154316369_154316533:ATP8B2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 154316453 C/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154316369_154316533:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154316369_154316533:ATP8B2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 154557440 T/G 1 131 119 250 61.1389158352553 63.4615955389666 -2.32267970371125 T:C:G T G 10 0.533290718814845 0.79994037404766 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154554538_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154554538_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154554538_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154554538_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154554543_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154554543_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000492630:exon_154557110_154557519:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154557285_154557519:ADAR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 40 43 83 18.6683712474062 22.9315009090383 -4.26312966163214 T:C C T 10 0.533290718814845 0.379445540187434 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:G T G 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 16 26 42 7.46734849896248 13.865558689186 -6.39821019022349 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0623208694621273 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 155904177 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000132680:ENST00000368321:exon_155904127_155904188:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000368320:exon_155904127_155904190:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000482337:exon_155904127_155904181:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000466713:exon_155904127_155904189:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000491599:exon_155904127_155904191:KIAA0907 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156108491 C/T 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 T:C C T 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156108279_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156108279_156108548:LMNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 26 20 46 12.134441310814 10.6658143762969 1.46862693451713 T:C C T 10 0.533290718814845 0.768000285226431 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 16 12 28 7.46734849896248 6.39948862577814 1.06785987318434 A:G G A 10 0.533290718814845 0.709796492193127 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 13 20 33 6.06722065540701 10.6658143762969 -4.59859372088989 A:G G A 10 0.533290718814845 0.118504469933107 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156518379 G/A 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156518373_156518540:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156518373_156518540:IQGAP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 44 46 90 20.5352083721468 24.5313730654829 -3.99616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.400546257529584 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 159888645 C/T 1 524 483 1007 244.555663341021 257.57941718757 -13.0237538465489 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.41176095853157 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159887897_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159887897_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159888541_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159888567_159888731:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159888628_159888731:TAGLN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 28 21 49 13.0678598731843 11.1991050951117 1.86875477807259 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.668316644533404 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 113 118 231 52.7381487739225 62.9283048201517 -10.1901560462292 T:G G T 10 0.533290718814845 0.187440925953836 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 1 13 2 15 6.06722065540701 1.06658143762969 5.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00927288066217656 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 C C 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 C C 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161018198 C/T 1 161 148 309 75.14019427081 78.9270263845971 -3.78683211378711 T:C C T 10 0.533290718814845 0.689946764821053 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161335955 A/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:C A C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 97 39 136 45.27080027496 20.798338033779 24.4724622411811 A:G A G 10 0.533290718814845 2.15549783648349e-05 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 98 195 293 45.7375095561452 103.991690168895 -58.2541806127496 A:G G A 10 0.533290718814845 9.04844774615558e-12 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161751741 A/G 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161751702_161751789:ATF6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 34 25 59 15.8681155602953 13.3322679703711 2.53584758992414 A:G A G 10 0.533290718814845 0.517934087076034 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 162549266 C/T 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000117143:ENST00000412525:exon_162549218_162549392:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162549218_162549393:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162549218_162549393:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162549218_162549393:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162549218_162549393:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162549218_162549393:UAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:T A T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 27 17 44 12.6011505919992 9.06594221985237 3.53520837214682 A:G A G 10 0.533290718814845 0.295292932360026 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 166829522 C/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166829423_166829574:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166829423_166829574:TADA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 55 36 91 25.6690104651835 19.1984658773344 6.4705445878491 T:C T C 10 0.533290718814845 0.207172913643973 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 168549422 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 169345868 A/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 23 16 39 10.7343134672586 8.53265150103752 2.20166196622104 T:C T C 10 0.533290718814845 0.523723415499499 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 42 44 86 19.6017898097765 23.4647916278532 -3.86300181807667 A:G G A 10 0.533290718814845 0.449658423095971 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 42 38 80 19.6017898097765 20.2650473149641 -0.663257505187602 T:C T C 10 0.533290718814845 0.911076722356236 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 173456936 G/A 1 129 85 214 60.205497272885 45.3297110992618 14.8757861736232 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0467143865135157 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 119 141 260 55.5384044610334 75.1939913528931 -19.6555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0152988525039127 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 173802601 G/A 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000117593:ENST00000361951:exon_173802514_173802637:DARS2;ENSG00000117593:ENST00000239457:exon_173802514_173802637:DARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 88 101 189 41.0704167442936 53.8623626002993 -12.7919458560057 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0682201325373202 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 32 42 74 14.934696997925 22.3982101902235 -7.46351319229853 A:G A G 10 0.533290718814845 0.102227534547190 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 180165699 A/C 1 26 18 44 12.134441310814 9.59923293866721 2.53520837214682 A:C A C 10 0.533290718814845 0.455298969015535 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G A G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 29 34 63 13.5345691543695 18.1318844397047 -4.59731528533524 A:G A G 10 0.533290718814845 0.257821449292104 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 20 22 42 9.3341856237031 11.7323958139266 -2.39821019022349 A:G G A 10 0.533290718814845 0.536801824099167 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 184020945 G/A 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.171748761798993 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184020811_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184020813_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184020860_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184020867_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184020880_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184020894_184021024:TSEN15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 24 22 46 11.2010227484437 11.7323958139266 -0.531373065482871 A:C A C 10 0.533290718814845 0.883679589246722 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 184671958 T/C 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184671945_184672130:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184671945_184672130:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184671945_184672130:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000466392:exon_184671945_184672130:EDEM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 13 16 29 6.06722065540701 8.53265150103752 -2.46543084563051 A:G A G 10 0.533290718814845 0.457232514618002 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 186316436 G/A 1 29 48 77 13.5345691543695 25.5979545031126 -12.0633853487431 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00607420238600901 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 198201732 A/C 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 A:C A C 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000151414:ENST00000367385:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000442588:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000391974:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000367383:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000417895:exon_198201683_198201767:NEK7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 18 32 50 8.40076706133279 17.065303002075 -8.66453594074225 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0156865437222075 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 201844057 T/C 1 6 17 23 2.80025568711093 9.06594221985237 -6.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0109983725369487 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843960_201844064:IPO9;ENSG00000198700:ENST00000456707:exon_201843960_201844064:IPO9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 34 43 77 15.8681155602953 22.9315009090383 -7.06338534874306 A:G G A 10 0.533290718814845 0.110946901262570 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 202862405 C/T 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202862367_202862553:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202862367_202862553:KLHL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 202977809 G/A 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000163444:ENST00000367242:exon_202977771_202977938:TMEM183A;ENSG00000163444:ENST00000468449:exon_202977771_202977938:TMEM183A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 203743122 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 203743653 C/T 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 204380127 C/A 1 15 21 36 7.00063921777732 11.1991050951117 -4.19846587733442 A:C C A 10 0.533290718814845 0.182676991709835 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 T:C C T 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C T C 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 1 10 11 0.466709281185155 5.33290718814845 -4.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00409725369498546 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 207941191 G/T 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 T:G G T 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000117335:ENST00000469535:exon_207940358_207943707:CD46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 91 112 203 42.4705445878491 59.7285605072626 -17.2580159194135 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0166395788546918 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 209950848 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 209956542 C/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:C C A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000162757:ENST00000294811:exon_209955661_209957054:C1orf74 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 210004332 G/A 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 33 21 54 15.4014062791101 11.1991050951117 4.20230118399837 T:C T C 10 0.533290718814845 0.276899286086025 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 T:C T C 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 A:G A G 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 14 23 37 6.53392993659217 12.2656865327414 -5.73175659614927 T:C C T 10 0.533290718814845 0.06958289945008 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 64 33 97 29.8693939958499 17.5985937208899 12.27080027496 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0142469489087692 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214454726 C/T 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 T:C C T 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214454445_214454770:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214454468_214454770:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214454536_214454770:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214454565_214454770:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214454576_214454770:SMYD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 6 20 26 2.80025568711093 10.6658143762969 -7.86555868918597 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00252432674626443 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 19 21 40 8.86747634251794 11.1991050951117 -2.3316287525938 T:C C T 10 0.533290718814845 0.52709789487673 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 62 42 104 28.9359754334796 22.3982101902235 6.53776524325612 A:G A G 10 0.533290718814845 0.203146878770704 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 25 22 47 11.6677320296289 11.7323958139266 -0.064663784297716 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 36 21 57 16.8015341226656 11.1991050951117 5.60242902755383 A:G A G 10 0.533290718814845 0.145912654585061 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 31 38 69 14.4679877167398 20.2650473149641 -5.79705959822431 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.184493086138541 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 220928313 T/C 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 220928334 A/G 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 220928376 T/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 T:C T C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 220936372 G/A 1 4 17 21 1.86683712474062 9.06594221985237 -7.19910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00173362860498601 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220936252_220936392:MOSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 220955168 A/G 1 7 19 26 3.26696496829608 10.1325236574821 -6.86555868918597 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0093696688389341 ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220955120_220955274:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000472447:exon_220955120_220955274:MOSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 25 32 57 11.6677320296289 17.065303002075 -5.39757097244617 T:C T C 10 0.533290718814845 0.183976512678885 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 41 47 88 19.1350805285914 25.0646637842977 -5.92958325570636 T:C T C 10 0.533290718814845 0.239765285778307 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:G T G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 224607296 T/C 1 35 27 62 16.3348248414804 14.3988494080008 1.93597543347961 T:C T C 10 0.533290718814845 0.702985328256406 ENSG00000162923:ENST00000414423:exon_224607220_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000295024:exon_224607220_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000486652:exon_224607220_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000366852:exon_224607220_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000443112:exon_224607220_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000489825:exon_224607147_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000477425:exon_224607251_224607317:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000445239:exon_224607264_224607317:WDR26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226034774 C/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226054333 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226054274_226054382:TMEM63A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226108194 G/C 1 63 58 121 29.4026847146648 30.930861691261 -1.52817697659625 C:G G C 10 0.533290718814845 0.785397685221238 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 10 15 25 4.66709281185155 7.99936078222268 -3.33226797037113 T:G T G 10 0.533290718814845 0.229281270563013 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 104 97 201 48.5377652432561 51.72919972504 -3.19143448178385 A:G A G 10 0.533290718814845 0.671797893047102 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 170 177 347 79.3405778014763 94.3924572302276 -15.0518794287512 T:C T C 10 0.533290718814845 0.106775400394247 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 152 121 273 70.9398107401436 64.5281769765962 6.41163376354731 A:G A G 10 0.533290718814845 0.466788004314501 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 133 120 253 62.0723343976256 63.9948862577814 -1.92255186015579 A:G G A 10 0.533290718814845 0.850119777059954 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 42 27 69 19.6017898097765 14.3988494080008 5.20294040177569 C:G C G 10 0.533290718814845 0.22868968729703 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226827357 T/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226827258_226827359:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226827258_226827359:ITPKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 10 15 25 4.66709281185155 7.99936078222268 -3.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.229281270563013 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 227920196 G/A 1 44 24 68 20.5352083721468 12.7989772515563 7.73623112059054 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0680502286782663 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 227946892 G/A 1 27 13 40 12.6011505919992 6.93277934459299 5.6683712474062 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0816941310965463 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000491439:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227946696_227947186:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227946696_227947186:SNAP47 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 229773819 C/T 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C C T 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 24 19 43 11.2010227484437 10.1325236574821 1.06849909096166 A:G G A 10 0.533290718814845 0.762561047237978 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 23 30 53 10.7343134672586 15.9987215644454 -5.26440809718679 T:C T C 10 0.533290718814845 0.168815703915968 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 11 17 28 5.1338020930367 9.06594221985237 -3.93214012681566 A:T T A 10 0.533290718814845 0.184006868411032 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 231488908 A/G 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 231488909 A/C 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:C A C 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 10 17 27 4.66709281185155 9.06594221985237 -4.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.121454868321471 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 T:C T C 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 9 16 25 4.20038353066639 8.53265150103752 -4.33226797037113 T:C T C 10 0.533290718814845 0.107687579177663 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G A G 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 29 13 42 13.5345691543695 6.93277934459299 6.60178980977651 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0446168703942869 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 20 8 28 9.3341856237031 4.26632575051876 5.06785987318434 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0595740251789008 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 18 1 19 8.40076706133279 0.533290718814845 7.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000126121602362020 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 17 1 18 7.93405778014763 0.533290718814845 7.40076706133279 T:G G T 10 0.533290718814845 0.000227713040482442 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 0 17 0 17 7.93405778014763 0 7.93405778014763 T T 10 0.533290718814845 2.51885981018944e-05 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 27 42 69 12.6011505919992 22.3982101902235 -9.79705959822431 T:C T C 10 0.533290718814845 0.021391412565895 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 17 18 35 7.93405778014763 9.59923293866721 -1.66517515851958 T:C C T 10 0.533290718814845 0.613800312425096 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 30 22 52 14.0012784355546 11.7323958139266 2.26888262162806 T:C T C 10 0.533290718814845 0.579673990099634 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 35 38 73 16.3348248414804 20.2650473149641 -3.93022247348368 T:C T C 10 0.533290718814845 0.411781775732744 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 36 33 69 16.8015341226656 17.5985937208899 -0.797059598224308 A:G A G 10 0.533290718814845 0.904158562583491 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 11 19 30 5.1338020930367 10.1325236574821 -4.99872156444535 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0979522717999928 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 29 35 64 13.5345691543695 18.6651751585196 -5.13060600415008 A:G A G 10 0.533290718814845 0.211729500008753 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236749626 C/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 236755856 T/C 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 10 15 25 4.66709281185155 7.99936078222268 -3.33226797037113 A:G A G 10 0.533290718814845 0.229281270563013 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 243419429 T/A 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:T T A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000490065:exon_243419336_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243419358_243419542:SDCCAG8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 1 246714520 G/A 1 15 13 28 7.00063921777732 6.93277934459299 0.0678598731843394 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246714515_246714604:TFB2M HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 142 110 252 66.272717928292 58.6619790696329 7.61073885865906 A:G G A 10 0.533290718814845 0.344300672003084 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 57 60 117 26.6024290275538 31.9974431288907 -5.39501410133687 A:G G A 10 0.533290718814845 0.354256581024111 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 60 47 107 28.0025568711093 25.0646637842977 2.93789308681158 T:C C T 10 0.533290718814845 0.628330462737009 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 75 74 149 35.0031960888866 39.4635131922985 -4.46031710341191 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.511414650783974 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 27 36 63 12.6011505919992 19.1984658773344 -6.59731528533524 A:G A G 10 0.533290718814845 0.101660041911232 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 86 83 169 40.1369981819233 44.2631296616321 -4.1261314797088 T:C C T 10 0.533290718814845 0.5380923192571 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 73 59 132 34.0697775265163 31.4641524100759 2.60562511644046 T:C C T 10 0.533290718814845 0.663746883841792 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3178772 C/G 1 66 50 116 30.8028125582202 26.6645359407423 4.13827661747798 C:G C G 10 0.533290718814845 0.45793101460937 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 70 109 179 32.6696496829609 58.1286883508181 -25.4590386678573 A:T T A 10 0.533290718814845 0.000164709736734562 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 109 70 179 50.8713116491819 37.3303503170391 13.5409613321427 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0432835624223281 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 3207632 A/G 1 6 14 20 2.80025568711093 7.46607006340783 -4.6658143762969 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0435114486167702 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 5781628 T/G 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000380270:exon_5781581_5781776:C10orf18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 5781969 A/T 1 15 17 32 7.00063921777732 9.06594221985237 -2.06530300207504 A:T A T 10 0.533290718814845 0.483602569142873 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 5788608 G/C 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 C:G G C 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 18 19 37 8.40076706133279 10.1325236574821 -1.73175659614927 A:G A G 10 0.533290718814845 0.622756122287319 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 7798033 A/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:T A T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000151657:ENST00000379562:exon_7797192_7798105:KIN;ENSG00000151657:ENST00000463666:exon_7797777_7798105:KIN;ENSG00000151657:ENST00000471320:exon_7797798_7798105:KIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 8006349 A/G 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 28 30 58 13.0678598731843 15.9987215644454 -2.93086169126101 A:G G A 10 0.533290718814845 0.510914928140003 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 2 14 16 0.93341856237031 7.46607006340783 -6.53265150103752 T:G T G 10 0.533290718814845 0.00153366538900978 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 99 93 192 46.2042188373303 49.5960368497806 -3.39181801245024 A:G A G 10 0.533290718814845 0.664435061964654 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 87 88 175 40.6037074631085 46.9295832557064 -6.32587579259788 T:G G T 10 0.533290718814845 0.363440739552735 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 16 21 37 7.46734849896248 11.1991050951117 -3.73175659614927 A:G A G 10 0.533290718814845 0.250015416114951 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 20 23 43 9.3341856237031 12.2656865327414 -2.93150090903834 A:C C A 10 0.533290718814845 0.445170226537947 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 16858993 T/C 1 57 52 109 26.6024290275538 27.7311173783719 -1.12868835081811 T:C T C 10 0.533290718814845 0.848173958578948 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16858972_16859382:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16858972_16859083:RSU1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 18834982 T/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000241058:ENST00000377304:exon_18834490_18835074:NSUN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 18 5 23 8.40076706133279 2.66645359407423 5.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0200673183720405 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 22048330 C/T 1 17 36 53 7.93405778014763 19.1984658773344 -11.2644080971868 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00222321917370722 ENSG00000136770:ENST00000376980:exon_22048099_22048547:DNAJC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27009254 A/G 1 8 15 23 3.73367424948124 7.99936078222268 -4.26568653274144 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0939399943193157 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_27009064_27009288:PDSS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 36 44 80 16.8015341226656 23.4647916278532 -6.6632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.145809721967723 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 109 93 202 50.8713116491819 49.5960368497806 1.2752747994013 T:C T C 10 0.533290718814845 0.887962253889069 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27444328 C/A 0 11 0 11 5.1338020930367 0 5.1338020930367 C C 10 0.533290718814845 0.00122104042253853 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 17 31 48 7.93405778014763 16.5320122832602 -8.59795450311256 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0138374961415724 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 27 16 43 12.6011505919992 8.53265150103752 4.06849909096166 T:C T C 10 0.533290718814845 0.225340886150396 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 31750099 C/T 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 T:C C T 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000424869:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000493835:exon_31749966_31750165:ZEB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 33200558 G/A 1 22 27 49 10.2676041860734 14.3988494080008 -4.13124522192741 A:G G A 10 0.533290718814845 0.254165227677138 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000494395:exon_33200455_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33200376_33200598:ITGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 33214802 A/G 1 23 27 50 10.7343134672586 14.3988494080008 -3.66453594074225 A:G A G 10 0.533290718814845 0.323032363912043 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33214799_33215037:ITGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 35 26 61 16.3348248414804 13.865558689186 2.46926615229446 T:C C T 10 0.533290718814845 0.608159119909221 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 36 32 68 16.8015341226656 17.065303002075 -0.263768879409461 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 T:G T G 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 27 18 45 12.6011505919992 9.59923293866721 3.00191765333197 T:C T C 10 0.533290718814845 0.455448361443369 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 36 35 71 16.8015341226656 18.6651751585196 -1.86364103585399 A:G G A 10 0.533290718814845 0.72157745461887 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 211 180 391 98.4756583300677 95.9923293866721 2.48332894339559 A:T T A 10 0.533290718814845 0.839373274570894 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 46122447 A/T 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:T A T 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 50732280 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50732079_50732823:ERCC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 50740600 C/T 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 50740876 G/C 1 3 11 14 1.40012784355546 5.8661979069633 -4.46607006340783 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0282747514932721 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 18 20 38 8.40076706133279 10.6658143762969 -2.26504731496411 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516956692122959 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 77 64 141 35.9366146512569 34.1306060041501 1.80600864710685 A:C C A 10 0.533290718814845 0.80035775714016 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 16 23 39 7.46734849896248 12.2656865327414 -4.79833803377896 A:G G A 10 0.533290718814845 0.148453931958528 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 49 37 86 22.8687547780726 19.7317565961493 3.13699818192332 C:G C G 10 0.533290718814845 0.518430959866485 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 A:T A T 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 70748606 G/A 1 25 9 34 11.6677320296289 4.79961646933361 6.86811556029527 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0240752006003684 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 18 7 25 8.40076706133279 3.73303503170392 4.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.071573023009701 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 54 34 88 25.2023011839984 18.1318844397047 7.07041674429364 A:G G A 10 0.533290718814845 0.135976214647286 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 32 25 57 14.934696997925 13.3322679703711 1.60242902755383 A:G G A 10 0.533290718814845 0.692694828478224 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 T:C C T 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 28 38 66 13.0678598731843 20.2650473149641 -7.19718744177977 T:C C T 10 0.533290718814845 0.08422690043104 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 71993094 T/G 1 76 73 149 35.4699053700718 38.9302224734837 -3.46031710341191 T:G T G 10 0.533290718814845 0.622418567658134 ENSG00000180817:ENST00000373232:exon_71993020_71993183:PPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 19 33 52 8.86747634251794 17.5985937208899 -8.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0176736150402910 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 72326400 G/A 1 1 12 13 0.466709281185155 6.39948862577814 -5.93277934459299 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00107242387112843 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72326337_72326644:KIAA1274 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 73511604 A/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73511425_73511618:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000470317:exon_73511425_73511618:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73511425_73511618:C10orf54 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 73521578 G/A 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 73533177 A/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 73578839 G/A 1 88 93 181 41.0704167442936 49.5960368497806 -8.52562010548695 A:G G A 10 0.533290718814845 0.206295235075047 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394929:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000495196:exon_73578788_73579028:PSAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75506674 T/C 1 57 33 90 26.6024290275538 17.5985937208899 9.00383530666394 T:C T C 10 0.533290718814845 0.057952190763069 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75506563_75506762:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000477008:exon_75506625_75506762:SEC24C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75527708 A/G 1 26 25 51 12.134441310814 13.3322679703711 -1.1978266595571 A:G A G 10 0.533290718814845 0.779890576999348 ENSG00000176986:ENST00000411652:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75527595_75527765:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75527595_75527765:SEC24C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 A:G G A 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75559077 G/A 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75566829 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000166507:ENST00000463410:exon_75566634_75566953:NDST2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75865065 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000035403:ENST00000372755:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000211998:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000436396:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000472585:exon_75864686_75865111:VCL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 4 12 16 1.86683712474062 6.39948862577814 -4.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0254215985752370 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 107 68 175 49.9378930868116 36.2637688794095 13.6741242074021 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0407183164350137 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 12 16 28 5.60051137422186 8.53265150103752 -2.93214012681566 A:T A T 10 0.533290718814845 0.34388687518086 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 153 166 319 71.4065200213287 88.5262593232643 -17.1197393019356 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0564695166878859 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 33 13 46 15.4014062791101 6.93277934459299 8.46862693451713 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0120786846880010 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 18 7 25 8.40076706133279 3.73303503170392 4.66773202962887 A:G A G 10 0.533290718814845 0.071573023009701 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 93711210 A/G 1 7 15 22 3.26696496829608 7.99936078222268 -4.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0536297201390633 ENSG00000095564:ENST00000265990:exon_93711160_93711323:BTAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 A:T A T 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 22 23 45 10.2676041860734 12.2656865327414 -1.99808234666803 T:C C T 10 0.533290718814845 0.554492200028458 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 95720490 C/T 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 C C 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 95720501 T/C 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 T T 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 97371146 G/A 1 23 45 68 10.7343134672586 23.998082346668 -13.2637688794095 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00143803990080576 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000485428:exon_97371013_97371199:ALDH18A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 30 29 59 14.0012784355546 15.4654308456305 -1.46415241007586 A:T A T 10 0.533290718814845 0.794392540972252 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 35 47 82 16.3348248414804 25.0646637842977 -8.72983894281729 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0597117921275486 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 101716484 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 11 10 21 5.1338020930367 5.33290718814845 -0.199105095111745 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 44 31 75 20.5352083721468 16.5320122832602 4.00319608888663 C:G C G 10 0.533290718814845 0.418073749379953 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 102247408 C/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:C C A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104140433 C/T 1 27 20 47 12.6011505919992 10.6658143762969 1.93533621570228 T:C C T 10 0.533290718814845 0.661561099572434 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405642180428618 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 90 102 192 42.0038353066639 54.3956533191142 -12.3918180124502 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0823465051543429 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 42 54 96 19.6017898097765 28.7976988160016 -9.19590900622512 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0655627941602944 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 70 67 137 32.6696496829609 35.7304781605946 -3.06082847763376 A:G G A 10 0.533290718814845 0.608457833943947 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105362287 C/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 C:G C G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 12 21 33 5.60051137422186 11.1991050951117 -5.59859372088989 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0557963044248418 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105758670 A/G 1 20 17 37 9.3341856237031 9.06594221985237 0.268243403850734 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105762945 A/G 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 A:G A G 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 19 25 44 8.86747634251794 13.3322679703711 -4.46479162785318 T:C C T 10 0.533290718814845 0.226369615898200 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 89 55 144 41.5371260254788 29.3309895348165 12.2061364906623 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0448819980016295 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 111872584 G/A 1 14 9 23 6.53392993659217 4.79961646933361 1.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.534727298566928 ENSG00000148700:ENST00000468251:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000360162:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000356080:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000277900:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000484622:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000487085:exon_111872535_111872657:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000495661:exon_111872535_111872652:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000497125:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000475954:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000496517:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000468345:exon_111872535_111872673:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000473669:exon_111872535_111872664:ADD3;ENSG00000148700:ENST00000462926:exon_111872535_111872673:ADD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 114154815 C/T 1 19 7 26 8.86747634251794 3.73303503170392 5.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0494794153073352 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000479936:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114154676_114154860:ACSL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 114169276 A/G 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 A:G A G 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114169265_114169443:ACSL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 115485204 G/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000165806:ENST00000429617:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115485121_115485296:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115485121_115485296:CASP7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:G G T 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 119029744 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 119133968 G/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000489491:exon_119133867_119133992:PDZD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 121196264 C/T 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C C T 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000457057:exon_121196163_121196276:GRK5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 121671651 T/C 1 11 10 21 5.1338020930367 5.33290718814845 -0.199105095111745 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121671556_121671676:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000446561:exon_121671556_121671676:SEC23IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 121685559 G/A 1 24 18 42 11.2010227484437 9.59923293866721 1.60178980977651 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.646097759557107 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 121693246 A/G 1 51 32 83 23.8021733404429 17.065303002075 6.73687033836786 A:G A G 10 0.533290718814845 0.152995376739078 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121693198_121693299:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000475542:exon_121693198_121693282:SEC23IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 126517989 G/A 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126517962_126518046:FAM175B;ENSG00000165660:ENST00000486933:exon_126517962_126518046:FAM175B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 145 147 292 67.6728457718475 78.3937356657822 -10.7208898939347 T:C T C 10 0.533290718814845 0.218222158704603 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 147 153 300 68.6062643342178 81.5934799786713 -12.9872156444535 C:G G C 10 0.533290718814845 0.147887440361227 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129901066 C/A 1 64 97 161 29.8693939958499 51.72919972504 -21.8598057291901 A:C C A 10 0.533290718814845 0.000642378267662176 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 109 91 200 50.8713116491819 48.5294554121509 2.341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.776976554749549 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 66 66 132 30.8028125582202 35.1971874417798 -4.39437488355955 A:G G A 10 0.533290718814845 0.48544420042177 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 112 117 229 52.2714394927374 62.3950141013369 -10.1235746085995 T:C T C 10 0.533290718814845 0.18569484209454 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 109 97 206 50.8713116491819 51.72919972504 -0.857888075858078 T:G T G 10 0.533290718814845 0.94435888007583 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 128 111 239 59.7387879916998 59.1952697884478 0.543518203252042 T:C C T 10 0.533290718814845 0.948431923645457 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 131 115 246 61.1389158352553 61.3284326637072 -0.189516828451872 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 119 128 247 55.5384044610334 68.2612120083002 -12.7228075472667 A:T T A 10 0.533290718814845 0.110906609964048 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 114 118 232 53.2048580551077 62.9283048201517 -9.72344676504405 T:C T C 10 0.533290718814845 0.211404910388693 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129903592 G/A 1 91 65 156 42.4705445878491 34.6638967229649 7.80664786488418 A:G G A 10 0.533290718814845 0.228882520246613 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 67 89 156 31.2695218394054 47.4628739745212 -16.1933521351158 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0101246668243817 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 69 61 130 32.2029404017757 32.5307338477055 -0.327793445929856 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129906903 C/T 1 66 60 126 30.8028125582202 31.9974431288907 -1.19463057067047 T:C C T 10 0.533290718814845 0.85852891128562 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 60 61 121 28.0025568711093 32.5307338477055 -4.52817697659625 C:G G C 10 0.533290718814845 0.413854601637318 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 25 33 58 11.6677320296289 17.5985937208899 -5.93086169126101 C:G C G 10 0.533290718814845 0.147135293923388 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 16 27 43 7.46734849896248 14.3988494080008 -6.93150090903834 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0457103695446745 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:G G T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 6 16 22 2.80025568711093 8.53265150103752 -5.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0176076148488402 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 5 12 17 2.33354640592577 6.39948862577814 -4.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0541099825374581 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 8 21 29 3.73367424948124 11.1991050951117 -7.46543084563051 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00800557351404291 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 38 31 69 17.7349526850359 16.5320122832602 1.2029404017757 A:G A G 10 0.533290718814845 0.810116203533027 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 182 126 308 84.9410891756982 67.1946305706705 17.7464586050277 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0455416221096682 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 431757 C/T 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_431694_433459:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_431694_431906:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_431694_431767:ANO9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 C:G C G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C T C 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 822588 C/T 1 25 27 52 11.6677320296289 14.3988494080008 -2.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.48843843590873 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000531923:exon_822016_822606:PNPLA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 11 20 31 5.1338020930367 10.6658143762969 -5.5320122832602 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.049263075607799 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 16 8 24 7.46734849896248 4.26632575051876 3.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.222733224438985 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 462 322 784 215.619687907542 171.71961145838 43.9000764491615 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00182729468645361 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 212 173 385 98.9423676112528 92.2592943549682 6.68307325628466 A:G G A 10 0.533290718814845 0.50699498518966 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 186 133 319 86.8079263004388 70.9276656023744 15.8802606980644 A:T:C:G G A 10 0.533290718814845 0.0818055649528999 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 3060505 C/T 1 24 24 48 11.2010227484437 12.7989772515563 -1.59795450311256 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.666538693127673 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000439280:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000465207:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000524825:exon_3060424_3060522:CARS;ENSG00000110619:ENST00000527330:exon_3060445_3060522:CARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 4406664 C/A 1 42 43 85 19.6017898097765 22.9315009090383 -3.32971109926183 A:C C A 10 0.533290718814845 0.514681239016508 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4406132_4407083:TRIM21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 5663706 G/C 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 C:G G C 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5663636_5663736:TRIM34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 153 125 278 71.4065200213287 66.6613398518556 4.74518016947309 T:C T C 10 0.533290718814845 0.588814050475112 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 202 168 370 94.2752747994013 89.592840760894 4.68243403850734 A:G G A 10 0.533290718814845 0.639399268466998 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 161 148 309 75.14019427081 78.9270263845971 -3.78683211378711 T:C T C 10 0.533290718814845 0.689946764821053 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 6243804 A/G 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G A G 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6243672_6243839:FAM160A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 92 80 172 42.9372538690343 42.6632575051876 0.273996363846656 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 117 105 222 54.6049858986631 55.9955254755587 -1.3905395768956 A:G G A 10 0.533290718814845 0.893028034618268 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:T A T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 14 23 37 6.53392993659217 12.2656865327414 -5.73175659614927 C:G C G 10 0.533290718814845 0.06958289945008 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 C:G G C 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 61 51 112 28.4692661522945 27.1978266595571 1.27143949273736 A:C A C 10 0.533290718814845 0.85006422142544 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 37 20 57 17.2682434038507 10.6658143762969 6.60242902755383 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0852324540954081 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 62 41 103 28.9359754334796 21.8649194714086 7.07105596207096 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.168103662417536 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 78 96 174 36.4033239324421 51.1959090062251 -14.792585073783 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0273718271285711 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 19 27 46 8.86747634251794 14.3988494080008 -5.53137306548287 T:C C T 10 0.533290718814845 0.106301157101412 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 31 21 52 14.4679877167398 11.1991050951117 3.26888262162806 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405763403770040 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 10822202 G/A 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.243055534897146 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 13408159 A/C 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:C A C 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000133794:ENST00000389707:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000401424:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403290:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000361003:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000389708:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403510:exon_13408143_13408810:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000339640:exon_13408143_13408808:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000403482:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000524392:exon_13408143_13408813:ARNTL;ENSG00000133794:ENST00000472842:exon_13408143_13408810:ARNTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 20 25 45 9.3341856237031 13.3322679703711 -3.99808234666803 A:G A G 10 0.533290718814845 0.236503059566074 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 18108492 T/C 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 T:C T C 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18108413_18108507:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 364 583 947 169.882178351396 310.908489069055 -141.026310717658 A:C C A 10 0.533290718814845 4.13994114442357e-20 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 9 17 26 4.20038353066639 9.06594221985237 -4.86555868918597 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0752576483829959 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 13 28 41 6.06722065540701 14.9321401268157 -8.86491947140865 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00711552721220002 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 17 7 24 7.93405778014763 3.73303503170392 4.20102274844372 A:T T A 10 0.533290718814845 0.102355687793340 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34460541 T/C 1 4 12 16 1.86683712474062 6.39948862577814 -4.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0254215985752370 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34460472_34460626:CAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 41 36 77 19.1350805285914 19.1984658773344 -0.0633853487430684 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 17 33 50 7.93405778014763 17.5985937208899 -9.66453594074225 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00681285405643542 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 6 14 20 2.80025568711093 7.46607006340783 -4.6658143762969 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0435114486167702 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 13 14 27 6.06722065540701 7.46607006340783 -1.39884940800082 T:C T C 10 0.533290718814845 0.700557007745927 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 39 41 80 18.201661966221 21.8649194714086 -3.6632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.434114265572976 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 141 150 291 65.8060086471069 79.9936078222267 -14.1875991751199 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.100017408275381 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 178 132 310 83.0742520509576 70.3943748835595 12.679877167398 A:G A G 10 0.533290718814845 0.154895031105082 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 57080882 C/T 1 11 3 14 5.1338020930367 1.59987215644454 3.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0649898735465232 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 57583801 C/T 1 30 21 51 14.0012784355546 11.1991050951117 2.8021733404429 T:C C T 10 0.533290718814845 0.484110672917486 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57583769_57587018:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57583772_57585412:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57583769_57586651:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57583769_57586651:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57583769_57586651:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533667:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527467:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000531014:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526772:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000525902:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57583769_57586650:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57583769_57584189:CTNND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 58893761 C/G 1 46 49 95 21.4686269345171 26.1312452219274 -4.66261828741028 C:G C G 10 0.533290718814845 0.355794209738519 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 18 7 25 8.40076706133279 3.73303503170392 4.66773202962887 T:G G T 10 0.533290718814845 0.071573023009701 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 58979393 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 58979722 G/A 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G G A 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 14 15 29 6.53392993659217 7.99936078222268 -1.46543084563051 C:G G C 10 0.533290718814845 0.71044292416145 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61108974 G/A 1 9 15 24 4.20038353066639 7.99936078222268 -3.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.15187969959101 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61108908_61108986:DAK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 22 24 46 10.2676041860734 12.7989772515563 -2.53137306548287 A:G G A 10 0.533290718814845 0.46414126978946 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 18 21 39 8.40076706133279 11.1991050951117 -2.79833803377896 T:C:G G T 10 0.533290718814845 0.42340361941009 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62290938 C/G 1 18 15 33 8.40076706133279 7.99936078222268 0.401406279110114 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62327224 C/T 1 1059 983 2042 494.245128775079 524.224776594993 -29.9796478199136 A:T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.190674979539911 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62327073_62327309:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62327075_62327309:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62327075_62327309:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000424909:exon_62327075_62327309:EEF1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 738 329 1067 344.431449514644 175.452646490084 168.97880302456 A:C:G G C 10 0.533290718814845 6.88561361074574e-26 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62365665 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G G A 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 11 23 34 5.1338020930367 12.2656865327414 -7.13188443970473 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0158475760281319 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:T T A 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 62 57 119 28.9359754334796 30.3975709724462 -1.46159553896656 A:G G A 10 0.533290718814845 0.854308617839101 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 32 24 56 14.934696997925 12.7989772515563 2.13571974636868 T:C T C 10 0.533290718814845 0.594598583871987 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 40 54 94 18.6683712474062 28.7976988160016 -10.1293275685954 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0387395670703917 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 46 38 84 21.4686269345171 20.2650473149641 1.20357961955302 T:C C T 10 0.533290718814845 0.827479829288514 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64004689 A/G 1 63 49 112 29.4026847146648 26.1312452219274 3.27143949273736 A:G A G 10 0.533290718814845 0.570546527729005 ENSG00000173511:ENST00000426086:exon_64004659_64004694:VEGFB;ENSG00000173511:ENST00000309422:exon_64004659_64004694:VEGFB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64004929 G/C 1 47 36 83 21.9353362157023 19.1984658773344 2.73687033836786 C:G G C 10 0.533290718814845 0.58333401990387 ENSG00000173511:ENST00000309422:exon_64004892_64005127:VEGFB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64056185 G/C 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 C:G G C 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000173264:ENST00000411458:exon_64056075_64056193:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000377702:exon_64056075_64056193:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000438980:exon_64056075_64056193:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000313074:exon_64056075_64056193:GPR137 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 42 49 91 19.6017898097765 26.1312452219274 -6.5294554121509 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.173641298446015 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 48 28 76 22.4020454968874 14.9321401268157 7.46990537007178 T:C T C 10 0.533290718814845 0.106898666198947 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 18 13 31 8.40076706133279 6.93277934459299 1.4679877167398 T:C C T 10 0.533290718814845 0.719561819758413 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65172473 C/T 0 19 0 19 8.86747634251794 0 8.86747634251794 C C 10 0.533290718814845 7.00616190041551e-06 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65172335_65172539:FRMD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65306073 C/T 1 122 104 226 56.9385323045889 55.4622347567439 1.47629754784502 T:C C T 10 0.533290718814845 0.893970093244738 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65305741_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65305913_65306146:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000528545:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000534462:exon_65305918_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000532290:exon_65305320_65306175:SCYL1;ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65306031_65306702:LTBP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65339027 C/T 1 47 43 90 21.9353362157023 22.9315009090383 -0.996164693336048 T:C C T 10 0.533290718814845 0.833616121077063 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 63 36 99 29.4026847146648 19.1984658773344 10.2042188373303 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.0437473210487048 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 23 27 50 10.7343134672586 14.3988494080008 -3.66453594074225 A:G G A 10 0.533290718814845 0.323032363912043 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 C:G C G 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65392695 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65392642_65392751:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000530174:exon_65392598_65392751:PCNXL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 A:G G A 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:C A C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65547118 A/C 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:C A C 10 0.533290718814845 0.617978371405662 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 5 16 21 2.33354640592577 8.53265150103752 -6.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00782670118630837 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 65651489 T/C 1 59 55 114 27.5358475899241 29.3309895348165 -1.79514194489233 T:C T C 10 0.533290718814845 0.77850647480437 ENSG00000172500:ENST00000534032:exon_65651212_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000338369:exon_65651392_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000357519:exon_65651392_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000525765:exon_65651394_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000531115:exon_65651396_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533045:exon_65651419_65651514:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533037:exon_65651480_65651514:FIBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 50 37 87 23.3354640592577 19.7317565961493 3.60370746310848 A:G G A 10 0.533290718814845 0.454010548212025 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 67804074 C/T 1 97 108 205 45.27080027496 57.5953976320033 -12.3245973570432 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0928156124225872 ENSG00000110717:ENST00000313468:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000528492:exon_67803929_67804106:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000524810:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531282:exon_67803929_67804111:NDUFS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 21 18 39 9.80089490488825 9.59923293866721 0.201661966221044 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 A:C C A 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 68855363 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68855343_68858072:TPCN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C T C 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 71726774 C/T 1 50 33 83 23.3354640592577 17.5985937208899 5.73687033836786 T:C C T 10 0.533290718814845 0.226906279372445 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 37 35 72 17.2682434038507 18.6651751585196 -1.39693175466884 C:G G C 10 0.533290718814845 0.813482581369031 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 46 33 79 21.4686269345171 17.5985937208899 3.87003321362724 T:C C T 10 0.533290718814845 0.4303981276116 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 73105534 G/A 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73105522_73105779:RELT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 73106569 G/C 1 18 23 41 8.40076706133279 12.2656865327414 -3.86491947140865 C:G G C 10 0.533290718814845 0.273353295187488 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106489_73108518:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106489_73108518:RELT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 C:G C G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 65 53 118 30.3361032770351 28.2644080971868 2.07169517984828 A:G G A 10 0.533290718814845 0.713242624386967 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 T:C T C 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 12 16 28 5.60051137422186 8.53265150103752 -2.93214012681566 T:C C T 10 0.533290718814845 0.34388687518086 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 51 61 112 23.8021733404429 32.5307338477055 -8.72856050726264 T:C C T 10 0.533290718814845 0.107442095081215 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 38 41 79 17.7349526850359 21.8649194714086 -4.12996678637276 T:C C T 10 0.533290718814845 0.368559482502803 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 T:G T G 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82643760 G/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:G G T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 50 65 115 23.3354640592577 34.6638967229649 -11.3284326637072 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0394243591239971 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 28 23 51 13.0678598731843 12.2656865327414 0.802173340442904 A:C A C 10 0.533290718814845 0.888801283177027 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 A:C A C 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 85725937 C/T 1 13 7 20 6.06722065540701 3.73303503170392 2.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.372254450678439 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000534412:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531771:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531558:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531930:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532041:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000525162:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528256:exon_85725913_85726006:PICALM HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 21 28 49 9.80089490488825 14.9321401268157 -5.13124522192741 T:G G T 10 0.533290718814845 0.153635711107862 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 35 30 65 16.3348248414804 15.9987215644454 0.336103277035075 A:C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 15 6 21 7.00063921777732 3.19974431288907 3.80089490488825 A:G A G 10 0.533290718814845 0.125329446963911 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 89 102 191 41.5371260254788 54.3956533191142 -12.8585272936354 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0696167539647788 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 102398329 C/T 1 23 40 63 10.7343134672586 21.3316287525938 -10.5973152853352 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0079038073958363 ENSG00000137673:ENST00000260227:exon_102398255_102398403:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000533366:exon_102398255_102398403:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000531200:exon_102397717_102398403:MMP7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 104825649 C/T 1 105 77 182 49.0044745244413 41.0633853487431 7.9410891756982 T:C C T 10 0.533290718814845 0.265106795917202 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 16 13 29 7.46734849896248 6.93277934459299 0.534569154369494 C:G G C 10 0.533290718814845 0.855209067729783 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 A:C A C 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 110035262 A/G 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 110035301 A/G 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 71 72 143 33.136358964146 38.3969317546688 -5.26057279052284 A:C A C 10 0.533290718814845 0.402353851313679 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 26 20 46 12.134441310814 10.6658143762969 1.46862693451713 T:C T C 10 0.533290718814845 0.768000285226431 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 17 6 23 7.93405778014763 3.19974431288907 4.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0591156409808618 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 19 7 26 8.86747634251794 3.73303503170392 5.13444131081403 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0494794153073352 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 T:C C T 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 C:G C G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 117864113 G/A 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 117864846 A/G 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117864714_117864922:IL10RA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 118422549 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118422501_118422567:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118422501_118422567:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118422501_118422567:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531201:exon_118422501_118422567:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000525060:exon_118422501_118422567:IFT46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 40 37 77 18.6683712474062 19.7317565961493 -1.06338534874307 T:C T C 10 0.533290718814845 0.820242250477806 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 11 18 29 5.1338020930367 9.59923293866721 -4.46543084563051 T:C T C 10 0.533290718814845 0.135154616723988 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 119043686 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160703:ENST00000482180:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000454811:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000449394:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000422249:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000474751:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000468765:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119043610_119043698:NLRX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 119156193 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000110395:ENST00000264033:exon_119155899_119156276:CBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 22 21 43 10.2676041860734 11.1991050951117 -0.931500909038336 A:G G A 10 0.533290718814845 0.878764736190408 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 119535644 G/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 C:G G C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000110400:ENST00000264025:exon_119531702_119536007:PVRL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1477 1521 2998 689.329608310474 811.135183317379 -121.805575006905 A:T:C:G A G 10 0.533290718814845 8.594800268696e-06 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 11 4 15 5.1338020930367 2.13316287525938 3.00063921777732 A:C A C 10 0.533290718814845 0.194148407751893 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 30 31 61 14.0012784355546 16.5320122832602 -2.53073384770554 A:T T A 10 0.533290718814845 0.52409681838958 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G A G 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 126135973 C/T 1 117 114 231 54.6049858986631 60.7951419448923 -6.19015604622921 T:C C T 10 0.533290718814845 0.429152052334173 ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135858_126135976:SRPR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 35 62 97 16.3348248414804 33.0640245665204 -16.72919972504 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000726352488786714 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 60 53 113 28.0025568711093 28.2644080971868 -0.261851226077489 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 21 31 52 9.80089490488825 16.5320122832602 -6.73111737837194 T:C T C 10 0.533290718814845 0.070564412710574 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 38 34 72 17.7349526850359 18.1318844397047 -0.396931754668842 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130750642 A/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:C A C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000527116:exon_130750517_130751036:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000426933:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530330:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130750517_130750701:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 27 16 43 12.6011505919992 8.53265150103752 4.06849909096166 T:C T C 10 0.533290718814845 0.225340886150396 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130776613 A/G 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130780015 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130779913_130780032:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130784754 C/G 1 19 5 24 8.86747634251794 2.66645359407423 6.20102274844372 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0129063528980085 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 130784971 C/G 1 11 4 15 5.1338020930367 2.13316287525938 3.00063921777732 C:G C G 10 0.533290718814845 0.194148407751893 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 15 15 30 7.00063921777732 7.99936078222268 -0.998721564445351 T:C T C 10 0.533290718814845 0.718981035499475 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 463248 G/C 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 C:G G C 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_463242_463400:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_463242_463400:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_463242_463400:KDM5A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 27 19 46 12.6011505919992 10.1325236574821 2.46862693451713 A:G A G 10 0.533290718814845 0.555007661201334 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 971291 C/T 1 62 46 108 28.9359754334796 24.5313730654829 4.40460236799674 T:C C T 10 0.533290718814845 0.440670601614851 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_971249_971436:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_971249_971436:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_971249_971436:WNK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 1702561 G/A 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 32 37 69 14.934696997925 19.7317565961493 -4.79705959822431 A:G G A 10 0.533290718814845 0.277889718591824 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 38 37 75 17.7349526850359 19.7317565961493 -1.99680391111338 A:G G A 10 0.533290718814845 0.645680190808317 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 138 86 224 64.4058808035514 45.8630018180767 18.5428789854747 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0131941399045553 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6567907 C/T 1 9 16 25 4.20038353066639 8.53265150103752 -4.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.107687579177663 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 61 57 118 28.4692661522945 30.3975709724462 -1.92830482015172 A:C C A 10 0.533290718814845 0.782087220151536 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6635274 G/A 1 45 30 75 21.001917653332 15.9987215644454 5.00319608888662 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297580802890316 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635234_6635366:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635234_6635366:NCAPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6637941 C/T 1 38 40 78 17.7349526850359 21.3316287525938 -3.59667606755791 T:C C T 10 0.533290718814845 0.428849571730654 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 64 48 112 29.8693939958499 25.5979545031126 4.27143949273736 C:G C G 10 0.533290718814845 0.44935585457504 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4165 3616 7781 1943.84415613617 1928.37923923448 15.4649169016909 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.733216217987031 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4013 3919 7932 1872.90434539603 2089.96632703538 -217.061981639351 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 1.09504429800215e-06 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6707526 G/A 1 124 120 244 57.8719508669592 63.9948862577814 -6.12293539082219 A:G G A 10 0.533290718814845 0.441863407201145 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6707388_6707591:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6707388_6707591:CHD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6709059 G/A 1 60 57 117 28.0025568711093 30.3975709724462 -2.39501410133687 A:G G A 10 0.533290718814845 0.7111123327671 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6708939_6709178:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6708939_6709178:CHD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 31 20 51 14.4679877167398 10.6658143762969 3.8021733404429 A:G G A 10 0.533290718814845 0.326871946400265 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 26 37 63 12.134441310814 19.7317565961493 -7.59731528533524 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0586989878861926 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 7287956 C/T 1 14 5 19 6.53392993659217 2.66645359407423 3.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.105735293726852 ENSG00000139182:ENST00000266546:exon_7287923_7288131:CLSTN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 1 33 1 34 15.4014062791101 0.533290718814845 14.8681155602953 T:G G T 10 0.533290718814845 2.03401688220516e-08 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 20 17 37 9.3341856237031 9.06594221985237 0.268243403850734 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 A:G A G 10 0.533290718814845 0.556619610522349 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 108 79 187 50.4046023679967 42.1299667863728 8.27463558162398 C:G C G 10 0.533290718814845 0.241158645945805 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 231 157 388 107.809843953771 83.7266428539307 24.0832010998401 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0145651577714977 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 12618690 G/A 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000165714:ENST00000314565:exon_12618480_12619838:LOH12CR1;ENSG00000165714:ENST00000298571:exon_12618480_12619838:LOH12CR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 40 40 80 18.6683712474062 21.3316287525938 -2.6632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.576470249894948 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 12976194 A/G 1 29 22 51 13.5345691543695 11.7323958139266 1.8021733404429 A:G A G 10 0.533290718814845 0.674789795989144 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12976137_12976253:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12976137_12976253:DDX47 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 T:G T G 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 64 66 130 29.8693939958499 35.1971874417798 -5.32779344592986 T:C C T 10 0.533290718814845 0.379622700024877 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 13 20 33 6.06722065540701 10.6658143762969 -4.59859372088989 A:G A G 10 0.533290718814845 0.118504469933107 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 16 18 34 7.46734849896248 9.59923293866721 -2.13188443970473 A:G A G 10 0.533290718814845 0.495241370465101 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 25147192 A/T 1 13 5 18 6.06722065540701 2.66645359407423 3.40076706133279 A:T A T 10 0.533290718814845 0.155041681425192 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 175 173 348 81.6741242074021 92.2592943549682 -10.5851701475661 C:G G C 10 0.533290718814845 0.259623295264877 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 7 20 27 3.26696496829608 10.6658143762969 -7.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00589814058789733 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:G T G 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 30823971 A/G 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30823896_30824030:IPO8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 0 13 0 13 6.06722065540701 0 6.06722065540701 T T 10 0.533290718814845 0.000332026908834375 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 C:G C G 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 32134240 C/T 1 24 37 61 11.2010227484437 19.7317565961493 -8.53073384770555 A:T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.0295867555925232 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 32134638 T/C 1 31 26 57 14.4679877167398 13.865558689186 0.602429027553834 T:C T C 10 0.533290718814845 0.895220745244316 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 32137901 A/G 1 45 42 87 21.001917653332 22.3982101902235 -1.39629253689152 A:G A G 10 0.533290718814845 0.830017800506069 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 39087609 G/A 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.117167394553238 ENSG00000139117:ENST00000331366:exon_39087459_39087640:CPNE8;ENSG00000139117:ENST00000360449:exon_39087459_39087640:CPNE8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 39713776 C/A 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 A:C C A 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39713708_39713815:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39713708_39713815:KIF21A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 39725527 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39725492_39725593:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39725492_39725593:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39725492_39725593:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39725492_39725593:KIF21A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 40715886 A/C 1 15 3 18 7.00063921777732 1.59987215644454 5.40076706133279 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0156326994729822 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40715837_40715983:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40715837_40715983:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40715837_40715983:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40715837_40715983:LRRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 40716260 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40716121_40716312:LRRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 40742254 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40742211_40742311:LRRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 42792751 C/T 1 63 88 151 29.4026847146648 46.9295832557064 -17.5268985410416 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.00537761354273297 ENSG00000134283:ENST00000395580:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000395568:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000432191:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000449194:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000317560:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000337898:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000256678:exon_42792656_42792796:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000358314:exon_42792656_42792796:PPHLN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 43 50 93 20.0684990909617 26.6645359407423 -6.59603684978059 T:G T G 10 0.533290718814845 0.177787065620227 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 48737245 A/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:C A C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000167528:ENST00000301042:exon_48733911_48737510:ZNF641;ENSG00000167528:ENST00000448928:exon_48733911_48737510:ZNF641 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 18 31 49 8.40076706133279 16.5320122832602 -8.1312452219274 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0218488275797875 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:G G A 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 44 39 83 20.5352083721468 20.798338033779 -0.263129661632135 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 49888663 A/G 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49888524_49888785:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49888524_49888785:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49888524_49888785:SPATS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 2 10 12 0.93341856237031 5.33290718814845 -4.39948862577814 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0168603606659464 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 18 18 36 8.40076706133279 9.59923293866721 -1.19846587733442 A:T A T 10 0.533290718814845 0.739850891543775 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 25 28 53 11.6677320296289 14.9321401268157 -3.26440809718679 T:C C T 10 0.533290718814845 0.409819201040782 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 53587563 A/G 1 32 23 55 14.934696997925 12.2656865327414 2.66901046518352 A:G A G 10 0.533290718814845 0.501594937749716 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53587492_53587685:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53587492_53587685:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53587492_53587685:ITGB7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 53589511 A/G 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 53677884 C/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53677842_53677951:ESPL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:G A G 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 17 16 33 7.93405778014763 8.53265150103752 -0.598593720889886 T:C C T 10 0.533290718814845 0.862945254696392 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:G A G 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 32 26 58 14.934696997925 13.865558689186 1.06913830873899 T:C T C 10 0.533290718814845 0.794158568963327 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 55357640 T/C 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55357569_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532757:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524959:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000526532:exon_55357525_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533446:exon_55357585_55357734:KIAA0748 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 C:G C G 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 26 18 44 12.134441310814 9.59923293866721 2.53520837214682 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.455298969015535 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 21 15 36 9.80089490488825 7.99936078222268 1.80153412266558 T:C C T 10 0.533290718814845 0.617940298890809 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 11 19 30 5.1338020930367 10.1325236574821 -4.99872156444535 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0979522717999928 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 20 20 40 9.3341856237031 10.6658143762969 -1.3316287525938 C:G C G 10 0.533290718814845 0.751974031650685 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 56865970 C/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56865903_56865979:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56865557_56866256:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56865903_56865979:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56865903_56865979:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56865903_56865979:GLS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57146013 A/T 1 17 18 35 7.93405778014763 9.59923293866721 -1.66517515851958 A:T A T 10 0.533290718814845 0.613800312425096 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57396584 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000166860:ENST00000300101:exon_57392618_57398745:ZBTB39 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 20 14 34 9.3341856237031 7.46607006340783 1.86811556029527 A:G G A 10 0.533290718814845 0.607330183376313 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 28 36 64 13.0678598731843 19.1984658773344 -6.13060600415008 A:C A C 10 0.533290718814845 0.133697969714809 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 A:T A T 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G G A 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 29 29 58 13.5345691543695 15.4654308456305 -1.93086169126101 A:T T A 10 0.533290718814845 0.693364029672237 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 32 22 54 14.934696997925 11.7323958139266 3.20230118399837 A:G A G 10 0.533290718814845 0.415231142591696 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 10 16 26 4.66709281185155 8.53265150103752 -3.86555868918597 T:G G T 10 0.533290718814845 0.168136211013644 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 68052181 C/A 1 20 12 32 9.3341856237031 6.39948862577814 2.93469699792496 A:C C A 10 0.533290718814845 0.376239865171977 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 69967862 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000166225:ENST00000299293:exon_69967785_69973559:FRS2;ENSG00000166225:ENST00000397997:exon_69967785_69973559:FRS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 72008421 T/C 1 18 10 28 8.40076706133279 5.33290718814845 3.06785987318434 T:C T C 10 0.533290718814845 0.262323428348085 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72008315_72008480:ZFC3H1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 8 13 21 3.73367424948124 6.93277934459299 -3.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.191682202539152 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 26 14 40 12.134441310814 7.46607006340783 4.6683712474062 T:C T C 10 0.533290718814845 0.155360906944256 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 77438436 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000165891:ENST00000322886:exon_77438417_77438575:E2F7;ENSG00000165891:ENST00000416496:exon_77438417_77438575:E2F7;ENSG00000165891:ENST00000339887:exon_77438417_77438575:E2F7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 80014907 A/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:T A T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_80014856_80014987:PAWR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 80169760 T/C 1 23 23 46 10.7343134672586 12.2656865327414 -1.53137306548287 T:C T C 10 0.533290718814845 0.660645980947782 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80167343_80169795:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80167343_80169795:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80167343_80169795:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80167343_80169795:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80167343_80169795:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80167343_80169795:PPP1R12A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 C:G G C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 88472996 C/T 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C C T 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88472869_88473006:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88472869_88473006:CEP290 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 94543506 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94542748_94543809:PLXNC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 94645255 A/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94645202_94645304:PLXNC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 99007973 G/C 1 75 35 110 35.0031960888866 18.6651751585196 16.3380209303671 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00208768686396406 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 104851127 C/G 1 21 12 33 9.80089490488825 6.39948862577814 3.40140627911011 C:G C G 10 0.533290718814845 0.295526095262369 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 105433523 T/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:T T A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105433491_105433584:ALDH1L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110385079 G/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:G G T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000139436:ENST00000343646:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000354574:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000361006:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110385061_110385309:GIT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 9 16 25 4.20038353066639 8.53265150103752 -4.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.107687579177663 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G A G 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 27 29 56 12.6011505919992 15.4654308456305 -2.86428025363132 T:C T C 10 0.533290718814845 0.503616760467259 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 110924406 T/G 1 36 44 80 16.8015341226656 23.4647916278532 -6.6632575051876 T:G T G 10 0.533290718814845 0.145809721967723 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110924339_110924522:C12orf24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 19 17 36 8.86747634251794 9.06594221985237 -0.198465877334421 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 113 130 243 52.7381487739225 69.3277934459299 -16.5896446720073 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0339192755892987 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 1 19 20 0.466709281185155 10.1325236574821 -9.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 9.19586988753162e-06 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 88 23 111 41.0704167442936 12.2656865327414 28.8047302115522 A:G G A 10 0.533290718814845 1.71352334276690e-08 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 96 43 139 44.8040909937749 22.9315009090383 21.8725900847365 C:G G C 10 0.533290718814845 0.000230023828137354 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113376320 C/T 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113376331 C/A 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 A:C C A 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113376388 G/A 1 22 11 33 10.2676041860734 5.8661979069633 4.40140627911011 A:G G A 10 0.533290718814845 0.162104094485981 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113376452 C/T 1 23 16 39 10.7343134672586 8.53265150103752 2.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.523723415499499 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 16 37 53 7.46734849896248 19.7317565961493 -12.2644080971868 A:G G A 10 0.533290718814845 0.000822471344349952 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C T C 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 118467553 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 T:C T C 10 0.533290718814845 0.595989802726756 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 11 3 14 5.1338020930367 1.59987215644454 3.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0649898735465232 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C T C 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 T:C C T 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 37 24 61 17.2682434038507 12.7989772515563 4.46926615229445 A:G A G 10 0.533290718814845 0.304630182797472 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 73 51 124 34.0697775265163 27.1978266595571 6.87195086695922 A:G A G 10 0.533290718814845 0.242030980992369 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121151093 C/T 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000175970:ENST00000344651:exon_121151077_121151190:UNC119B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 29 22 51 13.5345691543695 11.7323958139266 1.8021733404429 A:G G A 10 0.533290718814845 0.674789795989144 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 21 15 36 9.80089490488825 7.99936078222268 1.80153412266558 C:G G C 10 0.533290718814845 0.617940298890809 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121221518 C/T 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121221477_121221555:AC069214.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 A:T T A 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121454257 T/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:T T A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121458400 C/T 1 22 6 28 10.2676041860734 3.19974431288907 7.06785987318434 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00751312587015301 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C T C 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 17 14 31 7.93405778014763 7.46607006340783 0.467987716739804 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 A:G G A 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 121701681 G/A 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121701609_121701742:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121701609_121701742:CAMKK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 51 38 89 23.8021733404429 20.2650473149641 3.53712602547879 T:C C T 10 0.533290718814845 0.459700543133079 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 63 77 140 29.4026847146648 41.0633853487431 -11.6607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0514072615574651 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 27 26 53 12.6011505919992 13.865558689186 -1.26440809718679 A:G A G 10 0.533290718814845 0.783696513840242 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 123062219 G/A 1 10 3 13 4.66709281185155 1.59987215644454 3.06722065540701 A:G G A 10 0.533290718814845 0.101577760344088 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123062219_123062338:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123062219_123062338:KNTC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 C:G C G 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:G T G 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125263061 C/T 1 43 36 79 20.0684990909617 19.1984658773344 0.870033213627245 T:C C T 10 0.533290718814845 0.910374848000838 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 18 16 34 8.40076706133279 8.53265150103752 -0.131884439704731 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 24 16 40 11.2010227484437 8.53265150103752 2.6683712474062 A:G G A 10 0.533290718814845 0.431489020021948 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 132529393 G/A 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132529345_132529498:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132529345_132529498:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132529345_132529498:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132529345_132529498:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132529345_132529498:EP400 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 132636667 C/T 1 36 32 68 16.8015341226656 17.065303002075 -0.263768879409461 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636629_132636742:NOC4L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 T:C T C 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133264332 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133264192_133264378:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133264257_133264378:PGAM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 60 73 133 28.0025568711093 38.9302224734837 -10.9276656023744 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.067619739631452 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 26 26 52 12.134441310814 13.865558689186 -1.73111737837194 A:G G A 10 0.533290718814845 0.677777010014177 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133435793 C/T 1 21 24 45 9.80089490488825 12.7989772515563 -2.99808234666803 T:C C T 10 0.533290718814845 0.375030482736379 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 11 23 34 5.1338020930367 12.2656865327414 -7.13188443970473 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0158475760281319 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20224387 A/G 1 30 38 68 14.0012784355546 20.2650473149641 -6.26376887940946 A:G A G 10 0.533290718814845 0.144762881523683 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20398669 T/C 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20397622_20399375:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20397624_20399375:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20413021 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20425539 C/T 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425495_20425588:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425495_20425588:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425495_20425588:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 20 15 35 9.3341856237031 7.99936078222268 1.33482484148042 T:C T C 10 0.533290718814845 0.735863720798038 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 20608465 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20608401_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20608401_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20608401_20608544:ZMYM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 18 9 27 8.40076706133279 4.79961646933361 3.60115059199918 A:G A G 10 0.533290718814845 0.181385538451904 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 152 3 155 70.9398107401436 1.59987215644454 69.339938583699 T:C:G T G 10 0.533290718814845 3.97906229528029e-37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 40 0 40 18.6683712474062 0 18.6683712474062 C C 10 0.533290718814845 1.46820708619105e-11 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 19 25 44 8.86747634251794 13.3322679703711 -4.46479162785318 A:G A G 10 0.533290718814845 0.226369615898200 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 13 17 30 6.06722065540701 9.06594221985237 -2.99872156444535 A:G A G 10 0.533290718814845 0.279372965933084 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23911748 C/T 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23911820 A/G 1 3 12 15 1.40012784355546 6.39948862577814 -4.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0166427658718777 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 23913827 G/A 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 24243200 T/C 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C T C 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 21 9 30 9.80089490488825 4.79961646933361 5.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0700334987114098 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 25049676 G/A 1 8 15 23 3.73367424948124 7.99936078222268 -4.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0939399943193157 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 28009851 G/A 1 55 49 104 25.6690104651835 26.1312452219274 -0.462234756743882 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 15 17 32 7.00063921777732 9.06594221985237 -2.06530300207504 C:G C G 10 0.533290718814845 0.483602569142873 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G A G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 33704290 G/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 23 29 52 10.7343134672586 15.4654308456305 -4.73111737837194 C:G G C 10 0.533290718814845 0.211698519643848 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 36 28 64 16.8015341226656 14.9321401268157 1.86939399584992 A:G A G 10 0.533290718814845 0.707584033276157 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 17 22 39 7.93405778014763 11.7323958139266 -3.79833803377896 A:G A G 10 0.533290718814845 0.261824116322687 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 19 24 43 8.86747634251794 12.7989772515563 -3.93150090903834 A:C A C 10 0.533290718814845 0.284603030789994 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 18 23 41 8.40076706133279 12.2656865327414 -3.86491947140865 T:C T C 10 0.533290718814845 0.273353295187488 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 40229891 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 9 19 28 4.20038353066639 10.1325236574821 -5.93214012681566 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0353555000671646 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 63 44 107 29.4026847146648 23.4647916278532 5.93789308681158 A:T A T 10 0.533290718814845 0.286532964287124 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 45911509 T/C 1 4123 3857 7980 1924.24236632639 2056.90230246886 -132.659936142463 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.00294693192527897 ENSG00000133112:ENST00000379056:exon_45911008_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000528619:exon_45911034_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000529421:exon_45911188_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000484604:exon_45911199_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000533567:exon_45911312_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000490277:exon_45911312_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000530245:exon_45911313_45911688:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000530705:exon_45911313_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000448968:exon_45911313_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379060:exon_45911333_45911523:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379055:exon_45911437_45911523:TPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 21 35 56 9.80089490488825 18.6651751585196 -8.86428025363132 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0220609437999580 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 34 29 63 15.8681155602953 15.4654308456305 0.402684714664764 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 46705058 T/C 1 433 412 845 202.085118753172 219.715776151716 -17.630657398544 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.22765739532568 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 7 18 25 3.26696496829608 9.59923293866721 -6.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0147410457986700 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 47127813 C/T 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47127305_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47127335_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47127395_47127838:LRCH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 48655824 G/A 1 34 42 76 15.8681155602953 22.3982101902235 -6.53009462992822 A:G G A 10 0.533290718814845 0.136705080882543 ENSG00000136146:ENST00000258648:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378594:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378586:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000417167:exon_48655781_48655867:MED4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 11 2 13 5.1338020930367 1.06658143762969 4.06722065540701 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0262163998871804 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 24 29 53 11.2010227484437 15.4654308456305 -4.26440809718679 A:G A G 10 0.533290718814845 0.271434874489348 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 52598973 T/C 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:C T C 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52598827_52599073:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52598827_52599073:UTP14C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 53024706 G/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G G A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000136100:ENST00000378060:exon_53024634_53024757:VPS36;ENSG00000136100:ENST00000475375:exon_53024634_53024763:VPS36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 T:C C T 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 76395620 C/T 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 76397731 G/A 1 13 19 32 6.06722065540701 10.1325236574821 -4.06530300207504 A:G G A 10 0.533290718814845 0.159963903652607 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76397701_76398009:LMO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 6 13 19 2.80025568711093 6.93277934459299 -4.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0669886965950056 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 77738664 A/G 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G A G 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77738589_77738676:MYCBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 T:C C T 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 77759465 T/C 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77759238_77759512:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77759238_77759512:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77759238_77759512:MYCBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 79929326 G/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 13 14 27 6.06722065540701 7.46607006340783 -1.39884940800082 T:C T C 10 0.533290718814845 0.700557007745927 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 95264598 A/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:G A G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95264444_95264644:GPR180 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 95264604 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95264444_95264644:GPR180 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 84 58 142 39.203579619553 30.930861691261 8.27271792829201 A:G G A 10 0.533290718814845 0.178551755628452 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 25 27 52 11.6677320296289 14.3988494080008 -2.73111737837194 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.48843843590873 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 68 57 125 31.7362311205905 30.3975709724462 1.33866014814437 A:G A G 10 0.533290718814845 0.857890520575547 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 103518162 C/A 1 24 13 37 11.2010227484437 6.93277934459299 4.26824340385073 A:C C A 10 0.533290718814845 0.188189157888609 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103517068_103518731:ERCC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 108863591 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 15 15 30 7.00063921777732 7.99936078222268 -0.998721564445351 T:G G T 10 0.533290718814845 0.718981035499475 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 37 40 77 17.2682434038507 21.3316287525938 -4.06338534874307 A:G G A 10 0.533290718814845 0.363072493126587 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 111532288 G/A 1 33 42 75 15.4014062791101 22.3982101902235 -6.99680391111338 A:G G A 10 0.533290718814845 0.106886324972063 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 15 8 23 7.00063921777732 4.26632575051876 2.73431346725856 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.29943976246634 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 19 26 45 8.86747634251794 13.865558689186 -4.99808234666803 T:C T C 10 0.533290718814845 0.138524795610424 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 35 29 64 16.3348248414804 15.4654308456305 0.86939399584992 T:C C T 10 0.533290718814845 0.900513944917263 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 55 53 108 25.6690104651835 28.2644080971868 -2.59539763200326 A:G A G 10 0.533290718814845 0.630752694534819 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 13 114113637 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000150401:ENST00000375403:exon_114113627_114113723:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000332592:exon_114113627_114113723:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000478244:exon_114113627_114113723:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000482038:exon_114113627_114113858:DCUN1D2;ENSG00000150401:ENST00000438545:exon_114113627_114113723:DCUN1D2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 A:C C A 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 123 108 231 57.4052415857741 57.5953976320033 -0.190156046229198 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 48 47 95 22.4020454968874 25.0646637842977 -2.66261828741028 A:C A C 10 0.533290718814845 0.60810256262371 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 19 20 39 8.86747634251794 10.6658143762969 -1.79833803377896 C:G G C 10 0.533290718814845 0.631273578571673 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 33 29 62 15.4014062791101 15.4654308456305 -0.0640245665203913 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20920340 A/G 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.188395739495124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 265 279 544 123.677959514066 148.788110549342 -25.1101510352757 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0316835023920249 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 28 38 66 13.0678598731843 20.2650473149641 -7.19718744177977 A:C C A 10 0.533290718814845 0.08422690043104 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 A:G G A 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 39 37 76 18.201661966221 19.7317565961493 -1.53009462992822 C:G G C 10 0.533290718814845 0.731727257285485 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 55 42 97 25.6690104651835 22.3982101902235 3.27080027496003 C:G C G 10 0.533290718814845 0.54226234250662 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 55 42 97 25.6690104651835 22.3982101902235 3.27080027496003 T:C T C 10 0.533290718814845 0.54226234250662 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21871653 C/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21871612_21871822:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21871612_21871822:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21871612_21871822:CHD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 32 16 48 14.934696997925 8.53265150103752 6.40204549688744 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0816111097016277 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 19 1 20 8.86747634251794 0.533290718814845 8.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000129421987640166 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 15 0 15 7.00063921777732 0 7.00063921777732 A A 10 0.533290718814845 9.11095029014042e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 15 0 15 7.00063921777732 0 7.00063921777732 T T 10 0.533290718814845 9.11095029014042e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 31 29 60 14.4679877167398 15.4654308456305 -0.997443128890701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.797523718405806 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 31 34 65 14.4679877167398 18.1318844397047 -3.66389672296493 A:G G A 10 0.533290718814845 0.38576649666497 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 45 48 93 21.001917653332 25.5979545031126 -4.59603684978059 A:G A G 10 0.533290718814845 0.351167692800377 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 292 362 654 136.279110106065 193.051240210974 -56.7721301049087 T:G G T 10 0.533290718814845 9.1314529812606e-06 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 23 29 52 10.7343134672586 15.4654308456305 -4.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.211698519643848 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 374 322 696 174.549271163248 171.71961145838 2.82965970486788 A:T:C T A 10 0.533290718814845 0.849386070546418 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23240373 A/G 1 552 128 680 257.623523214206 68.2612120083002 189.362311205905 A:G A G 10 0.533290718814845 6.07800003521163e-52 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 10 53 63 4.66709281185155 28.2644080971868 -23.5973152853352 T:C T C 10 0.533290718814845 1.03117473577277e-09 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 25 4 29 11.6677320296289 2.13316287525938 9.53456915436949 A:G A G 10 0.533290718814845 0.000272075768028059 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23342582 C/T 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23342520_23342655:LRP10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 38 46 84 17.7349526850359 24.5313730654829 -6.79642038044698 A:G A G 10 0.533290718814845 0.155092441452025 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23745003 T/C 1 21 12 33 9.80089490488825 6.39948862577814 3.40140627911011 T:C T C 10 0.533290718814845 0.295526095262369 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 C:G C G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G G A 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 14 16 30 6.53392993659217 8.53265150103752 -1.99872156444535 A:G G A 10 0.533290718814845 0.471398009330776 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 22 30 52 10.2676041860734 15.9987215644454 -5.73111737837194 A:C C A 10 0.533290718814845 0.126490006586982 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 18 9 27 8.40076706133279 4.79961646933361 3.60115059199918 A:G A G 10 0.533290718814845 0.181385538451904 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 22 18 40 10.2676041860734 9.59923293866721 0.668371247406199 A:G G A 10 0.533290718814845 0.875165857272662 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 T:C C T 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 496 543 1039 231.487803467837 289.576860316461 -58.089056848624 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000344836278932208 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 112 109 221 52.2714394927374 58.1286883508181 -5.85724885808075 T:C C T 10 0.533290718814845 0.458466870209617 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 24 8 32 11.2010227484437 4.26632575051876 6.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0197782152819041 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 23 13 36 10.7343134672586 6.93277934459299 3.80153412266558 T:C T C 10 0.533290718814845 0.243146533507699 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 19 6 25 8.86747634251794 3.19974431288907 5.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0266209700113244 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24761467 G/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24761390_24761536:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24761390_24761536:DHRS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24771256 T/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:G G T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 15 13 28 7.00063921777732 6.93277934459299 0.0678598731843394 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 21 33 54 9.80089490488825 17.5985937208899 -7.79769881600163 T:C C T 10 0.533290718814845 0.040118341780843 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 30 18 48 14.0012784355546 9.59923293866721 4.40204549688744 T:C T C 10 0.533290718814845 0.247155420314597 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 29 32 61 13.5345691543695 17.065303002075 -3.53073384770555 A:G A G 10 0.533290718814845 0.372275362781889 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 20 22 42 9.3341856237031 11.7323958139266 -2.39821019022349 T:C T C 10 0.533290718814845 0.536801824099167 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 68 59 127 31.7362311205905 31.4641524100759 0.272078710514684 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 23 9 32 10.7343134672586 4.79961646933361 5.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0496119441317134 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 20 30 50 9.3341856237031 15.9987215644454 -6.66453594074225 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0655575988155827 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 28 34 62 13.0678598731843 18.1318844397047 -5.06402456652039 C:G C G 10 0.533290718814845 0.205285644389778 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 36789729 T/G 1 15 4 19 7.00063921777732 2.13316287525938 4.86747634251794 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0358808714490029 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 36789775 A/T 1 12 1 13 5.60051137422186 0.533290718814845 5.06722065540701 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0042828160988869 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 36789795 G/A 0 12 0 12 5.60051137422186 0 5.60051137422186 G G 10 0.533290718814845 0.000635933769607646 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39517925 T/C 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 T:C T C 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39556185 G/C 1 23 21 44 10.7343134672586 11.1991050951117 -0.464791627853181 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39556133_39556212:SEC23A;ENSG00000100934:ENST00000457395:exon_39556133_39556212:SEC23A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39650824 C/T 1 267 227 494 124.611378076436 121.05699317097 3.55438490546656 A:T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.752529590759539 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39650924 A/G 1 205 171 376 95.6754026429568 91.1927129173385 4.48268972561827 A:G A G 10 0.533290718814845 0.679309083814933 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39685330 C/T 0 52 0 52 24.2688826216281 0 24.2688826216281 C C 10 0.533290718814845 6.71347768314426e-15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39777676 G/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 C:G G C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000382245:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39777653_39777791:CTAGE5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 T:G G T 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 T:C C T 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 52 33 85 24.2688826216281 17.5985937208899 6.67028890073817 T:C C T 10 0.533290718814845 0.158333488155821 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 C:G G C 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 17 18 35 7.93405778014763 9.59923293866721 -1.66517515851958 A:G A G 10 0.533290718814845 0.613800312425096 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 46 47 93 21.4686269345171 25.0646637842977 -3.59603684978059 T:G T G 10 0.533290718814845 0.468473187715263 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 54 53 107 25.2023011839984 28.2644080971868 -3.06210691318842 A:G G A 10 0.533290718814845 0.562434865586975 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 47 47 94 21.9353362157023 25.0646637842977 -3.12932756859543 A:C C A 10 0.533290718814845 0.536339227124499 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 46 54 100 21.4686269345171 28.7976988160016 -7.3290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.160452744168993 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55636259 G/A 1 21 22 43 9.80089490488825 11.7323958139266 -1.93150090903834 A:G G A 10 0.533290718814845 0.64711865874411 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 40 20 60 18.6683712474062 10.6658143762969 8.0025568711093 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0390648673390773 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 39 32 71 18.201661966221 17.065303002075 1.13635896414601 A:G A G 10 0.533290718814845 0.812986580216494 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 67 93 160 31.2695218394054 49.5960368497806 -18.3265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00421936484904516 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 6 16 22 2.80025568711093 8.53265150103752 -5.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0176076148488402 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 25 14 39 11.6677320296289 7.46607006340783 4.20166196622104 A:T T A 10 0.533290718814845 0.200847962376411 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 14 21 35 6.53392993659217 11.1991050951117 -4.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.128481094431021 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 14 13 27 6.53392993659217 6.93277934459299 -0.398849408000816 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 57741263 A/T 1 30 32 62 14.0012784355546 17.065303002075 -3.06402456652039 A:T A T 10 0.533290718814845 0.447750791140305 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 17 23 40 7.93405778014763 12.2656865327414 -4.3316287525938 A:G A G 10 0.533290718814845 0.204853319079390 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 57876265 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57876097_57879466:NAA30;ENSG00000139977:ENST00000395257:exon_57876097_57879466:NAA30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60574539 A/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000126773:ENST00000391611:exon_60574304_60577875:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60574304_60575045:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60574357_60575045:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60581863 G/A 1 19 7 26 8.86747634251794 3.73303503170392 5.13444131081403 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0494794153073352 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60581935 C/T 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60582053 G/A 1 13 5 18 6.06722065540701 2.66645359407423 3.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.155041681425192 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 3 11 14 1.40012784355546 5.8661979069633 -4.46607006340783 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0282747514932721 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 38 16 54 17.7349526850359 8.53265150103752 9.20230118399837 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0135773032943026 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 61857969 A/G 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 64540823 A/G 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64540686_64540854:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64540686_64540854:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64540686_64540854:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64540686_64540854:SYNE2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 69 84 153 32.2029404017757 44.796420380447 -12.5934799786713 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0429275357277426 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 64988830 C/A 1 70 67 137 32.6696496829609 35.7304781605946 -3.06082847763376 A:C C A 10 0.533290718814845 0.608457833943947 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 7 14 21 3.26696496829608 7.46607006340783 -4.19910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0803254785566314 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 70235350 T/C 1 347 338 685 161.948120571249 180.252262959418 -18.3041423881688 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.168028382337343 ENSG00000100650:ENST00000394366:exon_70235321_70235391:SRSF5;ENSG00000100650:ENST00000451983:exon_70235321_70235391:SRSF5;ENSG00000100650:ENST00000344070:exon_70235330_70235391:SRSF5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 71109153 C/G 1 23 19 42 10.7343134672586 10.1325236574821 0.601789809776509 C:G C G 10 0.533290718814845 0.878402592194846 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 73572564 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 74203983 T/G 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 T:G T G 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 10 17 27 4.66709281185155 9.06594221985237 -4.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.121454868321471 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C C T 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 12 17 29 5.60051137422186 9.06594221985237 -3.46543084563051 A:T T A 10 0.533290718814845 0.263838780597277 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 29 19 48 13.5345691543695 10.1325236574821 3.40204549688744 A:G G A 10 0.533290718814845 0.385932828209766 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 40 27 67 18.6683712474062 14.3988494080008 4.26952183940538 T:C C T 10 0.533290718814845 0.328270944869951 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 19 14 33 8.86747634251794 7.46607006340783 1.40140627911011 T:C C T 10 0.533290718814845 0.728008888221575 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 75590846 A/T 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:T A T 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 22 28 50 10.2676041860734 14.9321401268157 -4.66453594074225 A:G G A 10 0.533290718814845 0.203469960167332 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77894724 G/A 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000151445:ENST00000445370:exon_77894713_77894817:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000448935:exon_77894713_77894817:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000327028:exon_77894713_77894817:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000343765:exon_77894713_77894817:VIPAR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 81 86 167 37.8034517759976 45.8630018180767 -8.05955004207912 T:C C T 10 0.533290718814845 0.215518225084511 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 104 122 226 48.5377652432561 65.0614676954111 -16.523702452155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0279260204113122 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 176 185 361 82.1408334885873 98.6587829807463 -16.517949492159 A:G G A 10 0.533290718814845 0.081986060647873 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 63 80 143 29.4026847146648 42.6632575051876 -13.2605727905228 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0291215457715425 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G A G 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 48 49 97 22.4020454968874 26.1312452219274 -3.72919972503997 T:C C T 10 0.533290718814845 0.47698608682833 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 16 25 41 7.46734849896248 13.3322679703711 -5.86491947140865 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0841261969907865 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 93299601 A/G 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93299467_93299692:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93299467_93299692:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93299467_93299692:GOLGA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 92 66 158 42.9372538690343 35.1971874417798 7.74006642725448 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.232047671894538 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 96001383 A/C 1 15 15 30 7.00063921777732 7.99936078222268 -0.998721564445351 A:C A C 10 0.533290718814845 0.718981035499475 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96001323_96001721:GLRX5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 96771959 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96771926_96772152:ATG2B;ENSG00000066739:ENST00000261834:exon_96771926_96772152:ATG2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 96781912 T/C 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96781721_96781920:ATG2B;ENSG00000066739:ENST00000261834:exon_96781721_96781920:ATG2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 40 46 86 18.6683712474062 24.5313730654829 -5.86300181807667 A:G A G 10 0.533290718814845 0.234482350114016 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 38 34 72 17.7349526850359 18.1318844397047 -0.396931754668842 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 A:C C A 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 100759277 C/T 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 29 25 54 13.5345691543695 13.3322679703711 0.202301183998369 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 18 19 37 8.40076706133279 10.1325236574821 -1.73175659614927 T:C T C 10 0.533290718814845 0.622756122287319 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 394 400 794 183.883456786951 213.316287525938 -29.432830738987 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.0390557707936322 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 24 17 41 11.2010227484437 9.06594221985237 2.13508052859135 C:G C G 10 0.533290718814845 0.53486061023421 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 21 23 44 9.80089490488825 12.2656865327414 -2.46479162785318 T:C C T 10 0.533290718814845 0.546096409302446 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 61 24 85 28.4692661522945 12.7989772515563 15.6702889007382 A:G G A 10 0.533290718814845 0.000670340564503075 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 44 51 95 20.5352083721468 27.1978266595571 -6.66261828741028 T:C T C 10 0.533290718814845 0.181969535272169 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 56 49 105 26.1357197463687 26.1312452219274 0.00447452444127094 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 T:G G T 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 19 25 44 8.86747634251794 13.3322679703711 -4.46479162785318 A:G G A 10 0.533290718814845 0.226369615898200 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 105936226 G/C 1 27 24 51 12.6011505919992 12.7989772515563 -0.197826659557096 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000426567:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000494981:exon_105936178_105936329:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481635:exon_105935804_105936329:MTA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 106321330 G/A 1 656 2575 3231 306.161288457462 1373.22360094823 -1067.06231249076 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 387 1145 1532 180.616491818655 610.617873042998 -430.001381224343 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 1.39738239717561e-110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 26 0 26 12.134441310814 0 12.134441310814 A A 10 0.533290718814845 1.55919237944174e-07 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 50 50 100 23.3354640592577 26.6645359407423 -3.3290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.54798899196092 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40247894 C/G 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 C:G C G 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40247821_40247969:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40247821_40247969:EIF2AK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 45 28 73 21.001917653332 14.9321401268157 6.06977752651631 A:C A C 10 0.533290718814845 0.161015264273277 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 32 23 55 14.934696997925 12.2656865327414 2.66901046518352 A:G A G 10 0.533290718814845 0.501594937749716 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 43 46 89 20.0684990909617 24.5313730654829 -4.46287397452121 A:G A G 10 0.533290718814845 0.39551197513191 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 47 53 100 21.9353362157023 28.2644080971868 -6.3290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.229147097064315 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 188 146 334 87.7413448628091 77.8604449469674 9.88089991584177 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297481651521832 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 17 6 23 7.93405778014763 3.19974431288907 4.73431346725856 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0591156409808618 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40758337 A/C 1 20 22 42 9.3341856237031 11.7323958139266 -2.39821019022349 A:C A C 10 0.533290718814845 0.536801824099167 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40758140_40760441:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40758140_40760426:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40758140_40760426:BAHD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 93 64 157 43.4039631502194 34.1306060041501 9.27335714606933 A:T T A 10 0.533290718814845 0.149994655433114 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40915190 A/G 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 40916237 A/G 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 13 14 27 6.06722065540701 7.46607006340783 -1.39884940800082 T:G T G 10 0.533290718814845 0.700557007745927 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 69 10 79 32.2029404017757 5.33290718814845 26.8700332136272 A:G A G 10 0.533290718814845 1.92102827783880e-10 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 69 9 78 32.2029404017757 4.79961646933361 27.4033239324421 A:C C A 10 0.533290718814845 5.54277266974206e-11 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41820200 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41820058_41820225:RPAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 42128723 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000243789:ENST00000397299:exon_42128673_42128749:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000335032:exon_42128623_42128749:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000408047:exon_42128673_42128749:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000431823:exon_42128673_42128749:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000405106:exon_42128673_42128749:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000478178:exon_42128673_42128749:JMJD7;ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42128673_42129138:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42128673_42128749:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42128673_42128749:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42128673_42128749:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000476036:exon_42128673_42128749:JMJD7-PLA2G4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 62 60 122 28.9359754334796 31.9974431288907 -3.06146769541109 A:G A G 10 0.533290718814845 0.587351729449389 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44119235 C/A 1 20 18 38 9.3341856237031 9.59923293866721 -0.265047314964111 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44119161_44119290:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44119178_44119316:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44119186_44119290:WDR76 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44849698 G/A 1 83 52 135 38.7368703383679 27.7311173783719 11.0057529599959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0582213196560066 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44849687_44849848:EIF3J HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44864894 C/T 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 T:C C T 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44864881_44865018:SPG11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 18 17 35 8.40076706133279 9.06594221985237 -0.665175158519576 A:G A G 10 0.533290718814845 0.866470286349281 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44943797 T/C 1 12 20 32 5.60051137422186 10.6658143762969 -5.06530300207504 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0783334510707375 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 44943798 G/A 1 12 20 32 5.60051137422186 10.6658143762969 -5.06530300207504 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0783334510707375 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:C C A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 49090175 G/A 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49090145_49090248:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49090145_49090248:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49090145_49090248:CEP152 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 49285001 G/C 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 C:G G C 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49280967_49285123:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49284327_49285123:SECISBP2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 49325289 A/C 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 A:C A C 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49325162_49325297:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49325162_49325297:SECISBP2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 51294832 G/A 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000081014:ENST00000261842:exon_51294699_51298097:AP4E1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 51791559 A/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000104093:ENST00000251076:exon_51790749_51792428:DMXL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 52901914 T/C 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 56387606 C/G 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 C:G C G 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 24 20 44 11.2010227484437 10.6658143762969 0.535208372146819 A:G A G 10 0.533290718814845 0.881448028362754 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 108 111 219 50.4046023679967 59.1952697884478 -8.79066742045106 A:G G A 10 0.533290718814845 0.249701613440284 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 T:G T G 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 T:C C T 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 19 21 40 8.86747634251794 11.1991050951117 -2.3316287525938 A:G A G 10 0.533290718814845 0.52709789487673 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 35 32 67 16.3348248414804 17.065303002075 -0.730478160594615 A:C C A 10 0.533290718814845 0.902829026314125 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 15 13 28 7.00063921777732 6.93277934459299 0.0678598731843394 T:C C T 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 17 15 32 7.93405778014763 7.99936078222268 -0.0653030020750407 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 72191073 T/C 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000066933:ENST00000356056:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000424560:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000446448:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000444904:exon_72189802_72191373:MYO9A;ENSG00000066933:ENST00000261864:exon_72189802_72191373:MYO9A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:G A G 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 25 27 52 11.6677320296289 14.3988494080008 -2.73111737837194 A:G A G 10 0.533290718814845 0.48843843590873 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 27 29 56 12.6011505919992 15.4654308456305 -2.86428025363132 C:G G C 10 0.533290718814845 0.503616760467259 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 75 72 147 35.0031960888866 38.3969317546688 -3.39373566578222 T:C T C 10 0.533290718814845 0.620089079462677 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 114 52 166 53.2048580551077 27.7311173783719 25.4737406767357 A:G G A 10 0.533290718814845 6.59508010665435e-05 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74882252 G/A 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000179361:ENST00000346246:exon_74882161_74882344:ARID3B;ENSG00000179361:ENST00000395077:exon_74882161_74882344:ARID3B;ENSG00000179361:ENST00000382537:exon_74882161_74882344:ARID3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 74920968 G/A 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000179335:ENST00000345005:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000483723:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000395066:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000454830:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000352989:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000348245:exon_74920945_74921024:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000330804:exon_74920945_74921024:CLK3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 15 1 16 7.00063921777732 0.533290718814845 6.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000739777050623032 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 1 15 27 42 7.00063921777732 14.3988494080008 -7.39821019022349 T:C C T 10 0.533290718814845 0.029255869836377 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 76222227 C/G 1 50 45 95 23.3354640592577 23.998082346668 -0.662618287410279 C:G C G 10 0.533290718814845 0.918329808999394 ENSG00000167196:ENST00000308275:exon_76222225_76222390:FBXO22;ENSG00000167196:ENST00000453211:exon_76222225_76223313:FBXO22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 78461349 A/G 1 55 54 109 25.6690104651835 28.7976988160016 -3.12868835081811 A:G A G 10 0.533290718814845 0.565662198618301 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78461264_78464291:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78461264_78462883:IDH3A;ENSG00000103740:ENST00000258873:exon_78459810_78463871:ACSBG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 78567853 G/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140403:ENST00000394855:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000343789:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000394852:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000446172:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000493321:exon_78567339_78568070:DNAJA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 T:C C T 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 43 53 96 20.0684990909617 28.2644080971868 -8.19590900622512 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101850906596269 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 80478500 C/T 1 24 16 40 11.2010227484437 8.53265150103752 2.6683712474062 T:C C T 10 0.533290718814845 0.431489020021948 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80478472_80479288:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80478472_80478682:FAH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 98 91 189 45.7375095561452 48.5294554121509 -2.79194585600571 A:C C A 10 0.533290718814845 0.71567289344426 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 14 6 20 6.53392993659217 3.19974431288907 3.3341856237031 T:G T G 10 0.533290718814845 0.178738983782814 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 85200520 G/T 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:G G T 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000197696:ENST00000360476:exon_85200407_85200579:NMB;ENSG00000197696:ENST00000394588:exon_85200407_85200579:NMB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 9 18 27 4.20038353066639 9.59923293866721 -5.39884940800082 T:C T C 10 0.533290718814845 0.051899062134577 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.171748761798993 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 A:G G A 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 C:G C G 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 17 8 25 7.93405778014763 4.26632575051876 3.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.163254530937577 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 11 17 28 5.1338020930367 9.06594221985237 -3.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.184006868411032 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 14 18 32 6.53392993659217 9.59923293866721 -3.06530300207504 A:G G A 10 0.533290718814845 0.292766499310502 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 89173292 G/A 1 24 12 36 11.2010227484437 6.39948862577814 4.80153412266558 A:G G A 10 0.533290718814845 0.132543587377525 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89173289_89175513:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89173289_89173455:AEN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 89173480 C/T 1 26 14 40 12.134441310814 7.46607006340783 4.6683712474062 T:C C T 10 0.533290718814845 0.155360906944256 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89173289_89175513:AEN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 90226947 C/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 90774691 C/T 1 114 102 216 53.2048580551077 54.3956533191142 -1.19079526400652 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.891633080696492 ENSG00000185043:ENST00000328649:exon_90774589_90774739:CIB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 C:G G C 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91459475 G/A 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91459353_91459486:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91459353_91459486:MAN2A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91486305 C/T 1 19 31 50 8.86747634251794 16.5320122832602 -7.66453594074225 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0333322586342941 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91486142_91486312:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91486142_91486312:UNC45A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91489919 A/G 1 17 19 36 7.93405778014763 10.1325236574821 -2.19846587733442 A:G A G 10 0.533290718814845 0.506348385532759 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91489844_91490144:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91489844_91490144:UNC45A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91503195 C/T 1 9 14 23 4.20038353066639 7.46607006340783 -3.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.210865779148278 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91503130_91503228:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91503130_91503228:RCCD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 64 58 122 29.8693939958499 30.930861691261 -1.06146769541109 T:C C T 10 0.533290718814845 0.856471691848577 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 94841691 G/A 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140563:ENST00000357742:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000451018:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000456504:exon_94841430_94841959:MCTP2;ENSG00000140563:ENST00000331706:exon_94841495_94841959:MCTP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 T:C C T 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101718190 C/T 1 20 21 41 9.3341856237031 11.1991050951117 -1.86491947140865 T:C C T 10 0.533290718814845 0.6393846277068 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101718950 T/C 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 T:C T C 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101775569 T/C 1 16 6 22 7.46734849896248 3.19974431288907 4.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0866299932985412 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101775287_101775782:CHSY1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 15 101827137 C/T 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000131876:ENST00000254193:exon_101827113_101827215:SNRPA1;ENSG00000131876:ENST00000394082:exon_101825931_101827215:SNRPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C T C 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 A:C C A 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 A:G A G 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 709001 C/A 1 2 9 11 0.93341856237031 4.79961646933361 -3.8661979069633 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0300816157817593 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_708896_709011:WDR90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G G A 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 716273 T/C 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:G G T 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 720707 C/A 1 23 34 57 10.7343134672586 18.1318844397047 -7.39757097244617 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0622455863871102 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720675_720773:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 721922 G/A 1 25 26 51 11.6677320296289 13.865558689186 -2.1978266595571 A:G G A 10 0.533290718814845 0.576089603408308 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_721860_722002:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 721965 G/A 1 25 24 49 11.6677320296289 12.7989772515563 -1.13124522192741 A:G G A 10 0.533290718814845 0.775955397216552 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_721860_722002:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 25 31 56 11.6677320296289 16.5320122832602 -4.86428025363132 A:G A G 10 0.533290718814845 0.227985169410488 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 722942 C/T 1 30 33 63 14.0012784355546 17.5985937208899 -3.59731528533524 T:C C T 10 0.533290718814845 0.379059022903526 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722928_723130:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 39 14 53 18.201661966221 7.46607006340783 10.7355919028132 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.0034797638985161 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 732049 T/C 1 89 95 184 41.5371260254788 50.6626182874103 -9.12549226193148 T:C T C 10 0.533290718814845 0.184008419110209 ENSG00000103266:ENST00000219548:exon_732020_732076:STUB1;ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 735407 G/C 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735257_735597:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735257_735597:WDR24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 737269 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_736744_737416:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000456065:exon_736744_737416:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_736744_737416:WDR24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 739359 G/C 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 C:G G C 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_739160_740400:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000456065:exon_739160_740400:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_739142_739642:WDR24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 12 18 30 5.60051137422186 9.59923293866721 -3.99872156444535 A:G A G 10 0.533290718814845 0.148463307294005 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 845742 G/A 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 A:G G A 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 246 222 468 114.810483171548 118.390539576896 -3.58005640534746 A:G A G 10 0.533290718814845 0.745911560527774 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 218 205 423 101.742623298364 109.324597357043 -7.58197405867945 A:G A G 10 0.533290718814845 0.465174259883425 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G A G 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 6 15 21 2.80025568711093 7.99936078222268 -5.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.027859306926896 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 T:C T C 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1608082 A/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1607936_1608135:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1607936_1608135:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1607936_1608135:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1607936_1608135:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000439987:exon_1607936_1608135:IFT140 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 11 17 28 5.1338020930367 9.06594221985237 -3.93214012681566 A:G A G 10 0.533290718814845 0.184006868411032 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 T:C T C 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 20 23 43 9.3341856237031 12.2656865327414 -2.93150090903834 A:C C A 10 0.533290718814845 0.445170226537947 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 36 48 84 16.8015341226656 25.5979545031126 -8.79642038044698 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0626533251967412 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 22 16 38 10.2676041860734 8.53265150103752 1.73495268503589 C:G C G 10 0.533290718814845 0.627896100180899 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 25 25 50 11.6677320296289 13.3322679703711 -1.66453594074225 A:G A G 10 0.533290718814845 0.672246947389556 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2125834 T/C 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2125800_2125893:TSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 2 10 12 0.93341856237031 5.33290718814845 -4.39948862577814 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0168603606659464 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 25 30 55 11.6677320296289 15.9987215644454 -4.33098953481648 C:G C G 10 0.533290718814845 0.279907385976551 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2578131 C/T 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000293971:exon_2578061_2578149:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000429721:exon_2577991_2578149:AMDHD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 139 125 264 64.8725900847365 66.6613398518556 -1.78874976711909 A:G A G 10 0.533290718814845 0.853270168737079 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 159 161 320 74.2067757084396 85.85980572919 -11.6530300207504 A:C:G C A 10 0.533290718814845 0.197768572028026 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 173 151 324 80.7407056450318 80.5268985410416 0.213807103990206 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 219 167 386 102.209332579549 89.0595500420791 13.1497825374698 A:C A C 10 0.533290718814845 0.184966626002584 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 19 30 49 8.86747634251794 15.9987215644454 -7.13124522192741 T:C C T 10 0.533290718814845 0.045182712700262 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 C:G G C 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 16 25 41 7.46734849896248 13.3322679703711 -5.86491947140865 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0841261969907865 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 45 42 87 21.001917653332 22.3982101902235 -1.39629253689152 C:G G C 10 0.533290718814845 0.830017800506069 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 3781313 G/A 1 19 5 24 8.86747634251794 2.66645359407423 6.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0129063528980085 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3781193_3781474:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3781193_3781474:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3781193_3781474:CREBBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4415540 G/A 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4415492_4415546:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4415492_4415546:CORO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 30 21 51 14.0012784355546 11.1991050951117 2.8021733404429 T:C T C 10 0.533290718814845 0.484110672917486 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 24 18 42 11.2010227484437 9.59923293866721 1.60178980977651 A:T A T 10 0.533290718814845 0.646097759557107 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 A:T T A 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 11 4 15 5.1338020930367 2.13316287525938 3.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.194148407751893 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 C:G G C 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 C:G G C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 106 109 215 49.4711838056264 58.1286883508181 -8.65750454519168 A:G A G 10 0.533290718814845 0.245644117673082 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 C:G C G 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11035888 C/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000182108:ENST00000331808:exon_11035426_11036317:DEXI;ENSG00000182108:ENST00000469379:exon_11035426_11035988:DEXI HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11056378 C/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11056312_11056445:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11056312_11056445:CLEC16A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 4 25 29 1.86683712474062 13.3322679703711 -11.4654308456305 A:C A C 10 0.533290718814845 1.58190358268350e-05 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 37 25 62 17.2682434038507 13.3322679703711 3.93597543347961 T:C C T 10 0.533290718814845 0.37319672804659 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 54 68 122 25.2023011839984 36.2637688794095 -11.0614676954111 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0461871259358193 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11781802 G/A 1 25 26 51 11.6677320296289 13.865558689186 -2.1978266595571 A:G G A 10 0.533290718814845 0.576089603408308 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11781713_11781822:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11781713_11781822:TXNDC11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 79 53 132 36.8700332136272 28.2644080971868 8.60562511644046 A:G G A 10 0.533290718814845 0.138761682845538 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 12121276 G/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000140660:ENST00000268271:exon_12121177_12121301:RUNDC2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 5 19 24 2.33354640592577 10.1325236574821 -7.79897725155628 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00163501548165888 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 7 28 35 3.26696496829608 14.9321401268157 -11.6651751585196 C:G C G 10 0.533290718814845 6.58656011197488e-05 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C T C 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 17228363 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 18847416 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18847255_18847534:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18847255_18847534:SMG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 18853744 T/C 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18853530_18853776:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18853530_18853776:SMG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C C T 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G A G 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 22285053 A/T 1 14 5 19 6.53392993659217 2.66645359407423 3.86747634251794 A:T A T 10 0.533290718814845 0.105735293726852 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22284947_22285071:EEF2K HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 22385604 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000140743:ENST00000268383:exon_22385552_22385938:CDR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 29 34 63 13.5345691543695 18.1318844397047 -4.59731528533524 C:G C G 10 0.533290718814845 0.257821449292104 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 17 20 37 7.93405778014763 10.6658143762969 -2.73175659614927 A:C A C 10 0.533290718814845 0.411870513912263 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 62 49 111 28.9359754334796 26.1312452219274 2.8047302115522 C:G G C 10 0.533290718814845 0.634842501369594 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 40 23 63 18.6683712474062 12.2656865327414 6.40268471466476 T:C C T 10 0.533290718814845 0.129184989990091 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 14 9 23 6.53392993659217 4.79961646933361 1.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.534727298566928 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 35 36 71 16.3348248414804 19.1984658773344 -2.86364103585399 T:C C T 10 0.533290718814845 0.552466561895883 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 87 65 152 40.6037074631085 34.6638967229649 5.93981074014356 T:C T C 10 0.533290718814845 0.371308785385686 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 52 27 79 24.2688826216281 14.3988494080008 9.87003321362724 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0315507917576277 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27373915 G/T 1 45 15 60 21.001917653332 7.99936078222268 13.0025568711093 T:G G T 10 0.533290718814845 0.000682379013327158 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27373964 T/C 1 22 14 36 10.2676041860734 7.46607006340783 2.80153412266558 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405273616224882 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 30 14 44 14.0012784355546 7.46607006340783 6.53520837214682 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0504355686039739 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 33 21 54 15.4014062791101 11.1991050951117 4.20230118399837 T:C T C 10 0.533290718814845 0.276899286086025 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 25 25 50 11.6677320296289 13.3322679703711 -1.66453594074225 T:C T C 10 0.533290718814845 0.672246947389556 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 27459961 C/T 1 34 34 68 15.8681155602953 18.1318844397047 -2.26376887940946 T:C C T 10 0.533290718814845 0.627609610506685 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27459855_27461879:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27459855_27462115:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27459855_27462115:IL21R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 10 20 30 4.66709281185155 10.6658143762969 -5.99872156444535 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0422865262663113 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 22 15 37 10.2676041860734 7.99936078222268 2.26824340385073 A:G G A 10 0.533290718814845 0.511957080843155 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C T C 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28916361 C/T 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28915743_28916365:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28915743_28916365:RABEP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 60 43 103 28.0025568711093 22.9315009090383 5.07105596207096 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.325312891936268 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C C T 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 29675914 G/A 1 85 100 185 39.6702889007382 53.3290718814845 -13.6587829807463 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0466463627295671 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 583 546 1129 272.091510930945 291.176732472905 -19.08522154196 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.257148216201154 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 13 22 35 6.06722065540701 11.7323958139266 -5.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0625800284567675 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 82 73 155 38.2701610571827 38.9302224734837 -0.660061416300984 A:G G A 10 0.533290718814845 0.935950632580529 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30408961 C/T 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 25 25 50 11.6677320296289 13.3322679703711 -1.66453594074225 A:G A G 10 0.533290718814845 0.672246947389556 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30665561 A/G 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665551_30665660:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665551_30665660:PRR14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 30900235 G/A 1 47 43 90 21.9353362157023 22.9315009090383 -0.996164693336048 A:G G A 10 0.533290718814845 0.833616121077063 ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30900181_30900266:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30900181_30900266:BCL7C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G G A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 6 12 18 2.80025568711093 6.39948862577814 -3.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.101505920919438 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 17 18 35 7.93405778014763 9.59923293866721 -1.66517515851958 A:G G A 10 0.533290718814845 0.613800312425096 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 369 318 687 172.215724757322 169.586448583121 2.62927617420146 A:C:G C A 10 0.533290718814845 0.848468242280708 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 C:G C G 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 47536987 C/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47536902_47537001:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47536902_47537001:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000323584:exon_47536902_47537001:PHKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 50744602 G/C 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 C:G G C 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000527070:exon_50744469_50744702:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000532206:exon_50744469_50744702:NOD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53283966 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53283783_53283978:CHD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53326860 G/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53326745_53326964:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53326745_53326964:CHD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 17 16 33 7.93405778014763 8.53265150103752 -0.598593720889886 A:G A G 10 0.533290718814845 0.862945254696392 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53503934 G/A 1 14 9 23 6.53392993659217 4.79961646933361 1.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.534727298566928 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53503943 C/G 1 14 7 21 6.53392993659217 3.73303503170392 2.80089490488825 C:G C G 10 0.533290718814845 0.276079092338444 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 21 25 46 9.80089490488825 13.3322679703711 -3.53137306548287 T:C T C 10 0.533290718814845 0.305088219507340 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 56396430 C/A 1 49 41 90 22.8687547780726 21.8649194714086 1.00383530666394 A:C C A 10 0.533290718814845 0.915943290459653 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 45 49 94 21.001917653332 26.1312452219274 -5.12932756859544 T:C C T 10 0.533290718814845 0.302492361726112 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 56485554 C/G 1 36 14 50 16.8015341226656 7.46607006340783 9.33546405925775 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0100449661428999 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56485407_56485678:OGFOD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 18 11 29 8.40076706133279 5.8661979069633 2.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.360200680270037 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 381 234 615 177.816236131544 124.790028202674 53.0262079288703 A:T:C:G G A 10 0.533290718814845 1.76458832349643e-05 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 13 7 20 6.06722065540701 3.73303503170392 2.3341856237031 C:G C G 10 0.533290718814845 0.372254450678439 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 53 54 107 24.7355919028132 28.7976988160016 -4.06210691318842 A:G G A 10 0.533290718814845 0.439861500161140 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 68 80 148 31.7362311205905 42.6632575051876 -10.9270263845971 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0832953175176048 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 31 29 60 14.4679877167398 15.4654308456305 -0.997443128890701 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.797523718405806 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 56 35 91 26.1357197463687 18.6651751585196 7.4705445878491 A:C A C 10 0.533290718814845 0.140910348679253 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 36 30 66 16.8015341226656 15.9987215644454 0.802812558220229 A:G G A 10 0.533290718814845 0.90209604705068 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 34 16 50 15.8681155602953 8.53265150103752 7.33546405925775 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0463282837161376 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 35 17 52 16.3348248414804 9.06594221985237 7.26888262162806 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0510674567737016 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 4 13 17 1.86683712474062 6.93277934459299 -5.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0152018826327138 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 68893953 T/C 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68893787_68894427:TMCO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 69008037 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_69007931_69008071:TMCO7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 69402356 G/A 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69402279_69402385:TERF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 39 40 79 18.201661966221 21.3316287525938 -3.12996678637275 A:T A T 10 0.533290718814845 0.500199198391341 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 78 64 142 36.4033239324421 34.1306060041501 2.27271792829201 T:C C T 10 0.533290718814845 0.736926033166124 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 19 19 38 8.86747634251794 10.1325236574821 -1.26504731496411 T:C T C 10 0.533290718814845 0.746072301092407 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 71319539 C/T 1 25 11 36 11.6677320296289 5.8661979069633 5.80153412266558 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0652022155611181 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 21 12 33 9.80089490488825 6.39948862577814 3.40140627911011 A:G G A 10 0.533290718814845 0.295526095262369 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 72057421 C/T 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72057373_72057532:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72057373_72057532:DHODH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 72130125 T/C 1 26 21 47 12.134441310814 11.1991050951117 0.935336215702284 T:C T C 10 0.533290718814845 0.884021485517194 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 31 27 58 14.4679877167398 14.3988494080008 0.0691383087389887 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 T:C T C 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 12 18 30 5.60051137422186 9.59923293866721 -3.99872156444535 A:G G A 10 0.533290718814845 0.148463307294005 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 86 67 153 40.1369981819233 35.7304781605946 4.40652002132872 A:G A G 10 0.533290718814845 0.517067818429624 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 75338997 T/A 1 42 32 74 19.6017898097765 17.065303002075 2.53648680770147 A:T T A 10 0.533290718814845 0.563066008415684 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75338922_75339080:CFDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 77228389 A/T 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:T A T 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 70 89 159 32.6696496829609 47.4628739745212 -14.7932242915604 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0209615816304910 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 21 14 35 9.80089490488825 7.46607006340783 2.33482484148042 C:G C G 10 0.533290718814845 0.4994999989639 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 29 15 44 13.5345691543695 7.99936078222268 5.53520837214682 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0987436073874953 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 1 14 1 15 6.53392993659217 0.533290718814845 6.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00133069076933885 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 1 14 1 15 6.53392993659217 0.533290718814845 6.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00133069076933885 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 14 0 14 6.53392993659217 0 6.53392993659217 G G 10 0.533290718814845 0.000173748253997234 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 14 6 20 6.53392993659217 3.19974431288907 3.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.178738983782814 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 17 15 32 7.93405778014763 7.99936078222268 -0.0653030020750407 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84158248 G/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000103160:ENST00000219439:exon_84155746_84158333:HSDL1;ENSG00000103160:ENST00000434463:exon_84155888_84158333:HSDL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 8 13 21 3.73367424948124 6.93277934459299 -3.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.191682202539152 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 21 20 41 9.80089490488825 10.6658143762969 -0.864919471408646 T:C C T 10 0.533290718814845 0.875932341908383 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 A:C A C 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 85711769 G/A 1 54 77 131 25.2023011839984 41.0633853487431 -15.8610841647447 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00644413663240155 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 85948098 G/A 1 77 75 152 35.9366146512569 39.9968039111134 -4.06018925985644 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516544800847708 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85948079_85948126:IRF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 85954801 G/A 1 111 98 209 51.8047302115522 52.2624904438548 -0.457760232302611 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85954712_85956197:IRF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88052077 C/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 C:G C G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88665036 G/A 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.595989802726756 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88665028_88665120:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88665028_88665120:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88665028_88665120:ZC3H18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88709828 A/G 1 99 110 209 46.2042188373303 58.6619790696329 -12.4577602323026 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0959179162850453 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88709698_88709979:CYBA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 198 230 428 92.4084376746607 122.656865327414 -30.2484276527537 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00361906826943882 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88713501 A/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:G A G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88763958 G/A 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88762903_88764041:RNF166 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 A:G A G 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 15 17 32 7.00063921777732 9.06594221985237 -2.06530300207504 A:G A G 10 0.533290718814845 0.483602569142873 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 C:G G C 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 25 18 43 11.6677320296289 9.59923293866721 2.06849909096166 A:G A G 10 0.533290718814845 0.545423020270265 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 32 33 65 14.934696997925 17.5985937208899 -2.66389672296493 C:G C G 10 0.533290718814845 0.535737941450592 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 17 2 19 7.93405778014763 1.06658143762969 6.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00183590168436833 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 17 2 19 7.93405778014763 1.06658143762969 6.86747634251794 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00183590168436833 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 18 0 18 8.40076706133279 0 8.40076706133279 G G 10 0.533290718814845 1.3275395608921e-05 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 18 2 20 8.40076706133279 1.06658143762969 7.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00104202433836910 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 17 1 18 7.93405778014763 0.533290718814845 7.40076706133279 A:C C A 10 0.533290718814845 0.000227713040482442 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89180765 A/T 1 25 12 37 11.6677320296289 6.39948862577814 5.26824340385073 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0991230100602562 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89293271 A/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 T:G G T 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89347746 A/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 13 19 32 6.06722065540701 10.1325236574821 -4.06530300207504 C:G G C 10 0.533290718814845 0.159963903652607 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 30 30 60 14.0012784355546 15.9987215644454 -1.9974431288907 A:G G A 10 0.533290718814845 0.607804278597764 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 13 20 33 6.06722065540701 10.6658143762969 -4.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.118504469933107 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 30 14 44 14.0012784355546 7.46607006340783 6.53520837214682 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0504355686039739 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89764549 G/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89790048 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89805672 C/T 1 23 18 41 10.7343134672586 9.59923293866721 1.13508052859135 T:C C T 10 0.533290718814845 0.75649677321812 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89805541_89805697:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89805541_89805697:FANCA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 89940232 A/C 1 64 53 117 29.8693939958499 28.2644080971868 1.60498589866313 A:T:C A C 10 0.533290718814845 0.781841947453267 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89939970_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000310554:exon_89940019_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89940019_89940267:TCF25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 70 53 123 32.6696496829609 28.2644080971868 4.40524158577406 A:G G A 10 0.533290718814845 0.469966559416935 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 27 25 52 12.6011505919992 13.3322679703711 -0.731117378371941 T:C C T 10 0.533290718814845 0.889869118980636 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 46 45 91 21.4686269345171 23.998082346668 -2.5294554121509 T:C C T 10 0.533290718814845 0.601158988072874 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 26 30 56 12.134441310814 15.9987215644454 -3.86428025363132 C:G G C 10 0.533290718814845 0.348808939753838 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 21 21 42 9.80089490488825 11.1991050951117 -1.39821019022349 C:G G C 10 0.533290718814845 0.757581136379853 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 30 20 50 14.0012784355546 10.6658143762969 3.33546405925775 T:C C T 10 0.533290718814845 0.396001582442071 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 27 32 59 12.6011505919992 17.065303002075 -4.46415241007586 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.296507662954318 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 26 20 46 12.134441310814 10.6658143762969 1.46862693451713 T:C T C 10 0.533290718814845 0.768000285226431 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 39 37 76 18.201661966221 19.7317565961493 -1.53009462992822 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731727257285485 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 1538237 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 C:G G C 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 13 17 30 6.06722065540701 9.06594221985237 -2.99872156444535 T:C T C 10 0.533290718814845 0.279372965933084 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 T:C:G T G 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 11 29 40 5.1338020930367 15.4654308456305 -10.3316287525938 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00126425805398249 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2234238 T/C 0 0 11 11 0 5.8661979069633 -5.8661979069633 C T C 10 0.533290718814845 0.000228828868409896 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 67 50 117 31.2695218394054 26.6645359407423 4.60498589866313 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405859153249144 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 42 40 82 19.6017898097765 21.3316287525938 -1.72983894281729 T:C T C 10 0.533290718814845 0.740436562184195 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2605027 G/A 0 54 0 54 25.2023011839984 0 25.2023011839984 G G 10 0.533290718814845 1.88755078214549e-15 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2604907_2605031:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2604907_2605031:KIAA0664 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 3926110 C/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 C:G C G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3926003_3926122:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3925940_3926122:ZZEF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 3947644 T/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 19 14 33 8.86747634251794 7.46607006340783 1.40140627911011 A:G G A 10 0.533290718814845 0.728008888221575 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 20 10 30 9.3341856237031 5.33290718814845 4.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.199457099473175 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 18 9 27 8.40076706133279 4.79961646933361 3.60115059199918 T:C C T 10 0.533290718814845 0.181385538451904 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 57 41 98 26.6024290275538 21.8649194714086 4.73750955614518 T:C T C 10 0.533290718814845 0.363085008115157 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 38 23 61 17.7349526850359 12.2656865327414 5.46926615229445 T:C C T 10 0.533290718814845 0.199045613864131 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:C T C 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6515387 A/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G A G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6515454 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 13 4 17 6.06722065540701 2.13316287525938 3.93405778014763 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0859735969639128 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 23 27 50 10.7343134672586 14.3988494080008 -3.66453594074225 T:C C T 10 0.533290718814845 0.323032363912043 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 22 11 33 10.2676041860734 5.8661979069633 4.40140627911011 A:G G A 10 0.533290718814845 0.162104094485981 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 25 12 37 11.6677320296289 6.39948862577814 5.26824340385073 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0991230100602562 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 80 65 145 37.3367424948124 34.6638967229649 2.67284577184747 A:G G A 10 0.533290718814845 0.677982690520295 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7155861 G/A 1 39 25 64 18.201661966221 13.3322679703711 4.86939399584992 A:T:C:G G A 10 0.533290718814845 0.25969666741972 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7155551_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7155745_7155915:C17orf81 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 3 13 16 1.40012784355546 6.93277934459299 -5.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0097004330509794 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 24 27 51 11.2010227484437 14.3988494080008 -3.1978266595571 A:G A G 10 0.533290718814845 0.40140467349042 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 24 20 44 11.2010227484437 10.6658143762969 0.535208372146819 T:C C T 10 0.533290718814845 0.881448028362754 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7297121 G/A 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G G A 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7296920_7297155:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7296920_7297155:PLSCR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7344810 G/C 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 C:G G C 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000161958:ENST00000293829:exon_7344790_7344900:FGF11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 C:G C G 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7479892 C/T 1 324 281 605 151.21380710399 149.854691986971 1.35911511701875 T:C C T 10 0.533290718814845 0.935065618916187 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7479842_7480010:EIF4A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 C:G G C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 C:G G C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 51 32 83 23.8021733404429 17.065303002075 6.73687033836786 T:C C T 10 0.533290718814845 0.152995376739078 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 60 43 103 28.0025568711093 22.9315009090383 5.07105596207096 C:G G C 10 0.533290718814845 0.325312891936268 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 C:G C G 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 11 21 32 5.1338020930367 11.1991050951117 -6.06530300207504 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0341414277824285 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 A:C C A 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 C:G C G 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 14 15 29 6.53392993659217 7.99936078222268 -1.46543084563051 T:G T G 10 0.533290718814845 0.71044292416145 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8064779 C/G 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 C:G C G 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000481878:exon_8064637_8064842:VAMP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8076741 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:T T A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 78 66 144 36.4033239324421 35.1971874417798 1.20613649066232 A:G G A 10 0.533290718814845 0.867608902229113 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 18 19 37 8.40076706133279 10.1325236574821 -1.73175659614927 T:C T C 10 0.533290718814845 0.622756122287319 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 T:C C T 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 26 26 52 12.134441310814 13.865558689186 -1.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.677777010014177 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 25 33 58 11.6677320296289 17.5985937208899 -5.93086169126101 A:G G A 10 0.533290718814845 0.147135293923388 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 12898295 T/C 1 22 24 46 10.2676041860734 12.7989772515563 -2.53137306548287 T:C T C 10 0.533290718814845 0.46414126978946 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12898081_12898379:ELAC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 20 21 41 9.3341856237031 11.1991050951117 -1.86491947140865 T:C C T 10 0.533290718814845 0.6393846277068 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 19 18 37 8.86747634251794 9.59923293866721 -0.731756596149266 A:G G A 10 0.533290718814845 0.869799189277867 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 15532277 G/A 1 3 12 15 1.40012784355546 6.39948862577814 -4.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0166427658718777 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 46 35 81 21.4686269345171 18.6651751585196 2.80345177599756 A:G A G 10 0.533290718814845 0.57842125257586 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 34 39 73 15.8681155602953 20.798338033779 -4.93022247348368 A:C A C 10 0.533290718814845 0.291065306765627 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 14 16 30 6.53392993659217 8.53265150103752 -1.99872156444535 C:G C G 10 0.533290718814845 0.471398009330776 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 20 17 37 9.3341856237031 9.06594221985237 0.268243403850734 T:C T C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 T:C T C 10 0.533290718814845 0.68978925310364 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 C:G G C 10 0.533290718814845 0.68978925310364 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 112 102 214 52.2714394927374 54.3956533191142 -2.12421382637683 A:G G A 10 0.533290718814845 0.784358946136866 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 101 124 225 47.1376373997007 66.1280491330408 -18.9904117333401 A:T:C:G A C 10 0.533290718814845 0.0132541787493023 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 C:G C G 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 59 46 105 27.5358475899241 24.5313730654829 3.00447452444127 A:G G A 10 0.533290718814845 0.625029182581183 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 38 0 38 17.7349526850359 0 17.7349526850359 T T 10 0.533290718814845 5.39196971867295e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 35 0 35 16.3348248414804 0 16.3348248414804 T T 10 0.533290718814845 3.84793916215919e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 40 0 40 18.6683712474062 0 18.6683712474062 G G 10 0.533290718814845 1.46820708619105e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 40 0 40 18.6683712474062 0 18.6683712474062 C C 10 0.533290718814845 1.46820708619105e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 36 0 36 16.8015341226656 0 16.8015341226656 C C 10 0.533290718814845 1.99475423880399e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 12 0 12 5.60051137422186 0 5.60051137422186 C C 10 0.533290718814845 0.000635933769607646 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 39 0 39 18.201661966221 0 18.201661966221 C C 10 0.533290718814845 2.81116581407863e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 25 0 25 11.6677320296289 0 11.6677320296289 C C 10 0.533290718814845 1.54637091390073e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 C C 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 17 0 17 7.93405778014763 0 7.93405778014763 C C 10 0.533290718814845 2.51885981018944e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 21 0 21 9.80089490488825 0 9.80089490488825 G G 10 0.533290718814845 1.95825000455807e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 63 0 63 29.4026847146648 0 29.4026847146648 G G 10 0.533290718814845 9.9956123233653e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 105 67 172 49.0044745244413 35.7304781605946 13.2739963638467 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0467355314834784 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 26874796 T/C 1 70 62 132 32.6696496829609 33.0640245665204 -0.394374883559536 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26874695_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26874695_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000444148:exon_26874660_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000487844:exon_26874706_26874867:UNC119 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27044237 C/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000109113:ENST00000453384:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000447716:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000422028:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000301043:exon_27044231_27044443:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000419712:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395243:exon_27044231_27044766:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000415040:exon_27044231_27044443:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000450529:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395242:exon_27044231_27044869:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395245:exon_27044231_27044911:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000413526:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000436730:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000412625:exon_27044231_27044309:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000353676:exon_27044231_27044611:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000483554:exon_27044231_27044725:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000482688:exon_27044231_27044443:RAB34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27425172 G/A 1 14 19 33 6.53392993659217 10.1325236574821 -3.59859372088989 A:G G A 10 0.533290718814845 0.225573054676117 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27425123_27425242:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27425123_27425242:MYO18A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 29 0 29 13.5345691543695 0 13.5345691543695 T T 10 0.533290718814845 2.06982672383996e-08 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 27835138 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27834914_27835150:TAOK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 29112938 A/G 1 20 14 34 9.3341856237031 7.46607006340783 1.86811556029527 A:G A G 10 0.533290718814845 0.607330183376313 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 33 23 56 15.4014062791101 12.2656865327414 3.13571974636868 T:C T C 10 0.533290718814845 0.424417248953607 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G A G 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 33679440 C/T 1 1 9 10 0.466709281185155 4.79961646933361 -4.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00795334939373948 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33677331_33680158:SLFN11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 33690466 C/A 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 A:C C A 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33689758_33690849:SLFN11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 29 47 76 13.5345691543695 25.0646637842977 -11.5300946299282 A:G G A 10 0.533290718814845 0.01093706880593 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 33772689 T/C 1 19 10 29 8.86747634251794 5.33290718814845 3.53456915436949 T:C T C 10 0.533290718814845 0.198901950501575 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33772675_33772699:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33772675_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:C A C 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 0.316573818173034 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 A:G A G 10 0.533290718814845 0.250869943426239 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 359 328 687 167.548631945471 174.919355771269 -7.37072382579854 A:G A G 10 0.533290718814845 0.592469685876969 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 358 327 685 167.081922664285 174.386065052454 -7.30414238816883 A:T:G T A 10 0.533290718814845 0.591949166348424 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 39 32 71 18.201661966221 17.065303002075 1.13635896414601 A:G G A 10 0.533290718814845 0.812986580216494 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 111 96 207 51.8047302115522 51.1959090062251 0.608821205327082 A:T A T 10 0.533290718814845 0.94458326797507 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:G T G 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 A:G G A 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 23 17 40 10.7343134672586 9.06594221985237 1.6683712474062 A:G A G 10 0.533290718814845 0.637263024103858 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 10 19 29 4.66709281185155 10.1325236574821 -5.46543084563051 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0608475014656546 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 6 12 18 2.80025568711093 6.39948862577814 -3.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101505920919438 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 35 36 71 16.3348248414804 19.1984658773344 -2.86364103585399 A:G G A 10 0.533290718814845 0.552466561895883 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40282473 C/T 1 50 48 98 23.3354640592577 25.5979545031126 -2.26249044385481 T:C C T 10 0.533290718814845 0.68597466098618 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40282355_40282608:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40282355_40282608:RAB5C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 15 13 28 7.00063921777732 6.93277934459299 0.0678598731843394 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 41 40 81 19.1350805285914 21.3316287525938 -2.19654822400245 A:G A G 10 0.533290718814845 0.656858310178847 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40724977 G/A 1 39 23 62 18.201661966221 12.2656865327414 5.93597543347961 A:G G A 10 0.533290718814845 0.161010239975321 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40724329_40725042:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40724329_40725042:PSMC3IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 A:C A C 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40849573 G/A 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 A:G G A 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 80 87 167 37.3367424948124 46.3962925368915 -9.05955004207912 T:C T C 10 0.533290718814845 0.163447598427293 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:C A C 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 8 15 23 3.73367424948124 7.99936078222268 -4.26568653274144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0939399943193157 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 T:C T C 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G G A 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 C:G C G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:C A C 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 104 116 220 48.5377652432561 61.861723382522 -13.3239581392659 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.0787945139401155 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 42427630 T/C 1 105 68 173 49.0044745244413 36.2637688794095 12.7407056450318 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0566533295200625 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427596_42427708:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42427596_42427708:GRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 33 29 62 15.4014062791101 15.4654308456305 -0.0640245665203913 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 21 8 29 9.80089490488825 4.26632575051876 5.53456915436949 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0416518111889447 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 45 52 97 21.001917653332 27.7311173783719 -6.72919972503997 T:C C T 10 0.533290718814845 0.186185652145883 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 29 25 54 13.5345691543695 13.3322679703711 0.202301183998369 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 50 36 86 23.3354640592577 19.1984658773344 4.13699818192333 T:C T C 10 0.533290718814845 0.389046772991038 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 32 33 65 14.934696997925 17.5985937208899 -2.66389672296493 T:C C T 10 0.533290718814845 0.535737941450592 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 C:G G C 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 17 22 39 7.93405778014763 11.7323958139266 -3.79833803377896 A:G G A 10 0.533290718814845 0.261824116322687 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 45994116 G/T 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 T:G G T 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 46136133 G/C 1 105 71 176 49.0044745244413 37.863641035854 11.1408334885873 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0967296584537172 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 122 100 222 56.9385323045889 53.3290718814845 3.6094604231044 T:C:G G C 10 0.533290718814845 0.638380294827318 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 47284202 G/C 1 35 42 77 16.3348248414804 22.3982101902235 -6.06338534874306 C:G G C 10 0.533290718814845 0.172104123256387 ENSG00000167083:ENST00000503070:exon_47284139_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000511277:exon_47283591_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000300406:exon_47283751_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000515635:exon_47283941_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000507680:exon_47284007_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000511673:exon_47284119_47284244:GNGT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 36 19 55 16.8015341226656 10.1325236574821 6.66901046518352 A:G G A 10 0.533290718814845 0.079188206217479 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 39 45 84 18.201661966221 23.998082346668 -5.79642038044698 T:C C T 10 0.533290718814845 0.229202259252110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 48551348 G/A 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506085:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000511147:exon_48551255_48551365:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000507792:exon_48551186_48551628:ACSF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 48628961 A/C 1 14 9 23 6.53392993659217 4.79961646933361 1.73431346725856 A:C A C 10 0.533290718814845 0.534727298566928 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628872_48629030:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628872_48629040:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628872_48629300:SPATA20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 23 24 47 10.7343134672586 12.7989772515563 -2.06466378429772 A:C A C 10 0.533290718814845 0.56190185725608 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 20 15 35 9.3341856237031 7.99936078222268 1.33482484148042 A:G G A 10 0.533290718814845 0.735863720798038 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 55062822 C/T 1 24 31 55 11.2010227484437 16.5320122832602 -5.33098953481647 T:C C T 10 0.533290718814845 0.176403399849368 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55062739_55062828:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55062739_55062828:SCPEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 56283726 C/T 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000011143:ENST00000393119:exon_56283644_56283741:MKS1;ENSG00000011143:ENST00000313863:exon_56283644_56283741:MKS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 58378976 A/G 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000170832:ENST00000300896:exon_58378960_58379065:USP32;ENSG00000170832:ENST00000393003:exon_58378960_58379065:USP32 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 2 11 13 0.93341856237031 5.8661979069633 -4.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00935895463927488 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 60059880 G/A 1 19 6 25 8.86747634251794 3.19974431288907 5.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0266209700113244 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60059559_60060475:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60059559_60060475:MED13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61766211 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000198909:ENST00000361357:exon_61766149_61766241:MAP3K3;ENSG00000198909:ENST00000361733:exon_61766149_61766241:MAP3K3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 19 7 26 8.86747634251794 3.73303503170392 5.13444131081403 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0494794153073352 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 47 66 113 21.9353362157023 35.1971874417798 -13.2618512260775 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0139983109496651 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 C:G G C 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 147 139 286 68.6062643342178 74.1274099152635 -5.52114558104567 T:C C T 10 0.533290718814845 0.515138207672627 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 163 158 321 76.0736128331803 84.2599335727455 -8.18632073956525 T:C C T 10 0.533290718814845 0.37104987218801 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 124 83 207 57.8719508669592 44.2631296616321 13.6088212053271 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0601033818999002 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 62500215 A/T 1 414 386 800 193.217642410654 205.85021746253 -12.632575051876 A:T:C A T 10 0.533290718814845 0.375849423836281 ENSG00000108654:ENST00000225792:exon_62500101_62500234:DDX5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 34 27 61 15.8681155602953 14.3988494080008 1.46926615229445 T:C T C 10 0.533290718814845 0.797734704510623 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 A:G A G 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 142 126 268 66.272717928292 67.1946305706705 -0.921912642378459 A:G A G 10 0.533290718814845 0.951199191812224 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 94 96 190 43.8706724314046 51.1959090062251 -7.32523657482055 A:T T A 10 0.533290718814845 0.308822077337529 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 67266765 G/C 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 C:G G C 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67266754_67266891:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67266754_67266891:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67266754_67266891:ABCA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 25 10 35 11.6677320296289 5.33290718814845 6.33482484148042 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0407658080747195 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 25 21 46 11.6677320296289 11.1991050951117 0.468626934517129 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:G G T 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 44 47 91 20.5352083721468 25.0646637842977 -4.5294554121509 T:C C T 10 0.533290718814845 0.346539542141122 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 60 69 129 28.0025568711093 36.7970595982243 -8.79450272711501 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.133505804853080 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G A G 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 C:G G C 10 0.533290718814845 0.283767288656670 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 73235099 C/T 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73234995_73235164:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73234995_73235164:GGA3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 22 38 60 10.2676041860734 20.2650473149641 -9.9974431288907 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0132793141375339 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 35 29 64 16.3348248414804 15.4654308456305 0.86939399584992 C:G G C 10 0.533290718814845 0.900513944917263 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74152366 A/G 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74396537 T/C 1 2 11 13 0.93341856237031 5.8661979069633 -4.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00935895463927488 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74396522_74396631:UBE2O HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 238 191 429 111.076808922067 101.858527293635 9.21828162843148 A:G G A 10 0.533290718814845 0.383994555637787 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76118767 G/A 1 22 35 57 10.2676041860734 18.6651751585196 -8.39757097244616 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0328316284895773 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76118686_76118830:TMC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 49 57 106 22.8687547780726 30.3975709724462 -7.52881619437358 A:G G A 10 0.533290718814845 0.145502137450781 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 1 43 46 89 20.0684990909617 24.5313730654829 -4.46287397452121 T:C C T 10 0.533290718814845 0.39551197513191 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 56 46 102 26.1357197463687 24.5313730654829 1.60434668088581 T:C C T 10 0.533290718814845 0.766910188171266 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 18 25 43 8.40076706133279 13.3322679703711 -4.93150090903834 A:G A G 10 0.533290718814845 0.168282961116614 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76795805 G/C 1 22 23 45 10.2676041860734 12.2656865327414 -1.99808234666803 C:G G C 10 0.533290718814845 0.554492200028458 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76795749_76795850:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76795749_76795850:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76799835 C/A 1 18 6 24 8.40076706133279 3.19974431288907 5.20102274844372 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0398768409185772 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C T C 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 25 15 40 11.6677320296289 7.99936078222268 3.6683712474062 A:G A G 10 0.533290718814845 0.270060733145318 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76814782 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76814749_76814860:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76814749_76814860:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 12 18 30 5.60051137422186 9.59923293866721 -3.99872156444535 A:G G A 10 0.533290718814845 0.148463307294005 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 17 8 25 7.93405778014763 4.26632575051876 3.66773202962887 A:G A G 10 0.533290718814845 0.163254530937577 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C C T 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78261730 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78262161 T/C 0 0 10 10 0 5.33290718814845 -5.33290718814845 C T C 10 0.533290718814845 0.000490302802268709 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78263486 T/C 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C T C 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78263514 G/A 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78321224 C/T 1 14 25 39 6.53392993659217 13.3322679703711 -6.79833803377896 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0360267182088226 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 78896529 C/T 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79163758 G/A 1 7 13 20 3.26696496829608 6.93277934459299 -3.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.118460995463565 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79163715_79163775:AZI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79164707 C/T 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 T:C C T 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79220255 C/T 1 28 27 55 13.0678598731843 14.3988494080008 -1.33098953481648 T:C C T 10 0.533290718814845 0.787378603932422 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 24 26 50 11.2010227484437 13.865558689186 -2.66453594074225 A:C C A 10 0.533290718814845 0.480547796044125 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 29 18 47 13.5345691543695 9.59923293866721 3.93533621570228 A:G G A 10 0.533290718814845 0.306274336069742 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 20 32 52 9.3341856237031 17.065303002075 -7.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0366503684913041 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 T:C C T 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 44 30 74 20.5352083721468 15.9987215644454 4.53648680770147 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297396790063436 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 29 14 43 13.5345691543695 7.46607006340783 6.06849909096166 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0677298142398656 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79639550 G/A 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 13 17 30 6.06722065540701 9.06594221985237 -2.99872156444535 A:G A G 10 0.533290718814845 0.279372965933084 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 18 17 35 8.40076706133279 9.06594221985237 -0.665175158519576 T:C T C 10 0.533290718814845 0.866470286349281 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 19 11 30 8.86747634251794 5.8661979069633 3.00127843555465 T:C T C 10 0.533290718814845 0.360513345000743 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 27 17 44 12.6011505919992 9.06594221985237 3.53520837214682 T:G G T 10 0.533290718814845 0.295292932360026 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 32 30 62 14.934696997925 15.9987215644454 -1.06402456652039 T:C C T 10 0.533290718814845 0.800328724120857 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 202 194 396 94.2752747994013 103.45839945008 -9.18312465067864 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.3648715979734 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 8 16 24 3.73367424948124 8.53265150103752 -4.79897725155628 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0642561142900687 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 79980756 C/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169689:ENST00000306704:exon_79980702_79980794:STRA13;ENSG00000169689:ENST00000392359:exon_79980702_79980794:STRA13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 A:C A C 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80007887 A/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80007897 G/T 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 13 7 20 6.06722065540701 3.73303503170392 2.3341856237031 T:G G T 10 0.533290718814845 0.372254450678439 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80041950 G/A 1 22 24 46 10.2676041860734 12.7989772515563 -2.53137306548287 A:G G A 10 0.533290718814845 0.46414126978946 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 37 17 54 17.2682434038507 9.06594221985237 8.20230118399837 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0286086048743654 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 11 10 21 5.1338020930367 5.33290718814845 -0.199105095111745 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 10 1 11 4.66709281185155 0.533290718814845 4.1338020930367 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0136489251822391 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 22 23 45 10.2676041860734 12.2656865327414 -1.99808234666803 A:G A G 10 0.533290718814845 0.554492200028458 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 670888 T/C 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.129891076919026 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 706558 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2554807 T/G 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 T:G T G 10 0.533290718814845 0.117167394553238 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2554836 A/G 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2555002 C/T 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 C C 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2555005 C/T 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 C C 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2555008 T/G 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 T T 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000101574:ENST00000319888:exon_2554668_2555037:METTL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 A:T A T 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G A G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 21 23 44 9.80089490488825 12.2656865327414 -2.46479162785318 A:G A G 10 0.533290718814845 0.546096409302446 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 11 3 14 5.1338020930367 1.59987215644454 3.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0649898735465232 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 3814148 C/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 C:G C G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400147:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400150:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400149:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400155:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400145:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000498188:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000478161:exon_3814059_3814273:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000484845:exon_3814059_3814273:DLGAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 5292030 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000198081:ENST00000357006:exon_5289018_5292203:ZFP161;ENSG00000198081:ENST00000400143:exon_5289019_5292203:ZFP161 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 T:C:G C G 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 63 73 136 29.4026847146648 38.9302224734837 -9.52753775881892 C:G C G 10 0.533290718814845 0.103259686496387 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 32 32 64 14.934696997925 17.065303002075 -2.13060600415008 T:C T C 10 0.533290718814845 0.617893605893214 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 12351111 G/A 1 23 24 47 10.7343134672586 12.7989772515563 -2.06466378429772 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56190185725608 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351084_12351209:AFG3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 34 27 61 15.8681155602953 14.3988494080008 1.46926615229445 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.797734704510623 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 54 40 94 25.2023011839984 21.3316287525938 3.87067243140457 A:C C A 10 0.533290718814845 0.469730294980395 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:G G T 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 13621267 G/A 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000168675:ENST00000361205:exon_13621116_13621270:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399848:exon_13621116_13621270:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000359446:exon_13621116_13621270:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399847:exon_13621116_13621270:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000361303:exon_13620867_13621270:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000435606:exon_13620867_13621270:C18orf1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 A:G G A 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 19203800 A/T 1 46 49 95 21.4686269345171 26.1312452219274 -4.66261828741028 A:T A T 10 0.533290718814845 0.355794209738519 ENSG00000167088:ENST00000300413:exon_19203709_19203900:SNRPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 15 8 23 7.00063921777732 4.26632575051876 2.73431346725856 T:C C T 10 0.533290718814845 0.29943976246634 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 21148863 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21148787_21148962:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21148787_21148962:NPC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 23854692 C/T 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23854627_23854788:TAF4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 23866349 G/A 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 5 16 21 2.33354640592577 8.53265150103752 -6.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00782670118630837 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 29101128 G/A 1 18 5 23 8.40076706133279 2.66645359407423 5.73431346725856 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0200673183720405 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29101062_29101206:DSG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 40 6 46 18.6683712474062 3.19974431288907 15.4686269345171 A:T:G G A 10 0.533290718814845 1.93174600747731e-06 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 29125854 A/G 1 10 27 37 4.66709281185155 14.3988494080008 -9.73175659614927 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00149197592279498 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 29454644 A/G 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29454443_29454667:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29454443_29454667:TRAPPC8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 29488804 A/G 1 10 17 27 4.66709281185155 9.06594221985237 -4.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.121454868321471 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29488717_29488973:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29488717_29488973:TRAPPC8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:G G T 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 29 33 62 13.5345691543695 17.5985937208899 -4.06402456652039 T:C T C 10 0.533290718814845 0.311203578337862 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 A:G G A 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 A:C A C 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 23 18 41 10.7343134672586 9.59923293866721 1.13508052859135 A:G G A 10 0.533290718814845 0.75649677321812 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 26 40 66 12.134441310814 21.3316287525938 -9.19718744177977 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0261045973756472 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 34310668 C/T 1 2 9 11 0.93341856237031 4.79961646933361 -3.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0300816157817593 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34310609_34310767:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34310609_34310767:FHOD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 34398883 G/A 1 17 24 41 7.93405778014763 12.7989772515563 -4.86491947140865 A:G G A 10 0.533290718814845 0.15839725846715 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 18 19 37 8.40076706133279 10.1325236574821 -1.73175659614927 T:C C T 10 0.533290718814845 0.622756122287319 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 3 19 22 1.40012784355546 10.1325236574821 -8.73239581392659 A:C C A 10 0.533290718814845 0.000157409043214423 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 3 19 22 1.40012784355546 10.1325236574821 -8.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000157409043214423 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 13 16 29 6.06722065540701 8.53265150103752 -2.46543084563051 A:G A G 10 0.533290718814845 0.457232514618002 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 16 12 28 7.46734849896248 6.39948862577814 1.06785987318434 T:C C T 10 0.533290718814845 0.709796492193127 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:G G T 10 0.533290718814845 0.400448892772459 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 17 8 25 7.93405778014763 4.26632575051876 3.66773202962887 A:C A C 10 0.533290718814845 0.163254530937577 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 16 13 29 7.46734849896248 6.93277934459299 0.534569154369494 T:C T C 10 0.533290718814845 0.855209067729783 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 54270240 T/C 1 202 163 365 94.2752747994013 86.9263871668197 7.34888763258157 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.462814703305819 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54264439_54270287:TXNL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 20 21 41 9.3341856237031 11.1991050951117 -1.86491947140865 A:C C A 10 0.533290718814845 0.6393846277068 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:T A T 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 8 17 25 3.73367424948124 9.06594221985237 -5.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0433533717040085 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 45 17 62 21.001917653332 9.06594221985237 11.9359754334796 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00216918494444951 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 33 11 44 15.4014062791101 5.8661979069633 9.53520837214682 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00384990087374274 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 19 15 34 8.86747634251794 7.99936078222268 0.868115560295269 T:G G T 10 0.533290718814845 0.86407496646472 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 T:G T G 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 27 17 44 12.6011505919992 9.06594221985237 3.53520837214682 A:C A C 10 0.533290718814845 0.295292932360026 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 11 17 28 5.1338020930367 9.06594221985237 -3.93214012681566 C:G C G 10 0.533290718814845 0.184006868411032 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:T A T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 20 1 21 9.3341856237031 0.533290718814845 8.80089490488825 T:G T G 10 0.533290718814845 6.93406095470723e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 23 1 24 10.7343134672586 0.533290718814845 10.2010227484437 C:G C G 10 0.533290718814845 1.0595051910725e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 25 4 29 11.6677320296289 2.13316287525938 9.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000272075768028059 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 18 9 27 8.40076706133279 4.79961646933361 3.60115059199918 T:C C T 10 0.533290718814845 0.181385538451904 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 13 16 29 6.06722065540701 8.53265150103752 -2.46543084563051 A:C A C 10 0.533290718814845 0.457232514618002 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 56400826 T/C 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.731379043001877 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 17 19 36 7.93405778014763 10.1325236574821 -2.19846587733442 T:C T C 10 0.533290718814845 0.506348385532759 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 60985773 C/T 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 T:C C T 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 72 66 138 33.6030682453312 35.1971874417798 -1.59411919644862 T:C T C 10 0.533290718814845 0.798502273696478 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 16 6 22 7.46734849896248 3.19974431288907 4.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0866299932985412 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 15 42 57 7.00063921777732 22.3982101902235 -15.3975709724462 A:G A G 10 0.533290718814845 4.72757684570696e-05 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 9 19 28 4.20038353066639 10.1325236574821 -5.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0353555000671646 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 9 20 29 4.20038353066639 10.6658143762969 -6.46543084563051 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0238161004604341 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 5 28 33 2.33354640592577 14.9321401268157 -12.5985937208899 T:C C T 10 0.533290718814845 1.047818915749e-05 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 25 51 76 11.6677320296289 27.1978266595571 -15.5300946299282 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000478877633713896 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 A:G A G 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61654329 C/T 1 18 20 38 8.40076706133279 10.6658143762969 -2.26504731496411 T:C C T 10 0.533290718814845 0.516956692122959 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 19 18 37 8.86747634251794 9.59923293866721 -0.731756596149266 A:G A G 10 0.533290718814845 0.869799189277867 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 26 44 70 12.134441310814 23.4647916278532 -11.3303503170392 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00802171475503113 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 67992279 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000170677:ENST00000397942:exon_67991779_67997436:SOCS6;ENSG00000170677:ENST00000302056:exon_67991778_67994308:SOCS6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 67992498 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000170677:ENST00000397942:exon_67991779_67997436:SOCS6;ENSG00000170677:ENST00000302056:exon_67991778_67994308:SOCS6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 72173173 G/T 1 54 48 102 25.2023011839984 25.5979545031126 -0.395653319114192 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72173084_72173246:CNDP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:G T G 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77208922 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77208782_77208984:NFATC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 19 10 29 8.86747634251794 5.33290718814845 3.53456915436949 A:G G A 10 0.533290718814845 0.198901950501575 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77891039 T/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:T T A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77890986_77891075:ADNP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77893683 A/G 1 14 23 37 6.53392993659217 12.2656865327414 -5.73175659614927 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.06958289945008 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77894844 G/A 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77895192 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 C:G G C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:G T G 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 170 147 317 79.3405778014763 78.3937356657822 0.946842135694126 T:C C T 10 0.533290718814845 0.955124097683507 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 115 94 209 53.6715673362928 50.1293275685954 3.5422397676974 T:C C T 10 0.533290718814845 0.628369649808157 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 810573 C/A 1 165 175 340 77.0070313955506 93.3258757925979 -16.3188443970473 A:C C A 10 0.533290718814845 0.081887060033799 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_810543_810620:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_810543_810620:PTBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 26 27 53 12.134441310814 14.3988494080008 -2.26440809718679 A:G A G 10 0.533290718814845 0.582879100091077 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 984537 A/G 1 55 39 94 25.6690104651835 20.798338033779 4.87067243140457 A:G A G 10 0.533290718814845 0.352489193897232 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 39 52 91 18.201661966221 27.7311173783719 -9.5294554121509 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0464309810735682 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 34 38 72 15.8681155602953 20.2650473149641 -4.39693175466884 T:C T C 10 0.533290718814845 0.344850408749405 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1010396 G/C 1 41 30 71 19.1350805285914 15.9987215644454 3.136358964146 C:G G C 10 0.533290718814845 0.477596493586608 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 54 33 87 25.2023011839984 17.5985937208899 7.60370746310848 A:G A G 10 0.533290718814845 0.107779895784007 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 43 24 67 20.0684990909617 12.7989772515563 7.26952183940539 T:G G T 10 0.533290718814845 0.08623267646808 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1061804 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1061781_1061887:ABCA7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 39 23 62 18.201661966221 12.2656865327414 5.93597543347961 A:G A G 10 0.533290718814845 0.161010239975321 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 82 107 189 38.2701610571827 57.0621069131884 -18.7919458560057 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00687080603883337 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 38 46 84 17.7349526850359 24.5313730654829 -6.79642038044698 A:G A G 10 0.533290718814845 0.155092441452025 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 6 13 19 2.80025568711093 6.93277934459299 -4.13252365748206 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0669886965950056 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1104874 C/T 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C C T 10 0.533290718814845 0.76468028377391 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.188395739495124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 A:G G A 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1119963 A/G 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G A G 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119905_1120022:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119905_1120022:SBNO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1127615 G/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1127523_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1127603_1127764:SBNO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 27 32 59 12.6011505919992 17.065303002075 -4.46415241007586 A:G G A 10 0.533290718814845 0.296507662954318 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 41 7 48 19.1350805285914 3.73303503170392 15.4020454968874 A:G G A 10 0.533290718814845 3.67592999003320e-06 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 41 5 46 19.1350805285914 2.66645359407423 16.4686269345171 T:C T C 10 0.533290718814845 3.18912685807621e-07 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1619348 G/A 1 41 5 46 19.1350805285914 2.66645359407423 16.4686269345171 A:G G A 10 0.533290718814845 3.18912685807621e-07 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 40 5 45 18.6683712474062 2.66645359407423 16.001917653332 T:C C T 10 0.533290718814845 5.48973699355018e-07 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 53 37 90 24.7355919028132 19.7317565961493 5.00383530666394 A:G G A 10 0.533290718814845 0.341754018939605 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 16 14 30 7.46734849896248 7.46607006340783 0.00127843555464935 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 18 11 29 8.40076706133279 5.8661979069633 2.53456915436949 A:G A G 10 0.533290718814845 0.360200680270037 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 45 61 106 21.001917653332 32.5307338477055 -11.5288161943736 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0253710247761738 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 T:C T C 10 0.533290718814845 0.417852462394259 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:C C A 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 37 34 71 17.2682434038507 18.1318844397047 -0.863641035853998 A:G A G 10 0.533290718814845 0.905458468378593 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 23 20 43 10.7343134672586 10.6658143762969 0.0684990909616641 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 21 28 49 9.80089490488825 14.9321401268157 -5.13124522192741 T:G G T 10 0.533290718814845 0.153635711107862 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3054196 G/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 C:G G C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 19 18 37 8.86747634251794 9.59923293866721 -0.731756596149266 T:C T C 10 0.533290718814845 0.869799189277867 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 31 25 56 14.4679877167398 13.3322679703711 1.13571974636868 A:G A G 10 0.533290718814845 0.790245985509363 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 105 142 247 49.0044745244413 75.727282071708 -26.7228075472667 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000703832556905557 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3980068 G/A 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.438425324362013 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 3980072 A/C 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:C A C 10 0.533290718814845 0.129891076919026 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 210 119 329 98.0089490488825 63.4615955389666 34.547353509916 A:G G A 10 0.533290718814845 0.000131614034768304 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 194 147 341 90.5416005499201 78.3937356657822 12.1478648841378 A:G A G 10 0.533290718814845 0.192998421419023 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 19 9 28 8.86747634251794 4.79961646933361 4.06785987318434 T:C T C 10 0.533290718814845 0.133620819103613 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 16 14 30 7.46734849896248 7.46607006340783 0.00127843555464935 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4409601 A/G 1 22 21 43 10.2676041860734 11.1991050951117 -0.931500909038336 A:G A G 10 0.533290718814845 0.878764736190408 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 T:C C T 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4792049 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000141965:ENST00000269856:exon_4791728_4795571:FEM1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 21 20 41 9.80089490488825 10.6658143762969 -0.864919471408646 A:G G A 10 0.533290718814845 0.875932341908383 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 25 40 65 11.6677320296289 21.3316287525938 -9.66389672296493 T:C T C 10 0.533290718814845 0.01796928161172 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 4910889 G/T 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 T:G G T 10 0.533290718814845 0.117167394553238 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 6230692 G/A 1 14 17 31 6.53392993659217 9.06594221985237 -2.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 0.374395278994912 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6230581_6230724:MLLT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 T:G G T 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 420 338 758 196.017898097765 180.252262959418 15.7656351383475 A:G G A 10 0.533290718814845 0.259185233754805 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 6731213 G/A 1 24 16 40 11.2010227484437 8.53265150103752 2.6683712474062 A:G G A 10 0.533290718814845 0.431489020021948 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6731210_6731293:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6731210_6731293:GPR108 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 6731267 G/A 1 27 23 50 12.6011505919992 12.2656865327414 0.335464059257749 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6731210_6731293:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6731210_6731293:GPR108 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:G T G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7747293 T/G 1 104 83 187 48.5377652432561 44.2631296616321 4.27463558162398 T:G T G 10 0.533290718814845 0.558048676034759 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 360 319 679 168.015341226656 170.119739301936 -2.10439807527979 A:G G A 10 0.533290718814845 0.877791554807813 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 13 5 18 6.06722065540701 2.66645359407423 3.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.155041681425192 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8321562 C/T 1 6 26 32 2.80025568711093 13.865558689186 -11.065303002075 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000109113532074517 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8321502_8321594:LASS4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 46 57 103 21.4686269345171 30.3975709724462 -8.92894403792904 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0927349442313418 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 54 62 116 25.2023011839984 33.0640245665204 -7.86172338252202 T:C C T 10 0.533290718814845 0.162595617105334 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 43 51 94 20.0684990909617 27.1978266595571 -7.12932756859543 T:C C T 10 0.533290718814845 0.148568341831210 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 23 31 54 10.7343134672586 16.5320122832602 -5.79769881600163 A:G A G 10 0.533290718814845 0.133336288052856 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 69 61 130 32.2029404017757 32.5307338477055 -0.327793445929856 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10220616 G/A 1 54 58 112 25.2023011839984 30.930861691261 -5.72856050726264 A:G G A 10 0.533290718814845 0.298050986378576 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10220589_10220696:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10220589_10220696:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10220589_10220696:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000466025:exon_10220589_10220696:PPAN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 C:G C G 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 21 36 57 9.80089490488825 19.1984658773344 -9.39757097244617 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0161703122373408 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 258 297 555 120.41099454577 158.387343488009 -37.976348942239 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.00139841617134736 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 154 145 299 71.8732293025139 77.3271542281525 -5.45392492563866 A:G A G 10 0.533290718814845 0.562255224850517 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10226393 G/A 1 259 274 533 120.877703826955 146.121656955268 -25.2439531283124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0299153236822253 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226360_10226496:EIF3G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10229297 C/A 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:C C A 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000130811:ENST00000453552:exon_10229275_10229403:EIF3G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 C:G C G 10 0.533290718814845 0.759312876969158 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10431799 G/T 1 17 19 36 7.93405778014763 10.1325236574821 -2.19846587733442 T:G G T 10 0.533290718814845 0.506348385532759 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 21 13 34 9.80089490488825 6.93277934459299 2.86811556029527 A:G A G 10 0.533290718814845 0.391138124053646 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 27 17 44 12.6011505919992 9.06594221985237 3.53520837214682 A:G A G 10 0.533290718814845 0.295292932360026 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 17 15 32 7.93405778014763 7.99936078222268 -0.0653030020750407 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 28 19 47 13.0678598731843 10.1325236574821 2.93533621570228 T:C T C 10 0.533290718814845 0.465351354718573 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11031615 C/T 1 29 40 69 13.5345691543695 21.3316287525938 -7.79705959822431 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0698898468443677 ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11031510_11031622:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11031510_11031622:CARM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 19 8 27 8.86747634251794 4.26632575051876 4.60115059199918 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0843371787153929 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11277232 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11276266_11277287:KANK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11289277 G/A 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11289229_11289396:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11289229_11289396:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11289229_11289396:KANK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11348960 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11348863_11348980:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11348863_11348980:DOCK6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 C:G G C 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 88 57 145 41.0704167442936 30.3975709724462 10.6728457718475 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0805788524917472 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 242 247 489 112.943646046808 131.722807547267 -18.7791615004592 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.0935200735602289 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 13936385 C/T 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13936364_13936527:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13936364_13936527:ZSWIM4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 118 70 188 55.0716951798483 37.3303503170391 17.7413448628091 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0103655078450194 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 75 43 118 35.0031960888866 22.9315009090383 12.0716951798483 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0268145592875684 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 77 42 119 35.9366146512569 22.3982101902235 13.5384044610334 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0130635312167562 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 59 36 95 27.5358475899241 19.1984658773344 8.33738171258972 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0996075087046493 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 71 57 128 33.136358964146 30.3975709724462 2.73878799169984 A:G A G 10 0.533290718814845 0.658414282635554 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 54 61 115 25.2023011839984 32.5307338477055 -7.32843266370718 A:G G A 10 0.533290718814845 0.190691763167915 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 14629171 C/T 1 24 17 41 11.2010227484437 9.06594221985237 2.13508052859135 T:C C T 10 0.533290718814845 0.53486061023421 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 26 19 45 12.134441310814 10.1325236574821 2.00191765333197 A:G G A 10 0.533290718814845 0.654502605543536 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 31 21 52 14.4679877167398 11.1991050951117 3.26888262162806 A:G G A 10 0.533290718814845 0.405763403770040 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 20 28 48 9.3341856237031 14.9321401268157 -5.59795450311256 A:G A G 10 0.533290718814845 0.112960139826796 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 11 24 35 5.1338020930367 12.7989772515563 -7.66517515851958 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0106291849207233 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 C:G G C 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 44 24 68 20.5352083721468 12.7989772515563 7.73623112059054 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0680502286782663 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 41 38 79 19.1350805285914 20.2650473149641 -1.12996678637276 T:C T C 10 0.533290718814845 0.82225357514806 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 74 52 126 34.5364868077015 27.7311173783719 6.80536942932952 T:C T C 10 0.533290718814845 0.245990205925756 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 35 16 51 16.3348248414804 8.53265150103752 7.80217334044291 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0344729183030585 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 21 25 46 9.80089490488825 13.3322679703711 -3.53137306548287 T:C T C 10 0.533290718814845 0.305088219507340 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 27 21 48 12.6011505919992 11.1991050951117 1.40204549688744 A:G A G 10 0.533290718814845 0.772851592201781 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.366675434698681 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 C:G C G 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17393504 G/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17394504 A/C 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:C A C 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 C:G C G 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17412366 G/A 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G G A 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 T:C T C 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 17886295 A/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:T A T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886265_17886322:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886265_17886322:FCHO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18170376 G/A 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.345887318058797 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18248146 T/C 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18248049_18248171:MAST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18266699 C/T 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18266267_18267011:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000444315:exon_18266267_18267011:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000473973:exon_18266267_18266808:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18266432_18267011:PIK3R2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 16 8 24 7.46734849896248 4.26632575051876 3.20102274844372 C:G G C 10 0.533290718814845 0.222733224438985 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18499422 C/G 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 25 24 49 11.6677320296289 12.7989772515563 -1.13124522192741 T:G G T 10 0.533290718814845 0.775955397216552 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 34 30 64 15.8681155602953 15.9987215644454 -0.130606004150081 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 86 74 160 40.1369981819233 39.4635131922985 0.673484989624797 T:C T C 10 0.533290718814845 0.936981712380092 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 A:G G A 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 19823270 T/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:T T A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 21132414 C/T 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 23837195 T/C 1 1 8 9 0.466709281185155 4.26632575051876 -3.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0153431914750835 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 A:T A T 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 24310413 G/C 1 16 10 26 7.46734849896248 5.33290718814845 2.13444131081403 C:G G C 10 0.533290718814845 0.437744169351963 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 19 14 33 8.86747634251794 7.46607006340783 1.40140627911011 T:C C T 10 0.533290718814845 0.728008888221575 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G G A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 33882222 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33882201_33882385:PEPD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 34884857 C/A 1 235 170 405 109.676681078511 90.6594221985237 19.0172588799878 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0585816061629547 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34884819_34884971:GPI HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35175877 G/A 1 23 29 52 10.7343134672586 15.4654308456305 -4.73111737837194 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.211698519643848 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35450229 C/T 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 38 51 89 17.7349526850359 27.1978266595571 -9.46287397452121 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0552361847858733 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 60 65 125 28.0025568711093 34.6638967229649 -6.66133985185563 T:G T G 10 0.533290718814845 0.244541160990608 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 113 88 201 52.7381487739225 46.9295832557064 5.80856551821615 A:G A G 10 0.533290718814845 0.437091912680611 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 158 125 283 73.7400664272545 66.6613398518556 7.07872657539886 A:G A G 10 0.533290718814845 0.404949958970872 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35827232 C/T 1 142 170 312 66.272717928292 90.6594221985237 -24.3867042702316 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00637628690257537 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35826939_35827244:CD22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35828619 T/C 1 14 15 29 6.53392993659217 7.99936078222268 -1.46543084563051 T:C T C 10 0.533290718814845 0.71044292416145 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35828773 C/T 1 134 122 256 62.5390436788108 65.0614676954111 -2.52242401660033 T:C C T 10 0.533290718814845 0.754570426541021 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35828658_35828924:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35828658_35828924:CD22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 135 120 255 63.0057529599959 63.9948862577814 -0.989133297785479 A:G G A 10 0.533290718814845 0.900318734460634 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36109312 C/A 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 A:C C A 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109304_36109367:HAUS5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 180 171 351 84.0076706133279 91.1927129173385 -7.18504230401061 T:C C T 10 0.533290718814845 0.454160633485576 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36214865 C/T 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36214618_36214908:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36214633_36214908:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36214634_36214908:AD000671.3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36273534 G/A 0 0 8 8 0 4.26632575051876 -4.26632575051876 A G A 10 0.533290718814845 0.00225097929524416 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36273499_36273581:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36273499_36273581:ARHGAP33 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36594738 C/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36594807 C/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 73 74 147 34.0697775265163 39.4635131922985 -5.39373566578222 A:G G A 10 0.533290718814845 0.408575016741947 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37004938 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C T C 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 17 15 32 7.93405778014763 7.99936078222268 -0.0653030020750407 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37310344 T/C 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 21 27 48 9.80089490488825 14.3988494080008 -4.59795450311256 T:G G T 10 0.533290718814845 0.195195995798985 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 37975897 C/T 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000171827:ENST00000330173:exon_37974781_37976242:ZNF570 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 10 3 13 4.66709281185155 1.59987215644454 3.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101577760344088 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38798263 C/T 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 T:C C T 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798237_38798392:YIF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 32 30 62 14.934696997925 15.9987215644454 -1.06402456652039 T:C C T 10 0.533290718814845 0.800328724120857 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 30 33 63 14.0012784355546 17.5985937208899 -3.59731528533524 A:G G A 10 0.533290718814845 0.379059022903526 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38896244 C/A 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:C C A 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 40 31 71 18.6683712474062 16.5320122832602 2.13635896414601 A:G G A 10 0.533290718814845 0.636026311421163 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39215172 T/C 1 88 53 141 41.0704167442936 28.2644080971868 12.8060086471069 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0345591130034726 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39215099_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39215071_39215205:ACTN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 88 102 190 41.0704167442936 54.3956533191142 -13.3252365748206 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0584988263761031 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39306529 C/T 1 221 221 442 103.142751141919 117.857248858081 -14.7144977161615 T:C C T 10 0.533290718814845 0.166900932492571 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 63 99 162 29.4026847146648 52.7957811626697 -23.3930964480049 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000269252204556784 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 175 93 268 81.6741242074021 49.5960368497806 32.0780873576215 T:C C T 10 0.533290718814845 8.36680601981793e-05 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 17 22 39 7.93405778014763 11.7323958139266 -3.79833803377896 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.261824116322687 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 A:G G A 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 18 11 29 8.40076706133279 5.8661979069633 2.53456915436949 C:G C G 10 0.533290718814845 0.360200680270037 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 T:C T C 10 0.533290718814845 0.85522063684702 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 1663 1504 3167 776.137534610913 802.069241097527 -25.9317064866141 A:T:C A C 10 0.533290718814845 0.363742617960569 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 1626 1449 3075 758.869291207062 772.73825156271 -13.8689603556484 A:T:C:G G A 10 0.533290718814845 0.625570103065581 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 39 44 83 18.201661966221 23.4647916278532 -5.26312966163214 T:C C T 10 0.533290718814845 0.271735429601497 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 42 33 75 19.6017898097765 17.5985937208899 2.00319608888662 A:G G A 10 0.533290718814845 0.728716747121145 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 40023088 T/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:G T G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.516482277403379 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 19 31 50 8.86747634251794 16.5320122832602 -7.66453594074225 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0333322586342941 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 23 16 39 10.7343134672586 8.53265150103752 2.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.523723415499499 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44050001 C/T 1 27 35 62 12.6011505919992 18.6651751585196 -6.06402456652039 T:C C T 10 0.533290718814845 0.128239826214467 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44049970_44050109:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44049970_44050109:XRCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 18 22 40 8.40076706133279 11.7323958139266 -3.3316287525938 T:C T C 10 0.533290718814845 0.342322993075483 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 15 20 35 7.00063921777732 10.6658143762969 -3.66517515851958 A:G G A 10 0.533290718814845 0.237929762685072 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44103164 C/T 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000124444:ENST00000391965:exon_44102983_44104156:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000525771:exon_44102983_44104522:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000533118:exon_44102983_44103646:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000528387:exon_44102983_44103677:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000529930:exon_44102983_44103566:ZNF576;ENSG00000124444:ENST00000336564:exon_44102983_44105309:ZNF576 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44284864 C/T 1 30 19 49 14.0012784355546 10.1325236574821 3.86875477807259 T:C C T 10 0.533290718814845 0.316704561238049 ENSG00000104783:ENST00000262888:exon_44284855_44285409:KCNN4;ENSG00000104783:ENST00000407385:exon_44284855_44285119:KCNN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 A:G A G 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 9 14 23 4.20038353066639 7.46607006340783 -3.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.210865779148278 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 9 17 26 4.20038353066639 9.06594221985237 -4.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0752576483829959 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 11 4 15 5.1338020930367 2.13316287525938 3.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.194148407751893 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 38 35 73 17.7349526850359 18.6651751585196 -0.930222473483685 T:C T C 10 0.533290718814845 0.906729365905238 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 17 23 40 7.93405778014763 12.2656865327414 -4.3316287525938 A:C C A 10 0.533290718814845 0.204853319079390 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 26 23 49 12.134441310814 12.2656865327414 -0.131245221927406 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46027125 G/A 1 93 99 192 43.4039631502194 52.7957811626697 -9.39181801245024 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.192844274935335 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46027099_46027135:VASP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46289503 C/T 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 48 36 84 22.4020454968874 19.1984658773344 3.20357961955302 C:G G C 10 0.533290718814845 0.513051665040949 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 31 45 76 14.4679877167398 23.998082346668 -9.53009462992822 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0292905685965963 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 46973981 G/A 0 0 19 19 0 10.1325236574821 -10.1325236574821 A G A 10 0.533290718814845 5.15089044944828e-07 ENSG00000182013:ENST00000438932:exon_46973195_46974371:PNMAL1;ENSG00000182013:ENST00000313683:exon_46972990_46974371:PNMAL1;ENSG00000182013:ENST00000417103:exon_46973781_46974371:PNMAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 37 21 58 17.2682434038507 11.1991050951117 6.06913830873899 A:G G A 10 0.533290718814845 0.115912389701996 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 77 71 148 35.9366146512569 37.863641035854 -1.92702638459706 A:G G A 10 0.533290718814845 0.804898947010804 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 C:G G C 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:C A C 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47858424 G/A 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 115 125 240 53.6715673362928 66.6613398518556 -12.9897725155628 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.105607811501134 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 T:C T C 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 48737706 A/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:T A T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48735710_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519302:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522068:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523750:exon_48737660_48737721:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518596:exon_48737078_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521092:exon_48737535_48737800:CARD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:G G T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 30 40 70 14.0012784355546 21.3316287525938 -7.33035031703915 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.0930799403481427 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 912 1020 1932 425.638864440861 543.956533191142 -118.317668750281 T:C T C 10 0.533290718814845 7.18733749982855e-08 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49481243 T/C 1 16 17 33 7.46734849896248 9.06594221985237 -1.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.604371642149387 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000472004:exon_49481181_49481243:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000496048:exon_49481181_49481259:GYS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 9 20 29 4.20038353066639 10.6658143762969 -6.46543084563051 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0238161004604341 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.297757918797876 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 22 25 47 10.2676041860734 13.3322679703711 -3.06466378429772 A:G A G 10 0.533290718814845 0.384010799360323 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 69 56 125 32.2029404017757 29.8642802536313 2.33866014814437 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.720234401200895 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50097784 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097711_50097872:PRR12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 40 63 103 18.6683712474062 33.5973152853352 -14.928944037929 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0039754735711165 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50381837 C/G 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 C:G C G 10 0.533290718814845 0.157465223432973 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50387759 C/T 1 20 11 31 9.3341856237031 5.8661979069633 3.4679877167398 T:C C T 10 0.533290718814845 0.280025987141869 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 42 54 96 19.6017898097765 28.7976988160016 -9.19590900622512 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0655627941602944 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 61 131 192 28.4692661522945 69.8610841647447 -41.3918180124502 T:C C T 10 0.533290718814845 1.85479116748544e-09 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50504056 T/C 0 15 0 15 7.00063921777732 0 7.00063921777732 T T 10 0.533290718814845 9.11095029014042e-05 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50881585 A/C 1 41 29 70 19.1350805285914 15.4654308456305 3.66964968296085 A:C A C 10 0.533290718814845 0.403607983947576 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881406_50881696:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881406_50881696:NR1H2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50882008 A/G 1 71 46 117 33.136358964146 24.5313730654829 8.60498589866313 A:G A G 10 0.533290718814845 0.115839227771226 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881779_50882053:NR1H2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50905762 T/C 1 19 14 33 8.86747634251794 7.46607006340783 1.40140627911011 T:C T C 10 0.533290718814845 0.728008888221575 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905711_50905792:POLD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50916772 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50916683_50916778:POLD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 63 62 125 29.4026847146648 33.0640245665204 -3.66133985185562 T:C T C 10 0.533290718814845 0.531131755278062 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 54 69 123 25.2023011839984 36.7970595982243 -11.5947584142259 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0377848427996411 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 63 85 148 29.4026847146648 45.3297110992618 -15.9270263845971 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0104214920473993 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 51380110 T/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:T T A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 35 49 84 16.3348248414804 26.1312452219274 -9.79642038044698 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0373174776319364 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 52089982 C/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 C:G C G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000105497:ENST00000262259:exon_52089880_52092993:ZNF175 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 52825032 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000198464:ENST00000468240:exon_52824832_52826949:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000490272:exon_52824832_52826933:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000429434:exon_52824832_52829163:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000335090:exon_52824832_52827333:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000391790:exon_52824832_52829163:ZNF480 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 15 15 0 7.99936078222268 -7.99936078222268 C T C 10 0.533290718814845 1.08566681484265e-05 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53056953 G/A 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:C C A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 7 15 22 3.26696496829608 7.99936078222268 -4.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0536297201390633 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53454543 G/A 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 3 14 17 1.40012784355546 7.46607006340783 -6.06594221985237 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0056070645065042 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53911990 C/G 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 C:G C G 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53959615 G/A 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 A:G G A 10 0.533290718814845 0.844787277202259 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 53959804 T/C 1 14 13 27 6.53392993659217 6.93277934459299 -0.398849408000816 T:C T C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 20 0 20 9.3341856237031 0 9.3341856237031 A A 10 0.533290718814845 3.70202574688604e-06 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 A:C C A 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54705317 C/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 C:G C G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54705340 C/G 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 16 35 51 7.46734849896248 18.6651751585196 -11.1978266595571 T:G T G 10 0.533290718814845 0.00183901006365385 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 54973198 G/A 1 21 22 43 9.80089490488825 11.7323958139266 -1.93150090903834 A:G G A 10 0.533290718814845 0.64711865874411 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54971946_54973217:LENG8;ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C T C 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 1 11 12 0.466709281185155 5.8661979069633 -5.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00210032151024646 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 0 0 15 15 0 7.99936078222268 -7.99936078222268 A G A 10 0.533290718814845 1.08566681484265e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 0 0 25 25 0 13.3322679703711 -13.3322679703711 A C A 10 0.533290718814845 5.32305481647497e-09 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55741961 G/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 56170657 G/A 1 145 1 146 67.6728457718475 0.533290718814845 67.1395550530326 A:G G A 10 0.533290718814845 3.10782737910313e-38 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56170576_56170711:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56170576_56170711:U2AF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57133876 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57867599 T/C 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C T C 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000131845:ENST00000282286:exon_57867398_57871266:ZNF304;ENSG00000131845:ENST00000391705:exon_57867398_57871266:ZNF304 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57909872 G/A 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000188785:ENST00000366197:exon_57909798_57912785:ZNF548;ENSG00000188785:ENST00000336128:exon_57909798_57911257:ZNF548 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57931303 C/A 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 A:C C A 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 57932027 C/T 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 19 12 31 8.86747634251794 6.39948862577814 2.4679877167398 A:G A G 10 0.533290718814845 0.472223446301787 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1188 1218 2406 554.450626047964 649.548095516481 -95.0974694685171 A:T:C:G G A 10 0.533290718814845 0.000111741161994363 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:C T C 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 6 17 23 2.80025568711093 9.06594221985237 -6.26568653274144 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0109983725369487 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 181 190 371 84.474379894513 101.325236574821 -16.8508566803075 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0858619352327694 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 175 178 353 81.6741242074021 94.9257479490424 -13.2516237416403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.165506960542122 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 15 10 25 7.00063921777732 5.33290718814845 1.66773202962887 A:G A G 10 0.533290718814845 0.552637806757096 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59073706 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 17 27 44 7.93405778014763 14.3988494080008 -6.46479162785318 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0685986817171811 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 105 149 254 49.0044745244413 79.4603171034119 -30.4558425789706 A:G A G 10 0.533290718814845 0.000151246486487233 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 16 17 33 7.46734849896248 9.06594221985237 -1.59859372088989 T:C C T 10 0.533290718814845 0.604371642149387 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 16 14 30 7.46734849896248 7.46607006340783 0.00127843555464935 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 C:G G C 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 3483181 C/T 1 34 34 68 15.8681155602953 18.1318844397047 -2.26376887940946 T:C C T 10 0.533290718814845 0.627609610506685 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 47 55 102 21.9353362157023 29.3309895348165 -7.39565331911419 A:G A G 10 0.533290718814845 0.164488766829630 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 18 21 39 8.40076706133279 11.1991050951117 -2.79833803377896 A:G A G 10 0.533290718814845 0.42340361941009 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 16 17 33 7.46734849896248 9.06594221985237 -1.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.604371642149387 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 9628284 A/C 1 123 86 209 57.4052415857741 45.8630018180767 11.5422397676974 A:C A C 10 0.533290718814845 0.111341545314438 ENSG00000134330:ENST00000482918:exon_9628276_9628573:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000497473:exon_9628276_9628940:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000470914:exon_9628276_9629871:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000492223:exon_9628276_9628586:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9628276_9628521:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000351760:exon_9628276_9628591:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000481688:exon_9628276_9628443:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000489468:exon_9628276_9628366:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000487850:exon_9628276_9628624:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000484826:exon_9628276_9628751:IAH1;ENSG00000134330:ENST00000490621:exon_9628274_9628521:IAH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10050947 T/C 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:G G T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 187 172 359 87.274635581624 91.7260036361533 -4.45136805452935 T:G T G 10 0.533290718814845 0.672234770626127 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 504 373 877 235.221477717318 198.917438117937 36.3040395993809 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0147818941584321 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 116 93 209 54.138276617478 49.5960368497806 4.54223976769739 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.533703260639298 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 122 109 231 56.9385323045889 58.1286883508181 -1.19015604622921 T:C C T 10 0.533290718814845 0.895182579953532 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 32 25 57 14.934696997925 13.3322679703711 1.60242902755383 T:C C T 10 0.533290718814845 0.692694828478224 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 15607842 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15607788_15607928:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15607788_15607928:NBAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 27 31 58 12.6011505919992 16.5320122832602 -3.93086169126101 T:C T C 10 0.533290718814845 0.35709200265136 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 A:G A G 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 T:C C T 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 24905927 G/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 C:G G C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24905820_24905997:NCOA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:G T G 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 42 35 77 19.6017898097765 18.6651751585196 0.936614651256935 T:C T C 10 0.533290718814845 0.909186845281978 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 19 37 56 8.86747634251794 19.7317565961493 -10.8642802536313 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00452370765630261 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 9 15 24 4.20038353066639 7.99936078222268 -3.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.15187969959101 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 96 83 179 44.8040909937749 44.2631296616321 0.540961332142743 A:G G A 10 0.533290718814845 0.940475096210116 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 57 49 106 26.6024290275538 26.1312452219274 0.471183805626424 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 27261956 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27261915_27262032:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27261915_27262032:TMEM214 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 20 18 38 9.3341856237031 9.59923293866721 -0.265047314964111 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 A:C C A 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 23 28 51 10.7343134672586 14.9321401268157 -4.1978266595571 A:C C A 10 0.533290718814845 0.262852457462748 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 52 44 96 24.2688826216281 23.4647916278532 0.804090993774878 A:G A G 10 0.533290718814845 0.918685362909552 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 22 28 50 10.2676041860734 14.9321401268157 -4.66453594074225 T:C T C 10 0.533290718814845 0.203469960167332 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 15 21 36 7.00063921777732 11.1991050951117 -4.19846587733442 T:G G T 10 0.533290718814845 0.182676991709835 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 28 34 62 13.0678598731843 18.1318844397047 -5.06402456652039 A:G A G 10 0.533290718814845 0.205285644389778 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 21 20 41 9.80089490488825 10.6658143762969 -0.864919471408646 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.875932341908383 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 118 98 216 55.0716951798483 52.2624904438548 2.80920473599348 T:C T C 10 0.533290718814845 0.733335650321773 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 52 46 98 24.2688826216281 24.5313730654829 -0.262490443854812 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 32772982 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:C:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32772917_32773081:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32772917_32773081:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32772917_32773081:BIRC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 33752479 G/A 1 30 37 67 14.0012784355546 19.7317565961493 -5.73047816059462 A:G G A 10 0.533290718814845 0.178436712719295 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33752204_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33752204_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33752204_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33752204_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000477927:exon_33752204_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33752248_33752479:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33752270_33752479:RASGRP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37076594 T/C 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000115808:ENST00000263918:exon_37070783_37076768:STRN;ENSG00000115808:ENST00000379213:exon_37075472_37076768:STRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 17 19 36 7.93405778014763 10.1325236574821 -2.19846587733442 A:G G A 10 0.533290718814845 0.506348385532759 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37464911 A/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G A G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37464900_37464978:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37464900_37464978:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000416653:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000469831:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37464900_37464978:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37464900_37465010:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000432075:exon_37464900_37465010:C2orf56 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 50 48 98 23.3354640592577 25.5979545031126 -2.26249044385481 A:G G A 10 0.533290718814845 0.68597466098618 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 A:G G A 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:C A C 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 14 25 39 6.53392993659217 13.3322679703711 -6.79833803377896 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0360267182088226 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 43797619 C/T 1 18 8 26 8.40076706133279 4.26632575051876 4.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.118061361205566 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43797527_43797654:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43797527_43797649:THADA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 A:G A G 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 43804229 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43804161_43804373:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43804161_43804373:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43804161_43804381:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43804161_43804381:THADA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 46987300 T/G 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 T:G T G 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 28 19 47 13.0678598731843 10.1325236574821 2.93533621570228 A:G A G 10 0.533290718814845 0.465351354718573 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 48010488 G/A 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 48030692 T/A 1 46 34 80 21.4686269345171 18.1318844397047 3.3367424948124 A:T:C T A 10 0.533290718814845 0.5020217234746 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 48602252 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170802:ENST00000340553:exon_48602059_48606433:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000304367:exon_48602059_48602582:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000495290:exon_48602059_48602289:FOXN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 A:T A T 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54035508 G/C 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 C:G G C 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 14 21 35 6.53392993659217 11.1991050951117 -4.66517515851958 A:G A G 10 0.533290718814845 0.128481094431021 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:T A T 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54150237 A/G 1 16 8 24 7.46734849896248 4.26632575051876 3.20102274844372 A:G A G 10 0.533290718814845 0.222733224438985 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54150186_54150255:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54150186_54150255:PSME4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 129 117 246 60.205497272885 62.3950141013369 -2.18951682845188 T:C C T 10 0.533290718814845 0.798447094051854 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 48 53 101 22.4020454968874 28.2644080971868 -5.86236260029935 T:C C T 10 0.533290718814845 0.272699556649355 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 36 36 72 16.8015341226656 19.1984658773344 -2.39693175466884 A:G G A 10 0.533290718814845 0.636955713330578 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 28 12 40 13.0678598731843 6.39948862577814 6.6683712474062 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0390411130925033 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 11 25 36 5.1338020930367 13.3322679703711 -8.19846587733442 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0070612267920545 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 53 36 89 24.7355919028132 19.1984658773344 5.53712602547879 A:G A G 10 0.533290718814845 0.244862116014403 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55771169 A/T 1 56 41 97 26.1357197463687 21.8649194714086 4.27080027496003 A:T A T 10 0.533290718814845 0.416357507810639 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55872538 T/C 1 16 39 55 7.46734849896248 20.798338033779 -13.3309895348165 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000358884520940541 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 55873592 G/A 1 31 16 47 14.4679877167398 8.53265150103752 5.93533621570228 A:G G A 10 0.533290718814845 0.106882776891827 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55873550_55873621:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55873550_55873621:PNPT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 30 27 57 14.0012784355546 14.3988494080008 -0.397570972446166 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 25 35 60 11.6677320296289 18.6651751585196 -6.9974431288907 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0917203056277665 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 61413723 A/G 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000173209:ENST00000491217:exon_61413581_61413910:AHSA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 79 65 144 36.8700332136272 34.6638967229649 2.20613649066232 A:G A G 10 0.533290718814845 0.73882349361464 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:G A G 10 0.533290718814845 0.320054568375534 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 12 17 29 5.60051137422186 9.06594221985237 -3.46543084563051 A:G A G 10 0.533290718814845 0.263838780597277 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 64321823 A/G 1 22 36 58 10.2676041860734 19.1984658773344 -8.93086169126101 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0244586965765444 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64319786_64322402:PELI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 64321885 G/C 1 27 33 60 12.6011505919992 17.5985937208899 -4.9974431288907 C:G G C 10 0.533290718814845 0.198846119966097 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64319786_64322402:PELI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 T:G G T 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 14 13 27 6.53392993659217 6.93277934459299 -0.398849408000816 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 68 67 135 31.7362311205905 35.7304781605946 -3.99424704000408 A:G G A 10 0.533290718814845 0.491759581983956 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G A G 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 20 29 49 9.3341856237031 15.4654308456305 -6.13124522192741 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0864751164309299 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:C T C 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 41 48 89 19.1350805285914 25.5979545031126 -6.46287397452121 A:G A G 10 0.533290718814845 0.202105928774558 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 295 260 555 137.679237949621 138.65558689186 -0.976348942238985 T:G G T 10 0.533290718814845 0.932263262263141 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 110 75 185 51.3380209303671 39.9968039111134 11.3412170192537 A:G G A 10 0.533290718814845 0.104844206858393 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 404 308 712 188.550549598803 164.253541394972 24.2970082038303 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0713640996814952 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 100 82 182 46.6709281185155 43.7298389428173 2.9410891756982 A:G G A 10 0.533290718814845 0.710436174653375 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 71297695 T/C 1 84 44 128 39.203579619553 23.4647916278532 15.7387879916998 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00584775326214177 ENSG00000124357:ENST00000497690:exon_71297632_71297749:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000434004:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000531934:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000465105:exon_71297632_71298149:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000480411:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71295780_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000533981:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71296108_71298957:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000464638:exon_71297430_71297969:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000428360:exon_71297632_71297716:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524736:exon_71297643_71297716:NAGK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 20 23 43 9.3341856237031 12.2656865327414 -2.93150090903834 A:C C A 10 0.533290718814845 0.445170226537947 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 97 63 160 45.27080027496 33.5973152853352 11.6734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0684256497552854 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 25 31 56 11.6677320296289 16.5320122832602 -4.86428025363132 A:C C A 10 0.533290718814845 0.227985169410488 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 73716810 G/A 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:G G A 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73716761_73717285:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 31 39 70 14.4679877167398 20.798338033779 -6.33035031703915 A:G A G 10 0.533290718814845 0.150357031772394 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 80 89 169 37.3367424948124 47.4628739745212 -10.1261314797088 A:T A T 10 0.533290718814845 0.123443765577550 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 75099477 A/T 1 14 3 17 6.53392993659217 1.59987215644454 4.93405778014763 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0256045468831271 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75099427_75099546:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75099427_75099546:HK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 C:G C G 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 10 6 16 4.66709281185155 3.19974431288907 1.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 0.617978371405662 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85549874 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85549017_85549881:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85549017_85549922:TGOLN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85573212 T/C 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85572636_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85573098_85573476:RETSAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 25 10 35 11.6677320296289 5.33290718814845 6.33482484148042 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0407658080747195 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 55 41 96 25.6690104651835 21.8649194714086 3.80409099377488 A:G A G 10 0.533290718814845 0.47462322462855 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 176 153 329 82.1408334885873 81.5934799786713 0.547353509915993 T:C C T 10 0.533290718814845 0.95601004150491 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 224 187 411 104.542878985475 99.725364418376 4.8175145670987 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.656497214998395 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 30 35 65 14.0012784355546 18.6651751585196 -4.66389672296492 A:G G A 10 0.533290718814845 0.264545629783848 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 86088311 T/C 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000115525:ENST00000393808:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393805:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000377332:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000525834:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393806:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000306262:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000455892:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000433665:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000473122:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000461892:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000461199:exon_86088304_86088415:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000484728:exon_86088045_86088415:ST3GAL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 86979093 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86979019_86979153:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000466417:exon_86979019_86979153:RMND5A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 83 71 154 38.7368703383679 37.863641035854 0.87322930251387 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.935687230269009 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 97749512 T/C 1 22 31 53 10.2676041860734 16.5320122832602 -6.26440809718678 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0982988670807729 ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97749320_97749554:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97749320_97749554:FAHD2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 99149946 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99149840_99149958:INPP4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:T T A 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 53 46 99 24.7355919028132 24.5313730654829 0.204218837330341 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 11 19 30 5.1338020930367 10.1325236574821 -4.99872156444535 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0979522717999928 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 18 39 57 8.40076706133279 20.798338033779 -12.3975709724462 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00124864331117273 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 13 19 32 6.06722065540701 10.1325236574821 -4.06530300207504 A:G A G 10 0.533290718814845 0.159963903652607 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 102984279 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 103001402 C/T 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000115604:ENST00000410040:exon_103001338_103001458:IL18R1;ENSG00000115604:ENST00000409599:exon_103001338_103001458:IL18R1;ENSG00000115604:ENST00000233957:exon_103001338_103001458:IL18R1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 109087563 C/G 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 C:G C G 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000409896:exon_109086107_109088572:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109086107_109088572:GCC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 10 3 13 4.66709281185155 1.59987215644454 3.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.101577760344088 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 109356978 G/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000469184:exon_109356945_109357137:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000437168:exon_109356945_109357137:RANBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 109429146 T/A 1 9 2 11 4.20038353066639 1.06658143762969 3.1338020930367 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0718773341081515 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109429087_109429164:CCDC138 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113496453 G/A 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113494184_113496625:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113495444_113496625:CKAP2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 58 60 118 27.069138308739 31.9974431288907 -4.92830482015171 T:C T C 10 0.533290718814845 0.406452516003014 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113940730 T/C 1 47 34 81 21.9353362157023 18.1318844397047 3.80345177599756 T:C T C 10 0.533290718814845 0.436430323341018 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 28 35 63 13.0678598731843 18.6651751585196 -5.59731528533523 C:G G C 10 0.533290718814845 0.166379725893306 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 29 36 65 13.5345691543695 19.1984658773344 -5.66389672296493 A:G A G 10 0.533290718814845 0.172396849263053 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 31 15 46 14.4679877167398 7.99936078222268 6.46862693451713 C:G G C 10 0.533290718814845 0.075035858709213 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 30 30 60 14.0012784355546 15.9987215644454 -1.9974431288907 T:C C T 10 0.533290718814845 0.607804278597764 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 42 22 64 19.6017898097765 11.7323958139266 7.86939399584992 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0594857802048098 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 20 17 37 9.3341856237031 9.06594221985237 0.268243403850734 T:C:G T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 20 21 41 9.3341856237031 11.1991050951117 -1.86491947140865 A:G A G 10 0.533290718814845 0.6393846277068 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 132241704 C/T 1 149 42 191 69.5396828965881 22.3982101902235 47.1414727063646 T:C C T 10 0.533290718814845 1.99211775815980e-12 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 132241731 T/C 1 245 60 305 114.343773890363 31.9974431288907 82.3463307614723 T:C T C 10 0.533290718814845 1.24198432278445e-22 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 3 28 31 1.40012784355546 14.9321401268157 -13.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 5.00929500273119e-07 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 10 15 25 4.66709281185155 7.99936078222268 -3.33226797037113 A:C A C 10 0.533290718814845 0.229281270563013 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 152317669 G/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152317652_152317803:RIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 36 18 54 16.8015341226656 9.59923293866721 7.20230118399837 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0559666403511675 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 44 34 78 20.5352083721468 18.1318844397047 2.40332393244209 A:T A T 10 0.533290718814845 0.650301763897422 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 32 15 47 14.934696997925 7.99936078222268 6.93533621570228 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0562284118864453 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 158290914 G/C 1 115 150 265 53.6715673362928 79.9936078222267 -26.3220404859339 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00133072514850050 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000418920:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000497432:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158290673_158290936:CYTIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160604379 C/T 1 44 50 94 20.5352083721468 26.6645359407423 -6.12932756859543 T:C C T 10 0.533290718814845 0.215811951461649 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 60 50 110 28.0025568711093 26.6645359407423 1.33802093036705 T:C C T 10 0.533290718814845 0.848646293699875 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160663678 T/C 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.634570222540065 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 73 84 157 34.0697775265163 44.796420380447 -10.7266428539307 A:G A G 10 0.533290718814845 0.093001547714193 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 53 46 99 24.7355919028132 24.5313730654829 0.204218837330341 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 66 58 124 30.8028125582202 30.930861691261 -0.128049133040783 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 28 29 57 13.0678598731843 15.4654308456305 -2.39757097244617 T:C C T 10 0.533290718814845 0.595881328481355 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 160743040 T/A 1 44 49 93 20.5352083721468 26.1312452219274 -5.59603684978059 A:T T A 10 0.533290718814845 0.254345061802284 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 163124026 T/C 1 120 108 228 56.0051137422186 57.5953976320033 -1.59028388978466 T:C T C 10 0.533290718814845 0.8424156604331 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 166758296 C/T 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000123607:ENST00000243344:exon_166758232_166758420:TTC21B;ENSG00000123607:ENST00000484129:exon_166758232_166758420:TTC21B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 22 27 49 10.2676041860734 14.3988494080008 -4.13124522192741 T:C T C 10 0.533290718814845 0.254165227677138 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 175436940 G/A 1 119 125 244 55.5384044610334 66.6613398518556 -11.1229353908222 A:G G A 10 0.533290718814845 0.158400620372816 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175436873_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 A:G G A 10 0.533290718814845 0.405642180428618 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 54 53 107 25.2023011839984 28.2644080971868 -3.06210691318842 T:C C T 10 0.533290718814845 0.562434865586975 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 49 56 105 22.8687547780726 29.8642802536313 -6.99552547555873 T:C C T 10 0.533290718814845 0.172585015538891 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 25 15 40 11.6677320296289 7.99936078222268 3.6683712474062 A:G A G 10 0.533290718814845 0.270060733145318 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 197183638 C/T 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000138411:ENST00000409111:exon_197183276_197184628:HECW2;ENSG00000138411:ENST00000260983:exon_197183276_197184628:HECW2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 90 88 178 42.0038353066639 46.9295832557064 -4.92574794904242 T:C T C 10 0.533290718814845 0.499107736904463 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 127 117 244 59.2720787105147 62.3950141013369 -3.12293539082219 A:G A G 10 0.533290718814845 0.70062440536129 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 98 116 214 45.7375095561452 61.861723382522 -16.1242138263768 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0283511256917232 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 2 9 11 0.93341856237031 4.79961646933361 -3.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0300816157817593 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198354993 T/C 1 145 267 412 67.6728457718475 142.388621923564 -74.7157761517161 T:C T C 10 0.533290718814845 1.53339610183799e-13 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198354921_198355020:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198354921_198355020:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000491249:exon_198354921_198355296:HSPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 327 330 657 152.613934947546 175.985937208899 -23.3720022613532 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0720115890040515 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 80 102 182 37.3367424948124 54.3956533191142 -17.0589108243018 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0115455681943935 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198365788 C/T 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000115541:ENST00000463841:exon_198365606_198365962:HSPE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 198570134 T/G 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:G T G 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 200790216 C/T 1 25 19 44 11.6677320296289 10.1325236574821 1.53520837214682 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.654449672943657 ENSG00000178074:ENST00000319974:exon_200789785_200792996:C2orf69 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 200813126 T/C 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000162971:ENST00000354611:exon_200813041_200813195:C2orf60;ENSG00000162971:ENST00000483328:exon_200813060_200813195:C2orf60;ENSG00000162971:ENST00000441832:exon_200813060_200813195:C2orf60;ENSG00000162971:ENST00000493181:exon_200806781_200813195:C2orf60 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 26 17 43 12.134441310814 9.06594221985237 3.06849909096166 A:G A G 10 0.533290718814845 0.363910342526798 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 201437214 A/G 1 25 18 43 11.6677320296289 9.59923293866721 2.06849909096166 A:G A G 10 0.533290718814845 0.545423020270265 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 19 19 38 8.86747634251794 10.1325236574821 -1.26504731496411 A:C C A 10 0.533290718814845 0.746072301092407 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 29 26 55 13.5345691543695 13.865558689186 -0.330989534816476 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 10 70 80 4.66709281185155 37.3303503170391 -32.6632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 4.50476090360843e-14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 42 40 82 19.6017898097765 21.3316287525938 -1.72983894281729 A:G A G 10 0.533290718814845 0.740436562184195 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 202139666 G/A 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000343290:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000450491:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392261:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000442304:exon_202139612_202139676:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000455604:exon_202139612_202139676:CASP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 47 50 97 21.9353362157023 26.6645359407423 -4.72919972503997 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.360416010530226 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 28 25 53 13.0678598731843 13.3322679703711 -0.264408097186786 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 T T 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 208424991 C/T 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000118260:ENST00000430624:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000236996:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000432329:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000353267:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000445803:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000421139:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000374397:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000494094:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000452474:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000414681:exon_208424950_208425072:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000480189:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000464407:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000448277:exon_208424950_208425096:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000457101:exon_208424950_208425096:CREB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 13 7 20 6.06722065540701 3.73303503170392 2.3341856237031 A:C C A 10 0.533290718814845 0.372254450678439 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 74 59 133 34.5364868077015 31.4641524100759 3.07233439762561 C:G C G 10 0.533290718814845 0.603380366773057 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 216211571 T/A 1 79 78 157 36.8700332136272 41.5966760675579 -4.72664285393066 A:T T A 10 0.533290718814845 0.47205388773046 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000446622:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000426233:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000479093:exon_216211482_216211664:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000467388:exon_216211482_216211963:ATIC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 216211682 G/C 1 5 17 22 2.33354640592577 9.06594221985237 -6.73239581392659 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00468689337050836 ENSG00000138363:ENST00000467388:exon_216211482_216211963:ATIC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 217364013 C/T 1 1551 1436 2987 723.866095118175 765.805472218117 -41.939377099942 A:T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.127986223480594 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363993_217366183:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000456586:exon_217363993_217364121:RPL37A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 46 41 87 21.4686269345171 21.8649194714086 -0.396292536891519 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 A:G G A 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 40 32 72 18.6683712474062 17.065303002075 1.60306824533116 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.724701462263727 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 28 19 47 13.0678598731843 10.1325236574821 2.93533621570228 A:G G A 10 0.533290718814845 0.465351354718573 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 24 35 59 11.2010227484437 18.6651751585196 -7.46415241007585 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0668350250231412 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220368810 G/A 1 25 19 44 11.6677320296289 10.1325236574821 1.53520837214682 A:G G A 10 0.533290718814845 0.654449672943657 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000435316:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220368805_220368935:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220368805_220370794:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000493655:exon_220368805_220368963:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373924:exon_220368805_220368939:GMPPA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220404458 G/A 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220405321 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 220480924 C/T 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220480766_220481173:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000494777:exon_220480766_220480934:AC009955.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 81 98 179 37.8034517759976 52.2624904438548 -14.4590386678573 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0356610467344872 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 223423491 C/G 1 129 141 270 60.205497272885 75.1939913528931 -14.9884940800082 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0767294117154452 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 110 110 220 51.3380209303671 58.6619790696329 -7.3239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.344278380816418 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 223520797 T/G 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:G T G 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223520735_223521056:FARSB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225670901 G/C 1 20 12 32 9.3341856237031 6.39948862577814 2.93469699792496 C:G G C 10 0.533290718814845 0.376239865171977 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225670843_225670954:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225684166 A/G 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225684163_225684246:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225709926 A/G 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225709920_225710041:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225727431 T/C 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225725297_225727463:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 225750861 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000471810:exon_225750798_225750902:DOCK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 61 61 122 28.4692661522945 32.5307338477055 -4.0614676954111 A:G G A 10 0.533290718814845 0.469275450481963 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 37 38 75 17.2682434038507 20.2650473149641 -2.99680391111338 C:G G C 10 0.533290718814845 0.490315448086252 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 33 43 76 15.4014062791101 22.9315009090383 -7.53009462992822 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0857662488555009 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231077676 G/A 1 34 46 80 15.8681155602953 24.5313730654829 -8.6632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.056844945780621 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C T C 10 0.533290718814845 0.237940889073470 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 76 65 141 35.4699053700718 34.6638967229649 0.80600864710685 A:G G A 10 0.533290718814845 0.932824644313173 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 29 24 53 13.5345691543695 12.7989772515563 0.735591902813214 T:C C T 10 0.533290718814845 0.89103389884831 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 28 18 46 13.0678598731843 9.59923293866721 3.46862693451713 T:C C T 10 0.533290718814845 0.375543968925051 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 25 11 36 11.6677320296289 5.8661979069633 5.80153412266558 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0652022155611181 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 84 101 185 39.203579619553 53.8623626002993 -14.6587829807463 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0325698687644558 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 232072912 T/C 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232072840_232072965:ARMC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 232320581 T/G 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:G T G 10 0.533290718814845 0.188395739495124 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 232320774 G/A 1 403 395 798 188.083840317617 210.649833931864 -22.5659936142463 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.110478048081349 ENSG00000115053:ENST00000322723:exon_232320721_232320847:NCL;ENSG00000115053:ENST00000392033:exon_232320721_232320847:NCL;ENSG00000115053:ENST00000322732:exon_232320721_232320847:NCL;ENSG00000115053:ENST00000461347:exon_232320721_232320847:NCL;ENSG00000115053:ENST00000356936:exon_232320721_232320847:NCL;ENSG00000115053:ENST00000466274:exon_232320721_232320847:NCL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 234091138 C/T 1 20 31 51 9.3341856237031 16.5320122832602 -7.19782665955709 T:C C T 10 0.533290718814845 0.049237418019671 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234091056_234091145:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000465281:exon_234091056_234091145:INPP5D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 31 26 57 14.4679877167398 13.865558689186 0.602429027553834 A:G G A 10 0.533290718814845 0.895220745244316 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 31 18 49 14.4679877167398 9.59923293866721 4.86875477807259 T:C C T 10 0.533290718814845 0.197434564772625 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 234201922 C/T 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000085978:ENST00000392017:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000373525:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392021:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000479942:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000347464:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000474148:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392020:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392018:exon_234201902_234202003:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000334050:exon_234201902_234201992:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000473865:exon_234201902_234202003:ATG16L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 28 18 46 13.0678598731843 9.59923293866721 3.46862693451713 T:C T C 10 0.533290718814845 0.375543968925051 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 68 75 143 31.7362311205905 39.9968039111134 -8.26057279052284 A:G A G 10 0.533290718814845 0.180038041657403 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 142 136 278 66.272717928292 72.5275377588189 -6.25481983052691 A:G A G 10 0.533290718814845 0.470930568489683 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 228 183 411 106.409716110215 97.5922015431166 8.81751456709868 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.400802837480005 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 238903399 G/A 1 21 11 32 9.80089490488825 5.8661979069633 3.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.214467789325282 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434137:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238903386_238903451:UBE2F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 3 9 12 1.40012784355546 4.79961646933361 -3.39948862577814 T:G G T 10 0.533290718814845 0.078661088597064 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 37 30 67 17.2682434038507 15.9987215644454 1.26952183940538 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.807159970223098 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 241492350 A/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000406958:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241492331_241494977:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000441168:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000462004:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000418708:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000418505:exon_241492331_241492474:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000464991:exon_241492159_241492474:ANKMY1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 65 54 119 30.3361032770351 28.7976988160016 1.53840446103344 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.783841071202734 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242066156 C/T 1 22 25 47 10.2676041860734 13.3322679703711 -3.06466378429772 T:C C T 10 0.533290718814845 0.384010799360323 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 22 32 54 10.2676041860734 17.065303002075 -6.79769881600163 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0756942398944153 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242066789 A/G 1 25 27 52 11.6677320296289 14.3988494080008 -2.73111737837194 A:G A G 10 0.533290718814845 0.48843843590873 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:T T A 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 C:G G C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 36 34 70 16.8015341226656 18.1318844397047 -1.33035031703915 T:C T C 10 0.533290718814845 0.810965509282555 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 26 7 33 12.134441310814 3.73303503170392 8.40140627911011 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00445754390246562 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 27 23 50 12.6011505919992 12.2656865327414 0.335464059257749 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 391025 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 63 81 144 29.4026847146648 43.1965482240024 -13.7938635093377 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0238983158947770 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C T C 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 72 69 141 33.6030682453312 36.7970595982243 -3.19399135289315 T:G T G 10 0.533290718814845 0.613102277846044 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 34 45 79 15.8681155602953 23.998082346668 -8.12996678637276 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0715303173600224 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 116 122 238 54.138276617478 65.0614676954111 -10.9231910779331 A:G A G 10 0.533290718814845 0.172369665248593 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 46 34 80 21.4686269345171 18.1318844397047 3.3367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.5020217234746 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 482 431 913 224.953873531245 229.848299809198 -4.8944262779535 T:C T C 10 0.533290718814845 0.765328405602323 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 2818801 T/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 9 16 25 4.20038353066639 8.53265150103752 -4.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.107687579177663 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 28 44 72 13.0678598731843 23.4647916278532 -10.3969317546688 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0175954156447607 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 47 38 85 21.9353362157023 20.2650473149641 1.67028890073817 A:G G A 10 0.533290718814845 0.745306999929633 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 3785507 G/A 1 28 33 61 13.0678598731843 17.5985937208899 -4.53073384770555 A:G G A 10 0.533290718814845 0.251069564242170 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3785468_3785884:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3785468_3785865:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3785468_3786757:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3785468_3786757:CDC25B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 3870124 G/C 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 C:G G C 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000125779:ENST00000316562:exon_3869742_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000336066:exon_3870036_3870375:PANK2;ENSG00000125779:ENST00000361370:exon_3870062_3870375:PANK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 35 39 74 16.3348248414804 20.798338033779 -4.46351319229853 A:G G A 10 0.533290718814845 0.351383230138518 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 31 45 76 14.4679877167398 23.998082346668 -9.53009462992822 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0292905685965963 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:C C A 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.595989802726756 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 13 4 17 6.06722065540701 2.13316287525938 3.93405778014763 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0859735969639128 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 10620386 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 31 29 60 14.4679877167398 15.4654308456305 -0.997443128890701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.797523718405806 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 13779113 T/C 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000477732:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13779107_13779146:C20orf7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 15967719 T/C 1 7 39 46 3.26696496829608 20.798338033779 -17.5313730654829 T:C T C 10 0.533290718814845 1.24950641300218e-07 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 10 2 12 4.66709281185155 1.06658143762969 3.60051137422186 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0436074830695437 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 18131563 T/C 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18131465_18131586:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18131465_18131586:CSRP2BP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 37 33 70 17.2682434038507 17.5985937208899 -0.330350317039155 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 20582457 A/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:C A C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20582326_20582490:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20582326_20582490:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20582326_20582490:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20582326_20582490:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000495793:exon_20582326_20582490:RALGAPA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 T:C T C 10 0.533290718814845 0.849549315863957 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 24994289 C/T 0 14 0 14 6.53392993659217 0 6.53392993659217 C C 10 0.533290718814845 0.000173748253997234 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 T:G G T 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 T:C T C 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 40 39 79 18.6683712474062 20.798338033779 -2.12996678637275 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.653176771737947 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 A:G A G 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 T:C T C 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 16 17 33 7.46734849896248 9.06594221985237 -1.59859372088989 A:G G A 10 0.533290718814845 0.604371642149387 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 73 81 154 34.0697775265163 43.1965482240024 -9.12677069748614 T:C C T 10 0.533290718814845 0.146475166618751 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 36639986 G/C 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36639917_36642305:TTI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 37194121 A/T 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:T A T 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000170471:ENST00000262879:exon_37194002_37194121:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397042:exon_37193999_37194121:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397038:exon_37193999_37194121:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397040:exon_37194002_37194121:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000438490:exon_37193999_37194121:RALGAPB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 T:C C T 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 40045231 G/C 1 12 5 17 5.60051137422186 2.66645359407423 2.93405778014763 C:G G C 10 0.533290718814845 0.223619859086185 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 40049349 C/T 1 20 13 33 9.3341856237031 6.93277934459299 2.40140627911011 T:C C T 10 0.533290718814845 0.486282104151889 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 40049586 T/C 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 40049873 T/C 1 7 14 21 3.26696496829608 7.46607006340783 -4.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0803254785566314 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 22 17 39 10.2676041860734 9.06594221985237 1.20166196622104 A:G G A 10 0.533290718814845 0.750054849407161 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42320881 C/T 1 33 88 121 15.4014062791101 46.9295832557064 -31.5281769765962 T:C C T 10 0.533290718814845 7.83533073204613e-09 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 67 116 183 31.2695218394054 61.861723382522 -30.5922015431166 A:G A G 10 0.533290718814845 7.31230369037748e-06 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 59 40 99 27.5358475899241 21.3316287525938 6.20421883733034 T:C C T 10 0.533290718814845 0.227506491352904 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 35 41 76 16.3348248414804 21.8649194714086 -5.53009462992822 A:C A C 10 0.533290718814845 0.208186261867363 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 30 30 60 14.0012784355546 15.9987215644454 -1.9974431288907 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.607804278597764 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 26 27 53 12.134441310814 14.3988494080008 -2.26440809718679 T:C T C 10 0.533290718814845 0.582879100091077 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44511533 G/A 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 22 20 42 10.2676041860734 10.6658143762969 -0.398210190223491 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 189 169 358 88.2080541439943 90.1261314797088 -1.91807733571451 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.873771393959418 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 44985295 C/T 1 1 11 12 0.466709281185155 5.8661979069633 -5.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00210032151024646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 41 35 76 19.1350805285914 18.6651751585196 0.469905370071778 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 47 51 98 21.9353362157023 27.1978266595571 -5.26249044385481 T:C T C 10 0.533290718814845 0.311793043781253 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 25 15 40 11.6677320296289 7.99936078222268 3.6683712474062 A:G A G 10 0.533290718814845 0.270060733145318 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 19 27 46 8.86747634251794 14.3988494080008 -5.53137306548287 A:G G A 10 0.533290718814845 0.106301157101412 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 C:G C G 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47269904 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269899_47270035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269899_47270035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269899_47270035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269899_47270035:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 19 15 34 8.86747634251794 7.99936078222268 0.868115560295269 T:C C T 10 0.533290718814845 0.86407496646472 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 20 28 48 9.3341856237031 14.9321401268157 -5.59795450311256 T:C C T 10 0.533290718814845 0.112960139826796 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 32 23 55 14.934696997925 12.2656865327414 2.66901046518352 A:G G A 10 0.533290718814845 0.501594937749716 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 33 25 58 15.4014062791101 13.3322679703711 2.06913830873899 A:G G A 10 0.533290718814845 0.601658109299094 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 C:G C G 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 10 18 28 4.66709281185155 9.59923293866721 -4.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0865211788782666 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 48259034 A/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G A G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48259005_48259121:B4GALT5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 A:T T A 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 52198967 A/G 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G A G 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 52645166 A/G 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 29 14 43 13.5345691543695 7.46607006340783 6.06849909096166 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0677298142398656 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:C C A 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 8 16 24 3.73367424948124 8.53265150103752 -4.79897725155628 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0642561142900687 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 268 222 490 125.078087357622 118.390539576896 6.68754778072595 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.556370788482388 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 69 65 134 32.2029404017757 34.6638967229649 -2.46095632118924 A:G A G 10 0.533290718814845 0.729246798538782 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:G G T 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 52 74 126 24.2688826216281 39.4635131922985 -15.1946305706705 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00726671294222707 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:C C A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 25 13 38 11.6677320296289 6.93277934459299 4.73495268503589 T:C C T 10 0.533290718814845 0.144001132582622 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 60776088 C/T 1 14 18 32 6.53392993659217 9.59923293866721 -3.06530300207504 T:C C T 10 0.533290718814845 0.292766499310502 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60775739_60777808:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60775739_60777823:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60775739_60777823:GTPBP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 13 3 16 6.06722065540701 1.59987215644454 4.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0414858195876844 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 61528074 T/C 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 10 16 26 4.66709281185155 8.53265150103752 -3.86555868918597 A:G A G 10 0.533290718814845 0.168136211013644 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 20 22 42 9.3341856237031 11.7323958139266 -2.39821019022349 T:C C T 10 0.533290718814845 0.536801824099167 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62194298 G/A 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62194713 A/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62195672 C/T 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C C T 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 7 14 21 3.26696496829608 7.46607006340783 -4.19910509511175 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0803254785566314 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62203748 G/A 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62203461_62204574:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62203461_62203808:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000479540:exon_62202038_62204574:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370082:exon_62203461_62204574:RP4-697K14.7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62236148 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62236096_62236255:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62236096_62236193:GMEB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 22 16 38 10.2676041860734 8.53265150103752 1.73495268503589 T:G T G 10 0.533290718814845 0.627896100180899 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 40 29 69 18.6683712474062 15.4654308456305 3.20294040177569 T:G G T 10 0.533290718814845 0.470725615279734 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62591172 G/A 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 A:G G A 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62588055_62591492:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62588055_62591492:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62588055_62591492:ZNF512B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62595169 A/G 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:G A G 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595142_62595266:ZNF512B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62597694 T/G 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:G T G 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62597494_62598134:ZNF512B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 14 34 48 6.53392993659217 18.1318844397047 -11.5979545031126 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000797420344925575 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 20 62896665 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000203880:ENST00000369758:exon_62896611_62896782:PCMTD2;ENSG00000203880:ENST00000308824:exon_62896611_62896782:PCMTD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 144 166 310 67.2061364906623 88.5262593232643 -21.320122832602 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0167054498828115 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 16339570 T/A 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 T T 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 ENSG00000180530:ENST00000400199:exon_16333556_16340847:NRIP1;ENSG00000180530:ENST00000400202:exon_16333556_16340847:NRIP1;ENSG00000180530:ENST00000318948:exon_16333556_16340847:NRIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 39 14 53 18.201661966221 7.46607006340783 10.7355919028132 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0034797638985161 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34128717 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34127524_34129105:GCFC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34707837 A/G 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:G A G 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000142166:ENST00000493503:exon_34707830_34707917:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34707830_34707953:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34707830_34707953:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34707830_34707953:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442071:exon_34707830_34707953:IFNAR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 40 28 68 18.6683712474062 14.9321401268157 3.73623112059054 C:G G C 10 0.533290718814845 0.396224406852941 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 45 50 95 21.001917653332 26.6645359407423 -5.66261828741028 A:G A G 10 0.533290718814845 0.258915551407998 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 28 39 67 13.0678598731843 20.798338033779 -7.73047816059461 T:C T C 10 0.533290718814845 0.066064610798206 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 63 73 136 29.4026847146648 38.9302224734837 -9.52753775881892 T:C T C 10 0.533290718814845 0.103259686496387 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 71 64 135 33.136358964146 34.1306060041501 -0.994247040004076 A:G G A 10 0.533290718814845 0.863560724332426 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38538018 T/C 1 44 57 101 20.5352083721468 30.3975709724462 -9.86236260029935 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0576811528813111 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38537852_38538053:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000487711:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000469939:exon_38537852_38538067:TTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 A:G G A 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38568215 C/T 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38568259 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 14 35 49 6.53392993659217 18.6651751585196 -12.1312452219274 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000517899430310902 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 38597878 C/T 1 36 36 72 16.8015341226656 19.1984658773344 -2.39693175466884 T:C C T 10 0.533290718814845 0.636955713330578 ENSG00000157538:ENST00000309117:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399000:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000497493:exon_38595721_38600107:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000288304:exon_38595728_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399001:exon_38597600_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000476950:exon_38597773_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000488368:exon_38597817_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000398998:exon_38597845_38597927:DSCR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G A G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 40571246 A/G 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G A G 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000446924:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40570689_40571588:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40570689_40571588:BRWD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 42749081 T/C 1 101 99 200 47.1376373997007 52.7957811626697 -5.658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.436187097347755 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 144 143 287 67.2061364906623 76.2605727905228 -9.05443629986053 T:C C T 10 0.533290718814845 0.287522216705163 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 1 1 8 9 0.466709281185155 4.26632575051876 -3.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0153431914750835 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 27 16 43 12.6011505919992 8.53265150103752 4.06849909096166 T:C T C 10 0.533290718814845 0.225340886150396 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 T:C T C 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 36 28 64 16.8015341226656 14.9321401268157 1.86939399584992 A:G A G 10 0.533290718814845 0.707584033276157 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45479055 C/T 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160218:ENST00000380221:exon_45478984_45479095:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45478984_45479095:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45478984_45479095:TRAPPC10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45648880 C/T 1 22 23 45 10.2676041860734 12.2656865327414 -1.99808234666803 T:C C T 10 0.533290718814845 0.554492200028458 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45750112 C/T 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 T:C C T 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 T:C T C 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 43 39 82 20.0684990909617 20.798338033779 -0.729838942817288 T:C C T 10 0.533290718814845 0.912079829173306 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 13 17 30 6.06722065540701 9.06594221985237 -2.99872156444535 A:G A G 10 0.533290718814845 0.279372965933084 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:C A C 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 A:G A G 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47705237 T/C 1 20 16 36 9.3341856237031 8.53265150103752 0.801534122665579 T:C T C 10 0.533290718814845 0.868029174100453 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000426537:exon_47704919_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000495475:exon_47705205_47705308:MCM3AP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47786524 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 A:G A G 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 19 14 33 8.86747634251794 7.46607006340783 1.40140627911011 A:G A G 10 0.533290718814845 0.728008888221575 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 24 22 46 11.2010227484437 11.7323958139266 -0.531373065482871 A:G G A 10 0.533290718814845 0.883679589246722 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:G A G 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 21 47970581 G/A 0 0 8 8 0 4.26632575051876 -4.26632575051876 A G A 10 0.533290718814845 0.00225097929524416 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47970456_47970657:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47970456_47970657:DIP2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:C C A 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 34 39 73 15.8681155602953 20.798338033779 -4.93022247348368 T:C T C 10 0.533290718814845 0.291065306765627 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 24 20 44 11.2010227484437 10.6658143762969 0.535208372146819 A:G A G 10 0.533290718814845 0.881448028362754 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19028643 C/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19028571_19028807:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19028571_19029472:DGCR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 T:C C T 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19318912 C/T 1 23 25 48 10.7343134672586 13.3322679703711 -2.59795450311256 T:C C T 10 0.533290718814845 0.472449978233469 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19318221_19319079:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19318221_19319079:HIRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19949952 A/G 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 29 18 47 13.5345691543695 9.59923293866721 3.93533621570228 C:G C G 10 0.533290718814845 0.306274336069742 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 20127032 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000099904:ENST00000436518:exon_20127001_20127158:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20127001_20127158:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20127001_20127158:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20127001_20127158:ZDHHC8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 20132700 C/T 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C C T 10 0.533290718814845 0.809088236970814 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 28 19 47 13.0678598731843 10.1325236574821 2.93533621570228 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.465351354718573 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 17 7 24 7.93405778014763 3.73303503170392 4.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.102355687793340 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 26 21 47 12.134441310814 11.1991050951117 0.935336215702284 T:C C T 10 0.533290718814845 0.884021485517194 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 34 31 65 15.8681155602953 16.5320122832602 -0.663896722964925 A:G A G 10 0.533290718814845 0.901469304606765 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 22277571 A/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22273793_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22273800_22277844:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000496143:exon_22277498_22277844:PPM1F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 23223278 A/T 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 23615844 C/T 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23615821_23615961:BCR;ENSG00000186716:ENST00000427791:exon_23615821_23615961:BCR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 24035129 C/T 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 T:C C T 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24034856_24035178:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24034856_24035178:RGL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 24035970 C/T 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24035946_24036161:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24035946_24036161:RGL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 112 87 199 52.2714394927374 46.3962925368915 5.87514695584584 A:G G A 10 0.533290718814845 0.434685162564245 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 T:C T C 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 3 9 12 1.40012784355546 4.79961646933361 -3.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.078661088597064 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 12 20 32 5.60051137422186 10.6658143762969 -5.06530300207504 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0783334510707375 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 23 14 37 10.7343134672586 7.46607006340783 3.26824340385073 T:C C T 10 0.533290718814845 0.32460132799244 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 29913301 A/G 1 18 7 25 8.40076706133279 3.73303503170392 4.66773202962887 A:G A G 10 0.533290718814845 0.071573023009701 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 30415938 G/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:G G T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000100330:ENST00000401950:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000333027:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000323630:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000351488:exon_30415469_30416873:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000406629:exon_30415469_30416873:MTMR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:G T G 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 29 10 39 13.5345691543695 5.33290718814845 8.20166196622104 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00956379143422153 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 30782089 A/G 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 A A 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000473077:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000431544:exon_30782059_30782130:RNF215 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 31655138 G/A 1 11 1 12 5.1338020930367 0.533290718814845 4.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0076572136047782 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31655107_31655216:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31655107_31655216:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31655107_31655216:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000333611:exon_31655107_31655216:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31655107_31655216:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000465937:exon_31654945_31655216:LIMK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 115 0 115 53.6715673362928 0 53.6715673362928 G G 10 0.533290718814845 4.31765256666306e-32 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 92 108 200 42.9372538690343 57.5953976320033 -14.658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0398452547263445 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 61 54 115 28.4692661522945 28.7976988160016 -0.328432663707179 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 16 8 24 7.46734849896248 4.26632575051876 3.20102274844372 T:G G T 10 0.533290718814845 0.222733224438985 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:G T G 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 C:G G C 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36537383 G/A 1 38 34 72 17.7349526850359 18.1318844397047 -0.396931754668842 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 39 24 63 18.201661966221 12.7989772515563 5.40268471466477 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.206527148550786 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 36 45 81 16.8015341226656 23.998082346668 -7.19654822400245 A:C C A 10 0.533290718814845 0.119251070983806 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 39 48 87 18.201661966221 25.5979545031126 -7.39629253689152 A:G G A 10 0.533290718814845 0.132110490893005 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 50 51 101 23.3354640592577 27.1978266595571 -3.86236260029935 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485416893791081 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 40 31 71 18.6683712474062 16.5320122832602 2.13635896414601 A:G G A 10 0.533290718814845 0.636026311421163 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 40 39 79 18.6683712474062 20.798338033779 -2.12996678637275 A:G A G 10 0.533290718814845 0.653176771737947 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 37319293 C/T 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37319286_37319409:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000421539:exon_37319286_37319409:CSF2RB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.117167394553238 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 37603051 C/T 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38046677 C/G 1 15 8 23 7.00063921777732 4.26632575051876 2.73431346725856 C:G C G 10 0.533290718814845 0.29943976246634 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 25 11 36 11.6677320296289 5.8661979069633 5.80153412266558 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0652022155611181 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 55 51 106 25.6690104651835 27.1978266595571 -1.52881619437357 T:C C T 10 0.533290718814845 0.771228277264707 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38084858 G/A 1 32 22 54 14.934696997925 11.7323958139266 3.20230118399837 A:G G A 10 0.533290718814845 0.415231142591696 ENSG00000100101:ENST00000493862:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000359114:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000438329:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000468597:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38084857_38084999:NOL12;ENSG00000100101:ENST00000484650:exon_38084857_38084999:NOL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 23 17 40 10.7343134672586 9.06594221985237 1.6683712474062 T:C C T 10 0.533290718814845 0.637263024103858 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38206092 C/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 C:G C G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38206034_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38206034_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38206034_38206164:GCAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 355 364 719 165.68179482073 194.117821648604 -28.4360268278736 T:C T C 10 0.533290718814845 0.036270268862946 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:G G T 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 38470938 C/T 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000100151:ENST00000404072:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000484021:exon_38470871_38471700:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000414087:exon_38470871_38471707:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000356976:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000426823:exon_38470871_38471139:PICK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 T:C T C 10 0.533290718814845 0.595989802726756 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 46 44 90 21.4686269345171 23.4647916278532 -1.99616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.674361050207166 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 A:G A G 10 0.533290718814845 0.838819395731248 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39715140 C/T 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39814765 G/C 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 C:G G C 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39814737_39814850:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39814737_39814850:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000464259:exon_39814644_39814850:TAB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 39883736 G/C 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 C:G G C 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000128268:ENST00000341184:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429786:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429402:exon_39883352_39883835:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000439236:exon_39883352_39885213:MGAT3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 40661410 G/A 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000100354:ENST00000454349:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000400140:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000429399:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000445835:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000335727:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000446273:exon_40661007_40663040:TNRC6B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 23 18 41 10.7343134672586 9.59923293866721 1.13508052859135 T:G G T 10 0.533290718814845 0.75649677321812 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 83 68 151 38.7368703383679 36.2637688794095 2.4731014589584 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.744375299412225 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 29 31 60 13.5345691543695 16.5320122832602 -2.9974431288907 A:G G A 10 0.533290718814845 0.441255350957587 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 33 16 49 15.4014062791101 8.53265150103752 6.86875477807259 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0617539687597957 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 53 37 90 24.7355919028132 19.7317565961493 5.00383530666394 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.341754018939605 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 43568512 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 36 22 58 16.8015341226656 11.7323958139266 5.06913830873899 A:G A G 10 0.533290718814845 0.190746328363524 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 25 25 50 11.6677320296289 13.3322679703711 -1.66453594074225 A:G A G 10 0.533290718814845 0.672246947389556 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 23 21 44 10.7343134672586 11.1991050951117 -0.464791627853181 T:C:G C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 32 16 48 14.934696997925 8.53265150103752 6.40204549688744 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0816111097016277 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 34 18 52 15.8681155602953 9.59923293866721 6.26888262162806 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.0950976867046335 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 46 66 112 21.4686269345171 35.1971874417798 -13.7285605072626 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0103709134168815 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 9 15 24 4.20038353066639 7.99936078222268 -3.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.15187969959101 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 60 47 107 28.0025568711093 25.0646637842977 2.93789308681158 A:C C A 10 0.533290718814845 0.628330462737009 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50655822 C/T 1 17 13 30 7.93405778014763 6.93277934459299 1.00127843555465 T:C C T 10 0.533290718814845 0.85522063684702 ENSG00000073169:ENST00000380903:exon_50655634_50656045:RP3-402G11.5;ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50655634_50656045:RP3-402G11.5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:T T A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 A:G G A 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50721492 C/T 1 9 14 23 4.20038353066639 7.46607006340783 -3.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.210865779148278 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50721479_50721615:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50721479_50721615:PLXNB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 14 7 21 6.53392993659217 3.73303503170392 2.80089490488825 T:C T C 10 0.533290718814845 0.276079092338444 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 27 12 39 12.6011505919992 6.39948862577814 6.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0537625376813641 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50898026 G/A 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50897899_50898095:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50897899_50898095:SBF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 12 18 30 5.60051137422186 9.59923293866721 -3.99872156444535 T:C C T 10 0.533290718814845 0.148463307294005 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 12 16 28 5.60051137422186 8.53265150103752 -2.93214012681566 A:G G A 10 0.533290718814845 0.34388687518086 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 72 68 140 33.6030682453312 36.2637688794095 -2.6607006340783 T:G T G 10 0.533290718814845 0.672485612608957 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 40 35 75 18.6683712474062 18.6651751585196 0.00319608888662515 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 44 35 79 20.5352083721468 18.6651751585196 1.87003321362725 A:G G A 10 0.533290718814845 0.735561777006558 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 21 41 62 9.80089490488825 21.8649194714086 -12.0640245665204 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0030859794696682 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 A:G A G 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 4712413 G/A 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000477577:exon_4712413_4712610:ITPR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 8794707 G/C 1 26 23 49 12.134441310814 12.2656865327414 -0.131245221927406 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8792094_8794910:OXTR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 7 16 23 3.26696496829608 8.53265150103752 -5.26568653274144 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0353055818003326 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 9425933 G/T 1 16 10 26 7.46734849896248 5.33290718814845 2.13444131081403 T:G G T 10 0.533290718814845 0.437744169351963 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 9879813 G/A 1 26 22 48 12.134441310814 11.7323958139266 0.402045496887439 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000156990:ENST00000423108:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9879534_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000464783:exon_9879566_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000466141:exon_9879578_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9879704_9879891:RPUSD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 63 49 112 29.4026847146648 26.1312452219274 3.27143949273736 T:C T C 10 0.533290718814845 0.570546527729005 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 10028289 G/C 1 39 29 68 18.201661966221 15.4654308456305 2.73623112059054 C:G G C 10 0.533290718814845 0.544722988837308 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10028191_10028804:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000487465:exon_10028191_10028522:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000429759:exon_10028191_10028366:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000470827:exon_10028191_10028586:TMEM111 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 23 24 47 10.7343134672586 12.7989772515563 -2.06466378429772 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56190185725608 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 33 31 64 15.4014062791101 16.5320122832602 -1.13060600415008 T:C C T 10 0.533290718814845 0.8030749022425 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 32 24 56 14.934696997925 12.7989772515563 2.13571974636868 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.594598583871987 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 21 22 43 9.80089490488825 11.7323958139266 -1.93150090903834 T:C T C 10 0.533290718814845 0.64711865874411 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 12475557 C/T 0 0 11 11 0 5.8661979069633 -5.8661979069633 T C T 10 0.533290718814845 0.000228828868409896 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 43 38 81 20.0684990909617 20.2650473149641 -0.196548224002445 A:T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 54 44 98 25.2023011839984 23.4647916278532 1.73750955614519 T:C C T 10 0.533290718814845 0.761928847651377 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 17 22 39 7.93405778014763 11.7323958139266 -3.79833803377896 T:G G T 10 0.533290718814845 0.261824116322687 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 25 24 49 11.6677320296289 12.7989772515563 -1.13124522192741 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.775955397216552 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 48 30 78 22.4020454968874 15.9987215644454 6.40332393244209 A:G G A 10 0.533290718814845 0.173009774280177 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 22 15 37 10.2676041860734 7.99936078222268 2.26824340385073 T:C C T 10 0.533290718814845 0.511957080843155 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13379412 G/A 1 30 16 46 14.0012784355546 8.53265150103752 5.46862693451713 A:G G A 10 0.533290718814845 0.138657079743941 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 47 39 86 21.9353362157023 20.798338033779 1.13699818192333 A:G A G 10 0.533290718814845 0.829640792272567 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 21 9 30 9.80089490488825 4.79961646933361 5.00127843555465 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0700334987114098 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 24 6 30 11.2010227484437 3.19974431288907 8.00127843555465 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00311769997951800 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 19 11 30 8.86747634251794 5.8661979069633 3.00127843555465 T:C T C 10 0.533290718814845 0.360513345000743 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15115478 C/T 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15117125 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000435849:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000426541:exon_15117113_15117217:ZFYVE20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15117154 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000435849:exon_15117113_15117217:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000426541:exon_15117113_15117217:ZFYVE20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15610070 C/T 1 11 19 30 5.1338020930367 10.1325236574821 -4.99872156444535 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0979522717999928 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:G G A 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 19 20 39 8.86747634251794 10.6658143762969 -1.79833803377896 C:G C G 10 0.533290718814845 0.631273578571673 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 357 351 708 166.6152133831 187.185042304011 -20.5698289209103 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.122643572909659 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 204 209 413 95.2086933617716 111.457760232303 -16.249066870531 A:C A C 10 0.533290718814845 0.114533578870500 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 16 10 26 7.46734849896248 5.33290718814845 2.13444131081403 T:G G T 10 0.533290718814845 0.437744169351963 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 23930669 T/C 1 158 165 323 73.7400664272545 87.9929686044494 -14.2529021771949 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.118417138318063 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23930603_23930707:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000467766:exon_23930603_23930917:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23930603_23930750:UBE2E1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 23932105 T/A 1 203 187 390 94.7419840805865 99.725364418376 -4.98338033778955 A:T T A 10 0.533290718814845 0.61229482695957 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23932000_23932805:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23932000_23932580:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23932000_23932363:UBE2E1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 27478899 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428179:exon_27478879_27479017:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428005:exon_27478879_27479017:SLC4A7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 38271881 C/T 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 T:C C T 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000172939:ENST00000446845:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000311806:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000426620:exon_38271856_38272184:OXSR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 125 86 211 58.3386601481444 45.8630018180767 12.4756583300677 T:C T C 10 0.533290718814845 0.097509532929629 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 12 18 30 5.60051137422186 9.59923293866721 -3.99872156444535 T:C C T 10 0.533290718814845 0.148463307294005 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 90 87 177 42.0038353066639 46.3962925368915 -4.39245723022757 A:G G A 10 0.533290718814845 0.546884761539262 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 41280827 C/T 1 84 59 143 39.203579619553 31.4641524100759 7.73942720947716 T:C C T 10 0.533290718814845 0.209029086334156 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41280625_41280844:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41280625_41281939:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000471014:exon_41280624_41280845:CTNNB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 45636542 C/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 46009487 G/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 103 96 199 48.071055962071 51.1959090062251 -3.12485304415416 T:C C T 10 0.533290718814845 0.670381909834594 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 110 75 185 51.3380209303671 39.9968039111134 11.3412170192537 T:G G T 10 0.533290718814845 0.104844206858393 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 22 17 39 10.2676041860734 9.06594221985237 1.20166196622104 A:G A G 10 0.533290718814845 0.750054849407161 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 83 70 153 38.7368703383679 37.3303503170391 1.40652002132872 T:C C T 10 0.533290718814845 0.871360298098188 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 21 15 36 9.80089490488825 7.99936078222268 1.80153412266558 A:G A G 10 0.533290718814845 0.617940298890809 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G A G 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 28 16 44 13.0678598731843 8.53265150103752 4.53520837214682 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.177691196348023 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 T:C T C 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 65 64 129 30.3361032770351 34.1306060041501 -3.79450272711501 T:C T C 10 0.533290718814845 0.537139119275137 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 51 48 99 23.8021733404429 25.5979545031126 -1.79578116266966 A:G G A 10 0.533290718814845 0.762825783056465 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 A:G A G 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 A:T T A 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 12 16 28 5.60051137422186 8.53265150103752 -2.93214012681566 T:G T G 10 0.533290718814845 0.34388687518086 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 50357869 A/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:C A C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50357000_50360213:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000481597:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000458018:exon_50357558_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000424190:exon_50357568_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000426286:exon_50357677_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000428028:exon_50357691_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000415028:exon_50357778_50357966:HYAL2;ENSG00000114383:ENST00000462137:exon_50357458_50357966:TUSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 52521920 C/T 1 24 15 39 11.2010227484437 7.99936078222268 3.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.338245160892478 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 53140879 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53140835_53140885:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53140835_53140885:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000471158:exon_53140835_53140885:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000467048:exon_53140835_53140885:RFT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 C:G C G 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 53 36 89 24.7355919028132 19.1984658773344 5.53712602547879 T:C C T 10 0.533290718814845 0.244862116014403 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 56 42 98 26.1357197463687 22.3982101902235 3.73750955614519 T:C C T 10 0.533290718814845 0.47946464965548 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 37 35 72 17.2682434038507 18.6651751585196 -1.39693175466884 T:C T C 10 0.533290718814845 0.813482581369031 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56763619 A/G 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G A G 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 C:G C G 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 56771251 A/C 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:C A C 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56771213_56771383:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56771213_56771383:ARHGEF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 64009102 G/T 1 130 100 230 60.6722065540701 53.3290718814845 7.34313467258564 T:G G T 10 0.533290718814845 0.355029097419555 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64008951_64009236:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64008951_64009148:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64008727_64009154:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64008951_64009132:PSMD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 67570954 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67570906_67571058:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67570906_67571058:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67570906_67571058:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000492795:exon_67570906_67571058:SUCLG2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 20 28 48 9.3341856237031 14.9321401268157 -5.59795450311256 T:C C T 10 0.533290718814845 0.112960139826796 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 24 33 57 11.2010227484437 17.5985937208899 -6.39757097244617 T:C T C 10 0.533290718814845 0.110468498707619 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 78717343 C/T 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000484514:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495961:exon_78717284_78717452:ROBO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 46 24 70 21.4686269345171 12.7989772515563 8.66964968296085 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0415259000252320 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 88188420 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 88189341 T/C 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 88190809 C/T 1 8 9 17 3.73367424948124 4.79961646933361 -1.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.634570222540065 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88190795_88193815:ZNF654 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 12 6 18 5.60051137422186 3.19974431288907 2.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 0.345887318058797 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 18 16 34 8.40076706133279 8.53265150103752 -0.131884439704731 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 39 32 71 18.201661966221 17.065303002075 1.13635896414601 T:C T C 10 0.533290718814845 0.812986580216494 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 98512540 G/A 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000064225:ENST00000483910:exon_98512519_98513206:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000469105:exon_98512519_98514098:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000462152:exon_98512519_98512788:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000486249:exon_98512519_98514689:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000497621:exon_98512519_98513237:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000493584:exon_98512519_98512839:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000394162:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000265261:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000474595:exon_98512519_98512609:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000491912:exon_98512519_98512636:ST3GAL6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 54 49 103 25.2023011839984 26.1312452219274 -0.928944037929039 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.92139985851819 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 100119548 T/C 1 32 27 59 14.934696997925 14.3988494080008 0.535847589924144 T:C T C 10 0.533290718814845 0.897187469558033 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100119470_100120242:TOMM70A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 64 47 111 29.8693939958499 25.0646637842977 4.8047302115522 T:C T C 10 0.533290718814845 0.392427431892815 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 67 52 119 31.2695218394054 27.7311173783719 3.53840446103344 C:G C G 10 0.533290718814845 0.522002591043558 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 105260518 G/A 1 15 4 19 7.00063921777732 2.13316287525938 4.86747634251794 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0358808714490029 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 11 2 13 5.1338020930367 1.06658143762969 4.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0262163998871804 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 29 38 67 13.5345691543695 20.2650473149641 -6.73047816059462 A:G A G 10 0.533290718814845 0.111503015410249 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 112299732 A/G 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 A:G A G 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 113164193 A/G 1 8 13 21 3.73367424948124 6.93277934459299 -3.19910509511175 A:G A G 10 0.533290718814845 0.191682202539152 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113161565_113164207:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000467618:exon_113164101_113164207:SPICE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 113165480 T/G 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113165436_113165523:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000467618:exon_113165436_113165523:SPICE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 113252042 C/T 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C C T 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113251143_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113251218_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113251402_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113252024_113252090:SIDT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 119013714 C/A 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:C C A 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119013220_119013851:ARHGAP31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 21 26 47 9.80089490488825 13.865558689186 -4.06466378429772 A:G G A 10 0.533290718814845 0.245379519834375 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 119134031 C/T 1 32 25 57 14.934696997925 13.3322679703711 1.60242902755383 T:C C T 10 0.533290718814845 0.692694828478224 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 22 24 46 10.2676041860734 12.7989772515563 -2.53137306548287 T:C C T 10 0.533290718814845 0.46414126978946 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 10 21 31 4.66709281185155 11.1991050951117 -6.5320122832602 A:T T A 10 0.533290718814845 0.0197437549469357 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 122 120 242 56.9385323045889 63.9948862577814 -7.0563539531925 A:G G A 10 0.533290718814845 0.367807046470858 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 145 98 243 67.6728457718475 52.2624904438548 15.4103553279927 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0535449304903577 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 49 57 106 22.8687547780726 30.3975709724462 -7.52881619437358 A:G G A 10 0.533290718814845 0.145502137450781 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 27 29 56 12.6011505919992 15.4654308456305 -2.86428025363132 T:C C T 10 0.533290718814845 0.503616760467259 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 16 11 27 7.46734849896248 5.8661979069633 1.60115059199918 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56889011730577 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 75 51 126 35.0031960888866 27.1978266595571 7.80536942932953 A:G A G 10 0.533290718814845 0.180547915471681 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 82 39 121 38.2701610571827 20.798338033779 17.4718230234038 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.00137970708652199 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 123634046 G/A 1 19 17 36 8.86747634251794 9.06594221985237 -0.198465877334421 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123634046_123634136:CCDC14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 4 11 15 1.86683712474062 5.8661979069633 -3.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0663814100243423 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:T T A 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 4 13 17 1.86683712474062 6.93277934459299 -5.06594221985237 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0152018826327138 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 18 7 25 8.40076706133279 3.73303503170392 4.66773202962887 T:C C T 10 0.533290718814845 0.071573023009701 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124739892 G/A 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124739636_124739974:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124739636_124739974:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G A G 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124746182 C/A 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 A:C C A 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 17 22 39 7.93405778014763 11.7323958139266 -3.79833803377896 T:C C T 10 0.533290718814845 0.261824116322687 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 126708453 T/C 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126707437_126708630:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126707502_126708630:PLXNA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 22 16 38 10.2676041860734 8.53265150103752 1.73495268503589 A:G G A 10 0.533290718814845 0.627896100180899 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 52 53 105 24.2688826216281 28.2644080971868 -3.99552547555873 T:C C T 10 0.533290718814845 0.436083049702127 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 348 330 678 162.414829852434 175.985937208899 -13.5711073564649 A:G G A 10 0.533290718814845 0.298927382820924 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 35 33 68 16.3348248414804 17.5985937208899 -1.26376887940946 T:C T C 10 0.533290718814845 0.80839253282432 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 56 45 101 26.1357197463687 23.998082346668 2.13763739970065 T:C C T 10 0.533290718814845 0.69107057644018 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 87 72 159 40.6037074631085 38.3969317546688 2.20677570843964 A:G G A 10 0.533290718814845 0.750974734481686 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 46 48 94 21.4686269345171 25.5979545031126 -4.12932756859543 T:C C T 10 0.533290718814845 0.409567556208258 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 129155726 C/A 1 52 48 100 24.2688826216281 25.5979545031126 -1.3290718814845 A:C C A 10 0.533290718814845 0.841317065769976 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 129155759 A/T 1 52 57 109 24.2688826216281 30.3975709724462 -6.12868835081811 A:T:C:G A T 10 0.533290718814845 0.250303639118868 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 130449222 A/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:G A G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 41 35 76 19.1350805285914 18.6651751585196 0.469905370071778 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 131102053 A/G 1 20 13 33 9.3341856237031 6.93277934459299 2.40140627911011 A:G A G 10 0.533290718814845 0.486282104151889 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 25 12 37 11.6677320296289 6.39948862577814 5.26824340385073 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0991230100602562 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 134851786 G/A 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488992:exon_134851634_134851891:EPHB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 12 12 24 5.60051137422186 6.39948862577814 -0.798977251556281 A:G G A 10 0.533290718814845 0.838819395731248 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 A:T T A 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 40 38 78 18.6683712474062 20.2650473149641 -1.59667606755791 T:G T G 10 0.533290718814845 0.734668403487352 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 141163655 G/A 1 47 41 88 21.9353362157023 21.8649194714086 0.0704167442936381 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 141163705 G/A 1 42 43 85 19.6017898097765 22.9315009090383 -3.32971109926183 A:G G A 10 0.533290718814845 0.514681239016508 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 141163975 G/A 1 74 83 157 34.5364868077015 44.2631296616321 -9.72664285393067 A:G G A 10 0.533290718814845 0.128652240395669 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 142281612 A/G 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142281074_142281951:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142281074_142281951:ATR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 23 0 23 10.7343134672586 0 10.7343134672586 G G 10 0.533290718814845 5.4945419159376e-07 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 19 19 38 8.86747634251794 10.1325236574821 -1.26504731496411 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.746072301092407 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 148786085 T/C 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 74 65 139 34.5364868077015 34.6638967229649 -0.127409915263463 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 40 21 61 18.6683712474062 11.1991050951117 7.46926615229445 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0715368726565124 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 150263928 C/T 1 303 273 576 141.412912199102 145.588366236453 -4.17545403735073 T:C C T 10 0.533290718814845 0.738430163865958 ENSG00000120742:ENST00000239944:exon_150263839_150264428:SERP1;ENSG00000120742:ENST00000479209:exon_150263839_150264964:SERP1;ENSG00000120742:ENST00000487153:exon_150263839_150264288:SERP1;ENSG00000120742:ENST00000491660:exon_150263839_150264286:SERP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 155571275 T/C 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000475842:exon_155571160_155571280:SLC33A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 105 81 186 49.0044745244413 43.1965482240024 5.80792630043882 A:G A G 10 0.533290718814845 0.41919599582557 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 2 9 11 0.93341856237031 4.79961646933361 -3.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0300816157817593 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 23 17 40 10.7343134672586 9.06594221985237 1.6683712474062 A:G G A 10 0.533290718814845 0.637263024103858 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 11 18 29 5.1338020930367 9.59923293866721 -4.46543084563051 T:C T C 10 0.533290718814845 0.135154616723988 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 158538056 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000477743:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465624:exon_158538004_158538115:MFSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 159997061 T/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:T T A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_159996981_159997152:RP11-432B6.3;ENSG00000068885:ENST00000326448:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000483465:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000496589:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000487943:exon_159996981_159997152:IFT80 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 14 20 34 6.53392993659217 10.6658143762969 -4.13188443970473 A:G A G 10 0.533290718814845 0.171377297838874 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 160243765 G/A 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000186432:ENST00000334256:exon_160243726_160243895:KPNA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 160804167 C/T 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000169255:ENST00000392779:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000320474:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000392780:exon_160801671_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000392781:exon_160801685_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000473285:exon_160802771_160804576:B3GALNT1;ENSG00000169255:ENST00000488170:exon_160803547_160804576:B3GALNT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 167745569 G/T 1 17 15 32 7.93405778014763 7.99936078222268 -0.0653030020750407 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167745516_167745625:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167745516_167745625:GOLIM4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 A:G G A 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 171965551 A/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000075420:ENST00000415807:exon_171965323_171965566:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000469491:exon_171965323_171965566:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000336824:exon_171965323_171965566:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000416957:exon_171965323_171965566:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000443501:exon_171965323_171965566:FNDC3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 179092989 C/T 1 9 2 11 4.20038353066639 1.06658143762969 3.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0718773341081515 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 28 26 54 13.0678598731843 13.865558689186 -0.797698816001631 T:G T G 10 0.533290718814845 0.891794035788955 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 109 89 198 50.8713116491819 47.4628739745212 3.40843767466068 T:C C T 10 0.533290718814845 0.669277821118082 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 183861802 C/T 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 18 26 44 8.40076706133279 13.865558689186 -5.46479162785318 A:G A G 10 0.533290718814845 0.129875042003903 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 183976103 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 184020542 G/T 1 26 33 59 12.134441310814 17.5985937208899 -5.46415241007586 T:G G T 10 0.533290718814845 0.191526469450478 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184020467_184020563:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184020467_184020560:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000491149:exon_184020467_184020611:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000460628:exon_184020528_184020611:PSMD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 60 51 111 28.0025568711093 27.1978266595571 0.804730211552204 T:C C T 10 0.533290718814845 0.924340949541722 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 A:C C A 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 186281851 G/A 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186281783_186282161:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186281783_186282161:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000413695:exon_186281783_186282161:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000430560:exon_186281783_186282134:TBCCD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 A:C C A 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 193336666 G/A 1 28 17 45 13.0678598731843 9.06594221985237 4.00191765333197 A:G G A 10 0.533290718814845 0.295575467568086 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392437:exon_193336658_193336709:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193336658_193336726:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193336658_193336725:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000497189:exon_193336616_193336725:OPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 34 15 49 15.8681155602953 7.99936078222268 7.86875477807259 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0307595739348403 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 33 15 48 15.4014062791101 7.99936078222268 7.40204549688744 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.0417632419653617 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 194387186 C/T 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 T:C C T 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 194387253 A/G 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 A:G A G 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 109 115 224 50.8713116491819 61.3284326637072 -10.4571210145253 T:C C T 10 0.533290718814845 0.180351631605562 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 196281104 A/C 1 12 21 33 5.60051137422186 11.1991050951117 -5.59859372088989 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0557963044248418 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 9 15 24 4.20038353066639 7.99936078222268 -3.79897725155628 T:C C T 10 0.533290718814845 0.15187969959101 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197421203 T/C 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 0.485824786386305 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 17 20 37 7.93405778014763 10.6658143762969 -2.73175659614927 A:G A G 10 0.533290718814845 0.411870513912263 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197432000 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197432029 C/A 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 52 44 96 24.2688826216281 23.4647916278532 0.804090993774878 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.918685362909552 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 16 7 23 7.46734849896248 3.73303503170392 3.73431346725856 A:G A G 10 0.533290718814845 0.144545033833458 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 1738974 C/T 1 24 18 42 11.2010227484437 9.59923293866721 1.60178980977651 T:C C T 10 0.533290718814845 0.646097759557107 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1738968_1739055:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1738968_1739055:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1738968_1739055:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1738968_1739055:TACC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 1986542 C/T 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:C C T 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000185049:ENST00000382882:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000467661:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000333877:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000416258:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000463820:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411638:exon_1986535_1986646:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000453740:exon_1986535_1986646:WHSC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 53 61 114 24.7355919028132 32.5307338477055 -7.79514194489234 A:G A G 10 0.533290718814845 0.159100345983451 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 39 38 77 18.201661966221 20.2650473149641 -2.06338534874306 A:G G A 10 0.533290718814845 0.649450236439366 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:C A C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 T:G G T 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 T:C T C 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 19 12 31 8.86747634251794 6.39948862577814 2.4679877167398 T:G T G 10 0.533290718814845 0.472223446301787 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 3149777 A/C 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 A:C A C 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3149732_3149934:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3149732_3149934:HTT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 21 15 36 9.80089490488825 7.99936078222268 1.80153412266558 A:G G A 10 0.533290718814845 0.617940298890809 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 58 44 102 27.069138308739 23.4647916278532 3.60434668088581 A:G A G 10 0.533290718814845 0.488991360927676 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 89 94 183 41.5371260254788 50.1293275685954 -8.59220154311664 A:C C A 10 0.533290718814845 0.208502297151635 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 4304337 C/T 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 4304522 A/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 4436514 G/C 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 C:G G C 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G A G 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 15 8 23 7.00063921777732 4.26632575051876 2.73431346725856 T:C C T 10 0.533290718814845 0.29943976246634 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:C A C 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 7 14 21 3.26696496829608 7.46607006340783 -4.19910509511175 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0803254785566314 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 25236017 T/C 1 19 4 23 8.86747634251794 2.13316287525938 6.73431346725856 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00550717574894312 ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25235597_25236053:PI4K2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 29 13 42 13.5345691543695 6.93277934459299 6.60178980977651 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0446168703942869 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 25363901 T/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:T T A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000168228:ENST00000450254:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000302874:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000507760:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000505412:exon_25363848_25363923:ZCCHC4;ENSG00000168228:ENST00000508058:exon_25363848_25363923:ZCCHC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 25417109 T/A 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 A:T:G T A 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25416774_25418220:ANAPC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 28 29 57 13.0678598731843 15.4654308456305 -2.39757097244617 T:C T C 10 0.533290718814845 0.595881328481355 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38023279 G/C 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 C:G G C 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38023294 G/A 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 130 188 318 60.6722065540701 100.258655137191 -39.5864485831207 A:G A G 10 0.533290718814845 1.05797132654248e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 105 128 233 49.0044745244413 68.2612120083002 -19.2567374838589 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.0124881705922520 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 99 112 211 46.2042188373303 59.7285605072626 -13.5243416699323 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0627970584360537 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 99 82 181 46.2042188373303 43.7298389428173 2.47437989451305 T:G T G 10 0.533290718814845 0.765822121555168 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 92 93 185 42.9372538690343 49.5960368497806 -6.65878298074633 A:C:G C A 10 0.533290718814845 0.338655548612846 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 101 154 255 47.1376373997007 82.1267706974861 -34.9891332977855 T:G T G 10 0.533290718814845 1.32937147690000e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 28 18 46 13.0678598731843 9.59923293866721 3.46862693451713 T:C T C 10 0.533290718814845 0.375543968925051 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 26 15 41 12.134441310814 7.99936078222268 4.13508052859135 C:G G C 10 0.533290718814845 0.21323398375524 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38830116 C/T 1 21 15 36 9.80089490488825 7.99936078222268 1.80153412266558 T:C C T 10 0.533290718814845 0.617940298890809 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 38830736 A/G 1 19 9 28 8.86747634251794 4.79961646933361 4.06785987318434 A:G A G 10 0.533290718814845 0.133620819103613 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000508254:exon_38830644_38831158:TLR6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 12 15 27 5.60051137422186 7.99936078222268 -2.39884940800082 T:C T C 10 0.533290718814845 0.441204288626119 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 39463903 C/A 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 A:C C A 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000424936:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39463816_39463909:LIAS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 18 18 36 8.40076706133279 9.59923293866721 -1.19846587733442 A:G A G 10 0.533290718814845 0.739850891543775 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 41015823 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 41015899 C/T 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 42545955 T/C 1 15 8 23 7.00063921777732 4.26632575051876 2.73431346725856 T:C T C 10 0.533290718814845 0.29943976246634 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42545934_42546003:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42545934_42546003:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42545934_42546003:ATP8A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 47455227 G/A 1 21 21 42 9.80089490488825 11.1991050951117 -1.39821019022349 A:G G A 10 0.533290718814845 0.757581136379853 ENSG00000169019:ENST00000306848:exon_47455076_47455231:COMMD8;ENSG00000169019:ENST00000381571:exon_47455076_47455231:COMMD8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 48582909 G/A 1 3 9 12 1.40012784355546 4.79961646933361 -3.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.078661088597064 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507711:exon_48582882_48582968:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000506685:exon_48582473_48582968:FRYL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 56874517 A/C 1 20 7 27 9.3341856237031 3.73303503170392 5.60115059199918 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0338526511911295 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56874493_56874548:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56874493_56874548:CEP135 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 52 57 109 24.2688826216281 30.3975709724462 -6.12868835081811 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.250303639118868 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 49 59 108 22.8687547780726 31.4641524100759 -8.59539763200326 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101689462565178 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:G G A 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 31 18 49 14.4679877167398 9.59923293866721 4.86875477807259 A:G G A 10 0.533290718814845 0.197434564772625 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 76695927 A/G 1 24 36 60 11.2010227484437 19.1984658773344 -7.9974431288907 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0513602597105057 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76695829_76695949:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76695829_76695949:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76695829_76695949:USO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 50 30 80 23.3354640592577 15.9987215644454 7.3367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.116410123818509 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 54 62 116 25.2023011839984 33.0640245665204 -7.86172338252202 A:G G A 10 0.533290718814845 0.162595617105334 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 83381295 C/T 1 49 43 92 22.8687547780726 22.9315009090383 -0.062746130965742 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000145293:ENST00000273920:exon_83381134_83382244:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000509635:exon_83381134_83382208:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000505846:exon_83381134_83382240:ENOPH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 5 15 20 2.33354640592577 7.99936078222268 -5.6658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0129330699667908 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:G A G 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 89649659 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000138640:ENST00000395002:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000264344:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000341818:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511573:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000509478:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000503556:exon_89648577_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511976:exon_89648580_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000508369:exon_89648806_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000513837:exon_89649330_89649810:FAM13A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95129734 A/C 1 14 19 33 6.53392993659217 10.1325236574821 -3.59859372088989 A:C A C 10 0.533290718814845 0.225573054676117 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95129497_95129735:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95129497_95129735:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95129497_95129735:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95129497_95129735:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95129497_95129735:SMARCAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95170839 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95170805_95170906:SMARCAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 18 13 31 8.40076706133279 6.93277934459299 1.4679877167398 T:C T C 10 0.533290718814845 0.719561819758413 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 7 18 25 3.26696496829608 9.59923293866721 -6.33226797037113 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0147410457986700 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 102117083 C/T 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000138814:ENST00000512215:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000394854:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000323055:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000394853:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000523694:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000528620:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000509183:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000492351:exon_102117073_102117085:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000529324:exon_102117073_102117273:PPP3CA;ENSG00000138814:ENST00000525819:exon_102117073_102117273:PPP3CA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 14 19 33 6.53392993659217 10.1325236574821 -3.59859372088989 A:G A G 10 0.533290718814845 0.225573054676117 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 107249244 C/G 1 57 61 118 26.6024290275538 32.5307338477055 -5.92830482015172 C:G C G 10 0.533290718814845 0.310167691710153 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.171748761798993 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 17 20 37 7.93405778014763 10.6658143762969 -2.73175659614927 A:G G A 10 0.533290718814845 0.411870513912263 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 45 42 87 21.001917653332 22.3982101902235 -1.39629253689152 T:C T C 10 0.533290718814845 0.830017800506069 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 144 138 282 67.2061364906623 73.5941191964486 -6.3879827057863 A:T A T 10 0.533290718814845 0.473965112636845 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 110605781 A/G 1 162 155 317 75.6069035519951 82.660061416301 -7.05315786430587 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.431216964070846 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 208 83 291 97.0755304865122 44.2631296616321 52.8124008248801 A:G A G 10 0.533290718814845 3.06821813879873e-10 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 6 14 20 2.80025568711093 7.46607006340783 -4.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0435114486167702 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 6 13 19 2.80025568711093 6.93277934459299 -4.13252365748206 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0669886965950056 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 4 16 20 1.86683712474062 8.53265150103752 -6.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00302762945772935 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 1 7 8 0.466709281185155 3.73303503170392 -3.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0293698630550817 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113360925 G/A 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113360842_113361028:ALPK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.129891076919026 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 119610606 A/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000145388:ENST00000388822:exon_119610525_119610612:METTL14;ENSG00000145388:ENST00000506780:exon_119610525_119610623:METTL14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 119652606 G/T 1 32 17 49 14.934696997925 9.06594221985237 5.86875477807259 T:G G T 10 0.533290718814845 0.114626701885464 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119652471_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511715:exon_119650277_119652662:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119652435_119652662:SEC24D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 142155133 A/C 1 91 84 175 42.4705445878491 44.796420380447 -2.32587579259788 A:C A C 10 0.533290718814845 0.762008140507118 ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142154869_142155851:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142154869_142155250:ZNF330 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 63 70 133 29.4026847146648 37.3303503170391 -7.92766560237438 T:C C T 10 0.533290718814845 0.192207393473688 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 146823487 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000151612:ENST00000508784:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000379448:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000281318:exon_146823318_146824367:ZNF827;ENSG00000151612:ENST00000440280:exon_146823318_146824367:ZNF827 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 148787875 T/C 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148787863_148787967:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148787863_148787967:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148782134_148787967:ARHGAP10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 154276856 A/G 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 A:G A G 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 22 6 28 10.2676041860734 3.19974431288907 7.06785987318434 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00751312587015301 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 61 73 134 28.4692661522945 38.9302224734837 -10.4609563211892 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0829660834692873 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 156617994 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515602:exon_156617908_156618001:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156617958_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156617908_156618212:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156617908_156618274:GUCY1A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 70 52 122 32.6696496829609 27.7311173783719 4.93853230458891 T:G G T 10 0.533290718814845 0.414300110703691 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 10 10 20 4.66709281185155 5.33290718814845 -0.6658143762969 T:C C T 10 0.533290718814845 0.824923408120412 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 54 45 99 25.2023011839984 23.998082346668 1.20421883733034 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.840812535551802 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 31 50 81 14.4679877167398 26.6645359407423 -12.1965482240024 A:T:C:G A C 10 0.533290718814845 0.00732467426402935 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 63 66 129 29.4026847146648 35.1971874417798 -5.79450272711501 T:C T C 10 0.533290718814845 0.331987836991526 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 169197297 C/T 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169197166_169197332:DDX60 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 170037572 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170037420_170037781:SH3RF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 170077789 A/G 1 16 14 30 7.46734849896248 7.46607006340783 0.00127843555464935 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170077555_170077830:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170077555_170077808:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170077555_170077830:SH3RF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 178274694 T/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 178274835 A/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:C A C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178274462_178274882:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178274462_178275433:NEIL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 184600571 C/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 48 52 100 22.4020454968874 27.7311173783719 -5.3290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.316444681194066 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 25 30 55 11.6677320296289 15.9987215644454 -4.33098953481648 T:C C T 10 0.533290718814845 0.279907385976551 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 63 58 121 29.4026847146648 30.930861691261 -1.52817697659625 T:C T C 10 0.533290718814845 0.785397685221238 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 53 46 99 24.7355919028132 24.5313730654829 0.204218837330341 A:C:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 186231888 G/A 1 31 24 55 14.4679877167398 12.7989772515563 1.66901046518352 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686962440542434 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186231789_186231970:SNX25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 38 17 55 17.7349526850359 9.06594221985237 8.66901046518352 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0211791271040178 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 32 20 52 14.934696997925 10.6658143762969 4.26888262162806 T:C C T 10 0.533290718814845 0.267177643463525 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 15 23 38 7.00063921777732 12.2656865327414 -5.26504731496411 C:G G C 10 0.533290718814845 0.103701712276299 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 39 33 72 18.201661966221 17.5985937208899 0.603068245331158 A:G G A 10 0.533290718814845 0.906562190026698 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 462465 C/A 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:C C A 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_462272_462644:EXOC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 6 14 20 2.80025568711093 7.46607006340783 -4.6658143762969 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0435114486167702 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 11 18 29 5.1338020930367 9.59923293866721 -4.46543084563051 A:C A C 10 0.533290718814845 0.135154616723988 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 21 26 47 9.80089490488825 13.865558689186 -4.06466378429772 T:C C T 10 0.533290718814845 0.245379519834375 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 A:C C A 10 0.533290718814845 0.130289799158052 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6633042 C/T 1 8 21 29 3.73367424948124 11.1991050951117 -7.46543084563051 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00800557351404291 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6632997_6633155:NSUN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 C:G C G 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 6739845 C/T 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6739845_6739965:PAPD7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 10227548 C/A 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:C C A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10226442_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10226845_10227759:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10227068_10227759:FAM173B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C C T 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 10403611 A/G 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 A:G A G 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10403519_10403653:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10403519_10403653:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10403519_10403653:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10403519_10403653:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10403519_10403653:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000510792:exon_10403519_10403653:MARCH6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 10761182 A/G 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000112977:ENST00000230895:exon_10761126_10761384:DAP;ENSG00000112977:ENST00000360512:exon_10761126_10761344:DAP;ENSG00000112977:ENST00000432074:exon_10761126_10761340:DAP;ENSG00000112977:ENST00000514882:exon_10761126_10761248:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508253:exon_10761126_10761337:DAP;ENSG00000112977:ENST00000510546:exon_10761126_10761311:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508646:exon_10761126_10761213:DAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 3 11 14 1.40012784355546 5.8661979069633 -4.46607006340783 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0282747514932721 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 14508347 A/T 1 20 17 37 9.3341856237031 9.06594221985237 0.268243403850734 A:T A T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14507989_14510313:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14507989_14508785:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14507989_14510312:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14507989_14508442:TRIO HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 19 10 29 8.86747634251794 5.33290718814845 3.53456915436949 A:G A G 10 0.533290718814845 0.198901950501575 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 31526371 T/C 1 7 13 20 3.26696496829608 6.93277934459299 -3.6658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.118460995463565 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512076:exon_31526186_31526527:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000512302:exon_31526186_31526433:DROSHA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 93 74 167 43.4039631502194 39.4635131922985 3.94044995792088 A:G G A 10 0.533290718814845 0.587377577767641 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 33998768 C/A 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:C C A 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 34004707 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34004679_34004839:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34004679_34004839:AMACR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 13 17 30 6.06722065540701 9.06594221985237 -2.99872156444535 T:C C T 10 0.533290718814845 0.279372965933084 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 36195363 A/G 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000152620:ENST00000397338:exon_36192694_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000404560:exon_36192987_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000282512:exon_36193815_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000381937:exon_36194332_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000511613:exon_36194924_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000506945:exon_36195088_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000502355:exon_36195090_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000509225:exon_36195164_36195384:C5orf33;ENSG00000152620:ENST00000514504:exon_36195246_36195384:C5orf33 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 36986170 G/A 1 34 35 69 15.8681155602953 18.6651751585196 -2.7970595982243 A:G G A 10 0.533290718814845 0.546988270643262 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 26 20 46 12.134441310814 10.6658143762969 1.46862693451713 C:G G C 10 0.533290718814845 0.768000285226431 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 C:G G C 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 56177743 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 56178217 A/C 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:C A C 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 58 56 114 27.069138308739 29.8642802536313 -2.79514194489233 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.639198071613337 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 61772535 G/T 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:G G T 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61772510_61772580:IPO11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 42 46 88 19.6017898097765 24.5313730654829 -4.92958325570636 T:C T C 10 0.533290718814845 0.336338813478985 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 22 35 57 10.2676041860734 18.6651751585196 -8.39757097244616 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0328316284895773 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 19 25 44 8.86747634251794 13.3322679703711 -4.46479162785318 A:G G A 10 0.533290718814845 0.226369615898200 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 13 39 52 6.06722065540701 20.798338033779 -14.7311173783719 T:C T C 10 0.533290718814845 3.96449151793026e-05 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 66479189 G/A 1 10 39 49 4.66709281185155 20.798338033779 -16.1312452219274 A:G G A 10 0.533290718814845 4.12368111513673e-06 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 67589188 C/T 1 12 4 16 5.60051137422186 2.13316287525938 3.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 0.130289799158052 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521409:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588929_67589220:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517698:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000519025:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523872:exon_67589131_67589311:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000520550:exon_67589131_67589311:PIK3R1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 68411954 C/T 1 55 23 78 25.6690104651835 12.2656865327414 13.4033239324421 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00292182166702749 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68411753_68412041:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68411753_68412041:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68411753_68412041:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68411753_68412041:SLC30A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 T:C C T 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 27 32 59 12.6011505919992 17.065303002075 -4.46415241007586 A:T A T 10 0.533290718814845 0.296507662954318 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 26 34 60 12.134441310814 18.1318844397047 -5.9974431288907 A:G A G 10 0.533290718814845 0.122839959422839 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 68616331 C/T 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000460090:exon_68616292_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68616292_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 20 10 30 9.3341856237031 5.33290718814845 4.00127843555465 A:G G A 10 0.533290718814845 0.199457099473175 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 14 9 23 6.53392993659217 4.79961646933361 1.73431346725856 A:T T A 10 0.533290718814845 0.534727298566928 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70849021 G/T 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 T:G G T 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70848943_70849147:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 16 4 20 7.46734849896248 2.13316287525938 5.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0227710047408782 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 42 37 79 19.6017898097765 19.7317565961493 -0.129966786372758 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 21 18 39 9.80089490488825 9.59923293866721 0.201661966221044 A:T A T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 20 9 29 9.3341856237031 4.79961646933361 4.53456915436949 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0972683129036133 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 6 19 25 2.80025568711093 10.1325236574821 -7.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00416046693546954 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 73931246 T/C 1 5 20 25 2.33354640592577 10.6658143762969 -8.33226797037113 T:C T C 10 0.533290718814845 0.000954130986163184 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 73932315 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000508331:exon_73932162_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000509127:exon_73932299_73932323:ENC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 18 16 34 8.40076706133279 8.53265150103752 -0.131884439704731 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 74046464 C/T 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 T:C C T 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74046404_74046492:GFM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 176 189 365 82.1408334885873 100.791945856006 -18.6511123674184 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0522764855793911 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 202 221 423 94.2752747994013 117.857248858081 -23.5819740586794 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0220156889557303 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 47 50 97 21.9353362157023 26.6645359407423 -4.72919972503997 A:G G A 10 0.533290718814845 0.360416010530226 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 15 3 18 7.00063921777732 1.59987215644454 5.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0156326994729822 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 T:C T C 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 75906851 T/C 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 T:C T C 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504254:exon_75906845_75907008:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000513534:exon_75906845_75907008:IQGAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C C T 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 26 15 41 12.134441310814 7.99936078222268 4.13508052859135 T:C C T 10 0.533290718814845 0.21323398375524 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 79966029 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79965916_79966128:MSH3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 70 44 114 32.6696496829609 23.4647916278532 9.20485805510767 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0911625203269963 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 26 36 62 12.134441310814 19.1984658773344 -7.06402456652039 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0757105796556385 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 37 28 65 17.2682434038507 14.9321401268157 2.33610327703507 A:G A G 10 0.533290718814845 0.619765501230077 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 T:C T C 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95084131 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000506959:exon_95084037_95084145:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000510623:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95084037_95084191:RHOBTB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 85 70 155 39.6702889007382 37.3303503170391 2.33993858369902 A:G A G 10 0.533290718814845 0.747683815043798 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 31 11 42 14.4679877167398 5.8661979069633 8.60178980977651 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00816386722138139 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 40 18 58 18.6683712474062 9.59923293866721 9.06913830873899 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0177172956355596 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 36 12 48 16.8015341226656 6.39948862577814 10.4020454968874 A:C A C 10 0.533290718814845 0.00335949649088245 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 30 27 57 14.0012784355546 14.3988494080008 -0.397570972446166 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 18 16 34 8.40076706133279 8.53265150103752 -0.131884439704731 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 0 59 0 59 27.5358475899241 0 27.5358475899241 G G 10 0.533290718814845 1.46318818362692e-16 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 38 26 64 17.7349526850359 13.865558689186 3.86939399584992 C:G G C 10 0.533290718814845 0.381021207225016 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 33 10 43 15.4014062791101 5.33290718814845 10.0684990909617 T:G T G 10 0.533290718814845 0.00199641386163507 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 16 3 19 7.46734849896248 1.59987215644454 5.86747634251794 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00945535815044814 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96118866 C/T 1 22 7 29 10.2676041860734 3.73303503170392 6.53456915436949 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0154165479323067 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 83 16 99 38.7368703383679 8.53265150103752 30.2042188373303 T:C C T 10 0.533290718814845 2.17790907111287e-10 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96122210 C/T 1 26 13 39 12.134441310814 6.93277934459299 5.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.109011514501541 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96122174_96122253:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 24 24 48 11.2010227484437 12.7989772515563 -1.59795450311256 T:C T C 10 0.533290718814845 0.666538693127673 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 38 20 58 17.7349526850359 10.6658143762969 7.06913830873899 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0661904604793314 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 20 9 29 9.3341856237031 4.79961646933361 4.53456915436949 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0972683129036133 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96129535 T/C 1 18 6 24 8.40076706133279 3.19974431288907 5.20102274844372 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0398768409185772 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 27 2 29 12.6011505919992 1.06658143762969 11.5345691543695 T:G G T 10 0.533290718814845 5.59319707903927e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 36 2 38 16.8015341226656 1.06658143762969 15.7349526850359 A:T T A 10 0.533290718814845 2.77236847988595e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 19 1 20 8.86747634251794 0.533290718814845 8.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000129421987640166 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 46 1 47 21.4686269345171 0.533290718814845 20.9353362157023 T:C C T 10 0.533290718814845 6.60195024068621e-12 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 26 1 27 12.134441310814 0.533290718814845 11.6011505919992 T:C C T 10 0.533290718814845 1.61416619184958e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 110079450 T/C 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164209:ENST00000508781:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000505422:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000447245:exon_110079431_110079488:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110079431_110079488:SLC25A46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 27 41 68 12.6011505919992 21.8649194714086 -9.26376887940946 A:G G A 10 0.533290718814845 0.028251035185179 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 17 11 28 7.93405778014763 5.8661979069633 2.06785987318434 C:G C G 10 0.533290718814845 0.456041150831043 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 10 15 25 4.66709281185155 7.99936078222268 -3.33226797037113 A:T A T 10 0.533290718814845 0.229281270563013 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 C:G G C 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 111497330 C/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:C C A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112175770 G/A 1 11 5 16 5.1338020930367 2.66645359407423 2.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 0.316573818173034 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112176325 G/A 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112176559 T/G 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112328377 A/G 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000512751:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000502635:exon_112328369_112328467:DCP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112889374 G/A 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G G A 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112889287_112889383:YTHDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112926755 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112926738_112926941:YTHDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 21 19 40 9.80089490488825 10.1325236574821 -0.331628752593801 A:T T A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 181 227 408 84.474379894513 121.05699317097 -36.5826132764568 C:G G C 10 0.533290718814845 0.000342061142323773 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 16 6 22 7.46734849896248 3.19974431288907 4.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0866299932985412 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 60 46 106 28.0025568711093 24.5313730654829 3.47118380562643 T:C C T 10 0.533290718814845 0.559402265781899 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 91 89 180 42.4705445878491 47.4628739745212 -4.9923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.456303210184957 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 35 32 67 16.3348248414804 17.065303002075 -0.730478160594615 A:G G A 10 0.533290718814845 0.902829026314125 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 28 24 52 13.0678598731843 12.7989772515563 0.268882621628059 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 130766662 T/C 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C T C 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000158987:ENST00000509018:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000512611:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000507093:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000296859:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000358714:exon_130766547_130767042:RAPGEF6;ENSG00000217128:ENST00000514667:exon_130766552_130767042:FNIP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 131607494 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607484_131607601:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131607484_131607526:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 131927059 A/G 1 51 35 86 23.8021733404429 18.6651751585196 5.13699818192333 A:G A G 10 0.533290718814845 0.281386823508822 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131926916_131927098:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131926916_131927098:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131926916_131927098:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131926916_131927098:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131926916_131927098:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000434288:exon_131926969_131927098:RAD50 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 135489593 C/T 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:C C T 10 0.533290718814845 0.237940889073470 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 A:G G A 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 13 3 16 6.06722065540701 1.59987215644454 4.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0414858195876844 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 C:G C G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 140021482 C/T 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000513002:exon_140021455_140021650:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000511410:exon_140021250_140021970:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000514449:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000505086:exon_140021455_140021922:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140021455_140021638:TMCO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 C:G C G 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C T C 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 19 16 35 8.86747634251794 8.53265150103752 0.334824841480424 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 A:C C A 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 C:G G C 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 C:G C G 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 142661490 A/G 1 33 43 76 15.4014062791101 22.9315009090383 -7.53009462992822 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0857662488555009 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 145499948 T/C 1 42 52 94 19.6017898097765 27.7311173783719 -8.12932756859543 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0985881237322873 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 C:G G C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149212243 G/C 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 C:G G C 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 33 41 74 15.4014062791101 21.8649194714086 -6.46351319229853 T:C C T 10 0.533290718814845 0.161639047877664 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 21 13 34 9.80089490488825 6.93277934459299 2.86811556029527 A:G G A 10 0.533290718814845 0.391138124053646 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.595989802726756 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 17 32 49 7.93405778014763 17.065303002075 -9.13124522192741 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00974881336919619 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 184 129 313 85.8745077380685 68.794502727115 17.0800050109535 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0541829658571047 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 73 43 116 34.0697775265163 22.9315009090383 11.138276617478 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.0405964727112165 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 27 22 49 12.6011505919992 11.7323958139266 0.868754778072594 C:G G C 10 0.533290718814845 0.886466470792541 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 12 21 33 5.60051137422186 11.1991050951117 -5.59859372088989 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.0557963044248418 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153413390 C/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153432733 T/C 1 3 6 9 1.40012784355546 3.19974431288907 -1.79961646933361 T:C T C 10 0.533290718814845 0.320054568375534 ENSG00000037749:ENST00000439768:exon_153432480_153433612:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153432480_153437014:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153432480_153434593:MFAP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153432970 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000037749:ENST00000439768:exon_153432480_153433612:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153432480_153437014:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153432480_153434593:MFAP3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 20 16 36 9.3341856237031 8.53265150103752 0.801534122665579 A:G A G 10 0.533290718814845 0.868029174100453 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 153796484 G/A 1 21 38 59 9.80089490488825 20.2650473149641 -10.4641524100759 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00850237214996613 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153796374_153800544:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153796374_153798572:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153796374_153798591:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153796374_153798593:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153796374_153799810:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153796374_153799810:GALNT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 154291414 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 154307098 C/T 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 58 39 97 27.069138308739 20.798338033779 6.27080027496003 A:G A G 10 0.533290718814845 0.222419149954623 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 28 21 49 13.0678598731843 11.1991050951117 1.86875477807259 A:G A G 10 0.533290718814845 0.668316644533404 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 33 43 76 15.4014062791101 22.9315009090383 -7.53009462992822 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0857662488555009 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 34 30 64 15.8681155602953 15.9987215644454 -0.130606004150081 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 41 31 72 19.1350805285914 16.5320122832602 2.60306824533116 A:C C A 10 0.533290718814845 0.557100688237838 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 36 44 80 16.8015341226656 23.4647916278532 -6.6632575051876 A:C A C 10 0.533290718814845 0.145809721967723 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 36 30 66 16.8015341226656 15.9987215644454 0.802812558220229 T:C T C 10 0.533290718814845 0.90209604705068 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 171481657 C/T 1 49 42 91 22.8687547780726 22.3982101902235 0.470544587849101 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 25 12 37 11.6677320296289 6.39948862577814 5.26824340385073 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0991230100602562 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 42 47 89 19.6017898097765 25.0646637842977 -5.46287397452121 A:G G A 10 0.533290718814845 0.288015926316764 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 175959412 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000146083:ENST00000274811:exon_175959367_175959517:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000513029:exon_175959367_175959517:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000504160:exon_175959367_175959517:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000504434:exon_175958883_175959517:RNF44 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:G G T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 10 10 20 4.66709281185155 5.33290718814845 -0.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.824923408120412 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 27 37 64 12.6011505919992 19.7317565961493 -7.13060600415008 A:G G A 10 0.533290718814845 0.079924049141798 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 14 22 36 6.53392993659217 11.7323958139266 -5.19846587733442 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0951164702500754 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 20 12 32 9.3341856237031 6.39948862577814 2.93469699792496 T:C T C 10 0.533290718814845 0.376239865171977 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 138 107 245 64.4058808035514 57.0621069131884 7.34377389036297 A:G A G 10 0.533290718814845 0.370188022825781 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 203 186 389 94.7419840805865 99.1920736995612 -4.45008961897472 T:C T C 10 0.533290718814845 0.684414904640524 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176795796 G/A 1 22 10 32 10.2676041860734 5.33290718814845 4.93469699792496 A:G G A 10 0.533290718814845 0.109473196454386 ENSG00000169220:ENST00000408923:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000398128:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000336477:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000514713:exon_176795718_176796076:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000511890:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000503110:exon_176795718_176795889:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000512490:exon_176795718_176795805:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000425155:exon_176795718_176795921:RGS14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 C:G G C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 54 65 119 25.2023011839984 34.6638967229649 -9.46159553896656 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0977750348377277 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 T:C T C 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 9 12 21 4.20038353066639 6.39948862577814 -2.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.385595047238848 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 9 17 26 4.20038353066639 9.06594221985237 -4.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0752576483829959 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 179043161 G/A 1 172 174 346 80.2739963638467 92.792585073783 -12.5185887099364 A:G G A 10 0.533290718814845 0.178446093466683 ENSG00000169045:ENST00000511300:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000393432:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502904:exon_179043127_179044111:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000442819:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000356731:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000515481:exon_179041181_179044650:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000329433:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510678:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510411:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523449:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000524179:exon_179043127_179043288:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519033:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000521720:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502632:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519958:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523136:exon_179043142_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504549:exon_179043159_179043219:HNRNPH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 60 74 134 28.0025568711093 39.4635131922985 -11.4609563211892 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0564112007046465 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 60 45 105 28.0025568711093 23.998082346668 4.00447452444127 A:C C A 10 0.533290718814845 0.493750343253647 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 60 40 100 28.0025568711093 21.3316287525938 6.6709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.193404819073641 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 53 68 121 24.7355919028132 36.2637688794095 -11.5281769765962 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0364178064768874 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 58 187 245 27.069138308739 99.725364418376 -72.656226109637 A:G G A 10 0.533290718814845 3.60170746836922e-21 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 3152800 C/T 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3152722_3152809:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000423798:exon_3152772_3153262:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 73 74 147 34.0697775265163 39.4635131922985 -5.39373566578222 A:G A G 10 0.533290718814845 0.408575016741947 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 6174866 G/A 1 15 64 79 7.00063921777732 34.1306060041501 -27.1299667863728 A:G G A 10 0.533290718814845 4.77305513915211e-10 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 41 47 88 19.1350805285914 25.0646637842977 -5.92958325570636 A:G A G 10 0.533290718814845 0.239765285778307 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 35 40 75 16.3348248414804 21.3316287525938 -4.99680391111337 A:G G A 10 0.533290718814845 0.249947131116216 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12120445 A/G 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000095951:ENST00000487103:exon_12120123_12120455:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12120588 C/T 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12122174 A/G 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 16 7 23 7.46734849896248 3.73303503170392 3.73431346725856 C:G C G 10 0.533290718814845 0.144545033833458 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12124855 G/A 1 8 14 22 3.73367424948124 7.46607006340783 -3.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.135293124077245 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:G G T 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 35 29 64 16.3348248414804 15.4654308456305 0.86939399584992 T:C C T 10 0.533290718814845 0.900513944917263 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 17629272 A/G 1 43 43 86 20.0684990909617 22.9315009090383 -2.86300181807667 A:G A G 10 0.533290718814845 0.589300222858511 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 18149357 A/C 1 24 29 53 11.2010227484437 15.4654308456305 -4.26440809718679 A:C A C 10 0.533290718814845 0.271434874489348 ENSG00000137364:ENST00000309983:exon_18149219_18149402:TPMT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 83 84 167 38.7368703383679 44.796420380447 -6.05955004207912 T:C C T 10 0.533290718814845 0.353065806357373 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 36 33 69 16.8015341226656 17.5985937208899 -0.797059598224308 A:G G A 10 0.533290718814845 0.904158562583491 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 18264658 G/A 1 24 20 44 11.2010227484437 10.6658143762969 0.535208372146819 A:G G A 10 0.533290718814845 0.881448028362754 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264616_18265054:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264616_18264799:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264616_18264766:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264616_18264772:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18264616_18264772:DEK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 17 24 41 7.93405778014763 12.7989772515563 -4.86491947140865 T:C C T 10 0.533290718814845 0.15839725846715 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 25 26 51 11.6677320296289 13.865558689186 -2.1978266595571 T:C T C 10 0.533290718814845 0.576089603408308 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 40 28 68 18.6683712474062 14.9321401268157 3.73623112059054 C:G G C 10 0.533290718814845 0.396224406852941 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 31 24 55 14.4679877167398 12.7989772515563 1.66901046518352 A:C:G A C 10 0.533290718814845 0.686962440542434 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 24843758 C/T 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 25600968 G/A 1 4 9 13 1.86683712474062 4.79961646933361 -2.93277934459299 A:G G A 10 0.533290718814845 0.162332488432764 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 25606465 G/A 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:G G A 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25606316_25606501:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25606289_25606501:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25606289_25606501:LRRC16A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 A:G G A 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26370572 C/T 0 23 0 23 10.7343134672586 0 10.7343134672586 C C 10 0.533290718814845 5.4945419159376e-07 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000530653:exon_26370550_26370588:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26370616 G/C 0 21 0 21 9.80089490488825 0 9.80089490488825 G G 10 0.533290718814845 1.95825000455807e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26370657 A/G 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 A A 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26370659 C/T 0 16 0 16 7.46734849896248 0 7.46734849896248 C C 10 0.533290718814845 4.78649997199623e-05 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 0 0 18 18 0 9.59923293866721 -9.59923293866721 A G A 10 0.533290718814845 1.10366145630706e-06 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26373150 C/T 1 24 1 25 11.2010227484437 0.533290718814845 10.6677320296289 T:C C T 10 0.533290718814845 5.6585564696881e-06 ENSG00000186470:ENST00000527417:exon_26373125_26373170:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532627:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26373125_26373315:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373116_26373325:BTN3A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26391005 C/A 1 2 8 10 0.93341856237031 4.26632575051876 -3.33290718814845 A:C C A 10 0.533290718814845 0.053043839415247 ENSG00000124508:ENST00000467485:exon_26390233_26391136:BTN2A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26405835 G/A 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26405770_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000396934:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000450085:exon_26405732_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000425234:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000427334:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000506698:exon_26405586_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26405600_26405876:BTN3A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 26413368 T/G 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26412933_26413474:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26412933_26413445:BTN3A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29523676 C/G 1 103 76 179 48.071055962071 40.5300946299282 7.54096133214274 C:G C G 10 0.533290718814845 0.262325444566336 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 153 153 306 71.4065200213287 81.5934799786713 -10.1869599573426 A:G A G 10 0.533290718814845 0.252077088918071 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 241 330 571 112.476936765622 175.985937208899 -63.5090004432765 A:G G A 10 0.533290718814845 1.12992430117322e-07 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 3 17 20 1.40012784355546 9.06594221985237 -7.6658143762969 C:G C G 10 0.533290718814845 0.000538293041746344 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:C A C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:T A T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.297757918797876 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 46 31 77 21.4686269345171 16.5320122832602 4.93661465125694 T:C T C 10 0.533290718814845 0.304044156718763 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 37 49 86 17.2682434038507 26.1312452219274 -8.86300181807668 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0656675391099654 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 28 22 50 13.0678598731843 11.7323958139266 1.33546405925775 T:C C T 10 0.533290718814845 0.777487179290162 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30228379 A/G 1 12 2 14 5.60051137422186 1.06658143762969 4.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0156418161619050 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30229013 A/G 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 A:G A G 10 0.533290718814845 0.117167394553238 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30229457 C/T 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30229463 G/A 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30230085 T/C 1 13 3 16 6.06722065540701 1.59987215644454 4.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0414858195876844 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 10 1 11 4.66709281185155 0.533290718814845 4.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0136489251822391 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 42 17 59 19.6017898097765 9.06594221985237 10.5358475899241 T:G T G 10 0.533290718814845 0.00596041410214583 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 42 17 59 19.6017898097765 9.06594221985237 10.5358475899241 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00596041410214583 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 900 793 1693 420.03835306664 422.899540020172 -2.86118695353258 T:C T C 10 0.533290718814845 0.903072392270791 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 25 36 61 11.6677320296289 19.1984658773344 -7.53073384770555 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0551667508382217 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:C T C 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 92 111 203 42.9372538690343 59.1952697884478 -16.2580159194135 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0242469289406790 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 18 17 35 8.40076706133279 9.06594221985237 -0.665175158519576 T:C C T 10 0.533290718814845 0.866470286349281 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 10 8 18 4.66709281185155 4.26632575051876 0.40076706133279 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 17 7 24 7.93405778014763 3.73303503170392 4.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.102355687793340 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 26 9 35 12.134441310814 4.79961646933361 7.33482484148042 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0165357254506977 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 3 12 15 1.40012784355546 6.39948862577814 -4.99936078222268 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0166427658718777 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 15 3 18 7.00063921777732 1.59987215644454 5.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0156326994729822 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 14 3 17 6.53392993659217 1.59987215644454 4.93405778014763 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0256045468831271 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 15 16 31 7.00063921777732 8.53265150103752 -1.5320122832602 T:G G T 10 0.533290718814845 0.594433221817073 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 5 17 22 2.33354640592577 9.06594221985237 -6.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00468689337050836 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 25 37 62 11.6677320296289 19.7317565961493 -8.06402456652039 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0421630848696704 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 16 20 36 7.46734849896248 10.6658143762969 -3.19846587733442 T:C C T 10 0.533290718814845 0.318333765491217 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31112701 G/A 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 16 13 29 7.46734849896248 6.93277934459299 0.534569154369494 T:G T G 10 0.533290718814845 0.855209067729783 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 A:T A T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 10 11 21 4.66709281185155 5.8661979069633 -1.19910509511175 C:G G C 10 0.533290718814845 0.665017509588756 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 39 23 62 18.201661966221 12.2656865327414 5.93597543347961 T:C C T 10 0.533290718814845 0.161010239975321 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 45 17 62 21.001917653332 9.06594221985237 11.9359754334796 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00216918494444951 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31238068 C/T 1 40 10 50 18.6683712474062 5.33290718814845 13.3354640592577 T:C C T 10 0.533290718814845 0.000162303792943124 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237987_31238199:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31237991_31238108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31237998_31238262:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 1 39 3 42 18.201661966221 1.59987215644454 16.6017898097765 A:G G A 10 0.533290718814845 5.2090267800105e-08 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 34 105 139 15.8681155602953 55.9955254755587 -40.1274099152635 T:C:G T G 10 0.533290718814845 5.14081899123754e-12 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 201 49 250 93.8085655182162 26.1312452219274 67.6773202962887 T:C C T 10 0.533290718814845 5.00156188007479e-19 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 48 207 255 22.4020454968874 110.391178794673 -87.9891332977855 T:C C T 10 0.533290718814845 8.30621133445383e-30 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 69 30 99 32.2029404017757 15.9987215644454 16.2042188373303 T:G G T 10 0.533290718814845 0.00116698556001913 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 0 112 0 112 52.2714394927374 0 52.2714394927374 C C 10 0.533290718814845 2.92872660281689e-31 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 106 30 136 49.4711838056264 15.9987215644454 33.4724622411811 T:C C T 10 0.533290718814845 4.08600850166352e-09 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31503107 C/T 1 28 13 41 13.0678598731843 6.93277934459299 6.13508052859135 T:C C T 10 0.533290718814845 0.060643444638536 ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 57 56 113 26.6024290275538 29.8642802536313 -3.26185122607749 T:C C T 10 0.533290718814845 0.572092216366505 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 76 121 197 35.4699053700718 64.5281769765962 -29.0582716065245 C:G C G 10 0.533290718814845 4.17659371111693e-05 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31604011 G/A 1 119 76 195 55.5384044610334 40.5300946299282 15.0083098311052 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0314350494465378 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 28 31 59 13.0678598731843 16.5320122832602 -3.46415241007585 C:G C G 10 0.533290718814845 0.433958872894716 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31746821 G/A 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 A:G G A 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:G G T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 18 11 29 8.40076706133279 5.8661979069633 2.53456915436949 T:C T C 10 0.533290718814845 0.360200680270037 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 17 10 27 7.93405778014763 5.33290718814845 2.60115059199918 T:G G T 10 0.533290718814845 0.34133979956756 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 0 30 0 30 14.0012784355546 0 14.0012784355546 G G 10 0.533290718814845 1.05988554952529e-08 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 69 32 101 32.2029404017757 17.065303002075 15.1376373997007 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00264046760850222 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32151934 A/G 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32151658_32152023:AGER HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 110 107 217 51.3380209303671 57.0621069131884 -5.72408598282136 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.454557321961968 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32163541 A/C 1 1 10 11 0.466709281185155 5.33290718814845 -4.8661979069633 A:C A C 10 0.533290718814845 0.00409725369498546 ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 557 629 1186 259.957069620131 335.439862134538 -75.4827925144062 A:C:G C A 10 0.533290718814845 1.23904114735266e-05 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2317 2264 4581 1081.365404506 1207.37018739681 -126.004782890805 A:T:C:G A C 10 0.533290718814845 0.000201158788984744 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C T C 10 0.533290718814845 0.759312876969158 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3116 2481 5597 1454.26612017294 1323.09427337963 131.171846793312 A:T:C:G T G 10 0.533290718814845 0.000447466748347202 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32605234 G/A 0 518 0 518 241.75540765391 0 241.75540765391 G G 10 0.533290718814845 4.59619634346238e-142 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 1288 0 1288 601.12155416648 0 601.12155416648 C C 10 0.533290718814845 0 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32605326 A/G 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 A A 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32605336 G/A 0 10 0 10 4.66709281185155 0 4.66709281185155 G G 10 0.533290718814845 0.00235084812796585 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 1 62 63 0.466709281185155 33.0640245665204 -32.5973152853352 A:C C A 10 0.533290718814845 1.03080160207672e-19 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32714143 G/A 0 26 0 26 12.134441310814 0 12.134441310814 G G 10 0.533290718814845 1.55919237944174e-07 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32784645 G/A 1 29 33 62 13.5345691543695 17.5985937208899 -4.06402456652039 A:G G A 10 0.533290718814845 0.311203578337862 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 23 31 54 10.7343134672586 16.5320122832602 -5.79769881600163 T:C T C 10 0.533290718814845 0.133336288052856 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 48 70 118 22.4020454968874 37.3303503170391 -14.9283048201517 A:C C A 10 0.533290718814845 0.00721164101255512 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 207 194 401 96.6088212053271 103.45839945008 -6.84957824475286 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.515363736363582 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 61 44 105 28.4692661522945 23.4647916278532 5.00447452444127 T:C C T 10 0.533290718814845 0.378803061123041 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 216 241 457 100.809204735993 128.523063234378 -27.7138584983842 A:T:C:G A G 10 0.533290718814845 0.0098805137999863 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 169 128 297 78.8738685202912 68.2612120083002 10.612656511991 A:G G A 10 0.533290718814845 0.22243451262448 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 241 207 448 112.476936765622 110.391178794673 2.08575797094943 T:C C T 10 0.533290718814845 0.849936381566868 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32944094 G/C 1 89 102 191 41.5371260254788 54.3956533191142 -12.8585272936354 T:C:G G C 10 0.533290718814845 0.0696167539647788 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944027_32944241:BRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 201 229 430 93.8085655182162 122.1235746086 -28.3150090903834 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00674392772078758 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32948462 G/A 1 232 192 424 108.276553234956 102.39181801245 5.88473522250571 A:G G A 10 0.533290718814845 0.592464390332273 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 56 89 145 26.1357197463687 47.4628739745212 -21.3271542281525 T:C:G G T 10 0.533290718814845 0.000439508586987609 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 42 33 75 19.6017898097765 17.5985937208899 2.00319608888662 A:G G A 10 0.533290718814845 0.728716747121145 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 45 34 79 21.001917653332 18.1318844397047 2.87003321362724 T:C C T 10 0.533290718814845 0.573417776768644 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 41 38 79 19.1350805285914 20.2650473149641 -1.12996678637276 A:G G A 10 0.533290718814845 0.82225357514806 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 665 308 973 310.361671988128 164.253541394972 146.108130593156 C:G G C 10 0.533290718814845 1.78524044551454e-21 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 1070 27 1097 499.378930868116 14.3988494080008 484.980081460115 A:T:C C T 10 0.533290718814845 1.29505106708178e-247 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1312 104 1416 612.322576914923 55.4622347567439 556.860342158179 T:C:G T C 10 0.533290718814845 4.75508764769393e-233 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037412 G/C 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 G G 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037413 C/A 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 C C 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 2088 290 2378 974.488979114604 154.654308456305 819.834670658299 A:T:G G A 10 0.533290718814845 3.29721982305476e-285 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 2034 287 2321 949.286677930605 153.054436299861 796.232241630745 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 2.44193910655627e-275 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 1110 170 1280 518.047302115522 90.6594221985237 427.387879916998 A:T:C:G T C 10 0.533290718814845 1.27882650517871e-143 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 889 2 891 414.904550973603 1.06658143762969 413.837969535973 T:C C T 10 0.533290718814845 1.77931998764661e-238 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 1 892 1 893 416.304678817158 0.533290718814845 415.771388098343 A:G G A 10 0.533290718814845 2.29448528505945e-241 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 1 856 2 858 399.503144694493 1.06658143762969 398.436563256863 A:T:C:G A T 10 0.533290718814845 1.67121174412385e-229 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 428 63 491 199.751572347246 33.5973152853352 166.154257061911 A:G A G 10 0.533290718814845 8.59720466031137e-58 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 206 87 293 96.1421119241419 46.3962925368915 49.7458193872504 T:C T C 10 0.533290718814845 3.4933959690307e-09 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 217 116 333 101.275914017179 61.861723382522 39.4141906346566 T:C C T 10 0.533290718814845 1.33558704324233e-05 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 220 101 321 102.676041860734 53.8623626002993 48.8136792604348 T:C T C 10 0.533290718814845 3.39306642095413e-08 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33095756 G/A 0 25 0 25 11.6677320296289 0 11.6677320296289 G G 10 0.533290718814845 1.54637091390073e-07 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33169895 C/G 1 63 68 131 29.4026847146648 36.2637688794095 -6.8610841647447 C:G C G 10 0.533290718814845 0.254989266564296 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33169849_33169899:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33169849_33169902:SLC39A7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 13 27 40 6.06722065540701 14.3988494080008 -8.3316287525938 T:C C T 10 0.533290718814845 0.01046436780006 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 16 12 28 7.46734849896248 6.39948862577814 1.06785987318434 A:G G A 10 0.533290718814845 0.709796492193127 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33239905 A/G 1 11 23 34 5.1338020930367 12.2656865327414 -7.13188443970473 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0158475760281319 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33240506 A/G 1 17 17 34 7.93405778014763 9.06594221985237 -1.13188443970473 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.73328229258271 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 42 33 75 19.6017898097765 17.5985937208899 2.00319608888662 A:G A G 10 0.533290718814845 0.728716747121145 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 63 48 111 29.4026847146648 25.5979545031126 3.8047302115522 A:G G A 10 0.533290718814845 0.506042728958314 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:C C A 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 35 41 76 16.3348248414804 21.8649194714086 -5.53009462992822 C:G G C 10 0.533290718814845 0.208186261867363 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 13 12 25 6.06722065540701 6.39948862577814 -0.332267970371126 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33408680 G/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000197283:ENST00000293748:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000395072:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000418600:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000449372:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000496374:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000428982:exon_33408506_33408742:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000440474:exon_33408506_33408742:SYNGAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 A:G G A 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33648144 C/T 1 13 8 21 6.06722065540701 4.26632575051876 1.80089490488825 T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.514849913618381 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33648106_33648231:ITPR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 C:G C G 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 20 24 44 9.3341856237031 12.7989772515563 -3.46479162785318 A:G G A 10 0.533290718814845 0.364821626129419 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 35423662 A/C 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 A:C A C 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35423524_35424130:FANCE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 T:C C T 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 A:G A G 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 31 33 64 14.4679877167398 17.5985937208899 -3.13060600415008 A:G G A 10 0.533290718814845 0.454156443638011 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 34 23 57 15.8681155602953 12.2656865327414 3.60242902755383 C:G G C 10 0.533290718814845 0.355863316935481 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 17 3 20 7.93405778014763 1.59987215644454 6.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00567267160524394 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 79 63 142 36.8700332136272 33.5973152853352 3.27271792829201 A:T T A 10 0.533290718814845 0.614305120887766 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 59 52 111 27.5358475899241 27.7311173783719 -0.195269788447796 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 81 69 150 37.8034517759976 36.7970595982243 1.00639217777324 T:C T C 10 0.533290718814845 0.934817154229534 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 45 60 105 21.001917653332 31.9974431288907 -10.9955254755587 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0394659600184284 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42627430 C/T 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 9 1 10 4.20038353066639 0.533290718814845 3.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0242359086233141 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 5 13 18 2.33354640592577 6.93277934459299 -4.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0340532783125087 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 17 18 35 7.93405778014763 9.59923293866721 -1.66517515851958 T:C T C 10 0.533290718814845 0.613800312425096 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 16 16 32 7.46734849896248 8.53265150103752 -1.06530300207504 C:G C G 10 0.533290718814845 0.726336480788252 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 83 79 162 38.7368703383679 42.1299667863728 -3.39309644800489 A:G A G 10 0.533290718814845 0.636760676401461 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 T:C C T 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43017728 C/A 1 19 13 32 8.86747634251794 6.93277934459299 1.93469699792496 A:C C A 10 0.533290718814845 0.595989802726756 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43017701_43017897:CUL7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43018909 C/T 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43018706_43019206:CUL7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:C A C 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43305520 C/T 1 84 99 183 39.203579619553 52.7957811626697 -13.5922015431166 T:C C T 10 0.533290718814845 0.045582274770928 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 45 25 70 21.001917653332 13.3322679703711 7.66964968296085 A:G G A 10 0.533290718814845 0.072479421537994 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 16 14 30 7.46734849896248 7.46607006340783 0.00127843555464935 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 44115169 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000534326:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000456124:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000497371:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000525873:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44115114_44115237:TMEM63B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 5 20 25 2.33354640592577 10.6658143762969 -8.33226797037113 A:C A C 10 0.533290718814845 0.000954130986163184 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 55 57 112 25.6690104651835 30.3975709724462 -4.72856050726264 T:G G T 10 0.533290718814845 0.394646751852094 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 16 13 29 7.46734849896248 6.93277934459299 0.534569154369494 C:G C G 10 0.533290718814845 0.855209067729783 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 46129345 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000112796:ENST00000371383:exon_46128152_46129490:ENPP5;ENSG00000112796:ENST00000230565:exon_46128152_46129490:ENPP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 T:C C T 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 22 12 34 10.2676041860734 6.39948862577814 3.86811556029527 A:G G A 10 0.533290718814845 0.229030954571415 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 52268890 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 9 0 9 4.20038353066639 0 4.20038353066639 G G 10 0.533290718814845 0.00453935417750068 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 13 13 0 6.93277934459299 -6.93277934459299 G A G 10 0.533290718814845 4.98429442058372e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 9 9 0 4.79961646933361 -4.79961646933361 G A G 10 0.533290718814845 0.00105055292884607 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57499035 T/C 0 18 0 18 8.40076706133279 0 8.40076706133279 T T 10 0.533290718814845 1.3275395608921e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57498967_57499035:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57498967_57499035:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 17 17 0 9.06594221985237 -9.06594221985237 A G A 10 0.533290718814845 2.36477289139062e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 73332121 C/T 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 T:C C T 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74125875 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74125888 A/G 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 T:G G T 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74161801 G/T 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 50 39 89 23.3354640592577 20.798338033779 2.53712602547879 A:G A G 10 0.533290718814845 0.597545274041113 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 8 13 21 3.73367424948124 6.93277934459299 -3.19910509511175 A:T:G G T 10 0.533290718814845 0.191682202539152 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74354175 C/T 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119899:ENST00000355773:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000393019:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000481996:exon_74354130_74354186:SLC17A5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 74497152 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 76624741 C/T 1 31 36 67 14.4679877167398 19.1984658773344 -4.73047816059462 T:C C T 10 0.533290718814845 0.271236664666022 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76624530_76626329:MYO6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 79595097 A/G 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G A G 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000146243:ENST00000369940:exon_79595095_79595160:IRAK1BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 A:T A T 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 16 11 27 7.46734849896248 5.8661979069633 1.60115059199918 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56889011730577 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 9 3 12 4.20038353066639 1.59987215644454 2.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.156686887223975 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 86199233 A/G 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000416334:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000437581:exon_86199212_86199317:NT5E HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 87968565 A/G 1 8 12 20 3.73367424948124 6.39948862577814 -2.6658143762969 A:G A G 10 0.533290718814845 0.266749908381947 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 23 10 33 10.7343134672586 5.33290718814845 5.40140627911011 T:C C T 10 0.533290718814845 0.079623075189137 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 39 41 80 18.201661966221 21.8649194714086 -3.6632575051876 A:C:G C G 10 0.533290718814845 0.434114265572976 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 T:C T C 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 90042914 T/C 1 91 83 174 42.4705445878491 44.2631296616321 -1.79258507378303 T:C T C 10 0.533290718814845 0.819838342592149 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90042805_90042924:UBE2J1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 16 15 31 7.46734849896248 7.99936078222268 -0.532012283260196 T:C C T 10 0.533290718814845 0.859206222940728 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 99893938 T/C 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 A:C A C 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 31 21 52 14.4679877167398 11.1991050951117 3.26888262162806 T:G G T 10 0.533290718814845 0.405763403770040 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 37 29 66 17.2682434038507 15.4654308456305 1.80281255822023 T:G G T 10 0.533290718814845 0.712049434047642 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 27 38 65 12.6011505919992 20.2650473149641 -7.66389672296493 A:G G A 10 0.533290718814845 0.06233292156924 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109770808 T/C 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 18 18 36 8.40076706133279 9.59923293866721 -1.19846587733442 T:C C T 10 0.533290718814845 0.739850891543775 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 T:C T C 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 T:C T C 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 110056482 A/G 1 4 12 16 1.86683712474062 6.39948862577814 -4.53265150103752 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0254215985752370 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110056353_110056501:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110056353_110056501:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000454215:exon_110056353_110056501:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000368941:exon_110056353_110056501:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110056353_110056501:FIG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 12 2 14 5.60051137422186 1.06658143762969 4.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0156418161619050 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 111695268 C/T 1 13 14 27 6.06722065540701 7.46607006340783 -1.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.700557007745927 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 16 4 20 7.46734849896248 2.13316287525938 5.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0227710047408782 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 111696852 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 116575083 C/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:C C A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 T:G G T 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 116720487 C/T 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 T:C C T 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000111817:ENST00000430252:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116720361_116720829:DSE HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 116966901 A/C 1 25 24 49 11.6677320296289 12.7989772515563 -1.13124522192741 A:T:C:G A C 10 0.533290718814845 0.775955397216552 ENSG00000153975:ENST00000485498:exon_116966877_116967421:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116966877_116967097:ZUFSP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 148 0 148 69.0729736154029 0 69.0729736154029 C C 10 0.533290718814845 4.24659857104355e-41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 20 18 38 9.3341856237031 9.59923293866721 -0.265047314964111 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 39 22 61 18.201661966221 11.7323958139266 6.46926615229446 T:G T G 10 0.533290718814845 0.122897670796501 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 132791117 C/T 1 14 17 31 6.53392993659217 9.06594221985237 -2.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.374395278994912 ENSG00000079950:ENST00000434788:exon_132791090_132791186:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367941:exon_132791090_132791186:STX7;ENSG00000079950:ENST00000448348:exon_132791090_132791186:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367937:exon_132791090_132791186:STX7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 17 25 42 7.93405778014763 13.3322679703711 -5.39821019022349 A:G A G 10 0.533290718814845 0.121106957640155 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 633 365 998 295.426974990203 194.651112367418 100.775862622785 A:G A G 10 0.533290718814845 1.28360841801342e-10 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 T:C T C 10 0.533290718814845 0.151117723652911 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 316 0 316 147.480132854509 0 147.480132854509 T T 10 0.533290718814845 5.94539151374021e-87 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 338 1 339 157.747737040582 0.533290718814845 157.214446321768 A:C A C 10 0.533290718814845 8.6274351702127e-91 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 336 0 336 156.814318478212 0 156.814318478212 A A 10 0.533290718814845 2.90435013515124e-92 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 153 0 153 71.4065200213287 0 71.4065200213287 G G 10 0.533290718814845 1.76930705227167e-42 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 185 0 185 86.3412170192537 0 86.3412170192537 T T 10 0.533290718814845 3.28119680089114e-51 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 136977568 T/C 1 2 18 20 0.93341856237031 9.59923293866721 -8.6658143762969 T:C:G T C 10 0.533290718814845 6.88331087102222e-05 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136977445_136977598:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136977445_136977598:MAP3K5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 15 26 41 7.00063921777732 13.865558689186 -6.86491947140865 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0407548458444312 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 109 1 110 50.8713116491819 0.533290718814845 50.338020930367 A:C A C 10 0.533290718814845 9.39551906575855e-29 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 T:G G T 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 143090734 T/C 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 T:C T C 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143090689_143096262:HIVEP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 143091769 G/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G G A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143090689_143096262:HIVEP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 143092754 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143090689_143096262:HIVEP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C:G T C 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 49 35 84 22.8687547780726 18.6651751585196 4.20357961955302 T:C C T 10 0.533290718814845 0.382956507548706 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 144179144 G/A 1 66 51 117 30.8028125582202 27.1978266595571 3.60498589866313 A:G G A 10 0.533290718814845 0.518060920797164 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144178889_144179144:LTV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 144878337 G/T 1 9 2 11 4.20038353066639 1.06658143762969 3.1338020930367 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0718773341081515 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144878293_144878447:UTRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 51 33 84 23.8021733404429 17.5985937208899 6.20357961955302 A:G G A 10 0.533290718814845 0.190147522356965 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 A:G G A 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 151161836 T/C 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000120278:ENST00000367328:exon_151160969_151164799:PLEKHG1;ENSG00000120278:ENST00000358517:exon_151160969_151164799:PLEKHG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 C:G C G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 32 37 69 14.934696997925 19.7317565961493 -4.79705959822431 A:T:C C T 10 0.533290718814845 0.277889718591824 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 14 15 29 6.53392993659217 7.99936078222268 -1.46543084563051 A:G G A 10 0.533290718814845 0.71044292416145 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 38 35 73 17.7349526850359 18.6651751585196 -0.930222473483685 T:C C T 10 0.533290718814845 0.906729365905238 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 152443761 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 153323620 C/T 1 22 32 54 10.2676041860734 17.065303002075 -6.79769881600163 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0756942398944153 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 157405930 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000354354:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000319584:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000452544:exon_157405796_157406039:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000493658:exon_157405900_157406039:ARID1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 160494409 A/G 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 A:G A G 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160494245_160494501:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160494245_160494501:IGF2R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 160525954 A/G 1 63 66 129 29.4026847146648 35.1971874417798 -5.79450272711501 A:G A G 10 0.533290718814845 0.331987836991526 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160525706_160527583:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160525706_160527583:IGF2R HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 166571935 C/T 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 T:C C T 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 166572005 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 11 16 27 5.1338020930367 8.53265150103752 -3.39884940800082 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246932831316883 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 166721224 C/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 C:G C G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 167435928 C/T 1 23 18 41 10.7343134672586 9.59923293866721 1.13508052859135 T:C C T 10 0.533290718814845 0.75649677321812 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167435897_167436123:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167435914_167436123:FGFR1OP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 167438276 G/T 1 23 16 39 10.7343134672586 8.53265150103752 2.20166196622104 T:G G T 10 0.533290718814845 0.523723415499499 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 167438364 T/C 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:C T C 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000420493:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000283506:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167438270_167438382:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000496181:exon_167438270_167438699:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000488525:exon_167438278_167438382:FGFR1OP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 17 17 34 7.93405778014763 9.06594221985237 -1.13188443970473 T:C C T 10 0.533290718814845 0.73328229258271 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 168317816 A/C 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:C A C 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000497596:exon_168317769_168317912:MLLT4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 19 15 34 8.86747634251794 7.99936078222268 0.868115560295269 A:G G A 10 0.533290718814845 0.86407496646472 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 158 129 287 73.7400664272545 68.794502727115 4.94556370013949 C:G G C 10 0.533290718814845 0.594518688623461 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 16 16 32 7.46734849896248 8.53265150103752 -1.06530300207504 T:C T C 10 0.533290718814845 0.726336480788252 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 4 14 18 1.86683712474062 7.46607006340783 -5.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0089755263181513 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 909048 G/A 1 11 11 22 5.1338020930367 5.8661979069633 -0.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.832235805354248 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_908111_909153:SUN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 53 30 83 24.7355919028132 15.9987215644454 8.73687033836786 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0612217457485547 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 18 4 22 8.40076706133279 2.13316287525938 6.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00891117183170367 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 10 5 15 4.66709281185155 2.66645359407423 2.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438815033771785 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 22 9 31 10.2676041860734 4.79961646933361 5.4679877167398 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0701136796662376 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 36 33 69 16.8015341226656 17.5985937208899 -0.797059598224308 T:C T C 10 0.533290718814845 0.904158562583491 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 T:C C T 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 13 10 23 6.06722065540701 5.33290718814845 0.734313467258565 T:C T C 10 0.533290718814845 0.836287867826393 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 14 11 25 6.53392993659217 5.8661979069633 0.667732029628874 T:C T C 10 0.533290718814845 0.843282325084879 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 28 21 49 13.0678598731843 11.1991050951117 1.86875477807259 C:G C G 10 0.533290718814845 0.668316644533404 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6036980 G/C 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 C:G G C 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6036957_6037054:PMS2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 98 75 173 45.7375095561452 39.9968039111134 5.74070564503181 T:C C T 10 0.533290718814845 0.402440222557718 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 12 11 23 5.60051137422186 5.8661979069633 -0.265686532741435 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 4 7 11 1.86683712474062 3.73303503170392 -1.8661979069633 T:C T C 10 0.533290718814845 0.366675434698681 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 103 56 159 48.071055962071 29.8642802536313 18.2067757084396 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0041003202296732 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6731672 G/C 1 15 15 30 7.00063921777732 7.99936078222268 -0.998721564445351 C:G G C 10 0.533290718814845 0.718981035499475 ENSG00000164631:ENST00000405858:exon_6728064_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000404360:exon_6728064_6732118:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000330442:exon_6728067_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000342651:exon_6730080_6732118:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000399476:exon_6730080_6732118:ZNF12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 6777017 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 41 38 79 19.1350805285914 20.2650473149641 -1.12996678637276 T:C C T 10 0.533290718814845 0.82225357514806 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 25 36 61 11.6677320296289 19.1984658773344 -7.53073384770555 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0551667508382217 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 7 9 16 3.26696496829608 4.79961646933361 -1.53265150103752 C:G C G 10 0.533290718814845 0.464005948357275 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 41 31 72 19.1350805285914 16.5320122832602 2.60306824533116 T:C C T 10 0.533290718814845 0.557100688237838 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 17854532 G/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:G G T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17854457_17854567:SNX13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 11 10 21 5.1338020930367 5.33290718814845 -0.199105095111745 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 23015831 T/C 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_23015829_23015924:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_23015829_23015924:FAM126A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 23164338 A/G 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164307_23164400:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164307_23164400:KLHL7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 63 14 77 29.4026847146648 7.46607006340783 21.9366146512569 A:T:C C T 10 0.533290718814845 2.42132805414362e-07 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 47 16 63 21.9353362157023 8.53265150103752 13.4026847146648 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00059872515244672 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 60 24 84 28.0025568711093 12.7989772515563 15.203579619553 T:G G T 10 0.533290718814845 0.000931384644717868 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:G G A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 24903124 G/A 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24903115_24903218:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000431825:exon_24903115_24903218:OSBPL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 25182405 G/T 1 3 5 8 1.40012784355546 2.66645359407423 -1.26632575051876 T:G G T 10 0.533290718814845 0.485824786386305 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25182259_25182433:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25182259_25182433:C7orf31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 27797714 T/C 1 48 43 91 22.4020454968874 22.9315009090383 -0.529455412150895 T:C T C 10 0.533290718814845 0.916750482903461 ENSG00000106052:ENST00000418691:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000422800:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000416801:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000490455:exon_27797650_27797970:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27797650_27797752:TAX1BP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 28 37 65 13.0678598731843 19.7317565961493 -6.66389672296493 C:G G C 10 0.533290718814845 0.106546433935569 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 A:T T A 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 15 17 32 7.00063921777732 9.06594221985237 -2.06530300207504 C:G C G 10 0.533290718814845 0.483602569142873 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G A G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 36895342 C/T 1 28 15 43 13.0678598731843 7.99936078222268 5.06849909096166 T:C C T 10 0.533290718814845 0.128866886764797 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 13 4 17 6.06722065540701 2.13316287525938 3.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0859735969639128 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 38398251 G/A 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 28 29 57 13.0678598731843 15.4654308456305 -2.39757097244617 A:G G A 10 0.533290718814845 0.595881328481355 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43664280 A/G 1 124 107 231 57.8719508669592 57.0621069131884 0.809843953770802 A:G A G 10 0.533290718814845 0.947465767060676 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43810764 G/A 1 45 22 67 21.001917653332 11.7323958139266 9.26952183940538 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0269756032063684 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43810734_43810769:BLVRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 226 186 412 105.476297547845 99.1920736995612 6.28422384828384 A:G A G 10 0.533290718814845 0.553674525710679 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 16 9 25 7.46734849896248 4.79961646933361 2.66773202962887 T:G T G 10 0.533290718814845 0.321136819594216 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 36 31 67 16.8015341226656 16.5320122832602 0.269521839405385 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 44 58 102 20.5352083721468 30.930861691261 -10.3956533191142 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0466965065599725 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.193047477338001 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 62 52 114 28.9359754334796 27.7311173783719 1.20485805510767 T:C T C 10 0.533290718814845 0.851465917078048 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 9 4 13 4.20038353066639 2.13316287525938 2.06722065540701 T:C C T 10 0.533290718814845 0.280682422703720 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 141 83 224 65.8060086471069 44.2631296616321 21.5428789854747 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00393577731258005 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 157 94 251 73.2733571460693 50.1293275685954 23.1440295774739 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00355411298997650 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 101 90 191 47.1376373997007 47.9961646933361 -0.858527293635404 A:G G A 10 0.533290718814845 0.942221234563316 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 A:G G A 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 19 30 49 8.86747634251794 15.9987215644454 -7.13124522192741 A:G G A 10 0.533290718814845 0.045182712700262 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 24 27 51 11.2010227484437 14.3988494080008 -3.1978266595571 A:C A C 10 0.533290718814845 0.40140467349042 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 50467941 C/T 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 8 1 9 3.73367424948124 0.533290718814845 3.20038353066639 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0428222058092989 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 56128100 A/G 1 198 201 399 92.4084376746607 107.191434481784 -14.7829968071232 A:G A G 10 0.533290718814845 0.145648069394928 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000492618:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000466572:exon_56127558_56128109:CCT6A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 63981915 T/A 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 A:T T A 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 A:G G A 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 9 11 20 4.20038353066639 5.8661979069633 -1.6658143762969 T:C C T 10 0.533290718814845 0.506343375369325 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 20 19 39 9.3341856237031 10.1325236574821 -0.798338033778956 A:G A G 10 0.533290718814845 0.872948278112427 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 C:G G C 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 13 31 44 6.06722065540701 16.5320122832602 -10.4647916278532 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00213562151732658 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 A:G G A 10 0.533290718814845 0.887877078887718 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 17 12 29 7.93405778014763 6.39948862577814 1.53456915436949 T:C T C 10 0.533290718814845 0.583729164596803 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 25 14 39 11.6677320296289 7.46607006340783 4.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.200847962376411 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 27 27 54 12.6011505919992 14.3988494080008 -1.79769881600163 T:C T C 10 0.533290718814845 0.683135437306546 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 82 80 162 38.2701610571827 42.6632575051876 -4.3930964480049 A:G G A 10 0.533290718814845 0.52889236343712 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 T:C C T 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 55 56 111 25.6690104651835 29.8642802536313 -4.1952697884478 A:G A G 10 0.533290718814845 0.447421149189238 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 A:G A G 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 92762924 A/C 1 35 18 53 16.3348248414804 9.59923293866721 6.73559190281322 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0732502343874715 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 C:G G C 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 95041016 G/C 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 C:G G C 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95040965_95041055:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000469926:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000491069:exon_95040963_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000490778:exon_95040994_95041091:PON2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 95800820 T/C 1 5 8 13 2.33354640592577 4.26632575051876 -1.93277934459299 T:C T C 10 0.533290718814845 0.405642180428618 ENSG00000004864:ENST00000265631:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000416240:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000490072:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000484495:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000492869:exon_95800784_95800836:SLC25A13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 98984354 G/C 1 149 163 312 69.5396828965881 86.9263871668197 -17.3867042702316 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0535585420485397 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99017737 G/A 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 A:G G A 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99017372_99017772:RP5-900K19.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99032517 G/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 8 20 28 3.73367424948124 10.6658143762969 -6.93214012681566 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0124011870892496 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 18 16 34 8.40076706133279 8.53265150103752 -0.131884439704731 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 247 89 336 115.277192452733 47.4628739745212 67.8143184782121 A:T:C T C 10 0.533290718814845 4.60530505044661e-14 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99091599 C/T 1 42 40 82 19.6017898097765 21.3316287525938 -1.72983894281729 T:C C T 10 0.533290718814845 0.740436562184195 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99097689 G/A 1 22 19 41 10.2676041860734 10.1325236574821 0.135080528591354 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99097261_99097887:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000481881:exon_99097261_99097898:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000485576:exon_99097261_99097920:ZNF394 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99217424 G/A 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99217184_99219197:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99217184_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99217184_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000431485:exon_99217184_99217439:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99217173_99217616:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99217230_99217620:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000466948:exon_99217288_99217616:ZNF498 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99227172 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000197037:ENST00000481424:exon_99226814_99230022:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394152:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394150:exon_99226814_99228527:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000334715:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000262941:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000394151:exon_99226814_99230030:ZNF498;ENSG00000197037:ENST00000485586:exon_99226814_99229994:ZNF498 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99654857 C/T 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 12 14 26 5.60051137422186 7.46607006340783 -1.86555868918597 A:G A G 10 0.533290718814845 0.556619610522349 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 114 111 225 53.2048580551077 59.1952697884478 -5.99041173334013 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.423705105698558 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 102 97 199 47.6043466808858 51.72919972504 -4.12485304415416 A:C:G G A 10 0.533290718814845 0.570356945915237 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99753604 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000146826:ENST00000470436:exon_99753463_99753820:C7orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99755006 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99754996_99755082:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99754996_99755082:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99754996_99755082:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99754996_99755082:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99754916_99755082:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000472061:exon_99754996_99755075:C7orf43 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99799845 T/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:T T A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99798283_99800226:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99798283_99800226:GATS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 49 23 72 22.8687547780726 12.2656865327414 10.6030682453312 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0129041321763843 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 99950006 C/T 1 15 5 20 7.00063921777732 2.66645359407423 4.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0710623827981987 ENSG00000121716:ENST00000470714:exon_99949786_99950112:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000310771:exon_99949786_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444874:exon_99949885_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422752:exon_99949786_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000420688:exon_99949782_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000452089:exon_99949799_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000493091:exon_99949891_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000457519:exon_99949905_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000448382:exon_99949911_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000443526:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000419749:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422808:exon_99949969_99950101:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000438028:exon_99949969_99950101:PILRB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100463822 G/A 1 5 5 10 2.33354640592577 2.66645359407423 -0.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100484481 C/T 1 102 91 193 47.6043466808858 48.5294554121509 -0.925108731265084 A:T:C:G C T 10 0.533290718814845 0.94251460437945 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100484416_100484589:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100484416_100484589:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100484416_100484589:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100484416_100484589:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100484416_100484589:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000487311:exon_100484181_100484589:SRRT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.171748761798993 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100799970 C/T 1 52 50 102 24.2688826216281 26.6645359407423 -2.39565331911419 T:C C T 10 0.533290718814845 0.691642544235344 ENSG00000106367:ENST00000337619:exon_100799875_100800053:AP1S1;ENSG00000106367:ENST00000443943:exon_100799875_100800053:AP1S1;ENSG00000106367:ENST00000429457:exon_100799875_100800053:AP1S1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100850908 G/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100853714 G/A 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100855823 G/A 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 100855877 G/A 1 12 9 21 5.60051137422186 4.79961646933361 0.800894904888255 A:G G A 10 0.533290718814845 0.828409272268214 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 104752798 G/A 1 24 24 48 11.2010227484437 12.7989772515563 -1.59795450311256 A:G G A 10 0.533290718814845 0.666538693127673 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 A:G G A 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 105917482 A/G 1 10 21 31 4.66709281185155 11.1991050951117 -6.5320122832602 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0197437549469357 ENSG00000105835:ENST00000222553:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000354289:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000484527:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000393618:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000441045:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000486949:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000489358:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000424768:exon_105917469_105917625:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000489732:exon_105915773_105917625:NAMPT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 81 72 153 37.8034517759976 38.3969317546688 -0.59347997867129 A:T A T 10 0.533290718814845 0.935573794783292 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 107564366 T/G 0 0 8 8 0 4.26632575051876 -4.26632575051876 G T G 10 0.533290718814845 0.00225097929524416 ENSG00000091136:ENST00000472714:exon_107564244_107564532:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107564248_107564532:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000412968:exon_107564249_107564532:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107564263_107564532:LAMB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 110303629 A/G 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 A:G A G 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000184903:ENST00000405709:exon_110303110_110303777:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000331762:exon_110303110_110303777:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000487733:exon_110303264_110303777:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000489381:exon_110303357_110303777:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000452895:exon_110303472_110303777:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000450877:exon_110303482_110303777:IMMP2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 112096073 T/C 1 23 15 38 10.7343134672586 7.99936078222268 2.73495268503589 T:C T C 10 0.533290718814845 0.41870590424498 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000443101:exon_112096057_112096128:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000429071:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000476927:exon_112096057_112096141:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000440625:exon_112096057_112096141:IFRD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 115889369 G/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000135269:ENST00000461440:exon_115889074_115889631:TES;ENSG00000135269:ENST00000496871:exon_115889074_115889860:TES;ENSG00000135269:ENST00000485009:exon_115889074_115890086:TES HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 6 10 16 2.80025568711093 5.33290718814845 -2.53265150103752 A:G A G 10 0.533290718814845 0.220607441584604 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 A:G G A 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 16 6 22 7.46734849896248 3.19974431288907 4.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0866299932985412 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 61 60 121 28.4692661522945 31.9974431288907 -3.52817697659625 T:C T C 10 0.533290718814845 0.525130268865300 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 T:C T C 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 39 41 80 18.201661966221 21.8649194714086 -3.6632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.434114265572976 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 19 24 43 8.86747634251794 12.7989772515563 -3.93150090903834 A:G A G 10 0.533290718814845 0.284603030789994 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 15 14 29 7.00063921777732 7.46607006340783 -0.465430845630506 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 14 14 28 6.53392993659217 7.46607006340783 -0.932140126815661 T:C T C 10 0.533290718814845 0.850229953487021 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 C:G G C 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 T:G T G 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 10 24 34 4.66709281185155 12.7989772515563 -8.13188443970473 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00565600752886625 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 44 27 71 20.5352083721468 14.3988494080008 6.136358964146 T:C T C 10 0.533290718814845 0.154621081713619 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 26 17 43 12.134441310814 9.06594221985237 3.06849909096166 A:G G A 10 0.533290718814845 0.363910342526798 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 141443499 T/C 1 177 150 327 82.6075427697724 79.9936078222267 2.61393494754569 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.781969094061569 ENSG00000106028:ENST00000265304:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000498107:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000489378:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000469123:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000467681:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000465582:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000463093:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000465167:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000484178:exon_141443361_141443501:SSBP1;ENSG00000106028:ENST00000481508:exon_141443361_141443501:SSBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 141 1 142 65.8060086471069 0.533290718814845 65.272717928292 T:G T G 10 0.533290718814845 2.21307029916075e-37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 148712092 G/A 1 47 41 88 21.9353362157023 21.8649194714086 0.0704167442936381 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 10 10 20 4.66709281185155 5.33290718814845 -0.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.824923408120412 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 149191568 C/T 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000181220:ENST00000340622:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000458143:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000461958:exon_149191295_149191595:ZNF746 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 38 46 84 17.7349526850359 24.5313730654829 -6.79642038044698 A:G A G 10 0.533290718814845 0.155092441452025 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 73 44 117 34.0697775265163 23.4647916278532 10.6049858986631 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0518138125021178 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 73 43 116 34.0697775265163 22.9315009090383 11.138276617478 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0405964727112165 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150269542 G/T 1 14 13 27 6.53392993659217 6.93277934459299 -0.398849408000816 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000478135:exon_150269217_150269621:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000479232:exon_150269217_150269569:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 20 19 39 9.3341856237031 10.1325236574821 -0.798338033778956 T:C C T 10 0.533290718814845 0.872948278112427 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 42 65 107 19.6017898097765 34.6638967229649 -15.0621069131884 T:C T C 10 0.533290718814845 0.00361238214909961 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 40 33 73 18.6683712474062 17.5985937208899 1.06977752651631 C:G G C 10 0.533290718814845 0.81577492595223 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150417677 G/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 2 19 21 0.93341856237031 10.1325236574821 -9.19910509511175 A:G G A 10 0.533290718814845 3.54135484105001e-05 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 13 25 38 6.06722065540701 13.3322679703711 -7.26504731496411 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0220452595244659 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 8 23 31 3.73367424948124 12.2656865327414 -8.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00325160337318742 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150730999 G/A 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730825_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150742388 A/C 1 6 8 14 2.80025568711093 4.26632575051876 -1.46607006340783 A:C A C 10 0.533290718814845 0.593918375408773 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 12 13 25 5.60051137422186 6.93277934459299 -1.33226797037113 A:C C A 10 0.533290718814845 0.68978925310364 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150765065 T/C 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C T C 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150764961_150765141:SLC4A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 38 44 82 17.7349526850359 23.4647916278532 -5.72983894281729 A:T A T 10 0.533290718814845 0.223928625517494 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 150934877 A/G 1 22 22 44 10.2676041860734 11.7323958139266 -1.46479162785318 A:G A G 10 0.533290718814845 0.76291635322776 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 28 11 39 13.0678598731843 5.8661979069633 7.20166196622104 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0239433407858628 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 31 28 59 14.4679877167398 14.9321401268157 -0.464152410075856 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 151859683 G/A 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 152346007 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000196584:ENST00000495707:exon_152341864_152346448:XRCC2;ENSG00000196584:ENST00000359321:exon_152343589_152346448:XRCC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156469133 C/G 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 C:G C G 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156480781 A/T 1 11 15 26 5.1338020930367 7.99936078222268 -2.86555868918597 A:T A T 10 0.533290718814845 0.32628259247279 ENSG00000105983:ENST00000353442:exon_156480724_156480885:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000415428:exon_156480724_156480885:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000354505:exon_156480724_156480885:LMBR1;ENSG00000105983:ENST00000454132:exon_156480724_156480885:LMBR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156742779 C/A 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 A:C C A 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 9 13 22 4.20038353066639 6.93277934459299 -2.73239581392659 C:G G C 10 0.533290718814845 0.287802393155827 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 10 12 22 4.66709281185155 6.39948862577814 -1.73239581392659 A:G G A 10 0.533290718814845 0.524610078613343 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 27 32 59 12.6011505919992 17.065303002075 -4.46415241007586 T:C T C 10 0.533290718814845 0.296507662954318 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 381410 A/G 1 18 12 30 8.40076706133279 6.39948862577814 2.00127843555465 A:G A G 10 0.533290718814845 0.583830491655552 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 34 27 61 15.8681155602953 14.3988494080008 1.46926615229445 C:G C G 10 0.533290718814845 0.797734704510623 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 T:C T C 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 59 56 115 27.5358475899241 29.8642802536313 -2.32843266370718 A:T:G A G 10 0.533290718814845 0.708796174024463 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 68 80 148 31.7362311205905 42.6632575051876 -10.9270263845971 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0832953175176048 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 41 39 80 19.1350805285914 20.798338033779 -1.6632575051876 T:C C T 10 0.533290718814845 0.737571797212478 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 22106739 C/T 1 16 17 33 7.46734849896248 9.06594221985237 -1.59859372088989 T:C C T 10 0.533290718814845 0.604371642149387 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22106557_22106822:POLR3D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 22262418 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 22386062 C/A 1 19 10 29 8.86747634251794 5.33290718814845 3.53456915436949 A:C C A 10 0.533290718814845 0.198901950501575 ENSG00000120910:ENST00000240139:exon_22386019_22386090:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000289963:exon_22386019_22386090:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000397775:exon_22386019_22386090:PPP3CC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 57 53 110 26.6024290275538 28.2644080971868 -1.66197906963296 A:G G A 10 0.533290718814845 0.774884524067205 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 23423697 G/A 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 91 86 177 42.4705445878491 45.8630018180767 -3.39245723022756 T:C C T 10 0.533290718814845 0.651417690675254 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 103 100 203 48.071055962071 53.3290718814845 -5.25801591941354 A:C A C 10 0.533290718814845 0.482078984484736 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 A:C A C 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 11 13 24 5.1338020930367 6.93277934459299 -1.79897725155628 T:C C T 10 0.533290718814845 0.541298627729078 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 21 21 42 9.80089490488825 11.1991050951117 -1.39821019022349 C:G C G 10 0.533290718814845 0.757581136379853 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 23 11 34 10.7343134672586 5.8661979069633 4.86811556029527 T:C T C 10 0.533290718814845 0.121020658099431 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 28217267 G/A 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G G A 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28217109_28217341:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28217109_28217341:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28217109_28217341:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000521912:exon_28217109_28217341:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520290:exon_28217112_28217341:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000521185:exon_28217209_28217341:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28217109_28217341:FBXO16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 A:G G A 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 30924557 C/T 1 8 4 12 3.73367424948124 2.13316287525938 1.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.400448892772459 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30924549_30924698:WRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 7 11 18 3.26696496829608 5.8661979069633 -2.59923293866721 T:G G T 10 0.533290718814845 0.244375059521440 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 4 6 10 1.86683712474062 3.19974431288907 -1.33290718814845 A:G A G 10 0.533290718814845 0.530126289756078 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 2 11 13 0.93341856237031 5.8661979069633 -4.93277934459299 C:G G C 10 0.533290718814845 0.00935895463927488 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 4 16 20 1.86683712474062 8.53265150103752 -6.6658143762969 A:G G A 10 0.533290718814845 0.00302762945772935 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 A:G A G 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 6 15 21 2.80025568711093 7.99936078222268 -5.19910509511175 T:C T C 10 0.533290718814845 0.027859306926896 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 15 22 37 7.00063921777732 11.7323958139266 -4.73175659614927 A:G A G 10 0.533290718814845 0.138473729545438 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 37702012 G/A 1 19 7 26 8.86747634251794 3.73303503170392 5.13444131081403 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0494794153073352 ENSG00000020181:ENST00000315215:exon_37698604_37702414:GPR124;ENSG00000104221:ENST00000220659:exon_37700786_37702731:BRF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 33 16 49 15.4014062791101 8.53265150103752 6.86875477807259 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0617539687597957 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 13 15 28 6.06722065540701 7.99936078222268 -1.93214012681566 A:G A G 10 0.533290718814845 0.57074811577837 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 13 9 22 6.06722065540701 4.79961646933361 1.26760418607341 T:C C T 10 0.533290718814845 0.67206983495877 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 41 18 59 19.1350805285914 9.59923293866721 9.53584758992414 A:G A G 10 0.533290718814845 0.013069199289497 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 24 24 48 11.2010227484437 12.7989772515563 -1.59795450311256 T:C T C 10 0.533290718814845 0.666538693127673 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 39 32 71 18.201661966221 17.065303002075 1.13635896414601 T:C T C 10 0.533290718814845 0.812986580216494 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 38934777 G/A 1 11 14 25 5.1338020930367 7.46607006340783 -2.33226797037113 A:G G A 10 0.533290718814845 0.424018017966496 ENSG00000168615:ENST00000487273:exon_38934747_38934930:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481873:exon_38934747_38934930:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000468065:exon_38934747_38934930:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000379917:exon_38934747_38934930:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000484143:exon_38934747_38934930:ADAM9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 41791283 G/A 1 11 12 23 5.1338020930367 6.39948862577814 -1.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.677999942984654 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41786997_41792385:MYST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 41798417 C/T 1 11 6 17 5.1338020930367 3.19974431288907 1.93405778014763 T:C C T 10 0.533290718814845 0.467493825840055 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000418721:exon_41798360_41798962:MYST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 41906095 A/G 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000485568:exon_41905896_41906820:MYST3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 42177163 G/A 1 21 25 46 9.80089490488825 13.3322679703711 -3.53137306548287 A:G G A 10 0.533290718814845 0.305088219507340 ENSG00000104365:ENST00000520810:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517890:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520835:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517917:exon_42176788_42177268:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000518679:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000342222:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520201:exon_42176788_42178362:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523517:exon_42177103_42177164:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517502:exon_42177103_42177164:IKBKB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 48694956 A/G 1 42 47 89 19.6017898097765 25.0646637842977 -5.46287397452121 A:G A G 10 0.533290718814845 0.288015926316764 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48694939_48695159:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48694939_48695159:AC103686.1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 15 9 24 7.00063921777732 4.79961646933361 2.20102274844372 A:G A G 10 0.533290718814845 0.417852462394259 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 59510073 C/T 1 23 26 49 10.7343134672586 13.865558689186 -3.13124522192741 T:C C T 10 0.533290718814845 0.392802233853041 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59509946_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59509962_59510109:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59510032_59510109:NSMAF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 47 29 76 21.9353362157023 15.4654308456305 6.46990537007178 T:C T C 10 0.533290718814845 0.167315891503499 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 31 16 47 14.4679877167398 8.53265150103752 5.93533621570228 T:G G T 10 0.533290718814845 0.106882776891827 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 9 5 14 4.20038353066639 2.66645359407423 1.53392993659217 T:C T C 10 0.533290718814845 0.438425324362013 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 71039118 C/G 1 5 12 17 2.33354640592577 6.39948862577814 -4.06594221985237 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0541099825374581 ENSG00000140396:ENST00000267974:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000452400:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518287:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518363:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000521239:exon_71038844_71039282:NCOA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 20 31 51 9.3341856237031 16.5320122832602 -7.19782665955709 T:C T C 10 0.533290718814845 0.049237418019671 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 42 39 81 19.6017898097765 20.798338033779 -1.19654822400244 A:G A G 10 0.533290718814845 0.824237147358539 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 36 44 80 16.8015341226656 23.4647916278532 -6.6632575051876 C:G C G 10 0.533290718814845 0.145809721967723 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 16 7 23 7.46734849896248 3.73303503170392 3.73431346725856 T:C C T 10 0.533290718814845 0.144545033833458 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 95521925 G/A 1 13 13 26 6.06722065540701 6.93277934459299 -0.865558689185971 A:G G A 10 0.533290718814845 0.844787277202259 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95521916_95522168:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95521916_95522168:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95521916_95522168:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95521916_95522168:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95521916_95522168:KIAA1429 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 T:C T C 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 27 24 51 12.6011505919992 12.7989772515563 -0.197826659557096 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 98289714 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000180543:ENST00000322128:exon_98285717_98290176:TSPYL5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 1431 1204 2635 667.860981375957 642.082025453073 25.7789559228834 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.319399619744116 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 22 12 34 10.2676041860734 6.39948862577814 3.86811556029527 T:C T C 10 0.533290718814845 0.229030954571415 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 37 33 70 17.2682434038507 17.5985937208899 -0.330350317039155 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 103307712 C/A 1 53 36 89 24.7355919028132 19.1984658773344 5.53712602547879 A:C C A 10 0.533290718814845 0.244862116014403 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307642_103307760:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307642_103307760:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307642_103307760:UBR5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 103308010 T/C 1 36 29 65 16.8015341226656 15.4654308456305 1.33610327703507 T:C T C 10 0.533290718814845 0.804113845199839 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307864_103308010:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307864_103308010:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307864_103308010:UBR5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 67 46 113 31.2695218394054 24.5313730654829 6.73814877392251 T:C T C 10 0.533290718814845 0.220789434421224 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 45 37 82 21.001917653332 19.7317565961493 1.2701610571827 A:G A G 10 0.533290718814845 0.825271978223454 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 30 28 58 14.0012784355546 14.9321401268157 -0.930861691261011 T:C T C 10 0.533290718814845 0.89545443106576 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 11 10 21 5.1338020930367 5.33290718814845 -0.199105095111745 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 2 17 19 0.93341856237031 9.06594221985237 -8.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.000241125775418368 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120793296 C/T 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 T:C C T 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120793293_120793433:TAF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 8 3 11 3.73367424948124 1.59987215644454 2.1338020930367 C:G C G 10 0.533290718814845 0.237940889073470 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120803654 C/T 1 7 2 9 3.26696496829608 1.06658143762969 2.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.188395739495124 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120844782 G/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120844722_120845103:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000521007:exon_120844722_120845074:TAF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 25 20 45 11.6677320296289 10.6658143762969 1.00191765333197 T:C T C 10 0.533290718814845 0.88145750092873 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 121455468 A/T 1 66 45 111 30.8028125582202 23.998082346668 6.8047302115522 A:T A T 10 0.533290718814845 0.216402990848543 ENSG00000172172:ENST00000518696:exon_121455425_121455548:MRPL13;ENSG00000172172:ENST00000306185:exon_121455425_121455548:MRPL13;ENSG00000172172:ENST00000518918:exon_121455425_121455548:MRPL13;ENSG00000172172:ENST00000520677:exon_121455425_121455548:MRPL13 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 A:G G A 10 0.533290718814845 0.364016514296618 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C C T 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 64 38 102 29.8693939958499 20.2650473149641 9.60434668088581 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0595923600022073 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 124141404 C/G 1 7 1 8 3.26696496829608 0.533290718814845 2.73367424948124 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0751718799617046 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000378080:exon_124141310_124141442:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124141310_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124141310_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518577:exon_124141306_124141412:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124141306_124141458:WDR67 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 A:T T A 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 134488007 G/A 1 6 11 17 2.80025568711093 5.8661979069633 -3.06594221985237 A:G G A 10 0.533290718814845 0.151117723652911 ENSG00000008513:ENST00000319914:exon_134487962_134488847:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000395320:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000399640:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000521180:exon_134487962_134488843:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522652:exon_134487962_134488317:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522204:exon_134487962_134488177:ST3GAL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 42 30 72 19.6017898097765 15.9987215644454 3.60306824533116 T:G G T 10 0.533290718814845 0.410849778145159 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:G G A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 2 9 11 0.93341856237031 4.79961646933361 -3.8661979069633 A:G A G 10 0.533290718814845 0.0300816157817593 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 A:G G A 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 10 13 23 4.66709281185155 6.93277934459299 -2.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.405534788029253 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 14 14 0 7.46607006340783 -7.46607006340783 A G A 10 0.533290718814845 2.32621646624581e-05 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 395 400 795 184.350166068136 213.316287525938 -28.9661214578018 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.0426896821596196 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G G A 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 T:G G T 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 9 15 24 4.20038353066639 7.99936078222268 -3.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.15187969959101 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:C C A 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 22 16 38 10.2676041860734 8.53265150103752 1.73495268503589 A:G G A 10 0.533290718814845 0.627896100180899 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 4 8 12 1.86683712474062 4.26632575051876 -2.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.246809298102635 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144990335 G/A 1 15 12 27 7.00063921777732 6.39948862577814 0.601150591999184 A:G G A 10 0.533290718814845 0.849549315863957 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 5 4 9 2.33354640592577 2.13316287525938 0.200383530666395 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 21 16 37 9.80089490488825 8.53265150103752 1.26824340385073 T:C T C 10 0.533290718814845 0.743193392397834 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 14 16 30 6.53392993659217 8.53265150103752 -1.99872156444535 T:C T C 10 0.533290718814845 0.471398009330776 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144996111 C/T 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144997783 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 144998514 C/T 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C C T 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 31 33 64 14.4679877167398 17.5985937208899 -3.13060600415008 A:G A G 10 0.533290718814845 0.454156443638011 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145065682 G/A 1 61 69 130 28.4692661522945 36.7970595982243 -8.32779344592986 A:G G A 10 0.533290718814845 0.159501365044744 ENSG00000178719:ENST00000313269:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000529301:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000395068:exon_145065368_145065770:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000530898:exon_145065368_145065694:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000531992:exon_145065462_145065972:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000534791:exon_145065622_145065770:GRINA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145580288 G/A 1 9 14 23 4.20038353066639 7.46607006340783 -3.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.210865779148278 ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580260_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145580260_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145580260_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145580260_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000526524:exon_145580260_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000527000:exon_145579960_145580373:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000524909:exon_145580260_145580373:FBXL6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 8 10 18 3.73367424948124 5.33290718814845 -1.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.486244307071159 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 T:C C T 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145736024 G/A 1 7 3 10 3.26696496829608 1.59987215644454 1.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.354595211026192 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 12 3 15 5.60051137422186 1.59987215644454 4.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0411175581608189 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 9 10 19 4.20038353066639 5.33290718814845 -1.13252365748206 C:G C G 10 0.533290718814845 0.650629395901778 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 A:G G A 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 286593 C/A 1 6 9 15 2.80025568711093 4.79961646933361 -1.99936078222268 A:C C A 10 0.533290718814845 0.315098491224094 ENSG00000107099:ENST00000469197:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000479404:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000487230:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_286461_286636:DOCK8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 8 16 24 3.73367424948124 8.53265150103752 -4.79897725155628 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0642561142900687 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 C:G G C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2039719 G/A 1 10 20 30 4.66709281185155 10.6658143762969 -5.99872156444535 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0422865262663113 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000491574:exon_2039466_2039857:SMARCA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 8 11 19 3.73367424948124 5.8661979069633 -2.13252365748206 T:C C T 10 0.533290718814845 0.364016514296618 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 A:C A C 10 0.533290718814845 0.171748761798993 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2182221 G/A 1 58 40 98 27.069138308739 21.3316287525938 5.73750955614519 A:G G A 10 0.533290718814845 0.266112278406797 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000452193:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000416751:exon_2182141_2182242:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2182141_2182242:SMARCA2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 49 49 98 22.8687547780726 26.1312452219274 -3.26249044385482 A:G G A 10 0.533290718814845 0.544129966625614 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 29 35 64 13.5345691543695 18.6651751585196 -5.13060600415008 A:C C A 10 0.533290718814845 0.211729500008753 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 39 40 79 18.201661966221 21.3316287525938 -3.12996678637275 T:C C T 10 0.533290718814845 0.500199198391341 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 4576680 T/C 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C T C 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 4685008 C/T 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C C T 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000106993:ENST00000381858:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381854:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000381845:exon_4684877_4685158:CDC37L1;ENSG00000106993:ENST00000479095:exon_4684877_4685475:CDC37L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 5762600 G/A 1 18 14 32 8.40076706133279 7.46607006340783 0.934696997924959 A:G G A 10 0.533290718814845 0.859819173361758 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5762541_5762660:KIAA1432 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 6606634 C/T 1 3 10 13 1.40012784355546 5.33290718814845 -3.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0474841958374864 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 14 6 20 6.53392993659217 3.19974431288907 3.3341856237031 A:G G A 10 0.533290718814845 0.178738983782814 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 60 25 85 28.0025568711093 13.3322679703711 14.6702889007382 A:T:C C A 10 0.533290718814845 0.00149028728670325 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 64 29 93 29.8693939958499 15.4654308456305 14.4039631502194 T:G G T 10 0.533290718814845 0.00338857535957860 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 15591372 T/A 1 6 4 10 2.80025568711093 2.13316287525938 0.66709281185155 A:T T A 10 0.533290718814845 0.759312876969158 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15591364_15591554:C9orf93 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 17135115 C/T 0 22 0 22 10.2676041860734 0 10.2676041860734 C C 10 0.533290718814845 1.03684641916410e-06 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 12 7 19 5.60051137422186 3.73303503170392 1.86747634251794 A:G G A 10 0.533290718814845 0.4926104501617 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 9 9 18 4.20038353066639 4.79961646933361 -0.59923293866721 A:G G A 10 0.533290718814845 0.816739351595121 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 26978170 A/G 1 6 3 9 2.80025568711093 1.59987215644454 1.20038353066639 A:G A G 10 0.533290718814845 0.516482277403379 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 26978259 A/G 1 10 4 14 4.66709281185155 2.13316287525938 2.53392993659217 A:G A G 10 0.533290718814845 0.193047477338001 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 27556780 G/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:G G A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000147894:ENST00000380003:exon_27556559_27556794:C9orf72;ENSG00000147894:ENST00000488117:exon_27556559_27556794:C9orf72 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 32487521 T/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32487469_32487631:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32487469_32487631:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32487469_32487631:DDX58 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 32492529 G/A 1 8 2 10 3.73367424948124 1.06658143762969 2.66709281185155 A:G G A 10 0.533290718814845 0.117167394553238 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32492389_32492536:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32492389_32492536:DDX58 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 34 32 66 15.8681155602953 17.065303002075 -1.19718744177977 A:G A G 10 0.533290718814845 0.80576262053611 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 363 416 779 169.415469070211 221.848939026976 -52.4334699567643 A:T:C T C 10 0.533290718814845 0.000184491286613145 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 33290532 A/G 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33290509_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33290510_33290595:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33290510_33290595:NFX1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 7 13 20 3.26696496829608 6.93277934459299 -3.6658143762969 A:C A C 10 0.533290718814845 0.118460995463565 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 34310927 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000186638:ENST00000402558:exon_34310722_34311369:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000379174:exon_34310722_34311369:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000379166:exon_34310722_34311369:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000345050:exon_34310722_34311369:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000403891:exon_34310722_34311369:KIF24;ENSG00000186638:ENST00000420188:exon_34310722_34311369:KIF24 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 34637690 T/G 1 22 19 41 10.2676041860734 10.1325236574821 0.135080528591354 T:G T G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34637544_34637768:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34637217_34637729:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34637544_34637741:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34637604_34637694:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34637604_34637694:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34637544_34637806:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34637217_34637793:SIGMAR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 10 9 19 4.66709281185155 4.79961646933361 -0.132523657482055 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 14 7 21 6.53392993659217 3.73303503170392 2.80089490488825 T:C T C 10 0.533290718814845 0.276079092338444 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 35733084 T/C 1 74 71 145 34.5364868077015 37.863641035854 -3.32715422815253 T:C T C 10 0.533290718814845 0.617759123133443 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35732993_35733140:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35732993_35733279:CREB3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 35753170 C/A 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 A:C C A 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35752648_35757908:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35752648_35758572:RGP1;ENSG00000215183:ENST00000436428:exon_35752987_35753277:MSMP;ENSG00000215183:ENST00000414286:exon_35752989_35753277:MSMP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 202 181 383 94.2752747994013 96.525620105487 -2.25034530608565 T:C T C 10 0.533290718814845 0.837765463798616 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 12 8 20 5.60051137422186 4.26632575051876 1.3341856237031 T:C C T 10 0.533290718814845 0.656383333800232 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71437571 A/G 1 15 7 22 7.00063921777732 3.73303503170392 3.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 0.201304971849887 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000377284:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000437200:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71437531_71437599:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000440050:exon_71437531_71437599:PIP5K1B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 25 5 30 11.6677320296289 2.66645359407423 9.00127843555465 A:G A G 10 0.533290718814845 0.00078933343956529 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 39 42 81 18.201661966221 22.3982101902235 -4.19654822400244 A:C C A 10 0.533290718814845 0.374018242915126 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 23 14 37 10.7343134672586 7.46607006340783 3.26824340385073 T:C C T 10 0.533290718814845 0.32460132799244 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 23 12 35 10.7343134672586 6.39948862577814 4.33482484148042 A:G G A 10 0.533290718814845 0.175268729276327 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 71863049 G/A 1 12 17 29 5.60051137422186 9.06594221985237 -3.46543084563051 A:G G A 10 0.533290718814845 0.263838780597277 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C T C 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 74360209 G/C 1 4 10 14 1.86683712474062 5.33290718814845 -3.46607006340783 C:G G C 10 0.533290718814845 0.104686587211335 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000434022:exon_74359934_74360495:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74359934_74360495:TMEM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 11 17 28 5.1338020930367 9.06594221985237 -3.93214012681566 T:C C T 10 0.533290718814845 0.184006868411032 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:C A C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 13 18 31 6.06722065540701 9.59923293866721 -3.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.212955299971123 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 16 19 35 7.46734849896248 10.1325236574821 -2.66517515851958 A:G A G 10 0.533290718814845 0.399873459616362 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 12 16 28 5.60051137422186 8.53265150103752 -2.93214012681566 C:G G C 10 0.533290718814845 0.34388687518086 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 17 9 26 7.93405778014763 4.79961646933361 3.13444131081403 T:C C T 10 0.533290718814845 0.243055534897146 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 29 28 57 13.5345691543695 14.9321401268157 -1.39757097244617 C:G G C 10 0.533290718814845 0.790942200097086 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 31 30 61 14.4679877167398 15.9987215644454 -1.53073384770555 A:G G A 10 0.533290718814845 0.702369933883045 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 20 15 35 9.3341856237031 7.99936078222268 1.33482484148042 T:C C T 10 0.533290718814845 0.735863720798038 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 23 17 40 10.7343134672586 9.06594221985237 1.6683712474062 T:C T C 10 0.533290718814845 0.637263024103858 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 8 8 16 3.73367424948124 4.26632575051876 -0.53265150103752 A:C C A 10 0.533290718814845 0.807501514791707 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 95768448 G/A 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 96422788 C/T 1 6 5 11 2.80025568711093 2.66645359407423 0.133802093036705 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197724:ENST00000359246:exon_96422474_96422842:PHF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 96436037 G/A 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 A:G G A 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000197724:ENST00000359246:exon_96435867_96436144:PHF2;ENSG00000197724:ENST00000427747:exon_96435867_96436144:PHF2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 97062981 C/T 1 3 7 10 1.40012784355546 3.73303503170392 -2.33290718814845 T:C C T 10 0.533290718814845 0.204947962251031 ENSG00000175787:ENST00000395395:exon_97062097_97063736:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000340911:exon_97061730_97063736:ZNF169 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 98691137 T/C 1 5 7 12 2.33354640592577 3.73303503170392 -1.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56521594486711 ENSG00000182150:ENST00000375266:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000405401:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000288985:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000466840:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000437817:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000456993:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98691001_98691146:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000426805:exon_98691001_98691399:C9orf102 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 98775235 T/C 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98774507_98776845:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98774507_98776842:C9orf102 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99525909 T/C 1 6 2 8 2.80025568711093 1.06658143762969 1.73367424948124 T:C T C 10 0.533290718814845 0.297757918797876 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000472201:exon_99525788_99525975:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99525788_99525914:ZNF510 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99537071 T/C 1 7 7 14 3.26696496829608 3.73303503170392 -0.46607006340783 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99537070_99537128:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99537070_99537128:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99537070_99537128:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99537070_99537128:ZNF510 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99538365 G/A 1 7 6 13 3.26696496829608 3.19974431288907 0.0672206554070147 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99538282_99538527:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99538282_99538530:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99538282_99538527:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99538282_99538527:ZNF510 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99580199 A/G 1 8 5 13 3.73367424948124 2.66645359407423 1.06722065540701 A:G A G 10 0.533290718814845 0.592075244882442 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 T:C C T 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 99581916 C/G 1 5 3 8 2.33354640592577 1.59987215644454 0.73367424948124 C:G C G 10 0.533290718814845 0.731379043001877 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 12 10 22 5.60051137422186 5.33290718814845 0.26760418607341 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 100388119 G/T 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 T:G G T 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100387963_100388279:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375171:exon_100387963_100388279:TSTD2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 31 26 57 14.4679877167398 13.865558689186 0.602429027553834 A:G G A 10 0.533290718814845 0.895220745244316 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 107533159 A/G 1 3 9 12 1.40012784355546 4.79961646933361 -3.39948862577814 A:G A G 10 0.533290718814845 0.078661088597064 ENSG00000165028:ENST00000374762:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B;ENSG00000165028:ENST00000461177:exon_107533130_107533279:NIPSNAP3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 11 2 13 5.1338020930367 1.06658143762969 4.06722065540701 T:G T G 10 0.533290718814845 0.0262163998871804 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 11 7 18 5.1338020930367 3.73303503170392 1.40076706133279 T:C C T 10 0.533290718814845 0.638538768208836 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 111688828 C/T 1 5 6 11 2.33354640592577 3.19974431288907 -0.866197906963295 T:C C T 10 0.533290718814845 0.76468028377391 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111688803_111688883:IKBKAP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 227 331 558 105.94300682903 176.519227927714 -70.5762210986835 A:G A G 10 0.533290718814845 2.38334070644073e-09 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 113018755 T/C 1 376 352 728 175.482689725618 187.718333022825 -12.2356432972072 T:C T C 10 0.533290718814845 0.372759218347758 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113018692_113018920:TXN HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 13 11 24 6.06722065540701 5.8661979069633 0.201022748443719 T:G G T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 43 25 68 20.0684990909617 13.3322679703711 6.73623112059054 A:G A G 10 0.533290718814845 0.114216290493578 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 115983540 G/A 1 2 7 9 0.93341856237031 3.73303503170392 -2.79961646933361 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0922027207521832 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115983471_115983598:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115983471_115983641:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115983471_115983598:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000462889:exon_115983471_115983559:FKBP15 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 27 25 52 12.6011505919992 13.3322679703711 -0.731117378371941 A:G A G 10 0.533290718814845 0.889869118980636 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 24 28 52 11.2010227484437 14.9321401268157 -3.73111737837194 T:C C T 10 0.533290718814845 0.331778572221411 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 117103887 C/T 1 20 13 33 9.3341856237031 6.93277934459299 2.40140627911011 T:C C T 10 0.533290718814845 0.486282104151889 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 31 28 59 14.4679877167398 14.9321401268157 -0.464152410075856 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 24 19 43 11.2010227484437 10.1325236574821 1.06849909096166 T:C C T 10 0.533290718814845 0.762561047237978 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 117124125 C/T 1 17 21 38 7.93405778014763 11.1991050951117 -3.26504731496411 T:C C T 10 0.533290718814845 0.330520729703812 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117123984_117124191:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117123984_117124191:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117123984_117124191:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117123984_117124191:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117123984_117124191:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117123984_117124191:AKNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 14 10 24 6.53392993659217 5.33290718814845 1.20102274844372 A:G G A 10 0.533290718814845 0.686007452675182 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 15 15 30 7.00063921777732 7.99936078222268 -0.998721564445351 C:G C G 10 0.533290718814845 0.718981035499475 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 10 14 24 4.66709281185155 7.46607006340783 -2.79897725155628 T:G T G 10 0.533290718814845 0.307616995498049 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 155 168 323 72.339938583699 89.592840760894 -17.2529021771949 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0578882527200905 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123673771 G/T 1 78 100 178 36.4033239324421 53.3290718814845 -16.9257479490424 T:G G T 10 0.533290718814845 0.0129660789850598 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123673614_123673791:TRAF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123850770 G/A 1 4 19 23 1.86683712474062 10.1325236574821 -8.26568653274144 A:G G A 10 0.533290718814845 0.000555051194253744 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 26 23 49 12.134441310814 12.2656865327414 -0.131245221927406 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 125075542 G/A 1 15 18 33 7.00063921777732 9.59923293866721 -2.59859372088989 A:G G A 10 0.533290718814845 0.387389240989014 ENSG00000148187:ENST00000344641:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000297908:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373729:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000470366:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000467864:exon_125075506_125075609:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000489572:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373723:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373730:exon_125075506_125075665:MRRF HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 7 4 11 3.26696496829608 2.13316287525938 1.1338020930367 T:G T G 10 0.533290718814845 0.558740274443457 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 125782663 A/G 1 7 5 12 3.26696496829608 2.66645359407423 0.60051137422186 A:G A G 10 0.533290718814845 0.780348208782854 ENSG00000011454:ENST00000456584:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000373647:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000447652:exon_125782588_125782738:RABGAP1;ENSG00000011454:ENST00000373643:exon_125782588_125782738:RABGAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 11 20 31 5.1338020930367 10.6658143762969 -5.5320122832602 A:G G A 10 0.533290718814845 0.049263075607799 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 17 14 31 7.93405778014763 7.46607006340783 0.467987716739804 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 128067419 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394084:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128067342_128067428:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128067342_128067428:GAPVD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 29 35 64 13.5345691543695 18.6651751585196 -5.13060600415008 A:G G A 10 0.533290718814845 0.211729500008753 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 130550351 C/T 1 56 18 74 26.1357197463687 9.59923293866721 16.5364868077015 T:C C T 10 0.533290718814845 9.7264111559444e-05 ENSG00000136807:ENST00000373265:exon_130550226_130550392:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000373264:exon_130550226_130550392:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000480353:exon_130550226_130550392:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000496284:exon_130550226_130550392:CDK9;ENSG00000136807:ENST00000491521:exon_130550226_130550392:CDK9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 32 21 53 14.934696997925 11.1991050951117 3.73559190281321 C:G G C 10 0.533290718814845 0.336782920485975 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 29 20 49 13.5345691543695 10.6658143762969 2.86875477807259 A:G A G 10 0.533290718814845 0.474899164426507 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G A G 10 0.533290718814845 0.782457514120988 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131079489 G/A 1 11 4 15 5.1338020930367 2.13316287525938 3.00063921777732 A:G G A 10 0.533290718814845 0.194148407751893 ENSG00000167112:ENST00000372890:exon_131079431_131079505:TRUB2;ENSG00000167112:ENST00000460320:exon_131079431_131079505:TRUB2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131085127 C/A 1 3 8 11 1.40012784355546 4.26632575051876 -2.8661979069633 A:C C A 10 0.533290718814845 0.128208341880012 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 11 8 19 5.1338020930367 4.26632575051876 0.867476342517945 A:G A G 10 0.533290718814845 0.819437837306137 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131343207 G/A 1 28 24 52 13.0678598731843 12.7989772515563 0.268882621628059 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131343201_131343338:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131343201_131343338:SPTAN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 29 25 54 13.5345691543695 13.3322679703711 0.202301183998369 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 42 55 97 19.6017898097765 29.3309895348165 -9.72919972503997 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0529979379571364 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 23 12 35 10.7343134672586 6.39948862577814 4.33482484148042 A:G G A 10 0.533290718814845 0.175268729276327 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 6 12 18 2.80025568711093 6.39948862577814 -3.59923293866721 T:C C T 10 0.533290718814845 0.101505920919438 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131589328 C/G 1 26 12 38 12.134441310814 6.39948862577814 5.73495268503589 C:G C G 10 0.533290718814845 0.0733589667027414 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131589311_131589470:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131589311_131589425:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131589311_131589470:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131589311_131589489:C9orf114 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 131589468 G/T 1 41 18 59 19.1350805285914 9.59923293866721 9.53584758992414 T:G G T 10 0.533290718814845 0.013069199289497 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131589311_131589470:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131589430_131589470:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131589311_131589470:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131589311_131589489:C9orf114 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 58 48 106 27.069138308739 25.5979545031126 1.47118380562643 A:G G A 10 0.533290718814845 0.84576203742393 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 45 29 74 21.001917653332 15.4654308456305 5.53648680770147 C:G C G 10 0.533290718814845 0.202464181376736 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 42 45 87 19.6017898097765 23.998082346668 -4.39629253689152 A:G A G 10 0.533290718814845 0.390194733521847 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 37 48 85 17.2682434038507 25.5979545031126 -8.32971109926183 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0815752204506212 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 5 9 14 2.33354640592577 4.79961646933361 -2.46607006340783 A:G G A 10 0.533290718814845 0.283767288656670 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 140 129 269 65.3392993659217 68.794502727115 -3.4552033611933 T:C C T 10 0.533290718814845 0.713960144165988 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 133759467 C/T 1 14 17 31 6.53392993659217 9.06594221985237 -2.5320122832602 T:C C T 10 0.533290718814845 0.374395278994912 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 34 41 75 15.8681155602953 21.8649194714086 -5.99680391111338 T:C C T 10 0.533290718814845 0.167207402866003 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 37 24 61 17.2682434038507 12.7989772515563 4.46926615229445 T:C T C 10 0.533290718814845 0.304630182797472 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 43 31 74 20.0684990909617 16.5320122832602 3.53648680770147 T:C T C 10 0.533290718814845 0.417952635784549 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 7 10 17 3.26696496829608 5.33290718814845 -2.06594221985237 A:G A G 10 0.533290718814845 0.340593363039387 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 26 37 63 12.134441310814 19.7317565961493 -7.59731528533524 T:C T C 10 0.533290718814845 0.0586989878861926 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135202662 C/T 1 37 25 62 17.2682434038507 13.3322679703711 3.93597543347961 T:C C T 10 0.533290718814845 0.37319672804659 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 29 25 54 13.5345691543695 13.3322679703711 0.202301183998369 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 39 26 65 18.201661966221 13.865558689186 4.33610327703508 T:C C T 10 0.533290718814845 0.320512435340999 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 37 38 75 17.2682434038507 20.2650473149641 -2.99680391111338 A:C A C 10 0.533290718814845 0.490315448086252 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135205006 G/C 1 33 46 79 15.4014062791101 24.5313730654829 -9.12996678637276 C:G G C 10 0.533290718814845 0.0424735248830897 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 25 19 44 11.6677320296289 10.1325236574821 1.53520837214682 A:G A G 10 0.533290718814845 0.654449672943657 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 24 38 62 11.2010227484437 20.2650473149641 -9.06402456652039 A:C C A 10 0.533290718814845 0.0221084832803646 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 17 11 28 7.93405778014763 5.8661979069633 2.06785987318434 C:G C G 10 0.533290718814845 0.456041150831043 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 7 8 15 3.26696496829608 4.26632575051876 -0.999360782222675 T:C T C 10 0.533290718814845 0.616507178693442 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 23 26 49 10.7343134672586 13.865558689186 -3.13124522192741 A:T:G G A 10 0.533290718814845 0.392802233853041 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135786904 A/G 1 2 6 8 0.93341856237031 3.19974431288907 -2.26632575051876 A:G A G 10 0.533290718814845 0.157465223432973 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000493467:exon_135786840_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000424271:exon_135786387_135786955:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000403810:exon_135786596_135786955:TSC1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 27 34 61 12.6011505919992 18.1318844397047 -5.53073384770555 A:G G A 10 0.533290718814845 0.160391936538732 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135982088 A/C 1 13 6 19 6.06722065540701 3.19974431288907 2.86747634251794 A:C A C 10 0.533290718814845 0.250869943426239 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000424572:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000460587:exon_135982032_135982135:RALGDS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 135983504 T/C 1 11 9 20 5.1338020930367 4.79961646933361 0.3341856237031 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 136913355 T/C 1 4 4 8 1.86683712474062 2.13316287525938 -0.26632575051876 T:C T C 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 139265088 C/T 1 1 12 13 0.466709281185155 6.39948862577814 -5.93277934459299 T:C C T 10 0.533290718814845 0.00107242387112843 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000485975:exon_139264202_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139264974_139265153:CARD9 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 9 6 15 4.20038353066639 3.19974431288907 1.00063921777732 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796958030377313 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 6 7 13 2.80025568711093 3.73303503170392 -0.932779344592985 A:G G A 10 0.533290718814845 0.782457514120988 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 23 23 46 10.7343134672586 12.2656865327414 -1.53137306548287 C:G G C 10 0.533290718814845 0.660645980947782 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 9 8 17 4.20038353066639 4.26632575051876 -0.0659422198523654 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 114 174 288 53.2048580551077 92.792585073783 -39.5877270186754 A:G G A 10 0.533290718814845 3.59093958315128e-06 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 30 19 49 14.0012784355546 10.1325236574821 3.86875477807259 A:G A G 10 0.533290718814845 0.316704561238049 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140079522 G/A 1 6 6 12 2.80025568711093 3.19974431288907 -0.39948862577814 A:G G A 10 0.533290718814845 1 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140079365_140079539:ANAPC2 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 14 12 26 6.53392993659217 6.39948862577814 0.134441310814029 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140109141 C/T 1 5 11 16 2.33354640592577 5.8661979069633 -3.53265150103752 T:C C T 10 0.533290718814845 0.0845993482927408 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140109022_140109143:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140109022_140109143:NDOR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140110801 C/T 1 14 7 21 6.53392993659217 3.73303503170392 2.80089490488825 T:C C T 10 0.533290718814845 0.276079092338444 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140110724_140111461:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140110724_140111461:NDOR1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 18 32 50 8.40076706133279 17.065303002075 -8.66453594074225 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0156865437222075 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 25 23 48 11.6677320296289 12.2656865327414 -0.597954503112561 T:C T C 10 0.533290718814845 0.885814894728098 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 7 13 20 3.26696496829608 6.93277934459299 -3.6658143762969 T:C T C 10 0.533290718814845 0.118460995463565 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 8 6 14 3.73367424948124 3.19974431288907 0.53392993659217 T:C C T 10 0.533290718814845 0.796941805576349 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 209873 T/A 1 7 12 19 3.26696496829608 6.39948862577814 -3.13252365748206 A:T T A 10 0.533290718814845 0.171748761798993 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_209702_209885:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_209702_209885:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_209702_209885:PLCXD1 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 14 8 22 6.53392993659217 4.26632575051876 2.26760418607341 A:G G A 10 0.533290718814845 0.396121625530175 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 8 7 15 3.73367424948124 3.73303503170392 0.000639217777324674 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 4 5 9 1.86683712474062 2.66645359407423 -0.799616469333605 T:C T C 10 0.533290718814845 0.742144486156731 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 9 7 16 4.20038353066639 3.73303503170392 0.46734849896248 A:G A G 10 0.533290718814845 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 10 7 17 4.66709281185155 3.73303503170392 0.934057780147635 A:C:G A G 10 0.533290718814845 0.809088236970814 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 5 10 15 2.33354640592577 5.33290718814845 -2.99936078222268 A:G A G 10 0.533290718814845 0.129891076919026 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 1475224 C/G 1 23 22 45 10.7343134672586 11.7323958139266 -0.998082346668026 C:G C G 10 0.533290718814845 0.767676184905606 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1475114_1475229:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1475114_1475229:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1475114_1475224:IL3RA HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 1506224 G/A 1 374 391 765 174.549271163248 208.516671056604 -33.9673998933564 A:G G A 10 0.533290718814845 0.0151381283789971 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1506172_1506312:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1506204_1506312:SLC25A6 HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 26 24 50 12.134441310814 12.7989772515563 -0.664535940742251 C:G C G 10 0.533290718814845 0.887877078887718 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 20 18 38 9.3341856237031 9.59923293866721 -0.265047314964111 T:C C T 10 0.533290718814845 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 16 11 27 7.46734849896248 5.8661979069633 1.60115059199918 T:C T C 10 0.533290718814845 0.56889011730577 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 14 6 20 6.53392993659217 3.19974431288907 3.3341856237031 C:G C G 10 0.533290718814845 0.178738983782814 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00720_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 24 24 48 11.2010227484437 12.7989772515563 -1.59795450311256 A:G G A 10 0.533290718814845 0.666538693127673 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1